View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18576_high_6 (Length: 360)

Name: NF18576_high_6
Description: NF18576
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18576_high_6
NF18576_high_6
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-348)||(29372345-29372690)
chr8 (144-334)||(3628619-3628809)
chr8 (142-334)||(32098047-32098240)
chr8 (142-348)||(13585287-13585492)
chr8 (142-334)||(18420479-18420671)
chr8 (142-348)||(43926194-43926399)
chr8 (142-348)||(34523823-34524027)
chr8 (161-334)||(44664935-44665108)
chr8 (142-334)||(43967941-43968132)
chr8 (142-348)||(3471588-3471792)
chr8 (188-334)||(18112118-18112267)
chr8 (144-334)||(1004060-1004247)
chr8 (142-348)||(12531547-12531753)
chr8 (144-348)||(42076096-42076301)
chr8 (185-334)||(7858087-7858238)
chr8 (142-348)||(39697808-39698014)
chr8 (202-338)||(5869253-5869388)
chr8 (144-318)||(36515027-36515202)
chr8 (142-348)||(23567145-23567350)
chr8 (235-334)||(42951727-42951831)
chr8 (148-318)||(42777763-42777934)
chr8 (242-348)||(27074562-27074669)
chr8 (253-335)||(30915268-30915351)
chr8 (230-348)||(33452779-33452897)
chr8 (142-179)||(33452916-33452953)
chr8 (144-224)||(35875011-35875091)
chr8 (229-265)||(2545883-2545919)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (142-335)||(26633364-26633557)
chr7 (144-335)||(36438223-36438414)
chr7 (142-348)||(12251158-12251364)
chr7 (172-348)||(32956763-32956940)
chr7 (142-334)||(33910066-33910257)
chr7 (142-348)||(36796242-36796448)
chr7 (142-334)||(40841114-40841307)
chr7 (142-334)||(773753-773946)
chr7 (161-335)||(7366688-7366862)
chr7 (142-348)||(33418987-33419194)
chr7 (142-335)||(44876027-44876218)
chr7 (142-335)||(30739124-30739319)
chr7 (142-346)||(42311999-42312204)
chr7 (142-334)||(11672588-11672779)
chr7 (149-348)||(40737877-40738067)
chr7 (142-331)||(3799633-3799819)
chr7 (142-335)||(41908179-41908371)
chr7 (230-335)||(1366010-1366115)
chr7 (142-348)||(7636194-7636402)
chr7 (142-348)||(42160993-42161196)
chr7 (236-334)||(18895361-18895459)
chr7 (152-328)||(41852181-41852356)
chr7 (148-334)||(44893906-44894091)
chr7 (142-348)||(46221573-46221779)
chr7 (203-348)||(4099956-4100104)
chr7 (142-348)||(6379955-6380160)
chr7 (145-311)||(25610091-25610257)
chr7 (262-348)||(26282532-26282618)
chr7 (142-348)||(18015451-18015658)
chr7 (270-348)||(40001694-40001772)
chr7 (142-287)||(28590015-28590158)
chr7 (269-348)||(8358291-8358370)
chr7 (255-348)||(9479115-9479208)
chr7 (142-179)||(40001581-40001618)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (142-348)||(10575393-10575599)
chr4 (142-349)||(21791418-21791624)
chr4 (144-348)||(35653852-35654056)
chr4 (142-349)||(5545316-5545523)
chr4 (142-348)||(32130661-32130866)
chr4 (142-348)||(19661367-19661572)
chr4 (142-334)||(41038252-41038442)
chr4 (142-334)||(23426037-23426228)
chr4 (142-348)||(11681612-11681818)
chr4 (142-348)||(11689891-11690097)
chr4 (142-348)||(28463459-28463664)
chr4 (142-348)||(53011700-53011908)
chr4 (144-348)||(22423672-22423878)
chr4 (185-348)||(44478027-44478193)
chr4 (142-348)||(27632386-27632591)
chr4 (142-334)||(45172516-45172707)
chr4 (238-348)||(43154754-43154864)
chr4 (145-348)||(23256582-23256783)
chr4 (185-348)||(29579868-29580033)
chr4 (149-334)||(16072596-16072785)
chr4 (142-334)||(29221492-29221683)
chr4 (230-335)||(34982225-34982330)
chr4 (142-335)||(26328900-26329095)
chr4 (239-335)||(55134209-55134306)
chr4 (185-300)||(51066336-51066452)
chr4 (144-224)||(24449211-24449291)
chr4 (142-179)||(55134366-55134403)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (142-311)||(6294279-6294448)
chr6 (142-348)||(6360748-6360952)
chr6 (144-335)||(3748440-3748631)
chr6 (142-348)||(57676-57880)
chr6 (185-348)||(29401128-29401291)
chr6 (185-348)||(2618343-2618508)
chr6 (142-348)||(7525038-7525242)
chr6 (144-335)||(30915233-30915429)
chr6 (144-348)||(3514723-3514926)
chr6 (185-334)||(29149405-29149556)
chr6 (142-348)||(12614589-12614792)
chr6 (185-348)||(628007-628171)
chr6 (145-334)||(6754208-6754395)
chr6 (142-335)||(1092911-1093103)
chr6 (144-334)||(21946109-21946296)
chr6 (142-335)||(29308337-29308530)
chr6 (142-348)||(350402-350611)
chr6 (161-348)||(19231601-19231788)
chr6 (142-328)||(22503751-22503936)
chr6 (260-348)||(1690621-1690709)
chr6 (270-348)||(31860990-31861067)
chr6 (230-318)||(11088564-11088652)
chr6 (142-212)||(11088694-11088765)
chr6 (267-334)||(14893412-14893479)
chr6 (299-332)||(15035807-15035840)
chr6 (294-335)||(31234912-31234953)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (144-348)||(44836597-44836797)
chr1 (144-335)||(17674226-17674417)
chr1 (144-334)||(13120738-13120928)
chr1 (162-348)||(27703419-27703605)
chr1 (142-340)||(50371130-50371328)
chr1 (142-348)||(18127808-18128013)
chr1 (142-348)||(50552483-50552688)
chr1 (145-334)||(9-198)
chr1 (146-348)||(12971394-12971596)
chr1 (142-335)||(30004778-30004970)
chr1 (185-348)||(48722281-48722446)
chr1 (144-335)||(22386708-22386900)
chr1 (142-348)||(6150709-6150915)
chr1 (144-348)||(42740098-42740300)
chr1 (142-348)||(25930592-25930796)
chr1 (142-334)||(30899658-30899853)
chr1 (142-330)||(14084570-14084759)
chr1 (142-348)||(28885542-28885747)
chr1 (142-334)||(10109722-10109917)
chr1 (186-348)||(29208010-29208174)
chr1 (144-348)||(37873628-37873838)
chr1 (235-348)||(12884100-12884213)
chr1 (161-335)||(24556807-24556979)
chr1 (148-330)||(6333396-6333574)
chr1 (142-348)||(51109972-51110177)
chr1 (161-348)||(17487172-17487359)
chr1 (203-334)||(33124559-33124692)
chr1 (142-346)||(5560473-5560677)
chr1 (142-346)||(9777403-9777609)
chr1 (144-318)||(26486247-26486419)
chr1 (188-348)||(52055540-52055701)
chr1 (142-348)||(15441278-15441482)
chr1 (142-313)||(1269574-1269746)
chr1 (185-334)||(20905197-20905349)
chr1 (142-290)||(52240407-52240554)
chr1 (281-335)||(3907472-3907526)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (142-348)||(36059775-36059981)
chr2 (144-348)||(1418897-1419101)
chr2 (151-335)||(29480516-29480700)
chr2 (144-348)||(39081386-39081588)
chr2 (142-348)||(26151618-26151823)
chr2 (142-348)||(7993620-7993825)
chr2 (145-335)||(38599403-38599592)
chr2 (142-334)||(41096407-41096600)
chr2 (142-348)||(45618965-45619169)
chr2 (152-335)||(13997315-13997497)
chr2 (142-348)||(18676181-18676387)
chr2 (142-348)||(4855981-4856186)
chr2 (142-318)||(17117515-17117691)
chr2 (185-348)||(19367330-19367495)
chr2 (144-340)||(27302409-27302596)
chr2 (142-346)||(1226137-1226341)
chr2 (142-334)||(25222325-25222516)
chr2 (142-348)||(38985579-38985785)
chr2 (142-318)||(42759627-42759802)
chr2 (142-348)||(2063793-2063999)
chr2 (142-348)||(6530647-6530852)
chr2 (142-348)||(18172812-18173016)
chr2 (230-348)||(15457488-15457607)
chr2 (142-291)||(36481439-36481588)
chr2 (166-348)||(31273059-31273241)
chr2 (144-348)||(42411431-42411634)
chr2 (227-348)||(34061810-34061932)
chr2 (230-348)||(21747188-21747306)
chr2 (185-348)||(13020411-13020576)
chr2 (142-348)||(18915923-18916130)
chr2 (142-348)||(45042377-45042583)
chr2 (142-348)||(12269413-12269618)
chr2 (142-318)||(13001655-13001832)
chr2 (142-223)||(9029707-9029789)
chr2 (254-346)||(18482488-18482581)
chr2 (186-258)||(38599593-38599665)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (144-334)||(18873459-18873652)
chr5 (144-333)||(17325847-17326037)
chr5 (144-332)||(7390273-7390460)
chr5 (142-348)||(43511606-43511812)
chr5 (188-348)||(13474618-13474780)
chr5 (142-334)||(13656212-13656403)
chr5 (144-348)||(40779180-40779382)
chr5 (152-313)||(10033570-10033730)
chr5 (144-334)||(13423866-13424056)
chr5 (142-346)||(17513806-17514010)
chr5 (142-348)||(10591143-10591349)
chr5 (142-348)||(27351337-27351543)
chr5 (144-348)||(138132-138336)
chr5 (142-334)||(12661311-12661501)
chr5 (142-348)||(29156178-29156384)
chr5 (230-335)||(42291839-42291944)
chr5 (241-348)||(20975973-20976080)
chr5 (142-348)||(4734451-4734658)
chr5 (142-334)||(19099185-19099376)
chr5 (185-335)||(40956314-40956465)
chr5 (142-348)||(26377645-26377850)
chr5 (142-333)||(33281677-33281868)
chr5 (242-348)||(36718535-36718643)
chr5 (235-348)||(5829373-5829484)
chr5 (230-319)||(3349687-3349776)
chr5 (230-335)||(931381-931481)
chr5 (145-245)||(16515596-16515696)
chr5 (142-279)||(8379313-8379449)
chr5 (142-291)||(26312029-26312181)
chr5 (142-224)||(23069336-23069418)
chr5 (272-327)||(16515533-16515588)
chr5 (142-224)||(37046894-37046974)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (144-335)||(27303188-27303377)
chr3 (144-348)||(7767051-7767258)
chr3 (144-348)||(46904730-46904934)
chr3 (142-348)||(54430540-54430747)
chr3 (161-348)||(29387643-29387830)
chr3 (142-348)||(18408179-18408384)
chr3 (142-348)||(24252608-24252814)
chr3 (142-334)||(28132607-28132797)
chr3 (166-348)||(42009156-42009338)
chr3 (144-348)||(21784656-21784860)
chr3 (142-348)||(8364160-8364366)
chr3 (145-348)||(50677187-50677390)
chr3 (142-348)||(51939426-51939632)
chr3 (142-334)||(52654993-52655185)
chr3 (161-334)||(25598976-25599148)
chr3 (205-348)||(36538119-36538262)
chr3 (141-318)||(6715457-6715633)
chr3 (142-334)||(1254925-1255112)
chr3 (142-334)||(46791568-46791759)
chr3 (142-334)||(13401461-13401653)
chr3 (142-348)||(41706923-41707131)
chr3 (142-348)||(23164443-23164648)
chr3 (144-335)||(40152002-40152193)
chr3 (144-324)||(51146949-51147129)
chr3 (239-335)||(48626996-48627092)
chr3 (142-348)||(27729640-27729845)
chr3 (185-348)||(23067635-23067801)
chr3 (214-329)||(15987207-15987322)
chr3 (142-348)||(21596323-21596528)
chr3 (142-333)||(20762052-20762243)
chr3 (142-279)||(27110743-27110879)
chr3 (142-348)||(43905723-43905919)
chr3 (230-335)||(19965838-19965943)
chr3 (239-340)||(1649798-1649899)
chr3 (142-205)||(15998415-15998476)
chr3 (142-199)||(19965748-19965804)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (142-348)||(16698-16903)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (142-311)||(1086-1255)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (141-348)||(46044-46249)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (142-334)||(17004-17194)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (142-291)||(22676-22824)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (238-348)||(8359-8471)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29372690 - 29372345
Alignment:
Q  1 ctaaaatgattgctggattacaattttcaataagaataaagccttgaggtcatggccgtgccaatgaaataggaggtttgactcnnnnnnnaaaataggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||       ||| |||||    
T  29372690 ctaaaatgattgctggattacaattttcaataagaataaagccttgaggtcagggccgttccaatgaaacaggaggctcgactctttttttaaa-taggc 29372592  T
Q  101 atccgtaaaatataaaacgtaatgttttgttttttgtgacatctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaat 200  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29372591 atccgttaaataaaaaa-gtaatgttttgttttttgtgacttctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaat 29372493  T
Q  201 ggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29372492 ggtgtcgtttggattgtcactccttcatcgtggcaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtcattctttcaattgaataact 29372393  T
Q  301 tttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29372392 ttccaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 29372345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Original strand, 3628619 - 3628809
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||   |||| | ||| || ||    
T  3628619 taaacatgaaagaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaactgtgtcgtttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaacggaaa 3628718  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3628719 aacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattatgtgattatacaaatt 3628809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 32098047 - 32098240
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| || |||    
T  32098047 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacgtaacggtgtcgtttggattcgtcactcctctgttgtgggaatggg 32098146  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32098147 gaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgatcatacaaatt 32098240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13585492 - 13585287
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||    
T  13585492 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaa--aaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttggacttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 13585396  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  13585395 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaattgattatacaaattagggg 13585296  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  13585295 tggtttgat 13585287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 18420479 - 18420671
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||  ||| ||    
T  18420479 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaa--aaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtgaaaaaagg 18420576  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18420577 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 18420671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 43926194 - 43926399
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |   ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  43926194 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagagaaagag--gtgaaatttatgtaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaaggg 43926290  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  43926291 taaagcgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattatggg 43926390  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  43926391 tggtttgat 43926399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 34523823 - 34524027
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |   ||  ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||  |   | |||| ||||||    
T  34523823 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagag--gtagaatttaa-taacggtgtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggg 34523919  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34523920 gaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggt 34524019  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  34524020 ggtttgat 34524027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 334
Target Start/End: Original strand, 44664935 - 44665108
Alignment:
Q  161 aaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgc 259  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44664935 aaaaaaaaattaagtgaaa--aaggtgaaatttatctaatggtatcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgc 44665032  T
Q  260 gaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  44665033 gaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaatagactgattaagtgatgatacaaatt 44665108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 43967941 - 43968132
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||| |    
T  43967941 tctaaatatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaaggatgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagag 43968037  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43968038 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaatt 43968132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3471792 - 3471588
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggat-tgtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |   |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| | | |||| ||||||    
T  3471792 tctaaacattaaaggaattaaaa--aaattaagtgaaatag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatctatcactcctctgttgtggaaaaggg 3471697  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  3471696 taaaatgaatggttcatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 3471597  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  3471596 tggtttgat 3471588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18112267 - 18112118
Alignment:
Q  188 aaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattc 284  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
T  18112267 aaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattc 18112168  T
Q  285 tttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    |||||||  ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18112167 tttcaataaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 18112118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1004247 - 1004060
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |   |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| | | |||| |||||| ||    
T  1004247 taaacatgaaaggaattaaaa--aaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttg--ttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaa 1004154  T
Q  244 aacgaatggtttatgcga--aaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataactttt-caaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1004153 aacgaatggtttatgcgatgaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 1004060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12531753 - 12531547
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||  ||||||| ||| || |||||||| ||| |||| |  |   | |||| ||||||    
T  12531753 tctaaacatgaaacgaaatataaaaaaattaagtgaaagagaggtataatttac-taacggcgtcgtttgaatttgtcatttatccgttgtgggaaaggg 12531655  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  12531654 gaaaacaaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagatttttaaattgactgattaagtgattatacaaattggaggt 12531555  T
Q  341 agtttgat 348  Q
    ||||||||    
T  12531554 agtttgat 12531547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42076301 - 42076096
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |  |||| | |||||||||    
T  42076301 taaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtcatttggaatgtcactcc-tactcgtagaaaaggggaa 42076203  T
Q  244 aacgaatggtttatgcg--aaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggta 341  Q
    ||||||| |||||||||  |||||  ||| ||| || | |||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  | ||    
T  42076202 aacgaatagtttatgcggaaaaaaataattattattatgattctttcaatgttatagcttttcaaattgattgattaagttattatacaaattgatgata 42076103  T
Q  342 gtttgat 348  Q
    |||||||    
T  42076102 gtttgat 42076096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 185 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7858238 - 7858087
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgt-cactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  7858238 gtgaaatttatctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgat 7858139  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||| |||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7858138 tctttaaatgaattaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 7858087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 39697808 - 39698014
