View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18506_low_2 (Length: 617)

Name: NF18506_low_2
Description: NF18506
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18506_low_2
NF18506_low_2
[»] chr6 (87 HSPs)
chr6 (1-600)||(26885074-26885673)
chr6 (2-530)||(26656970-26657498)
chr6 (2-530)||(26762941-26763469)
chr6 (2-516)||(26647484-26648001)
chr6 (2-516)||(26753452-26753969)
chr6 (16-516)||(31285578-31286081)
chr6 (1-531)||(26803450-26803983)
chr6 (16-523)||(27717152-27717662)
chr6 (2-516)||(26862585-26863102)
chr6 (16-526)||(28787257-28787770)
chr6 (16-526)||(28793378-28793891)
chr6 (16-516)||(27426272-27426775)
chr6 (16-516)||(26624290-26624793)
chr6 (16-516)||(26730267-26730770)
chr6 (1-515)||(27603365-27603882)
chr6 (2-516)||(26824824-26825341)
chr6 (16-516)||(27609780-27610283)
chr6 (16-531)||(27679969-27680487)
chr6 (32-489)||(27704941-27705401)
chr6 (2-521)||(27697241-27697763)
chr6 (2-516)||(27529964-27530478)
chr6 (2-516)||(25511897-25512413)
chr6 (2-516)||(26143873-26144390)
chr6 (2-355)||(27336916-27337272)
chr6 (2-355)||(27397656-27398012)
chr6 (2-516)||(25484064-25484581)
chr6 (4-516)||(27215459-27215974)
chr6 (2-516)||(25580727-25581244)
chr6 (2-470)||(27591727-27592198)
chr6 (2-483)||(27676313-27676797)
chr6 (2-482)||(25492013-25492496)
chr6 (2-516)||(26056927-26057444)
chr6 (2-516)||(26076897-26077414)
chr6 (4-374)||(25539550-25539923)
chr6 (347-526)||(26938382-26938561)
chr6 (196-526)||(29842642-29842972)
chr6 (196-526)||(29827188-29827518)
chr6 (205-470)||(28326689-28326954)
chr6 (205-470)||(28504325-28504590)
chr6 (226-470)||(28186626-28186870)
chr6 (336-470)||(28296446-28296580)
chr6 (336-470)||(28515493-28515627)
chr6 (1-91)||(28782105-28782195)
chr6 (205-526)||(27663865-27664185)
chr6 (205-289)||(26636857-26636941)
chr6 (205-289)||(26742823-26742907)
chr6 (205-291)||(26849923-26850009)
chr6 (205-289)||(26960336-26960420)
chr6 (226-470)||(28244027-28244271)
chr6 (336-470)||(28182451-28182585)
chr6 (340-526)||(2186172-2186358)
chr6 (205-283)||(26950954-26951032)
chr6 (205-280)||(25075078-25075153)
chr6 (225-284)||(26812759-26812818)
chr6 (366-467)||(28097152-28097253)
chr6 (205-525)||(28140746-28141066)
chr6 (18-74)||(28227973-28228029)
chr6 (340-483)||(25075213-25075356)
chr6 (13-56)||(29477188-29477231)
chr6 (340-414)||(26978726-26978800)
chr6 (316-419)||(28240679-28240778)
chr6 (226-283)||(28296633-28296690)
chr6 (226-283)||(28515383-28515440)
chr6 (560-600)||(27529898-27529938)
chr6 (36-83)||(26950782-26950829)
chr6 (561-600)||(27697180-27697219)
chr6 (18-73)||(28296846-28296901)
chr6 (18-73)||(28515172-28515227)
chr6 (562-600)||(25075432-25075470)
chr6 (562-600)||(26850277-26850315)
chr6 (340-414)||(26960471-26960545)
chr6 (20-74)||(29827009-29827063)
chr6 (18-83)||(28326499-28326564)
chr6 (18-83)||(28504135-28504200)
chr6 (316-469)||(29469534-29469687)
chr6 (305-470)||(29727656-29727821)
chr6 (560-600)||(25484607-25484647)
chr6 (560-600)||(25512439-25512479)
chr6 (560-600)||(25546531-25546571)
chr6 (560-600)||(26057470-26057510)
chr6 (560-600)||(26077440-26077480)
chr6 (560-600)||(26144416-26144456)
chr6 (355-523)||(26812889-26813057)
chr6 (560-600)||(28141089-28141129)
chr6 (18-74)||(28182139-28182195)
chr6 (251-283)||(28182375-28182407)
chr6 (18-74)||(28240375-28240431)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (2-536)||(28126315-28126852)
chr1 (250-537)||(28132140-28132427)
chr1 (16-516)||(267000-267503)
chr1 (2-254)||(28163298-28163553)
chr1 (205-528)||(26137099-26137422)
chr1 (303-425)||(5922220-5922342)
chr1 (560-600)||(266940-266980)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (16-523)||(2192-2702)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (16-526)||(8506-9019)
scaffold0419 (560-600)||(9050-9090)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (16-526)||(12325-12838)
scaffold0277 (1-526)||(3362-3890)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (16-516)||(29272498-29273001)
chr8 (316-526)||(35984621-35984837)
chr8 (397-470)||(12590144-12590217)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (16-516)||(60588-61091)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (16-516)||(18074780-18075283)
chr4 (16-482)||(18654167-18654636)
chr4 (16-458)||(18722799-18723244)
chr4 (16-458)||(18678274-18678719)
chr4 (16-458)||(18730218-18730663)
chr4 (16-430)||(18698142-18698559)
chr4 (149-482)||(18688316-18688652)
chr4 (18-525)||(5089601-5090111)
chr4 (558-600)||(18730091-18730133)
[»] scaffold1870 (2 HSPs)
scaffold1870 (226-526)||(1-301)
scaffold1870 (560-600)||(332-372)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (226-524)||(56946-57244)
scaffold0019 (18-165)||(57308-57455)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (314-427)||(3280979-3281092)
chr2 (391-537)||(17991854-17992000)
chr2 (205-282)||(17992109-17992186)
chr2 (22-86)||(3280684-3280748)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (226-470)||(44189-44433)
scaffold0038 (18-74)||(28471-28527)
scaffold0038 (316-419)||(40841-40940)
scaffold0038 (18-74)||(40537-40593)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (34-92)||(16691904-16691962)
chr5 (409-465)||(13717615-13717671)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (305-470)||(238571-238736)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (409-521)||(615211-615323)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 600
Target Start/End: Original strand, 26885074 - 26885673
Alignment:
Q  1 atggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885074 atggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccata 26885173  T
Q  101 gggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagagacaaagttcctttaggttatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26885174 gggtagatagaacatatgaagtagaagggatatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaaagacaaagttcctttaggttatga 26885273  T
Q  201 agagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26885274 agagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaacatggaag 26885373  T
Q  301 agtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885374 agtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttc 26885473  T
Q  401 tggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgtt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26885474 tggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttggagtgtt 26885573  T
Q  501 ggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgttcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26885574 ggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaataccgttcagcgagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtagaggacatgggtaaagaa 26885673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 530
Target Start/End: Original strand, 26656970 - 26657498
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || ||  |    
T  26656970 tggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgg 26657069  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagagacaaagttcctttaggttatgaa 201  Q
    | |||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26657070 gatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatggcttttagagacaatgttccttcaggttatgaa 26657169  T
Q  202 gagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaaga 301  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26657170 gaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaaga 26657269  T
Q  302 gtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttct 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26657270 gtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagattcaagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagcaaagtgtcttttt 26657369  T
Q  402 ggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttg 501  Q
     |||||||||||||  |||||||| |||| || ||  ||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26657370 agatatagcttgttttttcaaaggatgtagattgagtgaggtcgaagagacacttcttgctcactatggtcattgcataaaacatcatgttggagtgttg 26657469  T
Q  502 gtcgaaaaatctctcttaaagattaatac 530  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||    
T  26657470 gttgaaaaatctctcatagagattaatac 26657498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 530
Target Start/End: Original strand, 26762941 - 26763469
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  || ||  |    
T  26762941 tggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgg 26763040  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagagacaaagttcctttaggttatgaa 201  Q
    | |||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26763041 gatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatggcttttagagacaatgttccttcaggttatgaa 26763140  T
Q  202 gagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaaga 301  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26763141 gaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaaga 26763240  T
Q  302 gtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttct 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26763241 gtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagattcaagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagcaaagtgtcttttt 26763340  T
Q  402 ggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttg 501  Q
     |||||||||||||  |||||||| |||| || ||  ||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26763341 agatatagcttgttttttcaaaggatgtagattgagtgaggtcgaagagacacttcttgctcactatggtcattgcataaaacatcatgttggagtgttg 26763440  T
Q  502 gtcgaaaaatctctcttaaagattaatac 530  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||    
T  26763441 gttgaaaaatctctcatagagattaatac 26763469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 26647484 - 26648001
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |    
T  26647484 tggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgg 26647583  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||   ||||||| ||   | |||||    
T  26647584 gatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttat 26647683  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||    
T  26647684 gaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatgga 26647783  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  26647784 agggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctt 26647883  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||   ||| | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  26647884 tctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtagatgggaggagtttgaagatatacttcgttatcattatggccattgcataacacatcatcttggagtg 26647983  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  26647984 ttggctgaaaaatctctc 26648001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 26753452 - 26753969
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |    
T  26753452 tggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgg 26753551  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||   ||||||| ||   | |||||    
T  26753552 gatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttat 26753651  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||    
T  26753652 gaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatgga 26753751  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  26753752 agggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctt 26753851  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||   ||| | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  26753852 tctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtagatgggaggagtttgaagatatacttcgttatcattatggccattgcataacacatcatcttggagtg 26753951  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  26753952 ttggctgaaaaatctctc 26753969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Original strand, 31285578 - 31286081
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||   | ||| || || | || |||     
T  31285578 gctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacac 31285677  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |   ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  31285678 atgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttacgaagacattttaaa 31285777  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31285778 ccgtgcagttgcatattcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaaaatggaagagtacattagat 31285877  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    || ||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  31285878 gggtatgacaagattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctggacattgctt 31285977  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| ||   |||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||    
T  31285978 gttgcttcaaaggatgcggatgggcggatgtcaaagatatactccatgctcattatggccattgcataacacatcatctagaagtgttggctgaaaaatc 31286077  T
Q  513 tctc 516  Q
    ||||    
T  31286078 tctc 31286081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Original strand, 26803450 - 26803983
Alignment:
Q  1 atggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccata 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  | |||     
T  26803450 atggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatg 26803549  T
Q  101 gggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggtta 197  Q
       |||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |    ||||||| |||| | ||||    
