View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18467_low_19 (Length: 435)

Name: NF18467_low_19
Description: NF18467
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18467_low_19
NF18467_low_19
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (9-435)||(48949724-48950150)
chr1 (9-400)||(51113111-51113502)
chr1 (9-400)||(25682447-25682838)
chr1 (10-323)||(44527126-44527439)
chr1 (9-361)||(5609174-5609526)
chr1 (9-400)||(36733489-36733883)
chr1 (9-363)||(4394992-4395345)
chr1 (9-318)||(16816797-16817108)
chr1 (61-284)||(48166149-48166372)
chr1 (9-183)||(44602765-44602939)
chr1 (10-323)||(52109327-52109639)
chr1 (162-390)||(24538316-24538544)
chr1 (9-106)||(2885313-2885410)
chr1 (9-93)||(21031252-21031336)
chr1 (298-375)||(17507279-17507356)
chr1 (9-114)||(24538569-24538674)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (9-397)||(8387885-8388273)
chr5 (9-335)||(26597457-26597783)
chr5 (9-400)||(20204751-20205142)
chr5 (9-400)||(15988749-15989140)
chr5 (21-400)||(22767269-22767648)
chr5 (10-400)||(4267907-4268285)
chr5 (4-400)||(41940732-41941128)
chr5 (9-316)||(25730688-25730995)
chr5 (10-323)||(27292307-27292620)
chr5 (9-394)||(27532906-27533292)
chr5 (9-302)||(12660210-12660503)
chr5 (9-255)||(34652254-34652499)
chr5 (158-394)||(30222948-30223184)
chr5 (33-292)||(11375537-11375796)
chr5 (70-293)||(37448028-37448251)
chr5 (281-390)||(34653864-34653972)
chr5 (19-101)||(30222848-30222930)
chr5 (267-355)||(16074577-16074665)
chr5 (9-108)||(32632603-32632702)
chr5 (9-78)||(23074950-23075019)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (9-397)||(22289040-22289428)
chr7 (9-400)||(16731729-16732120)
chr7 (9-400)||(17709863-17710254)
chr7 (9-366)||(9328602-9328958)
chr7 (9-394)||(29200955-29201334)
chr7 (10-304)||(16098382-16098676)
chr7 (9-390)||(30493610-30493990)
chr7 (9-400)||(1581411-1581803)
chr7 (9-388)||(17877216-17877585)
chr7 (9-162)||(3275068-3275221)
chr7 (6-89)||(24139138-24139221)
chr7 (9-106)||(3601742-3601839)
chr7 (168-261)||(34578437-34578530)
chr7 (24-103)||(44480893-44480972)
chr7 (325-393)||(11745957-11746025)
chr7 (95-304)||(30824561-30824769)
chr7 (335-400)||(16098279-16098344)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (9-400)||(51259529-51259921)
chr4 (9-400)||(56065425-56065820)
chr4 (9-400)||(28537787-28538176)
chr4 (9-400)||(55734805-55735196)
chr4 (9-400)||(49951109-49951500)
chr4 (9-400)||(51734972-51735363)
chr4 (9-400)||(2064649-2065040)
chr4 (9-400)||(37245852-37246247)
chr4 (9-394)||(29655666-29656050)
chr4 (9-400)||(32577048-32577437)
chr4 (9-400)||(18442147-18442535)
chr4 (9-390)||(43840306-43840688)
chr4 (21-400)||(21321323-21321704)
chr4 (9-400)||(49119400-49119778)
chr4 (9-323)||(41835311-41835625)
chr4 (9-400)||(28425991-28426370)
chr4 (9-172)||(47226330-47226493)
chr4 (9-169)||(26422602-26422762)
chr4 (9-103)||(24989934-24990027)
chr4 (9-105)||(44936082-44936178)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (9-400)||(55199307-55199698)
chr3 (9-400)||(42340277-42340667)
chr3 (10-323)||(53496905-53497218)
chr3 (9-393)||(46007104-46007486)
chr3 (9-328)||(2615361-2615670)
chr3 (9-105)||(27608903-27608999)
chr3 (9-105)||(34497372-34497468)
chr3 (105-283)||(647307-647485)
chr3 (9-183)||(11020180-11020354)
chr3 (12-151)||(647166-647305)
chr3 (60-304)||(48227305-48227550)
chr3 (9-73)||(19117720-19117784)
chr3 (9-119)||(24176847-24176957)
chr3 (144-242)||(27941129-27941227)
chr3 (9-153)||(2121124-2121268)
chr3 (9-88)||(27747685-27747764)
chr3 (280-366)||(1070843-1070929)
chr3 (311-400)||(36310798-36310887)
chr3 (9-109)||(31341725-31341829)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (9-381)||(1-377)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (9-400)||(15605994-15606392)
chr6 (9-400)||(28106935-28107326)
chr6 (9-394)||(14679961-14680349)
chr6 (9-280)||(15053175-15053446)
chr6 (9-203)||(19690879-19691073)
chr6 (9-219)||(30801991-30802201)
chr6 (10-242)||(29368057-29368287)
chr6 (13-394)||(11731673-11732031)
chr6 (9-86)||(34104465-34104542)
chr6 (9-88)||(27443039-27443117)
chr6 (280-394)||(19364217-19364330)
chr6 (276-390)||(30802237-30802351)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (9-400)||(88355-88746)
chr2 (12-400)||(34695907-34696293)
chr2 (12-400)||(34718319-34718705)
chr2 (9-400)||(12130638-12131029)
chr2 (9-362)||(44017318-44017671)
chr2 (4-365)||(26198518-26198874)
chr2 (77-400)||(18345555-18345865)
chr2 (112-211)||(9709914-9710013)
chr2 (7-132)||(22845600-22845725)
chr2 (9-118)||(1417981-1418090)
chr2 (9-116)||(13109869-13109976)
chr2 (9-115)||(9710036-9710142)
chr2 (9-104)||(11292063-11292157)
chr2 (9-150)||(14827126-14827267)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (10-323)||(23853805-23854118)
chr8 (9-400)||(478056-478447)
chr8 (9-400)||(8451123-8451514)
chr8 (9-400)||(7127019-7127410)
chr8 (9-306)||(13414913-13415210)
chr8 (9-240)||(185591-185820)
chr8 (267-400)||(40588973-40589106)
chr8 (9-219)||(40588730-40588940)
chr8 (9-109)||(598237-598337)
chr8 (9-104)||(33642764-33642859)
chr8 (9-242)||(37712033-37712260)
chr8 (9-144)||(3606739-3606874)
chr8 (9-128)||(11870332-11870451)
chr8 (96-181)||(9496797-9496881)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (9-93)||(264-348)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (9-88)||(44244-44322)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 435
Target Start/End: Original strand, 48949724 - 48950150
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  48949724 ataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagttgaactcgaagacaacccggt 48949823  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48949824 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactttcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 48949923  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48949924 aatgaattgccaacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 48950023  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgccacttgggac 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48950024 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgccacctgggac 48950123  T
Q  409 agtatcaagaagtattggagtgtgatc 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  48950124 agtatcaagaagtattggagtgtgatc 48950150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51113502 - 51113111
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51113502 ataatactagaaacaatagcataaaactccgaatcaccatggcccagagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggt 51113403  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51113402 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatgacatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaacggttatatttgctcgttgccatttcgtttgagtccg 51113303  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51113302 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacggcatccacattgcactttaaccacgtctca 51113203  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51113202 cacgatttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggctgtttatgaacctcctgcca 51113111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25682838 - 25682447
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  25682838 ataatactagaaacaatagtatagaattctaaatcactgtggcccggagacgatagagcttgtactagagtagctgagtcaaactcgaagacagcccggt 25682739  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  25682738 cccatctgttcacattagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagccca 25682639  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25682638 gataaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatgaaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctca 25682539  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | |||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25682538 cacggtttctcccaaattgagttcttgccttgcactctattctacccatgttgcacaatcggcgataagggttgtttatgaatctcttgcca 25682447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44527439 - 44527126
Alignment:
Q  10 taatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44527439 taatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtc 44527340  T
Q  110 ccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccga 209  Q
    |||||||||  || || |||||||||  || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  44527339 ccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccattttgtttgagcccga 44527240  T
Q  210 atgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcac 309  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||      
T  44527239 ataaattgcccacaagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcgg 44527140  T
Q  310 gcggtttctcccaa 323  Q
     |||||||||||||    
T  44527139 tcggtttctcccaa 44527126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5609526 - 5609174
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |    
T  5609526 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccctgagacgatagagtttgcactagagtagatgagtcgaactcgaagacaacccgat 5609427  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||   | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||  || || |||   |||||||||||    
T  5609426 ctcatctgttcgcaacatcaaagtgaaggacctcgagtaaggctactgcctcccccttcaaaactatcatatttgtccgctgtcatagagtttgagcccg 5609327  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||||| |  | ||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  5609326 aataaattgctcgtgtgagtctctagcacagcacgcgaaagttgtaatatggttacagtcatggaacgcgacatccacattgcacttcaaccacgtctcg 5609227  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttg 361  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  5609226 ctcggtttctcccaaactgagttgttgccttgcactctattatgcctgtgttg 5609174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36733883 - 36733489
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  36733883 ataatactagaaacaataacatagaattatgaatcatcatggcccggagacgatatagcttgcactagagttatagagtcagactcgaagacaacccggt 36733784  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||  ||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  36733783 cccatttgttcacatcagcaaagtgaataacattgagtaagactactgcctccccctccaaaactgccatatttacccgttgtcattttgtttgagcccg 36733684  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccac--attgcacttcaaccacgtct 306  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  36733683 aataaattgtccacgagagtctctaacacaacacacaaaaggtgtaagatggttatagtcatgaaacgcggcatccacatattgcacttcaaccatgtct 36733584  T
Q  307 cacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatga-gggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | | |||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||| || || |||||||||| || |  ||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  36733583 cgctcggtttctccgaaactcagttattaccttgcattctattttggccttgttgcacaaccggtagtgaggggatgtttatgaacctcttgcca 36733489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4395345 - 4394992
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||    
T  4395345 ataatactataaacaataggatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagttggactcgaagataacctggt 4395246  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||| ||| || || |||||||||  || ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  4395245 cccatctattcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgcct-ccccttcaaaactctcatatttgcccgctgccatttcgattgagcccg 4395147  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||| ||    |||| ||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  4395146 gataaattgcccacgagagtctctaacacagcatgcaaaagttgtgatatggttacggtcatggaacgcggcttccacattgcacttcagccacgtctcg 4395047  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgca 363  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||  ||||||||    
T  4395046 ctcggtttctcccaaactgagttgttgtcttgcactctgttatgcatgtgttgca 4394992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Original strand, 16816797 - 16817108
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcac---catggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaaccc 105  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||   |||||| |||||| | |||  |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16816797 ataatactagaaacaatagcgtagaattccgaatcacgtccatggctcggagacggtagaacttgaactagagtagacgagtcggactcgaagacaaccc 16816896  T
Q  106 ggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagc 205  Q
    |||||||||||||  || || |||| ||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||| | ||||||    
T  16816897 ggtcccatctgtttgcatcagcaaaatgaagggcctcgagtaaggctactgcctcccc-tccaaaattgtcatatttgcccactgccattttgattgagc 16816995  T
Q  206 ccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtc 305  Q
     ||||| |||||| | || |||||||||| |||| |||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  16816996 tcgaataaattgcacgcgagagtctctaaaacaatacacaaaagatgtaatatggttacagacatggaacgcggcgtccgcattgcacttcaaccacatc 16817095  T
Q  306 tcacgcggtttct 318  Q
    |||| ||||||||    
T  16817096 tcactcggtttct 16817108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48166372 - 48166149
Alignment:
Q  61 atagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctc 160  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  | ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  48166372 atagagcttgcaatagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgatcccatatattcacataagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctattgtctc 48166273  T
