View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18556_high_2 (Length: 779)

Name: NF18556_high_2
Description: NF18556
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18556_high_2
NF18556_high_2
[»] chr6 (115 HSPs)
chr6 (12-335)||(26656014-26656337)
chr6 (12-335)||(26761985-26762308)
chr6 (12-335)||(27337904-27338227)
chr6 (12-335)||(27398644-27398967)
chr6 (12-323)||(25579744-25580055)
chr6 (8-323)||(26055947-26056262)
chr6 (8-323)||(26075917-26076232)
chr6 (12-323)||(26142890-26143201)
chr6 (512-773)||(26656481-26656742)
chr6 (512-773)||(26762452-26762713)
chr6 (12-323)||(25538565-25538876)
chr6 (21-227)||(26048879-26049085)
chr6 (21-227)||(26070048-26070254)
chr6 (12-335)||(26646504-26646827)
chr6 (12-335)||(26752472-26752795)
chr6 (12-323)||(25481767-25482078)
chr6 (450-775)||(25539002-25539322)
chr6 (450-775)||(26143327-26143647)
chr6 (567-775)||(25580293-25580501)
chr6 (563-772)||(28786805-28787014)
chr6 (13-332)||(26823866-26824185)
chr6 (12-136)||(26884188-26884314)
chr6 (563-773)||(26647046-26647256)
chr6 (563-773)||(26753014-26753224)
chr6 (545-775)||(27337498-27337728)
chr6 (545-775)||(27398238-27398468)
chr6 (563-772)||(28792926-28793135)
chr6 (29-138)||(27427642-27427751)
chr6 (563-775)||(25483626-25483838)
chr6 (59-202)||(26623048-26623191)
chr6 (59-202)||(26729026-26729169)
chr6 (563-772)||(28781668-28781877)
chr6 (587-775)||(25492722-25492910)
chr6 (12-136)||(27678971-27679095)
chr6 (12-136)||(27698532-27698656)
chr6 (12-160)||(28149963-28150110)
chr6 (621-775)||(26824444-26824598)
chr6 (12-316)||(27718237-27718541)
chr6 (563-775)||(26884637-26884849)
chr6 (12-136)||(27611040-27611164)
chr6 (12-136)||(27677652-27677776)
chr6 (12-136)||(27706440-27706564)
chr6 (563-775)||(27717902-27718114)
chr6 (564-775)||(27610523-27610734)
chr6 (26-189)||(28139580-28139743)
chr6 (563-775)||(26056489-26056701)
chr6 (563-775)||(26076459-26076671)
chr6 (563-779)||(26623838-26624054)
chr6 (563-779)||(26729815-26730031)
chr6 (563-775)||(27530704-27530916)
chr6 (12-172)||(27593022-27593182)
chr6 (12-136)||(27724883-27725007)
chr6 (566-775)||(26862153-26862359)
chr6 (26-156)||(27531215-27531345)
chr6 (562-779)||(27705803-27706020)
chr6 (563-779)||(27427011-27427227)
chr6 (8-127)||(28181135-28181254)
chr6 (12-102)||(27229257-27229347)
chr6 (413-474)||(26656415-26656476)
chr6 (413-474)||(26762386-26762447)
chr6 (570-779)||(27697985-27698194)
chr6 (563-779)||(26803013-26803229)
chr6 (563-775)||(27604107-27604319)
chr6 (563-779)||(31285126-31285342)
chr6 (67-202)||(26937174-26937309)
chr6 (8-127)||(28185387-28185506)
chr6 (12-316)||(26802467-26802771)
chr6 (21-133)||(26341975-26342087)
chr6 (571-775)||(27215027-27215231)
chr6 (12-128)||(28242829-28242945)
chr6 (12-323)||(28781164-28781475)
chr6 (21-136)||(27604743-27604858)
chr6 (562-777)||(27679516-27679731)
chr6 (8-127)||(28226971-28227090)
chr6 (12-119)||(31284313-31284420)
chr6 (68-252)||(28098291-28098475)
chr6 (12-323)||(28786303-28786614)
chr6 (12-323)||(28792424-28792735)
chr6 (71-317)||(26949745-26949991)
chr6 (216-323)||(27214649-27214756)
chr6 (216-323)||(27234472-27234579)
chr6 (69-198)||(2184980-2185109)
chr6 (66-127)||(28297760-28297821)
chr6 (66-127)||(28514252-28514313)
chr6 (68-116)||(2184369-2184417)
chr6 (13-121)||(26861642-26861750)
chr6 (69-117)||(26975134-26975182)
chr6 (562-773)||(27592426-27592637)
chr6 (562-773)||(27677025-27677236)
chr6 (12-115)||(28234589-28234692)
chr6 (69-119)||(25071741-25071791)
chr6 (21-122)||(28325515-28325616)
chr6 (68-136)||(26848741-26848809)
chr6 (563-670)||(25511505-25511612)
chr6 (68-127)||(27214498-27214557)
chr6 (68-127)||(27234671-27234730)
chr6 (230-285)||(28234806-28234861)
chr6 (143-202)||(29826183-29826242)
chr6 (223-285)||(26617858-26617920)
chr6 (223-285)||(26723786-26723848)
chr6 (68-122)||(27665169-27665223)
chr6 (216-317)||(26635919-26636020)
chr6 (216-317)||(26741885-26741986)
chr6 (216-317)||(26959395-26959496)
chr6 (415-460)||(27337783-27337828)
chr6 (415-460)||(27398523-27398568)
chr6 (71-122)||(26635774-26635825)
chr6 (71-122)||(26741740-26741791)
chr6 (216-335)||(26861842-26861961)
chr6 (230-317)||(28185609-28185696)
chr6 (230-317)||(28297570-28297657)
chr6 (230-317)||(28514416-28514503)
chr6 (223-285)||(26811745-26811807)
chr6 (71-117)||(26959250-26959296)
chr6 (197-310)||(25506848-25506961)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (12-331)||(18731334-18731653)
chr4 (12-323)||(18655315-18655626)
chr4 (12-323)||(18723923-18724234)
chr4 (12-322)||(18699239-18699549)
chr4 (12-323)||(18679405-18679716)
chr4 (29-138)||(18073804-18073913)
chr4 (563-773)||(18698801-18699011)
chr4 (29-126)||(17989088-17989185)
chr4 (563-779)||(18074328-18074544)
chr4 (637-775)||(18678959-18679097)
chr4 (637-775)||(18654876-18655014)
chr4 (637-775)||(18723484-18723622)
chr4 (563-773)||(18730905-18731115)
chr4 (69-207)||(5090921-5091059)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (67-331)||(29273613-29273877)
chr8 (563-779)||(29273237-29273453)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (12-323)||(268195-268506)
chr1 (23-333)||(28127507-28127817)
chr1 (568-775)||(28127078-28127285)
chr1 (573-775)||(28163778-28163980)
chr1 (67-332)||(28164192-28164456)
chr1 (563-779)||(267739-267955)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (563-772)||(8054-8263)
scaffold0419 (12-331)||(7550-7869)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (563-772)||(13081-13290)
scaffold0277 (70-331)||(4514-4775)
scaffold0277 (637-772)||(4118-4253)
scaffold0277 (12-331)||(13475-13794)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (29-138)||(59612-59721)
scaffold0003 (563-779)||(60136-60352)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (12-136)||(3459-3584)
scaffold0349 (563-775)||(2942-3154)
scaffold0349 (12-136)||(14394-14517)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (12-285)||(34750-35023)
scaffold0038 (12-128)||(42991-43107)
scaffold0038 (8-127)||(27469-27588)
scaffold0038 (21-122)||(116830-116931)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (12-122)||(58334-58444)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (21-122)||(3279722-3279823)
chr2 (69-122)||(17993736-17993789)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 115)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Original strand, 26656014 - 26656337
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656014 catcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 26656113  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  26656114 cattcattgctataagacaaagggttgttcggttttgcctgttttctatggtgtggatcctactcacatacgacatcagactggaagttacggtgagcat 26656213  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656214 cttactaagcatgaaaagaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 26656313  T
Q  312 accattgtagtcaagggtacccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26656314 accattgtagtcaagggtacccca 26656337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Original strand, 26761985 - 26762308
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26761985 catcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 26762084  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  26762085 cattcattgctataagacaaagggttgttcggttttgcctgttttctatggtgtggatcctactcacatacgacatcagactggaagttacggtgagcat 26762184  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762185 cttactaagcatgaaaagaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 26762284  T
Q  312 accattgtagtcaagggtacccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26762285 accattgtagtcaagggtacccca 26762308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27338227 - 27337904
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27338227 catcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgcatcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 27338128  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27338127 cattcactgctacaagacaaggggttgttcggttttgcctgttttctatggtgcggatcctactcacgtacgacatcagactgggagttatggtgagcat 27338028  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||     
T  27338027 cttactaagcatgaagataagttccaaaataacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctccggcc 27337928  T
Q  312 accattgtagtcaagggtacccca 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  27337927 accattttagtcaagggtacccca 27337904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27398967 - 27398644
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27398967 catcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgcatcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 27398868  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27398867 cattcactgctacaagacaaggggttgttcggttttgcctgttttctatggtgcggatcctactcacgtacgacatcagactgggagttatggtgagcat 27398768  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||     
T  27398767 cttactaagcatgaagataagttccaaaataacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctccggcc 27398668  T
Q  312 accattgtagtcaagggtacccca 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  27398667 accattttagtcaagggtacccca 27398644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 25579744 - 25580055
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579744 catcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 25579843  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  || |||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  25579844 cattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacatacgacatcagagtgggagttatggtgagtat 25579943  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || |||||||| || | |||   ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  25579944 cttactaagcatgaagagaggtttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttacccaagctgctaacttgtccggct 25580043  T
Q  312 accattgtagtc 323  Q
    | |||| |||||    
T  25580044 atcattatagtc 25580055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 323
Target Start/End: Original strand, 26055947 - 26056262
Alignment:
Q  8 acatcatcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtcc 107  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26055947 acatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtcc 26056046  T
Q  108 acatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |  || |||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26056047 acatcattcactgctacaacacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacatacgacatcagagtgggagttatggtga 26056146  T
Q  208 gcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtct 307  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| || |||||||| || | |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||     
T  26056147 gcatcttactaagcataaagaggggttccaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatggctcttactcaagctgctaacttgtcc 26056246  T
Q  308 ggctaccattgtagtc 323  Q
    ||||| |||| |||||    
T  26056247 ggctatcattatagtc 26056262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 323
Target Start/End: Original strand, 26075917 - 26076232
Alignment:
Q  8 acatcatcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtcc 107  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075917 acatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtcc 26076016  T
Q  108 acatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |  || |||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26076017 acatcattcactgctacaacacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacatacgacatcagagtgggagttatggtga 26076116  T
Q  208 gcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtct 307  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| || |||||||| || | |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||     
T  26076117 gcatcttactaagcataaagaggggttccaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatggctcttactcaagctgctaacttgtcc 26076216  T
Q  308 ggctaccattgtagtc 323  Q
    ||||| |||| |||||    
T  26076217 ggctatcattatagtc 26076232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 26142890 - 26143201
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26142890 catcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 26142989  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  || || ||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  26142990 cattcactgctacaagacaaagagttgcttagtatttcccgttttctatgatgtggaacctactcacatacgaaatcagagtgggatttatggtgagcat 26143089  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || |||||||| || | |||   ||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||| ||||    
T  26143090 cttactaagcatgaagagaggtttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttatccaagctgctaacttgtccggct 26143189  T
Q  312 accattgtagtc 323  Q
    | |||| |||||    
T  26143190 atcattatagtc 26143201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 512 - 773
Target Start/End: Original strand, 26656481 - 26656742
Alignment:
Q  512 acatggatgtgattgtaattaatgtagcatatgtactaatttatctgttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacat 611  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  26656481 acatgtatgtgattgtgattaatgtagtctgtgtactaacttatctcttgtacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacat 26656580  T
Q  612 ctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaat 711  Q
    |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |    
T  26656581 ctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatct 26656680  T
Q  712 gatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgc 773  Q
     | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26656681 aaggatgaggttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgc 26656742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 512 - 773
Target Start/End: Original strand, 26762452 - 26762713
Alignment:
Q  512 acatggatgtgattgtaattaatgtagcatatgtactaatttatctgttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacat 611  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  26762452 acatgtatgtgattgtgattaatgtagtctgtgtactaacttatctcttgtacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacat 26762551  T
Q  612 ctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaat 711  Q
    |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |    
T  26762552 ctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatct 26762651  T
Q  712 gatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgc 773  Q
     | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26762652 aaggatgaggttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgc 26762713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 25538565 - 25538876
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25538565 catcacttgtcaaggccatcgaagaatctagaatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccagat 25538664  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  || |||||  |||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25538665 cattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcagttacgacatcagagtgggagttatggtgagcat 25538764  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
     |||||||||||||||| | ||| ||||||||  || |||||||| || | |||   ||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||| ||||    
T  25538765 tttactaagcatgaagagaggtttcaaaataatgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttatccaagctgctaacttgtccggct 25538864  T
Q  312 accattgtagtc 323  Q
    | |||| |||||    
T  25538865 atcattatagtc 25538876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Original strand, 26048879 - 26049085
Alignment:
Q  21 tcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 120  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26048879 tcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 26048978  T
Q  121 ctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaag 220  Q
    ||||||||||||| |||| |  || |||||  |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26048979 ctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctactcacatacgacatcatagtggaagttatggtgagcatcttactaag 26049078  T
Q  221 catgaag 227  Q
    |||||||    
T  26049079 catgaag 26049085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Original strand, 26070048 - 26070254
Alignment:
Q  21 tcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 120  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070048 tcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 26070147  T
Q  121 ctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaag 220  Q
    ||||||||||||| |||| |  || |||||  |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26070148 ctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctactcacatacgacatcatagtggaagttatggtgagcatcttactaag 26070247  T
Q  221 catgaag 227  Q
    |||||||    
T  26070248 catgaag 26070254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Original strand, 26646504 - 26646827
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26646504 catcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacat 26646603  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||  ||||||||   |||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| |||    
T  26646604 cattcattgctacaagacaaagggtcgtctcgttttgcccgttttctatggcgtggatcctactcagatacggcatcaaagtgggagttatggtgaacat 26646703  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    || |||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||| | |  | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |    
T  26646704 ctcactaagcacgaagagagtttccaaaataacaagaaaaacaaggaacgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggat 26646803  T
Q  312 accattgtagtcaagggtacccca 335  Q
    |||||| |||||  ||||||||||    
T  26646804 accattatagtcctgggtacccca 26646827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Original strand, 26752472 - 26752795
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26752472 catcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacat 26752571  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||  ||||||||   |||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| |||    
T  26752572 cattcattgctacaagacaaagggtcgtctcgttttgcccgttttctatggcgtggatcctactcagatacggcatcaaagtgggagttatggtgaacat 26752671  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    || |||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||| | |  | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |    
T  26752672 ctcactaagcacgaagagagtttccaaaataacaagaaaaacaaggaacgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggat 26752771  T
Q  312 accattgtagtcaagggtacccca 335  Q
    |||||| |||||  ||||||||||    
T  26752772 accattatagtcctgggtacccca 26752795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 25481767 - 25482078
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25481767 catcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttgtattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 25481866  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  || || ||  ||||||||  ||||||||||| | |  | |||| ||| ||  | |||||| ||||  ||    
T  25481867 cattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattacccgttttctatggtgtggatcctactgatgttcgacgtcatacatgtagttatggtgaatat 25481966  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    || ||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||| || | |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  25481967 ctgactaagcatgaagaggggttccaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatggctcttactcaagctgctaatttgtccggct 25482066  T
Q  312 accattgtagtc 323  Q
    | |||| |||||    
T  25482067 atcattatagtc 25482078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 450 - 775
Target Start/End: Original strand, 25539002 - 25539322
Alignment:
Q  450 aaacaagtataagttatttatatgtccaaactgctgttataattgtatattatattctcagtacatggatgtgattgtaattaatgtagcatatgtacta 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||      ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    |||  ||||| |||    
T  25539002 aaacaagtgtaagttatttatatgtcaaaaaaa---ttagaattgcataatatattctcaatacatggatgtgattttgattt---tagtttatgttcta 25539095  T
Q  550 atttatctg-ttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgcc 648  Q
    | ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| |||  ||||| | |||  ||||| |||| |||    
T  25539096 acttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgtttttttatatgtggcc 25539195  T
Q  649 aaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactg 748  Q
    ||||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||  ||||||||  ||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539196 aaataccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactg 25539295  T
Q  749 gaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25539296 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaa 25539322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 450 - 775
Target Start/End: Original strand, 26143327 - 26143647
Alignment:
Q  450 aaacaagtataagttatttatatgtccaaactgctgttataattgtatattatattctcagtacatggatgtgattgtaattaatgtagcatatgtacta 549  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  |   ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    |||  ||| | |||    
T  26143327 aaacaagtgtaagttatttatatgtcaaaaaag---ttagaattgcataatatattctcaatacatggatgtgattttgattt---tagtgtattttcta 26143420  T
Q  550 atttatctg-ttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgcc 648  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| |||  ||||| | |||  ||||| |||| |||    
T  26143421 atttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgtttttttaaatgtagcc 26143520  T
Q  649 aaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactg 748  Q
    ||||||||||||||||||||||    | || || |||||||||  |||||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26143521 aaataccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactg 26143620  T
Q  749 gaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26143621 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaa 26143647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 567 - 775
Target Start/End: Original strand, 25580293 - 25580501
Alignment:
Q  567 gaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggatta 666  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| |||  ||||| | |||  ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  25580293 gaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttggatta 25580392  T
Q  667 cagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaa 766  Q
    ||||    | || ||||||||||||  |||||||| |||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25580393 cagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaa 25580492  T
Q  767 cacttgcaa 775  Q
    |||||||||    
T  25580493 cacttgcaa 25580501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 563 - 772
Target Start/End: Original strand, 28786805 - 28787014
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  28786805 acatgaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 28786904  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||   |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28786905 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 28787004  T
Q  763 tcaacacttg 772  Q
    ||||||||||    
T  28787005 tcaacacttg 28787014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 26823866 - 26824185
Alignment:
Q  13 atcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatc 112  Q
    ||||||||  || ||||||||||| || | ||| || |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26823866 atcactcaataatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctgccaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatc 26823965  T
Q  113 attcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatc 212  Q
    |||| |  |||||||  ||||||  |    ||||||||| ||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||    
T  26823966 attcgcgtctacaaggaaaaggggcgcctcgttttgcctgttttctatggtgtggatcctggtgacatacgacatcagcgtgggagttatgctatacatc 26824065  T
Q  213 ttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggcta 312  Q
    | |||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||||| ||||||||   |||||||  ||||||||||||     
T  26824066 tcactaagcatgaaaagaggttcggaaataacaaggaaaacatggagaaattgcttcaatggaagaaggctctgaaacaagctgctgacttgtctggctt 26824165  T
Q  313 ccattgtagtcaagggtacc 332  Q
     |||| |||||  |||||||    
T  26824166 tcattttagtcttgggtacc 26824185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 26884188 - 26884314
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccaca- 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26884188 catcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattccaatattttctaccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 26884287  T
Q  111 -tcattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
     |||||||||||||| |||||||||||    
