View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18521_high_3 (Length: 571)

Name: NF18521_high_3
Description: NF18521
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18521_high_3
NF18521_high_3
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (1-554)||(4574567-4575120)
chr6 (4-554)||(4560768-4561316)
chr6 (4-493)||(4266547-4267036)
chr6 (4-534)||(4480955-4481485)
chr6 (4-494)||(4489735-4490225)
chr6 (6-554)||(4457858-4458407)
chr6 (4-534)||(3172003-3172533)
chr6 (6-516)||(4514479-4514989)
chr6 (4-437)||(4503834-4504267)
chr6 (4-526)||(4461385-4461907)
chr6 (4-534)||(4470065-4470595)
chr6 (6-493)||(4506121-4506608)
chr6 (4-481)||(4563973-4564453)
chr6 (4-422)||(4598433-4598851)
chr6 (4-422)||(4613170-4613588)
chr6 (22-481)||(4299214-4299673)
chr6 (6-481)||(4626215-4626690)
chr6 (4-398)||(4516583-4516977)
chr6 (4-400)||(4585898-4586294)
chr6 (4-422)||(4579694-4580112)
chr6 (4-481)||(4259547-4260024)
chr6 (4-353)||(4602051-4602400)
chr6 (4-371)||(4617284-4617651)
chr6 (6-491)||(4622406-4622889)
chr6 (4-491)||(4592493-4592983)
chr6 (4-359)||(4557387-4557742)
chr6 (4-359)||(4571234-4571589)
chr6 (4-400)||(4256098-4256481)
chr6 (1-247)||(4568315-4568561)
chr6 (4-133)||(4493217-4493346)
chr6 (453-534)||(4503725-4503806)
chr6 (5-116)||(4391885-4391996)
chr6 (318-358)||(4835531-4835571)
chr6 (326-398)||(4568628-4568700)
chr6 (427-491)||(4602477-4602541)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (4-493)||(24103261-24103750)
chr5 (4-220)||(27999753-27999969)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (4-494)||(20863223-20863713)
chr8 (4-491)||(1674488-1674979)
chr8 (4-359)||(16685782-16686137)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (4-491)||(1281376-1281866)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (4-481)||(3086682-3087159)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (4-481)||(4082-4556)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (6-482)||(3110-3587)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (6-116)||(3443-3552)
scaffold0475 (175-221)||(3162-3208)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (283-491)||(4-216)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (91-132)||(1351057-1351098)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 526; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 554
Target Start/End: Original strand, 4574567 - 4575120
Alignment:
Q  1 cataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574567 cataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctctt 4574666  T
Q  101 gtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574667 gtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgat 4574766  T
Q  201 ccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaaca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574767 ccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaaca 4574866  T
Q  301 gatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgattta 400  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574867 gatcttggttcttttgattcaatccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgattta 4574966  T
Q  401 gaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcat 500  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4574967 caaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagggaacatagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattagaagtattgaataccat 4575066  T
Q  501 accagaagctctatgacatttatctgccacttcagtgttaaatcttatcgtcaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4575067 accagaagctctatgacatttatctgccacttcagtattaaatcttatcgtcaa 4575120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 554
Target Start/End: Original strand, 4560768 - 4561316
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4560768 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgatgggtggttcaatactttctcttgtg 4560867  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560868 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaa-tcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 4560966  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560967 taaaaatggtttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaag-gcttctcttgagacttaacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 4561065  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4561066 cctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattacagtctaaagatgtcaagtgattttgtggactttgatttacaa 4561165  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcatacc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4561166 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagggaacatagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattagaagtattgaataccatacc 4561265  T
Q  504 agaagctctatgacatttatctgccacttcagtgttaaatcttatcgtcaa 554  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561266 agaagctctaagacatttatctgccacttcagtgttaaatcttatcgtcaa 4561316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4267036 - 4266547
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  4267036 aacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtg 4266937  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4266936 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttaaaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatcca 4266837  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4266836 caaaaaagggttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagat 4266737  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4266736 cttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgattttgtggactttgatttaaaa 4266637  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattga 493  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4266636 aagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagcattcataacatcactctcaagttcatatgaagtattga 4266547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 534
Target Start/End: Original strand, 4480955 - 4481485
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4480955 aacattggcactccagcacatacactttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtg 4481054  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  4481055 gacaccaacttgctattaggcctctatttgaaatttctttcaaatactcagatgacaacaccactgagccaccaatgacaagattagacctaataatcca 4481154  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4481155 caaaaagttttttttgctattggcaaaaccccaagcaaactctaagagtttctcttgagacataattgtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 4481254  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  4481255 cctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaatgtttccaagtgatattgtggactttgatttaaaa 4481354  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcatacc 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |  | | |    
