View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18538_low_8 (Length: 264)

Name: NF18538_low_8
Description: NF18538
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18538_low_8
NF18538_low_8
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (20-253)||(18681474-18681707)
chr8 (20-253)||(31567783-31568016)
chr8 (20-253)||(31573004-31573237)
chr8 (20-253)||(36799372-36799605)
chr8 (20-253)||(1804439-1804672)
chr8 (20-253)||(9273131-9273364)
chr8 (24-200)||(44476236-44476414)
chr8 (24-200)||(44479498-44479676)
chr8 (24-200)||(23825124-23825301)
chr8 (24-182)||(19902945-19903105)
chr8 (24-200)||(23865434-23865611)
chr8 (24-200)||(25409554-25409731)
chr8 (24-182)||(30766966-30767126)
chr8 (24-225)||(17053597-17053799)
chr8 (20-197)||(22050197-22050375)
chr8 (20-197)||(22055715-22055893)
chr8 (20-225)||(22177582-22177787)
chr8 (20-236)||(22025548-22025766)
chr8 (24-201)||(14057606-14057784)
chr8 (59-236)||(22063551-22063731)
chr8 (24-199)||(18609793-18609969)
chr8 (24-225)||(41009433-41009637)
chr8 (94-225)||(25110911-25111043)
chr8 (69-188)||(21668901-21669023)
chr8 (24-225)||(21326822-21327027)
chr8 (67-234)||(21282101-21282270)
chr8 (24-225)||(21322234-21322439)
chr8 (24-107)||(31412606-31412688)
chr8 (24-107)||(31418788-31418870)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (20-253)||(14033138-14033371)
chr6 (20-253)||(28359803-28360036)
chr6 (21-253)||(23835054-23835286)
chr6 (20-253)||(27562486-27562719)
chr6 (20-248)||(33682157-33682384)
chr6 (24-225)||(12941800-12942000)
chr6 (24-199)||(28290209-28290384)
chr6 (24-188)||(1592759-1592924)
chr6 (24-200)||(29615199-29615376)
chr6 (43-225)||(21566163-21566346)
chr6 (24-182)||(25470708-25470868)
chr6 (24-225)||(12167237-12167439)
chr6 (24-225)||(19286146-19286348)
chr6 (24-200)||(24562282-24562459)
chr6 (20-225)||(19726602-19726807)
chr6 (20-225)||(22906961-22907167)
chr6 (24-225)||(19877330-19877532)
chr6 (24-225)||(19883106-19883308)
chr6 (24-200)||(34647652-34647829)
chr6 (24-225)||(19786847-19787050)
chr6 (24-200)||(23837580-23837758)
chr6 (24-200)||(34640978-34641155)
chr6 (20-188)||(21724772-21724941)
chr6 (63-197)||(29416468-29416605)
chr6 (20-182)||(937700-937863)
chr6 (112-225)||(18788448-18788560)
chr6 (112-225)||(18799428-18799540)
chr6 (24-225)||(19588556-19588760)
chr6 (98-200)||(11289602-11289705)
chr6 (24-108)||(14581950-14582034)
chr6 (112-234)||(19439792-19439913)
chr6 (59-163)||(19300705-19300813)
chr6 (24-62)||(11283984-11284022)
chr6 (24-108)||(23021423-23021503)
chr6 (67-108)||(24513921-24513962)
chr6 (67-199)||(8760427-8760562)
chr6 (69-108)||(26418761-26418798)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (20-253)||(27785691-27785924)
chr2 (20-253)||(27790912-27791145)
chr2 (20-253)||(12572307-12572540)
chr2 (20-253)||(12578789-12579022)
chr2 (24-253)||(10685572-10685801)
chr2 (20-253)||(27295953-27296185)
chr2 (24-225)||(20260824-20261024)
chr2 (20-225)||(2105573-2105779)
chr2 (24-225)||(23090006-23090207)
chr2 (24-200)||(6482321-6482499)
chr2 (24-200)||(6485788-6485966)
chr2 (24-182)||(5707031-5707191)
chr2 (24-225)||(23102434-23102635)
chr2 (24-200)||(26582675-26582852)
chr2 (24-200)||(200641-200818)
chr2 (24-200)||(23169298-23169475)
chr2 (24-200)||(23580555-23580732)
chr2 (24-182)||(27367600-27367760)
chr2 (24-225)||(9241333-9241534)
chr2 (24-200)||(43693401-43693578)
chr2 (24-200)||(6744324-6744501)
chr2 (24-225)||(23877838-23878040)
chr2 (44-234)||(22809901-22810093)
chr2 (26-198)||(23263985-23264158)
chr2 (69-225)||(19703456-19703615)
chr2 (24-225)||(20724032-20724236)
chr2 (67-199)||(21907291-21907426)
chr2 (67-225)||(21073954-21074114)
chr2 (67-108)||(24943419-24943460)
chr2 (26-102)||(23269201-23269276)
chr2 (26-102)||(23276070-23276145)
chr2 (67-225)||(23290968-23291129)
chr2 (69-108)||(21133348-21133385)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (18-253)||(21678214-21678449)
chr5 (20-253)||(22175010-22175243)
chr5 (20-253)||(17264743-17264975)
chr5 (20-253)||(17271225-17271457)
chr5 (24-199)||(9775467-9775642)
chr5 (24-225)||(37805292-37805492)
chr5 (24-200)||(19510999-19511177)
chr5 (22-243)||(22509127-22509348)
chr5 (20-225)||(758227-758431)
chr5 (24-225)||(23527448-23527651)
chr5 (20-225)||(22312804-22313009)
chr5 (24-200)||(21675471-21675648)
chr5 (24-201)||(22439724-22439902)
chr5 (24-182)||(1857520-1857680)
chr5 (20-225)||(20937590-20937796)
chr5 (59-197)||(10816808-10816949)
chr5 (24-152)||(23112785-23112914)
chr5 (23-197)||(23538800-23538976)
chr5 (23-108)||(19362597-19362678)
chr5 (24-108)||(19801964-19802044)
chr5 (24-108)||(27635972-27636054)
chr5 (24-85)||(24751647-24751707)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (20-253)||(806945-807178)
chr7 (20-253)||(11631888-11632121)
chr7 (20-253)||(18055657-18055890)
chr7 (21-253)||(20579889-20580121)
chr7 (20-253)||(18049178-18049411)
chr7 (20-253)||(23201451-23201683)
chr7 (20-253)||(23507578-23507810)
chr7 (24-199)||(23665829-23666004)
chr7 (24-225)||(11302852-11303052)
chr7 (24-199)||(29795730-29795905)
chr7 (24-199)||(29799549-29799724)
chr7 (20-243)||(15338822-15339045)
chr7 (20-225)||(15723191-15723396)
chr7 (24-182)||(12591652-12591812)
chr7 (20-225)||(15710967-15711172)
chr7 (20-225)||(35962712-35962918)
chr7 (24-200)||(14421354-14421532)
chr7 (24-225)||(14281620-14281822)
chr7 (20-199)||(14431985-14432165)
chr7 (24-200)||(4279963-4280140)
chr7 (24-225)||(13006306-13006508)
chr7 (24-200)||(19616295-19616472)
chr7 (24-200)||(13123971-13124148)
chr7 (24-198)||(16676192-16676367)
chr7 (23-199)||(16109067-16109244)
chr7 (24-182)||(12710917-12711077)
chr7 (24-200)||(13742505-13742682)
chr7 (20-188)||(1612619-1612788)
chr7 (24-198)||(17650429-17650603)
chr7 (20-225)||(19599838-19600043)
chr7 (24-225)||(20328224-20328425)
chr7 (55-225)||(11390302-11390473)
chr7 (23-234)||(6411820-6412032)
chr7 (97-199)||(14128244-14128347)
chr7 (55-225)||(11383814-11383985)
chr7 (55-225)||(18606896-18607067)
chr7 (69-199)||(21232034-21232167)
chr7 (24-225)||(11220086-11220290)
chr7 (137-225)||(36306034-36306121)
chr7 (24-108)||(37244401-37244484)
chr7 (69-108)||(3327845-3327882)
chr7 (69-108)||(15086016-15086053)
chr7 (59-111)||(16187804-16187855)
chr7 (69-108)||(16952330-16952367)
chr7 (24-108)||(18958522-18958605)
chr7 (69-108)||(26289861-26289898)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (20-253)||(41799899-41800132)
chr4 (20-253)||(42701222-42701455)
chr4 (20-253)||(51602020-51602253)
chr4 (20-253)||(51607901-51608134)
chr4 (21-253)||(53748698-53748930)
chr4 (20-253)||(635711-635944)
chr4 (24-225)||(15533786-15533986)
chr4 (23-225)||(23121598-23121801)
chr4 (24-225)||(18212138-18212339)
chr4 (24-200)||(11847053-11847230)
chr4 (24-182)||(8046914-8047074)
chr4 (20-199)||(20940256-20940436)
chr4 (23-197)||(4831090-4831266)
chr4 (23-197)||(4834385-4834561)
chr4 (20-199)||(14484425-14484606)
chr4 (20-225)||(43284871-43285076)
chr4 (22-236)||(11171222-11171437)
chr4 (20-225)||(17000142-17000348)
chr4 (69-225)||(15406955-15407113)
chr4 (24-108)||(14062908-14062993)
chr4 (24-107)||(13452226-13452307)
chr4 (24-108)||(40908583-40908667)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (20-253)||(44775197-44775430)
chr3 (20-253)||(44780381-44780614)
chr3 (21-253)||(4677161-4677393)
chr3 (21-253)||(41175474-41175706)
chr3 (21-253)||(41180612-41180844)
chr3 (21-253)||(8742857-8743089)
chr3 (21-253)||(8761027-8761259)
chr3 (20-248)||(13909525-13909751)
chr3 (20-236)||(13939984-13940198)
chr3 (20-248)||(13946470-13946696)
chr3 (20-253)||(12200199-12200431)
chr3 (39-199)||(12304763-12304924)
chr3 (43-225)||(17157079-17157262)
chr3 (24-200)||(9532849-9533027)
chr3 (46-225)||(24191783-24191963)
chr3 (20-199)||(16382880-16383060)
chr3 (24-225)||(41456123-41456325)
chr3 (20-225)||(14652691-14652896)
chr3 (24-200)||(8583294-8583471)
chr3 (24-200)||(14084531-14084708)
chr3 (24-200)||(14089932-14090109)
chr3 (20-201)||(13203537-13203719)
chr3 (20-199)||(16838502-16838681)
chr3 (24-225)||(16802425-16802626)
chr3 (24-200)||(24123203-24123380)
chr3 (24-200)||(49399473-49399650)
chr3 (24-182)||(13968850-13969010)
chr3 (24-182)||(13974325-13974485)
chr3 (24-179)||(17190836-17190992)
chr3 (23-197)||(34852211-34852387)
chr3 (24-225)||(14544166-14544368)
chr3 (22-199)||(14292701-14292881)
chr3 (55-225)||(23174189-23174358)
chr3 (113-199)||(16829979-16830065)
chr3 (20-147)||(16830055-16830182)
chr3 (67-184)||(17199056-17199175)
chr3 (66-225)||(17243654-17243815)
chr3 (24-173)||(12961428-12961580)
chr3 (67-234)||(31690561-31690731)
chr3 (67-188)||(18889009-18889133)
chr3 (137-225)||(23173876-23173963)
chr3 (54-108)||(23173814-23173869)
chr3 (24-85)||(11850780-11850840)
chr3 (67-108)||(18900048-18900089)
chr3 (23-108)||(19443468-19443553)
chr3 (69-108)||(10597829-10597866)
chr3 (69-108)||(12419436-12419473)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (20-253)||(27280188-27280420)
chr1 (24-200)||(20438531-20438709)
chr1 (20-199)||(3706763-3706943)
chr1 (24-200)||(21542056-21542233)
chr1 (24-200)||(42095903-42096080)
chr1 (24-179)||(20045899-20046056)
chr1 (20-225)||(23066676-23066882)
chr1 (24-225)||(19664105-19664306)
chr1 (24-225)||(41110814-41111016)
chr1 (23-199)||(32650101-32650278)
chr1 (20-236)||(20242528-20242746)
chr1 (20-202)||(22448270-22448444)
chr1 (24-225)||(19778434-19778639)
chr1 (20-123)||(955118-955223)
chr1 (24-108)||(36614935-36615015)
chr1 (69-179)||(29554465-29554578)
chr1 (137-225)||(955041-955128)
chr1 (24-108)||(24079551-24079634)
chr1 (24-108)||(24109120-24109203)
chr1 (24-108)||(23195571-23195653)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (73-253)||(40549-40730)
scaffold0124 (24-225)||(36793-36994)
scaffold0124 (21-69)||(8493-8541)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (43-225)||(4275-4458)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (24-201)||(4617-4795)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (20-225)||(14472-14677)
scaffold0239 (59-188)||(7225-7356)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (24-199)||(10259-10435)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (20-225)||(141322-141526)
scaffold0021 (69-197)||(146611-146742)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (20-236)||(265096-265311)
scaffold0005 (20-236)||(258670-258885)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (24-200)||(38401-38578)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (24-200)||(35546-35723)
scaffold0076 (24-182)||(30162-30322)
scaffold0076 (45-234)||(51667-51858)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (24-200)||(46979-47156)
scaffold0028 (24-200)||(52384-52561)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (24-200)||(174561-174738)
scaffold0011 (22-234)||(152359-152571)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (20-225)||(41927-42132)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (24-200)||(110758-110935)
scaffold0029 (24-86)||(116793-116855)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (20-225)||(63169-63374)
scaffold0026 (24-201)||(12876-13054)
scaffold0026 (18-225)||(124446-124655)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (20-234)||(5997-6212)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (24-182)||(9649-9809)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (43-225)||(15432-15615)
scaffold0025 (89-199)||(71154-71266)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (24-200)||(2566-2743)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (24-188)||(29748-29913)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (24-200)||(174561-174739)
scaffold0001 (24-200)||(489127-489304)
scaffold0001 (23-108)||(179002-179083)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (20-199)||(50972-51152)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (43-201)||(10217-10377)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (20-199)||(10337-10518)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (20-225)||(14004-14209)
scaffold0063 (20-201)||(24205-24387)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (55-225)||(143-314)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (24-225)||(47387-47589)
scaffold0067 (24-225)||(62807-63009)
scaffold0067 (24-225)||(56421-56623)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (62-188)||(14583-14710)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (57-236)||(20482-20664)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (20-153)||(15511-15645)
scaffold0348 (67-234)||(2962-3132)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (43-182)||(1-132)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (20-234)||(5144-5359)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (24-152)||(1-131)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (115-201)||(1-87)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (23-225)||(17476-17679)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (23-225)||(4981-5185)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (69-225)||(41592-41750)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (67-198)||(102930-103063)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (24-225)||(8410-8615)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (69-234)||(7293-7460)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (24-186)||(27781-27945)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (69-225)||(326816-326975)
scaffold0004 (24-225)||(321062-321266)
scaffold0004 (67-198)||(115778-115911)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (24-225)||(27861-28065)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (69-225)||(392-550)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (69-225)||(16914-17072)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (20-85)||(3654-3718)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (23-108)||(16141-16226)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (67-123)||(2081-2139)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (67-123)||(1157-1215)
scaffold0461 (67-123)||(8093-8151)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (23-112)||(13504-13594)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (55-108)||(3412-3466)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (69-111)||(370441-370483)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (69-108)||(270-307)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (69-108)||(4220-4257)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (69-108)||(31669-31706)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18681707 - 18681474
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681707 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 18681608  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  18681607 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 18681508  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18681507 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 18681474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31568016 - 31567783
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31568016 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 31567917  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  31567916 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 31567817  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31567816 atataccaaccaacctagacatatacatatatat 31567783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31573237 - 31573004
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573237 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 31573138  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  31573137 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatct 31573038  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31573037 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 31573004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 36799372 - 36799605
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799372 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 36799471  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  36799472 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatct 36799571  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36799572 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 36799605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1804672 - 1804439
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804672 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 1804573  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  1804572 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatct 1804473  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  1804472 acataccaaccaacctaaacatatacatatatat 1804439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9273364 - 9273131
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9273364 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcagaacataagtcctcaccactaacaccac 9273265  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  9273264 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatc 9273166  T
Q  219 tacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  9273165 tacataccaaccaacctaaacatatacatatatat 9273131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 44476236 - 44476414
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  44476236 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgtttt 44476335  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  44476336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44476414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 44479498 - 44479676
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  44479498 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgtttt 44479597  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  44479598 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44479676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 23825124 - 23825301
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  23825124 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23825222  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  23825223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 23825301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19903105 - 19902945
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19903105 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19903006  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  19903005 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccact 19902945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 23865434 - 23865611
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23865434 atgcatgtggtaccataatccagggccatgacccacaccgctgtcaaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccgctccacaccgcttt 23865533  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  23865534 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 23865611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 25409554 - 25409731
