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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF18491_low_6 (Length: 557)
Name: NF18491_low_6
Description: NF18491
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18491_low_6 |
 |  |
|
| [»] scaffold0006 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0702 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0662 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0238 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1480 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0069 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 11329825 - 11330068
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
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| T |
11329825 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
11329924 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11329925 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
11330024 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
11330025 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
11330068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 39554015 - 39554255
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39554015 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
39554114 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
39554115 |
ccttgggaaattttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
39554214 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39554215 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
39554255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16825593 - 16825351
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825593 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
16825494 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16825493 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
16825394 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825393 |
tcctaggaattaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
16825351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8419828 - 8419588
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419828 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
8419729 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8419728 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
8419629 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419628 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
8419588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27214094 - 27213854
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27214094 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaacagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttt |
27213995 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27213994 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
27213895 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27213894 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
27213854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27419463 - 27419223
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27419463 |
ctttataatattcctagggaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
27419364 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27419363 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
27419264 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27419263 |
tcccgggaatcagcaattataacttgaaacaaacacaccct |
27419223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 27248125 - 27248368
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27248125 |
ctttataatattcctatgaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
27248224 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27248225 |
ccttgggaaattttttctattcccagtaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
27248324 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27248325 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
27248368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 43949077 - 43949315
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43949077 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt |
43949176 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43949177 |
ccttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
43949276 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43949277 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
43949315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35488428 - 35488187
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488428 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccaccctttt |
35488329 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35488328 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
35488229 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488228 |
tcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
35488187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 45045458 - 45045699
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45045458 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
45045557 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45045558 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
45045657 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45045658 |
tcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacacccta |
45045699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 48341192 - 48341430
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
48341192 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccat |
48341291 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48341292 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc-gggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
48341390 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48341391 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
48341430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 40212721 - 40212960
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40212721 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttt |
40212820 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40212821 |
tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccccggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
40212920 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40212921 |
tcccgcgaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
40212960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 48313954 - 48314197
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48313954 |
ctttataatattccaaggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt |
48314053 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48314054 |
ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttctaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
48314153 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48314154 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
48314197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25924876 - 25924631
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25924876 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccaccctttt |
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T |
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T |
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T |
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246 |
Q |
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33378866 |
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T |
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Target: chr7; HSP #16
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T |
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247 |
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Target: chr7; HSP #17
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Q |
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T |
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242 |
Q |
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Target: chr7; HSP #18
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Q |
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T |
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202 |
Q |
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T |
 |
| Q |
104 |
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203 |
Q |
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T |
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| Q |
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243 |
Q |
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Target: chr7; HSP #20
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T |
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200 |
Q |
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28904229 |
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247 |
Q |
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| T |
28904228 |
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28904182 |
T |
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Target: chr7; HSP #21
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Q |
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| Q |
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203 |
Q |
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T |
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244 |
Q |
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 |
| Q |
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203 |
Q |
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243 |
Q |
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 |
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203 |
Q |
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T |
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| Q |
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246 |
Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
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Q |
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T |
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242 |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
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Q |
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 |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
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204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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| |
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 |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
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| |
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 |
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tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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| |
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203 |
Q |
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48160631 |
T |
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245 |
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|
|
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48160630 |
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48160589 |
T |
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Target: chr7; HSP #29
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Target Start/End: Complemental strand, 25045838 - 25045615
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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220 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
25045640 |
tataacttgaaacaaacacaccctaa |
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T |
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Target: chr7; HSP #30
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Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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247 |
Q |
| |
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|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
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T |
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Target: chr7; HSP #31
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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241 |
Q |
| |
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|||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
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| T |
37534145 |
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T |
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Target: chr7; HSP #32
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
132 |
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230 |
Q |
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T |
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| Q |
231 |
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244 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |
|
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| T |
18824205 |
aacaaacacaccct |
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Target: chr7; HSP #33
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5 |
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104 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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204 |
Q |
| |
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||| | || ||||||||||||| |||||| ||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |
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| T |
41684160 |
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41684061 |
T |
 |
| Q |
205 |
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245 |
Q |
| |
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| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
41684060 |
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T |
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Target: chr7; HSP #34
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120 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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219 |
Q |
| |
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| T |
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11000750 |
T |
 |
| Q |
220 |
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247 |
Q |
| |
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11000751 |
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Target: chr7; HSP #35
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Q |
| |
|
||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
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| |
|
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200 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |
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T |
 |
| Q |
201 |
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240 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
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207 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
208 |
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241 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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Target: chr7; HSP #38
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| |
|
|||| |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
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taacattataatattccaagtaaccttaaaactagggattataataggtaat-tatacatgatttttttcccatctccatgagaactttattcccactac |
45440835 |
T |
 |
| Q |
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199 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||| |
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|
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45440935 |
T |
 |
| Q |
200 |
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243 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45440936 |
ttattcccaagaatctacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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Target: chr7; HSP #39
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
|
|||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
159 |
gtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
236 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||| |
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Q |
| |
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tt-tccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacata |
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Q |
| |
|
|| | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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 |
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| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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22212218 |
T |
 |
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174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22212217 |
ctattcccaggaacgttttatacgcgggattaaaatttattaaacttgtaacaaa |
22212163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38528946 - 38528764
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
38528946 |
taacattataatattctgagaaactttaaaaatagggattataatatgcaat-tacacataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcacctt |
38528848 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
186 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38528847 |
tttctttgata--tttattctattcccaataacattttatacccaagaataaaatctagtaaacttgtaacaaacataagcatata |
38528764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5543373 - 5543131
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5543373 |
taacattataatgttcccgggaaccataaaaatatggattataataggtaat-tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcccactat |
5543275 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttcctt-gagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
199 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| || |
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| T |
5543274 |
ttttctttgggaaaaaatttctattcccaagaaagttttatacgagagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtatatttatatcgtt |
5543175 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || | |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
5543174 |
ttattcccaagaatctacgaaaataacttg-aacaaacgcaccct |
5543131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 242
Target Start/End: Original strand, 45723211 - 45723277
Alignment:
| Q |
176 |
ataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45723211 |
ataggcatatatattcctatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
45723277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47246300 - 47246064
Alignment:
| Q |
6 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc |
105 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47246300 |
ttataatactcctag--accttaaaaatagggattataatagatagtttacacatgaatttattctcatattcatgggaactttattctcacccttttct |
47246203 |
T |
 |
| Q |
106 |
ttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcc--tatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
|| | ||| || | ||||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |
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|
| T |
47246202 |
tttaaaaaaaatt-caattcctaagaacattttatacctgagaataaaattcagtaaacttgtaacaaacatagaaatatatatttctatatcattttat |
47246104 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47246103 |
ttctaagaatctacaaatataatttgaaacaaacgcaccc |
47246064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10902779 - 10902689
Alignment:
| Q |
114 |
ttttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10902779 |
ttttttctattcccaaaaacattttatatccaaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttatt |
10902689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43569926 - 43569775
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43569926 |
taactttataatatttttagaaatcataaaaatagggattataatagat-aattatttatgaatttatttacatcctcatgtgaattttattcccaccct |
43569828 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaa |
153 |
Q |
| |
|
||| ||| | || ||||| |||| | | ||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43569827 |
ttttcttaggtaaatttttatatttcgaagaatattttatacccgggaataaa |
43569775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 31598623 - 31598742
Alignment:
| Q |
117 |
tttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaa |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
31598623 |
tttctattcc-aggaacgttttataccttgtaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataagcatttgtatttctatcgttttattttcaggaatcta |
31598721 |
T |
 |
| Q |
217 |
caattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31598722 |
tgaatataacttgaaacaaac |
31598742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31921813 - 31921747
Alignment:
| Q |
177 |
taggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31921813 |
taggcatatatatttctatcattttatttccga-aatgaacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
31921747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 206
Target Start/End: Original strand, 20601277 - 20601355
Alignment:
| Q |
128 |
aggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcc |
206 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20601277 |
aggaaaattttacacctagaaataaaatttaataaatttataacaaacattagaatgtacattcctatcattttattcc |
20601355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 247
Target Start/End: Original strand, 19156613 - 19156692
Alignment:
| Q |
168 |
taacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || |||||| |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19156613 |
taacaaacattggaatgtacatttctatcattttattcttgaaaatatacaaatataacttgaaacaaacacatcctaaa |
19156692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 247
Target Start/End: Original strand, 20756012 - 20756091
Alignment:
| Q |
168 |
taacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || |||||| |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20756012 |
taacaaacattggaatgtacatttctatcattttattcttgaaaatatacaaatataacttgaaacaaacacatcctaaa |
20756091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11239359 - 11239117
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239359 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
11239260 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11239259 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
11239160 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239159 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
11239117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 26848851 - 26849094
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26848851 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccaccct |
26848950 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26848951 |
tttccttaggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
26849050 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849051 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
26849094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8476547 - 8476307
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476547 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
8476448 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8476447 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacaggcatatacattccaatcattttat |
8476348 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476347 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
8476307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48339996 - 48339754
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48339996 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
48339897 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48339896 |
ccttgggaaattttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttatatcattttat |
48339797 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48339796 |
tcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacatcctaa |
48339754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 20297624 - 20297868
Alignment:
| Q |
3 |
actttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttt |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20297624 |
actttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttt |
20297723 |
T |
 |
| Q |
103 |
tccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta |
202 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20297724 |
tccttggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcatttta |
20297823 |
T |
 |
| Q |
203 |
ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20297824 |
tttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
20297868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 40908104 - 40908339
Alignment:
| Q |
11 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgag |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40908104 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttggg |
40908203 |
T |
 |
| Q |
111 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40908204 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
40908303 |
T |
 |
| Q |
211 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908304 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
40908339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 44952137 - 44952381
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcc-taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccc |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44952137 |
taactttataatattccttaggaa-cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccc |
44952235 |
T |
 |
| Q |
100 |
ttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
199 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44952236 |
ttttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcatt |
44952335 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
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|
| T |
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ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 1099031 - 1099267
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Q |
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T |
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203 |
Q |
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T |
 |
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204 |
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241 |
Q |
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tcccgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33218155 - 33217917
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200 |
Q |
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T |
 |
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201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
239 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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33217955 |
tattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 6231740 - 6231501
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T |
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203 |
Q |
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T |
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| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
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tctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47115096 - 47114857
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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ccttgggaatttttttttatttccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
47114897 |
T |
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| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
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tcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28124675 - 28124436
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 |
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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243 |
Q |
| |
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28124475 |
tcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9320687 - 9320448
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Q |
| |
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T |
 |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
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| |
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T |
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tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
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| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20414704 - 20414464
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|
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
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20414604 |
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20414505 |
T |
 |
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204 |
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244 |
Q |
| |
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20414504 |
tcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
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|
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
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tcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttat |
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T |
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204 |
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224 |
Q |
| |
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31611024 |
tcccgggaatcaacaattata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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|
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| Q |
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Q |
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T |
 |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
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T |
 |
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204 |
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222 |
Q |
| |
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tccaagaaatcaacaatta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
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tttccttgggaaaaaatttatattctcaggtacattttatacatgaaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatattcctattattt |
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T |
 |
| Q |
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248 |
Q |
| |
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||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
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 |
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cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
205 |
cccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
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Q |
| |
|
| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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ctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccctaaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43719164 - 43718994
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43719164 |
ctttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataagtaaattatttatgaatt-----ccatctccatgggatctttattcccaccctttt |
43719070 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatag |
179 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43719069 |
ccttgggaaattttttctattctcaggaacattttatgccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacatag |
43718994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1247141 - 1246912
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
1247141 |
taactctataatactccttggtactataaaaatatggattataatagataa-ctatataagaatttattccgatctccatgtgaact--attcccacctt |
1247045 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
1247044 |
tttccttcggaaattttttctattaccaggaacattttattcttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatgtatttctatcattt |
1246945 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaac |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
1246944 |
tattcccgagaatcaacaaatatagcttcaaac |
1246912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 19532974 - 19533130
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19532974 |
taactttataatattcctaggaaccatgaaaatagggattataataggt-aactatttatgaatttattcccatctccaaggaaactttattcccaccct |
19533072 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaatttta |
158 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
19533073 |
tttccttggaaaaaaatttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta |
19533130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28770432 - 28770209
Alignment:
| Q |
20 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaatttttt |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
28770432 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaat-tacatatgaaatcattcccatcttcatgagaactttattcccaccattttctttgggaaaattttt |
28770334 |
T |
 |
| Q |
120 |
ctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaa |
219 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
28770333 |
ctattgctaggaacgttttatacccaggaatcaaatttagtaaacttgtaccaaacatagacatgcatatttctatctttttattcccaggaatctacga |
28770234 |
T |
 |
| Q |
220 |
ttataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28770233 |
atataacttgaaagaaacacaccct |
28770209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12228492 - 12228256
Alignment:
| Q |
5 |
tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc |
104 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
12228492 |
tttatgatattcttaggaatcataaaaataagtattataatagataa-ctacatatgattttattctcatctccatgggaactttattctcacc-ttttc |
12228395 |
T |
 |
| Q |
105 |
cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12228394 |
tttggaaatttttttctattcccagaaacattttgtacccgagaataaaatttagtaaacttgtaataaacataggcatatatatttctatcattttatt |
12228295 |
T |
 |
| Q |
205 |
cccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
| | ||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
12228294 |
cgcaggaattaacaactatattttaaaacaaacacaccc |
12228256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12931124 - 12930945
Alignment:
| Q |
59 |
ataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaatttta |
158 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
12931124 |
ataattttattcccatctctatgggaactttattcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccataaacattttatacc-gggaataaaattta |
12931026 |
T |
 |
| Q |
159 |
gtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12931025 |
gtaaacttgtaacaaacatagccatatgcatttttatgattttattcccaacaatctacaa-tataacttgaaacaaacaca |
12930945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 29512432 - 29512546
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29512432 |
ctttataatattcataggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctctatgggaactttatttccaccctttt |
29512530 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaatttttt |
119 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29512531 |
ccttgggaaatttttt |
29512546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 32071276 - 32071508
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||| |
|
|
| T |
32071276 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaataaagattataataggt-aactacatacaaatttattctcatctccat-gtaactttattctcgccct |
32071373 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
32071374 |
tttctttaagaaaatctttctatttccatgaacatttcataccca-aaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat----atatatatttctatcattt |
32071468 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
|||| | |||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32071469 |
tatttttagaaatcaataaatataacttcaaacaaacaca |
32071508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Original strand, 18460829 - 18461016
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagta |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18460829 |
aatttattttcatctccaagagaactttatttccaccattttctttgggaaaatttttctattcccagaaacattttataccaaagaataaaatttagta |
18460928 |
T |
 |
| Q |
162 |
aacttgtaacaaacataggc--atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18460929 |
aacttgtaacaaacatagacatatatatatttctattatttcattattaggaaacaacaaatataacttgaaacaaacacgccctaaa |
18461016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26849387 - 26849164
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacc-c |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849387 |
taactttataatattcataggaaccataaaaatagagattataataggt-aactatttatgaatttattctcatctctgtaggaactttattcccaccat |
26849289 |
T |
 |
| Q |
100 |
ttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
199 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
26849288 |
ttttctttgaatttttttttctattcccagaaactttttatacccggg----------agtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctatcatt |
26849199 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849198 |
ttattatcggtaat---caaatataacttgaaacaaac |
26849164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33647884 - 33647701
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagta |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||| ||| || |||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33647884 |
aatttattctcatcttcaaggaaactttatttccactcttttctttggaaatttttttatattctcagaaacgttttatacccaggaataaaatttagta |
33647785 |
T |
 |
| Q |
162 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || || ||| ||| | ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33647784 |
aacttgtaacaaacatagagatgtatatttctaacgttttattcccgagaatctacgaatattacttgaaacaaacacacccta |
33647701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2565666 - 2565459
Alignment:
| Q |
38 |
attataataggtaa--actatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacat |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
2565666 |
attataataggtaactactacgtatgaatttactctcatcttcatgggaactttattcccaccattttctttggaaaaaattttctattccaagaaacat |
2565567 |
T |
 |
| Q |
136 |
tttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
2565566 |
tttatacccggaaataaatttaac-aaacttgtaacaaacacaggtatatatatttctattattttattcctaagaatcaacaaatataacttaaaacga |
2565468 |
T |
 |
| Q |
236 |
acacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
2565467 |
acacaccct |
2565459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27823104 - 27823343
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| || || ||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27823104 |
taacattataatattcctagaaatcataaaaatatggattataacaggtaat-tacacatgaatttgttctcatcttcatgagaattttattcccaccct |
27823202 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |||| ||||| | | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
27823203 |
tttctttgggaaaattttcctatttcgatgaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttatagcaaacatagacatttatatttctatcattt |
27823302 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27823303 |
tattcccataaatttatgaatataacttgaaacaaacacac |
27823343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Original strand, 45826687 - 45826848
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| Q |
82 |
ggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggc |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
45826687 |
ggaacttttttcccatccttttctttgtgaatgttcttctattcccaggaacattttatatcatgaaataaaatttaataaacttgtaa-aaacatatga |
45826785 |
T |
 |
| Q |
182 |
atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45826786 |
atgcagatttctatcattttattccctggaatctacaacgataacttgaaacaaacacaccct |
45826848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 247
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| Q |
2 |
aactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctt |
101 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
24784040 |
aactttagaatattccaaggaaccttaaaaataaagattataataggtaat-tacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcatacactt |
24784138 |
T |
 |
| Q |
102 |
ttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttt |
201 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| ||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
24784139 |
ttctttga-aaaaactttatattcttatgaatattttata-ttaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaac--tgacatatgtatttttataatttt |
24784234 |
T |
 |
| Q |
202 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24784235 |
attccaaaaaatctacaattataacttaaaacaaacacaccctaaa |
24784280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43715370 - 43715305
Alignment:
| Q |
181 |
catatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43715370 |
catatacatttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
43715305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6832079 - 6831954
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| Q |
119 |
tctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
218 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || | | |||||||| || |||||| ||| |
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| T |
6832079 |
tctattcccaggaatattttatacct-ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgt-gttttttgtgattttatttccaggaatctaca |
6831982 |
T |
 |
| Q |
219 |
attataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6831981 |
aatataagttgaaacaaacacaccctaa |
6831954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 40584440 - 40584669
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40584440 |
taacattataatattccaaggaaccttaaaaataggaaatataataggtgat-tacacataattttattcccatctccatgggaactttattcccaccat |
40584538 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
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|||| ||| ||| |||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |
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| T |
40584539 |
tttctttggaaaaacttttctat----------attttatatccgaaaataaaatttaataaacttgtagaaaacatagacatatgcatttttatgattt |
40584628 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |
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|
| T |
40584629 |
tattctcaggaatctacaaatataacttaaaacaaatacac |
40584669 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Original strand, 29512631 - 29512705
Alignment:
| Q |
111 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatat |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29512631 |
aaattttttctattccgatgaacattttatactcaggaataaaatttagtaaacttgaaacaaacgtaggcatat |
29512705 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Original strand, 27093957 - 27094088
Alignment:
| Q |
114 |
ttttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatca-ttttattcccgggaa |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
27093957 |
ttttttctattcccataaacattttatacccgagaataagatatagtaaacttataacaaacataggcatatatatttcaatcatttttttttccgggaa |
27094056 |
T |
 |
| Q |
213 |
tcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27094057 |
cctacacatataacttaaaacaaatacaccct |
27094088 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28693570 - 28693423
Alignment:
| Q |
99 |
cttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcat |
198 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| | ||| ||| | |
|
|
| T |
28693570 |
cttttctttgagaaaatttttctattctcaggatcgttttatactcatgaataaaatttaattgacttataacaaacataagcatacatatttttatttt |
28693471 |
T |
 |
| Q |
199 |
tttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28693470 |
tttattctcgggaatctatgaatataacttgaaacaaacacactctaa |
28693423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28139846 - 28139716
Alignment:
| Q |
117 |
tttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaa |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||| |||| | |
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|
| T |
28139846 |
tttctattcccaagaacgttttatatccgaaaataaaatttactaatcttgtaacaaacataagcatgtatatttctatctttttattcctaagaatata |
28139747 |
T |
 |
| Q |
217 |
caattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28139746 |
cgaatataacttgaaacaaacgcaccctaaa |
28139716 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 55435488 - 55435390
Alignment:
| Q |
147 |
gaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
55435488 |
gaataaaatttaacaaacttgtaacaaacatgagaatgcatattcctatcattttattcccaggtatctacaaaaataacttgaaacaaatacacccta |
55435390 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39932622 - 39932529
Alignment:
| Q |
146 |
ggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggc--atatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39932622 |
ggaataaaatttagtaaacttataacaaacataaacatatatacatttctatcattttattcccatgaatttatgaatataacttgaaacaaac |
39932529 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9320446 - 9320405
Alignment:
| Q |
177 |
taggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
218 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9320446 |
taggtatatacattcctatcattttattcccgagaatcaaca |
9320405 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 244
Target Start/End: Original strand, 29512704 - 29512751
Alignment:
| Q |
197 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29512704 |
attttattcccagaaattaaaaattataacttgaaacaaacacaccct |
29512751 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 18460682 - 18460731
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
51 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18460682 |
taactttataatattcatag-aaccataaaaacagggattataatcggtaa |
18460731 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 48879161 - 48879406
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48879161 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
48879260 |
T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48879261 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
48879360 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaagt |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48879361 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccttaagt |
48879406 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 25932274 - 25932519
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25932274 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
25932373 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25932374 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattt |
25932473 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25932474 |
tattcctaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
25932519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 35999522 - 35999762
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35999522 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
35999621 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35999622 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
35999721 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35999722 |
tcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
35999762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 40435733 - 40435976
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccaccct |
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T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
40435833 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattt |
40435932 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40435933 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
40435976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48519130 - 48518891
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48519130 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaataggtattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
48519031 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48519030 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
48518931 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48518930 |
tcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccc |
48518891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6280163 - 6279920
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccct |
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T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6280063 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcatatcattt |
6279964 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6279963 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
6279920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27763138 - 27762899
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| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27763038 |
ccttgggaaatattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
27762939 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27762938 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
27762899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 43723100 - 43723342
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43723100 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcaccctttt |
43723199 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43723200 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