T  4481355 aagaagccaatggaccaatggtgtatagagaagggaatatagaatagagagaattcataacatcactctcaagttcataagaagtattgataacaaaagc 4481454  T
Q  504 agaagctctatgacatttatctgccacttca 534  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4481455 agatgctctttgacatttatctgtcacttca 4481485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 4 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4490225 - 4489735
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  4490225 aacattggcactccagcacatatactctccatgattgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaataccttctcttgtg 4490126  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4490125 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgacaacacctgtgagccaccaataacaagatcaggcctaatgatcca 4490026  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4490025 caaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaatagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 4489926  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| || ||    
T  4489925 cctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatttcaagtgattttctggaatttgatctaaaa 4489826  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaa 494  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||   | |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4489825 aagaagaaaatgggccaattgtgtatacagaagggaatatagaactaagagcattgatagcatcactctcaagttcattagaagtattgaa 4489735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 554
Target Start/End: Original strand, 4457858 - 4458407
Alignment:
Q  6 cattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgga 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  4457858 cattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtttcatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttatcttgtgga 4457957  T
Q  106 caccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccaca 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4457958 caccaacttgctattaagcctctatcagaagtttcattcacaaaatccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctagttatccaca 4458057  T
Q  206 aaaagggtttt-ttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatc 304  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  4458058 aaaaaggttttcttgctgttggccaaaacccaagcaaattctaagagcttctcttgagacataactgtgatgcttccaaaatttacataaataacagact 4458157  T
Q  305 ttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaaa 404  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4458158 ttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatattctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgattttgtggactttgatttataaa 4458257  T
Q  405 agaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcatacca 504  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |  |||  |    
T  4458258 agaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagtattcataacatcactctcaagttcataagaagtattgataacaatagaa 4458357  T
Q  505 gaagctctatgacatttatctgccacttcagtgttaaatcttatcgtcaa 554  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  4458358 gaggctctatgacatctatctgccacttcggttataaattttatcatcaa 4458407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 4 - 534
Target Start/End: Original strand, 3172003 - 3172533
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  3172003 aacattggcattccagcacatacactttccgtggttgagttccatccgcagtgagtcaagaatccgccaattgaaggatggttcaacactttctcttgcg 3172102  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3172103 gacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaataatcca 3172202  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172203 caaaaagggtttcttgctgttggctaaaccccaagcaaactctaataatttctcttgagacataactatgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 3172302  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||    
T  3172303 tttgattcttttgtttcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagaatctaaagatgccaagtgattttgcggactttgacttaaaa 3172402  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcatacc 503  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||   | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |    
T  3172403 acgaagcgaacggaccaattgtgtatagagaagggaatatagaactaagagtattcataacatcactctcaagttcattagaagtgttgaaaacaatagc 3172502  T
Q  504 agaagctctatgacatttatctgccacttca 534  Q
    ||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  3172503 agaagctttgtgacatttatctcctacttca 3172533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 4514989 - 4514479
Alignment:
Q  6 cattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgga 105  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4514989 cattggcactccagcgcatatgctctcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttcaaaactttctcttgtgga 4514890  T
Q  106 caccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccaca 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4514889 caccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattcacaaactcagacgacaaaaccactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccata 4514790  T
Q  206 aaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatct 305  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||  |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  4514789 aaaaggttttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttctccggagacataatcgtgatgctaccaaaattaacataaacaacagatcc 4514690  T
Q  306 tggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaaaa 405  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||     
T  4514689 tgattcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgattttgtggactttgattcaaaaac 4514590  T
Q  406 gaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcataccag 505  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||| |||    
T  4514589 gaagcaaatgggccaatggtgtatagagaagggagcatagaataaagagcattcataacatcactctcaagatcattagaagtatttaaaaaaatagcag 4514490  T
Q  506 aagctctatga 516  Q
    |||||||||||    
T  4514489 aagctctatga 4514479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 4 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4504267 - 4503834
