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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18504_high_1 (Length: 932)

Name: NF18504_high_1
Description: NF18504
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18504_high_1
NF18504_high_1
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (19-926)||(42225999-42226902)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 766; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 766; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 42226902 - 42225999
Alignment:
Q  19 tgtgtgtggtgtttatttttgaccaactgttgtggtttcttaaaaacctatttatcatttgcgcagtattcgtagtagatggatttgacttgtatatact 118  Q
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T  42226902 tgtgtatggtgtttatttttgaccaactgttgtggtttcttaaaa-cctatttatcatttgcgcagtattcatagtagacggatttgacttgtatatact 42226804  T
Q  119 tgcaaatttttacacatacatcaaatcaaatcattctatgatgtcttttttggattaattcataannnnnnnn-ataaatacctatttaacatattttaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42226803 tgcaaatttttacacatacatcaaatcaaatcattctatgatgtcttttttggattaattcatattttttttttataaataccaatttaacatattttaa 42226704  T
Q  218 ttggatgcatgtgtgaaatttgtttactttatcaatgtatatcattctttaatcacatgcttgtgttaaaccaaaaagagagtagtaaaaccatgaacaa 317  Q
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T  42226703 ttggatgcatgtgtgaaatttgtttacattatcaatgtatatcattctttaatcacatgcttgtgttaaaccaaaaagagagtagtaaaaccatgaacaa 42226604  T
Q  318 gattttgtggatgtgaggacaaaatcgatagatgataaataacgtatacgtgtattttttccacatgtcattnnnnnnncaagagaaacataaagttaga 417  Q
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T  42226603 gattttgtggatatgaggacaaaatcgat---tgataaataacgtatacgtgtattttttccacatgtcattaaaaaaacaagagaaacataaagttaga 42226507  T
Q  418 tcttaaacatctagaccggacaaggcttaaaatttataaatttatatctaagcctacttctatccggacaagataaacaaatattgtttcgattgagatt 517  Q
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T  42226506 tcttaaacatctagaccggacaaggcttagaatttataaatttatatctaagcctacttctatccggacaagatagacaaatattttttcgattaagatt 42226407  T
Q  518 caaaatcgatttttcaaataattcatccttacgtaaaacttatttatcctaaaacctaactcgtaaccactttgattgactatgggagaagaggtttctt 617  Q
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T  42226406 caaaatcgatttttcaaataattcgtccttatgtaaaacttatttatcctaaaacctaactcgtaaccactttgattgactatgggagaagaggtttctt 42226307  T
Q  618 ataaaagaaacattactaaacagcataacattaattattgtttgttttatttttgtcaatggaaaacaatgaggaatttagtcgctttcaaatgactgta 717  Q
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T  42226306 ataatagaaacattactaaacagcataacattaattattgtttgttttatttttgtcaatggaaaacaatgaggaatttagtcgctttcaaatgactgta 42226207  T
Q  718 aaagcttggtgagtagggtctcagcatctgatcactaagagagtgacaatttaaatgaggtagcagaatttgcactatttaagaagcactatattcacag 817  Q
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T  42226206 aaagcttggtgagtagggtctcagcatctgatcactaagagagtgacaatttaaatgaggtagtagaatttgcactatttaagaagcactatattcacag 42226107  T
Q  818 atgtatgaaccaaccagcattagcaatacaatacatgtcatgcatatgatcaacctattcatttcgtatagctagctctagcttcattttaattttatat 917  Q
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T  42226106 atgtatgaaccaaccagcattagcaatacaatacatgtcatgcatatgatcaacctattcatttcgtatagctagctctagcttcattttaa-tttatat 42226008  T
Q  918 atattcttc 926  Q
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T  42226007 atattcttc 42225999  T

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