43723299 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
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tttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
43723342 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 45596104 - 45596346
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Q |
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T |
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203 |
Q |
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| T |
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45596303 |
T |
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| Q |
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246 |
Q |
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| T |
45596304 |
tcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaacgcaccctaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39730535 - 39730290
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Q |
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T |
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200 |
Q |
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T |
 |
| Q |
201 |
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246 |
Q |
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39730335 |
tattcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 13230228 - 13229989
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Q |
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T |
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203 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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243 |
Q |
| |
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| T |
13230028 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 55968242 - 55967998
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Q |
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T |
 |
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200 |
Q |
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55968043 |
T |
 |
| Q |
201 |
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245 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18405472 - 18405230
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Q |
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T |
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| Q |
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203 |
Q |
| |
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T |
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247 |
Q |
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18405273 |
tctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
18405230 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Original strand, 23686624 - 23686863
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T |
 |
| Q |
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cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
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T |
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| Q |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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cccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 42773784 - 42774027
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Q |
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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42773884 |
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42773983 |
T |
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| Q |
204 |
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247 |
Q |
| |
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| T |
42773984 |
tcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
42774027 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41859285 - 41859044
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| Q |
4 |
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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| T |
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T |
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| Q |
204 |
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246 |
Q |
| |
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41859086 |
tcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
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T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
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tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatacatttatatcattt |
39835350 |
T |
 |
| Q |
201 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
39835349 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 4 - 244
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
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T |
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| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
25916074 |
tcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccct |
25916034 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
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 |
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203 |
Q |
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| T |
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tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccctggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttat |
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T |
 |
| Q |
204 |
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252 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
34049636 |
ttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccataaagtatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
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| |
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 |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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ccttgggaaattttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
45747836 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
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| T |
45747835 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
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| |
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 |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
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| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
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 |
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242 |
Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
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| |
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 |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacc-taggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta |
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| |
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| T |
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 |
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ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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ttcccggaaatcaacaattataacttgaaataaacacac |
41744222 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 935962 - 936206
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Q |
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T |
 |
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203 |
Q |
| |
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|
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936161 |
T |
 |
| Q |
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248 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
936162 |
tctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaag |
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T |
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Target: chr4; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 39498661 - 39498904
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Q |
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T |
 |
| Q |
104 |
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203 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39498861 |
ttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 39502000 - 39502243
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
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Q |
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T |
 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
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| T |
50672944 |
tccc-ggaatcaacaat--taacttaaaacaaacacaccct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 8322081 - 8322308
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Q |
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T |
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203 |
Q |
| |
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||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
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ccttggaaatttttttctattcccaagaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttat |
8322280 |
T |
 |
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tcccgggaatcaacaattataacttgaa |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
8322281 |
tcccaggaatcaacaattataacttgaa |
8322308 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 32953359 - 32953598
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4 |
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Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
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32953558 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32953559 |
tcctgggaatcaacaattataacttgagacaaacacaccc |
32953598 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 18931589 - 18931831
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4 |
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18931689 |
tcttggaaatttttttctattcccaggaacattttatacacgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcctatcattttat |
18931788 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18931789 |
tcccagaaatcaacaattataacttgaaacaaacacactctaa |
18931831 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 27942573 - 27942814
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgta------acaaacataggcatatacattcctatca |
197 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataataaacataaacatagacatatacattcctatca |
27942772 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
239 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27942773 |
ttttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
27942814 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34238193 - 34238007
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4 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatt |
190 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
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T |
 |
| Q |
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210 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27555369 |
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27555452 |
T |
 |
| Q |
211 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27555453 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
27555488 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
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ataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaat-tatttatgaaattattttcatctttatggaaattttattcccaccattttcttt |
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T |
 |
| Q |
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gagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
207 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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30415941 |
T |
 |
| Q |
208 |
gggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30415942 |
gggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
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| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||||| |
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|
| T |
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tttccttgggaaattttttatattcccggaaacattttatacat-ggaataaaatttagtaaacttattacaaacatagacatgtatatttctatcattt |
38414238 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
38414239 |
tattccc--gaatcaacaaatataactttagacaaacacacc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
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|
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|
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ttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
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| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || || ||| ||| |
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|
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ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
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Q |
| |
|
||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
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ttattttcaaaaatctacaattataacttgaaacaaacacaccataaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 48873857 - 48873978
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4 |
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| |
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|
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ccttgagaaattttttctattc |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18405587 - 18405828
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tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||| |
|
|
| T |
18405686 |
tttctttaggaaaaattttctattcctaggaacattttatacctagaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatgtatatttatatcgttt |
18405785 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| | |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18405786 |
tattctcggaaatctctgaatataacttaaaacaaacacaccc |
18405828 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #38
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Target Start/End: Complemental strand, 47426476 - 47426269
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47426476 |
taactttataatattcctaggaacc-------tagggattataataggtaa-ctatttatgaatttattttcatcttcatgggaactttattgccaccct |
47426385 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttc-cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatat-acattcctatcat |
198 |
Q |
| |
|
||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
47426384 |
tttttcttgataatatttttctatttccaggaacattttatatcaagaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatataatattcatatcat |
47426285 |
T |
 |
| Q |
199 |
tttattcccgggaatc |
214 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| |
|
|
| T |
47426284 |
tttattctcaggaatc |
47426269 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
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Target Start/End: Complemental strand, 36858618 - 36858374
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1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36858618 |
taacattataatattcccggaaaccataaaaatagggattataatatgtaat-tacatatgaaattattctcatcttcatgggaactttattcccaccct |
36858520 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttg-agaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
199 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| || |
|
|
| T |
36858519 |
tttatttgaattttttttttctattctcaggaacattttatacccgggcataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagc--atgcatttctatcttt |
36858422 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36858421 |
ttattcttgggaatctaagaatataacttgaaacaaacacaccctaaa |
36858374 |
T |
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Target: chr4; HSP #40
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186 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
10400961 |
tttattcccaccaatttctttgggaaattttttctatttccaggaatattttatacccaagaataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatata |
10400862 |
T |
 |
| Q |
187 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
238 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10400861 |
catttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaaca |
10400810 |
T |
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9 |
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108 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
7258805 |
taatattccaaggaaccataaaaattaggactataataagtagt-tacaaatgaatttattcccatattcatgggaactttattcccactcttttctttt |
7258903 |
T |
 |
| Q |
109 |
agaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccg |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7258904 |
ggaaattttttctattcccaggaacattttatacgcggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacaaagacatgtatatt-ctatcattttattctaa |
7259002 |
T |
 |
| Q |
209 |
ggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
|||||| || | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7259003 |
ggaatctaccaatataacttgaaacaaacgcacc |
7259036 |
T |
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Target: chr4; HSP #42
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100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51968612 |
taacattataatatttctgagaaccataaaaataaggattataat--gtaat-tacatatgaaattatttccatcttcatgggaactttattcccaccct |
51968708 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttcctt-gagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
199 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |
|
|
| T |
51968709 |
ttttctttgggaaacattttctattcccaggaacgttttatactcaagaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataggcatgcatatttctatcttt |
51968808 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51968809 |
ttattcccagaaatttacgaatataacttgaaacaaacacaccct |
51968853 |
T |
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Target: chr4; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Original strand, 52469535 - 52469734
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
52469535 |
ctttataatattcctatgaaccataaatatagagattataataggt-aactatattggaatttatttccatctccatgggaactttattcccaccaattt |
52469633 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |
|
|
| T |
52469634 |
ccttggaaaaaaatttctattcctagaaacattttattgccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatatgcaattctatcattttat |
52469733 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 38394745 - 38394943
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104 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38394745 |
ttataatatttttgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttatttccatctctatcagaactttattcccaccccttttc |
38394843 |
T |
 |
| Q |
105 |
cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
38394844 |
tttgggaatttttttatatttccagaaatattttatac-taggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatgtatattcccatcgttttatt |
38394942 |
T |
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100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36858240 |
taactttgtaatattcctaggaaccataaaaataaggattataacaggt-aactatatatgaatttattcccatctccatgagaattttattcccaccct |
36858338 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaa |
113 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |
|
|
| T |
36858339 |
tttctttgggaaa |
36858351 |
T |
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Target: chr4; HSP #46
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| Q |
6 |
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102 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
26165201 |
ttataatatttcaaagaaccttaaaaatagggaatataataataggtaat-tatacataattttattctcatcttaatgggaactttattctcactattt |
26165299 |
T |
 |
| Q |
103 |
tccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta |
202 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||| |
|
|
| T |
26165300 |
tctttatgaaaacttttctattctaag-aacattttatattcatgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtgcatttttatgatttta |
26165398 |
T |
 |
| Q |
203 |
ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26165399 |
ttctcaggaatctacaaatataacatgaaacaaacacaccctaa |
26165442 |
T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44309670 |
catgggaactttattcccacccttttctttaggaaatttttttctattctctagaacgttttata-ctaggaataaaatttagtaaccttgtaacaaaca |
44309768 |
T |
 |
| Q |
177 |
taggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||| ||||| ||||||| | | |||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44309769 |
tagacatgcatatttctatcgttttattttcagaaatctacgaatataacttgaaacaaac |
44309829 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
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183 |
tatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
239 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34237480 |
tatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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T |
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178 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| | ||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12276075 |
atgggaattttattcccaccttttcttttgggaaaatatttctttttccaagaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
12275976 |
T |
 |
| Q |
179 |
ggcatatacattcctatcatttt |
201 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
12275975 |
aacatatatatttctatcatttt |
12275953 |
T |
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tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48059893 |
tttataatatttctaggaattataaaaataagaattataataggtaat-tatatatgaatttatttatatttttatgagaactttattcccaccatttta |
48059991 |
T |
 |
| Q |
105 |
cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacata |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||| |||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48059992 |
tttgggaaattttttctattcccataaatattttatatccaaaaataaaatttaataaactcgtaacaaacata |
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T |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32384635 |
taacattataatattcctggaaaccataaaattagggattataataggt-aattgcacataaatttgttccaatctttatgggaattttattcccaccct |
32384537 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaa-ttttttctattcccaggaacattttatacc |
143 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
32384536 |
tttctttgggaaatttttttctgtttccatgaacgttttatacc |
32384493 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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161 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||||| |||| || |
|
|
| T |
37014566 |
aatttattctcatcttcatgagaactttatttccactcttttctttgggaaattttttctattcctatgaacatgttatacctggatataaaatttaata |
37014467 |
T |
 |
| Q |
162 |
aacttgtaacaaacat |
177 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |
|
|
| T |
37014466 |
aactcataacaaacat |
37014451 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22654638 |
aactttattcccaccctttttttttggagaaagtttttctattcgcaataacattttttacccgagaataaaaattagttaacttgtaataaacataggc |
22654539 |
T |
 |
| Q |
182 |
atatacattcctatcattttattc |
205 |
Q |
| |
|
|| || ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22654538 |
atgtatatttctatcattttattc |
22654515 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 22 - 240
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22 |
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120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24805305 |
aaccataaaaatagggaatataataggtaat-tacacatggatttattcccatattcatgggaactttattttccaccattttctttgtgaaattttttc |
24805207 |
T |
 |
| Q |
121 |
tattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| | || |||||||| | | |||| || | |
|
|
| T |
24805206 |
tattccca-aaatgttttattcccgaaaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataaacatgtatatttttttcgttttattctcagaaatctacgaa |
24805108 |
T |
 |
| Q |
221 |
tataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24805107 |
aataacttgaaacaaacaca |
24805088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9327342 - 9327241
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147 |
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245 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
9327342 |
gaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacacccta |
9327243 |
T |
 |
| Q |
246 |
aa |
247 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
9327242 |
aa |
9327241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9374101 - 9374000