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  4504267 aacattggcactccagcacaaacactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttatcttgtg 4504168  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4504167 gacaccaacttgctacaagtcctctattagaagtttcattcacaaaatcagatgacaacacctctgagccaccaataacaagatcaggcctaataatcca 4504068  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  || |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4504067 caaaaaaggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttatcttaagacataactgtaatgctgccaaaatttacataaacaacagat 4503968  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4503967 cctggttcttttaattcaagccaatcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttacaa 4503868  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagg 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503867 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagg 4503834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 526
Target Start/End: Original strand, 4461385 - 4461907
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  4461385 aacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcg 4461484  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4461485 gacaccagcttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 4461584  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
     ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  || |  ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4461585 taaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagttgatcaggagtcataactgtgatgctgccaaaatttacatagacaacagat 4461684  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  4461685 cctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtgattttgtggactttgatttataa 4461784  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcatacc 503  Q
    ||||||  | ||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||   ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| || |  | | |    
T  4461785 aagaagaaagtggaccaatggtgtatagagaagggaatataaaatagagttcattcataatatcactttcgagttcattagaagtattcaaaataacagc 4461884  T
Q  504 agaagctctatgacatttatctg 526  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  4461885 agaagctctgtgacatttatctg 4461907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 534
Target Start/End: Original strand, 4470065 - 4470595
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  4470065 aacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaagggtggttcagtacttgctcttgag 4470164  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    |||||||  |  | ||||| ||||||||||||||| | || | ||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4470165 gacaccagttcacgattaggcctctatctgaaattccatttacaatctctgatgagaaaactaccgagccgccaatgacaagatcgggcctaatgatcca 4470264  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4470265 caaaaagggttgcttgctatttgccaaaccccaagcaaactctaacagtttctctggagacataactgtgacgctgccgaaatttacatagacaacagat 4470364  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||  |  | |||||||||||||||||||| ||    
T  4470365 cctggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgaaatttaaagatgctagatgattttgtggactttgatttaaaa 4470464  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcatacc 503  Q
    ||||||  | ||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||| |    
T  4470465 aagaagaaagtggaccaatggcgtatagagaagggaatatagaatagagttcattcataacatcactttcaagttcattagaagtattcaaaacaatagc 4470564  T
Q  504 agaagctctatgacatttatctgccacttca 534  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  4470565 agaagctctttgacatttatttgtcacttca 4470595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 493
Target Start/End: Original strand, 4506121 - 4506608
Alignment:
Q  6 cattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgga 105  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || || ||||||||||||| |    
T  4506121 cattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgatttaacactttctcttgtgaa 4506220  T
Q  106 caccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccaca 205  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||   ||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4506221 caccagcttgctataaggcttctatctgaaatttcatttgcaaactctgaagacaaaaccactgagccaccaattacaagatcaggcctaatgatccaca 4506320  T
Q  206 aaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatct 305  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||  |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||       
T  4506321 aaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaaaaatttctccggagacataattgtgatgcttccaaaattcacataaacaacagaagc 4506420  T
Q  306 tggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaaaa 405  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||     
T  4506421 cggttcttttgattccagccattcgagacatttagtatcctctttccaaagatttgaatctaaagttgcaaactgattttgtggactttgatttacaaat 4506520  T
Q  406 gaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattga 493  Q
    |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4506521 gaagttaaagggccaatagtgtatagagaaggaaacataatatcaagagcattcagaacattactctcaagttcattagaagtattga 4506608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 481
Target Start/End: Original strand, 4563973 - 4564453
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4563973 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttcaatactttctcctgtg 4564072  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4564073 gacaccaacttgcaattaagcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaaacgactgagccaccaatgacaaggtcaggcctaatgatcca 4564172  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || |  || |  | | | | |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  4564173 caaaaagggtttattgcaattggccaacccccaagcaaattccaacagttgttttggtgtcataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaacggat 4564272  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcat---tttgtggactttgattta 400  Q
    |  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||||   ||| | ||   |||||||| |||| ||||    
T  4564273 cccggctccttggattcaagccattcaagacacttagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagaatccaattgatgaatttgtggagtttggttta 4564372  T
Q  401 gaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 481  Q
      || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||||| |||  ||| |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  4564373 ataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacatagaggagagagcatttattacatcactctaaagttcat 4564453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Original strand, 4598433 - 4598851
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||| ||||||| ||||||      
T  4598433 aacattggcactccggcacatatactttcagtggttgagttccatccgcaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgca 4598532  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598533 gacaccagcttgcaactaagcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 4598632  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||  || ||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  4598633 caaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaagtctaacaacttttctgcagtcatcaccgttatgctcccaaaattcacataaacaacagac 4598732  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||| ||    
T  4598733 cttggttcattggattcaagccagtcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacctaaagatgccaaatgcttttgttgactttgatttaaaa 4598832  T
Q  404 aagaagctaatggaccaat 422  Q
    | |||| ||| || |||||    
T  4598833 acgaagataaagggccaat 4598851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4613588 - 4613170
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||| |||||| |    
T  4613588 aacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgag 4613489  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4613488 gacaccagctcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactctgatgacaaaacaactgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 4613389  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||  || || |||  || |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  4613388 caaaaagggttgcttgctattcgccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgcagtcataacggtcatgctcccaaaattcacataaacaacggac 4613289  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
     | ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |    ||||  || ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  4613288 ttcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacttaaacttgccaagtgattttgtggactttgacttaaaa 4613189  T
Q  404 aagaagctaatggaccaat 422  Q
      |||| ||| ||||||||    
T  4613188 gtgaagataaaggaccaat 4613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 4299673 - 4299214
Alignment:
Q  22 catatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctatta 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||  |||    
T  4299673 catatgctttcaatggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacactagcttgcggtta 4299574  T
Q  122 gtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgct 221  Q
    | ||||||| ||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  | | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  4299573 ggcctctatttgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacaagccgccaatgacaaggtctggcctaatgatccacaaaaatggtttcctgca 4299474  T
Q  222 gttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattca 321  Q
     ||||||||||||||||||| |||||  || | |||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||  || || || ||||||    
T  4299473 attggccaaaccccaagcaatctctaacagttgctctggagtcataactgtaacgctgccaaaattcacataaacaaccgatcccggctccttggattca 4299374  T
Q  322 agccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaa 421  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||  || |||| ||| || ||||    
T  4299373 agccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaa 4299274  T
Q  422 ttgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 481  Q
    | || |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4299273 tagtatataaagaagggaacatagaatagagagcattcattacatcactctcaagttcat 4299214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 481
Target Start/End: Original strand, 4626215 - 4626690
Alignment:
Q  6 cattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgga 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||| |||    
T  4626215 cattggaactccagcgcatatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggttcagtactttctcttgcgga 4626314  T
Q  106 caccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccaca 205  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || |||||  |||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4626315 caccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcggatgacgaaataaatgagccaccaatcacaagatcaggcctaatgatccaca 4626414  T
Q  206 aaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatct 305  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||| ||||||  | | ||||||||| || ||||||||||||||  |    
T  4626415 aaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagtttctgtggagtcataactataacgctgccaaagttcacataaacaacagactt 4626514  T
Q  306 tggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaaaa 405  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |  |||||||||||| |||| | || |    
T  4626515 tggttccttgaattcaagccattcaagacaattggtgtcttctttccaaagattggaacctaaagatatcaactggttttgtggacttcgattcaaaaga 4626614  T
Q  406 gaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 481  Q
    |||   || || ||||| || |||| |||| | |||  ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4626615 gaatgcaaaggtccaatggtatatacagaaaggaacgtagaatagagcgcattcattacatcaccctcaagttcat 4626690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Original strand, 4516583 - 4516977
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  4516583 aacattggtactccggcacagatgctttccattgtggagttccatccacaatgagtcaagaatcctccaactgaaggatggttcaacactttctcttgcg 4516682  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4516683 gacaccagcttgctattacgcctctatccgaagtttcattcacaaaatcggatgacaaaataaccgagccaccaatgacaaggtcaggcctaataatcca 4516782  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |  ||| ||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  4516783 caaaaaaggtttcttgctgttggccaaaccccaagcgaactctaacagttgatctggagtcatgaccgtgatgcttccaaaattcacataaactacagaa 4516882  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatt 398  Q
    | | |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  4516883 ccttgttccttagattcaagccattcaagacatttcatatcttctttccaaagattagaacctatagaagccaagttattttgcggactttgatt 4516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Original strand, 4585898 - 4586294
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  4585898 aacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcaatacttgctcttgcg 4585997  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    | |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4585998 ggcaccaacccgcgattaggcctctatctgaaatttcattcttaaactcagatgacaaaaccaaggaaccaccaatgacaagatcaggtctaatgatcca 4586097  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
     |||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||  || |||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  4586098 taaaaaatgttgcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgtagtcataactgttgtgctcccaaaattcacataaacaacggac 4586197  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgattta 400  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  4586198 ctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttggtatcctctttccaaagatttgtacttaaagatgctaagtggttttgtggactttgattta 4586294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Original strand, 4579694 - 4580112