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | | ||  ||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||  |   | |||| |||||     
T  39697808 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaataagtgaaagagaggtagaatttac-taacagtgtcatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggc 39697906  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||    
T  39697907 gaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactaattaaatgatcatacaaattggtggt 39698006  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  39698007 ggtttgat 39698014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Original strand, 5869253 - 5869388
Alignment:
Q  202 gtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataact 300  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || |||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||    
T  5869253 gtgtcgtttgaatttgtcactccttcattgtgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 5869350  T
Q  301 tttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  5869351 tttcaaattgactgattaagtgattttaaaaattgtgg 5869388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 318
Target Start/End: Original strand, 36515027 - 36515202
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||   |||| | ||| |||||    
T  36515027 taaacacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagagctgaaatttatctaacggtgtcgtttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaatgggaa 36515126  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgatta 318  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||    
T  36515127 aacaaatgatttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattaactgatta 36515202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 23567145 - 23567350
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |   ||  ||||||| ||| || |||||||||||| |||| |  |   | |||| ||| ||    
T  23567145 tctaaacatgaaacgaaatacaa-aaaattaagtgaaagagtggtagaatttac-taacggcgtcgtttggatttgtcatttatccgttgtgggaaaagg 23567242  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23567243 aaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatcattgttgtgatactttcaatgaaatagtatttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggt 23567342  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  23567343 ggtttgat 23567350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 334
Target Start/End: Original strand, 42951727 - 42951831
Alignment:
Q  235 aaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtc----attctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatac 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42951727 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgtgtgattctttcaataaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatac 42951826  T
Q  330 aaatt 334  Q
    |||||    
T  42951827 aaatt 42951831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42777934 - 42777763
Alignment:
Q  148 catgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaac 246  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||||||| | | |||||||||||  || ||||| |||||| || |||||||||   | |||| ||| | ||||||    
T  42777934 catgaaacgaaataaaaaattaataagtgaaagagaggtgaaatttactgaacggtgtggtttggttttgtcactcctccgttgtgggaaatgagaaaac 42777835  T
Q  247 gaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgatta 318  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||  ||||||||| ||||    
T  42777834 gaatggtatatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaattaaatagctttctaaattgactaatta 42777763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27074669 - 27074562
Alignment:
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaata-acttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  27074669 aaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagactttt-aaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 27074571  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  27074570 tggtttgat 27074562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 335
Target Start/End: Original strand, 30915268 - 30915351
Alignment:
Q  253 tttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaa-taacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30915268 tttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattg 30915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33452897 - 33452779
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaatt-gaataacttttcaaattgactgattaaatgattata 328  Q
    |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  33452897 gtgggaaaggggaaa-caaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattaaaataacttttcaaattgattaattgagtgattata 33452799  T
Q  329 caaattgtgggtagtttgat 348  Q
     ||||||  ||| |||||||    
T  33452798 taaattggaggtggtttgat 33452779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33452953 - 33452916
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33452953 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaa 33452916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35875091 - 35875011
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcct 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | ||||||||| | |||| |||| | ||||||||||    
T  35875091 taaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaacgagaggtggagtttacctaacgatgtcatttgaaatgtcactcct 35875011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Original strand, 2545883 - 2545919
Alignment:
Q  229 cgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaa 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2545883 cgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatacgaaaaa 2545919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26633557 - 26633364
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaagggg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||||     
T  26633557 tctaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggtgtcgtttggaatgtcactcatacgtcgtgggaaaggga 26633458  T
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26633457 aaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattg 26633364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 36438223 - 36438414
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||   |||| | ||| |||||    
T  36438223 taaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtcatttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaaagggaa 36438322  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36438323 aacgaatggtttatgtgaaaaataaattattgttgtgattctttcaatgaaatggtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattg 36438414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 12251158 - 12251364
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  12251158 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgacgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 12251255  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  12251256 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaaatgattatagaaattagggg 12251355  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  12251356 tggtttgat 12251364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 172 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32956940 - 32956763
Alignment:
Q  172 aagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaat 270  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32956940 aagtgaaagataggtgaaatttacctaacagtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaat 32956841  T
Q  271 gattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
     |||||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  32956840 cattgttgtgattctttcaatgaaataactttataaattgactgattaaatgattataaaaattgggggtggtttgat 32956763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33910257 - 33910066
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||| | | |||| ||||||    
T  33910257 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtaattcctctgttgtggaaaaggg 33910161  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33910160 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagcgattatacaaatt 33910066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 36796242 - 36796448
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  36796242 tctaaaca-gaaatgaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgttttgatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 36796338  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  ||    
T  36796339 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttccaaattgactgattaagttattatacaaattaagg 36796438  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    ||||||||||    
T  36796439 gtagtttgat 36796448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 40841114 - 40841307
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||   | || | ||||||    
T  40841114 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaataattgaaagataggtgaaattttcctaatggtctcgtttggatttgtcacttctccgttgtaggaaaggg 40841213  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |  |||| | ||||||||||||    
T  40841214 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgagtgttgtaattcttttaatagaataactttataaattgattagttaagtaattatacaaatt 40841307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 773753 - 773946
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||   | || | ||||||    
T  773753 tctaaacatgaaacgaaataaaa-aaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggcgtcgtttgaatttgtgactcctccgttgttggaaaggg 773851  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcg--aaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  773852 -aaaacgaatggtttatgcacaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgataaagtaattatacaaatt 773946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7366862 - 7366688
Alignment:
Q  161 aaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcg 260  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||   |||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7366862 aaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttaccttacggtgtcgtttggaatgtcactcctacgtcgcaggaaaggggaaaatgaatggtttatgcg 7366763  T
Q  261 aaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  7366762 aaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaatagtttttcaaattgacaaattaagtaattattcaaattg 7366688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 33418987 - 33419194
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | || | ||| ||    
T  33418987 tctaaacatgaatggaattaaaaaaaaaataagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaatgg 33419084  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgac-tgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||    
T  33419085 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattattgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgacttaattaagtgattatacaaattaggg 33419184  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    ||||||||||    
T  33419185 gtagtttgat 33419194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Original strand, 44876027 - 44876218
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaa-ttaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||  |    
T  44876027 tctaaacatgaaatgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagagatgaaatttacctaaag-tgtcgtttggatttgtcactccttcattgtggaaa--g 44876123  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44876124 ggaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttctaaattgactgattaaatgattttaaaaattg 44876218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30739319 - 30739124
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaa-gtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    | |||  |||||    
T  30739319 tctatacatgaaatgaaataaaataaaataaaagtgaaagagaggtgaaatttaccaaacggtgtcatttggatttgtcactccgccgttgtgaaaaagg 30739220  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30739219 ggaaaactaattgtttatgcgaaaaggaaatgatcgttgtgattcttttaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattataaaaattg 30739124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42312204 - 42311999
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaa-ttaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||| |   | |||| |||||    
T  42312204 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggtgtcgtttagatttgtcgctcatccgttgtgg-aaagg 42312106  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| | |||    
T  42312105 ggaaaacgaattatttaagcgaaaaataaatgactgttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgactaatcaagtgattatacaaatcgaggg 42312006  T
Q  340 tagtttg 346  Q
    |||||||    
T  42312005 tagtttg 42311999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11672779 - 11672588
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| | || | |||||||| |||| ||||||||| | | |||| |||| |    
T  11672779 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatcaaacgatgtcgtttagatttgtcactcctctgttgtggaaaagag 11672683  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11672682 taaaacgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 11672588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Original strand, 40737877 - 40738067
Alignment:
Q  149 atgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacga 248  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||   |||| | ||||||||||||||    
T  40737877 atgaaacaaaataaaataaaataaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtgtcatttgaaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacga 40737976  T
Q  249 atggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    || ||||||||||||||         ||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||    
T  40737977 atagtttatgcgaaaaa---------gttgtgattctttcaataaaatagctttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgat 40738067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Original strand, 3799633 - 3799819
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaagggg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||  || |||| ||         
T  3799633 tctaaacatgaaacgaaataaaa--aaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggatttgcgctcctccattgtgggaatttct 3799730  T
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaa 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||   |||||| || |||||||||||||||||    
T  3799731 aaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttccaaaattggcttattaaatgattatacaa 3799819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41908371 - 41908179
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggat-tgtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||   | |||  |||||     
T  41908371 tctaaacatgaaacaaaataaaa-aaaattaagtgaaaaagaggtgaaatttatctaacgatatcgtttggatctgtcactcctccgtagtgaaaaagga 41908273  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41908272 gaatacgagtg-tttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttctaattgactgattaagtgattgtacaaattg 41908179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1366115 - 1366010
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatac 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1366115 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaataacttttcaaattgactgattaagtcattatac 1366016  T
Q  330 aaattg 335  Q
     |||||    
T  1366015 caattg 1366010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 7636194 - 7636402
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaa-ttaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||  || |||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| | | | |||| |||||    
T  7636194 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaattaagtgaaa--aaggtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttgtcactcttctgttgtggaaaagg 7636291  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtg 337  Q
    | ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |    
T  7636292 gtaaaacgaatggcttatgggaagaaaaaaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattagg 7636391  T
Q  338 ggtagtttgat 348  Q
    ||| |||||||    
T  7636392 ggtggtttgat 7636402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 42160993 - 42161196
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||| ||    
T  42160993 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaagg 42161089  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || ||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  42161090 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaattg-ttgctgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattaactgatcaagtgattatacaaattaggggt 42161188  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  42161189 ggtttgat 42161196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 334
Target Start/End: Original strand, 18895361 - 18895459
Alignment:
Q  236 aaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18895361 aaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaggaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaattgattatacaaatt 18895459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 328
Target Start/End: Original strand, 41852181 - 41852356
Alignment:
Q  152 aaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaat 250  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||   | |||| ||||||||||| ||||    
T  41852181 aaacgaaataaaa--aaattaagtgaaagagatgtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtggaaaaggggaaaatgaat 41852278  T
Q  251 ggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattata 328  Q
      ||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  41852279 tatttatgcaaaaaagaaatgagtgttgcgattctttcaatgaaataactctttaaattgactgagtaagtgattata 41852356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 44893906 - 44894091
Alignment:
Q  148 catgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaac 246  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||||||  ||| ||||||||||| ||| || ||||||||   |||| |||||| |||||    
T  44893906 catgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatgtaacggtgtcgtttgaatttgtaactcctttgctgtggaaaagggtaaaac 44894002  T
Q  247 gaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44894003 gaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaatt 44894091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 46221573 - 46221779
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |||| | | || |||||||| |||| || | | | |||| ||| ||    
T  46221573 tctaaacatgaaagaaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtaaaatttatctaacgatatcatttggatttgtcattcttctgttgtggaaaatgg 46221670  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  46221671 taaaacgaatggtttatgcgaataaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattctacaaattagggg 46221770  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    |||||||||    
