View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18471_high_30 (Length: 202)

Name: NF18471_high_30
Description: NF18471
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18471_high_30
NF18471_high_30
[»] chr8 (114 HSPs)
chr8 (1-202)||(38482793-38482994)
chr8 (1-202)||(14263582-14263783)
chr8 (1-202)||(33935061-33935262)
chr8 (1-202)||(35052091-35052292)
chr8 (1-202)||(23429947-23430148)
chr8 (1-202)||(34046889-34047090)
chr8 (1-202)||(23848557-23848758)
chr8 (1-202)||(26062746-26062946)
chr8 (1-202)||(34981867-34982068)
chr8 (1-202)||(14228323-14228523)
chr8 (1-202)||(40228333-40228534)
chr8 (1-202)||(45281379-45281579)
chr8 (1-202)||(9954687-9954888)
chr8 (1-202)||(4057326-4057527)
chr8 (1-202)||(16656739-16656939)
chr8 (1-198)||(39303521-39303718)
chr8 (16-202)||(38128548-38128734)
chr8 (1-202)||(32010085-32010286)
chr8 (1-202)||(43641990-43642191)
chr8 (8-202)||(25812750-25812943)
chr8 (8-202)||(25703579-25703772)
chr8 (5-202)||(21651747-21651944)
chr8 (1-185)||(40603869-40604053)
chr8 (1-202)||(1202445-1202646)
chr8 (2-202)||(1245351-1245551)
chr8 (4-202)||(12342615-12342813)
chr8 (1-202)||(18291502-18291702)
chr8 (1-202)||(15596382-15596583)
chr8 (2-202)||(10180409-10180609)
chr8 (1-202)||(11993931-11994120)
chr8 (1-157)||(3513395-3513551)
chr8 (1-202)||(8453237-8453436)
chr8 (4-202)||(36058274-36058471)
chr8 (1-202)||(43553077-43553278)
chr8 (1-124)||(167556-167679)
chr8 (8-160)||(9808017-9808169)
chr8 (4-202)||(26740138-26740336)
chr8 (1-190)||(12248783-12248972)
chr8 (1-122)||(13327817-13327938)
chr8 (2-202)||(17074583-17074783)
chr8 (2-202)||(17573487-17573687)
chr8 (1-202)||(33314582-33314783)
chr8 (2-200)||(8554019-8554217)
chr8 (3-183)||(12763474-12763654)
chr8 (14-202)||(18842581-18842768)
chr8 (2-202)||(2888469-2888669)
chr8 (1-150)||(15647452-15647601)
chr8 (1-137)||(2335471-2335607)
chr8 (1-202)||(2456116-2456312)
chr8 (1-129)||(11707559-11707687)
chr8 (1-177)||(17718541-17718717)
chr8 (3-150)||(15623664-15623811)
chr8 (3-190)||(23855598-23855784)
chr8 (1-202)||(13173967-13174168)
chr8 (1-197)||(6757444-6757640)
chr8 (2-190)||(27911685-27911873)
chr8 (2-190)||(27958104-27958292)
chr8 (1-202)||(27518714-27518909)
chr8 (1-202)||(14061150-14061351)
chr8 (1-129)||(6750653-6750781)
chr8 (1-124)||(31028692-31028815)
chr8 (1-107)||(16700989-16701095)
chr8 (1-196)||(19972317-19972512)
chr8 (1-196)||(21020321-21020516)
chr8 (2-202)||(23793272-23793476)
chr8 (1-124)||(35051884-35052007)
chr8 (1-124)||(35296082-35296205)
chr8 (1-202)||(3720718-3720919)
chr8 (1-190)||(8730842-8731029)
chr8 (1-124)||(7483782-7483903)
chr8 (1-190)||(7605912-7606099)
chr8 (16-202)||(14511431-14511617)
chr8 (2-195)||(9687522-9687711)
chr8 (15-202)||(39615454-39615639)
chr8 (1-202)||(11163304-11163505)
chr8 (81-202)||(41308013-41308135)
chr8 (40-189)||(36111955-36112104)
chr8 (12-111)||(17313126-17313225)
chr8 (1-119)||(43553534-43553653)
chr8 (1-151)||(38074314-38074464)
chr8 (1-151)||(41890560-41890710)
chr8 (1-150)||(13132169-13132318)
chr8 (2-129)||(38221851-38221978)
chr8 (1-124)||(43553322-43553445)
chr8 (1-183)||(35498090-35498272)
chr8 (1-108)||(40521337-40521446)
chr8 (12-202)||(42352788-42352976)
chr8 (5-129)||(41701556-41701680)
chr8 (1-151)||(8954751-8954901)
chr8 (1-82)||(41305682-41305763)
chr8 (114-202)||(13328121-13328209)
chr8 (1-151)||(9301595-9301745)
chr8 (1-58)||(8672340-8672397)
chr8 (1-102)||(10086256-10086357)
chr8 (8-197)||(29125947-29126135)
chr8 (51-150)||(35029635-35029733)
chr8 (1-202)||(45317690-45317891)
chr8 (2-202)||(6660992-6661192)
chr8 (2-202)||(6741394-6741594)
chr8 (8-202)||(11727628-11727821)
chr8 (53-190)||(15281469-15281606)
chr8 (53-190)||(15461838-15461975)
chr8 (45-190)||(41643503-41643648)
chr8 (1-85)||(13935194-13935278)
chr8 (2-78)||(30205499-30205575)
chr8 (103-202)||(17313282-17313381)
chr8 (8-151)||(27193105-27193248)
chr8 (1-90)||(37998224-37998312)
chr8 (2-50)||(35028645-35028693)
chr8 (2-150)||(40602810-40602958)
chr8 (52-202)||(8672583-8672733)
chr8 (140-202)||(29091086-29091148)
chr8 (132-202)||(31964738-31964808)
chr8 (8-122)||(11015945-11016060)
[»] chr5 (110 HSPs)
chr5 (1-202)||(1087931-1088132)
chr5 (1-202)||(34261332-34261533)
chr5 (1-202)||(8825077-8825278)
chr5 (1-202)||(9076091-9076292)
chr5 (1-202)||(18020766-18020967)
chr5 (1-202)||(26854093-26854293)
chr5 (1-202)||(38017275-38017476)
chr5 (1-202)||(38910294-38910494)
chr5 (1-202)||(39073064-39073265)
chr5 (4-202)||(7403875-7404073)
chr5 (1-202)||(4175478-4175679)
chr5 (1-202)||(10359233-10359434)
chr5 (6-202)||(25343985-25344181)
chr5 (1-202)||(7579665-7579867)
chr5 (1-202)||(38363211-38363410)
chr5 (1-202)||(12664878-12665079)
chr5 (1-202)||(42911570-42911771)
chr5 (5-202)||(2673976-2674173)
chr5 (1-202)||(18794803-18795004)
chr5 (1-202)||(4985173-4985374)
chr5 (1-202)||(6754177-6754378)
chr5 (1-202)||(12869897-12870098)
chr5 (1-202)||(28024257-28024458)
chr5 (1-202)||(38702161-38702362)
chr5 (1-202)||(4098351-4098552)
chr5 (1-202)||(6072472-6072673)
chr5 (1-202)||(1297735-1297937)
chr5 (9-202)||(16124258-16124451)
chr5 (1-202)||(36239478-36239679)
chr5 (1-202)||(40198808-40199009)
chr5 (6-202)||(14793788-14793984)
chr5 (1-202)||(24074836-24075037)
chr5 (17-195)||(22582508-22582686)
chr5 (6-190)||(2133917-2134100)
chr5 (1-202)||(8229802-8230002)
chr5 (1-202)||(4017434-4017635)
chr5 (1-190)||(4694784-4694973)
chr5 (1-190)||(6689619-6689808)
chr5 (1-202)||(4427403-4427605)
chr5 (4-202)||(28446983-28447180)
chr5 (1-151)||(37303156-37303306)
chr5 (1-202)||(32389006-32389207)
chr5 (5-202)||(18465725-18465918)
chr5 (1-129)||(4688869-4688997)
chr5 (2-202)||(9127349-9127549)
chr5 (1-192)||(4962194-4962385)
chr5 (1-202)||(12784441-12784641)
chr5 (1-190)||(28463395-28463584)
chr5 (2-202)||(7408352-7408552)
chr5 (2-202)||(18437321-18437521)
chr5 (1-202)||(39893807-39894008)
chr5 (2-202)||(12722957-12723157)
chr5 (1-202)||(38502802-38502999)
chr5 (4-182)||(19831560-19831736)
chr5 (1-196)||(38297620-38297815)
chr5 (1-151)||(31802808-31802958)
chr5 (5-166)||(5119202-5119363)
chr5 (6-183)||(24228973-24229150)
chr5 (4-202)||(31803347-31803545)
chr5 (1-202)||(37306697-37306898)
chr5 (1-202)||(6007903-6008106)
chr5 (1-202)||(37809779-37809980)
chr5 (1-129)||(21606329-21606457)
chr5 (1-202)||(13461030-13461231)
chr5 (1-195)||(32439917-32440111)
chr5 (1-202)||(37633696-37633897)
chr5 (1-129)||(38297873-38297999)
chr5 (2-129)||(5144069-5144196)
chr5 (6-124)||(7466207-7466325)
chr5 (1-190)||(1795127-1795316)
chr5 (1-202)||(26906511-26906711)
chr5 (8-202)||(3243823-3244017)
chr5 (1-151)||(21150512-21150662)
chr5 (1-151)||(21157653-21157803)
chr5 (12-190)||(24469647-24469825)
chr5 (81-199)||(31546000-31546118)
chr5 (2-151)||(18676464-18676613)
chr5 (1-129)||(425149-425272)
chr5 (1-124)||(7735159-7735282)
chr5 (1-104)||(40209064-40209167)
chr5 (1-151)||(18393020-18393170)
chr5 (1-151)||(25785927-25786077)
chr5 (7-202)||(13703123-13703318)
chr5 (1-201)||(31985049-31985249)
chr5 (4-196)||(38308130-38308322)
chr5 (2-151)||(4609045-4609194)
chr5 (8-202)||(8849136-8849331)
chr5 (81-202)||(25027573-25027694)
chr5 (1-82)||(25027842-25027923)
chr5 (1-86)||(42394242-42394327)
chr5 (12-124)||(3892843-3892955)
chr5 (4-182)||(11413548-11413726)
chr5 (6-202)||(12637945-12638134)
chr5 (81-202)||(3686790-3686911)
chr5 (14-202)||(17869300-17869488)
chr5 (1-124)||(38160312-38160432)
chr5 (91-202)||(30368133-30368244)
chr5 (8-202)||(5842991-5843185)
chr5 (8-151)||(40927180-40927323)
chr5 (7-67)||(9959010-9959070)
chr5 (87-190)||(6330927-6331030)
chr5 (1-151)||(4440109-4440259)
chr5 (132-202)||(38297523-38297593)
chr5 (1-50)||(10889244-10889293)
chr5 (146-202)||(10889186-10889242)
chr5 (2-150)||(36481096-36481244)
chr5 (49-99)||(10734559-10734609)
chr5 (2-82)||(3686414-3686494)
chr5 (1-150)||(13957210-13957359)
chr5 (37-187)||(23418602-23418752)
[»] chr4 (141 HSPs)
chr4 (1-202)||(26620353-26620554)
chr4 (1-202)||(44013915-44014116)
chr4 (1-202)||(44217747-44217948)
chr4 (2-202)||(44069073-44069273)
chr4 (1-202)||(38617311-38617510)
chr4 (1-202)||(5374352-5374553)
chr4 (1-202)||(13629195-13629396)
chr4 (1-200)||(46871962-46872161)
chr4 (4-202)||(35232300-35232498)
chr4 (1-202)||(3436069-3436270)
chr4 (3-200)||(16664284-16664481)
chr4 (1-202)||(48782241-48782441)
chr4 (1-202)||(53599788-53599989)
chr4 (2-202)||(8735431-8735631)
chr4 (2-202)||(50623456-50623655)
chr4 (1-195)||(21044756-21044950)
chr4 (1-198)||(16464788-16464985)
chr4 (1-202)||(22678311-22678512)
chr4 (1-202)||(56576106-56576306)
chr4 (3-202)||(35231733-35231932)
chr4 (1-202)||(29295395-29295596)
chr4 (1-202)||(39671366-39671567)
chr4 (2-202)||(42513027-42513228)
chr4 (3-202)||(19093155-19093354)
chr4 (1-202)||(6195065-6195266)
chr4 (2-202)||(354008-354208)
chr4 (8-202)||(36408771-36408965)
chr4 (8-202)||(36422937-36423131)
chr4 (1-202)||(39683716-39683917)
chr4 (1-202)||(23237668-23237872)
chr4 (1-202)||(22828403-22828604)
chr4 (1-190)||(55147075-55147264)
chr4 (4-202)||(42099752-42099950)
chr4 (1-202)||(26906391-26906592)
chr4 (1-190)||(31862000-31862189)
chr4 (1-202)||(19527222-19527411)
chr4 (32-202)||(33755033-33755201)
chr4 (1-202)||(47251454-47251655)
chr4 (2-202)||(38542278-38542478)
chr4 (1-160)||(8741668-8741827)
chr4 (4-202)||(53125240-53125438)
chr4 (1-202)||(34464318-34464519)
chr4 (1-202)||(12252141-12252334)
chr4 (1-124)||(52677225-52677348)
chr4 (1-202)||(33084519-33084715)
chr4 (3-199)||(37502064-37502261)
chr4 (1-202)||(54231579-54231781)
chr4 (21-202)||(52061619-52061800)
chr4 (1-145)||(47428570-47428714)
chr4 (1-170)||(32239441-32239606)
chr4 (2-202)||(35381421-35381617)
chr4 (4-202)||(55702964-55703162)
chr4 (1-190)||(40411984-40412173)
chr4 (1-145)||(4201377-4201521)
chr4 (1-202)||(18781520-18781721)
chr4 (1-151)||(44549684-44549834)
chr4 (13-202)||(47884989-47885179)
chr4 (1-190)||(23719798-23719987)
chr4 (1-202)||(30939196-30939397)
chr4 (1-202)||(33809128-33809329)
chr4 (1-202)||(36659429-36659630)
chr4 (1-202)||(52257793-52257994)
chr4 (1-189)||(52057466-52057654)
chr4 (3-149)||(47093855-47094001)
chr4 (1-202)||(55935148-55935349)
chr4 (1-112)||(27492400-27492512)
chr4 (1-196)||(26933780-26933974)
chr4 (1-190)||(19399575-19399763)
chr4 (1-98)||(23623601-23623698)
chr4 (1-129)||(29833001-29833129)
chr4 (2-202)||(42629359-42629559)
chr4 (2-124)||(41415049-41415171)
chr4 (16-202)||(44176591-44176777)
chr4 (1-202)||(9220043-9220244)
chr4 (1-190)||(36750590-36750779)
chr4 (1-177)||(53691681-53691857)
chr4 (87-202)||(31984154-31984269)
chr4 (1-115)||(9834305-9834419)
chr4 (2-202)||(18135052-18135253)
chr4 (2-202)||(49122262-49122463)
chr4 (1-202)||(30151713-30151914)
chr4 (1-109)||(36750218-36750326)
chr4 (1-202)||(56499614-56499817)
chr4 (2-202)||(43888025-43888223)
chr4 (1-125)||(54029139-54029263)
chr4 (76-202)||(42645377-42645503)
chr4 (4-129)||(6091428-6091553)
chr4 (1-186)||(31369842-31370027)
chr4 (4-151)||(1146099-1146249)
chr4 (2-202)||(45725578-45725778)
chr4 (1-124)||(7242280-7242403)
chr4 (1-182)||(1615077-1615256)
chr4 (1-151)||(6150735-6150885)
chr4 (1-63)||(33755223-33755285)
chr4 (1-151)||(38865945-38866094)
chr4 (1-91)||(51347303-51347393)
chr4 (1-177)||(34361097-34361272)
chr4 (2-202)||(47596615-47596815)
chr4 (1-124)||(42133078-42133200)
chr4 (1-151)||(1180954-1181104)
chr4 (94-151)||(23621905-23621962)
chr4 (1-102)||(41955776-41955877)
chr4 (2-150)||(1391225-1391373)
chr4 (2-150)||(18091284-18091432)
chr4 (143-202)||(9834463-9834522)
chr4 (1-119)||(34603665-34603783)
chr4 (16-190)||(36292672-36292846)
chr4 (2-104)||(37551765-37551867)
chr4 (4-102)||(48087742-48087840)
chr4 (8-125)||(55430382-55430499)
chr4 (2-90)||(8752182-8752270)
chr4 (2-150)||(14949138-14949286)
chr4 (1-65)||(37394298-37394362)
chr4 (2-125)||(41813684-41813808)
chr4 (3-118)||(3802203-3802318)
chr4 (1-119)||(14090281-14090399)
chr4 (8-202)||(48509872-48510065)
chr4 (2-106)||(3036427-3036529)
chr4 (2-91)||(38617858-38617947)
chr4 (12-125)||(39308983-39309096)
chr4 (2-102)||(34925444-34925544)
chr4 (36-202)||(47751609-47751772)
chr4 (53-124)||(19731452-19731523)
chr4 (4-90)||(17978113-17978198)
chr4 (1-202)||(38009768-38009969)
chr4 (2-150)||(8456965-8457113)
chr4 (1-148)||(43086446-43086591)
chr4 (142-202)||(52677168-52677228)
chr4 (8-124)||(52978306-52978421)
chr4 (8-202)||(51654875-51655068)
chr4 (29-110)||(25098341-25098422)
chr4 (2-202)||(27654746-27654947)
chr4 (1-106)||(27918643-27918747)
chr4 (2-126)||(56486427-56486551)
chr4 (12-109)||(20087228-20087325)
chr4 (132-202)||(29832362-29832432)
chr4 (2-127)||(6129008-6129132)
chr4 (148-185)||(23621604-23621641)
chr4 (2-99)||(30151934-30152031)
chr4 (1-41)||(1615268-1615308)
chr4 (78-118)||(13435247-13435287)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (1-202)||(10812237-10812438)
chr2 (1-202)||(26342618-26342819)
chr2 (2-202)||(15183005-15183205)
chr2 (4-202)||(34399243-34399441)
chr2 (1-202)||(3363622-3363823)
chr2 (1-202)||(15893584-15893785)
chr2 (1-202)||(478977-479178)
chr2 (1-202)||(30264606-30264807)
chr2 (1-199)||(41885663-41885861)
chr2 (1-202)||(14295761-14295962)
chr2 (1-202)||(19594389-19594589)
chr2 (1-200)||(10263794-10263993)
chr2 (1-199)||(38186059-38186257)
chr2 (2-202)||(14308434-14308632)
chr2 (2-202)||(34357217-34357417)
chr2 (1-202)||(36375609-36375812)
chr2 (1-199)||(25558193-25558388)
chr2 (1-202)||(11222320-11222521)
chr2 (1-202)||(11560051-11560252)
chr2 (1-202)||(37093488-37093688)
chr2 (1-202)||(15677300-15677496)
chr2 (1-202)||(28145575-28145777)
chr2 (1-202)||(44360472-44360672)
chr2 (1-202)||(36404845-36405047)
chr2 (1-202)||(14288469-14288668)
chr2 (1-202)||(4883641-4883842)
chr2 (1-202)||(9706825-9707026)
chr2 (13-198)||(38072240-38072419)
chr2 (1-202)||(4654757-4654958)
chr2 (1-202)||(14541369-14541570)
chr2 (1-202)||(13965645-13965846)
chr2 (1-202)||(13753993-13754194)
chr2 (1-202)||(13000915-13001116)
chr2 (1-202)||(13215431-13215632)
chr2 (1-202)||(9370012-9370213)
chr2 (1-202)||(35158355-35158556)
chr2 (1-129)||(2012899-2013027)
chr2 (1-190)||(31024956-31025145)
chr2 (1-202)||(43077330-43077531)
chr2 (78-202)||(3376281-3376405)
chr2 (1-124)||(32854862-32854985)
chr2 (1-109)||(6013513-6013621)
chr2 (4-128)||(32674252-32674380)
chr2 (1-124)||(8443729-8443852)
chr2 (1-124)||(13849797-13849920)
chr2 (1-190)||(1395603-1395791)
chr2 (17-202)||(31011722-31011905)
chr2 (4-197)||(34884547-34884740)
chr2 (1-108)||(32543885-32543992)
chr2 (1-107)||(34309149-34309255)
chr2 (1-125)||(30544558-30544682)
chr2 (111-202)||(1259633-1259724)
chr2 (2-76)||(14284167-14284241)
chr2 (1-150)||(838126-838275)
chr2 (2-151)||(28967286-28967435)
chr2 (2-151)||(37077209-37077358)
chr2 (126-202)||(14284247-14284322)
chr2 (1-92)||(25187241-25187332)
chr2 (1-104)||(38148137-38148240)
chr2 (4-151)||(7529759-7529907)
chr2 (1-124)||(29041988-29042108)
chr2 (1-109)||(37116690-37116798)
chr2 (6-202)||(45065115-45065311)
chr2 (2-150)||(33947485-33947633)
chr2 (2-102)||(42088933-42089033)
chr2 (58-157)||(36824486-36824585)
chr2 (4-90)||(2991852-2991937)
chr2 (8-202)||(25787382-25787566)
chr2 (113-202)||(34262826-34262915)
chr2 (8-151)||(928088-928229)
chr2 (62-202)||(4952700-4952840)
chr2 (65-129)||(34721564-34721628)
chr2 (1-150)||(37354027-37354176)
chr2 (1-41)||(37660182-37660222)
chr2 (2-90)||(42263619-42263707)
chr2 (159-202)||(8443874-8443917)
chr2 (71-125)||(37660845-37660899)
[»] chr1 (96 HSPs)
chr1 (3-202)||(19349377-19349576)
chr1 (1-202)||(35531293-35531494)
chr1 (1-202)||(30686449-30686650)
chr1 (1-202)||(45368126-45368327)
chr1 (3-202)||(13566716-13566918)
chr1 (2-202)||(43500545-43500745)
chr1 (1-202)||(20605622-20605823)
chr1 (1-202)||(38648495-38648696)
chr1 (1-202)||(1024594-1024795)
chr1 (1-202)||(21927696-21927895)
chr1 (1-202)||(37437051-37437252)
chr1 (1-202)||(37609302-37609500)
chr1 (1-202)||(13507808-13508009)
chr1 (1-202)||(13514996-13515197)
chr1 (1-202)||(35483779-35483978)
chr1 (1-202)||(1429322-1429523)
chr1 (1-190)||(32994479-32994668)
chr1 (1-202)||(45226575-45226776)
chr1 (1-202)||(50825571-50825771)
chr1 (1-202)||(18033824-18034025)
chr1 (1-202)||(49908177-49908381)
chr1 (1-202)||(7782989-7783189)
chr1 (29-202)||(12231069-12231242)
chr1 (1-202)||(28679059-28679260)
chr1 (1-202)||(31588738-31588938)
chr1 (2-202)||(12124683-12124883)
chr1 (23-202)||(1677258-1677437)
chr1 (2-202)||(35255525-35255725)
chr1 (1-202)||(44182798-44182997)
chr1 (3-202)||(19929464-19929663)
chr1 (1-202)||(13699212-13699413)
chr1 (13-202)||(49497202-49497391)
chr1 (38-202)||(29830828-29830992)
chr1 (1-191)||(52749055-52749243)
chr1 (56-202)||(8464255-8464401)
chr1 (1-202)||(43952826-43953017)
chr1 (8-154)||(44818499-44818645)
chr1 (1-202)||(10675940-10676141)
chr1 (2-202)||(51972279-51972479)
chr1 (36-202)||(2059810-2059976)
chr1 (5-202)||(32348020-32348216)
chr1 (4-202)||(30702288-30702486)
chr1 (1-202)||(35700373-35700574)
chr1 (1-202)||(51974169-51974370)
chr1 (2-202)||(9127706-9127908)
chr1 (35-202)||(39412509-39412676)
chr1 (1-202)||(32168310-32168511)
chr1 (1-202)||(38597629-38597830)
chr1 (1-202)||(10506851-10507050)
chr1 (1-202)||(51613449-51613650)
chr1 (2-190)||(19455410-19455597)
chr1 (14-202)||(31487777-31487964)
chr1 (18-124)||(24781810-24781916)
chr1 (1-202)||(9362011-9362212)
chr1 (4-202)||(52649727-52649925)
chr1 (2-202)||(48508172-48508372)
chr1 (1-195)||(15660625-15660819)
chr1 (1-190)||(4100919-4101108)
chr1 (2-202)||(18344365-18344565)
chr1 (53-202)||(5598145-5598284)
chr1 (8-202)||(12721485-12721679)
chr1 (1-202)||(36318391-36318591)
chr1 (1-202)||(37735137-37735338)
chr1 (1-202)||(40926751-40926942)
chr1 (1-124)||(1427717-1427840)
chr1 (1-123)||(1039445-1039566)
chr1 (1-123)||(1046351-1046472)
chr1 (16-202)||(46096599-46096785)
chr1 (1-129)||(38817996-38818124)
chr1 (1-184)||(31570653-31570836)
chr1 (1-202)||(42800146-42800345)
chr1 (14-149)||(48265087-48265221)
chr1 (4-202)||(43808939-43809143)
chr1 (1-185)||(17013460-17013648)
chr1 (1-124)||(1038121-1038245)
chr1 (1-124)||(1045027-1045151)
chr1 (1-129)||(8008240-8008368)
chr1 (1-64)||(8464585-8464648)
chr1 (5-151)||(42787335-42787481)
chr1 (2-151)||(11248820-11248969)
chr1 (1-202)||(48174671-48174871)
chr1 (6-151)||(50152476-50152621)
chr1 (8-151)||(2572016-2572159)
chr1 (29-202)||(33720583-33720756)
chr1 (1-62)||(19093306-19093367)
chr1 (2-150)||(52759067-52759215)
chr1 (1-60)||(35605496-35605555)
chr1 (8-202)||(8973450-8973643)
chr1 (2-125)||(1859134-1859255)
chr1 (1-88)||(37296838-37296924)
chr1 (1-87)||(52825315-52825401)
chr1 (1-60)||(5597861-5597920)
chr1 (12-151)||(10630461-10630599)
chr1 (87-202)||(35605722-35605837)
chr1 (78-129)||(1428520-1428571)
chr1 (1-46)||(1428257-1428302)
[»] chr3 (105 HSPs)
chr3 (4-202)||(54898093-54898291)
chr3 (1-202)||(53745289-53745489)
chr3 (1-202)||(54106301-54106502)
chr3 (1-202)||(19550284-19550485)
chr3 (3-202)||(47069864-47070063)
chr3 (1-202)||(43554428-43554628)
chr3 (1-195)||(790588-790782)
chr3 (4-202)||(24981331-24981529)
chr3 (9-202)||(27992286-27992479)
chr3 (1-202)||(45101365-45101566)
chr3 (1-201)||(51697571-51697772)
chr3 (8-202)||(29651713-29651907)
chr3 (1-191)||(51244662-51244852)
chr3 (1-202)||(27483795-27483994)
chr3 (1-202)||(34266447-34266646)
chr3 (2-202)||(52663481-52663681)
chr3 (1-202)||(41168799-41168997)
chr3 (2-202)||(29698030-29698230)
chr3 (1-202)||(42671897-42672098)
chr3 (1-202)||(43775397-43775598)
chr3 (1-202)||(46973461-46973662)
chr3 (2-202)||(35315171-35315371)
chr3 (3-202)||(28885718-28885916)
chr3 (8-202)||(13158446-13158640)
chr3 (1-151)||(45513673-45513823)
chr3 (1-202)||(39866856-39867057)
chr3 (12-202)||(52627245-52627434)
chr3 (1-190)||(17102792-17102981)
chr3 (1-202)||(32980678-32980879)
chr3 (1-202)||(33491146-33491347)
chr3 (29-198)||(43945445-43945614)
chr3 (2-202)||(49123562-49123761)
chr3 (1-202)||(36234405-36234603)
chr3 (1-202)||(6902316-6902517)
chr3 (1-202)||(45145167-45145367)
chr3 (1-202)||(51219100-51219292)
chr3 (3-202)||(25983670-25983868)
chr3 (16-185)||(40139858-40140027)
chr3 (4-148)||(7328496-7328640)
chr3 (1-197)||(3376316-3376516)
chr3 (1-202)||(54911309-54911509)
chr3 (1-202)||(3643203-3643403)
chr3 (8-202)||(13168062-13168244)
chr3 (1-190)||(50091983-50092172)
chr3 (1-113)||(20105230-20105342)
chr3 (14-198)||(33074289-33074472)
chr3 (4-202)||(41926718-41926919)
chr3 (4-202)||(11473443-11473641)
chr3 (1-202)||(24071-24272)
chr3 (1-190)||(32853967-32854156)
chr3 (2-202)||(41425668-41425868)
chr3 (1-202)||(47104162-47104363)
chr3 (1-202)||(48152023-48152224)
chr3 (1-202)||(51064921-51065122)
chr3 (1-202)||(52175758-52175958)
chr3 (7-124)||(55141561-55141678)
chr3 (1-196)||(27039619-27039814)
chr3 (1-202)||(33874553-33874754)
chr3 (30-202)||(29803727-29803887)
chr3 (4-129)||(5244015-5244140)
chr3 (2-202)||(40318935-40319135)
chr3 (8-124)||(40010749-40010865)
chr3 (3-202)||(45055227-45055426)
chr3 (1-202)||(20848731-20848927)
chr3 (1-109)||(27028115-27028223)
chr3 (1-195)||(30861558-30861750)
chr3 (70-202)||(29458210-29458342)
chr3 (1-92)||(48214105-48214196)
chr3 (1-202)||(42515181-42515380)
chr3 (1-195)||(54334197-54334391)
chr3 (13-202)||(41351201-41351390)
chr3 (4-129)||(53282020-53282145)
chr3 (2-129)||(49168403-49168530)
chr3 (1-151)||(23771325-23771475)
chr3 (1-124)||(52173785-52173908)
chr3 (1-150)||(35077425-35077574)
chr3 (16-149)||(42671473-42671605)
chr3 (1-82)||(44544296-44544377)
chr3 (2-176)||(36370861-36371035)
chr3 (29-202)||(32853367-32853538)
chr3 (8-202)||(26748398-26748591)
chr3 (39-129)||(28943614-28943704)
chr3 (8-202)||(34750700-34750893)
chr3 (1-115)||(43159854-43159968)
chr3 (1-182)||(2642748-2642921)
chr3 (1-146)||(28226465-28226608)
chr3 (1-150)||(35458563-35458712)
chr3 (1-57)||(44092181-44092237)
chr3 (81-157)||(44544079-44544155)
chr3 (1-64)||(2154184-2154247)
chr3 (71-150)||(8236954-8237033)
chr3 (71-125)||(53055339-53055393)
chr3 (8-124)||(22099909-22100025)
chr3 (143-202)||(7329004-7329063)
chr3 (132-185)||(20105350-20105403)
chr3 (2-119)||(53290851-53290968)
chr3 (1-41)||(40113415-40113455)
chr3 (146-202)||(45513325-45513381)
chr3 (1-68)||(47843979-47844046)
chr3 (132-202)||(2858584-2858654)
chr3 (2-36)||(29803674-29803708)
chr3 (14-63)||(29458865-29458914)
chr3 (1-124)||(42634431-42634555)
chr3 (113-202)||(48214205-48214294)
chr3 (2-82)||(18355927-18356007)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (1-202)||(49185-49385)
scaffold0024 (153-202)||(89360-89409)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (1-202)||(31430597-31430798)
chr7 (1-202)||(33099839-33100038)
chr7 (1-202)||(18470345-18470546)
chr7 (2-201)||(7312656-7312855)
chr7 (1-202)||(32528332-32528533)
chr7 (1-202)||(41891308-41891509)
chr7 (2-202)||(31398936-31399135)
chr7 (1-202)||(36922277-36922479)
chr7 (3-192)||(44480156-44480345)
chr7 (1-202)||(12838082-12838283)
chr7 (1-202)||(29497538-29497739)
chr7 (1-171)||(26632215-26632385)
chr7 (1-202)||(32966053-32966254)
chr7 (1-160)||(17896569-17896728)
chr7 (1-202)||(8264985-8265188)
chr7 (5-170)||(20035090-20035255)
chr7 (5-170)||(20045501-20045666)
chr7 (1-202)||(22950822-22951023)
chr7 (1-202)||(33921778-33921979)
chr7 (1-202)||(41675191-41675391)
chr7 (1-202)||(3837900-3838101)
chr7 (1-202)||(36298178-36298379)
chr7 (12-202)||(5732077-5732267)
chr7 (1-202)||(26723962-26724164)
chr7 (1-202)||(33173845-33174046)
chr7 (1-202)||(7477202-7477403)
chr7 (45-202)||(8381908-8382065)
chr7 (4-201)||(29722310-29722506)
chr7 (1-202)||(10227294-10227495)
chr7 (1-202)||(35112467-35112668)
chr7 (4-202)||(33257922-33258120)
chr7 (1-201)||(36648011-36648210)
chr7 (33-202)||(38168792-38168962)
chr7 (1-202)||(42841870-42842071)
chr7 (35-188)||(37353888-37354041)
chr7 (1-190)||(30866752-30866941)
chr7 (14-202)||(28608646-28608833)
chr7 (1-202)||(31815073-31815273)
chr7 (2-202)||(35746649-35746848)
chr7 (1-202)||(36406789-36406993)
chr7 (1-151)||(41889372-41889522)
chr7 (1-122)||(6799161-6799283)
chr7 (8-202)||(18194218-18194412)
chr7 (1-124)||(22382156-22382277)
chr7 (78-202)||(47408228-47408352)
chr7 (1-124)||(3310254-3310377)
chr7 (1-118)||(17354114-17354231)
chr7 (1-124)||(34368741-34368864)
chr7 (12-202)||(44820611-44820791)
chr7 (1-151)||(3177968-3178118)
chr7 (1-128)||(1553553-1553678)
chr7 (1-129)||(46285922-46286050)
chr7 (1-202)||(24283620-24283818)
chr7 (4-117)||(42881008-42881121)
chr7 (1-151)||(8965955-8966105)
chr7 (1-190)||(43874099-43874287)
chr7 (1-125)||(46563204-46563328)
chr7 (2-106)||(22057510-22057620)
chr7 (1-129)||(47459682-47459809)
chr7 (1-192)||(45324066-45324250)
chr7 (14-202)||(19327795-19327977)
chr7 (6-151)||(48981434-48981579)
chr7 (40-124)||(8380674-8380758)
chr7 (2-202)||(9601897-9602097)
chr7 (2-202)||(9829468-9829668)
chr7 (142-202)||(17896495-17896555)
chr7 (29-125)||(30586757-30586853)
chr7 (1-182)||(26803454-26803635)
chr7 (8-202)||(22785925-22786118)
chr7 (6-52)||(41409764-41409810)
chr7 (1-40)||(2408827-2408866)
chr7 (8-109)||(32049458-32049559)
chr7 (2-150)||(35860006-35860152)
chr7 (2-100)||(36339303-36339403)
chr7 (1-89)||(33071944-33072032)
chr7 (59-125)||(35684249-35684315)
chr7 (126-202)||(6799582-6799658)
chr7 (84-124)||(41409704-41409744)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (1-202)||(24663417-24663618)
chr6 (1-202)||(17123987-17124186)
chr6 (4-202)||(3621631-3621829)
chr6 (1-202)||(23923715-23923916)
chr6 (1-202)||(373761-373962)
chr6 (2-202)||(17193197-17193397)
chr6 (2-202)||(26470725-26470925)
chr6 (4-202)||(1751433-1751631)
chr6 (1-202)||(17835931-17836132)
chr6 (8-202)||(1252210-1252405)
chr6 (4-202)||(8992589-8992788)
chr6 (4-202)||(9017036-9017235)
chr6 (1-202)||(12732214-12732414)
chr6 (1-202)||(22050087-22050287)
chr6 (1-202)||(364544-364746)
chr6 (1-195)||(7632046-7632240)
chr6 (4-202)||(23777337-23777535)
chr6 (1-202)||(22784670-22784871)
chr6 (1-202)||(8176474-8176672)
chr6 (1-202)||(32359442-32359638)
chr6 (1-143)||(30388759-30388901)
chr6 (53-202)||(3850408-3850559)
chr6 (1-202)||(7056142-7056343)
chr6 (1-202)||(9838124-9838325)
chr6 (1-202)||(30416077-30416278)
chr6 (1-202)||(31244751-31244952)
chr6 (2-202)||(11431159-11431359)
chr6 (3-202)||(17251257-17251457)
chr6 (1-151)||(7235478-7235628)
chr6 (9-202)||(11128877-11129070)
chr6 (1-190)||(34730598-34730787)
chr6 (1-151)||(30237016-30237166)
chr6 (1-202)||(24356056-24356257)
chr6 (1-197)||(33260738-33260939)
chr6 (1-202)||(34378897-34379098)
chr6 (1-190)||(34607136-34607325)
chr6 (1-129)||(52701-52829)
chr6 (2-173)||(27313539-27313713)
chr6 (9-202)||(11676617-11676808)
chr6 (2-202)||(17601135-17601342)
chr6 (2-123)||(31854570-31854693)
chr6 (12-202)||(1249588-1249778)
chr6 (8-202)||(32250954-32251146)
chr6 (46-202)||(26485687-26485841)
chr6 (1-202)||(24635746-24635947)
chr6 (6-151)||(13597453-13597597)
chr6 (1-183)||(7170190-7170372)
chr6 (1-151)||(19811994-19812144)
chr6 (1-186)||(22400582-22400767)
chr6 (1-117)||(24948281-24948397)
chr6 (8-202)||(15432716-15432909)
chr6 (2-202)||(1923890-1924091)
chr6 (8-202)||(11000812-11001005)
chr6 (132-202)||(30388935-30389005)
chr6 (1-58)||(3849103-3849160)
chr6 (81-202)||(19645724-19645847)
chr6 (8-151)||(2381062-2381205)
chr6 (8-104)||(7632488-7632584)
chr6 (139-202)||(53807-53870)
chr6 (109-190)||(24949253-24949334)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-202)||(77126-77327)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-202)||(8192-8393)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (2-200)||(69139-69336)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (2-202)||(26129-26329)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (8-202)||(148348-148542)
scaffold0002 (8-202)||(138744-138926)
scaffold0002 (6-151)||(369448-369591)
scaffold0002 (2-90)||(492454-492542)
[»] scaffold1213 (1 HSPs)
scaffold1213 (1-170)||(1-170)
[»] scaffold0831 (1 HSPs)
scaffold0831 (1-183)||(2845-3028)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (1-202)||(4554-4753)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (2-202)||(419494-419694)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (52-202)||(195589-195738)
scaffold0014 (1-60)||(195882-195941)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-190)||(184141-184330)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-151)||(14774-14924)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (1-190)||(253-442)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-202)||(147129-147331)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (1-202)||(7462-7663)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-202)||(30694-30895)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (2-84)||(72067-72149)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-202)||(96063-96264)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (40-189)||(1832-1981)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (2-151)||(23175-23324)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (2-123)||(354-475)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (3-151)||(14303-14451)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (1-99)||(1071-1169)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-99)||(6460-6558)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-182)||(252632-252813)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (10-106)||(599-695)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (8-148)||(21017-21157)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 114)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38482994 - 38482793
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38482994 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 38482895  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38482894 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 38482795  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38482794 aa 38482793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 14263582 - 14263783
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14263582 ctgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 14263681  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14263682 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 14263781  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  14263782 aa 14263783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33935262 - 33935061
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33935262 ctgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 33935163  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33935162 atgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 33935063  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  33935062 aa 33935061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 35052091 - 35052292
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35052091 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttatttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 35052190  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35052191 ataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 35052290  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  35052291 aa 35052292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 23429947 - 23430148
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23429947 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 23430046  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  23430047 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacgatt 23430146  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  23430147 aa 23430148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 34046889 - 34047090
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34046889 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 34046988  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34046989 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgatattcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 34047088  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  34047089 aa 34047090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23848758 - 23848557
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23848758 ctgtcactttcaaaatttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 23848659  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23848658 atgaataaggtcattataataaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtcaaatgtcaaaatgtgacaatt 23848559  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  23848558 aa 23848557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 26062746 - 26062946
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26062746 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaa-tgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 26062844  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26062845 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 26062944  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  26062945 aa 26062946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 34981867 - 34982068
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34981867 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatacatgaaatgagatattaa 34981966  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34981967 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtattaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 34982066  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  34982067 aa 34982068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14228523 - 14228323
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14228523 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt-gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 14228425  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14228424 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatgacatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 14228325  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  14228324 aa 14228323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 40228333 - 40228534
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40228333 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgacatattaa 40228432  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40228433 atgaataaggtcattatagtaaaagtacagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaatt 40228532  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  40228533 aa 40228534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45281579 - 45281379
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  45281579 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgtggagagggaaatatatgaaatg-gatattaa 45281481  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45281480 atgaataaggtgattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 45281381  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  45281380 aa 45281379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 9954687 - 9954888
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9954687 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 9954786  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  9954787 atgaataaggtcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatatgacaatt 9954886  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  9954887 aa 9954888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4057326 - 4057527
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4057326 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 4057425  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4057426 attaataagatcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 4057525  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  4057526 aa 4057527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16656739 - 16656939
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16656739 ctgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttagcaatattattcttagttatt-attgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 16656837  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16656838 atgaataagttcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattagtatcaattgttgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 16656937  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  16656938 aa 16656939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39303718 - 39303521
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  39303718 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtctttagttttttattgcggagagagaaatatatgatataagatattaa 39303619  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39303618 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaa 39303521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38128734 - 38128548
Alignment:
Q  16 ttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38128734 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttactacggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt 38128635  T
Q  116 atagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  38128634 atagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaa 38128548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32010286 - 32010085
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32010286 ctgtcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 32010187  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  32010186 atgaacaaggtcattatagtaaaagtataaattattgcatcaaaagtagtagcaattattgattgtcttggtttgtgaaaaatgttaaaaagtgacaatt 32010087  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  32010086 aa 32010085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43642191 - 43641990
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  43642191 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaattagatgttaa 43642092  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43642091 aagaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 43641992  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  43641991 aa 43641990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25812943 - 25812750
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25812943 tttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaata 25812845  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25812844 agttcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtattaattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 25812750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25703772 - 25703579
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25703772 tttcaaagttcaatgcagcattaaatgttattttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaata 25703674  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25703673 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtattaattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 25703579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21651944 - 21651747
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21651944 cacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 21651845  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||  |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21651844 ataaggtcattatagtaaaagtacaagttattgcatcaaaagtagtaacgatcattggctatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 21651747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40604053 - 40603869
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40604053 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaa 40603954  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  40603953 atgaataaggtcatcatagtaaaagtttagtttattacatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgt 40603869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1202646 - 1202445
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1202646 ctgtcacttttaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtctttagttatttattgcggaaagagaaatatataaaataagatattaa 1202547  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1202546 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 1202447  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  1202446 aa 1202445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 1245351 - 1245551
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  1245351 tgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgtggagtgaaaaatatatgaaatgagaatttaaa 1245450  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  1245451 tgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgaatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaatta 1245550  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  1245551 a 1245551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12342813 - 12342615
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12342813 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatctttaactatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 12342714  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  12342713 aataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 12342615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18291502 - 18291702
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18291502 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttacca-tattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 18291600  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18291601 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttgatttttgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 18291700  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  18291701 aa 18291702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 15596382 - 15596583
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15596382 ctgtcactttcaaagttcaatgtaaaattaaatgatgttttatcaatattacctttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 15596481  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15596482 atgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaataacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 15596581  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  15596582 aa 15596583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 10180409 - 10180609
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10180409 tgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaacgttattttaccaatattatctttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaa 10180508  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  10180509 tgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacaatta 10180608  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  10180609 a 10180609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 11993931 - 11994120
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||            |||    
T  11993931 ctgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttatagcggagagagaaatatat------------taa 11994018  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11994019 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgtttattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 11994118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 3513395 - 3513551
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3513395 ctgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttacctatattatcattagttatttattacagagagataaatatatgaaatgagatattaa 3513494  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  3513495 atgaataaggtcattatagtaaatgtatagcttattgtatcaaaagtaatatcaatt 3513551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8453436 - 8453237
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||   |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  8453436 ctgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaccctcgattatttattgtggaga--taaatatatgaaataagatattaa 8453339  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8453338 atgaataatgtcattataataaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 8453239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 36058274 - 36058471
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36058274 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttac-aatattatccttagttatttattgctgagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 36058372  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | | ||  ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  36058373 aataagatcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactattttaatttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaa 36058471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 43553077 - 43553278
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43553077 ctgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaacgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 43553176  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||    
T  43553177 atgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcacaaagcgacaatt 43553276  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  43553277 aa 43553278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 167679 - 167556
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  167679 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaa 167580  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  167579 attaataaggttattatagtaaaa 167556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9808169 - 9808017
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9808169 tttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttactaatattgtcattagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 9808070  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9808069 aggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtattaattgtt 9808017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26740336 - 26740138
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||     
T  26740336 tcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaaatt 26740237  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||  |||||||||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26740236 aataaggctattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 26740138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12248972 - 12248783
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  12248972 ctgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttgcttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgaaatattaa 12248873  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||  | || |||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12248872 atgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcgtgtaaaatgtcaaaa 12248783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 13327817 - 13327938
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13327817 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 13327916  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaa 122  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  13327917 ataaataaggtcattatagtaa 13327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17074783 - 17074583
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17074783 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaaatatatgtaatgagatattaa 17074685  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |  | || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17074684 ataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgcatcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 17074585  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  17074584 aa 17074583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 17573487 - 17573687
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17573487 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaaatatatgtaatgagatattaa 17573585  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |  | || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17573586 ataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgcatcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 17573685  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  17573686 aa 17573687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 33314582 - 33314783
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33314582 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtatgatccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 33314681  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | |  ||||||||| |||| ||||| ||||  |||  | | ||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  33314682 atgaataaagtcattatagtaaaaggacaacttattgcataaaaaatagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaatt 33314781  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  33314782 aa 33314783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8554217 - 8554019
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  8554217 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatgttaa 8554119  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8554118 ataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 8554019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Original strand, 12763474 - 12763654
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12763474 gtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 12763573  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaat 183  Q
    |||||| |  |||||||||||| |||   |||||| |||||||  |||| || || ||| |||||||  ||||||||||||    
T  12763574 gaataatgatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaaacagtaacatttattgattgtcttaatttgtgcaaaat 12763654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 18842581 - 18842768
Alignment:
Q  14 agttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 113  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  18842581 agttcaatgcaatattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggtta 18842679  T
Q  114 ttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| || || ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18842680 ttatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 18842768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2888669 - 2888469
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2888669 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaa 2888571  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2888570 ataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 2888471  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  2888470 aa 2888469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15647601 - 15647452
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15647601 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 15647502  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||    
T  15647501 atgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15647452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 2335471 - 2335607
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2335471 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 2335570  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattg 137  Q
