View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18532_low_36 (Length: 298)

Name: NF18532_low_36
Description: NF18532
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18532_low_36
NF18532_low_36
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (15-281)||(26986927-26987193)
chr8 (15-281)||(26981813-26982080)
chr8 (15-281)||(34108229-34108497)
chr8 (15-281)||(14314849-14315115)
chr8 (15-281)||(14318553-14318819)
chr8 (15-281)||(18494115-18494380)
chr8 (17-281)||(43956788-43957051)
chr8 (13-281)||(10340905-10341163)
chr8 (15-275)||(25953119-25953363)
chr8 (15-123)||(18608724-18608832)
chr8 (165-281)||(18608588-18608703)
chr8 (16-87)||(18885065-18885136)
chr8 (45-115)||(1781869-1781939)
chr8 (173-263)||(1781976-1782066)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (15-281)||(12856789-12857055)
chr7 (15-281)||(26051021-26051287)
chr7 (15-281)||(26056134-26056400)
chr7 (15-281)||(26060380-26060646)
chr7 (15-281)||(26065493-26065759)
chr7 (15-281)||(12851674-12851942)
chr7 (15-159)||(14610364-14610508)
chr7 (198-281)||(14610512-14610595)
chr7 (15-110)||(11056625-11056720)
chr7 (15-123)||(4181478-4181585)
chr7 (15-281)||(5440238-5440492)
chr7 (15-281)||(5449248-5449502)
chr7 (13-122)||(37459938-37460047)
chr7 (165-275)||(4181347-4181457)
chr7 (15-76)||(35352434-35352495)
chr7 (13-57)||(5436692-5436736)
chr7 (165-221)||(37459861-37459917)
chr7 (165-210)||(35352330-35352375)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (15-281)||(21275773-21276039)
chr6 (13-281)||(21936624-21936886)
chr6 (13-281)||(21937568-21937832)
chr6 (15-281)||(24509703-24509966)
chr6 (15-130)||(20752207-20752322)
chr6 (15-130)||(24508917-24509032)
chr6 (15-121)||(2887490-2887596)
chr6 (15-121)||(2889212-2889318)
chr6 (15-122)||(11183263-11183370)
chr6 (165-281)||(24508798-24508914)
chr6 (165-281)||(20752076-20752192)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (15-281)||(35096028-35096294)
chr4 (15-281)||(35090915-35091181)
chr4 (15-281)||(32429231-32429487)
chr4 (15-281)||(30019786-30020054)
chr4 (13-281)||(18670838-18671096)
chr4 (15-125)||(18737162-18737272)
chr4 (15-122)||(34279588-34279695)
chr4 (15-125)||(18716489-18716599)
chr4 (14-123)||(34128333-34128442)
chr4 (165-281)||(3409546-3409662)
chr4 (15-123)||(14643826-14643934)
chr4 (15-122)||(54859254-54859361)
chr4 (15-121)||(47071408-47071514)
chr4 (165-281)||(54859115-54859232)
chr4 (15-119)||(3424799-3424904)
chr4 (173-281)||(34279451-34279559)
chr4 (165-279)||(22118855-22118971)
chr4 (162-281)||(25618245-25618357)
chr4 (173-279)||(34128203-34128306)
chr4 (165-281)||(47071535-47071657)
chr4 (165-232)||(3424697-3424764)
chr4 (233-281)||(3424251-3424299)
chr4 (173-281)||(14643683-14643791)
chr4 (43-104)||(34602060-34602121)
chr4 (233-281)||(32429172-32429220)
chr4 (233-279)||(54859058-54859104)
chr4 (40-121)||(3409695-3409781)
chr4 (233-281)||(3409487-3409535)
chr4 (233-281)||(18671107-18671155)
chr4 (233-281)||(25618186-25618234)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (15-281)||(9877477-9877743)
chr5 (15-281)||(9872362-9872628)
chr5 (15-281)||(39903845-39904111)
chr5 (15-281)||(39908958-39909224)
chr5 (15-281)||(13556242-13556509)
chr5 (15-281)||(2022964-2023219)
chr5 (15-269)||(35368851-35369095)
chr5 (15-131)||(4555653-4555769)
chr5 (50-121)||(43540857-43540928)
chr5 (37-109)||(25184114-25184186)
chr5 (15-69)||(43378437-43378491)
chr5 (167-226)||(4555772-4555831)
chr5 (165-281)||(43540721-43540834)
chr5 (233-281)||(2023230-2023278)
chr5 (88-144)||(43378485-43378541)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (15-281)||(8464750-8465016)
chr3 (15-281)||(10672876-10673142)
chr3 (15-281)||(8458311-8458578)
chr3 (15-281)||(6852890-6853156)
chr3 (15-281)||(6857993-6858259)
chr3 (15-281)||(10591233-10591499)
chr3 (15-281)||(31076340-31076606)
chr3 (15-281)||(1302182-1302449)
chr3 (15-281)||(31081445-31081711)
chr3 (15-281)||(4049807-4050074)
chr3 (15-281)||(33702537-33702804)
chr3 (15-281)||(5481426-5481692)
chr3 (15-281)||(10584796-10585062)
chr3 (15-281)||(4054941-4055208)
chr3 (15-281)||(10677989-10678257)
chr3 (15-281)||(5457949-5458216)
chr3 (15-224)||(33703299-33703509)
chr3 (13-281)||(49784494-49784752)
chr3 (13-122)||(3187551-3187660)
chr3 (15-118)||(20891059-20891162)
chr3 (13-121)||(18024246-18024354)
chr3 (162-281)||(29827551-29827669)
chr3 (15-123)||(29827429-29827532)
chr3 (173-232)||(18024167-18024226)
chr3 (173-231)||(20891185-20891243)
chr3 (233-281)||(20891354-20891402)
chr3 (183-231)||(18023560-18023607)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (15-281)||(17720464-17720730)
chr2 (15-281)||(45120386-45120653)
chr2 (15-281)||(14917320-14917586)
chr2 (15-281)||(30283388-30283645)
chr2 (15-281)||(42780184-42780439)
chr2 (15-123)||(716267-716375)
chr2 (15-123)||(16284437-16284546)
chr2 (162-221)||(20892347-20892406)
chr2 (163-281)||(716402-716520)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (15-281)||(1957-2223)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (15-281)||(28574297-28574563)
chr1 (15-281)||(28598309-28598575)
chr1 (15-281)||(3468067-3468334)
chr1 (17-281)||(43358755-43359009)
chr1 (15-281)||(10186519-10186783)
chr1 (15-153)||(3465473-3465611)
chr1 (15-279)||(44523971-44524226)
chr1 (26-281)||(21431619-21431865)
chr1 (17-281)||(19310826-19311079)
chr1 (15-133)||(17414621-17414740)
chr1 (15-124)||(35626172-35626281)
chr1 (13-123)||(1187826-1187935)
chr1 (15-138)||(13654335-13654461)
chr1 (174-281)||(13654468-13654575)
chr1 (15-76)||(16051206-16051267)
chr1 (165-281)||(16051335-16051451)
chr1 (165-281)||(1187961-1188077)
chr1 (173-226)||(3701491-3701544)
chr1 (13-57)||(29681588-29681632)
chr1 (13-57)||(48366213-48366257)
chr1 (167-226)||(17414561-17414620)
chr1 (179-223)||(10185832-10185876)
chr1 (165-281)||(35653191-35653307)
chr1 (233-280)||(10186461-10186508)
chr1 (233-281)||(10185907-10185955)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (15-123)||(173358-173466)
scaffold0005 (165-281)||(173493-173609)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (15-138)||(144096-144222)
scaffold0006 (174-281)||(144229-144336)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26987193 - 26986927
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26987193 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26987094  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26987093 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26986994  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26986993 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 26986927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26982080 - 26981813
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26982080 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26981981  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggt-ttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981980 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcacat 26981881  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981880 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 26981813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 34108229 - 34108497
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108229 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 34108328  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttg--tatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108329 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 34108428  T
Q  213 tgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108429 tgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 34108497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14315115 - 14314849
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14315115 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14315016  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315015 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14314916  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14314915 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 14314849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14318819 - 14318553
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14318819 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14318720  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318719 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14318620  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318619 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 14318553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18494380 - 18494115
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18494380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 18494281  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494280 caaaattctatccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 18494181  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494180 agagaaagcacct-tttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 18494115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43957051 - 43956788
