View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18552_high_1 (Length: 836)

Name: NF18552_high_1
Description: NF18552
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18552_high_1
NF18552_high_1
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (18-828)||(33805846-33806662)
chr2 (18-828)||(33801379-33802180)
chr2 (29-828)||(33811653-33812458)
chr2 (29-828)||(31027327-31028129)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (180-828)||(49462448-49463090)
chr3 (270-638)||(10071050-10071418)
chr3 (307-377)||(7815117-7815187)
chr3 (34-103)||(49462293-49462362)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 645; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 33806662 - 33805846
Alignment:
Q  18 gctagctacgtcgtgctttggactgctaatagagcattaccagtttccaatgttgataattttgtgtttgataaaaaaggaaatgcctatttatagagga 117  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33806662 gctagctccatcgtgctttggactgctaatagagcattaccagtttccaatgttgataattttgtgtttgataaaaaaggaaatgcctatttacagagga 33806563  T
Q  118 atggaactgtgatctggtctacaaacacaattagcaaaacaatggaattgcaagacactggaaatttggttttgcttggtaacgacgacaataatacggt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33806562 atggaactgtgatctggtctacaaacacaattagcaaaacaatggaattgcaagacactggaaatttggttttgcttggtaacgacgacaataatacggt 33806463  T
Q  218 aatttggcaaagttttagttatccaactgatactttaatgccttcacaagatttcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33806462 aatttggcaaagttttagttatccaactgatactttaatgccttcacaagatttcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttg 33806363  T
Q  318 acctatgttcttgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactccacagacttattggactatgcagaatgatatccgtaaaatca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  33806362 acctatgttcttgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactccacagacttattggactatgcagaatgataaccgtaaaatcg 33806263  T
Q  418 ttgataaggtcggccatgttgtggcatttgcaaatatcagggacaattcttggagattctatgataacaataggtctttgttatagcaattcattttctc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  33806262 ttgataaggtcggccatgttgtggcatttgcaaatatcagggacaattcttggagattctatgataacaataggtctttgttatggaaattcattttctc 33806163  T
Q  518 tgttgatgcaggtataaatgcaagctggcttgcagttttgggaaaagatggtgtcattactttctctaatctcaacggtggtggatcaaatggtgattcc 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33806162 tgttgatgcaggtataaatgcaagctggattgcagttttgggaaaagatggtgtcattattttctctaatctcaacggtggtggatcaaatggtgattcc 33806063  T
Q  618 tcaacaagaataccacaagattattgtgatacaccagaaccttgtgatccctacagaatatgctcaaacaaccgtatgtgtagctgtcctcttgttct-- 715  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||  |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||      
T  33806062 tcaacaagaataccacaagatcattgtgatacaccagaaccttgtgatccttacaacatttgtgcaaataaccgtaggtgtagctgtccttctgttcttc 33805963  T
Q  716 -tcttcctagttgtaaaccaggtattgcctctccttg---caatgatgaatcaaaaagatctgttgaatttctgaaagttgatgatggacttggttactt 811  Q
     || || |||||||||||||||| ||| ||| |||||     ||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33805962 atcatcgtagttgtaaaccaggttttgtctcgccttgtgttgatgataaatcagaaaagtctattgaatttctgaaagctgatgatggacttagttactt 33805863  T
Q  812 tgcgcttgatattcttc 828  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  33805862 tgcacttgattttcttc 33805846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 33802180 - 33801379
Alignment:
Q  18 gctagctacgtcgtgctttggactgctaatagagcattaccagtttccaatgttgataattttgtgtttgataaaaaaggaaatgcctatttatagagga 117  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33802180 gctagctccatcgtgctttggactgctaatagagcattaccagtttccaatgttgataattttgtgtttgataaaaaaggaaatgcctatttacagagga 33802081  T
Q  118 atggaactgtgatctggtctacaaacacaattagcaaaacaatggaattgcaagacactggaaatttggttttgcttggtaacgacgacaataatacggt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33802080 atggaactgtgatctggtctacaaacacaattagcaaaacaatggaattgcaagacactggaaatttggttttgcttggtaacgacgacaataatacggt 33801981  T
