View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18404_low_95 (Length: 334)

Name: NF18404_low_95
Description: NF18404
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18404_low_95
NF18404_low_95
[»] chr8 (79 HSPs)
chr8 (1-320)||(21395781-21396100)
chr8 (1-320)||(21790274-21790593)
chr8 (4-320)||(21389254-21389570)
chr8 (121-320)||(21778697-21778896)
chr8 (108-320)||(31971258-31971471)
chr8 (108-320)||(16199551-16199764)
chr8 (108-320)||(45130903-45131116)
chr8 (116-320)||(18879150-18879351)
chr8 (108-320)||(20536209-20536424)
chr8 (118-320)||(21918915-21919120)
chr8 (108-320)||(22626737-22626951)
chr8 (108-323)||(28648949-28649167)
chr8 (108-320)||(18818314-18818529)
chr8 (108-320)||(21923833-21924048)
chr8 (1-130)||(17353736-17353865)
chr8 (108-327)||(23648547-23648769)
chr8 (108-320)||(7372779-7372986)
chr8 (108-320)||(22875066-22875281)
chr8 (108-320)||(23406380-23406597)
chr8 (108-320)||(6759259-6759472)
chr8 (133-320)||(16092272-16092462)
chr8 (205-320)||(6520369-6520486)
chr8 (1-130)||(19899286-19899415)
chr8 (249-320)||(38855300-38855371)
chr8 (208-320)||(17140917-17141031)
chr8 (204-312)||(21285606-21285716)
chr8 (172-316)||(16413331-16413476)
chr8 (172-314)||(14409459-14409602)
chr8 (249-320)||(21490996-21491067)
chr8 (249-306)||(23760893-23760950)
chr8 (1-130)||(24755912-24756041)
chr8 (1-173)||(16184877-16185048)
chr8 (172-314)||(1484406-1484549)
chr8 (172-314)||(5853307-5853450)
chr8 (249-320)||(5866323-5866394)
chr8 (208-314)||(20046246-20046353)
chr8 (172-314)||(20403231-20403374)
chr8 (172-314)||(22001757-22001900)
chr8 (249-306)||(983455-983512)
chr8 (1-130)||(19983284-19983413)
chr8 (172-314)||(41598192-41598335)
chr8 (202-327)||(18678102-18678229)
chr8 (249-307)||(26355747-26355805)
chr8 (268-318)||(45290807-45290857)
chr8 (1-130)||(21161857-21161986)
chr8 (1-183)||(23776633-23776816)
chr8 (204-323)||(26223914-26224034)
chr8 (172-314)||(4483285-4483427)
chr8 (259-314)||(4542477-4542531)
chr8 (172-314)||(15203246-15203389)
chr8 (259-314)||(19896269-19896323)
chr8 (1-112)||(19976654-19976765)
chr8 (268-314)||(26225359-26225405)
chr8 (202-327)||(32121726-32121853)
chr8 (172-318)||(13508055-13508203)
chr8 (204-302)||(20498581-20498681)
chr8 (204-314)||(26219721-26219831)
chr8 (250-302)||(24353039-24353091)
chr8 (110-185)||(25363047-25363123)
chr8 (250-302)||(37116366-37116418)
chr8 (249-320)||(17612159-17612230)
chr8 (248-302)||(19154935-19154989)
chr8 (268-314)||(19937118-19937164)
chr8 (253-307)||(21673718-21673772)
chr8 (1-130)||(20465838-20465967)
chr8 (1-130)||(21168520-21168649)
chr8 (250-302)||(17267044-17267096)
chr8 (249-320)||(21249385-21249457)
chr8 (249-320)||(21255223-21255295)
chr8 (3-130)||(377469-377596)
chr8 (252-318)||(13597669-13597735)
chr8 (268-314)||(25484380-25484426)
chr8 (268-305)||(15070571-15070608)
chr8 (250-302)||(17439557-17439609)
chr8 (159-302)||(19801383-19801527)
chr8 (73-130)||(17926578-17926635)
chr8 (172-314)||(14823778-14823920)
chr8 (258-319)||(2418930-2418989)
chr8 (71-129)||(19259451-19259509)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (116-320)||(20309109-20309313)
chr2 (108-320)||(38021-38234)
chr2 (1-314)||(40622007-40622324)
chr2 (103-320)||(23285866-23286082)
chr2 (103-314)||(298714-298929)
chr2 (108-320)||(22731139-22731354)
chr2 (108-320)||(22738085-22738299)
chr2 (60-320)||(23103254-23103515)
chr2 (103-320)||(23654286-23654506)
chr2 (108-320)||(23060514-23060728)
chr2 (108-320)||(23076443-23076658)
chr2 (1-186)||(22740759-22740945)
chr2 (1-129)||(23038227-23038355)
chr2 (108-320)||(22337116-22337331)
chr2 (108-320)||(23660024-23660238)
chr2 (1-186)||(22758514-22758700)
chr2 (1-294)||(22798925-22799220)
chr2 (172-327)||(32214936-32215092)
chr2 (172-314)||(22105416-22105560)
chr2 (249-314)||(7679592-7679657)
chr2 (1-129)||(23019505-23019633)
chr2 (172-314)||(26505383-26505526)
chr2 (172-314)||(26507861-26508004)
chr2 (172-314)||(18808947-18809090)
chr2 (172-314)||(23130866-23131009)
chr2 (172-314)||(23133333-23133476)
chr2 (172-314)||(23135594-23135737)
chr2 (172-314)||(23709547-23709690)
chr2 (172-314)||(23712028-23712171)
chr2 (172-314)||(34402537-34402680)
chr2 (172-314)||(39682317-39682460)
chr2 (249-307)||(28405990-28406048)
chr2 (172-306)||(23708589-23708725)
chr2 (166-314)||(45029863-45030012)
chr2 (208-314)||(571401-571508)
chr2 (172-314)||(6725999-6726142)
chr2 (245-320)||(8946658-8946732)
chr2 (172-314)||(21155075-21155218)
chr2 (172-310)||(24367782-24367921)
chr2 (208-314)||(43137303-43137410)
chr2 (249-307)||(25175864-25175922)
chr2 (204-302)||(7735-7835)
chr2 (172-314)||(24898210-24898354)
chr2 (172-314)||(24900693-24900837)
chr2 (172-314)||(24903170-24903314)
chr2 (172-314)||(24905647-24905791)
chr2 (172-314)||(24908122-24908266)
chr2 (249-320)||(19671831-19671902)
chr2 (257-320)||(23040247-23040309)
chr2 (249-320)||(23071998-23072069)
chr2 (259-314)||(24643054-24643108)
chr2 (172-314)||(32039513-32039656)
chr2 (248-302)||(23207296-23207350)
chr2 (268-314)||(28577103-28577149)
chr2 (268-314)||(38967378-38967424)
chr2 (249-306)||(18786952-18787009)
chr2 (1-125)||(45677954-45678078)
chr2 (249-323)||(22134256-22134329)
chr2 (268-314)||(24529641-24529687)
chr2 (202-327)||(25616179-25616306)
chr2 (250-302)||(20520243-20520295)
chr2 (248-302)||(22413186-22413240)
chr2 (252-302)||(32451981-32452031)
chr2 (250-302)||(23004767-23004819)
chr2 (1-65)||(23101029-23101093)
chr2 (250-302)||(25108906-25108958)
chr2 (250-300)||(23287384-23287433)
chr2 (1-130)||(21918115-21918244)
chr2 (73-130)||(25963588-25963645)
chr2 (251-300)||(26392403-26392451)
chr2 (250-302)||(23791292-23791344)
chr2 (1-129)||(24673768-24673896)
chr2 (250-302)||(24697657-24697709)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (116-320)||(1290-1494)
scaffold0106 (116-320)||(7267-7471)
scaffold0106 (252-314)||(15291-15352)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (116-320)||(16283-16487)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (108-320)||(17046488-17046700)
chr4 (108-320)||(14053207-14053421)
chr4 (103-320)||(12902758-12902978)
chr4 (103-320)||(7088878-7089098)
chr4 (1-314)||(15121602-15121914)
chr4 (108-319)||(22636437-22636650)
chr4 (108-320)||(44052830-44053045)
chr4 (103-316)||(23374259-23374475)
chr4 (116-320)||(16270149-16270355)
chr4 (108-313)||(16377428-16377634)
chr4 (140-320)||(7798775-7798958)
chr4 (108-320)||(16239875-16240089)
chr4 (109-314)||(14038655-14038863)
chr4 (1-130)||(13569703-13569832)
chr4 (152-320)||(6899892-6900062)
chr4 (108-320)||(7893704-7893916)
chr4 (1-130)||(23843669-23843798)
chr4 (208-327)||(19618223-19618343)
chr4 (204-314)||(14280320-14280431)
chr4 (1-183)||(15093911-15094093)
chr4 (249-320)||(39706337-39706408)
chr4 (202-320)||(52873367-52873487)
chr4 (2-130)||(44675823-44675951)
chr4 (249-320)||(15551818-15551889)
chr4 (172-314)||(18215289-18215432)
chr4 (172-314)||(44928894-44929038)
chr4 (204-314)||(54798756-54798868)
chr4 (249-307)||(12774021-12774079)
chr4 (204-302)||(13853-13953)
chr4 (249-306)||(12288259-12288316)
chr4 (1-130)||(12570212-12570341)
chr4 (249-306)||(52243245-52243302)
chr4 (240-320)||(3096294-3096373)
chr4 (172-314)||(12322-12465)
chr4 (172-314)||(15118367-15118510)
chr4 (172-314)||(23803280-23803423)
chr4 (172-314)||(44615292-44615435)
chr4 (172-314)||(52312514-52312657)
chr4 (221-318)||(15355389-15355487)
chr4 (204-314)||(8574871-8574981)
chr4 (208-327)||(14970758-14970878)
chr4 (172-314)||(1837524-1837667)
chr4 (172-314)||(3515011-3515154)
chr4 (172-314)||(18239434-18239577)
chr4 (172-314)||(19242703-19242846)
chr4 (208-314)||(44773138-44773245)
chr4 (172-314)||(50222354-50222497)
chr4 (208-314)||(51463919-51464026)
chr4 (249-307)||(8846370-8846428)
chr4 (256-306)||(43198611-43198661)
chr4 (108-195)||(3096772-3096859)
chr4 (259-314)||(7641286-7641340)
chr4 (259-314)||(12610954-12611008)
chr4 (268-314)||(44102218-44102264)
chr4 (1-130)||(15124953-15125081)
chr4 (252-302)||(6190481-6190531)
chr4 (172-302)||(22353852-22353984)
chr4 (203-268)||(43256161-43256227)
chr4 (248-302)||(46640504-46640558)
chr4 (250-302)||(53082202-53082254)
chr4 (120-185)||(17047989-17048055)
chr4 (268-320)||(15367691-15367743)
chr4 (268-320)||(15370019-15370071)
chr4 (268-320)||(15371203-15371255)
chr4 (268-320)||(15373484-15373536)
chr4 (268-320)||(15402704-15402756)
chr4 (268-320)||(16223533-16223585)
chr4 (1-129)||(16487877-16488005)
chr4 (1-130)||(16356752-16356881)
chr4 (249-283)||(16596686-16596720)
chr4 (73-129)||(16348536-16348592)
chr4 (270-302)||(21815699-21815731)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (116-302)||(51601-51787)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (116-320)||(965-1169)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (116-320)||(27847746-27847950)
chr7 (108-319)||(40443393-40443605)
chr7 (1-314)||(17137862-17138174)
chr7 (108-320)||(12698832-12699048)
chr7 (1-314)||(12187022-12187334)
chr7 (108-320)||(9509190-9509405)
chr7 (109-314)||(18456319-18456526)
chr7 (108-305)||(10589055-10589254)
chr7 (103-305)||(26212012-26212217)
chr7 (103-320)||(16386147-16386368)
chr7 (1-186)||(18154635-18154821)
chr7 (108-314)||(3564269-3564478)
chr7 (108-320)||(38227482-38227696)
chr7 (1-130)||(9703458-9703587)
chr7 (249-320)||(67746-67817)
chr7 (172-314)||(16213688-16213831)
chr7 (172-327)||(24275162-24275318)
chr7 (6-173)||(24054618-24054784)
chr7 (204-314)||(48273396-48273508)
chr7 (172-314)||(24704692-24704832)
chr7 (172-314)||(24702242-24702385)
chr7 (249-320)||(28505347-28505418)
chr7 (249-320)||(34200787-34200858)
chr7 (249-320)||(47831808-47831879)
chr7 (3-186)||(19649285-19649469)
chr7 (1-118)||(11880456-11880573)
chr7 (172-320)||(18430710-18430859)
chr7 (172-314)||(456325-456468)
chr7 (172-314)||(11393302-11393445)
chr7 (172-314)||(11972500-11972643)
chr7 (172-302)||(13647344-13647476)
chr7 (172-314)||(14949137-14949280)
chr7 (172-314)||(15376728-15376871)
chr7 (202-306)||(16219717-16219823)
chr7 (172-314)||(16232524-16232667)
chr7 (172-314)||(18640276-18640419)
chr7 (172-314)||(20385138-20385281)
chr7 (172-314)||(21189610-21189753)
chr7 (172-314)||(32125495-32125638)
chr7 (172-314)||(41522921-41523064)
chr7 (172-314)||(41525383-41525526)
chr7 (208-314)||(44116513-44116620)
chr7 (249-307)||(811180-811238)
chr7 (249-307)||(18005660-18005718)
chr7 (249-307)||(44014192-44014250)
chr7 (204-306)||(2280121-2280225)
chr7 (208-314)||(17061966-17062073)
chr7 (204-306)||(16056343-16056446)
chr7 (208-314)||(16410063-16410170)
chr7 (249-320)||(16495403-16495474)
chr7 (253-320)||(22072914-22072981)
chr7 (172-314)||(27216864-27217007)
chr7 (259-314)||(3386337-3386391)
chr7 (249-320)||(11996076-11996147)
chr7 (268-314)||(13869350-13869396)
chr7 (268-314)||(20110560-20110606)
chr7 (245-306)||(12901338-12901399)
chr7 (250-306)||(14044761-14044817)
chr7 (250-306)||(14354791-14354847)
chr7 (208-314)||(13831377-13831484)
chr7 (248-306)||(1868043-1868101)
chr7 (240-314)||(18154882-18154955)
chr7 (268-314)||(38898489-38898535)
chr7 (1-126)||(12321541-12321666)
chr7 (258-306)||(15144096-15144143)
chr7 (249-320)||(15754936-15755007)
chr7 (203-268)||(2530139-2530205)
chr7 (225-320)||(10063841-10063938)
chr7 (249-299)||(12255842-12255892)
chr7 (250-302)||(20220238-20220290)
chr7 (250-293)||(14036282-14036325)
chr7 (250-293)||(14346312-14346355)
chr7 (249-320)||(19486793-19486864)
chr7 (248-295)||(48991206-48991253)
chr7 (268-314)||(14932802-14932848)
chr7 (248-298)||(15008547-15008597)
chr7 (239-327)||(15211450-15211539)
chr7 (268-314)||(15356237-15356283)
chr7 (268-314)||(15360351-15360397)
chr7 (296-327)||(16213622-16213653)
chr7 (268-314)||(26356106-26356152)
chr7 (268-314)||(26358558-26358604)
chr7 (268-321)||(2832509-2832562)
chr7 (1-38)||(10508881-10508918)
chr7 (252-300)||(9177718-9177766)
[»] chr6 (81 HSPs)
chr6 (116-320)||(16920546-16920750)
chr6 (115-302)||(11185524-11185711)
chr6 (116-300)||(22831524-22831710)
chr6 (149-320)||(35245587-35245758)
chr6 (108-320)||(20360865-20361080)
chr6 (108-320)||(20638188-20638403)
chr6 (109-320)||(29060541-29060755)
chr6 (108-320)||(17287701-17287916)
chr6 (108-323)||(18409732-18409950)
chr6 (108-320)||(19303446-19303660)
chr6 (170-320)||(16496245-16496397)
chr6 (108-320)||(25629260-25629475)
chr6 (1-130)||(19863171-19863300)
chr6 (1-130)||(19873313-19873442)
chr6 (110-320)||(20593774-20593987)
chr6 (1-186)||(25641982-25642168)
chr6 (116-320)||(22780140-22780347)
chr6 (1-173)||(22438951-22439122)
chr6 (172-327)||(30676725-30676881)
chr6 (163-320)||(20076701-20076857)
chr6 (249-320)||(27333267-27333338)
chr6 (249-320)||(27394007-27394078)
chr6 (1-130)||(22432443-22432572)
chr6 (172-327)||(34963364-34963520)
chr6 (1-130)||(22334690-22334819)
chr6 (176-314)||(1595553-1595692)
chr6 (172-314)||(2291195-2291338)
chr6 (221-314)||(25656633-25656727)
chr6 (176-306)||(20109153-20109285)
chr6 (172-314)||(12742321-12742464)
chr6 (172-314)||(18334607-18334750)
chr6 (172-314)||(19005050-19005193)
chr6 (172-314)||(19858934-19859077)
chr6 (208-314)||(22782231-22782338)
chr6 (172-314)||(24422551-24422694)
chr6 (204-306)||(25644335-25644440)
chr6 (172-314)||(25754813-25754956)
chr6 (172-314)||(33861798-33861941)
chr6 (172-314)||(33864282-33864425)
chr6 (249-306)||(9098563-9098620)
chr6 (172-314)||(1540926-1541069)
chr6 (172-314)||(8055033-8055176)
chr6 (172-314)||(26924655-26924798)
chr6 (249-307)||(19652209-19652267)
chr6 (259-320)||(25714418-25714478)
chr6 (2-130)||(15894229-15894357)
chr6 (268-327)||(19848063-19848122)
chr6 (223-313)||(25688507-25688598)
chr6 (249-304)||(28496520-28496575)
chr6 (249-304)||(29808931-29808986)
chr6 (208-307)||(4185827-4185928)
chr6 (221-314)||(16448591-16448685)
chr6 (256-306)||(19668386-19668436)
chr6 (1-130)||(21739821-21739950)
chr6 (204-302)||(23019425-23019525)
chr6 (259-314)||(3852121-3852175)
chr6 (259-314)||(20556996-20557050)
chr6 (268-327)||(23992421-23992480)
chr6 (1-130)||(18907299-18907428)
chr6 (250-302)||(23076749-23076801)
chr6 (250-302)||(35008167-35008219)
chr6 (249-320)||(1561304-1561375)
chr6 (1-99)||(16924678-16924776)
chr6 (172-302)||(18456735-18456866)
chr6 (172-302)||(18461895-18462026)
chr6 (208-307)||(4186381-4186482)
chr6 (274-320)||(22080799-22080845)
chr6 (149-268)||(27415887-27416008)
chr6 (248-300)||(33443068-33443119)
chr6 (249-320)||(8227560-8227631)
chr6 (1-294)||(15041349-15041644)
chr6 (1-64)||(16965109-16965172)
chr6 (259-302)||(18821904-18821946)
chr6 (1-99)||(31164646-31164744)
chr6 (1-130)||(21834689-21834818)
chr6 (239-327)||(25603424-25603512)
chr6 (239-327)||(25611762-25611850)
chr6 (240-314)||(19873123-19873196)
chr6 (240-314)||(22432252-22432325)
chr6 (240-314)||(22438802-22438875)
chr6 (255-319)||(18199473-18199534)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (2-302)||(174785-175086)
scaffold0021 (108-229)||(124679-124801)
scaffold0021 (251-320)||(121767-121835)
scaffold0021 (245-302)||(136414-136471)
scaffold0021 (245-302)||(145122-145179)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (108-320)||(32068-32280)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (108-302)||(5036-5230)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (108-320)||(10331-10543)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (108-305)||(13513-13711)
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (116-320)||(38801304-38801507)
chr1 (103-320)||(27250629-27250849)
chr1 (108-323)||(50210118-50210336)
chr1 (1-186)||(21714684-21714870)
chr1 (1-327)||(22468495-22468823)
chr1 (103-305)||(21026696-21026901)
chr1 (108-327)||(20135181-20135403)
chr1 (108-314)||(34509787-34509996)
chr1 (2-130)||(20091273-20091401)
chr1 (18-185)||(48603652-48603820)
chr1 (120-320)||(22532270-22532473)
chr1 (1-130)||(42865010-42865139)
chr1 (108-246)||(22354477-22354616)
chr1 (252-327)||(20454606-20454680)
chr1 (208-327)||(16361908-16362028)
chr1 (208-319)||(21840766-21840878)
chr1 (1-183)||(21787841-21788023)
chr1 (172-314)||(433016-433157)
chr1 (221-320)||(20847173-20847274)
chr1 (249-317)||(21754049-21754117)
chr1 (172-314)||(13988870-13989013)
chr1 (172-314)||(21923306-21923449)
chr1 (172-314)||(23593750-23593893)
chr1 (172-314)||(29776692-29776835)
chr1 (172-314)||(31612317-31612460)
chr1 (249-306)||(16758664-16758721)
chr1 (204-302)||(21896258-21896358)
chr1 (249-306)||(33681022-33681079)
chr1 (249-305)||(20918620-20918676)
chr1 (172-314)||(21475102-21475245)
chr1 (221-314)||(22123131-22123226)
chr1 (249-307)||(22921918-22921976)
chr1 (204-302)||(21861572-21861672)
chr1 (204-306)||(22237642-22237746)
chr1 (1-130)||(22831177-22831306)
chr1 (249-306)||(52928019-52928076)
chr1 (268-320)||(13212974-13213026)
chr1 (249-301)||(14295600-14295652)
chr1 (259-314)||(29298141-29298195)
chr1 (208-302)||(45574893-45574989)
chr1 (221-314)||(15860073-15860167)
chr1 (249-307)||(20248293-20248351)
chr1 (268-314)||(21342100-21342146)
chr1 (268-314)||(21346965-21347011)
chr1 (268-314)||(21707171-21707217)
chr1 (268-314)||(21711713-21711759)
chr1 (1-130)||(6152046-6152175)
chr1 (249-302)||(35261127-35261180)
chr1 (250-302)||(50614167-50614219)
chr1 (250-302)||(50621995-50622047)
chr1 (252-302)||(16368338-16368388)
chr1 (240-314)||(21714549-21714622)
chr1 (149-268)||(33797573-33797694)
chr1 (223-314)||(16275430-16275522)
chr1 (1-129)||(21022830-21022958)
chr1 (248-302)||(41050084-41050138)
chr1 (1-130)||(18181920-18182049)
chr1 (1-130)||(22449065-22449194)
chr1 (251-302)||(50686630-50686681)
chr1 (248-302)||(16093933-16093987)
chr1 (108-212)||(22356079-22356185)
chr1 (108-212)||(22357765-22357871)
chr1 (250-300)||(26064959-26065009)
chr1 (259-307)||(21161730-21161778)
chr1 (268-314)||(40389158-40389204)
chr1 (268-321)||(24783160-24783213)
chr1 (276-319)||(21533948-21533989)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (108-320)||(15370-15583)
scaffold0114 (1-314)||(7298-7610)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (116-320)||(46996-47200)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (1-318)||(37723906-37724224)
chr5 (1-314)||(22032326-22032636)
chr5 (108-320)||(21292875-21293089)
chr5 (108-320)||(23390401-23390616)
chr5 (4-314)||(18769806-18770115)
chr5 (103-320)||(8286742-8286963)
chr5 (103-305)||(22075035-22075240)
chr5 (108-320)||(25421533-25421748)
chr5 (108-320)||(24493570-24493784)
chr5 (1-314)||(23572087-23572399)
chr5 (1-130)||(26704257-26704386)
chr5 (1-130)||(26973990-26974119)
chr5 (116-314)||(24529227-24529428)
chr5 (108-301)||(25431414-25431610)
chr5 (108-320)||(13025312-13025526)
chr5 (108-320)||(13095496-13095710)
chr5 (108-320)||(1096468-1096683)
chr5 (108-320)||(9077953-9078168)
chr5 (170-320)||(21729032-21729184)
chr5 (170-320)||(21808357-21808509)
chr5 (1-130)||(23201559-23201689)
chr5 (205-320)||(21329500-21329617)
chr5 (1-129)||(14079340-14079468)
chr5 (221-320)||(21997553-21997654)
chr5 (1-183)||(21873387-21873569)
chr5 (2-130)||(23501145-23501273)
chr5 (249-320)||(19660884-19660955)
chr5 (249-320)||(21502205-21502276)
chr5 (172-314)||(29329938-29330081)
chr5 (249-307)||(22959581-22959639)
chr5 (204-314)||(22412191-22412302)
chr5 (205-302)||(20026942-20027043)
chr5 (206-307)||(21565556-21565659)
chr5 (172-314)||(264783-264926)
chr5 (172-314)||(10732955-10733098)
chr5 (172-314)||(20909016-20909159)
chr5 (172-314)||(39363388-39363531)
chr5 (221-314)||(11581263-11581357)
chr5 (221-306)||(26012054-26012141)
chr5 (249-320)||(36314578-36314649)
chr5 (172-314)||(42245380-42245523)
chr5 (172-314)||(36154798-36154938)
chr5 (221-314)||(39245140-39245234)
chr5 (259-314)||(20918052-20918106)
chr5 (172-314)||(29345984-29346127)
chr5 (268-314)||(2154726-2154772)
chr5 (221-314)||(18319098-18319192)
chr5 (268-314)||(23064515-23064561)
chr5 (268-314)||(38619438-38619484)
chr5 (223-314)||(20902075-20902168)
chr5 (204-302)||(22144068-22144168)
chr5 (270-314)||(10775790-10775834)
chr5 (268-327)||(17517269-17517328)
chr5 (202-311)||(18418590-18418699)
chr5 (249-320)||(19668899-19668970)
chr5 (172-314)||(29348457-29348600)
chr5 (172-314)||(29350930-29351073)
chr5 (172-314)||(32027397-32027540)
chr5 (1-127)||(23512301-23512427)
chr5 (268-314)||(31061072-31061118)
chr5 (149-268)||(18356367-18356488)
chr5 (103-186)||(22107273-22107357)
chr5 (268-314)||(20806854-20806900)
chr5 (248-302)||(22178269-22178323)
chr5 (221-314)||(24067111-24067205)
chr5 (240-314)||(26704078-26704151)
chr5 (240-314)||(26973811-26973884)
chr5 (203-268)||(20910800-20910866)
chr5 (251-305)||(26732884-26732937)
chr5 (252-319)||(15796423-15796487)
chr5 (243-294)||(21873277-21873327)
chr5 (251-302)||(26740697-26740747)
chr5 (249-320)||(40725854-40725925)
chr5 (109-157)||(22412340-22412388)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-310)||(26835-27143)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (116-320)||(4713-4919)
scaffold0358 (116-246)||(13-143)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (108-320)||(20698341-20698555)
chr3 (108-320)||(13442275-13442490)
chr3 (1-314)||(856143-856455)
chr3 (108-320)||(17487857-17488072)
chr3 (103-320)||(12399210-12399430)
chr3 (108-320)||(17499339-17499554)
chr3 (108-320)||(14972855-14973070)
chr3 (109-314)||(24153115-24153322)
chr3 (108-307)||(14576738-14576939)
chr3 (116-320)||(18438535-18438742)
chr3 (108-320)||(23083266-23083481)
chr3 (108-320)||(26686888-26687103)
chr3 (108-313)||(43840940-43841148)
chr3 (1-130)||(17524951-17525080)
chr3 (69-185)||(14179570-14179687)
chr3 (1-173)||(23408581-23408752)
chr3 (108-314)||(40213626-40213834)
chr3 (108-320)||(25476290-25476505)
chr3 (172-327)||(13544016-13544172)
chr3 (108-307)||(14572603-14572804)
chr3 (108-320)||(11424668-11424879)
chr3 (204-314)||(27165254-27165366)
chr3 (172-327)||(12567551-12567707)
chr3 (249-317)||(32307681-32307749)
chr3 (172-314)||(9707622-9707765)
chr3 (172-314)||(29172598-29172741)
chr3 (249-307)||(12174308-12174366)
chr3 (205-320)||(14234488-14234605)
chr3 (256-314)||(28194697-28194755)
chr3 (116-303)||(42386428-42386619)
chr3 (204-306)||(15470939-15471043)
chr3 (204-314)||(36166602-36166712)
chr3 (212-314)||(53301561-53301665)
chr3 (1-101)||(15877627-15877727)
chr3 (172-314)||(7781362-7781505)
chr3 (249-320)||(13210376-13210447)
chr3 (172-314)||(17463182-17463325)
chr3 (208-314)||(17672630-17672737)
chr3 (172-314)||(28848626-28848769)
chr3 (172-314)||(34159330-34159473)
chr3 (172-314)||(45606922-45607065)
chr3 (172-310)||(50242830-50242969)
chr3 (172-314)||(55476495-55476638)
chr3 (202-327)||(46822259-46822386)
chr3 (249-307)||(49668125-49668183)
chr3 (206-314)||(55500946-55501055)
chr3 (208-314)||(6469185-6469292)
chr3 (172-314)||(8899098-8899241)
chr3 (208-314)||(15977519-15977626)
chr3 (172-314)||(16454296-16454439)
chr3 (172-310)||(38961906-38962045)
chr3 (221-314)||(8499522-8499616)
chr3 (249-307)||(9512934-9512992)
chr3 (249-307)||(9520909-9520967)
chr3 (253-307)||(16097342-16097396)
chr3 (249-307)||(16103794-16103852)
chr3 (203-327)||(12511051-12511177)
chr3 (1-130)||(23077277-23077406)
chr3 (249-302)||(52523778-52523831)
chr3 (172-314)||(13151805-13151949)
chr3 (172-314)||(13154270-13154414)
chr3 (1-129)||(15051707-15051835)
chr3 (172-314)||(10247738-10247881)
chr3 (259-314)||(16282915-16282969)
chr3 (172-314)||(17446670-17446812)
chr3 (259-314)||(17737240-17737294)
chr3 (204-308)||(21618459-21618563)
chr3 (172-320)||(24340693-24340843)
chr3 (172-302)||(53070668-53070799)
chr3 (268-314)||(10556989-10557035)
chr3 (221-314)||(12119789-12119883)
chr3 (268-314)||(15412433-15412479)
chr3 (268-314)||(41123894-41123940)
chr3 (268-314)||(45577950-45577996)
chr3 (1-129)||(16909941-16910069)
chr3 (250-302)||(22110402-22110454)
chr3 (250-302)||(43925977-43926029)
chr3 (208-302)||(43550529-43550625)
chr3 (248-302)||(37251216-37251270)
chr3 (268-314)||(44494813-44494859)
chr3 (1-129)||(14878304-14878433)
chr3 (1-129)||(15060483-15060611)
chr3 (268-327)||(30029834-30029893)
chr3 (252-302)||(606378-606428)
chr3 (248-302)||(12377940-12377994)
chr3 (249-303)||(23274705-23274759)
chr3 (249-320)||(37642314-37642385)
chr3 (1-130)||(12496445-12496574)
chr3 (249-317)||(1644723-1644790)
chr3 (110-185)||(16796685-16796761)
chr3 (239-314)||(23077517-23077591)
chr3 (250-300)||(13919350-13919399)
chr3 (240-314)||(15878092-15878165)
chr3 (73-130)||(11862981-11863038)
chr3 (268-321)||(14665397-14665450)
chr3 (268-321)||(14668553-14668606)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-314)||(1884-2196)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-314)||(21605-21917)
scaffold0210 (1-314)||(29497-29809)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (108-320)||(13212-13427)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (108-320)||(1852-2067)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (103-320)||(949-1168)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (103-320)||(167879-168098)
scaffold0011 (108-320)||(51914-52129)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (116-320)||(4850-5057)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (108-320)||(3471-3686)
scaffold0292 (108-320)||(344-558)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-314)||(12766-13078)
scaffold0029 (172-327)||(11279-11435)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (108-320)||(6026-6244)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (108-320)||(3056-3270)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (1-186)||(36592-36778)
scaffold0131 (268-314)||(36457-36503)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (108-303)||(24206-24406)
scaffold0042 (1-130)||(34709-34838)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (108-320)||(38762-38976)
scaffold0145 (116-320)||(32943-33149)
scaffold0145 (223-314)||(9753-9845)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (103-320)||(20911-21132)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (116-320)||(1953-2160)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-186)||(20117-20303)
scaffold0139 (248-298)||(38339-38389)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (120-323)||(3103-3309)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-130)||(15468-15597)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (108-323)||(17120-17340)
scaffold0056 (1-130)||(13876-14005)
scaffold0056 (259-302)||(79388-79430)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (116-314)||(22890-23090)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (108-312)||(39486-39692)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (108-314)||(25970-26179)
scaffold0122 (204-314)||(44709-44821)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (108-312)||(75120-75326)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-186)||(69930-70116)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (108-320)||(8438-8649)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (108-306)||(339855-340053)
scaffold0003 (172-314)||(158465-158608)
scaffold0003 (149-268)||(71353-71474)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (108-313)||(25904-26111)
scaffold0026 (108-320)||(39859-40073)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (1-130)||(8756-8885)
scaffold0101 (268-314)||(1393-1439)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (108-320)||(39914-40128)
scaffold0080 (1-130)||(18455-18584)
scaffold0080 (248-302)||(19933-19987)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (185-320)||(28415-28552)
scaffold0046 (249-320)||(11293-11364)
scaffold0046 (249-320)||(1998-2069)
scaffold0046 (265-320)||(4553-4608)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (146-320)||(32901-33076)
scaffold0120 (146-320)||(45929-46104)
scaffold0120 (240-320)||(16114-16193)
scaffold0120 (259-320)||(17389-17449)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (108-320)||(16505-16720)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (1-130)||(1531-1660)
scaffold0261 (245-314)||(15668-15737)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (108-307)||(4522-4723)
scaffold0228 (108-307)||(12104-12305)
scaffold0228 (108-307)||(22056-22257)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (1-130)||(18252-18381)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-130)||(18431-18560)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-130)||(48259-48388)
scaffold0102 (249-307)||(19278-19336)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (1-125)||(65592-65716)
scaffold0031 (172-302)||(20394-20524)
scaffold0031 (176-320)||(128752-128897)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (172-327)||(501075-501231)
scaffold0001 (249-307)||(160698-160756)
scaffold0001 (268-314)||(85692-85738)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (249-320)||(6612-6683)
scaffold0333 (249-320)||(13992-14063)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (116-261)||(6669-6818)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (249-320)||(6172-6243)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (249-320)||(15826-15897)
scaffold0020 (268-314)||(178901-178947)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (204-307)||(100388-100493)
scaffold0023 (6-314)||(38283-38593)
scaffold0023 (249-320)||(119876-119947)
scaffold0023 (172-316)||(17455-17600)
scaffold0023 (172-314)||(44458-44602)
scaffold0023 (172-314)||(94415-94558)
scaffold0023 (1-130)||(23466-23594)
scaffold0023 (250-307)||(40224-40281)
scaffold0023 (249-307)||(101513-101571)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (108-320)||(8480-8691)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (176-306)||(8481-8613)
