View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18498_low_6 (Length: 448)

Name: NF18498_low_6
Description: NF18498
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18498_low_6
NF18498_low_6
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (1-426)||(28786872-28787297)
chr6 (1-426)||(28792993-28793418)
chr6 (1-426)||(27603827-27604252)
chr6 (5-430)||(27717618-27718043)
chr6 (5-430)||(27610239-27610664)
chr6 (1-426)||(28781735-28782160)
chr6 (2-430)||(27592140-27592568)
chr6 (5-430)||(27676739-27677164)
chr6 (1-426)||(26803080-26803505)
chr6 (4-430)||(31285196-31285622)
chr6 (6-400)||(27426761-27427155)
chr6 (8-430)||(26656606-26657028)
chr6 (8-430)||(26762577-26762999)
chr6 (3-367)||(27530483-27530847)
chr6 (5-393)||(27705560-27705948)
chr6 (2-430)||(27679585-27680013)
chr6 (8-426)||(26884711-26885129)
chr6 (9-430)||(27337214-27337635)
chr6 (9-430)||(27397954-27398375)
chr6 (8-430)||(26647120-26647542)
chr6 (8-430)||(26753088-26753510)
chr6 (17-367)||(26862230-26862580)
chr6 (4-426)||(26623908-26624330)
chr6 (4-426)||(26729885-26730307)
chr6 (1-430)||(27697705-27698134)
chr6 (12-367)||(26143513-26143868)
chr6 (8-246)||(25492622-25492860)
chr6 (17-430)||(26056572-26056985)
chr6 (17-430)||(26076542-26076955)
chr6 (8-220)||(26824460-26824672)
chr6 (12-367)||(25539188-25539543)
chr6 (17-367)||(25580372-25580722)
chr6 (17-430)||(25483709-25484122)
chr6 (8-367)||(27215093-27215452)
chr6 (126-367)||(25511651-25511892)
chr6 (127-210)||(28140295-28140378)
chr6 (69-196)||(29843340-29843467)
chr6 (128-181)||(26937790-26937843)
chr6 (135-210)||(26950511-26950586)
chr6 (122-196)||(29826741-29826815)
chr6 (17-69)||(25511588-25511640)
chr6 (119-183)||(26849464-26849528)
chr6 (135-183)||(28097809-28097857)
chr6 (336-367)||(25492501-25492532)
chr6 (126-183)||(26975710-26975767)
chr6 (135-196)||(28243563-28243624)
chr6 (147-183)||(25074647-25074683)
chr6 (82-162)||(29845851-29845931)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-426)||(8121-8546)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-426)||(12798-13223)
scaffold0277 (1-426)||(3835-4260)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (5-430)||(2658-3083)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (2-429)||(18678676-18679103)
chr4 (1-429)||(18698516-18698944)
chr4 (1-429)||(18723201-18723629)
chr4 (1-425)||(18730624-18731048)
chr4 (1-429)||(18654593-18655021)
chr4 (6-400)||(18074400-18074794)
chr4 (110-183)||(5090319-5090392)
chr4 (321-430)||(5090069-5090178)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (6-400)||(60208-60602)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (3-430)||(267459-267886)
chr1 (7-430)||(28126794-28127217)
chr1 (8-363)||(28163562-28163916)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (4-430)||(29272957-29273383)
chr8 (8-57)||(16440694-16440743)
chr8 (8-48)||(16449533-16449573)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (119-219)||(3280411-3280511)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (119-196)||(16691619-16691696)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (135-196)||(43725-43786)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (82-162)||(2056-2136)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 28786872 - 28787297
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28786872 tcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatg 28786971  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786972 gtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 28787071  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28787072 atgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtga 28787171  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28787172 gggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggagga 28787271  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  28787272 cctgattggttcggccgtggaagcag 28787297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 28792993 - 28793418
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28792993 tcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatg 28793092  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28793093 gtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 28793192  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28793193 atgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtga 28793292  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28793293 gggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggagga 28793392  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  28793393 cctgattggttcggccgtggaagcag 28793418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27604252 - 27603827
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27604252 tcagcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatg 27604153  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604152 gtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 27604053  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  27604052 atgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtga 27603953  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |    
T  27603952 gggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacaggctttggcaggagaa 27603853  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||||    
T  27603852 cctgattggtttgggcttggaagcag 27603827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27718043 - 27717618
Alignment:
Q  5 cccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtag 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27718043 cccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 27717944  T
Q  105 gactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717943 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27717844  T
Q  205 gagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggga 304  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27717843 gagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 27717744  T
Q  305 atttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctc 404  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  27717743 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 27717644  T
Q  405 attggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27717643 attggttcggccgtggaagcaaagtc 27717618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 5 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27610664 - 27610239
Alignment:
Q  5 cccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtag 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27610664 cccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 27610565  T
Q  105 gactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610564 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27610465  T
Q  205 gagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggga 304  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27610464 gagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 27610365  T
Q  305 atttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctc 404  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  27610364 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 27610265  T
Q  405 attggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27610264 attggttcggccgtggaagcaaagtc 27610239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 28781735 - 28782160
