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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18505_low_2 (Length: 713)

Name: NF18505_low_2
Description: NF18505
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18505_low_2
NF18505_low_2
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (18-711)||(48957690-48958383)
chr4 (208-701)||(48965065-48965555)
chr4 (204-704)||(48961023-48961525)
chr4 (237-684)||(48912312-48912759)
chr4 (416-616)||(48974062-48974262)
chr4 (195-338)||(48967181-48967324)
chr4 (414-570)||(48951185-48951341)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (204-711)||(12641421-12641928)
[»] scaffold0536 (3 HSPs)
scaffold0536 (236-711)||(6451-6926)
scaffold0536 (403-711)||(10433-10741)
scaffold0536 (414-563)||(1541-1690)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (204-711)||(13448095-13448599)
chr2 (204-710)||(13454566-13455069)
chr2 (204-711)||(13439932-13440436)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (226-704)||(12590116-12590594)
chr6 (165-704)||(12483411-12483953)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (172-711)||(3417470-3418006)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (217-711)||(12540430-12540921)
chr5 (226-711)||(28385088-28385570)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 642; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 642; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 711
Target Start/End: Original strand, 48957690 - 48958383
Alignment:
Q  18 atgttacataaacacaattcataatagggtaatgctttcaaacaggatatctatatatactcatagccagccaaatccacgtacaatattcacacttttg 117  Q
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T  48957690 atgttacataaacacaattcataatagggtaatgttttcaaacaggatatctctagatactcataggcagccaaatccacgtacaatattcacacttttg 48957789  T
Q  118 cgtgacatataatgagaaataatttagaaaaactaagacagtggtgggtatttgaattaatcaagtgtcttgcaatttctcatttgtttaagatcatcaa 217  Q
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T  48957790 cgtgacatataatgagaaataatttagaaaaactaagacagtggtgggtatttgaattaatcaagtgtcttgcagtttctcatttgtttaagatcatcaa 48957889  T
Q  218 tcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagcttc 317  Q
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T  48957890 tcaaagacaacaaattgttatgagatgatccaccttcttgaacagctcgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagcttc 48957989  T
Q  318 atcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacaccactctgttgca 417  Q
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T  48957990 atcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacaccactctgttgca 48958089  T
Q  418 ccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgctaa 517  Q
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T  48958090 ccaacctccaccccaattcctcgcacattagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgctaa 48958189  T
Q  518 cagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatcaa 617  Q
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T  48958190 cagcctccacagtggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatcaa 48958289  T
Q  618 acctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccctttcatctca 711  Q
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T  48958290 acctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttctcctcttcactctcgtcttctttccctttcttctca 48958383  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 208 - 701
Target Start/End: Original strand, 48965065 - 48965555
Alignment:
Q  208 agatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgattt 307  Q
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T  48965065 agatcatcaatcaaggctaacaaattcttatgagacgagccaccttcttgaatggctcgtctagccttttctccaaactcttgagcacgacttctaattt 48965164  T
Q  308 cctcagcttcatcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacacca 407  Q
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T  48965165 tctcagcttcatcaccactgtccatcaatctcctcacagccttctctatgctatcactactcaccagcttctctctttcttcaaaaccagtcaaacacca 48965264  T
Q  408 ctctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacc 507  Q
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T  48965265 ttctgttgcaccaacttccactccaatccctcgcacttctgttatcagtttttcgttgtagaattgttctccatgtgaaggccatgtaatcatcggaacc 48965364  T
Q  508 cccgcgctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccc 607  Q
    ||||| | ||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||| ||| || || ||||| ||||    
T  48965365 cccgcaccaacagcctccactgtggagttccaaccacaatgagtcataaaggcacccacagcggggtggctcagaatcagaacctgcggagcccaacccc 48965464  T
Q  608 taatgatcaaacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccc 701  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||   || |||||||||||||| || ||||||||    
