View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18597_low_9 (Length: 498)

Name: NF18597_low_9
Description: NF18597
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18597_low_9
NF18597_low_9
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (1-479)||(12497802-12498280)
chr3 (1-480)||(17489404-17489883)
chr3 (1-479)||(14876597-14877075)
chr3 (1-480)||(9522273-9522752)
chr3 (1-480)||(16492278-16492757)
chr3 (1-480)||(16370967-16371446)
chr3 (1-479)||(16807024-16807502)
chr3 (1-480)||(16691714-16692193)
chr3 (10-479)||(10905773-10906242)
chr3 (10-479)||(10005163-10005632)
chr3 (10-479)||(15589490-15589959)
chr3 (1-480)||(15208445-15208924)
chr3 (4-479)||(15348343-15348818)
chr3 (10-479)||(16635336-16635805)
chr3 (10-479)||(20062152-20062621)
chr3 (10-479)||(43162660-43163129)
chr3 (10-479)||(48425010-48425479)
chr3 (4-476)||(15402611-15403083)
chr3 (7-479)||(53385116-53385588)
chr3 (4-476)||(15338826-15339298)
chr3 (4-479)||(15725032-15725506)
chr3 (4-479)||(16412380-16412855)
chr3 (5-479)||(26792497-26792971)
chr3 (10-479)||(13252253-13252722)
chr3 (4-479)||(6600304-6600779)
chr3 (4-479)||(5425028-5425502)
chr3 (25-472)||(15247725-15248172)
chr3 (4-479)||(16756683-16757158)
chr3 (16-455)||(15227228-15227667)
chr3 (25-458)||(13972228-13972661)
chr3 (137-480)||(15015841-15016184)
chr3 (34-479)||(15953055-15953500)
chr3 (25-458)||(14086261-14086694)
chr3 (61-479)||(12850366-12850784)
chr3 (1-302)||(14571412-14571713)
chr3 (13-302)||(47123520-47123809)
chr3 (1-440)||(10383533-10383972)
chr3 (16-449)||(13322769-13323202)
chr3 (16-306)||(18134606-18134896)
chr3 (34-480)||(8759168-8759614)
chr3 (34-480)||(41177119-41177565)
chr3 (52-315)||(10420296-10420559)
chr3 (34-480)||(13941621-13942067)
chr3 (13-302)||(16329923-16330212)
chr3 (16-325)||(11304014-11304323)
chr3 (16-455)||(12360653-12361092)
chr3 (157-455)||(8274521-8274819)
chr3 (13-452)||(11961148-11961587)
chr3 (111-455)||(16836621-16836965)
chr3 (34-323)||(16381173-16381459)
chr3 (157-455)||(16742825-16743123)
chr3 (52-480)||(44776862-44777290)
chr3 (157-323)||(15576470-15576636)
chr3 (173-450)||(18748401-18748678)
chr3 (235-455)||(17192892-17193112)
chr3 (157-323)||(13975299-13975465)
chr3 (258-447)||(6712539-6712728)
chr3 (16-142)||(31945051-31945177)
chr3 (16-140)||(31689049-31689173)
chr3 (373-480)||(4678374-4678481)
chr3 (346-473)||(13001818-13001945)
chr3 (406-479)||(11564779-11564852)
chr3 (157-422)||(6153006-6153259)
chr3 (173-356)||(21686681-21686864)
chr3 (373-455)||(13975167-13975249)
chr3 (296-458)||(14183031-14183193)
chr3 (373-458)||(26009101-26009186)
chr3 (427-479)||(14126692-14126744)
chr3 (373-437)||(15576686-15576750)
chr3 (366-440)||(28754247-28754321)
chr3 (211-323)||(267512-267624)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (1-479)||(23573609-23574087)
chr5 (1-480)||(21984345-21984824)
chr5 (1-480)||(25423056-25423535)
chr5 (1-479)||(23516408-23516886)
chr5 (1-480)||(18775644-18776123)
chr5 (1-460)||(23440092-23440551)
chr5 (4-479)||(14999780-15000255)
chr5 (33-479)||(20798659-20799105)
chr5 (10-479)||(40708656-40709125)
chr5 (4-479)||(19769830-19770305)
chr5 (4-479)||(22332928-22333403)
chr5 (4-479)||(27610224-27610699)
chr5 (4-479)||(22134538-22135013)
chr5 (4-479)||(27668531-27669006)
chr5 (10-479)||(34566370-34566839)
chr5 (4-479)||(27685441-27685916)
chr5 (4-479)||(37291537-37292012)
chr5 (10-479)||(16356378-16356847)
chr5 (4-479)||(27518277-27518752)
chr5 (4-460)||(41770712-41771168)
chr5 (23-479)||(22348314-22348768)
chr5 (12-479)||(26738746-26739213)
chr5 (1-473)||(23471096-23471568)
chr5 (4-479)||(29476114-29476589)
chr5 (77-480)||(21498076-21498479)
chr5 (11-479)||(20468137-20468605)
chr5 (1-239)||(20573388-20573626)
chr5 (210-479)||(21339327-21339596)
chr5 (10-212)||(21343666-21343868)
chr5 (16-479)||(21890800-21891263)
chr5 (16-455)||(24749619-24750058)
chr5 (16-455)||(24735676-24736115)
chr5 (35-479)||(21564014-21564451)
chr5 (13-480)||(21404715-21405168)
chr5 (25-395)||(23442418-23442788)
chr5 (16-439)||(22461816-22462239)
chr5 (16-294)||(24737011-24737289)
chr5 (52-306)||(28923982-28924236)
chr5 (13-302)||(37545714-37546004)
chr5 (13-302)||(14887209-14887498)
chr5 (52-306)||(28895156-28895410)
chr5 (13-302)||(25847936-25848225)
chr5 (13-302)||(20342143-20342432)
chr5 (13-302)||(24798615-24798904)
chr5 (16-306)||(22236134-22236424)
chr5 (52-317)||(20773660-20773925)
chr5 (13-302)||(22502540-22502829)
chr5 (13-302)||(22381060-22381349)
chr5 (13-260)||(21662300-21662546)
chr5 (13-302)||(23080307-23080596)
chr5 (52-306)||(20821353-20821607)
chr5 (34-480)||(17269373-17269819)
chr5 (34-260)||(21665761-21665986)
chr5 (157-458)||(11210756-11211057)
chr5 (265-479)||(21831784-21831998)
chr5 (157-455)||(24581216-24581514)
chr5 (157-323)||(21937385-21937551)
chr5 (157-455)||(27011089-27011387)
chr5 (173-421)||(23503464-23503712)
chr5 (13-86)||(21625397-21625470)
chr5 (177-325)||(25244547-25244695)
chr5 (177-325)||(25308699-25308847)
chr5 (381-455)||(21229238-21229312)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (1-479)||(65372-65849)
scaffold0042 (1-206)||(39924-40129)
scaffold0042 (254-460)||(39700-39906)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (1-479)||(15533381-15533859)
chr8 (1-479)||(19977968-19978446)
chr8 (1-479)||(30313446-30313924)
chr8 (1-479)||(32600145-32600623)
chr8 (1-479)||(21166839-21167317)
chr8 (3-473)||(23650044-23650514)
chr8 (1-479)||(16408347-16408825)
chr8 (1-480)||(21250943-21251421)
chr8 (1-480)||(21788660-21789138)
chr8 (1-480)||(21922036-21922515)
chr8 (1-479)||(22133343-22133821)
chr8 (1-479)||(22164493-22164971)
chr8 (1-480)||(21394166-21394645)
chr8 (12-479)||(22046385-22046852)
chr8 (4-479)||(17674325-17674800)
chr8 (10-480)||(19112700-19113170)
chr8 (4-479)||(20018052-20018527)
chr8 (4-479)||(19485172-19485647)
chr8 (4-479)||(22120476-22120951)
chr8 (1-453)||(22987202-22987654)
chr8 (1-307)||(22032033-22032339)
chr8 (13-479)||(20396427-20396893)
chr8 (1-239)||(15441182-15441420)
chr8 (145-473)||(22377762-22378089)
chr8 (145-473)||(22383937-22384264)
chr8 (11-273)||(23948900-23949162)
chr8 (34-455)||(20388133-20388554)
chr8 (16-479)||(19851427-19851890)
chr8 (16-479)||(19857463-19857926)
chr8 (16-479)||(23654943-23655406)
chr8 (16-479)||(20010202-20010665)
chr8 (16-411)||(20007866-20008261)
chr8 (35-302)||(21681949-21682216)
chr8 (16-455)||(21840433-21840872)
chr8 (13-302)||(6679124-6679413)
chr8 (16-480)||(1266255-1266718)
chr8 (276-479)||(18856853-18857056)
chr8 (13-302)||(804152-804441)
chr8 (13-440)||(6603671-6604098)
chr8 (16-302)||(22061912-22062198)
chr8 (34-480)||(31571143-31571589)
chr8 (13-302)||(14565155-14565444)
chr8 (238-479)||(23949158-23949398)
chr8 (16-302)||(21324888-21325175)
chr8 (13-302)||(29303905-29304194)
chr8 (16-298)||(31416957-31417239)
chr8 (13-302)||(12304771-12305060)
chr8 (303-479)||(22040162-22040338)
chr8 (13-272)||(16265127-16265386)
chr8 (13-275)||(28982370-28982632)
chr8 (13-275)||(28987590-28987852)
chr8 (157-455)||(21196828-21197126)
chr8 (157-458)||(20652656-20652957)
chr8 (155-455)||(22051018-22051318)
chr8 (157-455)||(16877421-16877719)
chr8 (13-210)||(27347239-27347436)
chr8 (173-455)||(22315364-22315646)
chr8 (157-455)||(21850663-21850961)
chr8 (157-323)||(22982593-22982759)
chr8 (258-455)||(23157337-23157534)
chr8 (160-343)||(24818054-24818237)
chr8 (176-325)||(25282307-25282456)
chr8 (166-449)||(19863223-19863506)
chr8 (166-449)||(19867860-19868143)
chr8 (373-479)||(20975953-20976059)
chr8 (233-322)||(22283229-22283318)
chr8 (373-422)||(22982807-22982856)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (1-479)||(21325665-21326143)
chr2 (1-480)||(24675055-24675534)
chr2 (1-479)||(22756864-22757340)
chr2 (1-479)||(24707881-24708359)
chr2 (22-480)||(23063664-23064122)
chr2 (1-479)||(23188574-23189051)
chr2 (10-479)||(16924835-16925304)
chr2 (10-479)||(16998575-16999044)
chr2 (4-479)||(21145429-21145904)
chr2 (10-479)||(16981727-16982196)
chr2 (10-479)||(17063292-17063761)
chr2 (4-479)||(24261939-24262414)
chr2 (4-479)||(24878394-24878869)
chr2 (4-479)||(44385968-44386443)
chr2 (10-479)||(9609711-9610180)
chr2 (10-476)||(27217591-27218057)
chr2 (4-479)||(22325255-22325730)
chr2 (4-479)||(24709602-24710077)
chr2 (4-479)||(27370838-27371313)
chr2 (10-479)||(10868425-10868894)
chr2 (10-479)||(17066953-17067419)
chr2 (1-309)||(23138603-23138911)
chr2 (1-309)||(23550393-23550701)
chr2 (1-248)||(27377101-27377348)
chr2 (97-479)||(24825681-24826063)
chr2 (11-479)||(23087026-23087494)
chr2 (13-480)||(30211315-30211782)
chr2 (18-460)||(45529100-45529536)
chr2 (49-458)||(27365499-27365908)
chr2 (13-302)||(31830236-31830525)
chr2 (13-302)||(11358450-11358739)
chr2 (16-479)||(23276357-23276820)
chr2 (13-302)||(20832563-20832852)
chr2 (4-175)||(41609047-41609218)
chr2 (16-302)||(23293539-23293825)
chr2 (13-302)||(1063329-1063618)
chr2 (34-480)||(27787340-27787786)
chr2 (332-479)||(41608784-41608931)
chr2 (157-455)||(22276001-22276299)
chr2 (52-480)||(12573970-12574398)
chr2 (36-275)||(24653946-24654185)
chr2 (34-206)||(24944966-24945138)
chr2 (175-419)||(25128387-25128631)
chr2 (157-455)||(12640342-12640640)
chr2 (157-437)||(24831628-24831908)
chr2 (13-95)||(24833356-24833438)
chr2 (258-319)||(27368391-27368452)
chr2 (235-455)||(23817476-23817696)
chr2 (173-455)||(22761992-22762274)
chr2 (173-323)||(24570223-24570373)
chr2 (1-42)||(45676685-45676726)
chr2 (1-41)||(23599837-23599877)
chr2 (256-323)||(14708908-14708975)
chr2 (373-455)||(19652472-19652554)
chr2 (173-221)||(23817750-23817798)
chr2 (173-221)||(28144701-28144749)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (1-479)||(17044946-17045424)
chr1 (1-480)||(20249800-20250279)
chr1 (4-479)||(19106320-19106795)
chr1 (1-480)||(20136728-20137207)
chr1 (1-459)||(21747485-21747942)
chr1 (1-480)||(50620174-50620653)
chr1 (1-479)||(16078583-16079042)
chr1 (16-479)||(16350530-16350993)
chr1 (4-479)||(33390960-33391435)
chr1 (4-479)||(51333424-51333899)
chr1 (4-476)||(21830256-21830728)
chr1 (4-479)||(21836903-21837378)
chr1 (4-479)||(41354400-41354875)
chr1 (11-479)||(19760797-19761265)
chr1 (21-480)||(16369267-16369726)
chr1 (1-224)||(50612602-50612825)
chr1 (16-306)||(19664980-19665270)
chr1 (34-302)||(20940171-20940439)
chr1 (1-152)||(21163230-21163381)
chr1 (13-302)||(37677041-37677331)
chr1 (16-306)||(19854279-19854569)
chr1 (13-302)||(20294374-20294663)
chr1 (13-302)||(31550289-31550578)
chr1 (16-305)||(20856866-20857155)
chr1 (16-320)||(22433206-22433510)
chr1 (61-479)||(20835819-20836240)
chr1 (13-302)||(20075167-20075456)
chr1 (117-302)||(41307891-41308076)
chr1 (133-302)||(11382676-11382845)
chr1 (34-288)||(20244183-20244437)
chr1 (157-323)||(20831479-20831645)
chr1 (157-450)||(20914316-20914609)
chr1 (157-323)||(46518827-46518993)
chr1 (13-209)||(20395194-20395390)
chr1 (173-325)||(21202372-21202524)
chr1 (212-422)||(22135546-22135756)
chr1 (13-92)||(24476942-24477021)
chr1 (157-219)||(22142232-22142294)
chr1 (233-317)||(20184364-20184448)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-480)||(5989-6468)
scaffold0120 (34-455)||(1410-1831)
scaffold0120 (157-421)||(22816-23080)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-479)||(16252044-16252522)
chr4 (4-480)||(12523614-12524090)
chr4 (4-479)||(14680505-14680980)
chr4 (1-479)||(16355044-16355522)
chr4 (1-480)||(7090368-7090846)
chr4 (1-479)||(18227045-18227523)
chr4 (10-479)||(18297149-18297618)
chr4 (4-479)||(19778392-19778867)
chr4 (10-479)||(12476544-12477013)
chr4 (4-479)||(14266498-14266973)
chr4 (4-479)||(14303577-14304051)
chr4 (16-479)||(27711286-27711749)
chr4 (13-479)||(14652255-14652721)
chr4 (10-479)||(8386356-8386825)
chr4 (10-479)||(23955691-23956160)
chr4 (10-479)||(29039003-29039472)
chr4 (1-473)||(14159427-14159899)
chr4 (4-479)||(40472978-40473453)
chr4 (15-479)||(14850965-14851429)
chr4 (4-479)||(8053222-8053697)
chr4 (31-325)||(15149759-15150053)
chr4 (10-263)||(15364330-15364583)
chr4 (16-479)||(15003223-15003686)
chr4 (13-479)||(15070360-15070826)
chr4 (210-480)||(1640023-1640293)
chr4 (1-186)||(14927151-14927336)
chr4 (166-479)||(15414885-15415198)
chr4 (13-302)||(3264830-3265119)
chr4 (13-302)||(11207267-11207556)
chr4 (16-449)||(15245874-15246307)
chr4 (13-302)||(29453573-29453862)
chr4 (16-302)||(16145862-16146148)
chr4 (201-364)||(16676417-16676580)
chr4 (13-302)||(44661902-44662191)
chr4 (16-302)||(1649313-1649599)
chr4 (13-302)||(20890930-20891218)
chr4 (13-302)||(33222865-33223154)
chr4 (34-480)||(51606039-51606485)
chr4 (115-440)||(15358988-15359313)
chr4 (159-449)||(55375247-55375537)
chr4 (339-479)||(15147483-15147623)
chr4 (157-455)||(13247736-13248034)
chr4 (157-455)||(15293040-15293338)
chr4 (256-479)||(15077825-15078048)
chr4 (157-455)||(9290926-9291224)
chr4 (139-455)||(27900459-27900775)
chr4 (157-455)||(14997407-14997705)
chr4 (226-479)||(8706078-8706331)
chr4 (4-85)||(18607823-18607904)
chr4 (173-455)||(12132293-12132574)
chr4 (157-323)||(16445227-16445393)
chr4 (138-302)||(16752665-16752829)
chr4 (34-245)||(42702871-42703082)
chr4 (133-325)||(9849491-9849683)
chr4 (53-195)||(18164332-18164474)
chr4 (173-450)||(12342751-12343028)
chr4 (16-108)||(15415209-15415301)
chr4 (173-325)||(16685361-16685513)
chr4 (16-131)||(15319533-15319648)
chr4 (373-455)||(1649160-1649242)
chr4 (166-220)||(18550180-18550234)
chr4 (1-30)||(15351934-15351963)
chr4 (16-68)||(15359327-15359379)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (1-460)||(25765313-25765771)
chr6 (1-479)||(12497825-12498303)
chr6 (1-479)||(12510598-12511076)
chr6 (1-497)||(22762441-22762937)
chr6 (1-479)||(19864486-19864964)
chr6 (1-472)||(25609872-25610343)
chr6 (1-473)||(16963377-16963849)
chr6 (1-472)||(22078701-22079170)
chr6 (1-479)||(12505154-12505632)
chr6 (1-480)||(18407945-18408425)
chr6 (1-460)||(27331456-27331915)
chr6 (1-460)||(27392196-27392655)
chr6 (4-479)||(1543088-1543563)
chr6 (1-458)||(16927665-16928122)
chr6 (4-479)||(24313172-24313647)
chr6 (4-479)||(28263201-28263676)
chr6 (4-479)||(28341950-28342425)
chr6 (10-479)||(29591924-29592393)
chr6 (1-473)||(23078268-23078740)
chr6 (4-479)||(16626721-16627196)
chr6 (4-479)||(2874807-2875282)
chr6 (4-479)||(25112354-25112829)
chr6 (4-480)||(28292375-28292851)
chr6 (4-479)||(27187238-27187713)
chr6 (4-479)||(27261527-27262002)
chr6 (1-479)||(5839223-5839701)
chr6 (1-292)||(21833172-21833463)
chr6 (24-422)||(18197608-18198006)
chr6 (4-222)||(17032364-17032582)
chr6 (13-479)||(21471412-21471878)
chr6 (34-479)||(25768023-25768468)
chr6 (260-479)||(22433927-22434146)
chr6 (16-293)||(25750623-25750900)
chr6 (52-458)||(34645611-34646017)
chr6 (70-460)||(15459204-15459594)
chr6 (49-301)||(14131361-14131613)
chr6 (35-479)||(22796636-22797080)
chr6 (16-458)||(19879112-19879554)
chr6 (52-458)||(11280530-11280936)
chr6 (1-135)||(22433796-22433930)
chr6 (52-401)||(11287680-11288029)
chr6 (16-458)||(18794504-18794946)
chr6 (13-302)||(10469030-10469319)
chr6 (25-458)||(21564157-21564590)
chr6 (13-302)||(24364223-24364512)
chr6 (145-480)||(1640715-1641050)
chr6 (81-302)||(17415365-17415586)
chr6 (52-455)||(27560645-27561048)
chr6 (16-302)||(8766329-8766615)
chr6 (208-308)||(11291818-11291918)
chr6 (157-455)||(25743116-25743413)
chr6 (52-480)||(28282816-28283244)
chr6 (157-419)||(16098005-16098267)
chr6 (157-455)||(16382401-16382699)
chr6 (100-479)||(14381471-14381850)
chr6 (156-280)||(25750900-25751024)
chr6 (173-455)||(1648812-1649094)
chr6 (157-455)||(15078392-15078690)
chr6 (157-455)||(23996203-23996501)
chr6 (130-419)||(18800870-18801159)
chr6 (157-455)||(18837936-18838234)
chr6 (173-422)||(21412999-21413248)
chr6 (173-455)||(18571622-18571904)
chr6 (175-320)||(25655456-25655601)
chr6 (160-455)||(16233167-16233462)
chr6 (16-123)||(18787702-18787809)
chr6 (16-113)||(1640613-1640710)
chr6 (373-449)||(19453591-19453667)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-479)||(14326-14804)
scaffold0044 (4-479)||(589-1064)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-480)||(642-1121)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (1-479)||(17184-17662)
chr7 (4-479)||(11552970-11553445)
chr7 (4-479)||(12687428-12687903)
chr7 (1-480)||(15154524-15154998)
chr7 (4-479)||(14954547-14955022)
chr7 (4-479)||(8707532-8708007)
chr7 (4-479)||(15160925-15161400)
chr7 (4-479)||(10870922-10871397)
chr7 (10-479)||(8198561-8199030)
chr7 (4-479)||(11237081-11237556)
chr7 (4-479)||(18177669-18178144)
chr7 (1-479)||(14332321-14332799)
chr7 (4-460)||(18551645-18552101)
chr7 (10-479)||(44791219-44791688)
chr7 (4-479)||(13685990-13686466)
chr7 (4-479)||(23516637-23517112)
chr7 (1-353)||(14037731-14038083)
chr7 (1-353)||(14347761-14348113)
chr7 (12-479)||(15203814-15204281)
chr7 (64-479)||(15624539-15624954)
chr7 (16-479)||(12206646-12207109)
chr7 (16-479)||(19147151-19147614)
chr7 (16-479)||(20746550-20747013)
chr7 (16-479)||(14264090-14264553)
chr7 (13-476)||(21661900-21662360)
chr7 (181-480)||(35964717-35965016)
chr7 (16-479)||(15102449-15102910)
chr7 (16-479)||(11388274-11388736)
chr7 (256-479)||(9596236-9596459)
chr7 (16-479)||(16072140-16072603)
chr7 (226-480)||(11772108-11772362)
chr7 (16-302)||(8212151-8212437)
chr7 (13-302)||(11306286-11306575)
chr7 (13-440)||(49152238-49152665)
chr7 (34-480)||(16950316-16950762)
chr7 (34-480)||(18053798-18054244)
chr7 (34-480)||(23199588-23200034)
chr7 (34-480)||(23505715-23506161)
chr7 (13-452)||(13021294-13021733)
chr7 (16-306)||(13665493-13665778)
chr7 (173-455)||(14936443-14936725)
chr7 (16-480)||(14129813-14130277)
chr7 (16-480)||(14433631-14434095)
chr7 (34-480)||(14286221-14286667)
chr7 (13-302)||(12455640-12455928)
chr7 (34-299)||(6413469-6413734)
chr7 (49-302)||(26288060-26288312)
chr7 (157-323)||(4440008-4440174)
chr7 (157-323)||(7823980-7824146)
chr7 (157-323)||(27107798-27107964)
chr7 (34-455)||(1277-1698)
chr7 (367-473)||(14039986-14040092)
chr7 (367-473)||(14350016-14350122)
chr7 (173-323)||(15364036-15364186)
chr7 (157-323)||(12368600-12368766)
chr7 (118-300)||(26118630-26118812)
chr7 (157-318)||(21674562-21674723)
chr7 (175-419)||(12193654-12193898)
chr7 (173-320)||(45146652-45146798)
chr7 (1-59)||(12254326-12254384)
chr7 (34-149)||(15340454-15340569)
chr7 (175-323)||(13378796-13378944)
chr7 (166-353)||(41140-41327)
chr7 (172-323)||(20466877-20467028)
chr7 (13-92)||(26118817-26118896)
chr7 (173-323)||(13353247-13353397)
chr7 (52-140)||(15479323-15479411)
chr7 (177-323)||(17145282-17145428)
chr7 (237-302)||(12456940-12457005)
chr7 (157-320)||(17923760-17923924)
chr7 (235-302)||(15340590-15340657)
chr7 (233-422)||(5432524-5432710)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-480)||(4266-4745)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-480)||(8562-9041)
scaffold0109 (1-480)||(33434-33913)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-460)||(278711-279170)
scaffold0005 (13-479)||(164571-165037)
scaffold0005 (4-357)||(308628-308981)
scaffold0005 (16-455)||(260289-260728)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (5-480)||(555-1029)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (11-480)||(6348-6817)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (1-480)||(1105-1584)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-480)||(5187-5666)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-480)||(229009-229488)
scaffold0012 (1-470)||(219288-219757)
scaffold0012 (157-421)||(32917-33179)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-480)||(5980-6459)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-460)||(14005-14464)
scaffold0106 (253-478)||(17660-17884)
scaffold0106 (16-479)||(31391-31854)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-479)||(63893-64371)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-472)||(9309-9780)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-480)||(127060-127539)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (4-479)||(109673-110148)
scaffold0029 (16-455)||(112540-112979)
scaffold0029 (52-305)||(96038-96291)
scaffold0029 (370-455)||(95888-95973)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (4-479)||(43123-43598)
scaffold0028 (4-479)||(8454-8929)
scaffold0028 (25-458)||(50397-50830)
scaffold0028 (201-330)||(13832-13961)
scaffold0028 (337-479)||(15249-15391)
scaffold0028 (157-323)||(106591-106757)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (4-479)||(7346-7821)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-480)||(32613-33092)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-473)||(691-1162)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (5-479)||(180187-180661)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (4-479)||(383-858)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (4-476)||(6906-7380)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-479)||(16953-17431)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (99-479)||(7854-8234)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (48-480)||(49506-49938)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-480)||(14843-15322)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-479)||(448025-448503)