T  26803550 atatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccttcaagtta 26803649  T
Q  198 tgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgg 297  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  26803650 tgaagacattttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggtcttcccttagttttagagatagtgggttccaacttgtttggaaagagcataaaagaatgg 26803749  T
Q  298 aagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtct 397  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  26803750 aagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtct 26803849  T
Q  398 ttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagt 497  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||  ||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||    
T  26803850 ttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggatgggaggagtttgaagatatacttcatgttcattatggccattgcataacacatcatctaggagt 26803949  T
Q  498 gttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatact 531  Q
    |||||  |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  26803950 gttggctgaaaaatctctcattaagattagtact 26803983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 27717662 - 27717152
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| || || | || |       
T  27717662 gctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgc 27717563  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27717562 atgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaa 27717463  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||   |||||||| |||| |||||    
T  27717462 ccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaatacattagat 27717363  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    || ||||| | |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||    
T  27717362 gggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgctt 27717263  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||| | | || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  27717262 gttgcttcaaaagatgtaaatgggaagatgccaaatatatacttaattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgaaaaatc 27717163  T
Q  513 tctcttaaaga 523  Q
    |||| ||||||    
T  27717162 tctcataaaga 27717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 26862585 - 26863102
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  26862585 tggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtttggtcatggaagtagagtcatcattaccactcgagataaacacttactaacatgccatgg 26862684  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagagaca---aagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| ||||||||||  ||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |     |||||||||   |||||    
T  26862685 gatagaaagaacatatgcggtaaacgggctacatgagacagaagcttttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttat 26862784  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
     | ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||     
T  26862785 aacgatgttttaaaccgtgcagttgcatatgcttccggccttccgttagttctcgaaatagtgggttctaacttgtttggaaagagcatggaagaatggc 26862884  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  26862885 aatgcacattagatgggtatgaaaagattcccaataaagagatccaaaggatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagagcagcaaagtgtctt 26862984  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||  |||| |||  |||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  26862985 tctagatattgcttgttgtttcaaagggggtagctggatagaattcgaagatatacttaaatatcattatggccgatgcataaaacatcatgttggagtg 26863084  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  26863085 ttggctgaaaaatctctc 26863102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 526
Target Start/End: Original strand, 28787257 - 28787770
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||   | ||| || |||| || |||     
T  28787257 gctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacac 28787356  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| ||   ||||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  28787357 atgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 28787456  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||  |||||    
T  28787457 tcgtgcagtttcttatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagat 28787556  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || || || |    
T  28787557 ggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcat 28787656  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| ||| | |||   ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  28787657 gttgcttcaaaggatgtgagtgggaggagtttgaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatc 28787756  T
Q  513 tctcttaaagatta 526  Q
    |||| | |||||||    
T  28787757 tctcgttaagatta 28787770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 526
Target Start/End: Original strand, 28793378 - 28793891
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||   | ||| || |||| || |||     
T  28793378 gctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacac 28793477  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| ||   ||||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  28793478 atgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 28793577  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||  |||||    
T  28793578 tcgtgcagtttcgtatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagat 28793677  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || || || |    
T  28793678 ggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcat 28793777  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| ||| | |||   ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  28793778 gttgcttcaaaggatgtgagtgggaggagtttgaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatc 28793877  T
Q  513 tctcttaaagatta 526  Q
    |||| | |||||||    
T  28793878 tctcgttaagatta 28793891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27426775 - 27426272
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || |||  | |||| | |||||    
T  27426775 gctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacat 27426676  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    ||| |||| ||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  27426675 atgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaa 27426576  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     |||| |||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  27426575 tcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagat 27426476  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
     | |||||||||||||| |||| | ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  27426475 tggtatgaaaagattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgctt 27426376  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||     
T  27426375 gttgcttcaaaggttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatg 27426276  T
Q  513 tctc 516  Q
    ||||    
T  27426275 tctc 27426272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Original strand, 26624290 - 26624793
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||     ||| || || | || |||     
T  26624290 gctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacac 26624389  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| ||| | |  |||||||||||||||| |||| |||| |   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26624390 atgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaa 26624489  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||    
T  26624490 ccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtatacattagat 26624589  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    || ||||| | |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  26624590 gggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctagatattgctt 26624689  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||  ||||| |||  |||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||     
T  26624690 gttgctcgaaaggatgtggatggagggagttcgaagatatgcttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgacaaatg 26624789  T
Q  513 tctc 516  Q
    ||||    
T  26624790 tctc 26624793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Original strand, 26730267 - 26730770
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||     ||| || || | || |||     
T  26730267 gctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacac 26730366  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| ||| | |  |||||||||||||||| |||| |||| |   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26730367 atgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaa 26730466  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||    
T  26730467 ccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtatacattagat 26730566  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    || ||||| | |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  26730567 gggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctagatattgctt 26730666  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||  ||||| |||  |||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || ||||     
T  26730667 gttgctcgaaaggatgtggatggagggagttcgaagatatgcttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgacaaatg 26730766  T
Q  513 tctc 516  Q
    ||||    
T  26730767 tctc 26730770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27603882 - 27603365
Alignment:
Q  1 atggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccata 100  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||  | |||     
T  27603882 atggggcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattaccactcgagacagacacttactaaccagtcatg 27603783  T
Q  101 gggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggtta 197  Q
       |||| ||||  |||| | |||||||| | | | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||   ||||||| |||| || |||    
T  27603782 atatagaaagaaagtatgcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcagttta 27603683  T
Q  198 tgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgg 297  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  27603682 tgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttttggaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatgg 27603583  T
Q  298 aagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtct 397  Q
    ||| ||||  |||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  27603582 aagggtacgttagaaggatatgagaagattcccaataaaaagatccacgagattcttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtct 27603483  T
Q  398 ttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagt 497  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||  || |  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||    
T  27603482 ttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggattggaagtggttgaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagt 27603383  T
Q  498 gttggtcgaaaaatctct 515  Q
    |||||  |||||||||||    
T  27603382 gttggctgaaaaatctct 27603365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 26824824 - 26825341
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    |||      
T  26824824 tggagcaactagatgctttggctggaggatttgattggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaactcgagacaaacaattacttaccaatcatga 26824923  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagaga---caaagttcctttaggttat 198  Q
    | ||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | |   |||||| || | | |||||    
T  26824924 gatagaattaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccgtcaagttat 26825023  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26825024 gaacacattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtattagaaatagtgggttccaatttgtttggaaagagcatacaaatatgga 26825123  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || || || ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||    
T  26825124 agggtgcattagatggatatgaaaggattcctgacaaaaagatccaagagatacttagagtaagctatgatgctttggaagaagagcaacaaagtgtttt 26825223  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
     || || || ||||||||||||||||    ||  |||   ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26825224 cctcgacattgcttgttgcttcaaagaacatagttgggaggagttcgaagatatacttcgtactcattacggccattgcataaaacatcatgttcaagtg 26825323  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  26825324 ttggcagaaaaatctctc 26825341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27610283 - 27609780
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||| || || | || |       
T  27610283 gctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgctaacctgtcatgggataaaaagtatgc 27610184  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    || |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27610183 ataaagtggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaa 27610084  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||  |||| |||||    
T  27610083 ccgtgctgttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaggaatggaagtatacattagat 27609984  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    || ||||| | |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27609983 gggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgattctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgctt 27609884  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag-atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaat 511  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  ||| | | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||    