Q  161 cccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgt 260  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||     
T  48166272 ccactccaaaactgtcatatttgctcgctgccatttcatttgagcccgaataaattgaccacgggagtctctaacacaacacacaaaagatgtaagatgg 48166173  T
Q  261 tgacagtcatgaaacgcggcatcc 284  Q
    | || |||||| |||| |||||||    
T  48166172 ttacggtcatggaacgtggcatcc 48166149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44602939 - 44602765
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||    
T  44602939 ataatactagaaacaatagcatagaattttgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaaggcaacccggt 44602840  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttg 183  Q
    | ||||||||| || ||  |||||||||  ||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  44602839 ctcatctgttcacatcagtaaagtgaatgacatcgagtaagactaatgtctccccctccaaaattgtcatatttg 44602765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 52109639 - 52109327
Alignment:
Q  10 taatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtc 109  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||  ||    
T  52109639 taatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggtccggagacaatagagcttgtactagagtagatgaatcacactcaaagacaaccca-tc 52109541  T
Q  110 ccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccga 209  Q
    |||||||||  || || |||||||||   | ||||||||||| | ||| |||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  52109540 ccatctgttagcatcagcaaagtgaaggacctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaatgatcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcctga 52109441  T
Q  210 atgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcac 309  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| ||| ||| | || |||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||||||||       
T  52109440 ataaattgtccacaggagtctctaacacaacatgcaaaagatataagatgattacggtcatggaacacaacgtccacattacacttcaaccacgtctttg 52109341  T
Q  310 gcggtttctcccaa 323  Q
     |||||||||||||    
T  52109340 tcggtttctcccaa 52109327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24538544 - 24538316
Alignment:
Q  162 ccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgtt 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  || |    
T  24538544 ccctccaaaactgtcgtatttgcctgctgccaattcgtttgagcccgaataaattatccacgggagtctctaacacaacacacaaaagatctaacttggt 24538445  T
Q  262 gacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttg 361  Q
     || || ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  24538444 tacggttatagaacgcggcatccacattgcatttcgaccaggtctcacttggtttctctcaaactgagatgttaccttgcactctattctgcctatgttg 24538345  T
Q  362 cacaatcgatgatgagggttgtttatgaa 390  Q
    |||||  | || |||||| ||||||||||    
T  24538344 cacaactggtggtgagggatgtttatgaa 24538316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2885410 - 2885313
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2885410 ataatactagaaacaatagcatataactccgaatcaccatagcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtctgactcgaagacaacccg 2885313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21031336 - 21031252
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggact 93  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21031336 ataatactagaaactataacataaaattccgaatcaccatagtccggagacgatagagcttgcactagaatagctgagtcagact 21031252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17507356 - 17507279
Alignment:
Q  298 accacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatg 375  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||    
T  17507356 accatgtctcgctcggtttctcccaaactgagatattaccttgcactctcttctgttcgtgttgcacaaccgttgatg 17507279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24538674 - 24538569
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| ||| |||| ||  |||||  |||||||||||||||  ||||| |||| ||| | ||| ||||    
T  24538674 ataatactagaaataatagcgtagaattctgaatcactatgacccgaagcagatagatcttgcactagagtagaagagtcagactcgaaaagaactcggt 24538575  T
Q  109 cccatc 114  Q
    ||||||    
T  24538574 cccatc 24538569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8388273 - 8387885
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8388273 ataatactggaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggt 8388174  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8388173 cccatctgttcccaaccgcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctg 8388074  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8388073 aatgaattgcccacgagagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatattttaacggtcatgaaacgcggcatccacattgtacttcaaccacgtctca 8387974  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctg 397  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387973 cgcggtttctcccagactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctg 8387885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 335
Target Start/End: Original strand, 26597457 - 26597783
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26597457 ataatactagaaacaataacataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggt 26597556  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26597557 ctcatctattcccaactgcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaattgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 26597656  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26597657 aatgaattgtccacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgatgatcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctta 26597756  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgtta 335  Q
    | || |||||||||| ||| |||||||    
T  26597757 cacgatttctcccaaactgtgttgtta 26597783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20205142 - 20204751
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20205142 ataatactagaaacaatagcatagaattttgaatcaccatgacccggagaggatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcggt 20205043  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20205042 tccatctgttcgcaacaacaaagtgaatggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcctg 20204943  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
     || |||| ||| |||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20204942 gataaatttcccgcgggagtctctagcacaaaatgtaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctca 20204843  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
       |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20204842 tttggtttctcccaaactgagttattaccttacactctattttgcttgtgttgcacaaccaagggtgagggttgtttatgaacctcttgcca 20204751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 15988749 - 15989140
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15988749 ataatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggcctgaagacgatagagattgcactagagtagctgagacggacttgaagacaacccggt 15988848  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||| ||||| || || |||||| ||  || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  15988849 cccatatgttcgcatcagcaaagtaaagggcctcgagtaaggttactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccg 15988948  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||||| | ||  ||||||| ||| |||||   |||| ||||||||| |  | |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||     
T  15988949 aataaattgctcgcgaaagtctctgacataacacgcaaaagttgtaatatggttgcggtcatggaacgcgacatccatatttcacttcaacaacgtctcg 15989048  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15989049 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgctcgtgttgcacaaccgctagtgaaggttgtttatgaacctcttgcca 15989140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 400
Target Start/End: Original strand, 22767269 - 22767648
Alignment:
Q  21 acaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgttcc 120  Q
    ||||| ||||| ||||  |||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  22767269 acaatcgcatagaattctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcaaactcgaagacaacccggtcccatctgttta 22767368  T
Q  121 caacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgccc 220  Q
    || || |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22767369 catcagcaaagtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaattgccc 22767468  T
Q  221 acgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcc 320  Q
     ||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  22767469 ccgggaatctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatgattactgtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcc 22767568  T
Q  321 caatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||| |  |  ||| || |||||||||||||| |||||    
T  22767569 caaactgagttgttaccttgcactctattttggccgtgtggcacaaccagtagtgatggatgtttatgaacctcttgcca 22767648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4268285 - 4267907
Alignment:
Q  10 taatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4268285 taatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagaaaacccggtc 4268186  T
Q  110 ccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccga 209  Q
    ||| |||||  || || |||||||||  || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||    
T  4268185 ccacctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcctga 4268086  T
Q  210 atgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcac 309  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||      
T  4268085 ataaattgcccacgagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacaatcaagaaacgcggcgtccacgttgcactttaaccatgactcgt 4267986  T
Q  310 gcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
     ||||||||||||            | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | | |||||||||||| |||||    
T  4267985 tcggtttctccca------------aacttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccgatggtgaacgatttttatgaacctcttgcca 4267907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Original strand, 41940732 - 41941128
Alignment:
Q  4 ggtagataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaac 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| || |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41940732 ggtaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcacaatggtccagagacgatagagtttgcactagagtagttgagtcggactcgaagacaac 41940831  T
Q  104 ccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttg-ctcgttgccatttcgtttg 202  Q
    |||||||  | ||||| ||  | ||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||   || |||||||||||    
T  41940832 ccggtccagt-tgttcacatgagcaaagtgaatgacattgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttttctatatgtcatttcgtttg 41940930  T
Q  203 agcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccac 302  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41940931 agctcgaataaatttcccacgggagtctttaacactacacacaaaagatgtaagatagttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccac 41941030  T
Q  303 gtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
     |||| | |||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  41941031 atctcgctcggtttctcccaaattgggttgataccttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccggtggcgagggttgtttatgaacctcttgcca 41941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25730995 - 25730688
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  25730995 ataatactagaaacaataacatagaattcttaatcaccatgaccctgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcagt 25730896  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||| || || |||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  25730895 cccatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagctcg 25730796  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25730795 aataaatttcccgcgtgagactctaacacaacacgtgaaaattgtaatatggttacggtcatggaacgcggaatccacattgcacttcaaccacgtctcg 25730696  T
Q  309 cgcggttt 316  Q
    | ||||||    
T  25730695 ctcggttt 25730688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27292620 - 27292307
Alignment:
Q  10 taatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27292620 taatactagaaacaatagcataaaattccaaatcaccatggcctggagacgatagagtttgcactagagcagatgagtcgaactcgaagacaacccggtc 27292521  T
Q  110 ccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccga 209  Q
    |||||||||  || || |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  27292520 ccatctgttatcatcagcaaagtgaagggcatctagtaaggctattgcctcccccttcaaaacaataatatttgtccgctgccattttgtttgagcccga 27292421  T
Q  210 atgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcac 309  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||    ||| |||||||||| | ||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | |||      
T  27292420 ataaattgcccacgagagtctctaacacaacatgcaaaatatgtaatatggttactatcatggaacgtgacatccacattgcacttcaaccatgactcgt 27292321  T
Q  310 gcggtttctcccaa 323  Q
     |||||||||||||    
T  27292320 tcggtttctcccaa 27292307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Original strand, 27532906 - 27533292
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||| ||||  |  ||||||| || |||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  27532906 ataatacttgaaacaatagcaaagaattctgaatcaccatgacccggagacgataaagtctgcactaaagaagcaaagtcggactcgaaaacaacccggt 27533005  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |  | | ||||||||||||||||||    