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43957051 ttttacaaatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgcaaca 43956952  T
Q  117 aaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgag 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43956951 aaattatgtccaaattgtgtgtagttgtgt-gtttttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgag 43956853  T
Q  217 agaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43956852 agaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttat 43956788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10341163 - 10340905
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  10341163 aatattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagaatttatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 10341064  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    |||||||||||||||||| |         ||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10341063 aacaaaattctgtccaaaat---------tgtatg-tttttatatgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatggtgcattatatgactcttcaca 10340974  T
Q  213 tgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10340973 tgagaaaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccttttgtcaaaggttat 10340905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25953363 - 25953119
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25953363 tattgtacatatttatggttcaagcaattcactcatgcattagacaattgatggatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 25953264  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |    | |||||  |   || ||||||||||        ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25953263 caaaattctgtccaaaat-tgtgttgttat----tgtttgtcca---aattaatgccaaa--------catttatagtgcattatatgaccattcacatg 25953180  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaa 275  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25953179 agagaaaacacccatttgacttaaatcaattttatggttcattaagcatccttttgccaaa 25953119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18608832 - 18608724
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18608832 tattttacagatttatcgttccgtcaattaactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 18608733  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  18608732 caaaattct 18608724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18608703 - 18608588
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  18608703 taatgcctaaatgccaaacatttgtagtgcattatatgac-cttcacatgagagaaaacacccctttaacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 18608605  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
    | |||||||||||||||    
T  18608604 cctttgccaaaggttat 18608588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 18885065 - 18885136
Alignment:
Q  16 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  18885065 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaa 18885136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Original strand, 1781869 - 1781939
Alignment:
Q  45 actcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaac 115  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  1781869 actcatgaattagagaattggtggatgattttgagtaagagaatgagggataattatgttgttaatgtaac 1781939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Original strand, 1781976 - 1782066
Alignment:
Q  173 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcac 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||  ||   ||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  1781976 aaatgtcaaacatttatagtgcagtatacgacctttcacatgagagaaaatactattttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcac 1782066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 12856789 - 12857055
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12856789 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 12856888  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856889 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 12856988  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856989 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 12857055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 26051021 - 26051287
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26051021 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26051120  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051121 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26051220  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051221 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 26051287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 26056134 - 26056400
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26056134 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26056233  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056234 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26056333  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056334 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 26056400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 26060380 - 26060646
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26060380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26060479  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060480 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26060579  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060580 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 26060646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 26065493 - 26065759
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26065493 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26065592  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065593 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26065692  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065693 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 26065759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 12851674 - 12851942
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851674 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 12851773  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtata--ttcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851774 caaaattttgtccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtatatcttcaactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcaca 12851873  T
Q  213 tgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851874 tgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 12851942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Original strand, 14610364 - 14610508
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610364 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14610463  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610464 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatat 14610508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 281
Target Start/End: Original strand, 14610512 - 14610595
Alignment:
Q  198 atatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610512 atatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 14610595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 11056625 - 11056720
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11056625 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgataaagaattatgttgttaat 11056720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4181585 - 4181478
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  4181585 tattttacgggtttatggttcgagcaat-cactcatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 4181487  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  4181486 caaaattct 4181478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5440492 - 5440238
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5440492 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5440393  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattc-aactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
     |||| |   ||    ||||      |  ||| |||||||| | | | || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5440392 taaaaat---tc----ttgt------tcttgttgtttttgtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacat 5440306  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||||    
T  5440305 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttat 5440238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5449502 - 5449248
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5449502 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5449403  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattc-aactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
     |||| |   ||    ||||      |  ||| |||||||| | | | || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5449402 taaaaat---tc----ttgt------tcttgttgtttttgtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacat 5449316  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||||    