T  48965465 taataatcaaacc---cttctttccaatgtttctctcttcgaatccctttggtaaccacttttgcttctcctcttcactctcatcctctttccc 48965555  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 204 - 704
Target Start/End: Original strand, 48961023 - 48961525
Alignment:
Q  204 tttaagatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttg 303  Q
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T  48961023 tttaagatcatcaattaaagccaacaaattattatgagatgagccgcctacttgaacagctcatatagccttatccccaaactctcgagcacgccgtctt 48961122  T
Q  304 atttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacac 403  Q
    || || || |||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||| |||||| |||||||  | |  | ||| | | |||| |||| ||| |  ||||    
T  48961123 atatcttcggcttcatcaccaccgtccattaattttctcactgccttctctatattatctttgttgatcaccttatttctctcttcaataccatccacac 48961222  T
Q  404 accactctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattgg 503  Q
    |||| ||||||||||| || || |  || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  48961223 accattctgttgcaccaacttcaattccaataccccgcacatcagttatcaacttctcgttgtagaattgttctccatgtacgggccatgttatcattgg 48961322  T
Q  504 aacccccgcgctaacagcctccacaatg--gagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggccc 601  Q
     | ||| || ||| ||||||| |   ||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  48961323 gatccctgcactaccagcctcaatggtggagagttccacccgcaatgcgtcataaacacacccaccgctgtgtggcccaggatcataacttgtggggccc 48961422  T
Q  602 accccctaatgatcaaacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccc 701  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||  |||||||    
T  48961423 accccttaatgatcaaacccttcttcttttcaatgtttctctcttcaaatcctttcggcaaccacttgtctttctcctcttcgctctcatccactttccc 48961522  T
Q  702 ttt 704  Q
    |||    
T  48961523 ttt 48961525  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 237 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 48912759 - 48912312
Alignment:
Q  237 atgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaat 336  Q
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T  48912759 atgagatgaaccaccttctttaattgcatgtttagctttctccccaaactctcgagcatgttgtctgattttctcagcttcatcaccactgtccatcaat 48912660  T
Q  337 ctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacaccactctgttgcaccgacctccaccccgattc 436  Q
    | ||||||| |||| || ||| ||||  | |  || | ||||| | | ||| ||| |||  ||   | ||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  48912659 cgcttcacaaccttctcaatattatccctccaaaccaccttctctctttccccaataccagttgtgctccattccgttgcaccgacctccaccccaatcc 48912560  T
Q  437 ctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgctaacagcctccacaatggagtt 536  Q
    |  |||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||    
T  48912559 catgcacctgtgttatcaacttctcattgtaaaactgttctccatgcatcggccacgtgatcattggaacccctgcactaactgcctcaacagtggaatt 48912460  T
Q  537 ccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatcaaacctttcttctttccaatg 636  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||| |||| | | ||||||||||| ||     
T  48912459 ccacccacaatgtgtcataaatgcacccacggctgtgtggctcagaatcataacctgtggagcccaacccttaataatcatagccttcttctttccgata 48912360  T
Q  637 tttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttca 684  Q
     |||||||||| || || || |||||||| ||| |||| |||||||||    
T  48912359 attctctcttcaaacccctttggcaaccatttttctttctcctcttca 48912312  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 416 - 616
Target Start/End: Original strand, 48974062 - 48974262
Alignment:
Q  416 caccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgct 515  Q
    |||| |||||||| || || || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  48974062 caccaacctccacaccaataccccgcacctgagttatcaacttctcgttgtagaattgttcgtcatgcactggccacgtgatcattggaacccctgcact 48974161  T
Q  516 aacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatc 615  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||  |||||  | |||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48974162 aacggcttccacggtggagttccacccgcaatgtgtcaagaatgcaccgatagcagggtggcctaaaatcaccacttgtggggcccacccccttatgatc 48974261  T
Q  616 a 616  Q
    |    
T  48974262 a 48974262  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 48967181 - 48967324
Alignment:
Q  195 tctcatttgtttaagatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagca 294  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||    
T  48967181 tctcattcttttaagatcatcaatcaaagcaagtaaattattataagacaagccaccttcttgaagtgctcgtgtagccttttctccaaagtctcgagca 48967280  T
Q  295 cgctgtttgatttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaatct 338  Q
    || ||| |||| | ||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  48967281 cgttgtctgatcttctcagcttcatcgtcattgtccatcaatct 48967324  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 570