T  27609883 gttgcttcaaaggatataattgggaagatg-caaagtatacacttcattctcattatggccattccataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaat 27609785  T
Q  512 ctctc 516  Q
    |||||    
T  27609784 ctctc 27609780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 531
Target Start/End: Original strand, 27679969 - 27680487
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||   | ||| |  |||| || |||     
T  27679969 gctttggctggaggacttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagacttactaagcagtcatggcatagaaagtacac 27680068  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    ||| |||||||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  27680069 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaa 27680168  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |||||    
T  27680169 ccgtgcagttgcatatgcttttggccttccgttagttttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagattggaagcatacattagat 27680268  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    || ||||| | |||||| |||| | |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  27680269 gggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaggtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacatcgctt 27680368  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    | ||||||||||| | | ||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||  | ||||||    
T  27680369 gctgcttcaaaggatatcaatggaaggagttcgaagatatactttgtgctcattatgaccattgcataacacatcatctaggagtgttggctggaaaatc 27680468  T
Q  513 tctcttaaagattaatact 531  Q
    |||| | ||||||| ||||    
T  27680469 tctcgttaagattagtact 27680487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 27705401 - 27704941
Alignment:
Q  32 ttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatatgaagtagaagggct 131  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||| | |  |||||| |||| | |||||||  |||||||||| |    
T  27705401 ttgattggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggtt 27705302  T
Q  132 atatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaaccgtgcagtttcatat 228  Q
      |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27705301 gaatgggatagatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatat 27705202  T
Q  229 gcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattc 328  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||    
T  27705201 gcttctggccttccgttagttttagaagtaatgggttctaacttgtttggcaagaacatagaagaatggaagaatacattagatgggtatgacaggattc 27705102  T
Q  329 ctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtg 428  Q
    | |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||     
T  27705101 ccaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacattgcttgttgcttaaaagggta 27705002  T
Q  429 taaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcat 489  Q
    || || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  27705001 tagattgacagaggttgaaaatatacttcattctcattatgaccattgtataacacatcat 27704941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 27697763 - 27697241
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||      ||| |    
T  27697763 tggatcagctacaggctttggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagaccatcatgg 27697664  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| | ||| |||| |||| ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| ||||| | | | ||     
T  27697663 gatagaaaaaacgtatgcagtaaaagggttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccatcaaggtac 27697564  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  27697563 aaagagattttaagtcgtgcagtttcatatgtttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgga 27697464  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    ||  || | ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27697463 agtatatattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcaaagtgtctt 27697364  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   |  ||||  ||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||    
T  27697363 tctggacattgcttgttgcttcaaaggacatggatgggaagatgccaaatatatgcttcatgctcattatggccattccataacacatcatctagcagtg 27697264  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctcttaaa 521  Q
    ||||  |||||||||||| ||||    
T  27697263 ttggctgaaaaatctctcataaa 27697241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27530478 - 27529964
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |   ||| |    
T  27530478 tggatcagctagaggccttggctggaggacttgattggttcggtcctgggagtagagtcatcattactactcgaaacaaacacttactaaagattcatgg 27530379  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagagacaaagttcctttaggttatgaa 201  Q
    | |||| || ||| ||| |||||||||| |  ||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||| || | ||| || ||||||| | || |||||    
T  27530378 gatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgcgacagaagctctcgaattgttgaggtggatggctttcaaagaaaatgttccttcaagtcatgaa 27530279  T
Q  202 gagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaaga 301  Q
    || ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||| ||| | |||| | || ||||| ||| |||||| |||| || ||   |  | ||    
T  27530278 gacattttaaaccgtgcacttacttatgcttctggccttccattagctattgtaataatagggtccaatttggttggaaggagcgtacaagattcaatga 27530179  T
Q  302 gtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttct 401  Q
    ||||| ||||||| |||||| | ||||| |||| | ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  27530178 gtacattagatgggtatgaagaaattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggagaaagaagagcaaagtgtctttct 27530079  T
Q  402 ggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttg 501  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| |||    
T  27530078 agacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggccagaggtcaaagaaatacttcatgctcattatggtcattgcatagtacatcatgttgcagttttg 27529979  T
Q  502 gtcgaaaaatctctc 516  Q
    |  ||||||||||||    
T  27529978 gctgaaaaatctctc 27529964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 25511897 - 25512413
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |    
T  25511897 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgactggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg 25511996  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
      || | || ||| ||| |||||||||| |  ||| || ||||||| ||   ||||||||| |  |||| |||| |   ||||||||||||| | |||||    
T  25511997 attaca-agtacacatgcagtagaagggttgaatgagatagaagctcttattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttat 25512095  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||| |||| ||||| || | | ||  |||| |||||||||| ||   |||||   ||||    
T  25512096 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgtttggaaggaaggtagaagattgga 25512195  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || ||||| ||||||  |||||||| |||||  ||| | | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||    
T  25512196 agcgtacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctt 25512295  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    ||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25512296 tctagacattgcttgttacttcaaagggtataaatggacaaaagtaaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtg 25512395  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  25512396 ttggctgaaaaatctctc 25512413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 26143873 - 26144390
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |    
T  26143873 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg 26143972  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |    || ||| ||| ||||||||   |  ||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||| |||| |   ||||||||||||| | |||||    
T  26143973 gattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 26144072  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| || ||||| || ||||  |||| || | | ||   ||| |||||||||| ||   |||||   |||     
T  26144073 gaagaaattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggg 26144172  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || ||||| |||| |  |||||||| |||||  ||| | | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||    
T  26144173 agcgtacattagacgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctt 26144272  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26144273 tctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtgaatggacaaaggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtg 26144372  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  26144373 ttggctgaaaaatctctc 26144390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27337272 - 27336916
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |    
T  27337272 tggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgg 27337173  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttt-aga--gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||   ||||||| ||   | |||||    
T  27337172 gatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttat 27337073  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27337072 gaagatgttttaaaccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagtatgga 27336973  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatactta 355  Q
    |||  ||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||| ||| |||||||||    
T  27336972 agaacacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatacaaaagatactta 27336916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27398012 - 27397656
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |    
T  27398012 tggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgg 27397913  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttt-aga--gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||   ||||||| ||   | |||||    
T  27397912 gatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttat 27397813  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27397812 gaagatgttttaaaccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagtatgga 27397713  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatactta 355  Q
    |||  ||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||| ||| |||||||||    
T  27397712 agaacacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatacaaaagatactta 27397656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 25484064 - 25484581
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |    
T  25484064 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg 25484163  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |    || ||| ||| ||||||||   |  ||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||| |||| |   ||||||||||||| | |||||    
T  25484164 gattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 25484263  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||| || ||||  |||| || | | ||   ||| |||||||||| ||   |||||   ||||    
T  25484264 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattgga 25484363  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || ||||| ||||||  |||||||| |||||  ||| | | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||    
T  25484364 agcgtacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctt 25484463  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    ||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25484464 tctagacattgcttgttacttcaaagggtataaatggacaaaagtaaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtg 25484563  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    ||||  ||||||| ||||    
T  25484564 ttggctgaaaaatgtctc 25484581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 27215459 - 27215974
Alignment:
Q  4 gagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccataggg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||  | | ||| |||||||| |  ||| ||     
T  27215459 gagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcattacgactcgaaacagacagttactaacctatcatggga 27215558  T
Q  104 tagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagagaca---aagttcctttaggttatga 200  Q
    |||| |||    || | |||   || |||||||   ||||||||  | |||||||||||| | |||| |||| | |     ||||||||| | |||||||    
T  27215559 tagaaagattgcatcacgtaagcggtctatatgacgaagaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatga 27215658  T
Q  201 agagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaag 300  Q
    ||  ||||| || |||||| || | |||| ||| |||||||| |||| ||||| || | | || ||||| |||||||||| |||  |||||   ||| |     
T  27215659 aggcatttttaatcgtgcacttacttatgtttctggccttccattagctatagtaacaatagggtccaatttgtttggaaggagtgtagaagattgggaa 27215758  T
Q  301 agtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttc 400  Q
     ||| | ||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||    
T  27215759 cgtatattagatgagtatgaaaagattcccaataaagagatccaaaggatacttaaagtcagctatgatgctctggaggaaaaggagaagagtgtctttc 27215858  T
Q  401 tggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgtt 500  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215859 tagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaaaggtcaaagatatacttcatgcccattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgtt 27215958  T