scaffold0621 (249-320)||(6536-6607)
[»] scaffold0555 (2 HSPs)
scaffold0555 (1-130)||(773-902)
scaffold0555 (204-306)||(10543-10647)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (206-314)||(11447-11557)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-130)||(3933-4061)
scaffold0149 (1-130)||(8364-8492)
scaffold0149 (223-304)||(29946-30028)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (204-314)||(38704-38816)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (6-130)||(1031-1155)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (208-319)||(10772-10884)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (249-312)||(1091-1154)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (172-314)||(4698-4841)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (249-320)||(1083-1154)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-183)||(16148-16330)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (103-271)||(13141-13313)
scaffold0175 (244-320)||(34124-34200)
scaffold0175 (268-313)||(281-326)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (204-302)||(1051-1151)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (1-130)||(14863-14992)
scaffold0081 (1-130)||(23878-24007)
scaffold0081 (1-130)||(39302-39431)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (259-327)||(12353-12420)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (172-314)||(13396-13539)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (172-314)||(20751-20894)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (208-314)||(16788-16895)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (172-314)||(37825-37968)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (172-314)||(136684-136827)
scaffold0028 (172-314)||(139153-139296)
scaffold0028 (172-314)||(144091-144234)
scaffold0028 (172-314)||(134215-134358)
scaffold0028 (172-314)||(141622-141765)
scaffold0028 (249-303)||(62216-62270)
scaffold0028 (257-307)||(132672-132722)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (204-307)||(2808-2913)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (249-307)||(5657-5715)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (249-307)||(2694-2752)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (204-307)||(129919-130024)
scaffold0010 (245-302)||(60761-60818)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (245-306)||(8119-8180)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (249-306)||(23932-23989)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (204-306)||(22672-22776)
scaffold0037 (172-314)||(82076-82219)
scaffold0037 (1-130)||(21368-21497)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (216-306)||(32551-32643)
scaffold0034 (252-302)||(51936-51985)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (204-314)||(116434-116544)
scaffold0022 (250-302)||(129021-129072)
scaffold0022 (252-298)||(78345-78391)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (250-307)||(14747-14804)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (223-314)||(4301-4393)
scaffold0761 (1-129)||(6108-6236)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (2-130)||(6294-6422)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (259-319)||(9241-9300)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (71-171)||(23995-24094)
scaffold0198 (240-314)||(23846-23919)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (2-130)||(46527-46655)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (172-314)||(110-253)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (172-314)||(13951-14094)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (249-320)||(1118-1189)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (249-307)||(6826-6884)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (249-307)||(45841-45899)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (248-306)||(25121-25179)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (205-307)||(12780-12884)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (204-302)||(12587-12687)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-130)||(6877-7006)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (1-130)||(32626-32754)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (204-306)||(10542-10646)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (204-302)||(53551-53651)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (205-306)||(12954-13057)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (139-300)||(4545-4709)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (208-314)||(40404-40511)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (249-307)||(143-201)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (204-302)||(13147-13247)
scaffold0357 (204-306)||(16102-16206)
scaffold0357 (250-302)||(2680-2732)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (204-314)||(161136-161248)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (249-320)||(11465-11536)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (248-318)||(6332-6400)
scaffold0420 (255-318)||(13793-13854)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-80)||(15642-15721)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (172-320)||(17997-18147)
scaffold0247 (221-310)||(2193-2283)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (249-307)||(28818-28877)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (249-320)||(38305-38376)
scaffold0124 (69-130)||(42810-42871)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (252-302)||(569-619)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (221-314)||(4218-4312)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (254-320)||(4888-4953)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (108-241)||(27912-28046)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-130)||(6215-6344)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (172-314)||(12068-12205)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (249-306)||(27798-27855)
scaffold0165 (110-157)||(3648-3695)
scaffold0165 (110-157)||(7712-7759)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (1-129)||(582-710)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (110-185)||(1052-1128)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (2-130)||(348-476)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (257-307)||(32112-32162)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (149-268)||(15362-15483)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (248-302)||(2694-2748)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (248-306)||(103679-103737)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-130)||(1883-2012)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-130)||(4732-4861)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-130)||(3030-3159)
scaffold0158 (1-130)||(6696-6825)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (202-300)||(8059-8161)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (108-246)||(3434-3574)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (250-302)||(97024-97076)
scaffold0006 (250-302)||(106302-106354)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (259-302)||(11982-12024)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (248-302)||(267679-267733)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (268-314)||(29561-29607)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (88-130)||(4691-4733)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (250-300)||(206575-206624)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-130)||(1084-1213)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (73-129)||(44269-44325)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 79)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 21395781 - 21396100
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21395781 gcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 21395880  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21395881 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatac 21395980  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395981 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21396080  T
Q  301 agttgattaagatgttgatg 320  Q
    || || | |||||| |||||    
T  21396081 agatgttgaagatgatgatg 21396100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 21790274 - 21790593
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21790274 gcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 21790373  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21790374 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatac 21790473  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790474 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21790573  T
Q  301 agttgattaagatgttgatg 320  Q
    || || | |||||| |||||    
T  21790574 agatgttgaagatgatgatg 21790593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Original strand, 21389254 - 21389570
Alignment:
Q  4 tcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatata 103  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21389254 tcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccaatata 21389353  T
Q  104 agaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacata 203  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21389354 tgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 21389453  T
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21389553  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    || | |||||| |||||    
T  21389554 tgttgaagatgatgatg 21389570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778896
Alignment:
Q  121 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31971471 - 31971258
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971471 gttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 31971372  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971371 gttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
     | |||||| |||||    
T  31971272 ttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 16199551 - 16199764
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16199551 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 16199650  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16199651 gtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 16199750  T
Q  307 ttaagatgttgatg 320  Q
    | |||||| |||||    
T  16199751 tgaagatgatgatg 16199764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 45130903 - 45131116
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45130903 gttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagat 45131002  T
Q  208 gttgatgaa-ttgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45131003 gttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 45131101  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
     | |||||| |||||    
T  45131102 ttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 18879150 - 18879351
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  18879150 taatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 18879248  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||| | ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18879249 aattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T
Q  315 ttgatg 320  Q
     |||||    
T  18879346 atgatg 18879351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20536424 - 20536209
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  20536424 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20536325  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536324 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20536226  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  20536225 tgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 320
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919120
Alignment:
Q  118 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaa-tatttgtatacataagatgttgatgaa 216  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  217 ttgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 313  Q
    ||| | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 21919113  T
Q  314 gttgatg 320  Q
    | |||||    
T  21919114 gatgatg 21919120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22626951 - 22626737
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  22626951 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaaga 22626852  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626851 tgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22626753  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  22626752 gatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 323
Target Start/End: Original strand, 28648949 - 28649167
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||   ||||||  |||||    
T  28648949 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaaga 28649048  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649049 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 28649147  T
Q  304 tgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  28649148 tgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 18818314 - 18818529
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  18818314 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 18818413  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || || ||| ||  | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818414 tgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18818512  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  18818513 tgatgaagatgatgatg 18818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 21923833 - 21924048
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    |||| ||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  21923833 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 21923932  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923933 tgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21924031  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  21924032 tgatgaagatgatgatg 21924048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 17353736 - 17353865
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17353736 gcctcgcgagcacttgcagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 17353835  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17353836 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 17353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23648769 - 23648547
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  23648769 gttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaga 23648670  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| || |||| |  |||||| ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23648669 tgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23648571  T
Q  304 tgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23648570 tgattaagatgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372779
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    | || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7372795  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  7372794 gatgaagatgatgatg 7372779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875066
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  206 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatg 22875066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406380
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  207 tgtt--gatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    || |  | ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23406399  T
Q  302 gttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  23406398 gttgatgaagatgatgatg 23406380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6759472 - 6759259
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||  ||   ||||||  | ||    
T  6759472 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgag 6759373  T
Q  206 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759372 atgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6759277  T
Q  303 ttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  6759276 ttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 320
Target Start/End: Original strand, 16092272 - 16092462
Alignment:
Q  133 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 231  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  16092272 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatta 16092371  T
Q  232 ttatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16092372 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520369
Alignment:
Q  205 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  303 ttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||| |||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatg 6520369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19899415 - 19899286
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19899415 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 19899316  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19899315 ttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19899286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855371
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 38855371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140917
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
     | |||||| |||||    
T  17140931 ttgaagatgatgatg 17140917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285606
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  302 gttgattaaga 312  Q
    |||||||||||    
T  21285616 gttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Original strand, 16413331 - 16413476
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  16413331 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 16413429  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413430 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409602
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14409602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490996
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760950
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24756041 - 24755912
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   || ||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24756041 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 24755942  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  24755941 ataggatgttaactgcaatctgtgaagctg 24755912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16185048 - 16184877
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||   || ||  |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16185048 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctat 16184949  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 173  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||| | ||| | |||||||||    
T  16184948 ataagatgttaactgcaatctgtgaagctg-atatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgttta 16184877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484406
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853450
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866394
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 5866394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Original strand, 20046246 - 20046353
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20046343  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  20046344 gattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403231
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001757
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983512
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19983413 - 19983284
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||   || ||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  19983413 gcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaaatgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctgggtagtaatgtgacctat 19983314  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19983313 ttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19983284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41598335 - 41598192
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  41598335 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 41598237  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598236 -gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 327
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678229
Alignment:
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355805
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 318
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290857
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21161857 - 21161986
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| ||||||| ||  |||| || |||||||||| ||||||| ||||   ||||||    
T  21161857 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgtatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataacctat 21161956  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  21161957 acaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 21161986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 23776633 - 23776816
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatt-tgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagaccta 99  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||| | || || | |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  23776633 gcctcgcgagcactttcagaactgagtgcaagctaggatattgcgaatctgtgtcgcataatttggttagagatggacacttaggtagtaatgtgaccta 23776732  T
Q  100 tataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 183  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||  || || |||||| |||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  23776733 tataagaagttaactgcaatttgtgaagctg-ttatgaaatgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattactt 23776816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26224034 - 26223914
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||   || ||||||| ||| | | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26224034 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctt-tattgctgtt-gttatttaattaagctgcatgggtcgatcta 26223937  T
Q  301 agttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26223936 agttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483285
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483328 -gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542531
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 15203246 - 15203389
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15203246 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15203344  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15203345 -gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896269
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19976765 - 19976654
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||| || |||||||| || | |||| ||||| |||||||    
T  19976765 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctaggtagtaatgtgacctat 19976666  T
Q  101 ataagaagttaa 112  Q
     |||||||||||    
T  19976665 ttaagaagttaa 19976654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225405
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121726
Alignment:
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 318
Target Start/End: Original strand, 13508055 - 13508203
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgttt 269  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||  || ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  13508055 tatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgatt 13508154  T
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  13508155 gttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13508203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498581
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  20498581 g 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219721
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||  | ||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    |||||||| ||||    
T  26219733 gttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Original strand, 25363047 - 25363123
Alignment:
Q  110 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 185  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363047 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116366
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612230
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 17612230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154989
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937164
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673718
Alignment:
Q  253 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 20465838 - 20465967
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    ||| | ||||| || ||| ||| || | || |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  20465838 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttgaattgattagggacggacccttaggtagtaatgtgacctat 20465937  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20465938 ataagaggttaactgcaatctgtgaagctg 20465967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21168520 - 21168649
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||   || ||| ||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||| ||||   ||||||    
T  21168520 gcctcgcaagcacttcctgatctgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataacctat 21168619  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  21168620 acaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 21168649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267096
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21249457 - 21249385
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21249457 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21255295 - 21255223
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21255295 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21255223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 377596 - 377469
Alignment:
Q  3 ctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatat 102  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |    ||||| ||||| || ||| ||| || | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  377596 ctcgcgagcacttccagaactgagtgctaatgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatat 377497  T
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  377496 aagatgttaactgcaatctgtgaagctg 377469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 318
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597735
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13597735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484426
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439609
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 302
Target Start/End: Original strand, 19801383 - 19801527
Alignment:
Q  159 gtgttataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgc 255  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||     
T  19801383 gtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt 19801482  T
Q  256 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
     | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801483 -tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 130
Target Start/End: Original strand, 17926578 - 17926635
Alignment:
Q  73 tggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17926578 tggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctg 17926635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14823920 - 14823778
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  14823920 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 14823822  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14823821 -gttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 319
Target Start/End: Original strand, 2418930 - 2418989
Alignment:
Q  258 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2418930 atgttgctgtttattattgaattaagctgcatatgtcggtctaagttg--taagatgttgat 2418989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 129
Target Start/End: Original strand, 19259451 - 19259509
Alignment:
Q  71 gatggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  19259451 gatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagct 19259509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20309313 - 20309109
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309313 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 20309214  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||     
T  20309213 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 20309114  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  20309113 tgatg 20309109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 38021 - 38234
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38021 gttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 38120  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38121 gatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
     | |||||| |||||    
T  38220 ttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 40622007 - 40622324
