View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18556_low_3 (Length: 762)

Name: NF18556_low_3
Description: NF18556
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18556_low_3
NF18556_low_3
[»] chr6 (115 HSPs)
chr6 (17-318)||(26656036-26656337)
chr6 (17-318)||(26762007-26762308)
chr6 (24-318)||(27337904-27338198)
chr6 (24-318)||(27398644-27398938)
chr6 (17-306)||(25579766-25580055)
chr6 (25-306)||(26055981-26056262)
chr6 (25-306)||(26075951-26076232)
chr6 (17-306)||(26142912-26143201)
chr6 (17-306)||(25538587-25538876)
chr6 (495-756)||(26656481-26656742)
chr6 (495-756)||(26762452-26762713)
chr6 (17-210)||(26048892-26049085)
chr6 (17-210)||(26070061-26070254)
chr6 (17-318)||(26646526-26646827)
chr6 (17-318)||(26752494-26752795)
chr6 (17-306)||(25481789-25482078)
chr6 (433-758)||(25539002-25539322)
chr6 (433-758)||(26143327-26143647)
chr6 (550-758)||(25580293-25580501)
chr6 (24-315)||(26823894-26824185)
chr6 (546-755)||(28786805-28787014)
chr6 (546-756)||(26647046-26647256)
chr6 (546-756)||(26753014-26753224)
chr6 (528-758)||(27337498-27337728)
chr6 (528-758)||(27398238-27398468)
chr6 (24-185)||(26623030-26623191)
chr6 (24-185)||(26729008-26729169)
chr6 (546-755)||(28792926-28793135)
chr6 (17-121)||(27427642-27427746)
chr6 (546-758)||(25483626-25483838)
chr6 (17-119)||(26884210-26884314)
chr6 (546-755)||(28781668-28781877)
chr6 (570-758)||(25492722-25492910)
chr6 (24-119)||(27679000-27679095)
chr6 (604-758)||(26824444-26824598)
chr6 (18-119)||(27698532-27698633)
chr6 (546-758)||(26884637-26884849)
chr6 (19-139)||(27531215-27531335)
chr6 (546-758)||(27717902-27718114)
chr6 (547-758)||(27610523-27610734)
chr6 (24-119)||(27677652-27677747)
chr6 (24-119)||(27706440-27706535)
chr6 (18-299)||(27718237-27718518)
chr6 (50-172)||(28139621-28139743)
chr6 (18-119)||(27611040-27611141)
chr6 (546-758)||(26056489-26056701)
chr6 (546-758)||(26076459-26076671)
chr6 (546-762)||(26623838-26624054)
chr6 (546-762)||(26729815-26730031)
chr6 (546-758)||(27530704-27530916)
chr6 (549-758)||(26862153-26862359)
chr6 (24-155)||(27593022-27593153)
chr6 (21-143)||(28149988-28150110)
chr6 (545-762)||(27705803-27706020)
chr6 (18-119)||(27724883-27724984)
chr6 (546-762)||(27427011-27427227)
chr6 (396-457)||(26656415-26656476)
chr6 (396-457)||(26762386-26762447)
chr6 (553-762)||(27697985-27698194)
chr6 (546-762)||(26803013-26803229)
chr6 (25-85)||(27229287-27229347)
chr6 (546-758)||(27604107-27604319)
chr6 (546-762)||(31285126-31285342)
chr6 (50-185)||(26937174-26937309)
chr6 (24-102)||(31284342-31284420)
chr6 (18-119)||(27604743-27604844)
chr6 (554-758)||(27215027-27215231)
chr6 (545-760)||(27679516-27679731)
chr6 (51-235)||(28098291-28098475)
chr6 (17-306)||(28781186-28781475)
chr6 (21-116)||(26341975-26342070)
chr6 (54-300)||(26949745-26949991)
chr6 (199-306)||(27214649-27214756)
chr6 (199-306)||(27234472-27234579)
chr6 (68-306)||(28786376-28786614)
chr6 (68-306)||(28792497-28792735)
chr6 (24-110)||(28181168-28181254)
chr6 (24-110)||(28297760-28297846)
chr6 (24-110)||(28514227-28514313)
chr6 (52-181)||(2184980-2185109)
chr6 (54-111)||(28242888-28242945)
chr6 (51-99)||(2184369-2184417)
chr6 (52-100)||(26975134-26975182)
chr6 (17-299)||(26802489-26802771)
chr6 (545-756)||(27592426-27592637)
chr6 (545-756)||(27677025-27677236)
chr6 (52-102)||(25071741-25071791)
chr6 (42-104)||(26861688-26861750)
chr6 (24-110)||(28185420-28185506)
chr6 (17-110)||(28226997-28227090)
chr6 (51-119)||(26848741-26848809)
chr6 (546-653)||(25511505-25511612)
chr6 (51-110)||(27214498-27214557)
chr6 (51-110)||(27234671-27234730)
chr6 (213-268)||(28234806-28234861)
chr6 (54-98)||(28234648-28234692)
chr6 (126-185)||(29826183-29826242)
chr6 (206-268)||(26617858-26617920)
chr6 (206-268)||(26723786-26723848)
chr6 (51-105)||(27665169-27665223)
chr6 (199-300)||(26635919-26636020)
chr6 (199-300)||(26741885-26741986)
chr6 (199-300)||(26959395-26959496)
chr6 (398-443)||(27337783-27337828)
chr6 (398-443)||(27398523-27398568)
chr6 (24-105)||(28325535-28325616)
chr6 (54-105)||(26635774-26635825)
chr6 (54-105)||(26741740-26741791)
chr6 (199-318)||(26861842-26861961)
chr6 (213-300)||(28185609-28185696)
chr6 (213-300)||(28297570-28297657)
chr6 (213-300)||(28514416-28514503)
chr6 (206-268)||(26811745-26811807)
chr6 (54-100)||(26959250-26959296)
chr6 (180-293)||(25506848-25506961)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (50-314)||(18731334-18731598)
chr4 (24-306)||(18655315-18655597)
chr4 (50-306)||(18723923-18724179)
chr4 (50-305)||(18699239-18699494)
chr4 (50-306)||(18679405-18679661)
chr4 (17-121)||(18073809-18073913)
chr4 (17-109)||(17989088-17989180)
chr4 (546-756)||(18698801-18699011)
chr4 (546-762)||(18074328-18074544)
chr4 (620-758)||(18678959-18679097)
chr4 (620-758)||(18654876-18655014)
chr4 (620-758)||(18723484-18723622)
chr4 (546-756)||(18730905-18731115)
chr4 (52-190)||(5090921-5091059)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (27-314)||(29273613-29273900)
chr8 (546-762)||(29273237-29273453)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (24-306)||(268195-268477)
chr1 (17-316)||(28127507-28127806)
chr1 (551-758)||(28127078-28127285)
chr1 (556-758)||(28163778-28163980)
chr1 (50-315)||(28164192-28164456)
chr1 (546-762)||(267739-267955)
[»] scaffold0419 (3 HSPs)
scaffold0419 (546-755)||(8054-8263)
scaffold0419 (252-314)||(7807-7869)
scaffold0419 (17-113)||(7572-7668)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (546-755)||(13081-13290)
scaffold0277 (18-314)||(4514-4810)
scaffold0277 (620-755)||(4118-4253)
scaffold0277 (17-314)||(13475-13772)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (17-121)||(59617-59721)
scaffold0003 (546-762)||(60136-60352)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (18-119)||(3459-3561)
scaffold0349 (546-758)||(2942-3154)
scaffold0349 (18-119)||(14394-14494)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (54-268)||(34809-35023)
scaffold0038 (54-111)||(43050-43107)
scaffold0038 (17-110)||(27495-27588)
scaffold0038 (24-105)||(116850-116931)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (24-105)||(58334-58415)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (52-105)||(17993736-17993789)
chr2 (21-105)||(3279739-3279823)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 115)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 26656036 - 26656337
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26656036 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaag 26656135  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26656136 ggttgttcggttttgcctgttttctatggtgtggatcctactcacatacgacatcagactggaagttacggtgagcatcttactaagcatgaaaagaagt 26656235  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtaccc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656236 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtaccc 26656335  T
Q  317 ca 318  Q
    ||    
T  26656336 ca 26656337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 26762007 - 26762308
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26762007 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaag 26762106  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26762107 ggttgttcggttttgcctgttttctatggtgtggatcctactcacatacgacatcagactggaagttacggtgagcatcttactaagcatgaaaagaagt 26762206  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtaccc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762207 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtaccc 26762306  T
Q  317 ca 318  Q
    ||    
T  26762307 ca 26762308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27338198 - 27337904
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgtt 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27338198 aggattttgattcccatattttctgcaaactatgcatcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaggggttgtt 27338099  T
Q  124 cggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaa 223  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27338098 cggttttgcctgttttctatggtgcggatcctactcacgtacgacatcagactgggagttatggtgagcatcttactaagcatgaagataagttccaaaa 27337999  T
Q  224 taacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtacccca 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27337998 taacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctccggccaccattttagtcaagggtacccca 27337904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27398938 - 27398644
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgtt 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27398938 aggattttgattcccatattttctgcaaactatgcatcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaggggttgtt 27398839  T
Q  124 cggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaa 223  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27398838 cggttttgcctgttttctatggtgcggatcctactcacgtacgacatcagactgggagttatggtgagcatcttactaagcatgaagataagttccaaaa 27398739  T
Q  224 taacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtacccca 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27398738 taacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctccggccaccattttagtcaagggtacccca 27398644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 25579766 - 25580055
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579766 agaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 25579865  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
     |||| |  || |||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  25579866 agttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacatacgacatcagagtgggagttatggtgagtatcttactaagcatgaagagaggt 25579965  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    | ||||||||| || |||||||| || | |||   ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  25579966 ttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttacccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtc 25580055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Original strand, 26055981 - 26056262
Alignment:
Q  25 ggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |     
T  26055981 ggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaagagttgctt 26056080  T
Q  125 ggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaat 224  Q
     || |||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  26056081 agtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacatacgacatcagagtgggagttatggtgagcatcttactaagcataaagaggggttccaaaat 26056180  T
Q  225 aacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    ||| || |||||||| || | |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  26056181 aacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatggctcttactcaagctgctaacttgtccggctatcattatagtc 26056262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Original strand, 26075951 - 26076232
Alignment:
Q  25 ggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |     
T  26075951 ggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaagagttgctt 26076050  T
Q  125 ggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaat 224  Q
     || |||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  26076051 agtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacatacgacatcagagtgggagttatggtgagcatcttactaagcataaagaggggttccaaaat 26076150  T
Q  225 aacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    ||| || |||||||| || | |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  26076151 aacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatggctcttactcaagctgctaacttgtccggctatcattatagtc 26076232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 26142912 - 26143201