T  27533006 cccatctattcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaagctattgcctccccctccaaaactgttatattttcctgctaccatttcgtttgagcccg 27533105  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacac-atgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctc 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||  || | ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||  | ||||||    
T  27533106 aataaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcaaaaagatgtaaactggttacgatcatggaacgcgacatccacattacacttcagtcgcgtctc 27533205  T
Q  308 acgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctc 394  Q
     |||| |||||||||| || |  | ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  27533206 gcgcgatttctcccaaactaaactattaccttgcactatattctgtctgtgttgcacaaccggtggtgagggatgtttatgaacctc 27533292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12660503 - 12660210
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||    
T  12660503 ataatactagaaacaatatcatagaattctgaatcaccgtggcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgacgataacacggt 12660404  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    | ||| ||||| ||  | ||||||||||  ||||||||||| | | |||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12660403 ctcatttgttcacattagcaaagtgaatgacatcgagtaagactactgcctcccgctctaacactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 12660304  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccac 302  Q
    ||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||   |||||||||| ||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12660303 aataaattgtccatgaaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccac 12660210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 34652254 - 34652499
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||| |    
T  34652254 ataatactagaaacaataacatataattctgaatcaccatggcccagagacggtagagcttgcactagagtagtcgagtcgggctcgaagacaacccgat 34652353  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||  |||  |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||    
T  34652354 cccatctgttcacatcggcaaagtgaatggcatcgagtaaggttattatctccccttacaacactgtcatatttgctcgctgcc-ttttgtttgagaccg 34652452  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaa 255  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34652453 gataaattgcccacgggagtctctaacacaacacacaaaagatgtaa 34652499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 158 - 394
Target Start/End: Original strand, 30222948 - 30223184
Alignment:
Q  158 ctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaata 257  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  30222948 ctccctctccaaaactgtcaaattcgcttgctgcaaattcgtttgagcccgaataaattgcccatggaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaata 30223047  T
Q  258 tgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgt 357  Q
    || | ||||||||| |||||| | ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30223048 tggttacagtcatggaacgcgacgtccatgttgcactttgaccacgtctcgcacggtttctcccaaacagagttgttaccttgcactctattctgcccgt 30223147  T
Q  358 gttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctc 394  Q
    |||||||||  | || |||||| ||||||||||||||    
T  30223148 gttgcacaactgttggtgagggctgtttatgaacctc 30223184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Original strand, 11375537 - 11375796
Alignment:
Q  33 aatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagt 132  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||  |||||||||||||||||| | ||  || |  |||| |    
T  11375537 aattccgaatcaccatggaccggagacgatagagcttgcactagaatagatgaatcagactcaaagacaacccggtcccatatatttgcatccgcaaaat 11375636  T
Q  133 gaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctct 232  Q
    |||  || ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||  || ||||||||    
T  11375637 gaagggcctcgagtaaggctactgtctccccctccaaaactgtcatatttactcgctgccatttcgtttgagtccgaataaatcacctgcgagagtctct 11375736  T
Q  233 aacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgca 292  Q
    |||||||||    |||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11375737 aacacaacatgcaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacgcagcatccacattgca 11375796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37448251 - 37448028
Alignment:
Q  70 gcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaa 169  Q
    |||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||| | |||    
T  37448251 gcactagagtagttgaattgaactcgaagacaacccggttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctaccgcctcccctttcaa 37448152  T
Q  170 aactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtca 269  Q
     |||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| | |  ||||    
T  37448151 cactgtcatgtttgcacgctgccattttgtttgagtccgaatacattgtccacgagagtctctaacacaacatataaacgatgtaagatggttatggtca 37448052  T
Q  270 tgaaacgcggcatccacattgcac 293  Q
    || ||| || ||||||||| ||||    
T  37448051 tggaacacgacatccacatcgcac 37448028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 390
Target Start/End: Original strand, 34653864 - 34653972
Alignment:
Q  281 atccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||    
T  34653864 atccacattgcacttcaaccacgtctcgtgcggtttctcccaaacttagttgtt-gcctgcactctattctgcacgtgttgcacaactggtgttgagggt 34653962  T
Q  381 tgtttatgaa 390  Q
    ||||||||||    
T  34653963 tgtttatgaa 34653972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Original strand, 30222848 - 30222930
Alignment:
Q  19 aaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagaca 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  30222848 aaacaatagcatagaattccgaatcaccgtgacccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcagattcgaagaca 30222930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16074665 - 16074577
Alignment:
Q  267 tcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgccc 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||    
T  16074665 tcatggaacgcggcatccacattgcactttgaccacgtctcgcacggtttctcctaaactaagttgttatattgccctatattctgccc 16074577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32632702 - 32632603
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||  ||||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||    
T  32632702 ataatattagaaacaatgtcatagaattctgaatcactatggctcggagacgataaagcttacactaaagtagatgagtcagactcaaagacaacccggt 32632603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23075019 - 23074950
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagag 78  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  23075019 ataatactataaacaataacatagaattatgaatcaccatggaccgaagacgataaagcttgcactagag 23074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22289428 - 22289040
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22289428 ataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacagcccggt 22289329  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22289328 cccatttgttcccaacggcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaaccacctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtctgagtccg 22289229  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22289228 aatgaattgcccacgggaatctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttaaaccacgtctca 22289129  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctg 397  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22289128 cgcggcttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccgatgatgagggttgtttatgaacctcctg 22289040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16732120 - 16731729
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  16732120 ataatactagaaacaatagcagagaattctgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggt 16732021  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| || || || ||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  16732020 tccatctgttcgcatcagcagagtgaatggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccg 16731921  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16731920 aataaattgcccgcgggaatctctaacacaacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 16731821  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||  | || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  16731820 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgcatgtgttgcacaactggtggtgagtgttgtttatgaacctcttgcca 16731729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17710254 - 17709863
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  17710254 ataatactagaaacaatagcagagaattctgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggt 17710155  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| || || || ||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17710154 tccatctgttcgcatcagcagagtgaatggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccg 17710055  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  17710054 aataaattgcccgcgggaatctctaacacaacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 17709955  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||  | || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  17709954 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgcatgtgttgcacaactggtggtgagtgttgtttatgaacctcttgcca 17709863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 366
Target Start/End: Original strand, 9328602 - 9328958
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||  |||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||    
T  9328602 ataatactagaaacaaacgcatagaattctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactccaagacaacccggt 9328701  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||  || || |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  9328702 cccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatattttcccgttgccatttcgtttgagctcg 9328801  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||   || ||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  9328802 aataaattgtcc-cgggaatctctaacacaacacgcaaatgatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctcg 9328900  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaa 366  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  9328901 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattctagccgtgtggcacaa 9328958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Original strand, 29200955 - 29201334
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  29200955 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgaagacaacccgtt 29201054  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| || || ||||||||||  |||| |||||      | |||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  29201055 tccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcaagtaaacatgctacctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgtcatttcgtttgagcccg 29201154  T
Q  209 aatgaattg--cccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtct 306  Q
    ||| || ||  | |||  |||||||||| ||||||    |||||| |||||||         ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29201155 aataaactggccacacatgagtctctaatacaacatgcaaaagatataatatg--------gatggaaagcggcatcaacattgcacttcaaccacgtct 29201246  T
Q  307 cacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctc 394  Q
    |  |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29201247 cgtgcggtttctcccaaactgagctattaccttgcactgtattttgtccgtgttgcacaaccgatggtgagggctgtttatgaacctc 29201334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16098676 - 16098382
Alignment:
Q  10 taatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtc 109  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16098676 taatactagaaacaatatcatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatggagcttgtactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtc 16098577  T
Q  110 ccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccga 209  Q
    |||| ||||  || || |||| ||||  || || |||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16098576 ccatttgttagcatcagcaaattgaagggcctctagtaaggctactacctctccctccaaaattgtcatatttgttcgtttccatttcgtttgagcccga 16098477  T
Q  210 atgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgt 304  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| | || |||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  16098476 ataaattgcctatgggagtctctaacacaacacgcaaaagaagtaatatggttacggtcatggaacgatgcgtccacattgcacttcaaccacgt 16098382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 30493610 - 30493990
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  30493610 ataatactataaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcccgaagacgatagagcttgcactagagtaattgagtcggactcgaagacaacctggt 30493709  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    | |||||||||  | || | |||||||   |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||| |    
T  30493710 ctcatctgttcatatcagctaagtgaacgacatcaagtaaggctactgcct-cccctccaaaactgtcatacttgtctgctgccatttcgtttgagcctg 30493808  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    | | ||||||||| | || | |||||||||||||   ||| ||||||  || | ||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||     
T  30493809 agtaaattgcccatgagaatttctaacacaacacgcaaaatatgtaagttggttacagtcatggaatgcgacatccatattgcactttaaccacgtttcg 30493908  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaa 390  Q
      || ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| |||| | || |||||||    
T  30493909 ttcgatttcttccaaactgtgttgttatcttgcactttattatgcccatgttgcacaatggatggtgagagctggttatgaa 30493990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1581803 - 1581411
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| |||| ||||| |||||  || | |||||| |    
T  1581803 ataatattataaacaatggcatagaatttcgaatcaccatggtccggagacgatagagtttgcattagtgtagatgagttggactccaatagaacccgat 1581704  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccc-tccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagccc 207  Q
    | ||||||||| || || |||||||||  || ||||||||||| | ||| |||||| || |||||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  1581703 ctcatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcatcccccctcaaaaactataatatttgccctctgccatttcgtttgagccc 1581604  T
Q  208 gaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctc 307  Q
    | || || |  || | |||||||||| ||||||||   |||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1581603 ggataaactatccgctggagtctctagcacaacacgcaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacatctc 1581504  T
Q  308 acgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
     | | ||||||||||| |||||||||||  ||||||| || | ||  ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  1581503 gctcagtttctcccaaactgagttgttacgttgcactatactttgttcgtgttgtacaaccgatggtgagggatgtttatgaacctcttgcca 1581411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17877585 - 17877216
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  | | ||||| ||||||||          ||||| |||| |||||||||||| |    
T  17877585 ataatactagaaacaatagcatagaattacgaatcaccatgacccataaacgatagagcttgcac----------gagtcagactcgaagacaacccgat 17877496  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| ||     ||||||||  || | ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||| ||    
T  17877495 tccatctgttcgcatttgtaaagtgaagggccttgagtaaggctacttcctccccctccaatactgtcatatttccccgctgcgatttcgtttgagcacg 17877396  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    |||||| | |||| |||||||| |||| | ||||   | | |||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  17877395 aatgaacttcccatgggagtctataacgccacacgcaacaaatgtaatatggttacaatcatggaacgcgacatccacattgcatttcaaccacgtctcg 17877296  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatg 388  Q
    | |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || || || |||||| || ||||||||    
T  17877295 ctcggtttctcccaaattgagttgttaccttgcactcgattatgcccgtgtttcaaaaccgttgatgaaggctgtttatg 17877216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3275221 - 3275068
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3275221 ataatactaaaaacaatagcataaaattatgaatcatcgtggcctagagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccagt 3275122  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccc 162  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | || ||||||||    
T  3275121 cctatatgttcccaacagcaaagtgaatagcattgagtaaagtaactgcctccc 3275068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24139221 - 24139138
Alignment:
Q  6 tagataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  24139221 tagataatactagaaacaatagcataaaatttcaaatcaacatgacccggagacgacagagcttgcactagagtagctgagtcg 24139138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3601839 - 3601742
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  3601839 ataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggtccagagacgataaagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaaacaacccg 3601742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 261
Target Start/End: Original strand, 34578437 - 34578530
Alignment:
Q  168 aaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34578437 aaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtctgagcccgaataaattgcccacgggaatttcgaacacaacacgcaaaagatgtaatatgtt 34578530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 44480972 - 44480893
Alignment:
Q  24 atagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaac 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44480972 atagcataaaattccgaatcaccatgacccggagacgataacgtttgcagtagagtagcggagtcggactcgaagacaac 44480893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 393
Target Start/End: Original strand, 11745957 - 11746025
Alignment:
Q  325 ctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacct 393  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  11745957 ctgagttgttactttgcactctattctgtctgtgttgcacaaccggtggtgagggttgtttatgcacct 11746025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 304
Target Start/End: Original strand, 30824561 - 30824769
Alignment:
Q  95 gaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccat 194  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||  |  ||||||||  || ||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||   || || | |    
T  30824561 gaagacaacctgatcccatctgttcgcattagaaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccc--ttcaaaactgtcatatttatccgctgtctt 30824658  T
Q  195 ttcgtttg-agcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcac 293  Q
    ||  |||  ||||||||| ||||   | ||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||   |||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  30824659 tttttttttagcccgaataaattattcgcggcagtctctaacacaacatgcaaaagatgtaatatgactacagtcatgaaatgtagcatccacattgcac 30824758  T
Q  294 ttcaaccacgt 304  Q
    ||||| |||||    
T  30824759 ttcaatcacgt 30824769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16098344 - 16098279
Alignment:
Q  335 agcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||  | |||||| ||||||| |||||    
T  16098344 agcttgcactctattatgcccgtgttgcacaaccggtggtgaatgatgtttaggaacctcttgcca 16098279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 51259529 - 51259921
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  51259529 ataatactagaaacaataacataaaattctgaatcaccatggcccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacctggt 51259628  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctcccc-ctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagccc 207  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259629 ccgaactgatcccaacagcaaagtgaatgacatcgagtaaggcaactgcctcccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagccc 51259728  T
Q  208 gaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51259729 gaatgaattgcccacgagagtctctaacacaacatacgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcagttcaaccacgtctc 51259828  T
Q  308 acgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259829 acgcggtttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcgcaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 51259921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 56065820 - 56065425
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaat----caccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56065820 ataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatcaccatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacc 56065721  T
Q  105 cggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgag 204  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56065720 cggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgag 56065621  T
Q  205 cccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  56065620 cccgaatgaattgcccacgggagtctctaaaacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacgacatccacattgcacttcaaccacgt 56065521  T
Q  305 ctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56065520 ctcacacagtttctcccaaactgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgacgagggttgtttatgaacctcctgcca 56065425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 28537787 - 28538176
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28537787 ataatactagaaacaatagcatagaattttgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactaaagtagatgagtcggacttgaacacaacccggt 28537886  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  28537887 cccatctgttcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctc--aaactatcatattttcccgctgccatttcgtttgagcccg 28537984  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28537985 aataaattgcccgtgggagtctctaacacaacacgcaaaatatgtaatatggttacgatcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacgtctcg 28538084  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
      ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||| |||||    
T  28538085 ttcggtttctcccaaactgaattgttaccttgcactctactgtgcccgtgttgtacaatcggtggtgagtggtgtttatgaacctcttgcca 28538176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 55735196 - 55734805
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||    
T  55735196 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcactagagtagatgaatcggactcgaaaataacccggt 55735097  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  55735096 tccatgtgttcgcaacaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgctcgcttccatttcgtttgagcccg 55734997  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatat-gttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctc 307  Q
    ||  |||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55734996 aacaaattgctcatgggagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttgaga-tcatggagcgcgacatccacattgcacttcaaccacatctc 55734898  T
Q  308 acgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
     | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  55734897 gctcggtttctcccaaaccgagttgttaccttgcactctattttgtctgtattgcacaaccgatgatgatggttgtttatgaacatcttgcca 55734805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 49951500 - 49951109
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  49951500 ataatactagaaacaatagcagagaattctgaatcaccacggcccgaagatgataaagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggt 49951401  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| || || |||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  49951400 tccatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 49951301  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||| || || || ||||||||||| ||    |||||||||||||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  49951300 aataaattggccgcgagaatctctaacacagcatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 49951201  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  | || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  49951200 ctcggtttctccaaaactgagttgttaccttgcactctattatgcctgtgttgcacaactggtggtgagcgttgtttatgaacctcttgcca 49951109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 51734972 - 51735363
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||| || |    
T  51734972 ataatactagaaacaatatcatagaattatgaatcaccatggtccagagacgatagagcttgcactagagtagaggagcctgactcgaagacaactcg-t 51735070  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    || |||| ||| || || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  51735071 cctatctattcacatcagcaaagtgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcacgctgtcatttcgtttaagcccg 51735170  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  51735171 aataaattgtcaacggaagtctctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacaatcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcg 51735270  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgat-gatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||| ||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  51735271 ctcggtttcgcccaaactgagatgttacattgcaccctattctgcctatgttgcacaatcgatgggggagggatgtttatgaacctcttgcca 51735363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2065040 - 2064649
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||      
T  2065040 ataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttgggctagagtagatgagtccgactcaaagacaacccgac 2064941  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| || || |||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  2064940 tccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatactgtcatatttgcccgctgtcattttgtttgagcccg 2064841  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||  || |||||||||||||||||||||    | ||||||||||| | || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  2064840 aataaattatccgcgggagtctctaacacaacacgcagaggatgtaatatggttacggtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcg 2064741  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  2064740 ctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattttgtccgtgttgcacaaccgatggtgaaggttgtttacgaacctcttgcca 2064649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 37245852 - 37246247
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  37245852 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccagagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgaagacaacccggt 37245951  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  37245952 cccatctgttcacataagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgtgcccg 37246051  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||     | ||||||| | | | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  37246052 aataaatttccctcgggagtctctaacacaacatgcagaggatgtaagacgattacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 37246151  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgt----tagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||||||||| || ||||||    || ||||||| |||||| |  | |||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  37246152 ctcggtttctcccaaactaagttgttacgtaccttgcaccctattccggtcatgttgcacaaccggtagtgagggatgtttatgaacctcatgcca 37246247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Original strand, 29655666 - 29656050