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  4579694 aacattggaactccagcagatatgctttcagtgattgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcg 4579793  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||  | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4579794 gacaccagctcgttattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacagctgagccgccgatgacaagatcgggcctaatgatcca 4579893  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||  || || |||  || |||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  4579894 caaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgcagtcataactgtcaagctcccaaaattcacataaacaacagac 4579993  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    || ||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||    
T  4579994 ctaggttccttggattcaagccaataaagacacttggtatcttctttccaaaaattggtgcttaaagatgtcaaatggttttctggactttgatttaaaa 4580093  T
Q  404 aagaagctaatggaccaat 422  Q
    | |||| ||| || |||||    
T  4580094 acgaagataaagggccaat 4580112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 4260024 - 4259547
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||| |    
T  4260024 aacattggaacttcggcacaaatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagttaagaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcg 4259925  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  ||  ||| |||||||| ||||  |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  4259924 gacaccagctcgcgattaggcctctatccgaaatttcactctcaaactcagatgacaaaataaaggagccaccaataatgaggtcaggcctaatgatcca 4259825  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  |  ||| ||| |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||     
T  4259824 caaaaagggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaaaaattgatctggagtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagac 4259725  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||| || || ||| |||||| |||||||||  |    
T  4259724 tcaggttccttaaattcaagccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaacgatgccaggtgattatgtggagtttgatttaata 4259625  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 481  Q
    | |||| ||| || ||||| |  |||| |||||| |||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4259624 atgaaggtaaaggtccaatagcatataaagaagggaacatagaatagagcacattcattacatcactctcaagttcat 4259547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 353
Target Start/End: Original strand, 4602051 - 4602400
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4602051 aacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccgccgatcgaagggtggttcaacactttctcttgtg 4602150  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4602151 gacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcatttgtaaactcagatgacaaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 4602250  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||  |  |  |   | | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4602251 caaaaatggtttatggcaattggccaaaccccaagcgaattctaataattgatggggtgtcataactgtaatgctgccaaaattcacataaacaacggat 4602350  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttcca 353  Q
    |  || || || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4602351 cccggctccttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttcca 4602400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Original strand, 4617284 - 4617651
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  4617284 aacattggcactccagcgcatatactttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgtcttgtg 4617383  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4617384 gacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgagaaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatcca 4617483  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||| || |  |  | |||  | | |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  4617484 caaaaatgatttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgat 4617583  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaaga 371  Q
    |  || || || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4617584 cccggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 4617651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 491
Target Start/End: Original strand, 4622406 - 4622889
Alignment:
Q  6 cattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgga 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || | ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  4622406 cattgaaactccagcacatatgctttcggtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgcagggtggttaagtacttcctcttgtgga 4622505  T
Q  106 caccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccaca 205  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4622506 caccaacctgcgattaggcctctacctgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgcccatgacaaggtcaggcctaatgatccaca 4622605  T
Q  206 aaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatct 305  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||| ||| || || |||||||||||||| || ||||||| || ||     
T  4622606 aaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaatagttgatctcgagtcatcactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaagag-tc- 4622703  T
Q  306 tggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaaaa 405  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||  ||     
T  4622704 aggttccttggattcaagccactcaagacacttgatatcttctttccaaagattggaacctagagatgccaagtgattatgtggagtttgatttaataat 4622803  T
Q  406 gaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtatt 491  Q
    |||| ||| || ||||  || || | ||| || ||||  |||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  4622804 gaaggtaaaggtccaacggtatacaaagatgggaacattgaatagagcgcattcatcgcatcagtctcaagttcattataagtatt 4622889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 4592493 - 4592983
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||| |    
T  4592493 aacattggaattccagcacatatactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgag 4592592  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4592593 gacaccagctcgcgattacgcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaattgtgccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 4592692  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||  |  |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  4592693 caaaaaaggtttattgcaattggccaaaccccaagcaaactctaacattttctcttcattcataactgtaaggctgccgaaattcacataaacaacggaa 4592792  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcat---tttgtggactttgattta 400  Q