T  46221771 tagtttgat 46221779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 203 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4100104 - 4099956
Alignment:
Q  203 tgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaa-cgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataac 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |    
T  4100104 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaaacgaatggtttttgcgaagaaaaaaatgattgttgtaattctttcaatgaaatagc 4100005  T
Q  300 ttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  4100004 ttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 4099956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 6379955 - 6380160
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| | ||   ||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  6379955 tctaaatatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatccaacaatgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 6380051  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||   || |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  6380052 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgattgattaagtgattatacaaattagggg 6380151  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  6380152 tggtttgat 6380160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25610257 - 25610091
Alignment:
Q  145 aaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |  |  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||   |  || |||| |||||||||    
T  25610257 aaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagagatagaatttac-taacggtgtcgtttggatttgtcacctatccattgtgggaaaggggaa 25610159  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattga 311  Q
    ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  25610158 aactattggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatgacttttcaaattga 25610091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Original strand, 26282532 - 26282618
Alignment:
Q  262 aaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26282532 aaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgat 26282618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 18015451 - 18015658
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||  | | | |||  ||||||    
T  18015451 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatcaaacggtgtcgtttgaatttgtcacttttctgttgtgtaaaaggg 18015547  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa---aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtg 337  Q
     ||||||||||||| |||||||   ||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |    
T  18015548 taaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattagg 18015647  T
Q  338 ggtagtttgat 348  Q
    ||| |||||||    
T  18015648 ggtggtttgat 18015658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 348
Target Start/End: Original strand, 40001694 - 40001772
Alignment:
Q  270 tgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  40001694 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattggaggtggtttgat 40001772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 287
Target Start/End: Original strand, 28590015 - 28590158
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| || | | ||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||   | |||| ||||||    
T  28590015 tctaaacatgaaatgaaatagaa--aaattaagtggaagagaggtgaattttacctaacaatgtcgtttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaggg 28590112  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattcttt 287  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  28590113 gaaaacgaatgg-ttacgcgaaaaagaaataattgttgtgattcttt 28590158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 348
Target Start/End: Original strand, 8358291 - 8358370
Alignment:
Q  269 atgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  8358291 atgattgttgtgattctttcaatgagataactttttaaattgactgattaagtgattatataaattaggggtggtttgat 8358370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9479208 - 9479115
Alignment:
Q  255 tatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||   ||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||    
T  9479208 tatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagttttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgat 9479115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Original strand, 40001581 - 40001618
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40001581 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaa 40001618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 10575393 - 10575599
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaagggg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  10575393 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaataaagtgaaaaagagatgaaatttacctgacggtgtcattcggattgtcactcctccgtcgtgggaaagggg 10575492  T
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  10575493 aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattatttcaatgaaataactttctaaattgactgattaagtgattatacaagttgagggtg 10575592  T
Q  342 gtttgat 348  Q
    |||||||    
T  10575593 gtttgat 10575599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 349
Target Start/End: Original strand, 21791418 - 21791624
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaagggg 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| | | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  21791418 tctaaacatgaaatgaaataaaataaaataaatttaaagagaggtgaaatttacctaacaatgtcgtttggattgtcactcattcgtcgtgggaaagggg 21791517  T
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggta 341  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||     
T  21791518 aaa-caaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacacattgaaggtg 21791616  T
Q  342 gtttgatg 349  Q
    ||||||||    
T  21791617 gtttgatg 21791624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 35653852 - 35654056
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||   |||| | |||||| ||    
T  35653852 taaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacggtgtcatttgaaatgtcactcctacgtcgtaggaaagggaaa 35653951  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagt 343  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  35653952 aacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatggtggt 35654051  T
Q  344 ttgat 348  Q
    |||||    
T  35654052 ttgat 35654056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5545523 - 5545316
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaa-ttaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   | |||  || ||    
T  5545523 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagac--gtgaaatttacctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtgagaaggg 5545426  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||    
T  5545425 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttccaaattgaccgattaagtgattatacaaattggtgg 5545326  T
Q  340 tagtttgatg 349  Q
    | ||||||||    
T  5545325 tggtttgatg 5545316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 32130661 - 32130866
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  32130661 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagagatg--aaatttatctaattgtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 32130757  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  32130758 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 32130857  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  32130858 tggtttgat 32130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19661572 - 19661367
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  19661572 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaaggg 19661476  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||  ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  19661475 taaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaggattgttgtgtttctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 19661376  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  19661375 tggtttgat 19661367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41038442 - 41038252
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  41038442 tctaaacatgaaaggaattaaaa--aaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 41038347  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41038346 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 41038252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 23426037 - 23426228
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  23426037 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggcgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 23426133  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23426134 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 23426228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 11681612 - 11681818
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||||    
T  11681612 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaaggg 11681709  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||    
T  11681710 taaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtgattataaaaattagggg 11681809  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  11681810 tggtttgat 11681818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 11689891 - 11690097
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||||    
T  11689891 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaaggg 11689988  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||    
T  11689989 taaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtgattataaaaattagggg 11690088  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  11690089 tggtttgat 11690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 28463459 - 28463664
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  28463459 tctaaacatcaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctattgtggaaaaggg 28463555  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  28463556 caaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaacttgattgattaagtgattatacaaattagggg 28463655  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  28463656 tggtttgat 28463664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53011908 - 53011700
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaa--ttaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaag 238  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||    
T  53011908 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaag 53011811  T
Q  239 gggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtg 337  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  53011810 ggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagg 53011711  T
Q  338 ggtagtttgat 348  Q
    ||| |||||||    
T  53011710 ggtggtttgat 53011700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22423878 - 22423672
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||   ||| || ||    
T  22423878 taaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaacagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggaatgtcactcctatgtcgtatgaaatggaaa 22423779  T
Q  244 aacgaatggtttatgcg--aaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggta 341  Q
    |||||||| |||||| |  ||||| |||| |||||| | |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||     
T  22423778 aacgaatgatttatgtggaaaaaataaataattgttttgattctttcaataaaatagtttttcaaattgattgattaagtgatcatacaaattgatggtg 22423679  T
Q  342 gtttgat 348  Q
    |||||||    
T  22423678 gtttgat 22423672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44478193 - 44478027
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtca 281  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  44478193 gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtga 44478094  T
Q  282 ttctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44478093 ttctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatttagtgattatacaaattatgggtggtttgat 44478027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27632591 - 27632386
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| || | | |||| ||||||    
T  27632591 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactactctgttgtggaaaaggg 27632495  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
T  27632494 taaagcgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgatgtgattctttcaatgaagtagcttttcaaattgactaattaagtgattatacaaattagggg 27632395  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  27632394 tggtttgat 27632386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 45172516 - 45172707
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | | ||  ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||  |   | |||| ||||||    
T  45172516 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaat-aagtgaaagagaggtagaatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggg 45172613  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45172614 gaaaacgaatggtctatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 45172707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 238 - 348
Target Start/End: Original strand, 43154754 - 43154864
Alignment:
Q  238 ggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtg 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  43154754 ggggaaaacgaatgatttatgcgaaaaataaataattgttgtgattcttttaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgat 43154853  T
Q  338 ggtagtttgat 348  Q
    ||| |||||||    
T  43154854 ggtggtttgat 43154864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23256783 - 23256582
Alignment:
Q  145 aaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |   |||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| |||||| ||    
T  23256783 aaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtaaaatag--gtgaaatttatctaccggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaa 23256687  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagt 343  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||    
T  23256686 aacgaatggtttatgggaagaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaatagctttctaaattgactgattaagtggttatacaaattaggggtggt 23256587  T
Q  344 ttgat 348  Q
    |||||    
T  23256586 ttgat 23256582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29580033 - 29579868
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||| || | | |||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  29580033 gtgaaatttatctaacggtatcatttggatttgtcactactctgttgtggaaaatggtaaaacgaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgat 29579934  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||    
T  29579933 tctttcattgaaatagcttttcaatttgactgattaattaattatacaaattatgggtggtttgat 29579868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16072785 - 16072596
Alignment:
Q  149 atgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacg 247  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| | |||| ||||| || ||||||||| | | |||| |||||| |||||     
T  16072785 atgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacgatgtcatttgggtttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaaca 16072688  T
Q  248 aatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttc---aattg-aataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16072687 aatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttctttcattgaaatagtttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 16072596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 29221492 - 29221683
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||| | | || ||||||||||  ||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  29221492 tctaaatatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaattaatccaacggtgtcgtttaaatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 29221588  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||   || ||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29221589 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattccttcaatgaaatagacttccaaattgaccgtttaagtgattatacaaatt 29221683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34982330 - 34982225
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatac 329  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34982330 gtgggaaaggggaaaacaaatgatttatatgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagtttttccaattgactgattaagtgattatac 34982231  T
Q  330 aaattg 335  Q
    ||||||    
T  34982230 aaattg 34982225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Original strand, 26328900 - 26329095
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataa-aattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| | | |||||||||||||||  |||||||||| | || ||| ||||   | |||| |||||    
T  26328900 tctaaacatgaaaagaaataaaaaaagaattaagtaaaagagaggtgaaatttacctaaaagtgtcgtttgaatttatcattcctccgttgtgggaaagg 26328999  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaa-taacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    || |||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||  | ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26329000 gg-aaacaaatggtttatccaaaaaataaatgatcgttgtgattctttttattgaagcagctttctaaattgactgattgaatgattatataaattg 26329095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 55134306 - 55134209
Alignment:
Q  239 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaac-aaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  55134306 gggaaaacgaatgatttatgtaaaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 55134209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 300
Target Start/End: Original strand, 51066336 - 51066452
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcg--aaaaacaaatgattgttgtca 281  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  |  ||| ||  |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  51066336 gtgaaatttacctaacagtgtcatttggatttgtcactccttcgttttgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaaaatgattgttgtga 51066433  T
Q  282 ttctttcaattgaataact 300  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  51066434 ttctttcaatgaaataact 51066452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24449291 - 24449211
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcct 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | ||||||||| | |||| |||| | ||||||||||    
T  24449291 taaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaacgagaggtggagtttacctaacgatgtcatttgaaatgtcactcct 24449211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 55134403 - 55134366
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  55134403 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaa 55134366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6294448 - 6294279