T  5449315 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttat 5449248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37460047 - 37459938
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  37460047 aatattttacagatatatggtttcagcaattcgctaatgcatcagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgtgggagaattatgttgttcatgt 37459948  T
Q  113 aacaaaattc 122  Q
    |||| |||||    
T  37459947 aacataattc 37459938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4181457 - 4181347
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  | | |||||||||||||    
T  4181457 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcatatgagagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 4181358  T
Q  265 cttttgccaaa 275  Q
    | |||||||||    
T  4181357 cctttgccaaa 4181347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 35352495 - 35352434
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattta 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35352495 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatggttta 35352434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5436736 - 5436692
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5436736 aatattttacagatttatggttcaagcaattcactaatgcattag 5436692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37459917 - 37459861
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaa 221  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  37459917 taatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgtccattcacatgagagaaa 37459861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35352375 - 35352330
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttca 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  35352375 taatgcccaaatgtcaagcatatatggtgcattatatgacccttca 35352330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 21275773 - 21276039
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21275773 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 21275872  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275873 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 21275972  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275973 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 21276039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21936886 - 21936624
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21936886 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatagatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgt 21936787  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||     ||| ||| |||  | || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21936786 aacaaagttcagtccaaaattgtgtgt-----tgttgttgttg--tgttaaactaatgcccaaatgttaagcatttatagtgcattatatgacccttcac 21936694  T
Q  212 atgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21936693 atgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggtttattaagcacctttttgccaaaggttat 21936624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Original strand, 21937568 - 21937832
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21937568 aatattatacaaatttatggttccagcaattcactcatgcatttgagaattgatggatgttttagaataagagagtgatggaaaattatgttgttaatgt 21937667  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||| ||| |||  | || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21937668 -acaaaattatgtccaaaattgtgtgttgt--tgttgttgttg--tgttaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcgttatatgacccttcac 21937762  T
Q  212 atgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21937763 atgagagaaaatacccctttgacttgaatcaatgtgatggttcattaaacacccttttgccaaaggttat 21937832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 24509703 - 24509966
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24509703 tattttacaaatttatggttccaacaattcactaatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24509802  T
Q  115 caaaattctgt-ccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    || |||| ||| | ||||| ||| || |  ||| ||| | |  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24509803 cataattttgtacaaaattatgtataat--tgttgttgtcg--tgttaaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgaaccttcacat 24509898  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||| |||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  24509899 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaaacacacttttgtcaaatgttat 24509966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20752322 - 20752207
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20752322 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcatcagagaattgatggatgacttatagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 20752223  T
Q  115 caaaattctgtccaaa 130  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20752222 caaaattctttccaaa 20752207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24509032 - 24508917
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24509032 tattttacaaatttatgattccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24508933  T
Q  115 caaaattctgtccaaa 130  Q
    || |||| ||| ||||    
T  24508932 cataattttgtacaaa 24508917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2887490 - 2887596
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||    
T  2887490 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2887589  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2887590 caaaatt 2887596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2889212 - 2889318
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||    
T  2889212 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2889311  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2889312 caaaatt 2889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11183370 - 11183263
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||| ||| |||||    
T  11183370 tattttacaggtttatggtttcagcaatttactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaatgagagagaattatgttattattgtaa 11183271  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  11183270 caaaattc 11183263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24508914 - 24508798
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  24508914 taatgcccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 24508815  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||    
T  24508814 cttttgccaaaggttat 24508798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20752192 - 20752076
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  20752192 taatgcctaaatgccaagtatttatagtgcattagatgacctttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 20752093  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
     ||||| ||||||||||    
T  20752092 attttgtcaaaggttat 20752076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 35096028 - 35096294
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35096028 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 35096127  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096128 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 35096227  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096228 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 35096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 35090915 - 35091181
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  35090915 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattttgatgaattatgttgttaatgtaa 35091014  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091015 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 35091114  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091115 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 35091181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32429487 - 32429231
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||    
T  32429487 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatccaa 32429388  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||           | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32429387 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcacaaatgccaagcatttatagtgcattatatgactcttcaaat 32429299  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32429298 gagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccctttgtcaaaggttat 32429231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30020054 - 30019786
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30020054 tatttcacatatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 30019955  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggt--ttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | || | | |  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30019954 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgttgttctgttctctgtcaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacccttcac 30019855  T
Q  212 atgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| |||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30019854 atgagagaaagcacccatttgacttgaatc-atgttatggttcattaagcacctttttgccaaaggttat 30019786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Original strand, 18670838 - 18671096
