View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1858_low_47 (Length: 287)
Name: NF1858_low_47
Description: NF1858
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1858_low_47 |
 |  |
|
| [»] scaffold0006 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0662 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0702 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0238 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1480 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0069 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3572792 - 3572560
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572792 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
3572693 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3572692 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
3572593 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagt |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3572592 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttagt |
3572560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20260313 - 20260086
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260313 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
20260214 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260213 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccaggaatca |
20260114 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20260113 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
20260086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 46666553 - 46666783
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666553 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
46666652 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
46666653 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
46666752 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46666753 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
46666783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 2430341 - 2430569
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430341 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataagtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
2430440 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2430441 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
2430540 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2430541 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
2430569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 9115682 - 9115910
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115682 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
9115781 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9115782 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
9115881 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115882 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
9115910 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 25789608 - 25789834
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25789608 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
25789707 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25789708 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
25789807 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25789808 |
acaattataacttgaaacaaacacacc |
25789834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 39329453 - 39329681
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
39329453 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcatgggaaatt |
39329552 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39329553 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
39329652 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39329653 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
39329681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 52630618 - 52630846
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
52630618 |
cctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttctttgagaaatt |
52630717 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52630718 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccaggaatca |
52630817 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52630818 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
52630846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 14788568 - 14788795
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14788568 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
14788667 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14788668 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaatataatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctattattttattcccgggaatca |
14788767 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14788768 |
aaaattataacttgaaacaaacacaccc |
14788795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9832097 - 9831867
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9832097 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaaat |
9831998 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9831997 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctgggaatca |
9831898 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9831897 |
acaattataacttgaaacaaacacacactta |
9831867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12190401 - 12190175
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12190401 |
aggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttt |
12190302 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12190301 |
tctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatgtacattcctatcattttattcccgaaaatcaaca |
12190202 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12190201 |
attataacttgaaacaaacacaccctt |
12190175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Original strand, 2632699 - 2632927
Alignment:
| Q |
22 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2632699 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttatt-ccaccattttccttgggaaattt |
2632797 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
2632798 |
tttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctattattttattcccgggaatcaa |
2632897 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2632898 |
caattataacttgaaacaaacacaccctta |
2632927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51445306 - 51445083
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51445306 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
51445207 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatac-ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
51445206 |
ttttctattcccaggaacattttatactaagaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacatttatatcattttattcccgggaatcaa |
51445107 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51445106 |
caattataacttgaaacaaacaca |
51445083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 39930302 - 39930529
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
39930302 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttggaaattt |
39930401 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39930402 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
39930501 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39930502 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
39930529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1597567 - 1597341
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
1597567 |
taggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttcttggaaaaattt |
1597468 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
1597467 |
ttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggaaatcaac |
1597368 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1597367 |
aattataacttgaaacaaacacaccct |
1597341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 32824766 - 32824992
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcc-ttgggaaat |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32824766 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttcctttgggaaat |
32824865 |
T |
 |
| Q |
120 |
tttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||| |
|
|
| T |
32824866 |
tttttctattcccaggaacaatttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctattattttatttccggaaatc |
32824965 |
T |
 |
| Q |
212 |
aacaattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32824966 |
aacaattataacttgaaacaaacacac |
32824992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 8331859 - 8332087
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
8331859 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgaaatttt |
8331958 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
8331959 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgcaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccggaaatca |
8332058 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8332059 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
8332087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 36361628 - 36361851
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36361628 |
cctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttactctcatctccatgggaactttattccc-cccttttccttgggaaatt |
36361726 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36361727 |
ttttctattcctaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
36361826 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36361827 |
acaattataacttgaaacaaacaca |
36361851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 43 - 243
Target Start/End: Original strand, 47037324 - 47037532
Alignment:
| Q |
43 |
attataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattt |
142 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47037324 |
attataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattt |
47037423 |
T |
 |
| Q |
143 |
tatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaac |
234 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47037424 |
tataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaac |
47037523 |
T |
 |
| Q |
235 |
acaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
47037524 |
acaccctta |
47037532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Original strand, 6911330 - 6911569
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6911330 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
6911429 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaa--------cattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattccc |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6911430 |
ttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcttatcattttattccc |
6911529 |
T |
 |
| Q |
205 |
aggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6911530 |
gagaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccttag |
6911569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5518730 - 5518499
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
5518730 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ctatatataaatttattctcatctccatgggaactttattcccacctttttccttgggaaaat |
5518632 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5518631 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcctgggaatca |
5518532 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagt |
245 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5518531 |
acaaatataacttgaaacaaacacacccttagt |
5518499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 6978615 - 6978843
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6978615 |
cctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaatt |
6978714 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatac--ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6978715 |
ttttctattccctgaaacattttatacgaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
6978814 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6978815 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
6978843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4683598 - 4683371
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4683598 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattccc-cccttttttttgggaaatttt |
4683500 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4683499 |
ttctattcctaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaatttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatttctgggaatcaac |
4683400 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4683399 |
aattataaattgaaacaaagacaccctta |
4683371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38964900 - 38964677
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38964900 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattccaatctccatgggaactttattcccaccctttctcttgggaaattttttct |
38964801 |
T |
 |
| Q |
127 |
attcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaacaatt |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38964800 |
attcccaggaacattttataccaaggaataaatttttgtaaacttgtaacaaacataagcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaatt |
38964701 |
T |
 |
| Q |
219 |
ataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38964700 |
ataacttgaaacaaacaccccctt |
38964677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 35187301 - 35187530
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35187301 |
cctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaacttattcttatctccatgggaactttattcccacccttctccttgggaaatt |
35187400 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaac------aaacataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35187401 |
ttttctattcccacgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
35187500 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35187501 |
acaattataacttgaaaaaaacacaccctt |
35187530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50190991 - 50190762
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
50190991 |
cctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcc-atcttcatgggaactttattcccacctttttccttgggaaatt |
50190893 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || | ||| | |
|
|
| T |
50190892 |
ttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtaggcatatacattcctagcattttatttccggaaatta |
50190793 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
50190792 |
acaattatatcttgaaacaaacacactctta |
50190762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5806503 - 5806285
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
5806503 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcc-----------ttggaaaatt |
5806415 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaa--cataggcattcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5806414 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaaggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaa |
5806315 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacacccttagtt |
246 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5806314 |
ttataacttgaaacaaacacacccttagtt |
5806285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48916248 - 48916019
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
48916248 |
cctagaaaccataaaaatagggattataataggcaa-ctacatatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccatccttatctttgggaaatt |
48916150 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
48916149 |
ttttctattcccatgaacattttatacccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattctctggaatca |
48916050 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48916049 |
acaaatataacttgaaataaacacaccctta |
48916019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32202540 - 32202327
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32202540 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
32202441 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcattcctatcattttattcccaggaatcaacaatt |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
32202440 |
ttttctattcccataaacattttataccaaggattaaattttagt------------agcatatacatttctatcattttattttcgggaatcaacaatt |
32202353 |
T |
 |
| Q |
219 |
ataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32202352 |
ataacttgaaacaaacacacccttag |
32202327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 13653697 - 13653917
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13653697 |
cctaggaaccataaaattagggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgggaaatt |
13653795 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaa------acataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13653796 |
ttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcattttattctcaggaatca |
13653895 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaac |
234 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13653896 |
acaaatttaacttgaaacaaac |
13653917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52699688 - 52699465
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |
|
|
| T |
52699688 |
ggaaccatgaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaaaaatgtt |
52699590 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
52699589 |
ctattcccaggaacgttttatacccgggaataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatgtgtattcctatcattttattcccaggaatctacga |
52699490 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
52699489 |
atataacttgaaacaaacgcaccct |
52699465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49823123 - 49822916
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49823123 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattatcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
49823024 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49823023 |
ttttctattctcag-------------------aaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgagaatcaac |
49822943 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49822942 |
aattataacttgaaacaaacacaccct |
49822916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37436844 - 37436630
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
37436844 |
taggaaccataaaaataaggattataatagataa-ctatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcacccttttctttgggaaa-att |
37436747 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
37436746 |
ttctattctcagtaacattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatacattcctatcattttattctcgtgaatcaac |
37436647 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaaca |
231 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
37436646 |
aaatataacatgaaaca |
37436630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Original strand, 29091518 - 29091741
Alignment:
| Q |
22 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29091518 |
ctaggaaccataaaaatagggtttataataggtaa-ctatgtgtaaatttattc-----tccatgggaactttattcccacctttttttttgggaaattt |
29091611 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29091612 |
tttctattccgatgaacattttttactcgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttttatcattttattatcaggaatcaa |
29091711 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29091712 |
caaatataacttgaaacaaacacaccctta |
29091741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 46960528 - 46960639
Alignment:
| Q |
77 |
catctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaac |
174 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46960528 |
catcttcatgggaactttattcccacccttttcattgggaaaacttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaac |
46960627 |
T |
 |
| Q |
175 |
aaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
46960628 |
aaacataggcat |
46960639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 30240856 - 30241075
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |
|
|
| T |
30240856 |
cctaagaaccataaaagtagggattataataggtaat-tacatataaatttattctcatcttcatgagaactttattctcactcttttctttgggaattt |
30240954 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
30240955 |
ttttctattcccaataactttttattccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattaccaaaaatcaa |
30241054 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaac |
234 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30241055 |
caaatataacttgaaacaaac |
30241075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Original strand, 1007663 - 1007819
Alignment:
| Q |
92 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc----- |
184 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
1007663 |
tttattctcaccctttttcttggtaaaatttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacctagacatata |
1007762 |
T |
 |
| Q |
185 |
-attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1007763 |
tattcatatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccc |
1007819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17475502 - 17475386
Alignment:
| Q |
67 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagta |
164 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17475502 |
aatttactcccatctctattggaactttattcccactcttttctttgggaaattttatttattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagta |
17475403 |
T |
 |
| Q |
165 |
aacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17475402 |
aacttataacaaacata |
17475386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11014626 - 11014448
Alignment:
| Q |
63 |
tatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaattt |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
11014626 |
tatgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccacccttttcttttgaaatttttttctattcccagaaacattttatatccgtgaatataattt |
11014527 |
T |
 |
| Q |
161 |
agtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaa |
233 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11014526 |
attaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattcccaggaatctacatatataacttgaaacaaa |
11014448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19083285 - 19083104
Alignment:
| Q |
68 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaa |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19083285 |
atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
19083186 |
T |
 |
| Q |
166 |
acttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19083185 |
acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacaccct |
19083104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19131173 - 19130992
Alignment:
| Q |
68 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaa |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19131173 |
atttattctcatatgcctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctatttccaggaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
19131074 |
T |
 |
| Q |
166 |
acttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19131073 |
acttataacaaacatagacatgtatatttctatcattgtattcccaaaaatctacgaatataatttgaaacaaacacaccct |
19130992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24116555 - 24116338
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |||| | |
|
|
| T |
24116555 |
aaccataaaaataggaattataataggtaat-tacacataaatatattctcatcttcatgggagctttattccctcccttttctttgggaattctttttt |
24116457 |
T |
 |
| Q |
127 |
attcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc----attcctatcattttattcccaggaatcaacaattat |
220 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
24116456 |
atttacaggaacgttttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataaacatatatttctatcgttttattctcaggaatctacaaatat |
24116357 |
T |
 |
| Q |
221 |
aagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24116356 |
aacctgaaacaaacacacc |
24116338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31806938 - 31806759
Alignment:
| Q |
64 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacatttta--tacccgaataaaattta |
161 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
31806938 |
atgaatttgttctcatcttcatgggaactttatttccacccttttatttgggaatttttttctattcccaggaacgttttatgttcgagaataaaattta |
31806839 |
T |
 |
| Q |
162 |
gtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31806838 |
gtaaac--gtaacaaacataagcatgtatatttctatcattttattctcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacaca |
31806759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Original strand, 13521213 - 13521326
Alignment:
| Q |
68 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaa |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13521213 |
atttattctcatctttctggaaactttatttccacccttttctttgggaaattttttctattcccaagaacattttatactcgtgaataaaatttagtaa |
13521312 |
T |
 |
| Q |
166 |