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaagggg 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||    
T  6294448 tctaaacatgaaacaaaataaaataaaattatgtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaatgtcactcctacgtcgtgggaaagggg 6294349  T
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattga 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  6294348 aaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaattgcttttcaaattga 6294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6360952 - 6360748
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| | |||  ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  6360952 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaat-aagtgaaagagatg--aaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 6360856  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  6360855 taaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaat-gaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaaggg 6360757  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  6360756 tggtttgat 6360748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 3748440 - 3748631
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||   |||    |||||||||    
T  3748440 taaatatgaaataaaacaaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggtgtcatttggaatgtcactcctacgtcgcatgaaaggggaa 3748539  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3748540 aacgaatagtttatgtgacaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattg 3748631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 57880 - 57676
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  57880 tctaaatatgaaaggaattaaaa--aaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaaggg 57785  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  57784 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttgaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattatacaaattatggg 57685  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  57684 tggtttgat 57676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29401291 - 29401128
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  29401291 gtgaaatttatcta--ggtgtcatttggatttgtcactcctctgtcgtggaaaagggtaagacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgat 29401194  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29401193 tctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatactaattaggggtagtttgat 29401128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2618508 - 2618343
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  2618508 gtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgat 2618409  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  2618408 tctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 2618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 7525038 - 7525242
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  7525038 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaatag--gtgaaatttatctaacggtgtc-tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 7525133  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7525134 taaaataaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattatggg 7525233  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  7525234 tggtttgat 7525242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 30915233 - 30915429
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||   ||||   ||||||||     
T  30915233 taaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagagataaaatttacataacggtgtcgtttgaaatgtcacttctacgtcgtaagaaaggggat 30915332  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaac-----aaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    || |||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30915333 aatgaatggtttatgcgaaaaattaaagaaatgattgttgtgattctttcaattaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattg 30915429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 3514723 - 3514926
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgt-cactcctttatcgtggcaaagggga 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| |||||| |    
T  3514723 taaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaatggtgtcgtttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggta 3514819  T
Q  243 aaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||   ||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||     
T  3514820 aaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgatatagctttccaaattgaatgattacgtgattatacaaattaggggtg 3514919  T
Q  342 gtttgat 348  Q
    |||||||    
T  3514920 gtttgat 3514926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29149556 - 29149405
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  29149556 gtgaaatttacgtaacggtatcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgat 29149457  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29149456 tctttcaatgaactaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 29149405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 12614589 - 12614792
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| |||  |||||| ||| || |||||| | | |||| ||||||    
T  12614589 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggt--cgtttgaatttgttactcctctgttgtggaaaaggg 12614683  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  12614684 taaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 12614783  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  12614784 tggtttgat 12614792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Original strand, 628007 - 628171
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattg-tcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||| || | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  628007 gtgaaatttatctaacgatgtcgtttggatttatcacttctctgttgtggaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgat 628105  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  628106 tctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 628171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6754395 - 6754208
Alignment:
Q  145 aaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |   ||||||||||   || |||||| |||||||| ||||||||| | | |||| |||||| ||    
T  6754395 aaacatgaaaggaattaaaa--aaattaagtgaaagag--gtgaaatttattcaacggtgtcatttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaa 6754300  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6754299 aacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgactatacaaatt 6754208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Original strand, 1092911 - 1093103
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||  ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||  |   |  ||| ||||||    
T  1092911 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgttttgggaaaggg 1093009  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  1093010 gaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttc-atgaaatagctttttaaattgactgatttagtcattataccaattg 1093103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21946296 - 21946109
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |   | || | |||| ||||    
T  21946296 taaatatgaaacaaaacaaaataaa-ttaagtgaaagagaggtggaatttacctaacggtgtcgtttgaat-gtcactcttacgt-gtaggaaagaggaa 21946200  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21946199 aacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttatggttctttcaatgaaatagcttttcaaatagactgattaagtgattatacaaatt 21946109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Original strand, 29308337 - 29308530
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattg-tcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||  ||||||| ||| |||||| ||| ||||  |||||  |  || |||| ||||||    
T  29308337 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttac-taacggtgtcatttagatttatcacttatccattgtgggaaaggg 29308435  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  29308436 gaaaacgaatgatttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattacttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 29308530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 350611 - 350402
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaat--gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattg-tcactcctttatcgtggcaaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||| ||||   |  ||| |||     
T  350611 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaaatgaaagatataggtgaaatttacctgacggtgtcgttttgatttatcattcctccgttatgggaaaa 350512  T
Q  239 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattg-aataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtg 337  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||      
T  350511 gggaaa-caaattgtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagctttcgaaattgactgattgagtgattatataaattgat 350413  T
Q  338 ggtagtttgat 348  Q
    ||| |||||||    
T  350412 ggtggtttgat 350402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19231788 - 19231601
Alignment:
Q  161 aaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattg-tcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgc 259  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||  || | |||||||||  ||||| ||  || |||| |||   ||||| |||| |||||| |    
T  19231788 aaaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaagagtattgtttggatttatcacttctccattgtgggaaaattgaaaaagaatagtttatac 19231689  T
Q  260 gaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||   ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  19231688 gaaaaagaaatgattgttgtgattttttcaatgtcatagcttttcaaattgattgattaagtga-tatacaaattgaaggtagtttgat 19231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22503936 - 22503751
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||    | |||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||| || | | |||| ||||||    
T  22503936 tctaaacataaaaggaatttaaaaaaaattaagtgaag---aggtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttgtcacttctctgttgtggaaaaggg 22503840  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattata 328  Q
     |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22503839 taaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttttaattctttcaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattata 22503751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 348
Target Start/End: Original strand, 1690621 - 1690709
Alignment:
Q  260 gaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  1690621 gaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataaattttcaaattgattgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgat 1690709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31861067 - 31860990
Alignment:
Q  270 tgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  31861067 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattg-gggtggtttgat 31860990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11088652 - 11088564
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattg-aataacttttcaaattgactgatta 318  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11088652 gtggtaaaggggaaa-caaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagcttttcaaattgactgatta 11088564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11088765 - 11088694
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataa-aattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  11088765 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaagaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacagtgttgtttgg 11088694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 334
Target Start/End: Original strand, 14893412 - 14893479
Alignment:
Q  267 aaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||   ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14893412 aaatgattgttgtgattcttttaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 14893479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 332
Target Start/End: Original strand, 15035807 - 15035840
Alignment:
Q  299 cttttcaaattgactgattaaatgattatacaaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15035807 cttttcaaattgactggttaaatgattatacaaa 15035840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31234953 - 31234912
Alignment:
Q  294 aataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31234953 aatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattg 31234912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 44836597 - 44836797
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||    
T  44836597 taaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctagcggtgtcatttggaatgtcactcctacgtcgtgggaaagggaaa 44836696  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  44836697 aacgaatggtttatgcgaaaaagaaatga----tgtgattctttcagtgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggt 44836792  T
Q  344 ttgat 348  Q
    |||||    
T  44836793 ttgat 44836797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 17674226 - 17674417
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |   |||| | |||||||||    
T  17674226 taaacacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaaaataggtgaaatttacctaacggtgtcatttggaatgtcactcttacgtcgtaggaaaggggaa 17674325  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17674326 aacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattattcaaattg 17674417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Original strand, 13120738 - 13120928
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||| | |||||||||    
T  13120738 taaacacgaaacaaaacaaaataaaattaagtgatagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggggaa 13120837  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13120838 aatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtggtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattattcaaatt 13120928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 162 - 348
Target Start/End: Original strand, 27703419 - 27703605
Alignment:
Q  162 aaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcga 261  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |   | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27703419 aaataaaattaagtgaaggagaggtgaaatttacctaacagtgtcgtttggattgtcactcttccgtggtggaaaagggaaaaacgaatggtttatgcga 27703518  T
Q  262 aaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27703519 aaatgaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgat 27703605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50371328 - 50371130
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||   | ||||  |||||    
T  50371328 tctaaacatgaaacgaaataaaa-aaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacgatgttgtttggatttgtcactcctccgttgtgggtaaggg 50371230  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
     ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50371229 aaaaactaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgagggt 50371130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 18127808 - 18128013
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| |   || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  18127808 tctaaacattaaa-gaaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtaaaatttacctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaaggg 18127904  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18127905 taaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattcttgcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattatggg 18128004  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  18128005 tggtttgat 18128013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 50552688 - 50552483
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||| ||    
T  50552688 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagagatg--aaatttatctaatggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaaagg 50552592  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||    
T  50552591 taaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattagggg 50552492  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  50552491 tggtttgat 50552483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 198 - 9
Alignment:
Q  145 aaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | || | |||||| ||    
T  198 aaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaagggtaa 101  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  100 aacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatcactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12971596 - 12971394
Alignment:
Q  146 aacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaa 244  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||| | | ||  ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||  |   | |||| ||||||||||    
T  12971596 aacatgaaacgaaatacaaaaaaaataagtgaaagataggtagaatttac-taacggagtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaa 12971498  T
Q  245 acgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtt 344  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  12971497 acgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtt 12971398  T
Q  345 tgat 348  Q
    ||||    
T  12971397 tgat 12971394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Original strand, 30004778 - 30004970
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||| ||    
T  30004778 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaa--aaggtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaagg 30004875  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  30004876 taaaacgaatggtttatgggaagaacaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattaattgattaagtgattatacaaattg 30004970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Original strand, 48722281 - 48722446
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  48722281 gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgat 48722380  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    | |||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  48722381 tatttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 48722446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 22386708 - 22386900
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||   |||| | |||||||||    
T  22386708 taaacacgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttatttaacgatgtcgtttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggggaa 22386807  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaaca-aatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | | | |||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  22386808 aacaaatggtttatgcaaaaaaaatattaattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattgttcaaattg 22386900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6150915 - 6150709
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||  |    
