View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18506_low_3 (Length: 581)

Name: NF18506_low_3
Description: NF18506
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18506_low_3
NF18506_low_3
[»] chr6 (89 HSPs)
chr6 (2-564)||(26885114-26885673)
chr6 (7-480)||(31285608-31286081)
chr6 (8-495)||(27680000-27680487)
chr6 (7-487)||(27717152-27717632)
chr6 (7-480)||(26624320-26624793)
chr6 (7-480)||(26730297-26730770)
chr6 (8-494)||(26657015-26657498)
chr6 (8-494)||(26762986-26763469)
chr6 (9-495)||(26803497-26803983)
chr6 (7-490)||(28787287-28787770)
chr6 (7-490)||(28793408-28793891)
chr6 (7-480)||(27609780-27610253)
chr6 (4-480)||(26647525-26648001)
chr6 (4-480)||(26753493-26753969)
chr6 (4-480)||(27426272-27426748)
chr6 (9-453)||(27704941-27705385)
chr6 (9-479)||(27603365-27603835)
chr6 (13-480)||(26824874-26825341)
chr6 (2-485)||(27697241-27697724)
chr6 (2-480)||(26862624-26863102)
chr6 (16-480)||(27529964-27530425)
chr6 (4-446)||(25492013-25492455)
chr6 (2-447)||(27676313-27676758)
chr6 (4-434)||(27591727-27592157)
chr6 (4-480)||(25484105-25484581)
chr6 (4-480)||(26143914-26144390)
chr6 (4-480)||(25511938-25512413)
chr6 (103-480)||(27215597-27215974)
chr6 (4-480)||(25580768-25581244)
chr6 (4-480)||(26056968-26057444)
chr6 (4-480)||(26076938-26077414)
chr6 (4-319)||(27336916-27337231)
chr6 (4-319)||(27397656-27397971)
chr6 (166-490)||(29842642-29842966)
chr6 (166-490)||(29827194-29827518)
chr6 (4-203)||(25539589-25539788)
chr6 (311-490)||(26938382-26938561)
chr6 (168-434)||(28326688-28326954)
chr6 (168-434)||(28504324-28504590)
chr6 (190-434)||(28186626-28186870)
chr6 (169-490)||(27663865-27664185)
chr6 (190-434)||(28244027-28244271)
chr6 (190-434)||(28296446-28296690)
chr6 (190-434)||(28515383-28515627)
chr6 (167-253)||(26636855-26636941)
chr6 (167-253)||(26742821-26742907)
chr6 (167-255)||(26849921-26850009)
chr6 (1-247)||(26950786-26951032)
chr6 (167-253)||(26960334-26960420)
chr6 (7-79)||(28782150-28782222)
chr6 (124-489)||(28140701-28141066)
chr6 (167-244)||(25075076-25075153)
chr6 (167-248)||(26812737-26812818)
chr6 (300-434)||(28182451-28182585)
chr6 (304-490)||(2186172-2186358)
chr6 (190-253)||(26978612-26978675)
chr6 (330-431)||(28097152-28097253)
chr6 (4-44)||(25074913-25074953)
chr6 (304-447)||(25075213-25075356)
chr6 (1-44)||(26975994-26976037)
chr6 (1-44)||(31289312-31289355)
chr6 (304-378)||(26978726-26978800)
chr6 (280-383)||(28240679-28240778)
chr6 (1-42)||(26849755-26849796)
chr6 (198-247)||(28228192-28228241)
chr6 (190-243)||(28240589-28240642)
chr6 (524-564)||(27529898-27529938)
chr6 (1-44)||(26636689-26636732)
chr6 (1-44)||(26742655-26742698)
chr6 (525-564)||(27697180-27697219)
chr6 (196-246)||(2186064-2186114)
chr6 (526-564)||(25075432-25075470)
chr6 (526-564)||(26850277-26850315)
chr6 (304-378)||(26960471-26960545)
chr6 (10-40)||(27664305-27664335)
chr6 (201-247)||(28182361-28182407)
chr6 (13-43)||(28240409-28240439)
chr6 (173-246)||(26938244-26938317)
chr6 (280-433)||(29469534-29469687)
chr6 (269-434)||(29727656-29727821)
chr6 (524-564)||(25484607-25484647)
chr6 (524-564)||(25512439-25512479)
chr6 (524-564)||(25546531-25546571)
chr6 (524-564)||(26057470-26057510)
chr6 (524-564)||(26077440-26077480)
chr6 (524-564)||(26144416-26144456)
chr6 (4-40)||(26812574-26812610)
chr6 (319-487)||(26812889-26813057)
chr6 (524-564)||(28141089-28141129)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (4-500)||(28126315-28126811)
chr1 (9-480)||(267000-267471)
chr1 (214-501)||(28132140-28132427)
chr1 (4-218)||(28163298-28163512)
chr1 (1-492)||(26136931-26137422)
chr1 (267-389)||(5922220-5922342)
chr1 (524-564)||(266940-266980)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (7-487)||(2192-2672)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (7-490)||(8536-9019)
scaffold0419 (524-564)||(9050-9090)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (7-490)||(12325-12808)
scaffold0277 (9-490)||(3362-3843)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (7-480)||(29272498-29272971)
chr8 (280-490)||(35984621-35984837)
chr8 (361-434)||(12590144-12590217)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (4-480)||(60615-61091)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (4-480)||(18074807-18075283)
chr4 (8-446)||(18654167-18654605)
chr4 (8-422)||(18678274-18678688)
chr4 (106-422)||(18722799-18723115)
chr4 (106-446)||(18688316-18688656)
chr4 (8-422)||(18730218-18730632)
chr4 (8-394)||(18698142-18698528)
chr4 (2-489)||(5089601-5090088)
chr4 (522-564)||(18730091-18730133)
[»] scaffold1870 (2 HSPs)
scaffold1870 (190-490)||(1-301)
scaffold1870 (524-564)||(332-372)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (1-501)||(17991854-17992354)
chr2 (278-391)||(3280979-3281092)
chr2 (190-247)||(3280891-3280948)
chr2 (169-242)||(17713508-17713581)
chr2 (174-242)||(17662487-17662555)
[»] scaffold0038 (5 HSPs)
scaffold0038 (190-434)||(44189-44433)
scaffold0038 (280-383)||(40841-40940)
scaffold0038 (198-247)||(28690-28739)
scaffold0038 (190-243)||(40751-40804)
scaffold0038 (13-43)||(40571-40601)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (190-488)||(56946-57244)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (2-492)||(16691911-16692401)
chr5 (373-429)||(13717615-13717671)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (269-434)||(238571-238736)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (373-485)||(615211-615323)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 89)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 564
Target Start/End: Original strand, 26885114 - 26885673
Alignment:
Q  2 ttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggac 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||   | ||| || || | || ||| ||| |||||||||| |  ||||||     
T  26885114 ttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatatgaagtagaagggatatatgggaa 26885213  T
Q  102 tgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggc 201  Q
     |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||   || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26885214 agaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaaa---gacaaagttcctttaggttatgaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggc 26885310  T
Q  202 cttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaa 301  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885311 cttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaacatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaa 26885410  T
Q  302 agatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggac 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885411 agatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggac 26885510  T
Q  402 agaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaatac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26885511 agaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttggagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaatac 26885610  T
Q  502 cgttcagcaagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26885611 cgttcagcgagaaatcatgttgatgtgacattacatgacttggtagaggacatgggtaaagaa 26885673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 480
Target Start/End: Original strand, 31285608 - 31286081
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31285608 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 31285707  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31285708 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatattcttctggccttcc 31285807  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||    
T  31285808 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaaaatggaagagtacattagatgggtatgacaagattcccaataaagagatc 31285907  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||   |||| | || |    
T  31285908 caaaagatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggatgcggatgggcggatg 31286007  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  31286008 tcaaagatatactccatgctcattatggccattgcataacacatcatctagaagtgttggctgaaaaatctctc 31286081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Original strand, 27680000 - 27680487
Alignment:
Q  8 gtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27680000 gtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagacttactaagcagtcatggcatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagc 27680099  T
Q  108 tcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcca 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  27680100 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttttggccttccg 27680199  T
Q  208 ttagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  27680200 ttagttttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagattggaagcatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatcc 27680299  T
Q  308 aagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggt 407  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | | ||||||  ||| |    
T  27680300 aaaagatacttaaggtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacatcgcttgctgcttcaaaggatatcaatggaaggagtt 27680399  T
Q  408 cgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatact 495  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||  | |||||||||| | ||||||| ||||    
T  27680400 cgaagatatactttgtgctcattatgaccattgcataacacatcatctaggagtgttggctggaaaatctctcgttaagattagtact 27680487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27717632 - 27717152
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27717632 cgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaag 27717533  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717532 ctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 27717433  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||    
T  27717432 gttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatc 27717333  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||  ||| |    
T  27717332 caaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaagatgtaaatgggaagatg 27717233  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaaga 487  Q
     | || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27717232 ccaaatatatacttaattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgaaaaatctctcataaaga 27717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 480
Target Start/End: Original strand, 26624320 - 26624793
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  26624320 cgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacg 26624419  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26624420 gtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 26624519  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||    
T  26624520 gttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatc 26624619  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||  |||||  |||     
T  26624620 caaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctagatattgcttgttgctcgaaaggatgtggatggagggagt 26624719  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || |||| ||||    
T  26624720 tcgaagatatgcttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgacaaatgtctc 26624793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 480
Target Start/End: Original strand, 26730297 - 26730770
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  26730297 cgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacg 26730396  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26730397 gtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 26730496  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||    
T  26730497 gttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagtatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatc 26730596  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||  |||||  |||     
T  26730597 caaaagatacttaaagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttctagatattgcttgttgctcgaaaggatgtggatggagggagt 26730696  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || |||| ||||    
T  26730697 tcgaagatatgcttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgacaaatgtctc 26730770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 494
Target Start/End: Original strand, 26657015 - 26657498
Alignment:
Q  8 gtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||   |||| |||||| |||  ||| |||| ||| ||||| |  ||||||| |||||    
T  26657015 gtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagc 26657114  T
Q  108 tcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcca 207  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||| |   || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||     
T  26657115 acttgaattgttgagatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttccc 26657211  T
Q  208 ttagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcc 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  26657212 ttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaagagtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagattc 26657311  T
