View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18537_low_18 (Length: 370)

Name: NF18537_low_18
Description: NF18537
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18537_low_18
NF18537_low_18
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (16-370)||(28421142-28421496)
chr7 (16-366)||(3811356-3811706)
chr7 (16-370)||(3817494-3817848)
chr7 (16-370)||(5979357-5979714)
chr7 (16-362)||(351409-351755)
chr7 (16-370)||(339003-339356)
chr7 (17-355)||(5849153-5849492)
chr7 (16-356)||(35148204-35148546)
chr7 (16-333)||(22742149-22742467)
chr7 (16-294)||(26383291-26383569)
chr7 (16-361)||(43539617-43539949)
chr7 (178-370)||(15843730-15843923)
chr7 (178-370)||(15860839-15861032)
chr7 (206-370)||(20238762-20238927)
chr7 (16-233)||(35152849-35153066)
chr7 (37-333)||(26380751-26381023)
chr7 (229-356)||(35150736-35150865)
chr7 (70-323)||(18656883-18657132)
chr7 (128-370)||(7608163-7608421)
chr7 (121-253)||(42767505-42767633)
chr7 (16-299)||(8824433-8824701)
chr7 (30-110)||(30219519-30219598)
chr7 (35-110)||(18666930-18667006)
chr7 (245-334)||(3677876-3677965)
chr7 (16-60)||(7608070-7608114)
chr7 (126-222)||(24690652-24690743)
chr7 (288-333)||(12803893-12803938)
chr7 (300-333)||(24690848-24690881)
chr7 (201-240)||(15843687-15843726)
chr7 (201-240)||(15860796-15860835)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (16-370)||(12686362-12686716)
chr5 (16-370)||(12692464-12692818)
chr5 (16-370)||(32094404-32094759)
chr5 (16-370)||(32097205-32097559)
chr5 (17-370)||(28525569-28525922)
chr5 (17-370)||(28531665-28532018)
chr5 (16-370)||(41296901-41297259)
chr5 (17-370)||(7389730-7390084)
chr5 (27-333)||(19059991-19060300)
chr5 (16-353)||(20499760-20500098)
chr5 (27-333)||(19066332-19066634)
chr5 (16-356)||(30771905-30772246)
chr5 (16-352)||(30384586-30384921)
chr5 (131-366)||(14609909-14610141)
chr5 (28-353)||(26509491-26509809)
chr5 (16-110)||(14609753-14609846)
chr5 (30-312)||(33753476-33753754)
chr5 (31-321)||(26318492-26318765)
chr5 (27-113)||(22647928-22648014)
chr5 (24-94)||(8706846-8706916)
chr5 (30-312)||(33849110-33849385)
chr5 (28-189)||(33021223-33021383)
chr5 (16-83)||(25408435-25408499)
chr5 (32-110)||(11640702-11640780)
chr5 (27-83)||(38548009-38548065)
chr5 (300-366)||(8706605-8706672)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (16-370)||(12017-12372)
scaffold0208 (16-370)||(6144-6499)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (16-370)||(11839908-11840263)
chr3 (16-370)||(42191403-42191758)
chr3 (16-370)||(42197345-42197700)
chr3 (16-370)||(10244517-10244872)
chr3 (16-370)||(10238395-10238750)
chr3 (16-370)||(17055976-17056329)
chr3 (16-331)||(26429639-26429955)
chr3 (16-370)||(10769152-10769507)
chr3 (16-370)||(10760833-10761188)
chr3 (16-370)||(38449246-38449601)
chr3 (17-370)||(49151235-49151588)
chr3 (17-370)||(49157302-49157655)
chr3 (16-370)||(38455733-38456088)
chr3 (16-370)||(55003595-55003939)
chr3 (16-370)||(30051285-30051638)
chr3 (16-370)||(8331409-8331763)
chr3 (16-354)||(28964502-28964833)
chr3 (17-208)||(17601879-17602070)
chr3 (140-354)||(48128239-48128451)
chr3 (177-356)||(13444840-13445020)
chr3 (55-330)||(46656341-46656610)
chr3 (16-190)||(11846340-11846515)
chr3 (161-356)||(53069254-53069443)
chr3 (17-364)||(12108859-12109203)
chr3 (16-191)||(23138779-23138954)
chr3 (254-352)||(13837534-13837632)
chr3 (16-320)||(2982458-2982764)
chr3 (16-165)||(53071640-53071789)
chr3 (157-277)||(13367114-13367233)
chr3 (277-370)||(11846246-11846340)
chr3 (16-152)||(24643890-24644028)
chr3 (157-277)||(9760481-9760600)
chr3 (16-76)||(9586490-9586550)
chr3 (16-93)||(8474595-8474673)
chr3 (16-94)||(34300060-34300138)
chr3 (205-269)||(24643817-24643878)
chr3 (252-333)||(34300348-34300429)
chr3 (291-333)||(24643773-24643815)
chr3 (205-255)||(17593487-17593537)
chr3 (65-107)||(17000868-17000910)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (16-370)||(13455721-13456076)
chr2 (16-370)||(13461662-13462017)
chr2 (16-370)||(36750036-36750391)
chr2 (16-339)||(35084893-35085217)
chr2 (17-339)||(35090866-35091189)
chr2 (16-370)||(28683128-28683482)
chr2 (19-370)||(44716988-44717340)
chr2 (16-370)||(30964949-30965304)
chr2 (16-370)||(31001998-31002353)
chr2 (29-370)||(31007989-31008331)
chr2 (16-370)||(13149867-13150227)
chr2 (16-333)||(23343185-23343493)
chr2 (17-331)||(19879217-19879536)
chr2 (16-253)||(35439671-35439908)
chr2 (121-328)||(11048776-11048985)
chr2 (17-199)||(35442187-35442369)
chr2 (244-333)||(35438925-35439014)
chr2 (60-321)||(28765248-28765508)
chr2 (18-242)||(7771500-7771722)
chr2 (16-106)||(23283865-23283955)
chr2 (66-333)||(29832877-29833142)
chr2 (129-233)||(23284680-23284784)
chr2 (270-332)||(29034697-29034759)
chr2 (121-333)||(31651360-31651564)
chr2 (15-90)||(38731155-38731231)
chr2 (70-110)||(8342631-8342671)
chr2 (31-79)||(43212334-43212381)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (16-370)||(25381718-25382073)
chr1 (16-370)||(25387687-25388040)
chr1 (16-370)||(50305819-50306166)
chr1 (16-358)||(1077866-1078209)
chr1 (16-370)||(31051166-31051521)
chr1 (17-370)||(34739609-34739962)
chr1 (16-370)||(31057666-31058021)
chr1 (23-370)||(8093029-8093376)
chr1 (16-333)||(44409622-44409940)
chr1 (16-355)||(38152161-38152495)
chr1 (27-333)||(24926981-24927295)
chr1 (16-356)||(27954783-27955124)
chr1 (16-179)||(25275421-25275584)
chr1 (27-322)||(24963940-24964231)
chr1 (27-314)||(33458149-33458436)
chr1 (16-204)||(12183961-12184134)
chr1 (25-94)||(4280189-4280258)
chr1 (275-322)||(12183820-12183867)
chr1 (34-113)||(27396222-27396301)
chr1 (82-164)||(23253826-23253907)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (16-370)||(32896634-32896989)
chr8 (16-370)||(32890510-32890865)
chr8 (16-370)||(36818594-36818948)
chr8 (16-370)||(42993186-42993537)
chr8 (16-370)||(5542343-5542699)
chr8 (17-370)||(9934906-9935255)
chr8 (16-370)||(10699651-10700006)
chr8 (18-370)||(10705462-10705814)
chr8 (16-354)||(22219926-22220265)
chr8 (17-333)||(42033420-42033740)
chr8 (17-370)||(14417584-14417917)
chr8 (16-366)||(39735734-39736076)
chr8 (16-211)||(1883185-1883375)
chr8 (16-195)||(39727643-39727822)
chr8 (221-333)||(1883039-1883151)
chr8 (217-366)||(39727494-39727645)
chr8 (17-284)||(17954129-17954393)
chr8 (52-110)||(30890535-30890593)
chr8 (27-135)||(45365390-45365497)
chr8 (249-333)||(1171215-1171285)
chr8 (16-81)||(33630876-33630941)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (16-370)||(4580504-4580859)
chr6 (16-370)||(25353835-25354188)
chr6 (16-370)||(25343249-25343601)
chr6 (16-370)||(8650986-8651341)
chr6 (16-370)||(21191049-21191408)
chr6 (17-333)||(21197250-21197578)
chr6 (16-333)||(21770787-21771102)
chr6 (44-361)||(31756410-31756728)
chr6 (17-326)||(21783545-21783862)
chr6 (16-314)||(30905821-30906118)
chr6 (121-326)||(21789768-21789979)
chr6 (140-333)||(17581384-17581572)
chr6 (27-204)||(12801889-12802065)
chr6 (157-330)||(28728047-28728218)
chr6 (16-148)||(6096932-6097067)
chr6 (16-94)||(17581226-17581304)
chr6 (16-287)||(1105935-1106206)
chr6 (27-110)||(13007348-13007431)
chr6 (231-334)||(20745394-20745497)
chr6 (38-113)||(17900581-17900656)
chr6 (168-204)||(12801645-12801681)
chr6 (225-320)||(17900378-17900472)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (16-370)||(24287609-24287963)
chr4 (16-370)||(10733535-10733887)
chr4 (16-370)||(10947304-10947656)
chr4 (16-370)||(48166800-48167155)
chr4 (16-370)||(6257388-6257742)
chr4 (16-370)||(48160581-48160936)
chr4 (16-370)||(10739522-10739874)
chr4 (16-370)||(10953291-10953643)
chr4 (16-333)||(26957023-26957341)
chr4 (17-364)||(50168218-50168565)
chr4 (158-370)||(33458450-33458662)
chr4 (16-356)||(44831814-44832152)
chr4 (16-284)||(26971824-26972092)
chr4 (158-367)||(33461578-33461787)
chr4 (27-361)||(49976234-49976555)
chr4 (17-365)||(35177413-35177770)
chr4 (17-331)||(17627002-17627311)
chr4 (121-332)||(50155690-50155897)
chr4 (20-369)||(19686511-19686854)
chr4 (31-351)||(4632012-4632339)
chr4 (292-370)||(10733429-10733507)
chr4 (292-370)||(10947198-10947276)
chr4 (26-93)||(50426879-50426946)
chr4 (32-202)||(28704170-28704340)
chr4 (256-334)||(32284542-32284620)
chr4 (234-352)||(33045085-33045203)
chr4 (258-333)||(3769434-3769509)
chr4 (91-276)||(9237081-9237262)
chr4 (20-71)||(33461797-33461848)
chr4 (20-71)||(33458672-33458723)
chr4 (275-318)||(50427238-50427281)
chr4 (30-82)||(37607352-37607404)
chr4 (219-262)||(50427193-50427237)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (16-370)||(173073-173427)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (17-370)||(1377-1724)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (17-370)||(802-1135)
[»] scaffold1114 (2 HSPs)
scaffold1114 (17-280)||(686-949)
scaffold1114 (260-333)||(950-1023)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (16-247)||(5589-5821)
scaffold0185 (275-338)||(5826-5889)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (17-242)||(13896-14121)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (25-314)||(38059-38347)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (324-370)||(5465-5511)
[»] scaffold0449 (1 HSPs)
scaffold0449 (16-51)||(1281-1316)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28421496 - 28421142
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421496 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 28421397  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421396 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 28421297  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421296 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 28421197  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421196 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 28421142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3811706 - 3811356
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  3811706 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 3811609  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3811608 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 3811511  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3811510 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaag 3811411  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctcttt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3811410 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatcttctctcttt 3811356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3817848 - 3817494
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  3817848 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatgaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 3817751  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3817750 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 3817653  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3817652 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaag 3817553  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3817552 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggtt 3817494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5979714 - 5979357
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagcc-ttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctatttt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5979714 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagcccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctatttt 5979615  T
Q  115 ggatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaat- 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||     
T  5979614 ggataattaattatttaattagttgatatggactcaacatggatggatgttcggatggccaattaacagaataatgggaaagtctaatggtcatccaata 5979515  T
Q  214 ataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5979514 ataaaagaggttatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaaga 5979415  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5979414 accaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 5979357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Original strand, 351409 - 351755
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  351409 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtcagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattgg 351507  T
Q  116 g---atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
        ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351508 ataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattactggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 351605  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351606 tataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 351705  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctct 362  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351706 atcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctct 351755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 339003 - 339356
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  339003 caaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtcagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattgg 339101  T
Q  116 g---atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
        ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  339102 ataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattactggaataatgggaaacc-taatggccatccaa 339198  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339199 tataaaagaggtcatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 339298  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339299 atcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 339356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 355
Target Start/End: Original strand, 5849153 - 5849492
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  5849153 aaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-gg 5849250  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  5849251 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgttcggatggtccattaacggaataatgagaaaccttaatggtcatccaa 5849348  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5849349 tataaaagaggctatggtcctcaatataccgtacacggcaaactctcttttctccccatctgaagataacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 5849448  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcat 355  Q
    |||||||||| |||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  5849449 accaaatcagacgccgctaacatatgttgtgtatttcagatcat 5849492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35148546 - 35148204
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  35148546 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattatgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttggatttctaatt-g 35148449  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35148448 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggctcattaacagaataatgggaaactctaatggccatcca 35148351  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148350 atataaaagaggctatgatccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 35148251  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaac--tctattgtgtgtttcagatcatc 356  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  | | |||||||||||||||||||    
T  35148250 aaccaaatcagccgctgctgaccatattttgtgtgtttcagatcatc 35148204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22742467 - 22742149
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  22742467 caaataccgtaacaataattatattagttatttatcaactgtgagccttagttgattagtgataaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattag 22742369  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
     ||| |||||||    | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742368 -ataattaattaaatatataagtagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 22742272  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22742271 atataaaagagactatggtctccaatataccgtacatggcaaaactctctcttctcccaatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccagttgatgaa 22742172  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  22742171 aaaccaaatcagccgccgctaac 22742149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 26383291 - 26383569
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  26383291 caaatatcataataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 26383388  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    |||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26383389 gataattaattaaatatttaattaatgaatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 26383486  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26383487 atataaaagaggctatggtccctaatacaccggacacggcaaactctctcttctccctatttgaagagaacttgaggcataaa 26383569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 361
Target Start/End: Original strand, 43539617 - 43539949
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |       
T  43539617 caaatatcgtaaaaataattatattaattatttatcatttgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggtt--ttagatttataat--- 43539711  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
               ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  43539712 -----------atttaattaattgatatggactcaa--tgagtggatgtctggatgacccattaacggaataacggaaaaccctaatggtcacccaatat 43539798  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctc---cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43539799 aaaagaggttatggtccccaatataccgtgcacggcaaactctctcttctccttcccatctgaagagaactttaggcataaaggtactggttgaggaaga 43539898  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaac--tctattgtgtgtttcagatcatctcctc 361  Q
    |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  43539899 accaaatcagtcgccgctaaccatattttgtgtgtttcagatcatcacctc 43539949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Original strand, 15843730 - 15843923
Alignment:
Q  178 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg-tacacggcaaactctctcttctccccatctgaa 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15843730 taacggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaa 15843829  T
Q  277 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15843830 gagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttccgatcatctcctctctttggtt 15843923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Original strand, 15860839 - 15861032
Alignment:
Q  178 taacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccg-tacacggcaaactctctcttctccccatctgaa 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860839 taacggaataatgggaaactctaatggtcatccaatataaaagaggttatggtctccaatacaccggtacacggcaaactctctattctccccatctgaa 15860938  T
Q  277 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15860939 gagaacttgaggcataaatgtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttccgatcatctcctctctttggtt 15861032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 206 - 370
Target Start/End: Original strand, 20238762 - 20238927
Alignment:
Q  206 catccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238762 catccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggtt 20238861  T
Q  305 gaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20238862 gaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggtt 20238927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35153066 - 35152849
