View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18561_low_2 (Length: 238)

Name: NF18561_low_2
Description: NF18561
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18561_low_2
NF18561_low_2
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (18-238)||(67944-68164)
chr2 (32-238)||(25305411-25305618)
chr2 (70-238)||(43645897-43646065)
chr2 (26-197)||(19433448-19433618)
chr2 (25-188)||(23821730-23821893)
chr2 (25-188)||(23830809-23830972)
chr2 (26-237)||(24884647-24884857)
chr2 (26-237)||(9636705-9636916)
chr2 (36-206)||(19666498-19666668)
chr2 (26-237)||(6094676-6094887)
chr2 (46-236)||(31146258-31146447)
chr2 (25-237)||(36890761-36890973)
chr2 (30-237)||(28974013-28974220)
chr2 (30-238)||(24571367-24571574)
chr2 (46-237)||(24277741-24277932)
chr2 (43-189)||(19669233-19669379)
chr2 (43-201)||(22138137-22138295)
chr2 (54-232)||(24294604-24294782)
chr2 (32-237)||(25601990-25602195)
chr2 (126-238)||(22775280-22775392)
chr2 (126-238)||(22780658-22780770)
chr2 (26-193)||(25594984-25595147)
chr2 (46-169)||(3385-3507)
chr2 (46-232)||(722375-722557)
chr2 (46-213)||(22579962-22580126)
chr2 (32-236)||(32465824-32466027)
chr2 (80-177)||(24560867-24560964)
chr2 (32-199)||(18536723-18536888)
chr2 (35-193)||(33128012-33128172)
chr2 (30-204)||(271135-271307)
chr2 (60-193)||(25265525-25265657)
chr2 (25-204)||(25876029-25876207)
chr2 (28-204)||(23836815-23836990)
chr2 (70-193)||(4448253-4448376)
chr2 (26-193)||(28031366-28031534)
chr2 (63-193)||(24341524-24341653)
chr2 (60-193)||(36982576-36982708)
chr2 (32-156)||(27261772-27261896)
chr2 (127-193)||(16292921-16292987)
chr2 (29-193)||(9653024-9653189)
chr2 (26-193)||(15633175-15633341)
chr2 (25-72)||(16935554-16935601)
chr2 (25-72)||(17006214-17006261)
chr2 (32-142)||(12636047-12636156)
chr2 (28-193)||(21274177-21274341)
chr2 (32-193)||(22274689-22274849)
chr2 (32-193)||(22283922-22284082)
chr2 (32-72)||(11231586-11231626)
chr2 (32-72)||(12728360-12728400)
chr2 (133-193)||(19794839-19794899)
chr2 (32-72)||(22513433-22513473)
chr2 (32-72)||(24686029-24686069)
chr2 (32-72)||(28776055-28776095)
chr2 (32-72)||(34824443-34824483)
chr2 (26-193)||(25213008-25213176)
chr2 (32-142)||(12641821-12641930)
chr2 (26-72)||(23778293-23778338)
chr2 (177-237)||(27261915-27261974)
chr2 (32-142)||(42178148-42178257)
chr2 (43-84)||(16293002-16293043)
chr2 (110-193)||(17204375-17204459)
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (18-238)||(39656478-39656698)
chr3 (26-238)||(12488801-12489013)
chr3 (25-234)||(11061084-11061294)
chr3 (26-237)||(12952924-12953135)
chr3 (46-238)||(11329036-11329228)
chr3 (44-238)||(3576513-3576707)
chr3 (49-238)||(17191524-17191713)
chr3 (28-238)||(9590829-9591039)
chr3 (26-237)||(34559860-34560070)
chr3 (44-237)||(14814841-14815034)
chr3 (46-238)||(14059288-14059480)
chr3 (30-238)||(14295402-14295611)
chr3 (26-237)||(6228701-6228912)
chr3 (28-237)||(54423975-54424183)
chr3 (25-238)||(17139467-17139680)
chr3 (74-238)||(16880131-16880295)
chr3 (46-236)||(15876048-15876238)
chr3 (30-238)||(14301029-14301238)
chr3 (30-238)||(55440923-55441132)
chr3 (46-238)||(12560311-12560503)
chr3 (30-237)||(31412409-31412616)
chr3 (36-190)||(17204670-17204824)
chr3 (43-237)||(41661542-41661736)
chr3 (46-190)||(47784870-47785014)
chr3 (39-204)||(14528121-14528286)
chr3 (26-187)||(33369034-33369195)
chr3 (26-221)||(1990763-1990957)
chr3 (26-234)||(4162284-4162489)
chr3 (36-237)||(50313157-50313358)
chr3 (26-237)||(43427592-43427801)
chr3 (46-177)||(38811144-38811275)
chr3 (26-199)||(10912846-10913018)
chr3 (128-238)||(30207278-30207388)
chr3 (26-237)||(12349615-12349830)
chr3 (43-206)||(14080486-14080649)
chr3 (26-237)||(17522965-17523176)
chr3 (25-193)||(38167873-38168041)
chr3 (28-237)||(17100614-17100824)
chr3 (28-237)||(17101299-17101509)
chr3 (26-187)||(38375804-38375961)
chr3 (37-237)||(17938544-17938745)
chr3 (46-237)||(11638337-11638528)
chr3 (30-204)||(35123661-35123833)
chr3 (110-238)||(3578133-3578261)
chr3 (30-204)||(14298386-14298558)
chr3 (30-204)||(14304013-14304185)
chr3 (30-193)||(3992513-3992677)
chr3 (70-237)||(50112127-50112294)
chr3 (46-177)||(17960449-17960580)
chr3 (26-237)||(8631751-8631961)
chr3 (28-174)||(23492335-23492481)
chr3 (51-236)||(16996137-16996321)
chr3 (29-237)||(19570764-19570971)
chr3 (25-193)||(45581590-45581758)
chr3 (47-152)||(51961298-51961403)
chr3 (28-213)||(13817477-13817658)
chr3 (25-237)||(19260915-19261124)
chr3 (32-193)||(16934101-16934262)
chr3 (46-204)||(53898565-53898721)
chr3 (28-236)||(317586-317793)
chr3 (26-193)||(11477318-11477485)
chr3 (26-177)||(12264937-12265086)
chr3 (26-193)||(30152902-30153069)
chr3 (28-193)||(2844152-2844318)
chr3 (28-193)||(15859159-15859324)
chr3 (32-174)||(17956131-17956273)
chr3 (28-193)||(53771002-53771168)
chr3 (28-194)||(54038251-54038417)
chr3 (26-193)||(8268872-8269038)
chr3 (26-193)||(19946660-19946826)
chr3 (32-204)||(22144382-22144553)
chr3 (60-180)||(47984646-47984765)
chr3 (60-180)||(47993933-47994052)
chr3 (60-180)||(48003220-48003339)
chr3 (60-180)||(48012506-48012625)
chr3 (26-193)||(33341843-33342008)
chr3 (71-204)||(6146856-6146987)
chr3 (37-193)||(8275972-8276127)
chr3 (92-204)||(6154441-6154552)
chr3 (26-193)||(7853944-7854109)
chr3 (71-203)||(12349841-12349971)
chr3 (82-193)||(14284977-14285089)
chr3 (63-194)||(17912616-17912745)
chr3 (26-193)||(54685429-54685594)
chr3 (32-142)||(18910961-18911070)
chr3 (32-193)||(13838862-13839022)
chr3 (49-204)||(16182055-16182209)
chr3 (203-238)||(17204818-17204853)
chr3 (203-238)||(47784841-47784876)
chr3 (71-193)||(16261458-16261580)
chr3 (29-103)||(28558169-28558243)
chr3 (32-72)||(1467987-1468027)
chr3 (79-199)||(11402602-11402722)
chr3 (32-72)||(49232404-49232444)
chr3 (126-199)||(12539184-12539257)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (25-236)||(52265585-52265796)
chr4 (26-238)||(15044788-15045000)
chr4 (26-238)||(15109424-15109636)
chr4 (32-238)||(41166021-41166227)
chr4 (26-229)||(7964795-7964997)
chr4 (26-237)||(18276395-18276605)
chr4 (26-237)||(41256445-41256656)
chr4 (36-238)||(14901202-14901404)
chr4 (26-237)||(15013358-15013569)
chr4 (26-236)||(7185921-7186128)
chr4 (30-237)||(18238233-18238440)
chr4 (26-193)||(40905054-40905220)
chr4 (26-237)||(38764666-38764880)
chr4 (47-238)||(13809585-13809776)
chr4 (29-237)||(13590150-13590358)
chr4 (26-237)||(41916802-41917013)
chr4 (36-234)||(47535144-47535323)
chr4 (25-237)||(12837276-12837484)
chr4 (32-237)||(16732135-16732340)
chr4 (31-237)||(54398348-54398554)
chr4 (30-238)||(18494402-18494611)
chr4 (26-237)||(50220016-50220233)
chr4 (43-237)||(13442752-13442949)
chr4 (96-238)||(27961001-27961143)
chr4 (50-177)||(19821912-19822039)
chr4 (32-204)||(34395223-34395394)
chr4 (43-204)||(30232606-30232766)
chr4 (46-177)||(37957161-37957292)
chr4 (29-120)||(47468522-47468613)
chr4 (92-232)||(21959544-21959684)
chr4 (28-193)||(23270054-23270219)
chr4 (63-193)||(15675224-15675353)
chr4 (32-237)||(44055881-44056086)
chr4 (31-236)||(53704811-53705015)
chr4 (26-193)||(55376717-55376884)
chr4 (63-193)||(31115628-31115757)
chr4 (126-236)||(47468425-47468535)
chr4 (26-193)||(14996089-14996255)
chr4 (26-193)||(19697500-19697666)
chr4 (26-193)||(19708085-19708251)
chr4 (25-76)||(15851593-15851644)
chr4 (126-193)||(10104385-10104452)
chr4 (26-193)||(14951722-14951889)
chr4 (71-237)||(30457909-30458074)
chr4 (70-193)||(45458975-45459098)
chr4 (28-193)||(15272440-15272606)
chr4 (71-204)||(820026-820154)
chr4 (26-177)||(8374471-8374620)
chr4 (37-143)||(8044913-8045019)
chr4 (126-236)||(8872549-8872658)
chr4 (26-193)||(16522779-16522946)
chr4 (26-187)||(17145791-17145950)
chr4 (29-236)||(53907777-53907980)
chr4 (126-193)||(40885689-40885756)
chr4 (29-204)||(44346790-44346964)
chr4 (32-142)||(7132244-7132353)
chr4 (32-193)||(25119335-25119497)
chr4 (28-193)||(54118379-54118544)
chr4 (32-72)||(18168938-18168978)
chr4 (60-176)||(26680197-26680312)
chr4 (40-193)||(9295668-9295822)
chr4 (124-193)||(14500344-14500414)
chr4 (32-193)||(5682655-5682816)
chr4 (60-193)||(13246426-13246558)
chr4 (126-199)||(21417366-21417439)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (32-238)||(76922-77128)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (32-238)||(23837164-23837370)
chr8 (39-238)||(21198227-21198426)
chr8 (26-237)||(26011455-26011665)
chr8 (26-237)||(5854575-5854785)
chr8 (26-238)||(33611128-33611340)
chr8 (46-238)||(38533629-38533821)
chr8 (26-237)||(15933259-15933469)
chr8 (28-221)||(27233159-27233352)
chr8 (26-233)||(18261551-18261758)
chr8 (26-221)||(33528387-33528580)
chr8 (26-237)||(33172188-33172399)
chr8 (26-237)||(45559013-45559224)
chr8 (26-237)||(18041608-18041819)
chr8 (46-238)||(22735912-22736105)
chr8 (36-206)||(23226183-23226353)
chr8 (99-236)||(29306450-29306587)
chr8 (44-237)||(38635724-38635917)
chr8 (26-237)||(19331390-19331602)
chr8 (46-238)||(39446841-39447032)
chr8 (26-237)||(22497285-22497496)
chr8 (28-237)||(37653692-37653899)
chr8 (26-237)||(22742721-22742935)
chr8 (25-237)||(20481564-20481776)
chr8 (36-206)||(23149751-23149918)
chr8 (43-237)||(45465202-45465396)
chr8 (146-238)||(22981353-22981445)
chr8 (36-206)||(23158133-23158300)
chr8 (43-189)||(23151957-23152103)
chr8 (31-237)||(24552646-24552852)
chr8 (46-238)||(21680982-21681175)
chr8 (70-237)||(20647905-20648072)
chr8 (30-204)||(20573302-20573474)
chr8 (70-237)||(20653981-20654148)
chr8 (46-177)||(31194460-31194591)
chr8 (32-213)||(41246624-41246804)
chr8 (25-187)||(16039015-16039177)
chr8 (28-193)||(274405-274570)
chr8 (28-193)||(641279-641444)
chr8 (28-193)||(827085-827250)
chr8 (26-199)||(20709650-20709825)
chr8 (134-237)||(20561707-20561810)
chr8 (30-114)||(25296145-25296229)
chr8 (30-114)||(25758165-25758249)
chr8 (37-122)||(17285238-17285323)
chr8 (185-238)||(17285323-17285376)
chr8 (71-204)||(37611674-37611805)
chr8 (32-193)||(3431408-3431569)
chr8 (46-168)||(15969799-15969920)
chr8 (81-199)||(16002013-16002130)
chr8 (39-193)||(41506937-41507091)
chr8 (28-204)||(19993164-19993339)
chr8 (129-237)||(25296222-25296329)
chr8 (28-204)||(22234913-22235088)
chr8 (129-237)||(25758242-25758349)
chr8 (26-100)||(29297799-29297876)
chr8 (32-142)||(13721107-13721216)
chr8 (26-193)||(22886287-22886454)
chr8 (36-193)||(24716990-24717147)
chr8 (26-142)||(18612368-18612482)
chr8 (26-142)||(18619273-18619387)
chr8 (30-142)||(20567329-20567440)
chr8 (30-142)||(20573522-20573633)
chr8 (28-144)||(24385920-24386037)
chr8 (40-193)||(39115249-39115402)
chr8 (32-72)||(271608-271648)
chr8 (32-72)||(644272-644312)
chr8 (32-72)||(830007-830047)
chr8 (32-72)||(15319407-15319447)
chr8 (32-72)||(15499776-15499816)
chr8 (32-72)||(22089042-22089082)
chr8 (60-176)||(22907365-22907480)
chr8 (32-71)||(22006507-22006546)
chr8 (32-72)||(13662513-13662553)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (26-238)||(13377489-13377701)
chr7 (36-238)||(17224013-17224215)
chr7 (26-237)||(48356605-48356815)
chr7 (26-237)||(16915004-16915214)
chr7 (26-237)||(9838841-9839050)
chr7 (26-237)||(20583630-20583844)
chr7 (25-237)||(13863005-13863218)
chr7 (26-237)||(9611269-9611479)
chr7 (26-237)||(4484687-4484898)
chr7 (43-237)||(31501150-31501344)
chr7 (46-238)||(49047749-49047941)
chr7 (26-237)||(38424179-38424390)
chr7 (25-237)||(26070340-26070552)
chr7 (25-237)||(26094127-26094339)
chr7 (29-237)||(9723883-9724091)
chr7 (26-237)||(14935323-14935531)
chr7 (26-237)||(15362916-15363124)
chr7 (26-237)||(14271975-14272172)
chr7 (107-238)||(16919600-16919731)
chr7 (31-190)||(34241311-34241470)
chr7 (26-237)||(14940713-14940926)
chr7 (33-199)||(46473968-46474134)
chr7 (26-237)||(4446172-4446383)
chr7 (30-237)||(11287381-11287588)
chr7 (43-237)||(13448903-13449097)
chr7 (30-228)||(17947677-17947875)
chr7 (30-238)||(12248195-12248404)
chr7 (43-237)||(28390289-28390483)
chr7 (46-202)||(13274767-13274923)
chr7 (26-237)||(15358758-15358968)
chr7 (48-238)||(16570080-16570271)
chr7 (48-238)||(16595391-16595582)
chr7 (26-237)||(15368306-15368519)
chr7 (29-237)||(3894988-3895196)
chr7 (25-237)||(12369916-12370128)
chr7 (26-187)||(45149563-45149723)
chr7 (36-236)||(7284137-7284336)
chr7 (32-213)||(15822531-15822712)
chr7 (47-193)||(3049564-3049710)
chr7 (28-173)||(9321176-9321321)
chr7 (26-237)||(8267804-8267999)
chr7 (126-237)||(28722169-28722281)
chr7 (92-237)||(12759013-12759158)
chr7 (29-237)||(33559616-33559818)
chr7 (26-137)||(4438781-4438893)
chr7 (25-193)||(32494174-32494342)
chr7 (28-206)||(42056405-42056583)
chr7 (29-193)||(111397-111560)
chr7 (29-193)||(39046743-39046907)
chr7 (28-193)||(13320977-13321143)
chr7 (61-152)||(25124125-25124216)
chr7 (26-193)||(126375-126542)
chr7 (28-193)||(2028882-2029048)
chr7 (32-193)||(371056-371217)
chr7 (28-193)||(2190314-2190480)
chr7 (70-237)||(45452244-45452409)
chr7 (32-142)||(18980200-18980309)
chr7 (71-204)||(47289787-47289918)
chr7 (60-176)||(7293013-7293128)
chr7 (130-204)||(143703-143776)
chr7 (79-201)||(8563460-8563582)
chr7 (63-193)||(47481166-47481295)
chr7 (164-237)||(4438881-4438954)
chr7 (32-72)||(7822696-7822736)
chr7 (32-72)||(7830007-7830047)
chr7 (32-72)||(27101885-27101925)
chr7 (32-72)||(27109233-27109273)
chr7 (32-72)||(27176401-27176441)
chr7 (32-72)||(38783977-38784017)
chr7 (32-142)||(14251077-14251186)
chr7 (26-72)||(15852419-15852464)
chr7 (32-142)||(15927536-15927645)
chr7 (126-204)||(44865290-44865367)
chr7 (60-153)||(36052663-36052755)
chr7 (32-72)||(15951039-15951079)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (26-238)||(432423-432635)
chr5 (40-238)||(19862183-19862381)
chr5 (26-238)||(5450918-5451130)
chr5 (26-238)||(3673822-3674034)
chr5 (29-236)||(23493882-23494089)
chr5 (26-237)||(21616977-21617187)
chr5 (31-237)||(21222684-21222890)
chr5 (46-238)||(7728400-7728592)
chr5 (36-237)||(6456594-6456795)
chr5 (26-206)||(23981623-23981802)
chr5 (26-237)||(24084038-24084248)
chr5 (46-233)||(37983344-37983531)
chr5 (26-237)||(1168280-1168491)
chr5 (30-237)||(29917929-29918136)
chr5 (26-237)||(21109710-21109921)
chr5 (46-238)||(16595488-16595679)
chr5 (26-237)||(26559891-26560102)
chr5 (25-237)||(20712035-20712247)
chr5 (127-235)||(28902252-28902360)
chr5 (127-235)||(28938647-28938755)
chr5 (26-199)||(16835413-16835586)
chr5 (26-199)||(23417202-23417374)
chr5 (30-237)||(23234561-23234768)
chr5 (30-237)||(11337262-11337467)
chr5 (46-238)||(19405517-19405710)
chr5 (92-237)||(22885668-22885813)
chr5 (26-154)||(19873804-19873932)
chr5 (28-193)||(21650657-21650822)
chr5 (26-199)||(24225431-24225604)
chr5 (46-177)||(32966283-32966414)
chr5 (32-193)||(9730510-9730671)
chr5 (63-193)||(22053968-22054097)
chr5 (70-193)||(21906724-21906844)
chr5 (27-96)||(22882386-22882455)
chr5 (39-193)||(2031783-2031937)
chr5 (26-213)||(11584012-11584201)
chr5 (63-193)||(18531202-18531331)
chr5 (70-168)||(23466461-23466559)
chr5 (126-213)||(24183232-24183319)
chr5 (26-177)||(11212209-11212358)
chr5 (72-193)||(7528906-7529028)
chr5 (26-199)||(11763619-11763795)
chr5 (28-193)||(21204887-21205053)
chr5 (32-204)||(21397055-21397229)
chr5 (126-237)||(21297251-21297361)
chr5 (26-177)||(35791243-35791392)
chr5 (29-204)||(24475546-24475715)
chr5 (46-204)||(28261501-28261658)
chr5 (26-193)||(108960-109127)
chr5 (168-237)||(21310785-21310854)
chr5 (26-193)||(11342644-11342812)
chr5 (32-142)||(10778149-10778258)
chr5 (26-193)||(16105604-16105771)
chr5 (60-193)||(27182682-27182814)
chr5 (32-72)||(1219768-1219808)
chr5 (26-193)||(17909467-17909633)
chr5 (32-72)||(21932629-21932669)
chr5 (32-72)||(21938799-21938839)
chr5 (32-72)||(22883332-22883372)
chr5 (47-187)||(32950676-32950815)
chr5 (32-72)||(35582004-35582044)
chr5 (32-72)||(36990018-36990058)
chr5 (32-142)||(23514529-23514638)
chr5 (29-174)||(21646878-21647023)
chr5 (60-193)||(23506961-23507093)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (18-237)||(25651189-25651408)
chr6 (32-238)||(18381758-18381964)
chr6 (26-238)||(22361840-22362051)
chr6 (26-238)||(18398899-18399110)
chr6 (46-238)||(21623148-21623340)
chr6 (36-237)||(33538445-33538646)
chr6 (47-238)||(25367312-25367503)
chr6 (28-237)||(18629684-18629896)
chr6 (26-237)||(34966827-34967038)
chr6 (26-237)||(29605410-29605621)
chr6 (26-237)||(29160379-29160590)
chr6 (46-187)||(19854135-19854276)
chr6 (30-237)||(22462173-22462378)
chr6 (43-206)||(33324670-33324833)
chr6 (43-206)||(35136119-35136282)
chr6 (28-237)||(23221876-23222087)
chr6 (26-237)||(23222707-23222922)
chr6 (26-236)||(17083274-17083465)
chr6 (30-237)||(18777110-18777317)
chr6 (46-237)||(31628248-31628439)
chr6 (46-177)||(25919593-25919724)
chr6 (92-238)||(21411125-21411270)
chr6 (46-238)||(28195168-28195360)
chr6 (43-206)||(16887899-16888062)
chr6 (71-237)||(17557093-17557258)
chr6 (29-237)||(18570243-18570450)
chr6 (43-206)||(15079815-15079977)
chr6 (43-235)||(17013717-17013910)
chr6 (60-193)||(35009574-35009706)
chr6 (32-193)||(35015285-35015446)
chr6 (92-237)||(18432669-18432814)
chr6 (32-237)||(32898756-32898961)
chr6 (43-237)||(19672272-19672457)
chr6 (29-193)||(18002624-18002787)
chr6 (29-193)||(26089699-26089862)
chr6 (28-193)||(23994884-23995050)
chr6 (126-236)||(32352107-32352217)
chr6 (28-193)||(15742348-15742516)
chr6 (71-204)||(22440940-22441071)
chr6 (161-238)||(22848110-22848187)
chr6 (26-193)||(19629293-19629458)
chr6 (26-193)||(32276891-32277057)
chr6 (46-177)||(15740209-15740340)
chr6 (28-187)||(25744339-25744498)
chr6 (32-142)||(16231860-16231969)
chr6 (32-142)||(18087002-18087111)
chr6 (126-237)||(16106576-16106687)
chr6 (49-185)||(16300116-16300252)
chr6 (32-173)||(19983439-19983580)
chr6 (128-193)||(29665936-29666001)
chr6 (30-90)||(22848016-22848076)
chr6 (71-237)||(16086022-16086188)
chr6 (36-193)||(18823515-18823672)
chr6 (63-193)||(27740837-27740966)
chr6 (32-72)||(10488667-10488707)
chr6 (32-72)||(16376621-16376661)
chr6 (32-72)||(16383945-16383985)
chr6 (32-72)||(16556387-16556427)
chr6 (32-72)||(16632943-16632983)
chr6 (126-206)||(21931263-21931343)
chr6 (126-193)||(18583377-18583444)
chr6 (33-72)||(33314466-33314505)
chr6 (36-193)||(18839370-18839527)
chr6 (43-105)||(32352040-32352102)
chr6 (26-193)||(4991033-4991200)
chr6 (60-193)||(14626253-14626385)
chr6 (26-103)||(18583295-18583370)
chr6 (126-199)||(19175210-19175283)
chr6 (26-151)||(19609981-19610104)
chr6 (32-72)||(22225986-22226026)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (26-238)||(2391-2603)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (32-238)||(20177141-20177347)
chr1 (26-237)||(17608889-17609099)
chr1 (26-237)||(37233936-37234146)
chr1 (21-236)||(21194969-21195184)
chr1 (30-238)||(51627739-51627947)
chr1 (39-206)||(22143468-22143635)
chr1 (26-237)||(40436345-40436556)
chr1 (26-237)||(33397312-33397523)
chr1 (26-237)||(8537986-8538196)
chr1 (26-237)||(8603225-8603435)
chr1 (32-190)||(13376963-13377121)
chr1 (129-238)||(16645975-16646084)
chr1 (127-235)||(16656699-16656807)
chr1 (26-237)||(52400591-52400802)
chr1 (26-199)||(76487-76659)
chr1 (26-236)||(5768246-5768462)
chr1 (46-156)||(41229096-41229206)
chr1 (25-237)||(35054715-35054927)
chr1 (49-232)||(36356374-36356557)
chr1 (43-237)||(49997357-49997551)
chr1 (26-226)||(25093826-25094019)
chr1 (30-193)||(35522439-35522601)
chr1 (25-204)||(27329865-27330040)
chr1 (75-237)||(21718237-21718399)
chr1 (26-170)||(20194005-20194149)
chr1 (46-177)||(19603077-19603208)
chr1 (46-177)||(27674777-27674907)
chr1 (46-232)||(38033755-38033940)
chr1 (46-177)||(22829560-22829691)
chr1 (126-237)||(9784140-9784248)
chr1 (37-176)||(9784237-9784377)
chr1 (29-193)||(21859974-21860138)
chr1 (32-193)||(21650167-21650328)
chr1 (48-177)||(20955575-20955704)
chr1 (71-204)||(22403220-22403351)
chr1 (26-174)||(22366979-22367127)
chr1 (30-236)||(41212033-41212241)
chr1 (93-204)||(49967677-49967787)
chr1 (32-142)||(17148535-17148644)
chr1 (60-193)||(20445675-20445807)
chr1 (60-193)||(20531440-20531572)
chr1 (26-193)||(15861554-15861719)
chr1 (32-72)||(17004606-17004646)
chr1 (32-72)||(18060006-18060046)
chr1 (32-72)||(38055339-38055379)
chr1 (35-187)||(44035105-44035256)
chr1 (60-187)||(37844592-37844718)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (25-238)||(5899-6114)
scaffold0342 (33-193)||(579-739)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (26-236)||(28497-28706)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-237)||(69418-69628)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (36-238)||(35449-35650)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (38-237)||(2497-2696)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (36-238)||(6631-6833)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (25-237)||(4522-4735)
scaffold0447 (25-237)||(9136-9349)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (51-236)||(7102-7287)
scaffold0162 (60-172)||(8333-8444)
scaffold0162 (49-170)||(11730-11850)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (25-237)||(7130-7344)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (26-237)||(6504-6715)
scaffold0077 (25-204)||(15581-15762)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (26-237)||(30981-31191)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (25-238)||(11054-11266)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (25-204)||(46124-46302)
scaffold0034 (25-204)||(40617-40795)
scaffold0034 (25-193)||(79820-79991)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (26-238)||(43873-44084)
scaffold0080 (26-237)||(23748-23959)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (46-238)||(109570-109762)
scaffold0022 (46-238)||(102997-103189)
scaffold0022 (26-199)||(68072-68244)
scaffold0022 (46-237)||(112621-112809)
scaffold0022 (43-169)||(131813-131939)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (36-211)||(279-454)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (25-237)||(33624-33833)
scaffold0103 (127-199)||(33540-33612)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (43-234)||(197332-197523)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (26-237)||(7751-7962)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (26-237)||(97274-97484)
scaffold0031 (129-238)||(70676-70786)
scaffold0031 (46-238)||(31024-31216)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (30-221)||(2419-2610)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (39-238)||(8957-9156)
scaffold0480 (28-204)||(5356-5531)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (26-237)||(53308-53517)
scaffold0025 (26-237)||(85493-85704)
scaffold0025 (25-237)||(146560-146772)
scaffold0025 (63-193)||(8848-8977)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (26-238)||(27457-27669)
scaffold0004 (26-236)||(86317-86527)
scaffold0004 (28-151)||(193657-193781)
scaffold0004 (28-151)||(186695-186822)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (43-237)||(3229-3422)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (26-228)||(7362-7564)
scaffold0253 (26-228)||(16787-16989)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (32-237)||(4907-5112)
scaffold0075 (107-187)||(34601-34682)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (46-238)||(33803-33994)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (43-206)||(104730-104892)
scaffold0032 (46-238)||(93848-94039)
scaffold0032 (28-193)||(55542-55708)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (25-237)||(652-864)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (26-206)||(22529-22709)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (26-237)||(21473-21683)
scaffold0120 (26-236)||(31172-31381)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (43-206)||(79516-79679)
scaffold0028 (127-193)||(89589-89655)
scaffold0028 (26-193)||(130517-130684)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (30-238)||(159266-159472)
scaffold0014 (32-237)||(85298-85503)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (43-237)||(29941-30135)
scaffold0165 (45-237)||(21978-22170)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (43-237)||(37535-37729)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (58-236)||(3311-3489)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (30-237)||(109538-109745)
scaffold0035 (30-237)||(118039-118246)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (39-238)||(11660-11860)
scaffold0021 (32-236)||(132327-132531)
scaffold0021 (117-237)||(88326-88446)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (26-237)||(107971-108180)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (26-237)||(4566-4776)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (26-150)||(1109-1236)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (29-237)||(24804-25012)
scaffold0037 (28-187)||(94937-95096)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (30-237)||(8951-9158)
[»] scaffold0390 (3 HSPs)
scaffold0390 (43-201)||(15953-16111)
scaffold0390 (43-201)||(2969-3127)
scaffold0390 (43-135)||(5159-5251)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (30-238)||(1880-2088)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (26-213)||(106-291)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (50-201)||(7994-8145)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (43-201)||(4436-4594)
scaffold0786 (43-135)||(1571-1663)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (32-233)||(253069-253270)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (26-199)||(988-1160)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (26-236)||(1341-1551)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (43-206)||(10639-10802)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (25-214)||(617-806)
scaffold0195 (60-193)||(19202-19334)
scaffold0195 (60-193)||(21286-21418)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (26-177)||(1795-1944)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (43-206)||(70413-70576)
[»] scaffold0016 (5 HSPs)
scaffold0016 (36-139)||(116687-116790)
scaffold0016 (28-202)||(164177-164350)
scaffold0016 (165-238)||(116628-116700)
scaffold0016 (32-174)||(162325-162468)
scaffold0016 (32-118)||(166460-166546)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (26-120)||(90037-90131)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (26-199)||(12848-13020)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (26-199)||(33528-33700)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (46-213)||(9917-10084)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (58-237)||(13-192)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (29-199)||(2886-3059)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (44-237)||(1295-1488)
scaffold0359 (71-204)||(11764-11892)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (25-125)||(147515-147612)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (26-193)||(17441-17610)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (26-193)||(61354-61523)
scaffold0023 (32-72)||(154255-154295)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (49-206)||(1653-1812)
scaffold0456 (49-206)||(8798-8957)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (43-235)||(25322-25515)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (26-237)||(190-399)
scaffold0310 (130-237)||(6484-6591)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (26-187)||(68004-68168)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (32-204)||(254924-255095)
scaffold0011 (32-204)||(261530-261701)
scaffold0011 (60-193)||(123299-123431)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (80-199)||(12779-12898)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (28-174)||(9654-9800)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (32-186)||(10101-10255)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (28-193)||(17532-17697)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (60-193)||(41644-41776)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (26-174)||(3261-3407)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (30-237)||(11784-11990)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (26-213)||(24921-25105)
scaffold0158 (92-213)||(25237-25358)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (70-237)||(11644-11811)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (43-142)||(5934-6033)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (70-193)||(60810-60933)
scaffold0001 (32-237)||(70698-70903)
scaffold0001 (32-194)||(171873-172034)
scaffold0001 (32-194)||(177576-177737)
scaffold0001 (124-193)||(165093-165163)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (28-193)||(1106-1272)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (28-193)||(13514-13680)
scaffold0251 (28-193)||(21488-21654)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (28-193)||(14910-15076)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (32-237)||(22657-22862)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (60-193)||(13502-13634)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (26-193)||(49975-50142)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (32-237)||(898-1103)
scaffold0673 (28-204)||(6955-7133)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (92-237)||(7595-7740)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (43-137)||(22594-22688)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (32-174)||(30057-30199)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (43-116)||(1652-1725)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (32-193)||(6211-6372)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (27-80)||(1299-1352)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (41-193)||(6671-6823)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (28-204)||(32165-32340)
scaffold0091 (28-204)||(41963-42138)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (30-193)||(12648-12811)
scaffold0039 (25-173)||(19049-19197)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (46-144)||(7814-7912)
scaffold0589 (176-238)||(7915-7977)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (26-187)||(5714-5875)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (32-237)||(38264-38469)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (32-193)||(31408-31569)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (32-193)||(41275-41436)
scaffold0078 (60-176)||(37217-37332)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (71-236)||(48153-48316)
scaffold0068 (71-236)||(61601-61764)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (35-193)||(51317-51463)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (126-237)||(14096-14207)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (26-193)||(5183-5349)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (28-204)||(14839-15011)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (27-76)||(16188-16237)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (41-166)||(183-308)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (60-193)||(1120-1252)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (46-193)||(6343-6490)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (71-115)||(3321-3365)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (28-103)||(22722-22797)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (26-193)||(54378-54544)
scaffold0066 (129-193)||(45094-45158)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (60-193)||(2958-3091)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (26-193)||(17662-17826)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (39-148)||(24362-24471)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (32-72)||(31277-31317)
scaffold0107 (32-72)||(39614-39654)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (32-72)||(39071-39111)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (32-72)||(29130-29170)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 67944 - 68164
Alignment:
Q  18 cacaaactacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67944 cacaaactacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaata 68043  T
Q  118 tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68044 tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcac 68143  T
Q  218 tttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  68144 tttctcatactttgaacatga 68164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Original strand, 25305411 - 25305618
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25305411 tttcgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaa 25305510  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa-caacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25305511 caacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacacatatcactttctcatacttt 25305610  T
Q  231 gaacatga 238  Q
    ||||||||    
T  25305611 gaacatga 25305618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 70 - 238
Target Start/End: Original strand, 43645897 - 43646065
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43645897 caaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaaca 43645996  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43645997 acaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttaaacatga 43646065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19433618 - 19433448
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19433618 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttag 19433520  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19433519 caacaacaacatcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatttgag 19433448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23821893 - 23821730
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23821893 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcactta 23821794  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23821793 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattcaa 23821730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23830972 - 23830809
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23830972 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcactta 23830873  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23830872 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattcaa 23830809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 24884647 - 24884857
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  24884647 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcatttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctattag 24884745  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||  |||  ||||||||||||| |||    
T  24884746 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataactcacaatatatcactttcacat 24884845  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  24884846 actttgaacatg 24884857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 9636705 - 9636916
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||| ||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  9636705 acccattttaacaaaaccaacaacaacaagttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 9636804  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||| |||    
T  9636805 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcataattcacaatatatcattttcacat 9636904  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  9636905 actatgaacatg 9636916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 19666498 - 19666668
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19666498 acaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaac 19666597  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    ||||||||||||||  ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19666598 atcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataattca 19666668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 6094676 - 6094887
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  6094676 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattccacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 6094775  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  6094776 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 6094875  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  6094876 actatgaacatg 6094887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31146447 - 31146258
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||| |||| |||| ||| || ||| |||||||||||| ||||  | ||||||| | | || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31146447 caacaataactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaattgaa 31146348  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 236  Q
    || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31146347 caggaatcttattacaattcaacaaca-catagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 31146258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36890973 - 36890761
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | || |||||||||||| | || | |||| ||||||||    
T  36890973 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcactta 36890874  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||  || ||||||    
T  36890873 gcaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatattccattttctc 36890775  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  36890774 atactttgaacatg 36890761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 28974013 - 28974220
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||    
T  28974013 attttcactaaaacaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 28974112  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  28974113 aacaacatcaattgatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaa-atgagcatattttcaacatataccattttctcatact 28974211  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  28974212 ttgaacatg 28974220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24571574 - 24571367
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||| || |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||  | |  ||||| |||| | | || |||||| |||||||| ||||    
T  24571574 atttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaac 24571476  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactt 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  24571475 aacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatatttcaacatatatcattttctcatacct 24571376  T
Q  230 tgaacatga 238  Q
    |||||||||    
T  24571375 tgaacatga 24571367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Original strand, 24277741 - 24277932
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||    
T  24277741 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaa 24277840  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  24277841 catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatg 24277932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19669379 - 19669233
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19669379 caacaacaacaactcatttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaatt 19669280  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaac 189  Q
    |||||||  ||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19669279 gaacatggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaac 19669233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 201
Target Start/End: Original strand, 22138137 - 22138295
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138137 caacaacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 22138236  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 201  Q
     ||||||  |||   || ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  22138237 aaacatggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 22138295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24294782 - 24294604
Alignment:
Q  54 acttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatc 153  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24294782 acttatttctcatccacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatc 24294683  T
Q  154 ttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttga 232  Q
    | | || ||||||||| ||||||| || ||||  ||| || ||||||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24294682 tcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttggagcataatataacatatatcattttcatatactttga 24294604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 25601990 - 25602195
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | ||  ||||||||| | | ||  ||||| || || |||||||||    
T  25601990 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaacaa 25602089  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25602090 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaa-ttgagcatattttcaacatatatcaatttctcatacttt 25602188  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  25602189 gaacatg 25602195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22775392 - 22775280
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  22775392 caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaattcaacatatataactttctcat 22775293  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  22775292 actttgaacatga 22775280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22780770 - 22780658
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  22780770 caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaattcaacatatataactttctcat 22780671  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  22780670 actttgaacatga 22780658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 25594984 - 25595147
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||   | || ||||     
T  25594984 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaa---tctctcttaa 25595079  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25595080 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaaaaacaacatagcacaattcaacaatt 25595147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3507 - 3385
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3507 caacaacaactcatttctcatctacaa-tcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 3409  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||||| || | || |||||||||    
T  3408 catgaacctaagcataattcaaca 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Original strand, 722375 - 722557
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  722375 caacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaactacttcaattgaa 722474  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttga 232  Q
    ||||||||| | || ||||||||| ||||||| || ||||  ||| || |||||||    ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  722475 catgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcata----aacatatatcattttcatatactttga 722557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22580126 - 22579962
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||  || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||||| || || || |||||||||||||     
T  22580126 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcagcaacatcaattgat 22580027  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatata 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22580026 catgaaacttatcacaattcaacaacaa---agcataattcaaccaattgagcatatttcaacatata 22579962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 32465824 - 32466027
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||||||    
T  32465824 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 32465923  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg 231  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||  ||| ||||||||||    
T  32465924 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatatccatttttcatactttg 32466022  T
Q  232 aacat 236  Q
    |||||    
T  32466023 aacat 32466027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24560964 - 24560867
Alignment:
Q  80 attatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24560964 attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacata 24560867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 18536723 - 18536888
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | |  | ||||    
T  18536723 tttcacaaaactaacaacaacaactaaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacac-caagctatgaatcatcaacaacagtatctcatgacgacaa 18536820  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  18536821 caacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaatttaacaattagagca 18536888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 193
Target Start/End: Original strand, 33128012 - 33128172
Alignment:
Q  35 cacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacg---caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||    
T  33128012 cacaaaaccgataacaacaacttatttcaaatca-caaatcatgagttatgaacaccacccaagccatgaatcattaacaacaatatctcttaaccacaa 33128110  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  33128111 caatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 33128172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 271135 - 271307
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || ||| |||| || |||||||||||| ||| | || ||||| |||||| | || |||||| || || || ||||    
T  271135 attttcaccaaagcaccaacaacatctcattcctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 271233  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  271234 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaa-ttgagcatattt 271307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25265657 - 25265525
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||| |||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  25265657 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatca 25265559  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25265558 taattcaacaacaacatagcaaaattcaccaatt 25265525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25876207 - 25876029
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||  || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| |    
T  25876207 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaataacaagccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaa 25876108  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
     ||| ||||||| || |||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25876107 acaataacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 25876029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23836990 - 23836815
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||| | || |||| ||||||| | || |||||| || ||| | ||    
T  23836990 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaaca 23836891  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23836890 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 23836815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4448376 - 4448253
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  4448376 caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaaca 4448277  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||    
T  4448276 acaacaaagcatcattcaccaatt 4448253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28031534 - 28031366
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| || |||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || |    
T  28031534 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatctcattttctcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctca 28031436  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28031435 acaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatatcataattcatcaatt 28031366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24341653 - 24341524
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||||  || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||    
T  24341653 tcatcatcaattcatgaat-atgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaa 24341555  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  24341554 ttcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 24341524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36982708 - 36982576
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||| | |||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || |     
T  36982708 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataact 36982610  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  36982609 caattcaacaacaacttggcaaaattcaccaatt 36982576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Original strand, 27261772 - 27261896
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||| | || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||    
T  27261772 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 27261871  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatctta 156  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  27261872 caatatcaattgatcatgaaactta 27261896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16292987 - 16292921
Alignment:
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16292987 aacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagtacaattcaacaatt 16292921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9653189 - 9653024
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatc-aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||    
T  9653189 cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 9653090  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||   || | ||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  9653089 acatcaacatctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 9653024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 15633175 - 15633341
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||  | ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||    
T  15633175 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcactaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcat-agcaacaacatatctcag 15633272  T
Q  126 caacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15633273 caacaacaacatcaattgaaacttgtttctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 15633341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 72
Target Start/End: Original strand, 16935554 - 16935601
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16935554 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 16935601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 72
Target Start/End: Original strand, 17006214 - 17006261
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17006214 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 17006261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12636156 - 12636047
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||   ||||||||| ||| |||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  12636156 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaac-aattatggtatatgaacacccaatccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 12636058  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  12636057 caacatcaatt 12636047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21274341 - 21274177
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||| | |||||| |||   || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  21274341 ccattttcaccaaaccaacaaca-caacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgct-acccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 21274244  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  21274243 aacaacaacatctattgatcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 21274177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 22274689 - 22274849
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || ||| |||||||| ||| | || ||||||||  |||| || ||||||||| ||| | || |||    
T  22274689 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaatcatgca-acccaagccatctatcatcatcaacaatatgactaaacatcaa 22274787  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| | ||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  22274788 caacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 22274849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 22283922 - 22284082
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||| |||||||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||||||  ||| | || |||    
T  22283922 tttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgca-acccaagccatgtatcatcatcaacaataagactaaacatcaa 22284020  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||| | ||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  22284021 aaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 22284082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11231626 - 11231586
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11231626 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 11231586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 12728360 - 12728400
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12728360 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 12728400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19794899 - 19794839
Alignment:
Q  133 aacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  19794899 aacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 19794839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22513473 - 22513433
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22513473 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 22513433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24686069 - 24686029
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24686069 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 24686029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 28776095 - 28776055
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28776095 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 28776055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 34824443 - 34824483
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34824443 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 34824483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 25213008 - 25213176
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa--atcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactt 123  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| || ||| |||  |||||||  ||||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  ||     
T  25213008 acccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttttc-tcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcattatcaacaacatatctc 25213105  T
Q  124 agcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  25213106 agcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 25213176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12641930 - 12641821
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | | | |||   ||||||||| |||||||| |||||    |||||| ||  || ||||||||    
T  12641930 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaac-acttatggtatatgaacacccaagccataaatcatactcaacaacatatctcagcaacaa 12641832  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  12641831 caacatcaatt 12641821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23778338 - 23778293
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23778338 acccattttctcaaaac-aacaacaacatcttatttctcatcatcaa 23778293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 27261915 - 27261974
Alignment:
Q  177 agcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27261915 agcataattcaccaat--gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatg 27261974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 42178257 - 42178148
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  ||   ||||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  42178257 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaac-aattttggtatatgaacacccaagccataagtcataatcaacaacatatctcagcaacaa 42178159  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  42178158 caacatcaatt 42178148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 16293043 - 16293002
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattat 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16293043 caacaacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttat 16293002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 17204375 - 17204459
Alignment:
Q  110 caacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17204375 caacaatatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 17204459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 39656478 - 39656698
Alignment:
Q  18 cacaaactacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaata 117  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||    
T  39656478 cacaaactacccattttttcaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaata 39656577  T
Q  118 tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcac 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39656578 tcacttagcaacaaccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcac 39656677  T
Q  218 tttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39656678 tttctcatactttgaacatga 39656698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12489013 - 12488801
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  12489013 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttag 12488914  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12488913 caacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat 12488814  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  12488813 actttgaacatga 12488801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11061294 - 11061084
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11061294 tacccattttcaccaaatcaacaacaataacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 11061195  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  11061194 gcaccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctc 11061095  T
Q  224 atactttgaac 234  Q
    |||||||||||    
T  11061094 atactttgaac 11061084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 12952924 - 12953135
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12952924 acccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttag 12953023  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  12953024 caacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcatat 12953123  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  12953124 actttgaacatg 12953135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11329228 - 11329036
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11329228 caacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 11329129  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11329128 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatga 11329036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3576707 - 3576513
Alignment:
Q  44 aacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  3576707 aacaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatca 3576608  T
Q  144 aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3576607 aacatgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataattcaatatatatcactttctcatacattgaacatga 3576513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 17191524 - 17191713
Alignment:
Q  49 caacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacat 148  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17191524 caacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaattaaacat 17191623  T
Q  149 gaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17191624 gattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacataaatcactttctcatactttgaacatga 17191713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9591039 - 9590829
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  9591039 ccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaaca 9590940  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatac 227  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    ||| ||||||| |||||    
T  9590939 acaacaacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcataattcatatcataccactttcacatac 9590840  T
Q  228 tttgaacatga 238  Q
    |||||||||||    
T  9590839 tttgaacatga 9590829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 34559860 - 34560070
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34559860 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 34559958  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||| || ||| ||| |||    
T  34559959 caacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaacaactacataacataattcaaaatttagagcataattcaacatgtaacacattcacat 34560058  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    | ||||||||||    
T  34560059 attttgaacatg 34560070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14815034 - 14814841
Alignment:
Q  44 aacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  14815034 aacaacaacaacttatttctcatcatcaaattatgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatta 14814935  T
Q  144 aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  14814934 aacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatg 14814841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14059480 - 14059288
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14059480 caacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaa 14059381  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14059380 catgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcatatttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatga 14059288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Original strand, 14295402 - 14295611
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||    
T  14295402 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaac 14295501  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  14295502 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatact 14295601  T
Q  229 ttgaacatga 238  Q
    ||||||||||    
T  14295602 ttgaacatga 14295611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6228912 - 6228701
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  6228912 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatttcttag 6228813  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |  | || ||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  6228812 caacaacaacatcaattaaacatgatccacatcataattcgacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacat 6228713  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  6228712 actatgaacatg 6228701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Original strand, 54423975 - 54424183
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || | ||||  ||||||||||    
T  54423975 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcataa-caaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagca 54424073  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcata 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  54424074 ataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatatcaatttctcata 54424172  T
Q  227 ctttgaacatg 237  Q
    |||||||||||    
T  54424173 ctttgaacatg 54424183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 17139467 - 17139680
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||| ||||| || |||| | |||||||| || ||||| || || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  17139467 taccaatttttaccaaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcactta 17139566  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17139567 gcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatatttcaacatataccattttctca 17139666  T
Q  225 tactttgaacatga 238  Q
    || |||||||||||    
T  17139667 tagtttgaacatga 17139680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 16880131 - 16880295
Alignment:
Q  74 tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa 173  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16880131 tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaa 16880230  T
Q  174 catagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16880231 catagcataatttcacaaattgagcatattctaacatataccactttctcatactttgaacatga 16880295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 15876048 - 15876238
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15876048 caacaccaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattgaa 15876147  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15876148 catgaatcttatcacaattcaacaacaacttatgataatccaacaatttgagtatcattcaagatatatcactttctcatacttggaacat 15876238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Original strand, 14301029 - 14301238
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | ||  ||| ||||||| | || |||||| ||||||||| |||    
T  14301029 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaac 14301128  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  14301129 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatact 14301228  T
Q  229 ttgaacatga 238  Q
    ||||||||||    
T  14301229 ttgaacatga 14301238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55441132 - 55440923
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||| | || |||| ||||||| | || |||||| ||||||||||| |    
T  55441132 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatc 55441033  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  55441032 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatact 55440933  T
Q  229 ttgaacatga 238  Q
    ||||||||||    
T  55440932 ttgaacatga 55440923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12560503 - 12560311
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||| | || | |||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  12560503 caacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattgat 12560404  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12560403 catgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatga 12560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31412616 - 31412409
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  31412616 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaac 31412517  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactt 229  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| | ||||  |||||||| |||| ||||||     
T  31412516 aacaacatcaattaaacctaattctcatcacaattcaacaacaacatatcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatacta 31412417  T
Q  230 tgaacatg 237  Q
    ||||||||    
T  31412416 tgaacatg 31412409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 190
Target Start/End: Original strand, 17204670 - 17204824
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17204670 acaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaacaac 17204769  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaaca 190  Q
    ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17204770 atccattaaacatgattcctatcacaattcaacaacaatatagcataattcaaca 17204824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 41661542 - 41661736
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  41661542 caacaacaacaacttatttatcatcatcaattcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctctcaacaacaacaacatcaatt 41661641  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  41661642 aaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatg 41661736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47785014 - 47784870
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47785014 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaa 47784915  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaaca 190  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47784914 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaaca 47784870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14528286 - 14528121
Alignment:
Q  39 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||  | || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14528286 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 14528187  T
Q  139 aattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  14528186 aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattt 14528121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33369195 - 33369034
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||     
T  33369195 acccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattccttaa 33369096  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33369095 caacaaaaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattca 33369034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 1990763 - 1990957
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgc-aagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1990763 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctctta 1990861  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttc 221  Q
     |||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  1990862 acaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattc-acaatttgagcataattcacaatatatcattttc 1990957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4162489 - 4162284
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  4162489 acccatttttacaaaaccaacaacaac---ttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatagttcttag 4162393  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||    ||  |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  4162392 caacaacaacatcaattaaacatgattcacgtcatcattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacat 4162293  T
Q  226 actttgaac 234  Q
    ||| |||||    
T  4162292 actatgaac 4162284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 237
Target Start/End: Original strand, 50313157 - 50313358
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50313157 acaaaaccaaccacgacaacttatttctcatcgtcaaatcataatttatgaatactcaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaac 50313256  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  50313257 atcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacatatcacaatccaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaaca 50313356  T
Q  236 tg 237  Q
    ||    
T  50313357 tg 50313358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43427801 - 43427592
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  || |||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||  || |     
T  43427801 acccattttcacaaaaccaacatcaacaacttatttcatatcacaaactcatgatttatgaacaccaaagctatgaatcatcaacaacaatat--ctcaa 43427704  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |  |||||||| |||| |||    
T  43427703 caacaacaacatcaattaatcatgattctcatcacaactcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttcacat 43427604  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  43427603 actatgaacatg 43427592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38811275 - 38811144
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38811275 caacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 38811176  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  38811175 catgaatctcagcataattcaacatcaacata 38811144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 10912846 - 10913018
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||| | |      
T  10912846 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctgtgaatcatcaacatcaatatctcatga 10912944  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10912945 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagca 10913018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 238
Target Start/End: Original strand, 30207278 - 30207388
Alignment:
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatac 227  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30207278 acaacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatac 30207377  T
Q  228 tttgaacatga 238  Q
    |||||||||||    
T  30207378 tttgaacatga 30207388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12349830 - 12349615
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacg-----caagccatgaatcaccaacaacaatatca 120  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||      |||||||||| | | || | |||| || |    
T  12349830 acccattttcacaaa-ccaaaaacaacaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatga 12349732  T
Q  121 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactt 219  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||  |    
T  12349731 catatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataacaact 12349633  T
Q  220 tctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12349632 tctcacactttgaacatg 12349615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 14080486 - 14080649
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||||||    
T  14080486 caacaacaacaactcatttctcatcaccaaatcatgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaatt 14080585  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||  ||| | || ||||||||||||| |||||| |||||| | | ||||||||| ||||    
T  14080586 gaacatggttctcatcataattcaacaacaatatagcacaattcacccaattgagcataattca 14080649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17523176 - 17522965
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatc-actta 124  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||  |||||    
T  17523176 acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgactta 17523078  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || ||| |     
T  17523077 gcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccattttgtt 17522979  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  17522978 atactttgaacatg 17522965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 38167873 - 38168041
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || ||||||||    
T  38167873 tacccattttcaccaaaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcactta 38167972  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38167973 acaacaacaacatctattgatcatgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt 38168041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Original strand, 17100614 - 17100824
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaa-caacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  17100614 ccattttcaccaaaccaacattcaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaac 17100713  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  | | ||||    
T  17100714 aacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatgtttcat 17100812  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  17100813 actttgaacatg 17100824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Original strand, 17101299 - 17101509
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaa-caacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  17101299 ccattttcaccaaaccaacattcaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaac 17101398  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  | | ||||    
T  17101399 aacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatgtttcat 17101497  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  17101498 actttgaacatg 17101509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38375961 - 38375804
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | |      
T  38375961 acccattttcacaaaaccaacaacaac---ttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacagtatctcatga 38375866  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38375865 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacatagcacaattca 38375804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Original strand, 17938544 - 17938745
Alignment:
Q  37 caaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||  ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| |  | |||||| || || || ||||||||||    
T  17938544 caaaaacaacaacaacaactcatcttttcatctccaattcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatatcaacaacaac 17938643  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaac 234  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17938644 atcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaacaaagcataattcatcaa-ttaagcatattttcaacatatatcaacttctcatactttgaac 17938742  T
Q  235 atg 237  Q
    |||    
T  17938743 atg 17938745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Original strand, 11638337 - 11638528
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||  | ||  | || |||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||| ||    
T  11638337 caacaacaactcatttcttatcatcaattcatgatttatacatacctaggctatgaatcatcaacaccaatatctctgaataacaacaacatcaattaaa 11638436  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  11638437 catgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatg 11638528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 35123661 - 35123833
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||| |||||||| | || |||||| || || || ||||    
T  35123661 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 35123759  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35123760 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattt 35123833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Original strand, 3578133 - 3578261
Alignment:
Q  110 caacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaac 208  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  3578133 caacaacatgacttagcaacaacaa-atcaattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaac 3578231  T
Q  209 atatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  3578232 atatactattttctcatactttgaacatga 3578261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 14298386 - 14298558
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || ||  ||     
T  14298386 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat 14298484  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14298485 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattt 14298558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 14304013 - 14304185
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || ||  ||     
T  14304013 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat 14304111  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14304112 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattt 14304185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 3992513 - 3992677
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |||    
T  3992513 attttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaa 3992612  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  3992613 caacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 3992677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50112294 - 50112127
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||    
T  50112294 caaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatca 50112195  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  50112194 acaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatg 50112127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17960580 - 17960449
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  || ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  17960580 caacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtcatgaattattaataacaacatcacttagcagcaaacacatcaattgaa 17960481  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
     |||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  17960480 tatgaatctcagcataattcaacatcaacata 17960449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 8631751 - 8631961
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || ||    
T  8631751 acccattttcacaaa--caacaacaacaactcattttctcatcttcaattcgtgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacata 8631848  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
     |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || |  | |||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  8631849 tcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaaagcataattc-actaaataagcatattttcaacatataccaacttctc 8631947  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    | ||||||||||||    
T  8631948 aaactttgaacatg 8631961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Original strand, 23492335 - 23492481
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||    
T  23492335 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaactatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 23492434  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  23492435 acaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 23492481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16996321 - 16996137
Alignment:
Q  51 acaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatga 150  Q
    |||||| |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  16996321 acaactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatga 16996222  T
Q  151 atcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 236  Q
    | | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  16996221 aacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacat 16996137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19570971 - 19570764
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||  ||| || |||||||| || |||||||| || |||  || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | |||    
T  19570971 cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaac-caagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaa 19570873  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatata-tcactttctcatac 227  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  | ||    
T  19570872 caacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttccacatatactcattttcatacac 19570774  T
Q  228 tttgaacatg 237  Q
    ||||||||||    
T  19570773 tttgaacatg 19570764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 45581590 - 45581758
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || |||| |||| ||| |    
T  45581590 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaa 45581689  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa-catagcataattcaacaatt 193  Q
     ||||||||||| | ||| | |||||| | || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  45581690 acaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaatt 45581758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 51961403 - 51961298
Alignment:
Q  47 aacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 146  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| | |    
T  51961403 aacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaattaagc 51961304  T
Q  147 atgaat 152  Q
    ||||||    
T  51961303 atgaat 51961298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 13817477 - 13817658
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || |||    |    
T  13817477 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgact---aa 13817573  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatata 213  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  13817574 acaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttccacatata 13817658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19261124 - 19260915
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||  | || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | || |||| |||    
T  19261124 tacccattttcaccaaac---taacaacaacttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcattta 19261028  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||    
T  19261027 acaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttc 19260929  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  19260928 atactttgaacatg 19260915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16934262 - 16934101
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||||||||    
T  16934262 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaacaa 16934164  T
Q  132 caacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  16934163 caacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 16934101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53898721 - 53898565
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||  || | || |||||||||||| | || |||||| || || || |||||||||||| ||||||     
T  53898721 caacaacatctcatttctcaacat-aaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgat 53898623  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53898622 catgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 53898565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 317793 - 317586
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| || |||||||  || |||| || |||||||  | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||    
T  317793 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 317694  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatac 227  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||    
T  317693 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattt-agcatattttcacacatacccatttttcatac 317595  T
Q  228 tttgaacat 236  Q
    |||||||||    
T  317594 tttgaacat 317586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11477485 - 11477318
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  11477485 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcag 11477387  T
Q  126 caacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  11477386 cagcaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt 11477318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12265086 - 12264937
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||| | || |||| ||| | ||||| ||||||| |||| |||     
T  12265086 acccattttcacaaaac-aacaacaacatctcatttctcatcatcaatccat-aattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaa 12264989  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||  | | || |||||||||||||||    
T  12264988 tagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacata 12264937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 30152902 - 30153069
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||||||||  |||| || ||||||||| ||| |     
T  30152902 acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaa 30153001  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  30153002 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 30153069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 2844152 - 2844318
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  2844152 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 2844251  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||| |||   |||||||||| |||||    
T  2844252 aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaatt 2844318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15859324 - 15859159
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| |    
T  15859324 ccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaac 15859226  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    | | | ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  15859225 agccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 15859159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17956273 - 17956131
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||| |||| |||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  17956273 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 17956174  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    ||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  17956173 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 17956131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 53771002 - 53771168
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | || |||||||| |    
T  53771002 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 53771101  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  53771102 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 53771168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54038417 - 54038251