Q  218 aatttggcaaagttttagttatccaactgatactttaatgccttcacaagatttcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33801980 aatttggcaaagttttagttatccaactgatactttaatgccttcacaagatttcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttg 33801881  T
Q  318 acctatgttcttgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactccacagacttattggactatgcagaatgatatccgtaaaatca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  33801880 acctatgttcttgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactccacagacttattggactatgcagaatgataaccgtaaaacga 33801781  T
Q  418 ttgataaggtcggccatgttgtggcatttgcaaatatcagggacaattcttggagattctatgataacaataggtctttgttatagcaattcattttctc 517  Q
    || | |||   ||  |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33801780 ttaacaagaatggtgatgttgtggcttttgcaaatctcagtgataattcttggaggttctatgataacaataagtctttgttatggcaattcattgtctc 33801681  T
Q  518 tgttgatgcaggtataaatgcaagctggcttgcagttttgggaaaagatggtgtcattactttctctaatctcaacggtggtggatcaaatggtgattcc 617  Q
    |         | |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| |     
T  33801680 t---------gatatacatgcaagttggattgcagttttaggaaaagacggtgtcattactttctcgaatctcaacggtactggatcaaacagtgatgct 33801590  T
Q  618 tcaacaagaataccacaagattattgtgatacaccagaaccttgtgatccctacagaatatgctcaaacaaccgtatgtgtagctgtcctcttgttcttc 717  Q
    |||  ||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33801589 tcactaagaataccaagagatccttgtggtacaccagaaccttgtgatccctacggaatatgctcaaacaaccgtatgtgtagctgtcctcttgttcttc 33801490  T
Q  718 ttcctagttgtaaaccaggtattgcctctccttgcaatgatgaatcaaaaagatctgttgaatttctgaaagttgatgatggacttggttactttgcgct 817  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33801489 ttcctagttgtaaaccaggttttgcctctccttgcgatgatgaatcaaaaagatctgttgaatttctgaaagttgatgatggacttggttactttgcgct 33801390  T
Q  818 tgatattcttc 828  Q
    |||| ||||||    
T  33801389 tgattttcttc 33801379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 828
Target Start/End: Original strand, 33811653 - 33812458
Alignment:
Q  29 cgtgctttggactgctaatagagcattaccagtttccaatgttgataattttgtgtttgataaaaaaggaaatgcctatttatagaggaatggaactgtg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||    
T  33811653 cgtgctttggactgctaatagagcactaccagtttccaattatgataatttcgagtttgataaaaaaggaaatgcctatttactgaaagatggaactgtg 33811752  T
Q  129 atctggtctacaaacacaattagcaaaacaatggaattgcaagacactggaaatttggttttgcttggtaacgacgacaataatacggtaatttggcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33811753 atctggtctacaaacacaattagcaaaacaatggaattgcaaaacactggaaatttggttttgcttggtaaggacgacaataatacggtaatttggcaaa 33811852  T
Q  229 gttttagttatccaactgatactttaatgccttcacaagatttcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttgacctatgttct 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33811853 gttttagttatccaactgatactttgatgcattcacaggatttcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttgacctatgttct 33811952  T
Q  329 tgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactccacagacttattggactatgcagaatgatatccgtaaaatcattgataaggtc 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33811953 tgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactccacagacttattggactatgcagaatgataaccgtaaaatcgttgataaggtc 33812052  T
Q  429 ggccatgttgtggcatttgcaaatatcagggacaattcttggagattctatgataacaataggtctttgttatagcaattcattttctctgttgatgcag 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33812053 ggccatgttgtggcatttgcaaatatcagggacaattcttggagattctatgataacaataggtctttgttatggaaattcattttctctgttgatgcag 33812152  T
Q  529 gtataaatgcaagctggcttgcagttttgggaaaagatggtgtcattactttctctaatctcaacggtggtggatcaaatggtgattcctcaacaagaat 628  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33812153 gtataaatgcaagctggattgcagttttgggaaaagatggtgtcattattttctctaatctcaacggtggtggatcaaatggtgattcctcaacaagaat 33812252  T
Q  629 accacaagattattgtgatacaccagaaccttgtgatccctacagaatatgctcaaacaaccgtatgtgtagctgtcctcttgttct---tcttcctagt 725  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||  |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||   || || ||||    