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26142912 agaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 26143011  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
     |||| |  || || ||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  26143012 agttgcttagtatttcccgttttctatgatgtggaacctactcacatacgaaatcagagtgggatttatggtgagcatcttactaagcatgaagagaggt 26143111  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    | ||||||||| || |||||||| || | |||   ||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  26143112 ttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttatccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtc 26143201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 25538587 - 25538876
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25538587 agaatctagaatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccagatcattcactgctacaagacaaag 25538686  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
     |||| |  || |||||  |||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  25538687 agttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcagttacgacatcagagtgggagttatggtgagcattttactaagcatgaagagaggt 25538786  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    | ||||||||  || |||||||| || | |||   ||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  25538787 ttcaaaataatgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatagctcttatccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtc 25538876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 495 - 756
Target Start/End: Original strand, 26656481 - 26656742
Alignment:
Q  495 acatggatgtgattgtaattaatgtagcatatgtactaatttatctgttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacat 594  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  26656481 acatgtatgtgattgtgattaatgtagtctgtgtactaacttatctcttgtacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacat 26656580  T
Q  595 ctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaat 694  Q
    |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |    
T  26656581 ctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatct 26656680  T
Q  695 gatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgc 756  Q
     | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26656681 aaggatgaggttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgc 26656742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 495 - 756
Target Start/End: Original strand, 26762452 - 26762713
Alignment:
Q  495 acatggatgtgattgtaattaatgtagcatatgtactaatttatctgttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacat 594  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  26762452 acatgtatgtgattgtgattaatgtagtctgtgtactaacttatctcttgtacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacat 26762551  T
Q  595 ctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaat 694  Q
    |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |    
T  26762552 ctccgacaagatcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatct 26762651  T
Q  695 gatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgc 756  Q
     | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26762652 aaggatgaggttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgc 26762713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 26048892 - 26049085
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26048892 agaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 26048991  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaag 210  Q
     |||| |  || |||||  |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26048992 agttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctactcacatacgacatcatagtggaagttatggtgagcatcttactaagcatgaag 26049085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 26070061 - 26070254
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070061 agaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 26070160  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaag 210  Q
     |||| |  || |||||  |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26070161 agttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctactcacatacgacatcatagtggaagttatggtgagcatcttactaagcatgaag 26070254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 26646526 - 26646827
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26646526 agaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaag 26646625  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
    ||| ||   ||||||||  ||||||||   |||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |  |    
T  26646626 ggtcgtctcgttttgcccgttttctatggcgtggatcctactcagatacggcatcaaagtgggagttatggtgaacatctcactaagcacgaagagagtt 26646725  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||| | |  | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||  ||||||||    
T  26646726 tccaaaataacaagaaaaacaaggaacgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggataccattatagtcctgggtaccc 26646825  T
Q  317 ca 318  Q
    ||    
T  26646826 ca 26646827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 26752494 - 26752795
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26752494 agaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaag 26752593  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
    ||| ||   ||||||||  ||||||||   |||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |  |    
T  26752594 ggtcgtctcgttttgcccgttttctatggcgtggatcctactcagatacggcatcaaagtgggagttatggtgaacatctcactaagcacgaagagagtt 26752693  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||| | |  | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||  ||||||||    
T  26752694 tccaaaataacaagaaaaacaaggaacgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggataccattatagtcctgggtaccc 26752793  T
Q  317 ca 318  Q
    ||    
T  26752794 ca 26752795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 25481789 - 25482078
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25481789 agaatctaggatttgtattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 25481888  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
     |||| |  || || ||  ||||||||  ||||||||||| | |  | |||| ||| ||  | |||||| ||||  |||| ||||||||||||||   ||    
T  25481889 agttgcttagtattacccgttttctatggtgtggatcctactgatgttcgacgtcatacatgtagttatggtgaatatctgactaagcatgaagaggggt 25481988  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  25481989 tccaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatggctcttactcaagctgctaatttgtccggctatcattatagtc 25482078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 433 - 758
Target Start/End: Original strand, 25539002 - 25539322
Alignment:
Q  433 aaacaagtataagttatttatatgtccaaactgctgttataattgtatattatattctcagtacatggatgtgattgtaattaatgtagcatatgtacta 532  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||      ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    |||  ||||| |||    
T  25539002 aaacaagtgtaagttatttatatgtcaaaaaaa---ttagaattgcataatatattctcaatacatggatgtgattttgattt---tagtttatgttcta 25539095  T
Q  533 atttatctg-ttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgcc 631  Q
    | ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| |||  ||||| | |||  ||||| |||| |||    
T  25539096 acttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgtttttttatatgtggcc 25539195  T
Q  632 aaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactg 731  Q
    ||||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||  ||||||||  ||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539196 aaataccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactg 25539295  T
Q  732 gaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25539296 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaa 25539322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 433 - 758
Target Start/End: Original strand, 26143327 - 26143647
Alignment:
Q  433 aaacaagtataagttatttatatgtccaaactgctgttataattgtatattatattctcagtacatggatgtgattgtaattaatgtagcatatgtacta 532  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  |   ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||    |||  ||| | |||    
T  26143327 aaacaagtgtaagttatttatatgtcaaaaaag---ttagaattgcataatatattctcaatacatggatgtgattttgattt---tagtgtattttcta 26143420  T
Q  533 atttatctg-ttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgcc 631  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| |||  ||||| | |||  ||||| |||| |||    
T  26143421 atttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgtttttttaaatgtagcc 26143520  T
Q  632 aaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactg 731  Q
    ||||||||||||||||||||||    | || || |||||||||  |||||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26143521 aaataccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactg 26143620  T
Q  732 gaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26143621 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaa 26143647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 550 - 758
Target Start/End: Original strand, 25580293 - 25580501
Alignment:
Q  550 gaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggatta 649  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| |||  ||||| | |||  ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  25580293 gaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttggatta 25580392  T
Q  650 cagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaa 749  Q
    ||||    | || ||||||||||||  |||||||| |||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25580393 cagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaa 25580492  T
Q  750 cacttgcaa 758  Q
    |||||||||    
T  25580493 cacttgcaa 25580501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Original strand, 26823894 - 26824185
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgtt 123  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||  |      
T  26823894 aggatttttattcctgtgttttctgccaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcgcgtctacaaggaaaaggggcgcc 26823993  T
Q  124 cggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaa 223  Q
      ||||||||| ||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| |||||||||||| | | ||||  |||    
T  26823994 tcgttttgcctgttttctatggtgtggatcctggtgacatacgacatcagcgtgggagttatgctatacatctcactaagcatgaaaagaggttcggaaa 26824093  T
Q  224 taacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtacc 315  Q
    |||||||||||||||| |||  |||   |||||||||| ||||||||   |||||||  ||||||||||||  |||| |||||  |||||||    
T  26824094 taacaaggaaaacatggagaaattgcttcaatggaagaaggctctgaaacaagctgctgacttgtctggctttcattttagtcttgggtacc 26824185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 546 - 755
Target Start/End: Original strand, 28786805 - 28787014
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  28786805 acatgaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 28786904  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||   |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28786905 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 28787004  T
Q  746 tcaacacttg 755  Q
    ||||||||||    
T  28787005 tcaacacttg 28787014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 546 - 756
Target Start/End: Original strand, 26647046 - 26647256
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26647046 acatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttgg 26647145  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||| |||    | || ||||||||||||  ||||||||||  | |  |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  26647146 attagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaa 26647245  T
Q  746 tcaacacttgc 756  Q
    |||||||||||    
T  26647246 tcaacacttgc 26647256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 546 - 756