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || |||| |||| ||| | ||    
T  54038417 ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaaca 54038318  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt 194  Q
    ||||||||| | ||| | |||||| | || |||| |||| |||||||   |||||||||| ||||||    
T  54038317 acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaattt 54038251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8269038 - 8268872
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  8269038 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcag 8268941  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||| |||||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  8268940 caacaataacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 8268872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 19946660 - 19946826
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || ||||||||| || | || |||||| || || ||     
T  19946660 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatat 19946757  T
Q  126 caacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19946758 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataaatcatcaatt 19946826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22144553 - 22144382
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| |  |||| ||||||| ||| | || ||||||||| || | || |||||| ||  |||| ||||||    
T  22144553 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaa 22144454  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  22144453 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaa-ttgagcatattt 22144382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Original strand, 47984646 - 47984765
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |     
T  47984646 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatct 47984744  T
Q  160 caattcaacaacaacatagca 180  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  47984745 caatccaacaacaacttagca 47984765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Original strand, 47993933 - 47994052
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |     
T  47993933 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatct 47994031  T
Q  160 caattcaacaacaacatagca 180  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  47994032 caatccaacaacaacttagca 47994052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Original strand, 48003220 - 48003339
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |     
T  48003220 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatct 48003318  T
Q  160 caattcaacaacaacatagca 180  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  48003319 caatccaacaacaacttagca 48003339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Original strand, 48012506 - 48012625
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || |||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |     
T  48012506 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatct 48012604  T
Q  160 caattcaacaacaacatagca 180  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  48012605 caatccaacaacaacttagca 48012625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 33341843 - 33342008
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||| |||| ||| |     
T  33341843 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa 33341940  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| | || || |||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  33341941 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 33342008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6146987 - 6146856
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |  | |||||| || ||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  6146987 aaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaattgaccatgaaacttatcacaattcatcaa 6146889  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  6146888 caacaatgcatgattcaccaa-ttgagcatattt 6146856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8276127 - 8275972
Alignment:
Q  37 caaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaaca 136  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || |||||||| ||||    
T  8276127 caaaacaaccaacaacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaataaca 8276030  T
Q  137 tcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  8276029 tcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 8275972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6154552 - 6154441
Alignment:
Q  92 caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 191  Q
    |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||    
T  6154552 caagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaa 6154453  T
Q  192 tttgagcatattt 204  Q
     ||||||||||||    
T  6154452 -ttgagcatattt 6154441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 7853944 - 7854109
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | || |||||||||||| | || |||| |||| ||| |     
T  7853944 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgattcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa 7854041  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa-catagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  7854042 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaatt 7854109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12349971 - 12349841
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  12349971 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 12349873  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatatt 203  Q
    | ||   |||||||||| ||| |||||||||||    
T  12349872 ctacgatgcataattcaccaa-ttgagcatatt 12349841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Original strand, 14284977 - 14285089
Alignment:
Q  82 tatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagca 180  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||  |||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||    
T  14284977 tatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctgagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtca 14285076  T
Q  181 taattcaacaatt 193  Q
    ||||||| |||||    
T  14285077 taattcatcaatt 14285089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17912745 - 17912616
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || |||||  ||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||| || | |||    
T  17912745 tcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaa 17912647  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaattt 194  Q
    |||||| |||||||| || |||||| ||||||    
T  17912646 ttcaactacaacatatca-aattcatcaattt 17912616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54685594 - 54685429
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | |  |||||||||||| | || |||| |||| ||| |     
T  54685594 acccatttt-acaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaatccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa 54685497  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  54685496 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 54685429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 18910961 - 18911070
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||   ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  18910961 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaac-aattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 18911059  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  18911060 caacatcaatt 18911070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 13838862 - 13839022
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||| | || ||| | |||| ||| |||| |||| |||| ||| || | |    
T  13838862 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaa-tatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 13838960  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     ||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  13838961 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt 13839022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16182209 - 16182055
Alignment:
Q  49 caacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacat 148  Q
    ||||| || |||||||| || |||  || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| |  |||||||||| ||||||| |||    
T  16182209 caacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaattgatcat 16182110  T
Q  149 gaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
     || |||| ||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16182109 taaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttg-gcatattt 16182055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Original strand, 17204818 - 17204853
Alignment:
Q  203 ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17204818 ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 17204853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47784876 - 47784841
Alignment:
Q  203 ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47784876 ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 47784841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Original strand, 16261458 - 16261580
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    |||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||    
T  16261458 aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaa 16261557  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||   |||||||||| |||||    
T  16261558 caaccatgcataattcaccaatt 16261580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Original strand, 28558169 - 28558243
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaat 103  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||| | || ||||||||||||    
T  28558169 cattttcaccaaacaaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaat 28558243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1468027 - 1467987
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1468027 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 1467987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 199
Target Start/End: Original strand, 11402602 - 11402722
Alignment:
Q  79 aattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatag 178  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||||| ||   | ||||| ||||||||||| ||     
T  11402602 aattatgaacatccaaggtatgaatcatcaacaacaacatatcataacaacaacaacatcaattaaacatgtattcaatcacaaatcaacaacaacctaa 11402701  T
Q  179 cataattcaacaatttgagca 199  Q
    || |||||| | |||||||||    
T  11402702 cacaattcatccatttgagca 11402722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 49232404 - 49232444
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49232404 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 49232444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12539257 - 12539184
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   | ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  12539257 caacaacaacatcaattaaacatgtattcaatcacaaatcaacaacaacttagcacaattcatccatttgagca 12539184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52265796 - 52265585
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  52265796 tacccattttcaccaaaccaacaacatcaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcactta 52265697  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52265696 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctca 52265597  T
Q  225 tactttgaacat 236  Q
    ||||||||||||    
T  52265596 tactttgaacat 52265585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 15044788 - 15045000
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  15044788 acccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttag 15044887  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15044888 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat 15044987  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  15044988 actttgaacatga 15045000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15109636 - 15109424
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||    
T  15109636 acccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttag 15109537  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15109536 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataattcaacatatatcactttctcat 15109437  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  15109436 actttgaacatga 15109424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41166227 - 41166021
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41166227 tttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaa 41166128  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41166127 caacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 41166028  T
Q  232 aacatga 238  Q
    |||||||    
T  41166027 aacatga 41166021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7964997 - 7964795
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7964997 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 7964899  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  7964898 caacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat 7964799  T
Q  226 actt 229  Q
    ||||    
T  7964798 actt 7964795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 18276395 - 18276605
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  18276395 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcaatactcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactttg 18276493  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  18276494 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat 18276593  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
     |||||||||||    
T  18276594 gctttgaacatg 18276605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41256656 - 41256445
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  41256656 acccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 41256557  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||    
T  41256556 caacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacat 41256457  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  41256456 actatgaacatg 41256445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 14901202 - 14901404
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14901202 acaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaacaacaac 14901301  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14901302 atcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcatatttaaacatatatcactttctcatacttcaaaca 14901401  T
Q  236 tga 238  Q
    |||    
T  14901402 tga 14901404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15013569 - 15013358
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  15013569 acccatttttataaaacaaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 15013470  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||| |||    
T  15013469 caacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatgtcattttcacat 15013370  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  15013369 actatgaacatg 15013358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7186128 - 7185921
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  7186128 acccattttcacaaaa---acaacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttag 7186032  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| |||    
T  7186031 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcatttagtgcacaattcaacatatatcattttcacat 7185932  T
Q  226 actttgaacat 236  Q
    ||| |||||||    
T  7185931 actatgaacat 7185921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18238440 - 18238233
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  18238440 attttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcacatcactaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaac 18238341  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| ||||||     
T  18238340 aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatacta 18238241  T
Q  230 tgaacatg 237  Q
    ||||||||    
T  18238240 tgaacatg 18238233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40905220 - 40905054
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  40905220 acccctttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttag 40905121  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40905120 caacaacaacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt 40905054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 38764666 - 38764880
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaac---aacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact 122  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  38764666 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacaacttatttctcatcttcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct 38764765  T
Q  123 tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttct 222  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| || ||||     
T  38764766 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattgaacaacaacatcgcataattcaacaatttgagcacaattcacaatataacattttca 38764865  T
Q  223 catactttgaacatg 237  Q
    |||||| ||||||||    
T  38764866 catactatgaacatg 38764880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13809776 - 13809585
Alignment:
Q  47 aacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 146  Q
    ||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||| | |  |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13809776 aacaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatc 13809677  T
Q  147 atgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13809676 atgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcatatttcaacatataccattttctcatactttgaacatga 13809585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13590358 - 13590150
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||| |||    
T  13590358 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcatagactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaa 13590259  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||| |    
T  13590258 caacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatatt 13590159  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
     ||||||||    
T  13590158 atgaacatg 13590150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41917013 - 41916802
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  41917013 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttttgaacactcaagcaatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 41916914  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||  ||||||||  ||| |||    
T  41916913 caacaacaacatcagttaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaactcacaatatatcatcttcacat 41916814  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  41916813 actatgaacatg 41916802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47535323 - 47535144
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||                   |||    
T  47535323 acaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaac-------------------aac 47535243  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaac 234  Q
     |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47535242 gtcaattgaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaac 47535144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12837484 - 12837276
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || ||||||||    
T  12837484 tacccattttcaccaaaccaacaacaac---ttatttctca-caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcactta 12837389  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  12837388 acaacaacaacatccattgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaatttctc 12837290  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  12837289 atactttgaacatg 12837276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 16732135 - 16732340
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||    
T  16732135 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 16732234  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  16732235 cgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt 16732333  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  16732334 gaacatg 16732340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 54398348 - 54398554
Alignment:
Q  31 ttttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaaca 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  54398348 ttttcacaaaaccaacaataacaacttatttcagatcacaaattcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaaca 54398447  T
Q  131 acaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||  |||||| | ||||  ||||| |    
T  54398448 acaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatattattttcatatactat 54398547  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  54398548 gaacatg 54398554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18494611 - 18494402
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||    
T  18494611 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaac 18494512  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatca-ctttctcatact 228  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  18494511 aacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcacatttcaacatataccatttttctcatact 18494412  T
Q  229 ttgaacatga 238  Q
    |||| |||||    
T  18494411 ttgatcatga 18494402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50220233 - 50220016
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaa------caacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  50220233 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatc 50220134  T
Q  120 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactt 219  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||| || ||||| | ||||| |||||||| ||    
T  50220133 tcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacacaacacaattcaacatttagagcacaattcaaaatatatcattt 50220034  T
Q  220 tctcatactttgaacatg 237  Q
    || |||||| ||||||||    
T  50220033 tcacatactatgaacatg 50220016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13442949 - 13442752
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaac---aacatca 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||   |||||||    
T  13442949 caacaacaacaactcatttctcatcatcaattcataatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaaaatctcttaacaacaacaacaacatca 13442850  T
Q  140 attgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  13442849 attaaacatgattctcatcacaattcaacaataacataacacaattcaacatttagagcataattcacaatataacattttcacatactatgaacatg 13442752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 238
Target Start/End: Original strand, 27961001 - 27961143
Alignment:
Q  96 ccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 195  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||     
T  27961001 ccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaattt 27961100  T
Q  196 agcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  27961101 agcatatttcaacatataccacttcttcatactttgaacatga 27961143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19822039 - 19821912
Alignment:
Q  50 aacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatg 149  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19822039 aacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg 19821940  T
Q  150 aatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
      ||| | || |||||||||| ||||||    
T  19821939 gttctcatcataattcaacaataacata 19821912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Original strand, 34395223 - 34395394
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || |||||||||    
T  34395223 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaa 34395322  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34395323 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 34395394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30232766 - 30232606
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||||||||||||| |||    
T  30232766 caacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccatt 30232667  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    || |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30232666 gatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattt 30232606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37957292 - 37957161
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37957292 caacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaccacatcaattgaa 37957193  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  37957192 catgaatctcagcataattcaacatcaacata 37957161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 47468613 - 47468522
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatca 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  47468613 catttttacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaacatca 47468522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21959684 - 21959544
Alignment:
Q  92 caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 191  Q
    |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21959684 caagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa 21959585  T
Q  192 tttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttga 232  Q
     ||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  21959584 -ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttga 21959544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23270219 - 23270054
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| |  |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||    
T  23270219 ccattttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaaca 23270120  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  23270119 acaacaacatcaattgatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaatt 23270054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15675353 - 15675224
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||    
T  15675353 tcatcatcaattcatgaat-atgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaa 15675255  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  15675254 ttcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 15675224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 44055881 - 44056086
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||  || | | ||||    
T  44055881 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaa 44055980  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||   ||| |||||||||    
T  44055981 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatattcatttttcatacttt 44056079  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  44056080 gaacatg 44056086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 53705015 - 53704811
Alignment:
Q  31 ttttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaaca 130  Q
    ||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | |||||    
T  53705015 ttttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaaca 53704916  T
Q  131 acaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    |||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||| |  ||| |||||||||    
T  53704915 acaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccatttttcatacttt 53704817  T
Q  231 gaacat 236  Q
    ||||||    
T  53704816 gaacat 53704811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 55376884 - 55376717
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||  ||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || | |||     
T  55376884 acccattttcatcaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataatttaa 55376785  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||    
T  55376784 caacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaatt 55376717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Original strand, 31115628 - 31115757
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||    
T  31115628 tcatcatcaattcatgaat-atgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaa 31115726  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  31115727 ttcaacaacaacttaggaaaattcaccaatt 31115757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47468535 - 47468425
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||   ||||||| |||| |||    
T  47468535 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacactatatcattttcacat 47468436  T
Q  226 actttgaacat 236  Q
    ||| |||||||    
T  47468435 actatgaacat 47468425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 14996089 - 14996255
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  14996089 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcag 14996186  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  14996187 caacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 14996255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19697666 - 19697500
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  19697666 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcag 19697569  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  19697568 caacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 19697500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19708251 - 19708085
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  19708251 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcag 19708154  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  19708153 caacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 19708085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15851644 - 15851593
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatca 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15851644 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatca 15851593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10104452 - 10104385
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  10104452 caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 10104385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 14951722 - 14951889
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||||||||  |||| || ||||||||| ||| |     
T  14951722 acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaa 14951821  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  14951822 taacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 14951889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Original strand, 30457909 - 30458074
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||| | || |||| | || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  30457909 aaataatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 30458007  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||  || ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||    
T  30458008 caacaatgcgtaattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatg 30458074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45459098 - 45458975
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||||||||||| ||| | || ||||||||| || | |  |||||| || || || ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  45459098 caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaaca 45458999  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||| || ||||||||||| |||||    
T  45458998 acagcaaagcataattcaccaatt 45458975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15272606 - 15272440
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | || |||||||| |    
T  15272606 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 15272507  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  15272506 aacaacaacatctattgatcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 15272440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 820154 - 820026
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  820154 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaa---caattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 820059  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  820058 caacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 820026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Original strand, 8374471 - 8374620
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||   || ||||||| | || |||||||| | ||||| ||||||| |||| |||     
T  8374471 acccattttctcaaaac-aacaacaacatctcatttttcatcatcaatcgat-aattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaa 8374568  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||  | | || |||||||||||||||    
T  8374569 tagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacata 8374620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 8044913 - 8045019
Alignment:
Q  37 caaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaaca 136  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || |||| ||||||||    
T  8044913 caaaacaaccaacaacatcttatttctcatcaacaattcatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcagcaacaaca 8045012  T
Q  137 tcaattg 143  Q
    |||||||    
T  8045013 tcaattg 8045019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8872658 - 8872549
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||    
T  8872658 caacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccatttttcat 8872560  T
Q  226 actttgaacat 236  Q
    |||||||||||    
T  8872559 actttgaacat 8872549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 16522779 - 16522946
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  || |    
T  16522779 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctca 16522876  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  16522877 gcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 16522946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17145950 - 17145791
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||  | | ||||||| | || |||| ||| | ||||| ||||||| |||| |||     
T  17145950 acccattttctcaaaac-aacaacaacatctcatttttcatcatcaatccgt-aattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaa 17145853  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||||| || ||||||    
T  17145852 tagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattca 17145791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 53907980 - 53907777
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||  ||| || |||||||| || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | |||    
T  53907980 cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaa 53907881  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||   ||||||| |||||| | |  ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||| |||||||    
T  53907880 caacaa---caattgatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgggcatattttcacacatacccatttttcatact 53907785  T
Q  229 ttgaacat 236  Q
    ||||||||    
T  53907784 ttgaacat 53907777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40885756 - 40885689
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||    
T  40885756 caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaatt 40885689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 44346790 - 44346964
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| ||| ||  ||||||  || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||| | |||||| | |||    
T  44346790 cattttcaccaaaacacaaacaacgtctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaa 44346889  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||||| || |||| |||||| | || |||||||||  |||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  44346890 caacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaa-ttgagcatattt 44346964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7132353 - 7132244
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||   ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  7132353 tttcacacaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 7132255  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  7132254 caacatcaatt 7132244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25119497 - 25119335
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaaca 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||| | |||||| ||| | || ||||||||| ||||  | ||||||||| ||| | |||||    
T  25119497 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaaca 25119398  T
Q  131 acaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| ||| |||   |||||||||| |||||    
T  25119397 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaatt 25119335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54118544 - 54118379
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| |    
T  54118544 ccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaac 54118446  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| || |  |||  ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  54118445 aactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 54118379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 18168938 - 18168978
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18168938 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 18168978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 26680197 - 26680312
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
T  26680197 ttctcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 26680295  T
Q  160 caattcaacaacaacat 176  Q
    ||||||||| |||||||    
T  26680296 caattcaactacaacat 26680312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 9295668 - 9295822
Alignment:
Q  40 aaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  || |||||||||||||||    
T  9295668 aaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatc 9295766  T
Q  139 aattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  9295767 aattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 9295822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14500414 - 14500344
Alignment:
Q  124 agcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  14500414 agcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 14500344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5682816 - 5682655
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||| |||  |||| || ||||||||| | | |  |||||    
T  5682816 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatgaataaaaaacaa 5682717  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| | | | | |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  5682716 caacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 5682655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 13246426 - 13246558
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| || | | ||||||||||||||| ||||| || |     
T  13246426 ttctcatcctcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataact 13246524  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  13246525 caatctaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 13246558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 21417366 - 21417439
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | | ||||| ||||||||||| || || |||||| | |||||||||    
T  21417366 caacaacaacatcaattaaacatgtatttaatcacaaatcaacaacaacctaacacaattcatccatttgagca 21417439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 77128 - 76922
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  77128 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaacaa 77029  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  77028 caacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataattcaacatatatcactttctcatactttg 76929  T
Q  232 aacatga 238  Q
    |||||||    
T  76928 aacatga 76922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Original strand, 23837164 - 23837370
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23837164 tttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaa 23837263  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23837264 caacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagttcaacatatatcactttctcatactttg 23837363  T
Q  232 aacatga 238  Q
    |||||||    
T  23837364 aacatga 23837370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21198426 - 21198227
Alignment:
Q  39 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21198426 aaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaacaacaacatc 21198327  T
Q  139 aattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21198326 aattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 21198227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 26011455 - 26011665
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26011455 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 26011553  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  26011554 caacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat 26011653  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  26011654 actttgaacatg 26011665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 5854575 - 5854785
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5854575 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 5854673  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  5854674 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcataattcaacatataacactttcatat 5854773  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  5854774 actttgaacatg 5854785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33611340 - 33611128
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33611340 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatatctcatcatcaaatcatgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 33611241  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||   ||||||||||||| |||    
T  33611240 caacaacaacatcaattaaacatggttctcaacacaattcaacaacaacatagcataattcaatatttatagcataattctcaatatatcactttcacat 33611141  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  33611140 actttgaacatga 33611128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 38533629 - 38533821
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38533629 caacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacctagcaacaacaacatcaattgaa 38533728  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38533729 catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcatatttcaacatataccattttctcatactttgaacatga 38533821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 15933259 - 15933469
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15933259 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 15933357  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  15933358 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatttaacactttcacat 15933457  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  15933458 actttgaacatg 15933469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27233352 - 27233159
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  27233352 ccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca 27233253  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttc 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  27233252 acaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacattttgagcataattcacaatatatcattttc 27233159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18261758 - 18261551
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  18261758 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 18261659  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  18261658 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 18261559  T
Q  226 actttgaa 233  Q
    ||| ||||    
T  18261558 actatgaa 18261551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 33528387 - 33528580
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  33528387 acccatttt-acaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaa-aatatctcttag 33528484  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttc 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  33528485 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcaacatatatcattttc 33528580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 33172188 - 33172399