Target Start/End: Original strand, 48951185 - 48951341
Alignment:
Q  414 tgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcg 513  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||||| |||||| | ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |     
T  48951185 tgcacctacttccactcctatcccacgcacatgagttatgagcttctcattgtagaactgatcactatgcaccggccacgtgatcatcggaacccctaca 48951284  T
Q  514 ctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggca 570  Q
    |||| |||||||   |  ||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||    
T  48951285 ctaatagcctccgtcacagagttccacccacaatgtgtcaaaaacgcgccaacggca 48951341  T

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Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 204 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 12641928 - 12641421
Alignment:
Q  204 tttaagatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttg 303  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||| ||    
T  12641928 tttaagatcgttaatcaaagccaacaaattgttatgagacgacccgccttcttcaacagcatgtgtagcctttttcccaaactcttgagcacgttgtctg 12641829  T
Q  304 atttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacac 403  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||| |  |||| |||  | | | |||| | ||||     
T  12641828 atttccttagcttcatcaccatcgtccatcaatctcctcacagctttctctatactatgtctactcaccactttctcttttcctttataaccatgtacag 12641729  T
Q  404 accactctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattgg 503  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12641728 accactctgttgcacccacctccaccccaatccttcgcacaacagttatcagcttctcattatagaactgttctccttgcactggccacgtgatcattgg 12641629  T
Q  504 aacccccgcgctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccac 603  Q
    || ||| || ||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||| | |||||  |||||||||||||||    
T  12641628 aatccctgcactaacagcctctaccaaggagttcgacccgcaatgcgtcatgaatgcacccacagcagcgtggcttaaaatcattacttgtggggcccac 12641529  T
Q  604 cccctaatgatcaaacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccctt 703  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12641528 tccctaatgataaaacctttcttattttcaacatttctctcttcgaatcctttaggcaaccacttttctttctcctcttcactctcatcttttttccctt 12641429  T
Q  704 tcatctca 711  Q
    || |||||    
T  12641428 tcttctca 12641421  T

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Target: scaffold0536 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0536
Description:

Target: scaffold0536; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 236 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 6926 - 6451
Alignment:
Q  236 tatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaa 335  Q
    ||||||| || |||||||||||| | || ||| ||||||| || || |||||| |||||  || |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6926 tatgagatgaaccaccttcttgagccgcatgtttagccttatccccaaactctcgagcatactttttgattttctcagcttcgtcaccaccatccatcaa 6827  T
Q  336 tctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacaccactctgttgcaccgacctccaccccgatt 435  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||  | | ||| | ||||| | ||||| ||| |||  ||  || |||||| | ||| || ||| ||||||| |||    
T  6826 tctcctcacagccttctcaatactatccctccccaccaccttctctctctccccaataccagttgaactccactcagctgcccccaccaccaccccaatt 6727  T
Q  436 cctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgctaacagcctccacaatggagt 535  Q
    | |||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||| |    
T  6726 cgtcgcacctgtgttatcaacttttcattgtaaaattgttctccatgcaccggccacgtgatcatcggaacccctgcactaacagcctcaacagtggaat 6627  T
Q  536 tccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatcaaacctttcttctttccaat 635  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  6626 tccacccacaatgcgtcataaacgcacccagagctttgtggctcaaaatcataacttgtggagcccaacccctaataatcaaacccttcttctttccgat 6527  T
Q  636 gtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccctttcatctca 711  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6526 atttctctcttcgaatccctttggcaaccattttcctttctcctcttcactctcatcttctttccctttcttctca 6451  T

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Target: scaffold0536; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 403 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 10741 - 10433
Alignment:
Q  403 caccactctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattg 502  Q
    |||||||||  |||||| || ||| |||| || || ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10741 caccactctactgcacccacttcccccccaatcccccgcacttgcgttatcaacttctcattgtaaaattgttctccatgcattggccacgtgatcattg 10642  T
Q  503 gaacccccgcgctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggccca 602  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  10641 gaacccctgcactaaccgcctccacggtggaattccacccacaatgtgtcataaacgcacccacaacagtgtggcttagaatcataacctgaggggccca 10542  T