Target Start/End: Original strand, 26753014 - 26753224
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26753014 acatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttgg 26753113  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||| |||    | || ||||||||||||  ||||||||||  | |  |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  26753114 attagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaa 26753213  T
Q  746 tcaacacttgc 756  Q
    |||||||||||    
T  26753214 tcaacacttgc 26753224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 528 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 27337728 - 27337498
Alignment:
Q  528 tactaatttatctgttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgt 627  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | || |||| ||||| |||||||| |||||  || |||| ||    
T  27337728 tactaacttatctattggacatgaatagatatgagtacgagcttattgagaatatagtcgaacacatttccgataggatcaatcgtgtttttctacacgt 27337629  T
Q  628 tgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||  |||||||||  || |  |||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  27337628 tgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggt 27337529  T
Q  728 actggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    ||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  27337528 actagaggcttgggaaaatcaacacttgcaa 27337498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 528 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 27398468 - 27398238
Alignment:
Q  528 tactaatttatctgttccacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgt 627  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | || |||| ||||| |||||||| |||||  || |||| ||    
T  27398468 tactaacttatctattggacatgaatagatatgagtacgagcttattgagaatatagtcgaacacatttccgataggatcaatcgtgtttttctacacgt 27398369  T
Q  628 tgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||  |||||||||  || |  |||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  27398368 tgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggt 27398269  T
Q  728 actggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    ||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  27398268 actagaggcttgggaaaatcaacacttgcaa 27398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 185
Target Start/End: Original strand, 26623030 - 26623191
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgtt 123  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  26623030 aggatttttattcctgtgttttctcccaactatgcatattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgctacaaaacaaagggtcgtc 26623129  T
Q  124 cggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttat 185  Q
      ||||||||  | ||||||   |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26623130 tcgttttgcccgtcttctatggcgtggatcctactcacatacggcatcaaactgggagttat 26623191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 185
Target Start/End: Original strand, 26729008 - 26729169
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgtt 123  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  26729008 aggatttttattcctgtgttttctcccaactatgcatattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgctacaaaacaaagggtcgtc 26729107  T
Q  124 cggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttat 185  Q
      ||||||||  | ||||||   |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26729108 tcgttttgcccgtcttctatggcgtggatcctactcacatacggcatcaaactgggagttat 26729169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 546 - 755
Target Start/End: Original strand, 28792926 - 28793135
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  28792926 acattaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 28793025  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||   |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28793026 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 28793125  T
Q  746 tcaacacttg 755  Q
    ||||||||||    
T  28793126 tcaacacttg 28793135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27427746 - 27427642
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  27427746 agaatccaggattttgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaag 27427647  T
Q  117 ggttg 121  Q
    |||||    
T  27427646 ggttg 27427642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 546 - 758
Target Start/End: Original strand, 25483626 - 25483838
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| | || |||||||| |||  ||||| | ||   ||||| | || |||||||||||||||||    
T  25483626 acatgaatagatatgaacacaagtttattgagaagatagtccaatacatctccaacaatatcaatcatgattttttaaacgtagccaaataccctgttgg 25483725  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||||||||    | || ||||||||||||  |||||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25483726 attacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggaggcatgggtaaa 25483825  T
Q  746 tcaacacttgcaa 758  Q
    |||||||||||||    
T  25483826 tcaacacttgcaa 25483838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Original strand, 26884210 - 26884314
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccaca--tcattcactgctacaagacaa 114  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  26884210 agaatctagaatttttattccaatattttctaccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatgtcattcactgctacgagacaa 26884309  T
Q  115 agggt 119  Q
    |||||    
T  26884310 agggt 26884314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 546 - 755
Target Start/End: Original strand, 28781668 - 28781877
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  28781668 acatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcacttacatgttgccaattaccctgttgg 28781767  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||| |   ||| ||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28781768 attacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtcaggatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 28781867  T
Q  746 tcaacacttg 755  Q
    ||||||||||    
T  28781868 tcaacacttg 28781877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 570 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 25492910 - 25492722
Alignment:
Q  570 ttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagt 669  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| || |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||| ||    
T  25492910 ttattgagaatatagtcgaagacatctcggataggatcaatcgtgtttcattacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgt 25492811  T
Q  670 gaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    |||||  ||||| |||  || |  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25492810 gaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggactttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaa 25492722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 27679000 - 27679095
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggt 119  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679000 aggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggt 27679095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 604 - 758
Target Start/End: Original strand, 26824444 - 26824598
Alignment:
Q  604 gatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtg 703  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||  | |  ||||||||||    
T  26824444 gatcaatcgtgttagtttacatgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtg 26824543  T
Q  704 gtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26824544 gtccatatggtaggactttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaa 26824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27698633 - 27698532
Alignment:
Q  18 gaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27698633 gaatctaggatttttattcctgtgttttctctcaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacgagacaaagg 27698534  T
Q  118 gt 119  Q
    ||    
T  27698533 gt 27698532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 546 - 758
Target Start/End: Original strand, 26884637 - 26884849
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| | | | |||| | |||| ||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26884637 acatgaatagatacgaatacgagtttatcgggaagatagtcgaagatatctccgacaaaatcaatcgtgttgttttacatgtagccaaataccctgttgg 26884736  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||||||||   |||||||||| | ||||  |||||||||| || |  | | || | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26884737 attacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaa 26884836  T
Q  746 tcaacacttgcaa 758  Q
    |||||||||||||    
T  26884837 tcaacacttgcaa 26884849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27531335 - 27531215
Alignment:
Q  19 aatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaaggg 118  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  27531335 aatctaggatttttattcccgtattttctgaaaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcactcattgctacgatacaaaggg 27531236  T
Q  119 ttgttcggttttgcctatttt 139  Q
    ||||   ||||||||| ||||    
T  27531235 ttgtcttgttttgcctgtttt 27531215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 546 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 27718114 - 27717902
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  || |||| |||| |||||||| ||| || ||  |||  |   |||||||||||||| |||||||||||    
T  27718114 acatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttgg 27718015  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||    ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  27718014 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaa 27717915  T
Q  746 tcaacacttgcaa 758  Q
    |||||||||||||    
T  27717914 tcaacacttgcaa 27717902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 547 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 27610734 - 27610523
Alignment:
Q  547 catgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgga 646  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||  |||  |   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27610734 catgaatagatatgaatacgagtttactggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttgga 27610635  T
Q  647 ttacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaat 746  Q
    || |||| | |||||||| |||||||||  |||||||||    ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  27610634 ttgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaat 27610535  T
Q  747 caacacttgcaa 758  Q
    ||||||||||||    
T  27610534 caacacttgcaa 27610523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27677747 - 27677652
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggt 119  Q
    |||||||||||| |  | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677747 aggatttttattgctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggt 27677652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27706535 - 27706440
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggt 119  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706535 aggatttttattcctgtgttttctatcacctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggt 27706440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27718518 - 27718237
Alignment:
Q  18 gaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27718518 gaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagg 27718419  T
Q  118 gttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
    || |    ||||||||| ||||||     ||||| |||| | || | ||||||||||  || |||||| ||| ||||| |  || |||||||| | | ||    
T  27718418 gtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggt 27718320  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccat 299  Q