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  35153066 caaatatcgtaacaataattatattagatatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttcgatttctaatt-g 35152969  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35152968 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 35152871  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35152870 atataaaagaggctatggtccc 35152849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 26380751 - 26381023
Alignment:
Q  37 tattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattatttaattag 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||              
T  26380751 tattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaaataataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaatt---------- 26380838  T
Q  137 ttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaa 236  Q
      |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||       ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26380839 --gatatgaactcaa--tgagtgcatgtccggatgacccat-------ataatgggaaatcttaatggtcatccaatataaaagag-ctatggtccccag 26380926  T
Q  237 tacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26380927 tacatcagacacgacaaactctctcttctcccgatctgaagaaaactttaggcataaaggtagcagttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 26381023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 229 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35150865 - 35150736
Alignment:
Q  229 gtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccg 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35150865 gtccccaatacaccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaagaataaccaaatcagccgccg 35150766  T
Q  329 ctaac--tctattgtgtgtttcagatcatc 356  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  35150765 ctaaccatattttgtgtgtttcagatcatc 35150736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18657132 - 18656883
Alignment:
Q  70 attagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattattt-aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccgg 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  18657132 attagtgatcacattaagtaataaggctaattagattttta-tttggataattaattatttaaattaattaatatggactc--tatgagtggatgtctgg 18657036  T
Q  169 atggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatc-caatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctcc 267  Q
    ||| ||||||||   |||||||| ||| |||||||| |||| || | |  |||||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||     
T  18657035 atgacccattaatacaataatggtaaatcctaatgg-catcacactgt--aagaggctattgtctccaatgcaccatacacgacaaactttctcttctct 18656939  T
Q  268 ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc 323  Q
    || |||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18656938 ccgtctgaagagaactaaagacataaaagtaacagttgaggaagaaccaaatcagc 18656883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 370
Target Start/End: Original strand, 7608163 - 7608421
Alignment:
Q  128 tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctat 227  Q
    ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  7608163 tttaattagttgatatggggtta--atgagtggatgtccggatgacccattaatgaaataatgaaaaaccctaatgaccatccaatataaaagatgttat 7608260  T
Q  228 ggtccccaatacaccgtacacggca----aact-----------ctctcttct-ccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||    ||||            |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  7608261 ggtccccaatacaccggacaagacaagagaacttgagtcataaagtctcttctcccccatcggaagagaacttgagtcataaaggtaccgatttaggaag 7608360  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaa--ctctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
     |||||||||| |||||||||  | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7608361 taccaaatcagtcgccgctaatccgcttatgtgtgtttcagatcatctcatctctttggtt 7608421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 42767633 - 42767505
Alignment:
Q  121 ttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaag 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||    
T  42767633 ttaaatatttaattagttgatatggacttca-atgagtggatgtctggatgatccattaacggaataataggaaaccctaatggccat---atataaaag 42767538  T
Q  221 aggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa 253  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42767537 aggctatggtcccgaatataccgtacacggcaa 42767505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Original strand, 8824433 - 8824701
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||     
T  8824433 caaatatctttataataattatattagctatttatcaattgtgaggcttaattgattaatgatcgaattaggtaataaggat-attagatttc--tttta 8824529  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||| |||        |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||  || |    
T  8824530 gataattaattaatta--------atatggactcaatatgagtggatgtctggatgactca-taacggaataatgagaaaccttaatgaccatcacat-t 8824619  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtac 299  Q
    | ||||| | ||||||||||| | ||  ||||||  |||  |||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  8824620 ataagagaccatggtccccaacatactctacacgaaaaaacctctcttctcccc--ttgaagagaacatgaggcaaaaaagtac 8824701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 30219598 - 30219519
Alignment:
Q  30 ataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta 110  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  30219598 ataataatagtagttatttattaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagttataaag-ttattagatttcta 30219519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18667006 - 18666930
Alignment:
Q  35 tatattagttatttatcaattgtgagcctta--attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta 110  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18667006 tatattagttatttatcaaccgtgagccttataattgataagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta 18666930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 334
Target Start/End: Original strand, 3677876 - 3677965
Alignment:
Q  245 acacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaact 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  3677876 acacgacaaacattctcttctctccatctgaagagaaattgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaacaaatcaactgccggtaact 3677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Original strand, 7608070 - 7608114
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgag 60  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7608070 caaatatcataataataattatatcagttatttatcaattgtgag 7608114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 24690652 - 24690743
Alignment:
Q  126 tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagag 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    || ||||||||| |||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  24690652 tatttaattagttaatatggactcaatatgagtggatgtc----tgacccattaacagaataatgagaaa-cctaacgatcatctaatataaaagag 24690743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 333
Target Start/End: Original strand, 12803893 - 12803938
Alignment:
Q  288 gcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  12803893 gcataaaggtaccggttgaggaagaacctaatcagtcgtcgctaac 12803938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 333
Target Start/End: Original strand, 24690848 - 24690881
Alignment:
Q  300 cggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24690848 cggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 24690881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 240
Target Start/End: Original strand, 15843687 - 15843726
Alignment:
Q  201 atggccatccaatataaaagaggctatggtccccaataca 240  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15843687 atggtcatccaatataaaagaggttatggtccccaataca 15843726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 240
Target Start/End: Original strand, 15860796 - 15860835
Alignment:
Q  201 atggccatccaatataaaagaggctatggtccccaataca 240  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15860796 atggtcatccaatataaaagaggttatggtccccaataca 15860835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12686716 - 12686362
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686716 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 12686617  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12686616 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatat 12686517  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686516 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 12686417  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686416 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 12686362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12692818 - 12692464
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692818 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 12692719  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12692718 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaaatat 12692619  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692618 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 12692519  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692518 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 12692464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32094759 - 32094404
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094759 caaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 32094660  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32094659 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtgtatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatctaatat 32094560  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094559 aaaagaggctatggtcccaaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 32094460  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32094459 caaattagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggtt 32094404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32097559 - 32097205
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32097559 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattggttagtgatcaaattaaataataag-ctaattagatttctattttg 32097461  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097460 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 32097361  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097360 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggaaatactctctattctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 32097261  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32097260 taaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggtt 32097205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28525922 - 28525569
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  28525922 aaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctg-ttagatttctaatt-gg 28525825  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525824 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 28525727  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525726 tataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 28525627  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525626 atcaaatcagccaccgctgactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 28525569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28532018 - 28531665
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  28532018 aaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctg-ttagatttctaatt-gg 28531921  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531920 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 28531823  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28531822 tataaaagaggctatggtctccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtactggttgaggaaga 28531723  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531722 atcaaatcagccaccgctgactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 28531665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 41296901 - 41297259
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  41296901 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 41296998  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41296999 gataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatggtcatcca 41297096  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagaga---acttgaggcataaaggtaccggttgag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41297097 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaactacttgaggcataaaggtaccggttgag 41297196  T
Q  308 gaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41297197 gaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcacctcctctccttggtt 41297259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7390084 - 7389730
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  7390084 aaatatcgtaacgataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-gg 7389987  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7389986 ataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaa--tgagtggatgttcggatgacccattaacggaataatgggaaactctaatggccatccaa 7389889  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389888 tataaaagaggctatggttcccaatatactgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 7389789  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389788 aaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 7389730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19060300 - 19059991
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatt---ta 123  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||    
T  19060300 ataataattatattagctatttgtcaatttggagacttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttagaatattaatta 19060201  T
Q  124 attatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagagg 223  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19060200 attaattaattaatggatatggactcaatatgagtggatgtctggatgtcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagagg 19060101  T
Q  224 ctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc 323  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19060100 ctatggtccccaatacatcagacacgacaaactctctcttctcccgatatgaagagaacttgaggcataaaagtaccagttgaggaagaaccaaatcagc 19060001  T
Q  324 cgccgctaac 333  Q
    ||||||||||    
T  19060000 cgccgctaac 19059991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 353
Target Start/End: Original strand, 20499760 - 20500098
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |    
T  20499760 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaagtaataagacta-ttagatttctagtaag 20499858  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
     ||| |||||||    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20499859 -ataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaa--tgagtggatgtctggatggcccattaacgaaataatggaaaaccctaatggtcatcca 20499955  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20499956 ataaataagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctgttctctccatttgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttaaggaa 20500055  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatc 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  | |||| |||||||||||    
T  20500056 gaaccaaatcaaccgctgctaaccttcttgtttgtttcagatc 20500098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19066634 - 19066332
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatt 126  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  19066634 ataataattatattaattatttgtcaatctggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaacaaggcttattagatttctatttagaatatt-aatt 19066536  T
Q  127 atttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggcta 226  Q
      ||||||| | ||||||||    | ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |     
T  19066535 gattaattaatggatatggat---atatgagtggatgtctggatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatgaccatccaatataaaataggttg 19066439  T
Q  227 tggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgc 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19066438 tggtccccaatacaccggacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagctgc 19066339  T
Q  327 cgctaac 333  Q
    |||||||    
T  19066338 cgctaac 19066332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 30771905 - 30772246
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| | |||    
T  30771905 caaatatcgtaataataattatattagct---tatcagttgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctataaag-tttct-tattg 30771999  T
Q  116 gatatttaattat----ttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||  ||||||    
T  30772000 gataattaattaaataattaattagttgatatggactcaatatgagtggatgtctggatgacccattaacagaataatgaaaaaccctgatgatcatcca 30772099  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30772100 atatagaagagactatggtccacaatatatcagacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 30772199  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaa--ctctattgtgtgtttcagatcatc 356  Q
    || ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  30772200 aatcaaatcagccgccgctaaccctttgttgtgtgtttcagatcatc 30772246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 30384921 - 30384586
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  30384921 caaatattgtaataataattatattagctatttatcagttgtgagccttaattgattagtgattaaattaagtaataaggcta-ttggatttctaattag 30384823  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
     ||| |||||||    ||| |||| | |||||||| ||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||    
T  30384822 -ataattaattaaatatttcattaatagatatggattcaa--tgagtggatgtctggatgactcattaacggaataatggaaaatc-taatagtcatcca 30384727  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30384726 atataaaagagactatggtccc-aatacaccgtacacggcaaacattctcttctccccatctgaagagaactcgaggtataaaggtaccggttgaggaag 30384628  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaa-ctctattgtgtgtttcagat 352  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  30384627 aaccaaatcagtcgccgctaagctatgttgtgtgtttcagat 30384586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 131 - 366
Target Start/End: Original strand, 14609909 - 14610141
Alignment:
Q  131 aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggt 230  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  14609909 aattaattgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatggtcatctaatgtaaaagaggttatggt 14610005  T
Q  231 ccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610006 ccccaatacaccgaacacggcaaactttcttttctccccatctgaagagaactttaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 14610105  T
Q  331 aactctattgtgtgtttcagatcatctcctctcttt 366  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14610106 aacccttttgtttgtttcagatcatctcctctcttt 14610141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 26509491 - 26509809
Alignment:
Q  28 taataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatta 127  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||     |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26509491 taataattatattaactatttatcaatttggagccttaat-----agtgatcaaattaagtaacaagaatgattagatttctattt-ggataattaatta 26509584  T
Q  128 tttaat-tagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggcta 226  Q
    |||||  || |||||||| |||| |  |||||||||||  |||||| |||| ||||||||| || |||||  ||||||| |  ||   || |||||| ||    
T  26509585 tttaaaataattgatatgaactcta--tgagtggatgtttggatggtccatcaacggaatattgagaaactttaatggcaaatcacactataagaggtta 26509682  T