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  18670838 aatattttacagatttatggttccaacaagtcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 18670937  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattc-aactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
    |||| |||||||        || | || |||| |  || |||| | | | || |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18670938 aacataattctg--------gtttcta-ttgtct--ttgttgtgtgtccaaattaattcccaaatgccaagcatttatagtccattatatgacccttcac 18671026  T
Q  212 atgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  18671027 atgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatggttcattaagccctcttttaccaaaggttat 18671096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 18737162 - 18737272
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  18737162 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 18737261  T
Q  115 caaaattctgt 125  Q
    |||||||||||    
T  18737262 caaaattctgt 18737272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 34279695 - 34279588
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34279695 tattttacagatttatggtttcaggaattcactcatgcattagagaattgatggttgatttagagtaagagaacgaggaagaattatgttgttaatgtaa 34279596  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  34279595 caaaattc 34279588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 18716489 - 18716599
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||    
T  18716489 tattttacagatttatggttccagcaattcactcttgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgggggagaattatgttgttaatgcaa 18716588  T
Q  115 caaaattctgt 125  Q
    |||||||||||    
T  18716589 caaaattctgt 18716599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34128442 - 34128333
Alignment:
Q  14 atattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |    
T  34128442 atattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagaaaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 34128343  T
Q  114 acaaaattct 123  Q
    ||||||||||    
T  34128342 acaaaattct 34128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3409662 - 3409546
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3409662 taatgcccaaatgtcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacc 3409563  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
    | |||||||||||||||    
T  3409562 cctttgccaaaggttat 3409546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14643934 - 14643826
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  14643934 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 14643835  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  14643834 caaaattct 14643826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 54859361 - 54859254
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||| ||||||||||||| |    
T  54859361 tattttacggatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagagcaagagaatgagggagaatcatgttgttaatgtga 54859262  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  54859261 caaaattc 54859254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 47071408 - 47071514
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47071408 tattttacaaatttatggttcaaacaattcactcattcattagagaattgatagataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 47071507  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  47071508 caaaatt 47071514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 54859232 - 54859115
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca-cctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcac 263  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||     
T  54859232 taatgcccaaatatcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcat 54859133  T
Q  264 ccttttgccaaaggttat 281  Q
    || |||||||||||||||    
T  54859132 ccatttgccaaaggttat 54859115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3424904 - 3424799
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaaga-attatgttgttaatgta 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||  |||||||||||| |||    
T  3424904 tattttacagatttatgtttccagtaactcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagta 3424805  T
Q  114 acaaaa 119  Q
    ||||||    
T  3424804 acaaaa 3424799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34279559 - 34279451
Alignment:
Q  173 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcc 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   ||| |||| ||||||||  ||| || ||| | ||||||||| ||    
T  34279559 aaatgtcgagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatggttaattgaacacccttttacc 34279460  T
Q  273 aaaggttat 281  Q
    |||||||||    
T  34279459 aaaggttat 34279451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 279
Target Start/End: Original strand, 22118855 - 22118971
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaa--gcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagca 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||| |||   ||| |||||||||||    
T  22118855 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtatattatatgacccttcacatgagagaaaatacacccctttgacttgaatgaataatatggttcattaagca 22118954  T
Q  263 cccttttgccaaaggtt 279  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  22118955 cccctttgccgaaggtt 22118971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25618357 - 25618245
Alignment:
Q  162 aactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagc 261  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  25618357 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatg-------acatgagagaaaacacctctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 25618265  T
Q  262 acccttttgccaaaggttat 281  Q
    | ||  |||| |||||||||    
T  25618264 atccagttgcgaaaggttat 25618245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34128306 - 34128203
Alignment:
Q  173 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||   ||| |||| ||||||||  ||  |||||||||   |||||||||    
T  34128306 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacattagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatagttcattaag---ccttttgcc 34128210  T
Q  273 aaaggtt 279  Q
    |||||||    
T  34128209 aaaggtt 34128203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Original strand, 47071535 - 47071657
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat------gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcatta 258  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||      |||||||| ||| | ||| |||| ||||||||| ||| |||||||    
T  47071535 taatgcccaaatgttaaacatttatagtacattatatgacccttcacatgaacatgagagaaaacacttttttgacttgaatcaatgcaatggttcatta 47071634  T
Q  259 agcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  47071635 agcatccatttgccaaaggttat 47071657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3424764 - 3424697
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctcttta 232  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  3424764 taatgcccaaatatcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccttta 3424697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3424299 - 3424251
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3424299 acttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 3424251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14643791 - 14643683
Alignment:
Q  173 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcc 272  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| |||| ||||||||| | | |||||||| ||| | |||| |    
T  14643791 aaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtc 14643692  T
Q  273 aaaggttat 281  Q
    ||| |||||    
T  14643691 aaatgttat 14643683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34602121 - 34602060
Alignment:
Q  43 tcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgtt 104  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||    
T  34602121 tcactcatgcataagaaaattgatggatgatttagagtaaaagaatgagggagaattgtgtt 34602060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32429220 - 32429172
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32429220 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaatgttat 32429172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 54859104 - 54859058
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggtt 279  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54859104 acttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgccaaaggtt 54859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3409781 - 3409695
Alignment:
Q  40 aattcactcatgcattagagaatt----gatggatgatttagaataatagaatgatgaaga-attatgttgttaatgtaacaaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||| ||||||| | |||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  3409781 aattcactcatgcattagagaattaatatatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagtatcaaaatt 3409695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3409535 - 3409487