    | |||||| | ||| | |||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||    
T  27718319 ttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccat 27718237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Original strand, 28139621 - 28139743
Alignment:
Q  50 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 149  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||    
T  28139621 caactatgcctcttcttcgttttgcttggacgaacttgtccacatcattgactgcttcaacacaaagggatgtttggttttgcctgttttctatggtgtg 28139720  T
Q  150 gatcctaatcacatacgacatca 172  Q
    ||||||  |||||| ||||||||    
T  28139721 gatccttctcacattcgacatca 28139743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27611141 - 27611040
Alignment:
Q  18 gaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27611141 gaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagg 27611042  T
Q  118 gt 119  Q
    ||    
T  27611041 gt 27611040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 546 - 758
Target Start/End: Original strand, 26056489 - 26056701
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||| | ||| ||||||| ||| |||||| | |||  ||||| | || |||||||||||||||||    
T  26056489 acatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttgg 26056588  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| ||||    | || ||||||||||||  |||||||| |||||   |||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  26056589 attgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggaggcatgggtaaa 26056688  T
Q  746 tcaacacttgcaa 758  Q
    |||||||||||||    
T  26056689 tcaacacttgcaa 26056701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 546 - 758
Target Start/End: Original strand, 26076459 - 26076671
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||| | ||| ||||||| ||| |||||| | |||  ||||| | || |||||||||||||||||    
T  26076459 acatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttgg 26076558  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| ||||    | || ||||||||||||  |||||||| |||||   |||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  26076559 attgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggaggcatgggtaaa 26076658  T
Q  746 tcaacacttgcaa 758  Q
    |||||||||||||    
T  26076659 tcaacacttgcaa 26076671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Original strand, 26623838 - 26624054
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||| |||||||||||  |  |||||||  | |||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26623838 acatgaacagatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttgg 26623937  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||  |||  |||||||| |||||  ||||| ||| | ||||| | ||||||| | || |||    
T  26623938 attacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaa 26624037  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    |||||||||||||||||    
T  26624038 tcaacacttgcaagagc 26624054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Original strand, 26729815 - 26730031
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||| |||||||||||  |  |||||||  | |||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26729815 acatgaacagatatgaatatgattttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttgg 26729914  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||  |||  |||||||| |||||  ||||| ||| | ||||| | ||||||| | || |||    
T  26729915 attacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaa 26730014  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    |||||||||||||||||    
T  26730015 tcaacacttgcaagagc 26730031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 546 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 27530916 - 27530704
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||   | |||| | ||||||| ||| ||||||| |  ||||     ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27530916 acatgaatagatatgaatacgagtttattggaaagatagtcgaagacatttccaacaggattagtcgtgagcccttagatgttgccaaatatcctgttgg 27530817  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||||||||    ||||||||| |||||| | | |||||||     |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530816 attacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 27530717  T
Q  746 tcaacacttgcaa 758  Q
    |||||||||||||    
T  27530716 tcaacacttgcaa 27530704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 549 - 758
Target Start/End: Original strand, 26862153 - 26862359
Alignment:
Q  549 tgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggatt 648  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| | | |||| || ||||||||  |||| || | |||||||   ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  26862153 tgaatagatatgaatatgagtttattgggaagatagtcagagacatcttggacaagaccgaacgtgt---tttgcacgtagccaaataccctgttggatt 26862249  T
Q  649 acagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatca 748  Q
    | |||    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26862250 aaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggtactggaggcatggggaaatca 26862349  T
Q  749 acacttgcaa 758  Q
    ||||||||||    
T  26862350 acacttgcaa 26862359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27593153 - 27593022
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgtt 123  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |      
T  27593153 aggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgaccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgcc 27593054  T
Q  124 cggttttgcctattttctatcatgtggatcct 155  Q
    | ||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  27593053 ctgttttgcctgttttctttggtgtggatcct 27593022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 28149988 - 28150110
Alignment:
Q  21 tccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtt 120  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  28149988 tccaggattttcattccaatcttctctatcaactatacttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacattattcactgcttcaaggcaaagggtt 28150087  T
Q  121 gttcggttttgcctattttctat 143  Q
    | |  ||| ||||||||||||||    
T  28150088 gcttagttctgcctattttctat 28150110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 545 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27706020 - 27705803
Alignment:
Q  545 cacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttg 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  ||||||||||    
T  27706020 cacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacatcccttacatgttgccacttaccctgttg 27705921  T
Q  645 gattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaa 744  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| | ||||||| | |||||    
T  27705920 gattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggaggcttgggtaa 27705821  T
Q  745 atcaacacttgcaagagc 762  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27705820 atcaacacttgcaagagc 27705803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27724984 - 27724883
Alignment:
Q  18 gaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27724984 gaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctattcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagg 27724885  T
Q  118 gt 119  Q
    ||    
T  27724884 gt 27724883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27427227 - 27427011
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  |||||||||||    
T  27427227 acatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttgg 27427128  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||    
T  27427127 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaa 27427028  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    |||||||||||||||||    
T  27427027 tcaacacttgcaagagc 27427011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 457
Target Start/End: Original strand, 26656415 - 26656476
Alignment:
Q  396 atcttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatataaacaagtataagttatttatatgt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26656415 atcttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatttaaacaagtataagttatttatatgt 26656476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 457
Target Start/End: Original strand, 26762386 - 26762447
Alignment:
Q  396 atcttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatataaacaagtataagttatttatatgt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26762386 atcttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatttaaacaagtataagttatttatatgt 26762447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 553 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27698194 - 27697985
Alignment:
Q  553 tagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacag 652  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27698194 tagatatgaatacaagtttattgaagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacag 27698095  T
Q  653 tataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacac 752  Q
    | | ||||||||  ||||||||   |||||||||  |||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  27698094 tctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacac 27697995  T
Q  753 ttgcaagagc 762  Q
    ||||||||||    
T  27697994 ttgcaagagc 27697985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Original strand, 26803013 - 26803229
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||| |||      ||||||||||| || |||||||||||    
T  26803013 acatgaatagatatgaatacaagttgattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtcagcccttacatgttgctaattaccctgttgg 26803112  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| || | |  ||||||| |||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||||||    
T  26803113 attgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaa 26803212  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26803213 tcagcacttgcaagagc 26803229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Original strand, 27229287 - 27229347
Alignment:
Q  25 ggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaact 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27229287 ggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttgaacgaact 27229347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 546 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 27604319 - 27604107
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||  ||||| |||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| || ||| ||||    
T  27604319 acatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctattgg 27604220  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||    ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  27604219 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaa 27604120  T
Q  746 tcaacacttgcaa 758  Q
    |||||||||||||    
T  27604119 tcaacacttgcaa 27604107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Original strand, 31285126 - 31285342
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||| |||||||||||  |  ||||||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31285126 acatgaacagatatgaatatgattttattggagacatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgccaattaccctgttgg 31285225  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||  ||| |  | |||||||||||||||  |||||||||| || || | || | | ||| | |||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||    
T  31285226 atttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaa 31285325  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    |||||||||||||||||    
T  31285326 tcaacacttgcaagagc 31285342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Original strand, 26937174 - 26937309
Alignment:
Q  50 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 149  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||  |    ||||||||||||||||| | |||    