T  26884288 gtcattcactgctacgagacaaagggt 26884314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 563 - 773
Target Start/End: Original strand, 26647046 - 26647256
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26647046 acatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttgg 26647145  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||| |||    | || ||||||||||||  ||||||||||  | |  |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  26647146 attagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaa 26647245  T
Q  763 tcaacacttgc 773  Q
    |||||||||||    
T  26647246 tcaacacttgc 26647256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 563 - 773
Target Start/End: Original strand, 26753014 - 26753224
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26753014 acatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttgg 26753113  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||| |||    | || ||||||||||||  ||||||||||  | |  |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  26753114 attagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaa 26753213  T
Q  763 tcaacacttgc 773  Q
    |||||||||||    
T  26753214 tcaacacttgc 26753224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 545 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27337728 - 27337498
Alignment:
Q  545 tactaatttatctgttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgt 644  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | || |||| ||||| |||||||| |||||  || |||| ||    
T  27337728 tactaacttatctattggacatgaatagatatgagtacgagcttattgagaatatagtcgaacacatttccgataggatcaatcgtgtttttctacacgt 27337629  T
Q  645 tgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggt 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||  |||||||||  || |  |||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  27337628 tgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggt 27337529  T
Q  745 actggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    ||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  27337528 actagaggcttgggaaaatcaacacttgcaa 27337498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 545 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27398468 - 27398238
Alignment:
Q  545 tactaatttatctgttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgt 644  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | || |||| ||||| |||||||| |||||  || |||| ||    
T  27398468 tactaacttatctattggacatgaatagatatgagtacgagcttattgagaatatagtcgaacacatttccgataggatcaatcgtgtttttctacacgt 27398369  T
Q  645 tgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggt 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||  |||||||||  || |  |||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  27398368 tgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggt 27398269  T
Q  745 actggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    ||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  27398268 actagaggcttgggaaaatcaacacttgcaa 27398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 563 - 772
Target Start/End: Original strand, 28792926 - 28793135
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  28792926 acattaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 28793025  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||   |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28793026 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 28793125  T
Q  763 tcaacacttg 772  Q
    ||||||||||    
T  28793126 tcaacacttg 28793135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27427751 - 27427642
Alignment:
Q  29 attgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaaga 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27427751 attgaagaatccaggattttgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaa 27427652  T
Q  129 caaagggttg 138  Q
    | ||||||||    
T  27427651 ccaagggttg 27427642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 563 - 775
Target Start/End: Original strand, 25483626 - 25483838
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| | || |||||||| |||  ||||| | ||   ||||| | || |||||||||||||||||    
T  25483626 acatgaatagatatgaacacaagtttattgagaagatagtccaatacatctccaacaatatcaatcatgattttttaaacgtagccaaataccctgttgg 25483725  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||||||||    | || ||||||||||||  |||||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25483726 attacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggaggcatgggtaaa 25483825  T
Q  763 tcaacacttgcaa 775  Q
    |||||||||||||    
T  25483826 tcaacacttgcaa 25483838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Original strand, 26623048 - 26623191
Alignment:
Q  59 ttttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttct 158  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||  | ||||    
T  26623048 ttttctcccaactatgcatattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttgcccgtcttct 26623147  T
Q  159 atcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttat 202  Q
    ||   |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26623148 atggcgtggatcctactcacatacggcatcaaactgggagttat 26623191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Original strand, 26729026 - 26729169
Alignment:
Q  59 ttttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttct 158  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||  | ||||    
T  26729026 ttttctcccaactatgcatattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttgcccgtcttct 26729125  T
Q  159 atcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttat 202  Q
    ||   |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26729126 atggcgtggatcctactcacatacggcatcaaactgggagttat 26729169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 563 - 772
Target Start/End: Original strand, 28781668 - 28781877
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  28781668 acatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcacttacatgttgccaattaccctgttgg 28781767  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||| |   ||| ||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28781768 attacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtcaggatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 28781867  T
Q  763 tcaacacttg 772  Q
    ||||||||||    
T  28781868 tcaacacttg 28781877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 587 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 25492910 - 25492722
Alignment:
Q  587 ttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagt 686  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| || |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||| ||    
T  25492910 ttattgagaatatagtcgaagacatctcggataggatcaatcgtgtttcattacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgt 25492811  T
Q  687 gaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    |||||  ||||| |||  || |  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25492810 gaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggactttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaa 25492722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 27678971 - 27679095
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27678971 catcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 27679070  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27679071 cattcactgctacaagacaaagggt 27679095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27698656 - 27698532
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || |||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698656 catcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctctcaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 27698557  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
T  27698556 aattcactgctacgagacaaagggt 27698532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Original strand, 28149963 - 28150110
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28149963 catcactc-tcaaggccattgaagagtccaggattttcattccaatcttctctatcaactatacttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 28150061  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctat 160  Q
     |||||||||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  28150062 tattcactgcttcaaggcaaagggttgcttagttctgcctattttctat 28150110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 621 - 775
Target Start/End: Original strand, 26824444 - 26824598
Alignment:
Q  621 gatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtg 720  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||  | |  ||||||||||    
T  26824444 gatcaatcgtgttagtttacatgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtg 26824543  T
Q  721 gtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26824544 gtccatatggtaggactttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaa 26824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27718541 - 27718237
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27718541 catcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacat 27718442  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agca 210  Q
     |||||||||||||||||||||||| |    ||||||||| ||||||     ||||| |||| | || | ||||||||||  || |||||| ||| ||||    
T  27718441 aattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagca 27718342  T
Q  211 tcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggc 310  Q
    | |  || |||||||| | | ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||| | | ||||| |||||||| |||    
T  27718341 t-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggc 27718243  T
Q  311 taccat 316  Q
    ||||||    
T  27718242 taccat 27718237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 563 - 775
Target Start/End: Original strand, 26884637 - 26884849
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| | | | |||| | |||| ||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26884637 acatgaatagatacgaatacgagtttatcgggaagatagtcgaagatatctccgacaaaatcaatcgtgttgttttacatgtagccaaataccctgttgg 26884736  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||||||||   |||||||||| | ||||  |||||||||| || |  | | || | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26884737 attacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaa 26884836  T
Q  763 tcaacacttgcaa 775  Q
    |||||||||||||    
T  26884837 tcaacacttgcaa 26884849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27611164 - 27611040
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27611164 catcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacat 27611065  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27611064 aattcactgctacaagacaaagggt 27611040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27677776 - 27677652
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| || ||| |  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677776 catcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattgctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 27677677  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27677676 cattcactgctacaagacaaagggt 27677652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27706564 - 27706440
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| || |||||  | ||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706564 catcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcacctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 27706465  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27706464 cattcactgctacaagacaaagggt 27706440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 563 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27718114 - 27717902
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  || |||| |||| |||||||| ||| || ||  |||  |   |||||||||||||| |||||||||||    
T  27718114 acatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttgg 27718015  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||    ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  27718014 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaa 27717915  T
Q  763 tcaacacttgcaa 775  Q
    |||||||||||||    
T  27717914 tcaacacttgcaa 27717902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 564 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27610734 - 27610523
Alignment:
