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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF18563_high_1 (Length: 1126)
Name: NF18563_high_1
Description: NF18563
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF18563_high_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 1032; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 1032; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 35915811 - 35914713
Alignment:
| Q |
19 |
aaagttaccttgcagagacttctaaataagaaaatttgcatcaccacacaagataaaaagaatttatatatagattattagttatacttgattgatgaca |
118 |
Q |
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| T |
35915811 |
aaagttaccttgcagagacttctaaataagaaaatttgcatcaccacacacgataaaaagaatttatatatagattattagttatatttgattgatgaca |
35915712 |
T |
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| Q |
119 |
taactacattttcatagtagtgaaacataatatagtttcacctaaagaaaaatatcacttgattttgaatattatttttctttt--tatatataaaagaa |
216 |
Q |
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| T |
35915711 |
taactacattttcatagtagtgaaacataatatagtttaacctaaagaaaaatatcacttgattttgaatattatttttcttttgatatatataaaagaa |
35915612 |
T |
|
| Q |
217 |
catggtaacatctggttattatgagcatcatcatctgaactttacttttgacgaaatgattctgaccatggttgttaagctctcgggctaacccttacag |
316 |
Q |
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| T |
35915611 |
catggtaacatctggttattatgagcatcatcatctgaactttacttttgatgaaatgattctgaccatggttgttaagctctcaggctaacccttacag |
35915512 |
T |
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| Q |
317 |
tcttacagttatgagtcttaaaaacaaattaacccgcacgaatactctctttttcggaaactttaacgagttttatgtaaactctaataaaatcgataaa |
416 |
Q |
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| T |
35915511 |
tcttacaattatgagtcttaaaaacaaattaacccgcacgaatactctctttttcggaaactttaacgagttttatgtaaactctaataaaatcgataaa |
35915412 |
T |
|
| Q |
417 |
ctctcagttttactagtccagtctacagaagctcaacaagtttatttagcctctcgagtttgaaagcttcgattttgacaacataatgtttgaaactcgc |
516 |
Q |
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| T |
35915411 |
ctctcagttttactagtcaagtcaacagaagctcaacaagtttatttcgcctctcgagtttgaaagcttcgattttgacaacataatgtttgaaactcgc |
35915312 |
T |
|
| Q |
517 |
aggacctggttgttcctcactgggatatggagcctttcaagagctcggacccttcagagtcaattctgacggaaaaacattataccgcaacccatatgct |
616 |
Q |
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| T |
35915311 |
aggacctggttgttcctcactgggatatggagcctttcaagagctcggacccttcagagtcaattctgatggaaaaacattataccgcaacccatatgct |
35915212 |
T |
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| Q |
617 |
tggaatgaaggtgagacaatcatcaatataactaatttatttctttatgatgcatgcctgagacatgattatcttaccaacttatatccttatgaaatat |
716 |
Q |
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| T |
35915211 |
tggaatgaaggtgagacaatcatcaatataactaatttatttctttatgatgcatgcctgagacatgattatcttaccaacttatatccttatgaaatat |
35915112 |
T |
|
| Q |
717 |
gcagttgcaaatgtactcttcttggaatctccggcaggcgtaggattttcctactcaaacacaacatctgactatgacaattcaggagataagtccaccg |
816 |
Q |
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| T |
35915111 |
gcagttgcaaatgtactcttcttggaatctccggcaggagtaggattttcctactcaaacacaacatctgactatgacaattcaggagataagtccaccg |
35915012 |
T |
|
| Q |
817 |
ctaaagatgcctatgttttcctcatcaactggctggagaggtttccacagtacaaaacaagagctttttacataactggagagagttatgctggtcacta |
916 |
Q |
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| T |
35915011 |
ctaaagatgcctatgttttcctcatcaactggctggagagatttccacagtacaaaacaagagctttttacataactggagagagttatgctggtcacta |
35914912 |
T |
|
| Q |
917 |
tgttccgcagcttgcatggactattcttcacaacaataaactctataacaacaccactattaacctcaaaggcatttctgtatgttgttcaaactttgaa |
1016 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35914911 |
tgttccgcagcttgcatcgactattcttcacaacaataaactctataacaacaccactattaacctcaaaggcatttctgtatgttgttcaaactttgaa |
35914812 |
T |
|
| Q |
1017 |
agactaataatgcaatataactgtcaacctcataaatctaactttatcaatatctttacaataaaaaatttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