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  28781735 tcagcacttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtcaggatg 28781834  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781835 gtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 28781934  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28781935 atgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtga 28782034  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28782035 gggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggcaggagga 28782134  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  28782135 cctgattggttcggccgtggaagcag 28782160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27592568 - 27592140
Alignment:
Q  2 cagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatgg 101  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||    
T  27592568 cagcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatgg 27592469  T
Q  102 taggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaa 201  Q
    | ||| ||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592468 ttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaa 27592369  T
Q  202 tgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgag 301  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||| ||     
T  27592368 tgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaa 27592269  T
Q  302 ggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggac 401  Q
    |||||| || | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||| |||||||||| |||||||    
T  27592268 ggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagatgctttggctggaggac 27592169  T
Q  402 ctcattggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
     | ||||||  || | |||||||||||||    
T  27592168 ttgattggttcggtcctggaagcagagtc 27592140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27677164 - 27676739
Alignment:
Q  5 cccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtag 104  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||| |    
T  27677164 cccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttg 27677065  T
Q  105 gactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 204  Q
    || ||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677064 gaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 27676965  T
Q  205 gagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggga 304  Q
    || |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  27676964 gaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaagga 27676865  T
Q  305 atttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctc 404  Q
    ||| || | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||| | |||||||| ||| |||       
T  27676864 attcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggctttggctggaagactcg 27676765  T
Q  405 attggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||    
T  27676764 attggtttggtcctggaagcagagtc 27676739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 26803080 - 26803505
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||  |||    
T  26803080 tcagcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatg 26803179  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    || ||| ||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |      
T  26803180 gttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatg 26803279  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |  |||||||||  ||||||    |||| ||||    
T  26803280 atgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtga 26803379  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||| ||| |   |||| ||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26803380 ggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggagga 26803479  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26803480 cctgattggtttggccatggaagcag 26803505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 430
Target Start/End: Original strand, 31285196 - 31285622
Alignment:
Q  4 gcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |   | || || | || || |  ||||||    
T  31285196 gcccttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggta 31285295  T
Q  104 ggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 203  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||    
T  31285296 ggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgatg 31285395  T
Q  204 tgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggg 303  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  |||| ||||| ||||||    ||||||||||||    
T  31285396 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgaggg 31285495  T
Q  304 aatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacct 403  Q
    |||| |    ||  |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  31285496 aattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctttggctggaggactt 31285595  T
Q  404 cattggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||    
T  31285596 gattggttcggccgtggaagcagagtc 31285622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27427155 - 27426761
Alignment:
Q  6 ccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtagg 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||  ||||| ||    
T  27427155 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 27427056  T
Q  106 actttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtg 205  Q
    | ||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||     
T  27427055 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 27426956  T
Q  206 agagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaa 305  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||  |||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  27426955 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 27426856  T
Q  306 tttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    | ||    ||| |||||||| |   |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  27426855 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggagga 27426761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 430
Target Start/End: Original strand, 26656606 - 26657028
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||  || |  ||||||||||    
T  26656606 ttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggac 26656705  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||    
T  26656706 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcag 26656805  T
Q  208 agagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatt 307  Q
    |||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||  | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26656806 agagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26656905  T
Q  308 tcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcatt 407  Q
     |    ||| ||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | || ||| | |||||||||||||||| | |||    
T  26656906 ccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgatt 26657005  T
Q  408 ggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    |||  ||  ||||||||||||||    
T  26657006 ggttcggttgtggaagcagagtc 26657028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 430
Target Start/End: Original strand, 26762577 - 26762999
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||  || |  ||||||||||    
T  26762577 ttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggac 26762676  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||    
T  26762677 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcag 26762776  T
Q  208 agagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatt 307  Q
    |||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||  | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26762777 agagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26762876  T
Q  308 tcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcatt 407  Q