Q  227 tggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgc 326  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  26509683 tggtccacgatataccgtacacggtaaactctcccttttcc--atctgatgagaactagaggcataaaggtaccgattgaggaagtatcaaatcagccgc 26509780  T
Q  327 cgctaactcta--ttgtgtgtttcagatc 353  Q
    | |  ||||||  |||||| |||||||||    
T  26509781 caccgactctatgttgtgtatttcagatc 26509809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 14609753 - 14609846
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  14609753 caaatatcgtaataataattatattagttacttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaaact-attagatttcta 14609846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33753754 - 33753476
Alignment:
Q  30 ataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattag-----tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaa 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||     |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |         ||    
T  33753754 ataattatattagctatttatcaatttggagctttaattgattagattagtgatcaaactaagtaataagtttgattagatttctatct---------aa 33753664  T
Q  125 ttatttaattagttgatatgga-ctcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagagg 223  Q
     || ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||     
T  33753663 ataattaattaattgatatgaaactcaatatgagtggatttatggatgatacattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatcatat-taaaagagc 33753565  T
Q  224 ctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  33753564 ctatgttcctcagtacaccgtacacaccatactctctcttctccccatccaaggagaacttgaggcataaaaataccgtttgagaaaga 33753476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26318765 - 26318492
Alignment:
Q  31 taattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattattt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||                 ||||||    
T  26318765 taattatattagttatctatcaattctgagacttaattgattagtgattaaattaattaataaagata-ttagattt-----------------ttattt 26318684  T
Q  131 aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaa-ccctaatggccatc-caatataaaagaggctatg 228  Q
    |  || |||||||||||||||  |||||| |||||  ||||| ||||||| | |||||||  ||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  26318683 agataattgatatggactcaatttgagtgaatgtctagatggtccattaatgaaataatgaaaaaaccctaatggtcatcacactatataagaggctatg 26318584  T
Q  229 gtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatca 321  Q
     ||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26318583 atccccaatatatcggaaacgacaaactctctcttctccc-atctgaagagaacttatggtataaatgtaccggttgagaaagaaccaaatca 26318492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22648014 - 22647928
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22648014 ataataattatattaattatttataaatttggagtcttaattaattagttatcaaattaagtaataagactaattagatttctattt 22647928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8706916 - 8706846
Alignment:
Q  24 gtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataag 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8706916 gtaataataattatattagctatttatcaactgtgggtcttaattgattagtgatcaaattaagtgataag 8706846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33849385 - 33849110
Alignment:
Q  30 ataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattag-----tgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaa 124  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||     |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||         ||    
T  33849385 ataattatattagctatttattaatttggagctttaattgattagattagtgatcaaactaagtaataagtttgattagatttctattt---------aa 33849295  T
Q  125 ttatttaattagttgatatgga-ctcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagagg 223  Q
     || ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |  |||||   ||   |||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||     
T  33849294 ataattaattaattgatatgaaactcaatatgagtggatttatggatgataca---acggaataatgggaaaccctaatgactatcatat-taaaagagc 33849199  T
Q  224 ctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    ||||| ||| || ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  33849198 ctatgttcctcagtacactgtacacaccatactctctcttctccccatccaaggagaacttgaggcataaaaataccgtttgagaaaga 33849110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33021383 - 33021223
Alignment:
Q  28 taataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatta 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  33021383 taataattatattaattatttatcaactatgagatttgattgattagtgatcaaataaagtaa-aaaactaattagatttaca-tttggataattaatta 33021286  T
Q  128 t-ttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataat 189  Q
    | ||||||| |||||||  | |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  33021285 tcttaattaattgatataaattcaataagagtgaatgtttggatgacccattaacagaataat 33021223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25408499 - 25408435
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaat 83  Q
    |||||||||||| | |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25408499 caaatatcgtaaaagtaattatata---tatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaat 25408435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11640780 - 11640702
Alignment:
Q  32 aattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta 110  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  11640780 aattataatagctatttaacaattaggagttttaattgattagttatcaaattatgtaataaagctaattatatttcta 11640702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 38548009 - 38548065
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaat 83  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38548009 ataatgattatattatttatttatcaactaggagacttaattgattagtgatcaaat 38548065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 300 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8706672 - 8706605
Alignment:
Q  300 cggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa-ctctattgtgtgtttcagatcatctcctctcttt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    | ||||||||||||||||||||||||    
T  8706672 cggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaaccccttcaatttgtttcagatcatctcctctcttt 8706605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 12017 - 12372
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12017 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 12116  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 12216  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12217 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 12316  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12317 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 12372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 6144 - 6499
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttaaagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 6243  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6244 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 6343  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6344 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 6443  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6444 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 6499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11840263 - 11839908
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840263 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 11840164  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840163 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 11840064  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840063 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 11839964  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839963 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 11839908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42191758 - 42191403
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191758 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 42191659  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191658 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 42191559  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191558 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 42191459  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191458 caaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 42191403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42197700 - 42197345
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197700 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 42197601  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197600 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 42197501  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197500 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 42197401  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197400 caaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 42197345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10244872 - 10244517
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244872 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgttcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 10244773  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244772 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 10244673  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10244672 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaac 10244573  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10244572 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcatatcatctcctctctttggtt 10244517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10238750 - 10238395
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238750 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgttcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 10238651  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238650 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 10238551  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10238550 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaac 10238451  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10238450 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcatatcatatcctctctttggtt 10238395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17056329 - 17055976
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17056329 caaatatcgtaataataattatattatctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 17056230  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17056229 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatg-cctattaacggaataatgggaaaccctaatggacatccaatat 17056131  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17056130 aaaagaggctatggtccccaatacatcgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 17056031  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17056030 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctatctttggtt 17055976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26429955 - 26429639
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26429955 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 26429856  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26429855 gataattaattatttaattagttgatatgggctcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccagtat 26429756  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26429755 aaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 26429656  T
Q  315 caaatcagccgccgcta 331  Q
    |||||||||||||||||    
T  26429655 caaatcagccgccgcta 26429639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10769507 - 10769152
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  10769507 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 10769410  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769409 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 10769312  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769311 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 10769212  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10769211 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtatttcagatcatctcctctctttggtt 10769152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10761188 - 10760833
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  10761188 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 10761091  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10761090 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatcca 10760993  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10760992 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaa 10760893  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760892 gaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 10760833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38449601 - 38449246
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  38449601 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 38449504  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38449503 gataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 38449406  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449405 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 38449306  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449305 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 38449246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 49151235 - 49151588
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  49151235 aaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctg-ttagatttctaatt-gg 49151332  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151333 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 49151430  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151431 tataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 49151530  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151531 atcaaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 49151588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 49157302 - 49157655
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||    
T  49157302 aaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggctg-ttagatttctaatt-gg 49157399  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157400 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 49157497  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157498 tataaaagaggctatggtccccaatataccgtacatggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacgtgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 49157597  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157598 atcaaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 49157655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38456088 - 38455733
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  38456088 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtgttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 38455991  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38455990 gataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 38455893  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455892 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 38455793  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455792 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 38455733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 55003939 - 55003595
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55003939 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaatttattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 55003840  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||    
T  55003839 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaac-------gtcatccaatat 55003747  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||    
T  55003746 aaaagaggttatggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgag---gaacc 55003650  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  55003649 aaatcagccgccgctaactctattgtgtatttcagatcatcttttctctttggtt 55003595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30051638 - 30051285
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |    
T  30051638 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaagata-ttagatttctaatt-g 30051541  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30051540 gataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaac--gagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatggccatcca 30051444  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051443 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctgcccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 30051344  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051343 aatcaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 30051285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 8331409 - 8331763
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||    
T  8331409 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtggaccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggat-ataagatttcta-attg 8331506  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8331507 gataattaattaaatatttaatcagttgatatggactta--atgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 8331604  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331605 atataaaagaggctatggtccccaatacactgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 8331704  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8331705 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgttttagatcatctcctctctttggtt 8331763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Original strand, 28964502 - 28964833
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |    
T  28964502 caaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaagtta-ttagatttctaatt-g 28964599  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28964600 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggtccattaacggaataatgagaaaccctaatggtcatcca 28964697  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||    
T  28964698 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggaaaactctctcttctccccatctgaagagaactcgaggcat--------cggttgaggaag 28964789  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctat-tgtgtgtttcagatca 354  Q
    |||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  28964790 aaccaaattagccgccgctaacactttatgtttgtttcagatca 28964833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17602070 - 17601879
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17602070 aaatatcatagtaataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtggtcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 17601971  T
Q  117 atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccat 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17601970 ataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgattggatgtccgaatgacccattaacggaataatgacaaaccctaatggccat 17601879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 140 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48128451 - 48128239
Alignment:
Q  140 atatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatac 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48128451 atatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatggaaaaccttaatggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatat 48128354  T