    |  | ||| || ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |  || ||  | |||||   ||| | ||   |||||||| |||| ||||    
T  4592793 cccgattccttcgattcaagccatttaagacactcagtatcttctttccatatgttggaaccaaaagaatccaattgatggatttgtggagtttggttta 4592892  T
Q  401 gaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtatt 491  Q
      || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||||| |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4592893 ataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacatagaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtatt 4592983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Original strand, 4557387 - 4557742
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||| |||||| |    
T  4557387 aacattggaactccagcagatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcg 4557486  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    | ||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4557487 ggcaccagcccgcgattaggcctctatctgaaatttcattgacaaactccgatgacaaaacaactgagccaccgatgacaagatcgggcctaatgatcca 4557586  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||  || || |||   | |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  4557587 caaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgccgtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggac 4557686  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagatt 359  Q
    || ||||| || |||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4557687 ctcggttccttggattcaagccaaccaagacacttgttatcttctttccaaagatt 4557742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Original strand, 4571234 - 4571589
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||| |    
T  4571234 aacattggaactccagtagatatgctttcggtcgttgagttccatccacagtgagtcaagaaaccaccaattgaaggatggttcaatactttctcttgcg 4571333  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
      |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4571334 agcaccaaccagcaattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaactgagccaccaatgacaagatcgggcctaatgatcca 4571433  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    ||||||| |||  ||||| || || |||||||| ||||||||||  || || |||  || |||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  4571434 caaaaagagttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgaagtcataactgtcctgctcccaaaattcacataaacaacggac 4571533  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagatt 359  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4571534 ctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttgttatcttctttccaaagatt 4571589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4256481 - 4256098
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||| |    
T  4256481 aacattggaactccggcacaaatgctttcaatggttgagttccatcctcaatgagtcaagaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcg 4256382  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||| |             ||||||| ||||  |  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  4256381 gacaccaactctcgattagtcctctatccgaaact-------------cagatgacaaaataaaggagccaccaatgacgaggtcaggcctaatgataca 4256295  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |  ||| ||| |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||     
T  4256294 caaaaatggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaacagttgatctggagtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagac 4256195  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgattta 400  Q
       ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||| | | |||||| |||||||||    
T  4256194 tcaggttccttggattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaacgatgccaagtgactatgtggagtttgattta 4256098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 4568315 - 4568561
Alignment:
Q  1 cataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctctt 100  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    || ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  4568315 cataacattggtactctggcacaaatgctttccaatgtggagttccatccacaatgagtcaagaatcgtccaactgaagggtggttcaacacttgctctt 4568414  T
Q  101 gtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgat 200  Q
    | |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| || | |||| ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4568415 gcggacaccagcttgctatttggcctctatccgaagttccattcacaaactcggatgacaaaataactgagccaccaatgacaagctaaggcctaatgat 4568514  T
Q  201 ccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactcta 247  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  4568515 ccacaaaaaaggtttcttgctgttggcaaaacctcaagagaactcta 4568561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Original strand, 4493217 - 4493346
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||  | |||||||||||    
T  4493217 aacattggcactccggcacatatgtttttggtagttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaatcgaatggtggttcagcagtttctcttgtg 4493316  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctg 133  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4493317 gacaccaactagcaattaggcctctatctg 4493346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4503806 - 4503725
Alignment:
Q  453 agcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaatagcataccagaagctctatgacatttatctgccacttca 534  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||  | || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4503806 agcattcatagcatcactctcaagttcattagaagtattgaaaacaatggctgaggctctttgacatttatctgccacttca 4503725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 4391996 - 4391885
Alignment:
Q  5 acattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgg 104  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||  | | || ||||||||||||||| |||||  ||    
T  4391996 acattggaactctagaacaaatgctttcaatgggtgagtttcatccacaatgcgttaagaatccacaaattcaagggtggttcaatacttgctctttcgg 4391897  T
Q  105 acaccaacttgc 116  Q
    |||||| |||||    
T  4391896 acaccatcttgc 4391885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4835571 - 4835531
Alignment:
Q  318 ttcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagat 358  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4835571 ttcaagccattcaagacattttgtatcttccttccaaagat 4835531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 398
Target Start/End: Original strand, 4568628 - 4568700
Alignment:
Q  326 attcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatt 398  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||    
