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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF18445_high_2 (Length: 380)
Name: NF18445_high_2
Description: NF18445
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18445_high_2 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 10406756 - 10407126
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |
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| T |
10406756 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttttttcatgagaagctaaaacaactaaggc |
10406855 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
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| T |
10406856 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaatgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
10406955 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
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| T |
10406956 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacagacaacttcaagcatgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
10407055 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10407056 |
attggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
10407126 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3 - 371
Target Start/End: Original strand, 1952157 - 1952524
Alignment:
| Q |
3 |
tagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagcat |
102 |
Q |
| |
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|
| T |
1952157 |
tagtgctacatctaacataaattgtttatgttttcaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaggttaaaacaactaaagcat |
1952256 |
T |
|
| Q |
103 |
aagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaatgt |
202 |
Q |
| |
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| T |
1952257 |
aagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatctgaatgtcattgtctatgcacaatgt |
1952356 |
T |
|
| Q |
203 |
cttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaaaa |
302 |
Q |
| |
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||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
1952357 |
cttaaactacggtaataataatcacaacagacaacttcaagcctgtgtattttagtaagtgaatttatgcattaattattcaaatctctccaccacaaat |
1952456 |
T |
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| Q |
303 |
tggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1952457 |
tggatatcgttgttgaaagacacataaaaaatcaagctatga-tttaaaatacttacatggattataat |
1952524 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35178363 - 35177976
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35178363 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagctaaagcaactaaagc |
35178264 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacg-----------------cctttttgtacaaatccgaatgt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35178263 |
ataagttctttcatgtaacttaaaagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacatcttcttgtacaaatcaccttcttgtacaaatctgaatgt |
35178164 |
T |
|
| Q |
184 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattc |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35178163 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatggtaatagtaatcacaacaggcaacttcaagcttgtgtattttagcaagtgaatttatgcattagttattc |
35178064 |
T |
|
| Q |
284 |
aaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
35178063 |
aaatctctccaccaaaaattggatattgttgttgaaagacacataaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacagggattataat |
35177976 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3477138 - 3476888
Alignment:
| Q |
110 |
ttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcc---tttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaatgtctta |
206 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||||| | ||| |||| ||||||||| ||| ||| |
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|
| T |
3477138 |
ttcatgtagtttaatagcatgaatttgatatttgatgccattgaatcaacgccgccttcttatgcaaatatgtatgccattccctatgcacagtgt-tta |
3477040 |
T |
|
| Q |
207 |
aactatgataataataatcacaacaggcaacttca--at---catatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa- |
300 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3477039 |
aactgtgctaataataatcacaacaggcaacttcatgatgtgcctctgtattttagtacgtgaatttatgcattaattattcaaatctcaccaccaaaaa |
3476940 |
T |
|
| Q |
301 |
-aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaa |
351 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
3476939 |
taaatattattattgttgaaaaacacatcaaaaatcaagctacaactttaaa |
3476888 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14890720 - 14890350
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14890720 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatctttccaattttattatcaaatttctcactttaatttttactttcatgagaagctaaagcaactaaagc |
14890621 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14890620 |
ataagttctttcaagtaaattaatagcatgaatatgatatttgatactattaaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
14890521 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14890520 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacagacaacttcaagcatgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
14890421 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14890420 |
attggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
14890350 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 545212 - 545583
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
545212 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaacaaaagc |
545311 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
545312 |
ataagtcctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaatgcctttttgtacaaatctgaatgtcattgtatatgcacaat |
545411 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaa--tcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaa |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