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  25409554 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcatcaccgctccacaccgcttt 25409652  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  25409653 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgatccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 25409731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 30767126 - 30766966
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  30767126 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcataaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30767028  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  30767027 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 30766966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 17053597 - 17053799
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17053597 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgccgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 17053696  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||  || | || |||||||||||    
T  17053697 gaacaactagttttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctg-tgtatatctac 17053795  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  17053796 atac 17053799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 22050197 - 22050375
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22050197 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccactaacacca 22050295  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22050296 ctttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaa 22050375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 22055715 - 22055893
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22055715 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaaatcctcaccactaacacca 22055813  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22055814 ctttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaa 22055893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 22177582 - 22177787
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22177582 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcttcaccactaacacca 22177680  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| | || | || |||||||    
T  22177681 ctttgagcaacttgtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttttgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 22177779  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  22177780 ctacatac 22177787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22025766 - 22025548
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcaccacta--cac 115  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||  |||    
T  22025766 acccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacac 22025668  T
Q  116 cactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtat 215  Q
    | ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || | |||    
T  22025667 cgctttgagcaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tctat 22025569  T
Q  216 atctacataccaatcaaccta 236  Q
    |||||||||| | ||||||||    
T  22025568 atctacatacaactcaaccta 22025548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14057784 - 14057606
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  14057784 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 14057686  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa 201  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14057685 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaa 14057606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22063731 - 22063551
Alignment:
Q  59 caccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgacta 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  22063731 caccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccgctttgaacgacaa 22063632  T
Q  155 agcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaaccta 236  Q
     || |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22063631 ggcgttccggagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatacaactcaaccta 22063551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Original strand, 18609793 - 18609969
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18609793 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 18609891  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||  |||||||  |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||    
T  18609892 gaacaactagtgttccaccgctttcaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaact 18609969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41009637 - 41009433
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  41009637 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 41009539  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  41009538 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatct 41009439  T
Q  220 acatac 225  Q
    ||||||    
T  41009438 acatac 41009433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 25110911 - 25111043
Alignment:
Q  94 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtta 191  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  25110911 acataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaagacattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 25111010  T
Q  192 atgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||    
T  25111011 atgcaactaacccacttg-tgtatatctacatac 25111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Original strand, 21668901 - 21669023
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  21668901 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21669000  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatg 188  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  21669001 gccgaagctctcccgcttttatg 21669023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21327027 - 21326822
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcaccacta--caccac 118  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||  |||| |    
T  21327027 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 21326929  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact-aatccccatgttgtatat 217  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||||||| ||||| | || |||||||    
T  21326928 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaaatccacttg-tgtatat 21326830  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  21326829 ctacatac 21326822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Original strand, 21282101 - 21282270
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 163  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||| |||  |||| ||||||  ||| |||  ||||||  |||||||||| | |  |||||    
T  21282101 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcgtcaccgctatacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttcca 21282200  T
Q  164 gagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaacc 234  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| || | || ||||||||||||||| | ||||||    
T  21282201 gagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttg-tgtatatctacatacaactcaacc 21282270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21322439 - 21322234
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcaccact--acaccac 118  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  21322439 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 21322341  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-tccccatgttgtatat 217  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| || |||||  | ||||| || | ||||| |||||||||| ||| | || |||||||    
T  21322340 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgagaccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttg-tgtatat 21322242  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  21322241 ctacatac 21322234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31412688 - 31412606
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31412688 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcac 31412606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31418870 - 31418788
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31418870 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcac 31418788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 14033138 - 14033371
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033138 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 14033237  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  14033238 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 14033337  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14033338 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 14033371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28360036 - 28359803
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360036 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 28359937  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28359936 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccttgttgtatatct 28359837  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  28359836 acataccaacccacctagacatatatatatatat 28359803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 23835054 - 23835286
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835054 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactt 23835153  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  23835154 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatcta 23835253  T
Q  221 cataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  23835254 cataccaaccaacctatacatatacatatatat 23835286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27562719 - 27562486
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27562719 acccatgcatgtggtaccaagaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 27562620  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27562619 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccgctgttatgttaatgcaactaatccccattgagtatatct 27562520  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  27562519 acatactacccaacctagacatatacatatatat 27562486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33682384 - 33682157
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33682384 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 33682285  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  33682284 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccaaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatct 33682186  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcata 248  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  33682185 acataccaaccaacctatacatatacata 33682157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 12941800 - 12942000
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12941800 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 12941898  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctaca 222  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||    
T  12941899 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctg-tgtatatctaca 12941997  T
Q  223 tac 225  Q
    |||    
T  12941998 tac 12942000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28290384 - 28290209
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28290384 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacatcactttg 28290286  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  28290285 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactgttatgctcatgcaact 28290209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 1592759 - 1592924
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccacttt 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1592759 atgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccacttt 1592857  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 188  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1592858 gagcaactagtactccaccactttgaacgagaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 1592924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29615376 - 29615199
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  29615376 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 29615278  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  29615277 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 29615199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21566346 - 21566163
Alignment:
Q  43 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  21566346 tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcatgacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 21566247  T
Q  141 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | || |||||||||||||||    
T  21566246 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttg-tgtatatctacatac 21566163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25470868 - 25470708
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  25470868 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcacctctccacaccgcttt 25470769  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  25470768 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact 25470708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 12167237 - 12167439
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12167237 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12167336  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || | || |||||||||||    
T  12167337 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctg-tgtatatctac 12167435  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  12167436 atac 12167439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 19286146 - 19286348
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19286146 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19286245  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || | || |||||||||||    
T  19286246 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctg-tgtatatctac 19286344  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  19286345 atac 19286348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 24562282 - 24562459
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  24562282 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24562380  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  24562381 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 24562459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 19726602 - 19726807
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19726602 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 19726700  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  19726701 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 19726799  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  19726800 ctacatac 19726807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 22906961 - 22907167
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacc 116  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22906961 acccatgtatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacacc 22907059  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtata 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || | || ||||||    
T  22907060 actttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcagctgacccacttg-tgtata 22907158  T
Q  217 tctacatac 225  Q
    |||||||||    
T  22907159 tctacatac 22907167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 19877330 - 19877532
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19877330 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19877429  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || | || |||||||||||    
T  19877430 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctg-tgtatatctac 19877528  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  19877529 atac 19877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 19883106 - 19883308
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19883106 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19883205  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || | || |||||||||||    
T  19883206 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctg-tgtatatctac 19883304  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  19883305 atac 19883308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34647829 - 34647652
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  34647829 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 34647730  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  34647729 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 34647652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19787050 - 19786847
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19787050 atgcatgtggtaccataattcagggccattacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19786951  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg-ttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  || | || ||||||||||    
T  19786950 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctg-tgtatatcta 19786852  T
Q  221 catac 225  Q
    |||||    
T  19786851 catac 19786847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 23837580 - 23837758
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||    
T  23837580 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagttctcaccgctccacaccgcttt 23837679  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  ||||||  |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  23837680 gaacaactagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatggaacta 23837758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34641155 - 34640978
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  34641155 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 34641056  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  34641055 gaacaactagtgttccaccgctttgaacggcgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 34640978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21724941 - 21724772
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactac-acca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21724941 acccatacatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaatacca 21724843  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21724842 ctttgagcaactagtactccaccactttgatctattaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 21724772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29416605 - 29416468
Alignment:
Q  63 gctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcat 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |       
T  29416605 gctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgc 29416506  T
Q  160 tccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  29416505 tccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 29416468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 937863 - 937700
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| | || |  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  937863 acccatgcatgtggtaccataa-tcatgaccttagccctcacctctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcacctctaacacca 937765  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  937764 ctttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccact 937700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 225