Q  564 catgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgga 663  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||  |||  |   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27610734 catgaatagatatgaatacgagtttactggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttgga 27610635  T
Q  664 ttacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaat 763  Q
    || |||| | |||||||| |||||||||  |||||||||    ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  27610634 ttgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaat 27610535  T
Q  764 caacacttgcaa 775  Q
    ||||||||||||    
T  27610534 caacacttgcaa 27610523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Original strand, 28139580 - 28139743
Alignment:
Q  26 gccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctaca 125  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| ||  | |||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28139580 gccattgaagaatctaggattttcatccctgtgttttccatcaactatgcctcttcttcgttttgcttggacgaacttgtccacatcattgactgcttca 28139679  T
Q  126 agacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatca 189  Q
    | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  28139680 acacaaagggatgtttggttttgcctgttttctatggtgtggatccttctcacattcgacatca 28139743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 563 - 775
Target Start/End: Original strand, 26056489 - 26056701
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||| | ||| ||||||| ||| |||||| | |||  ||||| | || |||||||||||||||||    
T  26056489 acatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttgg 26056588  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| ||||    | || ||||||||||||  |||||||| |||||   |||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  26056589 attgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggaggcatgggtaaa 26056688  T
Q  763 tcaacacttgcaa 775  Q
    |||||||||||||    
T  26056689 tcaacacttgcaa 26056701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 563 - 775
Target Start/End: Original strand, 26076459 - 26076671
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||| | ||| ||||||| ||| |||||| | |||  ||||| | || |||||||||||||||||    
T  26076459 acatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttgg 26076558  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| ||||    | || ||||||||||||  |||||||| |||||   |||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  26076559 attgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggaggcatgggtaaa 26076658  T
Q  763 tcaacacttgcaa 775  Q
    |||||||||||||    
T  26076659 tcaacacttgcaa 26076671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Original strand, 26623838 - 26624054
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||| |||||||||||  |  |||||||  | |||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26623838 acatgaacagatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttgg 26623937  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||  |||  |||||||| |||||  ||||| ||| | ||||| | ||||||| | || |||    
T  26623938 attacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaa 26624037  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    |||||||||||||||||    
T  26624038 tcaacacttgcaagagc 26624054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Original strand, 26729815 - 26730031
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||| |||||||||||  |  |||||||  | |||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26729815 acatgaacagatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttgg 26729914  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||  |||  |||||||| |||||  ||||| ||| | ||||| | ||||||| | || |||    
T  26729915 attacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaa 26730014  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    |||||||||||||||||    
T  26730015 tcaacacttgcaagagc 26730031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 563 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27530916 - 27530704
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||   | |||| | ||||||| ||| ||||||| |  ||||     ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27530916 acatgaatagatatgaatacgagtttattggaaagatagtcgaagacatttccaacaggattagtcgtgagcccttagatgttgccaaatatcctgttgg 27530817  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||||||||    ||||||||| |||||| | | |||||||     |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530816 attacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 27530717  T
Q  763 tcaacacttgcaa 775  Q
    |||||||||||||    
T  27530716 tcaacacttgcaa 27530704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27593182 - 27593022
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27593182 catcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgaccacat 27593083  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcct 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  27593082 cattcattgctacaagacaaagggtcgccctgttttgcctgttttctttggtgtggatcct 27593022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27725007 - 27724883
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27725007 catcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctattcttcgttttgtttggacgaacttgtccacat 27724908  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27724907 aattcactgctacaagacaaagggt 27724883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 775
Target Start/End: Original strand, 26862153 - 26862359
Alignment:
Q  566 tgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggatt 665  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| | | |||| || ||||||||  |||| || | |||||||   ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  26862153 tgaatagatatgaatatgagtttattgggaagatagtcagagacatcttggacaagaccgaacgtgt---tttgcacgtagccaaataccctgttggatt 26862249  T
Q  666 acagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatca 765  Q
    | |||    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26862250 aaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggtactggaggcatggggaaatca 26862349  T
Q  766 acacttgcaa 775  Q
    ||||||||||    
T  26862350 acacttgcaa 26862359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27531345 - 27531215
Alignment:
Q  26 gccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctaca 125  Q
    ||||||||| |||| | ||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||     
T  27531345 gccattgaaaaatctaggatttttattcccgtattttctgaaaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcactcattgctacg 27531246  T
Q  126 agacaaagggttgttcggttttgcctatttt 156  Q
    | ||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  27531245 atacaaagggttgtcttgttttgcctgtttt 27531215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 562 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 27706020 - 27705803
Alignment:
Q  562 cacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  ||||||||||    
T  27706020 cacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacatcccttacatgttgccacttaccctgttg 27705921  T
Q  662 gattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaa 761  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| | ||||||| | |||||    
T  27705920 gattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggaggcttgggtaa 27705821  T
Q  762 atcaacacttgcaagagc 779  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27705820 atcaacacttgcaagagc 27705803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 27427227 - 27427011
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  |||||||||||    
T  27427227 acatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttgg 27427128  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||    
T  27427127 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaa 27427028  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    |||||||||||||||||    
T  27427027 tcaacacttgcaagagc 27427011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Original strand, 28181135 - 28181254
Alignment:
Q  8 acatcatcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtcc 107  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| || | ||| ||||||||| | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28181135 acatcatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtcc 28181234  T
Q  108 acatcattcactgctacaag 127  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28181235 acatcattcactgcttcaag 28181254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 102
Target Start/End: Original strand, 27229257 - 27229347
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaact 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27229257 catcactcgtcaaggccattgacgaatctcggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttgaacgaact 27229347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 413 - 474
Target Start/End: Original strand, 26656415 - 26656476
Alignment:
Q  413 atcttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatataaacaagtataagttatttatatgt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26656415 atcttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatttaaacaagtataagttatttatatgt 26656476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 413 - 474
Target Start/End: Original strand, 26762386 - 26762447
Alignment:
Q  413 atcttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatataaacaagtataagttatttatatgt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26762386 atcttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatttaaacaagtataagttatttatatgt 26762447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 570 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 27698194 - 27697985
Alignment:
Q  570 tagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacag 669  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27698194 tagatatgaatacaagtttattgaagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacag 27698095  T
Q  670 tataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacac 769  Q
    | | ||||||||  ||||||||   |||||||||  |||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  27698094 tctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacac 27697995  T
Q  770 ttgcaagagc 779  Q
    ||||||||||    
T  27697994 ttgcaagagc 27697985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Original strand, 26803013 - 26803229
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||| |||      ||||||||||| || |||||||||||    
T  26803013 acatgaatagatatgaatacaagttgattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtcagcccttacatgttgctaattaccctgttgg 26803112  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| || | |  ||||||| |||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||||||    
T  26803113 attgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaa 26803212  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26803213 tcagcacttgcaagagc 26803229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 563 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27604319 - 27604107
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||  ||||| |||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| || ||| ||||    
T  27604319 acatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctattgg 27604220  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||    ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  27604219 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaa 27604120  T
Q  763 tcaacacttgcaa 775  Q
    |||||||||||||    
T  27604119 tcaacacttgcaa 27604107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Original strand, 31285126 - 31285342
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||| |||||||||||  |  ||||||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31285126 acatgaacagatatgaatatgattttattggagacatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgccaattaccctgttgg 31285225  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||  ||| |  | |||||||||||||||  |||||||||| || || | || | | ||| | |||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||    
T  31285226 atttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaa 31285325  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    |||||||||||||||||    
T  31285326 tcaacacttgcaagagc 31285342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Original strand, 26937174 - 26937309
Alignment:
Q  67 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 166  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||  |    ||||||||||||||||| | |||    