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3409535 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaaaggttat 3409487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Original strand, 18671107 - 18671155
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18671107 acttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgccaaaggttat 18671155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25618234 - 25618186
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25618234 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaatgttat 25618186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9877743 - 9877477
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9877743 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 9877644  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877643 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 9877544  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877543 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 9877477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9872628 - 9872362
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9872628 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattgtgaagaattatgttgttaatgtaa 9872529  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9872528 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 9872429  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9872428 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 9872362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 39903845 - 39904111
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39903845 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39903944  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39903945 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgttttttcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 39904044  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39904045 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcactattttgccaaaggttat 39904111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 39908958 - 39909224
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39908958 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39909057  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39909058 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgatttttgttttttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 39909157  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39909158 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 39909224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13556509 - 13556242
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556509 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 13556410  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttt-tgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556409 caaacttctgtccaaattgtgtgtagttgtgtccttttctgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 13556310  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13556309 gagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttat 13556242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 2022964 - 2023219
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2022964 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 2023063  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||           | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2023064 caaaattctgtccaaaattatgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcccatatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 2023152  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  2023153 gagagaaagcacc-ctttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacccatttgtcaaaggttat 2023219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35369095 - 35368851
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||    
T  35369095 tattttacagatttatggttacaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaggaagaattatgtttttgatgcaa 35368996  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||        |||| | | ||||||| ||| |||| | |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35368995 caaaattc--------ttgt-ttttgttgtgt-gttgttgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacttttcacatg 35368906  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcaccctttt 269  Q
    ||||||| |||   ||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  35368905 agagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacaccttttt 35368851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 4555653 - 4555769
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4555653 tattttacagatttatggtaccaataattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4555752  T
Q  115 caaaattctgtccaaat 131  Q
    ||||||| |||||||||    
T  4555753 caaaattgtgtccaaat 4555769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43540928 - 43540857
Alignment:
Q  50 tgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43540928 tgcattagagaattgatagatgatttagagtaagagaatgatggagaactatgttgttaatgtaacaaaatt 43540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 109
Target Start/End: Original strand, 25184114 - 25184186
Alignment:
Q  37 agcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaa 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  25184114 agcaattcactaatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaaatatgttgttaa 25184186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 43378437 - 43378491
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatgga 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43378437 tattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattaaagaattgatgga 43378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 4555772 - 4555831
Alignment:
Q  167 atgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacc 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  4555772 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactattaacatgagagaaaacacc 4555831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43540834 - 43540721
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||   ||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||| |    
T  43540834 taatgcccagatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaa--cactcatttgacttgagtcaatgttatggttcattaagca-c 43540738  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43540737 cttttgtcaaaggttat 43540721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Original strand, 2023230 - 2023278
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2023230 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 2023278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 144
Target Start/End: Original strand, 43378485 - 43378541
Alignment:
Q  88 tgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgt 144  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||    
T  43378485 tgatggagaattatgttgataatgtaacaatattgtgtccaaattatgtgttgttgt 43378541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 8464750 - 8465016
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464750 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8464849  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464850 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 8464949  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8464950 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcaccattttgccaaaggttat 8465016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10673142 - 10672876
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10673142 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10673043  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10673042 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10672943  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10672942 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 10672876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 8458311 - 8458578
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458311 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8458410  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatg-ccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458411 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 8458510  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8458511 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaccacccttttgccaaaggttat 8458578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6853156 - 6852890
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6853156 tattttacagatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6853057  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6853056 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 6852957  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6852956 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttat 6852890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6858259 - 6857993