scaffold0001 (1-318)||(162079-162396)
scaffold0001 (34-478)||(90795-91239)
scaffold0001 (157-323)||(78647-78813)
scaffold0001 (124-199)||(175352-175427)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (100-479)||(21932-22311)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-431)||(16375-16805)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (11-479)||(14941-15409)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (10-479)||(26395-26864)
scaffold0011 (16-440)||(195604-196027)
scaffold0011 (16-302)||(148551-148837)
scaffold0011 (16-206)||(68575-68765)
scaffold0011 (157-422)||(121869-122134)
scaffold0011 (258-455)||(180147-180344)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-480)||(971-1444)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-473)||(3998-4469)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (10-473)||(3115-3578)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (11-479)||(111997-112465)
scaffold0004 (13-478)||(203331-203796)
scaffold0004 (13-479)||(385797-386263)
scaffold0004 (16-479)||(117549-118012)
scaffold0004 (34-306)||(322703-322975)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (34-479)||(1-446)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (13-479)||(886-1352)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-356)||(15459-15813)
scaffold0333 (212-480)||(15832-16100)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (13-479)||(25581-26047)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-470)||(16287-16756)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-299)||(27933-28231)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (1-297)||(26-322)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (13-479)||(116767-117233)
scaffold0037 (157-422)||(98137-98402)
scaffold0037 (157-254)||(23553-23650)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (11-395)||(206-590)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (11-460)||(12858-13307)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (136-479)||(642-985)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (160-479)||(7522-7841)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (13-480)||(5452-5918)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (13-479)||(24933-25399)
scaffold0234 (140-301)||(16211-16372)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (112-480)||(9047-9415)
scaffold0507 (1-110)||(6943-7052)
scaffold0507 (157-320)||(354-517)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (16-455)||(10626-11064)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (13-480)||(86365-86832)
scaffold0007 (338-479)||(46531-46672)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-220)||(16923-17142)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (25-479)||(26132-26586)
scaffold0192 (370-479)||(26859-26968)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (34-479)||(3874-4319)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (34-479)||(5776-6220)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (34-479)||(47123-47568)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (16-479)||(9779-10237)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (34-479)||(51725-52170)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (16-458)||(18830-19272)
scaffold0090 (118-458)||(23094-23434)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (34-479)||(28630-29076)
scaffold0064 (34-479)||(40621-41067)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (25-416)||(6961-7352)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (16-479)||(18399-18862)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (25-458)||(33560-33993)
scaffold0076 (157-323)||(40380-40546)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (43-479)||(4758-5194)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (16-455)||(27500-27939)
scaffold0139 (16-479)||(1011-1473)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (16-455)||(13787-14226)
scaffold0034 (70-306)||(4988-5224)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (25-479)||(21533-21987)
scaffold0235 (233-455)||(26004-26226)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (16-455)||(9969-10408)
[»] scaffold0058 (5 HSPs)
scaffold0058 (79-302)||(58445-58668)
scaffold0058 (35-302)||(19120-19387)
scaffold0058 (173-325)||(74038-74190)
scaffold0058 (13-68)||(59045-59100)
scaffold0058 (373-455)||(19458-19540)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (16-479)||(48895-49358)
scaffold0053 (16-480)||(57678-58141)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (235-488)||(4307-4560)
scaffold0023 (44-199)||(4567-4722)
scaffold0023 (1-113)||(36974-37086)
scaffold0023 (253-480)||(58972-59199)
scaffold0023 (34-86)||(18993-19045)
scaffold0023 (425-480)||(130538-130593)
scaffold0023 (425-480)||(134632-134687)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (16-479)||(509-972)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (25-302)||(19973-20250)
scaffold0298 (16-306)||(13396-13686)
scaffold0298 (16-306)||(17166-17456)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (286-479)||(12738-12931)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (34-419)||(4924-5309)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (34-479)||(37201-37646)
scaffold0026 (115-317)||(38198-38400)
scaffold0026 (115-302)||(27376-27563)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (16-302)||(79-365)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (16-302)||(14067-14352)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (34-302)||(2750-3018)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (25-302)||(1208-1485)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (16-458)||(6164-6607)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (16-455)||(27207-27645)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (16-306)||(172-462)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (16-306)||(10869-11159)
scaffold0124 (25-306)||(434-715)
scaffold0124 (157-455)||(7696-7994)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (16-302)||(39720-40006)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (16-317)||(14275-14576)
scaffold0203 (16-179)||(9039-9202)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (16-302)||(3872-4158)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (16-302)||(25904-26190)
scaffold0113 (13-302)||(16654-16943)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (16-302)||(49246-49532)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (13-302)||(16752-17041)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (1-302)||(38926-39227)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (16-455)||(61099-61538)
scaffold0067 (34-455)||(67487-67908)
scaffold0067 (16-455)||(52065-52504)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (16-455)||(42219-42658)
scaffold0010 (16-455)||(47285-47724)
scaffold0010 (137-215)||(2252-2330)
scaffold0010 (62-95)||(2210-2243)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (25-243)||(1167-1385)
scaffold0165 (1-64)||(26198-26261)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (332-480)||(1562-1710)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (317-480)||(6331-6494)
scaffold0358 (1-95)||(6239-6333)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (16-317)||(20103-20404)
scaffold0114 (1-320)||(43471-43790)
scaffold0114 (1-320)||(44483-44802)
scaffold0114 (16-199)||(36036-36219)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (34-480)||(12642-13088)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (13-302)||(26239-26528)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (157-455)||(46276-46574)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (34-302)||(248612-248880)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (159-450)||(23518-23809)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (157-455)||(1916-2214)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (250-364)||(3696-3810)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (157-450)||(277-570)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (16-245)||(4235-4464)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (349-480)||(10-141)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (34-479)||(7100-7543)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (36-302)||(42784-43050)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (166-419)||(1-254)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (361-480)||(8189-8308)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (34-184)||(2023-2173)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (157-323)||(3281-3447)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (157-455)||(14623-14921)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (34-214)||(13380-13560)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (173-436)||(959-1222)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (140-323)||(28284-28467)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (366-480)||(2-116)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (157-323)||(3893-4059)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (157-323)||(13030-13196)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (133-302)||(5311-5480)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (25-194)||(136109-136278)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (157-311)||(940-1094)
scaffold1710 (253-306)||(107-160)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (157-323)||(8217-8383)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (173-319)||(14661-14807)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (157-323)||(14779-14945)
scaffold0132 (234-323)||(43737-43826)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (157-323)||(24002-24168)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (258-455)||(71442-71639)
scaffold0021 (181-323)||(13397-13539)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (190-460)||(1115-1385)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (173-305)||(10493-10625)
scaffold0447 (173-305)||(5879-6011)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (173-323)||(8909-9059)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (173-323)||(9125-9275)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (173-323)||(3962-4112)
scaffold0218 (373-422)||(3863-3912)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (293-450)||(7426-7583)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (173-305)||(8488-8620)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (233-455)||(1310-1532)
scaffold0117 (157-219)||(10431-10493)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (233-323)||(26175-26265)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (253-455)||(3241-3443)
scaffold0222 (16-122)||(3487-3593)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (1-59)||(7498-7556)
scaffold0101 (250-302)||(5491-5543)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (25-122)||(45835-45932)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (160-320)||(10781-10941)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (133-302)||(10867-11036)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (258-323)||(18332-18397)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (16-103)||(9200-9287)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (16-92)||(886-962)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (427-479)||(19067-19119)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (415-479)||(197340-197404)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 12497802 - 12498280
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497802 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 12497901  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497902 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 12498001  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12498002 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 12498101  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498102 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 12498201  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  12498202 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 12498280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 17489404 - 17489883
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17489404 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccca 17489503  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489504 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 17489603  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489604 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 17489703  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17489704 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgc 17489803  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17489804 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 17489883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14877075 - 14876597
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14877075 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaa 14876976  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876975 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 14876876  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876875 aggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 14876776  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14876775 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctcgggtcctaagaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 14876676  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  14876675 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 14876597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 9522273 - 9522752
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9522273 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaaccca 9522372  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9522373 ctcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 9522472  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9522473 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatc 9522572  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9522573 ttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgc 9522672  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||    
T  9522673 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataaatattattatacgtgaactctatcaat 9522752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16492757 - 16492278
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492757 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16492658  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16492657 ctcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcac 16492558  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492557 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 16492458  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16492457 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgc 16492358  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  16492357 atctccgaccatacaaagcctcacaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaat 16492278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 16370967 - 16371446
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16370967 tcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16371066  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16371067 ctcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcac 16371166  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371167 aggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 16371266  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371267 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 16371366  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  16371367 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaat 16371446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16807502 - 16807024
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16807502 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccca 16807403  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16807402 ctcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcac 16807303  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||     
T  16807302 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcatt 16807203  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16807202 ttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 16807103  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  16807102 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 16807024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 16691714 - 16692193
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691714 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16691813  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16691814 cacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 16691913  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16691914 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatt 16692013  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692014 ttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 16692113  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  16692114 atatccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaat 16692193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906242
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10906072  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10906073 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaac 10906172  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  10906173 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 10906242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005632
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10005462  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005463 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 10005562  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  10005563 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 10005632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589490
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 15589660  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589659 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 15589560  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  15589559 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 15589490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 15208445 - 15208924
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15208445 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaaccca 15208544  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  15208545 ctcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcac 15208644  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15208645 aggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatc 15208744  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15208745 ttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 15208844  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  15208845 atctccgtccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaat 15208924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15348818 - 15348343
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  15348818 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 15348719  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15348718 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 15348619  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15348618 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 15348519  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348518 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 15348419  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  15348418 tccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaa 15348343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635805
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16635635  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635636 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 16635735  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16635736 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 16635805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062152
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 20062322  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062321 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 20062222  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  20062221 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 20062152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43163129
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 43162959  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162960 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 43163059  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  43163060 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 43163129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425479