     |    ||| ||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | || ||| | |||||||||||||||| | |||    
T  26762877 ccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggcaggaggacttgatt 26762976  T
Q  408 ggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    |||  ||  ||||||||||||||    
T  26762977 ggttcggttgtggaagcagagtc 26762999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27530847 - 27530483
Alignment:
Q  3 agcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggt 102  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||    
T  27530847 agcccttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggt 27530748  T
Q  103 aggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaat 202  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  27530747 aggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaat 27530648  T
Q  203 gtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagg 302  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||| ||  |||| | ||| ||||||||||||||||| |||    
T  27530647 gtgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcagg 27530548  T
Q  303 gaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgac 367  Q
    ||||| |    ||  || ||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27530547 gaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgac 27530483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27705948 - 27705560
Alignment:
Q  5 cccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtag 104  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||| ||||  ||||| |    
T  27705948 cccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttg 27705849  T
Q  105 gactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 204  Q
    || ||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  27705848 gaatttttggcattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgt 27705749  T
Q  205 gagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggga 304  Q
    ||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |  || ||||||  ||||||    |||| |||||||     
T  27705748 gagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgagggg 27705649  T
Q  305 atttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggc 393  Q
    ||| | |  ||| ||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  27705648 attccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgataggaagcaactgcatgctttggc 27705560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 430
Target Start/End: Original strand, 27679585 - 27680013
Alignment:
Q  2 cagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||  ||||    
T  27679585 cagcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatgg 27679684  T
Q  102 taggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaa 201  Q
    | ||| ||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| |  |    
T  27679685 ttggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatga 27679784  T
Q  202 tgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgag 301  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||      ||| ||||| ||||||    ||||||||||    
T  27679785 tgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagagaagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgag 27679884  T
Q  302 ggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggac 401  Q
    |||||| |    ||| |||||||  ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27679885 ggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctttggctggaggac 27679984  T
Q  402 ctcattggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
     | ||||||  ||  ||||||||||||||    
T  27679985 ttgattggttcggatgtggaagcagagtc 27680013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 426
Target Start/End: Original strand, 26884711 - 26885129
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| |   |||| | || || || |  |||||||||     
T  26884711 ttacatgtagccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaa 26884810  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || ||    
T  26884811 tttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcag 26884910  T
Q  208 agagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatt 307  Q
     ||||| ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26884911 ggagaattcaactcataataacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaatt 26885010  T
Q  308 tcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcatt 407  Q
     |    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | || ||| | |||||||| ||||||| | |||    
T  26885011 ccactcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggctttggctggaggacttgatt 26885110  T
Q  408 ggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  26885111 ggtttggtcgtggaagcag 26885129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27337635 - 27337214
Alignment:
Q  9 tacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggact 108  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| || |||   |||||||||||    
T  27337635 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27337536  T
Q  109 ttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaga 208  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| |||    
T  27337535 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttaga 27337436  T
Q  209 gagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaattt 308  Q
    ||||| ||||||   || || ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  ||||||||||     
T  27337435 gagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattc 27337336  T
Q  309 cttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcattg 408  Q
    |    ||  |||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||| | |||||||| ||||||| | ||||    
T  27337335 caatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattg 27337236  T
Q  409 gtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    ||  || | |||||||||||||    
T  27337235 gttcggtcctggaagcagagtc 27337214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27398375 - 27397954
Alignment:
Q  9 tacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggact 108  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| || |||   |||||||||||    
T  27398375 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27398276  T
Q  109 ttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaga 208  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| |||    
T  27398275 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttaga 27398176  T
Q  209 gagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaattt 308  Q
    ||||| ||||||   || || ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  ||||||||||     
T  27398175 gagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattc 27398076  T
Q  309 cttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcattg 408  Q
    |    ||  |||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||| | |||||||| ||||||| | ||||    
T  27398075 caatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgattg 27397976  T
Q  409 gtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    ||  || | |||||||||||||    
T  27397975 gttcggtcctggaagcagagtc 27397954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 430
Target Start/End: Original strand, 26647120 - 26647542
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  26647120 ttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggac 26647219  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| ||    
T  26647220 tttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcag 26647319  T
Q  208 agagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatt 307  Q