545412 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacagacaacttcaaagtc-tgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaa |
545510 |
T |
|
| Q |
299 |
aaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
545511 |
aaattggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacagggattataat |
545583 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 40611825 - 40612198
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaatttttt-ctttcatgagaagttaaagcaactaaag |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40611825 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaatttttttctttcatgagaagttaaagcaactaaag |
40611924 |
T |
|
| Q |
100 |
cataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcat--tgtctatgcac |
197 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40611925 |
cataagtcctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatattattgaatcaacgcctttttgtacaaatctgaatgtcatattgtctatgcac |
40612024 |
T |
|
| Q |
198 |
aatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccacca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40612025 |
aatgtcttaaattatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagcctgtatattttagtaagtgaagttatgcattagttattcaaatctctccacca |
40612124 |
T |
|
| Q |
298 |
aaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40612125 |
aaaattggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
40612198 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8075393 - 8075033
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8075393 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgttttcaagtttattatcaaatttctcactttaattttttcttt------------aagcaactaaagc |
8075306 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgca--ca |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
8075305 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatattagatactattgaatcaacgactttttgtacaaatctgaatgtcattgtctatgaaaaca |
8075206 |
T |
|
| Q |
199 |
atgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaa |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8075205 |
atgtcttaaactatggtaataataatcacaacaggtaacttcaagcctgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaa |
8075106 |
T |
|
| Q |
299 |
aaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8075105 |
aaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
8075033 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28590671 - 28590285
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28590671 |
actagtgctacatctaatataaattgtttatgtttttaagtttattattaaatttctcactttaattttt-ctttcatgataagttaaagcaactaaagt |
28590573 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacg-----------------cctttttgtacaaatccgaatgt |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28590572 |
ataagttctttcatgtaatttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaacttcttgtacaaatcaccttcttgtacaaatctgaatgt |
28590473 |
T |
|
| Q |
184 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattc |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28590472 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaatccaatgtattttagcaagtgaatttatgcattaattattc |
28590373 |
T |
|
| Q |
284 |
aaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28590372 |
aaatctctccaccaaaaattggatattgttgttgaaagacacataaaaaatcaagctatgactttaaaatgcttacatggattataat |
28590285 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2465637 - 2465251
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2465637 |
actagtgctacatctaatataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaaactaaagcaactaaagc |
2465538 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatcc-----------------gaatgt |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2465537 |
gtaagttctttcatgtaacttaataacatgagtatgatatttgatattatcgaatcaacaccttcttgtacaaatcaccttcttgtacaaatctgaatgt |
2465438 |
T |
|
| Q |
184 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattc |
283 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2465437 |
cattgtctacccacaatgtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagcctatgtattttagtaaatgaatttatgcattagttattc |
2465338 |
T |
|
| Q |
284 |
aaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2465337 |
aaatctctccatcaaaaattggatattgctattg-aagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
2465251 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 32640853 - 32641027
Alignment:
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1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32640853 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgttttcaagtttattatcaaatttctcaatttaattttt-cttttatgagaagttaaagcaactaaagc |
32640951 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatc |
176 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32640952 |
ataagttgtttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatc |
32641027 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4593664 - 4593539
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaatt-ttttctttcatgagaagttaaagcaactaaag |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4593664 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaatttttttctttcatgagaagctaaagcaactaaag |
4593565 |
T |
|
| Q |
100 |
cataagttctttcatgtaacttaata |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4593564 |
cataagttctttcatgtaacttaata |
4593539 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 25590995 - 25591107
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25590995 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
25591094 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttca |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
25591095 |
ataagttctttca |
25591107 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 32641060 - 32641193
Alignment:
| Q |
231 |
aggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaa |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32641060 |
aggcaacttcaaacctgtgtgttttagtaagtgaatttatgcattaattattcaaatctctccaccaaaaattggatatttttgttgaaagacacatcaa |
32641159 |
T |
|
| Q |
331 |
aaattaagctatgactttaaaatacttacatgga |
364 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32641160 |
aaatcaagctatgactttaaaatacttacgtgga |
32641193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 371
Target Start/End: Original strand, 32641193 - 32641284
Alignment:
| Q |
280 |
attcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
32641193 |
attcaaatatctccaccaaaaattggatatttttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacgtggattataat |
32641284 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4593540 - 4593435
Alignment:
| Q |
268 |
tatgcattagttattcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacat-caaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagt |
366 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
4593540 |
tatgcattagttattcaaatctctccacaaaaaattggatactgttgtttaaagacacataaaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacggggatt |
4593441 |
T |
|
| Q |
367 |
ataatc |
372 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
4593440 |
ataatc |
4593435 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 95
Target Start/End: Original strand, 30261380 - 30261442
Alignment:
| Q |
34 |
ttccaattttattatcaaatttctcactttaa-ttttttctttcatgagaagttaaagcaact |
95 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30261380 |
ttccaagtttattatcaaatttctcactttaatttttttctttcatcagaagctaaagcaact |
30261442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 48646614 - 48646984
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48646614 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccatgtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
48646713 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48646714 |
ataagttttttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttctgtacaaatctgaatgtcattgtctatgcacaat |
48646813 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48646814 |
gtcttaaactttggtaataataatcacaacaggcaacttaaagtctgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
48646913 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
48646914 |
attggatatatttgttgaaagacacataaaaaattaagctatgactttaaaatacttacaaggattataat |
48646984 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 48788234 - 48787864
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
48788234 |
actagtgccacatctaacatatgttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttaatgagaagctaaagcaactaaagc |
48788135 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
48788134 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgttatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatctgaatgtcattgtctatgcacagt |
48788035 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48788034 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagcttgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccatcaaaa |
48787935 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
48787934 |
attggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaacacttacagggattataat |
48787864 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 35728263 - 35728621
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
35728263 |
actagtgctacttctaacataagttctttatgtttccagatttattatcaaatttctcactttaattttttctttcgtgagaagttaaagcaactaaaac |
35728362 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35728363 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcataaatatgatatttgatactattgaatcaacacctttttgtacaaatctgaatgtcattgtctatgca-aat |
35728461 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
35728462 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacagacaacttcaagcctgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctatccatcaaaa |
35728561 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttaca |
360 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35728562 |
attggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttaca |
35728621 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 30924193 - 30924558
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30924193 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttc-aagtttattatcaaatttctcattttaattttttctttcatgagaagttaaatcaactaaagc |
30924291 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30924292 |
ataagttctttcatgtaacttagtagaatgaatatgatatttgatactattgaatcaacacctt---gtacaaatctgaatgtcattgtctatgc-caat |
30924387 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30924388 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacaggaaacttcaatcctctgtattttagtaagtgaatttatgtattagttattcaaatctttccaccaaaa |
30924487 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30924488 |
atgggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
30924558 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 7258839 - 7259215
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
7258839 |
actagtgctacatctatcagaagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaatttattctttcatgagaagctaaagcaactaaaac |
7258938 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttg-----------------tacaaatccgaatgt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
7258939 |
ataagttctttaatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatcaccttcttctacaaatctgaatgt |
7259038 |
T |
|
| Q |
184 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattc |
283 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7259039 |
cgttgtctatgcacaatgtcttaaactatggtaataataatcacaacatgcaacttcaagcctgtgtattttagcaggtgaatttatgcattagttatgc |
7259138 |
T |
|
| Q |
284 |
aaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttaca |
360 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7259139 |