Alignment:
| Q |
147 |
gaataaattttagtaaacttgtaa-caaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
9374101 |
gaataaaatttagtaaacttataaacaaacatagacatatatatttctaacattttatttttaggaatcaacaaatataacttgaaataaaaacacccta |
9374002 |
T |
 |
| Q |
246 |
aa |
247 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
9374001 |
aa |
9374000 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18094082 - 18094325
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| Q |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |
|
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| T |
18094082 |
taacattataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttattctcaccat |
18094180 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaa---attttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatca |
197 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | | || ||| |||||| |
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|
| T |
18094181 |
tttctttg-gaattttttttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaa-attagtaaacttctagcaaacataagaaggtatatttctatca |
18094278 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||| | | |||| || | ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18094279 |
ttttattttcagaaatctacgaatattacttgaaacaaacccaccct |
18094325 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 10401019 - 10400973
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| Q |
5 |
tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
51 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10401019 |
tttataatattcctcggaaccataaaaataaggattataataggtaa |
10400973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 30790380 - 30790517
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| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || || |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
30790380 |
taacattataatattccaaggaaccttaaaaatagaatttataataattacac-----ataattttatttccatcttcatggaaactttattcccatcct |
30790474 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacc |
143 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30790475 |
tttcattggaaaaacttttctattctcagaaacattttatacc |
30790517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 36860106 - 36860191
Alignment:
| Q |
156 |
ttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36860106 |
ttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttatatcattttatt-taagaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
36860191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 248
Target Start/End: Original strand, 37296665 - 37296758
Alignment:
| Q |
155 |
tttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaag |
248 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| || |||||| | | |||||| | |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
37296665 |
tttagcaaactagtaacaaacataagcatgtatatttctatcattttatttccaggaatctatgaatataaccttaaacaaacgcacccgaaag |
37296758 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46382342 - 46382156
Alignment:
| Q |
59 |
ataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaaca-ttttatacctaggaataaatttt |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || |||| || ||||||||||||||||| | ||| | |||||||| || |||||| ||| |
|
|
| T |
46382342 |
ataaatttatttttatcttcatgagaactttatttcctccattttttttaagaaattttttctattctctagaatatttttatacttaaaaataaaattt |
46382243 |
T |
 |
| Q |
158 |
agtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc----gggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| || | || | ||||||||||||| |||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46382242 |
attaaacttgtaacaaatgtatgagtacatattcctatcatttcattctcaaaagagaatctacaaaaataacttgaaacaaacaca |
46382156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 54478495 - 54478555
Alignment:
| Q |
118 |
ttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacata |
178 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54478495 |
ttctatttccaataacattttatacccatgaatgaaatttagtaaacttataacaaacata |
54478555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 9115670 - 9115911
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115670 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
9115769 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9115770 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
9115869 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115870 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
9115911 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 25789596 - 25789834
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25789596 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
25789695 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25789696 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
25789795 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25789796 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
25789834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3572804 - 3572564
Alignment:
| Q |
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103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572804 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
3572705 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572704 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
3572605 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572604 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
3572564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 46666541 - 46666781
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666541 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
46666640 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46666641 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
46666740 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666741 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
46666781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9832109 - 9831872
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9832109 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
9832010 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9832009 |
ccttgggaaaatttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
9831910 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9831909 |
tcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
9831872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20260325 - 20260086
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260325 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
20260226 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20260225 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
20260126 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260125 |
tcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
20260086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 2430336 - 2430574
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| Q |
11 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgag |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2430336 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataagtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
2430435 |
T |
 |
| Q |
111 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430436 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
2430535 |
T |
 |
| Q |
211 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaagt |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430536 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaagt |
2430574 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 39329441 - 39329685
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| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39329441 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
39329540 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39329541 |
tcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttat |
39329640 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaag |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39329641 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaag |
39329685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 6978603 - 6978846
Alignment:
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4 |
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T |
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Target: chr1; HSP #11
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T |
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Target: chr1; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 52630606 - 52630848
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T |
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249 |
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T |
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T |
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203 |
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T |
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240 |
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Target: chr1; HSP #15
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203 |
Q |
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240 |
Q |
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Target: chr1; HSP #16
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T |
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T |
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244 |
Q |
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Target: chr1; HSP #17
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200 |
Q |
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1597385 |
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246 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #18
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203 |
Q |
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244 |
Q |
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Target: chr1; HSP #19
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
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T |
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204 |
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244 |
Q |
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Target: chr1; HSP #20
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T |
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| Q |
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204 |
Q |
| |
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T |
 |
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205 |
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244 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
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| |
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T |
 |
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cctt-gagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta |
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Q |
| |
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T |
 |
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241 |
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tttccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
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Target: chr1; HSP #22
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 |
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tatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
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| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 1 - 244
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5518745 |
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5518647 |
T |
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200 |
Q |
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5518547 |
T |
 |
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244 |
Q |
| |
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|
| T |
5518546 |
tattcctgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
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T |
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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
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Target Start/End: Original strand, 6911318 - 6911566
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4 |
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103 |
Q |
| |
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T |
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195 |
Q |
| |
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| T |
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6911517 |
T |
 |
| Q |
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244 |
Q |
| |
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|
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| T |
6911518 |
cattttattcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
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T |
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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50191003 - 50190767
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4 |
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Q |
| |
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T |
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104 |
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203 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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241 |
Q |
| |
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| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
50190804 |
ttccggaaattaacaattatatcttgaaacaaacacac |
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T |
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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4683612 - 4683373
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Q |
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T |
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| Q |
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203 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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244 |
Q |
| |
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| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
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| T |
4683413 |
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4683373 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
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4 |
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103 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
104 |
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203 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
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204 |
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244 |
Q |
| |
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| |
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
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| T |
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48916065 |
T |
 |
| Q |
201 |
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244 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
48916064 |
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T |
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Target: chr1; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 4 - 244
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4 |
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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32202371 |
T |
 |
| Q |
204 |
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244 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
32202370 |
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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
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Target Start/End: Original strand, 13653682 - 13653917
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
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|
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taactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccat |
13653780 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |
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| T |
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13653880 |
T |
 |
| Q |
201 |
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237 |
Q |
| |
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||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |
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| T |
13653881 |
tattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac |
13653917 |
T |
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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
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Target Start/End: Complemental strand, 49823134 - 49822916
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattatcatctccatgggaactttattcccacccttttc |
49823035 |
T |
 |
| Q |
105 |
cttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
49823034 |
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49822956 |
T |
 |
| Q |
205 |
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244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49822955 |
cccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
49822916 |
T |
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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 52699707 - 52699463
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
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52699509 |
T |
 |
| Q |
201 |
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246 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
52699508 |
tattcccaggaatctacgaatataacttgaaacaaacgcaccctaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
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| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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|||| ||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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| T |
37436762 |
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37436664 |
T |
 |
| Q |
201 |
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234 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |
|
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| T |
37436663 |
tattctcgtgaatcaacaaatataacatgaaaca |
37436630 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
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| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
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|
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29091502 |
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29091595 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |
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|
| T |
29091596 |
tttttttgggaaattttttctattccgatgaacattttttactcgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttttatcattt |
29091695 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29091696 |
tattatcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
29091739 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
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| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| || |
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T |
 |
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tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
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30241038 |
T |
 |
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201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
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| |
|
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 |
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cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
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|
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| |
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46960557 |
tttcattgggaaaacttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatgcatt |
46960646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17475502 - 17475321
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagta |
161 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17475502 |
aatttactcccatctctattggaactttattcccactcttttctttgggaaattttatttattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta |
17475403 |
T |
 |
| Q |
162 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||| | | | ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
17475402 |
aacttataacaaacataaacatatatatttctatcgttttattttcgggaacctatgaatataacttgtaacaaacataccc |
17475321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24116555 - 24116338
Alignment:
| Q |
22 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttct |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| | |||| | |
|
|
| T |
24116555 |
aaccataaaaataggaattataataggtaat-tacacataaatatattctcatcttcatgggagctttattccctcccttttctttgggaattctttttt |
24116457 |
T |
 |
| Q |
122 |
attcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaatt |
221 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||| | |
|
|
| T |
24116456 |
atttacaggaacgttttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataaacatat--atttctatcgttttattctcaggaatctacaaat |
24116359 |
T |
 |
| Q |
222 |
ataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24116358 |
ataacctgaaacaaacacacc |
24116338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 47677474 - 47677716
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
47677474 |
taactttgtaatattctaaggaaccttaaaaatagggattataatatgtaat-tacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcccatcct |
47677572 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
47677573 |
ttcctttgggaaaacttttctattcaatggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaatttataacaaacacaaacatatgtatttttatgattt |
47677672 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47677673 |
tattccc-ggaatccacaaatataacgggaaacaaacacacccta |
47677716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1228118 - 1227936
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1228118 |
aactttataatatttcaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaat-tctacataattttattctaatcttcatgggaactttattcccgacctt |
1228020 |
T |
 |
| Q |
102 |
ttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatat |
185 |
Q |
| |
|
||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1228019 |
ttctttcggaaatcttttctattccaagaaacattttatacctgaaaataaaatttaataaacttgtaacaagcataggcatat |
1227936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11014622 - 11014448
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagta |
161 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| || |
|
|
| T |
11014622 |
aatttattctcatcttcatgagaactttatttccacccttttcttttgaaatttttttctattcccagaaacattttatatccgtgaatataatttatta |
11014523 |
T |
 |
| Q |
162 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11014522 |
aacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattcccaggaatctacatatataacttgaaacaaa |
11014448 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38519302 - 38519064
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccac-cc |
99 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
38519302 |
taacattataatattcttggaaaccataaaaatagggattataataggtaatttatacatgaattt-ttcctaatttcatgggaactttattcccaaacc |
38519204 |
T |
 |
| Q |
100 |
ttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
199 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||| | |
|
|
| T |
38519203 |
ttttctttgggaaaatttttct--tcccaaaaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatctgtatttctattgat |
38519106 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38519105 |
ttatttccaaaaatctacaaatataacttgaaacaaacacac |
38519064 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19083285 - 19083104
Alignment:
| Q |
63 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaa |
162 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19083285 |
atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
19083186 |
T |
 |
| Q |
163 |
acttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19083185 |
acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacaccct |
19083104 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19131173 - 19130992