    |||| ||||   |||||||||||| ||||| ||||||    
T  2335571 atgactaagactattatagtaaaagtatagattattg 2335607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2456312 - 2456116
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  2456312 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcttta---attaattgcggagag--aaatatataaaataaaatattaa 2456218  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | | ||| ||| || |||||||||||||||||| |||    
T  2456217 atgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacgatt 2456118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11707687 - 11707559
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11707687 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 11707588  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11707587 atgaataaagtcattatagtaaaagtata 11707559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 17718541 - 17718717
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  17718541 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaa 17718640  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtg 177  Q
    || ||||||| ||||||||||||| || |    |||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  17718641 attaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaacaattattgattgtcttggtttgtg 17718717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15623811 - 15623664
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15623811 gtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaat 15623712  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||    
T  15623711 gaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15623664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 23855598 - 23855784
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23855598 gtcactttcaaagtttattgcaacattaaatgttgttt-atcaatattacccttagttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaat 23855696  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
     |||||||| |||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||  | || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  23855697 aaataaggttattatagtaaaagtatgacgtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaa 23855784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13173967 - 13174168
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13173967 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttactaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 13174066  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||    |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  13174067 atgactaaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtt 13174166  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13174167 aa 13174168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6757444 - 6757640
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6757444 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaa 6757543  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    |||| ||||   |||||||||||| ||||  |||||  || | ||  |||| || || |||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6757544 atgactaagactattatagtaaaagtataaattattatataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaca 6757640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27911873 - 27911685
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  27911873 tgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaatattaaa 27911774  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    | ||||||| ||||||||||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27911773 ttaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaa 27911685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27958292 - 27958104
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  27958292 tgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaatattaaa 27958193  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    | ||||||| ||||||||||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27958192 ttaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaa 27958104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27518909 - 27518714
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||      |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27518909 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttta------ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 27518816  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||| ||||||||||||| | || |  ||||||||| |||||||||| ||||  |||  | | ||||||| || ||||||||||||||| || |||    
T  27518815 ataaataaagtcattatagtaacagtacaacttattgcataaaaagtagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaactatt 27518716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14061351 - 14061150
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||  |||||||    
T  14061351 ctgtcactttcaaaggtcaatgcaacattaaaagttgttttatcaatattgcccttagttatttattacagagagagaaataaataaaatgtaatattaa 14061252  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||| ||| |  |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  14061251 atgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 14061152  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  14061151 aa 14061150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 6750653 - 6750781
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6750653 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaa 6750752  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    |||| ||||   |||||||||||| ||||    
T  6750753 atgactaagactattatagtaaaagtata 6750781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 31028692 - 31028815
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  31028692 ctgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaacattaa 31028791  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  31028792 attaataaggtcattatagtaaaa 31028815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16701095 - 16700989
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16701095 ctgtcacttttaaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 16700996  T
Q  101 atgaata 107  Q
    |||||||    
T  16700995 atgaata 16700989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 19972317 - 19972512
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19972317 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatattaaataagatattaa 19972416  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgac 196  Q
    | || |||||  |||||||||||| ||||  |||||| || | ||   ||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19972417 acgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgac 19972512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21020516 - 21020321
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21020516 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatattaaataagatattaa 21020417  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgac 196  Q
    | || |||||  |||||||||||| ||||  |||||| || | ||   ||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21020416 acgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgac 21020321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23793476 - 23793272
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  23793476 tgtcattttcaaagttcaatgtaacattgaatgttgttttaccaatattatccttagatatttattacggagagaaaaacatataaaatgaaatattaaa 23793377  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta----tcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    | ||||||||||||||||||||| || |  | |||| ||||||| |||||    | | || ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||    
T  23793376 ttaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagtaacatttatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgaca 23793277  T
Q  198 attaa 202  Q
    |||||    
T  23793276 attaa 23793272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 35051884 - 35052007
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||  |||||    
T  35051884 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaaattagtgattaa 35051983  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  35051984 atgaataaggttattatagtaaaa 35052007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 35296082 - 35296205
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35296082 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccgacattacctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 35296181  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    |||| |||||  ||||||||||||    
T  35296182 atgattaaggctattatagtaaaa 35296205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 3720718 - 3720919
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  3720718 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattactctaagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 3720817  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||  |||||||||||| || |    |||| |||||||| |||   | || ||| |||| || ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  3720818 attaataaggctattatagtaaaagtaaaagcaattgtatcaaaagcagtcaaacttattgattgttttagtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 3720917  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  3720918 aa 3720919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8731029 - 8730842
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||    
T  8731029 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttag-tatttattgcggagagagaaatatatg-aataagataataa 8730932  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8730931 atgattaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaa 8730842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 7483782 - 7483903
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  7483782 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattatggagag--aaatatatgaaataagatattaa 7483879  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    |||| |||||  ||||||||||||    
T  7483880 atgactaaggctattatagtaaaa 7483903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7606099 - 7605912
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  7606099 ctgtcacttttcaagttcaatacaatattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttatggtagagaga--aatatatgaaattagatgttaa 7606002  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||   ||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  7606001 ataaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcattaaaagtaataatgattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaa 7605912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14511617 - 14511431
Alignment:
Q  16 ttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt 115  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14511617 ttcaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagatatttattgcggagagagaagcatataaaatgaaatattaaattaataaggtcatt 14511518  T
Q  116 atagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||| || |    |||| ||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  14511517 atagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaa 14511431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9687711 - 9687522
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9687711 tgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacaataccatta----tttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaa 9687616  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  | ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  9687615 tgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgcgtatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtga 9687522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39615639 - 39615454
Alignment:
Q  15 gttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcat 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |  || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  39615639 gttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgtgaaatgagaaatatatataatgagatattaaataaataaggttat 39615541  T
Q  115 tatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||  | | ||| ||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  39615540 tatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtaacaac-attattaattgtcttggtttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaa 39615454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 11163304 - 11163505
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||    
T  11163304 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaa 11163403  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtg-caaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| ||   || |||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  11163404 atgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctcaaaa-gtgacaat 11163502  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  11163503 taa 11163505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 41308013 - 41308135
Alignment:
Q  81 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgc-atcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgca 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| | || |    
T  41308013 tatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcaatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttggtatatgta 41308112  T
Q  180 aaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  41308113 aaatgtcaaaatatgacaattaa 41308135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36112104 - 36111955
Alignment:
Q  40 ttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgca 139  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||| |    
T  36112104 ttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgta 36112005  T
Q  140 tcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaa 189  Q
    | | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  36112004 taagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaa 36111955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 17313126 - 17313225
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17313126 aaagttcaacgcaacattaaatgttattttacaaatattaaccttagttatttattgcggagtgagaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggt 17313225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 43553653 - 43553534
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagtta-tttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  43553653 ctgtcactttcgaagttaaatgcaacattaaatgttgttttaccgatatcatccttacttattttattgcggagagaaaaatatatgaaattagatattg 43553554  T
Q  100 aatgaataaggtcattatag 119  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  43553553 aatgaataaggctattatag 43553534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 38074314 - 38074464
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38074314 ctgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttgacattattacccttgattatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaa 38074413  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||| | ||||||| ||||| | |  || ||| |||||||||||||    
T  38074414 atgagcaagattattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagtagta 38074464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 41890560 - 41890710
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41890560 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacacttgattatttcttgtagagagataagtatatgaaataagatattaa 41890659  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| ||   || ||| |||||||||||||    
T  41890660 atgatgaaggttattatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagta 41890710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13132318 - 13132169
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  13132318 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgcagagagagaaatataggaaatatgatattaa 13132219  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    || | |||||  |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  13132218 ataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagt 13132169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 38221851 - 38221978
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||   ||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  38221851 tgtcactttcaaagttcaatataacaataaatgttgttttacaaacattacccttaattatttatcatggagaaagaaatatatgaaataagatattaaa 38221950  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  38221951 tgactaaggctattatagtaaaagtata 38221978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 43553445 - 43553322
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||| | ||   ||||    
T  43553445 ctgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgcttaa 43553346  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  43553345 atgaataaggttattatagtaaaa 43553322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35498272 - 35498090
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||| | |||||||||| ||| |||||| |    
T  35498272 ctgtcacttttaaagtttaatgcaacattagatgtagttttatcaatattgtccttagttatttattacagagatagaaatatatgatatgtgatattga 35498173  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaat 183  Q
    || ||||||   |||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||| || || |   ||||||||||||||| |||||    
T  35498172 ataaataagactattatagtaaaagtataaattattatatcaaaagtagtaacatttatgaattgtcttggtttgtgtaaaat 35498090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 40521446 - 40521337
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataa--atatatgaaatgagatatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  40521446 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcggagagagaaacatatatgaaatgaaatatt 40521347  T
Q  99 aaatgaataa 108  Q
    |||| |||||    
T  40521346 aaattaataa 40521337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 42352788 - 42352976
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    |||||||| | || || ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42352788 aaagttcattacatcattaaatgttgttttacta-tattacccttagatatttattgcagaatgataaatatatgaaatgaggtattaaatgaataaggt 42352886  T
Q  112 cattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     ||||||  ||||| |||  || |||||||||||||||||  || | ||  |||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||    
T  42352887 tattatatgaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta-aaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaacatgacaattaa 42352976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41701680 - 41701556
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  41701680 cacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttcttttaccaacattacttttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaataaaatattaaatga 41701581  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
     ||||   |||||||||||||||||    
T  41701580 ctaagactattatagtaaaaatata 41701556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8954901 - 8954751
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8954901 ctgttactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatctttattatccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaa 8954802  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||| | ||||||| ||||| |||  || ||  |||||||||||||    
T  8954801 atgatgaagattattataggaaaaaaataaattgttttatcaaaagtagta 8954751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 41305682 - 41305763
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaata 82  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41305682 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagataaata 41305763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 202
Target Start/End: Original strand, 13328121 - 13328209
Alignment:
Q  114 ttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13328121 ttatagtaaaagtataacttattgtattaaaagtagtatcaatttttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 13328209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9301745 - 9301595
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |   ||||| ||||  || || ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9301745 ctgtcacttttaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcttttattacccttgatttttaattgtagggagagaaatatatgaaatgagatattaa 9301646  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  9301645 atgatgaaggttattataggaaaaatatgaattgttgcatcaaaagtagta 9301595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 8672340 - 8672397
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttag 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8672340 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttag 8672397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10086357 - 10086256
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10086357 ctgtcacttttaaagtttagtgcaacaataaatgttgttttaccgacatcatccttaattatttattgcagagagagaaatatatgaaataatatattaa 10086258  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  10086257 at 10086256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 29125947 - 29126135
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  29125947 tttcaaagtccaatgcattattaaatgtggttttacctatattacgcttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgatta 29126046  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    |||| || |||| ||||| |||  || ||| |||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  29126047 aggttatcataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagctaaaatgtgaca 29126135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 150
Target Start/End: Original strand, 35029635 - 35029733
Alignment:
Q  51 atccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||    
T  35029635 atccatagttatttattgtggagagagaaatatat-aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagt 35029733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 45317690 - 45317891
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||    ||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||  |||| |||    
T  45317690 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataaagcccttaataatttattggagagagaaaaatatatgaaatatgataataa 45317789  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |  ||||  |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||   |    ||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45317790 ataatcaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaatt 45317889  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  45317890 aa 45317891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 6660992 - 6661192
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| | |||||||| ||||||||  |||||| ||||| | |||||  |||||||||    
T  6660992 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaataaaagaaatatgatattaaa 6661091  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | | ||| |  |||||||  |||  |||  |||||| ||||||||||||   |  | ||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6661092 taattaaagatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatatatttagtgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaatta 6661191  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  6661192 a 6661192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 6741394 - 6741594
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| | |||||||| ||||||||  |||||| ||||| | |||||  |||||||||    
T  6741394 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaataaaagaaatatgatattaaa 6741493  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | | ||| |  |||||||  |||  |||  |||||| ||||||||||||   |  | ||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6741494 taattaaagatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatatatttagtgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaatta 6741593  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  6741594 a 6741594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 11727628 - 11727821
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||| | |||||  |||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  11727628 tttcaaagttcaatgtatcatcaaatgtggctttacttatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattatta 11727727  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || | ||||||| ||||| |||  || ||| |||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||    
T  11727728 agattattatagaaaaaagataaatttttgtatcaaaagtagta-gaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatgcgacaattaa 11727821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 15281469 - 15281606
Alignment:
Q  53 ccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtat 152  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||||||  |||||| || |||||||| |     
T  15281469 ccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagtagcaa 15281568  T
Q  153 caattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    || || ||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15281569 catttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaa 15281606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 15461838 - 15461975
Alignment:
Q  53 ccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtat 152  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||||||  |||||| || |||||||| |     
T  15461838 ccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagtagcaa 15461937  T
Q  153 caattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    || || ||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15461938 catttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaa 15461975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41643648 - 41643503
Alignment:
Q  45 aatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaa 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||  ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||  ||| ||||||  ||||||    
T  41643648 aatattacccttagttatttattacgaagagagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaaggataatttattatatcaaa 41643549  T
Q  145 agtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||| || || |||  | | |||||||||| ||||||||||||    
T  41643548 agtagtaacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaa 41643503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13935278 - 13935194
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatat 85  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  13935278 ctgttactttcgaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattatccctacttatttattatggagagagaaatatat 13935194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 30205499 - 30205575
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagata 78  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||  ||||||||    
T  30205499 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtctttagtaatttattgcagagagata 30205575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 202
Target Start/End: Original strand, 17313282 - 17313381
Alignment:
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||  |||  | |||| |||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  17313282 gaataaggtcattatagtaaaagtagaacttattgcatcaaaagtaataacaataattgactatcttcgtttatgtaagatgtcaaaatgtaacaattaa 17313381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27193248 - 27193105
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||  ||||||| |||||| | |||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  27193248 tttcaaagttcaatttatcattaaatgtgattttacctatattacctttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattatta 27193149  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||| |||||||  |||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  27193148 aggttattataggtaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 27193105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 37998312 - 37998224
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaat 90  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| || || ||| ||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  37998312 ctgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtctt-cctataatattcttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaat 37998224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 35028645 - 35028693
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatatt 50  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35028645 tgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatatt 35028693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40602958 - 40602810
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||| |  | ||| | || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  40602958 tgtcactttcaaagttcaatataacattaaataatgttctttctataatgtctttagtcatttattgcggagagagaaatatatgaaatataatattaaa 40602859  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | |||||  |||||||  ||||||||  |||||  || |||||||||    
T  40602858 taattaaggatattataggtaaaatataaattattatataaaaagtagt 40602810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 202
Target Start/End: Original strand, 8672583 - 8672733
Alignment:
Q  52 tccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    |||| ||||||| || ||    
T  8672583 tccttagataattattgccgagagagaaacataaaaaatgaaatagtaaataaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaataata 8672682  T
Q  152 tcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     || || ||| || | |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  8672683 acatttattgattattttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaa 8672733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29091148 - 29091086
Alignment:
Q  140 tcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||  | || ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29091148 tcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 29091086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 31964738 - 31964808
Alignment:
Q  132 ttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||| ||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||    
T  31964738 ttattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaa 31964808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11016060 - 11015945
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatat-tatccttagttatttattga-ggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | || ||||| |||||  |||| ||||||||||||| | |||  || |||||||||||||   |||||||||||     
T  11016060 tttcaaagttcaatgtaacattaattatt-ttttatcaataaatatcattagttatttatttatggaatgagaaatatatgaaatcgaatattaaatgag 11015962  T
Q  106 taaggtcattatagtaa 122  Q
    |||||| ||||||||||    
T  11015961 taaggttattatagtaa 11015945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 110)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1088132 - 1087931
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1088132 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 1088033  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1088032 atgaataaagtcgttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 1087933  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  1087932 aa 1087931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 34261332 - 34261533
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34261332 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 34261431  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  34261432 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgtatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtctaaaatgtcaaaatatgacaatt 34261531  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  34261532 aa 34261533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 8825077 - 8825278
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8825077 ctgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 8825176  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8825177 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataatt 8825276  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  8825277 aa 8825278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 9076091 - 9076292
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9076091 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 9076190  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  9076191 atgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaattatgacaatt 9076290  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  9076291 aa 9076292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18020967 - 18020766
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18020967 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatcaa 18020868  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18020867 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtctgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 18020768  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  18020767 aa 18020766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26854293 - 26854093
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26854293 ctgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaa 26854195  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26854194 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 26854095  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  26854094 aa 26854093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38017476 - 38017275
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38017476 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaa 38017377  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38017376 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttcgtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 38017277  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38017276 aa 38017275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38910294 - 38910494
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38910294 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatg-gatattaa 38910392  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38910393 atgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 38910492  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38910493 aa 38910494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 39073064 - 39073265
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||    
T  39073064 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagtgagaaatatatgaaatgagatattaa 39073163  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39073164 atgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 39073263  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  39073264 aa 39073265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 7403875 - 7404073
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7403875 tcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatg 7403974  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  7403975 aataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattatcttggtttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaa 7404073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4175679 - 4175478
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4175679 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 4175580  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4175579 atgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaattgtttattgtcttgctttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 4175480  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  4175479 aa 4175478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10359434 - 10359233
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  10359434 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagaaaaaaatatatgaaatgatatattaa 10359335  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10359334 atgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 10359235  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  10359234 aa 10359233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Original strand, 25343985 - 25344181
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343985 actttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 25344084  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25344085 taaggttattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaggatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgacaaaatgtgacaattaa 25344181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7579867 - 7579665
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7579867 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaa 7579768  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatc-aaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7579767 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcaacaaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaat 7579668  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  7579667 taa 7579665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38363211 - 38363410
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38363211 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt--ccttagttattaattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaa 38363308  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38363309 atgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaattgtgacaatt 38363408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 12664878 - 12665079
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12664878 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 12664977  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  12664978 atgaataaggtcattatagtaaaagtacatcatattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaatt 12665077  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  12665078 aa 12665079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 42911570 - 42911771
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42911570 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaa 42911669  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42911670 atgaatatgatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 42911769  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  42911770 aa 42911771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2674173 - 2673976
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2674173 cactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctcagttatttactgcgaagagagaaatatatgaaattagatattaaatga 2674074  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2674073 ataaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 2673976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18794803 - 18795004
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18794803 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaa 18794902  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  18794903 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacatcaaaagtatgatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaagtgtgaaaatt 18795002  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  18795003 aa 18795004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4985374 - 4985173
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4985374 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacccttaattatttattgaggagagagaaatatatgaaataagatattaa 4985275  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4985274 atgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaactattgattgtcttggtatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 4985175  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  4985174 aa 4985173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6754378 - 6754177
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6754378 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatatcatttttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 6754279  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6754278 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtatgatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 6754179  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  6754178 aa 6754177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12870098 - 12869897
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12870098 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaa 12869999  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12869998 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtataaaatatcaaaatgtgacaatt 12869899  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  12869898 aa 12869897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28024458 - 28024257
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  28024458 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaa 28024359  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28024358 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttggttggtgtaaaatgtcaaaatatgacaatt 28024259  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  28024258 aa 28024257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38702161 - 38702362
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38702161 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 38702260  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||    
T  38702261 ataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatattaaaatatgacaatt 38702360  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38702361 aa 38702362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4098351 - 4098552
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4098351 ctgtcacttttaaagttcagtacaacattaaatgttgttttgccaatattatcctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 4098450  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4098451 atgaataaggtcattatagtaaaggtataacttattgtatcaaaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 4098550  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  4098551 aa 4098552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6072472 - 6072673
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6072472 ctgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatattaaatgagatattaa 6072571  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||  |||||||| ||||    
T  6072572 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtttaaatgtgataatt 6072671  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  6072672 aa 6072673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1297937 - 1297735
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1297937 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatattaa 1297838  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatc-aaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  1297837 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaaatagtattaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtaacaat 1297738  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  1297737 taa 1297735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16124451 - 16124258
Alignment:
Q  9 ttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 108  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124451 ttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 16124352  T
Q  109 ggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16124351 ggtcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 16124258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36239478 - 36239679
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36239478 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 36239577  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36239578 attaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaactattgattgtcttgatatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 36239677  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  36239678 aa 36239679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 40198808 - 40199009
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  40198808 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatccgtagttatttattgcggagagagaaataaatgaaatgagatgttaa 40198907  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||| |||||| || ||||||    
T  40198908 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattgttgattgtcttgatctgtgtaaaatatcaaaaagtaacaatt 40199007  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  40199008 aa 40199009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14793984 - 14793788
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14793984 actttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaa 14793885  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||| ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14793884 taaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtaataattattgattatattggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 14793788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24075037 - 24074836
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24075037 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattactcttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 24074938  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24074937 atgaataagttcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 24074838  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  24074837 aa 24074836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 195
Target Start/End: Original strand, 22582508 - 22582686
Alignment:
Q  17 tcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta 116  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22582508 tcaatgtaacattaaatgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta 22582607  T
Q  117 tagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22582608 tagtacaagtatagtttattgcatcaaaagtagtataaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatgtga 22582686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2134100 - 2133917
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  2134100 actttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaa 2134001  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  2134000 taaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaa-tagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaa 2133917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8230002 - 8229802
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8230002 ctgtcattttccaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattccggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 8229903  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||    
T  8229902 atgaataaggtcactatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtattaacaattattgattgtcttaatttgtgtaagatgtcaaaa-gtgacaatt 8229804  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  8229803 aa 8229802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4017434 - 4017635
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4017434 ctgtcacttttaaagttcaatgcaatattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaa 4017533  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  | ||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4017534 atgaataaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaacaattattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 4017633  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  4017634 aa 4017635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 4694784 - 4694973
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4694784 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttattttactaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 4694883  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  4694884 atgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtattagcaattattgattatcttggtttgtgaaaaatgtaaaaa 4694973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 6689619 - 6689808
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  6689619 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttaattatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaa 6689718  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||| |||||| ||||||| ||||    
T  6689719 atgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaaatagtaacaattattaattgttttgatttgtgtaaaatgtaaaaa 6689808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4427605 - 4427403
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4427605 ctgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 4427506  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtag-tatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  || ||||  || |||||||| || ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4427505 atgagtgaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagcaataaattactgattgtcttgattcgtgtaaaatatcaaaaagtgacaat 4427406  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  4427405 taa 4427403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28447180 - 28446983
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  28447180 tcactttcaaagttaaatgcaacattaaatgttattttataaatattatccttagt-atttattgagaaaagagatatatatgaaatgagatgttaaatg 28447082  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28447081 aataaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaaatagtaacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 28446983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37303306 - 37303156
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37303306 ctgtcactttcaaaattcaatacaacattaaatgttgtttcaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 37303207  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  37303206 atgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattacatcaaaagtagta 37303156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 32389006 - 32389207
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  32389006 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaa 32389105  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||| || |  | |||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  32389106 attaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 32389205  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  32389206 aa 32389207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 18465725 - 18465918
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  18465725 cactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg----attaaatga 18465820  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    | ||  | |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  18465821 acaaaattattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttctgaaaaatatcaaaatatgataattaa 18465918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4688997 - 4688869
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4688997 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagaaaaatatatgaaatgagatattaa 4688898  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4688897 atgaataaggtcattaaagtaaaagtata 4688869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9127549 - 9127349