T  4568628 attcaagacatttcatatcttctttccaaagattggaacctaaagaagccaagtgcttttggggattttgatt 4568700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 491
Target Start/End: Original strand, 4602477 - 4602541
Alignment:
Q  427 tatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtatt 491  Q
    |||| |||||| |||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4602477 tataaagaagggaacatagaatatagtgcattcattacatcactctcaagttcattgtaagtatt 4602541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 493
Target Start/End: Original strand, 24103261 - 24103750
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  24103261 aacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggtttaacactttatcttgtg 24103360  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24103361 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaacttctttaaaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatcca 24103460  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24103461 caaaaaagggttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaactgat 24103560  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24103561 cttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtgattttgtggactttgatttaaaa 24103660  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattga 493  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24103661 aagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagcattcataacatcactctcaagttcatatgaagtattga 24103750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27999969 - 27999753
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27999969 aacattggcactccagcgcatatgctttcggtggttgagttccatccgcagtgagtcaagaacccgctgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtg 27999870  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27999869 gacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcctaaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatgacaagattaggcctagtgatcca 27999770  T
Q  204 caaaaagggttttttgc 220  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  27999769 caaaaaaggtttcttgc 27999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20863713 - 20863223
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | |||| | |||||||| || ||||||||||    
T  20863713 aacattggcactccagcacatatgctctcaatggttgagttccatccacaatgagttagaaatccaccaattgaaggatggttcaacaccttctcttgtg 20863614  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20863613 gacaccaactcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaacgcagatgaaaaaatcaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 20863514  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  || |||  |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20863513 caaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaacaatttttctacagacatgactgtggtactgccaaaatttacatatacaatagat 20863414  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
    |  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  20863413 cccggttctttcgattcaagccatgcaagacattcagtgtcttctttccaaagacttgaatctaaagacgccaagtgattctgtggactttgatttaaaa 20863314  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtattgaa 494  Q
    ||||| | || || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20863313 aagaaacaaaagggccaatggtgtatagagaagggaacatagaatagagaacattcataacatcactctcaagctcattgaaagtattgaa 20863223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 1674488 - 1674979
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1674488 aacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcagtgtgtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtg 1674587  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1674588 gacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcataaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatgacaagatcaggcctagtgatcca 1674687  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |  || |  ||| ||| ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  1674688 caaaaaaggtttcttgcaatcggccaaaccccaagcaaactccaatagttgatctggagtcataacaataatgctaccgaaattcacataaacaaccgat 1674787  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcat---tttgtggactttgattta 400  Q
    |  ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  ||||||||   || | ||   |||||||| |||| ||||    
T  1674788 cccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagattctaattgatgaatttgtggagtttggttta 1674887  T
Q  401 gaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaata-gaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtatt 491  Q
      || |||| ||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||  | || |||  | || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1674888 ataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacaaagaggaggagagcggttattacatcactctcaagttcattgaaagtatt 1674979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16686137 - 16685782
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||| |    
T  16686137 aacattggaactccagcatatatactttcagtggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccgattgaaggatggtttaatacttgctcttgcg 16686038  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    | ||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16686037 ggcaccagctcgcgattaggcttctatctgagatttcattcttaaactcagatgacaaaaccacggaaccgcaaatgacaagatcagacctaatgatcca 16685938  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
       |||  |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||  || || |||  || |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  16685937 ttgaaaatgttgcttgctattggtcaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgcagtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggaa 16685838  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagatt 359  Q
    || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  16685837 ctcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttatttccaaagatt 16685782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 1281376 - 1281866
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1281376 aacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtg 1281475  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1281476 gacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcgcaaagtcagatgacaaaatcactgagccgccaatgacaagatcaggcctagtgatcca 1281575  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||    || | |||| ||| |||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  1281576 caaaaatggtttcttgctattagccagaccccaagcaaattcctgaagttgctctggagtcataactgtaatgcttccgaaattcacataaacaacagat 1281675  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcat---tttgtggactttgattta 400  Q
    || ||||| || ||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| || || ||||||||   ||| | ||   |||||||| |||| ||||    