Target Start/End: Original strand, 18788448 - 18788560
Alignment:
Q  112 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgtt 211  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | || |    
T  18788448 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttg-t 18788546  T
Q  212 gtatatctacatac 225  Q
    ||||||||||||||    
T  18788547 gtatatctacatac 18788560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 225
Target Start/End: Original strand, 18799428 - 18799540
Alignment:
Q  112 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgtt 211  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | || |    
T  18799428 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttg-t 18799526  T
Q  212 gtatatctacatac 225  Q
    ||||||||||||||    
T  18799527 gtatatctacatac 18799540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19588760 - 19588556
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  19588760 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaatccctcaccgctaattgaatggttaaagtattcattttcatgacataagtcctcaccgctaaacaccgct 19588662  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||  | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  19588661 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatct 19588562  T
Q  220 acatac 225  Q
    ||||||    
T  19588561 acatac 19588556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11289705 - 11289602
Alignment:
Q  98 aagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgc 195  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  11289705 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgc 11289607  T
Q  196 aacta 200  Q
    |||||    
T  11289606 aacta 11289602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14582034 - 14581950
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  14582034 atgcatgtggtaccataa--cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattctttcatcaggacatgagtcctcacc 14581950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Original strand, 19439792 - 19439913
Alignment:
Q  112 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgtt 211  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||| | || | || |    
T  19439792 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactgacccacttg-t 19439890  T
Q  212 gtatatctacataccaatcaacc 234  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  19439891 gtatatctacatacaactcaacc 19439913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19300813 - 19300705
Alignment:
Q  59 caccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgacta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||| |    
T  19300813 caccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccactttgaacgacaa 19300714  T
Q  155 agcattcca 163  Q
    ||| |||||    
T  19300713 agcgttcca 19300705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11284022 - 11283984
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 62  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11284022 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacacc 11283984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23021503 - 23021423
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23021503 atgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgctttagaatggttaaagaattc--atcaggacataagtcctcacc 23021423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24513962 - 24513921
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  24513962 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcatcacc 24513921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8760562 - 8760427
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 163  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||  ||||||||||||||| || | || |||||    
T  8760562 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacgactagtgttccaccactttgaacaacaaggcgttcca 8760463  T
Q  164 gagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    | || ||||| ||||  || ||||| | ||||||||    
T  8760462 gggcagaagccctccagcttttatgcttatgcaact 8760427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26418798 - 26418761
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26418798 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 26418761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 27785691 - 27785924
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785691 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 27785790  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27785791 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 27785890  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27785891 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 27785924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 27790912 - 27791145
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27790912 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 27791011  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27791012 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 27791111  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27791112 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 27791145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 12572307 - 12572540
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572307 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 12572406  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  12572407 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatct 12572506  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12572507 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 12572540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 12578789 - 12579022
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578789 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 12578888  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  12578889 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatct 12578988  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12578989 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 12579022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10685801 - 10685572
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10685801 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 10685703  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctaca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  10685702 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctaca 10685603  T
Q  223 taccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10685602 taccaaccaacctagacatatacatatatat 10685572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27296185 - 27295953
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27296185 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccac 27296086  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  27296085 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatc 27295987  T
Q  219 tacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  27295986 tacataccaaccaatcta-acatatacatatatat 27295953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 20260824 - 20261024
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20260824 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 20260922  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctaca 222  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||    
T  20260923 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctg-tgtatatctaca 20261021  T
Q  223 tac 225  Q
    |||    
T  20261022 tac 20261024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 2105573 - 2105779
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2105573 acccatgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 2105672  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  2105673 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 2105771  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  2105772 ctacatac 2105779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23090207 - 23090006
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23090207 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23090109  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    || ||||||||  |||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | || |||||||||||    
T  23090108 gaataactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttg-tgtatatctac 23090010  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  23090009 atac 23090006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 6482321 - 6482499
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  6482321 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 6482420  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  6482421 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6482499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 6485788 - 6485966
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  6485788 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 6485887  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  6485888 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6485966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5707191 - 5707031
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  5707191 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 5707092  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5707091 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact 5707031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23102635 - 23102434
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23102635 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23102537  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| || | || |||||||||||    
T  23102536 gaaaaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagagccgaagctctcccacttttaggcttatgcaactaacccacttg-tgtatatctac 23102438  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  23102437 atac 23102434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 26582675 - 26582852
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  26582675 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 26582773  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  26582774 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 26582852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 200641 - 200818
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  200641 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 200739  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  200740 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 200818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23169475 - 23169298
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23169475 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23169377  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||    
T  23169376 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23169298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23580732 - 23580555
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23580732 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23580634  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||    
T  23580633 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23580555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27367760 - 27367600
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  27367760 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 27367662  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27367661 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 27367600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 9241333 - 9241534
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9241333 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 9241431  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  ||||| |  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||    
T  9241432 gaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagttcttccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctac 9241530  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  9241531 atac 9241534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 43693401 - 43693578
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  43693401 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 43693499  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  43693500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 43693578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6744501 - 6744324
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  6744501 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 6744403  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  ||| |||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  6744402 tgaacaaccagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 6744324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 23877838 - 23878040
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  23877838 atgcatgtggtaccatatttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcatcaggacataagtcttcaccgctcaacaccgcttt 23877937  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||| || | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| || | || |||||||||||    
T  23877938 gaacaactagtgttccaccgctttgaactacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttg-tgtatatctac 23878036  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  23878037 atac 23878040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 22809901 - 22810093
Alignment:
Q  44 cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacc 140  Q
    |||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  22809901 cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 22810000  T
Q  141 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaacc 234  Q
     ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||||| | ||||||    
T  22810001 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcctgcttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatacaactcaacc 22810093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Original strand, 23263985 - 23264158
Alignment:
Q  26 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 123  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||| || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  23263985 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccactatcgaatgattaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttga 23264083  T
Q  124 gtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaac 198  Q
      |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||||    
T  23264084 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 23264158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19703615 - 19703456
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||| || | || ||||||     
T  19703615 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgataaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagg 19703516  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||  ||  || |||||||||||||||    
T  19703515 gccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatctacatac 19703456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724236
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 20724130  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||| ||||| || || || | ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  20724131 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttttgcttatgcaactaactccactggtgtatatct 20724230  T
Q  220 acatac 225  Q
    ||||||    
T  20724231 acatac 20724236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Original strand, 21907291 - 21907426
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 163  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||  |||  |||  |||||| ||||||||||| | || |||||    
T  21907291 tcgaatggttaaaacattcttttcaggacataagtcctcaccgcaaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcca 21907390  T
Q  164 gagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  21907391 gggccgaagccctcccacttttatgcttatgcaact 21907426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21074114 - 21073954
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 164  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||| |  | ||||||    
T  21074114 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacatgggtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 21074015  T
Q  165 agccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact-aatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     |||||||| ||||| || ||||| | |||||| | ||||| | || |||||||||||||||    
T  21074014 ggccgaagccctcccgcttttatggttatgcaattgaatccacttg-tgtatatctacatac 21073954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Original strand, 24943419 - 24943460
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24943419 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcacc 24943460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Original strand, 23269201 - 23269276
Alignment:
Q  26 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 102  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23269201 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtc 23269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Original strand, 23276070 - 23276145
Alignment:
Q  26 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 102  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23276070 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtc 23276145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 23290968 - 23291129
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 163  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  |||  | |||| ||||||||||| | || |||||    
T  23290968 tcgaatggttaaagcattcgtttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttcca 23291067  T
Q  164 gagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-tccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    | |||| ||| |||||||| || || | |||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  23291068 gggccggagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttg-tgtatatctacatac 23291129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21133385 - 21133348
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21133385 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 21133348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21678449 - 21678214
Alignment:
Q  18 atacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacacca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678449 atacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacacca 21678350  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||    
T  21678349 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatat 21678250  T
Q  218 ctacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21678249 ctacataccaaccaacctagacatatacatatatat 21678214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 22175010 - 22175243