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||      
T  33172188 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacgcaagctatgaatcatcaacaaccatatctcttta 33172287  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  33172288 taacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 33172387  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  33172388 actatgaacatg 33172399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45559224 - 45559013
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  45559224 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaccacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaa 45559125  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  45559124 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 45559025  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  45559024 actatgaacatg 45559013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18041819 - 18041608
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||  ||||     
T  18041819 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttatgaacacctaagctatgaatcatcaacaacaatatatcttaa 18041720  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||  |||||||| |||| |||    
T  18041719 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtacaattcacaatatatcattttcacat 18041620  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  18041619 actatgaacatg 18041608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22736105 - 22735912
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22736105 caacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaattgaa 22736006  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatca-ctttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  22736005 catgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgatcataattcaacatatatcattttttttatactttgaacatga 22735912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23226353 - 23226183
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23226353 acaaaaccaacaacaacaatccatttctcataatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaac 23226254  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    ||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23226253 atcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaatcatttgagcataattca 23226183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 236
Target Start/End: Original strand, 29306450 - 29306587
Alignment:
Q  99 tgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29306450 tgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagc 29306549  T
Q  199 atatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 236  Q
    ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  29306550 ataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacat 29306587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38635917 - 38635724
Alignment:
Q  44 aacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  38635917 aacaacaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatta 38635818  T
Q  144 aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  38635817 aacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtataattcacaatatatcattttcgcatattatgaacatg 38635724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19331602 - 19331390
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaa-caatatcactta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||| || |    
T  19331602 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgattcatgaacacctaagctatgaatcatcaacaaacaatatctctca 19331503  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
      |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||    
T  19331502 ataacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcaca 19331403  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||| ||||||||    
T  19331402 tactatgaacatg 19331390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39447032 - 39446841
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| ||| ||| | || |||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  39447032 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 39446934  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  39446933 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatatttcaacatataacacttcttcatactttaaacatga 39446841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22497496 - 22497285
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| | ||||     
T  22497496 acccattttcacaaaaacaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcattaacaacaatacctcttat 22497397  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  22497396 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 22497297  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    | | ||||||||    
T  22497296 attatgaacatg 22497285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37653899 - 37653692
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||    
T  37653899 ccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatcaaatcatga--tatgaacacccaagccataaatcatcaacaacaatattccttaaca 37653802  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatac 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||    
T  37653801 acaacaacatcaattaaacatgattctcaacagaattcaacaacaatataaaacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatac 37653702  T
Q  228 tttgaacatg 237  Q
    | ||||||||    
T  37653701 tatgaacatg 37653692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 22742721 - 22742935
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact--- 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||       
T  22742721 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaacaaaccaagatttatgaacacccaagccacgaatcatcaacaacaatattcctcaa 22742820  T
Q  123 tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttct 222  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| ||||     
T  22742821 caacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttca 22742920  T
Q  223 catactttgaacatg 237  Q
    |||||| ||||||||    
T  22742921 catactatgaacatg 22742935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 20481564 - 20481776
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || |||||    
T  20481564 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgactta 20481663  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatt-tcaacatatatcactttctc 223  Q
     ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||  ||| ||    
T  20481664 acaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaa-ttgagcatattatcaacacatatccatttttc 20481762  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  20481763 atactttgaacatg 20481776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 23149751 - 23149918
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23149751 acaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaac 23149850  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    | | ||||||||||| ||| | || ||||   ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  23149851 aactattgaacatgattctcatcataatt---caacaacttagcataattcaaccaattgagcataattca 23149918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45465396 - 45465202
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45465396 caacaacaacaactcatttcccatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 45465297  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  | ||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  45465296 aaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagctcaattcaacatctagagcataattcacaatataacattttcacatactatgaacatg 45465202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 22981353 - 22981445
Alignment:
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22981353 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatga 22981445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Original strand, 23158133 - 23158300
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  23158133 acaaaaccaacaagaacaactcatttttcattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaac---atcacttaggaacaacaac 23158229  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    | | ||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  23158230 aactattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcataattca 23158300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23152103 - 23151957
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23152103 caacaacaacttctcatttatcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaatt 23152004  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaac 189  Q
    ||||| |  ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23152003 gaacacggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaac 23151957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24552852 - 24552646
Alignment:
Q  31 ttttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaaca 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | || ||||| |||||  | ||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  24552852 tttttacaaaaccaacgacaacaacttatttcacatcaccaactcatgattcattaacactcaagctctaaatcatcaacaaccatatctcttaacaaca 24552753  T
Q  131 acaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| |    
T  24552752 acaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactat 24552653  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  24552652 gaacatg 24552646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 21680982 - 21681175
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||||| || ||  |||||||||||||||     
T  21680982 caacaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattgat 21681081  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||    
T  21681082 catgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatga 21681175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20648072 - 20647905
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||||||||||| ||| | || ||||||||| || | || |||||| || || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||    
T  20648072 caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatca 20647973  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatttgagcat-atttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20647972 acaacatagcataattcaccaa-ttaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatg 20647905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20573474 - 20573302
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||    
T  20573474 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20573376  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  20573375 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaa-ttgagcatattt 20573302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20654148 - 20653981
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||||||||||| ||| | || ||||| |||||| | || |||||| || || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||    
T  20654148 caaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatca 20654049  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20654048 acaacttagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatg 20653981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31194591 - 31194460
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31194591 caacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaa 31194492  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    |||| ||   | || |||||||||||||||||    
T  31194491 catggataacaacataattcaacaacaacata 31194460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Original strand, 41246624 - 41246804
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || ||||||||  | |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||||    
T  41246624 tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa 41246723  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatata 213  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  41246724 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttaagcatatttcatcatata 41246804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16039177 - 16039015
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | |  |||||||| ||| | || | | || ||||||||    
T  16039177 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatatccaagccataaattagcatccataacatcactta 16039078  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  16039077 acaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 16039015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 274405 - 274570
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| | ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||    
T  274405 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 274504  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  274505 ataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 274570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 641444 - 641279
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| | ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||    
T  641444 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 641345  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  641344 ataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 641279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 827250 - 827085
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| | ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||    
T  827250 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 827151  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  827150 ataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 827085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 20709650 - 20709825
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaac---ttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||  || |||||| ||||||||||  |||  |||| ||| | ||||||||||| ||    
T  20709650 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacaacttatttcacatcagaaactcatgatttatgaacacctaagttatga-tcatctacaacaatatctct 20709748  T
Q  123 tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
     | || |||||||||||||| ||||||| ||| | || || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  20709749 caacatcaacaacatcaattaaacatgattctcatcaaaactcaacaacaaaatagcacaattcaataattagagca 20709825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561707
Alignment:
Q  134 acatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcat-atttcaacatatatcactttctcatactttga 232  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20561810 acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttga 20561712  T
Q  233 acatg 237  Q
    |||||    
T  20561711 acatg 20561707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 25296145 - 25296229
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  25296145 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatctaatcatgatatatgaacacctaagtcatgaatcatcaacaaca 25296229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 25758165 - 25758249
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  25758165 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatctaatcatgatatatgaacacctaagtcatgaatcatcaacaaca 25758249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Original strand, 17285238 - 17285323
Alignment:
Q  37 caaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact 122  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17285238 caaaactaccaacaacaactcatttctcatcctcaagtcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcact 17285323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 17285323 - 17285376
Alignment:
Q  185 tcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17285323 tcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 17285376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Original strand, 37611674 - 37611805
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| | || |||| | || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||    
T  37611674 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 37611772  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37611773 caacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattt 37611805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3431569 - 3431408
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||||||||    
T  3431569 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaacaa 3431471  T
Q  132 caacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  3431470 caacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 3431408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 168
Target Start/End: Original strand, 15969799 - 15969920
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15969799 caacaacaactcatttctcctctacaa-tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagcaacatcacttaacaacaactacaccaattgaa 15969897  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaac 168  Q
    ||||||||| | || ||||||||    
T  15969898 catgaatctcagcataattcaac 15969920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 16002013 - 16002130
Alignment:
Q  81 ttatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagca 180  Q
    |||||||||| ||||   ||||| | ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  16002013 ttatgaacacccaagatgtgaataatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatggatcc-accacaaatcaacaacaacatagca 16002111  T
Q  181 taattcaacaatttgagca 199  Q
     |||||||||||| |||||    
T  16002112 caattcaacaattagagca 16002130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41507091 - 41506937
Alignment:
Q  39 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    |||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || ||||||||| ||| | ||||||||||| |    
T  41507091 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 41506992  T
Q  139 aattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  41506991 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 41506937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19993339 - 19993164
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||  || |||||||| | || | |||||||||| | || |||||| || ||| | ||    
T  19993339 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 19993240  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||| |||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19993239 acaacaacaacaattgatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 19993164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 237
Target Start/End: Original strand, 25296222 - 25296329
Alignment:
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| | || |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||    
T  25296222 caacaacatcaattaaacataattctcatcataattgaacaaca-catagaacaattcaacaatttgagcataattcaacatatatcattttcacaagct 25296320  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  25296321 ttgaacatg 25296329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22235088 - 22234913
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| || | | |||| || |||| || |||||||| | || ||| |||||||| | || |||||| || ||| | ||    
T  22235088 ccattttcatcaaaacatcaacaacatctcaatcctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 22234989  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22234988 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 22234913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 237
Target Start/End: Original strand, 25758242 - 25758349
Alignment:
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| | || |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||    
T  25758242 caacaacatcaattaaacataattctcatcataattgaacaaca-catagaacaattcaacaatttgagcataattcaacatatatcattttcaaaagct 25758340  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  25758341 ttgaacatg 25758349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 100
Target Start/End: Original strand, 29297799 - 29297876
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaaca---acaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  29297799 acccatttttacaaaaccaacaacagcaacaactcatttctcataatcaaatcatgatctatgaacacccaagccatg 29297876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13721216 - 13721107
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||   ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  13721216 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaac-aattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 13721118  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  13721117 caacatcaatt 13721107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 22886287 - 22886454
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaactta-tttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| ||| |||||  |||||||| ||  || |    
T  22886287 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttaatttctcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctca 22886385  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  22886386 gcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattc-acaacaacatgtcatagttcatcaatt 22886454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24717147 - 24716990
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| ||| || ||||| |||||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||||||| ||| | || |||||||    
T  24717147 acaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatcaacaac 24717048  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    | | |||||||||||| |  | ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  24717047 aaccattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 24716990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 142
Target Start/End: Original strand, 18612368 - 18612482
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| || | ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  18612368 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacactcaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcag 18612465  T
Q  126 caacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||||||    
T  18612466 caacaacaacatcaatt 18612482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 142
Target Start/End: Original strand, 18619273 - 18619387
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| || | ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  18619273 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacactcaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcag 18619370  T
Q  126 caacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||||||    
T  18619371 caacaacaacatcaatt 18619387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20567440 - 20567329
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||    
T  20567440 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20567342  T
Q  130 aacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||    
T  20567341 aacaacatcaatt 20567329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20573633 - 20573522
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||    
T  20573633 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20573535  T
Q  130 aacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||    
T  20573534 aacaacatcaatt 20573522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24386037 - 24385920
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatc-aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | || | |||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  24386037 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttacttcataacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaac 24385938  T
Q  127 aacaacaacatcaattga 144  Q
    |||||||||||| |||||    
T  24385937 aacaacaacatctattga 24385920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 39115249 - 39115402
Alignment:
Q  40 aaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatca 139  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||| |||||| ||| | || |||| ||||||| | || |||| |||| ||| | ||||||||||| |     
T  39115249 aaccaacaataacaatttatttctcaacaataaattatgaatcatgcatacacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaacc 39115348  T
Q  140 attgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| |||||| | || ||| ||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  39115349 attgatcatgaaacatatcacgattcatcaacaactatgcataattcaccaatt 39115402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 271648 - 271608
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  271648 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 271608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 644272 - 644312
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  644272 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 644312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 830007 - 830047
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  830007 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 830047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15319447 - 15319407
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15319447 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 15319407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15499816 - 15499776
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15499816 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 15499776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22089082 - 22089042
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22089082 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 22089042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22907480 - 22907365
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
T  22907480 ttctcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 22907382  T
Q  160 caattcaacaacaacat 176  Q
    ||||||||| |||||||    
T  22907381 caattcaactacaacat 22907365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22006546 - 22006507
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatca 71  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22006546 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatca 22006507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13662553 - 13662513
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13662553 tttcacaaaaccaccaacaacaatttagttctcatcatcaa 13662513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 13377489 - 13377701
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||    
T  13377489 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttag 13377588  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13377589 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataattcaacatatatcactttctcat 13377688  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  13377689 actttgaacatga 13377701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17224215 - 17224013
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  17224215 acaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaacaacaac 17224116  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17224115 atcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatactttgaaca 17224016  T
Q  236 tga 238  Q
    |||    
T  17224015 tga 17224013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 48356605 - 48356815
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48356605 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 48356703  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  48356704 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat 48356803  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  48356804 actttgaacatg 48356815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16915214 - 16915004
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16915214 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgacttag 16915116  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  16915115 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcataattcaacatataacactttcacat 16915016  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  16915015 actttgaacatg 16915004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 9838841 - 9839050
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9838841 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacac-caagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttag 9838938  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  9838939 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat 9839038  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  9839039 actttgaacatg 9839050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20583844 - 20583630
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaac---ttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20583844 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatccct 20583745  T
Q  123 tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttct 222  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||     
T  20583744 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttca 20583645  T
Q  223 catactttgaacatg 237  Q
    |||||| ||||||||    
T  20583644 catactatgaacatg 20583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13863218 - 13863005
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  13863218 tacccattttcatcaaaccaacaacaacaacttatttcacattatcaaatcattgattatgaacacccaagccatgcatcattaacaacaatatcactta 13863119  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||    
T  13863118 gcaacaacaacaacaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttc 13863019  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  13863018 atactttgaacatg 13863005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 9611269 - 9611479
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9611269 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacac-caagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttag 9611366  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg-agcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  9611367 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataattcaacatataacactttcaca 9611466  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||||||||||||    
T  9611467 tactttgaacatg 9611479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 4484687 - 4484898
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  4484687 acccatttttacaaaaccaagcacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 4484786  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||    
T  4484787 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacat 4484886  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||  ||||||||    
T  4484887 acaatgaacatg 4484898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 31501150 - 31501344
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  31501150 caacaacaataacttatttctcatcatcaaatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaatt 31501249  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  31501250 aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcattattcacaatatatcattttcacatactatgaacatg 31501344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 49047941 - 49047749
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  49047941 caacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 49047842  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49047841 catgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcatatttcaacatataccactctctcatactttgaacatga 49047749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 38424179 - 38424390
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  38424179 acccatttttacaaaacccacaacaacaacttatttttcaccatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 38424278  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||    
T  38424279 caacaacaacatcacttaaacataattctcatcataattcaacaacaacatagaacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacat 38424378  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  38424379 actatgaacatg 38424390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26070552 - 26070340
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || | |||| ||||||||    
T  26070552 tacccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcactta 26070453  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  26070452 gcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccattttctc 26070354  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  26070353 atactttgaacatg 26070340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26094339 - 26094127
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || | |||| ||||||||    
T  26094339 tacccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcactta 26094240  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  26094239 gcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccattttctc 26094141  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  26094140 atactttgaacatg 26094127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9724091 - 9723883
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||| |||    
T  9724091 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcatagactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaa 9723992  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||| |    
T  9723991 caacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatatt 9723892  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
     ||||||||    
T  9723891 atgaacatg 9723883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 14935323 - 14935531
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||      
T  14935323 acccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctctt-- 14935420  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
     ||||||||||||| || || |||| ||| | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||    
T  14935421 -aacaacaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacat 14935519  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  14935520 actatgaacatg 14935531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 15362916 - 15363124
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||      
T  15362916 acccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctctt-- 15363013  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
     ||||||||||||| || || |||| ||| | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||    
T  15363014 -aacaacaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacat 15363112  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  15363113 actatgaacatg 15363124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14272172 - 14271975
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14272172 acccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcatttag 14272074  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||             || |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  14272073 caacaacaacatcaattgaacatgattctt-------------aataacatagcatgaatcaacaattggagcatagttcaacatatatcattttcacat 14271987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Original strand, 16919600 - 16919731
Alignment:
Q  107 caacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16919600 caacaacaatattacttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattca 16919699  T
Q  207 acatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16919700 acatatatcactttctcatattttgaacatga 16919731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34241470 - 34241311
Alignment:
Q  31 ttttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaaca 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  34241470 tttttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcacttatcaaca 34241371  T
Q  131 acaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaaca 190  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34241370 acaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaaca 34241311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 14940713 - 14940926
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaa--caacaatatcactt 123  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||  | | ||  || |||    
T  14940713 acccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaaaactctctt 14940812  T
Q  124 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctc 223  Q
    | |||||||||||||| || ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |    
T  14940813 aacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcac 14940912  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||| ||||||||    
T  14940913 atactatgaacatg 14940926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Original strand, 46473968 - 46474134
Alignment:
Q  33 ttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaac 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  46473968 ttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaac 46474067  T
Q  133 aacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46474068 aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagca 46474134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 4446172 - 4446383
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatca-ccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||    
T  4446172 acccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatctctta 4446271  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||  |||||||| |||| ||    
T  4446272 tcaacaacaacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagcacaatacataatatatcattttcaca 4446370  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||| ||||||||    
T  4446371 tactatgaacatg 4446383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 11287381 - 11287588
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||    
T  11287381 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 11287480  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  11287481 aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact 11287579  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  11287580 ttgaacatg 11287588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13449097 - 13448903
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13449097 caacaacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatcaacacccaagctacgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 13448998  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13448997 aaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatg 13448903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17947875 - 17947677
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |  |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  17947875 attttcacaaaaccaacaacaacaatttatttcacatcacaatctcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaac 17947776  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | || |  |||||||| |||| ||||||    
T  17947775 aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttcacatact 17947677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12248404 - 12248195
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||  |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||| |||| || | || | |||| |||||||||||||    
T  12248404 attttcatcaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaac 12248305  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  12248304 aacaacatccattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatact 12248205  T
Q  229 ttgaacatga 238  Q
    || |||||||    
T  12248204 ttaaacatga 12248195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 28390289 - 28390483
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28390289 caacaacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 28390388  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  28390389 aaacatgattatcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatg 28390483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 13274767 - 13274923
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13274767 caacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 13274866  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13274867 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatat 13274923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 15358758 - 15358968
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   ||||     
T  15358758 acccatttttacaaa-caaacaacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaa 15358856  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  15358857 caacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacat 15358956  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  15358957 actatgaacatg 15358968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16570271 - 16570080
Alignment:
Q  48 acaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaca 147  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || | || | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16570271 acaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatca 16570172  T
Q  148 tgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16570171 tgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatactttgaacatga 16570080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 16595391 - 16595582
Alignment:
Q  48 acaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaca 147  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || | || | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16595391 acaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatca 16595490  T
Q  148 tgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16595491 tgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatactttgaacatga 16595582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 15368306 - 15368519
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaa--caacaatatcactt 123  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||  | | ||  || |||    
T  15368306 acccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaaaactctctt 15368405  T
Q  124 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctc 223  Q
    | |||||||||||||| || ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| |||| |    
T  15368406 aacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcattaatttgagcataattcacaatatatcattttcac 15368505  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||| ||||||||    
T  15368506 atactatgaacatg 15368519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 3894988 - 3895196
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |||    
T  3894988 cattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaa 3895087  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatac 227  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||    
T  3895088 caacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatac 3895186  T
Q  228 tttgaacatg 237  Q
    ||||||||||    
T  3895187 tttgaacatg 3895196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12370128 - 12369916
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| ||| | ||  ||||||||||| |  |   |||| ||||||||    
T  12370128 tacccattttcaccaaaccaacaactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcactta 12370029  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||    
T  12370028 gcaacaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacagatacccatttttc 12369930  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  12369929 atactttgaacatg 12369916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 45149563 - 45149723
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  || |||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  45149563 acccattttcacaaaatcaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgg-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 45149661  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  45149662 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaaccaacaacatcatagcacaattca 45149723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7284336 - 7284137