acttgtaacaaaca |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
13521313 |
acttgtaacaaaca |
13521326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13932048 - 13931885
Alignment:
| Q |
83 |
catgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
180 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13932048 |
catgggaaatttattcccacccttttctttaggaaaacatttctattcc-aggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
13931950 |
T |
 |
| Q |
181 |
aggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
13931949 |
aggcatatgtatttttatgattttattcctaggaatctacaaatataacttcaaacaaacacacc |
13931885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1228101 - 1227938
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |
|
|
| T |
1228101 |
aggaaccttaaaaatagggattataataggtaat-tctacataattttattctaatcttcatgggaactttattcccgaccttttctttcggaaatcttt |
1228003 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1228002 |
tctattccaagaaacattttatacctgaaaataaaatttaataaacttgtaacaagcataggcat |
1227938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38519281 - 38519122
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac-ccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
38519281 |
aaccataaaaatagggattataataggtaatttatacatgaattt-ttcctaatttcatgggaactttattcccaaaccttttctttgggaaaatttttc |
38519183 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38519182 |
t--tcccaaaaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcat |
38519122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 47677492 - 47677648
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
47677492 |
aggaaccttaaaaatagggattataatatgtaat-tacacataattttattcccatcttcatgggaactttattcccatcctttcctttgggaaaacttt |
47677590 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaaca |
179 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
47677591 |
tctattcaatggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaatttataacaaaca |
47677648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 48462378 - 48462475
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
48462378 |
taggaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttattcccaattccatgggaactttatacccatcctttt-cttcggaaatttt |
48462475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Original strand, 13440281 - 13440408
Alignment:
| Q |
63 |
tatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggga-aattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
13440281 |
tatgaatttattctcatcttcatggaaactttatttccacccttttctttggaatttttttttctattctcaggaacattttatactcgtgaataaaatt |
13440380 |
T |
 |
| Q |
160 |
tagtaaacttgtaacaaacataggcatt |
187 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13440381 |
tagtaaaattctaacaaacatagtcatt |
13440408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 47031704 - 47031758
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc |
75 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47031704 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc |
47031758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9011374 - 9011167
Alignment:
| Q |
34 |
aaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattccca |
133 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
9011374 |
aaaataagaattataatagg-aaattactcatgaatttattcccaccactatgggaactttattccgacccttttctttgggaaaaattttcgattctca |
9011276 |
T |
 |
| Q |
134 |
-ggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagtt |
225 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| || | ||||| || |
|
|
| T |
9011275 |
cgaaaccttttataccgaaaataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatgtatattcctatcattttattttcaagaatctacgaatataactt |
9011176 |
T |
 |
| Q |
226 |
gaaacaaac |
234 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
9011175 |
gaaacaaac |
9011167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20505213 - 20504990
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| ||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
20505213 |
gaaccataaaaatagggattataatatgtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaagctttattttcacctttttctttggtaatttttttt |
20505115 |
T |
 |
| Q |
126 |
t---attcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||| || |
|
|
| T |
20505114 |
tcttattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtatatttctatcattttattctcagaaatctac |
20505015 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
20505014 |
aaatataatttaaaacaaacgcacc |
20504990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 239
Target Start/End: Original strand, 29769399 - 29769579
Alignment:
| Q |
64 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccc-ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaattt |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
29769399 |
atgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccctttttctttaggaaaattgttctattgccaggaacattttatgtcaaagaataaaattt |
29769498 |
T |
 |
| Q |
161 |
agtaaacttgtaacaaacataggc--attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| | || |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29769499 |
agtaattttgtaacaaacatagacatatttctatcattattttttcaggaatcaatgaatataacttgaaacaaacgcacc |
29769579 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Original strand, 52276877 - 52276930
Alignment:
| Q |
133 |
aggaacattttatacccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
52276877 |
aggaacattttatatccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcat |
52276930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 186
Target Start/End: Original strand, 37261734 - 37261859
Alignment:
| Q |
63 |
tatgaatttattcccatctccatgggaacttt-attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccg-aataaaattt |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| | || ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
37261734 |
tatgaatttattcatatcttcgtgagaacttttattctcaaccttttttttgggaaattttttctattcccaaaaagattttatgtcgggaataaaattt |
37261833 |
T |
 |
| Q |
161 |
agtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37261834 |
aataaacttgtaacaaacatatgcat |
37261859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 1007618 - 1007669
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattc |
75 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1007618 |
taggaaccataaaaatatggattataataggt-aactatttatgaatttattc |
1007669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52186172 - 52186049
Alignment:
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
52186172 |
tttctattcccagaaacattttatcgtcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatatatttctatcattttattataagaaatcaa |
52186073 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52186072 |
caaatataacttgaaacaaacaca |
52186049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37336664 - 37336514
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | || |||||||||||||| || ||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
37336664 |
aaccataaaaatagagattataataggtaat-tatacatgaatttattctctccttcgtgaaaactttattcccactctattctttggaaagaaatttct |
37336566 |
T |
 |
| Q |
127 |
attcccaggaacattttatacccga--ataaaatttagtaaacttgtaacaa |
176 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37336565 |
attcccaataatattttatatctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaa |
37336514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 52186249 - 52186170
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttt |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52186249 |
aaccataaaaatagaaattataataggtaa-ctatgtagaaatttattcacatctcaatgtgaacttaattcccacccttt |
52186170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Original strand, 3939356 - 3939455
Alignment:
| Q |
32 |
taaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcc |
131 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3939356 |
taaaaatatagattataataggtaacc-atgtatgaatttattctcatcttaatggaaacttgattcctacactttt-ctttggaatttttttctattcc |
3939453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33702524 - 33702410
Alignment:
| Q |
67 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc---gaataaaatttagt |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| | || |||| || ||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
33702524 |
aatttattctcatcgtcatgggaattttattctcacctttttattcgggaaattttttctattccctgaaaaatttaattccccaaaaataaaatttaat |
33702425 |
T |
 |
| Q |
164 |
aaacttgtaacaaac |
178 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33702424 |
aaatttgtaacaaac |
33702410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 186
Target Start/End: Original strand, 3939516 - 3939552
Alignment:
| Q |
150 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3939516 |
gaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataagcat |
3939552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4765787 - 4765556
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765787 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
4765688 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4765687 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
4765588 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4765587 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttag |
4765556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19065732 - 19065504
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065732 |
cctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
19065633 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19065632 |
ttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
19065533 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19065532 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
19065504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Original strand, 18412053 - 18412284
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412053 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacctttttccttgggaaatt |
18412152 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412153 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccaggaatca |
18412252 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18412253 |
ataattataacttgaaacaaacacacccttag |
18412284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11855882 - 11855658
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855882 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
11855783 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11855782 |
ttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattctcaggaatca |
11855683 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11855682 |
acaattataacttgaaacaaacaca |
11855658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29543242 - 29543011
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
29543242 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttttcatgggaaatt |
29543143 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543142 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccaggaatca |
29543043 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29543042 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttag |
29543011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12970755 - 12970527
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12970755 |
taggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttccttaagaaatttt |
12970656 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12970655 |
ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaac |
12970556 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12970555 |
aattataacttgaaacaaacacaccctta |
12970527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22936139 - 22935911
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22936139 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
22936040 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22936039 |
ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
22935940 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22935939 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
22935911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14207048 - 14206818
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14207048 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
14206949 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
14206948 |
ttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccggaaatca |
14206849 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14206848 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
14206818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 28602400 - 28602627
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28602400 |
cctaggaaccatacaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
28602499 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28602500 |
ttttctattctcagaaacattttataccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatcaa |
28602599 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28602600 |
caattataacttgaaacaaacacaccct |
28602627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 555933 - 555703
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
555933 |
cctaggaaccatcaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
555834 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
555833 |
ttttctattccctggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
555734 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
555733 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
555703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8646618 - 8646412
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8646618 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
8646519 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8646518 |
ttttctattcccaggaacattttataaccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
8646419 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaatta |
219 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
8646418 |
acaatta |
8646412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 36703718 - 36703945
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36703718 |
cctaggaaccatcaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
36703817 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36703818 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgataatca |
36703917 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703918 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
36703945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 8406741 - 8406959
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8406741 |
aggaaccaaaaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttt |
8406840 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
8406841 |
tctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatataggcatgtacattcctatcattttattctcgaaaatcaaca |
8406940 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaac |
234 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8406941 |
attataacttgaaacaaac |
8406959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 27481201 - 27481430
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27481201 |
cctaggaaccataaaaatagagattataatatgtaaactatttatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaata |
27481300 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
27481301 |
ttttttattctcaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttatttccaaaaatca |
27481400 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27481401 |
aaaattataacttgaaacaaacacaccctt |
27481430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 6091559 - 6091782
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
6091559 |
cctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccactcttttccttgggaaaat |
6091658 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6091659 |
ttttctattcccaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttatatcattttattcccgggaatca |
6091758 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6091759 |
acaattataacttgaaacaaacac |
6091782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 32535784 - 32536006
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32535784 |
aggaaccataaaaataggggttataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttaggaaattttt |
32535883 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaac------aaacataggcattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32535884 |
tctattcccaataacattttataccaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttattcctgggaatcaaca |
32535983 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
32535984 |
attataacttaaaacaaacacac |
32536006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42012401 - 42012178
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42012401 |
ggaaccataaaaatatggattataataggtaa-ctatataagaatttattctgatctccatgtgaactttattcccacccttttccttcggaaatttttt |
42012303 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42012302 |
ctattcctaggaacattttatactcgagaataaaatttagtaaatttgtaacaaacatagacatatgtatttctatcattttattcccgagaatcaacaa |
42012203 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
42012202 |
atatagcttcaaacaaacacaccct |
42012178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 20962439 - 20962659
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20962439 |
ggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcattaatttattctcatctccatgagaactttactcccacccttttccttgggaaaaatttt |
20962537 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
20962538 |
ctattcccagaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcacgtgtattcctatcattttattcccaagaatctacga |
20962637 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20962638 |
atataacttgaaacaaacacac |
20962659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Original strand, 27480860 - 27481069
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
27480860 |
gaaccataaaaatagaaattataataggtag-ctatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattctca-ccttttccttggaaaaaattttc |
27480957 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
27480958 |
tattcccatgaacattttatacacaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatacatattcctatcattttattctcaaaaatcaacaaa |
27481057 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataagttgaaa |
229 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |
|
|
| T |
27481058 |
tataacttgaaa |
27481069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35348746 - 35348590
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
35348746 |
ggaaccataaaaatatgaattataataggtaat-tacatgtgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaa-atttt |
35348649 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc-gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35348648 |
ctattcccaaaaacattttatacccaaaatacaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
35348590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 186
Target Start/End: Original strand, 1664580 - 1664741
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
1664580 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaa-ctacatataaatttattctcatctccatgggaatttaattcccacccgtttctttgggaaaaaatttc |
1664678 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1664679 |
tattctcaggaacattttatagctggtaataaaatttagtcaatttgtaacaaacataagcat |
1664741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43347118 - 43346895
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
43347118 |
aggaaccttaaaaatagggattaaaataggtaat-tacgcataattttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttcattggaaaaacttt |
43347020 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaa------acataggcattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
43347019 |
tctattgccagaaacaatttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacatacatatgtatttttatgattttattttcaggaatctaca |
43346920 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43346919 |
aatataacttgaaacaaacacaccc |
43346895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31583284 - 31583126
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
31583284 |
aggaaccgtaaaaatagggattataataggtact-tacatatgaatt-atttccatctttgtgggaactttattcccacctttttctttggaaaattttt |
31583187 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31583186 |
tctattcctgggaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
31583126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 6930502 - 6930714
Alignment:
| Q |
37 |
atagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagga |
136 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
6930502 |
atagagattataatagataa-ctagatataaatttatttccatcttcatgggaactttattcccacaattttctttgggaaa-tttttctattcccaata |
6930599 |
T |
 |
| Q |
137 |
acattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc----------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagt |
224 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
6930600 |
atattttatatccgaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatatatttctatcattttattctcaggaatcaacaaatataact |
6930699 |
T |
 |
| Q |
225 |
tgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6930700 |
tgaaataaacacacc |
6930714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40275934 - 40275819
Alignment:
| Q |
69 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaa |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40275934 |
tttattcccatcttcatgggaactttattcccatcattttctttgggaaaacttttctattcccaggaatatttcatatctgggaataaaatttagcaaa |
40275835 |
T |
 |
| Q |
167 |
cttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
40275834 |
cttgtaacaaacatag |
40275819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Original strand, 17251662 - 17251818
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17251662 |
gaaccataaaaatagggattataatatatagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccatcattttctttgggaaattttttc |
17251760 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
17251761 |
tattatcatgaacattttatactcgagaataaaatttagtaaaattataacaaacata |
17251818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19089889 - 19089782
Alignment:
| Q |
76 |
ccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaa |
173 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
19089889 |
ccatcttcatgagaactttatacccatcattttctttgggaaattttttctattcccaaaaacgttttatactcaagaataaaatttaataaacttataa |
19089790 |
T |
 |
| Q |
174 |
caaacata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
19089789 |
caaacata |
19089782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 186
Target Start/End: Original strand, 30899470 - 30899566
Alignment:
| Q |
92 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
30899470 |
tttattctcacccttttctttggaaaattgtttctattcccaagaatattttatatccaggaataaaatttagaaaacttgtaacatacataagcat |
30899566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26637139 - 26637045
Alignment:
| Q |
150 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat------tcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26637139 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaatatagacatatataattctatcattttattcccattaatcaacaaatataacttgaaacaaacacac |
26637045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41783805 - 41783685
Alignment:
| Q |
64 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaa-ttttttctattcccaggaacattttatacccga--ataaaattt |
160 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
41783805 |
atgaatttgttcacatctttatggaaactttattcccaacctttttctttgaattcttttttctattttcagaaacattttatatccgagaataaaattt |
41783706 |
T |
 |
| Q |
161 |
agtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41783705 |
agtaaacttataacaaacata |
41783685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 182
Target Start/End: Original strand, 28023719 - 28023840
Alignment:
| Q |
64 |
atgaatttattcccatctccatgggaa-ctttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata--cccgaataaaattt |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | || ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28023719 |
atgaatttattctcatcttcgtgagaaactttattctcacccttttgtttgagaaattttttctattcccaaacacattttatatgtgagaataaaattt |
28023818 |
T |
 |
| Q |
161 |
agtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28023819 |
aatgaacttgtaacaaatatag |
28023840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 186
Target Start/End: Original strand, 28429676 - 28429712
Alignment:
| Q |