acatctctccaccaaaaattggatattgttgttgaaagtcacataaaaaatcaagctatgactttaaaatacttaca |
7259215 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10895193 - 10894928
Alignment:
| Q |
86 |
taaagcaactaaagcataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatcc-------- |
177 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |
|
|
| T |
10895193 |
taaaacaactaaagcataagttctttcatgtgacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaactcaccttcctg |
10895094 |
T |
|
| Q |
178 |
---------gaatgtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaattt |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10895093 |
tacaaatttgaatgtcattgtctatgcacaatgtattaaactatggtaataataatcacaacagacaacttcaagcttgtgtattttagtaagtgaattt |
10894994 |
T |
|
| Q |
269 |
atgcattagttattcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaat |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10894993 |
atgcattagttattcaaatctctccaccaaaaattggatattgttgttgaaagacacatcaaaaat |
10894928 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 44333702 - 44333875
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
44333702 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtt-ccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagctaaaacaactaaagc |
44333800 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaat |
175 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
44333801 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaat |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Original strand, 42477947 - 42478111
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42477947 |
tagtgctacatctaacataagttgtttatgttttcaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcacgagc---taaagcaactaaagcat |
42478043 |
T |
|
| Q |
103 |
aagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgta |
170 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
42478044 |
aggttctttcatgtaacttaataacatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgta |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 248 - 371
Target Start/End: Original strand, 44333877 - 44334000
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248 |
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347 |
Q |
| |
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|
|
| T |
44333877 |
tgtattttagtaagtgaatttatgcgttagttattcaaatctctccatcaaaaattggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactt |
44333976 |
T |
|
| Q |
348 |
taaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
44333977 |
taaaatacttacagggattataat |
44334000 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 32664999 - 32665357
Alignment:
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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actagtgctacatgtaacataagttgtttatgtgtccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagctaaagcaactaaagc |
32665098 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatattttatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatctgaatgtcattgtctatgcacaat |
32665198 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32665199 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagcctgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatttctccaccaaaa |
32665298 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttac |
359 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32665299 |
attggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttac |
32665357 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9340598 - 9340228
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9340598 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttatttttttttttcatgagaagttcaagcaactaaagc |
9340499 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9340498 |
ataaattctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtataaatcggaatgtcattgtctatgtacaat |
9340399 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9340398 |
gtcttaaactatggtaataataatcacattaggcaacttcaagcctgtctatttttgtaagtgaatttatgcattagatattcaaatctctccaccaaaa |
9340299 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9340298 |
attggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacagggattataat |
9340228 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7945130 - 7944741
Alignment:
| Q |
3 |
tagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatg----agaagttaaagcaactaaa |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7945130 |
tagtgctacatctaacataagttgtttatgttttcaagtttattatcaaatttttcactttaattttttctttcatgcatgagaagttaaagcaactaaa |
7945031 |
T |
|
| Q |
99 |
gcataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatcc-----------------gaat |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7945030 |
gcataagttctttcatgtaatttaatagcatgaatatgatatttgatattattgaatcaacacattcttgtacaaatcaccttcttgcacaaatctgaat |
7944931 |
T |
|
| Q |
182 |
gtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttat |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7944930 |
gtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatggtaataataatcacaacatgcaacttcaagcctgtatattttagtaagtgaatttatgcattacttat |
7944831 |
T |
|
| Q |
282 |
tcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
7944830 |
tcaaatctctccaccaaaaattggatattgttgttgaaagacacataaaaaatcaagctatgaatttaaaatacttacagggattataat |
7944741 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 52440141 - 52440085
Alignment:
| Q |
303 |
tggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttac |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52440141 |
tggatattgttgttgaaagacacataaaaaatcaagctatgactttaaaatacttac |
52440085 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14704941 - 14704570
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14704941 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtt-ccaagtttattattaaatttctcactttaattttttctttcattagaagctaaagcaactaaagc |