Q  308 aagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||| || ||  |||||    
T  26657312 aagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagcaaagtgtctttttagatatagcttgttttttcaaaggatgtagattgagtgaggt 26657411  T
Q  408 cgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatac 494  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  26657412 cgaagagacacttcttgctcactatggtcattgcataaaacatcatgttggagtgttggttgaaaaatctctcatagagattaatac 26657498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 494
Target Start/End: Original strand, 26762986 - 26763469
Alignment:
Q  8 gtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||   |||| |||||| |||  ||| |||| ||| ||||| |  ||||||| |||||    
T  26762986 gtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagc 26763085  T
Q  108 tcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcca 207  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||| |   || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||     
T  26763086 acttgaattgttgagatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttccc 26763182  T
Q  208 ttagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcc 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  26763183 ttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaagagtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagattc 26763282  T
Q  308 aagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||| || ||  |||||    
T  26763283 aagagatacttaaagtaagctatgatgatttggaggaagaggagcaaagtgtctttttagatatagcttgttttttcaaaggatgtagattgagtgaggt 26763382  T
Q  408 cgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatac 494  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  26763383 cgaagagacacttcttgctcactatggtcattgcataaaacatcatgttggagtgttggttgaaaaatctctcatagagattaatac 26763469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 495
Target Start/End: Original strand, 26803497 - 26803983
Alignment:
Q  9 tggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagct 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  26803497 tggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagct 26803596  T
Q  109 cttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccat 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |    
T  26803597 cttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccttcaagttatgaagacattttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggtcttccct 26803696  T
Q  209 tagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcca 308  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26803697 tagttttagagatagtgggttccaacttgtttggaaagagcataaaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatcca 26803796  T
Q  309 agagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtc 408  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||  ||||   ||| |     
T  26803797 cgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggatgggaggagttt 26803896  T
Q  409 gaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatact 495  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  26803897 gaagatatacttcatgttcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcattaagattagtact 26803983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 490
Target Start/End: Original strand, 28787287 - 28787770
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||||    
T  28787287 cgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaag 28787386  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  28787387 ctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcttatgcttcgggccttcc 28787486  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28787487 cttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatc 28787586  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||| | |||   |||     
T  28787587 cacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcatgttgcttcaaaggatgtgagtgggaggagt 28787686  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  28787687 ttgaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatta 28787770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 490
Target Start/End: Original strand, 28793408 - 28793891
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||||    
T  28793408 cgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaag 28793507  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  28793508 ctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcgtatgcttcgggccttcc 28793607  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28793608 cttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtactttagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatc 28793707  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||| | |||   |||     
T  28793708 cacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcaacaaagtgtttttctagacattgcatgttgcttcaaaggatgtgagtgggaggagt 28793807  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  28793808 ttgaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatta 28793891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27610253 - 27609780
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  |||  ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  27610253 cgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgctaacctgtcatgggataaaaagtatgcataaagtggaagggctgtatgggacagaag 27610154  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27610153 ctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaaccgtgctgttgcatatgcttctggccttcc 27610054  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||    
T  27610053 gttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaggaatggaagtatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatc 27609954  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||  ||| |    
T  27609953 caaaagatacttaaagtgagctatgattctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggatataattgggaagatg 27609854  T
Q  407 tcgaag-atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
     | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  27609853 -caaagtatacacttcattctcattatggccattccataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctc 27609780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 26647525 - 26648001
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |  ||||||| |    
T  26647525 ggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacag 26647624  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | | ||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26647625 aagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggcct 26647724  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26647725 tcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaag 26647824  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||   |    
T  26647825 atccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtagatgggagg 26647924  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    || | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26647925 agtttgaagatatacttcgttatcattatggccattgcataacacatcatcttggagtgttggctgaaaaatctctc 26648001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 26753493 - 26753969
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |  ||||||| |    
T  26753493 ggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacag 26753592  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | | ||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26753593 aagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggcct 26753692  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26753693 tcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaag 26753792  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||   |    
T  26753793 atccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtagatgggagg 26753892  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    || | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26753893 agtttgaagatatacttcgttatcattatggccattgcataacacatcatcttggagtgttggctgaaaaatctctc 26753969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27426748 - 27426272
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    |||||| |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  27426748 ggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacag 27426649  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  27426648 aagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 27426549  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||    
T  27426548 tccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaagattcccaataaagag 27426449  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||  |     
T  27426448 atccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggttgtaaatgggaaa 27426349  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  27426348 aggtcaaagaaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatgtctc 27426272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27705385 - 27704941
Alignment:
Q  9 tggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagct 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||     |||| ||||| |||  ||| || |||||||||||||||||||||  || |||    
T  27705385 tggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggttgaatgggatagatgct 27705286  T
Q  109 cttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccat 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27705285 cttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgt 27705186  T
Q  209 tagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcca 308  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||||    
T  27705185 tagttttagaagtaatgggttctaacttgtttggcaagaacatagaagaatggaagaatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatcca 27705086  T
Q  309 agagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtc 408  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| || || |||||||||     
T  27705085 aaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttcttgacattgcttgttgcttaaaagggtatagattgacagaggtt 27704986  T
Q  409 gaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcat 453  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  27704985 gaaaatatacttcattctcattatgaccattgtataacacatcat 27704941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27603835 - 27603365
Alignment:
Q  9 tggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagct 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||| |||| |   ||||| |||||||||||  | |||| ||||||    
T  27603835 tggaagcagggtcatcattaccactcgagacagacacttactaaccagtcatgatatagaaagaaagtatgcattagaagggttgtgtaggacagaagct 27603736  T
Q  109 cttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccat 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |    
T  27603735 cttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcagtttatgaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggacttccct 27603636  T
Q  209 tagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcca 308  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27603635 tagttttggaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtacgttagaaggatatgagaagattcccaataaaaagatcca 27603536  T
Q  309 agagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtc 408  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||  || |  || |||     
T  27603535 cgagattcttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggatgtggattggaagtggtt 27603436  T
Q  409 gaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctct 479  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||    
T  27603435 gaagatatacttcgtgctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctct 27603365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 480
Target Start/End: Original strand, 26824874 - 26825341
Alignment:
Q  13 agcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | ||||| |||| ||   |   ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26824874 agcagagtcatcattacaactcgagacaaacaattacttaccaatcatgagatagaattaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttg 26824973  T
Q  113 aattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  26824974 aattgttaaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccgtcaagttatgaacacattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagt 26825073  T
Q  213 tatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagag 312  Q
      ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||    
T  26825074 attagaaatagtgggttccaatttgtttggaaagagcatacaaatatggaagggtgcattagatggatatgaaaggattcctgacaaaaagatccaagag 26825173  T
Q  313 atacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaag 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| || || || || ||||||||||||||||    ||  |||   ||| ||||||    
T  26825174 atacttagagtaagctatgatgctttggaagaagagcaacaaagtgttttcctcgacattgcttgttgcttcaaagaacatagttgggaggagttcgaag 26825273  T