150 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28429676 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcat |
28429712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 51
Target Start/End: Original strand, 36703626 - 36703656
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataata |
51 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36703626 |
cctaggaaccataaaaatagggattataata |
36703656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16720321 - 16720277
Alignment:
| Q |
139 |
attttatacccga--ataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16720321 |
attttatacccgataataaaatttagtaaacttgcaacaaacata |
16720277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 3913404 - 3913333
Alignment:
| Q |
30 |
cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3913404 |
cataaaaatagaaactataataggtaat-tacatatgagtttattcccatctttatgggaactttattcccac |
3913333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 346572 - 346342
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346572 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
346473 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
346472 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
346373 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
346372 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
346342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 6171635 - 6171865
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171635 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
6171734 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
6171735 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattctcgggaatca |
6171834 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6171835 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
6171865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 11071449 - 11071679
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11071449 |
cctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
11071548 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
11071549 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggaaatca |
11071648 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11071649 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
11071679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42674888 - 42674655
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42674888 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
42674789 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42674788 |
ttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
42674689 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagtt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42674688 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctaagtt |
42674655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9734073 - 9733846
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9734073 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
9733974 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9733973 |
ttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
9733874 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9733873 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
9733846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14777725 - 14777494
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777725 |
cctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccaccattttccttgggaaatt |
14777626 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14777625 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
14777526 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14777525 |
acaattataaattgaaacaaacacacccttag |
14777494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 2521519 - 2521749
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521519 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaattttattcccacccttttccttgggaaatt |
2521618 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
2521619 |
ttttctattcccaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattttcgggaatca |
2521718 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2521719 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
2521749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 41750373 - 41750599
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41750373 |
cctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
41750472 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41750473 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctaggaatca |
41750572 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41750573 |
acaattataacttgaaacaaacacacc |
41750599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 4559403 - 4559631
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559403 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
4559502 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4559503 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcttgggaatca |
4559602 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4559603 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
4559631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 2050710 - 2050940
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2050710 |
cctaggaatcataaaaataggaattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
2050809 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
2050810 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattctcgggaatca |
2050909 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2050910 |
acaattataacttgaaacaaacacacactta |
2050940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5770337 - 5770108
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5770337 |
cctagcaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaatt |
5770238 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5770237 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccaggaatca |
5770138 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5770137 |
acaattataacttgaaacaaacataccctt |
5770108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 37533800 - 37534029
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37533800 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttttttgggaaatttttt |
37533899 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
37533900 |
ctattccaaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccggaaatcaacaa |
37533999 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacacccttagtt |
246 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534000 |
ttataacttgaaacaaacacacccttagtt |
37534029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41729357 - 41729129
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41729357 |
cctagtaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
41729258 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
41729257 |
ttttctattcccaggaacattttatatctggcaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatccattcctatcattttattcccgggaataa |
41729158 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41729157 |
aaaattataacttgaaacaaacacaccct |
41729129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21737635 - 21737399
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21737635 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
21737536 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacatt--------ttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattccc |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21737535 |
ttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattccc |
21737436 |
T |
 |
| Q |
205 |
aggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21737435 |
gggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
21737399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 37192366 - 37192591
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37192366 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccaatctccatggaaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
37192465 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37192466 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
37192565 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37192566 |
acaattataacttgaaacaaacacac |
37192591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39995366 - 39995128
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39995366 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
39995267 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacatt--------ttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattccc |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39995266 |
ttttctattcccaggaacattttatcattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
39995167 |
T |
 |
| Q |
205 |
aggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39995166 |
gggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctta |
39995128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 17965827 - 17966055
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
17965827 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccaccctttttcatgggaaatt |
17965926 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
17965927 |
ttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttggtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattatcgggaatca |
17966026 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17966027 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
17966055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28311923 - 28311701
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28311923 |
cctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaa-ctatttatgaatttattcccatctccacgggaactttattcccacccttttccttgggaaaga |
28311825 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28311824 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattcagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatcattttattcccgggaatca |
28311725 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28311724 |
acaaatataacttgaaacaaacac |
28311701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 37233274 - 37233496
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37233274 |
cctaggaaccatgaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaacga |
37233372 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca------ttcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37233373 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatgttcctatcattttattcccgggaatca |
37233472 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37233473 |
acaaatataacttgaaacaaacac |
37233496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40951086 - 40950858
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
40951086 |
cctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttggaaattt |
40950987 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40950986 |
ttttgtattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatatttctatcattttattcccgagaatca |
40950887 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40950886 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
40950858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34356926 - 34356699
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34356926 |
cctaggaaccataaaaatagagattataataggaaaattatttatgaatttattcccat-tccgtgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
34356828 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34356827 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
34356728 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34356727 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
34356699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 638438 - 638660
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
638438 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattccc-cccttttccttgggaaatt |
638536 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
638537 |
ttttatattcctaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacctgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttatttccggaaatca |
638636 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
638637 |
acaattataacttgaaacaaacac |
638660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 26310113 - 26310335
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26310113 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaaatttt |
26310212 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaa--------acataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26310213 |
ttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttctaacaaacatatagacatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
26310312 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaaca |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
26310313 |
acaattataactttaaacaaaca |
26310335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20426703 - 20426482
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20426703 |
aaccataaaaatagagattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctccataggaactttattctcacccttttccttgggaaaaattttct |
20426605 |
T |
 |
| Q |
127 |
attcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaatt |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
20426604 |
attcccaggaacattttatatccggggataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatataaattcctatcattttattcccgggaatcaacaaat |
20426505 |
T |
 |
| Q |
219 |
ataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20426504 |
ataatttgaaacaaacacaccct |
20426482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Original strand, 45409096 - 45409324
Alignment:
| Q |
22 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
45409096 |
ctaggaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggtaaatt |
45409194 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
45409195 |
tttctattcccatgaatattttatacccggtaataaaatttagtaaacttgtaaaaaacataggcatatacattcctatcattttatacttgggaatcaa |
45409294 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45409295 |
caaatataacttgaaacaaacacaccctta |
45409324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27358189 - 27357960
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
27358189 |
cctaggaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccacccttttccttgggtaaat |
27358091 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
27358090 |
ttttctattcccatgaatattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatccctatcattttatacctgggaatca |
27357991 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27357990 |
acaaatataacttgaaacaaacacaccctta |
27357960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Original strand, 1988160 - 1988382
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
1988160 |
ggaaccaaaaaaatagggattataataggtaa-ctatataagaatttattctcatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaaattttt |
1988258 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1988259 |
ctattcccaagaacattttatatccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatgtatatttctatcattttattcccagaaatcaacaa |
1988358 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
1988359 |
atataacttcaaacaaacacaccc |
1988382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Original strand, 13760811 - 13760938
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13760811 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
13760910 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13760911 |
ttttctattcccataaacattttatacc |
13760938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Original strand, 23944007 - 23944165
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
23944007 |
cctaggaaccataaaaataaagattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttcgttgagaaatt |
23944106 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23944107 |
ttttctattcccaggaacattttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
23944165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18713883 - 18713660
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18713883 |
cctatgaaccataaaaatagggtttataataggtta-ctacgtataaatttatttccatctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaaatt |
18713785 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
18713784 |
ttttttattaccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttatatcattttattaccatgaatca |
18713685 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18713684 |
acaaatataacttgaaacaaacaca |
18713660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 3902304 - 3902521
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
3902304 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ctatatatgaatttattctcatctccaagggaactttattcccaccattttctttgggaatttttt |
3902402 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
3902403 |
tctattcccaggaacattttaaacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgtctatatatttctatcattttattctcaggaaagaaca |
3902502 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaac |
234 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3902503 |
aatataacttgaaacaaac |
3902521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 14832655 - 14832877
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
14832655 |
cctatgaaccataaaaataaggattataatagg-aaattacgtataaatttattctcatctcaatgagaactttattcccacccttttctttgggaaaat |
14832753 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14832754 |
ttttctattcccaagaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttttaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcctaggaatca |
14832853 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14832854 |
acaaatataacttgaaacaaacac |
14832877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Original strand, 45694037 - 45694260
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| | ||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45694037 |
ggaaccataaaaataggaattataattgc-aaattactcatgaatttattttcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaaaatttt |
45694135 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
45694136 |
ctattcccatgaacgttttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttattcccagaaatctacga |
45694235 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45694236 |
atataacttgaaacaaacgcaccct |
45694260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 244
Target Start/End: Original strand, 40569865 - 40570095
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactt---tattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
40569865 |
aggaacctcaaaaatagggattataataggtaat-tatacatgattttattcccatttccatgggaacttctttattcccaccattttctttgggaaaaa |
40569963 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca------ttcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40569964 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcatgtatgtttttatgattttattcccaggaatct |
40570063 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40570064 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttag |
40570095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11763577 - 11763435
Alignment:
| Q |
41 |
ggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacat |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
11763577 |
ggattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttattcccacctttttcctttggaaattttttctattcccagaaatat |
11763479 |
T |
 |
| Q |
141 |
tttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
11763478 |
tttatgtccgagaataaaatttagtaaatttataacaaacatag |
11763435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Original strand, 6571602 - 6571762
Alignment:
| Q |
92 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc----- |
184 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6571602 |
tttattcctaccctttttcttgggaaattttttatattccccggaacattttatacctgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatata |
6571701 |
T |
 |
| Q |
185 |
-attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6571702 |
tattcctatcattttatttccggaaatcaacaaatataactttaaacaaatacacccttag |
6571762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Original strand, 14253412 - 14253575
Alignment:
| Q |
67 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagta |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14253412 |
aatttattctcatcttcatgaaaattttattcacacccttttctttgagaaattttttctattcccataaacattttatactcgggaataaaatttagta |
14253511 |
T |
 |
| Q |
165 |
aacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataa |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14253512 |
aacttgtaacaaacatagacatatatatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatataa |
14253575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 4875624 - 4875781
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
4875624 |
aggaaccataaaaatagggattataatatgtaat-tacatatgaatttattctcatcttcatgggaactttattcccacccgtttctttgggattttttt |
4875722 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttata-cccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4875723 |
tttattctcgagaacgttttatattgaaaataaaatttagcaaacttgtaacaaacata |
4875781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5003059 - 5002836
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
5003059 |
aggaaccataaaaatatggattataataggtagt-tacacatgaattgattcatatcttcatggaaactttattcccaccatattctttggaattttttt |
5002961 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatac-ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat------tcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
5002960 |
tctattcccagaaacattttatacttggaataaaatttagcaaacttgtaacaaatatatgcatgtatacttctatcattttattcttagaaatctacaa |
5002861 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5002860 |
atataacttgaaacaaacgcaccct |
5002836 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 244
Target Start/End: Original strand, 25454914 - 25455099
Alignment:
| Q |
69 |
tttattcccatctccatgggaacttt--attcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccga--ataaaatttagta |
164 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
25454914 |
tttattctcgtcttcatgggaactttttattccctccattttttttgagaaaacttttctattcccaggaacattttatactcgagaatgaaatttagta |
25455013 |
T |
 |
| Q |
165 |
aacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25455014 |
aacttgtaacaaacatagacatatgtatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacttgaaacaaacacacccttag |
25455099 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 244
Target Start/End: Original strand, 39819537 - 39819771
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaacta---tttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | |||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| || || |
|
|
| T |
39819537 |
aggaaccttaaaaataaggattatattaggtaaacaaacatatataattttactctcatcttcatgagaactttattcccaccattttctttggaaattt |
39819636 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaac---attttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaa |
209 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |
|
|
| T |
39819637 |
ttttcaattcccaggaacattattatatacccgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatgtattttcatgattttattttcaggaa |
39819736 |
T |
 |
| Q |
210 |
tcaacaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39819737 |
tctacaaatataacttgaaacaaacacgcccttag |
39819771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41298141 - 41297983
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
41298141 |
aggaaccataagaatagagattataataggtaat-tataaatgaatatattctcatcttcatgagaactttattcacaccctttgctttgggaaattttt |
41298043 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
| |||| | | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41298042 |
tttatttctaaaaacattttatatccgggaataaaatttaataaacttgtaacatacata |
41297983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 182
Target Start/End: Original strand, 13539519 - 13539675
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
13539519 |
aaccataaaaataaggattataatagataat-tacacatgaatctattcccatgttcatgggaactttattcccactagtttctgtgagaaattttttcc |
13539617 |
T |
 |
| Q |
127 |
attcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13539618 |
attcccataaacattttatacctgcgaataaaatttaataaatttgtaacaaacatag |
13539675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 183
Target Start/End: Original strand, 25724918 - 25725034
Alignment:
| Q |
70 |
ttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaa-tttagtaaa |