T  26937174 caactatgccacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcgttgactgcttcaagacaaaaggtcatctaattttgcctattttctatgaagtg 26937273  T
Q  150 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttat 185  Q
    ||||||  |||| | ||||| || ||||||||||||    
T  26937274 gatccttctcacgttcgacaccaaactgggagttat 26937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Original strand, 31284342 - 31284420
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcact 102  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284342 aggatttttatccccgtgttttctgccaactatgcctcttcgtcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcact 31284420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27604844 - 27604743
Alignment:
Q  18 gaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagg 117  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27604844 gaatccaggatttttattcctgtgttttctatcaaatatgcctcttcttccttttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacacgacaaagg 27604745  T
Q  118 gt 119  Q
    ||    
T  27604744 gt 27604743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 554 - 758
Target Start/End: Original strand, 27215027 - 27215231
Alignment:
Q  554 agatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagt 653  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||   ||||||||||  ||| ||  || ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  27215027 agatatgaatacaagtttattgagaagatagttgaagacatctcaaacaagacgaatcgtgattttttacatgttgccaaacaccctgttggattacata 27215126  T
Q  654 ataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacact 753  Q
       || |||||||||| ||||  |||||||| | ||||  | | || | ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  27215127 cccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggacttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacact 27215226  T
Q  754 tgcaa 758  Q
    |||||    
T  27215227 tgcaa 27215231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 545 - 760
Target Start/End: Original strand, 27679516 - 27679731
Alignment:
Q  545 cacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttg 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  ||||||||||    
T  27679516 cacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttacatgttgccacttaccctgttg 27679615  T
Q  645 gattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaa 744  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||   ||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||  | || ||    
T  27679616 gattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggaggtttggggaa 27679715  T
Q  745 atcaacacttgcaaga 760  Q
    ||||||||||||||||    
T  27679716 atcaacacttgcaaga 27679731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28098475 - 28098291
Alignment:
Q  51 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctac-aagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 149  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |  ||||| |||||||| | | | |||    
T  28098475 aactatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcaccgttacgaaga-aaagggttgcttcgtttttcctattttttgtgacgtg 28098377  T
Q  150 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaa 235  Q
    || |||  |||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  28098376 gaaccttctcacgtgcgacatcagacggggagttatggtgaagcat-tagctaagcatgaagagaggttccaaaataacaaagaaaa 28098291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 28781186 - 28781475
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||||||  ||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||     
T  28781186 agaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaa 28781285  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga-gcatcttactaagcatgaagacaag 215  Q
    ||| |    ||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |  | |||||||| || ||   |||| |||| |||| |  ||   |||||| | | |    
T  28781286 ggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtccttatggtgaagcat-tggctggacatgaaaagagg 28781384  T
Q  216 ttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    || |||||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  28781385 tttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtc 28781475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 26342070 - 26341975
Alignment:
Q  21 tccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  26342070 tccaggattttcattccaattttctcaatcaactatgcttcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaaggcaaag 26341975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Original strand, 26949745 - 26949991
Alignment:
Q  54 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatc 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||| ||| |    ||| ||||  |||||||| |||| || |    
T  26949745 tatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccatatcattcactacttcaaggaaaaaggtcgccttgttctgccagttttctatgatgtagaac 26949844  T
Q  154 ctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagc 252  Q
    ||  |||| | |||||||||| |   |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||  |||||||| || |||||  |     
T  26949845 cttctcacgtgcgacatcagaattatagttatggtgaagca-cttgctaagcatgaagagaggttccaaaagagcaaaaaaaacatggagcggttgctga 26949943  T
Q  253 aatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccatt 300  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  26949944 aatggaagatagctctgaacaaagttgctgacttatctggctaccatt 26949991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Original strand, 27214649 - 27214756
Alignment:
Q  199 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 298  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  27214649 ctaagcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaacttatctggctatca 27214748  T
Q  299 ttgtagtc 306  Q
    || |||||    
T  27214749 ttatagtc 27214756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27234579 - 27234472
Alignment:
Q  199 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 298  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  27234579 ctaagcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaacttatctggctatca 27234480  T
Q  299 ttgtagtc 306  Q
    || |||||    
T  27234479 ttatagtc 27234472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 306
Target Start/End: Original strand, 28786376 - 28786614
Alignment:
Q  68 attttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacga 167  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    ||||||||| |||||| |  ||| ||||||| | |  | |||    
T  28786376 attttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtcgatcctactaatgtgcga 28786475  T
Q  168 catcagactgggagttattgtga-gcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggct 266  Q
    ||||| || ||  ||||| |||| |||| |  ||  ||||||| | | ||| |||||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  28786476 catcatacaggtcgttatggtgaagcat-tggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggct 28786574  T
Q  267 ctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  28786575 ctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtc 28786614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 306
Target Start/End: Original strand, 28792497 - 28792735
Alignment:
Q  68 attttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacga 167  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    ||||||||| |||||| |  ||| ||||||| | |  | |||    
T  28792497 attttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtcgatcctactaatgtgcga 28792596  T
Q  168 catcagactgggagttattgtga-gcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggct 266  Q
    ||||| || ||  ||||| |||| |||| |  ||  ||||||| | | ||| |||||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  28792597 catcatacaggtcgttatggtgaagcat-tggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggct 28792695  T
Q  267 ctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  28792696 ctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtc 28792735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 28181168 - 28181254
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 110  Q
    |||||||| |||||| | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28181168 aggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaag 28181254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28297846 - 28297760
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 110  Q
    |||||||| |||||  | || ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28297846 aggattttcattcctgtcttatctaccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaag 28297760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 28514227 - 28514313
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 110  Q
    |||||||| |||||  | || ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28514227 aggattttcattcctgtcttatctaccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaag 28514313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 181
Target Start/End: Original strand, 2184980 - 2185109
Alignment:
Q  52 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtgga 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||  |  ||||| ||||  |||||| | |  | ||    
T  2184980 actatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccatatcattcgttgctccaagtcaaagggacgcccggttctgccagttttctgtaacataga 2185079  T
Q  152 tcctaatcacatacgacatcagactgggag 181  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2185080 tcctaatcatgtacgaaatcagactgggag 2185109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 111
Target Start/End: Original strand, 28242888 - 28242945
Alignment:
Q  54 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaaga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28242888 tatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaaga 28242945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 99
Target Start/End: Original strand, 2184369 - 2184417
Alignment:
Q  51 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2184369 aactatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattc 2184417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Original strand, 26975134 - 26975182
Alignment:
Q  52 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26975134 actatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattca 26975182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Original strand, 26802489 - 26802771
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| || |||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  26802489 agaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaag 26802588  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agcatcttactaagcatgaagacaag 215  Q
    ||| |    || ||||||||||||| |  ||||||||||| | |  | || ||||| ||  | || ||| ||| ||||| |  || |||||||| | | |    
T  26802589 ggtcgcctcgtcttgcctattttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaaaagg 26802687  T
Q  216 ttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccat 299  Q
    || |||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||    
T  26802688 tttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccat 26802771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 545 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 27592637 - 27592426
Alignment:
Q  545 cacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttg 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       ||| |||||||||  ||||||||||    
T  27592637 cacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaaatgttgccacttaccctgttg 27592538  T
Q  645 gattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaa 744  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||   |||  |||| ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| | || ||    