1115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35914811 |
agactaataatgcaatataactgtcaacctcataaatctaactttatcattatctttacaataaaaaatttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
35914713 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 81 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 35922110 - 35921085
Alignment:
| Q |
81 |
tttatatatagattattagttatacttgattgatgacataactacattttcatagtagtgaaacataata---tagtttcacctaaagaaaaatatcact |
177 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
35922110 |
tttataaatagattattaattatacttgattgatgacataagttcattttcatagtagtgaaacatgatagtatagttttacctaagaacaaatatcact |
35922011 |
T |
|
| Q |
178 |
tgattttgaatattatttttctttttatatataaaagaacatggtaacatctggttattatgagcatcatcatctgaactttacttttgacgaaatgatt |
277 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| || | ||| | ||| || |||||| ||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
35922010 |
tgatattgaactttatttttcttttgatttataaaatcacatgcaaaaacctgttcatt--ga----catcatttgaactttactcttgataatatgatt |
35921917 |
T |
|
| Q |
278 |
ctgaccatggttgttaagctctcgggctaacccttacagtcttacagttatgagtcttaaaaacaaattaacccgcacgaatactctctttttcggaaac |
377 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||| |||| |||| || ||| | |||| |
|
|
| T |
35921916 |
atgaccatcgttgttaaactttcgggctaacccataccttcttacaattatgattcataaaaa-aaattaactcgcatacgcactcactgttttgtaaac |
35921818 |
T |
|
| Q |
378 |
tttaacgagttttatgtaaactctaataaaatcgataaactctcagttttactagtccagtctacagaagctcaacaagtttatttagcctctcgagttt |
477 |
Q |
| |
|
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|
| T |
35921817 |
ttttacgagtttaa-gtaaaat--aataaaattgg-aaactctgacttttactagtcgagtctacagaagctcaacaagtttacttagactctcaagttt |
35921722 |
T |
|
| Q |
478 |
gaaagcttcgattttgacaacataatgtttgaaactcgcaggacctggttgttcctcactgggatatggagcctttcaagagctcggacccttcagagtc |
577 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35921721 |
gtcagcttcaattttgacatcataatgtttgaaactcacaggacctggttgttcctcactgggatatggagcctttgaggagctcggacccttcagagtc |
35921622 |
T |
|
| Q |
578 |
aattctgacggaaaaacattataccgcaacccatatgcttggaatgaaggtgagacaatcatcaatataactaatttatttctttatgatgcatgcctga |
677 |
Q |
| |
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|| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || |||||||||||| |||| |
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| T |
35921621 |
aactctgatggcaaaacattataccgtaacccatatgcttggaatgaaggtgagatgatcatcgatataactaatgtgtta-tttatgatgcatttctga |
35921523 |
T |
|
| Q |
678 |
gacatgattatcttaccaacttatatccttatgaaatatgcagttgcaaatgtactcttcttggaatctccggcaggcgtaggattttcctactcaaaca |
777 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35921522 |
gacatgattatcttagaaacttaactccttatgaaatatgcagtggcaaatgtactcttcttggaatctccagcaggggtaggattttcctactcaaaca |
35921423 |
T |
|
| Q |
778 |
caacatctgactatgacaattcaggagataagtccaccgctaaagatgcctatgttttcctcatcaactggctggagaggtttccacagtacaaaacaag |
877 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35921422 |
catcatcggactatgacaattcaggagataagtccactgctaaagatgcctatgtcttcctaatcaactggctggagagatttccacagtacaaaaccag |
35921323 |
T |
|
| Q |
878 |
agctttttacataactggagagagttatgctggtcactatgttccgcagcttgcatggactattcttcacaacaataaactctataacaacaccactatt |
977 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35921322 |
agatttttacataactggagagagttatgccggtcattatgttcctcaacttgcatccactattctttacaacaataaactctataacaacaccattatt |
35921223 |
T |
|
| Q |
978 |
aacctcaaaggcatttctgtatgttgttcaaactttgaaagactaataatgcaatataactgtcaacctcataaatctaactttatcaatatctttacaa |
1077 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35921222 |
aacctcaaaggcatttctgtatgttgttcaaacttcgaatgactaataatgaaatataactcgcaatctcataattctaatctcattattatctatactt |
35921123 |
T |
|
| Q |
1078 |
taaaaaatttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
1115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35921122 |
aaaaaaatttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
35921085 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 436 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 35940742 - 35940058
Alignment:
| Q |
436 |
agtctacagaagctcaacaagtttatttagcctctcgagtttgaaagcttcgattttgacaacataatgtttgaaactcgcaggacctggttgttcctca |
535 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
35940742 |
agtctacagaagctcaaaaagtttacctagcctctcaagtttaacaaattcgattacgacaacataatgtttgaaccacacaggacctggctgttcttca |
35940643 |
T |
|
| Q |
536 |
ctgggatatggagcctttcaagagctcggacccttcagagtcaattctgacggaaaaacattataccgcaacccatatgcttggaatgaaggtgagacaa |
635 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35940642 |
cttgggtatggagcctttcaggagctcggacccttcagagtcaactctgatggaaaaacactataccgtaacccatatgcttggaatgaaggtgaaacaa |
35940543 |
T |
|
| Q |
636 |
tcatca---------atataactaatttatttctttatgatgcatgcctgagacatgattatcttaccaacttatatccttatgaaatatgcagttgcaa |
726 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
35940542 |
tcatcatcatcatcaatataattacattgtttctttatgatgcatttctgagacatgaatatcttacaaacttatatcattatgaaatatgcagtggcga |
35940443 |
T |
|
| Q |
727 |
atgtactcttcttggaatctccggcaggcgtaggattttcctactcaaacacaacatctgactatgacaattcaggagataagtccaccgctaaagatgc |
826 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||| | |
|
|
| T |
35940442 |
acgtactcttcttggaatctccagcaggaataggattttcctactcaaacacaacatctgactatgacaaatcaggagataaatcaactgccaaggattc |
35940343 |
T |
|
| Q |
827 |
ctatgttttcctcatcaactggctggagaggtttccacagtacaaaacaagagctttttacataactggagagagttatgctggtcactatgttccgcag |
926 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
35940342 |
ctatgtcttccttatcaactggctggagagatttccacagtacaaaacaagagatttttacataagtggagagagttatgctggtcattatgttcctcaa |
35940243 |
T |
|
| Q |
927 |
cttgcatggactattcttcacaacaataaactctataacaacaccactattaacctcaaaggcatttctgtatgttgttcaaactttgaaagactaataa |
1026 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35940242 |
cttgcatccactattctacacaacaataaactctataagaacaccattattaacctcaaaggcatttctgtatgttgatcaaacttcaaaagactaataa |
35940143 |
T |
|
| Q |
1027 |
tgcaatataactgtcaacctcataaatctaactttatcaatatctttacaataaaaaatttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
1115 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35940142 |
tgcaatataaatcacaatctcatatatctaact---tcattatctgtac-atacaaaatttcagttagggaatgcttggattgatgatg |
35940058 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 417 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 35910984 - 35910278
Alignment:
| Q |
417 |
ctctcagttttactagtccag--tctacagaagctcaacaagtttatttagcctctcgagtttgaaagcttcgattttgacaacataatgtttgaaactc |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35910984 |
ctctcagttttactagtcgagagtctatgtaagctcaacaagtttacttag--tcgagattatgacagctttgattctgacaacataatgtttgaaactc |
35910887 |
T |
|
| Q |
515 |
gcaggacctggttgttcctcactgggatatggagcctttcaagagctcggacccttcagagtcaattctgacggaaaaacattataccgcaacccatatg |
614 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35910886 |
acaggacctggctgttcctcactggggtatggagcctttcaggagctaggacccttcagaatcaactctgatggcaaaacactataccgtaacccatatg |
35910787 |
T |
|
| Q |
615 |
cttggaatgaaggtgagacaatcatca---------atataactaatttatttctttatgatgcatgcctgagacatgattatcttaccaacttatatcc |
705 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35910786 |
cttggaatgaaggtgaaacaatcatcatcatcatcaatataattacattgtttctt-atgatgcatttctgagacatgaatatcttaccaacttatatca |
35910688 |
T |
|
| Q |
706 |
ttatgaaatatgcagttgcaaatgtactcttcttggaatctccggcaggcgtaggattttcctactcaaacacaacatctgactatgacaattcaggaga |
805 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35910687 |
ttatgaaatatgcagtggcgaacgtactcttcttagaatctccagcaggagtaggattttcctactcaaacacaacatctgactatgacaaatcaggaga |
35910588 |
T |
|
| Q |
806 |
taagtccaccgctaaagatgcctatgttttcctcatcaactggctggagaggtttccacagtacaaaacaagagctttttacataactggagagagttat |