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22175010 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctaaccactaacaccac 22175109  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg-ttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||    
T  22175110 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgttttatgcaactaatccccttg-agtatat 22175208  T
Q  218 ctacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  22175209 ctacataccaaccaatcta-acatatacatatatat 22175243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17264975 - 17264743
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17264975 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccac 17264876  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  17264875 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatc 17264777  T
Q  219 tacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||    
T  17264776 tacataccaaccaatcta-acatatacttatatat 17264743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17271457 - 17271225
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17271457 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgttgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccac 17271358  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  17271357 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatc 17271259  T
Q  219 tacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||    
T  17271258 tacataccaaccaatcta-acatatacttatatat 17271225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Original strand, 9775467 - 9775642
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9775467 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 9775565  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9775566 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaact 9775642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37805492 - 37805292
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37805492 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 37805394  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctaca 222  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||    
T  37805393 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttacagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctg-tgtatatctaca 37805295  T
Q  223 tac 225  Q
    |||    
T  37805294 tac 37805292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 19510999 - 19511177
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19510999 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19511098  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  19511099 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 19511177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22509348 - 22509127
Alignment:
Q  22 ccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccact 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22509348 ccatgcatgtggtaccaaaa-tcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccact 22509250  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || |||||||||    
T  22509249 ttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatct 22509151  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatat 243  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||    
T  22509150 acatacaacccaacctatacatat 22509127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 758431 - 758227
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccac 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  758431 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcaggacgtaagtcctcaccactaacaccac 758333  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || ||||||||    
T  758332 tttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatc 758234  T
Q  219 tacatac 225  Q
    |||||||    
T  758233 tacatac 758227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 23527448 - 23527651
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23527448 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 23527547  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg-ttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  || | || ||||||||||    
T  23527548 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctg-tgtatatcta 23527646  T
Q  221 catac 225  Q
    |||||    
T  23527647 catac 23527651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22313009 - 22312804
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccact-acacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22313009 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactgacacca 22312911  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  22312910 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 22312812  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  22312811 ctacatac 22312804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21675648 - 21675471
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  21675648 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21675550  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21675549 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 21675471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22439902 - 22439724
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  22439902 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 22439804  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa 201  Q
    ||  |||||||  | |||| ||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  22439803 gaacaactagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccggagctctcccacttttatgcttatgcaactaa 22439724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1857680 - 1857520
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  1857680 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 1857582  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  1857581 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 1857520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 20937590 - 20937796
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacc 116  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  20937590 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattcattttcaagacataagtcctcaccactaaacacc 20937688  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtata 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||    
T  20937689 actttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccacagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtata 20937787  T
Q  217 tctacatac 225  Q
    |||||||||    
T  20937788 tctacatac 20937796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 197
Target Start/End: Original strand, 10816808 - 10816949
Alignment:
Q  59 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaa 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |     
T  10816808 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccaatttgaacgacaag 10816907  T
Q  156 gcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  10816908 gcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 10816949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23112914 - 23112785
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23112914 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgaccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccgctttg 23112816  T
Q  123 agtaac-tagtactccaccactttgaacgac 152  Q
    |  ||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  23112815 aacaacatagtgttccaccgctttgaacgac 23112785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 23538800 - 23538976
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23538800 catgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagtatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccact 23538898  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||    
T  23538899 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagtcgttccagagccgaagctctctcacttttatgattatgcaa 23538976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 19362597 - 19362678
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19362597 catgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 19362678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19802044 - 19801964
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19802044 atgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 19801964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27636054 - 27635972
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27636054 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 27635972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24751707 - 24751647
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 85  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24751707 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24751647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 807178 - 806945
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807178 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 807079  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  807078 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatct 806979  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  806978 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11632121 - 11631888
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632121 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 11632022  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  11632021 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatct 11631922  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11631921 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 11631888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18055890 - 18055657
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055890 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 18055791  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  18055790 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatct 18055691  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18055690 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 18055657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20580121 - 20579889
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20580121 cccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactt 20580022  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  20580021 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatcta 20579922  T
Q  221 cataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20579921 cataccaaccaacctagacatatacatatatat 20579889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18049411 - 18049178
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049411 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 18049312  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  18049311 ttgagtaactagtactccacctctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatct 18049212  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18049211 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 18049178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23201683 - 23201451
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201683 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 23201584  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||     
T  23201583 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatcc 23201485  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  23201484 acataccaaccaacctaaacatatacatatatat 23201451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23507810 - 23507578
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507810 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 23507711  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||     
T  23507710 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatcc 23507612  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  23507611 acataccaaccaacctaaacatatacatatatat 23507578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23666004 - 23665829
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23666004 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 23665906  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23665905 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaact 23665829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 11302852 - 11303052
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11302852 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 11302950  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctaca 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||    
T  11302951 agcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctg-tgtatatctaca 11303049  T
Q  223 tac 225  Q
    |||    
T  11303050 tac 11303052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Original strand, 29795730 - 29795905
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29795730 atgcatgtggtaccaaaac-cagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 29795828  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29795829 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaact 29795905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Original strand, 29799549 - 29799724
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29799549 atgcatgtggtaccaaaac-cagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 29799647  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29799648 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaact 29799724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Original strand, 15338822 - 15339045
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15338822 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 15338920  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  15338921 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 15339019  T
Q  218 ctacataccaatcaacctagacatat 243  Q
    |||||||| |  ||||||| ||||||    
T  15339020 ctacatacaacccaacctatacatat 15339045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15723396 - 15723191
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15723396 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 15723298  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  15723297 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 15723199  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  15723198 ctacatac 15723191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12591812 - 12591652
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12591812 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12591713  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12591712 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact 12591652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15711172 - 15710967
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15711172 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 15711074  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  15711073 ctttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 15710975  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  15710974 ctacatac 15710967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35962918 - 35962712
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacc 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  35962918 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacacc 35962820  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtata 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||    
T  35962819 actttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtata 35962721  T
Q  217 tctacatac 225  Q
    |||||||||    
T  35962720 tctacatac 35962712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 14421354 - 14421532
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  14421354 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 14421453  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  ||||||   |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  14421454 gaacaactagcgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 14421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281620
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactt 14281724  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||    
T  14281723 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatcta 14281625  T
Q  221 catac 225  Q
    |||||    
T  14281624 catac 14281620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 14431985 - 14432165
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14431985 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccactaacacca 14432083  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14432084 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatgcaact 14432165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 4279963 - 4280140
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  4279963 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4280061  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  4280062 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 4280140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 13006306 - 13006508
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13006306 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13006405  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || | || |||||||||||    
T  13006406 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctg-tgtatatctac 13006504  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  13006505 atac 13006508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 19616295 - 19616472
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  19616295 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 19616393  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  19616394 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 19616472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13124148 - 13123971
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13124148 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13124049  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  13124048 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 13123971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 16676192 - 16676367
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  16676192 atgcatgtggtaccatat-taaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 16676290  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaac 198  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  16676291 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaac 16676367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16109244 - 16109067
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactt 120  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16109244 catgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactt 16109146  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  16109145 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaact 16109067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12711077 - 12710917
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12711077 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12710978  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||    