Q  501 ggtcgaaaaatctctc 516  Q
    || |||||||||||||    
T  27215959 ggccgaaaaatctctc 27215974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 25580727 - 25581244
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |    
T  25580727 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg 25580826  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |    || ||| ||| ||||||||   |  ||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||| |||| |   ||||||||||||| |  ||||    
T  25580827 gattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaatttat 25580926  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || || || || ||||  |||| || | | ||    || |||||||||| ||   |||||   ||||    
T  25580927 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctgggctgcccttagcaatagtaacaataggggataatttgtttggaaggaaggtagaagattgga 25581026  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || ||| | ||||||  |||||||| ||||| |||| | | ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| ||   | ||||| | ||||||||    
T  25581027 agcgtatattagatgagtatgaaaatattcccaataaagatatccaaaggatacttcaagttagctatgatgctttggaaccaaaggagaagagtgtctt 25581126  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25581127 tctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaaaggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtg 25581226  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  25581227 ttggctgaaaaatctctc 25581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27592198 - 27591727
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||   || ||| |    
T  27592198 tggatcagctagatgctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgg 27592099  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| | |||||||| |||||||| | |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |   || |||||||||| | |||||    
T  27592098 gatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttat 27591999  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||      
T  27591998 gaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtg 27591899  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    ||  |||| |||||   |||| ||  |||||  ||| | | |||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27591898 agtctacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctt 27591799  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgta-aatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| | | ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27591798 tttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggaga-aagtcaaacagatacttcatgctcattatgg 27591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 27676797 - 27676313
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||   || ||| |    
T  27676797 tggatcagctagaggctttggctggaagactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgg 27676698  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| | |||||||| |||||||| | |  ||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |   || |||||||||| | |||||    
T  27676697 gatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttat 27676598  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||      
T  27676597 gaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtg 27676498  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    ||  |||| |||||   |||| ||  |||||  ||| | | |||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27676497 agtctacattagataagtatggaagaattccacataaagatatccaaaagatacttagactgagctatgatgctttggacgaagaggagcagagtgtctt 27676398  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaa 483  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |  ||| |||||| | |||||||||  |||||||||  || ||||||||    
T  27676397 tttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggaagaagtcgaacagatacttcatcatcattatggttatagcataaaa 27676313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25492496 - 25492013
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||| |||||||  | ||| |    
T  25492496 tggagcagctagaggatttggctgaaggacttgattggttcggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgg 25492397  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| || |   ||| |||||||| | |  ||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||| |||| |   |||| |||||||| |  ||||    
T  25492396 gatagaaagtatgcatgcagtagaagagttgcatggggaagaagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttcaatttat 25492297  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    ||||| |||||||  | |||| || | |||||||| |||||||| |||| | ||| |||| | || || || ||||||||||| |||||||||  |||||    
T  25492296 gaagacattttaacacttgcaattacctatgcttctggccttccattagctttagtaataatagggtcaaatttgtttggaaatagcatagaagaatgga 25492197  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || ||||| ||||||  ||||||||||||   |||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||    
T  25492196 agtgtacattagatgagtatgaaaagattttcaataaagagatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaggaaaaggagcagagtatctt 25492097  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaa 482  Q
    ||| || ||  |||||| ||||||||| || |||||| | || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25492096 tctagacatgacttgtttcttcaaaggttggaaatgggcggatgtcaaaaatatacttcatgatcattatggccattgcgtaaa 25492013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 26056927 - 26057444
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||      
T  26056927 tggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgt 26057026  T
Q  102 gg-tagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggtta 197  Q
    |  || | || ||| ||| |||||||||| |  ||| || ||||||| ||||||| |||||  |    || |||| |   ||||||||||||| | ||||    
T  26057027 gaataca-agtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagtta 26057125  T
Q  198 tgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgg 297  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||| |||| ||||| || | | ||  |||| ||| |||||| ||   |||||   |||    
T  26057126 tgaagatattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgattggaaggaaggtagaagattgg 26057225  T
Q  298 aagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtct 397  Q
     || ||| | |||| |  |||||||| |||||  ||| | | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||    
T  26057226 gagcgtatattagacgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtct 26057325  T
Q  398 ttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagt 497  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||    
T  26057326 ttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaaaggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccatcccatagaacatcatgttggagt 26057425  T
Q  498 gttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  26057426 gttggctgaaaaatctctc 26057444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 516
Target Start/End: Original strand, 26076897 - 26077414
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||      
T  26076897 tggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgt 26076996  T
Q  102 gg-tagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggtta 197  Q
    |  || | || ||| ||| |||||||||| |  ||| || ||||||| ||||||| |||||  |    || |||| |   ||||||||||||| | ||||    
T  26076997 gaataca-agtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagtta 26077095  T
Q  198 tgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgg 297  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||| |||| ||||| || | | ||  |||| ||| |||||| ||   |||||   |||    
T  26077096 tgaagatattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgattggaaggaaggtagaagattgg 26077195  T
Q  298 aagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtct 397  Q
     || ||| | |||| |  |||||||| |||||  ||| | | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||    
T  26077196 gagcgtatattagacgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtct 26077295  T
Q  398 ttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagt 497  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||    
T  26077296 ttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaaaggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccatcccatagaacatcatgttggagt 26077395  T
Q  498 gttggtcgaaaaatctctc 516  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  26077396 gttggctgaaaaatctctc 26077414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 25539550 - 25539923
Alignment:
Q  4 gagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccataggg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || | || ||| ||     
T  25539550 gagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgatacacatttattagcctgtcatggga 25539649  T
Q  104 tagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatga 200  Q
    |    || ||| ||| |||| ||||| |  ||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||| |||| |   |||||||||||||   |||||||    
T  25539650 ttacaagtacacatgtagtaaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttatga 25539749  T
Q  201 agagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaag 300  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||| || ||||  |||| || | | ||   ||| |||||||||| ||   |||||   ||||||    
T  25539750 agagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctacccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaag 25539849  T
Q  301 agtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgcttt 374  Q
     ||||| ||||||  |||||||| |||||  ||| | | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25539850 cgtacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagatatccaaaggatacttcaagtaagctatgatgcttt 25539923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 347 - 526
Target Start/End: Original strand, 26938382 - 26938561
Alignment:
Q  347 agatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcga 446  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| || | | ||||| ||    
T  26938382 agatacttagagtaagctttgattgtttggatgaagaagaacaaagtgtctttctggatattacgtgttgcttcaatgggtgtagattggctgaggttga 26938481  T
Q  447 agatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  26938482 agataaacttcatgctcattatggtcattgcataaaaaatcatgttggagtgttggttaataaatctctcataaagatta 26938561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29842972 - 29842642
Alignment:
Q  196 tatgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaactt-gtttggaaagagcatagaaata 294  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |  | |||||||| |||||||| || ||| ||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||  ||||||  |    
T  29842972 tatgatgacattttagaccgtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggt-ccagctttgtttggaaagaatatagaagaa 29842874  T
Q  295 tggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtg 394  Q
    |||||   |||| ||||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  29842873 tggaaatctacattagataggtatgaaaggattcctaataaagagatccacaatatacttaaaataagctttgatgctttggaggaagacgaacaaggtg 29842774  T
Q  395 tctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttga 494  Q
    | ||||| || || ||||||||||||||||||| | | | |  |||||| |||||||| |||  |||| || |||| || |||||| || ||||| |||     
T  29842773 tttttctcgacattgcttgttgcttcaaagggtatgatttgggagaggttgaagatattctttgtgcttatcatggtcaatgcatagaatatcatattgg 29842674  T
Q  495 agtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 526  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29842673 agtgttggtcgaaaaaactctcataaagatta 29842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 526
Target Start/End: Original strand, 29827188 - 29827518
Alignment:
Q  196 tatgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatat 295  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |  | |||||||| |||||||| || ||| ||||| |||| ||| ||   |||||||||||||  ||||||  ||    
T  29827188 tatgatgacattttagaccgtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggtcccgcgttgtttggaaagaatatagaagaat 29827287  T
Q  296 ggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgt 395  Q
    ||||   || | ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| || ||| ||||    
T  29827288 ggaaatctatattagatagatatgaaaggattcctaataaagagatccaaaatatacttaaaataagttttgatgctttggaggaagatgaacaaggtgt 29827387  T
Q  396 ctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaa 495  Q
     ||||| || || ||||||||||||||||||| | | | |  ||||||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||  ||||| || ||||| ||| |    
T  29827388 ttttctcgacattgcttgttgcttcaaagggtatgatttgggagaggtcaaagatattctttgtgctcatcatggtcaaagcatagaatatcatattgga 29827487  T
Q  496 gtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 526  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29827488 gtgttggtcgaaaaaactctcatacagatta 29827518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 470
Target Start/End: Original strand, 28326689 - 28326954
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagta 304  Q
    |||||| || |||||||  | |||||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||   |     
T  28326689 attttatactgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatctg 28326788  T
Q  305 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 404  Q
    || || ||   ||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| ||    
T  28326789 cattatatcagtatgaaaggattcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcga 28326888  T