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 48425309  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425310 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctagtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 48425409  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  48425410 catacaaagccttgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 48425479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 4 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15403083 - 15402611
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  15403083 tcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactc 15402984  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  15402983 ggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcatagg 15402884  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15402883 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 15402784  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15402783 tcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 15402684  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgat 476  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  15402683 tccgaccatgtaaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgat 15402611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 7 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 53385588 - 53385116
Alignment:
Q  7 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 106  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  53385588 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 53385489  T
Q  107 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 206  Q
    | |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53385488 aagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagt 53385389  T
Q  207 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53385388 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 53385289  T
Q  307 tgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctcc 406  Q
    || ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385288 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctcc 53385189  T
Q  407 gaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  53385188 gaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 53385116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 4 - 476
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15339298
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  15338826 tcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactc 15338925  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  15338926 ggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcatagg 15339025  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15339026 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgc 15339125  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15339126 tcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatc 15339225  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgat 476  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  15339226 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgat 15339298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15725506 - 15725032
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15725506 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 15725407  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  15725406 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 15725307  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  15725306 agtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttc 15725207  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||  ||  |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15725206 tcttggatcatccgaa-tttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 15725108  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15725107 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 15725032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16412855 - 16412380
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16412855 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 16412756  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16412755 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 16412656  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  16412655 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttc 16412556  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16412555 tcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 16412456  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  16412455 tccaaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 16412380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792497
Alignment:
Q  5 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcg 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  105 atacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagga 204  Q
     || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  205 gtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 26792672  T
Q  305 cttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatct 404  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  26792671 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatct 26792572  T
Q  405 ccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  26792571 ccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 26792497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252722
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||     
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttgg 13252552  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13252553 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgac 13252652  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  13252653 catacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattatatgtgaactcgatcaa 13252722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 6600304 - 6600779
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6600304 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 6600403  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6600404 ggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 6600503  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6600504 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 6600603  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6600604 tctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatc 6600703  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  6600704 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 6600779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 5425502 - 5425028
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5425502 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 5425403  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5425402 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 5425303  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5425302 agtgactctcaaag-cacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 5425204  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425203 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 5425104  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  5425103 tctgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 5425028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 25 - 472
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15248172
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 324  Q
     ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttc 15248024  T
Q  325 taagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgt 424  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||      
T  15248025 tcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgactatacaaagcctcaa 15248124  T
Q  425 aaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaact 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  15248125 aaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaact 15248172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16757158 - 16756683
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16757158 tcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 16757059  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16757058 ggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 16756959  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16756958 agtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttc 16756859  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756858 tctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 16756759  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  16756758 tccgaccatacaaggcctcgaacgatgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 16756683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227667
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||      
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctctcttatcaat 15227527  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || ||||| |  ||| | || ||||| |  |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||    
T  15227528 ttgaccttttttgtagtctgctgaactaaatctggtcccaacattacaccttcactcgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccaaccataca 15227627  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    || | ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  15227628 aatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15227667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972228
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||  |  || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc--ttctcttgaatcatcttaacct 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaacct 13972364  T
Q  323 tctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    | |  ||| |||||||||| || |||||||| || |  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||    
T  13972363 tttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttc 13972264  T
Q  423 gtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
      | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  13972263 aaacggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 13972228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 137 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15015841
Alignment:
Q  137 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttg 236  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  237 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgt 336  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgt 15015985  T
Q  337 tgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattc 436  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||    ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||| | ||||||||||    
T  15015984 tgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgatcatacaatgcttcgaacggtgccattc 15015885  T
Q  437 caatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  15015884 caatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaat 15015841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953055
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||| || || ||||| ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||  ||| |     
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 15953201  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| || || || | ||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  15953200 tgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 15953101  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| || |||||  |||| || | | |||||||||| |||||    
T  15953100 taccaatactcgaatggcaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 15953055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086694
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||  |  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc--ttctcttgaatcatcttaacct 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaacct 14086558  T
Q  323 tctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    | |  ||| |||||||||| || |||||||| || |  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||    
T  14086559 tttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttc 14086658  T
Q  423 gtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
      | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  14086659 aaacggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 14086694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12850784 - 12850366
Alignment:
Q  61 aacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggag 160  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  12850784 aacacatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggag 12850685  T
Q  161 tcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 260  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||| | |||||    
T  12850684 tcaacttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgctt 12850585  T
Q  261 atcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagact 360  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||  || || || || ||| |||| ||||| |  |||||||| || |||    
T  12850584 gtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacact 12850485  T
Q  361 actccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | | | | |||||||| ||||| || ||||| ||| | || |    
T  12850484 acactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacggtgccataccaatacttgaatggtaattgttgt 12850385  T
Q  461 gggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     | |||||||||| |||||    
T  12850384 tgtacgtgaactctatcaa 12850366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 14571412 - 14571713
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  14571412 tcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagccca 14571511  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  14571512 ctctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcat 14571611  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14571612 aggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatc 14571711  T
Q  301 tt 302  Q
    ||    
T  14571712 tt 14571713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 47123520 - 47123809
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  47123520 atcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 47123619  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47123620 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 47123719  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  47123720 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 47123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 10383533 - 10383972
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |    
T  10383533 tcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaa 10383632  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||     
T  10383633 ctctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaa 10383732  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10383733 aggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatc 10383832  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||   |||| | | || |||| |||| | |  ||||| |  || ||||| || || |  | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  10383833 ttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcctac 10383932  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaat 440  Q
    | ||||||||| |||| || ||| | |||||||| |||||    
T  10383933 acctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaat 10383972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322769
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |  | ||| ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatc 13322903  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || ||  | |  | ||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||  |||    
T  13322902 ttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacagcactctgacctgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccgtaca 13322803  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatg 449  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || |||||    
T  13322802 aagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatg 13322769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134606
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| ||  | || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 18134606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759168
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| |     
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 8759315  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  8759314 tcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 8759215  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || ||||||||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  8759214 ttcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaat 8759168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177565
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| |     
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 41177418  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  || ||||| |  || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  41177419 tcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 41177518  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || ||||||||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  41177519 ttcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaat 41177565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10420559 - 10420296
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || | || ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  10420559 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatga 10420460  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  10420459 actttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtcttt 10420360  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10420359 cctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 10420296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13942067
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| |     
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 13941920  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || | ||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  13941921 tcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgcca 13942020  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || ||||||||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  13942021 ttcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaat 13942067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329923
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatctt 16329923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11304323 - 11304014
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  11304323 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacta 11304224  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||    |||||||     
T  11304223 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcag 11304124  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  11304123 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 11304024  T
Q  316 ttaaccttct 325  Q
    || |||||||    
T  11304023 tttaccttct 11304014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360653
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||  | || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  |||| || ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 12360793  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| |  | ||||| |  |||||||| || ||  | |  || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  12360792 ttgactttctctgtagtccgatgaaccaagtctggtcccaatacagcactctctcctgactcaaaccagcataatggagtcctgcacctccgaccataca 12360693  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  12360692 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 12360653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274521
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 8274620  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  8274619 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 8274521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961148
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||  | |||| ||| ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    |  |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||  |||| ||||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||    |||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttcccttatc 11961288  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    || || ||||| | |||  | |  ||||| |  || ||||| || || || |  ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||     
T  11961287 attttgaccttttcagtcgtctcatgaaccacatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccat 11961188  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgata 452  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  11961187 acaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatgata 11961148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16836965 - 16836621