Q  413 atatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  26825274 atatacttcgtactcattacggccattgcataaaacatcatgttcaagtgttggcagaaaaatctctc 26825341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27697724 - 27697241
Alignment:
Q  2 ttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggac 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||     |||||||||| |||  ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  27697724 ttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagaccatcatgggatagaaaaaacgtatgcagtaaaagggttgaatgggac 27697625  T
Q  102 tgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggc 201  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||||    
T  27697624 agaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccatcaaggtacaaagagattttaagtcgtgcagtttcatatgtttctggc 27697525  T
Q  202 cttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaa 301  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||  || | ||||||| ||||| | |||||| |||| |     
T  27697524 cttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatggaagtatatattagatgggtatgacaggattcccaataaag 27697425  T
Q  302 agatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggac 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |  ||||      
T  27697424 agatccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaagaagaggagcaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggacatggatggga 27697325  T
Q  402 agaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaa 485  Q
    ||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  27697324 agatgccaaatatatgcttcatgctcattatggccattccataacacatcatctagcagtgttggctgaaaaatctctcataaa 27697241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 480
Target Start/End: Original strand, 26862624 - 26863102
Alignment:
Q  2 ttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggac 101  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |  ||| |||    
T  26862624 ttggtcatggaagtagagtcatcattaccactcgagataaacacttactaacatgccatgggatagaaagaacatatgcggtaaacgggctacatgagac 26862723  T
Q  102 tgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggc 201  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||  ||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26862724 agaagcttttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttataacgatgttttaaaccgtgcagttgcatatgcttccggc 26862823  T
Q  202 cttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaa 301  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |     
T  26862824 cttccgttagttctcgaaatagtgggttctaacttgtttggaaagagcatggaagaatggcaatgcacattagatgggtatgaaaagattcccaataaag 26862923  T
Q  302 agatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggac 401  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||     
T  26862924 agatccaaaggatacttaaagtaagctatgatgctttggaagaagagcagcaaagtgtctttctagatattgcttgttgtttcaaagggggtagctggat 26863023  T
Q  402 agaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    |||  |||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26863024 agaattcgaagatatacttaaatatcattatggccgatgcataaaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 26863102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27530425 - 27529964
Alignment:
Q  16 agagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaat 115  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  27530425 agagtcatcattactactcgaaacaaacacttactaaagattcatgggatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgcgacagaagctctcgaat 27530326  T
Q  116 tgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttat 215  Q
    |||| |||||||||||||| |||   || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||    
T  27530325 tgttgaggtggatggctttcaaa---gaaaatgttccttcaagtcatgaagacattttaaaccgtgcacttacttatgcttctggccttccattagctat 27530229  T
Q  216 agaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagata 315  Q
     | | || | || || || ||| |||||| |||| || ||   |  | ||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||| | ||||||||   |||    
T  27530228 tgtaataatagggtccaatttggttggaaggagcgtacaagattcaatgagtacattagatgggtatgaagaaattcccaataaagagatccaaagaata 27530129  T
Q  316 cttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagata 415  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  27530128 cttaaagtgagctatgattctttggagaaagaagagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggccagaggtcaaagaaa 27530029  T
Q  416 tacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  27530028 tacttcatgctcattatggtcattgcatagtacatcatgttgcagttttggctgaaaaatctctc 27529964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 25492455 - 25492013
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||   |    
T  25492455 ggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcatgcagtagaagagttgcatggggaag 25492356  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||| || | ||||||||||||||    
T  25492355 aagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttcaatttatgaagacattttaacacttgcaattacctatgcttctggcct 25492256  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    |||||||| | ||| | || | || ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||   |||| | ||    
T  25492255 tccattagctttagtaataatagggtcaaatttgtttggaaatagcatagaagaatggaagtgtacattagatgagtatgaaaagattttcaataaagag 25492156  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| || ||  |||||| ||||||||| || |||||| | |    
T  25492155 atccaaaagatacttagagtgagctatgatgctttggaggaaaaggagcagagtatctttctagacatgacttgtttcttcaaaggttggaaatgggcgg 25492056  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaa 446  Q
    | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25492055 atgtcaaaaatatacttcatgatcattatggccattgcgtaaa 25492013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 27676758 - 27676313
Alignment:
Q  2 ttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggac 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  27676758 ttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgagac 27676659  T
Q  102 tgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggc 201  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27676658 agaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggc 27676559  T
Q  202 cttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaa 301  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||  ||  |||| |||||   |||| ||  |||||  ||| |     
T  27676558 cttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaag 27676459  T
Q  302 agatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggac 401  Q
    | |||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |      
T  27676458 atatccaaaagatacttagactgagctatgatgctttggacgaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattgga 27676359  T
Q  402 agaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaa 447  Q
    ||| |||||| | |||||||||  |||||||||  || ||||||||    
T  27676358 agaagtcgaacagatacttcatcatcattatggttatagcataaaa 27676313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27592157 - 27591727
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  27592157 ggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgggacag 27592058  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27592057 aagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggcct 27591958  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||  ||  |||| |||||   |||| ||  |||||  ||| | |     
T  27591957 tccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagataagtatggaagaattccacataaagat 27591858  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgta-aatggaca 402  Q
    |||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |    
T  27591857 atccaaaagatacttagactcagctatgatgctttggaagaagaggagcagagtgtctttttggatattgcttgttgcatcaaaggatgtagattggaga 27591758  T
Q  403 gaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
     | ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27591757 -aagtcaaacagatacttcatgctcattatgg 27591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 25484105 - 25484581
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  25484105 ggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacag 25484204  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  25484205 aagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 25484304  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
     || ||||  |||| |  | | ||    || |||||||||| ||   |||||   |||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||  ||| | |     
T  25484305 gcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagat 25484404  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  25484405 atccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttacttcaaagggtataaatggacaa 25484504  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    | ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  25484505 aagtaaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatgtctc 25484581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 26143914 - 26144390
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  26143914 ggtcatggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacag 26144013  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  26144014 aagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaaattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 26144113  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
     || ||||  |||| |  | | ||    || |||||||||| ||   |||||   ||| || ||||| |||| |  |||||||| |||||  ||| | |     
T  26144114 gcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattgggagcgtacattagacgagtatgaaaatattcccgataaagat 26144213  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26144214 atccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtgaatggacaa 26144313  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26144314 aggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 26144390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 25511938 - 25512413
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  25511938 ggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg-attacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagatag 25512036  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    ||||||||   ||||| ||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  25512037 aagctcttattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 25512136  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||| |||| ||||| |  | | ||  | || |||||||||| ||   |||||   |||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||  ||| | |     
T  25512137 tccgttagctatagtaacaataggggccaatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtacattagatgagtatgaaaatattcccgataaagat 25512236  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  25512237 atccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttacttcaaagggtataaatggacaa 25512336  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    | ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25512337 aagtaaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 25512413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 103 - 480
Target Start/End: Original strand, 27215597 - 27215974
Alignment:
Q  103 gaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcc 202  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||| || | ||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||| || | |||| ||||||||    
T  27215597 gaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatgaaggcatttttaatcgtgcacttacttatgtttctggcc 27215696  T
Q  203 ttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaa 302  Q
    ||||||||| ||||| |  | | || || || |||||||||| |||  |||||   ||| |  ||| | ||||||  |||||||||||||| |||| | |    
T  27215697 ttccattagctatagtaacaatagggtccaatttgtttggaaggagtgtagaagattgggaacgtatattagatgagtatgaaaagattcccaataaaga 27215796  T
Q  303 gatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggaca 402  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215797 gatccaaaggatacttaaagtcagctatgatgctctggaggaaaaggagaagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggaca 27215896  T
Q  403 gaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27215897 aaggtcaaagatatacttcatgcccattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggccgaaaaatctctc 27215974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 25580768 - 25581244
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  25580768 ggtcatggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacag 25580867  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||    
T  25580868 aagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaatttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctgggct 25580967  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
     || ||||  |||| |  | | ||    || |||||||||| ||   |||||   |||||| ||| | ||||||  |||||||| ||||| |||| | |     