Q  603 ccccctaatgatcaaacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccct 702  Q
     ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||   ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| ||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10541 acccttaataatcaaacccttcttctttgcaataactctttcttcaaatcctttcggtagccatttttctttctcctcttgactctcattctctttccct 10442  T
Q  703 ttcatctca 711  Q
    ||| |||||    
T  10441 ttcttctca 10433  T

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Target: scaffold0536; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 1690 - 1541
Alignment:
Q  414 tgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcg 513  Q
    ||||||||| ||||| || || ||  |||| | |||||||||| | || || |||||||| || | ||| || ||||| |||||||||||||  || ||     
T  1690 tgcaccgacttccactccaatcccatgcacctgagttatcaacgtttcgttatagaattgatcactatgtactggccatgtgatcattggaattcctgca 1591  T
Q  514 ctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacc 563  Q
    |||||||||||    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1590 ctaacagcctcggttatagagttccacccacaatgtgtcaaaaatgcacc 1541  T

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Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 204 - 711
Target Start/End: Original strand, 13448095 - 13448599
Alignment:
Q  204 tttaagatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttg 303  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||  |  ||    
T  13448095 tttaagttcgtcaatcaaagccaacaaattattataagacgagccaccttcttgaatagcttgtatagctttttctccaaactctcgagcacgtagcctg 13448194  T
Q  304 atttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacac 403  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||| | ||||| | | |||  |   ||    
T  13448195 atattttcagcttcatcaccaccgtccatcaatctccttacagccttctctatgctatctctgctcactaacttctttctctccgcgacaccactcgtac 13448294  T
Q  404 accactctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattgg 503  Q
    |||| |||||||||||||| || || || |||||||| |  |  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13448295 accattctgttgcaccgacttcaactccaattcctcggaattgtgttatcagtttctcattgtagaattgatctccatgaaccggccacgttatcattgg 13448394  T
Q  504 aacccccgcgctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccac 603  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||  ||||||||  |||  ||| |||||||||||     
T  13448395 aactcccgcactaacagcctctacggttgagttccccccgcaatgcgtcataaatccccccactgcagggtggctcaatatcttaacctgtggggcccaa 13448494  T
Q  604 cccctaatgatcaaacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccctt 703  Q
    |||||||||||||||||   |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  13448495 cccctaatgatcaaacc---cttcttcccgatatttctctcttcaaatcccttcggtaaccacttttctttctcttcttcgctctcatcttctttccctt 13448591  T
Q  704 tcatctca 711  Q
    || |||||    
T  13448592 tcttctca 13448599  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 204 - 710
Target Start/End: Original strand, 13454566 - 13455069
Alignment:
Q  204 tttaagatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttg 303  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     ||    
T  13454566 tttaagttcatcaatcaaagccaacaaattattataagatgagccacctttttgaatagcttgtgtagccttttctccaaactctcgagcacgtaccctg 13454665  T
Q  304 atttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacac 403  Q
    || |  | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||| | ||||| ||| |||  ||  ||    
T  13454666 atatttttagcttcatcaccaccgcccatcaatctcctcacagccttctctatgctatctttgctcaccaacttctctctctccgcaacaccacttgtac 13454765  T
Q  404 accactctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattgg 503  Q
    |||| |||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13454766 accattctgttgcaccgacttcaattccaattcctcgaacttgtgttattagtttctcgttgtagaattgatctccatggactggccacgttatcattgg 13454865  T
Q  504 aacccccgcgctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccac 603  Q
    ||| |||  |||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||  ||| ||||  |||  |||||||||||||||     
T  13454866 aactcccatgctaacagcctctacgattgagttccccccgcaatgcgtcataaatccccccactgcagggtgactcaatatcttaacttgtggggcccaa 13454965  T
Q  604 cccctaatgatcaaacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccctt 703  Q
    ||||||||||||||||| || ||||   | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13454966 cccctaatgatcaaaccctttttct---cgatgtttttctcttcaaatcccttcggcaaccacttttgtttctcctcttcgctctcatcttctttccctt 13455062  T
Q  704 tcatctc 710  Q
    || ||||    
T  13455063 tcttctc 13455069  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 204 - 711
Target Start/End: Original strand, 13439932 - 13440436
Alignment:
Q  204 tttaagatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttg 303  Q