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40622007 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgcatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 40622106  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatt-----tg 195  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||    
T  40622107 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactg 40622205  T
Q  196 tatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  40622206 tatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagt 40622303  T
Q  294 cggtctaagttgattaagatg 314  Q
    || | |||| |||||||||||    
T  40622304 cgatataagatgattaagatg 40622324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23286082 - 23285866
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||      
T  23286082 aagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatt 23285983  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285982 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23285885  T
Q  302 gttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  23285884 gttgatgaagatgatgatg 23285866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 314
Target Start/End: Original strand, 298714 - 298929
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||      
T  298714 aagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 298813  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298814 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298913  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  298914 taagttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 22731139 - 22731354
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||| |    
T  22731139 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaata 22731238  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22731239 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaact 22731337  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  22731338 tgatgaagatgatgatg 22731354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 22738085 - 22738299
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22738085 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22738184  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738185 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22738282  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  22738283 tgatcaagatgatgatg 22738299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Original strand, 23103254 - 23103515
Alignment:
Q  60 atttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaag 159  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||  | ||| |    
T  23103254 atttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttggatttgatg 23103352  T
Q  160 tgttataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcc 256  Q
    || |||||||||||  ||||| |||||||  ||   || ||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  23103353 tgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcc 23103452  T
Q  257 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  23103453 tatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 23103515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Original strand, 23654286 - 23654506
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||      
T  23654286 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatt 23654385  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654386 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23654484  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| | |||||| |||||    
T  23654485 taagttgttgaagatgatgatg 23654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23060728 - 23060514
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||    
T  23060728 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaaga 23060630  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060629 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23060531  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  23060530 tgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076443
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    | ||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
     ||| |||||| |||||    
T  23076459 ggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22740759 - 22740945
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22740759 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 22740858  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22740859 ataagaagttaactgcaatctttgaagttg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22740945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23038355 - 23038227
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23038355 gcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaattgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctat 23038256  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||    
T  23038255 ataagaagttatctgcaatctgtgaagct 23038227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22337331 - 22337116
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  22337331 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22337232  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337231 tgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22337133  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  22337132 tgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23660238 - 23660024
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||    
T  23660238 gttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaaga 23660139  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23660138 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagtt 23660040  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  23660039 gatgaagatgatgatg 23660024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22758514 - 22758700
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22758514 gcctcgtgagcactttcagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 22758613  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
    ||||||| |||| || ||||| ||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22758614 ataagaaattaactgcaatctatgaagctg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22758700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 22798925 - 22799220
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22798925 gcctcgcgagcacttccagaactaagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctat 22799024  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgtat 198  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||| |||| ||  ||| ||    
T  22799025 ataagaagttaactgcaatttgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttactt-aagatattattgaat 22799122  T
Q  199 acataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 294  Q
       |||||||||| |||| |||| ||||||| || | |||   ||||||||||   ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799123 gattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgct-attgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Original strand, 32214936 - 32215092
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  32214936 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 32215034  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215035 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105416
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679592
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 23019505 - 23019633
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23019505 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtcaggatattgcgatctgtgtcgcataatttaattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctat 23019604  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  23019605 ataagaagttatttgcaatttgtgaagct 23019633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505383
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507861
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808947
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130866
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133333
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135594
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709690
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712171
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402680
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682317
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405990
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 306
Target Start/End: Original strand, 23708589 - 23708725
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgttt 269  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||||| ||||| ||| | |||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| | |    
T  23708589 tatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatct 23708688  T
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23708689 gttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 45029863 - 45030012
Alignment:
Q  166 aatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgtt 262  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||  | ||||    
T  45029863 aatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgtt 45029961  T
Q  263 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029962 gttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571401
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  571410 gattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6726142 - 6725999
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  6726142 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 6726044  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726043 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946658
Alignment:
Q  245 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155218
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155174 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367782
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43137410 - 43137303
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137410 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 43137313  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  43137312 gattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175864
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7835
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  7835 g 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898354
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24898308  T
Q  269 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898309 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900837
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24900791  T
Q  269 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900792 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903314
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24903268  T
Q  269 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903269 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905791
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24905745  T
Q  269 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905746 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908266
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24908220  T
Q  269 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908221 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671831
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 19671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 320
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040309
Alignment:
Q  257 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23040309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072069
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatg 23072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643108
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039656
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||| |||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039612 -gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207296
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577103
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967378
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787009
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 45677954 - 45678078
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| |   |||||| |||||||||||| ||| || | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  45677954 gcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgagttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctat 45678053  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtga 125  Q
    ||| || |||||||| |||||||||    
T  45678054 ataggatgttaattgcaatctgtga 45678078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 323
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134329
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatgatg 22134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529687
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616179
Alignment:
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtc 25616208  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||    
T  25616207 taagttgattaagatgttaataatgatgt 25616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520295
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413240
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004767
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 23101029 - 23101093
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgt 65  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  23101029 gcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgaggataatgcgatctatgtcgcatgatttgt 23101093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21918115 - 21918244
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||   || ||| ||| |||||| | ||| ||   | ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  21918115 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattatggttggacccttaggtagtaatgtgacctat 21918214  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21918215 ttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 21918244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 130
Target Start/End: Original strand, 25963588 - 25963645
Alignment:
Q  73 tggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25963588 tggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctg 25963645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  251 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791292
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24673896 - 24673768
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||   || ||| |||||||||| | ||| || | | ||||| |||  ||| ||||| |||||||    
T  24673896 gcctcgcgagcacttccacaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaagtagtaatgtgacctat 24673797  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    ||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  24673796 ataggatgttaattgcgatctgtgaagct 24673768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697709
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1290
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1494 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 1395  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||     
T  1394 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1295  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  1294 tgatg 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7267
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7471 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 7372  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||     
T  7371 attgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 7272  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  7271 tgatg 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 314
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15352
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16283
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16487 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatga 16388  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||     
T  16387 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 16288  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  16287 tgatg 16283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046488
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17046700 gttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagat 17046601  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17046600 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 17046501  T
Q  308 taagatgttgatg 320  Q
     |||||| |||||    
T  17046500 gaagatgatgatg 17046488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 14053207 - 14053421
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataag-a 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14053207 gttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaa 14053306  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  14053307 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatg 14053406  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
     | |||||| |||||    
T  14053407 ttgaagatgatgatg 14053421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12902978 - 12902758
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||      
T  12902978 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 12902879  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902878 taagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12902780  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| | |||||| |||||    
T  12902779 taagttgttgaagatgatgatg 12902758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7089098 - 7088878
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||      
T  7089098 aagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatg 7088999  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088998 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7088900  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  7088899 taagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 15121602 - 15121914
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |   || ||| ||||||| || | |||||| || ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  15121602 gcctcgcgagcacttccagaattgagtgcaagtgagaactttgcgatctgtgtcgaataacttgtttagacatggaccattaggtagtaatgagacctat 15121701  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15121702 ataagaagttaactgcaatctgtgaggctga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 15121800  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    ||||||||  ||||||||| || |  |||||||| ||| ||| |||||||||||     
T  15121801 ataagatgttgatgaattgaa-ttgatataatta--tcatgattattgttgtaatctgcctatgctgat-attgttattcaaccaagttgcatgagtcga 15121896  T
Q  297 tctaagttgattaagatg 314  Q
    | |||| |||||||||||    
T  15121897 tataagatgattaagatg 15121914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22636650 - 22636437
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22636650 gttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22636552  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636551 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22636453  T
Q  304 tgattaagatgttgat 319  Q
    |||| |||||| ||||    
T  22636452 tgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44053045 - 44052830
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  44053045 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 44052946  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44052945 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagt 44052847  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  44052846 tgatgaagatgatgatg 44052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 316
Target Start/End: Original strand, 23374259 - 23374475
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||      
T  23374259 aagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 23374358  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23374359 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttc 23374457  T
Q  299 taagttgattaagatgtt 316  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  23374458 taagttgttgaagatgtt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 16270149 - 16270355
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| |     
T  16270149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 16270248  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T
Q  313 tgttgatg 320  Q
    || |||||    
T  16270348 tgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 313
Target Start/End: Original strand, 16377428 - 16377634
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  16377428 gttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 16377527  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377528 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16377626  T
Q  306 attaagat 313  Q
    || |||||    
T  16377627 atgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798775
Alignment:
Q  140 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 238  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  239 atgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 16239875 - 16240089
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| |||  |||||    
T  16239875 gttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaaga 16239974  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  16239975 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagtt 16240073  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  16240074 gatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14038863 - 14038655
Alignment:
Q  109 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||   ||||||  | ||||    
T  14038863 ttaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagat 14038764  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 14038665  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||| ||||||    
T  14038664 gatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13569832 - 13569703
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13569832 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctat 13569733  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13569732 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 13569703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899892
Alignment:
Q  152 ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gt 248  Q
    |||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||  ||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgt 6899963  T
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6899962 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7893916 - 7893704
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||||||| |||  |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  7893916 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 7893820  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7893819 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagt 7893721  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  7893720 tgatgaagatgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23843798 - 23843669
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  23843798 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtggtaatgtgacctat 23843699  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23843698 ataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 23843669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 327
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618343
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  305 gattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  19618321 gattaagatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280320
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15094093 - 15093911
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  15094093 gcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggttagtaatgtgacctat 15093994  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 183  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15093993 ataagaagttaactgcaatctctgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 15093911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706408
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 39706408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 320
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873487
Alignment:
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatg 52873487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44675951 - 44675823
Alignment:
Q  2 cctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||| ||||| |||||||     
T  44675951 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctaggtagtaatgtgacctatt 44675852  T
Q  102 taagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44675851 taagaagttaactgcaatctgtgaagctg 44675823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551818
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 15551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215432
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 44928894 - 44929038
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  44928894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt 44928993  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928994 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798868
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774021
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13953
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  13953 g 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288316
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12570341 - 12570212
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   || ||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12570341 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 12570242  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  12570241 ataggatgttaactgcaatctgtgaagctg 12570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243302
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096294
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12465
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118510
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 23803280 - 23803423
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  23803280 tatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 23803378  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803379 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615292
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312514
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 15355389 - 15355487
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355389 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 15355486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574981
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    ||| |||||||||    
T  8574969 gttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 327
Target Start/End: Original strand, 14970758 - 14970878
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14970758 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 14970855  T
Q  305 gattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  14970856 gattaaaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 1837524 - 1837667
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1837524 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1837622  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837623 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3515154 - 3515011
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  3515154 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 3515056  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515055 -gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239577
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19242846 - 19242703
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| ||||||    
T  19242846 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt 19242748  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242747 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773245
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  44773236 gattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222497
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||  | ||||||||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222453 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464026
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  51464017 gattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846370
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 306
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198661
Alignment:
Q  256 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3096859 - 3096772
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttg 195  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096859 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641340
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610954