T  33812253 accacaagatcattgtgatacaccagaaccttgtgatccttacaacatttgtgcaaataaccgtaggtgtagctgtccttctgttcttcatcatcgtagt 33812352  T
Q  726 tgtaaaccaggtattgcctctccttg---caatgatgaatcaaaaagatctgttgaatttctgaaagttgatgatggacttggttactttgcgcttgata 822  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||     ||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  33812353 tgtaaaccaggttttgtctcgccttgtgttgatgataaatcagaaaagtctattgaatttctgaaagctgatgatggacttagttactttgcacttgatt 33812452  T
Q  823 ttcttc 828  Q
    ||||||    
T  33812453 ttcttc 33812458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 828
Target Start/End: Original strand, 31027327 - 31028129
Alignment:
Q  29 cgtgctttggactgctaatagagcattaccagtttccaatgttgataattttgtgtttgataaaaaaggaaatgcctatttatagaggaatggaactgtg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  |||   |||||| ||||    
T  31027327 cgtgctttgggctgctaatagagcattacctgtttccaattacgatagtttcgtgtttgataaaaatggaaatgcctttttggagaaagatggaattgtg 31027426  T
Q  129 atctggtctacaaacacaattagcaaaacaatggaattgcaagacactggaaatttggttttgcttggtaacgacgacaataatacggtaatttggcaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31027427 atctggtctacaaacacaattagcaaagcaatggaattgcaagacaatggaaatttggttttgcttggtaacgacgacaatgatacggtaatttggcaaa 31027526  T
Q  229 gttttagttatccaactgatactttaatgccttcacaagatttcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttgacctatgttct 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31027527 gttttagttatccaactgatactttgatgccttcgcaggaattcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagtccaaataacttgacctatgttct 31027626  T
Q  329 tgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactccacagacttattggactatgcagaatgatatccgtaaaatcattgataaggtc 428  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||    
T  31027627 tgagatcaaatcaggtaatgttattctttcagctggttacaaaactccacaaacatattggactatgcagaaggataaccgtaaaataatagataaggtc 31027726  T
Q  429 ggccatgttgtggcatttgcaaatatcagggacaattcttggagattctatgataacaataggtctttgttatagcaattcattttctctgttgatgcag 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31027727 ggccatgttgtggcgtttgcaaatctcagtgacaattcttggaggttctatgataacaataagtctttgttatggcaattcattttctctgctgatggag 31027826  T
Q  529 gtataaatgcaagctggcttgcagttttgggaaaagatggtgtcattactttctctaatctcaacggtggtggatcaaatggtgattcctcaacaagaat 628  Q
    | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31027827 gcataaatggaagttggattgcagttttgggaagggatggtgtcattactttctcgaatctcaacggtggtggatcaaacggtgattcttcaacaagaat 31027926  T
Q  629 accacaagattattgtgatacaccagaaccttgtgatccctacagaatatgctcaaacaaccgtatgtgtagctgtcctcttgttcttcttcctagttgt 728  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31027927 accacaagattattgtggtacaccagaaccttgtgatccctacaatatatgcgcaaacaaacgtacgtgtagctgtcctcatgttcttcttcctagttgt 31028026  T
Q  729 aaaccaggtattgcctctccttgcaatgatg---aatcaaaaagatctgttgaatttctgaaagttgatgatggacttggttactttgcgcttgatattc 825  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||||   |||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  31028027 aaaccaggttttgtctctccttgtgatgatgataaatcaaaaaagtctatagaatttctgaaagctgatgatggacttggctactttgcgcttgattttc 31028126  T
Q  826 ttc 828  Q
    |||    
T  31028127 ttc 31028129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 180 - 828
Target Start/End: Original strand, 49462448 - 49463090
Alignment:
Q  180 aatttggttttgcttggtaacgacgacaataatacggtaatttggcaaagttttagttatccaactgatactttaatgccttcacaagatttcaaagagg 279  Q
    ||||||||||||||||| || ||    |||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||  ||| | ||| || || |    
T  49462448 aatttggttttgcttgggaaggat---aatagtacggtaatttggcaaagttttgattttcctactgatactttgatgcctcaacaggtttttaaggaag 49462544  T
Q  280 gaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttgacctatgttcttgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactccaca 379  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  49462545 gaatgaagattactagtgaacctagttcaaataatttgacctatgttcttgagattaaatctggtaatgttgttctttctgctggttttaaaattccaca 49462644  T