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6858259 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6858160  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6858159 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 6858060  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6858059 agagaaatcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttat 6857993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10591499 - 10591233
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10591499 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10591400  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591399 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10591300  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10591299 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttaccaaaggttat 10591233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31076606 - 31076340
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31076606 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31076507  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31076506 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatg 31076407  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31076406 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 31076340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1302449 - 1302182
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1302449 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 1302350  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggt-ttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1302349 caaaattttgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 1302250  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1302249 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 1302182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31081711 - 31081445
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31081711 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31081612  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31081611 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatg 31081512  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31081511 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 31081445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 4049807 - 4050074
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4049807 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4049906  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4049907 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 4050006  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4050007 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 4050074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33702804 - 33702537
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33702804 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33702705  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggt-ttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33702704 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtctattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 33702605  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33702604 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 33702537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5481692 - 5481426
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481692 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5481593  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481592 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 5481493  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481492 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 5481426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10585062 - 10584796
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10585062 tattttacagatttatggttctagctattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10584963  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10584962 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10584863  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10584862 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 10584796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 4054941 - 4055208
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4054941 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4055040  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055041 caaaattctatccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 4055140  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055141 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 4055208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10678257 - 10677989
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10678257 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10678158  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattata--tgactcttcaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10678157 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgtgactcttcaca 10678058  T
Q  213 tgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10678057 tgaaagaaagcacctttttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 10677989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5458216 - 5457949
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458216 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5458117  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggt-ttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458116 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggttttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 5458017  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5458016 gagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaagggttat 5457949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 33703299 - 33703509
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33703299 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33703398  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703399 caaaattatgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 33703498  T
Q  214 gagagaaagca 224  Q
    |||||||||||    
T  33703499 gagagaaagca 33703509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Original strand, 49784494 - 49784752
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |  |||||||||||||||||     
T  49784494 aatattttccagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatagatgatttaaagtaaaagaatgagggggaattatgttgttaatgc 49784593  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||         ||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49784594 aacaaaattctgtccaaaat-tgtgt---------gttgttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 49784683  T
Q  213 tgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||| |||   ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49784684 tgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccatttgccaaagcttat 49784752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3187660 - 3187551
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3187660 aatattttacagatttatggttcgagcaattcactcatgcattaaagaattgatagatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 3187561  T
Q  113 aacaaaattc 122  Q
     |||||||||    
T  3187560 cacaaaattc 3187551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 20891059 - 20891162
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  20891059 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagcgaatgagggagaattatgttgtttatgtaa 20891158  T
Q  115 caaa 118  Q
    ||||    
T  20891159 caaa 20891162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18024354 - 18024246
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18024354 aatattttacagatttattgttctaacaattcattcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 18024255  T
Q  113 aacaaaatt 121  Q
    |||||||||    
T  18024254 aacaaaatt 18024246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 281
Target Start/End: Original strand, 29827551 - 29827669
Alignment:
Q  162 aactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagc 261  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  29827551 aactaatgcccaaatgccaagcatttataatgcattatatgact-ttcacatgatagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 29827649  T
Q  262 acccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  29827650 accattttgccaaagattat 29827669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 29827429 - 29827532
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||| |||||| ||    
T  29827429 tattttacagatttat-----cagcaattcactcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattaggttattaatgcaa 29827523  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  29827524 caaaattct 29827532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18024226 - 18024167
Alignment:
Q  173 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctcttta 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18024226 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacctcttta 18024167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 231