T  6150915 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaatag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaag 6150819  T
Q  241 g-aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaat-gattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
    | ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  6150818 gtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaattgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatataaattaggg 6150719  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    || |||||||    
T  6150718 gtggtttgat 6150709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42740300 - 42740098
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||  || || |||||| ||||||||||   |||| | |||||||||    
T  42740300 taaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagataggtga--tttacctaacagtttcatttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggggaa 42740203  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagt 343  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  ||| ||    
T  42740202 aacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgcgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactaattaagttattatacaaattgatggttgt 42740103  T
Q  344 ttgat 348  Q
    |||||    
T  42740102 ttgat 42740098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25930796 - 25930592
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | | | |||| ||||||    
T  25930796 tctaaatatgaaaagaattaaaa-aaaattaagtgaaagagatg--aaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaaggg 25930700  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
     ||||| |||||||||| | || || ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  25930699 taaaacaaatggtttatccaaagaaaaaatgattgttgtgatcctttcaatgaaatagcttttcaagttgactgattaagtgattatacaaattaggggt 25930600  T
Q  341 agtttgat 348  Q
    ||||||||    
T  25930599 agtttgat 25930592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30899853 - 30899658
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaa-ttaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| | | |||| |||||    
T  30899853 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcattcctctgttgtggaaaagg 30899756  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaa---aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30899755 gtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactaattaagtgattatacaaatt 30899658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Original strand, 14084570 - 14084759
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||  |||||    
T  14084570 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaaatgaaagag--gtgaaatttatctaatggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggagaaggg 14084667  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaa--tgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattataca 330  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||| |||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14084668 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattgattattgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattataca 14084759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 28885542 - 28885747
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | | | |||| ||| |     
T  28885542 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaaaga 28885638  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28885639 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttacaatgaaatagctttcaaaattgattgattaagtgattatacaaattatggg 28885738  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  28885739 tggtttgat 28885747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10109917 - 10109722
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacga---aataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcctttatcgtggcaaa 237  Q
    ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||  | | |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| | | |||| |||    
T  10109917 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaaaattaagtgaa--agaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaa 10109820  T
Q  238 ggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10109819 gggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaattgctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 10109722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 348
Target Start/End: Original strand, 29208010 - 29208174
Alignment:
Q  186 tgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcatt 283  Q
    ||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  29208010 tgaaatttatccaacggtgtcatttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgatt 29208109  T
Q  284 ctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||||  ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  29208110 ctttcaatgaaatagacttccagattgactgattaaatgattatacaaattaggggtggtttgat 29208174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 37873628 - 37873838
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaa-ttaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctt-----tatcgtggcaaa 237  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||      |||||| | |||    
T  37873628 taaacatgaaacaaactaaaataaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacgtaacagtgtcgtttggcatgtcactcctacgtcgtatcgtaggaaa 37873727  T
Q  238 ggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||  || |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||      
T  37873728 ggggaaaacgaatggtttatgcagaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattaactgattaagtgactatacaaattgat 37873827  T
Q  338 ggtagtttgat 348  Q
    ||| |||||||    
T  37873828 ggtggtttgat 37873838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 348
Target Start/End: Original strand, 12884100 - 12884213
Alignment:
Q  235 aaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12884100 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaatt 12884199  T
Q  335 gtgggtagtttgat 348  Q
      |||| |||||||    
T  12884200 aggggtggtttgat 12884213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24556979 - 24556807
Alignment:
Q  161 aaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcg 260  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |  | | |||  | |||||||||||||||||||    
T  24556979 aaaataaaattaagtgaaagag--gtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaatgtcactcctacgtgataggaaaaagaaaaacgaatggtttatgcg 24556882  T
Q  261 aaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||| |||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  24556881 aaaaagaaataattgttgtgattctttaaatgaaatagtttttcaaattgacttattaagtgattattcaaattg 24556807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 330
Target Start/End: Original strand, 6333396 - 6333574
Alignment:
Q  148 catgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgt-cactcctttatcgtggcaaaggggaaaac 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||  | |||| ||  |||||| |    
T  6333396 catgaaacgaaataaaa-aaaattaagtgaaagagatg--aaatttacctaacagtgtcgtttggattcttcactcattcgttgtgggaa--gggaaagc 6333490  T
Q  247 gaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattataca 330  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  6333491 gaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaataaaataactttccaatttgactgattaagtgattttaca 6333574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 51109972 - 51110177
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||| | |||| |||||     
T  51109972 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttgtcactcctttgttgtggaaaagga 51110068  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaa-tgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||| ||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||    
T  51110069 taaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaacttattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattatagaaattagggg 51110168  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  51110169 tggtttgat 51110177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Original strand, 17487172 - 17487359
Alignment:
Q  161 aaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgc 259  Q
    |||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||| | | |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  17487172 aaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggcgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggataaaacgaatggtttatgc 17487269  T
Q  260 gaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
     || ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  17487270 aaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgatttattaagtgattatataaattaggggtggtttgat 17487359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 203 - 334
Target Start/End: Original strand, 33124559 - 33124692
Alignment:
Q  203 tgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataact 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||| || | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||    
T  33124559 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaatggtataacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 33124658  T
Q  301 tttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33124659 tttcaaattgacttattaagtgattatacaaatt 33124692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5560677 - 5560473
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaa-ataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| | |||  |||||||| ||  |||||  |||||||| |||||||||   | |||| ||| |    
T  5560677 tctaaacatgaaacaaaataaataaaaaaataagtgaaagagatg--aaatttacgtac-ggtgttatttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaag 5560581  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaa-atgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
     ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5560580 agaaaatgaatagtttatgcggaaaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgggg 5560481  T
Q  339 gtagtttg 346  Q
    || |||||    
T  5560480 gtggtttg 5560473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9777609 - 9777403
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaa-ttaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || |  ||  ||| |||||    
T  9777609 tctaaacatgaaactaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacctaacggtgtcgtttggatttatcattcatccattatgggaaagg 9777510  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattg-aataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
    || |||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||  |||| ||||  | |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||    
T  9777509 gg-aaacaaatggtttatgagaaaaggtaatgattgttgtgattctttttattgaaatagttattcaaattgactgattgagtgattatataaattgggg 9777411  T
Q  339 gtagtttg 346  Q
    || |||||    
T  9777410 gtggtttg 9777403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 318
Target Start/End: Original strand, 26486247 - 26486419
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| ||   |||| | |||| ||||    
T  26486247 taaacatgaaacaaaataaaataaaattaattgaaagag--gtgaaatttaccaaacggtgtcatttggaatgtcacttctacgtcgtaggaaagaggaa 26486344  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgatta 318  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||  |||| ||||||| ||| | ||||||    
T  26486345 aacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttatgattttttcaatgaaatagcttttcagattaagtgatta 26486419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 52055701 - 52055540
Alignment:
Q  188 aaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaa-tgattgttgtcattct 285  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| | | |||  |||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||    
T  52055701 aaatttatctaacggtgtcgtttagatttgtcactcctcttt-gtgtaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaactgattgttgtgattct 52055603  T
Q  286 ttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||  |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  52055602 ttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatataaattatggatagtttgat 52055540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15441482 - 15441278
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | | | |||| ||||||    
T  15441482 tctaaacatgaaacggaataaaaaaaa--taagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttctgttgtggaaaaggg 15441385  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaa-taacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||| ||||| ||||||| ||||| || | |||||||| |||||||  | |||| || ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15441384 -aaaatgaatgatttatgcaaaaaagaatt-attgttgtgattctttttaatgaaatagctttataaattgagtgattaagtgattatacaaattgtagg 15441287  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  15441286 tggtttgat 15441278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1269746 - 1269574
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaa-attaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcct-ttatcgtggcaaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||    | |||| ||||    
T  1269746 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaattaataagtgaaagaaaggtgaaatttacggaacggtgtcgtttggatttgtcactcctccgcttgtgggaaag 1269647  T
Q  239 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgact 313  Q
    | |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  1269646 gagaaaacgaat-gtatatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgact 1269574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 334
Target Start/End: Original strand, 20905197 - 20905349
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagggg-aaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtca 281  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |    
T  20905197 gtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaattattgttgtga 20905296  T
Q  282 ttctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||  ||||   || |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20905297 ttctttcaatgaaatagacttccaaattgactgaataagtgattatacaaatt 20905349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Original strand, 52240407 - 52240554
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| ||||| | | |||| ||||||    
T  52240407 tctaaatatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacagtgtcgtttgaatttgtcgctcctctgttgtggaaaaggg 52240503  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaa 290  Q
     |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  52240504 caaaatgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaa 52240554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3907526 - 3907472
Alignment:
Q  281 attctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3907526 attctttcaatgaaataatttttcaaattgattgattaaatgattatacaaattg 3907472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 36059775 - 36059981
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaagggg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||| || |||||||||| |||||||| |   |||||| ||| |||    
T  36059775 tctaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtaaaatttacgtaacggcgtcgtttggaatgtcactcatacgtcgtgggaaaaggg 36059874  T
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggta 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||     
T  36059875 aaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtggttctttcaatgaaatagctttttaaattaactgattaagtgattatacaaattgatggtg 36059974  T
Q  342 gtttgat 348  Q
    |||||||    
T  36059975 gtttgat 36059981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1419101 - 1418897
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |   || | | |||||  ||    
T  1419101 taaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacctaacggtgtcatttggaatgtcactcatacgtcataggaaaggaaaa 1419002  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagt 343  Q
    || |||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  1419001 aatgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttacaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggt 1418902  T
Q  344 ttgat 348  Q
    |||||    
T  1418901 ttgat 1418897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 335
Target Start/End: Original strand, 29480516 - 29480700
Alignment:
Q  151 gaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaat 250  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||   ||||||||| || |||    
T  29480516 gaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaactttacctaacggtgtcgtttggaatgtcactcctatgtcgtaagaaaggggaagacaaat 29480615  T
Q  251 ggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
T  29480616 ggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataatttttcaaattgactgaataagtgtttattcaaattg 29480700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39081588 - 39081386
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||   |||| | |||||||||    
T  39081588 taaatatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatg-tgtcatttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggggaa 39081490  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagt 343  Q
    ||| ||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  39081489 aactaatggtttatatgaaaag-aaataattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggt 39081391  T
Q  344 ttgat 348  Q
    |||||    
T  39081390 ttgat 39081386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 26151618 - 26151823
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | || | ||||||    
T  26151618 tctaaacatgaaagtaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaaggg 26151714  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  26151715 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 26151814  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  26151815 tggtttgat 26151823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7993825 - 7993620
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  7993825 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaa--taagtgaaaga--tgtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaaggg 7993730  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  7993729 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaagattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattggctgattaagtgattatacaaattaggg 7993630  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    || |||||||    
T  7993629 gtggtttgat 7993620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38599592 - 38599403
Alignment:
Q  145 aaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaa 244  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |   |||||| ||||||||||    