Q  240 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctatt 339  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  48128353 accgtacacggcaaacattctcttctccctgtctgaagagaactaaaggcataaaggtaccagttgaggaagaaccaaatcagccgctgctaacattgtt 48128254  T
Q  340 gtgtgtttcagatca 354  Q
    || |||| |||||||    
T  48128253 gtttgttccagatca 48128239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 356
Target Start/End: Original strand, 13444840 - 13445020
Alignment:
Q  177 ttaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctga 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||    
T  13444840 ttaacgaaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaataggttatggtccccaatacaccgtacacaacgatattctctcttctccccatctga 13444939  T
Q  276 agagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||    
T  13444940 agagaacttgaggcataaaagtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaaccctgttttgtggttcagatcatc 13445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 330
Target Start/End: Original strand, 46656341 - 46656610
Alignment:
Q  55 tgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatta----tttaattagttgatatggactca 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||    ||||||||||||||||| ||||     
T  46656341 tgtgagctttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaatatttaattagttgatatgtactcg 46656438  T
Q  151 acatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgg 250  Q
    |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||         
T  46656439 a--tgagtggatgtccggatgacctattaacggaataatgggaaaccctattggttatccaatataaaagaggttatggttcccaatacaccgta----- 46656531  T
Q  251 caaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 330  Q
     ||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  46656532 -aaacattctcttctccccatctgaatagaattagagacataaaggtgccggttaaggaagagccaaatcaatcgccgct 46656610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11846515 - 11846340
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11846515 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaatggattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta-attg 11846417  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatg 190  Q
    |||| |||||    |||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846416 gataattaattaaatatttaattagttgatattgagtca--atgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatg 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 53069443 - 53069254
Alignment:
Q  161 atgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaa--gaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactct 258  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53069443 atgtccggatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatgatcgtccaatataaaaaagaggctatggtcctcaatacaccgtacatggcaaactct 53069344  T
Q  259 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac--tctattgtgtgtttcagatcatc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  53069343 ctcttctccccatctgaagagaact----------aggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccatattttgtgtgtttcagatcatc 53069254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12109203 - 12108859
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||  ||  |||||| || |     
T  12109203 aaatatcgtaataataattgtattagttatttatcaattgtgatctttaattgattagtgataaaattaagtgataatgtta--taagtttctaattag- 12109107  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| || ||||    ||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| | | |||||||||||||| ||||    ||||| ||| |||    
T  12109106 ataattgattaaacatttgattaattgatatggactcaatatgagttgatgtctagatgactcgttaacggaataatgagaaataacaatggtcattcaa 12109007  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||     ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12109006 tataaaagagagtacggtcctcaatacatcgtacacggcaaactatcttttcttccgatctgaa-----cttgaggcataaaggtaccggttaaagaaga 12108912  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaa-ctctattgtgtgtttcagatcatctcctctct 364  Q
    |||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  12108911 accaaatcagtcgccgctaacctatgttgtgtgtttcatatcacctcatctct 12108859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23138954 - 23138779
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||    
T  23138954 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataagact-attagatttcta-attg 23138857  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgg 191  Q
    |||| |||||    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23138856 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgg 23138779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 254 - 352
Target Start/End: Original strand, 13837534 - 13837632
Alignment:
Q  254 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837534 actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagat 13837632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2982764 - 2982458
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||      
T  2982764 caaatattgtaataataattatataatctatttatcaatagcgagccttatttgattagtgatcaaattaaataataaagatatttagatttctaattga 2982665  T
Q  116 gatatt---taattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
     | |||   ||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||||| ||| | ||    
T  2982664 aaaattaattaaatatttaattagttgatataaactcaatacgagtatatgtcaggatgacccattaaaagaataatga-aaatcctaatgaccaacaaa 2982566  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||   |||| |||||    
T  2982565 tataaaagaggtcatggtcccaaatataccatatacggcgaactctcttttctccctatctgaagagaacttaagacataaagatacttattgaagaaga 2982466  T
Q  313 accaaatc 320  Q
    ||||||||    
T  2982465 accaaatc 2982458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 53071789 - 53071640
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  53071789 caaatatcataacaataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attg 53071692  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtc 165  Q
    |||| |||||    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  53071691 gataattaattgaatatttaattagttgatatgaactca--atgagtggatgtc 53071640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13367233 - 13367114
Alignment:
Q  157 gtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaact 256  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||      
T  13367233 gtggatgtctggatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatgaccatccaatat-aaagaggctatggtccccaatataccgtacatagcaaaac 13367135  T
Q  257 ctctcttctccccatctgaag 277  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13367134 cgctcttctccccatctgaag 13367114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11846340 - 11846246
Alignment:
Q  277 gagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaa-tcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11846340 gagaacttgcggcataaaggttccggttgaggaagaaccaaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggtt 11846246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24644028 - 24643890
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||    
T  24644028 caaatatcctaacaataattacattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaacaaggct-attagatttcta-attg 24643931  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaac 152  Q
    |||| |||||    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24643930 gataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaac 24643890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 277
Target Start/End: Original strand, 9760481 - 9760600
Alignment:
Q  157 gtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaact 256  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||      
T  9760481 gtggatgtctggatggtccattaaaggaataataggaaaccctaatggtcatccaatat-aaagaggatatggtccccaatataccgtacatagtaaaac 9760579  T
Q  257 ctctcttctccccatctgaag 277  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  9760580 cgctcttctccccatctgaag 9760600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9586550 - 9586490
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtg 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9586550 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtg 9586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8474673 - 8474595
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagcctt-aattgattagtgatcaaattaagtaataa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8474673 caaatatcgtaataataattatattaacttttaatcaattgtgggcctttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 8474595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Original strand, 34300060 - 34300138
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataag 94  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  34300060 caaacatcataataataattatattaactatttatcaattgtgagaattaattgattagtaattgaattaagtaataag 34300138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24643878 - 24643817
Alignment:
Q  205 ccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctcccc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24643878 ccatccaatataaaagaggctatgg-ccccaatacaccgt--acgacaaactctctcttctcccc 24643817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 333
Target Start/End: Original strand, 34300348 - 34300429
Alignment:
Q  252 aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  34300348 aaactctctcatctcctcgtatgaagagaacttgaggcatgaaagtaccggttgaagaataaccaaataagtcgccgctaac 34300429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24643815 - 24643773
Alignment:
Q  291 taaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24643815 taaaggtaccggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaac 24643773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17593537 - 17593487
Alignment:
Q  205 ccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaac 255  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17593537 ccatacaatataaaagaggctctggtcccaaatataccgtacacggcaaac 17593487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17000910 - 17000868
Alignment:
Q  65 aattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagattt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  17000910 aattgattagtgatcacattaagaaataaggctaattatattt 17000868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 13455721 - 13456076
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455721 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 13455820  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455821 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 13455920  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455921 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 13456020  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13456021 caaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 13456076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 13461662 - 13462017
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461662 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 13461761  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461762 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 13461861  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461862 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 13461961  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461962 caaatcagccaccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 13462017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 36750036 - 36750391
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750036 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 36750135  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750136 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 36750235  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36750236 aaaagaggctatggtctccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaagaac 36750335  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750336 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 36750391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35085217 - 35084893
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085217 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 35085118  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35085117 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatccaatat 35085018  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085017 aaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 35084918  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctatt 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  35084917 caaatcagccgccgctaaccctatt 35084893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35091189 - 35090866
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091189 aaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 35091090  T
Q  117 atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatata 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35091089 ataattaattatttaattagttgatatagactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatccaatata 35090990  T
Q  217 aaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090989 aaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 35090890  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactctatt 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  35090889 aaatcagccgccgctaaccctatt 35090866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28683482 - 28683128
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  28683482 caaatatcgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 28683385  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    ||||  ||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683384 gataaataattaaacatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 28683287  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683286 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 28683187  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  28683186 aaccaaatcagccgctgttaactctattgtgtgtttcagatcatccactctccttggtt 28683128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44717340 - 44716988
Alignment:
Q  19 atatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggat 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  44717340 atatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggat 44717243  T
Q  119 atttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaata 214  Q
    | |||||||    | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44717242 aattaattaaatatataattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatggaaaaccctaatgaccatccaata 44717145  T
Q  215 taaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44717144 taaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactatctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaa 44717045  T
Q  314 ccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44717044 ccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 44716988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 30964949 - 30965304
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |    
T  30964949 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataagacta-ttagatttctaatt-g 30965046  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30965047 gataattaattaaatatttaattagttgatatggattcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaatcctaatggccatcta 30965144  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965145 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 30965244  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30965245 gaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggtt 30965304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 31001998 - 31002353
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  31001998 caaatatcataacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 31002095  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31002096 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccataatggccatcca 31002193  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002194 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacaacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 31002293  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31002294 gaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctttttggtt 31002353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 370
Target Start/End: Original strand, 31007989 - 31008331
Alignment:
Q  29 aataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatta- 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||     
T  31007989 aataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaa 31008086  T
Q  128 ---tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggc 224  Q
       ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31008087 atatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccgaatgacccattaacggaataatgggaaaccataatggccatccaatataaaagaggc 31008184  T
Q  225 tatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagc 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  31008185 tatggtccccaatataccgtacacaacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaagtaccggttgaggaagaaccaaattagt 31008284  T
Q  324 cgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31008285 cgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctttttggtt 31008331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13150227 - 13149867
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  13150227 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggcattagttgattattgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 13150130  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13150129 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtacggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcta 13150032  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctc-----cccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttg 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150031 atataaaagaggttatggtccccaatataccgtacacggcaatattctctcttctcctcatctcatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttg 13149932  T
Q  306 aggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149931 aggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 13149867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 23343185 - 23343493
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23343185 caaatatcataataataattatattaactatttatcaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttag 23343284  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
            | || ||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23343285 --------agtaattaattaatggatatggactcaatataggtggatgtccggatgacccattaacagaataatgg-aaaccctaatgaccatccaatat 23343375  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23343376 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgggaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgaggaagaacc 23343475  T
Q  316 aaatcagccgccgctaac 333  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  23343476 aaatcagccgctgctaac 23343493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 19879217 - 19879536
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  19879217 aaatatcgtaataataactatattagctatttattaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattgga 19879315  T