T  27592537 gattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaa 27592438  T
Q  745 atcaacacttgc 756  Q
    ||||||||||||    
T  27592437 atcaacacttgc 27592426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 545 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 27677236 - 27677025
Alignment:
Q  545 cacatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttg 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  |    |   |||||||||||||  ||||||||||    
T  27677236 cacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcaacaacccttacatgttgccacttaccctgttg 27677137  T
Q  645 gattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaa 744  Q
    |||| |||| |  |||||||||| ||||||  |||||||||   |||  |||| ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| | || ||    
T  27677136 gattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaa 27677037  T
Q  745 atcaacacttgc 756  Q
    ||||||||||||    
T  27677036 atcaacacttgc 27677025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 102
Target Start/End: Original strand, 25071741 - 25071791
Alignment:
Q  52 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcact 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25071741 actatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattcact 25071791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 104
Target Start/End: Original strand, 26861688 - 26861750
Alignment:
Q  42 ttttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26861688 ttttctgccaactatgcctcttcgtcattttgtttggatgaacttgtccaaatcattaactgc 26861750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 28185420 - 28185506
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 110  Q
    |||||||| |||||| | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28185420 aggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattaactgcttcaag 28185506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 28226997 - 28227090
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 110  Q
    |||||| |||||||| |||||  | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28226997 agaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaag 28227090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Original strand, 26848741 - 26848809
Alignment:
Q  51 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggt 119  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  26848741 aactatgccacttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctccaaggaaaagggt 26848809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 546 - 653
Target Start/End: Original strand, 25511505 - 25511612
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| ||| |||||| | |||  ||||  | || |||||||||||||||||    
T  25511505 acatgaatagatctgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcatgtttttttgaacgtagccaaataccctgttgg 25511604  T
Q  646 attacagt 653  Q
    ||| ||||    
T  25511605 attgcagt 25511612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Original strand, 27214498 - 27214557
Alignment:
Q  51 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27214498 aactatgctacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcactcattgctccaag 27214557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 27234730 - 27234671
Alignment:
Q  51 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27234730 aactatgctacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcactcattgctccaag 27234671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 268
Target Start/End: Original strand, 28234806 - 28234861
Alignment:
Q  213 aagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  28234806 aagttccaaaataacaaggataacatggagaggttgcagaaatggaagatggctct 28234861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Original strand, 28234648 - 28234692
Alignment:
Q  54 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcatt 98  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28234648 tatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcatt 28234692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Original strand, 29826183 - 29826242
Alignment:
Q  126 gttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||    
T  29826183 gttttgcctattttctatgatgtggatccttctcatgtgcgacatcagactgggagttat 29826242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Original strand, 26617858 - 26617920
Alignment:
Q  206 tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 268  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||    
T  26617858 tgaagaaaggttccaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctct 26617920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Original strand, 26723786 - 26723848
Alignment:
Q  206 tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 268  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||    
T  26723786 tgaagaaaggttccaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctct 26723848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27665223 - 27665169
Alignment:
Q  51 aactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 105  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27665223 aactatgctacttcttcattttgtttagatgaacttgtccacatcattcattgct 27665169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 300
Target Start/End: Original strand, 26635919 - 26636020
Alignment:
Q  199 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 298  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||||  ||||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26635919 ctaagcatgaagatcagtttcaaaatagcaaggaaaacatggagtggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccacca 26636018  T
Q  299 tt 300  Q
    ||    
T  26636019 tt 26636020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 300
Target Start/End: Original strand, 26741885 - 26741986
Alignment:
Q  199 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 298  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||||  ||||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26741885 ctaagcatgaagatcagtttcaaaatagcaaggaaaacatggagtggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccacca 26741984  T
Q  299 tt 300  Q
    ||    
T  26741985 tt 26741986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 300
Target Start/End: Original strand, 26959395 - 26959496
Alignment:
Q  199 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 298  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||||  ||||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26959395 ctaagcatgaagagcagtttcaaaatagcaaggaaaacatggagcggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccacca 26959494  T
Q  299 tt 300  Q
    ||    
T  26959495 tt 26959496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27337828 - 27337783
Alignment:
Q  398 cttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatataaacaagtata 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27337828 cttaaaaaggaagcatgttttttatttatgtttttaaacaagtata 27337783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27398568 - 27398523
Alignment:
Q  398 cttagaaaggaagcatgttttttatttatgtatataaacaagtata 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27398568 cttaaaaaggaagcatgttttttatttatgtttttaaacaagtata 27398523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 28325535 - 28325616
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 105  Q
    |||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28325535 aggattttcattcctattttgtctatcaattatgcttcttcttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgct 28325616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Original strand, 26635774 - 26635825
Alignment:
Q  54 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 105  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26635774 tatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcattgct 26635825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Original strand, 26741740 - 26741791
Alignment:
Q  54 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 105  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26741740 tatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattcattgct 26741791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 318
Target Start/End: Original strand, 26861842 - 26861961
Alignment:
Q  199 ctaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctacca 298  Q
    ||||||||||| | | ||| |||||| | | ||| |||||| |||||||| ||  ||||||  | ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  26861842 ctaagcatgaaaaaaggtttcaaaatgatatggataacatggagaggttgcagagatggaaagttgctctgaaccaagctgctaacttgtcaggctacca 26861941  T
Q  299 ttgtagtcaagggtacccca 318  Q
    || |||||  ||||||||||    
T  26861942 ttttagtcctgggtacccca 26861961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Original strand, 28185609 - 28185696
Alignment:
Q  213 aagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccatt 300  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||  || |||| ||||| |||||| ||||||    
T  28185609 aagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatt 28185696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28297657 - 28297570
Alignment:
Q  213 aagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccatt 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||  || |||| ||||| |||||| ||||||    
T  28297657 aagttccaaaataacaagaataacatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatt 28297570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Original strand, 28514416 - 28514503
Alignment:
Q  213 aagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccatt 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||  || |||| ||||| |||||| ||||||    
T  28514416 aagttccaaaataacaagaataacatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatt 28514503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Original strand, 26811745 - 26811807
Alignment:
Q  206 tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctct 268  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||||| |||||    
T  26811745 tgaagaaatgttccaaaataacaaggaaaacatggatcggttgcagaaatggaagatagctct 26811807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Original strand, 26959250 - 26959296
Alignment:
Q  54 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattca 100  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26959250 tatgcttcttcttcgttttatttggatgaacttgtccacatcattca 26959296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25506961 - 25506848
Alignment:
Q  180 agttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctg 279  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| | | | |||||||| || ||||| ||  || |||    
T  25506961 agttatggtgaagatctgactaagcatgaagagaagtttcaaaataataagaaaaacatggagagatcgcatcaatggaaaatagctctaacacaatctg 25506862  T
Q  280 ccaacttgtctggc 293  Q
    | ||| ||||||||    
T  25506861 ctaacctgtctggc 25506848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18731598 - 18731334
Alignment:
Q  50 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||   |||    
T  18731598 caactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtg 18731499  T
Q  150 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttgg 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||  || | |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||     
T  18731498 gatcctagtcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaacatctcactaagcacaaaaagagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgc 18731399  T
Q  250 agcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtac 314  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  18731398 atcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttagtcatgggtac 18731334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18655597 - 18655315