T  12710977 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccact 12710917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 13742505 - 13742682
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13742505 atgcatgtggtaccataatttagggccgttacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13742604  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  13742605 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccact-tgatgtttatgcaacta 13742682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 1612619 - 1612788
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1612619 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 1612717  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 188  Q
    ||||||| || ||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1612718 ctttgagcaaatagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatg 1612788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 17650429 - 17650603
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17650429 atgcatgtggtaccatattt-aggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 17650527  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaac 198  Q
    ||  |||||||  |||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17650528 gaacaactagtgttccaccgc-ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaac 17650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 19599838 - 19600043
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19599838 acccacgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatttattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 19599936  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| | || | || |||||||    
T  19599937 ctttgagcaactagtgatccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactattatgcttatacaactgacccacttg-tgtatat 19600035  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  19600036 ctacatac 19600043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20328425 - 20328224
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| | | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20328425 atgcatgtggtaccatata-caggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 20328327  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||    
T  20328326 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttg-tgtatatctac 20328228  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  20328227 atac 20328224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11390473 - 11390302
Alignment:
Q  55 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  11390473 cccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 11390374  T
Q  153 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  11390373 aaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 11390302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 6411820 - 6412032
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||  ||    
T  6411820 catgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctatacactgct 6411918  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| || | || |||||||||    
T  6411919 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaatgcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaaccctcttg-tgtatatct 6412017  T
Q  220 acataccaatcaacc 234  Q
    |||||| | ||||||    
T  6412018 acatacaactcaacc 6412032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 199
Target Start/End: Original strand, 14128244 - 14128347
Alignment:
Q  97 taagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgc 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14128244 taagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatgc 14128343  T
Q  196 aact 199  Q
    ||||    
T  14128344 aact 14128347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11383985 - 11383814
Alignment:
Q  55 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||  |||||| |||||||| ||    
T  11383985 cccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacttaagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaacaac 11383886  T
Q  153 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  11383885 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 11383814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Original strand, 18606896 - 18607067
Alignment:
Q  55 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||  |||||| |||||||| ||    
T  18606896 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcagaacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaaccac 18606995  T
Q  153 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     | || |||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  18606996 aaggcgttccagagtcgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 18607067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21232167 - 21232034
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  21232167 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21232068  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  21232067 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaact 21232034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220086
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccact--acaccact 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgcttaacaccgct 11220192  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||  ||  || |||||||||    
T  11220191 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttctgcaactaactccactggtgtatatct 11220092  T
Q  220 acatac 225  Q
    ||||||    
T  11220091 acatac 11220086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36306121 - 36306034
Alignment:
Q  137 caccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| || | || |||||||||||||||    
T  36306121 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactaacccacttg-tgtatatctacatac 36306034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 37244484 - 37244401
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37244484 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 37244401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Original strand, 3327845 - 3327882
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3327845 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 3327882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15086053 - 15086016
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15086053 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 15086016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16187855 - 16187804
Alignment:
Q  59 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact 111  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  16187855 caccgctattgaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccact 16187804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16952367 - 16952330
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16952367 gaatggttaaagcattct--tcaggacataagtcctcacc 16952330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18958605 - 18958522
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18958605 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcatgacataagtcctcacc 18958522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26289898 - 26289861
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26289898 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 26289861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41800132 - 41799899
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800132 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 41800033  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  41800032 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 41799933  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  41799932 acataccaaccaacctagacatatacgtatatat 41799899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 42701222 - 42701455
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701222 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 42701321  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  42701322 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 42701421  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  42701422 acataccaaccaacctagacatatacgtatatat 42701455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51602253 - 51602020
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602253 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 51602154  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  51602153 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 51602054  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  51602053 acataccaaccaacctagacatatacgtatatat 51602020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51608134 - 51607901
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608134 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 51608035  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  51608034 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatct 51607935  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  51607934 acataccaaccaacctagacatatacgtatatat 51607901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 53748930 - 53748698
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748930 cccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactt 53748831  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  53748830 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatcta 53748731  T
Q  221 cataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53748730 cataccaaccaacctagacatatacatatatat 53748698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 635944 - 635711
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  635944 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccac 635845  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  635844 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatc 635746  T
Q  219 tacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  635745 tacataccaaccaacctaaacatatacatatatat 635711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 15533786 - 15533986
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533786 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 15533884  T
Q  123 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctaca 222  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||    
T  15533885 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctg-tgtatatctaca 15533983  T
Q  223 tac 225  Q
    |||    
T  15533984 tac 15533986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 23121598 - 23121801
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23121598 catgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccact 23121696  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || |||||||||    
T  23121697 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacgaggcattccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatct 23121795  T
Q  220 acatac 225  Q
    ||||||    
T  23121796 acatac 23121801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 18212138 - 18212339
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18212138 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 18212236  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||    
T  18212237 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctac 18212335  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  18212336 atac 18212339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 11847053 - 11847230
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  11847053 atgcatgtggtaccataaa-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 11847151  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  11847152 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 11847230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8047074 - 8046914
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | | ||||| ||||    
T  8047074 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcactgctccacaccgcttt 8046975  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  8046974 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 8046914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 20940256 - 20940436
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20940256 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 20940354  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20940355 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgttccagagctgaagctctcccactgttatgctcatgcaact 20940436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4831266 - 4831090
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4831266 catgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccact 4831168  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  4831167 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 4831090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4834561 - 4834385
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4834561 catgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccact 4834463  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  4834462 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 4834385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 14484425 - 14484606
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacc 116  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14484425 acccatacatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacacc 14484523  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14484524 actttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaact 14484606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43285076 - 43284871
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43285076 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctctcctctgtagaatggttaaatcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 43284978  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | || | |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||  | ||||||||    
T  43284977 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactga-cccactcttgtatat 43284879  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  43284878 ctacatac 43284871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11171437 - 11171222
Alignment:
Q  22 ccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccac 118  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  11171437 ccatgcatgtagtaccataa-tcagggtcgtagccctcaccgccgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccac 11171339  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || | || |||||||     
T  11171338 tttgagcaactagtgctccaccactttaaacgataaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgtttatgcaactgacccacttg-tgtatata 11171240  T
Q  219 tacataccaatcaaccta 236  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  11171239 tacataccactcaaccta 11171222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17000348 - 17000142
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacc 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  17000348 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagtcctcaccgctgtaaaatggttaaaacattcattttcaggacataagttctcaccactaaacacc 17000250  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtata 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||    
T  17000249 actttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtata 17000151  T
Q  217 tctacatac 225  Q
    |||||||||    
T  17000150 tctacatac 17000142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Original strand, 15406955 - 15407113
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  15406955 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 15407054  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    |||||||||||| | || | ||||| |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  15407055 gccgaagctctctcgctttcatgtttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 15407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 14062908 - 14062993
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  14062908 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcacc 14062993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Original strand, 13452226 - 13452307
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 107  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13452226 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcac 13452307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 40908583 - 40908667
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  40908583 atgcatgtggtaccataa--cagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcacc 40908667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 44775197 - 44775430
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775197 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 44775296  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  44775297 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatct 44775396  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44775397 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 44775430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 44780381 - 44780614
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780381 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccact 44780480  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  44780481 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatct 44780580  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44780581 acataccaaccaacctagacatatacatatatat 44780614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 4677161 - 4677393
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677161 cccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactt 4677260  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  4677261 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatcta 4677360  T
Q  221 cataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4677361 cataccaaccaacctagacatatacatatatat 4677393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 41175474 - 41175706
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175474 cccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactt 41175573  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  41175574 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatcta 41175673  T
Q  221 cataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41175674 cataccaaccaacctagacatatacatatatat 41175706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 41180612 - 41180844
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactt 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180612 cccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactt 41180711  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  41180712 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatcta 41180811  T
Q  221 cataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41180812 cataccaaccaacctagacatatacatatatat 41180844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8743089 - 8742857