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||    
T  29655666 ataatactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatggcccgaagatgatagagcttgcactagagtagcgtagtcagactcgaagacaacacggt 29655765  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  29655766 tccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctactgcctctccctccaaaacagtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccg 29655865  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| | | | ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29655866 aataaattgcccacgggagcctctaacacaaca-acaaaagatgtaagagggttacgatcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctca 29655964  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctc 394  Q
    | |||||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||  || || ||| |  ||||||||||||||    
T  29655965 ctcggtttcttccaaactgagatattaccttgcattctattatgcccatgttgcacacccggtggtgatgaatgtttatgaacctc 29656050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 32577048 - 32577437
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||  || ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||    
T  32577048 ataatactataaacaatcgcatagaattctgaatcaccatgtcccgctgacgattgagcttgcactagagtagcagagtcagactcgaagacaacccagt 32577147  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||| ||||  || || |||||| ||| ||| |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32577148 cccatatgtttacatcagcaaagtaaatagcagcgagtaaggctagtacctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccg 32577247  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||| | |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  32577248 aataaattgccc-cgggaatctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttaaggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctc- 32577345  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |  ||| || |||||||||||||| |||||    
T  32577346 ctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactatattctggccgtgttgcacaaacggtagtgacggatgtttatgaacctcttgcca 32577437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 18442147 - 18442535
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  18442147 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgggccaaagacgatatagcttgcactag--tagatgagtcgcactcgaaaataacccggt 18442244  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||| ||||| ||||||| |  || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  18442245 tccatctgttcgcaacagcaaagtgtagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgcttccatttcgtttgagcccg 18442344  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |  | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18442345 aataaattgcccatgggagtctctaacacaacacgcaaaagttgtaatatggttgcggtcatggaacgcgacatccgcattgcacttcaaccacgtctcg 18442444  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||| || |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  18442445 ctcggtttctcccaaacagagttgttaccttgcactctattttgtctgtattgcacaaccggtgatga-ggttgtttatgaacatcttgcca 18442535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 43840306 - 43840688
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  43840306 ataatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcattagagtagctgagtcgaactcgaagacaaaccggt 43840405  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagt-aaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagccc 207  Q
    | ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||    
T  43840406 ctcatttgttcacatcagcaaagtgaatggcatcgagtaaaggttgttgtctccccctccaacactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgacccc 43840505  T
Q  208 gaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctc 307  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| | |   ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43840506 gaataaattgtccacgggagtctctaacacaaaacgcaaaagatgtaagatggttatgctcatagaacgcggcatccacgttgaacttcaaccacgtctc 43840605  T
Q  308 acgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaa 390  Q
      ||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || |||||| | ||||||||    
T  43840606 gtgcggtctctcccaaactaagttgttgtcttgcactctattatgctagtgttgcataatcggtggtgagggctttttatgaa 43840688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21321704 - 21321323
Alignment:
Q  21 acaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgc--ttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgtt 118  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| ||||  |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21321704 acaataacatagaattctgaatcaccatgaccctgagacaatagagcaattgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgtt 21321605  T
Q  119 cccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgc 218  Q
      || ||  ||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  21321604 agcatcagaaaagtgaagggcctcgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaatttc 21321505  T
Q  219 ccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttct 318  Q
    || || |||||||||| ||||||    |||| ||||||||| | || |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||    
T  21321504 ccgcgagagtctctaatacaacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcaacatccacattgcacttcaaccacgtttcgctcgatttct 21321405  T
Q  319 cccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |  |||||| ||||||||||| || |||||    
T  21321404 cccaaactgtgttgttgccttgcactctattatgctcgtgttgtacaaccggtagtgagggatgtttatgaacatcttgcca 21321323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 49119400 - 49119778
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| |||||| ||||  || ||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  49119400 ataatactagaaacaatcgcatataattctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggt 49119499  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||  || || |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49119500 cccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccg 49119599  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||             ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  49119600 aa-------------ggaatctctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcg 49119686  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    |  ||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||  ||| || |||||||||||||| |||||    
T  49119687 cttggtttatcccaaactgggttgttaccttacactctattctggccgtgtggcacaaccaatagtgatggatgtttatgaacctcttgcca 49119778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 323
Target Start/End: Original strand, 41835311 - 41835625
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  41835311 ataatactagaaacaatagcataggattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgtttgcactagagtagatgaatcgaactcgaagacaacccggt 41835410  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||  || |  |||| ||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||    
T  41835411 cccatctgtttgcatccgcaaaatgaagggtctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaactgtcatatttgccagctgtcattttgtttgagcccg 41835510  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||| |  || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||| | ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41835511 aataaattgtctgcgagagtctctaacacaacacgcaaaagttgtaatatggttacgttcaaggaacgtggcatccacattgcacttcaaccacgtctcg 41835610  T
Q  309 cgcggtttctcccaa 323  Q
    | || ||||||||||    
T  41835611 ctcgatttctcccaa 41835625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28426370 - 28425991
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| |||||| ||||  || ||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28426370 ataatactagaaacaatcgcatataattctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggt 28426271  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||  || || |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28426270 cccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccg 28426171  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||             ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  28426170 aa-------------ggaatctctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcg 28426084  T
Q  309 cgcggtttctcccaatct-gagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    |  ||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||  ||| || |||||||||||||| |||||    
T  28426083 cttggtttatcccaaactggggttgttaccttacactctattctggccgtgtggcacaaccaatagtgatggatgtttatgaacctcttgcca 28425991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 47226330 - 47226493
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |    
T  47226330 ataatactagaaacaatagcatataaatctgaatcaccatggcctgaagacgatagagcttgctctaaagtagatgagtcggactcgaacacaactcgat 47226429  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaac 172  Q
    | ||||||||| || || |||||||||  || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  47226430 ctcatctgttcgcatcagcaaagtgaaaagcctcgagtaagactattacctccccctccaaaac 47226493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 26422602 - 26422762
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |    
T  26422602 ataatactaaaaacaatcgcatagaattctgaatcactatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactcgaagacaacccgat 26422701  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaa 169  Q
    ||||||||||  || || |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  26422702 cccatctgtttacatcagcaaagtaaatagcatcgagtaaggctactgcctccctctccaa 26422762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Original strand, 24989934 - 24990027
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaac 103  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  24989934 ataatactagaaaca-taacatagaattttgaatcaccgtggcccagagacggtagagcttgcactagagtagctgagtcagactcaaagacaac 24990027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 44936082 - 44936178
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaaccc 105  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||   ||||||| ||||||| | | ||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  44936082 ataataatagaaacaataacatagaattctaaatcaccgtggcccgaaaacgatagagtttgcactagagtaaatgagtcggactcgaacacaaccc 44936178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 55199698 - 55199307
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55199698 ataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccatgacccgtagacgatagcgcttgcaccagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 55199599  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||    
T  55199598 cccatctgtttccaacaacaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttatcagctgtcatttcgtttgagcccg 55199499  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  55199498 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaatatattgacggtcatgaaacgtggcatccacattgcacgtcaaccacatctca 55199399  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55199398 cgcggtttctcccaaactgagttgttagcttgcactttattctgcatgtgttgcacaatcgatgatgagggctgtttatgaacctcctgcca 55199307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 42340277 - 42340667
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  42340277 ataatattagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccggagacgacagagcttgcactaaagtagctgagtctgactcgaagacaactcggt 42340376  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  42340377 cccatctgttcacatctgcaaagtgaatgacatcgagtagggctattgcctccccctccaacactgtcatatctgcccgctgccattttgtttgagcccg 42340476  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |  | | |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  42340477 aataaattgtccacgagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttgccgacatagaac-caacatccacattgcacttcaaccacgtctcg 42340575  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  42340576 cacggtttctctcaaactgagttgttgccttagactctattctgcacgtgttgcacaaccggtggtgagggctgtttatgaatctcttgcca 42340667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 53497218 - 53496905
Alignment:
Q  10 taatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  53497218 taatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtc 53497119  T
Q  110 ccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccga 209  Q
    |||||||||  || || |||||||||  || || |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||  || || ||||| ||||||||||||    
T  53497118 ccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggctactgcctccccctcaaaaactgtcacatttgtccgctgtcattttgtttgagcccga 53497019  T
Q  210 atgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcac 309  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||      
T  53497018 ataaattgcccacaagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacggtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcgg 53496919  T
Q  310 gcggtttctcccaa 323  Q
     |||||||||||||    