T  26937174 caactatgccacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcgttgactgcttcaagacaaaaggtcatctaattttgcctattttctatgaagtg 26937273  T
Q  167 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttat 202  Q
    ||||||  |||| | ||||| || ||||||||||||    
T  26937274 gatccttctcacgttcgacaccaaactgggagttat 26937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Original strand, 28185387 - 28185506
Alignment:
Q  8 acatcatcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtcc 107  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| || | ||| ||||||||| | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28185387 acatcatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtcc 28185486  T
Q  108 acatcattcactgctacaag 127  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  28185487 acatcattaactgcttcaag 28185506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 26802467 - 26802771
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||  | ||||||  ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  26802467 catcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 26802566  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agca 210  Q
     ||||| ||||| |||||||||||| |    || ||||||||||||| |  ||||||||||| | |  | || ||||| ||  | || ||| ||| ||||    
T  26802567 tattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctattttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagca 26802666  T
Q  211 tcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggc 310  Q
    | |  || |||||||| | | ||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| | | ||||| |||||||| |||    
T  26802667 t-tggctgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggc 26802765  T
Q  311 taccat 316  Q
    ||||||    
T  26802766 taccat 26802771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26342087 - 26341975
Alignment:
Q  21 tcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 120  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26342087 tcaaagccattgaagagtccaggattttcattccaattttctcaatcaactatgcttcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattg 26341988  T
Q  121 ctacaagacaaag 133  Q
    || |||| |||||    
T  26341987 cttcaaggcaaag 26341975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 775
Target Start/End: Original strand, 27215027 - 27215231
Alignment:
Q  571 agatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagt 670  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||   ||||||||||  ||| ||  || ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  27215027 agatatgaatacaagtttattgagaagatagttgaagacatctcaaacaagacgaatcgtgattttttacatgttgccaaacaccctgttggattacata 27215126  T
Q  671 ataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacact 770  Q
       || |||||||||| ||||  |||||||| | ||||  | | || | ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  27215127 cccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggacttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacact 27215226  T
Q  771 tgcaa 775  Q
    |||||    
T  27215227 tgcaa 27215231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Original strand, 28242829 - 28242945
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| ||||||||  | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28242829 catcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 28242928  T
Q  112 cattcactgctacaaga 128  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28242929 cattcactgctgcaaga 28242945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 28781164 - 28781475
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || |||||  | ||||||  |||||||||  ||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28781164 catcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 28781263  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga-gca 210  Q
     ||||| |||||||||||||| ||| |    ||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |  | |||||||| || ||   |||| |||| |||    
T  28781264 tattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtccttatggtgaagca 28781363  T
Q  211 tcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggc 310  Q
    | |  ||   |||||| | | ||| |||||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  28781364 t-tggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggc 28781462  T
Q  311 taccattgtagtc 323  Q
    ||||||| |||||    
T  28781463 taccattctagtc 28781475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27604858 - 27604743
Alignment:
Q  21 tcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||  | ||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  27604858 tcaaggccattgatgaatccaggatttttattcctgtgttttctatcaaatatgcctcttcttccttttgtttggatgaacttgttcacatcattcattg 27604759  T
Q  121 ctacaagacaaagggt 136  Q
    ||||| ||||||||||    
T  27604758 ctacacgacaaagggt 27604743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 562 - 777
Target Start/End: Original strand, 27679516 - 27679731
Alignment:
Q  562 cacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  ||||||||||    
T  27679516 cacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttacatgttgccacttaccctgttg 27679615  T
Q  662 gattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaa 761  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||   ||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||  | || ||    
T  27679616 gattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggaggtttggggaa 27679715  T
Q  762 atcaacacttgcaaga 777  Q
    ||||||||||||||||    
T  27679716 atcaacacttgcaaga 27679731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Original strand, 28226971 - 28227090
Alignment:
Q  8 acatcatcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtcc 107  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||  | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28226971 acatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtcc 28227070  T
Q  108 acatcattcactgctacaag 127  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  28227071 acatcattcattgcttcaag 28227090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Original strand, 31284313 - 31284420
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| || | ||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31284313 catcactcgacaatgccattgaagagtctaggatttttatccccgtgttttctgccaactatgcctcttcgtcgttttgtttggacgaacttgtccacat 31284412  T
Q  112 cattcact 119  Q
    ||||||||    
T  31284413 cattcact 31284420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28098475 - 28098291
Alignment:
Q  68 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctac-aagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 166  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |  ||||| |||||||| | | | |||    
T  28098475 aactatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcaccgttacgaaga-aaagggttgcttcgtttttcctattttttgtgacgtg 28098377  T
Q  167 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaa 252  Q
    || |||  |||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  28098376 gaaccttctcacgtgcgacatcagacggggagttatggtgaagcat-tagctaagcatgaagagaggttccaaaataacaaagaaaa 28098291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 28786303 - 28786614
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || |||||  | ||||||  |||||| ||  | ||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28786303 catcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 28786402  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga-gca 210  Q
     ||||| |||||||||||||| ||| |    ||||||||| |||||| |  ||| ||||||| | |  | |||||||| || ||  ||||| |||| |||    
T  28786403 tattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtcgatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagca 28786502  T
Q  211 tcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggc 310  Q
    | |  ||  ||||||| | | ||| |||||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  28786503 t-tggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggc 28786601  T
Q  311 taccattgtagtc 323  Q
    ||||||| |||||    
T  28786602 taccattctagtc 28786614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 28792424 - 28792735
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || |||||  | ||||||  |||||| ||  | ||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28792424 catcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 28792523  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga-gca 210  Q
     ||||| |||||||||||||| ||| |    ||||||||| |||||| |  ||| ||||||| | |  | |||||||| || ||  ||||| |||| |||    
T  28792524 tattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtcgatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagca 28792623  T
Q  211 tcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggc 310  Q
    | |  ||  ||||||| | | ||| |||||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  28792624 t-tggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggc 28792722  T
Q  311 taccattgtagtc 323  Q
    ||||||| |||||    
T  28792723 taccattctagtc 28792735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 317
Target Start/End: Original strand, 26949745 - 26949991
Alignment:
Q  71 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||| ||| |    ||| ||||  |||||||| |||| || |    
T  26949745 tatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccatatcattcactacttcaaggaaaaaggtcgccttgttctgccagttttctatgatgtagaac 26949844  T
Q  171 ctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagc 269  Q
    ||  |||| | |||||||||| |   |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||  |||||||| || |||||  |     
T  26949845 cttctcacgtgcgacatcagaattatagttatggtgaagca-cttgctaagcatgaagagaggttccaaaagagcaaaaaaaacatggagcggttgctga 26949943  T
Q  270 aatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccatt 317  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  26949944 aatggaagatagctctgaacaaagttgctgacttatctggctaccatt 26949991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 323
Target Start/End: Original strand, 27214649 - 27214756
Alignment:
Q  216 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 315  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  27214649 ctaagcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaacttatctggctatca 27214748  T
Q  316 ttgtagtc 323  Q
    || |||||    
T  27214749 ttatagtc 27214756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27234579 - 27234472
Alignment:
Q  216 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 315  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  27234579 ctaagcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaacttatctggctatca 27234480  T
Q  316 ttgtagtc 323  Q
    || |||||    
T  27234479 ttatagtc 27234472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 198
Target Start/End: Original strand, 2184980 - 2185109
Alignment:
Q  69 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtgga 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||  |  ||||| ||||  |||||| | |  | ||    
T  2184980 actatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccatatcattcgttgctccaagtcaaagggacgcccggttctgccagttttctgtaacataga 2185079  T
Q  169 tcctaatcacatacgacatcagactgggag 198  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2185080 tcctaatcatgtacgaaatcagactgggag 2185109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28297821 - 28297760
Alignment:
Q  66 ccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 127  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28297821 ccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaag 28297760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Original strand, 28514252 - 28514313
Alignment:
Q  66 ccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 127  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28514252 ccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaag 28514313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 116
Target Start/End: Original strand, 2184369 - 2184417
Alignment:
Q  68 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2184369 aactatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattc 2184417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 26861642 - 26861750
Alignment:
Q  13 atcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatc 112  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || |  || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26861642 atcactcgacaatgccattgaagagtctagaattttcattcctgtgttttctgccaactatgcctcttcgtcattttgtttggatgaacttgtccaaatc 26861741  T