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgtt 123  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18655597 aggatctttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccgcatcattcactgctacaagacaaagggtcgtc 18655498  T
Q  124 cggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaa 223  Q
      ||||| ||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||   | | || ||||||||    
T  18655497 tcgtttttcctgttttctatggcgtggatcctactcacatacgacatcaaactggaagttatggtgaacatctcactaagcacagaaagaatttccaaaa 18655398  T
Q  224 taacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  18655397 taacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattctagtc 18655315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18724179 - 18723923
Alignment:
Q  50 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||   |||    
T  18724179 caactatgcctcttcttcattttgtttgaacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtg 18724080  T
Q  150 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttgg 249  Q
    ||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||   |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||     
T  18724079 gatcctagtcacatacgacaccaaagtgggagttatggtgaacatctcactaagcacaaaatgagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgc 18723980  T
Q  250 agcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  18723979 atcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttagtc 18723923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18699494 - 18699239
Alignment:
Q  50 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||||   ||     
T  18699494 caactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcattcactgctacaagacaaaaggtcgtctcgttttgcctgttttctatggcgta 18699395  T
Q  150 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttgg 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||| | | | |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||     
T  18699394 gatcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaacatctcactaagcacggaaagagtttccaaaataacaagaaaaacatggagcggttgc 18699295  T
Q  250 agcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagt 305  Q
    | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18699294 atcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttagt 18699239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18679661 - 18679405
Alignment:
Q  50 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||   |||    
T  18679661 caactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatgtcgtg 18679562  T
Q  150 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagca-tgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttg 248  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||| | |  ||||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  18679561 gatcctactcacatatgacatcaaagtggtagttatggtgaacatctcactaatcactgaa-agagtttccaaaataacaataaaaacatggagcggttg 18679463  T
Q  249 gagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
     | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  18679462 catcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttagtc 18679405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Original strand, 18073809 - 18073913
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18073809 agaatccaggattttgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaag 18073908  T
Q  117 ggttg 121  Q
    |||||    
T  18073909 ggttg 18073913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17989180 - 17989088
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaa 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17989180 agaatccaggattttgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaa 17989088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 546 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18699011 - 18698801
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  18699011 acatgaatagatatgaatacaagtttattggagatatagtcaaatacgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 18698912  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| |||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||  |||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  18698911 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgttaggactttatggcattggaggcatgggtaaa 18698812  T
Q  746 tcaacacttgc 756  Q
    |||||||||||    
T  18698811 tcaacacttgc 18698801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Original strand, 18074328 - 18074544
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  |||||||||||    
T  18074328 acatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttgg 18074427  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||    
T  18074428 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaa 18074527  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    |||||||||||||||||    
T  18074528 tcaacacttgcaagagc 18074544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 620 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 18679097 - 18678959
Alignment:
Q  620 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggac 719  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||    ||  | ||||||  ||||||||||||||||    
T  18679097 ttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggtaggac 18678998  T
Q  720 tttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18678997 tttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaa 18678959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 620 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 18655014 - 18654876
Alignment:
Q  620 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggac 719  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||  |||  ||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  18655014 ttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggac 18654915  T
Q  720 tttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18654914 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaa 18654876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 620 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 18723622 - 18723484
Alignment:
Q  620 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggac 719  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||  |||  | ||| ||  ||||||||| ||||||    
T  18723622 ttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgataggac 18723523  T
Q  720 tttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaa 758  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18723522 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaa 18723484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18731115 - 18730905
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||| |  ||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||  |||||||||||    
T  18731115 acatgaatagatatgaatacaagtttattgaaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgg 18731016  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
     || |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||  |||  | ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  18731015 gttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaa 18730916  T
Q  746 tcaacacttgc 756  Q
    |||||||||||    
T  18730915 tcaacacttgc 18730905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5091059 - 5090921
Alignment:
Q  52 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtgga 151  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||  ||| |||||   |||||||||||||||||||  ||||||    
T  5091059 actatgcttcttcttcgttttgtttagatgaacttgtccatattattcactgctccaaggaaaatggttgcctggttttgcctattttctatggtgtgga 5090960  T
Q  152 tcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga 190  Q
     |||  |||  | ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5090959 accttctcatgtgcgatatcagactggaagttatggtga 5090921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29273900 - 29273613
Alignment:
Q  27 atttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcgg 126  Q
    |||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        
T  29273900 atttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtctca 29273801  T
Q  127 ttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataa 226  Q
    |||||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| |  ||||||||||     
T  29273800 ttttgcctgtcttctatggcgtggatcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaacatctcactaagtacgaagagagtttccaaaatag 29273701  T
Q  227 caaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtac 314  Q
    |||| |||||||| |  ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29273700 caagaaaaacatggatcggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagcttctaacttgtctggctaccattctagtcatgggtac 29273613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 29273453 - 29273237
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  || |||| |||| |||||||| ||| |||||  || ||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29273453 acatgaatagatatgaatacaagtttatcggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttgg 29273354  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||  |||||||| | |||  ||||| ||| ||||||| | ||| ||| | ||||||    
T  29273353 attacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatgggattggtggcttgggtaaa 29273254  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    ||||| |||||||||||    
T  29273253 tcaacccttgcaagagc 29273237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 268477 - 268195
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgtt 123  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  268477 aggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagaaaaagggtcgtc 268378  T
Q  124 cggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaa 223  Q
       |||||||  | ||||||   |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  268377 tcattttgcccgtcttctatggcgtggatcctactcacatacgacatcaaagtgggagttatggtgaacatctcactaagcacgaagagagtttccaaaa 268278  T
Q  224 taacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtc 306  Q
    || |||| |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  268277 tagcaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagcttctaacttgtctggctaccattctagtc 268195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28127806 - 28127507
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28127806 agaatctagaatttttattcctgtattttctaccaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtgcacatcattcactgctacaagacaaag 28127707  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
    ||| |    ||||||||| |||||| |   |||||||||| | |  | ||| |||| || ||||||||| ||||  | ||| ||||||||| ||| | ||    
T  28127706 ggtcgcctagttttgcctgttttctttggcgtggatcctactgatgtgcgatatcatacagggagttatggtgaagagcttgctaagcatggagagaggt 28127607  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28127606 tccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgcaccaatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagtccagggtaccc 28127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 551 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 28127285 - 28127078
Alignment:
Q  551 aatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattac 650  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || | |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28127285 aatagatatgaatacaagtttattcagaagataatcaaagacatatccgacaggatcaatcgtgttttcttacatgttgccaaatatcctgttggattac 28127186  T
Q  651 agtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaac 750  Q
    || |  |||||||||||||||| |  ||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  28127185 aggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtattggaggcttgggtaaatcaac 28127086  T