Alignment:
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    |||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  16836965 caccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaact 16836866  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    |||||||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||    |    
T  16836865 ctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttccctta 16836766  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 410  Q
    ||||||| ||||||| |||  | |  ||||| |  |||||||| || || || |  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  16836765 tcatcttgaccttctcagtcgtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgacc 16836666  T
Q  411 acacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    | ||||||| ||| | |||||||| || || || ||||| |||||    
T  16836665 atacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 16836621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381173
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    ||||| |||| ||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| ||||  || || || |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatc 16381260  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
      ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  16381259 ccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgacctt 16381173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742825
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| ||||| |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || ||||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 16742924  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  16742923 caaagcactctctccggactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 16742825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 480
Target Start/End: Original strand, 44776862 - 44777290
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| |  || || || ||||||||||| ||||| |    
T  44776862 gacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatga 44776961  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | ||| || || || || ||||| ||||||||  | ||    
T  44776962 acttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggcctt 44777061  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggt 351  Q
     || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| | |  ||||| |  ||||||    
T  44777062 cctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatctggt 44777161  T
Q  352 cctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgat 451  Q
    || || || || | ||| || | ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | || || ||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  44777162 cccaacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcctgcaccttcgaccatataatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgat 44777261  T
Q  452 aactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || | | | |||||||| ||||||    
T  44777262 aactgttgttgtaggtgaactctatcaat 44777290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576636
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 15576636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 450
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748678
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| || || ||  ||||||||||||  |  || || | |||||||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||| | | ||| |||| ||| |||||||| |   | | ||||||     
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttcacct 18748600  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatga 450  Q
    || ||||||||||||||||  || || || ||||||||| ||||| ||||  | |||||||| || || |||||||||    
T  18748601 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccataccgatactagaatga 18748678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 455
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17193112
Alignment:
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 334  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtactct 17192991  T
Q  335 gttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccat 434  Q
     ||| ||||  || |||| ||| || || | ||| ||  | ||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  17192992 cttgcacaacttccggtcgtaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 17193091  T
Q  435 tccaatcctagaatgataact 455  Q
     || || |||| |||| ||||    
T  17193092 accgatactagcatgaaaact 17193112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975299
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 13975299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6712728 - 6712539
Alignment:
Q  258 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaag 357  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | | ||| |||| ||| ||||||||     
T  6712728 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaaccttttatgtagtctcttgtacaacctccggtcctaac 6712629  T
Q  358 actactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaa 447  Q
    |   | | ||| || |||||| ||||||||||||| ||||| || || | |||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||    
T  6712628 aaagcactttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaa 6712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Original strand, 31945051 - 31945177
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  31945051 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 31945150  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacg 142  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31945151 ttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31689173 - 31689049
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  31689173 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactg 31689074  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgata 140  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  31689073 ttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 480
Target Start/End: Original strand, 4678374 - 4678481
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | ||||||||||| || || ||||||||||| || | | | |||||||    
T  4678374 gactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaact 4678473  T
Q  473 cgatcaat 480  Q
    | ||||||    
T  4678474 ctatcaat 4678481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 473
Target Start/End: Original strand, 13001818 - 13001945
Alignment:
Q  346 tctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctag 445  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || |    
T  13001818 tctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcg 13001917  T
Q  446 aatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    |||| ||||| || | | ||||||||||    
T  13001918 aatggtaactgttgttgtacgtgaactc 13001945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11564852 - 11564779
Alignment:
Q  406 cgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  11564852 cgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaa 11564779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6153259 - 6153006
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| || ||||| |||||| || | ||||||| |||||| || || ||  ||||||||| || ||| ||||| |    
T  6153259 ggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaacttgaaacttaatatcctttctcc 6153160  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     ||||||||||||||||||             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || |  |||||    
T  6153159 tcttatcatgataactctt------------agacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccgaccctaa 6153072  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
     || || | ||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||    
T  6153071 cacaacactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctc 6153006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 356
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686864
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| || | ||||| ||||| || || || ||  ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
    ||| |    ||| || ||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |  ||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  21686781 cttcttcttactttgagactctttcatcttttcctgaaacatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaatttctggtcctaa 21686864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13975249 - 13975167
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  13975249 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 13975167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14183193 - 14183031
Alignment:
Q  296 tcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagt 395  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| | || | || |||||||| || | ||| || || || | ||||| ||||||| |||||||||| || ||    
T  14183193 tcatcttttcctgaatcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgt 14183094  T
Q  396 tctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    ||| |||||||   || ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||    
T  14183093 tctacatctcctctcatacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactatt 14183031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 26009186 - 26009101
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  26009186 gactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 26009101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126692
Alignment:
Q  427 ggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaa 14126692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 437
Target Start/End: Original strand, 15576686 - 15576750
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattcc 437  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  15576686 gactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcc 15576750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 440
Target Start/End: Original strand, 28754247 - 28754321
Alignment:
Q  366 ttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaat 440  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  28754247 ttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaat 28754321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 267624 - 267512
Alignment:
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||||||||||||| |||  || | || ||| ||| ||||||| || || | ||    
T  267624 ctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatctcctgcctaccctgagacactttcatgttttcctaaa 267525  T
Q  311 tcatcttaacctt 323  Q
    |||||||||||||    
T  267524 tcatcttaacctt 267512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 23573609 - 23574087
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573609 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 23573708  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573709 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 23573808  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23573809 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 23573908  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573909 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 23574008  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  23574009 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 23574087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21984824 - 21984345
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21984824 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatccca 21984725  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21984724 ctcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcac 21984625  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21984624 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatc 21984525  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21984524 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgc 21984425  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  21984424 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgattactattattgtacgtgaactctatcaat 21984345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 25423056 - 25423535
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25423056 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 25423155  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25423156 cctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcac 25423255  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423256 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 25423355  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423356 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 25423455  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  25423456 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 25423535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 23516408 - 23516886
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23516408 tcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 23516507  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516508 ctcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 23516607  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516608 atgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 23516707  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  23516708 ttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgc 23516807  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  23516808 atctccgaccataccaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaa 23516886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 18775644 - 18776123
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775644 tcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 18775743  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18775744 ctcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcac 18775843  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18775844 aggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatt 18775943  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18775944 ctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 18776043  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  18776044 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaat 18776123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Original strand, 23440092 - 23440551
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23440092 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccct 23440191  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440192 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 23440291  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23440292 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 23440391  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23440392 ttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggttttaagaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttctgc 23440491  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    ||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23440492 atctccgaccatataaagcctgaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattat 23440551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15000255 - 14999780
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15000255 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 15000156  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15000155 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 15000056  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15000055 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 14999956  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14999955 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 14999856  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  14999855 tccgaccatataaagtctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 14999780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 33 - 479
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20799105
Alignment:
Q  33 aacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgat 132  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  133 atctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 232  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaat 332  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 20798958  T
Q  333 ttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcc 432  Q
     || |||||||||| ||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  20798959 ctgctgaacaatctttggtcctaagacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgcc 20799058  T
Q  433 attccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  20799059 attccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaa 20799105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40709125
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 40708955  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708956 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 40709055  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  40709056 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 40709125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 19769830 - 19770305
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19769830 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 19769929  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19769930 ggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 19770029  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19770030 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 19770129  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770130 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 19770229  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  19770230 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 19770305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22333403 - 22332928
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22333403 tcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 22333304  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22333303 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 22333204  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  22333203 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttc 22333104  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||   || |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22333103 tcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 22333004  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  22333003 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtctgtgaactcgatcaa 22332928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 27610224 - 27610699
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  27610224 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactc 27610323  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27610324 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27610423  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27610424 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttc 27610523  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610524 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 27610623  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  27610624 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 27610699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 22134538 - 22135013
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22134538 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 22134637  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  22134638 ggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 22134737  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22134738 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 22134837  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22134838 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatc 22134937  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22134938 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 22135013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27669006 - 27668531
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27669006 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 27668907  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27668906 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27668807  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27668806 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 27668707  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668706 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 27668607  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  27668606 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 27668531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566839
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 34566669  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566670 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 34566769  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  34566770 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 34566839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27685916 - 27685441