Target Start/End: Original strand, 20891185 - 20891243
Alignment:
Q  173 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctcttt 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  20891185 aaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccttt 20891243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Original strand, 20891354 - 20891402
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20891354 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 20891402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18023607 - 18023560
Alignment:
Q  183 catttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctcttt 231  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18023607 catttataatgtattatatgac-cttcacatgagagaaaacacctcttt 18023560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17720730 - 17720464
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17720730 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 17720631  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720630 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 17720531  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720530 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 17720464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 45120386 - 45120653
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120386 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattggagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 45120485  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120486 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 45120585  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120586 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 45120653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14917586 - 14917320
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917586 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14917487  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917486 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14917387  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917386 agagaaaacagctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 14917320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30283645 - 30283388
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30283645 tattttacagatttatggttctagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaaggatggagaattatgttgttaatgtaa 30283546  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||         | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30283545 caaaattctgtccaaattgtgtttagttgtgtg---------ttttcaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatg 30283455  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    | ||||| |||| ||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30283454 aaagaaaacacccctttaacttgaatcaatattatggttcattaagcacccttttgccaaagattat 30283388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 42780184 - 42780439
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  42780184 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgtag-taatgtaa 42780282  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||           | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42780283 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcccaactgtcaatcatttatagtgcattatatgactcttcacat 42780371  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||| |||| |||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  42780372 gagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagccaccatttgccaaaggttat 42780439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 716267 - 716375
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| | |     
T  716267 tattttacagatttagggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaaggagaattatgttgttaaagaag 716366  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  716367 caaaattct 716375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 16284437 - 16284546
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatga-tttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgta 113  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |    
T  16284437 tattttactgatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgattttagagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgca 16284536  T
Q  114 acaaaattct 123  Q
    ||||||||||    
T  16284537 acaaaattct 16284546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20892406 - 20892347
Alignment:
Q  162 aactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaa 221  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20892406 aactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacacgagagaaa 20892347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 281
Target Start/End: Original strand, 716402 - 716520
Alignment:
Q  163 actaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagca 262  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || | |||| |||| ||||||||  | | | |||||| ||    
T  716402 actaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacctttcatatgagagaaaacatccctttgacttgaatcaatgttacggtccattaaaca 716501  T
Q  263 cccttttgccaaaggttat 281  Q
    || ||||||||||||||||    
T  716502 cctttttgccaaaggttat 716520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2223 - 1957
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2223 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 2124  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2123 taaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 2024  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2023 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 1957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 28574297 - 28574563
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28574297 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28574396  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574397 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 28574496  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574497 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 28574563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 28598309 - 28598575
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28598309 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28598408  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598409 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 28598508  T
Q  215 agagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598509 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 28598575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 3468067 - 3468334
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3468067 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3468166  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3468167 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 3468266  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3468267 gagagaaagcacatctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 3468334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 43358755 - 43359009
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43358755 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaaca 43358854  T
Q  117 aaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatga 215  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||           | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43358855 aaattcagtccaaaattgtgtgttgtagtgtg-----------tccaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattataggactcttcacatga 43358943  T
Q  216 gagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    ||||||||||   ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43358944 gagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttat 43359009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10186783 - 10186519
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10186783 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 10186684  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattc-aactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||  | | ||| || | | ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10186683 caaaattctgtccaaaat-tatgttgt--tattgttcttctgtgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacat 10186587  T
Q  214 gagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||  ||| |||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10186586 gagagaaagcacccatttgacttgaaccaatgctatggttcattaagcacccctttgtcaaaggttat 10186519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 153
Target Start/End: Original strand, 3465473 - 3465611
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3465473 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3465572  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465573 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt 3465611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44524226 - 44523971