T  25580968 gcccttagcaatagtaacaataggggataatttgtttggaaggaaggtagaagattggaagcgtatattagatgagtatgaaaatattcccaataaagat 25581067  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| ||   | ||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25581068 atccaaaggatacttcaagttagctatgatgctttggaaccaaaggagaagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaa 25581167  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25581168 aggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccattgcatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 25581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 26056968 - 26057444
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26056968 ggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacag 26057067  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    ||||||||||||| || ||  | |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  26057068 aagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 26057167  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||| |||| ||||| |  | | ||  | || ||| |||||| ||   |||||   ||| || ||| | |||| |  |||||||| |||||  ||| | |     
T  26057168 tccgttagctatagtaacaataggggccaatttgattggaaggaaggtagaagattgggagcgtatattagacgagtatgaaaatattcccgataaagat 26057267  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26057268 atccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaa 26057367  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26057368 aggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccatcccatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 26057444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 26076938 - 26077414
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26076938 ggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacag 26077037  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    ||||||||||||| || ||  | |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  26077038 aagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 26077137  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||| |||| ||||| |  | | ||  | || ||| |||||| ||   |||||   ||| || ||| | |||| |  |||||||| |||||  ||| | |     
T  26077138 tccgttagctatagtaacaataggggccaatttgattggaaggaaggtagaagattgggagcgtatattagacgagtatgaaaatattcccgataaagat 26077237  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26077238 atccaaaggatacttcaagtaagctatgatgctttgaaggaaaaggatcagagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacaa 26077337  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26077338 aggttaaaaaaatacttcatgctcattatggccatcccatagaacatcatgttggagtgttggctgaaaaatctctc 26077414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27337231 - 27336916
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |  ||||||  |    
T  27337231 ggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaagg 27337132  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | | ||||| ||  || |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |    
T  27337131 aagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaaccgtgcagtttcatatggttcgggcat 27337032  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | ||    
T  27337031 tcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagtatggaagaacacattagatgggtatgacaggattcccaataaagag 27336932  T
Q  304 atccaagagatactta 319  Q
    || ||| |||||||||    
T  27336931 atacaaaagatactta 27336916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27397971 - 27397656
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |  ||||||  |    
T  27397971 ggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaagg 27397872  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | | ||||| ||  || |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |    
T  27397871 aagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaaccgtgcagtttcatatggttcgggcat 27397772  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | ||    
T  27397771 tcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagtatggaagaacacattagatgggtatgacaggattcccaataaagag 27397672  T
Q  304 atccaagagatactta 319  Q
    || ||| |||||||||    
T  27397671 atacaaaagatactta 27397656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29842966 - 29842642
Alignment:
Q  166 gacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaaga 265  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||| ||   |||||||||||||  ||||||  ||||||      
T  29842966 gacattttagaccgtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggtccagctttgtttggaaagaatatagaagaatggaaat 29842867  T
Q  266 gtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttct 365  Q
     |||| ||||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||    
T  29842866 ctacattagataggtatgaaaggattcctaataaagagatccacaatatacttaaaataagctttgatgctttggaggaagacgaacaaggtgtttttct 29842767  T
Q  366 ggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttg 465  Q
     || || ||||||||||||||||||| | | | |  |||||| |||||||| |||  |||| || |||| || |||||| || ||||| ||| |||||||    
T  29842766 cgacattgcttgttgcttcaaagggtatgatttgggagaggttgaagatattctttgtgcttatcatggtcaatgcatagaatatcatattggagtgttg 29842667  T
Q  466 gtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    
T  29842666 gtcgaaaaaactctcataaagatta 29842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 490
Target Start/End: Original strand, 29827194 - 29827518
Alignment:
Q  166 gacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaaga 265  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||| |    |||||||||||||  ||||||  ||||||      
T  29827194 gacattttagaccgtgcaatagcttatgcttctggccttccgttggttttagaattagtaggtcccgcgttgtttggaaagaatatagaagaatggaaat 29827293  T
Q  266 gtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttct 365  Q
     || | ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||    
T  29827294 ctatattagatagatatgaaaggattcctaataaagagatccaaaatatacttaaaataagttttgatgctttggaggaagatgaacaaggtgtttttct 29827393  T
Q  366 ggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttg 465  Q
     || || ||||||||||||||||||| | | | |  ||||||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||  ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  29827394 cgacattgcttgttgcttcaaagggtatgatttgggagaggtcaaagatattctttgtgctcatcatggtcaaagcatagaatatcatattggagtgttg 29827493  T
Q  466 gtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||    
T  29827494 gtcgaaaaaactctcatacagatta 29827518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 25539589 - 25539788
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||    |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  25539589 ggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgatacacatttattagcctgtcatgggattacaagtacacatgtagtaaaagggttgaatgagacag 25539688  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  25539689 aagctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 25539788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 311 - 490
Target Start/End: Original strand, 26938382 - 26938561
Alignment:
Q  311 agatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcga 410  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| || | | ||||| ||    
T  26938382 agatacttagagtaagctttgattgtttggatgaagaagaacaaagtgtctttctggatattacgtgttgcttcaatgggtgtagattggctgaggttga 26938481  T
Q  411 agatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  26938482 agataaacttcatgctcattatggtcattgcataaaaaatcatgttggagtgttggttaataaatctctcataaagatta 26938561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 434
Target Start/End: Original strand, 28326688 - 28326954
Alignment:
Q  168 cattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagt 267  Q
    ||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |  ||| ||   |    
T  28326688 cattttatactgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatct 28326787  T
Q  268 acactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgg 367  Q
     || || ||   ||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |    
T  28326788 gcattatatcagtatgaaaggattcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcg 28326887  T
Q  368 atatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
    | || ||||| |||||||| || | | ||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28326888 acattgcttgctgcttcaatggatatgaattgaaagaacttgaagatatacttcatgctcattatgg 28326954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 434
Target Start/End: Original strand, 28504324 - 28504590
Alignment:
Q  168 cattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagt 267  Q
    ||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |  ||| ||   |    
T  28504324 cattttatactgtgcagtaacttatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatagtagaatgtaaatct 28504423  T
Q  268 acactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgg 367  Q
     || || ||   ||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |    
T  28504424 gcattatatcagtatgaaaggattcccattaaaaagatccaagcgatacttaaagtaagctttgatgctttggatgaagatgagcagaatgtttttctcg 28504523  T
Q  368 atatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
    | || ||||| |||||||| || | | ||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28504524 acattgcttgctgcttcaatggatatgaattgaaagaacttgaagatatacttcatgctcattatgg 28504590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 434
Target Start/End: Original strand, 28186626 - 28186870
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 289  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |  ||||||   | || || ||   ||||||| ||    
T  28186626 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaagga 28186725  T
Q  290 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 389  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||  || |||| ||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28186726 ttcccgataaaaagatccaagagatactcaaagtaagctttgatgctttgggggaagcagaacaaaatgtttttctcgacatcgcttgctgcttcaaagg 28186825  T
Q  390 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
     | | ||| || |||  | |||||| |||||||||||||||||||    
T  28186826 atatgaattgaaagaacttgaagatgtacttcatgctcattatgg 28186870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27664185 - 27663865
Alignment:
Q  169 attttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagta 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |   ||  ||   |    
T  27664185 attttaaaccgtgcagttgaatatgcttctggccttccattagctttaaaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagcagattgtgagtcaa 27664086  T
Q  269 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 368  Q
    |  |||||   |||||||  |||||   |  | | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||  | || ||||||||| ||||    
T  27664085 ccttagataagtatgaaagaattccacctgaagatatccaaaagatacttaaagtaagctttgatactttggaagaagaacaacagagtgtctttttgga 27663986  T
Q  369 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtc 468  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||   ||| | ||||||   ||||||||||||||  || | ||||||||||  |||||||||     
T  27663985 tattgcttgttgcttcaaaggatgtgattgg-cagaagtttcagagacacttcaatttcattatggccattcaatgacacatcatgttagagtgttggtt 27663887  T
Q  469 gaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    ||  |||||||| |||||||||    
T  27663886 gatgaatctctcataaagatta 27663865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 434
Target Start/End: Original strand, 28244027 - 28244271
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 289  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |  ||||||   | || ||||| | |||  || ||    
T  28244027 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaagga 28244126  T
Q  290 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 389  Q
    |||| | || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28244127 ttccgattaaaaagatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaagg 28244226  T
Q  390 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
     | ||| | || |||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  28244227 atataatttgaaagaacttgaagatatactttatgctcattatgg 28244271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28296690 - 28296446
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 289  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  |  ||||||   | || ||  |   ||||||| ||    
T  28296690 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataagagaatggaaatctgcattaagtcagtatgaaagga 28296591  T
Q  290 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 389  Q
      || | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28296590 gacccattagaaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaaaaatgtttttcttgacatcgcttgctgcttcaaagg 28296491  T
Q  390 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
     | | ||| || |||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28296490 atatgaattgaaagaacttgaaaatatacttcatgctcattatgg 28296446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 434
Target Start/End: Original strand, 28515383 - 28515627