    |||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || || |||| ||| |||| |||  | || |||||||||||    
T  26647320 agagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaatt 26647419  T
Q  308 tcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcatt 407  Q
     |    ||  |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||| ||| | |||||||| ||||||| | |||    
T  26647420 ccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgatt 26647519  T
Q  408 ggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    |||  || | |||||||||||||    
T  26647520 ggttcggtcctggaagcagagtc 26647542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 430
Target Start/End: Original strand, 26753088 - 26753510
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  26753088 ttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggac 26753187  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| |||||| | ||||| ||    
T  26753188 tttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcag 26753287  T
Q  208 agagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatt 307  Q
    |||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || || |||| ||| |||| |||  | || |||||||||||    
T  26753288 agagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaatt 26753387  T
Q  308 tcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcatt 407  Q
     |    ||  |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||| ||| | |||||||| ||||||| | |||    
T  26753388 ccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggctggaggacttgatt 26753487  T
Q  408 ggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    |||  || | |||||||||||||    
T  26753488 ggttcggtcctggaagcagagtc 26753510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 26862230 - 26862580
Alignment:
Q  17 gccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggactttatggta 116  Q
    ||||| || |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||| || || |  |||||||||||||||||||    
T  26862230 gccaaataccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggta 26862329  T
Q  117 ccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaactc 216  Q
    | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||||||| | || || |||||||| ||    
T  26862330 ctggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattc 26862429  T
Q  217 agcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatttcttatata 316  Q
    | ||   ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |   ||||    
T  26862430 aactcataatagcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttata 26862529  T
Q  317 gaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgac 367  Q
     ||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26862530 aaggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgac 26862580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 26623908 - 26624330
Alignment:
Q  4 gcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggta 103  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||| ||||  |||||     
T  26623908 gcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggtt 26624007  T
Q  104 ggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 203  Q
    ||| | ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||    
T  26624008 ggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatg 26624107  T
Q  204 tgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggg 303  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||  |  |||| ||||| |||| |    ||||||||||||    
T  26624108 tgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgaggg 26624207  T
Q  304 aatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacct 403  Q
    ||||||    ||  |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |  |||||  |||||||||| ||||| | |    
T  26624208 aatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggctt 26624307  T
Q  404 cattggtatggccgtggaagcag 426  Q
     ||||||  || |||||||||||    
T  26624308 gattggttcggacgtggaagcag 26624330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 426
Target Start/End: Original strand, 26729885 - 26730307
Alignment:
Q  4 gcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggta 103  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||| ||||  |||||     
T  26729885 gcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggtt 26729984  T
Q  104 ggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 203  Q
    ||| | ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||    
T  26729985 ggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatg 26730084  T
Q  204 tgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggg 303  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||  |  |||| ||||| |||| |    ||||||||||||    
T  26730085 tgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgaggg 26730184  T
Q  304 aatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacct 403  Q
    ||||||    ||  |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |  |||||  |||||||||| ||||| | |    
T  26730185 aatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctttggctggagggctt 26730284  T
Q  404 cattggtatggccgtggaagcag 426  Q
     ||||||  || |||||||||||    
T  26730285 gattggttcggacgtggaagcag 26730307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27698134 - 27697705
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||   |||||||| |  ||||||||||||| ||||  |||    
T  27698134 tcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatg 27698035  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    || ||| ||| ||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | |    
T  27698034 gttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcata 27697935  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||  ||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||  |  || | ||||| | ||||    |||||||||    
T  27697934 atgtgagaatgaattcagctaaaaataacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtga 27697835  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
     |||||| |    ||  |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27697834 cggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggctttggctggagga 27697735  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    |   |||||| ||| | |||||||||||||    
T  27697734 ctcgattggtttggtcctggaagcagagtc 27697705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 367
Target Start/End: Original strand, 26143513 - 26143868
Alignment:
Q  12 atgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggacttta 111  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||||     | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||     
T  26143513 atgtagccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttt 26143612  T
Q  112 tggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagag 211  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||    
T  26143613 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 26143712  T
Q  212 aactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatttctt 311  Q
    || |||  |   |||||  |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| || |||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||      
T  26143713 aattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaa 26143812  T
Q  312 atatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgac 367  Q
      ||  ||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26143813 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgac 26143868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25492860 - 25492622
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||   |||  ||||||||||    