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27685916 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 27685817  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  27685816 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcatagg 27685717  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27685716 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctc 27685617  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27685616 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 27685517  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | || |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  27685516 tccgaccatataaggcctcgaaaggtgtcattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 27685441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37292012 - 37291537
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37292012 tcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 37291913  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  37291912 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcatagg 37291813  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37291812 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttc 37291713  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37291712 tcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 37291613  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  37291612 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 37291537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356847
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16356677  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356678 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 16356777  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16356778 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 16356847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 27518277 - 27518752
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  27518277 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 27518376  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27518377 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27518476  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27518477 agtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 27518576  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518577 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 27518676  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  27518677 tccaaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 27518752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 460
Target Start/End: Original strand, 41770712 - 41771168
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  41770712 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 41770811  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41770812 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 41770911  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  41770912 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttc 41771011  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771012 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 41771111  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41771112 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattat 41771168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 479
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348768
Alignment:
Q  23 atggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaac 122  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  123 tctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacg 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  223 tggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacct 322  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaagat--tttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactt 22348611  T
Q  323 tctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  22348612 tctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctc 22348711  T
Q  423 gtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22348712 gaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 22348768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738746
Alignment:
Q  12 gatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  112 accgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 211  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  212 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 311  Q
    ||||||| |  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 26738914  T
Q  312 catcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 411  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26738913 catcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaacca 26738814  T
Q  412 cacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     |||||||||   |  ||||||||||| | || |||| |||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  26738813 tacaaagccttaaattgtgccattccattactggaataataactgttattgtacgtgaactctatcaa 26738746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Original strand, 23471096 - 23471568
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23471096 tcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaaccca 23471195  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23471196 ctcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 23471295  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
      |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23471296 ttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatc 23471395  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || | |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| | ||| || || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23471396 ttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttatggccccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 23471495  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||    
T  23471496 atctccgaccatacaaagcatcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctgttattgtacgtgaactc 23471568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29476589 - 29476114
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29476589 tcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 29476490  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||    
T  29476489 ggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcatagg 29476390  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||    
T  29476389 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttc 29476290  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||  ||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29476289 tcttggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 29476190  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  29476189 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 29476114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 77 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498076
Alignment:
Q  77 tcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  177 caaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 276  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  277 tgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgact 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccacactttcacctgact 21498180  T
Q  377 caaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgat 476  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||| ||    
T  21498179 caaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacttttattttacgtgaactctat 21498080  T
Q  477 caat 480  Q
    ||||    
T  21498079 caat 21498076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20468605 - 20468137
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  20468605 ggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgc 20468506  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    ||| ||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20468505 cactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 20468406  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20468405 ctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgga 20468306  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 410  Q
    ||| |||||| |||| |||| |||| ||||| || | |||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20468305 tcaacttaacattctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgacc 20468206  T
Q  411 acacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |  || ||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  20468205 atgcagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 20468137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 20573388 - 20573626
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20573388 tcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 20573487  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20573488 ctcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcag 20573587  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaa 239  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20573588 tggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 210 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339327
Alignment:
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 21339397  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||    
T  21339396 catacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaa 21339327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  210 tct 212  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890800
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||  || | ||||||||| |||    
T  21890963 ttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctgttcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccataca 21890864  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  21890863 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 21890800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749619
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||| |    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24749759  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    |||||||| |  ||| | || ||||| || |||||||| || |  || | ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  24749758 ttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 24749659  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  24749658 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 24749619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735676
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||| |    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24735816  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    |||||||| |  ||| | || ||||| || |||||||| || |  || | |||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  24735815 ttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 24735716  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  24735715 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 24735676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564014
Alignment:
Q  35 catacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || | |||||| || |||||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 234  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 334  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||   ||||  || ||||| |  ||| | |    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctctcttatcaatttgaccttttctgtagtct 21564152  T
Q  335 gttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccat 434  Q
    | ||||| || ||| |||| || ||||| | |       ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||| |||    
T  21564151 gatgaactatatctagtcccaacactacactt-------actcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcat 21564059  T
Q  435 tccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  21564058 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 21564014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 480
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21405168
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
     |||||||| || |||||||                 || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||  ||||    
T  21404915 aaaaaacacatgatctcctt----------------gttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatc 21404998  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| |  |  ||    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21404999 aacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctggtcccagtatcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttctgcatctccgaccat 21405098  T
Q  413 aca--aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||  | || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  21405099 acaacacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaat 21405168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442418
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||   || ||||| |||||||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 324  Q
     ||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttc 23442489  T
Q  325 taagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagt 395  Q
    |  ||| | || ||||| |  || ||||| || ||||| | ||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  23442488 tctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagt 23442418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 439
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462239
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||  | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatc 22462115  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| |||  ||||| |  || || || || || || | ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  22462116 ttgactttctctgtagtttcatgaaccaattccggccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 22462215  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaa 439  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||    
T  22462216 aagcttcgaacggtgccataccaa 22462239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737011
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgct 294  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgct 24737011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28924236 - 28923982
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  28924236 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatga 28924137  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28924136 actttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtcttt 28924037  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28924036 cctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 28923982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37546004 - 37545714
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  37546004 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 37545905  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  37545904 cagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 37545805  T
Q  213 ca-aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || |||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  37545804 cagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 37545714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14887498 - 14887209
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  14887498 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14887399  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  14887398 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 14887299  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14887298 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 14887209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28895410 - 28895156
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  28895410 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatga 28895311  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28895310 actttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtcttt 28895211  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895210 cctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 28895156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 25847936 - 25848225
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||  ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||    
T  25847936 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgcca 25848035  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25848036 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 25848135  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||| || || || || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25848136 caaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 25848225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 20342143 - 20342432
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20342143 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 20342242  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20342243 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactct 20342342  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20342343 cagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 20342432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798615
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatctt 24798615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22236424 - 22236134
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| | ||| |    
T  22236424 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgacactg 22236325  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22236324 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 22236225  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22236224 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 22236134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 317
Target Start/End: Original strand, 20773660 - 20773925
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  20773660 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatga 20773759  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| || || |||| |||||| || |||| ||| || ||| | ||||| ||||||| ||| |||||    
T  20773760 actttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctcttt 20773859  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatctt 317  Q
     | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20773860 ccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatctt 20773925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502829
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatctt 22502829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381349
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 22381349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21662546 - 21662300
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||    
T  21662546 atcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtca 21662447  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  21662446 ttgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactct 21662348  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 260  Q
     | |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662347 tagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080307
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatctt 23080307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 306
Target Start/End: Original strand, 20821353 - 20821607
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || | || ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |    
T  20821353 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatga 20821452  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  20821453 actttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtcttt 20821552  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
      ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20821553 cttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 20821607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269373
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| || |  || || || |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| |     
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 17269520  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  17269519 tcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 17269420  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  17269419 ttcctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaat 17269373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| || ||| ||||    
T  21665886 tctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 260  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210756
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||| || |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||| | | ||| ||||  || ||||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 11210858  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataacta 456  Q