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| |  | |||||| || || || ||||||||||    
T  7284336 acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaac 7284238  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaac 234  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7284237 atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaac 7284139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15822712 - 15822531
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| |  |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||    
T  15822712 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaa 15822613  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata 213  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  15822612 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-accatttgagcatattttcaacatata 15822531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Original strand, 3049564 - 3049710
Alignment:
Q  47 aacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 146  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  3049564 aacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc 3049663  T
Q  147 atgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3049664 atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt 3049710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9321321 - 9321176
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| || ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  ||| ||    
T  9321321 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcacaaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcattaacaacaatatctattatca 9321222  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa 173  Q
    ||||||||||||||| || || | ||| | ||||||||||| ||||    
T  9321221 acaacaacatcaattaaatataattctcatcacaattcaactacaa 9321176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8267999 - 8267804
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||                || |     
T  8267999 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaaatcatgatttatgaacatccaagctatgaatc----------------ctcaa 8267916  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  8267915 caacaacatcatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 8267816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Original strand, 28722169 - 28722281
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaat-cttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||    
T  28722169 caacaacaacttcatttaaacatgaattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcaca 28722268  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||| ||||||||    
T  28722269 tactatgaacatg 28722281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 12759013 - 12759158
Alignment:
Q  92 caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 191  Q
    |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12759013 caagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaa 12759112  T
Q  192 tttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||||| |||||||| ||| | |||| ||| | ||||||||||    
T  12759113 -ttgagcatattttcaacacatacccctttttcacattttgaacatg 12759158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 33559616 - 33559818
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  || |||| |||||  || |||||| |||||||||| |||||||  ||||  |||      |||| |||| |||    
T  33559616 catttttacaaaaccaacaacaatagtttctttcacatcacaaattcatgatttatgaacacacaagccaaaaatcttcaa------tatctcttaacaa 33559709  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||  | ||||  |||||||| |||||||||||    
T  33559710 caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcccaattcacaatatatcattttctcatact 33559809  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
     ||||||||    
T  33559810 atgaacatg 33559818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 137
Target Start/End: Original strand, 4438781 - 4438893
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatca-ccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||    
T  4438781 acccatttttacaaaaccaacaacaacaagtcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatctctta 4438880  T
Q  125 gcaacaacaacat 137  Q
     ||||||||||||    
T  4438881 tcaacaacaacat 4438893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32494342 - 32494174
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || |||  |||| ||| |    
T  32494342 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaa 32494243  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     ||||||||||| | ||| | |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  32494242 acaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 32494174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42056583 - 42056405
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | ||||||||||| |    
T  42056583 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaac 42056484  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  42056483 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataattca 42056405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 111560 - 111397
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||| ||| | || |||||||||||| | || |||| |||| ||| | |||    
T  111560 cattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaatt-tgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaa 111462  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  111461 caacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 111397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39046907 - 39046743
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||  ||| || |||||||| || |||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | |||    
T  39046907 cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaa 39046808  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  39046807 caacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt 39046743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 13320977 - 13321143
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaa-cttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||  || | || |||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||| |    
T  13320977 ccatttacacaaaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatg-tgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaac 13321075  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa-caacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  13321076 aacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaatt 13321143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Original strand, 25124125 - 25124216
Alignment:
Q  61 tctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaat 152  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  25124125 tctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaattaagcatgaat 25124216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 126375 - 126542
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||| ||| ||| |     
T  126375 acccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagtatgactaaa 126474  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  126475 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 126542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 2028882 - 2029048
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatc-aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||| ||| | || |||| ||||||| | || | | || |||||||| |    
T  2028882 ccattttcatcaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaac 2028981  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa-catagcataattcaacaatt 193  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  2028982 aacgacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaatt 2029048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 371056 - 371217
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||   ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  ||  |||||||    
T  371056 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca-caaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcggcaacaa 371154  T
Q  132 caacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  371155 caacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 371217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2190480 - 2190314
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  2190480 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 2190381  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  2190380 aacatcaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 2190314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45452409 - 45452244
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||||||||||| |||   || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||    
T  45452409 caaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaattgatcatgaaacttatcacaattcatca 45452310  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||   || |||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  45452309 acaacatagcat--gtc-acaaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatg 45452244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18980309 - 18980200
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  18980309 tttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 18980211  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  18980210 caacatcaatt 18980200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Original strand, 47289787 - 47289918
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || || ||| || ||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||    
T  47289787 aaatcatgaatcatgca-acacaagccatgaattatcatcatcaacatgacttaacagcaacagcaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 47289885  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  47289886 caacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattt 47289918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 7293013 - 7293128
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
T  7293013 ttctcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 7293111  T
Q  160 caattcaacaacaacat 176  Q
    |||||||||||||||||    
T  7293112 caattcaacaacaacat 7293128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 204
Target Start/End: Original strand, 143703 - 143776
Alignment:
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  143703 aacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattt 143776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8563582 - 8563460
Alignment:
Q  79 aattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatag 178  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||  ||   | ||||| ||||||||||| ||     
T  8563582 aattatgaacacccaaggtgtgaatcatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatatattcaatcacaaatcaacaacaacctaa 8563483  T
Q  179 cataattcaacaatttgagcata 201  Q
    || |||||| | |||||||||||    
T  8563482 cacaattcatccatttgagcata 8563460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47481295 - 47481166
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||||| || |||| |||  | | | ||||||||||||||| ||||| || | |||    
T  47481295 tcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 47481197  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  47481196 ttcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 47481166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Original strand, 4438881 - 4438954
Alignment:
Q  164 tcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  4438881 tcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagcacaattcacaatatatcattttaacatactatgaacatg 4438954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 7822696 - 7822736
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7822696 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 7822736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 7830007 - 7830047
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7830007 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 7830047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27101925 - 27101885
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27101925 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 27101885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27109273 - 27109233
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27109273 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 27109233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 27176401 - 27176441
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27176401 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 27176441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38784017 - 38783977
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38784017 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 38783977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14251186 - 14251077
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||   | ||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  14251186 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaac-aattatggtatctgaacacccaagccataagtcataatcaacaacatatctcagcaacaa 14251088  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  14251087 caacatcaatt 14251077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Original strand, 15852419 - 15852464
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  15852419 acccattttcacaaaac-aacaacaacatctcatttctcatcatcaa 15852464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 15927536 - 15927645
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||   | ||||||| ||||||||  ||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  15927536 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaac-aattatggtatgtgaacacccaagccatagatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 15927634  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  15927635 caacatcaatt 15927645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 44865290 - 44865367
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  44865290 caacaacaacaacaattaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 44865367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Original strand, 36052663 - 36052755
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatc 153  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || | ||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36052663 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatc 36052755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15951079 - 15951039
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15951079 tttcagaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 15951039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 432423 - 432635
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  432423 acccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttctcatgatcaaatcataaattatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcacttag 432522  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  432523 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcattttctcat 432622  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  432623 actttgaacatga 432635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 19862183 - 19862381
Alignment:
Q  40 aaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatca 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19862183 aaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatca 19862282  T
Q  140 attgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19862283 attgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 19862381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5451130 - 5450918
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||| || |||||| |||||||||    
T  5451130 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatcacttag 5451031  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5451030 caacaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat 5450931  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  5450930 actttgaacatga 5450918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 3673822 - 3674034
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |  || |||||    
T  3673822 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgcttag 3673921  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3673922 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcat 3674021  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    ||||||| |||||    
T  3674022 actttgatcatga 3674034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Original strand, 23493882 - 23494089
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  23493882 cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaa 23493981  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| |  ||  |||||||    
T  23493982 caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcatatctcaacatatacctattcttcatact 23494081  T
Q  229 ttgaacat 236  Q
    ||||||||    
T  23494082 ttgaacat 23494089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 21616977 - 21617187
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21616977 acccatttt-acaaaaccaaccacaacagctcacttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcacttag 21617075  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  21617076 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcatagttcaacatataacactttcatat 21617175  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    |||| |||||||    
T  21617176 acttggaacatg 21617187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21222890 - 21222684
Alignment:
Q  31 ttttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaaca 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21222890 ttttcacaaaaccaataacaacaactgaattctcatcatcaagtcatgatttatgaacactcaatccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca 21222791  T
Q  131 acaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  21222790 acaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcataattcaacatataacactttcatatacttt 21222691  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  21222690 gaacatg 21222684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 7728400 - 7728592
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || || ||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7728400 caacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 7728499  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7728500 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 7728592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 237
Target Start/End: Original strand, 6456594 - 6456795
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  6456594 acaaaaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaac 6456693  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  6456694 atcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacatactatgaaca 6456793  T
Q  236 tg 237  Q
    ||    
T  6456794 tg 6456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23981802 - 23981623
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23981802 acccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatca-caaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23981704  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23981703 caacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccatttgagcataattca 23981623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 24084038 - 24084248
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  24084038 acccatttttacaaaaccaaccacaacaacttattt-tcatcatcaaatcatgatttactaacacccaagccatgaatcttcaacaacaatatttcttag 24084136  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  24084137 caacaacaacatcaattaaacatgattcacatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacat 24084236  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  24084237 actatgaacatg 24084248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Original strand, 37983344 - 37983531
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37983344 caacaacaactcatttttcatcatcaaatcctgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattaaa 37983443  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaa 233  Q
    ||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  37983444 catgattctcattacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataattcacaatatatcactttcacatactttgaa 37983531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1168491 - 1168280
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||    
T  1168491 acccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttag 1168392  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1168391 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatatcattttctca 1168293  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||||||||||||    
T  1168292 tactttgaacatg 1168280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 29917929 - 29918136
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29917929 atttttacaaaaccaacgacaataatttatttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaac 29918028  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactt 229  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||   ||| ||||||     
T  29918029 aacaacatcagttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcacaatatatcctgttcacatacta 29918128  T
Q  230 tgaacatg 237  Q
    ||||||||    
T  29918129 tgaacatg 29918136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 21109710 - 21109921
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  21109710 acccattttcacaaaaccaacaatagcaacttatttcacatgacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaataacaatatctcttaa 21109809  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  21109810 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 21109909  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  21109910 actatgaacatg 21109921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 16595488 - 16595679
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||| | ||| ||||  |||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  16595488 caacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattgaa 16595587  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16595588 catgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattc-acaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatga 16595679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26560102 - 26559891
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| || |||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  26560102 acccttttttacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaattcacgatttatgaacacccaagccaagaatcatcaccaacaatatctcttag 26560003  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  26560002 caacaacaacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacat 26559903  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  26559902 actatgaacatg 26559891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 20712035 - 20712247
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || |||||    
T  20712035 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgactta 20712134  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatt-tcaacatatatcactttctc 223  Q
     ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| |  ||| ||    
T  20712135 acaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattatcaacacatacccatttttc 20712233  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  20712234 atactttgaacatg 20712247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 28902252 - 28902360
Alignment:
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcata 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28902252 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcata 28902351  T
Q  227 ctttgaaca 235  Q
    |||||||||    
T  28902352 ctttgaaca 28902360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 28938647 - 28938755
Alignment:
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcata 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28938647 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcata 28938746  T
Q  227 ctttgaaca 235  Q
    |||||||||    
T  28938747 ctttgaaca 28938755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16835586 - 16835413
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  || |||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||     
T  16835586 acccattttcacaaaaccaacaacaacagcttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacatccaagctatgaatcatcaacaacaacatctcttaa 16835487  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16835486 caacaacaacattaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcgacaattagagca 16835413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 23417202 - 23417374
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | | ||     
T  23417202 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatacctcataa 23417300  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  23417301 caacaacaacatcaattaaacatgaatgtcaccacaaatcaacaacaacatagcacaattcagcaattagagca 23417374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23234768 - 23234561
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||     
T  23234768 attttcacaaaaccaacaacaacaatttatttcacatcacaaactcatgatttatgaaaactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaat 23234669  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | ||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| | ||||  |||||||| |||| ||||||     
T  23234668 aacaacatcaattaaacatgattctcatcactaatcaacaacaaaatagcacaattcaataattagagcacaattcacaatatatcattttcacatacta 23234569  T
Q  230 tgaacatg 237  Q
    | ||||||    
T  23234568 taaacatg 23234561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11337467 - 11337262
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||| | || ||||||||||    
T  11337467 attttcacaaaac-accaacaacatctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaac 11337370  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  11337369 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaa-atgagcatattttcaacatttaccatattctcatact 11337271  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  11337270 ttgaacatg 11337262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 19405517 - 19405710
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||  || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||||| || ||  ||||| |||||||||     
T  19405517 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaatatcaattgat 19405616  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  19405617 catgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatactttgaacatga 19405710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 22885668 - 22885813
Alignment:
Q  92 caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  22885668 caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcaacataattcaacaacaacataacacaattcaataa 22885767  T
Q  192 tttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||||| | ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  22885768 tttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatg 22885813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 154
Target Start/End: Original strand, 19873804 - 19873932
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  19873804 acccattttcacagaaaaaacaacaacaacttaattcacatcacaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 19873903  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatct 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19873904 caacaacaacatcaattaaacatgaatct 19873932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 21650657 - 21650822
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||| ||| | || ||| |||||||| | ||   | || |||||||| ||    
T  21650657 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcaccacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcattcataacatcacttaaca 21650756  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  21650757 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaatt 21650822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24225604 - 24225431
Alignment:
Q  26 acccattttcac-aaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaat-catgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactt 123  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||||||||  || ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | |    
T  24225604 acccattttcacaaaaatcctcaacaacaacttaaatcacatca-caaatccatg-attatgaacacccaagttatgaatcatcaacaacaatatctcat 24225507  T
Q  124 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  24225506 aacaacaataacatcaattaaacatgaattccaccacaaatcaacaacaaaatagcacaattcaacaattagagca 24225431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32966414 - 32966283
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||| ||||| | ||||||| | |||  ||||||||||||    
T  32966414 caacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctcaagccatgaattatcaataacaacaccacttagaagcaattacatcaattgaa 32966315  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  32966314 catgaatctcaacataattcaacatcaacata 32966283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9730671 - 9730510
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||  || ||||||||    
T  9730671 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaatatgtctcagcaacaa 9730573  T
Q  132 caacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  9730572 caacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 9730510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22054097 - 22053968
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||| || | |||    
T  22054097 tcatcatcaattcatgaat-atgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaa 22053999  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22053998 ttcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 22053968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Original strand, 21906724 - 21906844
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || |||||   ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||    
T  21906724 caaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta---acaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatca 21906820  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  21906821 acaacatagcataattcatcaatt 21906844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 22882386 - 22882455
Alignment:
Q  27 cccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagc 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  22882386 cccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcaacatcaattcatgatttatgaacacccaagc 22882455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 2031783 - 2031937
Alignment:
Q  39 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    |||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || ||||||||| ||| | ||||||||||| |    
T  2031783 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 2031882  T
Q  139 aattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  2031883 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 2031937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Original strand, 11584012 - 11584201
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatg-aacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| || || |||||||||||| | || |||| |||| ||| |    
T  11584012 acccatttt-acaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaa 11584109  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatt---caacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata 213  Q
     ||||||||||| | ||||| |||||| | || |||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11584110 acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatata 11584201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18531331 - 18531202
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || | ||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||| || | |||    
T  18531331 tcatcatcaattcatgaat-atgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaa 18531233  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  18531232 ttcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 18531202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Original strand, 23466461 - 23466559
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaac 168  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||||  | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  23466461 caaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaac 23466559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24183319 - 24183232
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata 213  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24183319 caacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatata 24183232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11212358 - 11212209
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||| | || |||| ||| |  |||| ||||||| |||| |||     
T  11212358 acccattttcacaaaac-aacaacaacatctcatttctcatcatcaatccat-aattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaa 11212261  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||  | | || |||||||||||||||    
T  11212260 tagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacata 11212209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 7528906 - 7529028
Alignment:
Q  72 aatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||  |||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  7528906 aatcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaa 7529005  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||  ||||||||| |||||    
T  7529006 caacatgtcataattcatcaatt 7529028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11763795 - 11763619
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaa-ccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatc--act 122  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||| ||| ||||  |||||||| |||||| ||||||  ||     
T  11763795 acccattttctcaaaaaccattaacaacaacttaattcacatcacaaactcatga-ttatgagcacccaagttatgaatcatcaacaaaaatatccaaca 11763697  T
Q  123 t-agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
      | ||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11763696 acaacaacaacaacaacaattaaacatgaatcccatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagca 11763619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 21204887 - 21205053
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatc-aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||| ||| | || |||||||||||| |  |  || || |||||||| |    
T  21204887 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagaataaataacatcacttaac 21204986  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||   ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  21204987 aacaacaacaaatattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 21205053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Original strand, 21397055 - 21397229
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac-- 129  Q
    |||||| ||| || ||| |||| || ||||||||  | |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||      
T  21397055 tttcaccaaaacaccaagaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa 21397154  T
Q  130 -aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
     ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21397155 taacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 21397229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21297361 - 21297251
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| | |||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||| ||     
T  21297361 caacaacaacttca-ttaaacatgaatttaaccataaattaacaacaacttagcacaattcaacaattttgacataattcaacatatatcattttcacaa 21297263  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  21297262 actttgaacatg 21297251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35791392 - 35791243
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||| | || |||| ||| | |||||  |||||| |||| |||     
T  35791392 acccattttctcaaaac-aacaacaacatctcatttctcatcatcaatccat-aattatgtatacccaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaa 35791295  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||  | | || |||||||||||||||    
T  35791294 tagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacata 35791243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 24475546 - 24475715
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || |||    ||    
T  24475546 cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgact---aaa 24475642  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24475643 caacaacaacaattgatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 24475715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 28261501 - 28261658
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || || ||| || ||| | ||||||||||| |||||||     
T  28261501 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 28261600  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||| || | || ||||||| | ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28261601 cataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 28261658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 109127 - 108960
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  || |    
T  109127 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctca 109030  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  109029 gcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 108960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21310854 - 21310785
Alignment:
Q  168 caacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  21310854 caacaacttagcacaatttaacaattttagcataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatg 21310785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 11342644 - 11342812
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||  || |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||||||||  |||| || ||||||||| ||| |     
T  11342644 acccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaa 11342743  T
Q  126 c-aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    | |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  11342744 caaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 11342812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10778258 - 10778149
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | |||   ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  10778258 tttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 10778160  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  10778159 caacatcaatt 10778149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 16105604 - 16105771
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||  |||||||||  ||||||| | |||  | |||||| ||  || |    
T  16105604 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacctaagccataattcataatcaacaacatatctca 16105701  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  16105702 gcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 16105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27182814 - 27182682
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| || | | ||||||||||||||| ||||| || |     
T  27182814 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataact 27182716  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  27182715 caatctaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 27182682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1219808 - 1219768
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1219808 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 1219768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 17909467 - 17909633
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| || | ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  |  |     
T  17909467 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcacca-ccaatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtcgcat 17909564  T
Q  126 caacaacaacatcaatt-gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    || ||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  17909565 cagcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 17909633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21932669 - 21932629
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21932669 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 21932629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21938839 - 21938799
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21938839 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 21938799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22883372 - 22883332
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22883372 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 22883332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 187
Target Start/End: Original strand, 32950676 - 32950815
Alignment:
Q  47 aacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| ||| | || |||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||  | || |||||||||| ||||    
T  32950676 aacaacatcttatttctcatcttcaatccatgaat-atgcagacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaac 32950774  T
Q  147 atgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    |||||||  | | |  |||||||||||||||| | ||||||    
T  32950775 atgaatcacatctcttttcaacaacaacatagtaaaattca 32950815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 35582004 - 35582044
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35582004 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 35582044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36990058 - 36990018
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36990058 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 36990018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 23514529 - 23514638
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||| |||   ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||| || |  |||||    
T  23514529 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatca-ataattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatctctcaagaacaa 23514627  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  23514628 caacatcaatt 23514638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21647023 - 21646878
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||  ||||||  | || |||||||||||| | || |||||  || ||| | |||    
T  21647023 cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaataattatacaaacccaagccatgaattatcatcaacatcatgactaaacaa 21646924  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    ||||| || ||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  21646923 caacagcaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 21646878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 23506961 - 23507093
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || | ||| |||| |||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||  | |     
T  23506961 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatct 23507059  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  23507060 caaattaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 23507093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 25651189 - 25651408
Alignment:
Q  18 cacaaactacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaata 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25651189 cacaaagtacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaata 25651288  T