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102218
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 15124953 - 15125081
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |  ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |    
T  15124953 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatatttcgatatgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgaccttt 15125052  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  15125053 ttaa-atgttaactgcaatctgtgaagctg 15125081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353852
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttg-tata--ctgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt 22353885  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353884 -gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 268
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256227
Alignment:
Q  203 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640558
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 185
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048055
Alignment:
Q  120 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 185  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367691
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370019
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371203
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373484
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402704
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223533
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 16223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 16487877 - 16488005
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||   || ||| ||| |||||| | ||| || | ||||||||||| |||| ||||| | |||||    
T  16487877 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtcctat 16487976  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
     ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16487977 ttaagatgttaattgagatctgtgaagct 16488005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 16356752 - 16356881
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| || |   || ||| ||| |||||| | ||| || | | ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  16356752 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctat 16356851  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16356852 ttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 16356881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16596720 - 16596686
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596720 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Original strand, 16348536 - 16348592
Alignment:
Q  73 tggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16348536 tggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagct 16348592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 302
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815731
Alignment:
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 51787 - 51601
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51787 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatga 51688  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51687 attgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 965 - 1169
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  965 taatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 1064  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||     
T  1065 attgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1164  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  1165 tgatg 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 27847746 - 27847950
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27847746 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 27847845  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||     
T  27847846 attgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatga 27847945  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  27847946 tgatg 27847950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40443605 - 40443393
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40443605 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 40443506  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  40443505 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgt 40443406  T
Q  307 ttaagatgttgat 319  Q
    | |||||| ||||    
T  40443405 tgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 17137862 - 17138174
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   |||||| ||||| || ||| ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17137862 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctat 17137961  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17137962 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 17138060  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |     
T  17138061 ataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgata 17138158  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  17138159 taagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12699048 - 12698832
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt----tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698948 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12698850  T
Q  303 ttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  12698849 ttgatgaagatgatgatg 12698832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12187334 - 12187022
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |  ||||| | ||| || ||| ||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  12187334 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatatagtgatatatgttgcttgaattgattagagatggaccattaggtagtaatgagacctat 12187235  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12187234 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-taagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 12187136  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg-ttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||     
T  12187135 ataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcga 12187040  T
Q  297 tctaagttgattaagatg 314  Q
    | |||| |||||||||||    
T  12187039 tataagatgattaagatg 12187022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9509405 - 9509190
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  9509405 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 9509306  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509305 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9509207  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  9509206 tgatgaagatgatgatg 9509190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 314
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456526
Alignment:
Q  109 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  306 attaagatg 314  Q
    |||||||||    
T  18456518 attaagatg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10589254 - 10589055
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |||||    
T  10589254 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagat 10589155  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 10589056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26212217 - 26212012
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||      
T  26212217 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 26212118  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26212117 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtc 26212019  T
Q  299 taagttg 305  Q
    |||||||    
T  26212018 taagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Original strand, 16386147 - 16386368
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||      
T  16386147 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatt 16386246  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386247 taagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16386346  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| | |||||| |||||    
T  16386347 taagttgttgaagatgatgatg 16386368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18154635 - 18154821
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18154635 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattaaagatggaccattgggtagtaatgagacctat 18154734  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| | | |||||||||||  |||||||||||||    
T  18154735 ataagaagttaactgcaatatgtgaagctg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaa 18154821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 314
Target Start/End: Original strand, 3564269 - 3564478
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  3564269 gttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 3564368  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564369 tgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 3564467  T
Q  304 tgattaagatg 314  Q
    |||| ||||||    
T  3564468 tgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38227696 - 38227482
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||    
T  38227696 gttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaaga 38227597  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38227596 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagta 38227498  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  38227497 gatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9703587 - 9703458
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9703587 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctat 9703488  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9703487 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 9703458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67746
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 67746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16213831 - 16213688
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  16213831 tatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 16213733  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213732 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16213688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275162
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 24275162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24054784 - 24054618
Alignment:
Q  6 gcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatataag 105  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||| | | || ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24054784 gcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaatattgcgatctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataag 24054685  T
Q  106 aagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 173  Q
     |||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  24054684 gagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatatgatgttta 24054618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273396
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704692
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 271  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  272 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702242
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505418
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 28505418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200787
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 34200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831808
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 47831808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 19649285 - 19649469
Alignment:
Q  3 ctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatat 102  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  19649285 ctcgcgagcacttccagaaccgagtgtaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaat 19649384  T
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
     ||||||||| || |||||||||||| |  ||||  |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  19649385 tagaagttaactgcaatctgtgaagcag-ttaagtgatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 19649469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11880573 - 11880456
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11880573 gcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatatgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 11880474  T
Q  101 ataagaagttaattgtaa 118  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  11880473 ataagatgttaactgtaa 11880456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430710
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 18430710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456325
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393445
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972500
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647344
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949280
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376871
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 306
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219823
Alignment:
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  300 aagttga 306  Q
    |||||||    
T  16219817 aagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232524
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640276
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385281
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189753
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125495
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522921
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525383
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116513
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  44116522 gattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811238
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005660
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014192
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44014192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280225
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  302 gttga 306  Q
    |||||    
T  2280221 gttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062073
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  306 attaagatg 314  Q
    |||||||||    
T  17062065 attaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056343
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T
Q  303 ttga 306  Q
    ||||    
T  16056346 ttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410063
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  16410072 gattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495403
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 16495403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072914
Alignment:
Q  253 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216864
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386337
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996147
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 11996147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869350
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13869350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110560
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901338
Alignment:
Q  245 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13831484 - 13831377
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||   ||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13831484 gttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 13831387  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  13831386 gattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 306
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868101
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154955
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898535
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 12321541 - 12321666
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |    | ||| |||||||||||| ||| || | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  12321541 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctat 12321640  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaa 126  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||    
T  12321641 ataagatgttaactgcaatctgtgaa 12321666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144143
Alignment:
Q  258 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755007
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 268
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  203 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 320
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063938
Alignment:
Q  225 gatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatg 10063938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220290
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 19486793 - 19486864
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 19486864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991206
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932848
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 298
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008597
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15211539 - 15211450
Alignment:
Q  239 atgttgttgt-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-ttaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15211539 atgttgttgtgattctgcctatgctgctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 15211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356283
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360397
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213622
Alignment:
Q  296 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16213622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 26356106 - 26356152
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26356106 ttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 26358558 - 26358604
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26358558 ttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832562
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 2832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 10508881 - 10508918
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgagga 38  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10508881 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagga 10508918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177766
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtcta 9177766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 81)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 16920546 - 16920750
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920546 taatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 16920645  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||     
T  16920646 atggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatga 16920745  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  16920746 tgatg 16920750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 115 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11185711 - 11185524
Alignment:
Q  115 gtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  11185711 gtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22831710 - 22831524
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacat--aagatgttgat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  22831710 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 22831611  T
Q  214 gaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831610 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 149 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245587
Alignment:
Q  149 tgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt 248  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 35245587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 20360865 - 20361080
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  20360865 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20360964  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20360965 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagt 20361063  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| || ||| |||||    
T  20361064 tgatgaaaatgatgatg 20361080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 20638188 - 20638403
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||   ||||    
T  20638188 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaaga 20638287  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20638288 tgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 20638386  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  20638387 tgatgaagatgatgatg 20638403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29060755 - 29060541
Alignment:
Q  109 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  ||   ||||||| | ||||    
T  29060755 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagat 29060656  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 17287701 - 17287916
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   ||  |||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287801 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17287899  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17287900 tgattaagatgatgatg 17287916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 323
Target Start/End: Original strand, 18409732 - 18409950
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  ||   || ||   | |||    
T  18409732 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgaga 18409831  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18409832 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagt 18409930  T
Q  304 tgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  18409931 tgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 19303446 - 19303660
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  19303446 gttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgaga 19303545  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19303546 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 19303644  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  19303645 gatgaagatgatgatg 19303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16496397 - 16496245
Alignment:
Q  170 tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctg 266  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  16496397 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 16496298  T
Q  267 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  16496297 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 16496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 25629260 - 25629475
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  25629260 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 25629359  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||   ||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629360 tgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25629458  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  25629459 tgatgaagatgatgatg 25629475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19863300 - 19863171
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19863300 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcacatcatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 19863201  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19863200 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19873442 - 19873313
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19873442 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcgcatcattttattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 19873343  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19873342 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19873313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20593987 - 20593774
Alignment:
Q  110 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 208  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||    
T  20593987 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatg 20593888  T
Q  209 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttg 20593789  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
    || |||||| |||||    
T  20593788 atgaagatgatgatg 20593774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 25641982 - 25642168
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25641982 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgaactgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 25642081  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  25642082 ataagaagttaactgcaatctttgaagttg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 25642168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 22780140 - 22780347
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||   |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||    
T  22780140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 22780239  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 311  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T
Q  312 atgttgatg 320  Q
    ||| |||||    
T  22780339 atgatgatg 22780347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22439122 - 22438951
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | | || ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22439122 gcctcgcgagcacttccacaactgagtgcaagtgagaatattgcgatctgtgtcgcataattcgatttgagatggacccttgggtagtaatgagatctat 22439023  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 173  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  22439022 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagttta 22438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Original strand, 30676725 - 30676881
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  30676725 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 30676823  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676824 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20076857 - 20076701
Alignment:
Q  163 tataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctat 259  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  20076857 tataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctat 20076761  T
Q  260 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20076760 gttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20076701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333338
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394078
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22432572 - 22432443
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | | || ||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22432572 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttagtatattgcgatctgtgtctcattatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctat 22432473  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  22432472 ataagaagttaactacaatctgtgaagctg 22432443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34963520 - 34963364
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34963520 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34963422  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963421 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 22334690 - 22334819
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  22334690 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccctgggtagcaatgagacctat 22334789  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  22334790 ataagaagttaactgcaatctgtaaagctg 22334819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595553
Alignment:
Q  176 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 272  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgtt 1595595  T
Q  273 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1595594 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291338
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656633
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109153
Alignment:
Q  176 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 273  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| |||||||||  |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  274 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742321
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334750
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005050
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859077
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22782338 - 22782231
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22782241  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  22782240 gattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422551
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644335
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  301 agttga 306  Q
    ||||||    
T  25644340 agttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25754956 - 25754813
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  25754956 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 25754858  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754857 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861798