166 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
25724918 |
ttattctcatcttcatgagaactttattcccacccttttctttgggaaactttttctattcccagaaacattttatacccagcaataaaattttaataaa |
25725017 |
T |
 |
| Q |
167 |
cttgtaacaaacatagg |
183 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| |
|
|
| T |
25725018 |
cctgcaacaaacatagg |
25725034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 7007429 - 7007531
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| || |
|
|
| T |
7007429 |
cctaagaaccattaaaatagggagtataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatggtaattttattcccaccattttctttgggaattt |
7007527 |
T |
 |
| Q |
121 |
tttt |
124 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
7007528 |
tttt |
7007531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 13790138 - 13790221
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactattt-atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt |
108 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13790138 |
aggaaccttaaaaatagggattataataggtaa--tattacatgattttattcccatctccatgggaactttattcccaccgtttt |
13790221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8868842 - 8868728
Alignment:
| Q |
67 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagta |
164 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
8868842 |
aatttatacccatcttcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaa-tattccta-tcccaggaacattttctacctaggaataaaatttacta |
8868745 |
T |
 |
| Q |
165 |
aacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
8868744 |
atcctgtaacaaacata |
8868728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 1623230 - 1623455
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||||| || | ||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
1623230 |
taggaaccataaaaatagagattataattggt-aactacatatgaatttattctcatattcattgaaactttattcccgccatgttctttggaaaaattt |
1623328 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaa-----acataggcattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
||| | | ||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
1623329 |
ctctgtactcaggaacattttataaccgggaatcaaatttaataaactcgtaacaacatagacatatatatttctattattttactcttaggaatcaaca |
1623428 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
| ||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1623429 |
aatataatttaaaacaaacataccctt |
1623455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 37851704 - 37851864
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggga--aatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| | || |
|
|
| T |
37851704 |
taggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttattctcaccattttctttggaatttttt |
37851802 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgaata-aaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
37851803 |
ttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaattagtaaacttctagcaaacata |
37851864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3254245 - 3254142
Alignment:
| Q |
67 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggg-aaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagt |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
3254245 |
aatttattctcatcttcatgggaactttattcccaccatttcctttgggaaaaaattttctattcccagaaacattttgtacgcgagaataaaatttagt |
3254146 |
T |
 |
| Q |
164 |
aaac |
167 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
3254145 |
aaac |
3254142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Original strand, 24499400 - 24499509
Alignment:
| Q |
135 |
gaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag----gcattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
24499400 |
gaacattttataccatggaataaaatttagtaaacttataacaaacatagatatatatttctatcattttatttctatgaatcaacaaatataacttgaa |
24499499 |
T |
 |
| Q |
229 |
acaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
24499500 |
acaaacacac |
24499509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14403419 - 14403231
Alignment:
| Q |
64 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctat---tcccaggaacattttatacccga--ataaaat |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
14403419 |
atgaatttattctcacc-ccatgaaaactttattcacaccattttctttggtaaaatttttctttctatttcaggaacattttatacctgagaataaaat |
14403321 |
T |
 |
| Q |
159 |
ttagtaaacttgtaacaaacataggcat------tcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14403320 |
ttattaaacttgtaataaatgtaggcatgtatatttttatcattttatttccaggaatcaacaaatacaacttcaaacaaacacaccctt |
14403231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 13760961 - 13761019
Alignment:
| Q |
185 |
attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13760961 |
attcctatcattttattcccgaaaatcaataattataacttgaaacaaacacatcctta |
13761019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Original strand, 4685064 - 4685109
Alignment:
| Q |
64 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc |
109 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4685064 |
atgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcacacccttttc |
4685109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 188
Target Start/End: Original strand, 25625328 - 25625399
Alignment:
| Q |
119 |
ttttttctattcccaggaacattttatac--ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcattc |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
25625328 |
ttttttctattcccatgaacattttatacctcagaataaaatctagtaaatttgcaacaaacctagacattc |
25625399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 516572 - 516463
Alignment:
| Q |
67 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagta |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||| ||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
516572 |
aatttattctcatcttcacgggaattttattctcaccattttctttgg-aatttttttatattcccaaaaacattttatacccagaaataaaatttacta |
516474 |
T |
 |
| Q |
165 |
aacttgtaaca |
175 |
Q |
| |
|
|| || ||||| |
|
|
| T |
516473 |
aaattataaca |
516463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 7007595 - 7007645
Alignment:
| Q |
191 |
atcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7007595 |
atcattttatccccaagaatcaacaaatataacttgaaataaacacaccct |
7007645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35818651 - 35818423
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818651 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
35818552 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35818551 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
35818452 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35818451 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
35818423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37392773 - 37392545
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392773 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
37392674 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37392673 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
37392574 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37392573 |
acaattataacttgaaacaaatacaccct |
37392545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 38363925 - 38364153
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38363925 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
38364024 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38364025 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
38364124 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38364125 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
38364153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32661161 - 32660930
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttt-ccttgggaaat |
119 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32661161 |
cctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcccttgggaaat |
32661062 |
T |
 |
| Q |
120 |
tttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32661061 |
tttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccaggaatc |
32660962 |
T |
 |
| Q |
212 |
aacaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32660961 |
aacaattataacttgaaacaaacacaccctta |
32660930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 12710489 - 12710717
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710489 |
cctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
12710588 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12710589 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
12710688 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12710689 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
12710717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18726847 - 18726619
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18726847 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatttccatctccatgagaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
18726748 |
T |
 |
| Q |
121 |
-ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18726747 |
tttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatc |
18726648 |
T |
 |
| Q |
212 |
aacaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18726647 |
aacaattataacttgaaacaaacacaccc |
18726619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26602160 - 26601935
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26602160 |
ggaaccataaaaatagggattataatagctaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
26602061 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaacaat |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26602060 |
ctattcccaagaacattttataccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaat |
26601961 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26601960 |
tataatttgaaacaaacacatcctta |
26601935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 18297957 - 18298183
Alignment:
| Q |
22 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18297957 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
18298056 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18298057 |
tttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattcccgagaatcaa |
18298156 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18298157 |
aaattataacttgaaacaaacaaaccc |
18298183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1554581 - 1554353
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1554581 |
cctaggaaccataaaattagggattataataggtaaattatgtatgaatttattcccatctccatggaaactttattcccacccttttccttgagaaatt |
1554482 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1554481 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
1554382 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554381 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
1554353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 42755711 - 42755937
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42755711 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
42755810 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatac--ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42755811 |
ttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaactaacataggcatatacatttctatcattttattcccaggaatca |
42755910 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42755911 |
acaattataacttgaaacaaacacacc |
42755937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 3049853 - 3050074
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
3049853 |
cctaggaatcataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttctttggaaattt |
3049952 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3049953 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
3050052 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaac |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3050053 |
acaattataacttgaaacaaac |
3050074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16313734 - 16313506
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16313734 |
cctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaatt |
16313635 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
16313634 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattcccggaaatca |
16313535 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16313534 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
16313506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 25837755 - 25837983
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
25837755 |
cctatgaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattgccacccttttttttgggaaaat |
25837854 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25837855 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattttgtaaacttgtaacaaacataggcatgtacattcctatcattttattcccgggaatca |
25837954 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25837955 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
25837983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 7931083 - 7931306
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7931083 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
7931182 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaa------acataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7931183 |
ttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttataacaaacatatacatatacatttctatcattttattcccaggaatca |
7931282 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7931283 |
acaattataacttgaaacaaacac |
7931306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Original strand, 26061988 - 26062219
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
26061988 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaattt |
26062087 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26062088 |
ttttctattcccagggacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggaatatacatttctatcattttattcccgagaatca |
26062187 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26062188 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttag |
26062219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38132965 - 38132736
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38132965 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcacatctccatgagaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
38132866 |
T |
 |
| Q |
121 |
-ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38132865 |
tttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattcccgagaatc |
38132766 |
T |
 |
| Q |
212 |
aacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38132765 |
aacaattataacttgaaacaaacacaccct |
38132736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41228940 - 41228713
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41228940 |
cctagaaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattct-atctccataggaactttattcccacccttttcctcgggaaatt |
41228842 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
41228841 |
ttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtaggcatatacattcctaccattttattcccgggaatta |
41228742 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41228741 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
41228713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10896441 - 10896217
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
10896441 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttctt-gattttttt |
10896343 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10896342 |
ttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaatttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctgggaatcaac |
10896243 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10896242 |
aattataacttgaaacaaacacaccc |
10896217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5020715 - 5020492
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5020715 |
ggaatcataaaaatatggattataataggtaa-ctacttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaaattttt |
5020617 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat---------tcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5020616 |
ctattcacagaaacattttatacccgagagtaaactttagtaaacttgtaagaaacatatgcatatatattcctcctatcattttattcccatgaatcaa |
5020517 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5020516 |
caaatataacttgaaacaaacacac |
5020492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 7317225 - 7317449
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7317225 |
gaaccatgaaaatagggattataataggtaa-ctatttacgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaaatttttc |
7317323 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttata-cccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaatt |
218 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
7317324 |
ta-tcctaggaacactttatatccggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcctatcattttatttttgaaaatcaacaaat |
7317422 |
T |
 |
| Q |
219 |
ataagttgaaacaaacacacccttagt |
245 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7317423 |
ataacttgaaacaaacacacccttagt |
7317449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29421715 - 29421493
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |
|
|
| T |
29421715 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaa-ctacatataaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgggaaaat |
29421617 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
29421616 |
ttttctattcccagaaatattttatacccgagaataaaatttaataaacttgtaacaaacataaacatatatatttctatcattttattctcatgaatca |
29421517 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29421516 |
acaaatataatttgaaacaaacac |
29421493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21137358 - 21137134
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
21137358 |
cctaggaaccataaaaatacggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccacgagaactttatttccaccattttctttggaaaaat |
21137260 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21137259 |
atttatattcccacaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctattattttattctcaggaatca |
21137160 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21137159 |
acaaatataacttcaaacaaacacac |
21137134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33444849 - 33444627
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
33444849 |
cctagcaatcatacaaatagtgattctaataggtaa-ctacatatgaaattat-ctcatcttcatgggaactttattcccaccattttctttgggcaatt |
33444752 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33444751 |
ttttctattcccaagaacattttataccgggaataaaatttagt-aacttgtaacaaacatagacatatatatttttatcattttattctcaggaatcaa |
33444653 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33444652 |
caaatataacttgaaacaaacacacc |
33444627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 35394235 - 35394462
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
35394235 |
cctatgaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctatatatgagtttgttcccatctccttaggaactttattcccaccatttttcttggaaattt |
35394333 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
35394334 |
ttttctattacgtagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctttcattttattctcgtgaatca |
35394433 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
| || ||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35394434 |
ataaatataacttgaaacaaacaaaccct |
35394462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 41432593 - 41432804
Alignment:
| Q |
29 |
ccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca-tctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttcta |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
41432593 |
ccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttattctcaatctccatgggaactttatttccaccctttttctagggaaaaattttcta |
41432691 |
T |
 |
| Q |
128 |
ttcccaggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata------ggcattcctatcattttattcccaggaatcaacaattat |
220 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
41432692 |
ttcccataaacgttttataccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatgtgtattcctatcattttattcccaggaatccacgaatat |
41432791 |
T |
 |
| Q |
221 |
aagttgaaacaaa |
233 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| |
|
|
| T |
41432792 |
aacttaaaacaaa |
41432804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 15226813 - 15226970
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
15226813 |
aggaaccttaaaaatagggattataataggtaat-tccacataattttattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttctttggg-aatcttt |
15226910 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15226911 |
tctattcgcaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
15226970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19160965 - 19160807
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |
|
|
| T |
19160965 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaat-tacatatgaattcattctcatctccatgacaactttattcccacccttttctttggaatttttt |
19160867 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
180 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19160866 |
ttatattcccaagaatattttatacacgggaatgaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
19160807 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6805846 - 6805698
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
6805846 |
aggaaccatgaaaatagagattttaataggtat-ctatttatgaatttattctcatctccatgagaactttattctcacccttttctttaggaaaaattt |
6805748 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgt |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6805747 |
tctattcccaagaacatattatactcgggaataaaatttagtaaacttgt |
6805698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31117750 - 31117594
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
31117750 |
cctaggaaccataaaaatagatattataataggtaa-ctatttatgaatttatccccat------gggaactttattcccaccctttttcttggaaattt |
31117658 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
31117657 |
ttttctattctgaagaacattttatattcggaaataaaatttaataaaatcgtaacaaacatag |
31117594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43872189 - 43872026
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| ||| | || |
|
|
| T |
43872189 |
aggaacctcaaaaatagggattataataggtaat-tatacgtgattttattcccatctccatatgaactttattcctaccaatttctttgaaaaaatatt |
43872091 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43872090 |
tatattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttaacaaacttgtaacaaacataggcat |
43872026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 40197280 - 40197223
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca |
78 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40197280 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattccca |
40197223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16219164 - 16218940
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
16219164 |
ggaaccatgaaaatggggattataataggtaat-tacacgtggatttattcccatcttcatgggaagattattcccacc-ttttctttggggaaatttta |
16219067 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || | || | |
|
|
| T |
16219066 |
ctattcctgagaacgttttaaaccccggaataaaatctagtaaacttgtaacaaacataggcatacatatttctatcgttttattcccagaaaactacga |
16218967 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16218966 |
atataatttgaaacaaacgcaccctta |
16218940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40197232 - 40197076
Alignment:
| Q |
92 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaac------aaacatagg |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
40197232 |
tttattcccacctttttccttgaaattttttttctattcccagaaacattttatatcaaagaataaattttagtaaacttataacaaacataaacatata |
40197133 |
T |
 |
| Q |
184 |
cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40197132 |
catttctatcattttatttccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacataccc |
40197076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 239
Target Start/End: Original strand, 25899548 - 25899702
Alignment:
| Q |
92 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------g |
183 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
25899548 |
tttattctcaccattttctttggaaaaacttttctattccgaggaacattt-atacccggaaataaaatttaataaacttgcaacaaacatagacacatg |
25899646 |
T |
 |
| Q |
184 |
cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25899647 |
catttttatgattttattcccaggaatctacaaatataatttgaaacaaacacacc |
25899702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 182
Target Start/End: Original strand, 38437369 - 38437461
Alignment:
| Q |
92 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38437369 |
tttatttccacccttttctttgggaaaaattttctattctcaggaacgttttatacccgaaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatag |
38437461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14764111 - 14763991
Alignment:
| Q |
67 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagta |
164 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14764111 |
aatttattatcatcttcatgtgaactttattcccacctttttcattga-attttttttctattctcatgaacattttatacccgtgaataaaatttagta |
14764013 |
T |
 |
| Q |
165 |
aacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
14764012 |
aacttgaaacaaacatatgcat |
14763991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37982008 - 37981857
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
37982008 |
ggaaccataaaaatagggattataacaagtaat-tacatataaatttattctcattttcataggaactttatttccacccttttcctt--gatttttttt |
37981912 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaac |
178 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37981911 |
taattcccaagaacgttttatatccaagaat-aaattttgtaaacttgaaacaaac |
37981857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32901858 - 32901787
Alignment:
| Q |
111 |
ttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32901858 |
ttgggaaaattttcctattcccagaaacattttataccatgaataaatttttttaaacttgtgacaaacata |
32901787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 243
Target Start/End: Original strand, 8635671 - 8635708
Alignment:
| Q |
206 |
ggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8635671 |
ggaatcaacaattataacttgaaacaaacacactctta |
8635708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 242
Target Start/End: Original strand, 34672355 - 34672407
Alignment:
| Q |
190 |
tatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34672355 |
tatcattttattttcaggaatcaacaaatacaacttcaaacaaacacaccctt |
34672407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8476535 - 8476304
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476535 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
8476436 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8476435 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacaggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
8476336 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8476335 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttag |
8476304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 26848866 - 26849096
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26848866 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccacccttttccttaggaaatt |
26848965 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26848966 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
26849065 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849066 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
26849096 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 40908109 - 40908337
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908109 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
40908208 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40908209 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
40908308 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40908309 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
40908337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11239347 - 11239119
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239347 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
11239248 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11239247 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
11239148 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11239147 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
11239119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47115084 - 47114857
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
47115084 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaattt |
47114985 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47114984 |
ttttttatttccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccaggaatca |
47114885 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47114884 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
47114857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6231728 - 6231496
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6231728 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttcattgggaaatt |
6231629 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
6231628 |
ttttctattccaaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattctcgggaatca |
6231529 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagt |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6231528 |
acaattataacttgaaacaaacacacccctagt |
6231496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33218140 - 33217917
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33218140 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
33218041 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
33218040 |
ttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttaataaatttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccggaaatca |
33217941 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33217940 |
acaattataacttgaaacaaacac |
33217917 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 1099044 - 1099267
Alignment:
| Q |
22 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1099044 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaa-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
1099142 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1099143 |
tttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagggatatacatttctatcattttattcccgggaatcaa |
1099242 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1099243 |
caattataacttaaaacaaacacac |
1099267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48339984 - 48339760
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48339984 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
48339885 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
48339884 |
ttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttatatcattttattcccggaaatca |
48339785 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48339784 |
acaattataacttgaaacaaacaca |
48339760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9320675 - 9320448
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9320675 |
cctaggaaccataaaaatagggatcataataagtaaactatttatgaatttatttccatctccatgggaactttattcccacctttttccttaggaaatt |
9320576 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9320575 |
ttttctattcccaggaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagtatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
9320476 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9320475 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
9320448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20414692 - 20414461
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20414692 |
cctaagaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaattt |
20414593 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20414592 |
ttttttatttccaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaatttataacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccagaaatca |
20414493 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20414492 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttag |
20414461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28124663 - 28124436
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28124663 |
cctaagaaccataaaaatagggattataatatgtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
28124564 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28124563 |
ttttatattccgaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgagaatca |
28124464 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28124463 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
28124436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Original strand, 44952161 - 44952380
Alignment:
| Q |
30 |
cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctatt |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44952161 |
cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctatt |
44952260 |
T |
 |
| Q |
130 |
cccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattata |
221 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44952261 |
cccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattata |
44952360 |
T |
 |
| Q |
222 |
agttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44952361 |
acttgaaacaaacacaccct |
44952380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 20297637 - 20297865
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
20297637 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggaaattt |
20297736 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
20297737 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttatttccgggaatca |
20297836 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20297837 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
20297865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31611212 - 31611004
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
31611212 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccaccctttttcatgggaaatt |
31611113 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31611112 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
31611013 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattata |
221 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
31611012 |
acaattata |
31611004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Original strand, 24574411 - 24574652
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24574411 |
cctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaatt |
24574510 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaa--------cattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattccc |
204 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24574511 |
ttttctatttccagaaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
24574610 |
T |
 |
| Q |
205 |
aggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacccttagtt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24574611 |
gggaatcaacaattataacttgaaacaaacacacccttagtt |
24574652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 46359796 - 46360002
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46359796 |
cctaggaatcataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaata |
46359895 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
46359896 |
ttttctattcacaagaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattccaagaaatca |
46359995 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaatta |
219 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
46359996 |
acaatta |
46360002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31436145 - 31435922
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
31436145 |
ggaatcataaaaataaggattataataggtaa-ctacattagaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccaatttctttgggaaaattttt |
31436047 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31436046 |
ctattttcaggaacattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattctcaggaatcaacaa |
31435947 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31435946 |
atataacttgaaacaaacacaccct |
31435922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53165951 - 53165733
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
53165951 |
cctaggaatcataaaaatagatattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttttcttggaaaaaa |
53165853 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
53165852 |
ttttctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatatattcctatcattttatttatgggaatca |
53165753 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaa |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
53165752 |
acaaatataacttgaaacaa |
53165733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43132383 - 43132156
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43132383 |
cctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaa-ctatttatgaatttaatctcatctccgtgggaactctattcccacccttttccttgggaaaaa |
43132285 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
43132284 |
atttatattctcaggtacattttatacatgaaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatatattcctattattttattctcgagaatca |
43132185 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43132184 |
acaaatataacttgaaacaaacacaccct |
43132156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10822942 - 10822736
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10822942 |
taggaaccatacaaatagggattattatagataa-ctatttatgattttattcccatctccatgaaaactttattcccacccttttcctagggaaatttt |
10822844 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat------tcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
10822843 |
ttctattcccaggaacattttatacccgggaattttttttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacacttctatcattttattcccggaaatcaac |
10822744 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataa |
222 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
10822743 |
aaatataa |
10822736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Original strand, 19532989 - 19533130
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19532989 |
cctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaa-ctatttatgaatttattcccatctccaaggaaactttattcccacccttttccttggaaaaaa |
19533087 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaattta |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19533088 |
atttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaattta |
19533130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43719150 - 43718994
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43719150 |
taggaaccataaaaatatggattataataagtaaattatttatgaatt-----ccatctccatgggatctttattcccacccttttccttgggaaatttt |
43719056 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43719055 |
ttctattctcaggaacattttatgccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacatag |
43718994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28770432 - 28770207
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
28770432 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaat-tacatatgaaatcattcccatcttcatgagaactttattcccaccattttctttgggaaaattttt |
28770334 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
28770333 |
ctattgctaggaacgttttatacccaggaatcaaatttagtaaacttgtaccaaacatagacatgcatatttctatctttttattcccaggaatctacga |
28770234 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28770233 |
atataacttgaaagaaacacaccctta |
28770207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12228479 - 12228256
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||| |
|
|
| T |
12228479 |
taggaatcataaaaataagtattataatagataa-ctacatatgattttattctcatctccatgggaactttattctcacc-ttttctttggaaattttt |
12228382 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacccga--ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
12228381 |
ttctattcccagaaacattttgtacccgagaataaaatttagtaaacttgtaataaacataggcatatatatttctatcattttattcgcaggaattaac |
12228282 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
12228281 |
aactatattttaaaacaaacacaccc |
12228256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 124
Target Start/End: Original strand, 29512446 - 29512546
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29512446 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctctatgggaactttatttccacccttttccttgggaaatttt |
29512544 |
T |
 |
| Q |
123 |
tt |
124 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
29512545 |
tt |
29512546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1247116 - 1246921
Alignment:
| Q |
31 |
ataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattc |
130 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1247116 |
ataaaaatatggattataatagataa-ctatataagaatttattccgatctccatgtgaact--attcccacctttttccttcggaaattttttctatta |
1247020 |
T |
 |
| Q |
131 |
ccaggaacattttatac--ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattata |
221 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
1247019 |
ccaggaacattttattcttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatatgtatttctatcattttattcccgagaatcaacaaatata |
1246921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12931119 - 12930940
Alignment:
| Q |
69 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaac |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12931119 |
tttattcccatctctatgggaactttattcccaccattttctttgagaaaacttttctattcccataaacattttataccgggaataaaatttagtaaac |
12931020 |
T |
 |
| Q |
168 |
ttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12931019 |
ttgtaacaaacatagccatatgcatttttatgattttattcccaacaatctacaa-tataacttgaaacaaacacatcctt |
12930940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 182
Target Start/End: Original strand, 18460827 - 18460946
Alignment:
| Q |
65 |
tgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttag |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18460827 |
tgaatttattttcatctccaagagaactttatttccaccattttctttgggaaaatttttctattcccagaaacattttataccaaagaataaaatttag |
18460926 |
T |
 |
| Q |
163 |
taaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18460927 |
taaacttgtaacaaacatag |
18460946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2565666 - 2565457
Alignment:
| Q |
43 |
attataataggtaa--actatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacat |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
2565666 |
attataataggtaactactacgtatgaatttactctcatcttcatgggaactttattcccaccattttctttggaaaaaattttctattccaagaaacat |
2565567 |
T |
 |
| Q |
141 |
tttataccc-gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaa |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||| || |||| || |
|
|
| T |
2565566 |
tttatacccggaaataaatttaacaaacttgtaacaaacacaggtatatatatttctattattttattcctaagaatcaacaaatataacttaaaacgaa |
2565467 |
T |
 |
| Q |
234 |
cacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
2565466 |
cacaccctta |
2565457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 32071291 - 32071450
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| || |||| | |
|
|
| T |
32071291 |
cctaggaaccataaaaataaagattataataggtaa-ctacatacaaatttattctcatctccatgt-aactttattctcgcccttttctttaagaaaat |
32071388 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgaa-taaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32071389 |
ctttctatttccatgaacatttcatacccaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
32071450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26849370 - 26849243
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggga-aattt |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| | | ||| |
|
|
| T |
26849370 |
taggaaccataaaaatagagattataataggtaa-ctatttatgaatttattctcatctctgtaggaactttattcccaccatttttctttgaatttttt |
26849272 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttatacccg |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26849271 |
tttctattcccagaaactttttatacccg |
26849243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 253
Target Start/End: Original strand, 29512631 - 29512763
Alignment:
| Q |
116 |
aaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcattcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
29512631 |
aaattttttctattccgatgaacattttatactcaggaataaaatttagtaaacttgaaacaaacgtaggcat-------attttattcccagaaattaa |
29512723 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacacacccttagttatttttt |
253 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
29512724 |
aaattataacttgaaacaaacacacccttaattttttttt |
29512763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33647886 - 33647767
Alignment:
| Q |
65 |
tgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttag |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33647886 |
tgaatttattctcatcttcaaggaaactttatttccactcttttctttggaaatttttttatattctcagaaacgttttatacccaggaataaaatttag |
33647787 |
T |
 |
| Q |
163 |
taaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33647786 |
taaacttgtaacaaacatag |
33647767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6832079 - 6831956
Alignment:
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacccg-aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca-----ttcctatcattttattcccaggaatcaacaat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
6832079 |
tctattcccaggaatattttatacctggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgttttttgtgattttatttccaggaatctacaaa |
6831980 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6831979 |
tataagttgaaacaaacacaccct |
6831956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 27823119 - 27823286
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
27823119 |
cctagaaatcataaaaatatggattataacaggtaat-tacacatgaatttgttctcatcttcatgagaattttattcccacccttttctttgggaaaat |
27823217 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatt |
187 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
27823218 |
tttcctatttcgatgaacgttttatactcgggaataaaatttagtaaacttatagcaaacatagacatt |
27823286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Original strand, 45826687 - 45826849
Alignment:
| Q |
87 |
ggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc |
184 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
45826687 |
ggaacttttttcccatccttttctttgtgaatgttcttctattcccaggaacattttatatcatgaaataaaatttaataaacttgtaa-aaacatatga |
45826785 |
T |
 |
| Q |
185 |
attc------ctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45826786 |
atgcagatttctatcattttattccctggaatctacaacgataacttgaaacaaacacaccctt |
45826849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 128
Target Start/End: Original strand, 40584502 - 40584561
Alignment:
| Q |
69 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctat |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
40584502 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttctttggaaaaacttttctat |
40584561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 186
Target Start/End: Original strand, 27093957 - 27094026
Alignment:
| Q |
119 |
ttttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27093957 |
ttttttctattcccataaacattttatacccgagaataagatatagtaaacttataacaaacataggcat |
27094026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38140583 - 38140434
Alignment:
| Q |
33 |
aaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattccc |
132 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
38140583 |
aaaaataaggattataatagg-aaattacacatgaacttattctcatcttcatgg-aactttattctcacccttttctttggaaaaaaatttctattcct |
38140486 |
T |
 |
| Q |
133 |
aggaac--attttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
180 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38140485 |
aggaacatattttatactcgtcaataaattatagtaaacttataacaaacat |
38140434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43715364 - 43715307
Alignment:
| Q |
184 |
cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43715364 |
catttctatcattttattttcgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
43715307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 24784182 - 24784277
Alignment:
| Q |
150 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaa----acataggcattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24784182 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaactgacatatgtatttttataattttattccaaaaaatctacaattataacttaaaacaaacacaccct |
24784277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 55435488 - 55435391
Alignment:
| Q |
150 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat----aggcat--tcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
55435488 |
gaataaaatttaacaaacttgtaacaaacatgagaatgcatattcctatcattttattcccaggtatctacaaaaataacttgaaacaaatacaccct |
55435391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28139846 - 28139780
Alignment:
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttatacccgaa--taaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28139846 |
tttctattcccaagaacgttttatatccgaaaataaaatttactaatcttgtaacaaacataagcat |
28139780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25916260 - 25916032
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25916260 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
25916161 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg----cattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25916160 |
ttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatacattcctatcattttattcccgggaatcaaa |
25916061 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25916060 |
aattataacttgaaacaaacacaccctta |
25916032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27763126 - 27762892
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27763126 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaata |
27763027 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27763026 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
27762927 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagtta |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27762926 |
acaattataacttgaaacaaacacacccatagtta |
27762892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6280148 - 6279918
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6280148 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
6280049 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6280048 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcatatcattttattcccgggaatca |
6279949 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6279948 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
6279918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 48879173 - 48879403
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48879173 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
48879272 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48879273 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
48879372 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48879373 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
48879403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 25932289 - 25932517
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25932289 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
25932388 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25932389 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctaggaatca |
25932488 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25932489 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
25932517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 42773796 - 42774024
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42773796 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
42773895 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42773896 |
ttttttatccccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccagaaatca |
42773995 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42773996 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
42774024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13230216 - 13229989
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230216 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
13230117 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
13230116 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaataa |
13230017 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230016 |
aaaattataacttgaaacaaacacaccc |
13229989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Original strand, 35999534 - 35999765
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35999534 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
35999633 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35999634 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgagaatca |
35999733 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35999734 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttag |
35999765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48519118 - 48518891
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48519118 |
cctaggaaccataaaaataggtattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
48519019 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48519018 |
ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
48518919 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48518918 |
aaaattataacttgaaacaaacacaccc |
48518891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39730520 - 39730292
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39730520 |
cctaggaaccatgaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgtgaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
39730421 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39730420 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
39730321 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39730320 |
aaaattataacttgaaacaaacacaccct |
39730292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Original strand, 40435748 - 40435979
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40435748 |
cctaggaaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
40435847 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40435848 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
40435947 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40435948 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttag |
40435979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 55968227 - 55967999
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
55968227 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcatgggaaatt |
55968128 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaa------acataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
55968127 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacagagacatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
55968028 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55968027 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
55967999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34049821 - 34049597
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34049821 |
aggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaattttt |
34049722 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
34049721 |
tctattcccaggaacattttataccctggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttatttccgggaatcaaca |
34049622 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34049621 |
attataacttgaaacaaacacaccc |
34049597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45748022 - 45747795
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45748022 |
cctaggaaccataaaaatagagattataat-ggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccccccttttccttgggaaatt |
45747924 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
45747923 |
ttttctattcctaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
45747824 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45747823 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
45747795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 23686635 - 23686865
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23686635 |
cctaggaaccataaaaatatgaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
23686734 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23686735 |
ttttctattcccagaaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttctatcattttattcccgggaatca |
23686834 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23686835 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
23686865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41859273 - 41859046
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41859273 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaat- |
41859175 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
41859174 |
ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccggaaatca |
41859075 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41859074 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
41859046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 43723112 - 43723340
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43723112 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcacccttttccttgggaaatt |
43723211 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
43723212 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattttcgggaatca |
43723311 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43723312 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
43723340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 45596116 - 45596344
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45596116 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatttccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
45596215 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45596216 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgaaaatca |
45596315 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45596316 |
acaattataacttgaaacaaacgcaccct |
45596344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50673131 - 50672903
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50673131 |
cctaggaaccataaaa-tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
50673033 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
50673032 |
ttttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattccc-ggaatca |
50672934 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagt |
245 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50672933 |
acaat--taacttaaaacaaacacacccttagt |
50672903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 47670210 - 47670436
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47670210 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatcttcatggaaactttatttccaccattttccttgggaaatt |
47670309 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47670310 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttatttccaggaatca |
47670409 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47670410 |
acaattataacttgaaacaaacacacc |
47670436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 935974 - 936202
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
935974 |
cctaggaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccaccctttttcttgtgaaatt |
936073 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
936074 |
ttttctattcccaggaacattttatgcccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagggatatatattccaatcattttattctcgggaatca |
936173 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
936174 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
936202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Original strand, 32953374 - 32953598
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32953374 |
aggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccattttccttgggaaattttt |
32953473 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
32953474 |
tctattcctaggaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaagataggcatatacattcctatcattttgttcctgggaatcaaca |
32953573 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32953574 |
attataacttgagacaaacacaccc |
32953598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39835534 - 39835304
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39835534 |
cctagaaatcataaaaataaggattataataggtaaactatttatgaatttattctaatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
39835435 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39835434 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatacatttatatcattttattcccgggaatca |
39835335 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39835334 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
39835304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41744448 - 41744216
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41744448 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactaattatgaatttattctcatctccataggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
41744349 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc---cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
41744348 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaagaaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccggaaatc |
41744249 |
T |
 |
| Q |
212 |
aacaattataagttgaaacaaacacacccttag |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
41744248 |
aacaattataacttgaaataaacacactcttag |
41744216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18405460 - 18405233
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18405460 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattctcacccttttcctt-ggaaatt |
18405362 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
18405361 |
ttttttattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctataattttattctcgggaatca |
18405262 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18405261 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
18405233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 8322095 - 8322308
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
8322095 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttggaaattttt |
8322194 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8322195 |
ttctattcccaagaatattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattcccaggaatcaac |
8322294 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |
|
|
| T |
8322295 |
aattataacttgaa |
8322308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 39498673 - 39498901
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
39498673 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgagaactttatttccacccttttccttggaatttt |
39498772 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaac------aaacataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
39498773 |
ttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttatttccgggaatca |
39498872 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39498873 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
39498901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 39502012 - 39502240
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
39502012 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctctatgagaactttatttccacccttttccttggaatttt |
39502111 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaac------aaacataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
39502112 |
ttttctattcccatgaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataaacatatacatttctatcattttatttccgggaatca |
39502211 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39502212 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
39502240 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 18931601 - 18931826
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
18931601 |
cctatgaactataaaaatagggattataataggaaaattatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccatttttcttggaaattt |
18931700 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18931701 |
ttttctattcccaggaacattttatacacgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcctatcattttattcccagaaatca |
18931800 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18931801 |
acaattataacttgaaacaaacacac |
18931826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 27942585 - 27942814
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27942585 |
cctaggaaccataaaaataaggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatttcaatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
27942684 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaa------------acataggcattcctatcattttattcccag |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
27942685 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataataaacataaacatagacatatacattcctatcattttatttccgg |
27942784 |
T |
 |
| Q |
207 |
gaatcaacaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27942785 |
gaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
27942814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34238181 - 34238014
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34238181 |
cctaggaacaaaaaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
34238082 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34238081 |
gtttctattcccaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
34238014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 27555274 - 27555486
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27555274 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
27555373 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27555374 |
ttt----------------ttttatacccgcgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgagaatca |
27555457 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27555458 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
27555486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 48873869 - 48873978
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48873869 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
48873968 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattc |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
48873969 |
ttttctattc |
48873978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 30415753 - 30415983
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30415753 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaat-tatttatgaaattattttcatctttatggaaattttattcccaccattttctttgggaaatttt |
30415851 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttata--cccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
30415852 |
ttctattccaaagaacattttatatttgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacagacatatatattcctatcattttattatcgggaatcaac |
30415951 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacacccttagtt |
246 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30415952 |
aaatataacttgaaacaaacacacccttagtt |
30415983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 38414062 - 38414278
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
38414062 |
aaccataaaaataggaattataataggtaa-ctacatatgaatttattaccatctccatgagaactttattcccacccttttccttgggaaattttttat |
38414160 |
T |
 |
| Q |
127 |
attcccaggaacattttatac-ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaatta |
219 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
38414161 |
attcccggaaacattttatacatggaataaaatttagtaaacttattacaaacatagacatgtatatttctatcattttattccc--gaatcaacaaata |
38414258 |
T |
 |
| Q |
220 |
taagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
38414259 |
taactttagacaaacacacc |
38414278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31938096 - 31937929
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccc-ttttccttgggaaat |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
31938096 |
cctaggaaccataaaaataaggattataataggtaa-ctgtttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttttccttggaaaat |
31937998 |
T |
 |
| Q |
120 |
tttttctattcccaggaacattttata--cccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31937997 |
tttttttattcccaagaacattttatatttgggaataaaatttaataaacttctaacaaacatatgcat |
31937929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 239
Target Start/End: Original strand, 7258854 - 7259036
Alignment:
| Q |
64 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaattta |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
7258854 |
atgaatttattcccatattcatgggaactttattcccactcttttcttttggaaattttttctattcccaggaacattttatacgcggaaataaaattta |
7258953 |
T |
 |
| Q |
162 |
gtaaacttgtaacaaacataggcat-----tcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7258954 |
gtaaacttgtaacaaacaaagacatgtatattctatcattttattctaaggaatctaccaatataacttgaaacaaacgcacc |
7259036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Original strand, 51968632 - 51968854
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccc-ttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
51968632 |
gaaccataaaaataaggattataat--gtaat-tacatatgaaattatttccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaaacatttt |
51968728 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| || | |
|
|
| T |
51968729 |
ctattcccaggaacgttttatactcaagaataaaatttagcaaacttgtaacaaacataggcatgcatatttctatctttttattcccagaaatttacga |
51968828 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51968829 |
atataacttgaaacaaacacaccctt |
51968854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Original strand, 18405603 - 18405764
Alignment:
| Q |
22 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |
|
|
| T |
18405603 |
ctaggaaccataaaaatagagattataataggtaat-tacacatggatttattcccatcttaatgagaactttattcccacccttttctttaggaaaaat |
18405701 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18405702 |
tttctattcctaggaacattttatacctagaaataaaattttgtaaacttgtaacaaacatag |
18405764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Original strand, 52469547 - 52469709
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
52469547 |
cctatgaaccataaatatagagattataataggtaa-ctatattggaatttatttccatctccatgggaactttattcccaccaatttccttggaaaaaa |
52469645 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52469646 |
atttctattcctagaaacattttattgccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacatag |
52469709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 38394759 - 38394921
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccc-ttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
38394759 |
ggaaccataaaaataggaattataatagg-aaattactcatgaatttatttccatctctatcagaactttattcccaccccttttctttgggaatttttt |
38394857 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacccg-aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
| |||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38394858 |
tatatttccagaaatattttatactaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcat |
38394921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36858597 - 36858377
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt-- |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
36858597 |
aaccataaaaatagggattataatatgtaat-tacatatgaaattattctcatcttcatgggaactttattcccacccttttatttg--aattttttttt |
36858501 |
T |
 |
| Q |
125 |
-ctattcccaggaacattttatacccga--ataaaatttagtaaacttgtaacaaacat----aggcattcctatcattttattcccaggaatcaacaat |
217 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||| | | |
|
|
| T |
36858500 |
tctattctcaggaacattttatacccgggcataaaatttagtaaacttgtaacaaacataagcatgcatttctatctttttattcttgggaatctaagaa |
36858401 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36858400 |
tataacttgaaacaaacacaccct |
36858377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10400961 - 10400810
Alignment:
| Q |
92 |
tttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------g |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10400961 |
tttattcccaccaatttctttgggaaattttttctatttccaggaatattttatacccaagaataaaatttagtaaacttgtaataaacatagacatata |
10400862 |
T |
 |
| Q |
184 |
cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaaca |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10400861 |
catttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatataacttgaaacaaaca |
10400810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47426451 - 47426305
Alignment:
| Q |
38 |
tagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttc-cttgggaaattttttctattcccagga |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47426451 |
tagggattataataggtaa-ctatttatgaatttattttcatcttcatgggaactttattgccacccttttttcttgataatatttttctatttccagga |
47426353 |
T |
 |
| Q |
137 |
acattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47426352 |
acattttatatcaagaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
47426305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Original strand, 36858255 - 36858351
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaa |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36858255 |
cctaggaaccataaaaataaggattataacaggtaa-ctatatatgaatttattcccatctccatgagaattttattcccacccttttctttgggaaa |
36858351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24805305 - 24805150
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc-ccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24805305 |
aaccataaaaatagggaatataataggtaat-tacacatggatttattcccatattcatgggaactttattttccaccattttctttgtgaaattttttc |
24805207 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24805206 |
tattccca-aaatgttttattcccgaaaataaaatttagtaaatttgtaacaaacata |
24805150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37014569 - 37014451
Alignment:
| Q |
64 |
atgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaattta |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
37014569 |
atgaatttattctcatcttcatgagaactttatttccactcttttctttgggaaattttttctattcctatgaacatgttatacctggatataaaattta |
37014470 |
T |
 |
| Q |
162 |
gtaaacttgtaacaaacat |