Q  118 tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||    
T  25651289 tcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacac 25651388  T
Q  218 tttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  25651389 tttcacatactttgaacatg 25651408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18381964 - 18381758
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18381964 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaa 18381865  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18381864 caacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 18381765  T
Q  232 aacatga 238  Q
    |||||||    
T  18381764 aacatga 18381758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22362051 - 22361840
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22362051 acccatttt-acaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 22361953  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  22361952 caacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacttatgtcactttctcat 22361853  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  22361852 actttgaacatga 22361840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 18398899 - 18399110
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  18398899 acccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttag 18398997  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  18398998 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatactattttctcat 18399097  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  18399098 actttgaacatga 18399110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 21623148 - 21623340
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21623148 caacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaacaacaacatcaatagaa 21623247  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21623248 catgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 21623340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33538646 - 33538445
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33538646 acaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaac 33538547  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  33538546 atcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacctttagagcataattcacaacatatcactttcacatactttgaaca 33538447  T
Q  236 tg 237  Q
    ||    
T  33538446 tg 33538445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25367503 - 25367312
Alignment:
Q  47 aacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 146  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25367503 aacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 25367404  T
Q  147 atgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25367403 atgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcatatttcaacataaaccactttctcatactttgaacatga 25367312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18629896 - 18629684
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18629896 ccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaaca 18629797  T
Q  128 acaac---aacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
    |||||   |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||    
T  18629796 acaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacattcagagcataattcacaatataccactttcaca 18629697  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||||||||||||    
T  18629696 tactttgaacatg 18629684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 34966827 - 34967038
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  34966827 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 34966926  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||  |||| |||    
T  34966927 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaattagagtacaattcacaatatatctttttcacat 34967026  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  34967027 actatgaacatg 34967038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 29605410 - 29605621
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  29605410 acccatttttacaaaaccaacaagaacaacttatttctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatttcttag 29605509  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||  |||| ||| |||| |||    
T  29605510 caacaacaacatcaattaagcatgattcacatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacattttgagcacaattcacaatatttcattttcacat 29605609  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  29605610 actatgaacatg 29605621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29160590 - 29160379
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  29160590 acccattttcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 29160491  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||  |||||||| |||| |||    
T  29160490 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcgcaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaactcacaatatatcattttcacat 29160391  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||  ||||||||    
T  29160390 accatgaacatg 29160379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 187
Target Start/End: Original strand, 19854135 - 19854276
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19854135 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaa 19854234  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19854235 catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattca 19854276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22462378 - 22462173
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22462378 attttcacaaaaccaacaacaactacttaattctcatcacaaactcatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaac 22462280  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactt 229  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| |||| |     
T  22462279 aacaacatcatttaaacatgaatctcatcacaa-ccaacaacatcatagcacaattcaacaattagagcaaaattcacaatataccactttcacatatta 22462181  T
Q  230 tgaacatg 237  Q
    ||||||||    
T  22462180 tgaacatg 22462173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 33324670 - 33324833
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33324670 caacaacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaatt 33324769  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||  ||| | || |||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  33324770 gaacatggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattca 33324833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35136282 - 35136119
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35136282 caacaacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaatt 35136183  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||  ||| | || |||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  35136182 gaacatggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattca 35136119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Original strand, 23221876 - 23222087
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact--tag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||  ||     
T  23221876 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttataa 23221975  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||  ||||| || |||| |||    
T  23221976 caacaacaatatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataatacaattcaacaattagagcataattcacaatataccattttcacat 23222075  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    | | ||||||||    
T  23222076 attatgaacatg 23222087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 23222707 - 23222922
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaaca--atatcact- 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||| ||     
T  23222707 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacatgatatctctt 23222806  T
Q  123 -tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttc 221  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| ||||    
T  23222807 ataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaataaacaacaacatagtacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc 23222906  T
Q  222 tcatactttgaacatg 237  Q
     |||| | ||||||||    
T  23222907 acatattatgaacatg 23222922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17083465 - 17083274
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||                
T  17083465 acccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaac------------ 17083378  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
           |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||| |||    
T  17083377 -------aacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcaacatatatcattttcacat 17083285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 18777110 - 18777317
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||||    
T  18777110 attttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaac 18777209  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||| |  ||| |||||||    
T  18777210 aacaacattcattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgaacatattttcaacacatacccatttttcatact 18777308  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  18777309 ttgaacatg 18777317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Original strand, 31628248 - 31628439
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||  || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || |||||||||||||||||||     
T  31628248 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 31628347  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31628348 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg 31628439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 25919593 - 25919724
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25919593 caacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatatagcaacaacaacatcaattgaa 25919692  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  25919693 catggttctcatcataattcaacaacaacata 25919724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21411270 - 21411125
Alignment:
Q  92 caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 191  Q
    |||||||||||| |  || ||||  |||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21411270 caagccatgaattataaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattgcacatgaatctcagcataatccaacatcaacatagcataattca-caa 21411172  T
Q  192 tttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21411171 tttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatga 21411125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28195360 - 28195168
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||||| | || |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||     
T  28195360 caacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattgat 28195262  T
Q  146 catgaa-tcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  28195261 cataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacatttcatcatataccattttctcatactatgaacatga 28195168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16888062 - 16887899
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||| || ||||| |||  ||||||| |||||||    
T  16888062 caacaacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaatt 16887963  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  16887962 gaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcacccaattgagcataattca 16887899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17557258 - 17557093
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||| ||||||||||  || | |||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| | | | |||||||||||||    
T  17557258 aaatcatgatttatgaacacctaaactatgaatgattaacaacaatattagttagcaacaacaacatcaattaaatatgattataatcacaattcaacaa 17557159  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17557158 caacatagca-aattcaacatctatagcataattcaacatataacactttcacatactttgaacatg 17557093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 18570243 - 18570450
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| | || || ||||||||| | || | | || |||||||| |||    
T  18570243 cattttcaccaaaccaacaacaaca-cttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaggccatgaattagcatccataacatcacttaacaa 18570341  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatac 227  Q
    |||| || || ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||    
T  18570342 caactacttctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatac 18570440  T
Q  228 tttgaacatg 237  Q
    ||||||||||    
T  18570441 tttgaacatg 18570450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15079977 - 15079815
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |  ||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  15079977 caacaacaacaacctatttctgaacc-caattcgtgaattatgaatacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaatt 15079879  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||  ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  15079878 gaacatggttctcatcataattcaacaacaatatagcataattcacccaattgagcataattca 15079815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17013910 - 17013717
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaa-catcaat 141  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||  | || || || |||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||    
T  17013910 caacaacaaccactcatttctcatcatcaattcatcatttatacatactcaggctatgaatcatcaacaacaatatttcttaataacaacaatcatcaat 17013811  T
Q  142 tgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  17013810 taaacatgaatctcatcacaaatcaacaagaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaaca 17013717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35009706 - 35009574
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  35009706 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatca 35009608  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35009607 taattcaacaacaacatagcaaaattcaccaatt 35009574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35015446 - 35015285
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  35015446 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 35015347  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  35015346 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 35015285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 18432669 - 18432814
Alignment:
Q  92 caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 191  Q
    |||||||||||| | || |||||| || || || |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18432669 caagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa 18432768  T
Q  192 tttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     || |||||| |||||||||| | |  ||| ||||||||| ||||||    
T  18432769 -ttaagcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatg 18432814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 32898756 - 32898961
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || ||||| || || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||||||| ||| | || |||||| || ||| | ||||||    
T  32898756 tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 32898855  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||||    
T  32898856 caacttcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatacttt 32898954  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  32898955 gaacatg 32898961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 19672272 - 19672457
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||| ||        ||||||||||||    
T  19672272 caacaacaacaactcatttatcatcatcaattcatgatttatgaacaccgaagttatgaatcatcaacaacaatatctct--------acaacatcaatt 19672363  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     |||||| |||| | | ||||||||||| || |||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  19672364 aaacatg-atctcatcgcaattcaacaataagatagcacaattcaacatttggagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatg 19672457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18002787 - 18002624
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | ||  ||||||| |||    
T  18002787 cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaagt-atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaa 18002689  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  18002688 caacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaatt 18002624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 26089699 - 26089862
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||| ||| | || ||| |||||||| | || | | || |||||||| |||    
T  26089699 cattttcacccaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaatt-atgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaacaa 26089797  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  26089798 caacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 26089862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 23994884 - 23995050
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | || |||||||| |    
T  23994884 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 23994983  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  23994984 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 23995050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Original strand, 32352107 - 32352217
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || || | ||||  |||||||| |||| |||    
T  32352107 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacataattcaacatttagaacacaattcacaatatatcattttcacat 32352206  T
Q  226 actttgaacat 236  Q
    ||| |||||||    
T  32352207 actatgaacat 32352217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15742516 - 15742348
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactt---a 124  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | || |||||||   |    
T  15742516 ccattttcaccaaaccagcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaaca 15742417  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  15742416 acaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 15742348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Original strand, 22440940 - 22441071
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||  ||    
T  22440940 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatgaa 22441038  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22441039 caacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 22441071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 238
Target Start/End: Original strand, 22848110 - 22848187
Alignment:
Q  161 aattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  22848110 aattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatga 22848187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 19629293 - 19629458
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  19629293 acccattttctcaaaacaatca-caacaactcatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcag 19629389  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  19629390 caacaacaacatcaattaaatcttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 19629458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32277057 - 32276891
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  32277057 acccatttttgcaaaacaaccaacagcatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatatctcag 32276960  T
Q  126 caacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||  || |||||| |||||    
T  32276959 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaataacatgtcacaattcatcaatt 32276891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 15740209 - 15740340
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||| |  || ||||  |||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  15740209 caacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattattaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattgaa 15740308  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||||||| |  | ||||||||| |||||||    
T  15740309 catgaatctcagtataattcaacatcaacata 15740340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25744498 - 25744339
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| || |||||||  || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||    
T  25744498 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 25744399  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    ||||||||| || |||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  25744398 acaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattca 25744339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 16231860 - 16231969
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||   ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  16231860 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaac-aattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 16231958  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  16231959 caacatcaatt 16231969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18087111 - 18087002
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  18087111 tttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 18087013  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  18087012 caacatcaatt 18087002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Original strand, 16106576 - 16106687
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata-tcactttctc 223  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||| || |||||| |||||||| ||| ||| ||| ||    
T  16106576 caacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaa-ttaagcatattttcaacacatactca-tttttc 16106673  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  16106674 atactttgaacatg 16106687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16300252 - 16300116
Alignment:
Q  49 caacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg-aaca 147  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||  || |||||||||||||||||||| |||     
T  16300252 caacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcatatacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaact 16300154  T
Q  148 tgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataatt 185  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  16300153 tgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataatt 16300116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19983580 - 19983439
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||| ||||||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  19983580 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 19983481  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa 173  Q
    ||||| | | | | |||||| | || ||||||||| ||||||    
T  19983480 caacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaa 19983439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 29665936 - 29666001
Alignment:
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  29665936 acaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 29666001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Original strand, 22848016 - 22848076
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacac 90  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22848016 atttttacaaaaccaacagcaacaacttatttttcatcatcaagtcatgatatatgaacac 22848076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086188
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||| ||| | || |||| ||||||| | ||  ||||| || || || ||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  16086022 aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa 16086121  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||  | |||||||| ||| || |||||| |||||||| ||| |  ||| || |||||||||||||    
T  16086122 caacaaggtataattcaccaa-ttaagcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatg 16086188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18823672 - 18823515
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||  || ||| |||||||| ||| | || ||||||||| || | || |||||| || || || ||||||||||    
T  18823672 acaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaac 18823574  T
Q  136 atcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  18823573 atcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 18823515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Original strand, 27740837 - 27740966
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || ||| |||||| ||| | ||||||| ||||  ||  | |||| |||||||||||||||||||| || | |||    
T  27740837 tcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaa 27740935  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  27740936 ttcaacaacgacttagcaaaattcaccaatt 27740966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 10488667 - 10488707
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10488667 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 10488707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16376661 - 16376621
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16376661 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 16376621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16383985 - 16383945
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16383985 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 16383945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16556427 - 16556387
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16556427 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 16556387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16632983 - 16632943
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16632983 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 16632943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 206
Target Start/End: Original strand, 21931263 - 21931343
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||| |||||| ||||    
T  21931263 caacaacaacttcatttgaacatgaattcaaccacaaatcaacaacaacataacacaactcatcaatttaagcataattca 21931343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Original strand, 18583377 - 18583444
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  18583377 caacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 18583444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33314505 - 33314466
Alignment:
Q  33 ttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33314505 ttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 33314466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18839527 - 18839370
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||  || ||| |||||||| ||| | || ||||||||| || | || |||||| || || || ||||||||||    
T  18839527 acaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaac 18839429  T
Q  136 atcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||| ||| ||| ||  ||| ||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||    
T  18839428 atcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaataacatgtcataagtcatcaatt 18839370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 105
Target Start/End: Original strand, 32352040 - 32352102
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatca 105  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  || |||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  32352040 caacaacaacaacttatttcacaacacaaattcatgatttatgaacactcaagccaagaatca 32352102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 4991033 - 4991200
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||  | |||  | |||||| ||  || |    
T  4991033 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccaaaattcatgatcaacaacatatctca 4991130  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  4991131 gcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 4991200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14626385 - 14626253
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| |||| | |||||||||||| || |||||  | |     
T  14626385 ttctcataatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatct 14626287  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14626286 caagttaacaacaacttagcataattcaccaatt 14626253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 18583295 - 18583370
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaat 103  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  18583295 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaat 18583370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 19175210 - 19175283
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||    
T  19175210 caacaacaacttcatttaaacatgaattcaaccacaaatcaacaacaacatagtacaattcatcaatttaagca 19175283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 19609981 - 19610104
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||| | | || |||| ||||| ||||  ||||||  |||| |||     
T  19609981 acccattttctcaaaac-aacaacaacatctcatttctcatcatcaatccat-aattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaa 19610078  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaa 151  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||    
T  19610079 caataacaacatcaatggaatatgaa 19610104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22226026 - 22225986
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  22226026 tttcacaaaaccaccaacaagaatttatttctcatcatcaa 22225986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2603 - 2391
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  2603 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttag 2504  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2503 gaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatgtcactttctcat 2404  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    |||||||||||||    
T  2403 actttgaacatga 2391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Original strand, 20177141 - 20177347
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  20177141 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa 20177240  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg 231  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20177241 caacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 20177340  T
Q  232 aacatga 238  Q
    |||||||    
T  20177341 aacatga 20177347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 17608889 - 17609099
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  17608889 acccattttc-caaaaccaacaacaacaactcaattctcataatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaa 17608987  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  17608988 caacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcatat 17609087  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  17609088 actttgaacatg 17609099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37234146 - 37233936
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37234146 acccatttt-acaaaaccaaccacaaaaactcaattttcatcatcaaatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttag 37234048  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  37234047 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatatatcactttcatat 37233948  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  37233947 actttgaacatg 37233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 21194969 - 21195184
Alignment:
Q  21 aaactacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatca 120  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  21194969 aaacaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatct 21195068  T
Q  121 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcacttt 220  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  21195069 cttaacaacaacaacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcatttt 21195168  T
Q  221 ctcatactttgaacat 236  Q
    | |||||| |||||||    
T  21195169 cacatactatgaacat 21195184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51627947 - 51627739
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||| || |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||  |||||||||||||    
T  51627947 atttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaac 51627848  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactt 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  51627847 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacatatttcaacatataccattttctcatactt 51627748  T
Q  230 tgaacatga 238  Q
    |||||||||    
T  51627747 tgaacatga 51627739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22143635 - 22143468
Alignment:
Q  39 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22143635 aaaccaacaacaacaatcgatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatc 22143536  T
Q  139 aattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||| ||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22143535 aattgagcatggttctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataattca 22143468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40436556 - 40436345
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  40436556 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 40436457  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
     |||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  40436456 aaacaacaacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 40436357  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    | | ||||||||    
T  40436356 attatgaacatg 40436345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 33397312 - 33397523
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  33397312 acccattttcacaaaaccaacaaccacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacacaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 33397411  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||| | |||| |||    
T  33397412 caacaacaagatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatattattttcacat 33397511  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    | | ||||||||    
T  33397512 attatgaacatg 33397523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8538196 - 8537986
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  8538196 acccatttttacaaa-ccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaa 8538098  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||| | ||||  ||||| || |||| |||    
T  8538097 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaattcacaatataacattttcacat 8537998  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  8537997 actatgaacatg 8537986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8603435 - 8603225
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  8603435 acccatttttacaaa-ccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaa 8603337  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||| | ||||  ||||| || |||| |||    
T  8603336 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaattcacaatataacattttcacat 8603237  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  8603236 actatgaacatg 8603225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13377121 - 13376963
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  13377121 tttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaacaa 13377022  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaaca 190  Q
    ||||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13377021 caacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataattcaaca 13376963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Original strand, 16645975 - 16646084
Alignment:
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16645975 caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataattcaacatatatcactttctcatact 16646074  T
Q  229 ttgaacatga 238  Q
    ||||||||||    
T  16646075 ttgaacatga 16646084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 16656699 - 16656807
Alignment:
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcata 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16656699 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcata 16656798  T
Q  227 ctttgaaca 235  Q
    |||||||||    
T  16656799 ctttgaaca 16656807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 52400591 - 52400802
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||   | || |||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  52400591 acccattttcacaaaatcaaccacaacaacttatttcacatcaccaactcatgatttatgaacatttacgctatgaatcatcaacaacaacatctctcag 52400690  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  52400691 caacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttcacat 52400790  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  52400791 actatgaacatg 52400802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 76659 - 76487
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||     
T  76659 acccattttcacaaagccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataa 76561  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  76560 taacaacaatatcaattaaacatgaatctcaccgcatttcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagca 76487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5768462 - 5768246
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaa------caacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||  || |||| | |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  5768462 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcataatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatc 5768363  T
Q  120 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactt 219  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| ||    
T  5768362 tcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattt 5768263  T
Q  220 tctcatactttgaacat 236  Q
    || |||||| |||||||    
T  5768262 tcacatactatgaacat 5768246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41229206 - 41229096
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41229206 caacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 41229107  T
Q  146 catgaatctta 156  Q
    ||||| |||||    
T  41229106 catgattctta 41229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 35054715 - 35054927
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || ||||||||    
T  35054715 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcactta 35054814  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||    
T  35054815 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttc 35054913  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  35054914 atactttgaacatg 35054927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36356557 - 36356374
Alignment:
Q  49 caacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacat 148  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36356557 caacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacat 36356458  T
Q  149 gaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttga 232  Q
    |||||| | || || |||||| ||||||| || ||||  ||| || ||||||| |   |||||||||| ||||  |||||||||    
T  36356457 gaatctcagcataaatcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataatatgacatatatcattttcatatactttga 36356374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49997551 - 49997357
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta-gcaacaacaacatcaat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  49997551 caacaacaacaacttatttctcatcaacaac-catgatttatgaacaccaaatccatgaatgatcaacaacaatatctcttaagcaacaacaacatcagt 49997453  T
Q  142 tgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    | ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| | | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  49997452 taaacatgattctcaccttaattcaacaacaacatagcacaattcaaaatttagagtacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatg 49997357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 25093826 - 25094019
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||   ||||  |||     
T  25093826 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatga-ttatgaacacccaagctataaatcatcaacaa---tatctttta- 25093920  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || || | ||||  |||||||| ||||||||    
T  25093921 --acaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagaacacaattcacaatatatcattttctcat 25094018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35522601 - 35522439
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||    
T  35522601 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaac 35522503  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35522502 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 35522439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27330040 - 27329865
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||   ||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || ||||||||    
T  27330040 tacctattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttgacaaca---aattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcactta 27329944  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27329943 acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattt 27329865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 21718237 - 21718399
Alignment:
Q  75 catgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  21718237 catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaac 21718336  T
Q  175 atagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  21718337 atagcataattcaccaa-ttgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatg 21718399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Original strand, 20194005 - 20194149
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |      
T  20194005 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcactaacccatga-ttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcatga 20194103  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatga-atcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | || |||||||||||||    
T  20194104 caacaacaacatcaattaaacatgacaacgtaacacaattcaacaa 20194149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 19603077 - 19603208
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||| | ||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19603077 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacacccaagtcatgaattatcaataaccacatcacttagcagcaactacatcaattgaa 19603176  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  19603177 catgaatttcagcataattcaacatcaacata 19603208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 27674777 - 27674907
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  27674777 caacaacaactcatttctcatcaa-aaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttaacaacaactacaccaattgaa 27674875  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||||||| | || ||||||||  |||||||    
T  27674876 catgaatctcagcataattcaacctcaacata 27674907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38033940 - 38033755
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  38033940 caacaacaacttatttctcatcaacaa-tcgtgaactatgcacacccaagccatgaattaacaacagcaacatcacttagcagcaatcacatcaattgaa 38033842  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttga 232  Q
    ||||||||| | || ||||||||| ||| ||| || || |  ||| || ||||||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  38033841 catgaatctcaacataattcaacatcaatatatcacaacttgacatttagagcataatataacatatatcattttcatatactttga 38033755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22829691 - 22829560
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |  || |||||||| ||||||  |||||||| |||    
T  22829691 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagaaaaatcacttaacaacaattacatcaatggaa 22829592  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    |||||| || | || ||||||||  |||||||    
T  22829591 catgaaactcaacataattcaacctcaacata 22829560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9784248 - 9784140
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  9784248 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa---agcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctca 9784153  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||||||||||||    