Q  113 attcactgc 121  Q
    ||| |||||    
T  26861742 attaactgc 26861750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 117
Target Start/End: Original strand, 26975134 - 26975182
Alignment:
Q  69 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattca 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975134 actatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattca 26975182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27592637 - 27592426
Alignment:
Q  562 cacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       ||| |||||||||  ||||||||||    
T  27592637 cacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaaatgttgccacttaccctgttg 27592538  T
Q  662 gattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaa 761  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||   |||  |||| ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| | || ||    
T  27592537 gattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaa 27592438  T
Q  762 atcaacacttgc 773  Q
    ||||||||||||    
T  27592437 atcaacacttgc 27592426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27677236 - 27677025
Alignment:
Q  562 cacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  |    |   |||||||||||||  ||||||||||    
T  27677236 cacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcaacaacccttacatgttgccacttaccctgttg 27677137  T
Q  662 gattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaa 761  Q
    |||| |||| |  |||||||||| ||||||  |||||||||   |||  |||| ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| | || ||    
T  27677136 gattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaa 27677037  T
Q  762 atcaacacttgc 773  Q
    ||||||||||||    
T  27677036 atcaacacttgc 27677025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Original strand, 28234589 - 28234692
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| ||||||||  | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28234589 catcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 28234688  T
Q  112 catt 115  Q
    ||||    
T  28234689 catt 28234692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 119
Target Start/End: Original strand, 25071741 - 25071791
Alignment:
Q  69 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcact 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25071741 actatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattcact 25071791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 28325515 - 28325616
Alignment:
Q  21 tcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 120  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||||||| || || |||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28325515 tcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctattttgtctatcaattatgcttcttcttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactg 28325614  T
Q  121 ct 122  Q
    ||    
T  28325615 ct 28325616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Original strand, 26848741 - 26848809
Alignment:
Q  68 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  26848741 aactatgccacttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctccaaggaaaagggt 26848809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 670
Target Start/End: Original strand, 25511505 - 25511612
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| ||| |||||| | |||  ||||  | || |||||||||||||||||    
T  25511505 acatgaatagatctgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcatgtttttttgaacgtagccaaataccctgttgg 25511604  T
Q  663 attacagt 670  Q
    ||| ||||    
T  25511605 attgcagt 25511612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Original strand, 27214498 - 27214557
Alignment:
Q  68 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 127  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27214498 aactatgctacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcactcattgctccaag 27214557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27234730 - 27234671
Alignment:
Q  68 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 127  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27234730 aactatgctacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcactcattgctccaag 27234671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 285
Target Start/End: Original strand, 28234806 - 28234861
Alignment:
Q  230 aagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  28234806 aagttccaaaataacaaggataacatggagaggttgcagaaatggaagatggctct 28234861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 29826183 - 29826242
Alignment:
Q  143 gttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttat 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||    
T  29826183 gttttgcctattttctatgatgtggatccttctcatgtgcgacatcagactgggagttat 29826242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 26617858 - 26617920
Alignment:
Q  223 tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 285  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||    
T  26617858 tgaagaaaggttccaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctct 26617920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 26723786 - 26723848
Alignment:
Q  223 tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 285  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||    
T  26723786 tgaagaaaggttccaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctct 26723848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27665223 - 27665169
Alignment:
Q  68 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 122  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27665223 aactatgctacttcttcattttgtttagatgaacttgtccacatcattcattgct 27665169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 317
Target Start/End: Original strand, 26635919 - 26636020
Alignment:
Q  216 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 315  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||||  ||||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26635919 ctaagcatgaagatcagtttcaaaatagcaaggaaaacatggagtggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccacca 26636018  T
Q  316 tt 317  Q
    ||    
T  26636019 tt 26636020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 317
Target Start/End: Original strand, 26741885 - 26741986
Alignment:
Q  216 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 315  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||||  ||||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26741885 ctaagcatgaagatcagtttcaaaatagcaaggaaaacatggagtggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccacca 26741984  T
Q  316 tt 317  Q
    ||    
T  26741985 tt 26741986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 317
Target Start/End: Original strand, 26959395 - 26959496
Alignment:
Q  216 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 315  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||||  ||||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26959395 ctaagcatgaagagcagtttcaaaatagcaaggaaaacatggagcggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccacca 26959494  T
Q  316 tt 317  Q
    ||    
T  26959495 tt 26959496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27337828 - 27337783
Alignment:
Q  415 cttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatataaacaagtata 460  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27337828 cttaaaaaggaagcatgttttttatttatgtttttaaacaagtata 27337783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27398568 - 27398523
Alignment:
Q  415 cttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatataaacaagtata 460  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27398568 cttaaaaaggaagcatgttttttatttatgtttttaaacaagtata 27398523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 122
Target Start/End: Original strand, 26635774 - 26635825
Alignment:
Q  71 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 122  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26635774 tatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcattgct 26635825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 122
Target Start/End: Original strand, 26741740 - 26741791
Alignment:
Q  71 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 122  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26741740 tatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcattgct 26741791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 335
Target Start/End: Original strand, 26861842 - 26861961
Alignment:
Q  216 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 315  Q
    ||||||||||| | | ||| |||||| | | ||| |||||| |||||||| ||  ||||||  | ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  26861842 ctaagcatgaaaaaaggtttcaaaatgatatggataacatggagaggttgcagagatggaaagttgctctgaaccaagctgctaacttgtcaggctacca 26861941  T
Q  316 ttgtagtcaagggtacccca 335  Q
    || |||||  ||||||||||    
T  26861942 ttttagtcctgggtacccca 26861961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 317
Target Start/End: Original strand, 28185609 - 28185696
Alignment:
Q  230 aagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccatt 317  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||  || |||| ||||| |||||| ||||||    
T  28185609 aagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatt 28185696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28297657 - 28297570
Alignment:
Q  230 aagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccatt 317  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||  || |||| ||||| |||||| ||||||    
T  28297657 aagttccaaaataacaagaataacatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatt 28297570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 317
Target Start/End: Original strand, 28514416 - 28514503
Alignment:
Q  230 aagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccatt 317  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||  || |||| ||||| |||||| ||||||    
T  28514416 aagttccaaaataacaagaataacatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatt 28514503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 26811745 - 26811807
Alignment:
Q  223 tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 285  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||||| |||||    
T  26811745 tgaagaaatgttccaaaataacaaggaaaacatggatcggttgcagaaatggaagatagctct 26811807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 117
Target Start/End: Original strand, 26959250 - 26959296
Alignment:
Q  71 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattca 117  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26959250 tatgcttcttcttcgttttatttggatgaacttgtccacatcattca 26959296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25506961 - 25506848
Alignment:
Q  197 agttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctg 296  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| | | | |||||||| || ||||| ||  || |||    
T  25506961 agttatggtgaagatctgactaagcatgaagagaagtttcaaaataataagaaaaacatggagagatcgcatcaatggaaaatagctctaacacaatctg 25506862  T
Q  297 ccaacttgtctggc 310  Q
    | ||| ||||||||    
T  25506861 ctaacctgtctggc 25506848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18731653 - 18731334
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| || | ||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731653 catcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 18731554  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||    
T  18731553 catgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtggatcctagtcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaacat 18731454  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    || ||||||||  || | |  ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  18731453 ctcactaagcacaaaaagagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggct 18731354  T
Q  312 accattgtagtcaagggtac 331  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  18731353 accattttagtcatgggtac 18731334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18655626 - 18655315
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    ||||||||  ||| |||||| |||| || | |||||| |||||  | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18655626 catcactcgacaatgccattcaagagtctaggatctttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccgcat 18655527  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||    
