View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18556_high_6 (Length: 389)

Name: NF18556_high_6
Description: NF18556
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18556_high_6
NF18556_high_6
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (17-373)||(9301730-9302086)
chr5 (123-373)||(9373399-9373649)
chr5 (123-373)||(9305348-9305598)
chr5 (123-373)||(9351877-9352127)
chr5 (123-373)||(9332149-9332399)
chr5 (123-370)||(9297518-9297765)
chr5 (123-373)||(9292908-9293158)
chr5 (100-373)||(9356258-9356527)
chr5 (17-373)||(9367386-9367743)
chr5 (138-370)||(9309884-9310116)
chr5 (113-373)||(9348888-9349145)
chr5 (123-373)||(9288376-9288629)
chr5 (17-89)||(9332434-9332506)
chr5 (23-90)||(9293191-9293258)
chr5 (17-74)||(9352174-9352231)
chr5 (35-90)||(9297801-9297856)
chr5 (20-90)||(9305632-9305700)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (267-373)||(31476587-31476693)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9302086 - 9301730
Alignment:
Q  17 acctcttatataaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttcgagcttttcaactatcttagaaggnnnnnnntaacaaattaaaagagca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  9302086 acctcttatataaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttctagcttttcaactatcttagaagaaaaaaaagaacaaattaaaagagca 9301987  T
Q  117 gttaagatggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatca 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||| |    
T  9301986 gttaagatggcaagcaacaattaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatctcatccaaactccactagaattgaaaaagagctaaccaaaatga 9301887  T
Q  217 agacatgggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9301886 agacatgggaagccacatcaacatccacatctgattcaattacaaatggcctcttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaattt 9301787  T
Q  317 gacatcaacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9301786 gacatcaacacagaagcttgtttctcaccatcatggtgagaaatttgtggaagagtt 9301730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 123 - 373
Target Start/End: Original strand, 9373399 - 9373649
Alignment:
Q  123 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9373399 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatctcatcctaactccacaagaatagaacaagagctaaccaaaatcaagacat 9373498  T
Q  223 gggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9373499 gggaagccacatcaacatccacatctgattcaattaccaatggcctcttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 9373598  T
Q  323 aacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9373599 aacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 9373649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 123 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9305598 - 9305348
Alignment:
Q  123 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  9305598 atggcaagcaacaattaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatctcatcctaactccacaagaatagaacaagagctaaccaaaatgaagacat 9305499  T
Q  223 gggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9305498 gggaagccacatcaacatccacatctgattcaattaccaatggcctcttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 9305399  T
Q  323 aacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9305398 aacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 9305348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 123 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9352127 - 9351877
Alignment:
Q  123 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 222  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9352127 atggcaaacaccaagtatcatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatcccaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 9352028  T
Q  223 gggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  9352027 gggaagccacatcaacatccacatctgattcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatttccttggaagatcttctcaatatgtcatc 9351928  T
Q  323 aacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    |||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9351927 aacacaaaaggcctttgctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 9351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 123 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9332399 - 9332149
Alignment:
Q  123 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 222  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9332399 atggcaaacaccaagtatcatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatcccaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 9332300  T
Q  223 gggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 322  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  9332299 ggaaagccacatcaacatccacatctgattcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatttccttggaagatcttctcaatatgtcatc 9332200  T
Q  323 aacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    |||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9332199 aacacaaaaggcctttgctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 9332149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 123 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9297765 - 9297518
Alignment:
Q  123 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9297765 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatctcatcctaactccacaagaatagaacaagagctaaccaaaatcaagacat 9297666  T
Q  223 gggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  9297665 gggaagccacatcaacatccacatctgattcaattaccactggcctttcctttcttgaagatttgtatatttctttggaagatcttctcaacatgtcatc 9297566  T
Q  323 aacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaaga 370  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9297565 aacacaaaaggctatttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaaga 9297518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 123 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9293158 - 9292908
Alignment:
Q  123 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 222  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9293158 atggcaagcaacaattaccacgttcgctcaaacagttttccttctcaatctcatcctaactccacaagaatagaacaagagctaaccaaaatcaagacat 9293059  T
Q  223 gggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9293058 gggaagccacatcaacatccacatctgattcaattaccactggcctttcctttcttgaagatttgtatatttctttggaagatcttctcaatatgtcatc 9292959  T
Q  323 aacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9292958 aacacaaaaggctatttctcaccatcagggtgagaaatttgtggaagagtt 9292908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 373
Target Start/End: Original strand, 9356258 - 9356527
Alignment:
Q  100 aacaaattaaaagagcagttaagatggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaaca 199  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  9356258 aacaaattaaa-gagcaattaagatggcaagcaaa---taccatgttcgctcaaatagctttccttctcaatcccatccaagctccacaagaattgaaca 9356353  T
