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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF18406_low_28 (Length: 422)
Name: NF18406_low_28
Description: NF18406
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18406_low_28 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 18 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12931041 - 12930658
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa--tgaaca |
115 |
Q |
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| T |
12931041 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaaca |
12930942 |
T |
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| Q |
116 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
215 |
Q |
| |
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| T |
12930941 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
12930842 |
T |
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| Q |
216 |
ccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgag |
315 |
Q |
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| T |
12930841 |
ccactctct--cacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
12930744 |
T |
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| Q |
316 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
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|
| T |
12930743 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
12930658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 19 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12935786 - 12935404
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa--tgaacac |
116 |
Q |
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| T |
12935786 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacac |
12935687 |
T |
|
| Q |
117 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
216 |
Q |
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| T |
12935686 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
12935587 |
T |
|
| Q |
217 |
cactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgaga |
316 |
Q |
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| T |
12935586 |
cactctct--cacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
12935489 |
T |
|
| Q |
317 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12935488 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
12935404 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 224
Target Start/End: Original strand, 26504931 - 26505055
Alignment:
| Q |
97 |
gtagcgataaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaa |
196 |
Q |
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|
| T |
26504931 |
gtagcgataaaa-taaacatcaatatttaacgtg-aataccgtctaataacaaggcaaaa-ccacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaa |
26505027 |
T |
|
| Q |
197 |
gaatattacaatattctctccactctct |
224 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26505028 |
aaatattacaatattctttcaactctct |
26505055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15589062 - 15588948
Alignment:
| Q |
108 |
aatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaa |
207 |
Q |
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| T |
15589062 |
aatgaacatcaatatttattttgaaaaaccctctattaatgagagaaaaatcaagtgacaaactctaaaaaatatttcactttatcaaacaatattacaa |
15588963 |
T |
|
| Q |
208 |
tattctctccactct |
222 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
15588962 |
cattttctccactct |
15588948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34907503 - 34907121
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa--tgaacac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34907503 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacac |
34907404 |
T |
|
| Q |
117 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907403 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
34907304 |
T |
|
| Q |
217 |
cactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgaga |
316 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
34907303 |
cactctct--cacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
34907206 |
T |
|
| Q |
317 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907205 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
34907121 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14174303 - 14173919
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa---tgaac |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
14174303 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagtgataaaaaaaatgaac |
14174204 |
T |
|
| Q |
115 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174203 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
14174104 |
T |
|
| Q |
215 |
tccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14174103 |
tccactctct--cacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttataga |
14174006 |
T |
|
| Q |
315 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174005 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
14173919 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14179057 - 14178673
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa---tgaac |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
14179057 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcaataaaaaaaatgaac |
14178958 |
T |
|
| Q |
115 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178957 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
14178858 |
T |
|
| Q |
215 |
tccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14178857 |
tccactctct--cacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttataga |
14178760 |
T |
|
| Q |
315 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178759 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
14178673 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 401
Target Start/End: Original strand, 28606801 - 28607189
Alignment:
| Q |
14 |
tatattgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa---t |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28606801 |
tatattgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaat |
28606900 |
T |
|
| Q |
111 |
gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatat |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28606901 |
taacaccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatat |
28607000 |
T |
|
| Q |
211 |
tctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagtta |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607001 |
tctctccactctct--cacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagtta |
28607098 |
T |
|
| Q |
311 |
ttgagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607099 |
tagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
28607189 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 401
Target Start/End: Original strand, 28611567 - 28611951
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaa---atgaac |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28611567 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaac |
28611666 |
T |
|
| Q |
115 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611667 |
accaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
28611766 |
T |
|
| Q |
215 |
tccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
28611767 |
tccactctct--cacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttataga |
28611864 |
T |
|
| Q |
315 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611865 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
28611951 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44161949 - 44161571