Alignment:
| Q |
63 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaa |
162 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19131173 |
atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
19131074 |
T |
 |
| Q |
163 |
acttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19131073 |
acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacaccct |
19130992 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13932048 - 13931885
Alignment:
| Q |
78 |
catgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacat |
177 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13932048 |
catgggaaatttattcccacccttttctttaggaaaacatttctattcc-aggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
13931950 |
T |
 |
| Q |
178 |
aggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13931949 |
aggcatatgtatttttatgattttattcctaggaatctacaaatataacttcaaacaaacacacc |
13931885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31806935 - 31806759
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagta |
161 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31806935 |
aatttgttctcatcttcatgggaactttatttccacccttttatttgggaatttttttctattcccaggaacgttttatgttcgagaataaaatttagta |
31806836 |
T |
 |
| Q |
162 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31806835 |
aac--gtaacaaacataagcatgtatatttctatcattttattctcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacaca |
31806759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 245
Target Start/End: Original strand, 13521213 - 13521394
Alignment:
| Q |
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atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaa |
162 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13521213 |
atttattctcatctttctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctattcccaagaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
13521312 |
T |
 |
| Q |
163 |
acttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| || ||| |||||||| || |||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13521313 |
acttgtaacaaacacagacatgtatatttctatcattgta-tcccaaaaatctacaaatataattagaaacaaacacacccta |
13521394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 48462361 - 48462463
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| Q |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
48462361 |
taactttataatatttgtaggaaccataaaaataaggattataataggt-aactatttatgaatttattcccaattccatgggaactttatacccatcct |
48462459 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttc |
104 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
48462460 |
tttc |
48462463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
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| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattc |
70 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47031692 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
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| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||| ||| || | || |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9011401 |
taacattataatattcctggagaccataaaa-taagaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccaccactatgggaactttattccgaccct |
9011304 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaa-cattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
199 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| ||||| |||| || ||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
9011303 |
tttctttgggaaaaattttcgattctcacgaaaccttttataccgaa-aataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatgtatattcctatcatt |
9011205 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9011204 |
ttattttcaagaatctacgaatataacttgaaacaaac |
9011167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52186262 - 52186049
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| Q |
9 |
taatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttg |
108 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52186262 |
taatattcttagaaaccataaaaatagaaattataataggtaa-ctatgtagaaatttattcacatctcaatgtgaacttaattcccacccttt------ |
52186170 |
T |
 |
| Q |
109 |
agaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52186169 |
-----------ctattcccagaaacattttatcgtcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatatatttctatcattttattataa |
52186081 |
T |
 |
| Q |
209 |
ggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52186080 |
gaaatcaacaaatataacttgaaacaaacaca |
52186049 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 6 - 207
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6 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13440230 |
ttataatattccatggaactttaagaatatggattataataggtagt-tacatatgaatttattctcatcttcatggaaactttatttccacccttttct |
13440328 |
T |
 |
| Q |
106 |
ttgagaa--attttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
13440329 |
ttg-gaatttttttttctattctcaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaaaattctaacaaacatagtcatttatatttctatcattgtat |
13440427 |
T |
 |
| Q |
204 |
tccc |
207 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
13440428 |
tccc |
13440431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Original strand, 19094020 - 19094186
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78 |
catgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacat |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || || ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19094020 |
catgggaactttattcccacagttttctttgggaatgttatttcattatcaggaacattttatatctagaaataaaatttaataaacttgcaacaaacat |
19094119 |
T |
 |
| Q |
178 |
aggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||| || | ||| | |||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19094120 |
aggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
19094186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20505213 - 20504990
Alignment:
| Q |
21 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| ||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
20505213 |
gaaccataaaaatagggattataatatgtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaagctttattttcacctttttctttggtaatttttttt |
20505115 |
T |
 |
| Q |
121 |
t---attcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaac |
217 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| | | |||| || |
|
|
| T |
20505114 |
tcttattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattctcagaaatctac |
20505015 |
T |
 |
| Q |
218 |
aattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
|| ||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
20505014 |
aaatataatttaaaacaaacgcacc |
20504990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 1007601 - 1007669
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattc |
70 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1007601 |
taactttataatattcttaggaaccataaaaatatggattataataggt-aactatttatgaatttattc |
1007669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 29769342 - 29769526
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | ||||||| || ||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29769342 |
taacattataatatttcaaggaaccttagaaacatagattataataggtaat-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccct |
29769440 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgag-aaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatat |
185 |
Q |
| |
|
||| ||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29769441 |
ttttctttaggaaaattgttctattgccaggaacattttatgtcaaagaataaaatttagtaattttgtaacaaacatagacatat |
29769526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Original strand, 37261764 - 37261923
Alignment:
| Q |
87 |
tttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
186 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
37261764 |
tttattctcaaccttttttttgggaaattttttctattcccaaaaagattttatgtcg-ggaataaaatttaataaacttgtaacaaacatatgcatgta |
37261862 |
T |
 |
| Q |
187 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||| | |||||| | | ||||| ||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
37261863 |
tatttctataattttattctcaggaatctatgaatataatttgaaacaaacgcaccataaa |
37261923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 3939503 - 3939583
Alignment:
| Q |
134 |
attttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatc |
214 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
3939503 |
atttcatacctaggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataagcatgtatatttctatcattctattctcaggaatc |
3939583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33702528 - 33702381
Alignment:
| Q |
58 |
tataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacatttta-tacctaggaataaattt |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||| | | |||||||||||||||||| | || |||| | | || | |||||| || |
|
|
| T |
33702528 |
tataaatttattctcatcgtcatgggaattttattctcacctttttattcgggaaattttttctattccctgaaaaatttaattccccaaaaataaaatt |
33702429 |
T |
 |
| Q |
157 |
tagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33702428 |
taataaatttgtaacaaacttaagaatatatatttctatcattttatt |
33702381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16257189 - 16257008
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaacttt-attcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagt |
160 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||| | |
|
|
| T |
16257189 |
aatttatttccatcttcatggaaacttttattccaaccattttcgatgggaatatttttct-ttcctaagaatcttttatacctaagaataaaatttaat |
16257091 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| | || || ||| ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16257090 |
aaacttgtaaaaaacattgaaatgtatatttttatgattttattccaagaaatatacaaatataacttcaaacaaacacaccc |
16257008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37336664 - 37336514
Alignment:
| Q |
22 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttct |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | || | || |||||||||||||| || ||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
37336664 |
aaccataaaaatagagattataataggtaat-tatacatgaatttattctctccttcgtgaaaactttattcccactctattctttggaaagaaatttct |
37336566 |
T |
 |
| Q |
122 |
attcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaa |
173 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37336565 |
attcccaataatattttatatctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaa |
37336514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 180
Target Start/End: Original strand, 19143511 - 19143611
Alignment:
| Q |
78 |
catgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacat |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19143511 |
catgggaactttattccaacaattttt-ttgagatgttttttc-attttcaggaacatttcatatctaggaataagatttaataaacttgcaacaaacat |
19143608 |
T |
 |
| Q |
178 |
agg |
180 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
19143609 |
agg |
19143611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Original strand, 3939356 - 3939455
Alignment:
| Q |
27 |
taaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcc |
126 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3939356 |
taaaaatatagattataataggt-aaccatgtatgaatttattctcatcttaatggaaacttgattcctacacttttctttg-gaatttttttctattcc |
3939453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 49627405 - 49627454
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggta |
50 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
49627405 |
taacattataatatttcaaagaaccataaaaatatggattataataggta |
49627454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29091415 - 29091387
Alignment:
| Q |
224 |
aacttgaaacaaacacaccctaaagtatt |
252 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29091415 |
aacttgaaacaaacacaccctaaagtatt |
29091387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 52276894 - 52276930
Alignment:
| Q |
147 |
gaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
183 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
52276894 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcat |
52276930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35818663 - 35818419
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818663 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
35818564 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35818563 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
35818464 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaag |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818463 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaag |
35818419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 12710477 - 12710719
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710477 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt |
12710576 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12710577 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
12710676 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710677 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
12710719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 38363913 - 38364156
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38363913 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
38364012 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38364013 |
tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
38364112 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38364113 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
38364156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37392785 - 37392543
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392785 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
37392686 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392685 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
37392586 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37392585 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaatacaccctaa |
37392543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18726859 - 18726619
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18726859 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgagaactttattcccaccctttt |
18726760 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaatttttt-ctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta |
202 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18726759 |
ccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta |
18726660 |
T |
 |
| Q |
203 |
ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18726659 |
ttcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
18726619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38132977 - 38132733
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38132977 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgagaactttattcccaccctttt |
38132878 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaatttttt-ctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta |
202 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38132877 |
ccttgggaaatttttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcatttta |
38132778 |
T |
 |
| Q |
203 |
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247 |
Q |
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38132777 |
ttcccgagaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
38132733 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1554592 - 1554353
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5 |
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104 |
Q |
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T |
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| Q |
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204 |
Q |
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T |
 |
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244 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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cccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 26061973 - 26062216
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100 |
Q |
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T |
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101 |
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200 |
Q |
| |
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T |
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244 |
Q |
| |
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|
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| T |
26062173 |
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26062216 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 42755699 - 42755937
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Q |
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T |
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203 |
Q |
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42755898 |
T |
 |
| Q |
204 |
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242 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
42755899 |
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42755937 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32661173 - 32660932
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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202 |
Q |
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32660974 |
T |
 |
| Q |
203 |
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244 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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32660973 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 7931071 - 7931306
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Q |
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T |
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203 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
204 |
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239 |
Q |
| |
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| T |
7931271 |
tcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26602176 - 26601941
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Q |
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| Q |
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203 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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240 |
Q |
| |
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| T |
26601977 |
tcccgggaatcaacaattataatttgaaacaaacaca |
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T |
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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
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| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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3050040 |
T |
 |
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237 |
Q |
| |
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| T |
3050041 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
3050074 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10896455 - 10896217
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| Q |
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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| T |
10896355 |
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10896257 |
T |
 |
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204 |
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243 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10896256 |
tcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
10896217 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 18297944 - 18298183
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Q |
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|
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|
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T |
 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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18298143 |
T |
 |
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243 |
Q |
| |
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||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
18298144 |
tcccgagaatcaaaaattataacttgaaacaaacaaaccc |
18298183 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16313746 - 16313504
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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T |
 |
| Q |
104 |
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203 |
Q |
| |
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| T |
16313646 |
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16313547 |
T |
 |
| Q |
204 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
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 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
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| T |
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25837942 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837943 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
25837985 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
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| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
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cctcgggaaattttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtaggcatatacattcctaccattttat |
41228754 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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41228753 |
tcccgggaattaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
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Q |
| |
|
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T |
 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
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29421532 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
239 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
29421531 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 7317206 - 7317445
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| |
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tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
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| |
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||| |||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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T |
 |
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tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
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7317402 |
tatttttgaaaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
7317445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5020733 - 5020487
Alignment:
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5020733 |
taactttataatattc-tgggaatcataaaaatatggattataataggtaa-ctacttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccct |
5020636 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacat---tcctatca |
197 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |
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|
| T |
5020635 |
tttccttgggaaaatttttctattcacagaaacattttatacccgagagtaaactttagtaaacttgtaagaaacatatgcatatatattcctcctatca |
5020536 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5020535 |
ttttattcccatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacactctaa |
5020487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21137373 - 21137134
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
21137373 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatacggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccacgagaactttatttccaccat |
21137275 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |
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|
| T |
21137274 |
tttctttggaaaaatatttatattcccacaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctattattt |
21137175 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21137174 |
tattctcaggaatcaacaaatataacttcaaacaaacacac |
21137134 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 35394220 - 35394465
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
35394220 |
taactttataatattcctatgaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatatatgagtttgttcccatctccttaggaactttattcccaccat |
35394318 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
35394319 |
ttttcttggaaatttttttctattacgtagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctttcattt |
35394418 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35394419 |
tattctcgtgaatcaataaatataacttgaaacaaacaaaccctaaa |
35394465 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33444864 - 33444627