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864282
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098620
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541069
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055033
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055077 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924798
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924754 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652209
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714418
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 25714418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 15894229 - 15894357
Alignment:
Q  2 cctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   || |   |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15894229 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgtcctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 15894328  T
Q  102 taagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    || || ||||| |  ||||||||||||||    
T  15894329 taggatgttaactacaatctgtgaagctg 15894357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 327
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848122
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688507
Alignment:
Q  223 ttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 313  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496575
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29808986
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 307
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185928
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4185926  T
Q  306 at 307  Q
    ||    
T  4185927 at 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 16448591 - 16448685
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448591 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668386
Alignment:
Q  256 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21739821 - 21739950
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |   || ||| |||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  21739821 gcctcgcgagcacttccagaactgagtacaattgagaatgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctat 21739920  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  21739921 ataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 21739950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019425
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  23019425 g 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852175
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 20556996 - 20557050
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20556996 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992421
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 23992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18907428 - 18907299
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18907428 gcctcgcgagcacttccagaacagagtgcaaatgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctat 18907329  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  18907328 ttaagatgttaactgcaatatgtgaagctg 18907299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561304
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 16924678 - 16924776
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttg-tttggagatggacccttgggtaataatgagaccta 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16924678 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagtttaatgcgatctgtgtcgcatgctttgattaggag-tggacccctgggtagtaatgagaccta 16924776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18456866 - 18456735
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18456866 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18456768  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461895
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186381
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  306 at 307  Q
    ||    
T  4186382 at 4186381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080845
Alignment:
Q  274 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatg 22080845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  149 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-t 245  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| || |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  246 tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443068
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 8227560 - 8227631
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8227560 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatg 8227631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 15041349 - 15041644
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||   || | ||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  15041349 gcctcgcaaccacttccagaattgagtgcaagtgagtttaacgcgatctgtatcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtaatgagacctaa 15041448  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatat-ttgtata 199  Q
      | || ||||  |  ||||||| ||||||  |||||| ||||| || | |||| ||  || | |||||| | ||||||||||| ||| | | ||| |||    
T  15041449 tgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatgtgcattacttg-agattttattgaata 15041547  T
Q  200 cataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 294  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||   |||||||||   ||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041548 cttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctact-attgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 16965109 - 16965172
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttg 64  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||    
T  16965109 gcctcacgagcacttccagaacttagtgcaagtgagtttaatgtgatctgtgtcgcatgctttg 16965172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 302
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821946
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 31164646 - 31164744
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagaccta 99  Q
    |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||   |||| ||  ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  31164646 gcctcgcgagtacttccagaattgagtgcaagtgagtttaatgcgacctgtgtcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtagtgagaccta 31164744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21834689 - 21834818
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||   || ||| ||| |||||| | ||| || | |||||||||||  ||| ||||  |||||||    
T  21834689 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttcagtagtaatctgacctat 21834788  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21834789 ttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 21834818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 327
Target Start/End: Original strand, 25603424 - 25603512
Alignment:
Q  239 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25603424 atgttgttgtaatctgcctatgctgctg-ttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 25603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 327
Target Start/End: Original strand, 25611762 - 25611850
Alignment:
Q  239 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25611762 atgttgttgtaatctgcctatgctgctg-ttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 25611850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19873196 - 19873123
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19873196 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 19873123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432252
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 22432252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438802
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 22438802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 319
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199534
Alignment:
Q  255 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatg--taagatgttgat 18199534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 175086 - 174785
Alignment:
Q  2 cctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  175086 cctcgcgagcacttccagaaccgagtccaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctata 174987  T
Q  102 taagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgtata 199  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  ||   || ||     
T  174986 taagaagttaactgaaatctgtgaagct-attatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatg 174888  T
Q  200 cataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
      | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174887 attgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 174788  T
Q  300 aag 302  Q
    |||    
T  174787 aag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 124801 - 124679
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |    
T  124801 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaa 124702  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatat 229  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  124701 cgttgatgaattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121767
Alignment:
Q  251 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 121767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 302
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136471
Alignment:
Q  245 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 302
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145179
Alignment:
Q  245 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32280 - 32068
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32280 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 32181  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32180 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 32082  T
Q  307 ttaagatgttgatg 320  Q
    | |||||| |||||    
T  32081 tgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 302
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5230
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagat 5135  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10543
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10331 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagat 10430  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10431 gttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgtt 10530  T
Q  308 taagatgttgatg 320  Q
     |||||| |||||    
T  10531 gaagatgatgatg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13711 - 13513
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13711 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 13612  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13611 gttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 38801304 - 38801507
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  38801304 taatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatga 38801403  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||     
T  38801404 attgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatga 38801502  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  38801503 tgatg 38801507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Original strand, 27250629 - 27250849
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||      
T  27250629 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 27250728  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250729 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27250827  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| | |||||| |||||    
T  27250828 taagttgttgaagatgatgatg 27250849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 323
Target Start/End: Original strand, 50210118 - 50210336
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  50210118 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 50210217  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210218 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 50210316  T
Q  304 tgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  50210317 tgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21714870 - 21714684
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21714870 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 21714771  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21714770 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 21714684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 22468495 - 22468823
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | || ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  22468495 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggtattgcgatatgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtattgagaccttt 22468594  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtata 199  Q
      |||  | ||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||   ||  ||| |||    
T  22468595 tgaagttggtaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaata 22468693  T
Q  200 cataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 296  Q
      |||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||   ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |    
T  22468694 attaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcag 22468792  T
Q  297 tctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22468793 tctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21026901 - 21026696
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||      
T  21026901 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 21026802  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026801 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21026703  T
Q  299 taagttg 305  Q
    |||||||    
T  21026702 taagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135181
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||   ||||||||  ||||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 20135205  T
Q  304 tgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20135204 tgattaagatgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34509996 - 34509787
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||   ||||||  |||||    
T  34509996 gttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 34509897  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509896 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 34509798  T
Q  304 tgattaagatg 314  Q
    |||| ||||||    
T  34509797 tgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 20091273 - 20091401
Alignment:
Q  2 cctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  20091273 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatt 20091372  T
Q  102 taagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20091373 taagaagttaactgcaatctgtgaagctg 20091401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48603820 - 48603652
Alignment:
Q  18 agaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgta 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||   || ||| ||||| |||||| ||| || ||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||||||||| ||    
T  48603820 agaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgttgcatgaattgattagagatggacccctaggtagtattgtgacctatataagaagttaattata 48603721  T
Q  118 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 185  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603720 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532270
Alignment:
Q  120 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 218  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||   || |||  |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  219 gaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    | | | ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  22532274 tgatg 22532270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 42865010 - 42865139
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42865010 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 42865109  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  42865110 ataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 42865139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 22354477 - 22354616
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22354477 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22354576  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt 246  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||    
T  22354577 tgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 327
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454680
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16362028 - 16361908
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16361931  T
Q  305 gattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16361930 gattaagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840766
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  305 gattaagatgttgat 319  Q
    |||||||||||||||    
T  21840780 gattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 21787841 - 21788023
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||  || ||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  21787841 gcctcgcgagcactttcagaactgagtgcaagtgagaaatttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtaacctat 21787940  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 183  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||  || || |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  21787941 ataagaagttaactgcaatctatgcagctg-ttatgaaatgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattactt 21788023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 433157 - 433016
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||        
T  433157 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---- 433062  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433061 cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 320
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847274
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    |||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  318 atg 320  Q
    |||    
T  20847272 atg 20847274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754049
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988870
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923449
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 23593750 - 23593893
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23593750 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23593848  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593849 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776692
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612317
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758664
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896358
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  21896358 g 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681022
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918620
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475245
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 22123131 - 22123226
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22123131 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921976
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861672
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  21861672 g 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237642
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  302 gttga 306  Q
    |||||    
T  22237646 gttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 22831177 - 22831306
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |   || ||| |||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  22831177 gcctcgcgagcacttcctgaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctat 22831276  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  22831277 ataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 22831306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928076
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213026
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295652
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298141
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45574989
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 15860073 - 15860167
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860073 atttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248293
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342100
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346965
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707171
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711713
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6152175 - 6152046
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||   || ||| |||||||||||| ||| || | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  6152175 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctat 6152076  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  6152075 ataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 6152046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 302
Target Start/End: Original strand, 35261127 - 35261180
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261127 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614219
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622047
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368388
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21714622 - 21714549
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21714622 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797573
Alignment:
Q  149 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-t 245  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  246 tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 314
Target Start/End: Original strand, 16275430 - 16275522
Alignment:
Q  223 ttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16275430 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21022958 - 21022830
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |||||| |    ||||| ||||| || ||||||| ||   ||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  21022958 gcctcgcgagcacttccagaactcagtactagtgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgatttgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgacctat 21022859  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  21022858 ataagatgttaactgcaatctgtgaagct 21022830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050138
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 18181920 - 18182049
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   || ||| |||||||||| | ||| || | ||||||| ||| |||| ||||| ||| | |    
T  18181920 gccttgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttgt 18182019  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||    
T  18182020 ataagaagttaactgcaaactgtgaagctg 18182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 22449065 - 22449194
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |   |||||| || || || ||| ||| || |  |||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  22449065 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatggacccttaggtagtaatgtgacatat 22449164  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22449165 ataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 22449194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686630
Alignment:
Q  251 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093987
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 22356079 - 22356185
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  22356079 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatg 22356178  T
Q  206 atgttga 212  Q
    |||||||    
T  22356179 atgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 22357765 - 22357871
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  22357765 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatg 22357864  T
Q  206 atgttga 212  Q
    |||||||    
T  22357865 atgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064959
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161730
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgat 21161730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40389204 - 40389158
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40389204 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783213
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatga 24783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 319
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533989
Alignment:
Q  276 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg--taagatgttgat 21533989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15583
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15370 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagat 15469  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15470 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
     | |||||| |||||    
T  15569 ttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7610 - 7298
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |    ||||||||| | || ||| ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7610 gcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgagaatgtagtgatttgtattgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctat 7511  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||| || || |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7510 ataagaagttaactgcaatctatgaaactga-tatgagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 7412  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |     
T  7411 ataagatgttgatgaattgaatttg-tataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatt 7314  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  7313 taagatgattaagatg 7298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47200 - 46996
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47200 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||     
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatga 47001  T
Q  316 tgatg 320  Q
    |||||    
T  47000 tgatg 46996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37724224 - 37723906
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  37724224 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggagattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtattgagacctat 37724125  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgtat 198  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |  || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  ||   || ||    
T  37724124 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 37724026  T
Q  199 acataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
       | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37724025 gattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 37723926  T
Q  299 taagttgattaagatgttga 318  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  37723925 taagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22032636 - 22032326
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   |||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22032636 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatatgtgttgcttgaattgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctat 22032537  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22032536 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 22032438  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg-ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |     
T  22032437 ataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgata 22032342  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  22032341 taagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 21292875 - 21293089
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21292875 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagat 21292974  T
Q  208 gttgatgaa-ttgaat-ttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  21292975 gttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 21293073  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    | | |||||| |||||    
T  21293074 gttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 23390401 - 23390616
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  23390401 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 23390500  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390501 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23390599  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  23390600 tgatgaagatgatgatg 23390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 314
Target Start/End: Original strand, 18769806 - 18770115
Alignment:
Q  4 tcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatata 103  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |    ||||| ||||| || ||| ||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18769806 tcgcgagcacttccagaactgagcgcaagtgagaatgtagtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatata 18769905  T