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  44524226 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgcaa 44524127  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac--a 212  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||        ||||   |  || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  44524126 caatattctgttcaaattgtgtgttgttg--------ttgt---tcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacata 44524038  T
Q  213 tgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggtt 279  Q
    |||| |||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44524037 tgagggaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaaggtt 44523971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21431865 - 21431619
Alignment:
Q  26 tttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgt 125  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  21431865 tttatggttccatcaattcactgatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-- 21431768  T
Q  126 ccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca- 224  Q
          ||| | | ||| | || || || | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21431767 ------tgt-tcttgttttctg-ttgttctctgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcac 21431676  T
Q  225 cctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    || |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21431675 cccctttgacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 21431619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 19310826 - 19311079
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  19310826 ttttacagatttatggttccagcaattcattcatgcattagagaattgatggatgatttatagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgtaaca 19310925  T
Q  117 aaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgag 216  Q
    ||| |||||||||         | || ||| | |||||  | |  || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19310926 aaactctgtccaa---------aattatgttgcttttg--tgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattacatgacccttcacatgag 19311014  T
Q  217 agaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19311015 agaaagcacccctttgacttgaatcaatgttatagttcattaagcacccttttaccaaaggttat 19311079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17414740 - 17414621
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17414740 tattttccagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 17414641  T
Q  115 caaaattc-tgtccaaattg 133  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  17414640 caaaattcatgtccaaattg 17414621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 35626172 - 35626281
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35626172 tattttatagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 35626271  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    ||||||||||    
T  35626272 caaaattctg 35626281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 1187826 - 1187935
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  1187826 aatattttacagatttatggttctaccaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatga-ggagatttatgttgttaatgt 1187924  T
Q  113 aacaaaattct 123  Q
    |||||||||||    
T  1187925 aacaaaattct 1187935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 13654335 - 13654461
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaat--aatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  13654335 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 13654434  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgt 138  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13654435 aacaaaattctatccaaaattgtgtgt 13654461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Original strand, 13654468 - 13654575
Alignment:
Q  174 aatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcca 273  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13654468 aatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 13654567  T
Q  274 aaggttat 281  Q
    | ||||||    
T  13654568 agggttat 13654575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 16051206 - 16051267
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattta 76  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16051206 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattta 16051267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Original strand, 16051335 - 16051451
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||     
T  16051335 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagtgaaaacacccttttgacttgaatcaatgatatggttcattaagcact 16051434  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
    | ||||||||| |||||    
T  16051435 catttgccaaatgttat 16051451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Original strand, 1187961 - 1188077
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||| || |||| |||| |||| ||| ||||  ||| |||||||| ||||    
T  1187961 taatgcccaaatggcaagcacttattatggattatatgactctacacatgagagtaaacacccctttgacttgaattaatgttatggttcattaaacacc 1188060  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
    | |||||||||||||||    
T  1188061 catttgccaaaggttat 1188077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3701544 - 3701491
Alignment:
Q  173 aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacc 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3701544 aaatgtcaagtatttatagtgcattatgtgactcttcacatgagagaaaacacc 3701491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 29681588 - 29681632
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29681588 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 29681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 48366257 - 48366213
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48366257 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 48366213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17414620 - 17414561
Alignment:
Q  167 atgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacc 226  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  17414620 atgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaccacc 17414561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 10185832 - 10185876
Alignment:
Q  179 caagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  10185832 caagcatttatagtgcattatatgaccattcatatgagagaaagc 10185876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35653307 - 35653191
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||| |||   ||| | || ||||||||  ||| ||||||||||||     
T  35653307 taatgcccaaatgtcaagtgtttataaggctatatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgaattgaatcaatgatatggttcattaagcact 35653208  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
    | |||| ||||||||||    
T  35653207 cctttgtcaaaggttat 35653191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10186508 - 10186461
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggtta 280  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10186508 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaagtta 10186461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Original strand, 10185907 - 10185955
Alignment:
Q  233 acttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10185907 acttgaatcaatgatatggttcattaagcacctttttgccaaaggttat 10185955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 173358 - 173466
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  173358 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 173457  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  173458 caaaattct 173466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 281
Target Start/End: Original strand, 173493 - 173609
Alignment:
Q  165 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacc 264  Q
    ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| |||| ||||||||| | | |||||||| |||     
T  173493 taatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacact 173592  T
Q  265 cttttgccaaaggttat 281  Q
    | |||| |||| |||||    
T  173593 cctttgtcaaatgttat 173609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 144096 - 144222
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaat--aatagaatgatgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  144096 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 144195  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgt 138  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  144196 aacaaaattctatccaaaattgtgtgt 144222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Original strand, 144229 - 144336
Alignment:
Q  174 aatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttaaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgcca 273  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  144229 aatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 144328  T
Q  274 aaggttat 281  Q
    | ||||||    
T  144329 agggttat 144336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University