180 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37014469 |
ataaactcataacaaacat |
37014451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 48059905 - 48060065
Alignment:
| Q |
22 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
121 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48059905 |
ctaggaattataaaaataagaattataataggtaat-tatatatgaatttatttatatttttatgagaactttattcccaccattttatttgggaaattt |
48060003 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48060004 |
tttctattcccataaatattttatatccaaaaataaaatttaataaactcgtaacaaacata |
48060065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 182
Target Start/End: Original strand, 44309670 - 44309771
Alignment:
| Q |
83 |
catgggaactttattcccacccttttccttgggaaa-ttttttctattcccaggaacattttatac-ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44309670 |
catgggaactttattcccacccttttctttaggaaatttttttctattctctagaacgttttatactaggaataaaatttagtaaccttgtaacaaacat |
44309769 |
T |
 |
| Q |
181 |
ag |
182 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
44309770 |
ag |
44309771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 18094099 - 18094259
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttggga--aatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| | || |
|
|
| T |
18094099 |
taggaatcataaaaatatgaattataataggtagt-tacacatgaatttattctcatcttcatgggaactttattctcaccattttctttggaatttttt |
18094197 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgaata-aaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
18094198 |
ttttctattcctagaaacattttatacccgaaaataaaattagtaaacttctagcaaacata |
18094259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12276075 - 12275976
Alignment:
| Q |
84 |
atgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12276075 |
atgggaattttattcccaccttttcttttgggaaaatatttctttttccaagaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
12275976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Original strand, 26165261 - 26165440
Alignment:
| Q |
69 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaa |
166 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26165261 |
tttattctcatcttaatgggaactttattctcactattttctttatgaaaacttttctattctaag-aacattttatattcatgaataaaatttagtaaa |
26165359 |
T |
 |
| Q |
167 |
cttgtaacaaacata------ggcattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26165360 |
cttgtaacaaacataaacatgtgcatttttatgattttattctcaggaatctacaaatataacatgaaacaaacacaccct |
26165440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 149
Target Start/End: Original strand, 30790438 - 30790518
Alignment:
| Q |
69 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc |
149 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30790438 |
tttatttccatcttcatggaaactttattcccatccttttcattggaaaaacttttctattctcagaaacattttataccc |
30790518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34237476 - 34237424
Alignment:
| Q |
184 |
cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34237476 |
catttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacac |
34237424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32384614 - 32384492
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt-ttttc |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32384614 |
aaccataaaattagggattataataggtaat-tgcacataaatttgttccaatctttatgggaattttattcccacccttttctttgggaaatttttttc |
32384516 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttataccc |
149 |
Q |
| |
|
| || ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
32384515 |
tgtttccatgaacgttttataccc |
32384492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22654638 - 22654537
Alignment:
| Q |
89 |
aactttattcccacccttttccttggga--aattttttctattcccaggaacattttatacccga--ataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22654638 |
aactttattcccaccctttttttttggagaaagtttttctattcgcaataacattttttacccgagaataaaaattagttaacttgtaataaacataggc |
22654539 |
T |
 |
| Q |
185 |
at |
186 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
22654538 |
at |
22654537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 273
Target Start/End: Original strand, 34354786 - 34354818
Alignment:
| Q |
241 |
ttagttattttttactaatgtactcatatttat |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34354786 |
ttagttattttttactaatgtactcatatttat |
34354818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 181
Target Start/End: Original strand, 54478495 - 54478555
Alignment:
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54478495 |
ttctatttccaataacattttatacccatgaatgaaatttagtaaacttataacaaacata |
54478555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9297172 - 9297144
Alignment:
| Q |
152 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9297172 |
ataaaatttagtaaacttgtaacaaacat |
9297144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 45045470 - 45045698
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45045470 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
45045569 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
45045570 |
ttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
45045669 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45045670 |
acaattataacttaaaacaaacacaccct |
45045698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 11329837 - 11330065
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11329837 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
11329936 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11329937 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
11330036 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11330037 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
11330065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35488416 - 35488188
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488416 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccataggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
35488317 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
35488316 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccggaaatca |
35488217 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35488216 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
35488188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 39554027 - 39554259
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39554027 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
39554126 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39554127 |
ttttctattctcaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
39554226 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagt |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39554227 |
acaattataacttgaaacaaacacacccttagt |
39554259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8419816 - 8419586
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419816 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
8419717 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8419716 |
ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
8419617 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419616 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
8419586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 48341207 - 48341430
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
48341207 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
48341306 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc-cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaa |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
48341307 |
ttttctattcccaggaacattttataccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaa |
48341406 |
T |
 |
| Q |
214 |
caattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48341407 |
caattataacttgaaacaaacaca |
48341430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9814441 - 9814217
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9814441 |
cctaggaaccataaaaatagagattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
9814342 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaa--acataggcattcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9814341 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacacatatacattcctatcattttattcccgggaatcaacaa |
9814242 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9814241 |
ttataacttgaaacaaacacaccct |
9814217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16825581 - 16825353
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825581 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
16825482 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
16825481 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcctaggaatta |
16825382 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16825381 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
16825353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 40212733 - 40212960
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40212733 |
cctaggaaccataaaaatagggattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgagaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
40212832 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40212833 |
ttttctattcccaggaacattttataccccggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgcgaatca |
40212932 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40212933 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
40212960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45265275 - 45265049
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265275 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
45265176 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45265175 |
ttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttataacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgagaatca |
45265076 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45265075 |
acaattataacttgaaacaaacacacc |
45265049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 27248137 - 27248365
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27248137 |
cctatgaactataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
27248236 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27248237 |
ttttctattcccagtaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
27248336 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27248337 |
acaattataacttgaaacaaacacaccct |
27248365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9947215 - 9946989
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9947215 |
taggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttaatctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
9947116 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9947115 |
ttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaa |
9947016 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9947015 |
aattataactttaaacaaacacaccct |
9946989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27419451 - 27419221
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27419451 |
cctagggaccataaaaatagagattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
27419352 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27419351 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
27419252 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27419251 |
gcaattataacttgaaacaaacacaccctta |
27419221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 25097913 - 25098142
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25097913 |
cctaggaaccataaatatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttaggaaatt |
25098012 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25098013 |
ttttctattcccaggaacattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatgggcatatacattcctatcattttattcccgaaaatca |
25098112 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25098113 |
aaaattataacttgaaacaaacacaccctt |
25098142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27214082 - 27213853
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27214082 |
cctaggaaccataaaaacagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
27213983 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27213982 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
27213883 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27213882 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctt |
27213853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 33378678 - 33378914
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33378678 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
33378777 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaa--------cattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattccc |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33378778 |
ttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
33378877 |
T |
 |
| Q |
205 |
aggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33378878 |
gggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccct |
33378914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 43949089 - 43949315
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43949089 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
43949188 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatac--ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43949189 |
ttttctatttccaggaacattttatactaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
43949288 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43949289 |
acaattataacttgaaacaaacacacc |
43949315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 48313969 - 48314194
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48313969 |
aggaaccataaaaatagggattataataggaaaactatttataaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaattttt |
48314068 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48314069 |
tctattcccagaaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttctaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatcaaca |
48314168 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48314169 |
attataacttgaaacaaacacaccct |
48314194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 44565889 - 44566116
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44565889 |
cctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
44565988 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
44565989 |
ttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttaataaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttatttccggaaatca |
44566088 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44566089 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
44566116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34930694 - 34930466
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34930694 |
cctaggaaccataaaaatagggattataatagataaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
34930595 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaac-aaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatc |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34930594 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaaacataggcatatacatttctatcattttattcccaggaatc |
34930495 |
T |
 |
| Q |
212 |
aacaattataa-gttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34930494 |
aacaattataactttgaaacaaacacacc |
34930466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 38544038 - 38544265
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
38544038 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccatttttcttgagaaatt |
38544137 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
38544138 |
ttttctattcccagaaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacctgtaataaacataggcatatacattcctatcattttatttccgggaatca |
38544237 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38544238 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
38544265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25924864 - 25924634
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25924864 |
cctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccacccttttcctggggaaatt |
25924765 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatac--ccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25924764 |
ttttctattcccaggaacattttatacaaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatca |
25924665 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25924664 |
acaattataacttgaaacaaacataccctta |
25924634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38396593 - 38396370
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
38396593 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccgtgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
38396494 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38396493 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttataccaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
38396394 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
38396393 |
acaattataacttggaacaaacac |
38396370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 45448786 - 45449009
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
45448786 |
cctaggaaccataaaaataaggattataatagataaactatttatgaatttattcccctctctatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
45448885 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45448886 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatctacattcctatcattttattcccgagaatca |
45448985 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacac |
236 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45448986 |
aaaattataacttgaaacaaacac |
45449009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41632591 - 41632365
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41632591 |
cctatgaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccctttttcttgggaaatt |
41632492 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41632491 |
ttttctattcctaagaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaataaacataggcatatacatttctatcattttattctcaggaatca |
41632392 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41632391 |
acaattataacttgaaacaaacacacc |
41632365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28904413 - 28904185
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
28904413 |
cctaggaaccataaaaatatggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccctttttcttataaattt |
28904314 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
28904313 |
ttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacatttctatcattttattctcgggaatca |
28904214 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28904213 |
acaattataacttaaaacaaacacaccct |
28904185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 44820098 - 44820323
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44820098 |
cctaggaaccataaaaatagggactataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
44820197 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaa------acataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44820198 |
ttttctgttccgaggaacattttataccaaggaataaattttaataaacatgtaacaaacacatacaaatacatttctatcattttattcctgaaaatca |
44820297 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
44820298 |
acaattataacttgaaacaaacacac |
44820323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25045838 - 25045617
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
25045838 |
gaaccatgaaaatatggattataatatgtaat-tatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttacgaaaatttttc |
25045740 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
25045739 |
tattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatatatattcctatctttttatcccca-gaatcaacaaa |
25045641 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25045640 |
tataacttgaaacaaacacaccct |
25045617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48160800 - 48160590
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48160800 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttcctt-ggaaatt |
48160702 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
48160701 |
ttttctcttcccag---------------gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatacattcctatcattttattcccgggaatcaac |
48160617 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48160616 |
aattataacttgaaacaaacacaccct |
48160590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 18824007 - 18824223
Alignment:
| Q |
37 |
atagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccagga |
136 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
18824007 |
atagggattataataggtaat-tatttatgaatttattcccatctccatgg-aactttattcccacctttttccttgggaaaatttttctattcccaaaa |
18824104 |
T |
 |
| Q |
137 |
acattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca-------ttcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttga |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| |
|
|
| T |
18824105 |
acattttatacccgggaataaaatttagtgaacttgtaacaaacataggcatatatattttctatcattttattcccaaaaatcaacaaatacaacttga |
18824204 |
T |
 |
| Q |
228 |
aacaaacacacccttagtt |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18824205 |
aacaaacacacccttagtt |
18824223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37534327 - 37534105
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534327 |
taggaactataataatagggattataataagtaa-ctatttatgaatttattcacatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
37534229 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca------ttcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
37534228 |
ttctattcccataaatattttatacccggaaataaaagttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgtttttatgattttatttccaggaatctac |
37534129 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37534128 |
aattataacatgaaacaaacacac |
37534105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30686218 - 30685993
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | || |
|
|
| T |
30686218 |
cctaggaaccataaaaatagcgattataataagtaa-ctatttatgaatttattcccatctccctaggaactttattcccacctttttccttggaatttt |
30686120 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca------ttcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
30686119 |
ttttctattcccatgaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgtttttatgattttattccaacgaatct |
30686020 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30686019 |
acaattataacttgaaacaaacacacc |
30685993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 11000552 - 11000775
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
11000552 |
gaaccataaaaatagggattataataggcga-cttcatatgaatttattctcatatgcatgggaactttattcccacccttttctttgggaaaatttttc |
11000650 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc-------attcctatcattttattcccaggaatcaacaa |
216 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11000651 |
tattcccaagaatattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggctatatatatttatatcattttatttccaggaatcaacat |
11000750 |
T |
 |
| Q |
217 |
ttataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11000751 |
atataacttgaaacaaacacaccct |
11000775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41684246 - 41684021
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || || |
|
|
| T |
41684246 |
taggaaccataaaaatagagattataataggtaa-ctacatataaatttattttcatctccatgagaactttattcccactcttttctttgggcaaaatt |
41684148 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41684147 |
ttctattcccaagaacatcttatatccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataaacatatatatttctatcatattattctcaggaatcaac |
41684048 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41684047 |
aaatataacttgaaacaaacacaccct |
41684021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 45722994 - 45723160
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
45722994 |
cctagaaatcataaaaatatggattataataggtaa-ctatttatgaatttatttctattttcatgggaactttattcccaccatttttcttgggaaaat |
45723092 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45723093 |
ttttctattcccaagaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtgacaaacataggcat |
45723160 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6656692 - 6656476
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
6656692 |
gaaccaaaaaaatatagattataataggtaa-ctatttatgactttattcccatctccatgggaactttattcccatatttttcattgggaaaacttttc |
6656594 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttatacccgaata-aaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaatt |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