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 289  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  |  ||||||   | || ||  |   ||||||| ||    
T  28515383 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataagagaatggaaatctgcattaagtcagtatgaaagga 28515482  T
Q  290 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 389  Q
      || | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28515483 gacccattagaaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaaaaatgtttttcttgacatcgcttgctgcttcaaagg 28515582  T
Q  390 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
     | | ||| || |||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28515583 atatgaattgaaagaacttgaaaatatacttcatgctcattatgg 28515627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 253
Target Start/End: Original strand, 26636855 - 26636941
Alignment:
Q  167 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatag 253  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26636855 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatag 26636941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 253
Target Start/End: Original strand, 26742821 - 26742907
Alignment:
Q  167 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatag 253  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26742821 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatag 26742907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Original strand, 26849921 - 26850009
Alignment:
Q  167 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaa 255  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26849921 acattttaaatcgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagaa 26850009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 26950786 - 26951032
Alignment:
Q  1 cttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatggga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||    |||||||||| ||||  | | ||| || ||| || || |||  |     
T  26950786 cttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgtgacaaacatttgttatcatgtcatgggattaaaaaaatatatgaagcagatggtttaaataagg 26950885  T
Q  101 ctgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctgg 200  Q
       |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||  |  |||| | || ||    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  26950886 aacaagctcttgaattgttaagaatgatggcttttaaaagtaacaaaaatgattcaaggtatgatagtattttaaaccgtgcagttaaatatgctgctgg 26950985  T
Q  201 ccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaaga 247  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26950986 ccttccattagctttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaaga 26951032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 253
Target Start/End: Original strand, 26960334 - 26960420
Alignment:
Q  167 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatag 253  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  26960334 acattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtatag 26960420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 28782150 - 28782222
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatg 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28782150 cgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacgcatg 28782222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 489
Target Start/End: Original strand, 28140701 - 28141066
Alignment:
Q  124 tggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtag 223  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||  |||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | | |||||||||    
T  28140701 tggaaggcatttaaaaataataaagttgattcaagttatgagcacattttaaaccgtgcagttacttatgcctctggccttccattggctttagaagtag 28140800  T
Q  224 tgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagt 323  Q
    | ||||| | |||||||||||||   | |||    |||||   |||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| | || |||   |||||||||||||    
T  28140801 ttggttctagcttgtttggaaagcataaagatgagtggaaatctacattagatcggtatgaaaggattcctcataaagaggtcctgaagatacttaaagt 28140900  T
Q  324 aagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcat 423  Q
     |||| ||||  ||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||| ||| | || ||   ||||||| |||||||| ||  ||    
T  28140901 gagctttgatagtttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgttgtttcagaggatatatattagcagaggttgaagatattctctat 28141000  T
Q  424 gctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatt 489  Q
    |||||||| ||  | ||||| ||| ||||| ||  ||||||| |||| |||| |||  ||||||||    
T  28141001 gctcattacggtgaatgcatgaaatatcatattagagtgttgatcgagaaatgtctaataaagatt 28141066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 244
Target Start/End: Original strand, 25075076 - 25075153
Alignment:
Q  167 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaa 244  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25075076 acattttaaaccgtgcaattaaatatgcttctggccttccattagctttagaagttgtgggttccaacttgtttggaa 25075153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Original strand, 26812737 - 26812818
Alignment:
Q  167 acattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagag 248  Q
    |||||||||| || |||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26812737 acattttaaatcgcgcagtaaaatatacttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagag 26812818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 434
Target Start/End: Original strand, 28182451 - 28182585
Alignment:
Q  300 aaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatgg 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| | ||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||| | | | | |    
T  28182451 aaagatccaagagatacttaaagttagctatgatgctctggaggatgatgagcagaatgtttttctggacatttcttgtttcttaaaaggatatgatttg 28182550  T
Q  400 acagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
    | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28182551 aaagaagttgaagatatatttcatgctcattatgg 28182585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 490
Target Start/End: Original strand, 2186172 - 2186358
Alignment:
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgta-aatggaca 402  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||| || ||  | ||| ||||||| || || |||||||  |||||||| |||| | |||| |    
T  2186172 atccaacagatacttaaagtcagctttgatgctttgcaggaggaagataagagtctctttctcgacattgcttgttttttcaaaggatgtagactgga-a 2186270  T
Q  403 gaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  2186271 gagttccaagatatacttgatgctcattatacttattgcatcaaaaatcatattggagtgttggttgaaaaatcactcataaagatta 2186358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 253
Target Start/End: Original strand, 26978612 - 26978675
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatag 253  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26978612 tatgcttctggtcttccattagctttagaagtagtgggttcaagcttgtttggaaagagtatag 26978675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28097253 - 28097152
Alignment:
Q  330 tgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcat 429  Q
    ||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||  |||||||    
T  28097253 tgatgctttggaggaagatgagaggagtgtttttctcgacattgcttgttgcttcaaagggtataaattgaaagaggtggaagatatgctttgtgctcat 28097154  T
Q  430 ta 431  Q
    ||    
T  28097153 ta 28097152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Original strand, 25074913 - 25074953
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 44  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074913 ggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 25074953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 447
Target Start/End: Original strand, 25075213 - 25075356
Alignment:
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||  ||||| ||| | ||     
T  25075213 atccaaaaaatacttaaagtaagctttgacgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgtttctttaattggtgtgaatcggcat 25075312  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaa 447  Q
    | |||||||| |||||| |   ||||||||| ||||||||||||    
T  25075313 atgtcgaagagatacttgaatatcattatggtcattgcataaaa 25075356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 26975994 - 26976037
Alignment:
Q  1 cttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 44  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975994 cttggtcatggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 26976037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 31289312 - 31289355
Alignment:
Q  1 cttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 44  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31289312 cttggtcctggaagcagagtcatcattaccacttgagacaaaca 31289355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Original strand, 26978726 - 26978800
Alignment:
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgt 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26978726 atccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgt 26978800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Original strand, 28240679 - 28240778
Alignment:
Q  280 tatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgtt 379  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||    | ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  28240679 tatgaaaggattccaaataaagagatccaaaagatacttaaagt----tttgatgctttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgtt 28240774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 26849755 - 26849796
Alignment:
Q  1 cttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaa 42  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26849755 cttggtcatggtagcagagtcatcattaccactcgagacaaa 26849796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Original strand, 28228192 - 28228241
Alignment:
Q  198 tggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaaga 247  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28228192 tggcattccattggttttagaagtagtgggttcaaacttgtttgggaaga 28228241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Original strand, 28240589 - 28240642
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttgga 243  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28240589 tatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttgga 28240642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27529938 - 27529898
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27529938 atgtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 27529898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 26636689 - 26636732
Alignment:
Q  1 cttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 44  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26636689 cttggtcgtggcagcagagtaatcatcaccactcgagacaaaca 26636732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 26742655 - 26742698
Alignment:
Q  1 cttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 44  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26742655 cttggtcgtggcagcagagtaatcatcaccactcgagacaaaca 26742698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 525 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27697219 - 27697180
Alignment:
Q  525 tgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27697219 tgtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 27697180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Original strand, 2186064 - 2186114
Alignment:
Q  196 tctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaag 246  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2186064 tctggccttccattagctttagaagtagtgggttctgacttgtctggaaag 2186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 526 - 564
Target Start/End: Original strand, 25075432 - 25075470
Alignment:
Q  526 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25075432 gtgacattacatgacttgttagaggacatgggtaaagaa 25075470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 526 - 564
Target Start/End: Original strand, 26850277 - 26850315
Alignment:
Q  526 gtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26850277 gtgacattacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 26850315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Original strand, 26960471 - 26960545
Alignment:
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgt 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26960471 atccaaaagatacttaaagtaagctatgacgctttggctgaagaacaacagagtgtctttttggatattgcttgt 26960545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 27664335 - 27664305
Alignment:
Q  10 ggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27664335 ggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 27664305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 28182361 - 28182407
Alignment:
Q  201 ccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaaga 247  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28182361 ccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 28182407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 43