T  38599592 aaacatgaaataaaataaaataaaattaagtgaaagagagatgaaatttacctaacggtgtcgtttgaaatgccactcatacgtcgtgggaaaggggaaa 38599493  T
Q  245 acgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38599492 acgaatggtttatg-aaaaaataaataattgttttgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattg 38599403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 41096407 - 41096600
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  41096407 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaataagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 41096504  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41096505 taaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 41096600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45619169 - 45618965
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  45619169 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 45619073  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  45619072 taaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttc-caaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 45618974  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  45618973 tggtttgat 45618965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13997497 - 13997315
Alignment:
Q  152 aaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatg 251  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| |   |||| | ||| |||||||||||||    
T  13997497 aaacaaaataaaacaagattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaaatgtgttgtttggaatgtcactcatacgtcgtaggaaa-gggaaaacgaatg 13997399  T
Q  252 gtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  13997398 gtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactcattaagtgattattcaaattg 13997315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 18676181 - 18676387
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   ||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  18676181 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaactttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctcttttgtggaaaaggg 18676277  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  ||    
T  18676278 taaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagttattatacaaattaggg 18676377  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    ||||||||||    
T  18676378 gtagtttgat 18676387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4856186 - 4855981
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||     
T  4856186 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacaatgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggt 4856090  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  4856089 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattcactgattaagtgattatacaaattagggg 4855990  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  4855989 tggtttgat 4855981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 318
Target Start/End: Original strand, 17117515 - 17117691
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |   | |||| ||||||    
T  17117515 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttac-taacggtgtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggg 17117613  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgatta 318  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  17117614 gaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatta 17117691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Original strand, 19367330 - 19367495
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  | | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  19367330 gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactccactgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgat 19367429  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  19367430 tctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 19367495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 27302409 - 27302596
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagggga 242  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||        ||  ||||| ||    
T  27302409 taaacatgaaacgaaattaaa--aaattaagtgaaataaaggtgaaatttacctaacgttgtcgtttggatttgtcactc--------tgcaaaaggtga 27302498  T
Q  243 aaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27302499 aaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgatatagcttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgagggt 27302596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Original strand, 1226137 - 1226341
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattg-tcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||| | |||||||||||||  | | |||||  | ||||   |||     
T  1226137 tctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaagagagatgaaatttacctaacgatgtcgtttggatttatgattccttcgttgtggggtagg- 1226235  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattg-aataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||    
T  1226236 -aaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaataacttttcaaattgtctgattgagtgattatataaattgaggg 1226334  T
Q  340 tagtttg 346  Q
    | |||||    
T  1226335 tggtttg 1226341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25222516 - 25222325
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||  ||| ||||| ||||| ||| ||||||||| | | |||  ||||||    
T  25222516 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaaga--tgtgaaatttatataacggtgttgtttgaatttgtcactcctctgttgtgaaaaaggg 25222420  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25222419 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttctaaattgactaattaagtgattatacaaatt 25222325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 38985579 - 38985785
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||||||  |   | |||| ||||||    
T  38985579 tctaaaaatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaattcac-taacggcgtcttttggatttgtcacttatccgttgtggaaaaggg 38985677  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  38985678 gaaaacaaatgttttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaaatgattatacaaattggaggt 38985777  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  38985778 ggtttgat 38985785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 318
Target Start/End: Original strand, 42759627 - 42759802
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||   |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  42759627 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagagatgg--aatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcacccctctattgtggaaaaggg 42759723  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgatta 318  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  42759724 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgatta 42759802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2063999 - 2063793
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||| ||    
T  2063999 tctaaatatggaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaagg 2063902  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcga-aaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  2063901 taaaacgaatggtttttgcgggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 2063802  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  2063801 tggtttgat 2063793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6530852 - 6530647
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggat-tgtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||  ||||||| ||||  ||| |||||| || |||||||||| | | |||| | |||     
T  6530852 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagagatg--aaatttatctaacagtgacgtttgaatctgtcactcctctgttgtggaatagga 6530756  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaaca-aatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  6530755 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcaatgaaataccttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 6530656  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  6530655 tggtttgat 6530647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 18172812 - 18173016
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| | | ||  |||||||| || || |||||||||||| ||||||  |   | |||| ||||||    
T  18172812 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaatt--gtgaaagagaggtagaatttacc-aacggcgtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggg 18172908  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  18172909 gaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaattgagtgattaagtgattatacaaattaggggt 18173008  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  18173009 ggtttgat 18173016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15457607 - 15457488
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaa-tgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattata 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15457607 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttgtgtgaaaaaaaaaattattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattata 15457508  T
Q  329 caaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  15457507 caaattgggggtagtttgat 15457488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36481588 - 36481439
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | | |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||    
T  36481588 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaa--agaggtgaaatttatctaccggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 36481491  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaat 291  Q
     |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36481490 taaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaat 36481439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Original strand, 31273059 - 31273241
Alignment:
Q  166 aaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaa 264  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  | | | |||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  31273059 aaaattaagcgaaagagaagtgaaatttacctaactgtgtcgtttggatttgtcacttttctgttgtgggaaagagaaaaacaaatggtttatgcgaaaa 31273158  T
Q  265 acaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    | |||||| |||| | ||||||| |||  ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31273159 agaaatgaatgttatgattcttttaatgaaatagtattccaaattgactgattaaatgattatacaaattg-gggtggtttgat 31273241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 42411431 - 42411634
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgt-cactcctttatcgtggcaaagggga 242  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |   || ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| | | |||  |||||| |    
T  42411431 taaacatgaaa-gaaattaaaaataattaagtgaaagag--gttaaatttatctaacggtgtcgtttggatttttcactcctctgttgtgaaaaagggta 42411527  T
Q  243 aaacgaatggtttatgcgaaa-aacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||  |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||     
T  42411528 aaacgaatggtttatgcgaagtaaaaaatgattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtg 42411627  T
Q  342 gtttgat 348  Q
    |||||||    
T  42411628 gtttgat 42411634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 348
Target Start/End: Original strand, 34061810 - 34061932
Alignment:
Q  227 atcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgatt 325  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| | ||     
T  34061810 atcgtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtaatc 34061909  T
Q  326 atacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  34061910 atacaaattatgggtggtttgat 34061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 348
Target Start/End: Original strand, 21747188 - 21747306
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatac 329  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||   |||   ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21747188 gtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgacatagtattttaaattgactgattaagtgattatac 21747287  T
Q  330 aaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  21747288 aaattgggggtggtttgat 21747306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13020576 - 13020411
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgt-cactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcat 282  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| ||| | ||||||| | | |||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  13020576 gtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttttcactcctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgat 13020477  T
Q  283 tctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||| |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  13020476 tctttaaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 13020411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 18915923 - 18916130
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgt--cactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||  ||||||| ||| || ||||||| |||| |  ||||  |   | |||| |||||    
T  18915923 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttac-taacggcgtcgtttcgattttatcacttatccgttgtgggaaagg 18916021  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
    | ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  18916022 gaaaaacaaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgctgtgattctttcagtgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgggga 18916121  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  18916122 tggtttgat 18916130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45042583 - 45042377
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| | ||   ||||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  45042583 tctaaatatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaatag--gtgaaatttatccaacaatgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 45042487  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaata-acttt--tcaaattgactgattaaatgattatacaaattgt 336  Q
     ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  45042486 taa--cgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagactttcaccaaattgactgattaagtgattatacaaattag 45042389  T
Q  337 gggtagtttgat 348  Q
    |||| |||||||    
T  45042388 gggtggtttgat 45042377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12269618 - 12269413
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||| |   |||| ||| |     
T  12269618 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcattcctctgctgtggaaaaaga 12269521  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||| |||  |||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  12269520 taaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgtggtgatttttttaatgaaatagctttccaaatc-actgattaagtgattatacaaattagggg 12269422  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  12269421 tggtttgat 12269413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13001832 - 13001655
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| | | ||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||     
T  13001832 tctaaacacgaaacgaaataaaaaattaataagtgaaagagaagtgcaatttaccgaacagtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtgggaaagga 13001733  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgatta 318  Q
    |||||||||| || ||| |  |||| |||||||| |||| ||||||| |||  |||| ||||  ||||||||| ||||    
T  13001732 gaaaacgaattgtatatactgaaaaaaaatgattattgtgattcttttaatgaaatagctttataaattgactaatta 13001655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9029789 - 9029707
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  9029789 tctaaacatgaaacgaaataaaaaattaataagtgaaagagaggtgaaatttaccaaacggtgtcgtttggatttgtcactcc 9029707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Original strand, 18482488 - 18482581
Alignment:
Q  254 ttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttt-tcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttg 346  Q
    ||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18482488 ttatgagaaaaagacattattgttgttattctttcaatgaaataactgtgttaaattgactgattaagcgattatacaaattgggggtagtttg 18482581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38599665 - 38599593
Alignment:
Q  186 tgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatg 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38599665 tgaaatttacctaacggtgtcgtttgaaatgccactcatacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 38599593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18873652 - 18873459
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||   |||| | |||||||||    
T  18873652 taaacatgaaacaaaacaaaataaagttaagtgaaagaaaggtgaaatttacctaacggtttcgtttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggggaa 18873553  T
Q  244 aacg---aatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  18873552 aacgaataatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattggctgattaagtggttatacaaatt 18873459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17326037 - 17325847
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||| | |||||||||    
T  17326037 taaacacgaaacaaaacaaaataaaataaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggggaa 17325938  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaata-acttttcaaattgactgattaaatgattatacaaat 333  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17325937 agcgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttcaaattgactgattaagtgattattcaaat 17325847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 332
Target Start/End: Original strand, 7390273 - 7390460
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| || | |||  | |||||||||    
T  7390273 taaacataaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaat-gtcacttctatgtcgcaggaaaggggaa 7390371  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7390372 aacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtcgtgattctttcgatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaa 7390460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43511812 - 43511606
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |   | |||| ||||||    
T  43511812 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttac-taacggtgtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggg 43511714  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
     ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43511713 aaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggt 43511614  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  43511613 ggtttgat 43511606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13474780 - 13474618
Alignment:
Q  188 aaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattct 285  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  13474780 aaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattct 13474681  T