Q  751 acttgcaa 758  Q
    ||||||||    
T  28127085 acttgcaa 28127078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 556 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 28163980 - 28163778
Alignment:
Q  556 atatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttggattacagtat 655  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |    
T  28163980 atatgaatacaagtttattcaggagataatcaaaggcacctccgacaggatcaatcgtgtttttttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatct 28163881  T
Q  656 aaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttg 755  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28163880 caagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttg 28163781  T
Q  756 caa 758  Q
    |||    
T  28163780 caa 28163778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28164456 - 28164192
Alignment:
Q  50 caactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtg 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||| |||||| |   |||    
T  28164456 caactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagttttgcctgttttct-tggcgtg 28164358  T
Q  150 gatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtgagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttgg 249  Q
    ||||||| | |  | |||||||| || ||||||||| |  |  |||||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||| || | |||     
T  28164357 gatcctactgatgtgcgacatcatacagggagttatggcaaagatcttactaagcatggtgagaggttccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgc 28164258  T
Q  250 agcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtacc 315  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  28164257 accaatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagtccagggtacc 28164192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 267955 - 267739
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||||     |||||||||||||| |||||||||||    
T  267955 acatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 267856  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||||||    
T  267855 attatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaa 267756  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    ||||| |||||||||||    
T  267755 tcaacccttgcaagagc 267739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 546 - 755
Target Start/End: Original strand, 8054 - 8263
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  8054 acatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 8153  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||   |||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8154 attacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 8253  T
Q  746 tcaacacttg 755  Q
    ||||||||||    
T  8254 tcaacacttg 8263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 314
Target Start/End: Original strand, 7807 - 7869
Alignment:
Q  252 caatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtac 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  7807 caatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcatgggtac 7869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Original strand, 7572 - 7668
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagaca 113  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||| ||  ||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  7572 agaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagaca 7668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 546 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 13290 - 13081
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||  |||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  13290 acatgaatagatatgaatacaagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttgg 13191  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||   |||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13190 attacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaa 13091  T
Q  746 tcaacacttg 755  Q
    ||||||||||    
T  13090 tcaacacttg 13081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4810 - 4514
Alignment:
Q  18 gaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||  |  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4810 gaatctaggatttttattcctgtgttttctatcttctatgccttttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagg 4711  T
Q  118 gttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtg-agcatcttactaagcatgaagacaagt 216  Q
    || |    ||||||||| ||||||     ||||| |||| | || | ||||||| ||  || |||||| ||| ||||| |  || |||||||| | | ||    
T  4710 gtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatctgaaaggtagttatggtgaagcat-tggctgagcatgaaaagaggt 4612  T
Q  217 tccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtac 314  Q
    | |||||| | ||| | |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  4611 ttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcatgggtac 4514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 620 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4253 - 4118
Alignment:
Q  620 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggac 719  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||   |||  |||| |||  | || |||||||||||    
T  4253 ttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggtaggac 4154  T
Q  720 tttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttg 755  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4153 tttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttg 4118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13772 - 13475
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||| ||  ||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||     
T  13772 agaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaa 13673  T
Q  117 ggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatcctaatcacatacgacatcagactgggagttattgtga-gcatcttactaagcatgaagacaag 215  Q
    ||| |    ||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |  | |||||||| || ||  ||||| |||| |||| |  ||   |||||| | | |    
T  13672 ggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcat-tggctggacatgaaaagagg 13574  T
Q  216 ttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaagggtac 314  Q
    || |||||| | ||| | |||||| || | ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  13573 tttcaaaatgataagaataacatggagcgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcatgggtac 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Original strand, 59617 - 59721
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  59617 agaatccaggattttgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaag 59716  T
Q  117 ggttg 121  Q
    |||||    
T  59717 ggttg 59721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Original strand, 60136 - 60352
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||| |||||||| ||| |||||  ||       |||||||||||||  |||||||||||    
T  60136 acatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttgg 60235  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||    
T  60236 attgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaa 60335  T
Q  746 tcaacacttgcaagagc 762  Q
    |||||||||||||||||    
T  60336 tcaacacttgcaagagc 60352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3561 - 3459
Alignment:
Q  18 gaatccaggatttttattcccatattttctgccaac-tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 116  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3561 gaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaacctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaag 3462  T
Q  117 ggt 119  Q
    |||    
T  3461 ggt 3459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 546 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 3154 - 2942
Alignment:
Q  546 acatgaatagatatgaatacaagcttattgaggatatagccaaagacatctccgacaggatcaaacgtgtaattttacatgttgccaaataccctgttgg 645  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  || |||| |||| |||||||| ||| || ||  |||  |   |||||||||||||| |||||||||||    
T  3154 acatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttgg 3055  T
Q  646 attacagtataaagtacaacaagtgaaatgccttcttgatatgggaaatgatgatgtggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaa 745  Q
    | |  ||| |  |||||||||||||||||  |||||||||    ||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  3054 aatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaa 2955  T
Q  746 tcaacacttgcaa 758  Q
    |||||||||||||    
T  2954 tcaacacttgcaa 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14494 - 14394
Alignment:
Q  18 gaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14494 gaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcct-ttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagg 14396  T
Q  118 gt 119  Q
    ||    
T  14395 gt 14394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Original strand, 34809 - 35023
Alignment:
Q  54 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggttgttcggttttgcctattttctatcatgtggatc 153  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||  ||   |||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  34809 tatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaaggaaagcgggcgtctagttttgccaattttctatgatgtggaac 34908  T
Q  154 ctaatcacatacgacatcagactgggagttattgt-gagcatcttactaagcatgaagacaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagc 252  Q
    ||  |||| | |||||||| |  || |||||| ||  |||| ||   | | |||  | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  34909 cttctcacgtgcgacatcacaagggcagttatggtaaagca-ctggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggataacatggagaggttgcaga 35007  T
Q  253 aatggaagatggctct 268  Q
    ||||||||||||||||    
T  35008 aatggaagatggctct 35023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 111
Target Start/End: Original strand, 43050 - 43107
Alignment:
Q  54 tatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaaga 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43050 tatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaaga 43107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 27495 - 27588
Alignment:
Q  17 agaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 110  Q
    |||||| |||||||| |||||  | || |||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27495 agaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaag 27588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 116850 - 116931
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 105  Q
    |||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  116850 aggattttcattcctattttgtctatcaattatgcttcttcttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgct 116931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 58415 - 58334
Alignment:
Q  24 aggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 105  Q
    |||||||| |||||| | || |||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  58415 aggattttcattcccgtcttgtctatcaactatgcttcttcttcattttgcttgaacgaacttgtccacatcattcactgct 58334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17993789 - 17993736
Alignment:
Q  52 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17993789 actatgcttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattcaatgct 17993736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Original strand, 3279739 - 3279823
Alignment:
Q  21 tccaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 105  Q
    |||| ||||||||||||  | || |||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3279739 tccatgatttttattccggtcttctctatcaactatgcttcttctatattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgct 3279823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University