6656593 |
tattcccagaaacattttatactcgaaaataaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatattcatatca-tttatttccaaaaatcaacaaat |
6656495 |
T |
 |
| Q |
219 |
ataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6656494 |
ataacttgaaacaaacaca |
6656476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6656447 - 6656226
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
6656447 |
taggaaccaaaaaaatacagattataataggtaa-ctatttatgattttattcccatctccatggaaactttatttccaccctttttattgggaaaactt |
6656349 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttatacccgaata-aaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
6656348 |
ttctatttccagaaatattttatactcgaaaataaatttagtaaacttataacaaacataggtatatatattcatatcattttatttccaaaaatcaaca |
6656249 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacac |
238 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6656248 |
aatataacttgaaacaaacacac |
6656226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 45440758 - 45440979
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
126 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |
|
|
| T |
45440758 |
aaccttaaaactagggattataataggtaat-tatacatgatttttttcccatctccatgagaactttattcccactactttctttgggaaaatttttat |
45440856 |
T |
 |
| Q |
127 |
attcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggca-------ttcctatcattttattcccaggaatcaacaat |
217 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
45440857 |
attccgaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatatgcatgtatgttttttatgattttattcccaagaatctacaat |
45440956 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45440957 |
tataacttgaaacaaacacaccc |
45440979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31921950 - 31921811
Alignment:
| Q |
22 |
ctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattt |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
31921950 |
ctaggaaccataaaaatagacattataatagg---actatatatgaatttattctcatctctatgggaactttattcccacccttttctttggaaatttt |
31921854 |
T |
 |
| Q |
122 |
tttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttag |
162 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
31921853 |
tttctattcccacaaacattttatactcaggaataaaatttag |
31921811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22156401 - 22156248
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt-tttt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22156401 |
gaaccataaaaatatggattataatatgtaat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctacccttttctttgggaaattttttt |
22156303 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22156302 |
ctattcccaggaacgttttatacgcgggattaaaatttattaaacttgtaacaaa |
22156248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22212316 - 22212163
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt-tttt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22212316 |
gaaccataaaaatatggattataatatgtaat-tacatatgaacttattctcatctctatgagaactttattcctacccttttctttgggaaattttttt |
22212218 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaa |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22212217 |
ctattcccaggaacgttttatacgcgggattaaaatttattaaacttgtaacaaa |
22212163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5543354 - 5543196
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttcctt-gggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |
|
|
| T |
5543354 |
ggaaccataaaaatatggattataataggtaat-tacacatgaatttgttcccatcttcatgggaactttattcccactatttttctttgggaaaaaatt |
5543256 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttatacccga--ataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5543255 |
tctattcccaagaaagttttatacgagagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
5543196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40385854 - 40385692
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttt-tccttgggaaat |
119 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| || |
|
|
| T |
40385854 |
cctaagaaccataaaaatatggattataataggtagt-tacacatgagtttatttccatcttaatgggaactttattcccaccatttctttttgggatat |
40385756 |
T |
 |
| Q |
120 |
tttttctattcccaggaacattttat--acccgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40385755 |
tttttctattcccagaaacattttatagacaggaataaaattcagtaaacttctaacaaacata |
40385692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43446062 - 43445943
Alignment:
| Q |
69 |
tttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata--cccgaataaaatttagtaaa |
166 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43446062 |
tttattctcatctccatgagaactttattcccaccattttctttgggaaaacttttttattctcatgaacattttatattcgagaataaaatttagtaaa |
43445963 |
T |
 |
| Q |
167 |
cttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43445962 |
cttataacaaatataggcat |
43445943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38528886 - 38528767
Alignment:
| Q |
67 |
aatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagta |
164 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38528886 |
aatttattctcatcttcatgagaactttattctcacctttttctttg--atatttattctattcccaataacattttatacccaagaataaaatctagta |
38528789 |
T |
 |
| Q |
165 |
aacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38528788 |
aacttgtaacaaacataagcat |
38528767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 43569902 - 43569783
Alignment:
| Q |
30 |
cataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctatt |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||| |
|
|
| T |
43569902 |
cataaaaatagggattataatagataat-tatttatgaatttatttacatcctcatgtgaattttattcccaccctttttcttaggtaaatttttatatt |
43569804 |
T |
 |
| Q |
130 |
cccaggaacattttatacccg |
150 |
Q |
| |
|
| | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43569803 |
tcgaagaatattttatacccg |
43569783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47246281 - 47246130
Alignment:
| Q |
32 |
taaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcc |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || | ||||| |
|
|
| T |
47246281 |
taaaaatagggattataatagatagtttacacatgaatttattctcatattcatgggaactttattctcacccttttcttttaaaaaaaatt-caattcc |
47246183 |
T |
 |
| Q |
132 |
caggaacattttatacccga--ataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47246182 |
taagaacattttatacctgagaataaaattcagtaaacttgtaacaaacatag |
47246130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10902779 - 10902714
Alignment:
| Q |
119 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgaa--taaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10902779 |
ttttttctattcccaaaaacattttatatccaaaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
10902714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 239
Target Start/End: Original strand, 45723223 - 45723277
Alignment:
| Q |
185 |
attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45723223 |
attcctatcattttattctcgggaatcaacaaatataacttgaaacaaacacacc |
45723277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 181
Target Start/End: Original strand, 30871130 - 30871194
Alignment:
| Q |
119 |
ttttttctattcccaggaacattttatacccgaa--taaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30871130 |
ttttttctattcccacaaacatttgatatccgaaaataaaacttaataaacttgtaacaaacata |
30871194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 187
Target Start/End: Original strand, 31598653 - 31598689
Alignment:
| Q |
151 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatt |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
31598653 |
aataaaatttagtaaacttgtaacaaatataagcatt |
31598689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31921798 - 31921743
Alignment:
| Q |
189 |
ctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacccttagt |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31921798 |
ctatcattttatttcc-gaaatgaacaaatataacttgaaacaaacacacccttagt |
31921743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Original strand, 201769 - 202002
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201769 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaattatttatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
201868 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
201869 |
ttttctattcccaggaatattttatacccggaaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
201968 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagtt |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
201969 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctaagtt |
202002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 143458 - 143678
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
143458 |
cctaggaaccataaaattagggattataataggtaa-ctacatatgaatttattctcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgggaaatt |
143556 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaa------acataggcattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
143557 |
ttttctattcccaggaacattttatatccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacgtatacatatatatttctatcattttattctcaggaatca |
143656 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaac |
234 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
143657 |
acaaatttaacttgaaacaaac |
143678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 182
Target Start/End: Original strand, 119211 - 119327
Alignment:
| Q |
68 |
atttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaa |
165 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
119211 |
atttattctcatctgcctgaaaactttatttccacccttttctttggaaaaaattttctattcccaggaacattttatactcatgaataaaatttagtaa |
119310 |
T |
 |
| Q |
166 |
acttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
119311 |
acttgtaacaaacatag |
119327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 2657544 - 2657774
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657544 |
cctagtaatcataaaaatatggattataataggaaaattatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
2657643 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2657644 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggtatatacattcctatcattttattcccgggaatca |
2657743 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657744 |
acaattataacttgaaacaaacacaccctta |
2657774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7053805 - 7053567
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053805 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccattttccttgggaaatt |
7053706 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacatt--------ttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattccc |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053705 |
ttttctattcccaggaacattttatcattttatacccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattccc |
7053606 |
T |
 |
| Q |
205 |
aggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7053605 |
gggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctta |
7053567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7344310 - 7344078
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344310 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
7344211 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | ||| |
|
|
| T |
7344210 |
ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaatataggcatatacattcctatcattttattctcggaaattt |
7344111 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacacccttagt |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7344110 |
acaattataatttgaaacgaacacacccttagt |
7344078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 16968771 - 16968989
Alignment:
| Q |
23 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16968771 |
taggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattctcatctccataggaactttattcccacccttttccttgggaaatttt |
16968870 |
T |
 |
| Q |
123 |
ttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16968871 |
ttctattcccagaaacattttatacccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatatagattcctatcattttattctcaggaatcaac |
16968970 |
T |
 |
| Q |
215 |
aattataagttgaaacaaa |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16968971 |
aattataacttgaaacaaa |
16968989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 14170859 - 14171085
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14170859 |
cctaggaaccataaaaatagggattgtaataggtaaactatttatgaatttatt-ccatctccatgggaactttattcccacccttttcctt-ggaaatt |
14170956 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14170957 |
ttttctattcccaggaacattttatatccaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatagattcctatcattttattcccgggaatca |
14171056 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14171057 |
aaaattataacttgaaacaaacacaccct |
14171085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 1316863 - 1317089
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1316863 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatcttcatgggaactttattcccacccttttccttgggaaa-t |
1316961 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1316962 |
ttttctattcccaggaacattttatacctgggaataaaataaagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattccaatcattttattcccgggaatca |
1317061 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1317062 |
acaattataacttgaaacaaacacaccc |
1317089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 18897765 - 18897989
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897765 |
cctaggaaccataaaaataggaattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttatttccacccttttccttgggaaatt |
18897864 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||| |
|
|
| T |
18897865 |
ttttctattcccagaaacattttataccaaggaataaattttaataaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcactttatttccgggaatca |
18897964 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18897965 |
acaattataacttgaaacaaacaca |
18897989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 8029147 - 8029297
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8029147 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaaatt |
8029246 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaatttagtaaactt |
169 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8029247 |
ttttctattcccaggaacattttataccaaggaataaattttagtaaactt |
8029297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6705950 - 6705764
Alignment:
| Q |
63 |
tatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacc--cgaataaaattt |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6705950 |
tatgaaattattctcatctccatgggaactttattcccacccttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttatacctaggaataaaattt |
6705851 |
T |
 |
| Q |
161 |
agtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6705850 |
agtaaacttgtaacaaacatagacatatatatttctaccattttattccaatgaatcaacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
6705764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 346051 - 345833
Alignment:
| Q |
27 |
aaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttct |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
346051 |
aaccataaaaataggaattttaatagg-aaattactcatgaatttattctcatctccattggaactttattcccacccttttctttgggaaaaattttct |
345953 |
T |
 |
| Q |
127 |
attcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag------gcattcctatcatttta-ttcccaggaatcaacaat |
217 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| || | |
|
|
| T |
345952 |
attcctaaaaacgttttatatccgagaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagacatgtgtattcctatcattttatttcctaggaatctacgaa |
345853 |
T |
 |
| Q |
218 |
tataagttgaaacaaacaca |
237 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
345852 |
tataacttaaaacaaacaca |
345833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10246343 - 10246259
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246343 |
cctaggaaccataaaattagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccaccct |
10246259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10849961 - 10849784
Alignment:
| Q |
71 |
tattcccatctccatgggaactttattcccaccc-ttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaac |
167 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
10849961 |
tattcccatcttcatgggaactttattcccaccctttttctttgggaacatttttctattcccaggaacattttacacccaggaagaaaagttactaaac |
10849862 |
T |
 |
| Q |
168 |
ttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacc |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10849861 |
ttgtaactaatataggaagatataattctatcattttattcccaggaatctataaaaataacttgaaacaaacacacc |
10849784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 243
Target Start/End: Original strand, 8029316 - 8029407
Alignment:
| Q |
158 |
tttagtaaacttgtaacaaacataggcat------tcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctta |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8029316 |
tttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacatttctatcattttattcccgggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccctta |
8029407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 248
Target Start/End: Original strand, 3869391 - 3869584
Alignment:
| Q |
62 |
ttatgaatttattcccatctccatgggaactttattc---ccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttatacccgaataaaat |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
3869391 |
ttatgaatttattctcatcttcgtgggaactttattctcaccaccattttctttgggaaaacttttctattccattgaacattttatgcc--aataaaat |
3869488 |
T |
 |
| Q |
159 |
ttagtaaacttgtaacaaacataggcattc------ctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacacccttagttat |
248 |
Q |
| |
|
||| | ||| | |||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3869489 |
ttaatgaacatttaacaaacgtagtaatacatatttctatcattttattcccagaaatctacaaaaataacttgaaacaaacacacccttagttat |
3869584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21008208 - 21008035
Alignment:
| Q |
63 |
tatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattt--tatacccgaataaaattt |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| | | | ||||||||||| |
|
|
| T |
21008208 |
tatgaatttattcccatctctatgagaactttattcccacctttttgtttga-attttttttctattcccaagaacatttcatgttcgggaataaaattt |
21008110 |
T |
 |
| Q |
161 |
agtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaa |
229 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
21008109 |
agtaaacctgtaacaaatagaggcatatatatttttatcattttattcccagaaatcaacaaatataacttgaaa |
21008035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14781833 - 14781685
Alignment:
| Q |
25 |
ggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatttttt |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
14781833 |
ggaaccataaaagtaggatttataataggtaat-tactcatgaatttattcccatctcct----aactt-----ccacccttttcttttggaaaaaattt |
14781744 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14781743 |
ctattcccatgagcattttatacctaggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
14781685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9760497 - 9760430
Alignment:
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttatacccg--aataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9760497 |
ttttctattctcatgaacattttatatcctgaaataaaatttagtaaacttataacaaaaataggcat |
9760430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 181
Target Start/End: Original strand, 8314888 - 8314919
Alignment:
| Q |
150 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
181 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314888 |
gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacata |
8314919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10246256 - 10246222
Alignment:
| Q |
206 |
ggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccc |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10246256 |
ggaatcaacaattataacttgaaacaaacacaccc |
10246222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 56
Target Start/End: Original strand, 8314741 - 8314773
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaa |
56 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8314741 |
aggaaccttaaaaatagggattataataggtaa |
8314773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29179 - 28957
Alignment:
| Q |
21 |
cctaggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaatt |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29179 |
cctaggaattataaaaatagggattataataggaaaactatttatgaatttattctcatttccatgggaactttattcccacccttttccttgagaaatt |
29080 |
T |
 |
| Q |
121 |
ttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatca |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29079 |
ttttctattcccaggaacattttatacccgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatacattcctatcattttattcccgaaaatca |
28980 |
T |
 |
| Q |
213 |
acaattataagttgaaacaaaca |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28979 |
acaattataacttgaaacaaaca |
28957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0662 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:
Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 4314 - 4540
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaa----actatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaat |
119 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
4314 |
aggaaccttaaaaatagggaatataataggtaattacactattaat---tttattttcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgagaaaa |
4410 |
T |
 |
| Q |
120 |
tttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||| |
|
|
| T |
4411 |
cttttctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattttattcctagaaatc |
4510 |
T |
 |
| Q |
212 |
aacaattataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4511 |
tacaaatataacttgaaacaaacacaccct |
4540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0702 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:
Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3788 - 3564
Alignment:
| Q |
24 |
aggaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |
|
|
| T |
3788 |
aggaaccttaaaaatagggaatataataggtaat-tacacataattttattttcatctccatgggaactttattcccaccattttctttgagaaaacttt |
3690 |
T |
 |
| Q |
124 |
tctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggc------attcctatcattttattcccaggaatcaaca |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
3689 |
tctattcccaggaacattttatactcgggaataaaatttagtaaacttgtaacaaacataggcatatatatttttataattttattcctagaaatctaca |
3590 |
T |
 |
| Q |
216 |
attataagttgaaacaaacacaccct |
241 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3589 |
aatataacttgaaacaaacacaccct |
3564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0238 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:
Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23517 - 23360
Alignment:
| Q |
26 |
gaaccataaaaatagggattataataggtaaactatttatgaatttattcccatctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttc |
125 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
23517 |
gaaccttaaaaatagggattataataggtagt-tacacatgaatttattttcatcttcatggaaactttattcccaccgttttctttggaaaaaaattta |
23419 |
T |
 |
| Q |
126 |
tattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23418 |
tattcccaggaatattttatactcgtgaataaaatttagtaaacttgtaacaaacatag |
23360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1480 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1480
Description:
Target: scaffold1480; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 556 - 383
Alignment:
| Q |
77 |
catctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttata--cccgaataaaatttagtaaacttgtaac |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
556 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttctttgggaatgttatttcattcccaggaacattttatatttaggaataaaatttaataaacttgcaac |
457 |
T |
 |
| Q |
175 |
aaacatagg------cattcctatcattttattcccaggaatcaacaattataagttgaaacaaacacaccctt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
456 |
aaacataggaatgcatatttccatcattctatttccaggaatttacaaagataacttgaaacaaacacaccctt |
383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0069 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:
Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21961 - 21853
Alignment:
| Q |
77 |
catctccatgggaactttattcccacccttttccttgggaaattttttctattcccaggaacattttataccc--gaataaaatttagtaaacttgtaac |
174 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21961 |
catcttcatgggaactttattcccacaattttttttgggaatgttatttcatacccaggaacattttatatctaggaataaaatttaataaacttgcaac |
21862 |
T |
 |
| Q |
175 |
aaacatagg |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
21861 |
aaacatagg |
21853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University