Q  286 ttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  13474680 ttcaatgaaacaacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 13474618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13656403 - 13656212
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |   |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||| | | || | ||||||    
T  13656403 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtaaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgacactcctctgttgtagaaaaggg 13656307  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13656306 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 13656212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40779382 - 40779180
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagggga 242  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  || |||| |||||  |    
T  40779382 taaacatgaaatgaaataaaa-aaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatgatgtcgtttcgatttgtcactcctccattgtgggaaagg--a 40779286  T
Q  243 aaacgaatggtttatgcgaaaaac-aaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggta 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||    
T  40779285 aaacgaatggtttatacgaaaaaagaaatgattgttgtgattcct-caatggaatagtttttcaaattgacttattaaacgattatacaaattggggata 40779187  T
Q  342 gtttgat 348  Q
    |||||||    
T  40779186 gtttgat 40779180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10033730 - 10033570
Alignment:
Q  152 aaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatg 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||   |||| | |||||| ||||||||||    
T  10033730 aaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtttcgtttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aaaacgaatg 10033632  T
Q  252 gtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgact 313  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  10033631 gtttatgcgaaaaagaaataattattgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgact 10033570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13424056 - 13423866
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagggga 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||| |    
T  13424056 taaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatcgaacggtgtcgtttagatttgtcactcctctattgtggaaaagggta 13423959  T
Q  243 aaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13423958 aaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgattgattaagtgattatacaaatt 13423866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Original strand, 17513806 - 17514010
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||  |||||||| || |   ||||||||||| ||||||  |   | |||| ||||||    
T  17513806 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttacc-aacgacctcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggg 17513904  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17513905 aaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcagtgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggt 17514004  T
Q  341 agtttg 346  Q
     |||||    
T  17514005 ggtttg 17514010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 10591143 - 10591349
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattg-tcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||  |   | |||| ||||||    
T  10591143 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttac-taacggtgccgtttggattgattacttatccgttgtgggaaaggg 10591241  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    || |||||||| ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10591242 gataacgaatgatttttgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattaactgattaagtgattatacaaattgggggt 10591341  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  10591342 ggtttgat 10591349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27351543 - 27351337
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||   | |||| ||||      
T  27351543 tctaaacatgaaaggaaataaaa-aaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatagtgtcgtttagatttgtcactcctccgttgtgggaaagaa 27351445  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||   || |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||    
T  27351444 gaaaatgactggtttatgcaaaaaagaaatgatttaggttattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtggttatacaaattggaggt 27351345  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  27351344 ggtttgat 27351337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 138336 - 138132
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgt-cgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaagggga 242  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||| | |  ||||| ||||||| ||   |||| | ||||||||    
T  138336 taaacaggaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggttttcacttggaatgtcactactacttcgtag-aaagggga 138238  T
Q  243 aaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtag 342  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |    
T  138237 aaacgaatggtttatgcggaaaaaaaataattgttgtgattatttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtgg 138138  T
Q  343 tttgat 348  Q
    ||||||    
T  138137 tttgat 138132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12661501 - 12661311
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  12661501 tctaaacatgaaaggaattaaaa--aaattaagtgaaaga--tgtgaaatttatctaacagtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 12661406  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12661405 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactggttaagtgattatacaaatt 12661311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29156384 - 29156178
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | | ||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||  |   | |||| ||||||    
T  29156384 tctaaacatgaaacaaaatacaaaaaaattaattgaaagagaggtagaatttac-taacggtatcgtttgaatttgtcacttatccgttgtgggaaaggg 29156286  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  29156285 gaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 29156186  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  29156185 ggtttgat 29156178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Original strand, 42291839 - 42291944
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatac 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42291839 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgattaagtgattatac 42291938  T
Q  330 aaattg 335  Q
    ||||||    
T  42291939 aaattg 42291944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 241 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20976080 - 20975973
Alignment:
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20976080 gaaaacgaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattggtggt 20975981  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  20975980 ggtttgat 20975973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 4734451 - 4734658
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaata-aaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||  ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||  |     |||| ||| |    
T  4734451 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggaaatg 4734549  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||  ||    
T  4734550 ggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgagtgatcaagggattatacaaattggtgg 4734649  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  4734650 tggtttgat 4734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 19099185 - 19099376
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||   | |||| ||  |     
T  19099185 tctaaacatgaaaagaattaaga-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcacttctcggttgtggaaagtga 19099281  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19099282 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaatt 19099376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40956465 - 40956314
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcatt 283  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  40956465 gtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttccattgtgggaaaggggaaaacgaatggtgtatgcaaaaaagaaatgattgttgtgatt 40956366  T
Q  284 ctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    |||| |||  ||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  40956365 cttttaatgaaatagtttttcaaattaaatgattaagtgattatacaaattg 40956314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 26377645 - 26377850
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| | |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   | |||  ||| ||    
T  26377645 tctaaacatgaaaggaattaaaa--atattaagtgaaagagatg--aaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctcagttgtgaaaaaagg 26377740  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||    
T  26377741 taaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttctcacattgactgaataagtgattatacaaattaggg 26377840  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    || |||||||    
T  26377841 gtggtttgat 26377850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33281868 - 33281677
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| | | ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||| |   | |||| ||| ||    
T  33281868 tctaaacatgaaacaaaatataaaaaaat-aagtgaaagagaggtgaaatttacttaacgatgtcgtttgaatttgtcactcatccgttgtgggaaaagg 33281770  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaat 333  Q
     ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33281769 aaaagcaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgggattctttcaatgaaataactttttaaattgactaattaagtgattatacaaat 33281677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 348
Target Start/End: Original strand, 36718535 - 36718643
Alignment:
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36718535 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaattatggttgtgattctttcaataaaataactttacaaattgactgattaaatgattatacaaattagggg 36718634  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  36718635 tggtttgat 36718643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5829484 - 5829373
Alignment:
Q  235 aaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5829484 aaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttt--aaattgactgattaagtgattatacaaatt 5829387  T
Q  335 gtgggtagtttgat 348  Q
    | || | |||||||    
T  5829386 gaggttggtttgat 5829373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 319
Target Start/End: Original strand, 3349687 - 3349776
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaa 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  3349687 gtgggaaaggggaaaacgaacggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 3349776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 931481 - 931381
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatac 329  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||     |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  931481 gtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgtgattctttc-----aatagctttctaaattgactgattaagtgattatac 931387  T
Q  330 aaattg 335  Q
    ||||||    
T  931386 aaattg 931381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16515696 - 16515596
Alignment:
Q  145 aaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaa 244  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| | |||||| |||    
T  16515696 aaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaaaagaggtgaaatttagctaatggtgtcatttggaatgtcactcctacatcgtagaaaagggaaaa 16515597  T
Q  245 a 245  Q
    |    
T  16515596 a 16515596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Original strand, 8379313 - 8379449
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | | |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| |   | ||||  |||||    
T  8379313 tctaaacatgaaacgaaaaaaaa-aatattaagtgaaagagaggtgaaatttacgcaacggtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtgg-gaaggg 8379410  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  8379411 gaaaacgaatggattatgcgaaaaagaaattattgttgt 8379449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26312181 - 26312029
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcc---tttatcgtggcaaa 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||   | | | |||| |||    
T  26312181 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctgatctgttgtggaaaa 26312085  T
Q  238 gggg-aaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaat 291  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26312084 ggggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaat 26312029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23069418 - 23069336
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcct 224  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23069418 tctaaatatgaaacgtaataaaa-aaaattaaatgaaagaaatgtgaaatttacctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcct 23069336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16515588 - 16515533
Alignment:
Q  272 attgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattat 327  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16515588 attgttgtgattctttcaataaaataatttttcaaattgattgattaagtgattat 16515533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37046974 - 37046894
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcct 224  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37046974 tctaaacatgaaa-gaaattaaaaaaaattaaatgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcct 37046894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27303377 - 27303188
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||| | |||||| ||    
T  27303377 taaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatggtgtcgtttgaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aa 27303280  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27303279 aacaaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattg 27303188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7767258 - 7767051
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||   || | | ||| |||||    
T  7767258 taaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaactgtgtcatttggaatgtcactcctacgtcttaggaaatgggaa 7767159  T
Q  244 aacgaatggtttatg---cgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    ||||||| |||||||    |||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  7767158 aacgaatagtttatgtgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggt 7767059  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  7767058 tgtttgat 7767051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46904934 - 46904730
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||| | |||||| ||    
T  46904934 taaacatgaaacaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaatgtcactcctacgtcgtaggaaagggaaa 46904835  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagt 343  Q
    ||  || ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  46904834 aataaaaggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggt 46904735  T
Q  344 ttgat 348  Q
    |||||    
T  46904734 ttgat 46904730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54430747 - 54430540
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtc-gtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||    
T  54430747 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaa--aaggtgaaatttatctaacggtatccgtttggatttgtcactcgtttgttgtggaaaagg 54430650  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  54430649 gtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgcaattcttttaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggg 54430550  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    || |||||||    
T  54430549 gtggtttgat 54430540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Original strand, 29387643 - 29387830
Alignment:
Q  161 aaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgc 259  Q
    |||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  29387643 aaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactcctctattgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgc 29387740  T
Q  260 gaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  29387741 gaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 29387830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18408384 - 18408179
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||||    
T  18408384 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatcaaacggtgtcgtttggatttgtcactgctctgttgtggaaaaggg 18408288  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaa-tgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  18408287 taaaacgaattgtttatgcgaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatggattagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 18408188  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  18408187 tggtttgat 18408179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24252814 - 24252608
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| | | | |||| ||||||    
T  24252814 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggggtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaaggg 24252717  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  24252716 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcactgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaaggg 24252617  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  24252616 tggtttgat 24252608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 28132607 - 28132797
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttgga-ttgtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||| | | |||| ||| ||    
T  28132607 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggcgtcgtttgaacttgtcactcctctgttgtggaaaatgg 28132703  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28132704 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 28132797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Original strand, 42009156 - 42009338
Alignment:
Q  166 aaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaa 265  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||||| |||| | | ||||||||| |||||||| |   |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42009156 aaaactaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacgatttcgtttggaatgtcactcttacgtcgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaa 42009255  T
Q  266 caaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
     |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  42009256 gaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgat 42009338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 348
Target Start/End: Original strand, 21784656 - 21784860
