View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18453_low_4 (Length: 760)

Name: NF18453_low_4
Description: NF18453
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18453_low_4
NF18453_low_4
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (115-747)||(5196937-5197569)
chr4 (125-747)||(5215092-5215714)
chr4 (118-747)||(5174199-5174828)
chr4 (118-745)||(4840696-4841323)
chr4 (101-711)||(5161241-5161853)
chr4 (118-750)||(5183541-5184173)
chr4 (118-745)||(4855204-4855829)
chr4 (122-454)||(7143408-7143740)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 747
Target Start/End: Original strand, 5196937 - 5197569
Alignment:
Q  115 ttggaagtgcagttcagaacaaagcattacgattacttttacaaaggtaaaatcctagagaacatgacaggattggatttatcatgcaataagctaacag 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5196937 ttggaagtggagttcagaacaaagcactatgaatacttttacaagggtaaagttctagagaatatgactggattggatttatcatgcaataagctaacag 5197036  T
Q  215 gtatcatcccttctcaaattggaaaccttcaacaaattagagccttgaacctatcacataattacttgtcaggtcctattccaattactttttcaaatct 314  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5197037 gtgtcatcccttctcaaattggagacctacaacaaattagagccttgaatctatcacataatcacttgtcaggtcccattccaatcactttttcaaatct 5197136  T
Q  315 taccaaaatagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaatccagttgaactttttatcaacattcaatgtgtca 414  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5197137 tacccaaatagagagtcttgacttatcatacaatgacttgagtggtaagatacccaatgaactaacccagctaaactttttgtcaaccttcaatgtgtca 5197236  T
Q  415 tacaacaacctttctggaacaccacctagtacaggacaatttgcaacttttgatgaggaaaactacagaggtaatcccagtctttgtggaccactcctca 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5197237 tacaacaacctttctggaacaccacctagtataggccagtttgcaaactttgatgaggataactacagaggtaatcccagtctttgtggaccactcctca 5197336  T
Q  515 atcggaagtgtgaacgtgacgagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatggagaaaaggaatcttccgtggataagataacattttattggagttt 614  Q
     ||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5197337 gtcgaaagtgtgaacgtgtcgagcctccaccatcatcccaatccaatgacaatgaagaagaggaaactggtgtggacatgataacattttattggagttt 5197436  T
Q  615 cacagcatcttacataacaatattgttggccttcataacagtgttgtgcatcaatgcatgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatg 714  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5197437 cacagcatcttacataacaatactattggccttcataacagtgttgtgcatcaatccacgttggcgcatggcctggttttattacatcagtaagtttatg 5197536  T
Q  715 cgtagattttttccaaattttccattttattga 747  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  5197537 cgtagattctttccaacttttccattgtattga 5197569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 125 - 747
Target Start/End: Original strand, 5215092 - 5215714
Alignment:
Q  125 agttcagaacaaagcattacgattacttttacaaaggtaaaatcctagagaacatgacaggattggatttatcatgcaataagctaacaggtatcatccc 224  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5215092 agttcagaacaaagcactatgaatacttttacaagggtaaagttctagagaatatgactggattggatttatcatggaataacctaacaggtctcatccc 5215191  T
Q  225 ttctcaaattggaaaccttcaacaaattagagccttgaacctatcacataattacttgtcaggtcctattccaattactttttcaaatcttaccaaaata 324  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5215192 ttctcaaattggtcaccttcaacaagttagagccttgaacctatcacataatcacttgtctggtcctattccaattactttttcaaatcttacccaaata 5215291  T
Q  325 gagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaatccagttgaactttttatcaacattcaatgtgtcatacaacaacc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  5215292 gagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccaaatgaactaacccagttgaactttttatcaaccttcaatgtatcatacaacaact 5215391  T
Q  425 tttctggaacaccacctagtacaggacaatttgcaacttttgatgaggaaaactacagaggtaatcccagtctttgtggaccactcctcaatcggaagtg 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  5215392 tttctggaacaccacctagtacaggacagtttggaggttttgatgaggacagttacagaggtaatcccggtctttgtggaccactcctctatcaaaagtg 5215491  T
Q  525 tgaacgtgacgagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatggagaaaaggaatcttccgtggataagataacattttattggagtttcacagcatct 624  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215492 tgaacgtgtcgagtcttcaccttcatcacaatccaatgacaatggagaaaaggaaaccatggtggacatgataacattttattggagtttcacagcatct 5215591  T