14704843 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14704842 |
ataaat-ctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatctgaatgtcattgtctatgcacaat |
14704744 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaa---tctctccacca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
14704743 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaatcctgtgtattttagtaagtgaatttatgcgttagttattcaaagtttcaaaccacca |
14704644 |
T |
|
| Q |
298 |
aaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14704643 |
aaaattggatattgttgttgaaagatacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
14704570 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31091085 - 31090725
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31091085 |
actagtgctacatctaacataagctctttatttttccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaatctaaagcaactaaagc |
31090986 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtca-ttgtctatgcacaa |
199 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31090985 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatttgaatgtcatttgtctatgcacaa |
31090886 |
T |
|
| Q |
200 |
tgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaa |
299 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31090885 |
tttcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagcctgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaa |
31090786 |
T |
|
| Q |
300 |
aaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttaca |
360 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31090785 |
aattggatattgttgttgaaagatacataaaaaatcaaacaatgactttaaaatacttaca |
31090725 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24459013 - 24458654
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
24459013 |
actagtgctgcatataacataagttgtttaagtttccaagtttattatcaaatttctcactttaattgtttctttcatgagaaggtaaatcaactaaaac |
24458914 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24458913 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatctaaatgtcattgtctatgcacaat |
24458814 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctcca-ccaaa |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24458813 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagccagtgtattttagtaagtgaatttatgcataagttattcaaatctctccacccaaa |
24458714 |
T |
|
| Q |
300 |
aaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttac |
359 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24458713 |
aattgaatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttac |
24458654 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Original strand, 39015573 - 39015935
Alignment:
| Q |
4 |
agtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagcata |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
39015573 |
agtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatctaatttttcactttaattttttctttcatgagaagctaaagcaatcaaagcata |
39015672 |
T |
|
| Q |
104 |
agttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaatgtc |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39015673 |
agttctttcatgtaacta-----catgaatatgatatttgatactattgaatcaacactattttgtacaaatctgaatgtcattgtctatgcacaatgtc |
39015767 |
T |
|
| Q |
204 |
ttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaaaat |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39015768 |
ttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagcctgggtattttagtaagtgaacttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaaatt |
39015867 |
T |
|
| Q |
304 |
ggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
39015868 |
ggatattgttattgaaagacacatcaaaaatcaaactataactttaaaatacttacagggattataat |
39015935 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2911046 - 2910692
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2911046 |
actagtgccacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttagttttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
2910947 |
T |
|
| Q |
101 |
ata--agttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcaca |
198 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2910946 |
atataagttctttcat------taatag-atgaatatgatatttgatactattgaatcaacacattctagtacaaatctaaatgtcattgtctatgcaca |
2910854 |
T |
|
| Q |
199 |
atgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaa |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2910853 |
atgtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagtctgtgtactttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaa |
2910754 |
T |
|
| Q |
299 |
aaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttaca |
360 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
2910753 |
aaattggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaattacttaca |
2910692 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39999893 - 39999528
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaatttttt-ctttcatgagaagttaaagcaactaaag |
99 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
39999893 |
actactgctacatctaacataagtttgttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaatttttttctttcatgaaaag---------ctaaag |
39999803 |
T |
|
| Q |
100 |
cataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatcc------------------gaat |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39999802 |
cataagttctttcatgtaactta-tagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatcacatttcttatactaatctgaat |
39999704 |
T |
|
| Q |
182 |
gtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttat |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39999703 |
gtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagcatgtgta-tttagtaagtgaatttatgcattagttat |
39999605 |
T |
|
| Q |
282 |
tcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttaca |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39999604 |
tcaaatctctccatcaaaaatcgg--attgttgttgaaagacacgtcaaaaatcaagctatgactttaaaatagttaca |