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactt 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743089 cccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactt 8742990  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  8742989 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatcta 8742890  T
Q  221 cataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  8742889 cataccaaccaacctatacatatacatatatat 8742857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8761259 - 8761027
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactt 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761259 cccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactt 8761160  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  8761159 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatcta 8761060  T
Q  221 cataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  8761059 cataccaaccaacctatacatatacatatatat 8761027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 13909525 - 13909751
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13909525 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 13909624  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  13909625 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-ccccttg-agtatatct 13909722  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcata 248  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13909723 acataccaaccaacctatacatatacata 13909751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 13939984 - 13940198
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13939984 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 13940083  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  13940084 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-ccccttg-agtatatct 13940181  T
Q  220 acataccaatcaaccta 236  Q
    ||||||||| |||||||    
T  13940182 acataccaaccaaccta 13940198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Original strand, 13946470 - 13946696
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946470 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccact 13946569  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  13946570 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaaactctcccactgttatgttaatgcaactaa-ccccttg-agtatatct 13946667  T
Q  220 acataccaatcaacctagacatatgcata 248  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13946668 acataccaaccaacctatacatatacata 13946696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 12200199 - 12200431
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12200199 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagttctcaccactaacaccac 12200297  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | || | ||  |||||||    
T  12200298 tttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagttgttccagagctgaagctctcccactgttatgcttatgcaacttacccacttg-agtatatc 12200396  T
Q  219 tacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||    
T  12200397 tacataccaaccaacctaagcatatacgtatatat 12200431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Original strand, 12304763 - 12304924
Alignment:
Q  39 aaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactcc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12304763 aaaatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctcc 12304862  T
Q  138 accactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  12304863 accactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaact 12304924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 17157079 - 17157262
Alignment:
Q  43 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  17157079 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 17157178  T
Q  141 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  17157179 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttg-tgtatatctacatac 17157262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 9532849 - 9533027
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9532849 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccacttt 9532948  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  9532949 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 9533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Original strand, 24191783 - 24191963
Alignment:
Q  46 gggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccact 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||    
T  24191783 gggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagttctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgct 24191882  T
Q  144 ttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  24191883 ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttg-tgtatatctacatac 24191963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16383060 - 16382880
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16383060 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 16382962  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16382961 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtaatgcttatgcaact 16382880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41456325 - 41456123
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41456325 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 41456226  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || | || |||||||||||    
T  41456225 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactatcccacctg-tgtatatctac 41456127  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  41456126 atac 41456123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14652896 - 14652691
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14652896 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 14652798  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  14652797 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactattatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 14652699  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  14652698 ctacatac 14652691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8583471 - 8583294
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  8583471 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 8583373  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  8583372 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 8583294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 14084531 - 14084708
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  14084531 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14084629  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  14084630 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 14084708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 14089932 - 14090109
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  14089932 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14090030  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  14090031 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 14090109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13203719 - 13203537
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13203719 acccatgcatgtggtaccataaa-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcattttcaggacctaagtcctcaccactaacacca 13203621  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13203620 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactaa 13203537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16838681 - 16838502
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc-aggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16838681 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccactaacacca 16838584  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16838583 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaact 16838502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16802626 - 16802425
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  16802626 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacataagtcatcaccgctcaacaccgcttt 16802528  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  || ||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| || | || |||||||||||    
T  16802527 gaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttg-tgtatatctac 16802429  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  16802428 atac 16802425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24123380 - 24123203
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  24123380 atgcacgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24123282  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  24123281 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 24123203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 49399473 - 49399650
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  49399473 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaccaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 49399571  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  49399572 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 49399650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13969010 - 13968850
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  13969010 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13968912  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13968911 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13968850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13974485 - 13974325
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  13974485 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13974387  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13974386 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13974325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 17190836 - 17190992
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc--actacaccacttt 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||    
T  17190836 atgcatgtggtaccaaat-tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgatcaacaccgcttt 17190934  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 179  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  17190935 gaacaactagtgttccaccgctttgaaagacaaggcgttccagagccgaagctctccc 17190992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34852387 - 34852211
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34852387 catgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccact 34852289  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||    
T  34852288 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgattatgcaa 34852211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14544368 - 14544166
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  14544368 atgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 14544270  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||    
T  14544269 tgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttg-tgtatatcta 14544171  T
Q  221 catac 225  Q
    |||||    
T  14544170 catac 14544166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Original strand, 14292701 - 14292881
Alignment:
Q  22 ccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacca 117  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||| |||  ||||     
T  14292701 ccatacatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccg 14292799  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14292800 ctttgagcaactagtgctccaacgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaact 14292881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Original strand, 23174189 - 23174358
Alignment:
Q  55 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgact 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||||||     
T  23174189 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattttt-tcaggacataagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgaca 23174287  T
Q  154 aagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  23174288 aggcgttcaagagccgaagctctcccacttttatgcttttgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 23174358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16830065 - 16829979
Alignment:
Q  113 caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16830065 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaact 16829979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16830182 - 16830055
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc-aggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16830182 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccactaacacca 16830085  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttga 147  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16830084 ctttgagcaactagtgctccaccactttga 16830055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17199175 - 17199056
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 164  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  17199175 tcgaatggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 17199076  T
Q  165 agccgaagctctcccactgt 184  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  17199075 agccgaagctctcccgctgt 17199056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17243815 - 17243654
Alignment:
Q  66 gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 163  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||| |  | ||| |    
T  17243815 gtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttcta 17243716  T
Q  164 gagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| | |||||||| |  ||  || |||||||||||||||    
T  17243715 gggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgactccactgatgtatatctacatac 17243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961428
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||  |||| ||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgct 12961482  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 173  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  12961481 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagc 12961428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31690731 - 31690561
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattcc 162  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||  |||| |||| |  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || ||||    
T  31690731 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttaaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcc 31690632  T
Q  163 agagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaacc 234  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| | || | || ||||||||||||||| | ||||||    
T  31690631 agagccgaagccctcccgcttttatgtttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatacaactcaacc 31690561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Original strand, 18889009 - 18889133
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaa-ctagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 163  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||   |||  |||||| ||||||||||| | || |||||    
T  18889009 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcatcactgaacaccgctttgaacaataaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcca 18889108  T
Q  164 gagccgaagctctcccactgttatg 188  Q
    | |||||||| ||||| || |||||    
T  18889109 gggccgaagccctcccgcttttatg 18889133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Original strand, 23173876 - 23173963
Alignment:
Q  137 caccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  23173876 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 23173963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 108
Target Start/End: Original strand, 23173814 - 23173869
Alignment:
Q  54 acccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  23173814 accctcacctctgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcacc 23173869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11850840 - 11850780
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 85  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11850840 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 11850780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Original strand, 18900048 - 18900089
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18900048 tcgaatggttaaagcatttttttcaggacataagtcctcacc 18900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 19443468 - 19443553
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  19443468 catgcatgtggtaccataa--cagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcaggacatgagtcctcacc 19443553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10597866 - 10597829
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10597866 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 10597829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Original strand, 12419436 - 12419473
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12419436 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 12419473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 27280188 - 27280420
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27280188 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccac 27280287  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  27280288 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttg-agtatatc 27280386  T
Q  219 tacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  27280387 tacataccaaccaatcta-acatatacatatatat 27280420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20438709 - 20438531
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20438709 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 20438610  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  20438609 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 20438531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3706943 - 3706763
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3706943 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 3706845  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3706844 ctttgagcaattagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaact 3706763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 21542056 - 21542233
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  21542056 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21542154  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21542155 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 21542233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42096080 - 42095903
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  42096080 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 42095982  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  42095981 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 42095903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20046056 - 20045899
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20046056 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtagaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 20045957  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 179  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  20045956 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctccc 20045899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23066882 - 23066676