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  9127549 tgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatctttaattatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaa 9127450  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||  || ||||  |||  | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9127449 tgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtgataacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 9127350  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  9127349 a 9127349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4962385 - 4962194
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  4962385 ctgtcactttcaaagttcaatggaacattaaatgttgttttacaaatattatctttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatgttaa 4962286  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatg 192  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |  || ||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  4962285 atgaataaaatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtgataacggttattgattatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatg 4962194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12784641 - 12784441
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  12784641 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 12784542  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||| ||||| |||||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  12784541 attaataagatcattttagtaaaagta-aaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaatt 12784443  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  12784442 aa 12784441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28463584 - 28463395
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28463584 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 28463485  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28463484 atgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaa 28463395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 7408352 - 7408552
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7408352 tgtcactttcaaagttcaaagcaatattaaatattgttttaccaatattactcttacttatttattatggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaa 7408451  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||    || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7408452 tgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtattaatgtttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaagatgacaatta 7408551  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  7408552 a 7408552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18437521 - 18437321
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18437521 tgtcactttcaaaatccaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattatggagagagaaatatatgaaatgagataataaa 18437422  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||   ||||| ||||||| | ||| || || ||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18437421 taaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatcaaaaatggtaacatttattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaatta 18437322  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  18437321 a 18437321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39894008 - 39893807
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  39894008 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 39893909  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||| || | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  39893908 attaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattattttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 39893809  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  39893808 aa 39893807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12723157 - 12722957
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  12723157 tgtcacttttaaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaa 12723058  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | |||||| ||||| |||||||| || |    |||| |||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  12723057 ttaataagatcattttagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaatta 12722958  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  12722957 a 12722957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38502999 - 38502802
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38502999 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttaactatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 38502900  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||    ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||  |||  | | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  38502899 atg----aggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaatcattgactattttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtaacaatt 38502804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19831736 - 19831560
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  19831736 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttaactatttattgtggaaagagaaatatt--aaatgagatattaaatg 19831639  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaa 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| || || || || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  19831638 aataaggtcattatagtaaacatataaattattgtatcaaaaatattaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaa 19831560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38297815 - 38297620
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  38297815 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattac 38297716  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgac 196  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  38297715 atgattaaggcgattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgac 38297620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 31802808 - 31802958
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  31802808 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgtggagagaaaattatatgaaagaagatattaa 31802907  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    || ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  31802908 attaataaggtcattatgataaaagtataaattattgtatcaaaagtagta 31802958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 5119202 - 5119363
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  5119202 cactttcaaagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatcctttgttatttattactgagagaaaaatatatgaaatgagatgttaaatta 5119301  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgt 166  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  5119302 ataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgt 5119363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 24228973 - 24229150
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24228973 actttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaattagatattgaatgaa 24229072  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaat 183  Q
    |||||| |||||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||| || || |||  |||||||||||||| |||||    
T  24229073 taaggttattatagtaaaagtgtatattgttgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaat 24229150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 31803347 - 31803545
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||     
T  31803347 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgatgttttactaatattatccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaattgaaatattaaatt 31803446  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || |||||| || |||||||| || |  | |||| ||||||||||||| || || ||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31803447 aacaaggtcgttttagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 31803545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37306898 - 37306697
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  37306898 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcagagagaaaaacatatgaattgaaatattaa 37306799  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || |||||||||||||||||| ||      |||| ||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  37306798 attaacaaggtcattatagtaaaagtaagaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 37306699  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  37306698 aa 37306697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6007903 - 6008106
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  6007903 ctgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattgtctttagttatatattacagagagagaaatatatgaaatgtggtattaa 6008002  T
Q  101 atgaataaggtcattatag-taaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtc-aaaatgtgacaa 198  Q
    || |||||||  ||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  6008003 attaataaggctattatagttaaaaatataaatcattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaaagtgacaa 6008102  T
Q  199 ttaa 202  Q
    ||||    
T  6008103 ttaa 6008106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 37809779 - 37809980
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||| ||| ||||||| | | |||||||    
T  37809779 ctgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttatatatttattgcagagagagaaacatatgaattaaaatattaa 37809878  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || ||| |||||||||||||| || |    |||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  37809879 attaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgcatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaatt 37809978  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  37809979 aa 37809980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21606457 - 21606329
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||    
T  21606457 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattacggagaaagaaatatatgaaataaaatattaa 21606358  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21606357 atgaataaggatattatagtaaaaatata 21606329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13461030 - 13461231
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13461030 ctgtcacttttaatgttgaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattactcttaattatttattgtggagagagaaatatataaaataagatattaa 13461129  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||| ||| | |||||| ||||||||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13461130 atgaaaaagattattataataaaaatataaattattgtataacaaaaagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 13461229  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13461230 aa 13461231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32440111 - 32439917
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  32440111 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacctttagttatttattgcagagagagaaatacatgaaataagatattaa 32440012  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    |||| |||||  |||||| ||||| ||    |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32440011 atgactaaggctattataataaaagtactaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtga 32439917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 37633696 - 37633897
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  || ||| ||| ||||||| | | |||||||    
T  37633696 ctgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttatatatttattgcagaaagagaaacatatgaattaaaatattaa 37633795  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || ||| |||||||||||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  37633796 attaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaatt 37633895  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  37633896 aa 37633897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38297999 - 38297873
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  38297999 ctgtcactttcaaagtt--atgcatcattaaatgttgttttaccaatattatcctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaa 38297902  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    || |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  38297901 attaataaggttattatactaaaagtata 38297873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 5144196 - 5144069
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5144196 tgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattacccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaa 5144097  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||| |||||  |||||| ||||| ||||    
T  5144096 tgactaaggctattataataaaagtata 5144069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Original strand, 7466207 - 7466325
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  7466207 actttcaaacttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaa 7466306  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaa 124  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  7466307 taaggtcattatagcaaaa 7466325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1795316 - 1795127
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  1795316 ctgtcactttcaaagttcaatgttacaataaatgttgttttaccaacattacccttatttatttattgcgaagagagaaatatacgaaataagatattaa 1795217  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| ||| |  |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1795216 atgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaa 1795127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 26906511 - 26906711
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttg-ttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  26906511 ctgtcactttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttttaccaatatcacccttagttatttatt--acagagagaaatatatgaaacaagatatta 26906608  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||| | || ||||| | ||||  |||  |||||| |||||||||||||  | || |||  ||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  26906609 aatgaatgatgttattattggaaaaggataaattattgtatcaaaagtagtaagatttattgaatgttttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaat 26906708  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  26906709 taa 26906711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 3243823 - 3244017
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3243823 tttcaaaaatcaatgcaatattaaatgttgttttatcaaatttgtcctttgttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaaatgaata 3243922  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||  ||||||| ||||| | |  |||||| || |||| ||||| || || ||  |||||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  3243923 aggctattataggaaaaacaaaaattattgtataaaaaatagtaacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaa 3244017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 21150512 - 21150662
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21150512 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaa 21150611  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  |||||  |||||| ||||| ||   || ||| |||||||||||||    
T  21150612 atgatgaaggtttttatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagta 21150662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 21157653 - 21157803
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21157653 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaa 21157752  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  |||||  |||||| ||||| ||   || ||| |||||||||||||    
T  21157753 atgatgaaggtttttatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagta 21157803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24469825 - 24469647
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||  |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  24469825 aaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattatccttaattatttattgcagagaggaaaatttattaaataagatattaaatgactaaggt 24469726  T
Q  112 cattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
     |||||||||||||||||  | |||| || | ||  |||| || || | || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24469725 tattatagtaaaaatataaatcattgtataagaaaaagtaacatttatagtgtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaa 24469647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31546118 - 31546000
Alignment:
Q  81 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaa 180  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  31546118 tatatgaaatgtgttattaattgaatcaggtcattgtagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaa 31546019  T
Q  181 aatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  31546018 aatgtcaaaaggtgacaat 31546000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18676613 - 18676464
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  18676613 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattatccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataggatattaaa 18676514  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||| ||   || ||| |||||||||||||    
T  18676513 tgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagta 18676464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 425149 - 425272
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  425149 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatttctcttagttatttattgcggagagagaaataaatgaaataagatattaa 425248  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    |||     ||| |||||||||||||||||    
T  425249 atg-----ggttattatagtaaaaatata 425272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7735282 - 7735159
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  7735282 ctgtcactgtcaaaattcaatgcaaaattcaatgttgttttaccaacattatccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 7735183  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || |||||||  ||||||||||||    
T  7735182 attaataaggctattatagtaaaa 7735159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 40209167 - 40209064
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  40209167 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgtggatagagaaatataggaaatatgatattaa 40209068  T
Q  101 atga 104  Q
    ||||    
T  40209067 atga 40209064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18393170 - 18393020
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||    
T  18393170 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaa 18393071  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  18393070 atgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 18393020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 25785927 - 25786077
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25785927 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttggcattattacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 25786026  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||||| | |  || ||| |||||||||||||    
T  25786027 atgaggaaggttattataagaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagtagta 25786077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 13703123 - 13703318
Alignment:
Q  7 ctttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaat 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| || |||||| |||    
T  13703123 ctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattacctttagatatttattgcggagagagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaat 13703221  T
Q  107 aaggtcattatagtaaaaat-atagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||   |||||||||||| | | |    |||| ||||||| |||||  | || ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13703222 aagactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaaatagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaa 13703318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31985249 - 31985049
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||   | | | | |||||||| ||| |||| |||||    
T  31985249 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaaagttattttaccgatattacccttaattatttatcttgaacaaagaaatatataaaacgagacattaa 31985150  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||   ||| |||||||||||||  |||||  || ||||||| |  || || ||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  31985149 atgaataagactattctagtaaaaatataaattattatattaaaagtaatgacatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgataatt 31985050  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  31985049 a 31985049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38308322 - 38308130
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    ||||||||||| |||| || || | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||   ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  38308322 tcactttcaaaattcattgtaataataaatgttgttttatcaacattacccttagttatatattgtaaagagagacatacatgaaataagatattaaatg 38308223  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgac 196  Q
    | |||||  |||||||||||| |||   |||||| || ||||  |||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38308222 actaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataaaaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgac 38308130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Original strand, 4609045 - 4609194
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| | ||  ||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  4609045 tgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacctttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaa 4609144  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||  ||||| |||| || ||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  4609145 tgatgaaggttattacaggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 4609194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8849331 - 8849136
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgaga--tattaaatgaa 105  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||   |||||| |||||| |||||  |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||     
T  8849331 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatatttattgcagagagagaaatgtatgaaatgagaagtattaaatgat 8849232  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  || | ||  ||||| || |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  8849231 taaggttattatagaaaaaagataattttttgtatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcatgatttgtgtaaaaagtcaaaatgagacaattaa 8849136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25027694 - 25027573
Alignment:
Q  81 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaa 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||| |||| || ||    
T  25027694 tatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttatgtaa 25027595  T
Q  181 aatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  25027594 aatgtcacaaagtgacaattaa 25027573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25027923 - 25027842
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaata 82  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25027923 ctgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaata 25027842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42394327 - 42394242
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42394327 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttatgaacattacccttaggtatttattggggagagagaaatatatg 42394242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Original strand, 3892843 - 3892955
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| | ||||||||| ||||||||    
T  3892843 aaagttcaatgcaacgttaaatgttattttaccagtattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatataataaaatattaaattaataaggt 3892942  T
Q  112 cattatagtaaaa 124  Q
    |||||||||||||    
T  3892943 cattatagtaaaa 3892955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11413726 - 11413548
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||  |||||||||   |||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  11413726 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacatttattacctttgattatttattatagagagagaagtatgtgaaattagatattaaatg 11413627  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaa 182  Q
    |  ||||| ||||||| ||||| ||   || ||| |||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  11413626 atgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 11413548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12638134 - 12637945
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  || ||| ||| ||||||||||| |||||||||       
T  12638134 acttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaaaattacctttagatatttattgcagaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaat--- 12638038  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
        |||||||||||||| ||| |    |||| |||||||||||||  | || ||| |||||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||    
T  12638037 ----gtcattatagtaaagataaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaa 12637945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 3686790 - 3686911
Alignment:
Q  81 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaa 180  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| |||| ||||||| |  ||    
T  3686790 tatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgttttggtttatataa 3686889  T
Q  181 aatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  3686890 aacgtcaaaatgtgataattaa 3686911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17869488 - 17869300
Alignment:
Q  14 agttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 113  Q
    |||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || | ||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |    
T  17869488 agttaaatggaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-atcgtggagtaagaaatatatgtaatgagatattaaataaataagatta 17869390  T
Q  114 ttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgt-gcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||| |||||||| |  |||||  ||||||||||| | || || |||   ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17869389 ttataataaaaatagaaattattatatcaaaagtagcaacatttattgaccgtcttagtttgtggaaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 17869300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 38160312 - 38160432
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||  | | ||||||| ||| || ||||    
T  38160312 ctgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattatccttaaatatttattacggagag--agacatatgaagtgaaat-ttaa 38160408  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || |||||| | ||||||||||||    
T  38160409 atcaataagattattatagtaaaa 38160432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30368244 - 30368133
Alignment:
Q  91 gagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||||  ||||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  30368244 gagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattatatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaa 30368145  T
Q  191 tgtgacaattaa 202  Q
    ||| ||||||||    
T  30368144 tgtaacaattaa 30368133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5843185 - 5842991
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| | | |||| |||||||||  ||| || ||| ||||||| ||| || |||||| ||||    
T  5843185 tttcaaagttcaatgcaatattaaatgtagttttatcaatatcacctttagatatttattgcagagtgagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaata 5843087  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagttta-ttgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||   |||||||||||| || |    | ||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||    
T  5843086 agactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattaa 5842991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 40927180 - 40927323
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||| ||||||  ||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  40927180 tttcaaaattcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattactcttatatatttattgcagagagagcaatatataaaatgaagtattaaatgatta 40927279  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    || | ||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  40927280 agattattataggaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta 40927323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9959070 - 9959010
Alignment:
Q  7 ctttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt 67  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9959070 ctttcaaagttcaatgcaatatcaaatgttgttttaccaatattatccttacctatttatt 9959010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 190
Target Start/End: Original strand, 6330927 - 6331030
Alignment:
Q  87 aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||  | || ||| ||||||  |||| || ||||||||    
T  6330927 aaatgagatattacatgaataagattattatagtaaaaatataaattattttatcaaaagtagtaatatttattgattgtctaagtttatgtaaaatgtc 6331026  T
Q  187 aaaa 190  Q
    ||||    
T  6331027 aaaa 6331030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 4440109 - 4440259
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||| |  ||||||| ||||||||  ||  || |||||||| ||||  ||||||||    
T  4440109 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttatttttcctataatgcccttagtaatttattggagactgaaaaatatataaaatatgatattaa 4440208  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    || | ||| |  |||||||  |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  4440209 ataattaaagatattataggcaaaacataaattattgtatcaaaagtagta 4440259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38297593 - 38297523
Alignment:
Q  132 ttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  38297593 ttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttgttttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaa 38297523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10889293 - 10889244
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatatt 50  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10889293 ctgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 10889244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10889242 - 10889186
Alignment:
Q  146 gtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  10889242 gtaggatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaa 10889186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 36481096 - 36481244
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||| |  ||||||| ||||||||  ||||||||||| || |||||   ||||||||    
T  36481096 tgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcttataatgcccttagtaatttattgcagagagataaatttaagaaatataatattaaa 36481195  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | |||||  |||||||  |||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  36481196 taattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagt 36481244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10734609 - 10734559
Alignment:
Q  49 ttatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  10734609 ttatccttagttatttattgtggagagagaaatataagaaattagatatta 10734559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Original strand, 3686414 - 3686494
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaata 82  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  3686414 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttattta-ttattgtggagagagaaata 3686494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13957359 - 13957210
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||     |||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||  ||||||||    
T  13957359 ctgtcactctcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataaagctcttagtaatttattgaagagagaagagtatatgaaatatgatattaa 13957260  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    || |  ||||  |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  13957259 ataatcaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagt 13957210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 23418602 - 23418752
Alignment:
Q  37 gttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttatt 136  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||  ||||    ||||  |||  |||||    
T  23418602 gttttaccaatattatggttagttatttattagagatagagaaatatacgaaataaaatattaaatgaatgaggctattaataaaaaaggataaattatt 23418701  T
Q  137 gcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtca 187  Q
    | |||||| ||| || || || ||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  23418702 gtatcaaaggtaataacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtca 23418752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 141)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26620554 - 26620353
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26620554 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggataaataaatatatgaaatgagatattaa 26620455  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620454 attaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgttttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 26620355  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  26620354 aa 26620353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44014116 - 44013915
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014116 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagataaatatatgaaatgagatattaa 44014017  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44014016 ataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtttcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 44013917  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  44013916 aa 44013915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 44217747 - 44217948
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44217747 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 44217846  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44217847 atgaagaaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 44217946  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  44217947 aa 44217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 44069073 - 44069273
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44069073 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 44069172  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44069173 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 44069272  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  44069273 a 44069273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38617510 - 38617311
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38617510 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaa 38617411  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38617410 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattg--ttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 38617313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5374553 - 5374352
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5374553 ctgtcactttcaaagctcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 5374454  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5374453 atgaataagatcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaatt 5374354  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  5374353 aa 5374352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13629396 - 13629195
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13629396 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 13629297  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13629296 atgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatgaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 13629197  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13629196 aa 13629195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 46871962 - 46872161
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46871962 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 46872061  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46872062 atgaataaggtcattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 46872161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35232498 - 35232300
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35232498 tcacgttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 35232399  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35232398 aataaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagcagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 35232300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3436270 - 3436069
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3436270 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 3436171  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3436170 attaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtattaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataatt 3436071  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  3436070 aa 3436069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Original strand, 16664284 - 16664481
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16664284 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaat 16664383  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16664384 gaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 16664481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 48782241 - 48782441
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  48782241 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-agatattaa 48782339  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48782340 atgaataaggtcattatagtaaaagtattgcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 48782439  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  48782440 aa 48782441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53599989 - 53599788
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  53599989 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaa 53599890  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  53599889 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 53599790  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  53599789 aa 53599788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 8735431 - 8735631
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8735431 tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaa 8735530  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8735531 tgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatta 8735630  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  8735631 a 8735631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 50623456 - 50623655
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50623456 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaa 50623554  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50623555 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatta 50623654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21044950 - 21044756
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21044950 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgcaatgagatattaa 21044851  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21044850 ataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtga 21044756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16464985 - 16464788
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16464985 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttagtgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 16464886  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16464885 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtctaggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaa 16464788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22678512 - 22678311
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678512 ctgtcgctttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtaatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaa 22678413  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22678412 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaatagtagtatcaattgttgattatcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaatt 22678313  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  22678312 aa 22678311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 56576306 - 56576106
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  56576306 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaa 56576208  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  56576207 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaggtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaatt 56576108  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  56576107 aa 56576106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 35231733 - 35231932
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  35231733 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaat 35231832  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35231833 gaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 35231932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 29295395 - 29295596
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29295395 ctgtgactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 29295494  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  29295495 atgaataaggtcattatattaaaagtataacttattgcatcgaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgataatt 29295594  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  29295595 aa 29295596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 39671366 - 39671567
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39671366 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtccttaattatttattgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaa 39671465  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39671466 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcataatgtgacaatt 39671565  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  39671566 aa 39671567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42513228 - 42513027
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  42513228 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgtgatattaaa 42513129  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtc-aaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  42513128 tgaataaggtcatgatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtattaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatttcaaaaatgtgacaatt 42513029  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  42513028 aa 42513027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19093354 - 19093155
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19093354 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaggaatatatgaaatgagatattaaat 19093255  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19093254 gaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 19093155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6195065 - 6195266
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6195065 ctgtcacattcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaa 6195164  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6195165 ataaacaaggtcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaattatggattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaatt 6195264  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  6195265 aa 6195266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 354008 - 354208
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  354008 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 354107  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||  |||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  354108 tgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaaatagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 354207  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  354208 a 354208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 36408771 - 36408965
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36408771 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaacaatattctctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaata 36408870  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36408871 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 36408965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 36422937 - 36423131
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36422937 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaacaatattctctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaata 36423036  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36423037 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 36423131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39683917 - 39683716
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39683917 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 39683818  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  39683817 atgaataagatcgttatactaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtgaaaatgtgataatt 39683718  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  39683717 aa 39683716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 23237668 - 23237872
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagat---aaatatatgaaatgagatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23237668 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagattataaatatatgaaatgagatat 23237767  T
Q  98 taaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  23237768 taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatcgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttctagtttgtgtaaaatgttaaaatgtaaca 23237867  T
Q  198 attaa 202  Q
    |||||    
T  23237868 attaa 23237872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22828604 - 22828403
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22828604 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattacatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcagatagagaaatatatgaaataatatattaa 22828505  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22828504 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaattattggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 22828405  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  22828404 aa 22828403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 55147264 - 55147075
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  55147264 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 55147165  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  55147164 atgaataaggtcattacagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaataacaattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtaaaaa 55147075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 42099752 - 42099950
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42099752 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatggtgttttatcaatattacccttaattatttattgcggaaagagaaatatatgaaataagatattaaatg 42099851  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  42099852 aataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtttaatgtcaaaatgtgacaattaa 42099950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26906592 - 26906391
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26906592 ctgtcactttcaaggttcaatgcaacattaaatattgttttactaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 26906493  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  26906492 attaataaggtcattaaagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaatatcaattgttgattgttttagtttgtgtaaaatatcaaaatatgacaatt 26906393  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  26906392 aa 26906391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31862189 - 31862000
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||    
T  31862189 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttatttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatgttaa 31862090  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  31862089 atgaataaggtcattatagtaaaagtataattttttgcatcaaaagtagtaacaattattgattatcttagtttgtgtaaaatttcaaaa 31862000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19527411 - 19527222
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||                
T  19527411 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaa------------ 19527324  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19527323 atgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgtatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaatt 19527224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33755201 - 33755033
Alignment:
Q  32 atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33755201 atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagc 33755104  T
Q  132 ttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  33755103 ttattgcattaaaaggagtatcaattgttgattgtcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaa 33755033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 47251454 - 47251655
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47251454 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattattcttagctatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaa 47251553  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  ||| || | ||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  47251554 atgaataaggtcattataataaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgattattttggtttatgtaaaatgataaaatgtgacaatt 47251653  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  47251654 aa 47251655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38542478 - 38542278
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38542478 tgtcactttcaaaattcagtgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaaa 38542379  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  38542378 tgaataagttcattatagtaaaagtctaacttattgcatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaaatgacaatta 38542279  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  38542278 a 38542278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8741827 - 8741668
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8741827 ctgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgtggagagtgaaatatatgaaatgagatattaa 8741728  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8741727 atgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgtt 8741668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53125438 - 53125240
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||    
T  53125438 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagaaagaaatgtatgaaataagatattaaatg 53125339  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  53125338 aataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcataaaaaatagtaacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 53125240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 34464318 - 34464519