T  53496918 tcggtttctcccaa 53496905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 46007486 - 46007104
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||      
T  46007486 ataatgctagaaacaatagcataaaattccgaatcgccatggcccggagacgatatagtttgcactagagtagttgaatcggactcgaagac-acccg-- 46007390  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||  |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46007389 cccatctgttcatatcgacaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgtctccccctaaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 46007290  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctct-aacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctc 307  Q
    ||| ||||  ||||| |||||||| |||| |||||   |||||| ||| ||| | ||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46007289 aataaattttccacgagagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaataatggaacacggcatccacattgcacttcaaccacgtctc 46007190  T
Q  308 acgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacct 393  Q
     |   |||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||| | || ||| ||||||| || || |||||| ||||||| |||||    
T  46007189 gctttgtttttcccaaactgagttgttatcctgcactttattttacctgtgctgcacaaccggtggtgagggctgtttataaacct 46007104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2615670 - 2615361
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |  ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||         
T  2615670 ataatactaaaaacaatatcatagaattctgaatcaccatggcacaaagacgatagagctcgcactagagtagttgagtcggattgaaagacaaca---- 2615575  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
          | |||||| || |||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  2615574 ------ttttcccatcagcaaagtgaacgacatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgcccgctgccaattcgtttgagcccg 2615481  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||| ||  ||| |||||||||| | |   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||      
T  2615480 aatgaattgcccacaaaagcctctaacacaacgcacaaaaaatgtaatatggttatgatcatgaaacgcggtatccacattgcatttcaaccacgtcttg 2615381  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctga 328  Q
    | || |||||||||| ||||    
T  2615380 cacgatttctcccaaactga 2615361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 27608903 - 27608999
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaaccc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27608903 ataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccc 27608999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 34497372 - 34497468
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaaccc 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34497372 ataatactaggaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccc 34497468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 283
Target Start/End: Original strand, 647307 - 647485
Alignment:
Q  105 cggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgag 204  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  647307 cggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctgctgcctccccctccataactgtcatattagcccgctgccatttcgtttgag 647406  T
Q  205 cccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatc 283  Q
    |||| |  ||||||| |  | |||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||    
T  647407 cccggaaaaattgcctagagaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacgctcatggaacgcggcatc 647485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 11020180 - 11020354
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||| | |||| |||| ||||||||||| ||    
T  11020180 ataatactagaaacaatagcacagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagaccttacactggagtagttaagtcagactcgaagacaacccagt 11020279  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttg 183  Q
     |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||   || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11020280 tccatttgttcccatcagcaaagtaaatagcatcgagtaaagctgatgtctccccctccaaaagtgtcatatttg 11020354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Original strand, 647166 - 647305
Alignment:
Q  12 atactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtccc 111  Q
    |||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| |    
T  647166 atactataaacaacaacatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcagactcgaagataactcggtcac 647265  T
Q  112 atctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggc 151  Q
    |||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||    
T  647266 atctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggc 647305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48227550 - 48227305
Alignment:
Q  60 gatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgca-tcgagtaaggcaattgcc 158  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||   |||  ||| || || ||||||||   |   ||||||||||| | |||     
T  48227550 gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaactcggttttatccattcacatcagcaaagtgatggggtctcgagtaaggctactgca 48227451  T
Q  159 tccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatat 258  Q
    |||| |||||| || ||||| ||| | |  |||  |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  48227450 tcccactccaatacagtcatgttttcccactgctgtttcgtttaagcccgaataaattgcccgcgagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaacat 48227351  T
Q  259 gttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgt 304  Q
    | | || || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48227350 ggttacggtaatgaaatgcggcatccacattgtacttcaaccacgt 48227305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Original strand, 19117720 - 19117784
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcac 73  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19117720 ataatactaaaaacaatagcataaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcac 19117784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24176957 - 24176847
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  |    
T  24176957 ataatactagatacaatagcttagaattccgaatcaccatgacccagagacgatagagcttgcactagagtagttgtgtcagactcgaagacaacccaat 24176858  T
Q  109 cccatctgttc 119  Q
    | |||||||||    
T  24176857 ctcatctgttc 24176847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 242
Target Start/End: Original strand, 27941129 - 27941227
Alignment:
Q  144 agtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacac 242  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||||||| |||||| ||||| || || || ||||||| |||||||    
T  27941129 agtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgtccgctgccattttgtttgagtccgaataaattgtcctcgagaatctctaatacaacac 27941227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2121268 - 2121124
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||  ||||  |||| ||||||| |||||||| | |||||||||  || ||||| || |    
T  2121268 ataatactagaaacaatagcacaaaattatgaataatcatggcctagagacaatagagcttgcattagagtagttaagtcggactcaaaaacaacacgat 2121169  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaa 153  Q
    ||||||| |||  | || ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  2121168 cccatctattcatatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaagcaa 2121124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 27747685 - 27747764
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtc 88  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| || ||| |||||    
T  27747685 ataatactaaaaacaatagcatagaattttgaatcaccatggcccggagacgataaagcctgcactaaagaagcggagtc 27747764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1070929 - 1070843
Alignment:
Q  280 catccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaa 366  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  1070929 catccacattgcagttcaaccatgtctcgcgcggtttctcctaaactgaggttttaccttgctctctattatgtccgtgttgtacaa 1070843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 400
Target Start/End: Original strand, 36310798 - 36310887
Alignment:
Q  311 cggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    ||||||||  ||| |||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36310798 cggtttctttcaaactgaattgtcaccttgcactctattatggccgtgttgcacaatcagttgtgagggttgtttatgaacctcttgcca 36310887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Original strand, 31341725 - 31341829
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggag----atgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacc 104  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    | ||||| ||||||||||||||||  ||||| || | ||||| ||||    
T  31341725 ataatattagaaacaatagtataaaattctgaatcaccatgacccggagacgtaggatagagcttgcactagagtagtggagtcagattcgaagataacc 31341824  T
Q  105 cggtc 109  Q
    |||||    
T  31341825 cggtc 31341829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 377 - 1
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaat----caccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  377 ataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatcaccatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacc 278  T
Q  105 cggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgag 204  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  277 cggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctcccaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgag 178  T
Q  205 cccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||   |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  177 cccgaatgaattgcccacgggagtctctaaaacaacacgcgaaagatngtatatgttgacggtcatgaaacacgacatccacattgcacttcaaccacgt 78  T
Q  305 ctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggtt 381  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  77 ctcacacagtttctcccaaactgagttgttagcttgcagtctgttctgcccgtgttgcacaatcgatgacgagggtt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 15605994 - 15606392
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605994 ataatactagaaacaatagcatagtgttctgaatcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 15606093  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||    
T  15606094 cccatttgttcccatcaacaaagtgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatgttttcccgctgccattttgtttgagcccg 15606193  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15606194 aataagttgcccatgggagtctctaacacaacacgaaaaagatgtaatatggttacgatcgtgaaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 15606293  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttag-------cttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||  | ||||||||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15606294 tgcggtttctcccaaactgagttgttagttgttaccttgcactctatgtttcccgtgttgcatagccggtggtgagtgttgtttatgaacctcctgcca 15606392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28107326 - 28106935
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||  | |    
T  28107326 ataatactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaagacaacgtgat 28107227  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||| |||  |    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  28107226 cccatctattcatatttgcaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatctgtccgctgccatttcgtttgagcctg 28107127  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||     
T  28107126 aataaattgtccacgggagtctctaacacaacacacgaaagatgtaagatggttacgatcatggaacgtggcttcctcgttgcacttcaaccacgtctcg 28107027  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
       |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||| |||  | |||||||||||||| |||||    
T  28107026 tttggtttctcccaaactgagatgttaccttgcactctattttgcatgtgttgcacaaccaatggtgaaagatgtttatgaacctcttgcca 28106935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14680349 - 14679961
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |  |||||||| ||||    
T  14680349 ataatactagaaacaatagcagagaattttgaatcaccactgcccggagatgatagagcttgcaatagagtagacgagtcggaatcaaagacaactcggt 14680250  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||||||  || || || ||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||      
T  14680249 tccatctgtttgcatcagcagagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgctgccatttcatttgagccat 14680150  T
Q  209 aatgaattgc---ccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtc 305  Q
    ||| ||||||   || ||||||||||||||||||||    ||||||||||| || |  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14680149 aataaattgcccgccgcgggagtctctaacacaacatgcaaaagatgtaatgtggttgcggtcatggaacgcggtatccacattgcacttcaaccatgtc 14680050  T
Q  306 tcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctc 394  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    || |||| ||||||||||||||||    
T  14680049 tcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatgctcgtgttgcacaactagtggtgagagttgtttatgaacctc 14679961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 280
Target Start/End: Original strand, 15053175 - 15053446
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||| || || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  15053175 ataatattataagcaacagcatagaattccgaatcaccatggcccgaagacgatagcgtttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccttgt 15053274  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    | ||| | ||| |  || ||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||| | |||||||||||    