     |  || |  || || |||||||||||||||||||  || || || |||| |||| |||| |||||  | |||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  11210857 caaaacactctctccggactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgaaaacta 11210758  T
Q  457 tt 458  Q
    ||    
T  11210757 tt 11210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831784
Alignment:
Q  265 tgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactc 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   || | ||||||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T
Q  365 cttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatggga 464  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | |||| |||||| || |||||| | ||||| || | | |    
T  21831898 cctcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgta 21831799  T
Q  465 cgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||| |||||    
T  21831798 cgtgaactctatcaa 21831784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581514
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || | ||||||||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||  ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtggtttcttgcacaacttccggtcctaa 24581415  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  24581416 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 24581514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937385
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 21937385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011387
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 27011288  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | |||| |||||| || |||| |||| ||||    
T  27011289 caaagcactctctccgaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcattccgatactagcatgaaaact 27011387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 421
Target Start/End: Original strand, 23503464 - 23503712
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| || | || || |||||||| || || ||   ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  23503464 acttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 23503563  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | | ||| || |  || |||||||| |   | | ||||||     
T  23503564 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcaccacttccggtcctaacaaagcactttcacca 23503663  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcct 421  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||| |||||||||    
T  23503664 gactcaaaccaacacaacggtgtcctagacctccgaccatacaaagcct 23503712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 21625397 - 21625470
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatg 86  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21625397 atcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25244695 - 25244547
Alignment:
Q  177 caaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 276  Q
    ||||||||||||||||||    ||| || | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||  | | ||||| ||||||||||| |    
T  25244695 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctct 25244596  T
Q  277 tgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
    || | ||| |    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  25244595 tgcctactgtcacgcgctttcatcttcttctgaatcatcttaacattct 25244547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25308847 - 25308699
Alignment:
Q  177 caaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 276  Q
    ||||||||||||||||||    ||| || | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||  | | ||||| ||||||||||| |    
T  25308847 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctct 25308748  T
Q  277 tgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
    || | ||| |    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  25308747 tgcctactgtcacgcgctttcatcttcttctgaatcatcttaacattct 25308699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21229312 - 21229238
Alignment:
Q  381 ccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| || ||| | ||||||||||| || || |||||||||||    
T  21229312 ccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataact 21229238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 65372 - 65849
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65372 tcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 65470  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  65471 ctcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcac 65570  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  65571 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 65670  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  65671 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 65770  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  65771 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 65849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40129 - 39924
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  40129 tcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaa 40030  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40029 ctcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 39930  T
Q  201 aggagt 206  Q
    ||||||    
T  39929 aggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 254 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39700
Alignment:
Q  254 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcc 39807  T
Q  354 taagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataa 453  Q
    |||||| |||  |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39806 taagaccactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataa 39707  T
Q  454 ctattat 460  Q
    || ||||    
T  39706 ctgttat 39700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 15533381 - 15533859
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533381 tcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 15533480  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15533481 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccac 15533580  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15533581 aggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 15533680  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533681 ttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 15533780  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15533781 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 15533859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 19977968 - 19978446
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19977968 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 19978067  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978068 ctcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 19978167  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978168 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 19978267  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978268 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 19978367  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||    
T  19978368 atcttcgaccatataaagcctccaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaa 19978446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 30313924 - 30313446
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30313924 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccca 30313825  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313824 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 30313725  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  30313724 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 30313625  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||  | |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30313624 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgagccctaagaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgc 30313525  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  30313524 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccgttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 30313446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 32600145 - 32600623
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32600145 tcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatccca 32600244  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32600245 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 32600344  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32600345 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatt 32600444  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  32600445 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgc 32600544  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  32600545 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 32600623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21167317 - 21166839
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21167317 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaa 21167218  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21167217 ctcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 21167118  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167117 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 21167018  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  |||||||||    
T  21167017 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttctgc 21166918  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||    
T  21166917 atcttcgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtaaactctatcaa 21166839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 473
Target Start/End: Original strand, 23650044 - 23650514
Alignment:
Q  3 atcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccact 102  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23650044 atcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaact 23650143  T
Q  103 cgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacag 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23650144 cgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacag 23650243  T
Q  203 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23650244 gagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatctt 23650343  T
Q  303 ctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcat 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650344 ctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcat 23650443  T
Q  403 ctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23650444 ctccgaccatacaaagcttcataaggcgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactc 23650514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16408825 - 16408347
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408825 tcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16408726  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408725 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 16408626  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16408625 aagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16408526  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  16408525 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgt 16408426  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  16408425 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaa 16408347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 21250943 - 21251421
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21250943 tcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 21251042  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21251043 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 21251142  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21251143 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatc 21251242  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
     |||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21251243 -tctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgc 21251341  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  21251342 atcttcgaccatacaaagcgtaataaggtgtcatctcaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaat 21251421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21789138 - 21788660
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21789138 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 21789039  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21789038 ctcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcac 21788939  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21788938 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatc 21788839  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  21788838 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgc 21788739  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  21788738 atctccgaccatac-aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 21788660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21922515 - 21922036
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21922515 tcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaaccca 21922416  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21922415 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcac 21922316  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21922315 atgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatc 21922216  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922215 ttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 21922116  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  21922115 atctccgaccatagaaagcctcataaggtgccattccaatagtagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 21922036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22133821 - 22133343
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22133821 tcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccga 22133722  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22133721 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 22133622  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22133621 atgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 22133522  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22133521 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgc 22133422  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22133421 atcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 22133343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22164971 - 22164493
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164971 tcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 22164872  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22164871 ctcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 22164772  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22164771 atgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 22164672  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22164671 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctcgggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgc 22164572  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22164571 atcaccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 22164493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 21394645 - 21394166
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21394645 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 21394546  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21394545 ctcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcac 21394446  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21394445 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatc 21394346  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  21394345 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgc 21394246  T
Q  401 atctccga-ccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  21394245 atctccgacccatac-aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 21394166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 479
Target Start/End: Original strand, 22046385 - 22046852
Alignment:
Q  12 gatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22046385 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgcc 22046484  T
Q  112 accgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046485 accgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactc 22046584  T
Q  212 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 311  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  22046585 tcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaat 22046684  T
Q  312 catcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 411  Q
    ||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22046685 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgacca 22046784  T
Q  412 cacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  22046785 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaccattattgtatgtgaactcgatcaa 22046852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17674800 - 17674325
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17674800 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 17674701  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17674700 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 17674601  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17674600 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 17674501  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674500 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 17674401  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  17674400 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaa 17674325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 10 - 480
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19113170
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 19112999  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113000 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 19113099  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  19113100 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaat 19113170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20018527 - 20018052
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  20018527 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 20018428  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20018427 ggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 20018328  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20018327 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 20018228  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018227 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 20018128  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  20018127 tccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 20018052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19485647 - 19485172
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19485647 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 19485548  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19485547 ggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 19485448  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19485447 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 19485348  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485347 tctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 19485248  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  19485247 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 19485172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22120951 - 22120476
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22120951 tcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactc 22120852  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  22120851 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcatagg 22120752  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  22120751 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttc 22120652  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22120651 tcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcctaagaccactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 22120552  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22120551 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 22120476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Original strand, 22987202 - 22987654
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22987202 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 22987301  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22987302 ctcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcac 22987401  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
     ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22987402 tggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatc 22987501  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| | || ||||||||||||| | || |||||| || || |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22987502 ttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgc 22987601  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataa 453  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22987602 atctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataa 22987654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 22032033 - 22032339