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34464318 ctgtcactttcatagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattatcattagttatttattgtgaagagataaatatatgaaataaaatattaa 34464417  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  34464418 atgaataaggtcattatattaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattattgattgttttaatttgtataaaatatcaaaatgtaacaatt 34464517  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  34464518 aa 34464519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 12252141 - 12252334
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||      |||||||||||| |||||||||    
T  12252141 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttat--atga------aatatatgaaataagatattaa 12252232  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||    
T  12252233 atgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtattatcaattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacagtt 12252332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 52677348 - 52677225
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52677348 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 52677249  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  52677248 atgaataaggtcattatagtaaaa 52677225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 33084519 - 33084715
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33084519 ctgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttgttgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 33084618  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||      ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  33084619 ataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattg-----attggtttctgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 33084713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Original strand, 37502064 - 37502261
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagt-tcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37502064 gtcactttcaaagggtcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatgtaatattaaa 37502163  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  37502164 tgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaat 37502261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 54231579 - 54231781
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacact-aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||| |||    
T  54231579 ctgtcatttttaaagttcaattcaacaattaaatgttattttactaatattatccttagttatttattatggaaagagaaatatattaaatgagatgtta 54231678  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  54231679 aatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaat 54231778  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  54231779 taa 54231781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 52061619 - 52061800
Alignment:
Q  21 tgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt 120  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52061619 tgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagt 52061718  T
Q  121 aaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  52061719 aaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatgattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 52061800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 47428570 - 47428714
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47428570 ctgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaa 47428669  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaa 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  47428670 atgaataatgtcattatagtaaaagtattacttattgcatcaaaa 47428714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 32239441 - 32239606
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  32239441 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatga-atattaa 32239539  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttg 170  Q
    |||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32239540 atgaataaagtc---atagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttg 32239606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35381617 - 35381421
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35381617 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 35381518  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  |||    ||||||||||||| ||||  ||   | ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35381517 tgaataaggtcattataataaaagtacaactta----atcaaaagtagtaacaatcattaactatcttaatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 35381422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 55702964 - 55703162
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55702964 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgataatttattaatattacccttaattatttattgcagagagagaaatatatgaaataagataataaatg 55703063  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  55703064 aataaggtcgttatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtaataacaattattgattgtcttggtatatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 55703162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 40411984 - 40412173
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  40411984 ctgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttatcaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaa 40412083  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  ||| || ||||||||||||    
T  40412084 atgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattacatcaaaaatagtaacaattattaattgtcttaatttatgtaaaatgtcaaaa 40412173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4201521 - 4201377
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4201521 ctgtcactttcaaagttcaattcaacattaaatgttgttttactaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaa 4201422  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||    
T  4201421 atgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcataaaaa 4201377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18781520 - 18781721
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18781520 ctgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatattcttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 18781619  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
     |||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  |||| ||| || ||||  |||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  18781620 ttgaataaggtaattataataaaagtatatcttattgcatcaaaagtaataataattattgattatcttaatttgtgtaaaatgtcgaaaaatgacaatt 18781719  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  18781720 aa 18781721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 44549684 - 44549834
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44549684 ctgtcgctttcaaagtttaatgcaacattaaatgctgttttatcaatattattcttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 44549783  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  44549784 atgaataaggtcattataataaaagtataacttattgtatcaaaagtagta 44549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47885179 - 47884989
Alignment:
Q  13 aagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg-aataaggt 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47885179 aagtttaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattggagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaaataaggt 47885080  T
Q  112 cattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47885079 cattatagtaaaagtcaaacttattgcatcaaaagtaataataattattgattgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 47884989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23719987 - 23719798
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  23719987 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttgctcatttattgtggagaaagaaatatatgaaaagaaatattaa 23719888  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||  | || |||  |||||| |||| || ||||||||||||    
T  23719887 atgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaa 23719798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 30939196 - 30939397
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  30939196 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttggatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaa 30939295  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |    |||| |||||||||| || || || |||   ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  30939296 attaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtactaccatttattgaccgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatatgacaatt 30939395  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  30939396 aa 30939397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 33809128 - 33809329
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33809128 ctgtcacattcaaagtttaatgcaatagtaaatgttgttttaccaatattacccctagatatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 33809227  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||| ||||||||| || ||| |    |||||||||||||||||| || || ||| |||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  33809228 attaataaggccattatagtcaatataaaaacaattgcatcaaaagtagtaacatttattgattgttttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 33809327  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  33809328 aa 33809329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36659630 - 36659429
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  36659630 ctgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttattaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttag 36659531  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || || |||||||||||||||  |||  ||||||||| |||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  36659530 ataaacaatgtcattatagtaaaagcataacttattgcattaaaaataaaaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaatt 36659431  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  36659430 aa 36659429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52257994 - 52257793
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  52257994 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatctttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaa 52257895  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  | || || || |||  |||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  52257894 atgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattgagtgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacagtt 52257795  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  52257794 aa 52257793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52057654 - 52057466
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  52057654 ctgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgaaatattaa 52057555  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaa 189  Q
    || |||||| | |||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||  | || ||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  52057554 ataaataagattattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattggattggtttgtgtaaaatgtcaaa 52057466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Original strand, 47093855 - 47094001
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  47093855 gtcactttcaaagttcaatgcatcattatatgttgttttaccaatattatcctttgttatttattgcgaagagagaaatatataaaatgatatgttaaat 47093954  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtag 149  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  47093955 taataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtag 47094001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 55935148 - 55935349
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  55935148 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattatggagagagaaatacatgaaataagatattaa 55935247  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||| |||||  |||||||||||| |||   |||||| || | ||  |||| || || |||  ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||    
T  55935248 atgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagtt 55935347  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  55935348 aa 55935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 27492400 - 27492512
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagt-tatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27492400 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatgcttagtcaatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatatta 27492499  T
Q  100 aatgaataaggtc 112  Q
    |||||||||||||    
T  27492500 aatgaataaggtc 27492512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26933974 - 26933780
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26933974 ctgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatcgcagagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 26933875  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgac 196  Q
    | ||||||||  |||||||||||| |||   ||||||  |||||||||||| || || ||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||    
T  26933874 a-gaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtgtcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgac 26933780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 19399575 - 19399763
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19399575 ctgtcactttcaaagttcaatgcaataataaa-gttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 19399673  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    || | |||||  |||||| ||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19399674 attactaaggctattatattaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 19399763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23623698 - 23623601
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23623698 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaagtatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatt 23623601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 29833129 - 29833001
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  29833129 ctgttacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatgttatcgttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgctaa 29833030  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  29833029 atgaataaaatcattatagtaaaagtata 29833001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 42629359 - 42629559
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||  | ||||||||    
T  42629359 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttatcaatattacccttaattatttaatgcggagagagaaatttatgaaacaaaatattaaa 42629458  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||| ||||  ||| ||||| || ||||  ||| || | ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  42629459 tgaaaaaggctattttagtacaagtataaattactgtaccaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaatta 42629558  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  42629559 a 42629559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Original strand, 41415049 - 41415171
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41415049 tgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagctatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaa 41415148  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||| ||||   ||||||||||||    
T  41415149 tgactaagactattatagtaaaa 41415171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44176777 - 44176591
Alignment:
Q  16 ttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt 115  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  44176777 ttcaatgcaaaattaaattttgttttaccaatattattcttgcttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaagttatt 44176678  T
Q  116 atagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||  | || ||   ||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||||||    
T  44176677 ataataaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgttttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaa 44176591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9220244 - 9220043
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  9220244 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaa 9220145  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |  |||||| ||||||||||| || |    |||| |||||||||||||  | || ||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9220144 attagcaaggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaagatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaatt 9220045  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  9220044 aa 9220043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 36750590 - 36750779
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  36750590 ctgtcacttacaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattgcggagagagaaatatataaaataatatattaa 36750689  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  36750690 atgattaaggctattatagtacaaatataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtaaaaa 36750779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 53691857 - 53691681
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  53691857 ctgtcactttcaaagttcaatacatcattaaatgttgttttatcaatattacccttaaatatttattgtggaaagagaaacatatgaaataaaatattaa 53691758  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtg 177  Q
    || || |||||||||||||||||| ||      |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  53691757 attaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtg 53691681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31984269 - 31984154
Alignment:
Q  87 aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtc 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  31984269 aaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtgttggtttgtgtaaaatgtc 31984170  T
Q  187 aaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| |||||||||||    
T  31984169 aaaaagtgacaattaa 31984154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 9834305 - 9834419
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9834305 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatcttattttacatatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatattaa 9834404  T
Q  101 atgaataaggtcatt 115  Q
    ||||||||| |||||    
T  9834405 atgaataagatcatt 9834419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18135253 - 18135052
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||   |||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  18135253 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaaatattaa 18135155  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatc-aaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||  | || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18135154 ataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaat 18135055  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  18135054 taa 18135052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49122463 - 49122262
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||   |||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  49122463 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaaatattaa 49122365  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatc-aaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||  | || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  49122364 ataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaat 49122265  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  49122264 taa 49122262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 30151713 - 30151914
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||| | ||||| |    
T  30151713 ctgtcattttcgaagttcaacgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttacttatttattgcgcatagagaaatatatgaaattaaatattga 30151812  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||   ||  || ||| |||||||| |||| || || |||  |||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||    
T  30151813 atgaataaggctattatagtaaaagagtatattgttgtatcaaaagcagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagagacaatt 30151912  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  30151913 aa 30151914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 36750218 - 36750326
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36750218 ctgtcactttcgaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattaatcttacttatttattgtggagagacaaatatatgaaatgaaatattaa 36750317  T
Q  101 atgaataag 109  Q
    |||||||||    
T  36750318 atgaataag 36750326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 56499817 - 56499614
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattg-ag-gagagataaatatatgaaatgagatatt 98  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  56499817 ctgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgtttttcttatattacccttatttatttattgcagagagagaaaaatatatgaaatgagatatt 56499718  T
Q  99 aaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaa 198  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| |||||  |  | ||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  56499717 aaatgattagggctattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaatagtaaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaaggtgacaa 56499618  T
Q  199 ttaa 202  Q
    ||||    
T  56499617 ttaa 56499614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 43888025 - 43888223
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  43888025 tgtcactttcaaagttcaatacatcattaa-tgttgttttatcaatattacccttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaa 43888123  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaat-atagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    | || |||||||||||||||||| | ||||   |||| ||| ||||||||| || || ||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  43888124 ttaacaaggtcattatagtaaaagtaatag-caattgtatc-aaagtagtaacatttattgattctcttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaatt 43888221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 54029139 - 54029263
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  54029139 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttacctttattaaccttgattatttattgtagagagataattatatgaaataagatattaa 54029238  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  54029239 atgatgaaggttattataggaaaaa 54029263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 202
Target Start/End: Original strand, 42645377 - 42645503
Alignment:
Q  76 ataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttg 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||| || |     
T  42645377 ataaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaataacaattattgattatcttagtata 42645476  T
Q  176 tgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  42645477 tgtaaaatgtcaaaatgtgataattaa 42645503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6091553 - 6091428
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6091553 tcactttcaaaattcaatgcaacaataaatattgttttttcaatattatttttagttatttattgtgcagagagaaatatatgaaataagatattaaatg 6091454  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    | ||| |  |||||||||||| ||||    
T  6091453 actaaagctattatagtaaaagtata 6091428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 31369842 - 31370027
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||| | ||  |||||    
T  31369842 ctgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgattaa 31369941  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtc 186  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||   || ||  |||||||||| || || || |||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  31369942 acaaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtaataacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtc 31370027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1146249 - 1146099
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1146249 tcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 1146150  T
Q  104 aataagg---tcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |  ||||   | ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  1146149 atgaaggtaattattatagaaaaaatatgaattgttgcatcaaaagtagta 1146099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 45725578 - 45725778
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||  |||||  ||||||||||    
T  45725578 tgtcatttttaaagttcaatgcaatattaaatattattttatcaatattatccttaattatttattacagagagagaaataattgaaacaagatattaaa 45725677  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||  ||| ||||||| ||||||||||||| || || |||  | | || ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  45725678 tgaatgaggttattattggaaaatgataatttattgtatcaaaagtagtaacatttattgactttatttgtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaatta 45725777  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  45725778 a 45725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 7242280 - 7242403
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  7242280 ctgtcgctttcaaagtttaatacaacattaaatattgttttatcaatattatctttagttatttattaatgagagaaatatatgtgaaatgagatattaa 7242379  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || |||||||  || |||||||||    
T  7242380 attaataaggctatcatagtaaaa 7242403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1615256 - 1615077
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| | ||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1615256 ctgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattaccattgattatttattgtagagaga--aatatatgaaatgagatattaa 1615159  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaa 182  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||||||    | |||||||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  1615158 atgatgaaggttattataggaaaaatatgaactgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 1615077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 6150735 - 6150885
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || || ||||| |||||||||||    
T  6150735 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaagtgagatattaa 6150834  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  6150835 atgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 6150885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 33755285 - 33755223
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatt 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33755285 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatt 33755223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 38865945 - 38866094
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||| || || |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38865945 ctgtcattttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttt-acctatattacccttggatatttgttgtagagagagaaatatatgtaatgagatattaa 38866043  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  38866044 atgattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta 38866094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 51347303 - 51347393
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatg 91  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  51347303 ctgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatg 51347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 34361097 - 34361272
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatg--agatatt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  | |||||    
T  34361097 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgtt---ttaccgatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaaaatatt 34361193  T
Q  99 aaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtg 177  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||  |    |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||    
T  34361194 aaattaataagaccattatagtaaaaatgaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtg 34361272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47596815 - 47596615
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | | | |||||||| ||||||||  |||| |||||||||  ||||| | |||||  |||||  | ||||||||    
T  47596815 tgtcattttcaaagttcaatgcaatattgagtattgttttatcaatattactcttaattatttattacggagacagaaataattgaaacaatatattaaa 47596716  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||| ||||||||||||| || || |||  | | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  47596715 tgaataaggttattattggaaaaggataatttattgtatcaaaagtagtaacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaatta 47596616  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  47596615 a 47596615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 42133078 - 42133200
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||  ||| || ||||    
T  42133078 ctgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttatcaatattatccttagatatttattgcggagtgagaaacatatgatgtgaaat-ttaa 42133176  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || |||||||  ||||||||||||    
T  42133177 atcaataaggctattatagtaaaa 42133200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1181104 - 1180954
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  || | ||| | ||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1181104 ctgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttggcattcttacctttgattatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 1181005  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| | |  || ||| |||||||||||||    
T  1181004 atgagaaaggttattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagtagta 1180954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23621962 - 23621905
Alignment:
Q  94 atattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23621962 atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagta 23621905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 41955877 - 41955776
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  41955877 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatataattttatcaatattatccttagatatttattgcagagagagaaaaatatgaaatgaaatattaa 41955778  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  41955777 at 41955776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1391373 - 1391225
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||   |||||||||    
T  1391373 tgtcactttcaaagttcaatgtaacactaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatgtgaaaaatgatattaaa 1391274  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | |||||  ||||||   |||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  1391273 taattaaggatattatacgtaaaacataagttattgtatcaaaagtagt 1391225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 18091284 - 18091432
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | || ||| |  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  18091284 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaa 18091383  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | |||||  |||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  18091384 taattaaggatattataattaaaacataagttattgcatcaaaagtagt 18091432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 9834463 - 9834522
Alignment:
Q  143 aaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9834463 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 9834522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 34603665 - 34603783
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  34603665 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatacccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaa 34603764  T
Q  101 atgaataaggtcattatag 119  Q
    || | |||||  |||||||    
T  34603765 ataattaaggatattatag 34603783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 36292672 - 36292846
Alignment:
Q  16 ttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||    
T  36292672 ttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacttttagatatttaatgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagacaatt 36292771  T
Q  116 atagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||| ||||| || |  | | || ||| ||||||||| || || ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  36292772 ataataaaagtaaaaataactgtatcgaaagtagtaacatttattgattgttttggttagtgtaaaatgtcaaaa 36292846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 37551867 - 37551765
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  37551867 tgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttgtgcctttattacccttggttatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaa 37551768  T
Q  102 tga 104  Q
    |||    
T  37551767 tga 37551765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 48087742 - 48087840
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  48087742 tcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatacccttagtaatttattgcagagagaaaaatatatgaaatatgatattaaat 48087840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 55430499 - 55430382
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||| || | || ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |     
T  55430499 tttcaaagttcattgtatcattaaatgtggttttacctatattatccttagatacttattgtgaagagataaatatatgaaattaagtattaaatgattg 55430400  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaa 125  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  55430399 aggttattataggaaaaa 55430382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Original strand, 8752182 - 8752270
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaat 90  Q
    ||||| ||||||| || || |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8752182 tgtcaatttcaaattttaaagcaacattaaatgttattttagcaatattacccttagttatttattaaggagagagaaatatatgaaat 8752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14949286 - 14949138
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  14949286 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaa 14949187  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | |||||  |||||||  |||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  14949186 taattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagt 14949138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 37394362 - 37394298
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttattta 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  37394362 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattattta 37394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 41813684 - 41813808
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttacc-aatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||    
T  41813684 tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccttttattacccttgattatttattgtagagagataagtgtatgaaataatatattaa 41813783  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  41813784 atgatgaaggttattataggaaaaa 41813808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 3802203 - 3802318
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||| | |||||||||    
T  3802203 gtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataaaatattaaat 3802302  T
Q  103 gaataaggtcattata 118  Q
    ||  ||||| ||||||    
T  3802303 gatgaaggttattata 3802318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 14090281 - 14090399
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  14090281 ctgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatacccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaa 14090380  T
Q  101 atgaataaggtcattatag 119  Q
    || | |||||  |||||||    
T  14090381 ataattaaggatattatag 14090399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48510065 - 48509872
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| | |||||| ||||||  ||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  48510065 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattactcttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgatta 48509966  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||   ||||||| ||||  |||  || ||| |||||||||||||  |||  ||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  48509965 agaatattatagaaaaatgataaatttttgtatcaaaagtagtaaaaatatttg-ttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaa 48509872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Original strand, 3036427 - 3036529
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3036427 tgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttattttaccgatattacccttagtaatttatt--atagagagaaatatatgaaataagatattaaa 3036524  T
Q  102 tgaat 106  Q
    |||||    
T  3036525 tgaat 3036529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Original strand, 38617858 - 38617947
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatg 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||| |||| |||||    
T  38617858 tgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattatccttatatatttattgcagagagaaaaacatattaaatg 38617947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 39308983 - 39309096
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    ||||| ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  39308983 aaagtacaatgtatcattaaatgtagttttacctatattatccttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagtattaaattattaaggt 39309082  T
Q  112 cattatagtaaaaa 125  Q
     ||||||| |||||    
T  39309083 tattataggaaaaa 39309096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34925544 - 34925444
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||  | | ||||||||  ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34925544 tgtcactttcaaaattcaatataacattaaatgttgttttaatattgttatccttgattatttattgcagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaa 34925445  T
Q  102 t 102  Q
    |    
T  34925444 t 34925444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 202
Target Start/End: Original strand, 47751609 - 47751772
Alignment:
Q  36 tgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttat 135  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||   | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||   ||||    
T  47751609 tgttttatcaatgttacccttagttattt---gcggagagagaaatatctgaaatgagatattaaatgaataaaactattatagtaaaagtatcaattat 47751705  T
Q  136 tgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || ||||||| ||||| || || |   || | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  47751706 tgtatcaaaaatagtaacatttataaattattttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacaattaa 47751772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19731523 - 19731452
Alignment:
Q  53 ccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19731523 ccttagatatttattgcggagagagaaacatttgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 19731452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 17978113 - 17978198
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaat 90  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| | | |||||||||    
T  17978113 tcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagacacatatgaaat 17978198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38009969 - 38009768
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||    ||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||  ||||||||    
T  38009969 ctgtcactttcaaagttcaatgtaactttaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattggagagagaaaagtatatgaaatatgatattaa 38009870  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |  || |  |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||   |    ||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38009869 ataatcaatgatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaatt 38009770  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38009769 aa 38009768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8457113 - 8456965
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| | |  ||| |  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  8457113 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaagggtgttcttcttataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaa 8457014  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | |||||  |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  8457013 taattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagt 8456965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 43086446 - 43086591
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  43086446 ctgtgactttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttttcctttattacccttgattatttactgcagagaga--aatatatgaaaagaaatattaa 43086543  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagta 148  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||    
T  43086544 atgatgaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagta 43086591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52677228 - 52677168
Alignment:
Q  142 aaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52677228 aaaagtagcatcaattattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 52677168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 52978421 - 52978306
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||||| ||| | | ||| ||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52978421 tttcaaagttcaatttaatattaaatgttgttctacaagt-ttaccctttattatttattgtgtagagagaaatatatgaaaagagatattaaatgaata 52978323  T
Q  108 aggtcattatagtaaaa 124  Q
    |||  ||||||| ||||    
T  52978322 aggctattatagaaaaa 52978306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51655068 - 51654875
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||| | |||| | |||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  51655068 tttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaactattaaattatta 51654969  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||| |  || | ||  || | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  51654968 aggttattacagtaaaaagataaattgttgtatcaaaagtag-aaaaagtatttattattttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacgattaa 51654875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 25098422 - 25098341
Alignment:
Q  29 taaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25098422 taaatgttgttttattaatattacccttgtttatttattacggagagagaaatgtatgaaataagatattaaataaataagg 25098341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27654947 - 27654746
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaac-actaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||  | |||||  ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  27654947 tgtcactttcaaagttcaacacaaatattaaattatgtgttatctatattacccttagttatttattgcagattgataaatatatgaaatgaaatattaa 27654848  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||  || |  ||||||| ||||  |||  || ||| |||||||||||||  | || ||  ||||||| ||||||| |||| || ||||  ||||||||    
T  27654847 atgatgaaagctattatagaaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatttattagttgtcttagtttgtgtaaaaagttaaaaaatgacaatt 27654748  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  27654747 aa 27654746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 27918643 - 27918747
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||   ||||| ||||||||||||  |||||| ||    
T  27918643 ctgtcactttcaaagttcaatcaaatattaaatgttg-tttatcaatattaccattagttatatattgcaaagagagaaatatatgaaacaagatataaa 27918741  T
Q  101 atgaat 106  Q
    ||||||    
T  27918742 atgaat 27918747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 56486427 - 56486551
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||| | |||||| | |||  |||||||||   | | | |||||||| |||||| ||||||||    
T  56486427 tgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttggtttatctatattacctttaaatatttattgtaaataaagaaatatataaaatgaaatattaaa 56486526  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaat 126  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  56486527 tgattaaggttattgtagtaaaaat 56486551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Original strand, 20087228 - 20087325
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 109  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||| | ||||||||||| ||||    
T  20087228 aaagtttaatgcaatgttaaatgttgttttattaatgttattcttatttatttattgcggagagagaaatatagaaaataatatattaaatgagtaag 20087325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29832432 - 29832362
Alignment:
Q  132 ttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |  | |||||||||||| | |||||||||    
T  29832432 ttattgcatcaaaagttgtaacaattattgattgtcttggtataagtaaaatgtcaaaaggagacaattaa 29832362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 6129008 - 6129132
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || |||||  |||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  6129008 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataatacccttatctatttattgtagagagagaaata-atggaatgaaataataaa 6129106  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaata 127  Q
    ||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  6129107 tgattaagggtattgtagaaaaaata 6129132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23621641 - 23621604
Alignment:
Q  148 agtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgt 185  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23621641 agtattaattgttgattgtcttggtttgtgcaaaatgt 23621604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30152031 - 30151934
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | || ||| |  ||||| | ||||||||  |||| | |||||||||||||  |||||||    
T  30152031 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttattcctataatgcccttaataatttattgcagagatagaaatatatgaaatatgatatta 30151934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 1615308 - 1615268
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt 41  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  1615308 ctgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgtttt 1615268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13435287 - 13435247
Alignment:
Q  78 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  13435287 aaatatatgaaatgagatattaaattaataatgttattata 13435247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10812237 - 10812438
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10812237 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 10812336  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10812337 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 10812436  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  10812437 aa 10812438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 26342618 - 26342819
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26342618 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 26342717  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26342718 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaacgtgacaatt 26342817  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  26342818 aa 26342819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15183205 - 15183005
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15183205 tgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 15183106  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15183105 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 15183006  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  15183005 a 15183005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 34399243 - 34399441
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34399243 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 34399342  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  34399343 aataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaatgtgataattaa 34399441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 3363622 - 3363823
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3363622 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 3363721  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3363722 atcaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaatt 3363821  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  3363822 aa 3363823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15893785 - 15893584
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15893785 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 15893686  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15893685 atgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 15893586  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  15893585 aa 15893584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 479178 - 478977
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  479178 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 479079  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  479078 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 478979  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  478978 aa 478977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30264807 - 30264606
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30264807 ctgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 30264708  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30264707 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 30264608  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  30264607 aa 30264606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 41885663 - 41885861
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41885663 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 41885762  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41885763 atgaataaggtcattacagtaaaagtacagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaat 41885861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14295962 - 14295761
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14295962 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 14295863  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14295862 atgaataaggtcattatagtaaaagtataccttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 14295763  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  14295762 aa 14295761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19594389 - 19594589
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19594389 ctgtcactttcaaa-ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccatagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 19594487  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19594488 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattatctttgtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 19594587  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  19594588 aa 19594589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 10263794 - 10263993
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagtt-atttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10263794 ctgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatta 10263893  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10263894 aatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt-ttggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaat 10263992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38186257 - 38186059