Q  117 ---atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaat 213  Q
       ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19879316 taaataattaaatatttaattaattgatattgactcaa--tgagtgaatgtccagatgacccattaacggaataatgggaaact-taatggccatccaat 19879412  T
Q  214 ataa-----aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgag 307  Q
    ||||     |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19879413 ataacataaaagaggttatggtcgccaatacatcgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaa 19879512  T
Q  308 gaagaaccaaatcagccgccgcta 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  19879513 gaagaatcaaatcagccgccgcta 19879536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35439908 - 35439671
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  35439908 caaatatcgtaacaataattatattcgttatttatcaattgtgagccttgattgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 35439811  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35439810 gataattaattaaatatttaattagttgatatgaacttaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 35439713  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35439712 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaa 35439671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11048985 - 11048776
Alignment:
Q  121 ttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaag 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11048985 ttaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgggtggatgtctggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggcgatccaatataaaag 11048888  T
Q  221 aggctatggtccccaatacaccgtacacggca----aactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacca 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11048887 aggctatggtccccaatacatcgtacacggcaaaccaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccagttgaggaagaacca 11048788  T
Q  317 aatcagccgccg 328  Q
    ||| || |||||    
T  11048787 aattagtcgccg 11048776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35442369 - 35442187
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  35442369 aaatatcgtaacaataattatattcgctatttatcaattgtgagccttgattgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attgg 35442272  T
Q  117 atatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccct 199  Q
    ||| |||||    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35442271 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatggaaaaccct 35442187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 244 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35439014 - 35438925
Alignment:
Q  244 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35439014 tacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 35438925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 321
Target Start/End: Original strand, 28765248 - 28765508
Alignment:
Q  60 gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattatt-taattagttgatatggactcaacatgagt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| || | ||| || |||||||| |||| | ||||||    
T  28765248 gccttaattgattagtgatcaaattaaatgataaggctaattatatttttattt-ggataattaactaatataaataattgatatgaactcgatatgagt 28765346  T
Q  159 ggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactct 258  Q
    | ||||  ||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||  |    
T  28765347 gaatgtatggatgactcatcaacggaataatggaaaactctaatggcgattcaatataaaagaggcaatggt-cccattacaccatacacgacaaacatt 28765445  T
Q  259 ctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatca 321  Q
     | ||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28765446 atattctctcattccgaagagaatttgaggcatcaaggtacctattgaggaagaaccaaatca 28765508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7771722 - 7771500
Alignment:
Q  18 aatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgga 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||    
T  7771722 aatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtaagtcttagttgattactgatcaaattaagtaataaagct-attagatttcta-attgga 7771625  T
Q  118 tatttaat----tatttaattagttgata-tggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    || |||||    |||||||||||||||||  ||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  7771624 taattaattaaatatttaattagttgatacgggactc--gatgagtggacgtccggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaatcgtcatccaa 7771528  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacacc 242  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  7771527 tataaaa-aggttatggt-cccaatacacc 7771500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Original strand, 23283865 - 23283955
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23283865 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttggagtcttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatt 23283955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 333
Target Start/End: Original strand, 29832877 - 29833142
Alignment:
Q  66 attgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaac----atgag 157  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||| |||||||    |||||||| |||||||||||||||     |||||    
T  29832877 attgattagtgataaaattaagtaataagacta-ttagacttttaatt-ggataattaattaaatatttaattaattgatatggactcaatgggaatgag 29832974  T
Q  158 tggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactc 257  Q
    || ||||| | ||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |   ||||||||||||||||||   |||    ||||||    
T  29832975 tgaatgtcagaatgacccatcaacagaataatgagaaaccctaatggtcattcgatataaatg---ctatggtccccaatacacg--aca----aaactc 29833065  T
Q  258 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaa-tcagccgccgctaac 333  Q
    | | ||||| |  |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29833066 tatattctctctgtctgaagagaacttgaaggataaatgtatcggttgaggaagaaccaaatttagccgccgctaac 29833142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Original strand, 23284680 - 23284784
Alignment:
Q  129 ttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatg 228  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  23284680 ttaattaatggatattgactcaatatgggtggatgttctgatgacccattaacggaataatgtgaaactctaatggccatcaaatataaaagatgttatg 23284779  T
Q  229 gtccc 233  Q
    |||||    
T  23284780 gtccc 23284784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 332
Target Start/End: Original strand, 29034697 - 29034759
Alignment:
Q  270 atctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29034697 atctgaagagaacttgagacataaaggtaccagttgaggaagaatcaaatcagccaccgctaa 29034759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 333
Target Start/End: Original strand, 31651360 - 31651564
Alignment:
Q  121 ttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatc-caatataaaa 219  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||  ||    
T  31651360 ttaaatatttaattaattgatatggactca--atgagtcgatgtctagatgatccattaaaagaataatgggaaaccttaatgaccatcacaccat--aa 31651455  T
Q  220 gaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaat 319  Q
    |||| || ||||||||||| ||||     |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||   ||| || |||||||||||    
T  31651456 gaggttacggtccccaatataccg-----gcaaaactctttcttctccccatctgaagataacttgatatttaaaggtattagttaagaaagaaccaaat 31651550  T
Q  320 cagccgccgctaac 333  Q
    || || ||||||||    
T  31651551 caccctccgctaac 31651564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 38731155 - 38731231
Alignment:
Q  15 tcaaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgag-ccttaattgattagtgatcaaattaagtaa 90  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | || ||||||||||| || ||||||||||    
T  38731155 tcaaatatctttataataattatattagtcatttatcaatttggagtctttgattgattagtggtcgaattaagtaa 38731231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 8342671 - 8342631
Alignment:
Q  70 attagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8342671 attagtgatcaaattaaataataagattaattagatttcta 8342631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 43212334 - 43212381
Alignment:
Q  31 taattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatc 79  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  43212334 taattatattagttatttatctttta-gagccttaattgattagtgatc 43212381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25382073 - 25381718
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25382073 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 25381974  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381973 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 25381874  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381873 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 25381774  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381773 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 25381718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25388040 - 25387687
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388040 caaatatcgtaataataattatattatttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 25387941  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387940 gataattaattatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgtccggatggcccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 25387843  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387842 aaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 25387743  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387742 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 25387687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 50305819 - 50306166
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50305819 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 50305918  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50305919 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatat 50306018  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  50306019 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaattctctcttctccccatctgaagagaacttgaggc-------taccggttgaggaagaacc 50306111  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50306112 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 50306166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Original strand, 1077866 - 1078209
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1077866 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataagactaattagatttctattttg 1077965  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077966 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 1078065  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078066 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctcaccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 1078165  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctc 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078166 caaatcagcggccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctc 1078209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 31051166 - 31051521
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  31051166 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 31051263  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051264 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 31051361  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31051362 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaa 31051461  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051462 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 31051521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 34739609 - 34739962
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |     
T  34739609 aaatatcgtaacaataattatattagctatttataaattgagggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaattgga 34739707  T
Q  117 ---atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaat 213  Q
       ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739708 taaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaat 34739805  T
Q  214 ataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaa 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739806 ataaaagaggctgtggtccccaatataccgtacacgacaaactctctcttctcccaatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaa 34739905  T
Q  314 ccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34739906 ccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcattttctctctttggtt 34739962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 31057666 - 31058021
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  31057666 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 31057763  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31057764 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccataca 31057861  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31057862 atataaaagaggctatgatccccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttaaggaa 31057961  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31057962 gaaccaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgttttagatcatctcctctctttggtt 31058021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8093376 - 8093029
Alignment:
Q  23 cgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatattt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  8093376 cgtaacaataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattaataatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataatt 8093279  T
Q  123 aatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaa 218  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  8093278 aattaaatgtttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaacgatcatcaaatataaa 8093181  T
Q  219 agaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8093180 agaggctatggtccccaatataccgaacacggcaaactctcttttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaa 8093081  T
Q  319 tcagccgccgctaactcta-ttgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8093080 tcagccgccgctaac-ctagttgtttgtttcagatcatctcatctctttggtt 8093029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 44409622 - 44409940
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| || |    
T  44409622 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgattaaattaggtaataaggcta-ttaggtttctaatt-g 44409719  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44409720 gataattaattaaatatttaattagttaatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgagaaaccctaatggccatcca 44409817  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44409818 atataaaagaggttatggtccccaatacactatacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaa 44409917  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44409918 gaaccaaatcagccgccgctaac 44409940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38152495 - 38152161
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  38152495 caaatattgtaacaataattatattaattatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 38152398  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38152397 gataattaattaaatatttaattagttgatatgaactcaat-------gatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaacc-taatgaccatcca 38152306  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38152305 atataaaagaggctatggttcccaatacaccgtacacgacaaactcgttcttctccccatctaaagaaaacttgaagcataaaggtaccggttgaagaag 38152206  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaac-tctattgtgtgtttcagatcat 355  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  38152205 aaccaaattagctgccgctaacgtatgttgtgtatttcagatcat 38152161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24927295 - 24926981
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatt----- 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||         
T  24927295 ataataattatattagctatttatcaatttggagtcttaattgattagtgatcaaattaagtaacaaggcttataagatttctatttagaatattaatta 24927196  T
Q  122 ------taattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
          |||||| ||||||| | |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24927195 attaattaattaattaattaatggatatggactcaa--tg-gtggatgtctggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatat 24927099  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24927098 aaaagaggctatggttcccaatactccatacgtggaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcatataggtaccggttgaggaagaacc 24926999  T
Q  316 aaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  24926998 aaatcagctgccactaac 24926981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Original strand, 27954783 - 27955124
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  27954783 caaaaatcgtaatactaattatattagttatttatcaattgtgaggcttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttctaattt- 27954880  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  27954881 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtggatgtatggatggctcattagtggaataatgggaaatcataatggtcatcca 27954980  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||   ||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27954981 atataaaagatgttatgatccccaatacac---acacgacaatacattctcttctccccatctg-agagaacttaagacataaaggtaccggttgaggaa 27955076  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaac--tctattgtgtgtttcagatcatc 356  Q
     ||| ||||||| || || ||||  | | |||||||||||||||||||    
T  27955077 taactaaatcagtcgtcgttaacattttgttgtgtgtttcagatcatc 27955124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25275584 - 25275421
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25275584 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 25275485  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccatta 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25275484 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgacccatta 25275421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24964231 - 24963940
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatt 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| | ||||| ||||    
T  24964231 ataataattatattagctatttatcaatttgaagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagcttataagatttctatttagaatatt-aatt 24964133  T
Q  127 atttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggcta 226  Q
    | ||||||| | |||||| ||||||  || ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  24964132 aattaattaatggatatgaactcaa--tgggtggatgtctgaatgacccattaacggaaaaatgg-aaaccctaattgtcatctaatataaaagatgcta 24964036  T
Q  227 tggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcag 322  Q
    || || |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24964035 tgatcaccaagacaccgtatgtggcaaactctctcttctccccatctgaagaggacttgaggcataaatgtactggttgaggaagaaccaaatcag 24963940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33458436 - 33458149
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt---tggatattta 123  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |   |   || |||    
T  33458436 ataatagttatattggttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataatgct-attagatttctaactagataattactta 33458338  T
Q  124 attatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaata-taaaagag 222  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||  |||| || |||||    
T  33458337 aatatttaattaactgatatggact-aatgtgagtggatgtccggatgatccattaatgaaataacgagaaaccctaatgaccat--aatactataagag 33458241  T