T  15053275 ctcattttttcacgtcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcatcttgtttgagcccg 15053374  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggc 280  Q
    ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||   |||||||||| ||| | || | |||||||||||||    
T  15053375 aataaattgtccactgaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttaccgacatgaaacgcggc 15053446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 19690879 - 19691073
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||| | | |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19690879 ataatactagaaacaatgacatagaattccaaatcaccatgactcagagacgatagagcttgcactaaagtagctgagtcagactcgaagacaactcggt 19690978  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttga 203  Q
    | ||||||||| || || ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19690979 cacatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaggctattgcctccccttccaaaacggtcatatttgtccgttgtcatttcgtttga 19691073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 30801991 - 30802201
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||    
T  30801991 ataatactagaaacaataacatagaattccaagtcaccatggctcggaaacgatagagcttgcactaaagtagctgaatcggactcgaagacaacctagt 30802090  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||| | ||| || |  |||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  30802091 cccattttttcacatctgcaaagtaaatggcatctagtaaggctactgcctcccccaccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttaagcccg 30802190  T
Q  209 aatgaattgcc 219  Q
    ||| |||||||    
T  30802191 aataaattgcc 30802201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 29368057 - 29368287
Alignment:
Q  10 taatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    ||||    
T  29368057 taatactagaagcaatagcatagaattacgaatcactatgacccggagacgatagagcttgcactatagtagatgagtcggactcgaaaacagttaggtc 29368156  T
Q  110 ccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccga 209  Q
    |||||| ||  || || |||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||  |||    
T  29368157 ccatctattagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggatattgcctccccctccaaaactgtcatatttatccgctgccatttcttttgag--cga 29368254  T
Q  210 atgaattgcccacgggagtctctaacacaacac 242  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  29368255 ataaattgtccacgagagtctcaaacacaacac 29368287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 11731673 - 11732031
Alignment:
Q  13 tactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtccca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |    |||||||||| |||||||||| | ||| |    
T  11731673 tactagaaacagtagcatagaactccgaaccaccatggcccggagacaatagagcttgcactatattgaaagagtcggactcgaagacaacctgttccta 11731772  T
Q  113 tctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatg 212  Q
    | ||||| || || |||||||||  |  |||||  ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||     
T  11731773 tatgttctcatcagcaaagtgaagagtctcgag--aggctgctgcctcccc-tccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccggata 11731869  T
Q  213 aattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcg 312  Q
    |||| ||||                 |||| | |||||||||||||  | ||||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||||||| | |     
T  11731870 aattcccca-----------------acacttaaaagatgtaatattgttacagtcatggaatgcgtcatctacattgcacttccaccacgtctcgctca 11731952  T
Q  313 gtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctc 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |   |||||||    || |||||||||||||||||||||    
T  11731953 gtttctcccaagctgagttgttaccttgcactatattcttcctgcaatgcacaa---ctggtgagggttgtttatgaacctc 11732031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 34104465 - 34104542
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgag 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34104465 ataatactaaaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggtccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgag 34104542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27443117 - 27443039
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtc 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27443117 ataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc-tgcactagagtagctgagtc 27443039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 394
Target Start/End: Original strand, 19364217 - 19364330
Alignment:
Q  280 catccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgaggg 379  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||  || || ||||||    
T  19364217 catccacaatgcactttaaccac-tctcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcactcgattttgctcgtgttgcacatgcgttggtgaggg 19364315  T
Q  380 ttgtttatgaacctc 394  Q
    |||||||||||||||    
T  19364316 ttgtttatgaacctc 19364330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 390
Target Start/End: Original strand, 30802237 - 30802351
Alignment:
Q  276 gcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatg 375  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || |||| |   |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  30802237 gcggcatccacaatgcactttaactacctctcgcttagtttttcccaaactgagttggtaccttgcactctattctgcctgtgttccacaaccgttggtg 30802336  T
Q  376 agggttgtttatgaa 390  Q
    |||| ||||||||||    
T  30802337 agggctgtttatgaa 30802351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 88746 - 88355
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  |  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  88746 ataatactggaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgatcttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggt 88647  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  88646 cccatctgttagcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccattgccatttcatttgagcccg 88547  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||    |||| ||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  88546 aataaattgcccgcgagagtctctaacacaacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctcg 88447  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |  |||||| ||||||||||| || |||||    
T  88446 ctcggtttctcccaaactgtgttgttgccttgcactctattatgctcgtgttgtacaaccggtagtgagggatgtttatgaacatcttgcca 88355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 400
Target Start/End: Original strand, 34695907 - 34696293
Alignment:
Q  12 atactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtccc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34695907 atactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttccc 34696006  T
Q  112 atctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaat 211  Q
    |||| ||  || || |||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||    
T  34696007 atctattgacatcagcaaagtgaatggccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcca--tcgattgagcccgaat 34696104  T
Q  212 gaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| | |  |||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  34696105 aaattgcccacgggagtctctaacgcaacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgc 34696204  T
Q  312 ggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||  |||| |||||   | ||| ||| |||||| |||||||||| |||||    
T  34696205 agtttctcccaaactgagttgttaccttgcattctattatgttcgtgatgcaccggcaatggtgatggttgtgtatgaacctcttgcca 34696293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 400
Target Start/End: Original strand, 34718319 - 34718705
Alignment:
Q  12 atactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtccc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34718319 atactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttccc 34718418  T
Q  112 atctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaat 211  Q
    |||| ||  || || |||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||    
T  34718419 atctattgacatcagcaaagtgaatggccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcca--tcgattgagcccgaat 34718516  T
Q  212 gaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgc 311  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| | |  |||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  34718517 aaattgcccacgggagtctctaacgcaacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgc 34718616  T
Q  312 ggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||  |||| |||||   | ||| ||| |||||| |||||||||| |||||    
T  34718617 agtttctcccaaactgagttgttaccttgcattctattatgttcgtgatgcaccggcaatggtgatggttgtgtatgaacctcttgcca 34718705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 12130638 - 12131029
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |    
T  12130638 ataatactagaaataatagcatagaattctgaatcaccatgtcccgaagatgatagagcttggactagagtagatgagtcagactcgaagataacccgat 12130737  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||| ||  || || |||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12130738 tccatctatttgcatcagcaaagtgaagagcctcaagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttgctcgctgtcatttcgtttgagcccg 12130837  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  |||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12130838 aataatttgcccgcgggagtctctaacacaacacccaaaagatagaatatggttacggtcatggaacggggcatccacattgcacttcaaccacgtctcg 12130937  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | || ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12130938 ctcgatttctcccaaattgagttgttaccttgcactctgtttgtcccgtgttgcacaaccggtggtgatggttgtttatgaacctcttgcca 12131029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 362
Target Start/End: Original strand, 44017318 - 44017671
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||| ||||||   |||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||  |||    
T  44017318 ataatacaagaaacaatggcatataattcttaatgaccatgtttcggagacgatagagcttgcactaaagtaacggagtcagactcgaagacaacttggt 44017417  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    | ||| ||||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||    
T  44017418 ctcatatgttcacattagcaacgtgaatggcatcgagtaaggttgttgtctccccctccaaaactgtcatatttgcacggtgtcattttatttgagcccg 44017517  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |   |||   ||||||| || | |||||||||||||||| |||||     
T  44017518 aataaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaagatggtcatgatcacagaacgcggaattcgcattgcacttcaaccatgtctcg 44017617  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgc 362  Q
    | ||| |||| | || || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  44017618 ctcggcttcttcaaaacttagctgttaccttgcactttattctgctcgcgttgc 44017671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26198874 - 26198518
Alignment:
Q  4 ggtagataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaac 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  26198874 ggtaaataatactagaaacaatagcatagaatttcaattcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagac--c 26198777  T
Q  104 ccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttga 203  Q
    ||||        |||| ||  | |||||| ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  26198776 ccgg--------gttcacattagcaaagtaaatggcatcaag-aaggctactgcatccccctccaaaactgtcatatttgttcgctaccattttatttga 26198686  T
Q  204 gcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatga------aacgcggcatccacattgcacttca 297  Q
    || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| | |  || ||||      |||||| |||||||| | |||||||    
T  26198685 gctcgaataaattgcccacatgagtctctaacacagcacacaaaagatgcaatatgattatggtaatgaaaatggaacgcgacatccacaatacacttca 26198586  T
Q  298 accacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcaca 365  Q
    ||||||||||  ||  |||||||| | || || |||||  ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  26198585 accacgtctcgtgcaatttctcccgaactaagctgttactttgcattctattctgttcgtgttgcaca 26198518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 400
Target Start/End: Original strand, 18345555 - 18345865
Alignment:
Q  77 agtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtc 176  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  || |||||||||||  || || |||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  18345555 agtagatgagtcggattcgaagacaattcgatcccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctc-aaaactgtc 18345653  T
Q  177 atatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacg 276  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||| | ||  ||||| ||||    
T  18345654 atatttgtccgttaccatttcgtttgagttcaaataaattacccacggaagtctctaacacaacacgcaaaagaagtaatatggttacgctcatggaacg 18345753  T
Q  277 cggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatga 376  Q
      || |||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||            | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  18345754 ttgcgtccacattgcacttcaaccatgtctcgttcggtttcttcca------------aacttgcactctattctgcccgtgttgcacaaccggtggtga 18345841  T
Q  377 gggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
      | |||||||||||||| |||||    
T  18345842 atgatgtttatgaacctcttgcca 18345865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9710013 - 9709914
Alignment:
Q  112 atctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaat 211  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9710013 atctgttcccaaccgcaaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaat 9709914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22845725 - 22845600