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38186257 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatgagatattaa 38186158  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  38186157 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaaataatatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaat 38186059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 14308434 - 14308632
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308434 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatatcgttttatcaattgta--cttaattatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 14308531  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14308532 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 14308631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 34357217 - 34357417
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34357217 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttactgtggaaagagaaatatataaaatgagatattaaa 34357316  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34357317 tgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaaatagtataaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcgaaatgtgacaatta 34357416  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  34357417 a 34357417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36375609 - 36375812
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatc--cttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36375609 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatagtattatcttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatt 36375708  T
Q  99 aaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36375709 aaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaggtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaa 36375808  T
Q  199 ttaa 202  Q
    ||||    
T  36375809 ttaa 36375812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25558388 - 25558193
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25558388 ctgtcactttcaaagtt-aatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagata--tatatgaaatgagatattaa 25558292  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25558291 atgaataaggtcattatagtaaaagtctagcttattgtatcaaaagtagtatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaat 25558193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11222521 - 11222320
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11222521 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 11222422  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11222421 atgaataaggtcattatattaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 11222322  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  11222321 aa 11222320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11560252 - 11560051
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11560252 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgcaatgagatattaa 11560153  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| | |||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  11560152 atgaataagataattatagtaaaagtacagcttattacatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgataatt 11560053  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  11560052 aa 11560051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 37093488 - 37093688
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37093488 ctgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaatgagatattaa 37093587  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37093588 atgaataa-gtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 37093686  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  37093687 aa 37093688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15677496 - 15677300
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15677496 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaa 15677397  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  15677396 atgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaa-tgttgattgtcttggtttgtg----atgtcaaaatgtgacaatt 15677302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28145777 - 28145575
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28145777 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaattatatgaaatgagatattaa 28145678  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtt--tgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaa 198  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |  ||||| ||||||||||||||    
T  28145677 atgaataatgtcattatagt-aaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttatataaaaaatatcaaaatgtgacaa 28145579  T
Q  199 ttaa 202  Q
    ||||    
T  28145578 ttaa 28145575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 44360472 - 44360672
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44360472 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatat-acccttaaatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 44360570  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44360571 atgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 44360670  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  44360671 aa 44360672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36405047 - 36404845
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattga-ggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36405047 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttatttacggatagataaatatatgaaatgagatatta 36404948  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  36404947 aatgaataaggttattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggttcatgtaaaatatcaaaatgtgacaat 36404848  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  36404847 taa 36404845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 14288469 - 14288668
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14288469 ctgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttatcaatattgtccttaattatttatcgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 14288568  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14288569 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtatcaattattgattgtctt--tttgtataaaatatcaaaatgtgacaatt 14288666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4883641 - 4883842
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4883641 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 4883740  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||  |||  | | || |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4883741 atgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaatcattggctatattagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 4883840  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  4883841 aa 4883842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 9706825 - 9707026
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9706825 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattatggagagataaatatataaaatgagatatcaa 9706924  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9706925 atgaataaggttattatagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 9707024  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  9707025 aa 9707026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38072419 - 38072240
Alignment:
Q  13 aagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38072419 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagttc 38072320  T
Q  113 attatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaa 198  Q
    |||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  38072319 attat------aatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatatgacaa 38072240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4654757 - 4654958
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4654757 ctgtcacttgcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttagttatttatagcggagagagaaatgtatgaaatgagatattaa 4654856  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | | ||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  4654857 atgaataaggtcattatagtaaaaacacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgagacaatt 4654956  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  4654957 aa 4654958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 14541369 - 14541570
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14541369 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgagatattaa 14541468  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||    ||| | |||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  14541469 atgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtatcgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaatt 14541568  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  14541569 aa 14541570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13965645 - 13965846
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  13965645 ctgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatataccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatgttaa 13965744  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13965745 atgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattggatcaaatgtaaaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 13965844  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13965845 aa 13965846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13753993 - 13754194
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  13753993 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgaaatattaa 13754092  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaata-tagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||| || ||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13754093 atgaataaggctattatagtaaaagtagtaaattattgtatcaaaagtagtaacatttaatgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa-gtgacaat 13754191  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  13754192 taa 13754194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13001116 - 13000915
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13001116 ctgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatcttgttttatcagtattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 13001017  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||  ||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||  |||||| ||||||||| || || ||||||    
T  13001016 ataaataaggctattatagcaaaaatattaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcacaaagtaacaatt 13000917  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13000916 aa 13000915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13215431 - 13215632
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  13215431 ctgtcactttcgaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatatatgaaattagattttaa 13215530  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| || || |||  ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13215531 attaatagggttattatagtaaaaatacatatcattgtatcaaaagtagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaatt 13215630  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13215631 aa 13215632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 9370012 - 9370213
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  9370012 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaagtgttgttttatcaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 9370111  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||  | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  9370112 attaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattaatggtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 9370211  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  9370212 aa 9370213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35158556 - 35158355
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||| |||    
T  35158556 ctgtcactttcgaaattcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttgcttatttactgtggagaaagaaatatatgaaatgaaatagtaa 35158457  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||  | || |||  ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  35158456 atgaataaggttattacagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcatgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 35158357  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  35158356 aa 35158355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 2012899 - 2013027
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2012899 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaa 2012998  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    || | |||||| |||||||||||| ||||    
T  2012999 attactaaggttattatagtaaaagtata 2013027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31025145 - 31024956
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31025145 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattacccttagttatttattatggagagataaatatatgaaataagatattaa 31025046  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| |||||  |||||||||||| |||   |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31025045 atgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaa 31024956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 43077330 - 43077531
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  43077330 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaataaaatattaa 43077429  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||| || |||||||||| ||      |||| |||||||||| || || || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  43077430 attaataaggccaatatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtaataacacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaatt 43077529  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  43077530 aa 43077531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3376405 - 3376281
Alignment:
Q  78 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  3376405 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgttattataataaaaatatagcttattatattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttgtg 3376306  T
Q  178 caaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  3376305 taaaatgtcaaaatgtgacaattaa 3376281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32854985 - 32854862
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  32854985 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 32854886  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || ||||||| |||| ||||||||    
T  32854885 attaataaggccattgtagtaaaa 32854862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 6013513 - 6013621
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6013513 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaataagatattaa 6013612  T
Q  101 atgaataag 109  Q
    |||| ||||    
T  6013613 atgactaag 6013621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 32674252 - 32674380
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgaga----tatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||    
T  32674252 tcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccgtagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagaggagtatta 32674351  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatat 128  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32674352 aatgaataaggctattatagtaaaaatat 32674380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 8443729 - 8443852
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt-accaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  8443729 ctgtcactttcaaagttcaatgcaa-attaaatgttgtttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacaaatgaaatgaaatatta 8443827  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  8443828 aattaataaggtcattatagtaaaa 8443852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13849920 - 13849797
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  13849920 ctgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattacctttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 13849821  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  13849820 attaacaaggtcattatagtaaaa 13849797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 1395603 - 1395791
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1395603 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgtt-ttttaccaacattacccttagttaattattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaa 1395701  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    | || ||||   |||||||||||||||||  |||||| || | ||  |||| || || ||   ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1395702 aagactaagactattatagtaaaaatataaattattgtataagaaaaagtaacatttattaagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaa 1395791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31011905 - 31011722
Alignment:
Q  17 tcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta 116  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||| ||||| |||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  31011905 tcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacctttatttatt-attgtggagagagaaatgtatgtaataagatattaaataaacaaggttatta 31011807  T
Q  117 tagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||| | || |||| ||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  31011806 tagtaaaaatagaatt-attgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaa 31011722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34884740 - 34884547
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||| ||| ||| ||| ||||||||| | | |||||||     
T  34884740 tcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttatcaatattacctttagatgtttattgcggaaagaaaaacatatgaaataaaacattaaatt 34884641  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    ||||||||||||||||||||| || |    |||| |||||||||||||  | || ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34884640 aataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaca 34884547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32543992 - 32543885
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32543992 ctgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacctttagttatttattacagagaaaaaaatatatgaaatgagatattaa 32543893  T
Q  101 atgaataa 108  Q
    ||||||||    
T  32543892 atgaataa 32543885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34309255 - 34309149
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34309255 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatgttatcattgcttattcattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 34309156  T
Q  101 atgaata 107  Q
    || ||||    
T  34309155 attaata 34309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 30544558 - 30544682
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  30544558 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttactgtagagggataagtatatgaaataagatattaa 30544657  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    ||||| || || ||||||| |||||    
T  30544658 atgaagaaagttattataggaaaaa 30544682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1259724 - 1259633
Alignment:
Q  111 tcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  1259724 tcattatggtaaaattatagtttattgcgtcaaaagtagtatcaattgttgattctcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaa 1259633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 14284167 - 14284241
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagaga 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14284167 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagaga 14284241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 838275 - 838126
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  838275 ctgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctattatgtccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaa 838176  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    || | ||| |  |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  838175 ataattaaagatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagt 838126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28967435 - 28967286
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||| |  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  28967435 tgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttatcgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaa 28967336  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||| ||   || ||||||||||| |||||    
T  28967335 tgataaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaaatagta 28967286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Original strand, 37077209 - 37077358
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||| | || |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37077209 tgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttattttgtcattattaccattggttatttattgcagatagagaaatatatgaaatgagatattaaa 37077308  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    | |  ||||| ||||||| ||||| |||  |||||| || ||||||||||    
T  37077309 ttatgaaggttattatagaaaaaagataaattattgtataaaaagtagta 37077358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 202
Target Start/End: Original strand, 14284247 - 14284322
Alignment:
Q  126 tatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14284247 tatagcttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtg-taaatgtcaaaatgtgacaattaa 14284322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 25187332 - 25187241
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatga 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25187332 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattactcttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatga 25187241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 38148240 - 38148137
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38148240 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttttcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaatgagatattaa 38148141  T
Q  101 atga 104  Q
    ||||    
T  38148140 atga 38148137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7529907 - 7529759
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatg-agatattaaat 102  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  7529907 tcactttcaaagttcaacacaatattaaatgatgtgttacctatattacccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaaaatattaaat 7529808  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||  ||||  ||||||| ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  7529807 gatgaaggctattataggaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagta 7529759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 29041988 - 29042108
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  29041988 ctgtcactttcaaagtccaatgcaacattagatattgttttaccaatattacccgtagatatttatt--gcagagagaaacatatgaaatga-aaattaa 29042084  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || ||||| |||||||| ||||||    
T  29042085 attaataacgtcattattgtaaaa 29042108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 37116798 - 37116690
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||  ||||||| ||| | | ||||| | |||||||    
T  37116798 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatcttacccttagataattattacggagagaaaaacacaagaaataaaatattaa 37116699  T
Q  101 atgaataag 109  Q
    || ||||||    
T  37116698 ataaataag 37116690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Original strand, 45065115 - 45065311
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||   ||||| || || ||||||| |||||||||||||     
T  45065115 actttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtaaagagagaagtaaatgaaataagatattaaatgat 45065214  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     || || ||||||| ||||| ||   || |||||||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||||||||    
T  45065215 gaatgttattatagaaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaaatatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaattcaaaagtgacaattaa 45065311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33947633 - 33947485
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | || ||| | |||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  33947633 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatataaaatatgatattaaa 33947534  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | |||||  |||||||  |||| |||  |||||| ||||||| ||||    
T  33947533 taattaaggatattataggcaaaacataaattattgtatcaaaaatagt 33947485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Original strand, 42088933 - 42089033
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  42088933 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaa 42089032  T
Q  102 t 102  Q
    |    
T  42089033 t 42089033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Original strand, 36824486 - 36824585
Alignment:
Q  58 gttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 157  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |  |  ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  36824486 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaataaataagatcattacagtaaaagtgcaacttattgcattaaaaatagtaacaatt 36824585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 2991852 - 2991937
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaat 90  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| | | |||||||||    
T  2991852 tcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagacacatatgaaat 2991937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 25787382 - 25787566
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||   |||||| |||||| |||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  25787382 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgatta 25787481  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||  ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||||||          ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25787482 aggatattataggaaaaggataaattgttgtatcaaaagta----------tttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaa 25787566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34262915 - 34262826
Alignment:
Q  113 attatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||    
T  34262915 attatagtaaaaatatatattattatatcaaaagtagtaacaattattgaatgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaattgacaattaa 34262826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 928229 - 928088
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||  ||| || || |||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||  | ||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  928229 tttcaaagtctaatacatcattaaatgttgttttacatatattattcttaaatatttatt--gtagagagaaatatattaaatgaagtattaaatgatta 928132  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||| ||||||| ||||| |||  || || |||||||| |||||    
T  928131 aggttattataggaaaaagataaattgttacatcaaaaatagta 928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4952840 - 4952700
Alignment:
Q  62 tttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttg 161  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |    || | || |||||||||| || || |||    
T  4952840 tttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccgttatagtaaaagtaaaaacaatagtattaaaagtagtaacatttattg 4952741  T
Q  162 tttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     |  | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  4952740 atcattttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 4952700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Original strand, 34721564 - 34721628
Alignment:
Q  65 attgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  34721564 attgcggagagagaaatatatgaaataatatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 34721628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 37354027 - 37354176
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| || |||    ||||||| |||||||   |||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  37354027 ctgtcactttcaaagttcaacgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatataaaatatgatattaa 37354126  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    || | ||| |  |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  37354127 ataattaaagatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagt 37354176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 37660182 - 37660222
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt 41  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37660182 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 37660222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 42263707 - 42263619
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaat 90  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  42263707 tgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 42263619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Original strand, 8443874 - 8443917
Alignment:
Q  159 ttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8443874 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 8443917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 125
Target Start/End: Original strand, 37660845 - 37660899
Alignment:
Q  71 gagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  37660845 gagagagaaacatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaaa 37660899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 7e-88; HSPs: 96)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19349576 - 19349377
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349576 gtcactttcaaagttgaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 19349477  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19349476 gaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcagaatgtgacaattaa 19349377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35531494 - 35531293
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  35531494 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagataaatatatgaaataggatatcaa 35531395  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35531394 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 35531295  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  35531294 aa 35531293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 30686449 - 30686650
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30686449 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 30686548  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  30686549 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaacgtgacaatt 30686648  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  30686649 aa 30686650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 45368126 - 45368327
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45368126 ctgtcactttcaaagttcaatgaaacattgaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 45368225  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45368226 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaatt 45368325  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  45368326 aa 45368327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 13566716 - 13566918
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatt---tattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13566716 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatta 13566815  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13566816 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaat 13566915  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  13566916 taa 13566918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 43500545 - 43500745
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43500545 tgtcacttttaaagttcaatgcagtattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 43500644  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43500645 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 43500744  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  43500745 a 43500745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20605823 - 20605622
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20605823 ctgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcattggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 20605724  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20605723 atgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaatt 20605624  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  20605623 aa 20605622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38648495 - 38648696
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  38648495 ctgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatatcaa 38648594  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38648595 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 38648694  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38648695 aa 38648696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 1024594 - 1024795
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1024594 ctgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattgtcgttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 1024693  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1024694 atgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 1024793  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  1024794 aa 1024795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21927895 - 21927696
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  21927895 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaa 21927796  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  21927795 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtc--aatgtgacaatt 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37437252 - 37437051
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  37437252 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggagataaaaatatattaaatgagatattaa 37437153  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37437152 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtggtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaatt 37437053  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  37437052 aa 37437051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37609500 - 37609302
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37609500 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 37609401  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  37609400 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaa---agtatcaattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 37609304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13507808 - 13508009
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13507808 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 13507907  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  13507908 attaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataatt 13508007  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13508008 aa 13508009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13514996 - 13515197
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13514996 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 13515095  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  13515096 attaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataatt 13515195  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13515196 aa 13515197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35483978 - 35483779
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35483978 ctgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagaga--aatatatgaaatgagatattaa 35483881  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35483880 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaataatatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaatt 35483781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 1429322 - 1429523
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1429322 ctgtcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatacaaaatgagatattaa 1429421  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1429422 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcatttgtagattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 1429521  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  1429522 aa 1429523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32994668 - 32994479
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32994668 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 32994569  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32994568 atgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 32994479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45226776 - 45226575
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45226776 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgtggaaagagaaatatatgaaatgagatattaa 45226677  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45226676 atgaataaagtcattataataaaagtatagcttattacatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtataaaatgtcaaaatgtgacaatt 45226577  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  45226576 aa 45226575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 50825771 - 50825571
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50825771 ctgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 50825672  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  50825671 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaa-tgttgattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaatt 50825573  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  50825572 aa 50825571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18034025 - 18033824
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18034025 ctgtcactttcaaagttcaatccaacattaaatattgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 18033926  T
Q  101 atgaataaggtcattatagta-aaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  18033925 atgaataaggtcattatagtaaaaaatatagcttattgcatcaaaatgagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatg-aaaaatgtgacaat 18033827  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  18033826 taa 18033824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49908381 - 49908177
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  49908381 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatcga 49908282  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaat---atagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  49908281 attaataaggtcattatagtaaaaatataatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagttcgtataaaatgtcaaaatgtgata 49908182  T
Q  198 attaa 202  Q
    |||||    
T  49908181 attaa 49908177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7782989 - 7783189
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||    
T  7782989 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttgttttatcaatattgttcttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataa-atgttaa 7783087  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7783088 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagttaattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaatt 7783187  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  7783188 aa 7783189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12231242 - 12231069
Alignment:
Q  29 taaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatat 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12231242 taaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtac 12231143  T
Q  129 agtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12231142 agcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 12231069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 28679059 - 28679260
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28679059 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtctttagttatttattgcggagagagaaatatatcaaatgagatattaa 28679158  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  28679159 atgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtataaattgttaattgtcttaatttatataaaatgtcaaaatgtgataatt 28679258  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  28679259 aa 28679260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31588938 - 31588738
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31588938 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagata-taa 31588840  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  31588839 atgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtattaatttttgattatcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaatt 31588740  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  31588739 aa 31588738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 12124683 - 12124883
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12124683 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 12124782  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12124783 tgaataagattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagcatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatggcaaaatgtgacaatta 12124882  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  12124883 a 12124883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 202
Target Start/End: Original strand, 1677258 - 1677437
Alignment:
Q  23 caacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1677258 caacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcaatatagtaa 1677357  T
Q  123 aaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1677358 aagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 1677437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 35255525 - 35255725
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35255525 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatgttaaa 35255624  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  35255625 tgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaatta 35255724  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  35255725 a 35255725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 44182798 - 44182997
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44182798 ctgtcactctcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taa 44182896  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  44182897 ataaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattatatc-aaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaatt 44182995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19929663 - 19929464
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19929663 gtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttaccaatattattctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaat 19929564  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  19929563 taataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaa 19929464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13699212 - 13699413
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13699212 ctgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatactatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 13699311  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||||||| || ||||||||||||| || |||||    
T  13699312 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatggcaatt 13699411  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  13699412 aa 13699413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 49497202 - 49497391
Alignment:
Q  13 aagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtc 112  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49497202 aagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtc 49497301  T
Q  113 attatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  49497302 attatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaataatatcaattgttaattgtcttagtttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaa 49497391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Original strand, 29830828 - 29830992
Alignment:
Q  38 ttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattg 137  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29830828 ttttaccaatattggtcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg 29830927  T
Q  138 catcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29830928 catcaaaagtaatatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 29830992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 52749055 - 52749243
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  52749055 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttatatcaatattatccttagttatttattgtggagaga--aatatatgaaataagatattaa 52749152  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaat 191  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  52749153 atgaataagattattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgattcgtgtaaaatgtcaaaat 52749243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8464401 - 8464255
Alignment:
Q  56 tagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaa 155  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8464401 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 8464302  T
Q  156 ttgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8464301 ttgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 8464255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 43952826 - 43953017
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  43952826 ctgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttacaaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgcgatgttaa 43952925  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||          || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43952926 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtag----------tgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 43953015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 44818499 - 44818645
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44818499 tttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 44818598  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatca 154  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44818599 aggtcattacagtaaaactatagcttattgcatcaaaagtagtatca 44818645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10675940 - 10676141
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10675940 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctaagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatattaa 10676039  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||  |||  | | ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  10676040 ataaataaggttattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtaataacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataatt 10676139  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  10676140 aa 10676141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51972479 - 51972279
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51972479 tgtcactttcaaaattcaatgcaacatgaaatattattttaccaatattatcattagctatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaa 51972380  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  51972379 tgaataatatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaactattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaatta 51972280  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  51972279 a 51972279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2059976 - 2059810
Alignment:
Q  36 tgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttat 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||    
T  2059976 tgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtgaaagtataacttat 2059877  T
Q  136 tgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2059876 tgcatcaaatgtagtaacaattattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 2059810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 32348020 - 32348216
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32348020 cactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgagatattaaatga 32348119  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||    ||||| |||||||||||||  | || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32348120 ataaggttattctagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaa-gtgacaattaa 32348216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30702486 - 30702288
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||| |||||     
T  30702486 tcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtagagaaaaaaatatataaaatgagataataaata 30702387  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||| || || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30702386 aataatgttattatagtaaaagtataaaatattgtatcaaaagtggtaacatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 30702288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35700574 - 35700373
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35700574 ctgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaa 35700475  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||   |||||  ||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||  ||||||||    
T  35700474 atgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattatatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaatt 35700375  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  35700374 aa 35700373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51974370 - 51974169
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  51974370 ctgtcattttcgaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattatccttgcttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 51974271  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||  | || |||  ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  51974270 atgaataaggttattatagtaaaagtatacattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 51974171  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  51974170 aa 51974169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 9127706 - 9127908
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagata--aatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||| ||||||| |  |||||||||| ||| ||||||    
T  9127706 tgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgtttttccagtattatccttgctcatttattgtggagagagagaaatatatgaagtgaaatatta 9127805  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9127806 aatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaat 9127905  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  9127906 taa 9127908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39412676 - 39412509
Alignment:
Q  35 ttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagttta 134  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39412676 ttgttttaccaatattatcttttgttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaaatataactta 39412577  T