T  25492860 ttacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggac 25492761  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||| | | |||||||    
T  25492760 tttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgag 25492661  T
Q  208 agagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccagga 246  Q
    |||||| ||| || |||  || |||||| ||||||||||    
T  25492660 agagaattcaactccaagaaacttgaaagatctccagga 25492622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 430
Target Start/End: Original strand, 26056572 - 26056985
Alignment:
Q  17 gccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggactttatggta 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     | |||||  |||  ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  26056572 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26056671  T
Q  117 ccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaactc 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  26056672 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26056771  T
Q  217 agcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatttcttatata 316  Q
    | ||   || || ||||||||||||||| || ||||||||  ||||| | || ||||  |   | |||||| || |||||||||||||||  |   ||||    
T  26056772 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattata 26056871  T
Q  317 gaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcattggtatggcc 416  Q
     ||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  || | || ||| | |||||||| ||||||| | ||||||  || |    
T  26056872 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtc 26056971  T
Q  417 gtggaagcagagtc 430  Q
     |||||||||||||    
T  26056972 ttggaagcagagtc 26056985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 430
Target Start/End: Original strand, 26076542 - 26076955
Alignment:
Q  17 gccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggactttatggta 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     | |||||  |||  ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  26076542 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26076641  T
Q  117 ccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaactc 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  26076642 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 26076741  T
Q  217 agcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatttcttatata 316  Q
    | ||   || || ||||||||||||||| || ||||||||  ||||| | || ||||  |   | || ||| || |||||||||||||||  |   ||||    
T  26076742 aactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattata 26076841  T
Q  317 gaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcattggtatggcc 416  Q
     ||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  || | || ||| | |||||||| ||||||| | ||||||  || |    
T  26076842 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtc 26076941  T
Q  417 gtggaagcagagtc 430  Q
     |||||||||||||    
T  26076942 ttggaagcagagtc 26076955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Original strand, 26824460 - 26824672
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  26824460 ttacatgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggac 26824559  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    |||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||   |  ||||||||||| || |||||    
T  26824560 tttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgag 26824659  T
Q  208 agagaactcagct 220  Q
    |||||| ||||||    
T  26824660 agagaattcagct 26824672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 367
Target Start/End: Original strand, 25539188 - 25539543
Alignment:
Q  12 atgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggacttta 111  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||     | ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  25539188 atgtggccaaataccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 25539287  T
Q  112 tggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagag 211  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||     |||||||||| | ||||| ||||||    
T  25539288 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttcttcataatgtcagagag 25539387  T
Q  212 aactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatttctt 311  Q
    || |||  |   ||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||||| | || ||||  |   | |||||| || |||||||||||||||  |      
T  25539388 aattcaagtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataacaa 25539487  T
Q  312 atatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgac 367  Q
      ||| ||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25539488 tcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgac 25539543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 25580372 - 25580722
Alignment:
Q  17 gccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggactttatggta 116  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     | ||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  25580372 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggta 25580471  T
Q  117 ccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaactc 216  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||  ||    
T  25580472 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttc 25580571  T
Q  217 agcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatttcttatata 316  Q
    |  |   ||||| ||||||||||||||  |  | |||||| ||| || | || ||||  |  || |||||| || ||||||||||||||||||    ||     
T  25580572 aattcttaataacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcatt 25580671  T
Q  317 gaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgac 367  Q
     ||||||| |||  |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25580672 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgac 25580722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 430
Target Start/End: Original strand, 25483709 - 25484122
Alignment:
Q  17 gccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggactttatggta 116  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     | ||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  25483709 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggta 25483808  T
Q  117 ccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaactc 216  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  25483809 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 25483908  T
Q  217 agcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatttcttatata 316  Q
    |  |   |||||  |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | || ||||  |   | |||||| || |||||||||||||||  |    |||    
T  25483909 aagtcataataacctgaaacatctccaaaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcata 25484008  T
Q  317 gaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcattggtatggcc 416  Q
     ||||||| |||  |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || | || ||| | |||||||| ||||||| | ||||||  || |    
T  25484009 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtc 25484108  T
Q  417 gtggaagcagagtc 430  Q
     |||||||||||||    
T  25484109 atggaagcagagtc 25484122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 367
Target Start/End: Original strand, 27215093 - 27215452
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||  | | | |||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| | || |  ||||  ||||||||||    
T  27215093 ttacatgttgccaaacaccctgttggattacatacccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggac 27215192  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    || ||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||| ||||||     
T  27215193 ttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaa 27215292  T