Alignment:
Q  7 agataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccg 106  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  22845725 agataatactagaaacaatagcctagaattctgaatcaccatgatctggagacgatagagcttgcactagagtagattagttggactcgaagacaacccg 22845626  T
Q  107 gtcccatctgttcccaacaacaaagt 132  Q
    ||||||||||||| || || ||||||    
T  22845625 gtcccatctgttcgcatcagcaaagt 22845600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 118
Target Start/End: Original strand, 1417981 - 1418090
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | || ||||  |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||    
T  1417981 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatagtccagagacaatagagcttgaactagagtagatgagtcagactcgaagacaacccagt 1418080  T
Q  109 cccatctgtt 118  Q
    ||||||||||    
T  1418081 cccatctgtt 1418090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Original strand, 13109869 - 13109976
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||    
T  13109869 ataatactggaaacaatagcttataattccaaatcaccatggcccgaagacgatagagcttccactagagtagaagagtcggactcgaagacaaccatgt 13109968  T
Q  109 cccatctg 116  Q
    ||||||||    
T  13109969 cccatctg 13109976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 9710142 - 9710036
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||    
T  9710142 ataatactagaaacaattgcatagaattatgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcaaagtcagactcgaagacaacccggt 9710043  T
Q  109 cccatct 115  Q
    |||||||    
T  9710042 cccatct 9710036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 11292063 - 11292157
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacc 104  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | | | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  11292063 ataatactataaacaataacataaaattttgaatcatcatggcc-gaaaacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaacc 11292157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14827267 - 14827126
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  | | ||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||||||| || |    
T  14827267 ataatattataaataatagcatagaatttcgaatcaccatgacccaaacacgatagagcttgcactagagtagctaagtcagattcaaagacaactcgat 14827168  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaagg 150  Q
    | ||||| |||  | ||  |||||||||  ||||||||||||    
T  14827167 ctcatctattcatatcagtaaagtgaatgacatcgagtaagg 14827126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23854118 - 23853805
Alignment:
Q  10 taatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | |||    
T  23854118 taatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagttgatgagtcggactcgaagacaactcagtc 23854019  T
Q  110 ccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccga 209  Q
     ||||||||  || ||||||||||||| || || |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||   || || |||||||||||| |||||    
T  23854018 tcatctgttagcatcaacaaagtgaatggcctcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatttttccgctgtcatttcgtttgaacccga 23853919  T
Q  210 atgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcac 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||  | || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  23853918 ataaattgcccacgggagtctctaacataacacgcaaaagatgtaatatagttacggtcatggaacgcggcgtccacatcgcacttcaaccacgtctcgt 23853819  T
Q  310 gcggtttctcccaa 323  Q
     |||||||||||||    
T  23853818 tcggtttctcccaa 23853805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 478056 - 478447
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| || | ||||| ||||||||    
T  478056 ataatattagaaacaatatcataaaataccgaatcaccataacccggagacgatagagcttgcactagagtagtagagtcagattcgaagataacccggt 478155  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  478156 cccatctattcacattagcaaagtgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccattttgtttgagcccg 478255  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
     || ||||| ||| || | ||||||||||||||||  |||||||| | ||| |    |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  478256 gataaattgaccatggaaatctctaacacaacacacaaaagatgttagatggttgtggtcatggaacgttgcatccacattacacttcaaccacatctcg 478355  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    |  ||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||| |||||    
T  478356 cttggtttctcccaaattgagatgttaccttggactctattttgcctgtgttgcacaaccactggtgatggatgtttatgaacctcttgcca 478447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 8451123 - 8451514
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8451123 ataatactagacacaataacataaaattccgaatcaccatgacctggagacgataaagcttgcactaaagtagatgagtcagactcgaagacaacccggt 8451222  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    |||||| |||| || || | |||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| |||||||||||    
T  8451223 cccatccgttcacatcagcgaagtgaatggaatcgagtaaagctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcccgcttcctttttgtttgagcccg 8451322  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    |||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8451323 aataaattgtccacaagagtctctaacacaacatccaaaagatgtaaaatggttacggtcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccacgtctcg 8451422  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | |||||||||||||  |||  | | | ||||||||||||| |||  ||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||| |||||    
T  8451423 cacggtttctcccaaattgaactatgaccttgcactctattttgctggtgttgcacaacctgtggtgatggctgtttatgaacctcttgcca 8451514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7127410 - 7127019
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||    ||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||||    
T  7127410 ataatacttgaaacaataacatagaatactaaatcaccatggcccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcatagtcagactcgaaggcaacccggt 7127311  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| || ||    
T  7127310 cccatctgttcacatcagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactacctccccctccaaaactttcatatttgcccgtttccatttcatttgtgcacg 7127211  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctca 308  Q
    ||| |||| ||| || |||||||||||||||||     | ||||||| | | | ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  7127210 aataaatttcccccgagagtctctaacacaacatgcagaggatgtaagacggttacgttcatggaacgcggcatccacattccacttcaaccatgtctcg 7127111  T
Q  309 cgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaatcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
    | ||| ||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  7127110 ctcggcttctcccaaactaagttgttaccttgccccctattctggctgtgttgcacaaccggtagtgagggatgtttatgaacctcatgcca 7127019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13415210 - 13414913
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||  || |||||||  |||||||| || |    
T  13415210 ataatactaaaaacaatagcataaaattcagaatcaccatggcccggggacgatataccttgcactagagtagaagaatcggactcaaagacaactcgat 13415111  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    ||||||||||  || |  ||||  |||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  13415110 cccatctgtttgcatccgcaaaaggaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccg 13415011  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacacatgaaagatgtaatatgttgacagtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtct 306  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||  |||| ||||||||| | ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13415010 aataaattgcccgcgaaagtctctaaaaaaacacacaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacacgacatccacattgcacttcaaccacgtct 13414913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 185591 - 185820
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  185591 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatggtccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgtagacaacccggt 185690  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
     |||||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  185691 tccatctattcacatcaacaaagtgaatagtatcgagtaaggctacttcct-cccctccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgagccca 185789  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaac 240  Q
     || |||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  185790 gataaatttccctc-ggagtctcttacacaac 185820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 267 - 400
Target Start/End: Original strand, 40588973 - 40589106
Alignment:
Q  267 tcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagttgttagcttgcactctattctgcccgtgttgcacaa 366  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40588973 tcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcactcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctgttatgcccgtgttgcacaa 40589072  T
Q  367 tcgatgatgagggttgtttatgaacctcctgcca 400  Q
     || || |||||| |||||||||||||| |||||    
T  40589073 ccggtggtgagggctgtttatgaacctcttgcca 40589106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 40588730 - 40588940
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| || ||||| | || ||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||    
T  40588730 ataatactataaacaatagcatagaattcagaatcatcatggcccggggacgatagagtttacactagagtagatgaatcagactcaaagacaacccggt 40588829  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    | ||||||||  || |  ||||  |||  || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40588830 ctcatctgtttgcatccgcaaaacgaagggcctcgagtacggctactgcctccccctccaaaactgttatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccg 40588929  T
Q  209 aatgaattgcc 219  Q
    ||| |||||||    
T  40588930 aataaattgcc 40588940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Original strand, 598237 - 598337
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  598237 ataatactagaaacaatagcatagaacttcgaatcaccatgacctgaagacgatagagcttgcactagagtagctaagtccgacttgaagacaacccggt 598336  T
Q  109 c 109  Q
    |    
T  598337 c 598337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 33642764 - 33642859
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33642764 ataatactagaaacaatatcattgaattctgaatcaccatggcccggagacgacagagcttgcattagagtagatgagttggacttgaagacaacc 33642859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37712260 - 37712033
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| || | |||  |||| |||| |||||||||||| | |||  ||| ||||| |||| | |    
T  37712260 ataatactagaaacaatagcatagtattctgaatcaccatgtcc-gaagacaatagagcttacactagagtagcagggtcaaactagaagataacctgat 37712162  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccg 208  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||| ||||    ||| || | | ||| ||||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||| |     
T  37712161 ctcatctgttcacatcaacaaagtgaatggcat----taaagctactacct-ccccttcaaaactgtcatattttcccgctgtcatttcgttttagctca 37712067  T
Q  209 aatgaattgcccacgggagtctctaacacaacac 242  Q
    ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  37712066 aataaattgcccacacgagtttctaacacaacac 37712033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 144
Target Start/End: Original strand, 3606739 - 3606874
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||| |||| ||||| | ||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||  |||    
T  3606739 ataatactagaaacaatagcatagaattccaagtcaccatgaccctgagacgatagagtttgtactaaagttgttgagtcggacttgaaaacaacttggt 3606838  T
Q  109 cccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcga 144  Q
     |||||||||| || ||| ||| ||||| |||||||    
T  3606839 tccatctgttcacatcaagaaattgaatggcatcga 3606874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11870451 - 11870332
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | ||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||| || |  || || ||    
T  11870451 ataatactagaaacaatagcatagaaatccgaatcaccatggctccgagacaatagagcttgcacaagagtagctgagtcagactcgatggaaatccagt 11870352  T
Q  109 cccatctgttcccaacaaca 128  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  11870351 ctcatctgttcccatcaaca 11870332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9496881 - 9496797
Alignment:
Q  96 aagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcgagtaaggcaattgcctccccctccaaaactgtcatatt 181  Q
    |||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||  |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9496881 aagacaacacggtcccata-gttcacatcaacaaagtgaatgtcatcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatt 9496797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Original strand, 264 - 348
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggact 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  264 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaattaccatgacctggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggact 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 44244 - 44322
Alignment:
Q  9 ataatactagaaacaatagcataaaatttcgaatcaccatggcccggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtc 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44244 ataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc-tgcactagagtagctgagtc 44322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University