Q  135 ttgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  39412576 ttgcatcaaaagtagaaacaattattgattgttttggtttgtataaaatgttaaaaagtgacaattaa 39412509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32168511 - 32168310
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  32168511 ctgtcagtttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 32168412  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || |||||||||||||||||| ||      |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  32168411 attaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtaccatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaatt 32168312  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  32168311 aa 32168310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38597629 - 38597830
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38597629 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttagttatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaa 38597728  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  38597729 atgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtt 38597828  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38597829 aa 38597830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10506851 - 10507050
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10506851 ctgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcgatattacccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaa 10506948  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||  | || ||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||  ||||||||    
T  10506949 atgaataaggctattatagtacaagtatcaattattgcatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaatt 10507048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 51613449 - 51613650
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  51613449 ctgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattactcttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaa 51613548  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || |||||||||||||||||| ||      |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  51613549 attaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaagtgacaatt 51613648  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  51613649 aa 51613650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19455597 - 19455410
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||    ||||||||    
T  19455597 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatctatgaaacataatattaaa 19455498  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||||   ||| |||||||  ||||  |||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19455497 tgaataagactattttagtaaaggtataaattattgtatcaaaagtagtaac-attattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 19455410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31487964 - 31487777
Alignment:
Q  14 agttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  31487964 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attgtagaaagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggtta 31487866  T
Q  114 ttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |  | || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31487865 ttatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 31487777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24781916 - 24781810
Alignment:
Q  18 caatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattat 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24781916 caatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattat 24781817  T
Q  118 agtaaaa 124  Q
    |||||||    
T  24781816 agtaaaa 24781810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 9362011 - 9362212
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9362011 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaataagatattaa 9362110  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  ||||  | || |||  ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||    
T  9362111 atgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaaaatttattgagtgtcttgatttgtataaaatgtcaaaaagtgacagtt 9362210  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  9362211 aa 9362212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52649925 - 52649727
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  52649925 tcactttcaaagttcaaagcaatattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattacagagagtgaaatatatgaaacaagatattaaatg 52649826  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||| |||  ||||| | ||||  |||  |||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  52649825 aatgaggctattattggaaaaggatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgattagtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 52649727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 48508172 - 48508372
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48508172 tgtcactttacacagttcaatgcaacattaaaagttattttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaa 48508270  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||  | || || ||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48508271 ataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtaacaacatttattgattattttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaatt 48508370  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  48508371 aa 48508372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15660625 - 15660819
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15660625 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaa 15660724  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    |||| ||||   |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  | || || || |||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  15660725 atgactaagactattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtga 15660819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4101108 - 4100919
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4101108 ctgtcacttttaaagttcaatgtagcattaaatgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatgaaatattaa 4101009  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    || |||||| |||||||||||||| || |    |||| |||||||||| || || || ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  4101008 attaataagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaa 4100919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 18344365 - 18344565
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18344365 tgtcaattttaaaattcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgtgcagagagaaatatatgaaatgagataataaa 18344464  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||| |||  | || ||  || | ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  18344465 caaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatcaaaagtggtaatatttattaattatattgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatta 18344564  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  18344565 a 18344565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 202
Target Start/End: Original strand, 5598145 - 5598284
Alignment:
Q  53 ccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtat 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||     
T  5598145 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaa----------attgcatcaaaagtagtaa 5598234  T
Q  153 caattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5598235 taattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 5598284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 12721485 - 12721679
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12721485 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaagatttcccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaata 12721584  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||  || |    |||| |||||||||||||  | || ||  |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||    
T  12721585 aggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttatttattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaa 12721679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36318391 - 36318591
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||| |||| |||||||||| | |||||    
T  36318391 ctgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttatttatttattacaaagagaaaaat-tatgaaatgacacattaa 36318489  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |  |||||||| |||||||||||  | ||  |||||| ||||||||||||  || || |||  ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  36318490 acaaataaggttattatagtaaaggtgtaaattattgtatcaaaagtagtgacatttattgaatgtattggtttgtgtaaattgtcaaaaagtgacaatt 36318589  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  36318590 aa 36318591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37735338 - 37735137
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  37735338 ctgtcactgtcaaagttcaatgcaaaattaaatattgttttaccaacattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 37735239  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||  ||||||||||||  | |    |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||| | |||| |||| ||||    
T  37735238 attaataaggctattatagtaaaatcaaaaacaattgtatcaaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatttgaaaaagtgataatt 37735139  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  37735138 aa 37735137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40926942 - 40926751
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||       
T  40926942 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaacgatgttttatcaatattactctta-ttatttatggcggagagagaaatatatgaaacgaaatat--- 40926847  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
          |||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40926846 ------aaggtcgttatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 40926753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 1427717 - 1427840
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1427717 ctgtcattttcaaaggtcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatccttagttatttattgcaaagagagaaatatatgaaataagatattaa 1427816  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    |||| ||| |  ||||||||||||    
T  1427817 atgactaatgctattatagtaaaa 1427840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1039566 - 1039445
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  1039566 ctgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattacacttagatatttattg-caagagaaaaacatatgaaatgaaatattaa 1039468  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaa 123  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  1039467 attaataaggtcattatagtaaa 1039445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1046472 - 1046351
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  1046472 ctgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattacacttagatatttattg-caagagaaaaacatatgaaatgaaatattaa 1046374  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaa 123  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  1046373 attaataaggtcattatagtaaa 1046351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 46096599 - 46096785
Alignment:
Q  16 ttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  46096599 ttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttagttattaattatggggagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataagattatt 46096698  T
Q  116 atagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     |||||||| |||    ||||| |||||||||||||  | || ||| |||| ||| | |||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  46096699 gtagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattgatgtgtataaaatatcaaaaagtgacaattaa 46096785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38818124 - 38817996
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  38818124 ctgtcacttttaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttagcaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatgtgaaataatatattaa 38818025  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  38818024 atgaataaggctgttatagtaaaagtata 38817996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31570836 - 31570653
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| || |||| |||||| | ||  |||||    
T  31570836 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttacttatttatcacggagtgagaaatgtatgaagttagtgattaa 31570737  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatg 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||||||||| || || |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  31570736 atgaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatg 31570653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 42800146 - 42800345
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  42800146 ctgttactttcaaa-ttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatccttatatatttatt--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 42800242  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaat-atagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    || ||||| | |||| |||||||| | | |    |||| ||||| ||||||| || || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42800243 attaataatgccattttagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaagagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaat 42800342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 48265221 - 48265087
Alignment:
Q  14 agttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |    
T  48265221 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attatggagagagaaatatatgtaatgagacattaaataaataaggtta 48265123  T
Q  114 ttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtag 149  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  48265122 ttatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtag 48265087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 43808939 - 43809143
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt-accaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgaga-----tat 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |     |||    
T  43808939 tcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttttaccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatactgtat 43809038  T
Q  98 taaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| || |  | |||| |||||||| |||| || || ||| |||||||  ||| || ||||||| |||| ||||||    
T  43809039 taaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagcagtaacacttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgaca 43809138  T
Q  198 attaa 202  Q
    |||||    
T  43809139 attaa 43809143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 17013460 - 17013648
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgag---at-a 96  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||| | ||   || |    
T  17013460 ctgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatctttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgaatga 17013559  T
Q  97 ttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgt 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||   || ||  ||||||||||||| || || |||  ||| |||||||||| |||||||    
T  17013560 ttaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcgttgttctatcaaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgt 17013648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 1038121 - 1038245
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt-accaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  1038121 ctgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatattatccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatatta 1038220  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||| |||||  |||||||| |||||    
T  1038221 aattaataaaatcattataataaaa 1038245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 1045027 - 1045151
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt-accaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  1045027 ctgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatattatccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatatta 1045126  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||| |||||  |||||||| |||||    
T  1045127 aattaataaaatcattataataaaa 1045151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8008368 - 8008240
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  8008368 ctgtcacttttaaagatcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattactcttaattatttattgtggagagagaagtatatgaaagaagatattaa 8008269  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    || |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8008268 attaataagatcattatggtaaaattata 8008240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8464648 - 8464585
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttattt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8464648 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattt 8464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42787481 - 42787335
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || | |  |||||||||||||    
T  42787481 cactttcaaaattcaatggaatattaactgttcttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatacattatacaagatattaaatga 42787382  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||||| ||||| |  |||  |||  |||||| |||||||||||||    
T  42787381 ataaggttattattgagaaaggataaattattgtatcaaaagtagta 42787335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Original strand, 11248820 - 11248969
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||  |||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  11248820 tgtcgctttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttgattatttatttcagagagagaaatatatgaaatgagatattaca 11248919  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  11248920 tgatgaaggttactataagaaaaagataaattattgtatcaaaagtagta 11248969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48174871 - 48174671
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||    |||||| | |||||  ||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||    
T  48174871 ctgtcacttttaaagttcaatgcatagttaaatgctcttttatgaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatgttaa 48174772  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || |||||||||||||||||| ||      |||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  48174771 attaacaaggtcattatagtaaaagtaattacaattgtatcaaaa-tagtatcatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgataatt 48174673  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  48174672 aa 48174671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Original strand, 50152476 - 50152621
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||  || | |||| |||||||||| |||||||||||||     
T  50152476 actttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattgtagaaatataattatatgaaataagatattaaatgat 50152575  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
     ||||| ||| ||| ||||| ||   || ||| |||||||||||||    
T  50152576 gaaggttattgtaggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagta 50152621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 2572016 - 2572159
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| | |||||| |||||| | |||  |||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  2572016 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattacctttatatatttattgcagagagtgaaatatatgaaatgaaatattaaataatta 2572115  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  2572116 aggttattatagaaaaaagataatttattatatcaaaagtagta 2572159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Original strand, 33720583 - 33720756
Alignment:
Q  29 taaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaat-a 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |    
T  33720583 taaatgttgttttaccaatattacccttaaatatt-attgcggagagagaaaaacatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaagtaa 33720681  T
Q  128 tagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     |    |||| ||||||| |||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  33720682 aaaacaattgtatcaaaaatagtatcatttattgataatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaa 33720756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 19093306 - 19093367
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19093306 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttagttat 19093367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 52759067 - 52759215
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | || ||| |  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  52759067 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaa 52759166  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | |||||  |||||| | |||| |||  |||||| || |||||||||    
T  52759167 taattaaggatattataattaaaacataagttattgtataaaaagtagt 52759215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 35605496 - 35605555
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 60  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35605496 ctgtcactttcaaaatttaatgcaaaattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 35605555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8973643 - 8973450
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||  | |||| |||||||||||||||  |||||||||| |     
T  8973643 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgattttacctatattacccttatatatttattgtagggagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattg 8973544  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    | || ||||||| ||||| |||  || ||| || ||||||||||  || | ||  |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  8973543 atgttattataggaaaaagataaattgttgtataaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaa 8973450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 1859134 - 1859255
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||    ||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  1859134 tgtcattttcaaagtttaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttatatatttatt--atagagagaagtatatgaaatgagatattaga 1859231  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||    
T  1859232 tgattaaggttgttatagaaaaaa 1859255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 37296924 - 37296838
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaa 88  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  37296924 ctgtcactttcgaagttcaacgcaacattgaatattattttaccaatattatccttacttatttatt-aggggagagaaatgtatgaa 37296838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 52825315 - 52825401
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatga 87  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |  ||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  52825315 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttaataatttattgtagagagagaaatatatga 52825401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 5597861 - 5597920
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  5597861 ctgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacccttagtt 5597920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Original strand, 10630461 - 10630599
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    ||||||||||| | || ||||| | | |||||| |||||| |||||  |||||||||   ||| | |||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  10630461 aaagttcaatgtatcattaaatatggctttacctatattacccttatatatttattgca-agataaaaatatatgaaatgaagtattaaataattaaggt 10630559  T
Q  112 cattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
     ||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  10630560 tattatagaaaaaagataatttgttgtatcaaaagtagta 10630599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 202
Target Start/End: Original strand, 35605722 - 35605837
Alignment:
Q  87 aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtc 186  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    ||||  ||||||| || ||  | || ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  35605722 aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattatatcaaaattaataatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtc 35605821  T
Q  187 aaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||  |||||||||||    
T  35605822 aaatagtgacaattaa 35605837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 129
Target Start/End: Original strand, 1428520 - 1428571
Alignment:
Q  78 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  1428520 aaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtata 1428571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 1428257 - 1428302
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  1428257 ctgtcactttcaaagttcaatgcaataataaaggttggtttaccaa 1428302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 105)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 54898291 - 54898093
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54898291 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 54898192  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  54898191 aataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 54898093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53745489 - 53745289
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  53745489 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttcttgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaa 53745391  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53745390 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 53745291  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  53745290 aa 53745289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 54106301 - 54106502
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54106301 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaa 54106400  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  54106401 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaatt 54106500  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  54106501 aa 54106502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19550284 - 19550485
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19550284 ctgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttatcaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 19550383  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19550384 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 19550483  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  19550484 aa 19550485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47070063 - 47069864
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47070063 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 47069964  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||  | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47069963 gaataaaattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 47069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 43554428 - 43554628
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43554428 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatga-atattaa 43554526  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43554527 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtatgatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 43554626  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  43554627 aa 43554628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 790588 - 790782
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  790588 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaattatatgaactgggatattaa 790687  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  790688 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtga 790782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 24981331 - 24981529
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24981331 tcactttcaaagttcgatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtctttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgatatattaaatg 24981430  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24981431 aataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttagtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 24981529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 27992286 - 27992479
Alignment:
Q  9 ttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27992286 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgccgagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataa 27992385  T
Q  109 ggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27992386 ggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtattgggttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 27992479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45101566 - 45101365
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45101566 ctgtcactttgaaagttccatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 45101467  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45101466 atgaataaggtcattataggaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcagctgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 45101367  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  45101366 aa 45101365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51697772 - 51697571
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  51697772 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttacgaatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaatgagatattaa 51697673  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaa-tatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  51697672 atgaataaggtcattatagtaaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaat 51697573  T
Q  200 ta 201  Q
    ||    
T  51697572 ta 51697571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 29651713 - 29651907
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29651713 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 29651812  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29651813 aagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaactgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtaaaaatgtgacaattaa 29651907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 51244662 - 51244852
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51244662 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 51244761  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaat 191  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51244762 atgaataagatcattataataaaaatatggcttattgcatcaaaactagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaat 51244852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27483994 - 27483795
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27483994 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaa 27483897  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  27483896 atgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcctgatttgtataaaatgttaaaatatgacaatt 27483797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34266646 - 34266447
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34266646 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgctgcgaga--aatatatgaaatgagatattaa 34266549  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34266548 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgatt 34266449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 52663481 - 52663681
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52663481 tgtcattttcaaagttcaaagcaatattaaacgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 52663580  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  52663581 tgaataaggtcattatagcaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtgaaatgtcaaaatatgacaatta 52663680  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  52663681 a 52663681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 41168799 - 41168997
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41168799 ctgtcattttcaaacttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 41168898  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaa---agtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    |||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41168899 atgaataaggtcattatag------tatagcttattgcatcaaaagtagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgaca 41168992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 29698030 - 29698230
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29698030 tgtcattttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaa-tgagatattaaa 29698128  T
Q  102 tgaata-aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29698129 tgaatagaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 29698228  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  29698229 aa 29698230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42672098 - 42671897
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42672098 ctgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaataagatattaa 42671999  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  42671998 atgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgacaatt 42671899  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  42671898 aa 42671897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43775598 - 43775397
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43775598 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagctatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 43775499  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  43775498 atgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgaaaatt 43775399  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  43775398 aa 43775397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 46973461 - 46973662
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  46973461 ctgtcactttcaaagttcaatacaacatcaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatattaa 46973560  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  46973561 atgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgctttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaatt 46973660  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  46973661 aa 46973662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 35315171 - 35315371
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35315171 tgtcattttcaaagttcaatacaaccttaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaa 35315270  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  35315271 tgaacaaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaatta 35315370  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  35315371 a 35315371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 28885718 - 28885916
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28885718 gtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 28885817  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  28885818 gaataaggtcattatagtaaag-tacaacttattgcatcaaaagtagtaacaataattgactatcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaa 28885916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13158640 - 13158446
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13158640 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatccttagttatttattgcggagagagaaatataagaaatgatatattaaatgaata 13158541  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  13158540 aggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatataacaattaa 13158446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 45513823 - 45513673
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45513823 ctgtcacttttaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 45513724  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45513723 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 45513673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39867057 - 39866856
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39867057 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 39866958  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39866957 attaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 39866858  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  39866857 aa 39866856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52627434 - 52627245
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  52627434 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagt 52627336  T
Q  112 cattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  52627335 cattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaatcgttaattatcttggtatgaggaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 52627245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 17102792 - 17102981
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17102792 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaa 17102891  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  17102892 atgaataaggtcattataataaaagtataaattattgcatcaaaagtagtaacaattattaattgttttaatttgtgtaaaatgtcaaaa 17102981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 32980678 - 32980879
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32980678 ctgtcactttcaaaattcaatacaacattaaataatgttttatcaatattacccttagttatttattgtagagagagaaatatatgaaataagatattaa 32980777  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32980778 atgaataaggtcagtataataaaagtataacttattgcatcaaaagtattaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 32980877  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  32980878 aa 32980879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33491347 - 33491146
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33491347 ctgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattacggagagtgaaatatatgaaatgagatattaa 33491248  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33491247 ataaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 33491148  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  33491147 aa 33491146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Original strand, 43945445 - 43945614
Alignment:
Q  29 taaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatat 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  43945445 taaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattacagtaaaagtat 43945544  T
Q  129 agtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaa 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  43945545 agtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaa 43945614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 49123562 - 49123761
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49123562 tgtcactttcaaagatcaatgcaacattaaatattgttttactaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 49123661  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaa--atatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  49123662 tgaataaggtcattatagtaaaagtgtatagtttattgcatcaaatgtagtatcaa---ttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgactat 49123758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36234405 - 36234603
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  36234405 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttattttttgcggagagagaaatatatgaaataggatattaa 36234504  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||   ||||||| || ||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36234505 atgaataagatcattacagtaaaagtatagcttattgtatcaaa---agtatcactttttgattgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 36234601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6902316 - 6902517
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6902316 ctgtcccttttaaagttcaatttaacattaaattttgttttatcaatattgttcttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 6902415  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  6902416 ataaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaatgtagtatcaattgttgatggtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacagtt 6902515  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  6902516 aa 6902517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 45145167 - 45145367
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  45145167 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta-ttatttattgcggaaagagatatatatgaaatgagatgttaa 45145265  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  45145266 atgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcagcaaaagtaataataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaatt 45145365  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  45145366 aa 45145367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51219292 - 51219100
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||                
T  51219292 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaa------------ 51219205  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgt---ttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  51219204 atgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaatatgtgaca 51219105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25983868 - 25983670
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  25983868 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatataaaatgagaagttaaat 25983769  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||| | || ||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25983768 gaacaaagtcattatagtaaaagtataacttatt-catcaaaaatagtaacaattgtagattatcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaactgacaattaa 25983670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40140027 - 40139858
Alignment:
Q  16 ttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt 115  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40140027 ttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcatt 40139928  T
Q  116 atagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgt 185  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40139927 atagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 40139858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Original strand, 7328496 - 7328640
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7328496 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatg 7328595  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagta 148  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  7328596 aataaggtcattataatgaaagtataacttattgcatcaaaagta 7328640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3376516 - 3376316
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagata----aatatatgaaatgagata 96  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||||||||||    
T  3376516 ctgtcagtttcaaagtccaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagagaaaaatatatgaaatgagata 3376417  T
Q  97 ttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||| ||||  ||| || |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  3376416 ttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattacataaaaaatagtaacaatcattgattatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgac 3376317  T
Q  197 a 197  Q
    |    
T  3376316 a 3376316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 54911509 - 54911309
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  54911509 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttatcaatattacctttaattatttattgtggagtgagaaatatatgaaataagatattaa 54911410  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  | | || ||||| | ||||||||||||||    
T  54911409 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtctt-atatatgtaaaattttaaaatgtgacaatt 54911311  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  54911310 aa 54911309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3643403 - 3643203
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  3643403 ctgtcactttcaaagttcaatgcaact-taaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 3643305  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |  | |||| ||||||||||||| || || ||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  3643304 attaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttcttgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacactt 3643205  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  3643204 aa 3643203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 13168062 - 13168244
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168062 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 13168161  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || | || ||||||||| ||||  |||||||            ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13168162 agctaatcatagtaaaagtataacttattgc------------atcaattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtaaaaatgtgacaattaa 13168244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 50091983 - 50092172
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  50091983 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattttccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaa 50092082  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  | || || || ||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  50092083 atgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttatttagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 50092172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 20105230 - 20105342
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20105230 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaa 20105329  T
Q  101 atgaataaggtca 113  Q
    |||||||||||||    
T  20105330 atgaataaggtca 20105342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33074472 - 33074289
Alignment:
Q  14 agttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  33074472 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattactcttatttatt-attgcggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggtta 33074374  T
Q  114 ttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaa 198  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33074373 ttatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcagcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaa 33074289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 41926718 - 41926919
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggaga-gataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  41926718 tcactttcaaagtttcatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcgttagttatttattgcggagataaaaaaaatatgaaatgagatgttaaat 41926817  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaa---agtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||   ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  41926818 gaataagatcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgt-aaaaagtgacaat 41926916  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  41926917 taa 41926919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 11473443 - 11473641
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  11473443 tcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggaaagagaagtatatgaaataagatattaaatg 11473542  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11473543 actaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgaatgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacaattaa 11473641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24272 - 24071
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  24272 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttgctaatttattttggagaaagaaatatatgaaatgaaatattaa 24173  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||  | || ||   ||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||    
T  24172 atgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacactt 24073  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  24072 aa 24071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32854156 - 32853967
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32854156 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttatcaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaa 32854057  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32854056 atgactaaggttattatagtaaaagtatacattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 32853967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 41425668 - 41425868
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41425668 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaa 41425766  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41425767 ataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 41425866  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  41425867 aa 41425868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47104363 - 47104162
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  47104363 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcattagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 47104264  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || | |  |||  ||||||| ||||| || || ||| |||| ||| ||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  47104263 attaataaagtcattatagtaaaagtaaaatcaattatatcaaaaatagtaacatttattgattgttttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtggcaatt 47104164  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  47104163 aa 47104162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 48152023 - 48152224
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  48152023 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatatcaa 48152122  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||    ||||| |||||||||| ||  | || ||| |||| ||| |||||| ||||| | ||||  ||||||||    
T  48152123 atgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtaataatatttattgattgtattgatttgtgtaaaatataaaaaaatgacaatt 48152222  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  48152223 aa 48152224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 51064921 - 51065122
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  51064921 ctgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttattataccaatattatccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 51065020  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||| |||||||||| ||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  51065021 attaataagatcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgataatt 51065120  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  51065121 aa 51065122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 52175758 - 52175958
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  52175758 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttgaatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatgaaatattaa 52175857  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||| ||||||| ||||||| || |    |||| |||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  52175858 attaataaagtcattacagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataac-attgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtcataatt 52175956  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  52175957 aa 52175958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 55141678 - 55141561