Q  208 agagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatt 307  Q
    |||||| ||| ||| |||||| |||||||| || |||||  || ||||| | |||||  ||  |||  |   | |||||||||||||||||||||| |||    
T  27215293 agagaattcaactttaaataacttgaaacacctgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggaggtgttagtgaggggatt 27215392  T
Q  308 tcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgac 367  Q
     |  | ||| |  ||| ||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27215393 acaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgac 27215452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 367
Target Start/End: Original strand, 25511651 - 25511892
Alignment:
Q  126 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaactcagcttcaaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||   ||    
T  25511651 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaa 25511750  T
Q  226 taaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatttcttatatagaggaaagg 325  Q
     || ||||||||||||||| || ||||||||  ||||| | || ||||  |   | || ||| || |||||||||||||||  |   |||| |||||||     
T  25511751 gaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaaga 25511850  T
Q  326 ctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgac 367  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25511851 ctatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgac 25511892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Original strand, 28140295 - 28140378
Alignment:
Q  127 gggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagaga 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||    
T  28140295 gggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgagaga 28140378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29843467 - 29843340
Alignment:
Q  69 ttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgc 168  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  29843467 ttgatgcaaaatttgatgatcgagtccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgc 29843368  T
Q  169 tgatcaatttgaatgctcatgttttctt 196  Q
    |||| |||||||||| |  |||||||||    
T  29843367 tgataaatttgaatgtttgtgttttctt 29843340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 181
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937843
Alignment:
Q  128 ggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 181  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaa 26937843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 26950511 - 26950586
Alignment:
Q  135 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagaga 210  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  26950511 caacacttgctcaagcagtttataacttgattgctaatcaatttgaatgcaaatgttttcttcacaatgtgagaga 26950586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 196
Target Start/End: Original strand, 29826741 - 29826815
Alignment:
Q  122 ggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  29826741 ggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatatgattggtgataaatttgaatgcttgtgttttctt 29826815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 25511588 - 25511640
Alignment:
Q  17 gccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttct 69  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  25511588 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttct 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Original strand, 26849464 - 26849528
Alignment:
Q  119 ggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 183  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26849464 ggaggaatgggaaaaacaacacttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaatg 26849528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28097857 - 28097809
Alignment:
Q  135 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 183  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28097857 caacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatg 28097809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25492532 - 25492501
Alignment:
Q  336 agaagattcttttgattctcgatgatgttgac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25492532 agaagattcttttgattctcgatgatgttgac 25492501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 183
Target Start/End: Original strand, 26975710 - 26975767
Alignment:
Q  126 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 183  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26975710 tgggtaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatg 26975767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 196
Target Start/End: Original strand, 28243563 - 28243624
Alignment:
Q  135 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 196  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28243563 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttctt 28243624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Original strand, 25074647 - 25074683
Alignment:
Q  147 aagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 183  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25074647 aagcaatttataatttgattgctaatcaatttgaatg 25074683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29845931 - 29845851
Alignment:
Q  82 tgatgatggagtccggatggtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattt 162  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  29845931 tgatgatcgagtccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataattt 29845851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 8121 - 8546
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  8121 tcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatg 8220  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8221 gtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 8320  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  8321 atgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtga 8420  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8421 gggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggagga 8520  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  8521 cctgattggttcggccgtggaagcag 8546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13223 - 12798
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  13223 tcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatg 13124  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13123 gtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 13024  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  13023 atgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtga 12924  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12923 gggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggagga 12824  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  12823 cctgattggttcggccgtggaagcag 12798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4260 - 3835
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||  |||    
T  4260 tcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatg 4161  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4160 gtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 4061  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  4060 atgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgttagtga 3961  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |    
T  3960 gggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaa 3861  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcag 426  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3860 cctgattggtttggccttggaagcag 3835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2658
Alignment:
Q  5 cccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtag 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3083 cccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtag 2984  T
Q  105 gactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2983 gactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgt 2884  T
Q  205 gagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggga 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2883 gagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgaggga 2784  T
Q  305 atttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctc 404  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  2783 attccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttggctggaggacctg 2684  T
Q  405 attggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  2683 attggttcggccgtggaagcaaagtc 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 2 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18679103 - 18678676
Alignment:
Q  2 cagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18679103 cagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatgg 18679004  T
Q  102 taggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaa 201  Q
    ||||||||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679003 taggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaa 18678904  T
Q  202 tgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgag 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18678903 tgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgag 18678804  T
Q  302 ggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggac 401  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || || | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18678803 ggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatgctttggccggaggac 18678704  T
Q  402 ctcattggtatggccgtggaagcagagt 429  Q
     | ||||||  ||  |||||||||||||    
T  18678703 gtgattggttcggttgtggaagcagagt 18678676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18698944 - 18698516
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  18698944 tcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatg 18698845  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
     ||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18698844 ttaggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 18698745  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18698744 atgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtga 18698645  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18698644 gggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggagga 18698545  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcagagt 429  Q
    | | ||||||  ||| |||||||||||||    
T  18698544 cgtgattggttcggctgtggaagcagagt 18698516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18723629 - 18723201
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  18723629 tcagcccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatg 18723530  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
     |||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18723529 ataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 18723430  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  18723429 acgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtga 18723330  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18723329 gagaattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggagga 18723230  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcagagt 429  Q
    ||| ||||||  |||  ||||||||||||    
T  18723229 cctgattggttcggctctggaagcagagt 18723201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18731048 - 18730624
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  18731048 tcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatg 18730949  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
     |||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18730948 ataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 18730849  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18730848 atgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtga 18730749  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18730748 gggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttggctggagga 18730649  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagca 425  Q
    | | ||||||  ||| |||||||||    
T  18730648 cgtgattggttcggctgtggaagca 18730624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18655021 - 18654593
Alignment:
Q  1 tcagcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatg 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||    
T  18655021 tcagcccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatg 18654922  T
Q  101 gtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 200  Q
     |||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654921 ataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaa 18654822  T
Q  201 atgtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtga 300  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18654821 atgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtga 18654722  T
Q  301 gggaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | | ||| ||||||||||| ||||||    
T  18654721 gggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgctttggctggagga 18654622  T
Q  401 cctcattggtatggccgtggaagcagagt 429  Q
    | | ||||||  ||  |||||||||||||    
T  18654621 cgtgattggttcggttgtggaagcagagt 18654593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 400
Target Start/End: Original strand, 18074400 - 18074794
Alignment:
Q  6 ccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtagg 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||  ||||| ||    
T  18074400 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 18074499  T
Q  106 actttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtg 205  Q
    | ||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||     
T  18074500 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 18074599  T
Q  206 agagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaa 305  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||  |||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  18074600 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 18074699  T
Q  306 tttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    | ||    ||| |||||||| |   |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  18074700 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggagga 18074794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5090392 - 5090319
Alignment:
Q  110 tatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 183  Q
    ||||| || |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  5090392 tatgggactggaggaatgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatg 5090319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5090178 - 5090069
Alignment:
Q  321 aaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcattggtatggccgtgg 420  Q
    ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||| | |||||| |||| |||| |||||| ||| | |||    
T  5090178 aaaggctacaaagaaagaaagttcttttgattctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccggagaacctgattggtttggtcttgg 5090079  T
Q  421 aagcagagtc 430  Q
     |||||||||    
T  5090078 cagcagagtc 5090069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 400
Target Start/End: Original strand, 60208 - 60602
Alignment:
Q  6 ccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtagg 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||  ||||| ||    
T  60208 ccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttgg 60307  T