Q  223 gctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||| |   ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||  || ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  33458240 gctatgattttcaatacactagacacggcaaactctctcttcttcccatacgaatagaactatagacataaagctaccagttgagaaagaac 33458149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12184134 - 12183961
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||                  |||||||||||||||||||||| |    
T  12184134 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgagta------------------aaggctaattagatttctattt-g 12184054  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatgg 204  Q
    |||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12184053 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtagatgtccggatggccaattaacggaataatgagaaaccctaatgg 12183961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 4280258 - 4280189
Alignment:
Q  25 taataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataag 94  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4280258 taataataattatattaactatttatcaattgtgaaccttaattgattagtgatcaaattaagtaataag 4280189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12183867 - 12183820
Alignment:
Q  275 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcag 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12183867 aagagaacttgaggcataaaggtagcggttgagaaataaccaaatcag 12183820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27396301 - 27396222
Alignment:
Q  34 ttatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||   || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  27396301 ttatattagttatttattaatttgaagtcttaattaattaatgatcaatttaagtaataatacttattagatttttattt 27396222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Original strand, 23253826 - 23253907
Alignment:
Q  82 attaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgt 164  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||    
T  23253826 attaagtgataagactaattgaatttctatttag-ataattaattaattaattaattgatatggactcgatatgagtagatgt 23253907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 32896634 - 32896989
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896634 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 32896733  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896734 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 32896833  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896834 aaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 32896933  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32896934 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggtt 32896989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 32890510 - 32890865
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890510 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgacccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 32890609  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890610 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 32890709  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890710 aaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 32890809  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32890810 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcatctctttggtt 32890865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 36818594 - 36818948
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36818594 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggttaattagatttctattttg 36818693  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  36818694 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggctatcaaatat 36818793  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36818794 aaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgatgagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 36818893  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36818894 aaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 36818948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42993537 - 42993186
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993537 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 42993438  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42993437 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtcc-gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatcgccatccaatat 42993339  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993338 aaaagaggttatggtccccaatataccgaacacggcaatactct---ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 42993242  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993241 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 42993186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5542699 - 5542343
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  5542699 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataagactaattagatttctaattgg 5542600  T
Q  116 g---atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
        ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542599 ataaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 5542502  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542501 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 5542402  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5542401 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcccctctttggtt 5542343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 9934906 - 9935255
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9934906 aaatattgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaagtaataaagctaattagatttctattttgg 9935005  T
Q  117 atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatata 216  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  9935006 ataattaattatttaatttattgatatggactcaacatgagtggatatccggatgacccattaacggaataatgggaaa-cctaatggccatccaa-ata 9935103  T
Q  217 aaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9935104 aaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaaa--ctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgattgaggaagaacca 9935201  T
Q  317 aatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9935202 aatcagccgccgctaaatctattgtgtgtttcagatcatctcctatctttggtt 9935255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 10699651 - 10700006
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |    
T  10699651 caaatatcgtaacaataattatactagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaattaggcta-ttagatttctaatt-g 10699748  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  10699749 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggagtaatgggaaaccctaatggtcatcaa 10699846  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699847 atataaaagagactatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctctccatctgacgaaaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 10699946  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10699947 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatttcctctctttggtt 10700006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 370
Target Start/End: Original strand, 10705462 - 10705814
Alignment:
Q  18 aatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgga 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |    
T  10705462 aatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaaacta-ttagatttctaatt-gaa 10705559  T
Q  118 tatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaat 213  Q
    || |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||    
T  10705560 taattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatagtcatcaaat 10705656  T
Q  214 ataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10705657 ataaaagaggctatggtctccaatataccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttaagccataaaggtaccggttgaggaaga 10705756  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705757 atcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 10705814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22220265 - 22219926
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  22220265 caaatatcgtaacaatagttatattagctatttatcaatcgtaagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataagggta-ttagatttctaatt-g 22220168  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22220167 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgaatggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 22220070  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22220069 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 22219970  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatca 354  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22219969 gaaccaaatcagccgccactaactttattgtttgtttcagatca 22219926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Original strand, 42033420 - 42033740
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |     
T  42033420 aaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggtta-ttagatttctaattag- 42033517  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggccc----attaacggaataatgggaaaccctaatggccat 208  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42033518 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccgcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcat 42033615  T
Q  209 ccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgagg 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033616 ccaatataaaggaggctatggtccccaatacattgtacacggcaaactctctcttctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgagg 42033715  T
Q  309 aagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42033716 aagaaccaaatcagccgccgctaac 42033740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Original strand, 14417584 - 14417917
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14417584 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-gg 14417681  T
Q  117 atatttaatt----atttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||                     
T  14417682 ataattaattgaatatttaattagttgatatgggctcaa--tgagtggatgttcggatgtcccattaacgaaataatgggaaa----------------- 14417762  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14417763 ---aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaaga 14417859  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14417860 accaaatcagccgccgctaaaactattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggtt 14417917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39736076 - 39735734
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  39736076 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagcattagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttcta-attg 39735979  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  39735978 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atcagtggatgtccggatgacccattaacggaataa-gggaaaccctaatggccatcta 39735882  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    |||||||||||||| ||||         |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  39735881 atataaaagaggctctggt---------accgtacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagtacttgaggcataaatgtaccagttaaggaa 39735791  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactc-tattgtgtgtttcagatcatctcctctcttt 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  39735790 gaatcaaatcagccgccgctaacccttgttgtttgtttcagatcaccttctctcttt 39735734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1883375 - 1883185
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1883375 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaatttggagccttacttgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttctatttag 1883276  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
     ||     |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1883275 aat-----attaattaattaatggatatggactcaatatgagtggatgtccggatgacccattaacgaaataatgggaaaccttaatggccatcca 1883185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39727822 - 39727643
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  39727822 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagacttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attaaatttcta-attg 39727725  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaa 195  Q
    |||| |||||    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39727724 gataattaattaaatatttaattaattgatatggactca--atgagtggatgtccggatagcccattaacggaacaatgggaaa 39727643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1883151 - 1883039
Alignment:
Q  221 aggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1883151 aggctatggtccccaatacacaatacacggcaaactttctcttctccccatctgaagagaacttgagacataaaggtactggttgaggaagaaccaaatt 1883052  T
Q  321 agccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||||    
T  1883051 agccgccgctaac 1883039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39727645 - 39727494
Alignment:
Q  217 aaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 315  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727645 aaagaggatatggtccccaatataccgtacacaacaaaactctctcttctccccatctcaagagtacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaacc 39727546  T
Q  316 aaatcagccgccgctaactc-tattgtgtgtttcagatcatctcctctcttt 366  Q
    |||||||| ||||||||| | |  ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  39727545 aaatcagcagccgctaacccttgctgtttgtttcagatcaccttctctcttt 39727494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Original strand, 17954129 - 17954393
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaatta----agtaataaggctaattagatttctatt 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17954129 aaatatctttataataattatattagctatttatcaatttggagacttaattgattagtgatcagattactaaagtaataagccta-ttagatttctatt 17954227  T
Q  113 ttggatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggcca-tcca 211  Q
    |    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |  | | ||    
T  17954228 taat-taattaattaattaattagttgatatggactcaaaatgagtggatgttcagatgacccactaacggaataatggaaaaccctaattgatattaca 17954326  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaactt 284  Q
     |||  ||||||||||| ||  |||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17954327 ctat--aagaggctatgatcatcaata---cgtacacgacaaactctttcttctccccatc-gaagagaactt 17954393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 30890593 - 30890535
Alignment:
Q  52 aattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30890593 aattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaattaataagactaattagatttcta 30890535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 135
Target Start/End: Original strand, 45365390 - 45365497
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||| | || | ||| ||||||    
T  45365390 ataataattatattagttatctatcatatatgagtcttgattgattagtgattgaattaactaacaagtctaattagatttcca-ttcgaataattaatt 45365488  T
Q  127 atttaatta 135  Q
    |||||||||    
T  45365489 atttaatta 45365497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 333
Target Start/End: Original strand, 1171215 - 1171285
Alignment:
Q  249 ggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171215 ggcaaactctctcttctccccatctgaagagaact--------------accggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 1171285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 33630876 - 33630941
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaa 81  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  33630876 caaatatctttataatatttatattagttatttataatttgagagtcttaatcgattaatgatcaa 33630941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4580859 - 4580504
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580859 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 4580760  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580759 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 4580660  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580659 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 4580560  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580559 caaatcagccgccgctaactctattgcgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 4580504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 25353835 - 25354188
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25353835 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagattt--attttg 25353932  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  25353933 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatatccggatggcccattaacggaataatgggaaactctaatggtcatctaatat 25354032  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354033 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 25354132  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354133 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 25354188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 25343249 - 25343601
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25343249 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgaaccttaattgattagtgattaaattaagtaataaggctaattagattt--attttg 25343346  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25343347 gataattaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgttcggatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatat 25343446  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343447 aaaagaggctatg-tccccaatacaccgtacacgacaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 25343545  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343546 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 25343601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8651341 - 8650986
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |    
T  8651341 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataagacta-ttagatttctaatt-g 8651244  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8651243 gataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 8651146  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651145 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 8651046  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651045 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 8650986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21191408 - 21191049
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  21191408 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaattgattagtgatcaaattaagtaatatggctaattagatttctaattgg 21191309  T
Q  116 g---atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
        ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21191308 ataaataattaaatatttaattagttgatatggattcaa--tgagtggatgttcggatggcccattaacggaataatgtgaaaccataatggccatccaa 21191211  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttga---ggcataaaggtaccggttgagg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21191210 tataaaagaggctatggtccccaatataccttacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgatgaggcataaaggtaccggttgagg 21191111  T
Q  309 aagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21191110 aagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcatatcatctcctctctttggtt 21191049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21197578 - 21197250
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  21197578 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaatttagagccttaactgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctaattgga 21197479  T
Q  117 ---atatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaat 213  Q
       ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21197478 taaataattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaacctaatggccatccaat 21197381  T
Q  214 ataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-----------actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccgg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21197380 ataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactcggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataccgg 21197281  T
Q  303 ttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21197280 ttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 21197250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21771102 - 21770787
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |    
T  21771102 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaaacta-ttagatttctaatt-g 21771005  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
     ||| |||||||    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21771004 aataattaattaaatatttaattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatgacc-attaacggaataatgggaaaccctaatggccaacca 21770908  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770907 atataaaagaggctacggtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttct--ccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 21770810  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  21770809 gaaccaaatcagccgctgctaac 21770787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 44 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31756728 - 31756410
Alignment:
Q  44 tatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattat----ttaattagttg 139  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||     |||||||||||    
T  31756728 tatttatcaattgtgggtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-ggataattaattaaataattaattagttg 31756631  T
Q  140 atatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatac 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31756630 atatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaa-ggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatat 31756534  T
Q  240 accgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaa--ctcta 337  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  31756533 atcaaacacgacaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggtataaaggtacctgttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaaccctata 31756434  T
Q  338 ttgtgtgtttcagatcatctcctc 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  31756433 ttgtgtgtttcagatcatcacctc 31756410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21783862 - 21783545
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||  ||||    
T  21783862 aaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagtcttagtggattagtgatcaaattaagtaataaaact-attaaatttcta-attgg 21783765  T
Q  117 atatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21783764 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactta--atgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatgg-catccaa 21783668  T
Q  213 tataaaagaggctatg--gtccccaatacaccgtacacggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggta------ccggt 303  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||    
T  21783667 tataaaagaggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggt 21783568  T
Q  304 tgaggaagaaccaaatcagccgc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21783567 tgaggaagaaccaaatcagccgc 21783545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30906118 - 30905821
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  30906118 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttagttgattagtaaccaaataaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 30906021  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30906020 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcta--tgagtagatgtctggatgatcctttaacagaataatgggaaaccataatggtcatcca 30905923  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  30905922 atataaaagaggctatggttcccaatacaccgtactcgacaaactctctcttc-ccccatctgaagagaacttgaggcataaatataccaattgaggaag 30905824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21789979 - 21789768
Alignment:
Q  121 ttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaag 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21789979 ttaaatatttaattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatgg-catccaatataaaag 21789883  T
Q  221 aggctatg--gtccccaatacaccgtacacggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggta------ccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  21789882 aggctatggtgtccccaatacaccgtacacggcaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaaaggtgccggttgaggaag 21789783  T
Q  312 aaccaaatcagccgc 326  Q
    |||||||||||||||    
T  21789782 aaccaaatcagccgc 21789768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 333
Target Start/End: Original strand, 17581384 - 17581572
Alignment:
Q  140 atatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatac 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||       
T  17581384 atatggactcaa--tgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaacc-taataaccgtccaatataaaagaggctatggtccccaa--- 17581477  T
Q  240 accgtacacggcaaa-ctctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17581478 actgtacacgacaaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtacaagttgaggaagaaccaaatcagctgccactaac 17581572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12802065 - 12801889
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatt 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  12802065 ataataattatattagctatttgtcaatttggagccttaattgattagtgatcaatttaagtaataaagcttattagatttctatttagaata-ttaatt 12801967  T
Q  127 atttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatgg 204  Q
    | ||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12801966 aattatttaatggatttggactcaatatgagtggatgtctggatgacccattaatggaataatgggaaaccctaatgg 12801889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 330
Target Start/End: Original strand, 28728047 - 28728218
Alignment:
Q  157 gtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaact 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||      
T  28728047 gtggatgtccggatggtccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcctatat-aatgaggctatggtccccaatataccgtacacagcaaaac 28728145  T
Q  257 ctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 330  Q
    | ||||||||||||||||||| | | ||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28728146 cgctcttctccccatctgaagcgca-ttagggcatcgaggtaccggttgaggaagaacctaactagccgccgct 28728218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Original strand, 6096932 - 6097067
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||     
T  6096932 caaatatagtaacaataattatattacttatttgtcaattgtcagccttacttgattagtgatgaaattaagtaataaggct-attaaatttctaatttt 6097030  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggact 148  Q
    |||| |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  6097031 gataattaattaaatatttaattagttgatatggact 6097067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Original strand, 17581226 - 17581304
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataag 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581226 caaatatcgtaataataattatattaactatttatcaattgtgagcctcaattgattagtgatcaaattaagtaataag 17581304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 1105935 - 1106206
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt-- 113  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||  |      
T  1105935 caaatatggtagtaataattatatttgatatttatcaattgtaagttttatttgattagtgttcaaattaaatgataaggcta-ttaaatttttaactac 1106033  T
Q  114 -tggatatttaattatttaa-ttagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
     |   || |||| ||||||| ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||  |||  |    
T  1106034 ataattaattaaatatttaaattaattaatatggattcaa--tgagtggatgtccggatgactcattaacgaaataatggaaaaccgtaatgatcattga 1106131  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggc-aaactctctcttctccccatctgaagagaacttgag 287  Q
     |||||| |||| |||||||||||||  || ||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1106132 gtataaatgaggatatggtccccaat--actgtacacgtcaaaactttctcttctccctatgtgaagagaacttgag 1106206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 110
Target Start/End: Original strand, 13007348 - 13007431
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttcta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  13007348 ataataattatattagttatttatcaatttggagccctaattgattaatgatcaaattaaacaataagactaattaaatttcta 13007431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Original strand, 20745394 - 20745497
Alignment:
Q  231 ccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgct 330  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || | |||||    
T  20745394 ccccaatacaccgtacatggcatattctcacttatttccatctgaagagaacttggggcttaaaagtaccgattgaggaaaaaccaaattagtcaccgct 20745493  T
Q  331 aact 334  Q
    ||||    
T  20745494 aact 20745497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17900656 - 17900581
Alignment:
Q  38 attagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattt 113  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||    
T  17900656 attagttattgatcaatttggagtcttaattgattggtgatcaaattaagtaattagacttgttagatttttattt 17900581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12801681 - 12801645
Alignment:
Q  168 gatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatgg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12801681 gatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatgg 12801645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17900472 - 17900378
Alignment:
Q  225 tatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatc 320  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||   |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||    
T  17900472 tatggtccccaatacatcgtacatgacatgttctctcttcttcggatatgaagagaacttgaggcataaa-gcaccagtagaggaagaaccgaatc 17900378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 24287609 - 24287963
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287609 caaatatcgtaataataattatattagctatttataaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 24287708  T
Q  116 gatatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatat 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24287709 gatatttaaatatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaatat 24287808  T
Q  216 aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287809 aaaagaggctat-gtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 24287907  T
Q  315 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287908 caaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 24287963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10733887 - 10733535
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  10733887 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 10733790  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733789 gataattaattaagtatttgattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 10733692  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10733691 atataa--gaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaag 10733594  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10733593 aaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggtt 10733535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10947656 - 10947304
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  10947656 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 10947559  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947558 gataattaattaagtatttgattagttgatatggacttaa--tgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 10947461  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10947460 atataa--gaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaag 10947363  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10947362 aaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggtt 10947304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 48166800 - 48167155
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  48166800 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 48166897  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48166898 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgttcggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 48166995  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48166996 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaa 48167095  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48167096 gaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 48167155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6257742 - 6257388
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |    
T  6257742 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaagcta-ttagatttctaatt-g 6257645  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6257644 gataattaattaaatatttaattaattgatatgggctcaa--tgagtggatatccggatggcccattaacggaataatgg-aaaccctaatggtcatcca 6257548  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257547 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 6257448  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6257447 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctcactttggtt 6257388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Original strand, 48160581 - 48160936
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  48160581 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 48160678  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48160679 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgttcggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaa 48160776  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48160777 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaa 48160876  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160877 gaaccaaattagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 48160936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10739874 - 10739522
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  10739874 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttct-gattg 10739777  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||    ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739776 gataattaattaagtatttgattagttgatatggactta--atgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 10739679  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10739678 atat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggtaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaag 10739581  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10739580 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggtt 10739522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10953643 - 10953291
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  10953643 caaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggct-attagatttct-gattg 10953546  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||    ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953545 gataattaattaagtatttgattagttgatatggactta--atgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 10953448  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10953447 atat--aagaggctatggtccccaatacaccgtacacggtaaactctctcttctccccatctgaagagaatttgaggcataaaggtatcggttgaggaag 10953350  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10953349 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggtt 10953291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26957341 - 26957023
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |    
T  26957341 caaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttaattaattagtgatcaaattaagtaataagacta-ttagatttctaatt-g 26957244  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26957243 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatggctcattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcaa 26957146  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957145 atataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaa 26957046  T
Q  311 gaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  26957045 gaaccaaatcagtcgccgctaac 26957023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 364
Target Start/End: Original strand, 50168218 - 50168565
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  50168218 aaatatcgtaataataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattgattagtggtcaaatcaagtaacaaggcta-ttagatttctaatt-gg 50168315  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  50168316 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgaccgaatgacccattaacgaaataatggaaaaccctaatggtcattcaa 50168413  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50168414 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacgcaaaactctcttttctctccatctgaagagaacttgaggcataaaggtacc-gttgaggaaga 50168512  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaa-ctctattgtgtgtttcagatcatctcctctct 364  Q
    || |||||| |||||||||| |  | |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  50168513 actaaatcaaccgccgctaatccttgttgtttgtttcagatcacatcctctct 50168565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 158 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33458662 - 33458450
Alignment:
Q  158 tggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactc 257  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  33458662 tggatgtctggatggcccattaacgaaataatgcgaaaccctaacggtcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacgacaaactt 33458563  T
Q  258 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33458562 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtatcggttgagaaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatct 33458463  T
Q  358 cctctctttggtt 370  Q
    | |||||||||||    
T  33458462 catctctttggtt 33458450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44832152 - 44831814
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || || |    
T  44832152 caaatattgtaacaataattatattagttatttatcaattatagatcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggtta-taagatttttaattag 44832054  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
     ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44832053 -ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtgcatgtccggatggtccattaacggaataattggaaaccctaatggtcatcca 44831957  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44831956 atataaaagaggctatggtccccaatataccgaacac----aactctctcttctccgcatccgaagagaacttgaggcataaaaataccggttgaggaag 44831861  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactcta--ttgtgtgtttcagatcatc 356  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  44831860 aaccacatcagccgtcgctaaccctattttgtgtgtttcagatcatc 44831814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26972092 - 26971824
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  |||    
T  26972092 caaatattgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagtcttaattgattagtgatcaaattaagtgataaggat-attagatttcta-attg 26971995  T