T  1281676 ctcggttccttcgattcaagccattgaagacactcgatatcttctttccaaaggttggaatctaaagaatccaattgatgaatttgtggagtttggttta 1281775  T
Q  401 gaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtatt 491  Q
      || |||| ||| || ||||| | ||| | ||||||||  | |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1281776 ataatgaaggtaaagggccaatcgggtaaacagaaggaattatagaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagtatt 1281866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 481
Target Start/End: Original strand, 3086682 - 3087159
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||  || |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  3086682 aacattggcactccagcaagtacgctttcaaccgttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaatacttgctcttgcg 3086781  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3086782 gacaccagcttgcgattagacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 3086881  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||| |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||     
T  3086882 caaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagttgctcttgagtcataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagac 3086981  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
        || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||||| |    
T  3086982 tcaagtccctttgattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtgaagtttgatttagta 3087081  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 481  Q
      |||| |||||| ||||| || ||||  ||||| |||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3087082 gtgaaggtaatggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattacatcactctcaagttcat 3087159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 4556 - 4082
Alignment:
Q  4 aacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtg 103  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  4556 aacattggcactcctacacatatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgtg 4457  T
Q  104 gacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatcca 203  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4456 gacaccagctcgcaattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaaggtcaggcctaatgatcca 4357  T
Q  204 caaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagat 303  Q
    |||||||| ||| || |  |||| |||| |||||||||||||||  || |  ||| ||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  4356 caaaaaggatttcttacaattggtcaaaacccaagcaaactctaacagttgatctggagtcataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaaccgac 4257  T
Q  304 cttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaa 403  Q
       ||||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||    ||| ||| |||||| |||||||||  |    
T  4256 tcaggttccttggatgcaagccactcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagat---tagtgattatgtggagtttgatttaata 4160  T
Q  404 aagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 481  Q
    | |||| ||| || ||||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  4159 atgaagttaaaggtccaatggtatataaagaagggaacatagaatagagagcattcaatacaccgctctcaagttcat 4082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3587 - 3110
Alignment:
Q  6 cattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgga 105  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  3587 cattggtactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggatcagtacttgctcttgtgga 3488  T
Q  106 caccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccaca 205  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || ||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3487 caccagcttgtgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctgatgacaaaataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccaca 3388  T
Q  206 aaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatct 305  Q
    |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||  || |  | | ||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||       
T  3387 aaaacggtttcttgctatcggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatttggagtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaacagactc 3288  T
Q  306 tggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtct-aaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaaa 404  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  || ||||||  ||||| ||| |||||| ||||| |||  ||    
T  3287 aggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaaagattccaagtgattatgtggagtttgacttaataa 3188  T
Q  405 agaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcatt 482  Q
     |||| |||||| || ||  ||||||  || || |||| ||| | ||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3187 tgaaggtaatggtccgatactgtataatgatgggaacatagagtggagcgcattcagtacatcactctcaagttcatt 3110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3552 - 3443
Alignment:
Q  6 cattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgga 105  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||||  |||    
T  3552 cattggaactccagaacaaatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaact-aagggtggttcaacacttgctcttacgga 3454  T
Q  106 caccaacttgc 116  Q
    ||||| |||||    
T  3453 caccatcttgc 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3208 - 3162
Alignment:
Q  175 ccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgct 221  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3208 ccaatgacaaggtcagacctaatgatccacacaaagggtttcttgct 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 491
Target Start/End: Original strand, 4 - 216
Alignment:
Q  283 aaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcat 382  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  ||||||||   || | ||    
T  4 aaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagattctaattgat 103  T
Q  383 ---tttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaata-gaaagcattcataacatcactctcaagtt 478  Q
       |||||||| |||| ||||  || |||| ||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||  | || |||  | || ||||||||||||||||    
T  104 gaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacaaagaggaggagagcggttattacatcactctcaagtt 203  T
Q  479 cattcgaagtatt 491  Q
    ||||  |||||||    
T  204 cattgaaagtatt 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1351098 - 1351057
Alignment:
Q  91 actttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatct 132  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  1351098 actttctcttgtggacaccaacctaccattagtcctctatct 1351057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University