Q  104 agaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacata 203  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18769906 agaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacata 18770004  T
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||||||||||| | |||    
T  18770005 agatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataa 18770102  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    | |||||||||||    
T  18770103 gatgattaagatg 18770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Original strand, 8286742 - 8286963
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||      
T  8286742 aagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatt 8286841  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 297  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286842 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8286940  T
Q  298 ctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  8286941 ctaagttgatgaagatgatgatg 8286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22075240 - 22075035
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||      
T  22075240 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 22075141  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075140 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtc 22075042  T
Q  299 taagttg 305  Q
    |||||||    
T  22075041 taagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25421748 - 25421533
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  25421748 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 25421649  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421648 tgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25421550  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  25421549 tgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24493784 - 24493570
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  24493784 gttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaaga 24493685  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24493684 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 24493586  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  24493585 gatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23572399 - 23572087
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |   |||||| |  || || ||| ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23572399 gcctcgcgcgcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctaagttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctat 23572300  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| ||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23572299 ataagaagttaactgcaatttgtgaagttga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 23572201  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | |||||||||   ||||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||||||||  |     
T  23572200 ataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtgatctgcctatgctg-ttattgttattgaactaagttgcatgagtccata 23572103  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  23572102 taagatgattaagatg 23572087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26704386 - 26704257
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26704386 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatat 26704287  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26704286 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 26704257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26974119 - 26973990
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26974119 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatat 26974020  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26974019 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 26973990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24529428 - 24529227
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||    
T  24529428 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 24529329  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 311  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24529328 acttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 24529230  T
Q  312 atg 314  Q
    |||    
T  24529229 atg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25431610 - 25431414
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| | |  |||||    
T  25431610 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaaga 25431511  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431510 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13025526 - 13025312
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||    
T  13025526 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaaga 13025427  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13025426 tgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagtt 13025328  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  13025327 gatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13095710 - 13095496
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||    
T  13095710 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaaga 13095611  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13095610 tgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagtt 13095512  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  13095511 gatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096468
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||| || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |   ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1096485  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| ||||||||||||    
T  1096484 tgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9078168 - 9077953
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||   ||||||  | |||    
T  9078168 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgaga 9078069  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9078068 tgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagt 9077970  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  9077969 tgatgaagatgatgatg 9077953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 21729032 - 21729184
Alignment:
Q  170 tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctg 266  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  21729032 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 21729131  T
Q  267 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21729132 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21729184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 21808357 - 21808509
Alignment:
Q  170 tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctg 266  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  21808357 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 21808456  T
Q  267 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21808457 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21808509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23201689 - 23201559
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggaccctt-gggtaataatgagaccta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23201689 gcctcgcgagcacttttagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagatggacccttggggtagtaatgagaccta 23201590  T
Q  100 tataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||    
T  23201589 tagaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 23201559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 320
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329617
Alignment:
Q  205 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  303 ttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||| |||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14079468 - 14079340
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  14079468 gcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctat 14079369  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||    
T  14079368 ttaagaagttaactgcaatctgtgaagct 14079340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 320
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997654
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  318 atg 320  Q
    |||    
T  21997652 atg 21997654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21873569 - 21873387
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21873569 gcctcgcgagcacttacagaactgagtgcaagttaggatattgagatctgtgtcgcataatttgattagagatgaacccttgggtagtaatgtgacctat 21873470  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 183  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21873469 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 21873387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 23501145 - 23501273
Alignment:
Q  2 cctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |   || ||| ||||||| || | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23501145 cctcgcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaatgttgcgatctgtgtcgtataagttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctata 23501244  T
Q  102 taagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23501245 taagaagttaattgcaatctgtgaagctg 23501273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660955
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 19660955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502276
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329938
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959639
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412191
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 302
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  205 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgt----tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  301 ag 302  Q
    ||    
T  20027042 ag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565556
Alignment:
Q  206 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  304 tgat 307  Q
    ||||    
T  21565559 tgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264926
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733098
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909016
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363388
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 11581263 - 11581357
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581263 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Original strand, 26012054 - 26012141
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012054 atttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314578
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 36314578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245523
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 36154798 - 36154938
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||    |    
T  36154798 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----t 36154892  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154893 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39245234 - 39245140
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245234 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918106
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345984
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29346028 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154772
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 18319098 - 18319192
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319098 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064515
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619438
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 314
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902168
Alignment:
Q  223 ttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatg 20902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22144168 - 22144068
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||  |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144168 agatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22144069  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  22144068 g 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 314
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775834
Alignment:
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 327
Target Start/End: Original strand, 17517269 - 17517328
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418590
Alignment:
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatgtt-gttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  300 aagttgattaag 311  Q
    ||||||||||||    
T  18418601 aagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668899
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 19668899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29348600 - 29348457
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29348600 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29348502  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29348501 c-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29351073 - 29350930
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29351073 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29350975  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29350974 c-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027397
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32027441 -gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23512427 - 23512301
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||   || ||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| || |  |||||||    
T  23512427 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtattatgacctat 23512328  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaag 127  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||    
T  23512327 ataagaagtttactgcaatctttgaag 23512301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061072
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  149 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-tt 246  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  247 gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Original strand, 22107273 - 22107357
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaa 186  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22107273 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806900
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178323
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24067205 - 24067111
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24067205 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26704151 - 26704078
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26704151 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26704078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26973884 - 26973811
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26973884 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26973811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 268
Target Start/End: Original strand, 20910800 - 20910866
Alignment:
Q  203 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||    
T  20910800 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 305
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  251 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796423
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatg--taagatgttgat 15796423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21873327 - 21873277
Alignment:
Q  243 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 294  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873327 tgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 302
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  251 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40725925 - 40725854
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  40725925 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 40725854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412340
Alignment:
Q  109 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 157  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 22412340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27143 - 26835
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27143 gcctcgcaagcatttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgaatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacatat 27044  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27043 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 26945  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |     
T  26944 ataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgata 26847  T
Q  299 taagttgattaa 310  Q
    |||| |||||||    
T  26846 taagatgattaa 26835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4919 - 4713
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4919 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 4820  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
    |||| | ||||| || ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4819 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T
Q  313 tgttgatg 320  Q
    || |||||    
T  4720 tgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 13
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  143 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 44  T
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgtt 246  Q
    |||| | ||||| || |||||||||| ||||    
T  43 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 20698341 - 20698555
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20698341 gttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagat 20698440  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698441 gttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20698539  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  20698540 gatgaagatgatgatg 20698555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13442490 - 13442275
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  13442490 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13442391  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442390 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 13442292  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  13442291 tgatgaagatgatgatg 13442275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 856455 - 856143
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   |||||| ||||| || ||| ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  856455 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctat 856356  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||| || |||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  856355 ataagaagttaactgcaatctgtgaagct-tatatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatac 856257  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |     
T  856256 ataagatgttgttgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgata 856159  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  856158 taagatgattaagatg 856143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17488072 - 17487857
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  17488072 gttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17487973  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487972 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17487874  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  17487873 tgatgaagatgatgatg 17487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12399430 - 12399210
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | |||||| |||      
T  12399430 aagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatt 12399331  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399330 taagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12399232  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| | |||||| |||||    
T  12399231 taagttgttgaagatgatgatg 12399210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17499554 - 17499339
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  17499554 gttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17499455  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499454 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17499356  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  17499355 tgatgaagatgatgatg 17499339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14973070 - 14972855
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||   |||||| || |||    
T  14973070 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgaga 14972971  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972970 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14972872  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  14972871 tgatgaagatgatgatg 14972855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 314
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153322
Alignment:
Q  109 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 207  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  306 attaagatg 314  Q
    |||||||||    
T  24153314 attaagatg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 307
Target Start/End: Original strand, 14576738 - 14576939
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  14576738 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 14576837  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14576838 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagtt 14576936  T
Q  305 gat 307  Q
    |||    
T  14576937 gat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18438742 - 18438535
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||   |||||| | ||||||||| ||    
T  18438742 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttg 18438643  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 311  Q
    | ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18438642 acttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 18438544  T
Q  312 atgttgatg 320  Q
    ||| |||||    
T  18438543 atgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 23083266 - 23083481
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||| | | ||| |||  |||||    
T  23083266 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaaga 23083365  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083366 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23083464  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  23083465 tgatgaagatgatgatg 23083481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686888
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26686905  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||  |||||| |||||    
T  26686904 tgaagaagatgatgatg 26686888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840940
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 43840950  T
Q  304 tgattaagat 313  Q
    |||| |||||    
T  43840949 tgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 17524951 - 17525080
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17524951 gcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 17525050  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17525051 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 17525080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14179687 - 14179570
Alignment:
Q  69 gagatggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataat 168  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14179687 gagatggacccctgggtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat 14179588  T
Q  169 g-tttatgcattacttga 185  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14179587 gttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23408752 - 23408581
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||  ||||||    
T  23408752 gcctcgcgagcacttccagaacttagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgttacctat 23408653  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 173  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23408652 tttagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttta 23408581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 314
Target Start/End: Original strand, 40213626 - 40213834
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |  ||   ||||||  | |||    
T  40213626 gttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgaga 40213725  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40213726 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 40213823  T
Q  304 tgattaagatg 314  Q
    |||||||||||    
T  40213824 tgattaagatg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 25476290 - 25476505
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  25476290 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 25476389  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25476390 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagt 25476488  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  25476489 tgatgaagatgatgatg 25476505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13544172 - 13544016
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | ||||||||||    
T  13544172 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 13544074  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13544073 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14572804 - 14572603
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatg-cattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||  ||||| |||||| ||| |||||||||| |  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||    
T  14572804 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaaga 14572705  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| |   | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572704 tgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14572606  T
Q  305 gat 307  Q
    |||    
T  14572605 gat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 11424668 - 11424879
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   || |||  | |||    
T  11424668 gttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga 11424767  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||||||   |||   |||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11424768 tgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 11424863  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  11424864 gatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27165366 - 27165254
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||   ||| |||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165366 agatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27165267  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||    
T  27165266 gttgattaagatg 27165254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12567707 - 12567551
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | ||||||||||    
T  12567707 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 12567609  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12567608 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgt 12567551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307681
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707765
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172741
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174366
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234488
Alignment:
Q  205 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  303 ttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||| |||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatg 14234488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194697
Alignment:
Q  256 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42386619 - 42386428
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgat 213  Q
    |||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||   || |||  | |||||||| |    
T  42386619 taatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgtt 42386520  T
Q  214 gaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || ||| |||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386519 gacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470939
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  302 gttga 306  Q
    |||||    
T  15470943 gttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166602
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Original strand, 53301561 - 53301665
Alignment:
Q  212 atgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 309  Q
    |||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53301561 atgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatta 53301660  T
Q  310 agatg 314  Q
    |||||    
T  53301661 agatg 53301665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 15877627 - 15877727
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15877627 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatcagtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 15877726  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  15877727 a 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781505
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210447
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463182
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672630