    |||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |  |     
T  13439932 tttaagttcttcaattaaagccaacaaattattataagacgagccaccttcttgaatagcttgtgtagccttttctccaaactcttgagcaagtagcctc 13440031  T
Q  304 atttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacac 403  Q
    || |  | |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||  | ||||| | ||||| | ||||| ||| ||| ||   ||    
T  13440032 atatttttagcttcatcaccattctccatcaatctcctcacagccttctctatgttatccctgctcaccaacttctctctctccgcaacaccattcttac 13440131  T
Q  404 accactctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattgg 503  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| |  |  |||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13440132 accattccgttgcaccgacttccactccaattcctcgaaattgtgttaccagtttctcgttgtagaattgatctccatgaaccggccacgttatcattgg 13440231  T
Q  504 aacccccgcgctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccac 603  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||  ||||||||  |||  |||||||||||||||     
T  13440232 aactcccgcactaacagactctacaattgagttccccccgcaatgcgtcataaatccccccaccgcagggtggctcaatatcttaacttgtggggcccaa 13440331  T
Q  604 cccctaatgatcaaacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccctt 703  Q
    ||| |||||||||||||   | || | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  13440332 cccttaatgatcaaacc---catcctcctaatgtttctctcttcgaatccctttggcaaccacttttctttctcttcctcactctcatcttctttccctt 13440428  T
Q  704 tcatctca 711  Q
    || |||||    
T  13440429 tcttctca 13440436  T

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Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 226 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 12590594 - 12590116
Alignment:
Q  226 aacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagcttcatcaccac 325  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||| |||||||||| || |||| ||||| || |||||||||  |||  || |||||||||||||||||   ||||    
T  12590594 aacaaattattattagaggagccaccttgttgaacagctagtctagctttttcccctaactcttgactacgtcgtctgatttcctcagcttcaatgccac 12590495  T
Q  326 cgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacaccactctgttgcaccgacctc 425  Q
    | |||||||||||  ||||||| || | ||| |||||| ||||||| | |||   |||||| |||| | |||  | | |||| ||||||||||| || ||    
T  12590494 catccatcaatcttctcacagcattctttatgctatctctactcaccacctt---tttctcgtcaataacgtacatagaccaatctgttgcaccaacttc 12590398  T
Q  426 caccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgctaacagcctcc 525  Q
    ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||||| |||||||| ||||  || || ||||| ||||||    
T  12590397 cactccaattccatgcacatcagttatcaacttctcattgtaaaaatgttcaccattcaatggccatgtgatcatcggaattccagcactaaccgcctcc 12590298  T
Q  526 acaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatcaaacctttct 625  Q
    || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12590297 acgacggaattccatccacaatgtgtcataaacgcgcccactgcattgtggctcataatcattacttgtggggcccaacccctaatgatcaaacccttct 12590198  T
Q  626 tcttt---ccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttcccttt 704  Q
    |||||   ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  12590197 tctttctcccaatgtttctctcttcaaatccactaggcaaccatttttgtttatcctcatcactctcatcttccttcccttt 12590116  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 165 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 12483953 - 12483411
Alignment:
Q  165 gtatttgaattaatcaagtgtcttgca-atttctc---atttgtttaagatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||   || | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||    
T  12483953 gtatttgaattaatcaagtgtcttgcggatgtctctccatct-tttaagatcatcaaccaatgacaacaaattattattagaggagccaccttgttgcac 12483855  T
Q  261 agcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatacta 360  Q
     ||| || |||||||||| || |  ||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||   | ||| |  ||||||||  ||||||||||||||||  |     
T  12483854 ggctagtctagccttttcccccagttctcgagcacgttgtctgatttccttggcttcactgctaccatttatcaatcttctcacagccttttctatgttg 12483755  T
Q  361 tctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacaccactctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttct 460  Q
    ||| ||||||||| |||   ||||| | ||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||| |  ||||    
T  12483754 tctctactcacaacctt---tttcttcccaaaatcatacaaacaccactctgttgcaccgacttccacaccaatccctcgcacattagttatgagtttct 12483658  T
Q  461 cattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgc 560  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||  || ||||| || || || |||||||||||    
T  12483657 cattgtaaaaatgttcaccgtgaaccggccacgtgatcattggaatccctgcactaaccgcttccacaacagaattccatccacagtgagtcataaatgc 12483558  T
Q  561 acccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatcaaacc---tttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttc 657  Q