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa---tgaaca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44161949 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaaca |
44161850 |
T |
|
| Q |
116 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44161849 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattaca--attctct |
44161752 |
T |
|
| Q |
216 |
ccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgag |
315 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44161751 |
ccactctct--tacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
44161654 |
T |
|
| Q |
316 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44161653 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctcacacacctctacacaca |
44161571 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11104829 - 11104456
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaacacca |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104829 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagctgtagcgataaaaatgaacacca |
11104730 |
T |
|
| Q |
119 |
atatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
11104729 |
atatttaacatagaaaatcctctaatatcgaggg-taaaccacgggacaaactccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaatattctctcca |
11104631 |
T |
|
| Q |
219 |
ctctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgagatg |
318 |
Q |
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|
|
| T |
11104630 |
ctctct---tacacacaaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagttatagagatg |
11104534 |
T |
|
| Q |
319 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacaca |
396 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104533 |
atatccacccggtgtatttttcctacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacaca |
11104456 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Original strand, 48826700 - 48827000
Alignment:
| Q |
17 |
attgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgata-aaaatgaaca |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
48826700 |
attgttgggatcgacgagcttaacgcaattgtaaattaaaatttcaaaattcaa--gagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatagaaaaagaaca |
48826797 |
T |
|
| Q |
116 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826798 |
ccaatatttaacgtggaaaatcctctaataccgagggaaaaatcacgggac-aactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
48826896 |
T |
|
| Q |
216 |
ccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgag |
315 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48826897 |
tcgctctct--tacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
48826994 |
T |
|
| Q |
316 |
atgata |
321 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
48826995 |
atgata |
48827000 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 216
Target Start/End: Original strand, 48708086 - 48708256
Alignment:
| Q |
46 |
tgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaata |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || | || ||| ||||||||| | || ||||||||||||| || ||||| || ||||| |
|
|
| T |
48708086 |
tgtaaattaaaattccaaaatataaaagaaattgaatcttacaacgcagtggtggcgataaaattaaataccaatatttaacatgaaaaactctataata |
48708185 |
T |
|
| Q |
146 |
ccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
216 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48708186 |
ctaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctctc |
48708256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 224
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726381
Alignment:
| Q |
131 |
gaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct |
224 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24726288 |
gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctct |
24726381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 401
Target Start/End: Original strand, 37040426 - 37040809
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaa---atgaaca |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37040426 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaaca |
37040525 |
T |
|
| Q |
116 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37040526 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattttct |
37040625 |
T |
|
| Q |
216 |
ccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgag |
315 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37040626 |
ccactctct--cacacacacaagagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
37040723 |
T |
|
| Q |
316 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040724 |
atgatacccacccgatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
37040809 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15290595 - 15290223
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaa-gagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa---tgaa |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15290595 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaattgtaaattaaaatttcaaaatccaaaaagagattggatcttgcagcgcagccttagcgataaaaaaaatgaa |
15290496 |
T |
|
| Q |
114 |
caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290495 |
caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaatattct |
15290396 |
T |
|
| Q |
214 |
ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattg |
313 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15290395 |
ctccactctct--tacacacacaagagatacaatatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgaatgctattattt--cagcacctagaagttatag |
15290301 |
T |
|
| Q |
314 |
agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca |
398 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290300 |
agatgatacccacccggtgtattttt-ccacactttctggatttagtcaacactcta------ttctcacacacttctacacaca |
15290223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12099361 - 12098988
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaacacca |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
12099361 |
tgttgggctcgacgagtttaacgcgagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagatatgatcttgcagctcaccgatagcgataaaaatgaaaagca |
12099262 |
T |
|
| Q |
119 |
atatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
218 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12099261 |
atattttacgtgaaaaaccctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctcca |
12099162 |
T |
|
| Q |
219 |
ctctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgagatg |
318 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
12099161 |
ctctct--tacacgcacaagagacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagagatg |
12099064 |
T |
|
| Q |
319 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca |
398 |
Q |
| |
|
|||| ||| | | |||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12099063 |
atactcactcaatctatttt--cgaga--ctctgaatttactcaacactctatttttcctttcacatacttctacacaca |
12098988 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12082002
Alignment:
| Q |
167 |
aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagac |
266 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12082227 |
aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaa--agagatacaatatagtgtttctaatgagac |
12082131 |
T |
|
| Q |
267 |
ctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacac |
366 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12082130 |
tcgctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaacac |
12082032 |
T |
|
| Q |
367 |
tctatttttcttctcacacacttctacaca |
396 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12082031 |
tctaattttctgatcacacacttctacaca |
12082002 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 2757236 - 2757418
Alignment:
| Q |
42 |
caagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa-tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctc |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
2757236 |
caagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaattgaattatgcagtgtagcaataacgataaaaatttaacaccaatatttaatatgaaaacccctt |
2757335 |
T |
|
| Q |
141 |
taataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct |
224 |
Q |
| |
|
|||| | | |||||||||| | |||||| | | |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2757336 |
taatgcttaaggaaaaaccatgagacaaattttg-aaaatattccactatatttaaaaatattgcactattctctccactctct |
2757418 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 12084751 - 12084657
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaa |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12084751 |
tgttgggctcaacgagcttaacacgagggtaaattaaaatttcaaaatccaatagacattggatcttgtagcgcaacggtagcgataaaaatgaa |
12084657 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 401
Target Start/End: Original strand, 42910992 - 42911372
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaacacc |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42910992 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtggaaattaaaattttaaaatccaaaagagattagatcttgcagcgcagcggcaacgataaaaatgaacacc |
42911091 |
T |
|
| Q |
118 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911092 |
aatatttaacatggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccg-aaaatattccactatatttaagaatattacaatattctctcc |
42911190 |
T |
|
| Q |
218 |
actctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgagat |
317 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42911191 |
actctct--cacacacacaaaagatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatagagat |
42911288 |
T |
|
| Q |
318 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911289 |
gatacccacccagtgtattttttccacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacacacag |
42911372 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 394
Target Start/End: Original strand, 29106878 - 29107249
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaacacca |
118 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29106878 |
tgttgggatcgaggagcttaatgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagattggatcttgcagcgcagcggtagcgttaaaaatgaacacca |
29106977 |
T |
|
| Q |
119 |
atatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29106978 |
atatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
29107077 |
T |
|
| Q |
219 |
ctctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgagatg |
318 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29107078 |
ctctct--tacacacacaagagatacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataaagatg |
29107174 |
T |
|
| Q |
319 |
ata-cccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctaca |
394 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29107175 |
ataccccacccaatgtatttttcccacactctctggatttactcaaca--ctattttttctctcacacacttctaca |
29107249 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 38997137 - 38997320
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaacacc |
117 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| |||| | || | |||||||| ||||| | |
|
|
| T |
38997137 |
ttgttgggttcgaagggcttaatgcgggtgtaaattaaaattccagaatccaaaagaaattaaatcttgaagtgcatcgacaatgataaaaaagaacagc |
38997236 |
T |
|
| Q |
118 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38997237 |
aatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata |
38997320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Original strand, 38994698 - 38994819
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaacacc |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
38994698 |
ttgttgggcttgacgatcttaatgctagtgtaaattaaaattccaaaacccaaacaaaattggatcttgcagtgcagcggtaatgataaaaaggaacttt |
38994797 |
T |
|
| Q |
118 |
aatatttaacgtggaaaaccct |
139 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
38994798 |
aatatttgatgtggaaaaccct |
38994819 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8539555 - 8539165
Alignment:
| Q |
12 |
tatatattgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagcgataaaaa-t |
110 |
Q |
| |
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| T |
8539555 |
tatatattgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaattctaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtaacaataaaaaat |
8539456 |
T |
|
| Q |
111 |
gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatat |
210 |
Q |
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| T |
8539455 |
gaacatcaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatat |
8539356 |
T |
|
| Q |
211 |
tctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaa---tatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaag |
307 |
Q |
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| T |
8539355 |
tatctccactctct--tacacacacaagagatacaatattatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaag |
8539259 |
T |
|
| Q |
308 |
ttattgagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
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| T |
8539258 |
ttatagagatgatacccatccgatgtatttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctcacacacttctacacacacag |
8539165 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 238 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302143
Alignment:
| Q |
238 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttattgagatgatacccacccggtgtattt |
337 |
Q |
| |
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| T |
51302306 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt |
51302207 |
T |
|
| Q |
338 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
401 |
Q |
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| T |
51302206 |
tatccacactctctggatttactcaatactctatttttcctcacacacacttctacacacacag |
51302143 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 51302362 - 51302304
Alignment:
| Q |
92 |
tagcggtagcgataaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgag |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
51302362 |
tagcggtagcgataaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgag |
51302304 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 51303020 - 51302937
Alignment:
| Q |
18 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattggatcttgcagtgtagcggtagc |
101 |
Q |
| |
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| T |
51303020 |
ttgttgggatcgacgagcttaatgcaagtgtaaattaaaatttcaaaatccaaaacagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
51302937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Original strand, 2100199 - 2100379
Alignment:
| Q |
19 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaataccaaaatccaaaagagattgga-tcttgcagtgtagcggtagcgataaaaatgaacacc |
117 |
Q |
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| T |
2100199 |
tgttgggctcgacgagcttaacacaagtgtaaattaaaattccaaaattcataagagatttgaattttgcagcacaacgataatgataaaattgaacatc |
2100298 |
T |
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| Q |
118 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
201 |
Q |
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| T |
2100299 |
aatatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaaac---ggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
2100379 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 224
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100753
Alignment:
| Q |
194 |
aaagaatattacaatattctctccactctct |
224 |
Q |
| |
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| T |
2100723 |
aaagaatattacaatattctctccactctct |
2100753 |
T |
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