View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1855_low_2 (Length: 682)

Name: NF1855_low_2
Description: NF1855
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1855_low_2
NF1855_low_2
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (15-662)||(27876278-27876925)
chr6 (121-561)||(8481374-8481814)
chr6 (53-170)||(26978485-26978602)
chr6 (18-212)||(18148776-18148970)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (15-662)||(48699390-48700037)
chr4 (19-662)||(42268004-42268647)
chr4 (19-662)||(30947756-30948399)
chr4 (121-582)||(2001058-2001521)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (15-662)||(41720511-41721158)
chr5 (15-662)||(34354111-34354758)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (19-662)||(5820848-5821491)
chr3 (42-662)||(2814859-2815479)
chr3 (121-630)||(42587084-42587593)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (19-662)||(827580-828223)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (19-662)||(9441664-9442308)
chr8 (121-630)||(24596163-24596672)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (606-661)||(8134716-8134771)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 612; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 612; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 662
Target Start/End: Original strand, 27876278 - 27876925
Alignment:
Q  15 catcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27876278 catcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctc 27876377  T
Q  115 tttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacagg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876378 tttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacagg 27876477  T
Q  215 cgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876478 cgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacag 27876577  T
Q  315 gacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttat 414  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876578 gacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttat 27876677  T
Q  415 tacataacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatc 514  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876678 tacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatc 27876777  T
Q  515 cgctctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatatt 614  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876778 cgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatatt 27876877  T
Q  615 ctcctccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27876878 ctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaa 27876925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 561
Target Start/End: Original strand, 8481374 - 8481814
Alignment:
Q  121 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgatac 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  8481374 agtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatctctgccaacaacaagcttgcgaatagtgggatcccacaagcgatac 8481473  T
Q  221 cccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaac 320  Q
    ||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||  || ||||  ||| |    
T  8481474 cccttcatcttgtcagtataacccaagaatatacattttttagactttggatctgtctttgttctgtcttgggagatgtacatcctgtgcacaatacatc 8481573  T
Q  321 caaaaacatgcagagaagaataatcta-ctggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacat 419  Q
    | || ||||| |  || |||||| |||  ||| |||   ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||| || ||||| || ||||    
T  8481574 cgaacacatgtaaggatgaataa-ctaggtggatttttgttccaaatctccatcggtgttttcaaaccaattgcagtttatggagatcgattgatcacat 8481672  T
Q  420 aacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgctc 519  Q
    |||| ||  ||||||| |||| |||| | || |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||    
T  8481673 aacatgccattttcgcagcttttgccaaaaaagacttggccattcctgctgttctctgcataactcttgttttatctaggagagttttattcaatcgctc 8481772  T
Q  520 taccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattg 561  Q
    | | | |||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||    
T  8481773 tgctataccattatgttgaggcgtatatggaactgtgaattg 8481814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 170
Target Start/End: Original strand, 26978485 - 26978602
Alignment:
Q  53 ggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagtt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26978485 ggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagtt 26978584  T
Q  153 cattttctgcaaagacta 170  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26978585 cattttctgcaaagacta 26978602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 18148776 - 18148970
Alignment:
Q  18 cattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctcttt 117  Q
    |||||||  ||| |||||||||  | |||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  18148776 cattgaccgcatttggttcttgcacatcgtgctctgattcagcttcagaagaatcactttccttgaatttttcttccatatgcactattgcaatctcttt 18148875  T
Q  118 agaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccaca 212  Q
      ||||| |||| ||||| |||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  18148876 gaaagtgttgtcttttttatgctcactctacaactcattttctacaaagactacatccatgataacaacaaccttgcgggtagtggaatctcaca 18148970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 612; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 612; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 662
Target Start/End: Original strand, 48699390 - 48700037
Alignment:
Q  15 catcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48699390 catcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctc 48699489  T
Q  115 tttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacagg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699490 tttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacagg 48699589  T
Q  215 cgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699590 cgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacag 48699689  T
Q  315 gacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttat 414  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699690 gacaaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttat 48699789  T
Q  415 tacataacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatc 514  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699790 tacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatc 48699889  T
Q  515 cgctctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatatt 614  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699890 cgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatatt 48699989  T
Q  615 ctcctccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48699990 ctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaa 48700037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 42268647 - 42268004
Alignment:
Q  19 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctcttta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42268647 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctcttta 42268548  T
Q  119 gaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268547 gaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 42268448  T
Q  219 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42268447 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacatacacaggaca 42268348  T
Q  319 accaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 418  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268347 accaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 42268248  T
Q  419 taacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 518  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268247 taacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 42268148  T
Q  519 ctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 618  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268147 ctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 42268048  T
Q  619 tccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42268047 tccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaa 42268004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 662
Target Start/End: Original strand, 30947756 - 30948399
Alignment:
Q  19 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctcttta 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  30947756 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttctatctgcagaatagcagtctcttta 30947855  T
Q  119 gaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947856 aaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 30947955  T
Q  219 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947956 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctagactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 30948055  T
Q  319 accaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30948056 accaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccattggtgtcttcaaatcaatcgtcgttgatggtgagcgatttattaca 30948155  T
Q  419 taacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 518  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948156 taacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccatttccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 30948255  T
Q  519 ctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 618  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30948256 ctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 30948355  T
Q  619 tccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  30948356 tccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaa 30948399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 121 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 2001521 - 2001058
Alignment:
Q  121 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacat--ccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 218  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  2001521 agtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccacaagcgat 2001422  T
Q  219 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 318  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |  || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||    
T  2001421 accccttcacgttgtcagcataacccaagaatatacaatttctagactttggatctagttttgttctttcttgggagttgttcattgcgtacacaataca 2001322  T
Q  319 accaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 418  Q
     || || ||||  |  |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||| || ||     
T  2001321 tccgaacacatataaggaagaataatcaggtggctttccgttccaaatctccattggtgttttcaaaccaattgcggttgatggagatcgattgatcacg 2001222  T
Q  419 taacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 518  Q
    ||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||| ||| |||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  2001221 taataggcagttttcacagcttctgcccagaaagacttagccactcctgttgttctcaacatggctcttgttctatataggagagttatattcatccgct 2001122  T
Q  519 ctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgttt 582  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||  |||||| || |||||    
T  2001121 ctgctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaattgtcttgtaataccttcatgttt 2001058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 604; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 41721158 - 41720511
Alignment:
Q  15 catcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41721158 catcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccgattcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctc 41721059  T
Q  115 tttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacagg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721058 tttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacagg 41720959  T
Q  215 cgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720958 cgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacag 41720859  T
Q  315 gacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttat 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720858 gacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccattggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttat 41720759  T
Q  415 tacataacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatc 514  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720758 tacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatc 41720659  T
Q  515 cgctctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatatt 614  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41720658 cgctctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctatatatt 41720559  T
Q  615 ctcctccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  41720558 ctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcctagtttcaa 41720511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 34354758 - 34354111
Alignment:
Q  15 catcattgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34354758 catcattgacatcatatggttcttgttctccgtgcatcggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcattatagcagtctc 34354659  T
Q  115 tttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacagg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354658 tttagaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaataaccttgcgggcagtgggatcccacagg 34354559  T
Q  215 cgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354558 cgataccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacattttctgaactttgggtccaacttcgttctgtcttgggagttgtacatcacgtacacag 34354459  T
Q  315 gacaaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttat 414  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34354458 gacaaccaaacacatgtagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccattggtgtcttcaaatcaattgtcgttgatggtgagcgatttat 34354359  T
Q  415 tacataacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatc 514  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354358 tacataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcctgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatc 34354259  T
Q  515 cgctctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatatt 614  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354258 cgctctgccgcaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatatt 34354159  T
Q  615 ctcctccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34354158 ctcctccattgtctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaa 34354111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 604; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 662
Target Start/End: Original strand, 5820848 - 5821491
Alignment:
Q  19 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctcttta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5820848 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctcttta 5820947  T
Q  119 gaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820948 gaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 5821047  T
Q  219 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5821048 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacatacacaggaca 5821147  T
Q  319 accaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 418  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821148 accaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 5821247  T
Q  419 taacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 518  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821248 taacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 5821347  T
Q  519 ctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 618  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821348 ctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 5821447  T
Q  619 tccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5821448 tccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaa 5821491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 662
Target Start/End: Original strand, 2814859 - 2815479
Alignment:
Q  42 cttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctctttagaagtgctgtcatttttctgctc 141  Q
    |||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2814859 cttcgtgcactgattctgattctgaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcactatagcagtctctttagaaatgctgtcatttttctgctc 2814958  T
Q  142 actttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgataccccttaacattgtcagcataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2814959 actttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggaccccacaggcgataccccttaacattgtcagcataa 2815058  T