    |||||| |||  |||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    || ||| ||| |||||||||||| || ||||| |||    
T  12483557 acccactgcagggtggctcaaaatcagtacctgtggtgcccaccccctgatgattaaacccatcttattccttctaatgtttctctcctcaaatcccttc 12483458  T
Q  658 ggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttcccttt 704  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  12483457 ggcaaccacttttctttctcctcatcgctctcatcttccttcccttt 12483411  T

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Target: chr7 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 3418006 - 3417470
Alignment:
Q  172 aattaatcaagtgtcttgcaatttctcatttgtttaagatcatcaatcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtag 271  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||  | |||||| || || |||||||  |||||||| | ||| || || ||||||||||||| |||| || |||    
T  3418006 aattaatcaagtggcttgcagtctctcaactttttaagttcgtcgatcaaagttaacaaattatgatgtgaggaaccaccttcttgaatagctcgtttag 3417907  T
Q  272 ccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagcttcatcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcac 371  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||  || | ||  | ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||  ||||| |||||   |||| | |||||    
T  3417906 ccttctctccaagctctcgagcacgtagtctcataccttcagcctcatcactactgtccatcaatctcctcattgccttctctatgtcatctctgctcac 3417807  T
Q  372 aatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacaccactctgttgcaccgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaat 471  Q
     | ||||| | ||||| ||| ||| | | ||| ||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || |  ||||| |  ||||||||| | |||    
T  3417806 caacttctttctctccccaataccatgtgcacgccattctgttgcacctacttccactccaattcctcggacttgtgttattagtttctcattgaacaat 3417707  T
Q  472 tgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgctaacagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaa 571  Q
    || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| | || || |||     
T  3417706 tgatctccatgacccggccacgttatcattggaactcctgcaccaacagcctcaacaaatgagttccccccacaatgtgtcataaatccccctaccgcag 3417607  T
Q  572 tgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatcaaacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcc 671  Q
     ||||||||  |||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |    
T  3417606 ggtggctcaatatctgaacctgtggggcccaacccctaacgatcaaacc---cttctttccaatgtttctctcctcaaatcccttcggcaaccacttttc 3417510  T
Q  672 tttatcctcttcactctcgtcttctttccctttcatctca 711  Q
    ||| || |||||  |||| |||||||| |||||| |||||    
T  3417509 tttctcttcttcgttctcatcttcttttcctttcttctca 3417470  T

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Target: chr5 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 217 - 711
Target Start/End: Original strand, 12540430 - 12540921
Alignment:
Q  217 atcaaagacaacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagctt 316  Q
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T  12540430 atcaaagataacaaattattatgagaggaaccaccttcttgaacagctcgtctagccttctctccaatctctcgtgcacgtagtctcatattttcagctt 12540529  T
Q  317 catcaccaccgtccatcaatctcttcacagccttttctatactatctttactcacaatcttctgtttctcctcaaaaccgtttacacaccactctgttgc 416  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||| | |  || | ||||| | ||||| ||  ||| |||  |||||| ||||||||    
T  12540530 cataaccaccatccatcaatctcctcatagccttctctatgccatctctgccaaccaacttctttctctccccattaccatttgtacaccattctgttgc 12540629  T
Q  417 accgacctccaccccgattcctcgcacatcagttatcaacttctcattgtagaattgttctccatgcaccggccacgtgatcattggaacccccgcgcta 516  Q
    ||| || || || || |||||||| || |  ||||| |  ||||| ||| | || || ||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12540630 acctacttctactccaattcctcggacctgtgttattagtttctcgttgaataagtgatctccatgacacggccacgttatcattggaactcccgcacca 12540729  T
Q  517 acagcctccacaatggagttccacccgcaatgtgtcataaatgcacccacggcaatgtggctcagaatcaaaacttgtggggcccaccccctaatgatca 616  Q
    |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12540730 acagcctctacaattgagtttcccccacaatgtgtcataaatccccccaccgcagggtggctcaatatcttaacctgtggggcccaacccctaatgatca 12540829  T
Q  617 aacctttcttctttccaatgtttctctcttcgaatcctttcggcaaccactttcctttatcctcttcactctcgtcttctttccctttcatctca 711  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  12540830 aacc---cttttttccaatgtttctctcctcaaatcccttcggcatccacttttctttctcttcttcagtctcatcttctttccctctcttctca 12540921  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 226 - 711
Target Start/End: Original strand, 28385088 - 28385570
Alignment:
Q  226 aacaaattgttatgagacgatccaccttcttgaacagcttgtgtagccttttctccgaactcttgagcacgctgtttgatttcctcagcttcatcaccac 325  Q
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