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||| || |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
33444864 |
taactttataatattcctagcaatcatacaaatagtgattctaataggtaa-ctacatatgaaattat-ctcatcttcatgggaactttattcccaccat |
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T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
33444766 |
tttctttgggcaattttttctattcccaagaacattttataccg-ggaataaaatttagtaa-cttgtaacaaacatagacatatatatttttatcattt |
33444669 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33444668 |
tattctcaggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
33444627 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40197232 - 40197076
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186 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40197232 |
tttattcccacctttttccttgaaattttttttctattcccagaaacattttatatcaaagaataaattttagtaaacttataacaaacataaacatata |
40197133 |
T |
 |
| Q |
187 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40197132 |
catttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacataccc |
40197076 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 41432570 - 41432804
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41432570 |
taacattataatattcttgggagccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattctcaatctccatgggaactttatttccaccc |
41432668 |
T |
 |
| Q |
100 |
ttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatt |
199 |
Q |
| |
|
|||| || | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
41432669 |
tttttctagggaaaaattttctattcccataaacgttttataccg-ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtgtattcctatcatt |
41432767 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
236 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| || | |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41432768 |
ttattcccaggaatccacgaatataacttaaaacaaa |
41432804 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15226795 - 15227029
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| Q |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15226795 |
taactttataaaaatccaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaat-tccacataattttattctcatcttcatgggaactttattcccaccct |
15226893 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
15226894 |
tttctttgggaa-tcttttctattcgcaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatgtatttatatgattt |
15226992 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15226993 |
tattcagaggaatctacgaatataacttgaaacaaac |
15227029 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19160977 - 19160778
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| Q |
6 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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19160879 |
T |
 |
| Q |
106 |
ttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
205 |
Q |
| |
|
||| | |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19160878 |
ttggaattttttttatattcccaagaatattttatacacgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacatctgcatatatatttatattattttattc |
19160779 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6805864 - 6805698
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| Q |
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100 |
Q |
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|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6805864 |
taactttataatattcccaggaaccatgaaaatagagattttaataggtat-ctatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattctcaccct |
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T |
 |
| Q |
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tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgt |
168 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
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tttctttaggaaaaattttctattcccaagaacatattatactcgggaataaaatttagtaaacttgt |
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T |
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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43872207 - 43871971
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43872207 |
taacattataatgtttcaaggaacctcaaaaatagggattataataggtaat-tatacgtgattttattcccatctccatatgaactttattcctaccaa |
43872109 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |
|
|
| T |
43872108 |
tttctttgaaaaaatatttatattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcatgtatgtttttatgattt |
43872009 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
238 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43872008 |
tatttccaagaatctataattataacttgaaacaaaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattccca |
73 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
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T |
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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagatattataataggt-aactatttatgaattt------atccccatgggaactttattcccaccct |
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T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatag |
179 |
Q |
| |
|
||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
31117672 |
ttttcttggaaatttttttctattctgaagaacattttatattcggaaataaaatttaataaaatcgtaacaaacatag |
31117594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16219183 - 16218942
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
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taacattataatattcttgggaaccatgaaaatggggattataataggtaat-tacacgtggatttattcccatcttcatgggaagattattcccacc-t |
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T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| | || |||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |
|
|
| T |
16219085 |
tttctttggggaaattttactattcctgagaacgttttaaaccccggaataaaatctagtaaacttgtaacaaacataggcatacatatttctatcgttt |
16218986 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||| | || | || | ||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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tattcccagaaaactacgaatataatttgaaacaaacgcaccct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
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161 |
Q |
| |
|
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|
|
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 |
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aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| | || | | | ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
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14764012 |
aacttgaaacaaacatatgcatgtatatttctatcattttattcacataaaactatgaatataacttgaaacaaacacactctaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Original strand, 25899548 - 25899702
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186 |
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| |
|
||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| || || |
|
|
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T |
 |
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cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
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Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25899647 |
catttttatgattttattcccaggaatctacaaatataatttgaaacaaacacacc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37982027 - 37981857
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| |
|
|||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37982027 |
taacattataatatttatgggaaccataaaaatagggattataacaagtaat-tacatataaatttattctcattttcataggaactttatttccaccct |
37981929 |
T |
 |
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tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaac |
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| |
|
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|
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37981928 |
tttcctt--gatttttttttaattcccaagaacgttttatatccaagaataaatttt-gtaaacttgaaacaaac |
37981857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 237
Target Start/End: Original strand, 38437369 - 38437519
Alignment:
| Q |
87 |
tttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
186 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38437369 |
tttatttccacccttttctttgggaaaaattttctattctcaggaacgttttatacccgaaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatagatatatg |
38437468 |
T |
 |
| Q |
187 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38437469 |
tattcctatcgttttattttcaggaatatacaaatataacttaaaacaaac |
38437519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 34672289 - 34672406
Alignment:
| Q |
127 |
caggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataac |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
34672289 |
caggaacattttatatctgagaataaaatttattaaacttgtaataaatgtaagcatatatatttttatcattttattttcaggaatcaacaaatacaac |
34672388 |
T |
 |
| Q |
227 |
ttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34672389 |
ttcaaacaaacacaccct |
34672406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 241
Target Start/End: Original strand, 8635664 - 8635703
Alignment:
| Q |
202 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8635664 |
attcctgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
8635703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 12649966 - 12650137
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12649966 |
taacattataatattcttaggaacttaaaaaatagagattataataggtagt-tacatgtgaatttattttcattttcatgggaactttattcccactat |
12650064 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaa |
174 |
Q |
| |
|
|||| ||| | || |||| ||||| ||| ||| ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12650065 |
tttctttgcgtaaatttt-ctatttccatgaatattttatacacagaaataaaatttaataatcttgtaacaaa |
12650137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32901854 - 32901725
Alignment:
| Q |
110 |
gaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatata----cattcctatcattttattc |
205 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
32901854 |
gaaaattttcctattcccagaaacattttatacc-atgaataaatttttttaaacttgtgacaaacataagaatatatatttatttatatcaatttattc |
32901756 |
T |
 |
| Q |
206 |
ccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
236 |
Q |
| |
|
| | |||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32901755 |
tcagaaatctacaaatataacttgaaacaaa |
32901725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14207063 - 14206820
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14207063 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
14206964 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14206963 |
tttccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattt |
14206864 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14206863 |
tattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
14206820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4765799 - 4765559
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765799 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
4765700 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765699 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
4765600 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765599 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
4765559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22936151 - 22935908
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936151 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
22936052 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22936051 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
22935952 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22935951 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
22935908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19065744 - 19065503
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065744 |
ctttataatattcctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
19065645 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065644 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
19065545 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065544 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
19065503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12970769 - 12970529
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970769 |
ctttataatattcataggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccaccctttt |
12970670 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970669 |
ccttaagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
12970570 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970569 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
12970529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 555945 - 555705
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
555945 |
ctttataatattcctaggaaccatcaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccaccctttt |
555846 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
555845 |
ccttgggaaattttttctattccctggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttat |
555746 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
555745 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
555705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11855897 - 11855658
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855897 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccaccct |
11855798 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855797 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
11855698 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855697 |
tattctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
11855658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 28602388 - 28602629
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28602388 |
ctttataatattcctaggaaccatacaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
28602487 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28602488 |
ccttgggaaattttttctattctcagaaacattttatacc-gggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
28602586 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28602587 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
28602629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 18412041 - 18412281
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18412041 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccttttt |
18412140 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412141 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
18412240 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412241 |
tcccaggaatcaataattataacttgaaacaaacacaccct |
18412281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29543254 - 29543014
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543254 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttt |
29543155 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29543154 |
tcatgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttat |
29543055 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543054 |
tcccaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
29543014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 36703706 - 36703945
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703706 |
ctttataatattcctaggaaccatcaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttt |
36703805 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36703806 |
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36703905 |
T |
 |
| Q |
204 |
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243 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703906 |
tcccgataatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 6091547 - 6091782
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4 |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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6091746 |
T |
 |
| Q |
204 |
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239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
6091747 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
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T |
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Target: chr5; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 32535769 - 32536006
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4 |
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103 |
Q |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
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| Q |
104 |
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203 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
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ccttaggaaattttttctattcccaataacattttataccaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttat |
32535968 |
T |
 |
| Q |
204 |
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241 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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32535969 |
tcctgggaatcaacaattataacttaaaacaaacacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
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Target Start/End: Complemental strand, 8646623 - 8646412
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110 |
Q |
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T |
 |
| Q |
111 |
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210 |
Q |
| |
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|
| T |
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8646424 |
T |
 |
| Q |
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222 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
8646423 |
aatcaacaatta |
8646412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 8406726 - 8406959
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103 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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203 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
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ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatataggcatgtacattcctatcattttat |
8406925 |
T |
 |
| Q |
204 |
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237 |
Q |
| |
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| T |
8406926 |
tctcgaaaatcaacaattataacttgaaacaaac |
8406959 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 27481189 - 27481429
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| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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ctttataatattcctaggaaccataaaaatagagattataatatgtaaactatttatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccaccctttt |
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T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
27481289 |
ccttgggaaatattttttattctcaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
27481388 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
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| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
27481389 |
ttccaaaaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccct |
27481429 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42012420 - 42012176
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100 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
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42012420 |
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T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
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| T |
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42012222 |
T |
 |
| Q |
201 |
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246 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |
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| T |
42012221 |
tattcccgagaatcaacaaatatagcttcaaacaaacacaccctaa |
42012176 |
T |
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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 27480840 - 27481069
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |
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|
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27480937 |
T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
| |
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|||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
27480938 |
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27481037 |
T |
 |
| Q |
201 |
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232 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||| |||||||||||| |
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| T |
27481038 |
tattctcaaaaatcaacaaatataacttgaaa |
27481069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20962420 - 20962659
Alignment:
| Q |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20962420 |
taacattataatatttctgggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcattaatttattctcatctccatgagaactttactcccaccct |
20962518 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
20962519 |
tttccttgggaaaaattttctattcccagaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcacgtgtattcctatcattt |
20962618 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20962619 |
tattcccaagaatctacgaatataacttgaaacaaacacac |
20962659 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 1664560 - 1664754
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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1664658 |
T |
 |
| Q |
101 |
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196 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |
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|
| T |
1664659 |
tttctttgggaaaaaatttctattctcaggaacattttatagctggtaataaaatttagtcaatttgtaacaaacataagcatatagatttctatc |
1664754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43347128 - 43346895
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9 |
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108 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
43347128 |
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43347030 |
T |
 |
| Q |
109 |
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208 |
Q |
| |
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||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||| | |
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| T |
43347029 |
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43346930 |
T |
 |
| Q |
209 |
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243 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43346929 |
ggaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
43346895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 6930471 - 6930714
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |
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|
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taactttataatattcctagaaaccttacagatagagattataatagataa-ctagatataaatttatttccatcttcatgggaactttattcccacaat |
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T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggc----atatacattcctatc |
196 |
Q |
| |
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|||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |
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| T |
6930570 |
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T |
 |
| Q |
197 |
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242 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
6930669 |
attttattctcaggaatcaacaaatataacttgaaataaacacacc |
6930714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40275991 - 40275750
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6 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |
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ttataatattccatggaaccttaaaaatagggattttaataggttat-tagagataattttattcccatcttcatgggaactttattcccatcattttct |
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T |
 |
| Q |
106 |
ttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
205 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |
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|
| T |
40275892 |
ttgggaaaacttttctattcccaggaatatttcatatctgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaacatagacatatgtatttttataattttattc |
40275793 |
T |
 |
| Q |
206 |
ccgggaatcaacaattataacttg-aaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |
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|
| T |
40275792 |
ccaaaaatctacaaatataacttgaaaaaaaacacaccctaaa |
40275750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35348765 - 35348534
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100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