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22032033 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatccta 22032132  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032133 ctcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 22032232  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22032233 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 22032332  T
Q  301 ttctctt 307  Q
    |||||||    
T  22032333 ttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396427
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    |  || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatc 20396594  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||| || ||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||     
T  20396593 aacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccat 20396494  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||    
T  20396493 acaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaa 20396427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 15441182 - 15441420
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  15441182 tcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaa 15441281  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15441282 cacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccac 15441381  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15441382 aggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 145 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377762
Alignment:
Q  145 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  245 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaat 344  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaat 22377890  T
Q  345 ctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatccta 444  Q
     ||||||||||| || || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  ||| || |||||||  | |||||||||||||| |||    
T  22377889 ttctggtcctaaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatac-aagcctcaaatggtgccattccaatacta 22377791  T
Q  445 gaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||    
T  22377790 gaatgataactattgttgtacgtgaactc 22377762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 145 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22383937
Alignment:
Q  145 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  245 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaat 344  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaat 22384065  T
Q  345 ctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatccta 444  Q
     ||||||||||| || || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  ||| || |||||||  | |||||||||||||| |||    
T  22384064 ttctggtcctaaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatac-aagcctcaaatggtgccattccaatacta 22383966  T
Q  445 gaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||    
T  22383965 gaatgataactattgttgtacgtgaactc 22383937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 23948900 - 23949162
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23948900 ggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgc 23948999  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    |||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23949000 caccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgact 23949099  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  23949100 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 455
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388554
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||| ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||  || ||||| |  ||| |     
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttttgtagtc 20388432  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| || ||| |||| || |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| | |||||||    
T  20388433 tgatgaactatatctcgtcccaacactacattttaacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgcca 20388532  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataact 455  Q
    | ||||| || ||||| |||||    
T  20388533 tgccaatactcgaatggtaact 20388554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851890
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||  |||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatc 19851726  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||| ||| | |  ||||| |  |||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  19851727 ttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccataca 19851826  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||| |||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  19851827 aagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 19851890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857926
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||  |||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatc 19857762  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||| ||| | |  ||||| |  |||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  19857763 ttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccataca 19857862  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||| |||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  19857863 aagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 19857926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 23654943 - 23655406
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |  |||  |||| |    
T  23654943 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactg 23655042  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  23655043 ttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23655142  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||  || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  23655143 aaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 23655242  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || || || | |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  23655243 ttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccataca 23655342  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| | ||| || ||||||||||| || | | |||||||||| |||||    
T  23655343 aagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaa 23655406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010202
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20010366  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    |  |||||||   || | || ||||| |  |||||||| || |  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||    
T  20010365 tggaccttctctatagtctgatgaactaaatctggtcccaacaacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccataca 20010266  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||  ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  20010265 aagtttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 20010202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008261
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20008165  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 411  Q
    || |||||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || || || | ||| ||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||    
T  20008166 tttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcatgcacctccgacca 20008261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21682216 - 21681949
Alignment:
Q  35 catacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  21682216 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 21682117  T
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 234  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||    
T  21682116 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 21682017  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21682016 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatctt 21681949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Original strand, 21840433 - 21840872
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||  || ||||| |    
T  21840433 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 21840532  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| || | |||||| ||||| |     
T  21840533 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttag 21840632  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||    
T  21840633 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatc 21840732  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || || || | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||    
T  21840733 ttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccataca 21840832  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  21840833 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 21840872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 6679124 - 6679413
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  6679124 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6679223  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  6679224 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 6679323  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6679324 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 6679413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266718
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 1266554  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || ||||||| |||  | || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||    
T  1266555 tt-accttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcacaaaggagtcctgcacctctgaccataca 1266653  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  1266654 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaat 1266718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 276 - 479
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18857056
Alignment:
Q  276 ttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgac 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacgactctttcacctgac 18856952  T
Q  376 tcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||    
T  18856953 tcaaaccagcacaacagagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcga 18857052  T
Q  476 tcaa 479  Q
    ||||    
T  18857053 tcaa 18857056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 804441 - 804152
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  804441 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 804342  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  804341 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 804242  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  804241 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 804152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 440
Target Start/End: Original strand, 6603671 - 6604098
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  6603671 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6603770  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  6603771 ctgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 6603870  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||    
T  6603871 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 6603970  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | | | || |||| |||| | |  ||||| |  || ||||| || || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||     
T  6603971 aacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccat 6604070  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaat 440  Q
    |||| || ||| | |||||||| |||||    
T  6604071 acaaggcttcgaacggtgccataccaat 6604098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22062198 - 22061912
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  22062198 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 22062099  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22062098 ttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 22061999  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||| || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22061998 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 22061912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571143
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| |     
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 31571290  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  || ||||| |  || || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  31571289 tcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 31571190  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || |||||||||||||| | | | |||||||| ||||||    
T  31571189 ttcctatactcgaatgataactattgttgtaggtgaactctatcaat 31571143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 14565155 - 14565444
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  14565155 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14565254  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  14565255 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 14565354  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14565355 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 14565444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 238 - 479
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949398
Alignment:
Q  238 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgtt 337  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T
Q  338 gaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattcc 437  Q
     ||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||    
T  23949258 -aacgatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatatagagcttcgaaaggtgccattcc 23949356  T
Q  438 aatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  23949357 aatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 23949398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324888
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaa-gatgcggtggtaatcccactcgatacgccacc 114  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| || || |||| ||| |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  115 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 214  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  215 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatctt 21324888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303905
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||| ||| || || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatctt 29303905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416957
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||| ||| ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 298  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttca 31416957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305060
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||| |||| || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     | ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 12305060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 479
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040338
Alignment:
Q  303 ctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcat 402  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctcattcaaaccagcacaacggagttctgcat 22040261  T
Q  403 ctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  22040262 ctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcgatcaa 22040338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16265386 - 16265127
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  16265386 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16265287  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | |||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16265286 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16265187  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16265186 cagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 28982370 - 28982632
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  28982370 atcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 28982469  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  28982470 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccct 28982569  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 275  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28982570 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 28987590 - 28987852
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  28987590 atcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 28987689  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  28987690 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccct 28987789  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 275  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28987790 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21196828
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| || || ||| | |||||||||| ||| ||||| |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  || | | ||| ||||  || ||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttacatagtctcttgcacaacttccggtcctaa 21196927  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | | ||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21196926 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaact 21196828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652656
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| || || || ||  |||||||||| | ||| ||||| |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | ||| || | ||| ||||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtctcttgcaccacctccggtcctaa 20652758  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataacta 456  Q
     |   | | ||| || |||| ||||||||||||||| || || || |||| |||| ||||||||||  | |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  20652757 caaggcactttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaacta 20652658  T
Q  457 tt 458  Q
    ||    
T  20652657 tt 20652656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 455
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051318
Alignment:
Q  155 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttct 254  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| || || || || ||||||||||||||  | || ||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  255 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcct 354  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||  ||  | |||||||| |  ||||||||     
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaaatctggtccc 22051217  T
Q  355 aagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataac 454  Q
    || || || |  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| || || || ||||| ||||    
T  22051218 aacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaac 22051317  T
Q  455 t 455  Q
    |    
T  22051318 t 22051318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877421
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 16877520  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  16877519 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 16877421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 27347239 - 27347436
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||    
T  27347239 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgcca 27347338  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    | || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27347339 ctgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 455
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315646
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcct----aagactactccttc 368  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||  || ||||||    ||||  |||  |||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgaacaacttccggtcctacccaaga--act--ttc 22315559  T
Q  369 acccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||| || || | |||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  22315560 acctgactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaact 22315646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850663
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || || |||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggccctaa 21850762  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||| || |||| |||| ||||    
T  21850761 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtaccattccgatactagcatgaaaact 21850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982759
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||| |||||| | || || ||  | |||||||||| ||||||||  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaacctt 22982759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 23157534 - 23157337
Alignment:
Q  258 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaag 357  Q
    |||||||||||||||| | | || | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  | |||||||||     