Q  200 agagctatgcaaaatcaagacatgggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttg 299  Q
    |||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9356354 agatttaagaaaaatgaagacatgggaagctacatcaacatccacatctgattcaattaccactggcctttcctttcttgaagatttgtatatttctttg 9356453  T
Q  300 gaagatcttctaaatatgacatcaacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9356454 gatgatcttctacatatgtcatcaacacaaaaggccgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 9356527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Original strand, 9367386 - 9367743
Alignment:
Q  17 acctcttatataaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttcgagcttttcaactatcttagaaggnnnnnnntaacaaatta------aa 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||         |||||| ||      ||    
T  9367386 acctcttatataaatagagagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttagagctttataattatcttagaagaaaaaaag-aacaaactataatttaa 9367484  T
Q  111 agagcagttaagatggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgca 210  Q
    |||| | |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||| ||||||||||||||  ||    
T  9367485 agagaaat----atggcaagcaacaattaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatctcatcctaatacctcaagattagaacaagagctaacca 9367580  T
Q  211 aaatcaagacatgggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttct 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9367581 aaattaagacatgggaagccacatcaacatcgacatctgattcaattaccaatggcctttcatttcttgaagatttgtatatttctttggaaaatcttct 9367680  T
Q  311 aaatatgacatcaacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
     |||||| |||||||||| |||    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9367681 caatatgtcatcaacacaaaaggccattgctcaccgtcaaggtgagaaatttgttgaagagtt 9367743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 138 - 370
Target Start/End: Original strand, 9309884 - 9310116
Alignment:
Q  138 taccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacatgggaagccacatcaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9309884 taccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatctcatccaagctccactagaattgaacaagagttaaccaaaatgaagacatgggaagccacatcaa 9309983  T
Q  238 catccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatcaacacagaagcttgt 337  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||  | |    
T  9309984 catccacatctgattcaattaccactggcctttcctttcttgaagatttgtatatttctttggaagatcttctcaacatgtcatcaacacaaaaggctat 9310083  T
Q  338 ttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaaga 370  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  9310084 ttctcaccatcatggcgagaaatttgtcgaaga 9310116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Original strand, 9348888 - 9349145
Alignment:
Q  113 agcagttaagatggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaa 212  Q
    |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||  ||||    
T  9348888 agcaattaagatggcaagcaaa---taccatgttcgctcaaatagttttccttctcaatctcatccaagctcctctagaattgaacaagagttaaccaaa 9348984  T
Q  213 atcaagacatgggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaa 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  9348985 atgaagacatgggaagccacatcaacatccacatctgagtcaattactaccggcctttcctttcttgaagatttgtatatatctttggaggattttctac 9349084  T
Q  313 atatgacatcaacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    ||||| |||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9349085 atatgtcatcaacacaaaaggccattgctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 9349145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 123 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9288629 - 9288376
Alignment:
Q  123 atggcaagcaacaagtaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatcacatccaaactccacaagaatagaacaagagctatgcaaaatcaagacat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||| ||   ||||| |||||||    
T  9288629 atggcaagcaacaattaccatgttcgctcaaacagttttccttctcaatctcatcctaacacctcaagaatagatcaagagttaacaaaaatgaagacat 9288530  T
Q  223 gggaagccacatcaacatccacatctgactcaattaccaatggccttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9288529 gggaagccacatcaacatccacatctcattcaattaccaatggcctttcatttcttgaagatttgtatatttctttggaagatcttctcaatatgtcatc 9288430  T
Q  323 aacacagaag---cttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtggaagagtt 373  Q
    |||||| |||    ||| |   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9288429 aacacaaaaggccattgctcaccaccatcgaggtgagaaatttgtcgaagagtt 9288376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9332506 - 9332434
Alignment:
Q  17 acctcttatataaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttcgagcttttcaactatcttagaa 89  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  9332506 acctcttatataaatagagcatcaagaacttggtaacatcacacaaacattgagctttacaattatcttagaa 9332434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9293258 - 9293191
Alignment:
Q  23 tatataaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttcgagcttttcaactatcttagaag 90  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  9293258 tatataaatagagagtcaagaacttggtaacatcacacaaacattaagctttacaattatcttagaag 9293191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9352231 - 9352174
Alignment:
Q  17 acctcttatataaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttcgagcttt 74  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9352231 acctcttatataaatagagattcaagaacttggtaacatcacacaaacattgagcttt 9352174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9297856 - 9297801
Alignment:
Q  35 gagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttcgagcttttcaactatcttagaag 90  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  9297856 gagtcaagcacttgttaacatcacacaaacattgagctttacaattatcttagaag 9297801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9305700 - 9305632
Alignment:
Q  20 tcttatataaatagggagtcaagaacttggtaacatcacacaaacttcgagcttttcaactatcttagaag 90  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  9305700 tcttatataaatag--agtcaagaccttggtaacataacacaaacatttagctttacaattatcttagaag 9305632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 373
Target Start/End: Original strand, 31476587 - 31476693
Alignment:
Q  267 cttttcttgcttgaagatttgtatatatctttggaagatcttctaaatatgacatcaacacagaagcttgtttctcaccatcaaggtgagaaatttgtgg 366  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||| ||||||| ||  |  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31476587 ctttccttgcttgaagatttgtatatgtcaatggaagatcttctcaacatggcatcaacccaacaagtgatttctcaccatcaaggtgaaaaatgtgtgg 31476686  T
Q  367 aagagtt 373  Q
    |||||||    
T  31476687 aagagtt 31476693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University