905 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35910587 |
taagtcaactgccaaagacacctatgtcttcctcgtcaactggctggagagatttccacaatacaaaaccagagatttttacataactggagagagttat |
35910488 |
T |
|
| Q |
906 |
gctggtcactatgttccgcagcttgcatggactattcttcacaacaataaactctataacaacaccactattaacctcaaaggcatttctgtatgttgtt |
1005 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
35910487 |
gctggtcattatgttcctcaacttgcatccactattctacacaacaataaactctataacaacaccattgttaacctcaaaggcatttctgtatgatttt |
35910388 |
T |
|
| Q |
1006 |
caaactttgaaagactaataatgcaatataactgtcaacctcataaatctaactttatcaatatctttacaataaaaaatttcagatagggaatgcttgg |
1105 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||| || ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35910387 |
ccaacttcaaaagaccaagtatgaaatgtaactcacaatctcataaatctaacttcagtattatctttactttaaaaaatttcagatagggaatgcttgg |
35910288 |
T |
|
| Q |
1106 |
attgatgatg |
1115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
35910287 |
attgatgatg |
35910278 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 467 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 35928326 - 35927678
Alignment:
| Q |
467 |
ctctcgagtttgaaagcttcgattttgacaacataatgtttgaaactcgcaggacctggttgttcctcactgggatatggagcctttcaagagctcggac |
566 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
35928326 |
ctctcgagtttgacagctttgattctgacaacataatgtttgaaacttacaggacctggctgttcctcactggggtatggagcctttcaggagctaggac |
35928227 |
T |
|
| Q |
567 |
ccttcagagtcaattctgacggaaaaacattataccgcaacccatatgcttggaatgaaggtgagacaatcatcaatataactaatttatttctttatga |
666 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || || || |||||| |||| |
|
|
| T |
35928226 |
ccttcagaatcaactctgatggcaaaacactataccgtaaccaatatgcttggactgaaggtgaaacaatcatcgatagaatgaaattgtttctt-atga |
35928128 |
T |
|
| Q |
667 |
tgcatgc---ctgagacatgattatcttaccaacttatatccttatgaaatatgcagttgcaaatgtactcttcttggaatctccggcaggcgtaggatt |
763 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
35928127 |
tgcatttattcttagacatgaataacttaccagtttat--cattatgaaatatgcagttgcaaatgtactattcttagagtctccagcaggagtgggatt |
35928030 |
T |
|
| Q |
764 |
ttcctactcaaacacaacatctgactatgacaattcaggagataagtccaccgctaaagatgcctatgttttcctcatcaactggctggagaggtttcca |
863 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||| | || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35928029 |
ttcctattcaaacacaacttctgactatgacaagtcaggagataaatcaactgccaaggattcttacgtcttcctaatcaactggctggagagatttcca |
35927930 |
T |
|
| Q |
864 |
cagtacaaaacaagagctttttacataactggagagagttatgctggtcactatgttccgcagcttgcatggactattcttcacaacaataaactctata |
963 |
Q |
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| T |
35927929 |
cagtacaaaacaagagctttttacatagctggagagagttatgctggtcattatgttcctcaacttgcatcgactattcttcacaacaataaactctata |
35927830 |
T |
|
| Q |
964 |
acaacaccactattaacctcaaaggcatttctgtatgttgttcaaactttgaaagactaataatgcaatataactgtcaacctcataaatctaactttat |
1063 |
Q |
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| T |
35927829 |
acaacactgttattaacctcaaaggcatttctgtatgttcttcaaacttcaaaagaccaagtatgaaatgtaactcacaatctcataaatctaactttat |
35927730 |
T |
|
| Q |
1064 |
caatatctttacaataaaaaatttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
1115 |
Q |
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| T |
35927729 |
tattatctttactttaaaaaatttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
35927678 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 431 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 35935178 - 35934492
Alignment:
| Q |
431 |
agtccagtctacagaagctcaacaagtttatttagcctctcgagtttgaaagcttcgattttgacaacataatgtttgaaactcgcaggacctggttgtt |
530 |
Q |
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| T |
35935178 |
agtcgagtctacagaagctacacatgtttacctagactctagagtttgaaaaatttgatgctgataacataatatttgaaacacacaggacctggctgtt |
35935079 |
T |
|
| Q |
531 |
