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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF18519_low_3 (Length: 251)
Name: NF18519_low_3
Description: NF18519
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18519_low_3 |
 | |
|
| [»] chr8 (8 HSPs) |
| |
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| [»] chr4 (8 HSPs) |
| |
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| [»] chr3 (5 HSPs) |
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| [»] chr2 (7 HSPs) |
| |
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| [»] chr1 (11 HSPs) |
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| [»] chr6 (3 HSPs) |
| |
|
| [»] chr5 (7 HSPs) |
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|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 30982804 - 30983041
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30982804 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
30982903 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30982904 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
30983003 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30983004 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
30983041 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 34774023 - 34774260
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34774023 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
34774122 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34774123 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
34774222 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34774223 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
34774260 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30211086 - 30210849
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30211086 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
30210987 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30210986 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
30210887 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30210886 |
caaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
30210849 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 193888 - 193652
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
193888 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaa-ttacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaacta |
193790 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193789 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
193690 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193689 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
193652 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 721492 - 721256
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
721492 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaa-ttacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaacta |
721394 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
721393 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
721294 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
721293 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
721256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 882599 - 882363
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
882599 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaa-ttacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaacta |
882501 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
882500 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
882401 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
882400 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
882363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44240622 - 44240387
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44240622 |
aatataagttattacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
44240525 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44240524 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
44240425 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44240424 |
cgaacgcgatccatctctgatgacgaaactatatttaa |
44240387 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31778752 - 31778710
Alignment:
| Q |
66 |
aatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaa |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
31778752 |
aatagaatttaaagttcaatatagtactaaaatattattacaa |
31778710 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 24035795 - 24036032
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24035795 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
24035894 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24035895 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
24035994 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24035995 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
24036032 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24247049 - 24246812
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24247049 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
24246950 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24246949 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
24246850 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24246849 |
cgaacgcgatccatctctgacgatgaaactacatttaa |
24246812 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 56561008 - 56560773
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
56561008 |
aatataagttattacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
56560911 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56560910 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
56560811 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56560810 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
56560773 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 49128160 - 49128013
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49128160 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
49128061 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagt |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49128060 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagt |
49128013 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Original strand, 39382613 - 39382748
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39382613 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
39382712 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatata |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39382713 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatata |
39382748 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 251
Target Start/End: Original strand, 52056607 - 52056811
Alignment:
| Q |
45 |
aaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattg |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
52056607 |
aaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgtattatggtattaaaatattg |
52056704 |
T |
|
| Q |
145 |
atataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaacgcgatccatctctgacgacgaaacta |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
52056705 |
atataataatttaaagaacaatattaattattttgcatgtgctcaataatttgattgcagattatgtttcgaacgtgatccatctctgacgaggaaacta |
52056804 |
T |
|
| Q |
245 |
catttaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
52056805 |
catttaa |
52056811 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 51833963 - 51834116
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51833963 |
aatataagttattacaatattaacagcaagaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaacagagtattaaaatataattacaaaacta |
51834062 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaata |
167 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51834063 |
atttaatgtgtatcataatactaaaatattgatataataatttaaagtaaaata |
51834116 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 251
Target Start/End: Original strand, 31430944 - 31430981
Alignment:
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31430944 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
31430981 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 51124964 - 51125201
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51124964 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
51125063 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51125064 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
51125163 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51125164 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
51125201 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52693044 - 52692807
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52693044 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
52692945 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52692944 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
52692845 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52692844 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
52692807 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38469685 - 38469448
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38469685 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
38469586 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38469585 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
38469486 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38469485 |
tgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
38469448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1528010 - 1527826
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1528010 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
1527911 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttca |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1527910 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttca |
1527826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 47140944 - 47141080
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47140944 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
47141043 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47141044 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataa |
47141080 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14380609 - 14380372
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14380609 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
14380510 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14380509 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
14380410 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14380409 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
14380372 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 31686514 - 31686751
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31686514 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
31686613 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31686614 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
31686713 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31686714 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
31686751 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31787152 - 31786924
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31787152 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
31787053 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31787052 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
31786953 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaac |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31786952 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaac |
31786924 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40255012 - 40254824
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40255012 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
40254913 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgc |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40254912 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgc |
40254824 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13896496 - 13896264
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13896496 |
aatataagttattacaatactaatag---gaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
13896402 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13896401 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgtctgtgctcaataattttattgcggattatgttt |
13896302 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13896301 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
13896264 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14037113 - 14036881
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14037113 |
aatataagttattacaatactaatag---gaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
14037019 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14037018 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgtctgtgctcaataattttattgcggattatgttt |
14036919 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14036918 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
14036881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Original strand, 2443126 - 2443280
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2443126 |
aatataagttattacaatactaacaacatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaatatattattacaaaacta |
2443225 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatact |
169 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2443226 |
atttaatgtgtatcataatactaaaatattgatataa-aatttaaagtacaatact |
2443280 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 5271200 - 5271437
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5271200 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
5271299 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5271300 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
5271399 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5271400 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
5271437 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 50978520 - 50978757
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50978520 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
50978619 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50978620 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
50978719 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50978720 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
50978757 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 51488069 - 51488306
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51488069 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
51488168 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51488169 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
51488268 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51488269 |
cgaacgcgatccatctctgacgatgaaactacatttaa |
51488306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 7592899 - 7593122
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7592899 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtacaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
7592998 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7592999 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
7593098 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgac |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7593099 |
cgaacgcgatccatctctgacgac |
7593122 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38843819 - 38843631
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38843819 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
38843720 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgc |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38843719 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgc |
38843631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46407988 - 46407753
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46407988 |
aatataagttattacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
46407891 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46407890 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
46407791 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46407790 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
46407753 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 26999985 - 27000141
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26999985 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
27000084 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatacta |
170 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27000085 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatacta |
27000141 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35606830 - 35606595
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35606830 |
aatataggttattacaatacaaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
35606733 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35606732 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcatgtgctcaataatttgattgcgggttatgttt |
35606633 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35606632 |
cgaatgtgatccatctctgacgacaaaactacatttaa |
35606595 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27576348 - 27576188
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27576348 |
aatataagttattacaatactaacagtatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaattttattacaaaacta |
27576249 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
174 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27576248 |
atttaatgtgtatcatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
27576188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15353662 - 15353534
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15353662 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
15353563 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatat |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15353562 |
acataatgtgtattatagtactaaaatat |
15353534 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 26821839 - 26821785
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataat |
68 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26821839 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataat |
26821785 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30019722 - 30019485
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30019722 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
30019623 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30019622 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaataataattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
30019523 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30019522 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
30019485 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 21515286 - 21515521
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21515286 |
aatataagttattacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
21515383 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21515384 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaaaaacaataataattatattgactgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
21515483 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21515484 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
21515521 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 31745911 - 31746072
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatta-caaaact |
112 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31745911 |
aatataagttattacaatactaacagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattaccaaaact |
31746010 |
T |
|
| Q |
113 |
aacataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
174 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31746011 |
aatttaatgtgtatcatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
31746072 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 29542015 - 29542252
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29542015 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
29542114 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29542115 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
29542214 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29542215 |
cgaacgcgatccatctctgacgatgaaactacatttaa |
29542252 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42663879 - 42663660
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42663879 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagattattaaaatattattacaaaacta |
42663780 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42663779 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
42663680 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctga |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42663679 |
cgaacgcggtccatctctga |
42663660 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Original strand, 3260531 - 3260725
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3260531 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
3260630 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggatta |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3260631 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggatta |
3260725 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 27738146 - 27738381
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27738146 |
aatataagttattacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
27738243 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27738244 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
27738343 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27738344 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
27738381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33232957 - 33232722
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33232957 |
aatataagttattacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaacta |
33232860 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
213 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33232859 |
atttaaagtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaaaaacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgttt |
33232760 |
T |
|
| Q |
214 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33232759 |
cgaacgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
33232722 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 7071619 - 7071850
Alignment:
| Q |
18 |
taaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacat |
117 |
Q |
| |
|
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| T |
7071619 |
taagttattacaatactaataccatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaattt |
7071716 |
T |
|
| Q |
118 |
aatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattgcggattatgtttcgaa |
217 |
Q |
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| T |
7071717 |
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7071816 |
T |
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| Q |
218 |
cgcgatccatctctgacgacgaaactacatttaa |
251 |
Q |
| |
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| T |
7071817 |
cgtgattcatttctgacgacgaaactacatttaa |
7071850 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 32728858 - 32728908
Alignment:
| Q |
23 |
tattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaat |
73 |
Q |
| |
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| T |
32728858 |
tattacaatactaataccagggaaataaaagttacaaatagataatagaat |
32728908 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 31012190 - 31012377
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
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| T |
31012190 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
31012289 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattg |
201 |
Q |
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| T |
31012290 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttcattg |
31012377 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 25341171 - 25341355
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
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| T |
25341171 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
25341270 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttca |
198 |
Q |
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| T |
25341271 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaattattttgcctgtgctcaataatttca |
25341355 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41064985 - 41064825
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
| |
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| T |
41064985 |
aatataagttattagaatactaaaagcatgaaaataaaaattagaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
41064886 |
T |
|
| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaaaatattgatataataatttaaagtacaatactaatta |
174 |
Q |
| |
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| T |
41064885 |
atttaatgtgtatcatagtactaaaatattgatataataatttaaagtataatactaatta |
41064825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12910426 - 12910305
Alignment:
| Q |
14 |
aatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaacta |
113 |
Q |
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| T |
12910426 |
aatataagttattacaatactaatagcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaacta |
12910329 |
T |
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| Q |
114 |
acataatgtgtattatagtactaa |
137 |
Q |
| |
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| T |
12910328 |
atttaaagtgtattatagtactaa |
12910305 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 72
Target Start/End: Original strand, 47238756 - 47238805
Alignment:
| Q |
23 |
tattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaaatagataatagaa |
72 |
Q |
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| T |
47238756 |
tattacaatactaataccatggaaataaaaattacaaatagataatagaa |
47238805 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40725817 - 40725766
Alignment:
| Q |
63 |
gataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaa |
114 |
Q |
| |
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| T |
40725817 |
gataatagaatttatagtgtaatatagtactaaaatatcattacaaaactaa |
40725766 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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