39999528 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 32765839 - 32765722
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32765839 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgttttcaagtttattatcaaatttctcactttaattttatctttcatgagaag---------ctaaagc |
32765749 |
T |
|
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ataagttctttcatgtaacttaatagc |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
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32765748 |
ataagttctttcatgttacttaatagc |
32765722 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32765676 - 32765586
Alignment:
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166 |
ttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtatttta |
256 |
Q |
| |
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||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| |
|
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| T |
32765676 |
ttgtacaaatctgaattgcattgtctatgcacaatgtcttacactatggtaataataatcacaacagggaacttcaagcctgtgtatttta |
32765586 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32765561 - 32765521
Alignment:
| Q |
329 |
aaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtata |
369 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32765561 |
aaaaatcaagctattactttaaaatacttacatggattata |
32765521 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
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Target Start/End: Complemental strand, 55389028 - 55388641
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100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55389028 |
actagtgctacatctaacataggttgtttatgtttccaagtttatcatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
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T |
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| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgc-----------------ctttttgtacaaatccgaatgt |
183 |
Q |
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| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |
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| T |
55388928 |
agaagttctttcatgtaacttaatagcgtgaatatgatatttgatactattgaatcaacacattcttgtacaaatcaccttcttgtacaaatctgaatgt |
55388829 |
T |
|
| Q |
184 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattc |
283 |
Q |
| |
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| T |
55388828 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataattacaataggcaacttcaagcctgagtattttagtaagtgaatttatgcattagttattc |
55388729 |
T |
|
| Q |
284 |
aaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
55388728 |
aaagctctccaccaaaaattggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagttatgactttaaaatacttacagggattataat |
55388641 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 17701084 - 17701470
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
17701084 |
actagtgctacatataacataagttgtttatgtttccaagtttgttatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaaggtaaagcaactaaagc |
17701183 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgt-----------------acaaatccgaatgt |
183 |
Q |
| |
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| T |
17701184 |
ataagttctttcatgtaacttaatacaatgaatatga-atttgatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatcatcttcttgtacaaatctgaatgt |
17701282 |
T |
|
| Q |
184 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattc |
283 |
Q |
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| T |
17701283 |
cattgtctatgcacaatgtcttaaactatggtaataataatcacaacatacaacttcaagcctgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattc |
17701382 |
T |
|
| Q |
284 |
aaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
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|
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| T |
17701383 |
aaatatctccaccaaaaattggttattgttgttgaaagacacataaaaaatcaaactatgactttaaaatacttacatggattataat |
17701470 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 52317477 - 52317867
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttc-atgagaagttaaagcaactaaag |
99 |
Q |
| |
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| T |
52317477 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattataaaatatttcactttaattttttatttctatgagaagttaaagcaattaaag |
52317576 |
T |
|
| Q |
100 |
cataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatcc-----------------gaatg |
182 |
Q |
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| T |
52317577 |
cataagttctttcatataacttaatagcatgaatataatatttgatactattgaatcaacacctttttgtagaaatcacattcttgtataaatttgaatg |
52317676 |
T |
|
| Q |
183 |
tcattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttatt |
282 |
Q |
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| T |
52317677 |
tcattgtctatgcacaatgtcttaaactatggtaataataatcacaacaggcaacttcaagcat--gtatgttagtaagtgaatttatgcattagttatt |
52317774 |
T |
|
| Q |
283 |
----caaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
52317775 |
aattcaaatctctccaccaaaaattgaatattgttgttgaaagagacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttaaagggattataat |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 48573554 - 48573902
Alignment:
| Q |
2 |
ctagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttct-ttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48573554 |
ctagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttgttatcaaatttctcactttaattttttttcttcatgaaaagttaaagcaactaaagc |
48573653 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
48573654 |
ataagttctttcatgtaacttaataccat----------------------gaatcaacaccttcttgtacaaatctgaatgtcattgtctatacacaat |
48573731 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaa |
300 |
Q |
| |
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|
| T |
48573732 |