T  9784152 tactttgaacatg 9784140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9784377 - 9784237
Alignment:
Q  37 caaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||||||    
T  9784377 caaaaacatcaacaacaactcattttctcaccttcaaatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaac 9784278  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacat 176  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9784277 atcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaacaacat 9784237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 21859974 - 21860138
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| ||| | || | ||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||    
T  21859974 cattttcaccaaaccaacaacaacaattcatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaa 21860073  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||| | ||| | |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  21860074 caacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 21860138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21650328 - 21650167
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || | ||||||    
T  21650328 tttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaacaa 21650230  T
Q  132 caacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21650229 caacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 21650167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20955704 - 20955575
Alignment:
Q  48 acaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaca 147  Q
    ||||||||| ||||| || || ||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20955704 acaacaactcatttcacaccaacaattcacgaattattcacaccgaagccatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaactacatcaattgaaca 20955605  T
Q  148 tgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  20955604 tgaatttcagcataattcaacatcaacata 20955575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22403351 - 22403220
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||||||||| || || | |||||| |||| ||||||||| |||    
T  22403351 aaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaa 22403253  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22403252 caacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 22403220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 22366979 - 22367127
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||| |||| |||| || ||||||||| ||| |     
T  22366979 acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaa 22367078  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  22367079 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 22367127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 236
Target Start/End: Original strand, 41212033 - 41212241
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact---tagc 126  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || |||    | |    
T  41212033 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaac 41212132  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcata 226  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||||| || | ||||||||||||  ||| ||| |  ||| |||||    
T  41212133 aacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattc-actaattgagcatatttttacacatacccatttttcata 41212231  T
Q  227 ctttgaacat 236  Q
    ||||||||||    
T  41212232 ctttgaacat 41212241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 204
Target Start/End: Original strand, 49967677 - 49967787
Alignment:
Q  93 aagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaat 192  Q
    |||| |||||| | || |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  | |||||||| |||     
T  49967677 aagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaa- 49967775  T
Q  193 ttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||    
T  49967776 ttgagcatattt 49967787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 17148535 - 17148644
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || ||||||||    
T  17148535 tttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaac-aattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaa 17148633  T
Q  132 caacatcaatt 142  Q
    |||||||||||    
T  17148634 caacatcaatt 17148644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 20445675 - 20445807
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| || | | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  20445675 ttctcatcctcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataaca 20445773  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  20445774 caattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 20445807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 20531440 - 20531572
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| || | | |||||||||||| || ||||| || ||    
T  20531440 ttctcatcctcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataaca 20531538  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  20531539 caattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 20531572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15861719 - 15861554
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||| |||| |||| || ||||||||| ||| |     
T  15861719 acccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaatatgactaaa 15861620  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||  ||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  15861619 ca--aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 15861554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 17004606 - 17004646
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17004606 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 17004646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18060046 - 18060006
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18060046 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 18060006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38055379 - 38055339
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38055379 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 38055339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44035256 - 44035105
Alignment:
Q  35 cacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaa 134  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||| || ||||| |||||| ||| | || |||||||| | ||| || |||| |||| ||| | |||||||||    
T  44035256 cacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaaacaacaacaa 44035158  T
Q  135 catcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    || | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  44035157 caaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 44035105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37844718 - 37844592
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||| || |     
T  37844718 ttctcatcctcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataact 37844620  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    ||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  37844619 caatctaacaacaacttagcaaaattca 37844592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 5899 - 6114
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5899 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 5998  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatca-ctttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  5999 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttct 6098  T
Q  223 catactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  6099 catactttgaacatga 6114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 579
Alignment:
Q  33 ttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaac 132  Q
    |||||||||||| |||||| ||   |||||||| || ||||| || ||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||||||| | | |  | ||||    
T  739 ttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaac 640  T
Q  133 aacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  639 aacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 28497 - 28706
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  28497 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 28595  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28596 caacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat 28695  T
Q  226 actttgaacat 236  Q
    |||||||||||    
T  28696 actttgaacat 28706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 69418 - 69628
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  69418 acccatttt-acaaaaccaacaacaacacctcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 69516  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  69517 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat 69616  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||| ||||||    
T  69617 actttaaacatg 69628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 35449 - 35650
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  35449 acaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaac 35547  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35548 atcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatactttgaaca 35647  T
Q  236 tga 238  Q
    |||    
T  35648 tga 35650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 2497 - 2696
Alignment:
Q  38 aaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacat 137  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2497 aaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacat 2596  T
Q  138 caattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2597 caattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcatatactttgaacatg 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 6631 - 6833
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |  ||||||    
T  6631 acaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttaggagtaacaac 6730  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6731 atcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaacatatatcactttctcatactttgaaca 6830  T
Q  236 tga 238  Q
    |||    
T  6831 tga 6833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 4522 - 4735
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4522 taccaattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 4621  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||    
T  4622 gcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttc 4721  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  4722 atactttgaacatg 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 9136 - 9349
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9136 taccaattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 9235  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||    
T  9236 gcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttc 9335  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  9336 atactttgaacatg 9349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7287 - 7102
Alignment:
Q  51 acaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatga 150  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7287 acaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaacatga 7188  T
Q  151 atcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 236  Q
     ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7187 ttcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacat 7102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8444 - 8333
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||||| |||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  8444 ttctcatcatcaattcatgtat-atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatca 8346  T
Q  160 caattcaacaaca 172  Q
     ||||||||||||    
T  8345 taattcaacaaca 8333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 170
Target Start/End: Original strand, 11730 - 11850
Alignment:
Q  49 caacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg-aaca 147  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || |||||||||||||||||||| |||     
T  11730 caacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcat-aacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattgaaact 11827  T
Q  148 tgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||    
T  11828 tgattctcacctcaattcaacaa 11850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 7130 - 7344
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7130 taccaattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 7229  T
Q  125 gcaacaacaacat-caattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttct 222  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |  ||| |    
T  7230 gcaacaacaacatccaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccattttt 7329  T
Q  223 catactttgaacatg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  7330 catactttgaacatg 7344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 6504 - 6715
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6504 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttag 6603  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||||||| |||| |||    
T  6604 caacaacatcatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagtataactcacaatatatcattttcacat 6703  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  6704 actatgaacatg 6715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15762 - 15581
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact-- 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || || |||      
T  15762 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatctataacatgactaa 15663  T
Q  123 -tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
      | ||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15662 acaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 15581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 30981 - 31191
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30981 acccatttt-acaaaagcaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcttgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatcacttag 31079  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  31080 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcataattcaacatataacactttcacat 31179  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  31180 actatgaacatg 31191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11266
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  11054 tacccatttttacaaa-ccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacata 11152  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11153 gcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcataattcaacatatatcactttcaca 11252  T
Q  225 tactttgaacatga 238  Q
     |||||||||||||    
T  11253 cactttgaacatga 11266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 46124 - 46302
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46124 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 46223  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  46224 gaaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattt 46302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 40617 - 40795
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40617 tacccattttcaccaaaccaacaacaacagcttatttcaaattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 40716  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40717 gcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaacaatatagcataattcaccaa-ttgagcatattt 40795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 79820 - 79991
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaac---aacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcac 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || |||| |||| ||    
T  79820 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgac 79919  T
Q  122 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa-catagcataattcaacaatt 193  Q
    | | ||||||||||| | ||| | |||||| | || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  79920 taaacaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaatt 79991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44084 - 43873
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44084 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 43986  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||  ||| || || |  | |||||||||||||||||||  ||    
T  43985 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaatttgacatttagaacccaattcaacatatatcactttcatat 43886  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
     ||||||||||||    
T  43885 cctttgaacatga 43873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23959 - 23748
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  23959 acccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttttcatcatcaaattatgatatacgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaa 23860  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  23859 caacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacat 23760  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  23759 actatgaacatg 23748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 109570 - 109762
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  || | || |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  109570 caacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaactgat 109669  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  109670 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttaaacatga 109762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 103189 - 102997
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    ||||||||||| |||| ||| || ||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| | || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  103189 caacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaattgaa 103090  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  103089 catgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattccaccatataccactttctcatactttgaacatga 102997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 68244 - 68072
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||| | |      
T  68244 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacaaccaagctatgaatcatcaaaaacaatatctcatga 68146  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  68145 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaattcaacaattagagca 68072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 112809 - 112621
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||||||   | ||||| |||||||||||| ||||||     
T  112809 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcaacaaca---tgacttaacaacaacaacataaattgat 112713  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  112712 catgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattc-actaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatg 112621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Original strand, 131813 - 131939
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  131813 caacaacaagaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaaaaatatttcttaacaacaacaacaacaatt 131912  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
     | ||||| ||| | ||||||||||||    
T  131913 aagcatgattctcatcacaattcaaca 131939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 211
Target Start/End: Original strand, 279 - 454
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  279 acaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagcaacaacaac 378  T
Q  136 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacata 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  379 atcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaacata 454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 33624 - 33833
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33624 tacccattttcaccaaaccaac---aacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 33720  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcat-atttcaacatatatcactttctc 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  33721 gcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaaacataatttcaacatataccaatttctc 33819  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  33820 atactttgaacatg 33833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 33540 - 33612
Alignment:
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |  ||| ||||||||||||||    
T  33540 aacaacaacttcaattgaacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatctcaatccaacaatttgagca 33612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 197523 - 197332
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197523 caacaacaacaactcaattctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 197424  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaac 234  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  197423 gaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataattcaacttataacactttcacatactttgaac 197332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7962 - 7751
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  7962 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 7863  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  7862 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacat 7763  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  7762 actatgaacatg 7751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 97484 - 97274
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  97484 acccatttt-acaaaaccaataacaacaactcaattcttatcatcaaatcatgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaattag 97386  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  97385 taacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat 97286  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  97285 actttgaacatg 97274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Original strand, 70676 - 70786
Alignment:
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatac 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  70676 caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaacatattccattttctcatac 70775  T
Q  228 tttgaacatga 238  Q
    |||||||||||    
T  70776 tttgaacatga 70786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Original strand, 31024 - 31216
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||| ||| | || ||| ||  |||| || || |||||||||||||| |     
T  31024 caacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaacaacatcaattaat 31123  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  31124 catgaaacttatcacaattcaacaactaca-aacataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccattttcttatactttgaacatga 31216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2610
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2419 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 2518  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttc 221  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||| | | || || ||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  2519 aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataaattatcatttagagcataatataacatatatcattttc 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9156 - 8957
Alignment:
Q  39 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    |||||| | |||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | ||  ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9156 aaaccaccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 9057  T
Q  139 aattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9056 aattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatatcaacatatatcattttctcatactttgaacatga 8957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5531 - 5356
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || ||| |||||||| | || |||||| || ||||||||    
T  5531 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagca 5432  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  5431 acaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaa-ttgagcatattt 5356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 53308 - 53517
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  53308 acccatttt-acaaaaccaacaacaacacgtcaattctcatcatcaaatcatgattaatga-ctcccaagccatgaatcattaacaacaatgtcacttag 53405  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  53406 caacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataattcaacatataacaccttcacat 53505  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||    
T  53506 actttgaacatg 53517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 85493 - 85704
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  85493 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacctatttttcatcaacaaaccatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctcttag 85592  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||| |||| || ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||    
T  85593 caacaacaatatcacttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcattaatttgagcataattcacaatatatcattttcacat 85692  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  85693 actatgaacatg 85704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 146560 - 146772
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | || ||||||||    
T  146560 tacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcactta 146659  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||    
T  146660 acaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttc 146758  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  146759 atactttgaacatg 146772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Original strand, 8848 - 8977
Alignment:
Q  63 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaa 162  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||  | ||| |||||||||||||||| |||| || | |||    
T  8848 tcatcatcaattcatgaat-atgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaa 8946  T
Q  163 ttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  8947 ttcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 8977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 27457 - 27669
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  27457 acccatttttacaaaaccgacaacaacaactcatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 27556  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  27557 caacaacatcatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagggcacaattcacaatatatcattttcacat 27656  T
Q  226 actttgaacatga 238  Q
    ||| |||||||||    
T  27657 actatgaacatga 27669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 86317 - 86527
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  86317 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 86416  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| | | | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  ||||| || |||| |||    
T  86417 caacaaaaacatcaattaaacatgattatcatcacaattgaactataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataacattttcacat 86516  T
Q  226 actttgaacat 236  Q
    ||| |||||||    
T  86517 actatgaacat 86527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 193781 - 193657
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatc-aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  193781 ccattttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 193682  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaa 151  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  193681 aacaacaacatctattgatcatgaa 193657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 186822 - 186695
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaa---caacttatttctcatcatc-aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactt 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || || | |||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||    
T  186822 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcactt 186723  T
Q  124 agcaacaacaacatcaattgaacatgaa 151  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  186722 aacaacaacaacatctattgatcatgaa 186695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 3229 - 3422
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3229 caacaacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 3328  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  3329 aaacatg-atttcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcccaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatg 3422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 7362 - 7564
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||  | |||||||||| |||||    
T  7362 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctcttag 7461  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  7462 caacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttcacat 7561  T
Q  226 act 228  Q
    |||    
T  7562 act 7564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Original strand, 16787 - 16989
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||  | |||||||||| |||||    
T  16787 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctcttag 16886  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  16887 caacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttcacat 16986  T
Q  226 act 228  Q
    |||    
T  16987 act 16989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 4907 - 5112
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||    
T  4907 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 5006  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  5007 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctcatactgt 5105  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  5106 gaacatg 5112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34682 - 34601
Alignment:
Q  107 caacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    ||||||||| ||||  || |||||| |||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34682 caacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca 34601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33994 - 33803
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| ||| ||| | || |||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33994 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 33896  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  33895 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatatttcaacatataacacttcttcatactttaaacatga 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 104892 - 104730
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104892 caacaacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 104793  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
     ||||||  | | | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  104792 -aacatggttatcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccatttgagcataattca 104730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 94039 - 93848
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||  ||||||| | || |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  94039 caacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcacttattaataacaacatcaattgaa 93940  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  93939 catgaatttcatcacaatttaacaac-acatagcatacttcaataatttgagcatatttcaacaaataccattttctcatactttgaacatga 93848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 55542 - 55708
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  55542 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 55641  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  55642 aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 55708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 864 - 652
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||   || |||||||||||| | || |||||| || |||||    
T  864 taccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta 765  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctc 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  764 gcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-atgagcatattttcaacatataccattttctc 666  T
Q  224 atactttgaacatg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  665 atactttgaacatg 652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22709 - 22529
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||| |||     
T  22709 acccatttttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcataattcatgaacacccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaattaa 22610  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22609 caacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaattcaataatttgagcataattca 22529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 21473 - 21683
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||    
T  21473 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttag 21571  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctca 224  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  21572 caacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccattttctca 21670  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||||||||||||    
T  21671 tactttgaacatg 21683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 31172 - 31381
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||    
T  31172 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttag 31270  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctca 224  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  31271 caacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaa-ttgagcatattttcaacatataccattttctca 31369  T
Q  225 tactttgaacat 236  Q
    ||||||||||||    
T  31370 tactttgaacat 31381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 79516 - 79679
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79516 caacaacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaatt 79615  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||  ||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||    
T  79616 gaacatggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataattca 79679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 89655 - 89589
Alignment:
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  89655 aacaacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaatt 89589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 130517 - 130684
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  || |    
T  130517 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctca 130614  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  130615 acaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 130684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Original strand, 159266 - 159472
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||  ||| | || ||||   |||||||||||||    
T  159266 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcatcaac---atcacttagcaac 159362  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcat-atttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  159363 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatact 159462  T
Q  229 ttgaacatga 238  Q
    ||||||||||    
T  159463 ttgaacatga 159472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 85298 - 85503
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||  || |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||| |||||||| | || |||||| || ||||||||||||    
T  85298 tttcaccaaaacaccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 85397  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  85398 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaatatataccaatttctcatacttt 85496  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  85497 gaacatg 85503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 29941 - 30135
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29941 caacaacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacgtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaatt 30040  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  30041 aaacatgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaacaattagagcaaaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatg 30135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 21978 - 22170
Alignment:
Q  45 acaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  | || |||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  21978 acaacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacatacccaagctgtgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaa 22077  T
Q  145 acatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| | ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  22078 acatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcccaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatg 22170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 37535 - 37729
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37535 caacaacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 37634  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||| |||   | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  37635 aaacatgattctcgtctcaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatg 37729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 236
Target Start/End: Original strand, 3311 - 3489
Alignment:
Q  58 atttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttac 157  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  3311 atttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatcttat 3410  T
Q  158 cacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3411 cacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttcacatataccactttctcatactttgaacat 3489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 109745 - 109538
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| |  | |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||    
T  109745 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 109646  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  109645 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattt-atcatattttcaatatataccaatttctcatact 109547  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  109546 ttgaacatg 109538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 118246 - 118039
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| |  | |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||    
T  118246 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 118147  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  118146 aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgaacatattttcaacatataccaacttctcatact 118048  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  118047 ttgaacatg 118039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Original strand, 11660 - 11860
Alignment:
Q  39 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | |  |||||||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11660 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatc 11759  T
Q  139 aattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcat-atttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  11760 aattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacatg 11859  T
Q  238 a 238  Q
    |    
T  11860 a 11860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 132531 - 132327
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || ||||||||  | |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||||    
T  132531 tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa 132432  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||    
T  132431 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatacttt 132333  T
Q  231 gaacat 236  Q
    ||||||    
T  132332 gaacat 132327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 88326 - 88446
Alignment:
Q  117 atcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatc 215  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||| |    
T  88326 atcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgatcatattttcaacacatacc 88424  T
Q  216 actttctcatactttgaacatg 237  Q
      ||| ||||||||||||||||    
T  88425 catttttcatactttgaacatg 88446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 107971 - 108180
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||     
T  107971 acccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaa-aattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatcttaa 108069  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatctt-accacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctca 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| || |||| ||    
T  108070 caacaacaacatcaattaaacatg-atcttcatcacaattcaacaataaca-agcataattcaacatttagagcataattcataatataccattttcaca 108167  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||| ||||||||    
T  108168 tactatgaacatg 108180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Original strand, 4566 - 4776
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   ||||     
T  4566 acccatttttacaaa-caaacaacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaa 4664  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||    
T  4665 caacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacat 4764  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  4765 actatgaacatg 4776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1236 - 1109
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaac---ttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  1236 acccatttttacaaaaccaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct 1137  T
Q  123 tagcaacaacaacatcaattgaacatga 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1136 tagcaacaacaacatcaattaaacatga 1109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25012 - 24804
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| || ||||||| |||| | || | | || |||||||| |||    
T  25012 cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaa 24913  T
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatat-ttcaacatatatcactttctcatac 227  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||    
T  24912 caacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatatgttcaacacatacccatttttcatac 24814  T
Q  228 tttgaacatg 237  Q
    ||||||||||    
T  24813 tttgaacatg 24804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 94937 - 95096
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || ||| |||||||| | || | | || |||||||| ||    
T  94937 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatca 95036  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  95037 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 95096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 8951 - 9158
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | | | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||    
T  8951 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 9050  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9051 aacaacatcaagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact 9149  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  9150 ttgaacatg 9158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16111 - 15953
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16111 caacaacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 16012  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 201  Q
     ||||||  |||   || ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  16011 aaacatggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3127 - 2969
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3127 caacaacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccatgtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 3028  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 201  Q
     ||||||  |||   || ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  3027 aaacatggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 2969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 135
Target Start/End: Original strand, 5159 - 5251