T  18655526 cattcactgctacaagacaaagggtcgtctcgtttttcctgttttctatggcgtggatcctactcacatacgacatcaaactggaagttatggtgaacat 18655427  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    || ||||||||   | | || ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  18655426 ctcactaagcacagaaagaatttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggct 18655327  T
Q  312 accattgtagtc 323  Q
    |||||| |||||    
T  18655326 accattctagtc 18655315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18724234 - 18723923
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| || | ||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18724234 catcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttgaacgaacttgtccacat 18724135  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |||| |||    
T  18724134 catgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtggatcctagtcacatacgacaccaaagtgggagttatggtgaacat 18724035  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    || ||||||||  ||   |  ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  18724034 ctcactaagcacaaaatgagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggct 18723935  T
Q  312 accattgtagtc 323  Q
    |||||| |||||    
T  18723934 accattttagtc 18723923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18699549 - 18699239
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| || | ||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18699549 catcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacat 18699450  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||    
T  18699449 cattcactgctacaagacaaaaggtcgtctcgttttgcctgttttctatggcgtagatcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaacat 18699350  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    || |||||||| | | | |  ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  18699349 ctcactaagcacggaaagagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggct 18699250  T
Q  312 accattgtagt 322  Q
    |||||| ||||    
T  18699249 accattttagt 18699239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18679716 - 18679405
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| || | ||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679716 catcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 18679617  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||| | ||| |||||| |||| |||    
T  18679616 cattcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatgtcgtggatcctactcacatatgacatcaaagtggtagttatggtgaacat 18679517  T
Q  212 cttactaagca-tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggc 310  Q
    || ||||| || |||| | |  ||||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  18679516 ctcactaatcactgaa-agagtttccaaaataacaataaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggc 18679418  T
Q  311 taccattgtagtc 323  Q
    ||||||| |||||    
T  18679417 taccattttagtc 18679405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 18073804 - 18073913
Alignment:
Q  29 attgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaaga 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18073804 attgaagaatccaggattttgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaa 18073903  T
Q  129 caaagggttg 138  Q
    | ||||||||    
T  18073904 ccaagggttg 18073913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 563 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 18699011 - 18698801
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  18699011 acatgaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 18698912  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| |||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||  |||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  18698911 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgttaggactttatggcattggaggcatgggtaaa 18698812  T
Q  763 tcaacacttgc 773  Q
    |||||||||||    
T  18698811 tcaacacttgc 18698801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17989185 - 17989088
Alignment:
Q  29 attgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaa 126  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17989185 attgaagaatccaggattttgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaa 17989088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Original strand, 18074328 - 18074544
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  |||||||||||    
T  18074328 acatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttgg 18074427  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||    
T  18074428 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaa 18074527  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    |||||||||||||||||    
T  18074528 tcaacacttgcaagagc 18074544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 637 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 18679097 - 18678959
Alignment:
Q  637 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggac 736  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||    ||  | ||||||  ||||||||||||||||    
T  18679097 ttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggtaggac 18678998  T
Q  737 tttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18678997 tttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaa 18678959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 637 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 18655014 - 18654876
Alignment:
Q  637 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggac 736  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||  |||  ||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  18655014 ttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggac 18654915  T
Q  737 tttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18654914 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaa 18654876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 637 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 18723622 - 18723484
Alignment:
Q  637 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggac 736  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||  |||  | ||| ||  ||||||||| ||||||    
T  18723622 ttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgataggac 18723523  T
Q  737 tttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 775  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18723522 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaa 18723484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 563 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 18731115 - 18730905
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||| |  ||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||  |||||||||||    
T  18731115 acatgaatagatatgaatacaagtttattgaaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgg 18731016  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
     || |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||  |||  | ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  18731015 gttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaa 18730916  T
Q  763 tcaacacttgc 773  Q
    |||||||||||    
T  18730915 tcaacacttgc 18730905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5091059 - 5090921
Alignment:
Q  69 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtgga 168  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||  ||| |||||   |||||||||||||||||||  ||||||    
T  5091059 actatgcttcttcttcgttttgtttagatgaacttgtccatattattcactgctccaaggaaaatggttgcctggttttgcctattttctatggtgtgga 5090960  T
Q  169 tcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga 207  Q
     |||  |||  | ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5090959 accttctcatgtgcgatatcagactggaagttatggtga 5090921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29273877 - 29273613
Alignment:
Q  67 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| | ||||||   |||    
T  29273877 caactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtctcattttgcctgtcttctatggcgtg 29273778  T
Q  167 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttgg 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| |  |||||||||| |||| |||||||| |  |||||     
T  29273777 gatcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaacatctcactaagtacgaagagagtttccaaaatagcaagaaaaacatggatcggttgc 29273678  T
Q  267 agcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtac 331  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29273677 atcaatggaagttggctctgacccaagcttctaacttgtctggctaccattctagtcatgggtac 29273613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 29273453 - 29273237
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  || |||| |||| |||||||| ||| |||||  || ||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29273453 acatgaatagatatgaatacaagtttatcggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttgg 29273354  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||  |||||||| | |||  ||||| ||| ||||||| | ||| ||| | ||||||    
T  29273353 attacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatgggattggtggcttgggtaaa 29273254  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    ||||| |||||||||||    
T  29273253 tcaacccttgcaagagc 29273237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 268506 - 268195
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| || | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268506 catcactcgacaatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 268407  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcat 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||||  | ||||||   |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||    
T  268406 cattcactgctacaagaaaaagggtcgtctcattttgcccgtcttctatggcgtggatcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaacat 268307  T
Q  212 cttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggct 311  Q
    || |||||||| ||||| |  |||||||||| |||| |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  268306 ctcactaagcacgaagagagtttccaaaatagcaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagcttctaacttgtctggct 268207  T
Q  312 accattgtagtc 323  Q
    |||||| |||||    
T  268206 accattctagtc 268195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28127817 - 28127507
Alignment:
Q  23 aaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 122  Q
    ||||||||||||||||| |  || || |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28127817 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtattttctaccaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtgcacatcattcactgct 28127718  T
Q  123 acaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagca 222  Q
    |||||||||||||| |    ||||||||| |||||| |   |||||||||| | |  | ||| |||| || ||||||||| ||||  | ||| |||||||    
T  28127717 acaagacaaagggtcgcctagttttgcctgttttctttggcgtggatcctactgatgtgcgatatcatacagggagttatggtgaagagcttgctaagca 28127618  T
Q  223 tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagt 322  Q
    || ||| | |||||||||||||||| |||||||| || | ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  28127617 tggagagaggttccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgcaccaatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagt 28127518  T
Q  323 caagggtaccc 333  Q
    | |||||||||    
T  28127517 ccagggtaccc 28127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 568 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 28127285 - 28127078
Alignment:
Q  568 aatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattac 667  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || | |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28127285 aatagatatgaatacaagtttattcagaagataatcaaagacatatccgacaggatcaatcgtgttttcttacatgttgccaaatatcctgttggattac 28127186  T
Q  668 agtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaac 767  Q
    || |  |||||||||||||||| |  ||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  28127185 aggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtattggaggcttgggtaaatcaac 28127086  T
Q  768 acttgcaa 775  Q
    ||||||||    
T  28127085 acttgcaa 28127078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 573 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 28163980 - 28163778
Alignment:
Q  573 atatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtat 672  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |    