Target Start/End: Original strand, 28240409 - 28240439
Alignment:
Q  13 agcagagtcatcattaccactcgagacaaac 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28240409 agcagagtcatcattaccactcgagacaaac 28240439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 26938244 - 26938317
Alignment:
Q  173 taaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaag 246  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||  | ||||||||||||    
T  26938244 taaaccgtgcaattaaatacgcttctggccttccattagctttagaagttgtaggttcccatttgtttggaaag 26938317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 433
Target Start/End: Original strand, 29469534 - 29469687
Alignment:
Q  280 tatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgtt 379  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  || | |||| |||||||||  ||||||| ||| |   ||| ||||| || || || || |    
T  29469534 tatgaaaggattcctgataaaaagatccaaacgatactacaacttagctttgatgctttgcaggaagaagagaagtctgtttttcttgacattgcctgct 29469633  T
Q  380 gcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatg 433  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  29469634 gcttcaaaggatataaatggacaagggtagaacaaatacttaatgctcattatg 29469687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29727821 - 29727656
Alignment:
Q  269 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 368  Q
    |||||||| | || ||||| |||||| ||| ||||||||||  || |||  |||| |||| ||||||| | ||||| || ||| |   ||| ||||| ||    
T  29727821 cactagatcgttacgaaaaaattcctcataaaaagatccaaatgacactacaagtgagctttgatgctctggaggacgaagagaagtttgtttttcttga 29727722  T
Q  369 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||  |||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  29727721 cattgcttgttgcttcaaaggatggaaattaacaagggtcgaagaaatacttcatgttcatcatgg 29727656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 25484607 - 25484647
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25484607 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 25484647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 25512439 - 25512479
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25512439 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 25512479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 25546531 - 25546571
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25546531 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 25546571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 26057470 - 26057510
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26057470 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 26057510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 26077440 - 26077480
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26077440 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 26077480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 26144416 - 26144456
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26144416 atgtgaccttacatgacttgatagaggacatgggtaaagaa 26144456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 40
Target Start/End: Original strand, 26812574 - 26812610
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 40  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26812574 ggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagaca 26812610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 487
Target Start/End: Original strand, 26812889 - 26813057
Alignment:
Q  319 aaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatac 418  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||| ||  | ||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  || | || | |||||| | ||||    
T  26812889 aaagtaagctttgatgctttggacaaagaagaaaagagtgtttttttggatattgtatgttgctttaaagggtgtccattggcatatgtcgaaaaaatac 26812988  T
Q  419 ttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaaga 487  Q
    | |||  |||||||||  |||||||||||   ||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26812989 tccattttcattatggatattgcataaaaagccacattggagtgttggttgaaaaatctctcataaaga 26813057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 28141089 - 28141129
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28141089 atgtgacattacatgacttgatagaggagatgggtaaagaa 28141129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28126811 - 28126315
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |||  ||      
T  28126811 ggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgcggtaaaagggttgtatgtaacaa 28126712  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||| || ||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  28126711 aagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaaccgggcagtttcatatgcttcaggcct 28126612  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28126611 tcccttagttatagaaatagtgggttccaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattccaaataaaaag 28126512  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||||    
T  28126511 atccaagagatatttaaactaagctatgatgctttggaggaagatgagcaaagtgtctttctcgatatagcttgctgcttcaaagggtatagattgacag 28126412  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaata 500  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28126411 aggttgaaaagatacttcatgctcattatggccattgcataaagcatcatgttggagtgttggttgaaaaatctctcattgagattaatactcaata 28126315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 267471 - 267000
Alignment:
Q  9 tggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagct 108  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  267471 tggaagcagagtcgtcgttaccactcgagacaagcaattactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgaagtagaagggttgtatgggaccgaagct 267372  T
Q  109 cttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccat 208  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||| |||  |||| | || |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  267371 cttgaattgttgagttggatggcttttaaaaatgatccagttccatcaatttacaatgagattttaattcgtgcagttgcttatgcttctggccttccgt 267272  T
Q  209 tagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcca 308  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  267271 tagttttagaaattgtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagggtacattagatgggtatgataagattcccaataaagagatcca 267172  T
Q  309 agagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtc 408  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| | | |||||  ||| | |    
T  267171 aaagatacttaaagtgagctatgatggtttggaagaagaggagcagagtgtctttttagacattgcttgttgcttcaaaggatatgaatgggaagatgcc 267072  T
Q  409 gaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  267071 aaacatatacttcattctcattatggccactgcataacacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctc 267000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 214 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 28132427 - 28132140
Alignment:
Q  214 atagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagaga 313  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28132427 atagaaatagtgggttcaaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagtgtacattagatggatatgaaaagattcctaataaaaagatccatgaga 28132328  T
Q  314 tacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaaga 413  Q
    || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||  |||||||||    
T  28132327 tatttaaagtaagttacgatgctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaggggtatagattgacaatggtcgaaga 28132228  T
Q  414 tatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaatac 501  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||    
T  28132227 gatacttcatgctcataatggccattgcataaaacatcatgttggagtgttggtcgaaaaatctctcatagagattaagactcgatac 28132140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28163512 - 28163298
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| |    
T  28163512 ggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcattcggtagaagggttgtatgggacgg 28163413  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28163412 aagcgcttgaattgttgacgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaagatgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggcct 28163313  T
Q  204 tccattagttataga 218  Q
    ||| |||||||||||    
T  28163312 tcccttagttataga 28163298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 26136931 - 26137422
Alignment:
Q  1 cttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatggga 100  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    |||||||||| ||||| | | ||| ||| ||    || |||  |     
T  26136931 cttggtcctgggagtagagtcatcattaccacccgagacaaacatttgctatcatgtcatgggattaaaagaatatatgaagtcgatttcttaaataagg 26137030  T
Q  101 ctgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctgg 200  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   |   ||| |||| ||  | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26137031 atgaagctcttgaattgtttaggtggatggcttttaaaagtaaccacaatgactcaagttatgattatattttaaacagtgcagttaaatatgcttctgg 26137130  T
Q  201 ccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaataca 300  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |  |  |||| |   |||| || |    ||||||| ||||||  ||  |    
T  26137131 ccttccgttagctttagaagtagtgggttccagcttgtttggaaagtgtacaacagaatgggaatctacattacagaagtatgaaaggattccacatgaa 26137230  T
Q  301 aagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatgga 400  Q
     | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26137231 gatatccaaaacatacttagagtaagctatgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtatttttggatattgcttgttgcttcaaagggtgtaaattga 26137330  T
Q  401 cagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaat 492  Q
    |||| ||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||| ||||| | |||||||||    
T  26137331 cagaagtccaaaagatacttcatgctcgttatgaccattgcataaaaagtcatgttggagtgttggttgataaagctctcatgaagattaat 26137422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5922342 - 5922220
Alignment:
Q  267 tacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctg 366  Q
    |||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||| |||  | | || ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||     
T  5922342 tacattagatcgttatgaaaggattcctgataaaaagatgcaaacgttgctaaaagtgagctttgatgctttggaagaagaagagaaaagtgtttttctt 5922243  T
Q  367 gatatagcttgttgcttcaaagg 389  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5922242 gatattgcttgttgcttcaaagg 5922220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 266980 - 266940
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  266980 atgtgacattacatgacatgatagaggacatgggtaaagaa 266940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2672 - 2192
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2672 cgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaag 2573  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2572 ctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 2473  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||    
T  2472 gttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatggaagaatacattagatgggtatgacaggattcccaataaagagatc 2373  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||  ||| |    
T  2372 caaaagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaagatgtaaatgggaagatg 2273  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaaga 487  Q
     | || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2272 ccaaatatatacttaattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtgttggttgaaaaatctctcataaaga 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 490
Target Start/End: Original strand, 8536 - 9019
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || |||| || ||||    
T  8536 cgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaag 8635  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8636 ctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcc 8735  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8736 cttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatc 8835  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||  |||||  |||     
T  8836 cacgagatacttaaagtaagttatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaaggatgtggatggaaggagt 8935  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  8936 ttgaagatatactacgtgctcattatggccattgcataaaacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatta 9019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 9050 - 9090
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  9050 atgtgacattacatgactttatagaggacatgggtaaagaa 9090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12808 - 12325
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || |||| || ||||    
T  12808 cgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaag 12709  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12708 ctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcc 12609  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12608 cttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatc 12509  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||  |||||  |||     