gtcttaaactatggtaataatgatcacaacatgcaacttctagcatgtgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccatcaaaa |
48573831 |
T |
|
| Q |
301 |
aatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48573832 |
attggttattgttgttgaaagacacataaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
48573902 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 53958660 - 53958401
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53958660 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttcttactttaattttttctttcatgagaaggtaaagcaactaaagc |
53958561 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53958560 |
ataagttctttcatgtaacttaatagtatgaatatgatatttgatactattgaatcaacatcttcttgtaaaaatccgaatgttgttgtctatgcacaac |
53958461 |
T |
|
| Q |
201 |
gtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaa |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
53958460 |
gtcttaaactatggtaataataatcacaacatgcaacttcaagcttgtgtattttagtaa |
53958401 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36279875 - 36279700
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
36279875 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaaacaagtaaagc |
36279776 |
T |
|
| Q |
101 |
ataagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatc |
176 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
36279775 |
atgagttctttcatgtaacttaatagcatgaatatgatatttgatactattgaatcaacaccatcttgtacaaatc |
36279700 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 179 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 53958402 - 53958210
Alignment:
| Q |
179 |
aatgtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagt |
278 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53958402 |
aatgtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatcacagcaggcaacttcaagcttgtgtcatttagtaagtgaatttatgcattagt |
53958303 |
T |
|
| Q |
279 |
tattcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
53958302 |
tatttaaatctctccatcaaaaattggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacagggattataat |
53958210 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48809208 - 48809052
Alignment:
| Q |
30 |
atgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagcataagttctttcatgtaacttaatagcat |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48809208 |
atgtttccaagtttattatcaaatttctcactttaattttt-ctttcatgagaagttaaagcaactaaaacataagttctttaatgtaacttaatagcat |
48809110 |
T |
|
| Q |
130 |
gaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcatt |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48809109 |
gaatatgatatttaatactattgaatcaacaccttcttgtacaaatctgaatgtcatt |
48809052 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 202 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36279695 - 36279526
Alignment:
| Q |
202 |
tcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaaa |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36279695 |
tcttaaactatgataataataatcacaacaggcaacttcaagcttgtgtattttagtaagtgaatttatgcatgaattattcaaatctctccaccaaaaa |
36279596 |
T |
|
| Q |
302 |
atggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
36279595 |
ttgaatattgttgttgacagacacataaaaaatcaagctataactttaaaatacttagagggattataat |
36279526 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 248 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48809038 - 48808926
Alignment:
| Q |
248 |
tgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
48809038 |
tgtattttagcaagtgaatttatgcattagttattcacatctctccaccaaaaatttgatattgttgttgaaagacacataaaaaatcaagctataactt |
48808939 |
T |
|
| Q |
348 |
taaaatacttaca |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
48808938 |
taaaatacttaca |
48808926 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47875381 - 47875136
Alignment:
| Q |
127 |
catgaatatgatatttgatactattgaatcaacgcctttttgtacaaatccgaatgtcattgtctatgcacaatgtcttaaactatgataataataatca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
47875381 |
catgaatatgatatttgatattattgaatcaacaccttcttgtacaaatttgaatgtcattgtctatgcagaatgttttaaactatggtaataataatca |
47875282 |
T |
|
| Q |
227 |
caacaggcaacttcaatcatatgtattttagtaagtgaatttatgcattagttattcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacaca |
326 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
47875281 |
caacatgcaacttcaagcctgtgtattttagtaagtgaatttatgcatcaggtattcaaatctctccgccaaaaattggttatcgttgttgaaagacaca |
47875182 |
T |
|
| Q |
327 |
t-caaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtataat |
371 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47875181 |
taaaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattataat |
47875136 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42278725 - 42278623
Alignment:
| Q |
269 |
atgcattagttattcaaatctctccaccaaaaaatggatattgttgttgaaagacacatcaaaaattaagctatgactttaaaatacttacatggagtat |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
42278725 |
atgcattagttattcacatctctccaccaaaaattggatattgttgttgaaagacacatcaaaaatcaagctatgactttaaaatacttacatggattat |
42278626 |
T |
|
| Q |
369 |
aat |
371 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
42278625 |
aat |
42278623 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 47878060 - 47877957
Alignment:
| Q |
1 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaattttattatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagttaaagcaactaaagc |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |
|
|
| T |
47878060 |
actagtgctacatctaacataagttgtttatgtttccaagtttgttatcaaatttctcactttaattttttctttcatgagaagctaaaacaattaaagc |
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T |
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ataa |
104 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
47877960 |
ataa |
47877957 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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