Q  405 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
     || ||||| |||||||| || | | ||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28326889 cattgcttgctgcttcaatggatatgaattgaaagaacttgaagatatacttcatgctcattatgg 28326954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 470
Target Start/End: Original strand, 28504325 - 28504590
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagta 304  Q
    |||||| || |||||||  | |||||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||   |     
T  28504325 attttatactgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatctg 28504424  T
Q  305 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 404  Q
    || || ||   ||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| ||    
T  28504425 cattatatcagtatgaaaggattcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcga 28504524  T
Q  405 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
     || ||||| |||||||| || | | ||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28504525 cattgcttgctgcttcaatggatatgaattgaaagaacttgaagatatacttcatgctcattatgg 28504590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 470
Target Start/End: Original strand, 28186626 - 28186870
Alignment:
Q  226 tatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 325  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||   | || || ||   ||||||| ||    
T  28186626 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaagga 28186725  T
Q  326 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 425  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||  || |||| ||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28186726 ttcccgataaaaagatccaagagatactcaaagtaagctttgatgctttgggggaagcagaacaaaatgtttttctcgacatcgcttgctgcttcaaagg 28186825  T
Q  426 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
     | | ||| || |||  | |||||| |||||||||||||||||||    
T  28186826 atatgaattgaaagaacttgaagatgtacttcatgctcattatgg 28186870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 336 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28296580 - 28296446
Alignment:
Q  336 aaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatgg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | | ||| |    
T  28296580 aaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaaaaatgtttttcttgacatcgcttgctgcttcaaaggatatgaattg 28296481  T
Q  436 acagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
    | |||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28296480 aaagaacttgaaaatatacttcatgctcattatgg 28296446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 336 - 470
Target Start/End: Original strand, 28515493 - 28515627
Alignment:
Q  336 aaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatgg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | | ||| |    
T  28515493 aaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaaaaatgtttttcttgacatcgcttgctgcttcaaaggatatgaattg 28515592  T
Q  436 acagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
    | |||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28515593 aaagaacttgaaaatatacttcatgctcattatgg 28515627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 28782105 - 28782195
Alignment:
Q  1 atggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaa 91  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28782105 atggagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaa 28782195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27664185 - 27663865
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagta 304  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | || || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||  ||   |    
T  27664185 attttaaaccgtgcagttgaatatgcttctggccttccattagctttaaaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagattgtgagtcaa 27664086  T
Q  305 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 404  Q
    |  |||||   |||||||  |||||   |  | | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||  | || ||||||||| ||||    
T  27664085 ccttagataagtatgaaagaattccacctgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatactttggaagaagaacaacagagtgtctttttgga 27663986  T
Q  405 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtc 504  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||   ||| | ||||||   ||||||||||||||  || | ||||||||||  |||||||||     
T  27663985 tattgcttgttgcttcaaaggatgtgattgg-cagaagtttcagagacacttcaatttcattatggccattcaatgacacatcatgttagagtgttggtt 27663887  T
Q  505 gaaaaatctctcttaaagatta 526  Q
    ||  |||||||| |||||||||    
T  27663886 gatgaatctctcataaagatta 27663865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 26636857 - 26636941
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatag 289  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26636857 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatag 26636941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 26742823 - 26742907
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatag 289  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26742823 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatag 26742907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 291
Target Start/End: Original strand, 26849923 - 26850009
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaa 291  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26849923 attttaaatcgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagaa 26850009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 26960336 - 26960420
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatag 289  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26960336 attttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatag 26960420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 470
Target Start/End: Original strand, 28244027 - 28244271
Alignment:
Q  226 tatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 325  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |  |||| |  ||||||   | || ||||| | |||  || ||    
T  28244027 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaagga 28244126  T
Q  326 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 425  Q
    |||| | || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28244127 ttccgattaaaaagatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaagg 28244226  T
Q  426 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
     | ||| | || |||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  28244227 atataatttgaaagaacttgaagatatactttatgctcattatgg 28244271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 470
Target Start/End: Original strand, 28182451 - 28182585
Alignment:
Q  336 aaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatgg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| | ||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||| | | | | |    
T  28182451 aaagatccaagagatacttaaagttagctatgatgctctggaggatgatgagcagaatgtttttctggacatttcttgtttcttaaaaggatatgatttg 28182550  T
Q  436 acagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
    | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28182551 aaagaagttgaagatatatttcatgctcattatgg 28182585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 526
Target Start/End: Original strand, 2186172 - 2186358
Alignment:
Q  340 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgta-aatggaca 438  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||| || ||  | ||| ||||||| || || |||||||  |||||||| |||| | |||| |    
T  2186172 atccaacagatacttaaagtcagctttgatgctttgcaggaggaagataagagtctctttctcgacattgcttgttttttcaaaggatgtagactgga-a 2186270  T
Q  439 gaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 526  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  2186271 gagttccaagatatacttgatgctcattatacttattgcatcaaaaatcatattggagtgttggttgaaaaatcactcataaagatta 2186358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 283
Target Start/End: Original strand, 26950954 - 26951032
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaaga 283  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26950954 attttaaaccgtgcagttaaatatgctgctggccttccattagctttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaaga 26951032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Original strand, 25075078 - 25075153
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaa 280  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25075078 attttaaaccgtgcaattaaatatgcttctggccttccattagctttagaagttgtgggttccaacttgtttggaa 25075153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 284
Target Start/End: Original strand, 26812759 - 26812818
Alignment:
Q  225 atatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagag 284  Q
    |||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812759 atatacttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagag 26812818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 28097253 - 28097152
Alignment:
Q  366 tgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcat 465  Q
    ||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||  |||||||    
T  28097253 tgatgctttggaggaagatgagaggagtgtttttctcgacattgcttgttgcttcaaagggtataaattgaaagaggtggaagatatgctttgtgctcat 28097154  T
Q  466 ta 467  Q
    ||    
T  28097153 ta 28097152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 525
Target Start/End: Original strand, 28140746 - 28141066
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagta 304  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| || | | ||||| |||| ||||| | |||||||||||||   | |||    |||||   ||    
T  28140746 attttaaaccgtgcagttacttatgcctctggccttccattggctttagaagtagttggttctagcttgtttggaaagcataaagatgagtggaaatcta 28140845  T
Q  305 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 404  Q
    || ||||| | ||||||| ||||||| ||| | || |||   ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||    
T  28140846 cattagatcggtatgaaaggattcctcataaagaggtcctgaagatacttaaagtgagctttgatagtttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcga 28140945  T
Q  405 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtc 504  Q
     || |||||||| |||| ||| | || ||   ||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||  | ||||| ||| ||||| ||  ||||||| ||    
T  28140946 cattgcttgttgtttcagaggatatatattagcagaggttgaagatattctctatgctcattacggtgaatgcatgaaatatcatattagagtgttgatc 28141045  T
Q  505 gaaaaatctctcttaaagatt 525  Q
    || |||| |||  ||||||||    
T  28141046 gagaaatgtctaataaagatt 28141066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 28227973 - 28228029
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||    
T  28227973 tttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcg 28228029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 483
Target Start/End: Original strand, 25075213 - 25075356
Alignment:
Q  340 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 439  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||  ||||| ||| | ||     
T  25075213 atccaaaaaatacttaaagtaagctttgacgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtttctttaattggtgtgaatcggcat 25075312  T
Q  440 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaa 483  Q
    | |||||||| |||||| |   ||||||||| ||||||||||||    
T  25075313 atgtcgaagagatacttgaatatcattatggtcattgcataaaa 25075356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 29477231 - 29477188
Alignment:
Q  13 gaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcag 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29477231 gaggctttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagcag 29477188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 414
Target Start/End: Original strand, 26978726 - 26978800
Alignment:
Q  340 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgt 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26978726 atccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgt 26978800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 419
Target Start/End: Original strand, 28240679 - 28240778
Alignment:
Q  316 tatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgtt 415  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||    | ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  28240679 tatgaaaggattccaaataaagagatccaaaagatacttaaagt----tttgatgctttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgtt 28240774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28296690 - 28296633
Alignment:
Q  226 tatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaaga 283  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28296690 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28296633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 283
Target Start/End: Original strand, 28515383 - 28515440
Alignment:
Q  226 tatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaaga 283  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28515383 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28515440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27529938 - 27529898
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27529938 atgtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 27529898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 83
Target Start/End: Original strand, 26950782 - 26950829
Alignment:
Q  36 ttggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaaca 83  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26950782 ttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgtgacaaaca 26950829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 561 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27697219 - 27697180
Alignment:
Q  561 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27697219 tgtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 27697180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 28296901 - 28296846
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactc 73  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||    
T  28296901 tttggctggacgacttgattggtttggtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28296846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Original strand, 28515172 - 28515227
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactc 73  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||    
T  28515172 tttggctggacgacttgattggtttggtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28515227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 600
Target Start/End: Original strand, 25075432 - 25075470
Alignment:
Q  562 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25075432 gtgacattacatgacttgttagaggacatgggtaaagaa 25075470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 600
Target Start/End: Original strand, 26850277 - 26850315
Alignment:
Q  562 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26850277 gtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 26850315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 414
Target Start/End: Original strand, 26960471 - 26960545
Alignment:
Q  340 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgt 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26960471 atccaaaagatacttaaagtaagctatgacgctttggctgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgt 26960545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 74
Target Start/End: Original strand, 29827009 - 29827063
Alignment:
Q  20 tggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcg 74  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||    
T  29827009 tggcgggaggacttgattggtttggtcctggcagcatagtgatcattaccactcg 29827063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 28326499 - 28326564
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaaca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || || ||| |||||||||| || |||||    
T  28326499 tttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatcgttaccactcgagacaaaca 28326564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 28504135 - 28504200
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaaca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || || ||| |||||||||| || |||||    
T  28504135 tttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatcgttaccactcgagacaaaca 28504200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 469
Target Start/End: Original strand, 29469534 - 29469687
Alignment:
Q  316 tatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgtt 415  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  || | |||| |||||||||  ||||||| ||| |   ||| ||||| || || || || |    
T  29469534 tatgaaaggattcctgataaaaagatccaaacgatactacaacttagctttgatgctttgcaggaagaagagaagtctgtttttcttgacattgcctgct 29469633  T
Q  416 gcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatg 469  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  29469634 gcttcaaaggatataaatggacaagggtagaacaaatacttaatgctcattatg 29469687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29727821 - 29727656
Alignment:
Q  305 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 404  Q
    |||||||| | || ||||| |||||| ||| ||||||||||  || |||  |||| |||| ||||||| | ||||| || ||| |   ||| ||||| ||    
T  29727821 cactagatcgttacgaaaaaattcctcataaaaagatccaaatgacactacaagtgagctttgatgctctggaggacgaagagaagtttgtttttcttga 29727722  T
Q  405 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||  |||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  29727721 cattgcttgttgcttcaaaggatggaaattaacaagggtcgaagaaatacttcatgttcatcatgg 29727656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 25484607 - 25484647
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25484607 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 25484647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 25512439 - 25512479
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25512439 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 25512479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 25546531 - 25546571
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25546531 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 25546571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 26057470 - 26057510
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26057470 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 26057510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 26077440 - 26077480
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26077440 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 26077480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 26144416 - 26144456
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26144416 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 26144456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 355 - 523
Target Start/End: Original strand, 26812889 - 26813057
Alignment:
Q  355 aaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatac 454  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||| ||  | ||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  || | || | |||||| | ||||    
T  26812889 aaagtaagctttgatgctttggacaaagaagaaaagagtgtttttttggatattgtatgttgctttaaagggtgtccattggcatatgtcgaaaaaatac 26812988  T
Q  455 ttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaaga 523  Q
    | |||  |||||||||  |||||||||||   ||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26812989 tccattttcattatggatattgcataaaaagccacattggagtgttggttgaaaaatctctcataaaga 26813057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 28141089 - 28141129
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28141089 atgtgacattacatgacttgatagaggagatgggtaaagaa 28141129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 28182139 - 28182195
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcg 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||||||||    
T  28182139 tttggctggaggaattgattggtttggtcctggtagtaaagtgatcattaccactcg 28182195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 28182375 - 28182407
Alignment:
Q  251 tagaaatagtgggttccaacttgtttggaaaga 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28182375 tagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28182407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 28240375 - 28240431
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcg 74  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  28240375 tttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccactcg 28240431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 2 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 28126852 - 28126315
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |    
T  28126852 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgg 28126753  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| || ||  |||  ||| ||||| | ||||  | | ||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||| | |||||    
T  28126752 gatagaaagtacgcatgcggtaaaagggttgtatgtaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttat 28126653  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgga 298  Q
    || ||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  28126652 gatgatgttttaaaccgggcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttatagaaatagtgggttccaacttatttggaaagagcatagaagaatgga 28126553  T
Q  299 agagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctt 398  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28126552 agggtacattagatggatatgaaaagattccaaataaaaagatccaagagatatttaaactaagctatgatgctttggaggaagatgagcaaagtgtctt 28126453  T
Q  399 tctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtg 498  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28126452 tctcgatatagcttgctgcttcaaagggtatagattgacagaggttgaaaagatacttcatgctcattatggccattgcataaagcatcatgttggagtg 28126353  T
Q  499 ttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaata 536  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28126352 ttggttgaaaaatctctcattgagattaatactcaata 28126315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 250 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28132427 - 28132140
Alignment:
Q  250 atagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagaga 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28132427 atagaaatagtgggttcaaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagtgtacattagatggatatgaaaagattcctaataaaaagatccatgaga 28132328  T
Q  350 tacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaaga 449  Q
    || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||  |||||||||    
T  28132327 tatttaaagtaagttacgatgctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaggggtatagattgacaatggtcgaaga 28132228  T
Q  450 tatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaatac 537  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||    
T  28132227 gatacttcatgctcataatggccattgcataaaacatcatgttggagtgttggtcgaaaaatctctcatagagattaagactcgatac 28132140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 267503 - 267000
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||| || |||||||||| || || || |||||||| || ||| || |||| || ||      
T  267503 gctttggctggaggacttgattggttcggctatggaagcagagtcgtcgttaccactcgagacaagcaattactaacctgtcatgggatagaaagtacgc 267404  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagagacaa---agttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| | |  |   |||||| | |  |||  | ||||||||||     
T  267403 atgaagtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattgttgagttggatggcttttaaaaatgatccagttccatcaatttacaatgagattttaat 267304  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  267303 tcgtgcagttgcttatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagat 267204  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    || ||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| | || || ||||    
T  267203 gggtatgataagattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtgagctatgatggtttggaagaagaggagcagagtgtctttttagacattgctt 267104  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| | | |||||  ||| | | || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  267103 gttgcttcaaaggatatgaatgggaagatgccaaacatatacttcattctcattatggccactgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatc 267004  T
Q  513 tctc 516  Q
    ||||    
T  267003 tctc 267000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28163553 - 28163298
Alignment:
Q  2 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |    
T  28163553 tggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgg 28163454  T
Q  102 ggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttat 198  Q
    | |||| || |   ||   ||||||||| | |||||||  |||||  |||||||||||| |||| |||| |||| |    |||||||||||| | |||||    
T  28163453 gatagaaagtatgcattcggtagaagggttgtatgggacggaagcgcttgaattgttgacgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttat 28163354  T
Q  199 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttataga 254  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28163353 gaagatgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttataga 28163298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 528
Target Start/End: Original strand, 26137099 - 26137422
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagta 304  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |  |  |||| |   ||    
T  26137099 attttaaacagtgcagttaaatatgcttctggccttccgttagctttagaagtagtgggttccagcttgtttggaaagtgtacaacagaatgggaatcta 26137198  T
Q  305 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 404  Q
    || || |    ||||||| ||||||  ||  | | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||| ||||    
T  26137199 cattacagaagtatgaaaggattccacatgaagatatccaaaacatacttagagtaagctatgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtatttttgga 26137298  T
Q  405 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtc 504  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||     
T  26137299 tattgcttgttgcttcaaagggtgtaaattgacagaagtccaaaagatacttcatgctcgttatgaccattgcataaaaagtcatgttggagtgttggtt 26137398  T
Q  505 gaaaaatctctcttaaagattaat 528  Q
    || ||| ||||| | |||||||||    
T  26137399 gataaagctctcatgaagattaat 26137422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5922342 - 5922220
Alignment:
Q  303 tacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctg 402  Q
    |||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||| |||  | | || ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||     
T  5922342 tacattagatcgttatgaaaggattcctgataaaaagatgcaaacgttgctaaaagtgagctttgatgctttggaagaagaagagaaaagtgtttttctt 5922243  T
Q  403 gatatagcttgttgcttcaaagg 425  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5922242 gatattgcttgttgcttcaaagg 5922220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 266980 - 266940