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  17672639 gattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848769
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159330
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607065
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50242969 - 50242830
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  50242969 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 50242871  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242870 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476495
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822259
Alignment:
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 46822288  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46822287 taagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668183
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500946
Alignment:
Q  206 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  303 ttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469292
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  6469283 gattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899098
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15977626 - 15977519
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977626 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15977529  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  15977528 gattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454439
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 310
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962045
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8499616 - 8499522
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499616 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8499522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512934
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520909
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097342
Alignment:
Q  253 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103794
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12511177 - 12511051
Alignment:
Q  203 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  12511177 aagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattct 12511079  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12511078 aagttgattaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 23077277 - 23077406
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||  | | ||| ||||||   || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23077277 gcctcgcgagcacttccagaaccgatttcaattgaggattttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctat 23077376  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    || ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  23077377 atgagaagtttactgtaatttgtgaagctg 23077406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 302
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523831
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151949
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13151903  T
Q  269 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151904 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154414
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13154368  T
Q  269 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154369 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15051835 - 15051707
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||   |||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| || || |||||||    
T  15051835 gcctcgcgagcacttctaggactgaatgcaagttaggatgttgtgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctat 15051736  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    |||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  15051735 ataagatgttaactgcaatttgtgaagct 15051707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247881
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10247837 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 16282915 - 16282969
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282915 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446812
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737240
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618459
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T
Q  302 gttgatt 308  Q
    |||||||    
T  21618465 gttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 320
Target Start/End: Original strand, 24340693 - 24340843
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgttt 269  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||  || ||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  24340693 tatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgatt 24340792  T
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  24340793 gttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 24340843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 302
Target Start/End: Original strand, 53070668 - 53070799
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||||||    
T  53070668 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 53070766  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556989
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 12119789 - 12119883
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119789 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412433
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123894
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577996
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16910069 - 16909941
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     |||| ||||| || ||| ||| || | ||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  16910069 gcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaatgtcatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctat 16909970  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    | |||| ||||| || |||||||||||||    
T  16909969 acaagatgttaactgcaatctgtgaagct 16909941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110454
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925977
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Original strand, 43550529 - 43550625
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251270
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494813
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 14878304 - 14878433
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatgga-cccttgggtaataatgagaccta 99  Q
    |||||| ||||||||| |||||  ||||| | |||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||| | |||| ||||| ||| ||    
T  14878304 gcctcgagagcacttccagaaccgagtgcgattgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccccctaggtagtaatgtgactta 14878403  T
Q  100 tataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14878404 tataagaagttaactgcaatctgtgaagct 14878433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15060611 - 15060483
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||   || ||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| || || |||||||    
T  15060611 gcctcgcgagcacttccaggactgattgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctat 15060512  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    |||||| | ||| || |||||||||||||    
T  15060511 ataagatggtaactgcaatctgtgaagct 15060483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30029893 - 30029834
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029893 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgt 30029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377940
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274705
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 37642314 - 37642385
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 37642385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12496574 - 12496445
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| || |   || ||| ||| |||||| | ||| || | | ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  12496574 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctat 12496475  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12496474 ttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 12496445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Original strand, 1644723 - 1644790
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1644723 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatgttg 1644790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16796761 - 16796685
Alignment:
Q  110 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttga 185  Q
    ||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16796761 taattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 314
Target Start/End: Original strand, 23077517 - 23077591
Alignment:
Q  239 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  23077517 atgttgttgtgatctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 23077591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878165
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatg 15878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11863038 - 11862981
Alignment:
Q  73 tggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  11863038 tggacccttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctg 11862981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665397
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668553
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14668553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2196 - 1884
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   | |||| ||||| || ||| ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2196 gcctcgcgagcacttcgagaactgagtgcaagtgagaatgttatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctat 2097  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||   ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2096 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatac 1998  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |     
T  1997 ataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgata 1900  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  1899 taagatgattaagatg 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 21605 - 21917
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   |||||| ||||| || ||| ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21605 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctat 21704  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21705 ataagatgttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 21803  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |     
T  21804 ataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgata 21901  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  21902 taagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 29497 - 29809
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   |||||| ||||| || ||| ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29497 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctat 29596  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29597 ataagatgttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 29695  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |     
T  29696 ataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgata 29793  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  29794 taagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13427 - 13212
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  13427 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13328  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13327 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13229  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  13228 tgatgaagatgatgatg 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1852
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  2067 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 1968  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1967 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1869  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  1868 tgatgaagatgatgatg 1852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Original strand, 949 - 1168
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacat 202  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  949 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 1048  T
Q  203 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1147  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||| | |||||| |||||    
T  1148 aagttgttgaagatgatgatg 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Original strand, 167879 - 168098
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacat 202  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  167879 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 167978  T
Q  203 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167979 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 168077  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||| | |||||| |||||    
T  168078 aagttgttgaagatgatgatg 168098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52129 - 51914
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  52129 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 52030  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52029 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 51931  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  51930 tgatgaagatgatgatg 51914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5057 - 4850
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||| ||    
T  5057 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttg 4958  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 311  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  4957 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 4859  T
Q  312 atgttgatg 320  Q
    ||| |||||    
T  4858 atgatgatg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3686 - 3471
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  3686 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 3587  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3586 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 3488  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  3487 tgatgaagatgatgatg 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 344
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  558 gttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaaga 459  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||  | ||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  458 tgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 360  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  359 gataaagatgatgatg 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13078 - 12766
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |   |||||| || || || ||| ||| ||   ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13078 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatatgagttgcttgaattgattatggatggacccttaggtagtaatgagacctat 12979  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac 200  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12978 ataagaagttaactgcaatttgtgaagct-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatac 12880  T
Q  201 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | |||||||||   ||||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||||||||  |     
T  12879 ataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtgatctgcctatgctg-ttattgttattgaactaagttgcatgagtctata 12782  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||    
T  12781 taagatgattaagatg 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11435 - 11279
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  11435 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 11337  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11336 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 6026 - 6244
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  6026 gttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 6125  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||   ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6126 tgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6225  T
Q  302 gttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  6226 gttgatgaagatgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 3056 - 3270
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  3056 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 3155  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3254  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  3255 gatgaagatgatgatg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36778 - 36592
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36778 gcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgaggaaaatacgatctgtgtcgcatgatttgtttagagaaggacccttgggtagtaatgagacctat 36679  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  36678 ttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 36592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36457
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 303
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24406
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  206 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T
Q  302 gt 303  Q
    ||    
T  24405 gt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 34709 - 34838
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | || ||  | |||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34709 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaacattgcgacctttgtcacataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 34808  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  34809 ataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 34838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38976 - 38762
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  38976 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 38877  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38876 tgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagtt 38778  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  38777 gatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33149 - 32943
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| |     
T  33149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 33050  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T
Q  313 tgttgatg 320  Q
    || |||||    
T  32950 tgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9753
Alignment:
Q  223 ttgatataattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21132 - 20911
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |    
T  21132 aagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatata 21033  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21032 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtc 20933  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| | | ||||||||||||    
T  20932 taagtcgttgaagatgttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2160 - 1953
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||    
T  2160 taatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 2061  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 311  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  2060 aattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T
Q  312 atgttgatg 320  Q
    ||| |||||    
T  1961 atgatgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20303 - 20117
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20303 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggataatgtaatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacctat 20204  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20203 ataagaagttaactgcaacctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 20117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 323
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3309
Alignment:
Q  120 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 218  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  219 gaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgt 315  Q
      ||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  316 tgatgatg 323  Q
    ||||||||    
T  3302 tgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 15468 - 15597
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15468 gcctcgcgatcacttctagaacttagtgcaagtgaggatattgtgatctgtgtcgcttaatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 15567  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15568 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 15597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 323
Target Start/End: Original strand, 17120 - 17340
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  17120 gttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 17219  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg-----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17318  T
Q  302 gttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  17319 gttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 13876 - 14005
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   || ||  |||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||| |||   |||||||    
T  13876 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttatttagagaaggacccttgggtagtaaaatgacctat 13975  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  13976 ataggatgttaactgaaatctgtgaagctg 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 302
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79430
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23090 - 22890
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||    
T  23090 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22991  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 311  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22990 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 22893  T
Q  312 atg 314  Q
    |||    
T  22892 atg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39692 - 39486
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  39692 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 39593  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39592 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39494  T
Q  305 gattaaga 312  Q
    ||| ||||    
T  39493 gatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 314
Target Start/End: Original strand, 25970 - 26179
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  25970 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 26069  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
     |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070 cgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26168  T
Q  304 tgattaagatg 314  Q
    |||| ||||||    
T  26169 tgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44821
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  44808 agttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 312
Target Start/End: Original strand, 75120 - 75326
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  75120 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 75219  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 75318  T
Q  305 gattaaga 312  Q
    ||| ||||    
T  75319 gatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 70116 - 69930
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70116 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 70017  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 186  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  70016 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8649
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8633  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  8634 gatgaagatgatgatg 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Original strand, 339855 - 340053
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  339855 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgaga 339954  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339955 tgttgttgacttga-tttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 340051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158608
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  149 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-t 245  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| || |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  246 tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26111 - 25904
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  26111 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 26012  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26011 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 25913  T
Q  305 gattaagat 313  Q
    ||| |||||    
T  25912 gatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40073 - 39859
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  40073 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 39974  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39973 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagtt 39875  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  39874 gatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 8756 - 8885
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||  |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8756 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgacctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 8855  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8856 ataagaagttaactgtaatctgtgaagctg 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1439
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40128 - 39914
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |   |||  |||||    
T  40128 gttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaaga 40029  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||  |||  || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40028 tgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagtt 39930  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||| |||||    
T  39929 gatgaagatgatgatg 39914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 18455 - 18584
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    ||| | ||||| || | | ||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18455 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttcaattgatttgggatggacccttaggtagtaatgagacctat 18554  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18555 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19987
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28415
Alignment:
Q  185 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 281  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaacta 28454  T
Q  282 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11293
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1998
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4553
Alignment:
Q  265 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 320
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33076
Alignment:
Q  146 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg 244  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  245 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 33076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45929
Alignment:
Q  146 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg 244  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  245 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 45929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16193 - 16114
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16193 tgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 320
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17449
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Original strand, 16505 - 16720
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  16505 gttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 16604  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    || || ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16605 tgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 16703  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  16704 tgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1660 - 1531
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1660 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctat 1561  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||||    
T  1560 ataagaagttaaatgcaatctacgaagctg 1531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15668
Alignment:
Q  245 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4723 - 4522
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  4723 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 4624  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4623 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 4526  T
Q  304 tgat 307  Q
    ||||    
T  4525 tgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12305 - 12104