Alignment:
Q  7 ctttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaat 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55141678 ctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgttgaaagataaatatataaaatgagatattaaatgaat 55141579  T
Q  107 aaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  55141578 aaggttattatagtaaaa 55141561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27039814 - 27039619
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27039814 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttgattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 27039715  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgac 196  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||    |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27039714 atgaataaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgac 27039619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33874754 - 33874553
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  33874754 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaa 33874655  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||    |    |||| ||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  33874654 attaataaggccattatagtaaaaggtaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaatt 33874555  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  33874554 aa 33874553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 29803727 - 29803887
Alignment:
Q  30 aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||            |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29803727 aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatat------------taaatgaataagatcattatagtaaaagtata 29803814  T
Q  130 gtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29803815 acttattgcatcaataatagtatcaattgttgattgtcttggttcgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaa 29803887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 5244140 - 5244015
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5244140 tcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcagagagagaaatatatggaataagatattaaatg 5244041  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||    
T  5244040 actaaggttattatagtaaaagtata 5244015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40319135 - 40318935
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  40319135 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatctaatgagatattaa 40319037  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40319036 ataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 40318937  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  40318936 aa 40318935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40010865 - 40010749
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40010865 tttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccgacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 40010766  T
Q  108 aggtcattatagtaaaa 124  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40010765 aggttattatagtaaaa 40010749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 45055227 - 45055426
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  45055227 gtcactttcaaagtttaatgcatcattaaatgttgttttactaatattatcttttattatttattgcggagagagaaatataagaaatgagatgttaaat 45055326  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  |  |||| ||| |||||||| ||| || ||||| | ||||  ||||||||||    
T  45055327 taataatgtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtaaaaataattattgattgtcttgatttatgtaaaatattaaaaattgacaattaa 45055426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20848927 - 20848731
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |     ||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  20848927 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattactcttagat-----ttgcggaaagagaaacatatgaaatgaaatattaa 20848833  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20848832 attaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacagtt 20848733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27028223 - 27028115
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27028223 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 27028124  T
Q  101 atgaataag 109  Q
    |||||||||    
T  27028123 atgaataag 27028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30861750 - 30861558
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30861750 ctgtcattatcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagctatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 30861651  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    |||| ||||   |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  | || || ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  30861650 atgactaagactattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttgttg--tgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtga 30861558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29458342 - 29458210
Alignment:
Q  70 ggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtctt 169  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| |||||||    
T  29458342 ggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtctt 29458243  T
Q  170 ggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29458242 ggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaa 29458210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 48214105 - 48214196
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatga 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  48214105 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatga 48214196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42515380 - 42515181
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  42515380 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacaattattacctttagatatctattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 42515281  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||  |||||||||||| || |    |||| ||||||| |||||  | || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  42515280 attaataaggcgattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagta--acttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagttacaatt 42515183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54334391 - 54334197
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  54334391 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttatttatttatcgcggagagaaaaatatatgacataagatattaa 54334292  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    || | |||||  |||||| ||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  54334291 ataactaaggctattataataaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgagttaaatgtcaaaaagtga 54334197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41351390 - 41351201
Alignment:
Q  13 aagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtc 112  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||  |  ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  41351390 aagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatctttgttcgtttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtt 41351291  T
Q  113 attatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||| || |  |||  ||||||| ||| || ||||| ||| || |||||||||||    
T  41351290 attatagtaaaagtatatattattatatcaaaagtagtaacattaattgaatgtcttgatttatgtaaaatatcagaaagtgacaattaa 41351201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 53282020 - 53282145
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53282020 tcactttcaaggttcaatgcagcaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatg 53282119  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    | ||||   |||||||||||||||||    
T  53282120 actaagactattatagtaaaaatata 53282145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 49168403 - 49168530
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  49168403 tgtcaattttaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattactcttagttatttattgaggagagaaaaatatttgaaataatatattaaa 49168502  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  49168503 tgactaagattattataataaaaatata 49168530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 23771325 - 23771475
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  23771325 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaa 23771424  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  23771425 atgatgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 23771475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 52173785 - 52173908
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  52173785 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcagagagaaaaacatatgaaatgaaatattaa 52173884  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    |  ||||||||||||  |||||||    
T  52173885 actaataaggtcattgcagtaaaa 52173908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 35077425 - 35077574
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  35077425 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgcagagagagaaatataggaaatatgatattaa 35077524  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    || | |||||  |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35077525 ataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagt 35077574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42671605 - 42671473
Alignment:
Q  16 ttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||    
T  42671605 ttcaatgcaacattaaatgttaatttattaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaagttatt 42671507  T
Q  116 atagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtag 149  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||||||    
T  42671506 atagtacaaatataaattattgtatcaaaagtag 42671473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 44544377 - 44544296
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaata 82  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44544377 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 44544296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36371035 - 36370861
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| | || ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  36371035 tgtcactttacatagttcaatgcaatattaaatgttactttactaatattacccttatttatt-actgtggagagaaaaatatatgttatgagatattaa 36370937  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgt 176  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||    
T  36370936 ataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgt 36370861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32853538 - 32853367
Alignment:
Q  29 taaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||  |||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||     
T  32853538 taaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcagagagagaaacat--gaaatgaaatattaaattaataaggtcgttatagtaaaagtaa 32853441  T
Q  129 agtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |    |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  32853440 aaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagttacaattaa 32853367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 26748398 - 26748591
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  26748398 tttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattatta 26748497  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| ||||||| ||||| |||  || ||| |||||||||||||  ||   ||  |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26748498 aggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta-aaagcatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaa 26748591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28943704 - 28943614
Alignment:
Q  39 tttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||    
T  28943704 tttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtata 28943614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 34750700 - 34750893
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| | ||| || |||||| |||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||   ||||||| | ||    
T  34750700 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttgcctatattacccttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataatta 34750799  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  || | ||  |||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  34750800 aggttattataggaaaaagataatttgttgtatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagacaaaatgagacaattaa 34750893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43159968 - 43159854
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||  |||||| ||| |||| |||| | |||||||    
T  43159968 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgatttatcaatattacccttaaatatttattgcagagagaaaaacatataaaataaaatattaa 43159869  T
Q  101 atgaataaggtcatt 115  Q
    || ||||||| ||||    
T  43159868 attaataaggccatt 43159854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 2642748 - 2642921
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||        || ||||||||||| |||||||||    
T  2642748 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattg--------tagatatatgaaataagatattaa 2642839  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaa 182  Q
    ||||  ||||| ||||| | ||||| ||   || ||| |||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  2642840 atgatgaaggttattattggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 2642921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 28226465 - 28226608
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |  ||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  28226465 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttatt--gcagagagaaatatatgaaatatgatattaa 28226562  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaag 146  Q
    || | |||||  |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||    
T  28226563 ataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaag 28226608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35458712 - 35458563
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||    ||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  35458712 ctgtcactttcaaagttcaatgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatatgaaatatgatattaa 35458613  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    || | |||||  |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  35458612 ataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagt 35458563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 44092237 - 44092181
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatcctta 57  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44092237 ctgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 44092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44544155 - 44544079
Alignment:
Q  81 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| || |||||    
T  44544155 tatatgaaatgagatattaaatgaaaaaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtattaacaatt 44544079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 2154247 - 2154184
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttattt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||    
T  2154247 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtcttatcaatattactcttagatattt 2154184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8237033 - 8236954
Alignment:
Q  71 gagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||  | ||||||||||    
T  8237033 gagagaaaaatatatgaaattagatattaaatgaacaaggttattatagtaaaagtataaattattataacaaaagtagt 8236954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 125
Target Start/End: Original strand, 53055339 - 53055393
Alignment:
Q  71 gagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  53055339 gagagataaatatatgaaatgagatattaaatgataaaggttattatagaaaaaa 53055393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22100025 - 22099909
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||| || ||| |  |  ||||||||||||    
T  22100025 tttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatccttacttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaata 22099926  T
Q  108 aggtcattatagtaaaa 124  Q
    || | ||||||||||||    
T  22099925 agattattatagtaaaa 22099909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 7329004 - 7329063
Alignment:
Q  143 aaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7329004 aaagtagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaa 7329063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Original strand, 20105350 - 20105403
Alignment:
Q  132 ttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  20105350 ttattgcatcaaaagtggtatcaattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgt 20105403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 53290968 - 53290851
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  | ||| |  ||||| | ||||||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  53290968 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttattttttctataatgcccttaataatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaa 53290869  T
Q  102 tgaataaggtcattatag 119  Q
    | | |||||  |||||||    
T  53290868 taattaaggatattatag 53290851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 40113455 - 40113415
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt 41  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40113455 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttt 40113415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45513381 - 45513325
Alignment:
Q  146 gtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  45513381 gtagtatcaattgttgattgttttgatttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaa 45513325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 47844046 - 47843979
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattg 68  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || ||| || | ||||| ||||||||    
T  47844046 ctgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttttcctataataccgttagtaatttattg 47843979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2858654 - 2858584
Alignment:
Q  132 ttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||| ||||||||||| | |  || ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2858654 ttattgtatcaaaagtagcaacctttattgattgtcttggtctgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaa 2858584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 36
Target Start/End: Original strand, 29803674 - 29803708
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgtt 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29803674 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 29803708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 29458914 - 29458865
Alignment:
Q  14 agttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatt 63  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  29458914 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt 29458865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 42634555 - 42634431
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagtt---atttattgaggagagataaatatatgaaatgagatat 97  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||   |||||||  |||||||  |||||||||| | ||  ||    
T  42634555 ctgtcacttttgaagttcagtgcaatattaaatattgttttataaatattatcgttacttcttatttattatggagaga--aatatatgaagttagtgat 42634458  T
Q  98 taaatgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42634457 taaataaataaggttattatagtaaaa 42634431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 202
Target Start/End: Original strand, 48214205 - 48214294
Alignment:
Q  113 attatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||  | || ||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48214205 attatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtgtgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 48214294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Original strand, 18355927 - 18356007
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaata 82  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  18355927 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgatttatcaataatacccttacttatttattgtagagagagaaata 18356007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 49185 - 49385
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  49185 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaa-attaa 49283  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49284 atgaataaggtcattataataaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 49383  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  49384 aa 49385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 89360 - 89409
Alignment:
Q  153 caattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89360 caattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 89409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 31430597 - 31430798
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31430597 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 31430696  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31430697 atgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatgaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 31430796  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  31430797 aa 31430798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33100038 - 33099839
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33100038 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatcttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggaga--taaatatatgaaatgagatattaa 33099941  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33099940 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 33099841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18470345 - 18470546
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18470345 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 18470444  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||||    
T  18470445 atgaataaggtcgttatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatattaaaatgcgacaatt 18470544  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  18470545 aa 18470546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 7312656 - 7312855
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7312656 tgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa 7312755  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7312756 taaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatta 7312855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32528533 - 32528332
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32528533 ctgtcactttcaaagttcaatgaaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 32528434  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  32528433 atgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaatt 32528334  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  32528333 aa 32528332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 41891308 - 41891509
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  41891308 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccaatattgtcctgagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgatatattaa 41891407  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41891408 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 41891507  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  41891508 aa 41891509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31399135 - 31398936
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31399135 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagata-taaa 31399037  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  31399036 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattatatcaaaagtagtatcaatttttaattgtcttggtttatgtaaaatgctaaaatgtgacaatta 31398937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36922277 - 36922479
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36922277 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaa 36922376  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatc-aaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  36922377 atgaataaggtcattatagtaaaaacatagcttattgcatcaaaaagtaatatcaattgttgattgtcttgatttatttaaaatgtcaaaatgtgacaat 36922476  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  36922477 taa 36922479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44480345 - 44480156
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44480345 gtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 44480246  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44480245 gaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcataaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatg 44480156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12838283 - 12838082
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12838283 ctgtcactttcaaagttcagtgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 12838184  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12838183 ataaataaggttattatagtaaaggtatagcttattgtatcaaaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaatt 12838084  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  12838083 aa 12838082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29497739 - 29497538
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29497739 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgttcttcgttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 29497640  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29497639 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttgattgtcctggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataatt 29497540  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  29497539 aa 29497538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 26632385 - 26632215
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26632385 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 26632286  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttgg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  26632285 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcatttgttatttgtcttgg 26632215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32966254 - 32966053
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32966254 ctgtcattttcaaagttaaatgcaacattaaatgttggtttaccaatattgtccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 32966155  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32966154 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtggtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 32966055  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  32966054 aa 32966053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17896728 - 17896569
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17896728 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 17896629  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17896628 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgtt 17896569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 8264985 - 8265188
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaac----actaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagata 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||    
T  8264985 ctgtcactttcaaagttcaatgcaaccaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattgcggagagagagatatgt--aatgagata 8265082  T
Q  97 ttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgac 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8265083 ttaaattaataaggttattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaaggagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaatgtgac 8265182  T
Q  197 aattaa 202  Q
    ||||||    
T  8265183 aattaa 8265188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 20035090 - 20035255
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20035090 cactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 20035189  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttg 170  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20035190 ataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaaggaatatcaattgttgattgtcttg 20035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 20045501 - 20045666
Alignment:
Q  5 cactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20045501 cactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 20045600  T
Q  105 ataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttg 170  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20045601 ataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaaggaatatcaattgttgattgtcttg 20045666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22951023 - 22950822
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22951023 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattctccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 22950924  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  22950923 atgaataatgtcattataataaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatataacaatt 22950824  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  22950823 aa 22950822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33921979 - 33921778
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33921979 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccgatattatccttaattatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaa 33921880  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  33921879 atgaataaggtcattatagtaaaaatataatttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 33921780  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  33921779 aa 33921778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41675391 - 41675191
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  41675391 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcaaagaaataaatatattaaataaaatattaa 41675292  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41675291 atgaataaggtcgttatagtaaaactatagcttattgcatcaaaaatag-atcaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 41675193  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  41675192 aa 41675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 3837900 - 3838101
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3837900 ctgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattatctttagttatttattgcggaaagataaatatatgaaatgagatgttaa 3837999  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  3838000 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttatggcatcaaaagtaataacaattattgattgtcttgatttgcgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 3838099  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  3838100 aa 3838101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36298379 - 36298178
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36298379 ctgtcactttcaatgttcaatgcaacattaaatgatgttttatcagtattacccttaattatttatttcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 36298280  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36298279 atgaataaagtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 36298180  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  36298179 aa 36298178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5732267 - 5732077
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5732267 aaagttcaatgcaacattaaatgctgttttaccaatattatccttagttatttatttcggagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataaggt 5732168  T
Q  112 cattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5732167 cattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 5732077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 26723962 - 26724164
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26723962 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattacccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaa 26724061  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtc-aaaatgtgacaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26724062 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaataatcattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaatgtgacaat 26724161  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  26724162 taa 26724164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 33173845 - 33174046
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33173845 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagattttaa 33173944  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||| ||||||||||||| ||||  |||  | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33173945 atgaataagatcattatattaaaagtacaacttattgtatcaaaagtagtaacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 33174044  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  33174045 aa 33174046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7477403 - 7477202
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7477403 ctgttactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccgatattatccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaa 7477304  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||  | |||| |||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  7477303 attaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaatt 7477204  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  7477203 aa 7477202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 8381908 - 8382065
Alignment:
Q  45 aatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaa 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  8381908 aatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaa 8382007  T
Q  145 agtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8382008 agtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaa 8382065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29722506 - 29722310
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||     
T  29722506 tcactttcataattcaatgcaatattaaatgttgttttactaatattgtccttaattatttattgcggagatagaaatatatgaaataagatattaaata 29722407  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  29722406 aataag-tcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcgattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgttaaaatgtgacaatta 29722310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10227294 - 10227495
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||    
T  10227294 ctgtcactttcaaaattcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattatcctttgttatttattgcggagggagaaatatataaaatgagatgttaa 10227393  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  10227394 attaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaataattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 10227493  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  10227494 aa 10227495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 35112467 - 35112668
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35112467 ctgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttagttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaa 35112566  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||  | || ||| |||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35112567 ataaataaagttattatagtaaaaatatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtatttgtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 35112666  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  35112667 aa 35112668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 33257922 - 33258120
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33257922 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttggttatttattatggagagagaaatatataaaatgagatattaaatg 33258021  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||| |||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||  | || ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33258022 aataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaa 33258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36648210 - 36648011
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36648210 ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttaatttatcaatattatccttagctatttatttcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 36648111  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  36648110 attaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaa-gtgacaatt 36648012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38168962 - 38168792
Alignment:
Q  33 tgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  38168962 tgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataact 38168863  T
Q  133 tattgcatcaaaagtagtatc-aattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  || ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  38168862 tattgcatcaaaaatagtaacaaattaatgattgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagtgacaattaa 38168792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42842071 - 42841870
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  42842071 ctgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 42841972  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || |||||||||||||||||| ||      |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  42841971 attaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaatt 42841872  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  42841871 aa 42841870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37354041 - 37353888
Alignment:
Q  35 ttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagttta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  37354041 ttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatgtaactta 37353942  T
Q  135 ttgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaa 188  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||| ||  || ||||||||||    
T  37353941 ttgcatcagaagtagtaacaattattgattgttttgattcatgtaaaatgtcaa 37353888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30866941 - 30866752
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  30866941 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttggtttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaa 30866842  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| |||||  ||||||||||| |||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30866841 atgactaaggctattatagtaaacatataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 30866752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 28608646 - 28608833
Alignment:
Q  14 agttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |    
T  28608646 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgatatattaaataaataaggtta 28608744  T
Q  114 ttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | || || ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  28608745 ttatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaa 28608833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31815273 - 31815073
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  31815273 ctgttactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 31815174  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||  ||||||||||||| || |  | |||| ||||||||||||| | ||| ||| || ||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  31815173 attaataagaccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaac-attattgattatcttgatttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaatt 31815075  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  31815074 aa 31815073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35746848 - 35746649
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  35746848 tgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattg-cgaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaa 35746750  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | ||||||| ||||||||||||| || |  | |||| ||||||| ||||| || || ||| |||||||  ||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  35746749 ttaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaatta 35746650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36406789 - 36406993
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36406789 ctgttactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggatagagaaatatattaaataagatattaa 36406888  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttg---tcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgaca 197  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  ||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36406889 atgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaca 36406988  T
Q  198 attaa 202  Q
     ||||    
T  36406989 gttaa 36406993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 41889522 - 41889372
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41889522 ctgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatattgttttatcaatattattcttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaa 41889423  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||    
T  41889422 atgaataagactattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 41889372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 6799161 - 6799283
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagat-atta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  6799161 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttaattatttattacggagagagaaatatataaaatgatataatta 6799260  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaa 122  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  6799261 aatgaataagaccattatagtaa 6799283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18194412 - 18194218
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18194412 tttcaaatttcaatgcaaaattaaatgttgttttaccaacattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 18194313  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||  ||||||||||||  | |    |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||    
T  18194312 aggctattatagtaaaagcaaaaacaattgtatcaaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatttgaaaaactgacaattaa 18194218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22382277 - 22382156
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  22382277 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattatccttagatatttatt--gcagagagaaacatatgaattgaaatattaa 22382180  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  22382179 attaacaaggtcattatagtaaaa 22382156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Original strand, 47408228 - 47408352
Alignment:
Q  78 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||    
T  47408228 aaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgtg 47408327  T
Q  178 caaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
T  47408328 taaaatgtcaaaaagtgacaattaa 47408352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 3310254 - 3310377
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||||    
T  3310254 ctgtcacttctaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattactcttagttatttattgcggagagagaaatatatgatataaaatattaa 3310353  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3310354 atgaataaggtcattatagtaaaa 3310377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17354231 - 17354114
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| | | ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  17354231 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatattacccttagatatatattgcgaaaagagaaacatatgaaatgaaatattaa 17354132  T
Q  101 atgaataaggtcattata 118  Q
    || |||||||||||||||    
T  17354131 attaataaggtcattata 17354114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34368864 - 34368741
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  34368864 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcgaagagaaaaacatatgaaatgaaatattaa 34368765  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    || ||||||||||||  |||||||    
T  34368764 attaataaggtcattgcagtaaaa 34368741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44820791 - 44820611
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44820791 aaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacatttagttatttatttcggagagaaaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 44820692  T
Q  112 cattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     |||||||||||          || |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  44820691 tattatagtaaa----------atggcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatatgacagttaa 44820611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 3177968 - 3178118
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  3177968 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgccgttattacccttggttatttattgcagagagagaaatatatgaaaagatatattaa 3178067  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  3178068 atgacgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 3178118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 1553553 - 1553678
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| |||| |||||| | ||  |||||    
T  1553553 ctgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttatt--acagagagaaatgtatgaagttagtgattaa 1553650  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatat 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1553651 atgaataaggttattatagtaaaaatat 1553678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 46286050 - 46285922
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  46286050 ctgtcactttcaaagttcaatgcaagaataaatattgttttaccaacattacccttagttatttattgcgtagagagaaatatatgaaataaaatattaa 46285951  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    || | |||||  | |||||||||| ||||    
T  46285950 attactaaggctaatatagtaaaagtata 46285922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24283620 - 24283818
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||| |||| || ||| |||||||    
T  24283620 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagatatttattgcggagag--aaacatataaattgaaatattaa 24283717  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || || ||||||||||||||| || |  | |||  ||||||||||||| || || ||  ||||||| ||||||| |||| || ||||  ||||||||    
T  24283718 attaacaaagtcattatagtaaaagta-aaataattatatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttagtttgtgtaaaaggtaaaaaaatgacaatt 24283816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Original strand, 42881008 - 42881121
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  42881008 tcactttttaaggtcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttggttattgattgcggagagagaaatatataaaattagatgttaaatg 42881107  T
Q  104 aataaggtcattat 117  Q
    ||||||||| ||||    
T  42881108 aataaggtcgttat 42881121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8966105 - 8965955
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  8966105 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacattgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaa 8966006  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| ||   || ||| |||||||||||||    
T  8966005 atgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagta 8965955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43874287 - 43874099
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  || | | ||||| ||||||| ||||||| |    
T  43874287 ctgtcactttcgaaattcaatgcaacattaaatgttattttgccaatattatcattacttatttattgcagata-agaaatacatgaaattagatattca 43874189  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||  || ||| ||||||||||||| || || |||  ||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  43874188 atgaataaggttattatagtaaaagagtatattgttgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtatttgttcgtgtaaaatgtcaaaa 43874099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 46563328 - 46563204
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  || ||||| ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46563328 ctgtcactttcaaagttcagtacaacattaaatattgttttgacattattacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaa 46563229  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  46563228 atgaggaaggttattataggaaaaa 46563204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22057620 - 22057510
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt---gag---gagagataaatatatgaaatgagat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||   |||||| ||||||||||||  ||||    
T  22057620 tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttagcaatattacccttagttatttattacagagagagagagagaaatatatgaaacaagat 22057521  T
Q  96 attaaatgaat 106  Q
    |||||||||||    
T  22057520 attaaatgaat 22057510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 47459682 - 47459809
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttta-ccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||  | |||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  47459682 ctgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatatttttttttccaatattatccttgctcatttattgtggagaga--aatatatcaaatgaaatatta 47459779  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47459780 aataaataaggttattatagtaaaaatata 47459809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 45324066 - 45324250
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||     | |||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45324066 ctgttactttcaaagttcaatgct----tgaatgatgttttatcaatattactcttaattatttattgcggagagagaaatatataaaataagatattaa 45324161  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatg 192  Q
    || |||||  |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| || |   |||  ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  45324162 ataaataaaatcattataataaaagtataacttattgcatcaaaaataat---aataattgattgtattggtttgtgtaaaatgttaaaatg 45324250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19327977 - 19327795
Alignment:
Q  14 agttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| | || |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||       
T  19327977 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattactcttatttatt-actgtggagggagaaatatatgtaatgagatattaaataaataagg--- 19327882  T
Q  114 ttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||   |||||| |  |||||| ||||||||||| |  | || ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19327881 ttata--taaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaa 19327795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 48981579 - 48981434
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||  | |||||||||||     
T  48981579 actttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttgcctttattacccttagttatttattgcagagatgaaaatatatgaaaaaaaatattaaatgat 48981480  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