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagggga 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||| |    
T  21784656 taaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggta 21784752  T
Q  243 aaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  21784753 aaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattaactgattaagtgattatacaaattaggggt 21784852  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  21784853 ggtttgat 21784860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8364366 - 8364160
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| | | |||| ||||||    
T  8364366 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aacattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtctctcctctgttgtggaaaaggg 8364270  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
     ||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  8364269 taaaacaaatggtttgtgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggg 8364170  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    || |||||||    
T  8364169 gtggtttgat 8364160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 348
Target Start/End: Original strand, 50677187 - 50677390
Alignment:
Q  145 aaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaa 244  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||   |||||||| | |  ||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  50677187 aaacatgaaataaaacaaaataaagcaaagtgaaagagagatgaaatttatctaacagtttcgtttggaatgtcactcctacatcgtaggaaaggggaaa 50677286  T
Q  245 acgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtt 344  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||    
T  50677287 acgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattgtttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtt 50677386  T
Q  345 tgat 348  Q
    ||||    
T  50677387 tgat 50677390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 51939426 - 51939632
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||||    
T  51939426 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttaaccaactgtgtcgtttggatttgtcacttctatgttgtggaaaaggg 51939522  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa--aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
     ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  51939523 taaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggg 51939622  T
Q  339 gtagtttgat 348  Q
    || |||||||    
T  51939623 gtggtttgat 51939632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 52654993 - 52655185
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  52654993 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaataagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctatgttgtggaaaaggg 52655090  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52655091 taaaacgaatggtttatgcgaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 52655185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 334
Target Start/End: Original strand, 25598976 - 25599148
Alignment:
Q  161 aaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgc 259  Q
    |||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25598976 aaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgc 25599073  T
Q  260 gaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||| || | ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25599074 gaagaaaacatgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatataaatt 25599148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 348
Target Start/End: Original strand, 36538119 - 36538262
Alignment:
Q  205 tcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttc 304  Q
    |||||| || ||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||||    
T  36538119 tcgtttagaatgtcactcctgcttcgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttc 36538218  T
Q  305 aaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  36538219 aaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgat 36538262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6715633 - 6715457
Alignment:
Q  141 atctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||| |    
T  6715633 atctaaacatggaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatataatggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaag 6715537  T
Q  240 gg-aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgatta 318  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  6715536 ggtaaaacgaatggtttatgcgaaaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaataactttcaaaattgactgatta 6715457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 1254925 - 1255112
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaagggg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | | ||||||| ||||||| ||||| || | ||||  |||||  ||   | || |||||||    
T  1254925 tctaaacatgaaacgaaataaaaagaaattaagcgaaaaagaggtgaaatctacctaacggtgttgtctagatttgcactctgtt---gcgggaaagggg 1255021  T
Q  242 aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1255022 aaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaattattgttg--attctttcaatgaaataactttctaaattgaccgattaagtcattatacaaatt 1255112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 46791568 - 46791759
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  46791568 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 46791664  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
      ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46791665 tcaagtgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 46791759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13401653 - 13401461
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |   |||||||||| || | ||||||||||| ||| | ||||||| | | |||| ||||||    
T  13401653 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaattgaaagag--gtgaaatttatcttacggtgtcgtttgaatttggcactcctctgttgtggaaaaggg 13401557  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcg--aaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13401556 taaaacaaatggtttatgcgggaaaaaaaaatgattgttgtgattcttccaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 13401461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 41706923 - 41707131
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||     |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||||    
T  41706923 tctaaacatgaaaagaattaaaa-aaaattaagtgaaaggg--gtgaaatttatctaacgttgtcgtttggatttgtcactcctctggtgtgaaaaaggg 41707019  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa----aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgt 336  Q
     ||| |||||||||||||||||    ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||      
T  41707020 taaagcgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatgcaaattag 41707119  T
Q  337 gggtagtttgat 348  Q
    |||| |||||||    
T  41707120 gggtggtttgat 41707131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 23164443 - 23164648
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||| ||    
T  23164443 tctaaatatgaaaagaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaagg 23164539  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||   || |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  23164540 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgattgattaagtgattatacaaattagggg 23164639  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  23164640 tggtttgat 23164648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 40152002 - 40152193
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggat-tgtcactcctttatcgtggcaaagggga 242  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||   | |||| ||||||||    
T  40152002 taaatatgaaacgaaataaaa-aaaattaaatgaaagagaggtgaaatttacctaaaggtgttgtttggatgtatcattcctccgttgtgggaaagggga 40152100  T
Q  243 aaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattc-tttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    || | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| |||  ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40152101 aa-caaatggtttatgcgcaaaagaaatgattgttgtgattcgttttaatgaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattg 40152193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 51147129 - 51146949
Alignment:
Q  144 taaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgtcactcctttatcgtggcaaaggggaa 243  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| | |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||| | |||||| ||    
T  51147129 taaacacgaaacaaaacaaaataaaatgaagtgaaagagagataaaatttacctaacggtgtcgtttggaatgtcacttctatgtcgtagaaaaggg-aa 51147031  T
Q  244 aacgaatggtttatgcgaaa-aacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgat 324  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  51147030 aacgaatggtttatgcgagagaaaaaataattgttgtgattctttcaataaaatagttttttaaattgactgattaagtgat 51146949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 48626996 - 48627092
Alignment:
Q  239 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48626996 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattg 48627092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 27729640 - 27729845
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| || | | |||  ||||||    
T  27729640 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacagtgtcgtttggatttgtcacttctatgttgtgaaaaaggg 27729736  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaaca-aatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| ||  |||  |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||    
T  27729737 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcgatcaaattgctttccaaattgattgattatgtgattatacaaattagggg 27729836  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  27729837 tggtttgat 27729845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Original strand, 23067635 - 23067801
Alignment:
Q  185 gtgaaatttacctaatggtgtcgtttggattgt-cactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaa-aacaaatgattgt-tgtca 281  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||| | | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  || |||||||||| ||| |    
T  23067635 gtgaaatttatctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaattaaaaaatgattgtgtgtga 23067734  T
Q  282 ttctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggtagtttgat 348  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23067735 ttctttaaatgaaataacttttcaaattgactggtgaagtgattatacaaattaggggtggtttgat 23067801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15987322 - 15987207
Alignment:
Q  214 ttgtcactcctttatcgtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgact 313  Q
    |||||||||||   | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||  ||||||| |    
T  15987322 ttgtcactcctccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgatagttgtaattcttttaatgaaataactttcgaaattgaat 15987223  T
Q  314 gattaaatgattatac 329  Q
    |||||| |||||||||    
T  15987222 gattaagtgattatac 15987207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21596528 - 21596323
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||||||||  | ||||||||  || |||||||||  || |||| ||||||    
T  21596528 tctaaacatgaaatgtaataaaa-agaattaaatgaaagaaaaatgaaatttacctaacagcgtcgtttgattttgtcactcctccattgtgg-aaaggg 21596431  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
     ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||  |||  |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  21596430 aaaaacaaatggtttgagcaaaaaataaatgattgttgtgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgactgattaagtgattatacaaattgggagt 21596331  T
Q  341 agtttgat 348  Q
     |||||||    
T  21596330 ggtttgat 21596323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20762243 - 20762052
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||||||   || ||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  20762243 tctaaatatgaaatgaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttattcaacggtatcgtttgtatttgtcactcctctattgtggaaaaggg 20762146  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcga-aaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaat 333  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||   || |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  20762145 taaaacgaatggtttatgcgacgaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaatagacttccaaattaactgatcaagtgattatacaaat 20762052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Original strand, 27110743 - 27110879
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  27110743 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaaggg 27110839  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgt 279  Q
     |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  27110840 taaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaatgattgttgt 27110879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 43905723 - 43905919
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||  ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||  |     |||| ||||||    
T  43905723 tctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggaaaggg 43905821  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgggt 340  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||           |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  43905822 aaaaatgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtg----------tgaaataacttttcaaattgactgattgagtgattatacaaattgagggt 43905911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Original strand, 19965838 - 19965943
Alignment:
Q  230 gtggcaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgtt-gtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattata 328  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||| |||  |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  19965838 gtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgggaaa-aaatgattgtttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaatttaactaattaagtgattata 19965936  T
Q  329 caaattg 335  Q
    |||||||    
T  19965937 caaattg 19965943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Original strand, 1649798 - 1649899
Alignment:
Q  239 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 338  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || |||||||||  |  |||||| |  ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1649798 gggaaaacaaatggcttatgcaaaaaagaattgattgttgcgaagctttcagtgaaatagattttcaaattgaatgattaagtgattatacaaattgggg 1649897  T
Q  339 gt 340  Q
    ||    
T  1649898 gt 1649899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15998476 - 15998415
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgt 205  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  15998476 tctaaacatgaaacgaaacagaa--aaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggtgt 15998415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Original strand, 19965748 - 19965804
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  19965748 tctaaacatgaaaggaaataaaa-aaaaataagtgaaagagaggtgaaatttacctaa 19965804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16903 - 16698
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| | | |||| ||||||    
T  16903 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgttactcctctgttgtggaaaaggg 16807  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaa-atgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
     ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  16806 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgatcgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 16707  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  16706 tggtttgat 16698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1255 - 1086
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  1255 tctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaaatgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaaggg 1158  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattga 311  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  1157 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattga 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 348
Target Start/End: Original strand, 46044 - 46249
Alignment:
Q  141 atctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaagg 239  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| | | |||  ||||     
T  46044 atctaaatatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaacag--gtgaaatttagccaacggtgtcgtttggatttgtcactcctcttt-gtgaaaaaga 46140  T
Q  240 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattgtggg 339  Q
    | ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||  ||||   || |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  46141 gtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaatgattgttgtgattatttcaatgaaatagacttccaaattgactgattaagtgattatccaaattatggg 46240  T
Q  340 tagtttgat 348  Q
    | |||||||    
T  46241 tggtttgat 46249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 17004 - 17194
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |   |||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||| |||| | |||| ||| ||    
T  17004 tctaaacatgaaaggaattaaaa--aaattaagtgaaagag--gtgaaatttatccaacggtgtcgtttgaatttgtcacttctttgttgtggaaaatgg 17099  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaa-tgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 334  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17100 taaaacgaatggtttatgcgaagaagaaaatgattgttgtgattctttcaacgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 17194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Original strand, 22676 - 22824
Alignment:
Q  142 tctaaacatgaaacgaaataaaataaaattaagtgaaacaaatgtgaaatttacctaatggtgtcgtttggatt-gtcactcctttatcgtggcaaaggg 240  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||    
T  22676 tctaaacatgaaaggaattaaaa-aaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctatgttgtggaaaaggg 22772  T
Q  241 gaaaacgaatggtttatgcgaa-aaacaaatgattgttgtcattctttcaat 291  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  22773 taaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattattgtgattctttcaat 22824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 348
Target Start/End: Original strand, 8359 - 8471
Alignment:
Q  238 ggggaaaacgaatggtttatgcg--aaaaacaaatgattgttgtcattctttcaattgaataacttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 335  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||| |||| ||| |||| |||||||||||  ||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8359 ggggaaaacgaatggtttgtgtggaaaaaaaaaataatttttgtgattctttcaatgaaatagttttcgaaattgactgattaattgattatacaaatta 8458  T
Q  336 tgggtagtttgat 348  Q
    ||||| |||||||    
T  8459 tgggtggtttgat 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University