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|||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||| |
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|
| T |
35348666 |
tttctttgggaaa-attttctattcccaaaaacattttataccca-aaatacaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatt-ctatctttt |
35348570 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35348569 |
tattcccgaaaatctacgattataa-ttgaaacaaac |
35348534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31583302 - 31583102
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1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
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Q |
| |
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|||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |
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| T |
31583302 |
taacattataatattctcaggaaccgtaaaaatagggattataataggtact-tacatatgaatt-atttccatctttgtgggaactttattcccacctt |
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T |
 |
| Q |
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tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| ||| |
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| T |
31583204 |
tttctttggaaaattttttctattcctgggaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagaca-atatatttctatcgttt |
31583106 |
T |
 |
| Q |
201 |
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204 |
Q |
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|
|
| T |
31583105 |
tatt |
31583102 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Original strand, 17251651 - 17251854
Alignment:
| Q |
9 |
taatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttg |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
17251651 |
taatattcctag-aaccataaaaatagggattataatatatagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccatcattttctttg |
17251748 |
T |
 |
| Q |
109 |
agaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccg |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
17251749 |
ggaaattttttctattatcatgaacattttatactcgagaataaaatttagtaaaattataacaaacataaacatgtatatttctatcattttattctca |
17251848 |
T |
 |
| Q |
209 |
ggaatc |
214 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
17251849 |
ggaatc |
17251854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26637141 - 26637045
Alignment:
| Q |
145 |
aggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26637141 |
aggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatataattctatcattttattcccattaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
26637045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 30899470 - 30899618
Alignment:
| Q |
87 |
tttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
186 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
30899470 |
tttattctcacccttttctttggaaaattgtttctattcccaagaatattttatatccaggaataaaatttagaaaacttgtaacatacataagcatgta |
30899569 |
T |
 |
| Q |
187 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
236 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| |||| |||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30899570 |
tattaatatca-tttgttcctaggaatctacgaatataacttgaaacaaa |
30899618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19089889 - 19089718
Alignment:
| Q |
71 |
ccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaa |
170 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
19089889 |
ccatcttcatgagaactttatacccatcattttctttgggaaattttttctattcccaaaaacgttttatactcaagaataaaatttaataaacttataa |
19089790 |
T |
 |
| Q |
171 |
caaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||| |||| |||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
19089789 |
caaacataaacatgcatatttctatttttttattcccaggaatttacgaatataacttaaaacaaacgcacc |
19089718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 36703614 - 36703656
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
46 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703614 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
36703656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3913327 - 3913201
Alignment:
| Q |
114 |
ttttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaat |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
3913327 |
ttttttctattcctaa-aacattttatacct-ggaataaaatttagtaaatttgtaataaacatacacatgtatatttctatcgttttattcccaagaat |
3913230 |
T |
 |
| Q |
214 |
caacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
3913229 |
ctacgaatataacttgaaataaacgcacc |
3913201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15200676 - 15200542
Alignment:
| Q |
112 |
aattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggga |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | | |
|
|
| T |
15200676 |
aattttttctat-cccagaaacattttatgcctgagaataaaatttaataaatttataacaaacatagacatatatatttatatcattttattttcaaaa |
15200578 |
T |
 |
| Q |
212 |
atcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
15200577 |
atctataaatataacttgaaacaaacgcaccttaaa |
15200542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 28023745 - 28023840
Alignment:
| Q |
84 |
aactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatag |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28023745 |
aactttattctcacccttttgtttgagaaattttttctattcccaaacacattttatatgtgagaataaaatttaatgaacttgtaacaaatatag |
28023840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 26637263 - 26637213
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccata-aaaatagggattataataggta |
50 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26637263 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaaatatggattataataggta |
26637213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Original strand, 28429675 - 28429733
Alignment:
| Q |
146 |
ggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28429675 |
ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatgtatatttctatcattttatt |
28429733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41783802 - 41783624
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcctt-gagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagt |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
41783802 |
aatttgttcacatctttatggaaactttattcccaacctttttctttgaattcttttttctattttcagaaacattttatatccgagaataaaatttagt |
41783703 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
239 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||| |||| ||||| | || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41783702 |
aaacttataacaaacatatgcgtgtacatttttatgattttaatcccaagaatctataaatataacttgaaataaacac |
41783624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16720307 - 16720212
Alignment:
| Q |
148 |
aataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||| | || || ||| |||||| ||||||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16720307 |
aataaaatttagtaaacttgcaacaaacatatgtatgtatatttctatca-tttattcataggaatctacgaatataacatgaaacaaacacaccct |
16720212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36978268 - 36978210
Alignment:
| Q |
146 |
ggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36978268 |
ggaataaaattttgtaagtttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttatt |
36978210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9734085 - 9733846
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9734085 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
9733986 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9733985 |
ccttgggaaattttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttat |
9733886 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9733885 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
9733846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 346584 - 346344
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346584 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
346485 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346484 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
346385 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346384 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
346344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 41750358 - 41750599
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41750358 |
taactttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
41750457 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41750458 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattt |
41750557 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41750558 |
tattcctaggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
41750599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 6171623 - 6171863
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6171623 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt |
6171722 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171723 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
6171822 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171823 |
tctcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
6171863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 11071434 - 11071677
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11071434 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccct |
11071533 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11071534 |
ttttcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
11071633 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11071634 |
tattcccggaaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
11071677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42674900 - 42674658
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674900 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccaccctttt |
42674801 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42674800 |
tcttgggaaattttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
42674701 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42674700 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
42674658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 37192354 - 37192591
Alignment:
| Q |
4 |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 2521507 - 2521747
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4 |
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Q |
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T |
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Target: chr2; HSP #9
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246 |
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T |
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Target: chr2; HSP #10
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T |
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248 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr2; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 14777737 - 14777497
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4 |
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Q |
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T |
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Q |
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244 |
Q |
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Target: chr2; HSP #13
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203 |
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Q |
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Target: chr2; HSP #14
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 |
| Q |
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203 |
Q |
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T |
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204 |
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241 |
Q |
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2050898 |
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Target: chr2; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 41729369 - 41729128
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Q |
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| Q |
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203 |
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245 |
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Target: chr2; HSP #16
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210 |
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37533990 |
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244 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
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T |
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Q |
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Target: chr2; HSP #18
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Q |
| |
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T |
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| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
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17965915 |
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T |
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204 |
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246 |
Q |
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Target: chr2; HSP #19
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Q |
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 |
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441 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
442 |
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512 |
Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
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ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaac--ataggcatatacattcctatcatttt |
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Q |
| |
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202 |
attcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28311938 - 28311701
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| T |
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T |
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Target: chr2; HSP #22
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Target Start/End: Complemental strand, 34356938 - 34356697
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203 |
Q |
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T |
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34356697 |
T |
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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
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Target Start/End: Original strand, 37233259 - 37233496
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T |
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| Q |
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200 |
Q |
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T |
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Q |
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| T |
37233458 |
tattcccgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 638426 - 638660
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Q |
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239 |
Q |
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638625 |
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T |
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Target: chr2; HSP #25
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Target Start/End: Complemental strand, 27358200 - 27357962
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T |
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Target: chr2; HSP #26
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Target Start/End: Complemental strand, 20426724 - 20426481
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| Q |
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Target: chr2; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 45409084 - 45409322
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204 |
Q |
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244 |
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Target: chr2; HSP #28
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Target Start/End: Original strand, 14832643 - 14832877
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T |
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203 |
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14832841 |
T |
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204 |
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239 |
Q |
| |
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14832842 |
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14832877 |
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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18713898 - 18713660
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18713800 |
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200 |
Q |
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18713700 |
T |
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Target: chr2; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 1988141 - 1988382
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Q |
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T |
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243 |
Q |
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Target: chr2; HSP #31
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Target Start/End: Original strand, 3902286 - 3902521
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200 |
Q |
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T |
 |
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201 |
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tattctcaggaaagaacaaatataacttgaaacaaac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 23943995 - 23944165
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Query Start/End: Original strand, 4 - 240
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 |
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203 |
Q |
| |
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204 |
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240 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 1 - 247
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247 |
Q |
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tattcccagaaatctacgaatataacttgaaacaaacgcaccctaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 40569847 - 40570092
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| Q |
98 |
ccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatca |
197 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| | |
|
|
| T |
40569946 |
cattttctttgggaaaaattttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcatgtatgtttttatga |
40570045 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40570046 |
ttttattcccaggaatctacaattataacttgaaacaaacacaccct |
40570092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Original strand, 6571602 - 6571759
Alignment:
| Q |
87 |
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186 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6571602 |
tttattcctaccctttttcttgggaaattttttatattccccggaacattttatacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
6571701 |
T |
 |
| Q |
187 |
cattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6571702 |
tattcctatcattttatttccggaaatcaacaaatataactttaaacaaatacaccct |
6571759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 14253411 - 14253578
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| Q |
61 |
aaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagt |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
14253411 |
aaatttattctcatcttcatgaaaattttattcacacccttttctttgagaaattttttctattcccataaacattttatactcgggaataaaatttagt |
14253510 |
T |
 |
| Q |
161 |
aaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataactt |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14253511 |
aaacttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatataactt |
14253578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11763577 - 11763374
Alignment:
| Q |
36 |
ggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacat |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
11763577 |
ggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttattcccacctttttcctttggaaattttttctattcccagaaatat |
11763479 |
T |
 |
| Q |
136 |
tttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
11763478 |
tttatgtccgagaataaaatttagtaaatttataacaaacatagacatatatattcctatcatttcattcccgaaaaacaacaaatataacttgaaa-aa |
11763380 |
T |
 |
| Q |
236 |
acacac |
241 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
11763379 |
acacac |
11763374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 39819521 - 39819768
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| Q |
3 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39819521 |
actttataatattccaaggaaccttaaaaataaggattatattaggtaaacaaacatatataattttactctcatcttcatgagaactttattcccacca |
39819620 |
T |
 |
| Q |
100 |
ttttccttgagaaattttttctattcccaggaac---attttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc |
196 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
39819621 |
ttttctttggaaatttttttcaattcccaggaacattattatatacccgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatgtattttcatg |
39819720 |
T |
 |
| Q |
197 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39819721 |
attttattttcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacacgccct |
39819768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8868850 - 8868659
Alignment:
| Q |
54 |
tatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaa |
153 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8868850 |
tattcataaatttatacccatcttcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaa-tattccta-tcccaggaacattttctacctaggaataaa |
8868753 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaag |
248 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
8868752 |
atttactaatcctgtaacaaacataagaatatgtatttctatcaatttattcctaggaatctacaa-aataacttgaaacaaacgcaccccaaag |
8868659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Original strand, 25454914 - 25455096
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| Q |
64 |
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161 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
25454914 |
tttattctcgtcttcatgggaactttttattccctccattttttttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgagaatgaaatttagta |
25455013 |
T |
 |
| Q |
162 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25455014 |
aacttgtaacaaacatagacatatgtatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
25455096 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5003059 - 5002833
Alignment:
| Q |
19 |
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118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
5003059 |
aggaaccataaaaatatggattataataggtagt-tacacatgaattgattcatatcttcatggaaactttattcccaccatattctttggaattttttt |
5002961 |
T |
 |
| Q |
119 |
tctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| || | | |||||||||||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
5002960 |
tctattcccagaaacattttatactt-ggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatatatgcatgtatacttctatcattttattcttagaaatctaca |
5002862 |
T |
 |
| Q |
219 |
attataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5002861 |
aatataacttgaaacaaacgcaccctaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 7007414 - 7007648
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
7007414 |
taactttataatattcctaagaaccattaaaatagggagtataataggt-aactacatatgaatttattctcatctccatggtaattttattcccaccat |
7007512 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||| |||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| | || ||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
7007513 |
tttctttgggaa--tttttttattatcaataacatttt---------agtaaaatttagtaaacttgtatgaaacattgacaaatatatttccatcattt |
7007601 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaaa |
247 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7007602 |
tatccccaagaatcaacaaatataacttgaaataaacacaccctaaa |
7007648 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 25724918 - 25725097
Alignment:
| Q |
65 |
ttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaat-aaattttagtaaa |
163 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
25724918 |
ttattctcatcttcatgagaactttattcccacccttttctttgggaaactttttctattcccagaaacattttatacccagcaataaaattttaataaa |
25725017 |
T |
 |
| Q |
164 |
cttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25725018 |