     ||||| ||||||| ||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  48981479 gaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 48981434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8380758 - 8380674
Alignment:
Q  40 ttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8380758 ttaccaacattacccttagttatttattacggggagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaa 8380674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9602097 - 9601897
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  9602097 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaa 9601998  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | | |||||  ||||||   |||  |||  |||||| ||||||||||||   |    ||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9601997 taattaaggatattataagcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaatta 9601898  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  9601897 a 9601897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9829668 - 9829468
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  9829668 tgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaa 9829569  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | | |||||  ||||||   |||  |||  |||||| ||||||||||||   |    ||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9829568 taattaaggatattataagcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaatta 9829469  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  9829468 a 9829468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17896555 - 17896495
Alignment:
Q  142 aaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17896555 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 17896495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30586853 - 30586757
Alignment:
Q  29 taaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  30586853 taaatgttgatttatctatattacccttagatatttactgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaaaa 30586757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26803635 - 26803454
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||||  |||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26803635 ctgtcgcttttaaagttcaatacaacattaaatattgttttccccttattacccttgattatttatcgtagagagagaaatatataaaatgagatattaa 26803536  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaa 182  Q
    ||||  ||||| |||||||  |||| ||   || ||| |||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  26803535 atgatgaaggttattatagggaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 26803454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 22785925 - 22786118
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||| | |||||  |||||| |||||  ||||| |||  |||||| ||||||||  |||||  |||||||| | ||    
T  22785925 tttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttacatatattacccttatatattttttgctgagagagaaatatattgaatgaagtattaaattatta 22786024  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| ||||||| ||||| |||  || ||| |||||||||||||  || | ||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22786025 aggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta-aaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaa 22786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 41409810 - 41409764
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattat 52  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41409810 actttcaaagttcaacgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 41409764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 2408866 - 2408827
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2408866 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 2408827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Original strand, 32049458 - 32049559
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||   |||||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||    
T  32049458 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgtctttacctatattactcttatatatttattgcagagagataaatacatgaaatgaagtattaaatgatta 32049557  T
Q  108 ag 109  Q
    ||    
T  32049558 ag 32049559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 35860006 - 35860152
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||    ||||||| |||||||  | ||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  35860006 tgtcattttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttagtaatttatt--gcagagagaaatataagaaatatgatattaaa 35860103  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    | | ||||   ||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  35860104 taattaagaatattatagaaaaaccataagttattgcatcaaaagtagt 35860152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 36339403 - 36339303
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgt--tgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |  | |||||||||||||| ||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  36339403 tgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatatatttttttaccaatattacccttgattattaattatggagagagaaatatatgaaacaagatatta 36339304  T
Q  100 a 100  Q
    |    
T  36339303 a 36339303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 33071944 - 33072032
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaa 89  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||    ||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  33071944 ctgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttaataatttattgcagagagagaaatatatgaaa 33072032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Original strand, 35684249 - 35684315
Alignment:
Q  59 ttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaa 125  Q
    ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||    
T  35684249 ttatttattgtagagagagaagtatatgaaatgagatattaaatgacgaagattattataggaaaaa 35684315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 202
Target Start/End: Original strand, 6799582 - 6799658
Alignment:
Q  126 tatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||   ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  6799582 tataatttatcgcatcaaaaatagtaacaatcactgactgtcttggtttatgtaaaatgtcaacatgtgacaattaa 6799658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41409744 - 41409704
Alignment:
Q  84 atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa 124  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41409744 atgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaa 41409704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24663417 - 24663618
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24663417 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 24663516  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24663517 atgaataatgtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 24663616  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  24663617 aa 24663618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17124186 - 17123987
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17124186 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaa 17124089  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17124088 atgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 17123989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 3621631 - 3621829
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3621631 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttctaccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg 3621730  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3621731 aataatgtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 3621829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23923916 - 23923715
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23923916 ctgtcactttcaaagttcaatacaacgttaaatgctgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaa 23923817  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23923816 ctgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacattaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 23923717  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  23923716 aa 23923715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 373761 - 373962
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  373761 ctgtcactttcaaagttcaatgcaattttaaatgttgttttaccaatattgtcattatttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 373860  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  373861 atgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgctgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 373960  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  373961 aa 373962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 17193197 - 17193397
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17193197 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagatatatatgaaatgagatattaaa 17193296  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  17193297 tgaataaggtcattatagtaaaataataacttattgcatcaaaagtaggatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaacgtgacaatta 17193396  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  17193397 a 17193397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26470925 - 26470725
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26470925 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaa 26470826  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  26470825 tgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaatta 26470726  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  26470725 a 26470725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1751631 - 1751433
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  1751631 tcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcagagaaagaaatatatgaaaagagatattaaatg 1751532  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1751531 aataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 1751433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 17835931 - 17836132
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17835931 ctgttactttcaaattttaatgcaacattaaatgtttttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatattaa 17836030  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17836031 atgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagaatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaatatgtgacaatt 17836130  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  17836131 aa 17836132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 1252210 - 1252405
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttattt-attgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaat 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1252210 tttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttgttttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaat 1252309  T
Q  107 aaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  1252310 aaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgataattaa 1252405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 8992589 - 8992788
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8992589 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatg 8992688  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatc-aattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||  || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8992689 aataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaa 8992788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 9017036 - 9017235
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9017036 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatg 9017135  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatc-aattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||  || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9017136 aataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaa 9017235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 12732214 - 12732414
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12732214 ctgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccactattatcct-agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaa 12732312  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12732313 atgaataatatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttgttttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 12732412  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  12732413 aa 12732414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 22050087 - 22050287
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22050087 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatat-acccttaaatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 22050185  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22050186 atgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 22050285  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  22050286 aa 22050287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 364746 - 364544
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt-accaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  364746 ctgtcattttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgtttttaccaatattgtcattaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatatta 364647  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  364646 aatgaagaaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaagatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaat 364547  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  364546 taa 364544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7632240 - 7632046
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7632240 ctgtcactttcaaagttcaaagcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatgttaa 7632141  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||| ||| |  |||||||||||| ||||    
T  7632140 ataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtaataattattgattgtcttgatttatataaaatgtcaaaaagtga 7632046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 23777337 - 23777535
Alignment:
Q  4 tcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23777337 tcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttgctcatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatg 23777436  T
Q  104 aataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| || || ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23777437 aataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttatttaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 23777535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22784871 - 22784670
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |  ||||||    
T  22784871 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattgtggagagaaaaatatattaaataaattattaa 22784772  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| || |||  | ||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  22784771 atgaataaggctattatagtaaaagtatacattattgtatcaaaagtagtatcatttattgaatatcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 22784672  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  22784671 aa 22784670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 8176474 - 8176672
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  8176474 ctgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgtt---ttaccaatattatcttttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaa 8176570  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  8176571 attaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatt 8176670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32359638 - 32359442
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  32359638 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat-ttgttttaccaat--tatccttagttatttattgcggagagaga--tatatgaaatgagatattta 32359544  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  32359543 atgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagaagtgtcaattattaattgtcttggtttgtataaaatatcaaaatgtaacaatt 32359444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 30388759 - 30388901
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30388759 ctgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatgcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaa 30388858  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaa 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30388859 atgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaa 30388901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 202
Target Start/End: Original strand, 3850408 - 3850559
Alignment:
Q  53 ccttagttatttattgaggag--agataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagt 150  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  3850408 ccttagttatttattacggagggagatatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttgtggcatcaaaagtagt 3850507  T
Q  151 atcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3850508 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaa 3850559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7056343 - 7056142
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7056343 ctgtcactttcaaaattcaatccaacattaaatgttgatttatcaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 7056244  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  |  |||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7056243 atgaccaaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaatt 7056144  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  7056143 aa 7056142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9838325 - 9838124
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9838325 ctgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagggaaatatatgaaatgagatattaa 9838226  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||| || || ||| |||| ||| |||||| ||||| ||| ||  ||||||||    
T  9838225 atgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaatt 9838126  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  9838125 aa 9838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30416278 - 30416077
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    |||||||    
T  30416278 ctgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagttatttatggcggagagagaaatatatgaaacagaatattaa 30416179  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| || ||| ||||    
T  30416178 atgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaacatatgataatt 30416079  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  30416078 aa 30416077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31244952 - 31244751
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  31244952 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaattcttgttttatcaatattattcttagatatttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 31244853  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |    |||| |||||||||| || || || ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  31244852 attaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtactaccatttattgattgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaatt 31244753  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  31244752 aa 31244751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11431359 - 11431159
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11431359 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaaccttagttatttattgtcgagagataaatataggaaataagatattaaa 11431260  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | | ||| || ||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||| |  |  | ||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  11431259 ttagtaaagttattatcgtaaaagtataagttattgtatcaaaagtaggaatagctattgattgtcttgatttgtgtaacatgtaaaaatgtgacaatta 11431160  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  11431159 a 11431159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17251457 - 17251257
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  17251457 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcaaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaat 17251358  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt-gttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
     ||||||||||||||||||||| || |    |||| ||||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17251357 taataaggtcattatagtaaaagtaaaagcaattgtatcaaaagtagtaacacttaattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaatta 17251258  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  17251257 a 17251257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 7235478 - 7235628
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  7235478 ctgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagttatttattgtggagagagggatatatgaaatgagatattaa 7235577  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||    
T  7235578 atgaataaggttattatagtaaaagtatattgtattgtatcaaaagtagta 7235628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 11128877 - 11129070
Alignment:
Q  9 ttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  11128877 ttcaaagttcaattcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagatacatatgaattgaaatattaaattaataa 11128976  T
Q  109 ggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||| || || ||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11128977 ggtcattatagtaaaaataaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 11129070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 34730598 - 34730787
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34730598 ctgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattatccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattga 34730697  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| || |  |||  |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  34730698 atgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatcaaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatcaaaa 34730787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 30237016 - 30237166
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30237016 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattacccttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatattaa 30237115  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||    
T  30237116 attaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagta 30237166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24356257 - 24356056
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  24356257 ctgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattccggagagagaaacatatgaaatgaaatattaa 24356158  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || |||||||||||||||||| |||     || | ||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||   ||||| |||||| |||||||||    
T  24356157 atcaacaaggtcattatagtaaaagtattagcaatggtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttggataaaatatcaaaaagtgacaatt 24356058  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  24356057 aa 24356056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 33260738 - 33260939
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  33260738 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaacattaa 33260837  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatc-----aattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtga 195  Q
    || ||||||||||||||||| ||| || |    |||| ||||||||||||| |     | || ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33260838 attaataaggtcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacattatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtga 33260937  T
Q  196 ca 197  Q
    ||    
T  33260938 ca 33260939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 34378897 - 34379098
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  34378897 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattatggagagtgaaatatatgaaataagatattaa 34378996  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||| |||||   ||||||||||| |||   |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||    
T  34378997 atgactaaggcttttatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagtt 34379096  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  34379097 aa 34379098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 34607136 - 34607325
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  34607136 ctgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatggtgttttaccaatattatccttacttatttattgcagagagagacatatatgaaattagatattaa 34607235  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    | ||||||| | |||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||| || |  |||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  34607236 acgaataagattattatagtaaaagtatacattgttgtatcaaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatgtcaaaa 34607325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 52701 - 52829
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  52701 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaattatgttttatcaatattacccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaa 52800  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatata 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  52801 atgaataaggtcattataataaaagtata 52829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 27313539 - 27313713
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaa---tatatgaaatgagatatt 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||| ||    
T  27313539 tgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatagtatatgaaatgagatgtt 27313638  T
Q  99 aaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtt 173  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||  | ||||| ||| || ||||||||    
T  27313639 aaatgaacaagataattatagaaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaacaattattgattatcttggtt 27313713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11676808 - 11676617
Alignment:
Q  9 ttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11676808 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattactcttagatatttatt--gcagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataa 11676711  T
Q  109 ggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||||| || |    |||| |||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  11676710 ggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaa 11676617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17601342 - 17601135
Alignment:
Q  2 tgtcacttt-caaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17601342 tgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaa 17601244  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaa-------aatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgt 193  Q
    || |||||||| |||||||||||       ||||||  |||||| ||||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17601243 ataaataaggttattatagtaaaaatagaaaatataaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaacgtcaaaatgt 17601144  T
Q  194 gacaattaa 202  Q
    |||||||||    
T  17601143 gacaattaa 17601135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31854693 - 31854570
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattg--aggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31854693 tgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttattttaccaacattacccttagttatttattgcaaagagagataaatatatgaaataagatatta 31854594  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaa 123  Q
    ||||| |||||  |||||||||||    
T  31854593 aatgactaaggctattatagtaaa 31854570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 1249588 - 1249778
Alignment:
Q  12 aaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt 111  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  1249588 aaagttcaattcaattttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaatgagac 1249687  T
Q  112 cattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
     ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| |  ||||| ||| || |||||||||||    
T  1249688 aattatagtaaaaatatcaattattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttagtttatataaaatatcataaagtgacaattaa 1249778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32251146 - 32250954
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||| |||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  32251146 tttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttagatatt-attgcagagagagaaatatatgaaatgaggtattaaatgatta 32251048  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| ||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  32251047 aggttattataggaaaaagataaattcttgcatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgataattaa 32250954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26485841 - 26485687
Alignment:
Q  46 atattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaa 145  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  26485841 atattatcctttctcatttattgtggagaga--aatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaa 26485744  T
Q  146 gtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||| || || |||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  26485743 gtagtaacatttattgaatgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaa 26485687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24635746 - 24635947
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  24635746 ctgtcattttcaaagttcaatgtaacaatgaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcagagagagaaatatgtgatataagatattaa 24635845  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||| |||||  |||||||||||  ||||  |||||| || | ||  |||| || || ||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  24635846 atgactaaggctattatagtaaatgtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacattt 24635945  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  24635946 aa 24635947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Original strand, 13597453 - 13597597
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    |||||||||||| |||| || | ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13597453 actttcaaagtttaatgtaaaattaa-tgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagaaagaaatttatgaaatgagatattaaatgta 13597551  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
     ||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  13597552 aaaggttattatagtaaaaatataaattattatatcaaaagtagta 13597597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 7170190 - 7170372
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  7170190 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccattattacccctaaatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaatattaa 7170289  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaat 183  Q
    ||  ||||||| |||||| ||||| || |    |||| ||||||||||||| || || ||| |||||||  |||||| |||||    
T  7170290 atttataaggttattataataaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaaat 7170372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 19811994 - 19812144
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||    
T  19811994 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttaattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaa 19812093  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  19812094 atgatgaaggttattataagaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 19812144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22400767 - 22400582
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||| |||| |||||| | ||  |||||    
T  22400767 ctgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattatgaggagagaaatgtatgaagttagtgattaa 22400668  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtc 186  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||   || ||  ||||||||||||| || || |||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  22400667 atgaataatgttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtc 22400582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 24948281 - 24948397
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  24948281 ctgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatagtgttttactaatattacccttggatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaa 24948380  T
Q  101 atgaataaggtcattat 117  Q
    || ||||||||||||||    
T  24948381 attaataaggtcattat 24948397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 15432716 - 15432909
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  15432716 tttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattactgagagataaatatatgaaatgaaatattaaattatta 15432815  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||| ||||||| ||||| |||  || ||| |||||||||||||  || | ||  ||||||| ||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  15432816 aggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttagtttgtgtagaaagtcaaaatatgacaattaa 15432909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 1923890 - 1924091
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgtttt-accaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||  ||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1923890 tgtcacttttaaattttaatgcaaccttaaatattgtttttatcaatattacctttagttatttattgcaatgagataaatatatgaaatgagatattaa 1923989  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||     ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || || || || ||| || ||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  1923990 atgaataatactgttatagtaaaagtataaattatttcatcaaaattaataacatttattgattatcttggtttatataaaatgtgaaaaagtgacaatt 1924089  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  1924090 aa 1924091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11001005 - 11000812
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  11001005 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgatta 11000906  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||  ||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| |||||  || | ||  ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  11000905 aggatattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaatagta-aaagtatttgttgtcttagtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaa 11000812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 30388935 - 30389005
Alignment:
Q  132 ttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30388935 ttattgcatcaaaaatagtattaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaa 30389005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 3849103 - 3849160
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttag 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3849103 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttag 3849160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19645847 - 19645724
Alignment:
Q  81 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattg--catcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgc 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||   |||||   ||||||||||||| ||  | ||| ||||||| |||||||     
T  19645847 tatatgaaatgtaatattaaatgaacaaggctattatagtaaaagtataaagtattgtatatcaaaagtagtaacatctattgattgtcttagtttgtgt 19645748  T
Q  179 aaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  19645747 aaaatgtcaaaaagtgacaattaa 19645724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2381205 - 2381062
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| | |||||| |||||| |||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||   ||||||| | ||    
T  2381205 tttcaaagttcaatgtattattaaatgtggctttacctatattacccttatatatttattgcaaagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataatta 2381106  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  2381105 aggttattataggaaaaagataatttgttgtatcaaaaatagta 2381062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Original strand, 7632488 - 7632584
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 104  Q
    |||| |||| ||||| | || ||||||||||||||   ||||||  ||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7632488 tttctaagtccaatgaatcaataaatgttgttttatttatattactcttagatatttattgtagagataaaaatatatgaaatgagatattaaatga 7632584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 202
Target Start/End: Original strand, 53807 - 53870
Alignment:
Q  139 atcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  53807 atcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtatatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaa 53870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 190
Target Start/End: Original strand, 24949253 - 24949334
Alignment:
Q  109 ggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||||||||||||||| || |  | |||| ||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  24949253 ggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaa 24949334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 77126 - 77327
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  77126 ctgtcactttcaaagtccaatgcaatattaaatgttgttttactaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaa 77225  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  77226 atgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaatt 77325  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  77326 aa 77327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8393
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8192 ctgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattcttcttagttatttattgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaa 8291  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8292 atgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 8391  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  8392 aa 8393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 143; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 69139 - 69336
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  69139 tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaa 69238  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  69239 tgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtat-aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 69336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 137; Significance: 9e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26329 - 26129
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  26329 tgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaattgaatattaaa 26230  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  26229 tgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaatta 26130  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  26129 a 26129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 148348 - 148542
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  148348 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatccttagttatttattgcggagagagaaatataagaaatgatatattaaatgaata 148447  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  148448 aggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatataacaattaa 148542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 138926 - 138744
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138926 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 138827  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    || | || ||||||||| ||||  ||||||||            |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  138826 agctaatcatagtaaaagtataacttattgca------------tcaattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtaaaaatgtgacaattaa 138744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Original strand, 369448 - 369591
Alignment:
Q  6 actttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  369448 actttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttggttatttatt--gcagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgat 369545  T
Q  106 taaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
     || || ||||||| ||||| |||   | ||| |||||||||||||    
T  369546 aaaagttattataggaaaaagataaactgttgtatcaaaagtagta 369591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 492542 - 492454
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaat 90  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  492542 tgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 492454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1213 (Bit Score: 122; Significance: 8e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1213
Description:

Target: scaffold1213; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 1
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  170 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaa 71  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  70 atgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0831 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0831
Description:

Target: scaffold0831; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 2845 - 3028
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  2845 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagttgttaa 2944  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatc-aattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaat 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  2945 atgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaaattactgattgtcttggtttgtgtaaaat 3028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4753
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4554 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttattaatat-acccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaa 4652  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||  | |||||||||||||    
T  4653 ataaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaat-accaaatgtgacaatt 4751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 419694 - 419494
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  419694 tgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattactcttagttatttattacggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaa 419595  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatta 201  Q
    | |||||| | |||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||    
T  419594 taaataagattattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaatta 419495  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  419494 a 419494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 195738 - 195589
Alignment:
Q  52 tccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  195738 tccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataagatcgttatagtaaaagtatagtttattgtatcaaacatagta 195640  T
Q  152 tcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 202  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  195639 tcaattgtcgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 195589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 195941 - 195882
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 60  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  195941 ctgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagtt 195882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 184330 - 184141
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  184330 ctgtcgctttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaataagatattaa 184231  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||||  |||||| || | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  184230 atgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaa 184141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14924 - 14774
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14924 ctgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccctagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgagatattaa 14825  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||    
T  14824 atgaataagtctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 14774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 442 - 253
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  442 ctgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattatccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattga 343  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| || |  |||  |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  342 atgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatcaaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatcaaaa 253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 147331 - 147129
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaat-gagatatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||  | ||||||    
T  147331 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaataaaaatatta 147232  T
Q  100 aatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||  |    |||| ||||||||||||| || || ||  |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  147231 aattaataaggccattatagtaaaaatgaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaat 147132  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  147131 taa 147129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7462 - 7663
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||| ||| ||| ||||||| || ||||    
T  7462 ctgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattacccttagatatttattgcggggagagaaacatacgaaatgaaatcttaa 7561  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || || |||||||||||||||||| ||      |||| |||||||||||||  | || ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  7562 attaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaatt 7661  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  7662 aa 7663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30895 - 30694
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  30895 ctgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaa 30796  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaatt 200  Q
    || |  |||||| ||||||||||| || |    |||| |||||||||||||  | || ||  |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  30795 attagcaaggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaagatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaatt 30696  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  30695 aa 30694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 72149 - 72067
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatata 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  72149 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 72067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 96264 - 96063
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||    
T  96264 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaa 96165  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtg-caaaatgtcaaaatgtgacaat 199  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| ||   || |||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  96164 atgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctcaaaa-gtgacaat 96066  T
Q  200 taa 202  Q
    |||    
T  96065 taa 96063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1981 - 1832
Alignment:
Q  40 ttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgca 139  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||| |    
T  1981 ttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgta 1882  T
Q  140 tcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaa 189  Q
    | | ||  |||| || || |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  1881 taagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaa 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Original strand, 23175 - 23324
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23175 tgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttggttatttattgccgagagaaaaatatataaaatgagatattaaa 23274  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    |||  ||||| ||||||| || || |||  || ||| |||||||||||||    
T  23275 tgataaaggttattataggaagaagataaattgttgtatcaaaagtagta 23324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 62; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Original strand, 354 - 475
Alignment:
Q  2 tgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  354 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaaaattacttttagatatttattgcagagagggaaacatatgaaatgaaatattaaa 453  T
Q  102 tgaataaggtcattatagtaaa 123  Q
    | ||||||  ||||||||||||    
T  454 ttaataagaccattatagtaaa 475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14451 - 14303
Alignment:
Q  3 gtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaat 102  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14451 gtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaat 14352  T
Q  103 gaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 151  Q
    ||  ||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  14351 gatgaaggttattataggaaaaaaataaattattgcatcaaaagtagta 14303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1071 - 1169
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1071 ctgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttattacagaaagataaatatatgaaatgaaatatta 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6558 - 6460
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatatta 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6558 ctgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttattacagaaagataaatatatgaaatgaaatatta 6460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 252632 - 252813
Alignment:
Q  1 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |  ||||| ||||  ||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||    
T  252632 ctgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatattgttttgtctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaa 252731  T
Q  101 atgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgtcttggtttgtgcaaaa 182  Q
    ||||  ||||| ||||||| ||||| ||   || |||||| ||||||||||  || | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  252732 atgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcataaaaagtagtaaaaagtatttcttgtcttggtttgtgtaaaa 252813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Original strand, 599 - 695
Alignment:
Q  10 tcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaat 106  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  599 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttttcaatattacccttaattatttattacaaagagagaaatatatgaaacaatatattaaatgaat 695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 21017 - 21157
Alignment:
Q  8 tttcaaagttcaatgcaacactaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    || ||| |||||||   || ||||||| |||||||||    
T  21017 tttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttactaatactattcttagtcatttatcctagatagagaaatataaataacgagatatcaaatgaata 21116  T
Q  108 aggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagta 148  Q
    | |  ||||||| ||||| |||  |||||  ||||||||||    
T  21117 aaggtattataggaaaaagataaattattatatcaaaagta 21157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University