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacc 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  23066882 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggatcgtagccctctccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacacc 23066784  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtata 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||    
T  23066783 actttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtata 23066685  T
Q  217 tctacatac 225  Q
    |||||||||    
T  23066684 tctacatac 23066676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19664306 - 19664105
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  19664306 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 19664208  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || | || |||||||||||    
T  19664207 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactaacccacttg-tgtatatctac 19664109  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  19664108 atac 19664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 41110814 - 41111016
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41110814 atgcatgtgataccataattcagggtcatgacccacaccattgtcgaatggttaaagcattctcagcatgacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 41110913  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||   ||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || | || |||||||||||    
T  41110914 gaacgactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctg-tgtatatctac 41111012  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  41111013 atac 41111016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Original strand, 32650101 - 32650278
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactt 120  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||    
T  32650101 catgcatgtggtaccatat-tcaggaccgtagcccacaccgttgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctt 32650199  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    |||  ||||| |  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  32650200 tgaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaact 32650278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 20242528 - 20242746
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcaccacta--cac 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||  |||||||| ||||| |||| ||||||   |  ||||||||||||||||||| |||  |||    
T  20242528 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaaggccgaagccctaaccgctgtagaatgattaaggcattcattttccaggacataagtcctcaccgctaaacac 20242626  T
Q  116 cactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtat 215  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | | || | || |||||    
T  20242627 cgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaatgacccacttg-tgtat 20242725  T
Q  216 atctacataccaatcaaccta 236  Q
    |||||||||| | ||||||||    
T  20242726 atctacatacaactcaaccta 20242746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22448444 - 22448270
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccactacaccac 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||           
T  22448444 acccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcaccact------- 22448353  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaat 202  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||| ||||    
T  22448352 -ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttctacttttatgcttatgcaattaat 22448270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19778639 - 19778434
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcaccacta--caccac 118  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  19778639 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 19778541  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-tccccatgttgtatat 217  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||||||||| ||| | || |||||||    
T  19778540 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttg-tgtatat 19778442  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  19778441 ctacatac 19778434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 955223 - 955118
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccact--acacc 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  955223 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccactaaacacc 955125  T
Q  117 actttga 123  Q
    |||||||    
T  955124 actttga 955118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 36614935 - 36615015
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36614935 atgcatgtggtaccaaaa--cagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 36615015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29554578 - 29554465
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||     
T  29554578 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagg 29554479  T
Q  166 gccgaagctctccc 179  Q
    |||| ||| |||||    
T  29554478 gccggagccctccc 29554465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 955128 - 955041
Alignment:
Q  137 caccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||| | || | || |||||||||||||||    
T  955128 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttccacttttatgctcatgctactgacccacttg-tgtatatctacatac 955041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 24079551 - 24079634
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24079551 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 24079634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24109203 - 24109120
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24109203 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 24109120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23195653 - 23195571
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23195653 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 23195571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 73 - 253
Target Start/End: Original strand, 40549 - 40730
Alignment:
Q  73 ggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaag 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40549 ggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcattccagagccgaag 40648  T
Q  173 ctctcccactgttatg-ttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaacctagacatatgcatatatat 253  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  40649 ctcttccactgttatgtttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacatatatat 40730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36994 - 36793
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  36994 atgcatgtggtaccataa-tcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 36896  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctac 221  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||    
T  36895 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctac 36797  T
Q  222 atac 225  Q
    ||||    
T  36796 atac 36793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8541 - 8493
Alignment:
Q  21 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8541 cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4275
Alignment:
Q  43 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||  || ||||  ||||||    
T  4458 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctgtgaacaattagtgttccacc 4359  T
Q  141 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  4358 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaatccacttg-tgtatatctacatac 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4617
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  4795 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaattgttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4697  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa 201  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  4696 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaa 4617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14472
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14677 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 14579  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  14578 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 14480  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  14479 ctacatac 14472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 7225
Alignment:
Q  59 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactac-accactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaag 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  7356 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaataccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagg 7257  T
Q  157 cattccagagccgaagctctcccactgttatg 188  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7256 cgttccagagccgaagctctcccactgttatg 7225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10435 - 10259
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  10435 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 10337  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  10336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccacttttatgcttatgcaact 10259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 141322 - 141526
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccac 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  141322 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcaggacgtaagtcctcaccactaacaccac 141420  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || ||||||||    
T  141421 tttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatc 141519  T
Q  219 tacatac 225  Q
    |||||||    
T  141520 tacatac 141526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Original strand, 146611 - 146742
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaca--ccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  146611 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaaaaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaga 146710  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaa 197  Q
    | ||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  146711 gacgaagctctcccacttttatgattatgcaa 146742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 265096 - 265311
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccac 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  265096 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcatgacataagtcctcaccactaacaccac 265194  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || ||||||||    
T  265195 tttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatc 265293  T
Q  219 tacataccaatcaaccta 236  Q
    |||||||||  |||||||    
T  265294 tacataccacccaaccta 265311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 258670 - 258885
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccac 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  258670 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcatgacatatgtcctcaccactaacaccac 258768  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | || ||||||||    
T  258769 tttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatc 258867  T
Q  219 tacataccaatcaaccta 236  Q
    |||||||||  |||||||    
T  258868 tacataccacccaaccta 258885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 38401 - 38578
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  38401 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 38499  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  38500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 38578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35723 - 35546
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  35723 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 35625  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  35624 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 35546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 30322 - 30162
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  30322 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30224  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  30223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 30162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51858 - 51667
Alignment:
Q  45 agggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacca 141  Q
    ||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||  ||||| |  ||||||     
T  51858 agggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgctaaacaccgctttgaacaactactgttccaccg 51759  T
Q  142 ctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaacc 234  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||||| | ||||||    
T  51758 ctttgaatgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatacaactcaacc 51667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47156 - 46979
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  47156 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 47058  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  47057 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 46979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52561 - 52384
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  52561 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 52463  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  52462 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 52384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 174738 - 174561
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  174738 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 174640  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  174639 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtt-atgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 152359 - 152571
Alignment:
Q  22 ccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccact 119  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| || | |||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  152359 ccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaacactgtagaatggttaaagcaatcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccact 152457  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | || |||||||||    
T  152458 ttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttg-tgtatatct 152556  T
Q  220 acataccaatcaacc 234  Q
    |||||| | ||||||    
T  152557 acatacaactcaacc 152571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 41927 - 42132
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41927 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 42025  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  42026 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 42124  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  42125 ctacatac 42132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 110758 - 110935
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  110758 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcatt 110857  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  110858 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 110935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 86
Target Start/End: Original strand, 116793 - 116855
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 86  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  116793 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattct 116855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 63374 - 63169
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  63374 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 63276  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||    
T  63275 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatat 63177  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  63176 ctacatac 63169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12876
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||    
T  13054 atgcatgtggtaccataa-tcaggtccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacctaagtcctcaccgctctacaccgcttt 12956  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa 201  Q
    ||  |||| ||  |||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  12955 gaacaacttgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaactaa 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 124655 - 124446
Alignment:
Q  18 atacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--c 113  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||  |    
T  124655 atactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaac 124557  T
Q  114 accactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgt 213  Q
    ||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||  | ||||| ||||| || ||||| | |||||||| | || | |||| |    
T  124556 accgctttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaggtcagaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtt-t 124458  T
Q  214 atatctacatac 225  Q
    ||||||||||||    
T  124457 atatctacatac 124446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6212 - 5997
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacc 116  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6212 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacacc 6114  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtata 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||  |  ||||||    
T  6113 actttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgtaactaa-cccacttatgtata 6015  T
Q  217 tctacataccaatcaacc 234  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  6014 tctacatacaactcaacc 5997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9809 - 9649
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9809 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaataggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 9710  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9709 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 9649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15615 - 15432
Alignment:
Q  43 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  15615 tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 15516  T
Q  141 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     ||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  15515 gctttgaatgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttgtgcaactaacccccttg-tgtatatctacatac 15432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 199
Target Start/End: Original strand, 71154 - 71266
Alignment:
Q  89 tcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtta 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||    
T  71154 tcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgctttta 71253  T
Q  187 tgttaatgcaact 199  Q
    || | ||||||||    
T  71254 tgcttatgcaact 71266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 2566 - 2743
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  2566 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 2664  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||| ||  |||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||    