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  12305 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 12206  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12205 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 12108  T
Q  304 tgat 307  Q
    ||||    
T  12107 tgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22257 - 22056
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  22257 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22158  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22157 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 22060  T
Q  304 tgat 307  Q
    ||||    
T  22059 tgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 18252 - 18381
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  18252 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctat 18351  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  18352 ttaagaagttaactacaatctgtgaagctg 18381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18560 - 18431
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18560 gcctcacgagcgcttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatatgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 18461  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18460 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 18431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 48259 - 48388
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | | || ||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48259 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaagaatattgcgatctgtgtcacataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 48358  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  48359 ataagaagttaaatgcaatatgtgaagctg 48388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19278
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 65592 - 65716
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65592 gcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctttgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctat 65691  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtga 125  Q
    |||||||||||| || || ||||||    
T  65692 ataagaagttaactgcaacctgtga 65716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 302
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20524
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 269  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 128897 - 128752
Alignment:
Q  176 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtatactgcctat--gttgctgtttgtta 273  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |  |   | |  |||||| |||||||    
T  128897 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgct-tttgtta 128799  T
Q  274 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  128798 tttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatg 128752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 501231 - 501075
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| | ||||||||||    
T  501231 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 501133  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  501132 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 501075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160698
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85738
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6612
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13992
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6669
Alignment:
Q  116 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 214  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||    
T  6818 taatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 6719  T
Q  215 aattgaatttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgt 261  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6718 aattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6243
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15897
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178901
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 178901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100388
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  302 gttgat 307  Q
    ||||||    
T  100393 gttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 314
Target Start/End: Original strand, 38283 - 38593
Alignment:
Q  6 gcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatataag 105  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |   || ||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38283 gcgagcacttccagaactaagtgcaagtgagaactttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataag 38382  T
Q  106 aagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaaga-atatttgtatacata 203  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||| |||| ||  ||| ||   ||    
T  38383 aagttagttgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgatta 38480  T
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||| |  | |||||||||||||    || ||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  38481 agatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgat-ctgtctatgctgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcaatat 38578  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    ||| |||||||||||    
T  38579 aagatgattaagatg 38593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119876
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Original strand, 17455 - 17600
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||| ||    
T  17455 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt 17553  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17554 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44458
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgt 267  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44503 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94415
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 23466 - 23594
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   || ||| | |||||||| ||||| ||   | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23466 gcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaactttgcgatctttgtcgcataatttgattaatgttggacccttgggtagtaatgtgacctat 23565  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23566 a-aagaagttagttgcaatctgtgaagctg 23594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40281
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101513
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8691 - 8480
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||| | |||||||||||||| | | ||| ||   |||||    
T  8691 gttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaaga 8596  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8595 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 8497  T
Q  304 tgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||| |||||    
T  8496 tgatgaagatgatgatg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  176 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 273  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  274 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6536
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 6536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 902 - 773
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| || |||||| | || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  902 gcctcgtgagcacttccagaactgagtgtaaatgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtaatgagacctat 803  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  802 ttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10647
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  302 gttga 306  Q
    |||||    
T  10643 gttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 314
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11557
Alignment:
Q  206 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  303 ttgattaagatg 314  Q
    ||| | ||||||    
T  11546 ttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4061 - 3933
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4061 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 3963  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3962 ataagatattaattgcaatctgtgaagctg 3933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8492 - 8364
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   || ||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8492 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 8394  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8393 ataagatattaattgcaatctgtgaagctg 8364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29946
Alignment:
Q  223 ttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38816
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||    
T  38804 gttgattaagatg 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 130
Target Start/End: Original strand, 1031 - 1155
Alignment:
Q  6 gcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctatataag 105  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  1031 gcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccttgggtagtaatatgacctatataag 1130  T
Q  106 aagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||| || |||| |||||||||    
T  1131 aagttaactgcaatcagtgaagctg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10772
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  305 gattaagatgttgat 319  Q
    |||||||||||||||    
T  10786 gattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1091
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4841 - 4698
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  4841 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 4743  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4742 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1154
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 16148 - 16330
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    || ||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  16148 gcctcgcgagcacttccagaattgagtgcaagtgaggttgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtaatatgacctat 16247  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 183  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16248 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 16330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13141
Alignment:
Q  103 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 201  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  13313 aagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 13214  T
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 271  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13213 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34124
Alignment:
Q  244 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  34200 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 34124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 281
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1051
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  1051 g 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14992 - 14863
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||  || |||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  14992 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgattagagatggactcctgggtagtaatgaaacctat 14893  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  14892 acaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 14863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24007 - 23878
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||  || |||||||||| ||||| |  ||||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  24007 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctat 23908  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  23907 acaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 23878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 39431 - 39302
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||  || |||||||||| ||||| |  ||||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  39431 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctat 39332  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  39331 acaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 39302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 327
Target Start/End: Original strand, 12353 - 12420
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13396
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20751
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16788
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  16797 gattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37825
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136684
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139153
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144091
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134215
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141622
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62216
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132672
Alignment:
Q  257 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 307
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2913
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  302 gttgat 307  Q
    | ||||    
T  2908 gatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5657
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2752
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129919
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  302 gttgat 307  Q
    ||||||    
T  129924 gttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 302
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60818
Alignment:
Q  245 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8180
Alignment:
Q  245 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 23932 - 23989
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22776
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  302 gttga 306  Q
    |||||    
T  22772 gttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 82219 - 82076
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  82219 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 82121  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  82120 -gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21368 - 21497
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||   || ||| ||| |||||| | ||| || | ||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  21368 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctat 21467  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  21468 ttaagatgttaactgaaatttgtgaagctg 21497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32643 - 32551
Alignment:
Q  216 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32643 attgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51985
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116434
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||    
T  116446 gttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129072
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78345
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14804
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4301
Alignment:
Q  223 ttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 6108 - 6236
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||   || || ||||||||||| | ||| || ||||||||||| |  ||| ||||| || ||||    
T  6108 gcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagtgaggatgttgcgacttgtgtcgcataacttgattagagatggacccctaagtagtaatgtgatctat 6207  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
     || || ||||| || |||||||||||||    
T  6208 ttaggatgttaaatgcaatctgtgaagct 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6422 - 6294
Alignment:
Q  2 cctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctata 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||| ||| || |||||||    
T  6422 cctcgcgagcacttccagaactgtgtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccctgggtagtaaagaaacctata 6323  T
Q  102 taagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||    
T  6322 caagaagttaactgcaatctgtgaagctg 6294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9241
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9300 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24094 - 23995
Alignment:
Q  71 gatggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  24094 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgt 23996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23919 - 23846
Alignment:
Q  240 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 46527 - 46655
Alignment:
Q  2 cctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   || ||| |||||||||| | ||| || | ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  46527 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctata 46626  T
Q  102 taagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46627 taagaagttaactgcaatctgtgaagctg 46655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 253 - 110
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||||    
T  253 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 155  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  154 -gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13951
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1189
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6826
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45899
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25121
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12780
Alignment:
Q  205 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  303 ttgat 307  Q
    |||||    
T  12784 ttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12587
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  12587 g 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 6877 - 7006
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |   || ||| |||||||||||| ||| || | ||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  6877 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgacctat 6976  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  6977 ataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 7006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32754 - 32626
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |    
T  32754 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatatcgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacct-t 32656  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  32655 ttaaaatgttaattgcaatctgtgaagctg 32626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  302 gttga 306  Q
    |||||    
T  10546 gttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53651
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  53651 g 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12954
Alignment:
Q  205 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 12958  T
Q  303 ttga 306  Q
    ||||    
T  12957 ttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4545
Alignment:
Q  139 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 237  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||  |||||||||| ||||||  ||||||||| || || |    
T  4709 atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatat 4610  T
Q  238 catgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    | || || |||   |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4609 cttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40511 - 40404
Alignment:
Q  208 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40511 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 40414  T
Q  305 gattaagatg 314  Q
    ||||||||||    
T  40413 gattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 143
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13147
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  13147 g 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 306
Target Start/End: Original strand, 16102 - 16206
Alignment:
Q  204 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16102 agatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 16201  T
Q  302 gttga 306  Q
    |||||    
T  16202 gttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 161136 - 161248
Alignment:
Q  204 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  161136 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtct 161233  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||| ||||||||    
T  161234 aagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11465
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6400
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 318
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13854
Alignment:
Q  255 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 13854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15721 - 15642
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggaccct 80  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  15721 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccct 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 320
Target Start/End: Original strand, 17997 - 18147
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgttt 269  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||  || ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| ||    
T  17997 tatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgatt 18096  T
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  18097 gttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 310
Target Start/End: Original strand, 2193 - 2283
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2193 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28877
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38376
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42871 - 42810
Alignment:
Q  69 gagatggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  42871 gagatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctg 42810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 569
Alignment:
Q  252 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4312 - 4218
Alignment:
Q  221 atttgatataattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312 atttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 320
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4953
Alignment:
Q  254 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28046 - 27912
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 206  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  28046 gttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 27947  T
Q  207 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg 241  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  27946 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6344
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| | || ||||||| |||||| | ||| || | | ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  6215 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatattgcgatttgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctat 6314  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  6315 ttaagatgttaactgaaatatgtgaagctg 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12068
Alignment:
Q  172 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  12205 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt 12107  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12106 t-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Original strand, 27798 - 27855
Alignment:
Q  249 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27798 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3648
Alignment:
Q  110 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 157  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3695 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7712
Alignment:
Q  110 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 157  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7759 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 710 - 582
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||   || ||| ||| |||||| | ||| || | ||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  710 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgacctat 611  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
     ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  610 ttaagatgttaattgagatctgtgaagct 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 1052
Alignment:
Q  110 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 185  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1128 taattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 348
Alignment:
Q  2 cctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctata 101  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  ||| |||||||||| | ||| || | ||||||||||| |||| ||||| ||||||      
T  476 cctcgcaagcacttctagaactgagtgcaagttaggatatttggatctgtgtcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaat 377  T
Q  102 taagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  376 taagatgttaacggaaatctgtgaagctg 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32112
Alignment:
Q  257 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  149 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-t 245  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  246 tgtatactgcctatgttgctgtt 268  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2694
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 306
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103737
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 1883 - 2012
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |   |||||| |||||||||||| | | || | | ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  1883 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctat 1982  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     |||||  |||| || ||| ||||||||||    
T  1983 ttaagatattaactgaaatatgtgaagctg 2012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 4732 - 4861
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||| ||| | |||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||  | |  |||||||    
T  4732 gcctcgcgagcatttccaaaaccgagtgcaattgaggacattgcgatttgtgtcgcataatttgatcagaggtggactcttgggtagcattatgacctat 4831  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  4832 ataagaagtttactgcaatctgtgaagctg 4861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3159 - 3030
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||   |||||| |||||||||| | ||| || | | ||||| ||| |||| || || |||||||    
T  3159 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctat 3060  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  3059 ataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 3030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6825 - 6696
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||   |||||| |||||||||| | ||| || | | ||||| ||| |||| || || |||||||    
T  6825 gcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctat 6726  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  6725 ataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 6696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 300
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8161
Alignment:
Q  202 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 297  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||   ||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  298 cta 300  Q
    |||    
T  8159 cta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 246
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  108 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  206 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt 246  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97024
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106302
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  259 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267679
Alignment:
Q  248 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29561
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 130
Target Start/End: Original strand, 4691 - 4733
Alignment:
Q  88 taatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4691 taatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  250 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1213 - 1084
Alignment:
Q  1 gcctcgcgagcacttctagaacttagtgcaagtgaggaaaatgtgatttgtgtcgcatgatttgtttggagatggacccttgggtaataatgagacctat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||   || ||| |||||||||  | ||| || | | |||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  1213 gcctcgcgagcacttctagaactgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctat 1114  T
Q  101 ataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 130  Q
     ||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  1113 ttaagatgttaactgaaatctgtgaggctg 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44325 - 44269
Alignment:
Q  73 tggacccttgggtaataatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 129  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  44325 tggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagct 44269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University