Q  116 gatatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26971994 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactca--atgagtggatgtctggatggtccattaacggaataat-ggaaaccctaatggccatcca 26971898  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaactt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26971897 atataaaagagactatggtccccaatataccgtacacggcaatactctctcttctccccatctgaagagaactt 26971824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 158 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33461787 - 33461578
Alignment:
Q  158 tggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactc 257  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33461787 tggatgtccggatgactcattaacgggataatgggaaaccctgatgatcatccaatataaaagaggctatggtccccaatataccgtacacggtaaactc 33461688  T
Q  258 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatct 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33461687 tctcttctccccatctgaaaagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaatcaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatct 33461588  T
Q  358 cctctctttg 367  Q
    | ||||||||    
T  33461587 catctctttg 33461578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 361
Target Start/End: Original strand, 49976234 - 49976555
Alignment:
Q  27 ataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaatt 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||| ||||    
T  49976234 ataataattatattagctatttattaatttggagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcttattagatttttgtttagaatatt-aatt 49976332  T
Q  127 atttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaagaggcta 226  Q
    | ||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||        ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49976333 aattaattaatggatatggattcaatatgggtggatgtctggatg--------acgtaataatggaaaaccctaatggccatccaatataaaagaggtta 49976424  T
Q  227 tggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgc 326  Q
    |||||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49976425 tggtc-----tccaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaa-gtacc-gttgaggaagaaccaaatcagccgc 49976517  T
Q  327 cgctaac---tctattgtgtgtttcagatcatctcctc 361  Q
    |||||||   | | |||||||||| |||||||| ||||    
T  49976518 cgctaacccttattttgtgtgtttgagatcatcacctc 49976555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 365
Target Start/End: Original strand, 35177413 - 35177770
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtga----gccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |    
T  35177413 aaatatcgtaataataattatattagatatttatcaattatgaacgagcattaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctg-ttagttttctaat 35177511  T
Q  113 ttgga---tatttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatc 209  Q
    | |     ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35177512 tagataattatttaaatatttaatttgttgacatggactcaatacgagtgtatgtctggatgacctattaaaggaataatgagaaaccctaatggtcatc 35177611  T
Q  210 caatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctc-tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgagg 308  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  |||    || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  35177612 caatataaaagaggttatagtcctcaatacaccgtacacaacaataaatcatggtctcctcatctgaagagaacttgaggcataaatgtatcggttgaga 35177711  T
Q  309 aagaaccaaatcagccgccgctaactcta--ttgtgtgtttcagatcatctcctctctt 365  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35177712 aataatcaaatcaggcgccgctaactctatgttgtgtgtttcagatcatcacctctctt 35177770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17627311 - 17627002
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |  || |    
T  17627311 aaatatcgtaataataattatattagctatttatcgattgtgagtctgaattgattagtgattaaattaagtaataagcct-attagatttcca-attag 17627214  T
Q  117 atatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||    ||||| |||| || |||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||   |  ||    
T  17627213 ataattaattaaatatttgattaattaatatggactca--atgaggggatgtcaggatgacccattaacggaataattgaaaaccctaatggttgttaaa 17627116  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||     ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  17627115 tataaaagaggccatgatccccaatacacagtacac-----acattctcttctccccatctgaagagaactagaagcataaaagtaccggttgaggaaga 17627021  T
Q  313 accaaatcagccgccgcta 331  Q
    || |||  ||||| |||||    
T  17627020 acaaaactagccgtcgcta 17627002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 332
Target Start/End: Original strand, 50155690 - 50155897
Alignment:
Q  121 ttaattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaatataaaag 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  50155690 ttaaatatttaattagttgatatggactc-----gagtggatgtccggatgatccattaacgaactaatgagaaaccataatgatcatccaatataaaag 50155784  T
Q  221 aggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctc-ttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaat 319  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  50155785 aagttatggtccccaatacaccgtacacgcaaaactctctctttctcctcatctgaaaagaacttaaggcataaaggtaccagtcgagaaagaatcaaat 50155884  T
Q  320 cagccgccgctaa 332  Q
    |||||||||||||    
T  50155885 cagccgccgctaa 50155897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19686854 - 19686511
Alignment:
Q  20 tatcgtaataataattatat---tagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||| || |        
T  19686854 tatcgtaataataattatataattagctatttatcgattgtgtgtcttaattgattagtgatcaaattaaataataagactg-ttaaatttataataaa- 19686757  T
Q  117 atatttaatt----atttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| ||||||    ||||||||| |||||||| ||||||    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19686756 ataattaattgaatatttaattaattgatatgaactcaagc--agtggatgtctggatgacccattaacgaaataatgagaaaccctactgaccatccaa 19686659  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||| |||| ||| | |||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  19686658 tataaaagagactatagtctc-aatacatc--acaaggcaaactctctcttctcctcatcccaagagaaattgaggcataatggtaccggttgagaacga 19686562  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggt 369  Q
    ||||||||||| || |       |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19686561 accaaatcagctgctg------atattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggt 19686511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 4632012 - 4632339
Alignment:
Q  31 taattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattattt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |  |||| ||||| ||    
T  4632012 taattatattagttatttatcaatttgaagtcttaattgattagtaatcaaattaagtaataaggtttattagatttctacttagagtatt-aattaatt 4632110  T
Q  131 aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatgg------------------ccatccaa 212  Q
    ||||||| |||||||||| |   ||||||||||        ||||||||| |||||| || ||||| |||||||                  ||||||||    
T  4632111 aattagtggatatggactaa---tgagtggatg--------gcccattaatggaatattgagaaactctaatggtcatcaaatataaaaggtccatccaa 4632199  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4632200 tataaaagaggttatggtccccaatatacagtacatgacaatactttctcttcttctcatctgaagagaacttgaggcataaagataccggttgaggaag 4632299  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcaga 351  Q
    |||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||    
T  4632300 aaccaaatcagaagccgctaactatgttttgtgtttcaga 4632339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10733507 - 10733429
Alignment:
Q  292 aaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10733507 aaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggtt 10733429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10947276 - 10947198
Alignment:
Q  292 aaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10947276 aaaggtatcggttgaggaagaaccaaatcagccgtcgctaactctattgtgtgtttcaaatcatctcctctctttggtt 10947198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Original strand, 50426879 - 50426946
Alignment:
Q  26 aataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426879 aataataattatattagttatttatcaagtgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataa 50426946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 202
Target Start/End: Original strand, 28704170 - 28704340
Alignment:
Q  32 aattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttggatatttaattattt- 130  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | | | || |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  28704170 aattagattagctatttatcaattttaaccttttattgattactgatccaataaagcaaaattgctaattagatttttattt-ggataattaattatttt 28704268  T
Q  131 aattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaat 202  Q
    |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28704269 aattaactgatatgaactcaatatgagtggatgtctggatgactcattaactgaataatgagaaaccctaat 28704340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 334
Target Start/End: Original strand, 32284542 - 32284620
Alignment:
Q  256 tctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaact 334  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32284542 tctctattctcctcatctgaagaaaacttgaggcctaaaggtaccgatcgaggaagaaccaaatcagtcgccactaact 32284620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Original strand, 33045085 - 33045203
Alignment:
Q  234 caatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    ||||||||||| |||| | || |||||||||||| |   |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  33045085 caatacaccgttcacgacgaattctctcttctccgcgattgaagagaacttgagatataaaagtaccggttgagaaagaactaaatcagccgccgttaac 33045184  T
Q  334 tctattgtgtgtttcagat 352  Q
    | | || ||| ||||||||    
T  33045185 ttttttatgtctttcagat 33045203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 333
Target Start/End: Original strand, 3769434 - 3769509
Alignment:
Q  258 tctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3769434 tctcttctccctatctgaaaagaactataggcataaatatacgggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaac 3769509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 276
Target Start/End: Original strand, 9237081 - 9237262
Alignment:
Q  91 taaggctaattagatttctattttggatatttaattatttaatt-agttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataat 189  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |  |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  9237081 taagactaattatatttctattg-ggataattaattatttaattgaagtgatatggactcta--tgagtggatgtctggatgaccaattaacgggataat 9237177  T
Q  190 gggaaaccctaatggccatc-caatataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaa 276  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||  ||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||    
T  9237178 -ggaaaccttaatgaccatcacactat--aagaggctatgattcccaatacattgtacacgacaaactctttgttcttcccatttgaa 9237262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 33461848 - 33461797
Alignment:
Q  20 tatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgat 71  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33461848 tatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgagccttagttgat 33461797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 33458723 - 33458672
Alignment:
Q  20 tatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgat 71  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33458723 tatcgtaacaataattatattaactatttatcaattgtgagccttagttgat 33458672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 318
Target Start/End: Original strand, 50427238 - 50427281
Alignment:
Q  275 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaa 318  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50427238 aagagaagttgaggcataaatgtaccggttgagtaagaaccaaa 50427281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 37607352 - 37607404
Alignment:
Q  30 ataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaa 82  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  37607352 ataattatgttagttatttctcaattatgagtatttattgattagtgatcaaa 37607404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 262
Target Start/End: Original strand, 50427193 - 50427237
Alignment:
Q  219 agaggctatggtccccaatacaccgtacacgg-caaactctctct 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  50427193 agaggctatggtccccagtacaccgtacacggtaaaactctctct 50427237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 173427 - 173073
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  173427 caaatatcgtaataataattatattagcgatttatcaattgtgggtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-g 173330  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
    |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  173329 gataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgttctattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatcca 173232  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  173231 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtatacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtactggttgaggaag 173132  T
Q  312 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  173131 aaccaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggtt 173073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1724 - 1377
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  1724 aaatatcgtaacaataattatattagctatttatcaattgtgggccttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-gg 1627  T
Q  117 atatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||      |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1626 ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaa--tgagtggatgtccggatgaccc------ggaataatggaaaatcctaatggccatccaa 1535  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1534 tataaaagaggctatggtccccaatatatcatacaccgcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaatgtaccggttgaggaaaa 1435  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1434 accaaatcagtcgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 1377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 802
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  1135 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagtcttagttgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttctaatt-gg 1038  T
Q  117 atatttaatt----atttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||                     
T  1037 ataattaattgaatatttaattagttgatatgggctcaa--tgagtggatgttcggatgtcccattaacgaaataatgggaaa----------------- 957  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaaga 312  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  956 ---aaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaacgtaccggttgaggaaga 860  T
Q  313 accaaatcagccgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  859 accaaatcagccgccgctaaaactattgtgtgtttcagatcatcttctctctttggtt 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 686 - 949
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |  |     
T  686 aaatatcataataataattatattagttatttatcaattgtgagcctcaattgattagtgatcaaattaagtaataaggcta-ttagatttaaaatcaga 784  T
Q  117 atatt---taattatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaat 213  Q
      |||   ||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  785 taattgattaaatatttaattaactgatatgtactcaa--tgagtgaatgtctagatgacccattaacagaataatgggaaaccctaatggtcatccaat 882  T
Q  214 ataaaagaggctatggtccccaatacaccgtacacggcaaactctctcttctccccatctgaagaga 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  883 ataaaagaggctatggtccccaatacactgtacacgacaaactctctcttctccccatctgaagaga 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 333
Target Start/End: Original strand, 950 - 1023
Alignment:
Q  260 tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaac 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  950 tcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaagataacggttgaggaagaaccaaatcagccgccactaac 1023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Original strand, 5589 - 5821
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttg 115  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |    
T  5589 caaatatcgctataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaatatgacta-ttagatttctaattcg 5687  T
Q  116 gatatttaatta----tttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatcca 211  Q
     ||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  5688 -ataattaattaaatatttaattagttgatatggactcaatatgagtggatgttcggatgacccattaacagaataatgggaaa-cctaacggccattca 5785  T
Q  212 atataaaagaggctatggtccccaatacaccgtaca 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5786 atataaaagaggctatggttcccaatacatcgtaca 5821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Original strand, 5826 - 5889
Alignment:
Q  275 aagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaaccaaatcagccgccgctaactctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  5826 aagataacttgaggcataaatgtaccggttgaggaagaaccaaattagtcgtcgctaaccctat 5889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 13896 - 14121
Alignment:
Q  17 aaatatcgtaataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaattagatttctattttgg 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||  ||||    
T  13896 aaatatagtaataataattatattagctatttatcaatcgtgagccttaattgactagtgatcaaattaagtaataattct-attagatttgta-attgg 13993  T
Q  117 atatttaat----tatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatccaa 212  Q
    ||| |||||    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13994 ataattaattaaatatttaattagttgatatggattca--atgagtggatgtccggatgacccattaacggaataatgggaaaccctaatggtcatccaa 14091  T
Q  213 tataaaagaggctatggtccccaatacacc 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14092 tataaaagaggttatggtccccaatacacc 14121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 314
Target Start/End: Original strand, 38059 - 38347
Alignment:
Q  25 taataataattatattagttatttatcaattgtgagccttaattgattagtgatcaaattaagtaataaggctaa-ttagatttctattttggatattta 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || | ||| |||    
T  38059 taataataattttattagttatttatcaatttgaaaccttaattgaatagtgatcaaattaagtaacaaggttaatttagatttcta-ttcgaataatta 38157  T
Q  124 attatttaattagttgatatggactcaacatgagtggatgtccggatggcccattaacggaataatgggaaaccctaatggccatc-caatataaaagag 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||  |||| || |||||||||||||| | |||||||||||  |||| || |||  |||||    
T  38158 attatttaattaattgatatggacttaatatg-gtggatgtctagatgaccgattaacggaataatagaaaaccctaatgatcatcacactat--aagag 38254  T
Q  223 gctatggtccccaatacaccgtacacggcaa-actctctcttctccccatctgaagagaacttgaggcataaaggtaccggttgaggaagaac 314  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |  || || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  38255 gttatggtctccaatacaccgtacatgataatacactctattcttcccatctgaagagaacttgagacataaaggtatcagttgaggaagaac 38347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 370
Target Start/End: Original strand, 5465 - 5511
Alignment:
Q  324 cgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5465 cgccgctaactctattgtgtgtttcagatcatctcctctctttggtt 5511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0449 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0449
Description:

Target: scaffold0449; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 1316 - 1281
Alignment:
Q  16 caaatatcgtaataataattatattagttatttatc 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1316 caaatatcgtaataataattatattagctatttatc 1281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University