T  12508 cacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaaggatgtggatggaaggagt 12409  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  12408 ttgaatatatacttcgtgctcattatggccatcgcataacacatcatctagtagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatta 12325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3362
Alignment:
Q  9 tggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagct 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| || ||||||| ||||||    
T  3843 tggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaagaagtcatgggatagaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagct 3744  T
Q  109 cttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccat 208  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| | | | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  3743 cttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttccct 3644  T
Q  209 tagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcca 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3643 tagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaagatcca 3544  T
Q  309 agagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtc 408  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||  ||||   ||| |     
T  3543 ccagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaaggatgtggatgggaggagttt 3444  T
Q  409 gaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatta 490  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  3443 gaatatatacttcgtgctcattatggccatcgcataacacatcatctagtagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatta 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 29272971 - 29272498
Alignment:
Q  7 cgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaag 106  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||  |||    
T  29272971 cgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttgctaacttgtcatgggataaaaagtatgcatgaagtagaagggctgtatgggacaaaag 29272872  T
Q  107 ctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29272871 ctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaatttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcc 29272772  T
Q  207 attagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatc 306  Q
     |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  29272771 cttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaagattcccaataaaaggatc 29272672  T
Q  307 caagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagagg 406  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |    
T  29272671 caccagatacttaaagtaagttatgatgctttggaagaagagcaacaaagtgtctttctggacattgcttgttgcttcaaaggttgtgaatgggaagatg 29272572  T
Q  407 tcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
     | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||  ||||||||||||    
T  29272571 ccaaatatatacttcattctcattatggccattgcataacacatcatctaggagtattggctgaaaaatctctc 29272498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 490
Target Start/End: Original strand, 35984621 - 35984837
Alignment:
Q  280 tatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgtt 379  Q
    |||||||  |||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  35984621 tatgaaaccattcctaataaagacatccaaaagatacttaaagtaagttttgatgctttagaggaagatgagcaaagtgtttttcttgacattgcttgtt 35984720  T
Q  380 gcttcaaagg-----gtg-taaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaa 473  Q
     || |  |||      || ||||| | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||    |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  35984721 tctacggaggaacaaatgataaattggcagatgtagaaaatatgcttcatgctcattatgatgcttgcatgaaatatcatattggagtattggttgaaaa 35984820  T
Q  474 atctctcttaaagatta 490  Q
    ||||||| |||||||||    
T  35984821 atctctcataaagatta 35984837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 434
Target Start/End: Original strand, 12590144 - 12590217
Alignment:
Q  361 tttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12590144 tttcttgatattgcttgttgcttcaaaggatggaaattgacaagggtcgaagaaatacttcatgctcatcatgg 12590217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 60615 - 61091
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    |||||| |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  60615 ggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacag 60714  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  60715 aagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 60814  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||    
T  60815 tccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaagattcccaataaagag 60914  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||  |     
T  60915 atccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggttgtaaatgggaaa 61014  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  61015 aggtcaaagaaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatgtctc 61091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 18074807 - 18075283
Alignment:
Q  4 ggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactg 103  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    |||||| |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  18074807 ggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacag 18074906  T
Q  104 aagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  18074907 aagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 18075006  T
Q  204 tccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaag 303  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||    
T  18075007 tccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatgcaagaatacattagattggtatgaaaagattcccaataaagag 18075106  T
Q  304 atccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacag 403  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||  |     
T  18075107 atccaaagaatacttaaagtgagctatgattctttggaggaagaggagcaaagtgtctttctagacattgcttgttgcttcaaaggttgtaaatgggaaa 18075206  T
Q  404 aggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctc 480  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  18075207 aggtcaaagaaatacttcatgctcattatggtcattgcataaatcatcatgttgaagtgctagttgaaaaatgtctc 18075283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 18654605 - 18654167
Alignment:
Q  8 gtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||| ||  |  |    | ||    
T  18654605 gtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgc 18654506  T
Q  108 tcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcca 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18654505 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaatttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagttgcgtatgcttctggccttcca 18654406  T
Q  208 ttagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcc 307  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||  |   |||| |||||   |||||||  |||||  ||  | | ||||    
T  18654405 ttagctatagaagtcgtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgaatctacattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatcc 18654306  T
Q  308 aagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggt 407  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||| || | |||| ||    
T  18654305 aaaagatacttaaagtaagttttgatgctttggatgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttgttcaaaggatgtagattggcagaagt 18654206  T
Q  408 cgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaa 446  Q
    |||||| ||||||||   |||||||||  ||||||||||    
T  18654205 cgaagagatacttcaaagtcattatggttattgcataaa 18654167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18678688 - 18678274
Alignment:
Q  8 gtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||| ||  | ||    | ||    
T  18678688 gtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgc 18678589  T
Q  108 tcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcca 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18678588 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaacgtgcagttgtgtatgcttctggccttcca 18678489  T
Q  208 ttagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcc 307  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   |  |||  ||  |||| |||||   |||||||  |||||  ||  | | ||||    
T  18678488 ttagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatatttcagaatgtgagtctacattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatcc 18678389  T
Q  308 aagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggt 407  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||| ||    
T  18678388 aaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaattgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtagattggcagaagt 18678289  T
Q  408 cgaagatatacttca 422  Q
    |||||| ||||||||    
T  18678288 cgaagagatacttca 18678274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18723115 - 18722799
Alignment:
Q  106 gctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttc 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18723115 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgagcagttgcgtatgcttctggccttc 18723016  T
Q  206 cattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagat 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||  ||  |||| |||||   |||||||  |||||  ||  | | ||    
T  18723015 cattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtattgcagaatgtgagtctacattagatatgtatgaaagaattccagatgaagatat 18722916  T
Q  306 ccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagag 405  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | ||||     
T  18722915 ccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttgggcgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtagattggcagaa 18722816  T
Q  406 gtcgaagatatacttca 422  Q
    |||||||| ||||||||    
T  18722815 gtcgaagagatacttca 18722799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 106 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 18688656 - 18688316
Alignment:
Q  106 gctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttc 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  18688656 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 18688557  T
Q  206 cattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagat 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||  ||  |||| |||||   ||| |||  ||||| ||   | | ||    
T  18688556 cattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatttcagaatgtgagtctacattagataagtatcaaagaattccaaacgaagatat 18688457  T
Q  306 ccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagag 405  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | || |     
T  18688456 ccaaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtatattggcaaaa 18688357  T
Q  406 gtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaa 446  Q
    |||||||| |||||| |   |||||||||  ||||||||||    
T  18688356 gtcgaagagatacttaaacttcattatggttattgcataaa 18688316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18730632 - 18730218
Alignment:
Q  8 gtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagc 107  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||| ||  |  |    | ||    
T  18730632 gtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgc 18730533  T
Q  108 tcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcca 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18730532 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttcca 18730433  T
Q  208 ttagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcc 307  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | |  |||  |   |||| |||||   |||||||  |||||  ||  | | ||||    
T  18730432 ttagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgattctacattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatcc 18730333  T
Q  308 aagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggt 407  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || | |||| ||    
T  18730332 aaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgtagattggcagaagt 18730233  T
Q  408 cgaagatatacttca 422  Q
    |||||| ||||||||    
T  18730232 cgaagagatacttca 18730218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18698528 - 18698142
Alignment:
Q  8 gtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||| ||  |  |    | ||    
T  18698528 gtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgc 18698429  T
Q  108 tcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttcca 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18698428 tcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttcca 18698329  T
Q  208 ttagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatcc 307  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | |  |||  |   |||| |||||   |||||||  |||||  ||  | | ||||    
T  18698328 ttagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagttttgcagaatgtgactctacattagataagtatgaaagaattccacatgaagatatcc 18698229  T