cctgcaacaaacataggaatacgtatttctatcattttgttcccaagaatttccaaagataacttgaaacaaacgcaccc |
25725097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4875606 - 4875848
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| Q |
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taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4875606 |
taacattataatatgccgaggaaccataaaaatagggattataatatgt-aattacatatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccg |
4875704 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| || |||||| ||||| | |||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
4875705 |
tttctttgggattttttttttattctcgagaacgttttata-ttgaaaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataaacaaatttatttctatcattt |
4875803 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
|||| || || | |||| |||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4875804 |
tatttccaaaaagctacaaatataacttaaaacaaacgcacccta |
4875848 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41298159 - 41297983
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41298159 |
taacattataatattccaaggaaccataagaatagagattataataggtaat-tataaatgaatatattctcatcttcatgagaactttattcacaccct |
41298061 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacata |
178 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41298060 |
ttgctttgggaaattttttttatttctaaaaacattttatatccgggaataaaatttaataaacttgtaacatacata |
41297983 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 1623213 - 1623454
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||| | ||| | |||||||||||| || | |
|
|
| T |
1623213 |
taactttatattattcgtaggaaccataaaaatagagattataattggt-aactacatatgaatttattctcatattcattgaaactttattcccgccat |
1623311 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| ||| ||| | | ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||| |
|
|
| T |
1623312 |
gttctttggaaaaatttctctgtactcaggaacattttataaccgggaatcaaatttaataaactcgtaac-aacatagacatatatatttctattattt |
1623410 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1623411 |
tactcttaggaatcaacaaatataatttaaaacaaacataccct |
1623454 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 13539498 - 13539675
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13539498 |
taacattatagtattctcagaaaccataaaaataaggattataatagataat-tacacatgaatctattcccatgttcatgggaactttattcccactag |
13539596 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatag |
179 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13539597 |
tttctgtgagaaattttttccattcccataaacattttatacctgcgaataaaatttaataaatttgtaacaaacatag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 13790120 - 13790221
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1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatt-tataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccc |
99 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13790120 |
taacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa--tattacatgattttattcccatctccatgggaactttattcccaccg |
13790217 |
T |
 |
| Q |
100 |
tttt |
103 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
13790218 |
tttt |
13790221 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 241
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gaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttg |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24499400 |
gaacattttataccatggaataaaatttagtaaacttataacaaacatag--atatatatttctatcattttatttctatgaatcaacaaatataacttg |
24499497 |
T |
 |
| Q |
230 |
aaacaaacacac |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
24499498 |
aaacaaacacac |
24499509 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14403349 - 14403232
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127 |
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226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |
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|
| T |
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T |
 |
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ttgaaacaaacacaccct |
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Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14403249 |
ttcaaacaaacacaccct |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 37851687 - 37851930
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
37851687 |
taacattataatatttttaggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttattctcaccat |
37851785 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaa---attttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatca |
197 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | | || ||| |||||| |
|
|
| T |
37851786 |
tttctttg-gaattttttttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaa-attagtaaacttctagcaaacataagaaggtatatttctatca |
37851883 |
T |
 |
| Q |
198 |
ttttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||| | | |||| || | ||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37851884 |
ttttattttcagaaatctacgaatattacttgaaacaaacccaccct |
37851930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3254249 - 3254142
Alignment:
| Q |
58 |
tataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgag-aaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattt |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || |
|
|
| T |
3254249 |
tataaatttattctcatcttcatgggaactttattcccaccatttcctttgggaaaaaattttctattcccagaaacattttgtacgcgagaataaaatt |
3254150 |
T |
 |
| Q |
157 |
tagtaaac |
164 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
3254149 |
tagtaaac |
3254142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 25625328 - 25625418
Alignment:
| Q |
114 |
ttttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25625328 |
ttttttctattcccatgaacattttatacctcagaataaaatctagtaaatttgcaacaaacctagacattcatatttctatcattttatt |
25625418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 11763638 - 11763597
Alignment:
| Q |
5 |
tttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataata |
46 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11763638 |
tttataatattcctaagaaccataaaaatagggattataata |
11763597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 516574 - 516463
Alignment:
| Q |
60 |
taaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttag |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
516574 |
taaatttattctcatcttcacgggaattttattctcaccattttctttg-gaatttttttatattcccaaaaacattttatacccagaaataaaatttac |
516476 |
T |
 |
| Q |
160 |
taaacttgtaaca |
172 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| |
|
|
| T |
516475 |
taaaattataaca |
516463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 204
Target Start/End: Original strand, 4685067 - 4685211
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttga-gaaattttttctattcccagg-aacattttatacctaggaataaattttag |
159 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
4685067 |
aatttgttcccatcttcatgggaactttattcacacccttttctttgatttttttttttctattgccaggaaacgttttatactctgaaataaaatttaa |
4685166 |
T |
 |
| Q |
160 |
taaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatt |
204 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4685167 |
taaatttataacaaacataaacatgtatatttctatcattttatt |
4685211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1723324 - 1723225
Alignment:
| Q |
147 |
gaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| | |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1723324 |
gaataaaatttaataaacttgtaacaaacattgaaatgtatatttccatcattttattcatggaaatatacaaacataacttgaaacaaacacactctaa |
1723225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 3254334 - 3254284
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
51 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
3254334 |
taacttcataatattcctagaaaccataaaaataagggttataataagtaa |
3254284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 14137033 - 14137153
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| || || || ||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
14137033 |
taacattataatattcccaacaaccataaaaatagagattttaataagt-aattacatatgaatttattctcgtcttcatgagaactttattcttaacct |
14137131 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttcta |
122 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14137132 |
tttttttgagaaaatttttcta |
14137153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 201764 - 201999
Alignment:
| Q |
11 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgag |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
201764 |
atattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg |
201863 |
T |
 |
| Q |
111 |
aaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201864 |
aaattttttctattcccaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggg |
201963 |
T |
 |
| Q |
211 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201964 |
aatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
201999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 143443 - 143678
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
143443 |
taactttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccat |
143541 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
143542 |
tttctttgggaaattttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcattt |
143641 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
143642 |
tattctcaggaatcaacaaatttaacttgaaacaaac |
143678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Original strand, 119211 - 119355
Alignment:
| Q |
63 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaa |
162 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
119211 |
atttattctcatctgcctgaaaactttatttccacccttttctttggaaaaaattttctattcccaggaacattttatactcatgaataaaatttagtaa |
119310 |
T |
 |
| Q |
163 |
acttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
119311 |
acttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattccc |
119355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Original strand, 1316851 - 1317089
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316851 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttt |
1316950 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1316951 |
ccttgggaaatttt-tctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttat |
1317049 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1317050 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
1317089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 2657529 - 2657772
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657529 |
taactttataatattcctagtaatcataaaaatatggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
2657628 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657629 |
tttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattt |
2657728 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657729 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
2657772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7053817 - 7053569
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7053817 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttt |
7053718 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacatt--------ttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctat |
195 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053717 |
ccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctat |
7053618 |
T |
 |
| Q |
196 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053617 |
cattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
7053569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 14170847 - 14171087
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14170847 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcc-atctccatgggaactttattcccaccctttt |
14170945 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14170946 |
ccttg-gaaattttttctattcccaggaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatagattcctatcattttat |
14171044 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14171045 |
tcccgggaatcaaaaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
14171087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 18897753 - 18897989
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18897753 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccaccctttt |
18897852 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
18897853 |
ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcactttat |
18897952 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897953 |
ttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacaca |
18897989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7344320 - 7344082
Alignment:
| Q |
6 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344320 |
ttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc |
7344221 |
T |
 |
| Q |
106 |
ttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattc |
205 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344220 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatatacattcctatcattttattc |
7344121 |
T |
 |
| Q |
206 |
ccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7344120 |
tcggaaatttacaattataatttgaaacgaacacaccct |
7344082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 16968757 - 16968989
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968757 |
ctttataatattcttaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttt |
16968856 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968857 |
ccttgggaaattttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatagattcctatcattttat |
16968956 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
236 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968957 |
tctcaggaatcaacaattataacttgaaacaaa |
16968989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Original strand, 8029135 - 8029297
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029135 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
8029234 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaactt |
166 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029235 |
ctttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaactt |
8029297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6705943 - 6705762
Alignment:
| Q |
65 |
ttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaac |
164 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6705943 |
ttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaaatttagtaaac |
6705844 |
T |
 |
| Q |
165 |
ttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6705843 |
ttgtaacaaacatagacatatatatttctaccattttattccaatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccctaa |
6705762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 244
Target Start/End: Original strand, 8029312 - 8029405
Alignment:
| Q |
151 |
aaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029312 |
aaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
8029405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10246355 - 10246259
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246355 |
ctttataatattcctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
10246259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 346051 - 345833
Alignment:
| Q |
22 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttct |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
346051 |
aaccataaaaataggaattttaatagg-aaattactcatgaatttattctcatctccattggaactttattcccacccttttctttgggaaaaattttct |
345953 |
T |
 |
| Q |
122 |
attcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcatttta-ttcccgggaatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |
|
|
| T |
345952 |
attcctaaaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttatttcctaggaatctacgaa |
345853 |
T |
 |
| Q |
221 |
tataacttgaaacaaacaca |
240 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
345852 |
tataacttaaaacaaacaca |
345833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10849961 - 10849784
Alignment:
| Q |
66 |
tattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcctt-gagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaac |
164 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
10849961 |
tattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttacacccaggaagaaaagttactaaac |
10849862 |
T |
 |
| Q |
165 |
ttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| | ||| | | |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10849861 |
ttgtaactaatataggaagatataattctatcattttattcccaggaatctataaaaataacttgaaacaaacacacc |
10849784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21008204 - 21008035
Alignment:
| Q |
62 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagta |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21008204 |
aatttattcccatctctatgagaactttattcccacctttttgtttga-attttttttctattcccaagaacatttcatgttcgggaataaaatttagta |
21008106 |
T |
 |
| Q |
162 |
aacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaa |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21008105 |
aacctgtaacaaatagaggcatatatatttttatcattttattcccagaaatcaacaaatataacttgaaa |
21008035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14781852 - 14781626
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
14781852 |
taacattataatattcctgggaaccataaaagtaggatttataataggtaat-tactcatgaatttattcccatctcct----aactt-----ccaccct |
14781763 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| || |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||| |
|
|
| T |
14781762 |
tttcttttggaaaaaatttctattcccatgagcattttatacctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtatgtatattcctattgttt |
14781663 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
237 |
Q |
| |
|
|| || | |||||| || | ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14781662 |
taatcgcaggaatctacgaatataatttgaaacaaac |
14781626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Original strand, 3869391 - 3869577
Alignment:
| Q |
57 |
ttataaatttattcccatctccatgggaactttattc---ccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaa |
153 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3869391 |
ttatgaatttattctcatcttcgtgggaactttattctcaccaccattttctttgggaaaacttttctattccattgaacattttatgcc----aataaa |
3869486 |
T |
 |
| Q |
154 |
ttttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
| |
|
|||| | ||| | |||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3869487 |
atttaatgaacatttaacaaacgtagtaatacatatttctatcattttattcccagaaatctacaaaaataacttgaaacaaacacaccct |
3869577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 247
Target Start/End: Original strand, 8314887 - 8314988
Alignment:
| Q |
146 |
ggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccta |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || || ||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8314887 |
ggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgaatgtatgtttttatgattttattctcatgaatctagaattataacttgaaacaaacatacccta |
8314986 |
T |
 |
| Q |
246 |
aa |
247 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
8314987 |
aa |
8314988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9760497 - 9760367
Alignment:
| Q |
116 |
ttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || | | | |||||||||||| | || || |
|
|
| T |
9760497 |
ttttctattctcatgaacattttatatcctgaaataaaatttagtaaacttataacaaaaataggcatgtataattcgatcattttattctcaagagtct |
9760398 |
T |
 |
| Q |
216 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9760397 |
acaaagataacttgaaacaaacgcactctaa |
9760367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10246258 - 10246222
Alignment:
| Q |
207 |
cgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246258 |
cgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
10246222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 8314723 - 8314773
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
51 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314723 |
taacattataataattcaaggaaccttaaaaatagggattataataggtaa |
8314773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29191 - 28957
Alignment:
| Q |
4 |
ctttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29191 |
ctttataatattcctaggaattataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccaccctttt |
29092 |
T |
 |
| Q |
104 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29091 |
ccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttat |
28992 |
T |
 |
| Q |
204 |
tcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
238 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28991 |
tcccgaaaatcaacaattataacttgaaacaaaca |
28957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0702 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:
Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3806 - 3562
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
100 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
3806 |
taacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaat-tacacataattttattttcatctccatgggaactttattcccaccat |
3708 |
T |
 |
| Q |
101 |
tttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattt |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
3707 |
tttctttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattt |
3608 |
T |
 |
| Q |
201 |
tattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3607 |
tattcctagaaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccctaa |
3562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0662 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:
Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 4296 - 4542
Alignment:
| Q |
1 |
taactttataatattcctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa----actatttataaatttattcccatctccatgggaactttattccca |
96 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4296 |
taacattataatattccaaggaaccttaaaaatagggaatataataggtaattacactattaat---tttattttcatctccatgggaactttattccca |
4392 |
T |
 |
| Q |
97 |
cccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatc |
196 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
4393 |
ccattttctttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttata |
4492 |
T |
 |
| Q |
197 |
attttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4493 |
attttattcctagaaatctacaaatataacttgaaacaaacacaccctaa |
4542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:
Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23517 - 23297
Alignment:
| Q |
21 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttc |
120 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
23517 |
gaaccttaaaaatagggattataataggtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccgttttctttggaaaaaaattta |
23419 |
T |
 |
| Q |
121 |
tattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||| | | |||| |||| |
|
|
| T |
23418 |
tattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctataattttattctcagaaatctacaaa |
23319 |
T |
 |
| Q |
221 |
tataacttgaaacaaacacacc |
242 |
Q |
| |
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|
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| T |
23318 |
tataatttaaaacaaacgcacc |
23297 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1480 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:
Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 556 - 384
Alignment:
| Q |
72 |
catctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaac |
171 |
Q |
| |
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| T |
556 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttctttgggaatgttatttcattcccaggaacattttatatttaggaataaaatttaataaacttgcaac |
457 |
T |
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| Q |
172 |
aaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
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|
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| T |
456 |
aaacataggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaagataacttgaaacaaacacaccct |
384 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0069 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:
Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21961 - 21789
Alignment:
| Q |
72 |
catctccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaattttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaattttagtaaacttgtaac |
171 |
Q |
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| T |
21961 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttttttgggaatgttatttcatacccaggaacattttatatctaggaataaaatttaataaacttgcaac |
21862 |
T |
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| Q |
172 |
aaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
244 |
Q |
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| T |
21861 |
aaacataggaatgcatatttccatcattctatttcgaggaatttacaaagataacttgaaacaaatacaccct |
21789 |
T |
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