Q  106 actttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtg 205  Q
    | ||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||     
T  60308 aatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtc 60407  T
Q  206 agagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaa 305  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||  |||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  60408 agagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggagatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaa 60507  T
Q  306 tttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggagga 400  Q
    | ||    ||| |||||||| |   |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  60508 tctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggagga 60602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 267886 - 267459
Alignment:
Q  3 agcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  |||||    
T  267886 agcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggt 267787  T
Q  103 aggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaat 202  Q
     ||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||    
T  267786 tggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgat 267687  T
Q  203 gtgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagg 302  Q
    |||||||| || ||||||  || ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |  |||| ||||| ||||||    |||||||||||    
T  267686 gtgagagaaaattcagctataagtaacttgaaacatctccaagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagg 267587  T
Q  303 gaatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacc 402  Q
    | ||| |    ||  |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||     
T  267586 gcattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgctttggctggaggact 267487  T
Q  403 tcattggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    | ||||||  |||  |||||||||||||    
T  267486 tgattggttcggctatggaagcagagtc 267459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28127217 - 28126794
Alignment:
Q  7 cttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtagga 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | ||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||||  ||||  |||||||||    
T  28127217 cttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtagga 28127118  T
Q  107 ctttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 206  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||    
T  28127117 ctttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28127018  T
Q  207 gagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaat 306  Q
    ||||||  ||| || || |||| |||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| ||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28127017 gagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28126918  T
Q  307 ttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacctcat 406  Q
    | |    ||| |  ||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  || | || ||| | |||||||| ||||||| | ||    
T  28126917 tgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgat 28126818  T
Q  407 tggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
    ||||  || |||||||||| ||||    
T  28126817 tggttcggtcgtggaagcaaagtc 28126794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28163916 - 28163562
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggtaggac 107  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||  ||||  ||||||||||    
T  28163916 ttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggac 28163817  T
Q  108 tttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 207  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||    
T  28163816 tttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgag 28163717  T
Q  208 agagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgagggaatt 307  Q
    |||||| ||| || ||   || ||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||| ||  || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28163716 agagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagct-ctttttgaaacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaatt 28163618  T
Q  308 tcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 363  Q
     |    ||| |  |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  28163617 acaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgt 28163562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 29273383 - 29272957
Alignment:
Q  4 gcccttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccggatggta 103  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||  |||  |||||     
T  29273383 gcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggtt 29273284  T
Q  104 ggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatg 203  Q
    ||| ||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||| |  |||    
T  29273283 ggaatttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatg 29273184  T
Q  204 tgagagagaactcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttctaaaaacacttcaattgaaaattgagttaggaggtgttagtgaggg 303  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  |  |||| ||||| ||||||    ||||||||||||    
T  29273183 tgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggg 29273084  T
Q  304 aatttcttatatagaggaaaggctacattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaatcaactacatgctttggcaggaggacct 403  Q
     ||| |   |||| |||| ||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  29273083 gattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctttggctggaggacat 29272984  T
Q  404 cattggtatggccgtggaagcagagtc 430  Q
     ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  29272983 gattggttcggccgtggaagcaaagtc 29272957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 16440694 - 16440743
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 57  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  16440694 ttacatgttgctaattaccctgttggattggagtctcgagtgcaccaagt 16440743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Original strand, 16449533 - 16449573
Alignment:
Q  8 ttacatgttgccaattatcctgttggattgcagtctcgagt 48  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16449533 ttacatgttgcgaattatccagttggattggagtctcgagt 16449573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 219
Target Start/End: Original strand, 3280411 - 3280511
Alignment:
Q  119 ggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaactcag 218  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||| || ||||    
T  3280411 ggaggaatgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattcag 3280510  T
Q  219 c 219  Q
    |    
T  3280511 c 3280511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Original strand, 16691619 - 16691696
Alignment:
Q  119 ggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 196  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  16691619 ggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttctt 16691696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 196
Target Start/End: Original strand, 43725 - 43786
Alignment:
Q  135 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttctt 196  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  43725 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttctt 43786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2136 - 2056
Alignment:
Q  82 tgatgatggagtccggatggtaggactttatggtaccggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattt 162  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  2136 tgatgatcgagtccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataattt 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University