T  28163980 atatgaatacaagtttattcaggagataatcaaaggcacctccgacaggatcaatcgtgtttttttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatct 28163881  T
Q  673 aaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttg 772  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28163880 caagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttg 28163781  T
Q  773 caa 775  Q
    |||    
T  28163780 caa 28163778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28164456 - 28164192
Alignment:
Q  67 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||| |||||| |   |||    
T  28164456 caactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagttttgcctgttttct-tggcgtg 28164358  T
Q  167 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttgg 266  Q
    ||||||| | |  | |||||||| || ||||||||| |  |  |||||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||| || | |||     
T  28164357 gatcctactgatgtgcgacatcatacagggagttatggcaaagatcttactaagcatggtgagaggttccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgc 28164258  T
Q  267 agcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtacc 332  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  28164257 accaatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagtccagggtacc 28164192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 267955 - 267739
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||||     |||||||||||||| |||||||||||    
T  267955 acatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 267856  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||||||    
T  267855 attatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaa 267756  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    ||||| |||||||||||    
T  267755 tcaacccttgcaagagc 267739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 563 - 772
Target Start/End: Original strand, 8054 - 8263
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  8054 acatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 8153  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||   |||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8154 attacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 8253  T
Q  763 tcaacacttg 772  Q
    ||||||||||    
T  8254 tcaacacttg 8263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 7550 - 7869
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || |||||  | ||||||  |||||| ||  ||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  7550 catcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 7649  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga-gca 210  Q
     ||||| |||||||||||| | ||| |    ||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |  | |||||||| || ||  ||||| |||| |||    
T  7650 tattcattgctacaagacagaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagca 7749  T
Q  211 tcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggc 310  Q
    | |  ||   |||||| | | ||| |||||| | ||| | |||||| || | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  7750 t-tggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagcgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggc 7848  T
Q  311 taccattgtagtcaagggtac 331  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  7849 taccattctagtcatgggtac 7869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 563 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 13290 - 13081
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  13290 acatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 13191  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||   |||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13190 attacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 13091  T
Q  763 tcaacacttg 772  Q
    ||||||||||    
T  13090 tcaacacttg 13081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4775 - 4514
Alignment:
Q  70 ctatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggat 169  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    ||||||||| ||||||     |||||     
T  4775 ctatgccttttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaa 4676  T
Q  170 cctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggag 268  Q
    |||| | || | ||||||| ||  || |||||| ||| ||||| |  || |||||||| | | ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| |     
T  4675 cctactaacgtgcgacatctgaaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcat 4577  T
Q  269 caatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtac 331  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  4576 caatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcatgggtac 4514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 637 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 4253 - 4118
Alignment:
Q  637 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggac 736  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||   |||  |||| |||  | || |||||||||||    
T  4253 ttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggtaggac 4154  T
Q  737 tttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttg 772  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4153 tttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttg 4118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13794 - 13475
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || |||||  | ||||||  |||||| ||  ||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  13794 catcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 13695  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga-gca 210  Q
     ||||| |||||||||||||| ||| |    ||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |  | |||||||| || ||  ||||| |||| |||    
T  13694 tattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagca 13595  T
Q  211 tcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggc 310  Q
    | |  ||   |||||| | | ||| |||||| | ||| | |||||| || | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  13594 t-tggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagcgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggc 13496  T
Q  311 taccattgtagtcaagggtac 331  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  13495 taccattctagtcatgggtac 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 59612 - 59721
Alignment:
Q  29 attgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaaga 128  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  59612 attgaagaatccaggattttgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaa 59711  T
Q  129 caaagggttg 138  Q
    | ||||||||    
T  59712 ccaagggttg 59721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 563 - 779
Target Start/End: Original strand, 60136 - 60352
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  |||||||||||    
T  60136 acatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttgg 60235  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||    
T  60236 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaa 60335  T
Q  763 tcaacacttgcaagagc 779  Q
    |||||||||||||||||    
T  60336 tcaacacttgcaagagc 60352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3584 - 3459
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaac-tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccaca 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || |||||  | ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3584 catcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaacctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccaca 3485  T
Q  111 tcattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3484 tcattcactgctacaagacaaagggt 3459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 563 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 3154 - 2942
Alignment:
Q  563 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 662  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  || |||| |||| |||||||| ||| || ||  |||  |   |||||||||||||| |||||||||||    
T  3154 acatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttgg 3055  T
Q  663 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 762  Q
    | |  ||| |  |||||||||||||||||  |||||||||    ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  3054 aatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaa 2955  T
Q  763 tcaacacttgcaa 775  Q
    |||||||||||||    
T  2954 tcaacacttgcaa 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14517 - 14394
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || |||||  | ||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14517 catcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcct-ttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacat 14419  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggt 136  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14418 aattcactgctacaagacaaagggt 14394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 285
Target Start/End: Original strand, 34750 - 35023
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| ||||||||  | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34750 catcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 34849  T
Q  112 cattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgt-gagca 210  Q
    ||||||||||| ||||  ||  ||  ||   |||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||| | |||||||| |  || |||||| ||  ||||    
T  34850 cattcactgcttcaaggaaagcgggcgtctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacaagggcagttatggtaaagca 34949  T
Q  211 tcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 285  Q
     ||   | | |||  | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  34950 -ctggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggataacatggagaggttgcagaaatggaagatggctct 35023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Original strand, 42991 - 43107
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | ||| ||||||||  | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42991 catcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 43090  T
Q  112 cattcactgctacaaga 128  Q
    ||||||||||| |||||    
T  43091 cattcactgctgcaaga 43107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Original strand, 27469 - 27588
Alignment:
Q  8 acatcatcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtcc 107  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||  | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27469 acatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtcc 27568  T
Q  108 acatcattcactgctacaag 127  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  27569 acatcattcattgcttcaag 27588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 116830 - 116931
Alignment:
Q  21 tcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 120  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||||||| || || |||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  116830 tcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctattttgtctatcaattatgcttcttcttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactg 116929  T
Q  121 ct 122  Q
    ||    
T  116930 ct 116931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 58444 - 58334
Alignment:
Q  12 catcactcatcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 111  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| || | ||| ||||||||| | || |||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  58444 catcacttttcaaggccattaaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaactatgcttcttcttcattttgcttgaacgaacttgtccacat 58345  T
Q  112 cattcactgct 122  Q
    |||||||||||    
T  58344 cattcactgct 58334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 3279722 - 3279823
Alignment:
Q  21 tcaaggccattgaagaatccacgatcttcattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactg 120  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| || |||||  | || |||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3279722 tcaaggccatcgaagagtccatgatttttattccggtcttctctatcaactatgcttcttctatattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattg 3279821  T
Q  121 ct 122  Q
    ||    
T  3279822 ct 3279823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17993789 - 17993736
Alignment:
Q  69 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17993789 actatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattcaatgct 17993736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University