Q  308 aagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgta 394  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  18698228 aaaagatacttaaagtaagctttgatgctttggacgaagaacaacaaagtgtctttttggatattgcttgtttcttcaaaggatgta 18698142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5090088 - 5089601
Alignment:
Q  2 ttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggac 101  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||  | |  ||| | | |||||| || || |||| ||     
T  5090088 ttggtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggattgatataacatacgaagtagatggtttaaatgagaa 5089989  T
Q  102 tgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggc 201  Q
     ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |  ||  |||  | || |||| ||||  |||||||||||||  ||  | ||||||||||||    
T  5089988 cgaagctcttcaattattaaggtggaaggcttttaaaaatagtactgttaatccaagttatgaaggaattttaaaccgtgtggtaacttatgcttctggc 5089889  T
Q  202 cttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaa 301  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||||   |  ||||||||  ||||||| ||||||||||| |     
T  5089888 cttccattggctttagaagttgtgggttccaatttgtttggaaaggatatagaaaaatggaaatctttactagatgagtatgaaaggattcctaataaag 5089789  T
Q  302 agatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggac 401  Q
    | |||||| ||||||||| ||| |||| | ||  |||||  ||| | ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| | ||  | |      
T  5089788 aaatccaaaagatacttatagtgagctttaataatttaggtgaatatgagcagagtgttttcctcgacattgcttgttgtttcaaaggatatagcttgga 5089689  T
Q  402 agaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatt 489  Q
     ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||| ||||| | | |  |||||| || ||||||||| ||||||||    
T  5089688 tgaggtcgaatatatactttgtgctcattatggttattgcatgaaatatcatataggaaagttggttgataaatctctcataaagatt 5089601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 522 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 18730133 - 18730091
Alignment:
Q  522 tgatgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18730133 tgatgtgacattacatgacttgctagaggtcatgggtaaagaa 18730091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 190 - 490
Target Start/End: Original strand, 1 - 301
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 289  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtacattagatggatatgaaaaga 100  T
Q  290 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 389  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  101 ttcccaataaaaagatccacgagatacttaaagtaagctatgatgctttggaggaagagcagcaaagtgtttttctagacattgcctgttgcttcaaagg 200  T
Q  390 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagatt 489  Q
     |||  |||||  ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  201 atgtggatggaaggagtttgaagatatactacgtgctcattatggccattgcataaaacatcatctaggagtgttggctgaaaaatctctcgttaagatt 300  T
Q  490 a 490  Q
    |    
T  301 a 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 564
Target Start/End: Original strand, 332 - 372
Alignment:
Q  524 atgtgacattacatgacttggtggaggacatgggtaaagaa 564  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  332 atgtgacattacatgactttatagaggacatgggtaaagaa 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 17992354 - 17991854
Alignment:
Q  1 cttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatggga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   |||||||||| ||||  | | ||| |||||| || || |||| |     
T  17992354 cttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacatttgttaacatgtcatgggattaaaacaatatatgaagtagatggattaaatgagg 17992255  T
Q  101 ctgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctgg 200  Q
      |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |  |  || ||  |||  ||||  |  | ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  17992254 aagaagctcttgaactgttaaggtggaaggcatttaaaggcaacgaaattgattctagttataactatattttaaaccgtgtagttaaatatgctgctgg 17992155  T
Q  201 ccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaataca 300  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |   |||||  || || | |||   ||||||| ||| ||   |  |    
T  17992154 cctcccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagtgtttagcagattggaaatgtgcattggataagtatgaaaggataccacctgaa 17992055  T
Q  301 aagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatgga 400  Q
     | |||||| | ||||| ||| |||||| ||||||| | || |||||  |  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |  || |     
T  17992054 gatatccaaaatatactaaaaataagctttgatgctctggatgaagaacaaaagagtgtctttttggatattgcttgttgcttcaaagagcatgtattgg 17991955  T
Q  401 cagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaatactcaata 500  Q
    || | |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||  | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17991954 catatgtcgaagaaatgcttcatggtcattatggtcattgcataaaaagccacctcgaagtgttggttgataaatctctcataaagattaatactaaata 17991855  T
Q  501 c 501  Q
    |    
T  17991854 c 17991854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 391
Target Start/End: Original strand, 3280979 - 3281092
Alignment:
Q  278 gatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttg 377  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||    
T  3280979 gatatgaaaggattcctaataaagagattcagaagatacttaaagtgagttttgatgctttggaggaagacgagcaaagtgtttttctcgacattgcttg 3281078  T
Q  378 ttgcttcaaagggt 391  Q
    |||||| |||||||    
T  3281079 ttgctttaaagggt 3281092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 247
Target Start/End: Original strand, 3280891 - 3280948
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaaga 247  Q
    |||||||||||||||||||| |   |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3280891 tatgcttctggccttccattggcattagaagtattaggttccaacttgtttggaaaga 3280948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 242
Target Start/End: Original strand, 17713508 - 17713581
Alignment:
Q  169 attttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttgg 242  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | | |||||| | |||||  ||||||||||    
T  17713508 atttcaaaccgtgcagtttcttatgcttctggccttccattggctttggaagtaataggttctcacttgtttgg 17713581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 242
Target Start/End: Original strand, 17662487 - 17662555
Alignment:
Q  174 aaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttgg 242  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | | |||||| | |||||  ||||||||||    
T  17662487 aaaccgtgcagtttcttatgcttctggccttccattggctttggaagtaataggttctcacttgtttgg 17662555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 434
Target Start/End: Original strand, 44189 - 44433
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 289  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |  ||||||   | || ||||| | |||  || ||    
T  44189 tatgcttctggccttccattggctttagaagtagtgggttcaaacttatttggaaataatataggagaatggaaatctgcattagatcggtatagaagga 44288  T
Q  290 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 389  Q
    |||| | || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  44289 ttccgattaaaaagatacaggagatacttaaagtaagctttgatgctttggagaaagatgagcagaatgtttttctcgacattgcttgctgcttcaaagg 44388  T
Q  390 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
     | ||| | || |||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  44389 atataatttgaaagaacttgaagatatactttatgctcattatgg 44433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Original strand, 40841 - 40940
Alignment:
Q  280 tatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgtt 379  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||    | ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  40841 tatgaaaggattccaaataaagagatccaaaagatacttaaagt----tttgatgctttggagaaagatgagcaaagtgtttttctcgacattgcttgtt 40936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Original strand, 28690 - 28739
Alignment:
Q  198 tggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaaga 247  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28690 tggcattccattggttttagaagtagtgggttcaaacttgtttgggaaga 28739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Original strand, 40751 - 40804
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttgga 243  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40751 tatgcttctggcctaccattagctttagaagtagttggttccaacttgtttgga 40804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 43
Target Start/End: Original strand, 40571 - 40601
Alignment:
Q  13 agcagagtcatcattaccactcgagacaaac 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40571 agcagagtcatcattaccactcgagacaaac 40601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 57244 - 56946
Alignment:
Q  190 tatgcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaaga 289  Q
    |||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |  ||||||   | || || ||   ||||||| ||    
T  57244 tatgcttcaggccttccattggccttagaagtagtgggttcgaacttgtttggaaagaatataggagaatggaaatctgcattaaatcagtatgaaagga 57145  T
Q  290 ttcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagg 389  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | | ||| ||||| || ||  |||||| |||  ||||    
T  57144 ttcccattaaaaagatccaagagatacttaaagtaagctttgatgctttggaggaagatgagaagaatgtttttctcgacatttcttgtttcttagaagg 57045  T
Q  390 gtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagat 488  Q
     ||| | |  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||  ||  |||||||   |||||||||||| |||||||    
T  57044 atgtgatttaaaagaagttgaagatatacttcatgctcattatggtagctgcatgaaacatcaaattagagtgttgcatgaaaaatctctcataaagat 56946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 492
Target Start/End: Original strand, 16691911 - 16692401
Alignment:
Q  2 ttggtcgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggac 101  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  | || | | ||| ||| || || || |||||       
T  16691911 ttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacaagtcatggtattgatagaatatatgaagtggatggtttaaatggaga 16692010  T
Q  102 tgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggc 201  Q
     |||||||| ||| | || ||||||| | ||||||||| | | |||||   |||| ||| |||  ||||||||||   ||  ||  | ||||||||||||    
T  16692011 agaagctctagaactattgaggtggaagacttttaaaaataacaaagtcgattcaagtttcgagtacattttaaaatatgttgtaacttatgcttctggc 16692110  T
Q  202 cttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaatatggaagagtacactagatggatatgaaaagattcctaatacaa 301  Q
    |||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||  ||||||   |||| | ||| ||||||||  |||||||  || |     
T  16692111 cttccattagctttagaagtagtaggatctaacttgtttggaaagaatatagaagaatggaaatctacatttgatcgatatgaatggattcctggtaaac 16692210  T
Q  302 agatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctggatatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggac 401  Q
      || ||  | |||||||||||||| | ||||  ||| |||||||| ||  | ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| | | | | |||    
T  16692211 gaattcacaaaatacttaaagtaagttttgatagtttggaggaagatgaaaagagtgtttttttggacattgcttgttgcttcaaaggatatgatttgac 16692310  T
Q  402 agaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaaaatctctcttaaagattaat 492  Q
     || || ||   |||||||  ||||||||||||  | ||||||||| | ||| ||| ||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  16692311 ggaagttgagtttatactttgtgctcattatggtaaatgcataaaataccatattggagtattggttgaaaaatcccttataaagattaat 16692401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 429
Target Start/End: Original strand, 13717615 - 13717671
Alignment:
Q  373 gcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcat 429  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  13717615 gcttgttgcttcaaaggatataaatcgacaaaggtcaaagaaatacttcatgctcat 13717671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 238736 - 238571
Alignment:
Q  269 cactagatggatatgaaaagattcctaatacaaagatccaagagatacttaaagtaagctatgatgctttagaggaagaggagcaaagtgtctttctgga 368  Q
    |||||||| | | ||||||  ||||| ||| ||||||||||  || |||  || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| ||    
T  238736 cactagatcgttttgaaaaagttcctcataaaaagatccaaatgacactacaactaagctatgatgctttacaggaagaagagaaaattgtttttcttga 238637  T
Q  369 tatagcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatgg 434  Q
     || || |||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||| | || ||| |||||||| ||||    
T  238636 cattgcatgttgcttcaaaggatataaattgacaagggtcgaacaaattctttatgctcatcatgg 238571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 485
Target Start/End: Original strand, 615211 - 615323
Alignment:
Q  373 gcttgttgcttcaaagggtgtaaatggacagaggtcgaagatatacttcatgctcattatggccattgcataaaacatcatgttgaagtgttggtcgaaa 472  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| ||||  || | |||||||| ||||    
T  615211 gcttgttgcttcaaaggatggaaattgacaagggttgaagaaatacttcatgctcattatggtgatatcatgaaagatcacattaatgtgttggtggaaa 615310  T
Q  473 aatctctcttaaa 485  Q
    |||||||| ||||    
T  615311 aatctctcataaa 615323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University