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  266980 atgtgacattacatgacatgatagaggacatgggtaaagaa 266940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 2702 - 2192
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| || || | || |       
T  2702 gctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgc 2603  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2602 atgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaa 2503  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||   |||||||| |||| |||||    
T  2502 ccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaatacattagat 2403  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    || ||||| | |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||    
T  2402 gggtatgacaggattcccaataaagagatccaaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgctt 2303  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||| | | || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  2302 gttgcttcaaaagatgtaaatgggaagatgccaaatatatacttaattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgaaaaatc 2203  T
Q  513 tctcttaaaga 523  Q
    |||| ||||||    
T  2202 tctcataaaga 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 526
Target Start/End: Original strand, 8506 - 9019
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   | ||| || || | || ||      
T  8506 gctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgc 8605  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||  ||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| ||   ||||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  8606 atgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 8705  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  8706 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagat 8805  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |    
T  8806 ggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcct 8905  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  8906 gttgcttcaaaggatgtggatggaaggagtttgaagatatactacgtgctcattatggccattgcataaaacatcatctaggagtgttggctgaaaaatc 9005  T
Q  513 tctcttaaagatta 526  Q
    |||| | |||||||    
T  9006 tctcgttaagatta 9019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 9050 - 9090
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  9050 atgtgacattacatgactttatagaggacatgggtaaagaa 9090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12838 - 12325
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   | ||| || || | || ||      
T  12838 gctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgc 12739  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||  ||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| ||   ||||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  12738 atgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 12639  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  12638 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagat 12539  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |    
T  12538 ggatatgaaaagattcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcct 12439  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  12438 gttgcttcaaaggatgtggatggaaggagtttgaatatatacttcgtgctcattatggccatcgcataacacatcatctagtagtgttggctgaaaaatc 12339  T
Q  513 tctcttaaagatta 526  Q
    |||| | |||||||    
T  12338 tctcgttaagatta 12325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3890 - 3362
Alignment:
Q  1 atggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccata 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||   | |||     
T  3890 atggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaagaagtcatg 3791  T
Q  101 gggtagatagaacatatgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggtta 197  Q
    || |||| || ||  |||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| ||   ||||||| |||| | ||||    
T  3790 ggatagaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 3691  T
Q  198 tgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatgg 297  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  3690 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatgg 3591  T
Q  298 aagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtct 397  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  3590 aagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatccaccagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgttt 3491  T
Q  398 ttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagt 497  Q
    |||| || || || |||||||||||||| |||  ||||   ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | |||    
T  3490 ttctagacattgcctgttgcttcaaaggatgtggatgggaggagtttgaatatatacttcgtgctcattatggccatcgcataacacatcatctagtagt 3391  T
Q  498 gttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 526  Q
    |||||  |||||||||||| | |||||||    
T  3390 gttggctgaaaaatctctcgttaagatta 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 29273001 - 29272498
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| || || | || |       
T  29273001 gctttggctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttgctaacttgtcatgggataaaaagtatgc 29272902  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggccttta-gag--acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||   ||||||| |||| |  |||||||||  |||||||    
T  29272901 atgaagtagaagggctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaatttatgaagacgttttaaa 29272802  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  29272801 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtacattagat 29272702  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  29272701 ggatatgaaaagattcccaataaaaggatccaccagatacttaaagtaagttatgatgctttggaagaagagcaacaaagtgtctttctggacattgctt 29272602  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||  ||||||||    
T  29272601 gttgcttcaaaggttgtgaatgggaagatgccaaatatatacttcattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtattggctgaaaaatc 29272502  T
Q  513 tctc 516  Q
    ||||    
T  29272501 tctc 29272498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 316 - 526
Target Start/End: Original strand, 35984621 - 35984837
Alignment:
Q  316 tatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgtt 415  Q
    |||||||  |||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  35984621 tatgaaaccattcctaataaagacatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttagaggaagatgagcaaagtgtttttcttgacattgcttgtt 35984720  T
Q  416 gcttcaaagg-----gtg-taaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaa 509  Q
     || |  |||      || ||||| | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||    |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  35984721 tctacggaggaacaaatgataaattggcagatgtagaaaatatgcttcatgctcattatgatgcttgcatgaaatatcatattggagtattggttgaaaa 35984820  T
Q  510 atctctcttaaagatta 526  Q
    ||||||| |||||||||    
T  35984821 atctctcataaagatta 35984837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 470
Target Start/End: Original strand, 12590144 - 12590217
Alignment:
Q  397 tttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12590144 tttcttgatattgcttgttgcttcaaaggatggaaattgacaagggtcgaagaaatacttcatgctcatcatgg 12590217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Original strand, 60588 - 61091
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || |||  | |||| | |||||    
T  60588 gctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacat 60687  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    ||| |||| ||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  60688 atgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaa 60787  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     |||| |||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  60788 tcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagat 60887  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
     | |||||||||||||| |||| | ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  60888 tggtatgaaaagattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgctt 60987  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||     
T  60988 gttgcttcaaaggttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatg 61087  T
Q  513 tctc 516  Q
    ||||    
T  61088 tctc 61091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 516
Target Start/End: Original strand, 18074780 - 18075283
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || |||  | |||| | |||||    
T  18074780 gctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacat 18074879  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    ||| |||| ||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  18074880 atgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaa 18074979  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     |||| |||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  18074980 tcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagat 18075079  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
     | |||||||||||||| |||| | ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  18075080 tggtatgaaaagattcccaataaagagatccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgctt 18075179  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatc 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||     
T  18075180 gttgcttcaaaggttgtaaatgggaaaaggtcaaagaaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatg 18075279  T
Q  513 tctc 516  Q
    ||||    
T  18075280 tctc 18075283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18654636 - 18654167
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||     |||  | |||| |  |       
T  18654636 gctttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgc 18654537  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagag---acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||| ||||| | | |  | || | ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18654536 atgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaatttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 18654437  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | |  |||  |   |||| |||||    
T  18654436 ccgtgcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtcgtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgaatctacattagat 18654337  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
       |||||||  |||||  ||  | | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18654336 aagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttggatgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgctt 18654237  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaa 482  Q
    |||  |||||||| |||| || | |||| |||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||||||    
T  18654236 gtttgttcaaaggatgtagattggcagaagtcgaagagatacttcaaagtcattatggttattgcataaa 18654167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18723244 - 18722799
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    |||  |||||| |  |       
T  18723244 gctttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacaattactaaccaatcatgaggtagaaattatgc 18723145  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagag---acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||| ||||| | | |  | || | ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18723144 atgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 18723045  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    ||| |||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||  ||  |||| |||||    
T  18723044 ccgagcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagat 18722945  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
       |||||||  |||||  ||  | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18722944 atgtatgaaagaattccagatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgggcgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgctt 18722845  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttca 458  Q
    ||| ||||||||| |||| || | |||| |||||||| ||||||||    
T  18722844 gtttcttcaaaggatgtagattggcagaagtcgaagagatacttca 18722799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18678719 - 18678274
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||     |||  | |||| |  |       
T  18678719 gctttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgc 18678620  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagag---acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||| ||||| | | | || || | ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18678619 atgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 18678520  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
     |||||||||   |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||   |  |||  ||  |||| |||||    
T  18678519 acgtgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatttcagaatgtgagtctacattagat 18678420  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
       |||||||  |||||  ||  | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  18678419 aagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaattgtctttttggatattgctt 18678320  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttca 458  Q
    ||| ||||||||| |||| || | |||| |||||||| ||||||||    