Q  625 tacataacaatattgttggccttcataacagtgttgtgcatcaatgcatgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatgcgtagatttt 724  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5215592 tacataacaatactattggccttcataacagtgttgtgcgtcaatccacgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatgcgtaaaattt 5215691  T
Q  725 ttccaaattttccattttattga 747  Q
    ||||||  |||||||| ||||||    
T  5215692 ttccaacgtttccattgtattga 5215714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 118 - 747
Target Start/End: Original strand, 5174199 - 5174828
Alignment:
Q  118 gaagtgcagttcagaacaaagcattacgattacttttacaaaggtaaaatcctagagaacatgacaggattggatttatcatgcaataagctaacaggta 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | || |||| |||||| |||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5174199 gaagtggagttcagaacaaagcacaatgaatactcttacaagggtatagttctagagaatatgactggattggatttatcatgcaataagctaacaggtg 5174298  T
Q  218 tcatcccttctcaaattggaaaccttcaacaaattagagccttgaacctatcacataattacttgtcaggtcctattccaattactttttcaaatcttac 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5174299 tcatcccttctcaaattggagacctacaacaaattagagccttgaatctatcacataatcacttgtctggtcccattccaatcactttttcaaatcttac 5174398  T
Q  318 caaaatagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaatccagttgaactttttatcaacattcaatgtgtcatac 417  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5174399 ccaaatagagagtcttgacttatcatacaatgacttgagtggtaagatacccaatgaactaacccagctaaactttttgtcaaccttcaatgtgtcatac 5174498  T
Q  418 aacaacctttctggaacaccacctagtacaggacaatttgcaacttttgatgaggaaaactacagaggtaatcccagtctttgtggaccactcctcaatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  5174499 aacaacctttctggaacaccacctagtacaggacaatttggaggctttgttgaggaaaactacataggtaatcctggtctttgtggaccattcgtcaatc 5174598  T
Q  518 ggaagtgtgaacgtgacgagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatggagaaaaggaatcttccgtggataagataacattttattggagtttcac 617  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  5174599 gaaagtgtgaacatgtcgagtcttcagcatcatcacaatccaatgacgacggagaaaaggaaaccatggtggacatgataactttttattggagtttcac 5174698  T
Q  618 agcatcttacataacaatattgttggccttcataacagtgttgtgcatcaatgcatgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatgcgt 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5174699 agcatcttacataacaatattgttggccctcataacagttttgtgcatcaatccacgttggcgtatggcctggttttattatatcagtaagtttatgcgt 5174798  T
Q  718 agattttttccaaattttccattttattga 747  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5174799 agattttttccaacttttccattgtattga 5174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 118 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 4841323 - 4840696
Alignment:
Q  118 gaagtgcagttcagaacaaagcattacgattacttttacaaaggtaaaatcctagagaacatgacaggattggatttatcatgcaataagctaacaggta 217  Q
    |||||| |||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  4841323 gaagtggagtttagaacaaagcacaatgaatacttttacaagggtaaagttctagagattatgactggattggatttatcatgcaataatttaacaggtg 4841224  T
Q  218 tcatcccttctcaaattggaaaccttcaacaaattagagccttgaacctatcacataattacttgtcaggtcctattccaattactttttcaaatcttac 317  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4841223 ttatcccttcccaaattggagacctacaacaaattagagccttgaatctatcacataatcacttgtcaggtcccattccaatcactttttcaaatcttac 4841124  T
Q  318 caaaatagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaatccagttgaactttttatcaacattcaatgtgtcatac 417  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  4841123 ccaaatagagagtcttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccaaatgaactaacccagttgaactttttagaaatcttcaatgtgtcatac 4841024  T
Q  418 aacaacctttctggaacaccacctagtacaggacaatttgcaacttttgatgaggaaaactacagaggtaatcccagtctttgtggaccactcctcaatc 517  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  4841023 aacaacctctctggaacaccacctagtacaggacaatttggaggctttgttgaggaaaactacataggtaatcctggtctttgtggaccattcctcaatc 4840924  T
Q  518 ggaagtgtgaacgtgacgagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatggagaaaaggaatcttccgtggataagataacattttattggagtttcac 617  Q
    | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  4840923 gaaagtgtgaacatgtcgagtcttcagcatcatcacaatccaatgacgacggagaaaaggaaaccatggtggacatgataactttttattggagtttcac 4840824  T
Q  618 agcatcttacataacaatattgttggccttcataacagtgttgtgcatcaatgcatgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatgcgt 717  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4840823 agcatcttacataacaatattgttagccttcataacagtgttgtgcatcaatccacgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatgcgt 4840724  T
Q  718 agattttttccaaattttccattttatt 745  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4840723 agattttttccaacttttccattgtatt 4840696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 711
Target Start/End: Original strand, 5161241 - 5161853
Alignment:
Q  101 atggcgaactatacttggaagtgcagttcagaacaaagcattacgattacttttacaaaggtaaaatcctagagaacatgacaggattggatttatcatg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5161241 atggcgaactacacttggaagtggagttcagaacaaagcacaatgattacttttacaaaggtaaagtcctagagaaaatgactggattggatttatcatg 5161340  T
Q  201 caataagctaacaggtatcatcccttctcaaattggaaaccttcaacaaattagagccttgaacctatcacataattacttgtcaggtcctattccaatt 300  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5161341 caacaagctaacaggtactatcccttctcaaattgggcacctgcaacaagttttagccttgaacctatcacataatcacttgtcgggtcctattccaatt 5161440  T
Q  301 actttttcaaatcttaccaaaatagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaatccagttgaactttttatcaa 400  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  5161441 acgttttcaaatcttaccgaaatagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgagctaacccagttgacctttttatcaa 5161540  T
Q  401 cattcaatgtgtcatacaacaacctttctggaacaccacctagtacaggacaatttgcaacttttgatgaggaaaactacagaggtaatcccagtctttg 500  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  5161541 ccttcaacgtgtcatacaacaacctttctggaacaccacctagtacaggacagtttgcaaccttcgttgaggacagctacagaggtaatcccggtctttg 5161640  T
Q  501 tggaccactcctcaatcggaagtgtgaacgtgacgagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatggagaaaaggaatcttccgtggataagataaca 600  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    ||||| | |||||||    
T  5161641 tggatcactcctcgaccgaaagtgtgaaggtgtcaagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatgaagaagaggaaacaaatgtggacatgataaca 5161740  T
Q  601 ttttattgga-gtttc-acagcatcttacataacaatattgttggccttcataacagtgttgtgcatcaatgcatgttggcgtatggcctggttttatta 698  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  5161741 ttttattggaggtttctacagcatcttacataacaatattgttggccttcgtaacagtgttgtgtatcaatgctcgttggcgtatggcttggttttatta 5161840  T
Q  699 catcagtaagttt 711  Q
    ||| |||||||||    
T  5161841 cattagtaagttt 5161853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 118 - 750
Target Start/End: Original strand, 5183541 - 5184173
Alignment:
Q  118 gaagtgcagttcagaacaaagcattacgattacttttacaaaggtaaaatcctagagaacatgacaggattggatttatcatgcaataagctaacaggta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| | | ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5183541 gaagtgcagtttagaacaaagcactatgattacttttacaagggtatagttctaaagatcatgactggattggatttatcatgcaataagctaacaggtg 5183640  T
Q  218 tcatcccttctcaaattggaaaccttcaacaaattagagccttgaacctatcacataattacttgtcaggtcctattccaattactttttcaaatcttac 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5183641 tcatcccttctcaaattggagacctacaacaaattaaagccttgaatctatcacataattacttgtctggtcctattccaataactttttcaaaacttac 5183740  T
Q  318 caaaatagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaatccagttgaactttttatcaacattcaatgtgtcatac 417  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||  ||  |||||||||||||||    
T  5183741 ccaaatagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagattccttatgaactaaccaagttgacctctttagaaatcttcaatgtgtcatac 5183840  T
Q  418 aacaacctttctggaacaccacctagtacaggacaatttgcaacttttgatgaggaaaactacagaggtaatcccagtctttgtggaccactcctcaatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  5183841 aacaacctttctggaacaccacctagcacaagacaatttgcaaactttgatgagtacaactacagaggtaatcccggtctttgcggacaactcctaaatc 5183940  T
Q  518 ggaagtgtgaacgtgacgagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatggagaaaaggaatcttccgtggataagataacattttattggagtttcac 617  Q
      ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  5183941 aaaagtgtgaacgtgtcgagtcttcaccttcatcacaatccaatgacaatggagaaaagcaaaccatggtggacatgataacattttattggagtttcat 5184040  T
Q  618 agcatcttacataacaatattgttggccttcataacagtgttgtgcatcaatgcatgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatgcgt 717  Q
    | ||||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5184041 aacatcttatattacaatactattggccttcataactgtgttgggcatcaatccacgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatgcgt 5184140  T
Q  718 agattttttccaaattttccattttattgatga 750  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  5184141 agattctttccatcttttccattatattgatga 5184173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 118 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 4855829 - 4855204
Alignment:
Q  118 gaagtgcagttcagaacaaagcattacgattacttttacaaaggtaaaatcctagagaacatgacaggattggatttatcatgcaataagctaacaggta 217  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  4855829 gaagtggagttcagaacaaagcactatgaatacttttacaagggtaaagttctagagaatatgactggattggatttatcatggaataacctaacaggtg 4855730  T
Q  218 tcatcccttctcaaattggaaaccttcaacaaattagagccttgaacctatcacataattacttgtcaggtcctattccaattactttttcaaatcttac 317  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4855729 tcatcccttctcaaattggtcaccttcaaccagttagagccttgaacctatcacataatcacttgtctggtcctattccaattactttttcaaatcttac 4855630  T
Q  318 caaaatagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaatccagttgaactttttatcaacattcaatgtgtcatac 417  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||  || ||||||||||||||||    
T  4855629 ccaaatagaaagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaaccaagttgacctctttagaaatattcaatgtgtcatac 4855530  T
Q  418 aacaacctttctggaacaccacctagtacaggacaatttgcaacttttgatgaggaaaactacagaggtaatcccagtctttgtggaccactcctcaatc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |    
T  4855529 aacaacctttctggaacaccacctagtacaggacagtttgcaaccttcattgaggacagctacagaggtaatcccgatctttgtggaccactcctcgacc 4855430  T
Q  518 ggaagtgtgaacgtgacgagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatggagaaaaggaatcttccgtggataagataacattttattggagtttcac 617  Q
    | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4855429 gaaagtgtgaaggtgccaagtcttcaccatcatcacaatccaatgacaatgaagaagaggaaacaaatgtggacatgataacattttattggagtttcac 4855330  T
Q  618 agcatcttacataacaatattgttggccttcataacagtgttgtgcatcaatgcatgttggcgtatggcctggttttattacatcagtaagtttatgcgt 717  Q
    | ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||    
T  4855329 accatcttacataacaatactactgaccttcataacagtgt--tgcatcaatccacgttggcgtttggcctggttttattacattagtaagtttgtaggt 4855232  T
Q  718 agattttttccaaattttccattttatt 745  Q
    |  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  4855231 atcttttttccaacttttccattgtatt 4855204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 454
Target Start/End: Original strand, 7143408 - 7143740
Alignment:
Q  122 tgcagttcagaacaaagcattacgattacttttacaaaggtaaaatcctagagaacatgacaggattggatttatcatgcaataagctaacaggtatcat 221  Q
    ||||||| ||||||||| | || || ||||||||| | | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||  |  ||||    
T  7143408 tgcagtttagaacaaagaactatgagtacttttacgacgctaaaatcctagagatgatgactggattggatttatcatgcaatatcgtaactagagtcat 7143507  T
Q  222 cccttctcaaattggaaaccttcaacaaattagagccttgaacctatcacataattacttgtcaggtcctattccaattactttttcaaatcttaccaaa 321  Q
     |||||| || ||||| || | ||| |   | ||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  7143508 accttctgaacttggagacatgcaaaaccatcgagtcttgaatctataacataatcacttgtcaggtcctattccaatcactttttccaatcttacccaa 7143607  T
Q  322 atagagagccttgacttatcatacaataacttgagtggtaagataccttatgaactaatccagttgaactttttatcaacattcaatgtgtcatacaaca 421  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||| | ||||||  || |||| |||| ||   |  ||||||||||| |||||||    
T  7143608 atagagagtcttgacttatcatagagtaacttgaatggtaaggtagcttctcaactaagtcacttgacctttatagatatcttcaatgtgtcttacaaca 7143707  T
Q  422 acctttctggaacaccacctagtacaggacaat 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7143708 acctttctggaacaccacctagtataggacaat 7143740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University