T  2665 gaacaactggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactttgatgcttatgcaacta 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 29748 - 29913
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  29748 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccacttt 29846  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 188  Q
    ||  ||| |||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29847 gaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccaaagctctcccacttttatg 29913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 174739 - 174561
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  174739 atgcatgtggtaccataattcttggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 174640  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
     |  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  174639 taacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Original strand, 489127 - 489304
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  489127 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaacactgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 489226  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaacta 200  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  489227 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 489304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 179002 - 179083
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  179002 catgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 179083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51152 - 50972
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51152 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcgttttcaggacataagtcctcaccactaacacca 51054  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  51053 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaact 50972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 201
Target Start/End: Original strand, 10217 - 10377
Alignment:
Q  43 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  || |||    
T  10217 tcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttctacc 10316  T
Q  141 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa 201  Q
     ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||    
T  10317 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcgactaa 10377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 10337 - 10518
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactacac--c 116  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  10337 acccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcactaaacatc 10435  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaact 199  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  10436 actttgagcaaccagtgctccaccactttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaact 10518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 14004 - 14209
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||  ||| |||| | || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14004 acccatgcatgtggtatcgaaa-tcaggaccgtagccctcacctcggtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcgccactaacacca 14102  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatat 217  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || |||||||    
T  14103 ctttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttctatgtttatgcaactaacccccttg-tgtatat 14201  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  14202 ctacatac 14209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 24205 - 24387
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24205 acccatgcatctggtaccataa-tcaggaccgtagccctcacctctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcgccactaacacca 24303  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa 201  Q
    ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||    
T  24304 ctttgaggaatgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctcttccacttctatgcttatgcaactaa 24387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 314 - 143
Alignment:
Q  55 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  314 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 215  T
Q  153 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  214 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47589 - 47387
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  47589 atgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 47491  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||    
T  47490 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttg-tgtatatcta 47392  T
Q  221 catac 225  Q
    |||||    
T  47391 catac 47387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 63009 - 62807
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  63009 atgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 62911  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||    
T  62910 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaactgacccgcttg-tgtatatcta 62812  T
Q  221 catac 225  Q
    |||||    
T  62811 catac 62807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 56623 - 56421
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactt 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  56623 atgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctt 56525  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatcta 220  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||    
T  56524 tgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaatctctcccacttttatgcttatgcaactgaccctcttg-tgtatatcta 56426  T
Q  221 catac 225  Q
    |||||    
T  56425 catac 56421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14710 - 14583
Alignment:
Q  62 cgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcatt 160  Q
    |||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||    
T  14710 cgctgtagaatggttaaaacattcatttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgtt 14611  T
Q  161 ccagagccgaagctctcccactgttatg 188  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14610 ctagagccgaagctctcccactgttatg 14583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20664 - 20482
Alignment:
Q  57 cacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 152  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20664 cacaccactgtagaatgattaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcgttgagcaactagtactccaccgctttgaacgac 20565  T
Q  153 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaaccta 236  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20564 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatacaactcaaccta 20482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15645 - 15511
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-cacca 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15645 acccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacacca 15547  T
Q  118 ctttgagtaactagtactccaccactttgaacgact 153  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15546 ctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgact 15511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Original strand, 2962 - 3132
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattcc 162  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||  | || ||||    
T  2962 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcatcaccgctaaacacctctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttcc 3061  T
Q  163 agagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaacc 234  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||| || | || ||||||||||||||| | ||||||    
T  3062 agagccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttg-tgtatatctacatacaactcaacc 3132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 182
Target Start/End: Original strand, 1 - 132
Alignment:
Q  43 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccac 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||        |||| ||||||  |||||||  ||||||||    
T  1 tcaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcct--------caccgctttgaacaactagtgttccaccac 92  T
Q  143 tttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 182  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  93 tttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 5144 - 5359
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--cacc 116  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  5144 acccatgcatgtggtaccataatt-agggccaaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctatacacc 5242  T
Q  117 actttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtata 216  Q
     ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| || | || ||||||    
T  5243 gctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaaccctcttg-tgtata 5341  T
Q  217 tctacataccaatcaacc 234  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  5342 tctacatacaactcaacc 5359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 1
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 121  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  131 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgatccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 32  T
Q  122 gagtaactagtactccaccactttgaacgac 152  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  31 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 201
Target Start/End: Original strand, 1 - 87
Alignment:
Q  115 ccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa 201  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  1 ccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaagcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaa 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 17476 - 17679
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||   ||| || |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  17476 catgcatgtggtaccataa-tcggggccgaagccctcatcgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 17574  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||| | || | || |||||||||    
T  17575 ttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctttcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatct 17673  T
Q  220 acatac 225  Q
    ||||||    
T  17674 acatac 17679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5185 - 4981
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  5185 catgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 5087  T
Q  120 ttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatc 218  Q
    ||||  ||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||| || | || ||||||||    
T  5086 ttgaacaacaaagtgctccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttg-tgtatatc 4988  T
Q  219 tacatac 225  Q
    |||||||    
T  4987 tacatac 4981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41750 - 41592
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||| |||||| | || |||||||    
T  41750 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccaga 41651  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  41650 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 41592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 103063 - 102930
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 164  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| |  | ||||||    
T  103063 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaactcgttccag 102964  T
Q  165 agccgaagctctcccactgttatgttaatgcaac 198  Q
     |||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  102963 ggccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaac 102930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8615
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcaccacta--caccac 118  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  8410 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 8508  T
Q  119 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-tccccatgttgtatat 217  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||||||||| ||| | || |||||||    
T  8509 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttg-tgtatat 8607  T
Q  218 ctacatac 225  Q
    ||||||||    
T  8608 ctacatac 8615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 234
Target Start/End: Original strand, 7293 - 7460
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||| || |||||  |||||| || |||||||| | || |||||||    
T  7293 gaatggttaaagcattcattttcaggatataagtccttaccactaaacaccgctttgaatatctagtgttccaccgctatgaacgacaaggcgttccaga 7392  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacataccaatcaacc 234  Q
    |||||||||||||| || ||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||||| | ||||||    
T  7393 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatacaactcaacc 7460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27781
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcatc-aggacataagtcctcaccacta-caccactt 120  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| | ||| |||| |||    
T  27945 atgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttataggacataagtcctcatcgctaacaccgctt 27847  T
Q  121 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtta 186  Q
    |||  |||| ||  |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27846 tgaacaactcgtgttccaccactttgaacgacaagccgttccagagccgaagctctcccgctgtta 27781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Original strand, 326816 - 326975
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| ||     
T  326816 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagg 326915  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-tccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    |||||||| |||||||| || || | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  326916 gccgaagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccccttg-tgtatatctacatac 326975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 321062 - 321266
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  321062 atgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgct 321160  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-tccccatgttgtatatc 218  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||| | || || | ||||||| || ||||| || ||||||||    
T  321161 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccatttttgtgcttatgcaacaaactccccttg-tgtatatc 321259  T
Q  219 tacatac 225  Q
    |||||||    
T  321260 tacatac 321266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Original strand, 115778 - 115911
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 164  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  ||  |||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  115778 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacgggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 115877  T
Q  165 agccgaagctctcccactgttatgttaatgcaac 198  Q
     | |||||| ||||| || ||||| | |||||||    
T  115878 ggtcgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 115911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 27861 - 28065
Alignment:
Q  24 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  27861 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 27959  T
Q  120 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatct 219  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  27960 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatct 28059  T
Q  220 acatac 225  Q
    ||||||    
T  28060 acatac 28065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 550 - 392
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactacac--cactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||  |||||||  ||||||  |||||||||| | || |||||||    
T  550 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcgctaaactccgctttgaacaactagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccaga 451  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  450 gccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17072 - 16914
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactacaccac--tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 165  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||| ||  |  |||||  |||||||  |||||  ||||||||||| | || |||||||    
T  17072 gaatggttaaagcattcattttcaggacataaggcctcaccgctaaactccgttttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccaga 16973  T
Q  166 gccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatgttgtatatctacatac 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  16972 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttg-tgtatatctacatac 16914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 3654 - 3718
Alignment:
Q  20 acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 85  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3654 acccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 3718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16226 - 16141
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16226 catgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctattcgaatgcttaaagcattcttttcaggacataagtcctcacc 16141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 2081 - 2139
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 123  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  2081 tcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttga 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1215 - 1157
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 123  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  1215 tcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttga 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 8093
Alignment:
Q  67 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 123  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  8151 tcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttga 8093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13594 - 13504
Alignment:
Q  23 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta 112  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  13594 catgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcaggacataagtcctcaccacta 13504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3466 - 3412
Alignment:
Q  55 cccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3466 cccacaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcacc 3412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 111
Target Start/End: Original strand, 370441 - 370483
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact 111  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  370441 gaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccact 370483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Original strand, 270 - 307
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  270 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4220
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4257 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 4220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31706 - 31669
Alignment:
Q  69 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31706 gaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 31669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University