T  18678319 gtttcttcaaaggatgtagattggcagaagtcgaagagatacttca 18678274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18730663 - 18730218
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||    |||  | |||| |  |       
T  18730663 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatcc 18730564  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||| ||||| | | |  | || | ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  18730563 atgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaa 18730464  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    || |||||||   |||||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | |  |||  |   |||| |||||    
T  18730463 ccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgattctacattagat 18730364  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
       |||||||  |||||  ||  | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18730363 aagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgctt 18730264  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttca 458  Q
    ||| ||||||||| |||| || | |||| |||||||| ||||||||    
T  18730263 gtttcttcaaaggatgtagattggcagaagtcgaagagatacttca 18730218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18698559 - 18698142
Alignment:
Q  16 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||    |||  | |||| |  |       
T  18698559 gctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatcc 18698460  T
Q  116 atgaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaga---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 212  Q
    |||||||| ||||| | | |  | || | ||| ||||||||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  18698459 atgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaa 18698360  T
Q  213 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagat 312  Q
    || |||||||   |||||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | |  |||  |   |||| |||||    
T  18698359 ccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgactctacattagat 18698260  T
Q  313 ggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagctt 412  Q
       |||||||  |||||  ||  | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18698259 aagtatgaaagaattccacatgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgctt 18698160  T
Q  413 gttgcttcaaagggtgta 430  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  18698159 gtttcttcaaaggatgta 18698142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18688652 - 18688316
Alignment:
Q  149 ttgaattgttgaggtggctggcctttagag---acaaagttcctttaggttatgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttccttt 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| ||    
T  18688652 ttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttccatt 18688553  T
Q  246 agttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaa 345  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |  |||  ||  |||| |||||   ||| |||  ||||| ||   | | ||||||    
T  18688552 agctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatatccaa 18688453  T
Q  346 gagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcg 445  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | || | ||||    
T  18688452 aagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtatattggcaaaagtcg 18688353  T
Q  446 aagatatacttcatgctcattatggccattgcataaa 482  Q
    |||| |||||| |   |||||||||  ||||||||||    
T  18688352 aagagatacttaaacttcattatggttattgcataaa 18688316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5090111 - 5089601
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatat 117  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||| || | |||| ||||||     
T  5090111 tttggccggagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggattgatataacatac 5090012  T
Q  118 gaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttagagacaaa---gttcctttaggttatgaagagattttaaacc 214  Q
    |||||||| ||  || ||| ||| |||||| || |||| || ||||||  ||| |||| | | |     |||  |  | |||||||||  ||||||||||    
T  5090011 gaagtagatggtttaaatgagaacgaagctcttcaattattaaggtggaaggcttttaaaaatagtactgttaatccaagttatgaaggaattttaaacc 5089912  T
Q  215 gtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatgg 314  Q
    |||  ||  | |||||||| |||||||| || | | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||   |  ||||||||     
T  5089911 gtgtggtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagttgtgggttccaatttgtttggaaaggatatagaaaaatggaaatctttactagatga 5089812  T
Q  315 atatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgt 414  Q
     ||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||| |||| | ||  |||||  ||| | ||||| ||||| || || || || ||||||    
T  5089811 gtatgaaaggattcctaataaagaaatccaaaagatacttatagtgagctttaataatttaggtgaatatgagcagagtgttttcctcgacattgcttgt 5089712  T
Q  415 tgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctc 514  Q
    || |||||||| | ||  | |   ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||| ||||| | | |  |||||| || |||||||    
T  5089711 tgtttcaaaggatatagcttggatgaggtcgaatatatactttgtgctcattatggttattgcatgaaatatcatataggaaagttggttgataaatctc 5089612  T
Q  515 tcttaaagatt 525  Q
    || ||||||||    
T  5089611 tcataaagatt 5089601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 18730133 - 18730091
Alignment:
Q  558 tgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18730133 tgatgtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaa 18730091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 226 - 526
Target Start/End: Original strand, 1 - 301
Alignment:
Q  226 tatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 100  T
Q  326 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 425  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  101 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaagg 200  T
Q  426 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatt 525  Q
     |||  |||||  ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  201 atgtggatggaaggagtttgaagatatactacgtgctcattatggccattgcataaaacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatt 300  T
Q  526 a 526  Q
    |    
T  301 a 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 600
Target Start/End: Original strand, 332 - 372
Alignment:
Q  560 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 600  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  332 atgtgacattacatgactttatagaggacatgggtaaagaa 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 57244 - 56946
Alignment:
Q  226 tatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 325  Q
    |||||||| |||||||| || |   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |  ||||||   | || || ||   ||||||| ||    
T  57244 tatgcttcaggccttccattggccttagaagtagtgggttcgaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaagga 57145  T
Q  326 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 425  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | | ||| ||||| || ||  |||||| |||  ||||    
T  57144 ttcccattaaaaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaagaatgtttttctcgacatttcttgtttcttagaagg 57045  T
Q  426 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagat 524  Q
     ||| | |  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||  ||  |||||||   |||||||||||| |||||||    
T  57044 atgtgatttaaaagaagttgaagatatacttcatgctcattatggtagctgcatgaaacatcaaattagagtgttgcatgaaaaatctctcataaagat 56946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 57455 - 57308
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||||||||| ||  |||| || ||| |  | ||| || | || ||| |||||    
T  57455 tttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagtaaagtgatcattaccactcgagacgaacaattgctagcaggtcatgggattgaaagagcatat 57356  T
Q  118 gaagtagaagggctatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtgg 165  Q
    ||| ||||   | || ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  57355 gaaatagataagttaaatgagaaagaagctcttgaattgttgaggtgg 57308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 427
Target Start/End: Original strand, 3280979 - 3281092
Alignment:
Q  314 gatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttg 413  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||    
T  3280979 gatatgaaaggattcctaataaagagattcagaagatacttaaagtgagttttgatgctttggaggaagacgagcaaagtgtttttctcgacattgcttg 3281078  T
Q  414 ttgcttcaaagggt 427  Q
    |||||| |||||||    
T  3281079 ttgctttaaagggt 3281092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 391 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17992000 - 17991854
Alignment:
Q  391 agtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatg 490  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |  || | || | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||      
T  17992000 agtgtctttttggatattgcttgttgcttcaaagagcatgtattggcatatgtcgaagaaatgcttcatggtcattatggtcattgcataaaaagccacc 17991901  T
Q  491 ttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaatac 537  Q
    | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17991900 tcgaagtgttggttgataaatctctcataaagattaatactaaatac 17991854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17992186 - 17992109
Alignment:
Q  205 attttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaag 282  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||| || |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17992186 attttaaaccgtgtagttaaatatgctgctggcctcccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaag 17992109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 86
Target Start/End: Original strand, 3280684 - 3280748
Alignment:
Q  22 gctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacactt 86  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  3280684 gctggagggcttgattggtttagtgttggtagtagggtgatcattaccactcgagacaaacactt 3280748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 470
Target Start/End: Original strand, 44189 - 44433
Alignment:
Q  226 tatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 325  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |  |||| |  ||||||   | || ||||| | |||  || ||    
T  44189 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaagga 44288  T
Q  326 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 425  Q
    |||| | || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  44289 ttccgattaaaaagatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaagg 44388  T
Q  426 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
     | ||| | || |||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  44389 atataatttgaaagaacttgaagatatactttatgctcattatgg 44433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 28471 - 28527
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||    
T  28471 tttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcg 28527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 419
Target Start/End: Original strand, 40841 - 40940
Alignment:
Q  316 tatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgtt 415  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||    | ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  40841 tatgaaaggattccaaataaagagatccaaaagatacttaaagt----tttgatgctttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgtt 40936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 40537 - 40593
Alignment:
Q  18 tttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcg 74  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  40537 tttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccactcg 40593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 16691904 - 16691962
Alignment:
Q  34 gattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaac 92  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16691904 gattggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaac 16691962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 465
Target Start/End: Original strand, 13717615 - 13717671
Alignment:
Q  409 gcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcat 465  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  13717615 gcttgttgcttcaaaggatataaatcgacaaaggtcaaagaaatacttcatgctcat 13717671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 238736 - 238571
Alignment:
Q  305 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 404  Q
    |||||||| | | ||||||  ||||| ||| ||||||||||  || |||  || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| ||    
T  238736 cactagatcgttttgaaaaagttcctcataaaaagatccaaatgacactacaactaagctatgatgctttacaggaagaagagaaaattgtttttcttga 238637  T
Q  405 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 470  Q
     || || |||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||| | || ||| |||||||| ||||    
T  238636 cattgcatgttgcttcaaaggatataaattgacaagggtcgaacaaattctttatgctcatcatgg 238571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 521
Target Start/End: Original strand, 615211 - 615323
Alignment:
Q  409 gcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaa 508  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| ||||  || | |||||||| ||||    
T  615211 gcttgttgcttcaaaggatggaaattgacaagggttgaagaaatacttcatgctcattatggtgatatcatgaaagatcacattaatgtgttggtggaaa 615310  T
Q  509 aatctctcttaaa 521  Q
    |||||||| ||||    
T  615311 aatctctcataaa 615323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University