Q  380 gacttattggactatgcagaatgatatccgtaaaatcattgataaggtcggccatgttgtggcatttgcaaatatcagggacaattcttggagattctat 479  Q
    |  |||||||||||||||| | |||| | | |||| |||||||||||  || ||||||||||  |  || ||| | || ||||||||||||||||| |||    
T  49462645 ggtttattggactatgcaggaggataacaggaaaaccattgataaggatggtcatgttgtggtttcggcgaatcttagtgacaattcttggagattttat 49462744  T
Q  480 gataacaataggtctttgttatagcaattcattttctctgttgatgcaggtataaatgcaagctggcttgcagttttgggaaaagatggtgtcattactt 579  Q
    ||| |||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  49462745 gatgacaagaagtctttgttgtggcaattcattttctctgatgatgtaggtgtaaatgcaacttggattgctgttttgggaagggatggtgttattactt 49462844  T
Q  580 tctctaatctcaacggtggtggatcaaatggtgattcctcaacaagaataccacaagattattgtgatacaccagaaccttgtgatccctacagaatatg 679  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||  |||||  ||||| || || || ||||| || || |||||    
T  49462845 tctctaatctcaacagtggtgggtcgaatggtgattcttcgactaggataccacaagatccttgtgggacaccggagccatgcgatccttatagcatatg 49462944  T
Q  680 ctcaaacaaccgtatgtgtagctgtcctcttgttcttcttcctagttgtaaaccaggtattgcctctccttgcaatgatgaatcaaaaagatctgttgaa 779  Q
    | | |||||||| | ||||||||||||   |  | || |||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||  ||||| ||||| |||  ||| |  ||    
T  49462945 cacgaacaaccgaaggtgtagctgtcc---ttctattattcctaattgtaaacctggttttttttctccttgtgatgataaatcagaaaactctatccaa 49463041  T
Q  780 tttctgaaagttgatgatggacttggttactttgcgcttgatattcttc 828  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  49463042 tttttgaaaggtgatgacggacttggttactttgcacttgattttcttc 49463090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 270 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 10071418 - 10071050
Alignment:
Q  270 ttcaaagagggaatgaaacttaccagtgaacctagttcaaataacttgacctatgttcttgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttca 369  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | || |||| ||||||||      
T  10071418 ttcaaagaggtaaagaaacttacaagtgaacctattccaaataactcgacctatgttcttcagataaaatctggtaatgctattgtttctgctggtttgg 10071319  T
Q  370 aaactccacagacttattggactatgcagaatgatatccgtaaaatcattgataaggtcggccatgttgtggcatttgcaaatatcagggacaattcttg 469  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||| | || ||| ||||  |||||||||| |    ||||| ||||   ||||||||||||  ||||||  ||    
T  10071318 aaactccactgacttactagactatgcagaagggtaaccgcaaaacaattgataaggacaataatgttttggctactgcaaatatcagtaacaatttatg 10071219  T
Q  470 gagattctatgataacaataggtctttgttatagcaattcattttctctgttgatgcaggtataaatgcaagctggcttgcagttttgggaaaagatggt 569  Q
    |||||| |||||  | || | ||||||||| | |||||| | ||||| || ||||||| || | || ||||  ||| |||||||||| ||||  ||||||    
T  10071218 gagattgtatgacgagaagatgtctttgttgttgcaatttactttctatgctgatgcatgtgtgaaagcaacttggattgcagttttcggaagggatggt 10071119  T
Q  570 gtcattactttctctaatctcaacggtggtggatcaaatggtgattcctcaacaagaataccacaagat 638  Q
     | ||||||||||||| |||||||  |||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10071118 tttattactttctctactctcaacaatggtggaataaacagtgattcatcaacaagaataccacaagat 10071050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 307 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7815187 - 7815117
Alignment:
Q  307 caaataacttgacctatgttcttgagatcaaatctggtgatgttgttctttcagctggtttcaaaactcca 377  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  7815187 caaataacttgacctttgttattgagatcaaatctggtaatgttatactttcagcttgtttcaaaactcca 7815117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Original strand, 49462293 - 49462362
Alignment:
Q  34 tttggactgctaatagagcattaccagtttccaatgttgataattttgtgtttgataaaaaaggaaatgc 103  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  49462293 tttggactgctaatagaggaaaaccagtttctaattctgataattttgtctttgataaaaagggtaatgc 49462362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University