cctcactgggatatggagcctttcaagagctcggacccttcagagtcaattctgacggaaaaacattataccgcaacccatatgcttggaatgaaggtga |
630 |
Q |
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| T |
35935078 |
cttcacttgggtatggagcctttgaggagctaggacccttcagagtcaactctgatggaaaaacattataccgtaaccaatatgcttggagtgaaggtat |
35934979 |
T |
|
| Q |
631 |
gacaatcatca---atataactaatttatttctttatgatgcatgcctgagacatgattatcttaccaacttatatccttatgaaatat--gcagttgca |
725 |
Q |
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| T |
35934978 |
gacaatcataatcgatatgattaaatgttttctccattatgcatttaagagacatgaacatctaaccaatttat--cattataaaatatatgcagttgca |
35934881 |
T |
|
| Q |
726 |
aatgtactcttcttggaatctccggcaggcgtaggattttcctactcaaacacaacatctgactatgacaattcaggagataagtccaccgctaaagatg |
825 |
Q |
| |
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| T |
35934880 |
aatatactcttcttagagtctccagcaggagtgggattttcctactcaaacacaacttctgactataaaaaagcaggagataagtccactgctaaagatg |
35934781 |
T |
|
| Q |
826 |
cctatgttttcctcatcaactggctggagaggtttccacagtacaaaacaagagctttttacataactggagagagttatgctggtcactatgttccgca |
925 |
Q |
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| T |
35934780 |
cctatgttttcctaatcaactggctggagagatttccacagtacaaaaccagagatttttacataactggagagagttatgctggtcattatgttcctca |
35934681 |
T |
|
| Q |
926 |
gcttgcatggactattcttcacaacaataaactctataacaacaccactattaacctcaaaggcatttctgtatgttgttcaaactttgaaagactaata |
1025 |
Q |
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| T |
35934680 |
acttgcatccactattcttcaccaccataaactctataacaaaaccatcattaacctcaaaggcatatctgtatgttgatcaatcttcaaaagactaata |
35934581 |
T |
|
| Q |
1026 |
atgcaatataactgtcaacctcataaatctaactttatcaatatctttacaataaaaaatttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
1115 |
Q |
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| T |
35934580 |
atgcaatataactcactatcacatataactaacttcatgattatttgtac-ttcaaatttttcagatagggaatgcttggattgatgatg |
35934492 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35911317 - 35910992
Alignment:
| Q |
23 |
ttaccttgcagagacttctaaataagaaaatttgcatcaccacacaagataaaaagaatttatatatagattattagttatacttgattgatgacataac |
122 |
Q |
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| T |
35911317 |
ttaccttgcagaaaccactaaataagaaaatttgcaacaccacacgagataaaattagtttataaatagattattaattatacttgattgatgacataag |
35911218 |
T |
|
| Q |
123 |
tacattttcatagtagtgaaa--cataatatagtttcacctaaagaaaaatatcacttgattttgaatattatttttctttttatatataaaagaacatg |
220 |
Q |
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| T |
35911217 |
ttcattttcgtagtactgaaaatgataatatagtttaacctaaagacaaacatcacttgatattgaatattatttttcttttgatat-taaaagaaaatg |
35911119 |
T |
|
| Q |
221 |
gtaacatctggttat--tatgagcatcatcatctgaactttacttttgacgaaatgattctgaccatggttgttaagctctcgggctaacccttacagtc |
318 |
Q |
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| T |
35911118 |
gtaaaacctggttataatatgagcatcatcatctgaactttactcttgatgaaattattctggcaatggttattaaactcaagggctaacccttacactc |
35911019 |
T |
|
| Q |
319 |
ttacagttatgagtcttaaaaacaaat |
345 |
Q |
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| T |
35911018 |
ttacaactatgagtcataaaaacaaat |
35910992 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35940895 - 35940803
Alignment:
| Q |
45 |
taagaaaatttgcatcaccacacaagataaaaagaatttatatatagattattagtta-tacttgattgatgacataactacattttcatagtagtg |
140 |
Q |
| |
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| T |
35940895 |
taagtaaatttacaacaccacacaagataagaagaatttata----gattatcagttaatatttgattgatgacataacttcatattcatagtagtg |
35940803 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35935257 - 35935216
Alignment:
| Q |
106 |
ttgattgatgacataactacattttcatagtagtgaaacata |
147 |
Q |
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| T |
35935257 |
ttgatcgataacataacttcattttcatagtagtgaaacata |
35935216 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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