Q  242 cccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaaccaaaaacatgcagagaagaat 341  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2815059 cccaagaagatacatttcttagactttgggtccaactttgttctttcttgagagttgtacatcacatacacaggacaaccaaacacatgtagagaagaat 2815158  T
Q  342 aatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcgctgcttc 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2815159 aatctactggctttcctttccacatctccataggagtcttcaaatcaatcaacgttgatggtgagcgatttattacataacaggcggttttcactgcttc 2815258  T
Q  442 tgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgctctaccacaccattctgctgaggt 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2815259 tgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttatattcatccgctctgccacaccattctgctgaggt 2815358  T
Q  542 gtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctccattgtctgtcctcaggcact 641  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  2815359 gtatgtgcaacagtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgtcatctacatattatcctccattatctatcctcaagcact 2815458  T
Q  642 taattttcttctcagtttcaa 662  Q
    |||| || ||| |||||||||    
T  2815459 taatctttttcccagtttcaa 2815479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 121 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 42587593 - 42587084
Alignment:
Q  121 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgatac 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  42587593 agtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccacaagcgatac 42587494  T
Q  221 cccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaac 320  Q
    || || || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  42587493 cctttcacgttgtcagcataacccaagaatatacattttctagactttggatctagctttgttctttcttgggagttgtacattgcgtacacagtacatc 42587394  T
Q  321 caaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacata 420  Q
    | || ||||| |  |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||| |||| || |||||||| || ||||| || || ||    
T  42587393 cgaacacatgtaaggaagaataatcaggtggctttccgttccaaatctccattggtgtttacaaaccaattgcggttgatggagatcgattgatcacgta 42587294  T
Q  421 acaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgctct 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| | | |||||| ||| |||  |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42587293 acaggcggttttcacagcttctgcccagaaagacttagccactactgctgttctcaacatggctcttgttttatctaagagagttctattcatccgctct 42587194  T
Q  521 accacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctc 620  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| || ||||  | ||| || |||||||||||||||||||    
T  42587193 gctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaattgtcttgtaataccctcatgtttgcagaatgtcaaaaaatcaccatctacatattctcctc 42587094  T
Q  621 cattgtctgt 630  Q
    ||||||||||    
T  42587093 cattgtctgt 42587084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 600; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 828223 - 827580
Alignment:
Q  19 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctcttta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  828223 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctcttta 828124  T
Q  119 gaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  828123 gaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttctgcaaagactagatccctgctaacaacaaccttgcgggtagtgggatcccacaggcgat 828024  T
Q  219 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828023 accccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggaca 827924  T
Q  319 accaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 418  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827923 accaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattaca 827824  T
Q  419 taacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827823 taacaggcggttttcactgcttctgcacagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgct 827724  T
Q  519 ctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 618  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827723 ctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcc 827624  T
Q  619 tccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  827623 tccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaa 827580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 593; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 662
Target Start/End: Original strand, 9441664 - 9442308
Alignment:
Q  19 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacgatagcagtctcttta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9441664 attgacatcatctggttcttgttcttcgtgcaccggttcagcttcagaagaatcactttctttggatttttcttccatctgcacaatagcagtctcttta 9441763  T
Q  119 gaagtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttct-gcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441764 gaagtgctgtcatttttctgcttactttgcagttcattttcttgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcga 9441863  T
Q  218 taccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggac 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9441864 taccccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacatacacaggac 9441963  T
Q  318 aaccaaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattac 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9441964 aaccaaacacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcaccgttgatggtgagcgatttattac 9442063  T
Q  418 ataacaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgc 517  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442064 ataacaggcggttttcactgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcatagctcttgttctttctaggagagttctattcatccgc 9442163  T
Q  518 tctaccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctc 617  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442164 tctgccacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctc 9442263  T
Q  618 ctccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttcaa 662  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9442264 ctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttcccagtttcaa 9442308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 121 - 630
Target Start/End: Original strand, 24596163 - 24596672
Alignment:
Q  121 agtgctgtcatttttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatccctgctaacaacaaccttgcgggcagtgggatcccacaggcgatac 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  24596163 agtgttgtcatgtttctgctcactttgcagttcattttctgcaaagactacatctctgctaacaacaagcttgtgagcagtgggatcccataagcgatac 24596262  T
Q  221 cccttaacattgtcagcataacccaagaagatacatttcctggactttgggtccaacttcgttctttcttgggagttgtacatcacgtacacaggacaac 320  Q
    || || || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  24596263 cctttcacgttgtcagcataacccaagaatatacattttctagactttggatctagctttgttctttcttgggagttgtacattgcgtacacagtacatc 24596362  T
Q  321 caaaaacatgcagagaagaataatctactggctttcctttccacatctccatcggtgtcttcaaatcaatcgccgttgatggtgagcgatttattacata 420  Q
    | || ||||| |  |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||  || ||||| || || ||    
T  24596363 cgaacacatgtaaggaagaataatcaggtggctttccgttccaaatctccattggtgttttcaaaccaattgcggttgatgtagatcgattgatcacgta 24596462  T
Q  421 acaggcggttttcgctgcttctgcccagaacgacttggccattcccgctgttttcagcataactcttgttctttctaggagagttctattcatccgctct 520  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |   |||||| ||| |||  ||||| || | | || ||||||||||||||||||||||    
T  24596463 ataggcggttttcacagcttctgcccagaaagacttagccactattgctgttctcaacatggctctttttttatttaagagagttctattcatccgctct 24596562  T
Q  521 accacaccattctgctgaggtgtatgtgcaaccgtgaattgccttacaataccctcttgtttacaaaatgctagaaactcgccatctacatattctcctc 620  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| || ||||  | ||| || |||||||||||||||||||    
T  24596563 gctacaccattctgttgaggcgtatgtggaactgtgaattgtcttgtaataccctcatgtttgcagaatgtcaaaaaatcaccatctacatattctcctc 24596662  T
Q  621 cattgtctgt 630  Q
    ||||||||||    
T  24596663 cattgtctgt 24596672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 661
Target Start/End: Original strand, 8134716 - 8134771
Alignment:
Q  606 ctacatattctcctccattgtctgtcctcaggcacttaattttcttctcagtttca 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8134716 ctacatattctcctccattatctgtcctcaagcacttaattttcttctcaatttca 8134771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University