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5159 caacaacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacatagcaacaacaac 5251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Original strand, 1880 - 2088
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||||||| |||| | || || ||| || ||||||||||    
T  1880 attttcaccaaaccactaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaac 1979  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||    
T  1980 aacaacatcaattgatcatgaatcttataacaaatcaacaac-acatagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatataccattttcgcatact 2078  T
Q  229 ttgaacatga 238  Q
    ||||||||||    
T  2079 ttgaacatga 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Original strand, 106 - 291
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || ||     
T  106 acccatttt-acaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat 203  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  204 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatata 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 7994 - 8145
Alignment:
Q  50 aacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatg 149  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7994 aacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg 8093  T
Q  150 aatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 201  Q
      ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  8094 gttctcatcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcata 8145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4594 - 4436
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4594 caacaacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaaatcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 4495  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 201  Q
     ||||||  |||   || ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  4494 aaacatggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 4436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 135
Target Start/End: Original strand, 1571 - 1663
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1571 caacaacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 253270 - 253069
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||  ||||||||||| ||| | || |||||| ||||| | || |||||| || ||||| ||| ||    
T  253270 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaaa 253171  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  253170 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaatttctcatacttt 253072  T
Q  231 gaa 233  Q
    |||    
T  253071 gaa 253069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1160 - 988
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||| | ||     
T  1160 acccattttcacaaaacaaacaacaccaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacacaagctatgaatcattaacaacgatatctcataa 1062  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1061 caacaacaacatcaattaaacatgaatctccccacatttcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagca 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 1341 - 1551
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||| | | || |||||| || || |||    
T  1341 acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgacatag 1440  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctca 224  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  1441 caacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaa-ttgagcatattttcaacatataccaatttctca 1539  T
Q  225 tactttgaacat 236  Q
    ||||||||||||    
T  1540 tactttgaacat 1551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 10639 - 10802
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10639 caacaacaacaattcatttttcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaatt 10738  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||  ||| | || ||||| |||||||| || |||||| |||| | || |||||| ||||    
T  10739 gaacatggttctcatcataattcgacaacaacgtatcataatccaaccaattaagcataattca 10802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 806 - 617
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||   || |||||||||||| | || |||||| || |||||    
T  806 taccaattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta 707  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatat 214  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  706 gtaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-atgagcatattttcaacatatat 617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 19202 - 19334
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||| || |     
T  19202 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataact 19300  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  19301 caattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 19334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 21286 - 21418
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||| || |     
T  21286 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataact 21384  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  21385 caattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 21418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Original strand, 1795 - 1944
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  1795 acccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttcacatcatcaattcatgatttatg-acacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaa 1893  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacata 177  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  1894 caacatcaacatcaattaaacatgattctcatcacaattc-acaacaacata 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 70576 - 70413
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  70576 caacaataacaacccatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaatt 70477  T
Q  143 gaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||||||   || | || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  70476 gaacatggtcctcatcataattcaacaacaatataacataattcacccaattgagcataattca 70413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 116790 - 116687
Alignment:
Q  36 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 135  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  116790 acaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaac 116691  T
Q  136 atca 139  Q
    ||||    
T  116690 atca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 164177 - 164350
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| ||| || ||||| || || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| |||| |||||| || ||| | ||    
T  164177 ccattttcaccaaaacaccaacaccatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaaca 164276  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatat 202  Q
    ||||||||| || |||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  164277 acaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatat 164350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 116700 - 116628
Alignment:
Q  165 caacaacaacatagcataattcaacaatttgagca-tatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  116700 caacaacaacat--cataaatcatccatttgagcaatatttcaacatatatcattttctcatactttgaacatga 116628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 162468 - 162325
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc-aaca 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || ||||||||  |||| || ||||||||| ||| | | ||||    
T  162468 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaaca 162369  T
Q  131 acaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    |||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  162368 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 162325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 166546 - 166460
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatat 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||| ||| || |||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| || |||||||||    
T  166546 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatat 166460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 90131 - 90037
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatca 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  90131 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaacatca 90037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13020 - 12848
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  ||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | ||     
T  13020 acccattttcacaaaaccatcaacaacaacttaaattacatcataaatccatga-ttatgaacacccaagttatgaatcatcaacaacaatatctcataa 12922  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    |||||||||||||| || |||||||||   ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12921 caacaacaacatcatttaaacatgaattccaccacacatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagca 12848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33700 - 33528
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||| | |      
T  33700 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctataaatcatcaacaataatatctcatga 33602  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  33601 caacaacaacatcaattaaatgtgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaatttaacaattagagca 33528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 9917 - 10084
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 145  Q
    |||||||| || |||||||  || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || |||||||||||||||||||     
T  9917 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 10016  T
Q  146 catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10017 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatata 10084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Original strand, 13 - 192
Alignment:
Q  58 atttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttac 157  Q
    |||||||| || ||||| |||||  ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  13 atttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttat 112  T
Q  158 cacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  113 cacaattcatcaaccacgtagcataattc-acgaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatg 192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3059 - 2886
Alignment:
Q  29 cattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||    
T  3059 cattttcacaaatccaacaataacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcttttaacaa 2960  T
Q  129 caac---aacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagca 199  Q
    ||||   ||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||    
T  2959 caacaacaacataaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataatacaattcaacaattagagca 2886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 1295 - 1488
Alignment:
Q  44 aacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 143  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  1295 aacaccaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 1394  T
Q  144 aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||| || ||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  1395 atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcatcacatacccatttttcatactttgaacatg 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11892 - 11764
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||    
T  11892 aaatcatgagttatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaa---caattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 11797  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||  ||||||||| || | ||||||||||||    
T  11796 caacaatgcataattc-actaattgagcatattt 11764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Original strand, 147515 - 147612
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  147515 tacccattttcaccaaaccaac---aacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 147611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17610 - 17441
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaaca---cgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact 122  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17610 acccattcccacaaaaccgataacaacaactgatttcaaatca-caaatcatgagttatgaacatcactcaagccatgaatcatcaacaacaatatctct 17512  T
Q  123 tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17511 taaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 17441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 61523 - 61354
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaaca---cgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcact 122  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  61523 acccattcccacaaaaccgataacaacaactaatttcaaatca-caaatcatgagttatgaacaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatctct 61425  T
Q  123 tagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  61424 taaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 61354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 154295 - 154255
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  154295 tttcacaaaaccaccatcaacaatttatttctcatcatcaa 154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1812 - 1653
Alignment:
Q  49 caacaactt-atttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta-gcaacaacaacatcaattgaac 146  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  || |  |||||||||| |||||||| |    
T  1812 caacaacttcattcctcgtcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagc 1713  T
Q  147 atgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  1712 atggttctcatcataattcaacaacaacatagcataattcacccatttgaacataattca 1653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8957 - 8798
Alignment:
Q  49 caacaactt-atttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta-gcaacaacaacatcaattgaac 146  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  || |  |||||||||| |||||||| |    
T  8957 caacaacttcattcctcgtcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagc 8858  T
Q  147 atgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttca 206  Q
    |||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  8857 atggttctcatcataattcaacaacaacatagcataattcacccatttgaacataattca 8798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 25322 - 25515
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaa-catcaat 141  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||  | || || || |||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||    
T  25322 caacaacaaccactcatttctcatcatcaattcatcatttatacatactcaggctatgaatcatcaacaacaatatttcttaataacaacaatcatcaat 25421  T
Q  142 tgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaaca 235  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  25422 taaacatgaatctcatcacaaatcaacaagaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaaca 25515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 399 - 190
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||| || ||| |||||||| ||| | || ||||| |||||| | || |||||| || || ||     
T  399 acccatttt-acaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatat 302  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctca 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||| || | || |||||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  301 caacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattc-acgaattaagcatattttcaacatataccaacttctca 203  T
Q  225 tactttgaacatg 237  Q
    |||||||||||||    
T  202 tactttgaacatg 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6591 - 6484
Alignment:
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||| || | || |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  6591 aacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattc-acgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatact 6493  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  6492 ttgaacatg 6484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 68168 - 68004
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |  ||||     
T  68168 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatca-caactcatgatttatgaacacccaagctataaatcatcaacaacaatgtatcttaa 68070  T
Q  126 caacaacaacat----caattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    ||||||||||||    ||||| || || | ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  68069 caacaacaacatacatcaattaaatataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattca 68004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 255095 - 254924
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||    
T  255095 tttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 254996  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  254995 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 254924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 261701 - 261530
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||    
T  261701 tttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 261602  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  261601 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 261530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 123431 - 123299
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||| | ||| |||| |||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||| || |     
T  123431 ttctcatcttcaattcatgaat-atgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataact 123333  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||  ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  123332 taatctaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 123299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 199
Target Start/End: Original strand, 12779 - 12898
Alignment:
Q  80 attatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagc 179  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  12779 attatgaacacccaagttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaattccaccacaaatcaacaacaacatagc 12878  T
Q  180 ataattcaacaatttgagca 199  Q
    | |||| ||||||| |||||    
T  12879 acaattaaacaattagagca 12898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9800 - 9654
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | ||  ||||||| ||    
T  9800 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaaca 9701  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  9700 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 9654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10255 - 10101
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||||||    
T  10255 tttcaccaaaccatcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 10156  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattc 186  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  10155 caacatccattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattc 10101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17697 - 17532
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || || || || |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||    
T  17697 ccatttccaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 17598  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  17597 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 17532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 41644 - 41776
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  41644 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatca 41742  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41743 taattcaacaacaacatagcaaaattcaccaatt 41776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 3261 - 3407
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || ||     
T  3261 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatat 3358  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  3359 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11990 - 11784
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| ||| || ||| |||| || |||||||| || ||| |||||||  ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||    
T  11990 attttcaccaaaacaccaaaaacatctcatttctcaacaccaa-tcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 11892  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||| |  ||| |||||||    
T  11891 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaactaatacccatttttcatact 11793  T
Q  229 ttgaacatg 237  Q
    |||||||||    
T  11792 ttgaacatg 11784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Original strand, 24921 - 25105
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| ||  | ||     
T  24921 acccatttt-acaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatat 25017  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata 213  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25018 caacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatata 25105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 213
Target Start/End: Original strand, 25237 - 25358
Alignment:
Q  92 caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 191  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||  | || ||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  25237 caagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaa 25336  T
Q  192 tttgagcata-tttcaacatata 213  Q
     ||||||||| ||||||||||||    
T  25337 -ttgagcatattttcaacatata 25358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11811 - 11644
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||||||||||||||| | || |||| ||||||| | || |||||| || || || |||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  11811 caaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaattgatcatgaaactgatcacaattcaaca 11712  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  11711 acaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatg 11644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Original strand, 5934 - 6033
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 142  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5934 caacaacaacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacattaatt 6033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Original strand, 60810 - 60933
Alignment:
Q  70 caaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaaca 169  Q
    |||||||||||| ||| | || |||| ||||||| | || |||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  60810 caaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaca 60909  T
Q  170 acaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  60910 acaacaaagcataattcaccaatt 60933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 70903 - 70698
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||| ||||||| | || |||||| || ||| | ||||||    
T  70903 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 70804  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatc-actttctcatactt 229  Q
    ||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  70803 caacatccaatgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacctacttt-tcatactt 70706  T
Q  230 tgaacatg 237  Q
    ||||||||    
T  70705 tgaacatg 70698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Original strand, 171873 - 172034
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||| | || |||||||||||| ||| | ||  |||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| || | |    
T  171873 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaacaacaaatcatgaat-atgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 171971  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt 194  Q
     ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  171972 taacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaattt 172034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Original strand, 177576 - 177737
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||| | || |||||||||||| ||| | ||  |||| |||| ||| |||| |||| |||| ||| || | |    
T  177576 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaacaacaaatcatgaat-atgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 177674  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt 194  Q
     ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  177675 taacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaattt 177737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 165163 - 165093
Alignment:
Q  124 agcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  165163 agcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 165093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1272 - 1106
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatc-aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | || |||||||| |    
T  1272 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 1173  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  1172 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 1106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13680 - 13514
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  13680 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 13581  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  13580 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 13514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21654 - 21488
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | ||   | || |||||||| |    
T  21654 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 21555  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  21554 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 21488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 14910 - 15076
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaa-tcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagc 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| |    
T  14910 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 15009  T
Q  127 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  15010 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 15076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 22657 - 22862
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || ||||||||  | |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||  | ||||||    
T  22657 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaa 22756  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||    
T  22757 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatacttt 22855  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  22856 gaacatg 22862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13634
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| | || |||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  13502 ttctcatcgtcaattcatgaat-atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatca 13600  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13601 taattcaacaacaacatagcaaaattcatcaatt 13634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50142 - 49975
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  50142 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcag 50044  T
Q  126 caacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  50043 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt 49975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1103 - 898
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||| || || || ||||||    
T  1103 tttcaccaaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 1004  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||| |  ||| |||||||||    
T  1003 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaactcatacccatttttcatacttt 905  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  904 gaacatg 898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7133 - 6955
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| || |||||||| || |||| || |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||    
T  7133 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 7034  T
Q  128 acaac---aacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    |||||   |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7033 acaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 6955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 7595 - 7740
Alignment:
Q  92 caagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 191  Q
    |||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| | ||||||||  |||||||||| |||    
T  7595 caagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcaccaa 7694  T
Q  192 tttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatg 237  Q
     ||||||||| ||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  7695 -ttgagcatattttcatcatatacccatttttcatactttgaacatg 7740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22688 - 22594
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacat 137  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22688 caacaataacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacat 22594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 30057 - 30199
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || ||||||||| ||| | ||||||    
T  30057 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaa 30156  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaac 174  Q
    ||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  30157 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 30199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 116
Target Start/End: Original strand, 1652 - 1725
Alignment:
Q  43 caacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaat 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||    
T  1652 caacaacaacatctcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcataaacaacaat 1725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6372 - 6211
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||| |||| |||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  6372 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaacaa 6273  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  6272 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 6211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Original strand, 1299 - 1352
Alignment:
Q  27 cccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaa 80  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1299 cccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaa 1352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6823 - 6671
Alignment:
Q  41 accaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||||||||| ||| |    
T  6823 accaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatcta 6724  T
Q  141 ttgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||| ||| || |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  6723 ttgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 6671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Original strand, 32165 - 32340
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| || | |||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||    
T  32165 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 32264  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32265 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaa-ttgagcatattt 32340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42138 - 41963
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || |||| || | |||||| | || |||||||||||| | || |||||| || ||| | ||    
T  42138 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 42039  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42038 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaa-ttgagcatattt 41963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12648
Alignment:
Q  30 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaac 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || |||| |||| ||| | ||||    
T  12811 attttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaac 12712  T
Q  130 aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa-catagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||| | ||| | |||||| | || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  12711 aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaatt 12648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19197 - 19049
Alignment:
Q  25 tacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || |||| |||| ||| |    
T  19197 tacctattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaa 19098  T
Q  125 gcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaa 173  Q
     ||||||||||| | ||| | |||||| | || ||||||||| ||||||    
T  19097 acaacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 19049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 144
Target Start/End: Original strand, 7814 - 7912
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 144  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7814 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattga 7912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Original strand, 7915 - 7977
Alignment:
Q  176 tagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacatga 238  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7915 tagcataattggaccaattgagcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatga 7977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5875 - 5714
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||||| || |||||||| || ||| ||||||  ||||||||| |||| ||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  5875 acccatttatacaaaacaaccaacaacatctcatttctcaccaacaa-tcatgacatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcag 5777  T
Q  126 caacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattca 187  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  5776 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattca 5714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 38264 - 38469
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    |||||| ||| || ||||| || || |||||||| || |||| ||||||| ||| | || ||||  |||||| | || |||||| || ||| | ||||||    
T  38264 tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 38363  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatacttt 230  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||| | ||||    
T  38364 caacgtcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaatt-gagcatattttcaacatatacccatttctcttccttt 38462  T
Q  231 gaacatg 237  Q
    |||||||    
T  38463 gaacatg 38469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31569 - 31408
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || ||||| |||||| ||| | ||  |||||||| |||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  31569 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 31470  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  31469 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 31408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 41275 - 41436
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||| || ||||| |||||| ||| | ||  |||||||| |||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  41275 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 41374  T
Q  132 caacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||| | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  41375 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 41436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37332 - 37217
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
T  37332 ttctcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 37234  T
Q  160 caattcaacaacaacat 176  Q
    |||| |||| |||||||    
T  37233 caatccaactacaacat 37217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 236
Target Start/End: Original strand, 48153 - 48316
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| | || |||||| ||  |||| |||||| || | ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||    
T  48153 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 48251  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 236  Q
    ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  48252 caacaaaacataattcaccaa-ttgagcatattttaacacatacccatttttcatactttgaacat 48316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 236
Target Start/End: Original strand, 61601 - 61764
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaa 170  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| | || |||||| ||  |||| |||||| || | ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||    
T  61601 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 61699  T
Q  171 caacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacat 236  Q
    ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  61700 caacaaaacataattcaccaa-ttgagcatattttaacacatacccatttttcatactttgaacat 61764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 51463 - 51317
Alignment:
Q  35 cacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaa 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||            |||| | |||||||    
T  51463 cacaaaaccaataacaacaacttatttcaaatca-caaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatca-----------tcttaaccacaacaa 51376  T
Q  135 catcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  51375 catcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaatt 51317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Original strand, 14096 - 14207
Alignment:
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| | ||||  ||||| || |||| |||    
T  14096 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacgtagtataattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacat 14195  T
Q  226 actttgaacatg 237  Q
    ||| ||||||||    
T  14196 actatgaacatg 14207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5349
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| | || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||  || ||    
T  5183 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttcttaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcag 5280  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaa-catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  5281 caacaacaacatcaattaaatcttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Original strand, 14839 - 15011
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 127  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| || |||||||| || |||| |  |||||||| | || |||||||||||| | || |||||| || |||    |    
T  14839 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgact---aa 14935  T
Q  128 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14936 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattt 15011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16237 - 16188
Alignment:
Q  27 cccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatca 76  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16237 cccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcattatcaaatca 16188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 183
Alignment:
Q  41 accaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || | | || |||||||| ||||||||||||  |    
T  308 accaacaacaacaacttatttcacaacaataaattatgaatcatgcatactcaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattta 209  T
Q  141 ttgaacatgaatcttaccacaattca 166  Q
    |||| |||||| |||| || ||||||    
T  208 ttgatcatgaaacttatcataattca 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1252
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttacca 159  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || | ||| |||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||  | |     
T  1120 ttctcatcatcaattcatgaat-atgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatct 1218  T
Q  160 caattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  1219 caaattaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 1252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6490 - 6343
Alignment:
Q  46 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg-a 144  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| ||  || |||| ||||||||||||||| |    
T  6490 caacaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcatcaacaacatcaattgaa 6392  T
Q  145 acatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    || ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  6391 acttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 6343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 3365 - 3321
Alignment:
Q  71 aaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaa 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3365 aaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaa 3321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22797 - 22722
Alignment:
Q  28 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaat 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || ||| ||||||||    
T  22797 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaat 22722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 54378 - 54544
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||| ||| | || |||  ||||| ||||| ||||||| |||| |||     
T  54378 acccatttttgcaaaacaactaacaaaatcttatttctcatcatcaatccataaat-atgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaa 54476  T
Q  126 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  54477 tagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaatt 54544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 193
Target Start/End: Original strand, 45094 - 45158
Alignment:
Q  129 caacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  45094 caacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaatt 45158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 2958 - 3091
Alignment:
Q  60 ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttacc 158  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||  ||| ||| ||||||||| ||||  || |||||| |||||||||| || |||||||| || |    
T  2958 ttctcataatcaattcatgaat-atgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatc 3056  T
Q  159 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  3057 tcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 3091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 17662 - 17826
Alignment:
Q  26 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 125  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| || | ||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||  |  ||       
T  17662 acccatttttgcaaaacaaccaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgagcacccaagccataaatcataaacaacaacttgtct--- 17757  T
Q  126 caacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 193  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  17758 cagcaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 17826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24471 - 24362
Alignment:
Q  39 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 138  Q
    |||||| |||||||||   |||||||| || |||||||||||| ||| | || |||| ||||||| | || |||||| || || |||||||||||||| |    
T  24471 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaacaac 24372  T
Q  139 aattgaacat 148  Q
    |||| |||||    
T  24371 aattcaacat 24362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 31277 - 31317
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31277 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 31317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 39614 - 39654
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39614 tttcacaaaaccaccaacaacaaattatttctcatcatcaa 39654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 39071 - 39111
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39071 tttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaa 39111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 29130 - 29170
Alignment:
Q  32 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29130 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatatctcatcatcaa 29170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University