T  23157534 cttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttttggtcctaac 23157435  T
Q  358 actactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |   | | |||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | |||| ||| || || ||||||||| ||||    
T  23157434 aaagcactttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccgatactagaatgaaaact 23157337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24818237 - 24818054
Alignment:
Q  160 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 259  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| | ||||| |||||  |  | ||||| |||||||| || ||| |  |||||||||||  |||||| || | ||    
T  24818237 gtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcacgaggttcactcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctct 24818138  T
Q  260 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaa 343  Q
     |||||| |||||||| |  | |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||    
T  24818137 catcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttatgtagtctgttgaacaa 24818054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 325
Target Start/End: Original strand, 25282307 - 25282456
Alignment:
Q  176 tcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 275  Q
    |||||| |||||||||||  || ||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  || || || | ||||| ||||||||||||    
T  25282307 tcaaagtacgtccaacactggttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcgatgtccttcctcctcttattatgataactctt 25282406  T
Q  276 ttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
     || | |||| | ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25282407 ctgcctactccgagacactctcatcttctcttgaatgatcttaaccttct 25282456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 449
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863506
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 265  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |    ||| || |  |||||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  266 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactcc 365  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||  ||||| ||||||| || ||||| |  ||  | || ||||||||||| ||||| || ||| |       
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19863422  T
Q  366 ttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatg 449  Q
     || || |||||  |||||||||| || ||||  ||||||| |||| |||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  19863423 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19863506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 449
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868143
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 265  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |    ||| || |  |||||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  266 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactcc 365  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||  ||||| ||||||| || ||||| |  ||  | || ||||||||||| ||||| || ||| |       
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19868059  T
Q  366 ttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatg 449  Q
     || || |||||  |||||||||| || ||||  ||||||| |||| |||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  19868060 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19868143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20976059 - 20975953
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaact 472  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||    
T  20976059 gactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 20975960  T
Q  473 cgatcaa 479  Q
    | |||||    
T  20975959 ctatcaa 20975953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 322
Target Start/End: Original strand, 22283229 - 22283318
Alignment:
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacct 322  Q
    |||||||||||| ||| || || |  ||||||||||||||||| |  | |||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22283229 cttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataactcttctacctactctgagacactctcattttctcctgaatcatcttaacct 22283318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Original strand, 22982807 - 22982856
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||    
T  22982807 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctc 22982856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21326143 - 21325665
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326143 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 21326044  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21326043 ctcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 21325944  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325943 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 21325844  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21325843 ttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttctgc 21325744  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  21325743 atctccgaccagataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcgatcaa 21325665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 24675055 - 24675534
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24675055 tcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaa 24675154  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675155 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 24675254  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24675255 aggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatt 24675354  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  24675355 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgc 24675454  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  24675455 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaat 24675534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22757340 - 22756864
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757340 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 22757241  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22757240 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcac 22757141  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757140 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 22757041  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||||||||||||||||| |    
T  22757040 ttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactc--accaacacaacggagttctac 22756943  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| |||||| | ||||| |||| | ||||||| || |||||    
T  22756942 atctccgaccatataaagcctcaaagggtgccattccaatactagaacggtaactgttattgtacgtgaagtctatcaa 22756864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24708359 - 24707881
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708359 tcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 24708260  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708259 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 24708160  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24708159 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 24708060  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708059 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 24707960  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  24707959 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaa 24707881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 480
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23064122
Alignment:
Q  22 gatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 121  Q
    |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  122 ctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 221  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  222 gtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 23063963  T
Q  322 ttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcct 421  Q
    ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23063964 ttctcggtagtttgttcaacaatctctggtcctaagaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcct 23064063  T
Q  422 cgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  23064064 cataaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 23064122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 23188574 - 23189051
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23188574 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctca 23188673  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188674 ctcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 23188773  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23188774 aggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 23188873  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23188874 ttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacac-acggagttctgc 23188972  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  23188973 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcctaaactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaa 23189051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925304
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16925134  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925135 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 16925234  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16925235 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 16925304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16999044
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16998874  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998875 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 16998974  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16998975 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 16999044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145429
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 21145605  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| |||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21145604 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttttgcatc 21145505  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  21145504 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaa 21145429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16982196
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16982026  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982027 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 16982126  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16982127 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 16982196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063761
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17063591  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063592 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 17063691  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  17063692 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 17063761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 24261939 - 24262414
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  24261939 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactc 24262038  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24262039 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 24262138  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24262139 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 24262238  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24262239 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 24262338  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  24262339 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtggactcgatcaa 24262414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24878869 - 24878394
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  24878869 tcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactt 24878770  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  24878769 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 24878670  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24878669 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 24878570  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24878569 tcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacc 24878470  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  24878469 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgtcattccaatactataatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 24878394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44386443 - 44385968
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44386443 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactc 44386344  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44386343 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 44386244  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  44386243 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttc 44386144  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386143 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 44386044  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  44386043 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 44385968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9610180
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 9610010  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610011 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 9610110  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  9610111 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 9610180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27218057
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgt 27217890  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217891 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 27217990  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgat 476  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  27217991 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgat 27218057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22325730 - 22325255
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  22325730 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 22325631  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22325630 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 22325531  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22325530 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 22325431  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22325430 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacaccacggagttctgcatc 22325331  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  22325330 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 22325255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 24709602 - 24710077
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24709602 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 24709701  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24709702 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 24709801  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24709802 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 24709901  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709902 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 24710001  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||| |||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  24710002 tccgaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 24710077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 27370838 - 27371313
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||    
T  27370838 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactc 27370937  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  27370938 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcatagg 27371037  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27371038 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 27371137  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  27371138 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatc 27371237  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  27371238 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaa 27371313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868894
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||     
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttgg 10868724  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868725 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccaccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 10868824  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |  ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||    
T  10868825 cgtacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattgttataagtgaactcgatcaa 10868894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067419
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || || | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgt-gtgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17067249  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067250 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 17067349  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  17067350 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 17067419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 23138603 - 23138911
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23138603 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccta 23138702  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23138703 ctcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 23138802  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138803 aagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 23138902  T
Q  301 ttctcttga 309  Q
    || ||||||    
T  23138903 ttttcttga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 23550393 - 23550701
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23550393 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccta 23550492  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23550493 ctcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 23550592  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550593 aagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 23550692  T
Q  301 ttctcttga 309  Q
    || ||||||    
T  23550693 ttttcttga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27377348 - 27377101
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27377348 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 27377249  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27377248 cccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 27377149  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27377148 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 97 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24826063 - 24825681
Alignment:
Q  97 cccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24826063 cccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccag 24825964  T
Q  197 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 296  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24825963 tcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgcttt 24825864  T
Q  297 catcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagtt 396  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  24825863 catcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcaacccaacacaacggagtc 24825764  T
Q  397 ctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || || ||||||||| ||| ||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||    
T  24825763 ctacacctccgaccatacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaatgttaactattattatacgtgaactctatcaa 24825681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Original strand, 23087026 - 23087494
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||||||    
T  23087026 ggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgc 23087125  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  23087126 cactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgact 23087225  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  23087226 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctctctta 23087325  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 410  Q
    |||  |||||||| | | || | ||  ||||||| |||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  23087326 tcaatttaaccttttcaatagtctgacgaacaatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttccgcacctccgacc 23087425  T
Q  411 acacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||||| ||| | |||||||| |||||  | ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  23087426 atacaaagcttcgaatggtgccataccaatagtcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 23087494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211315
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    ||   |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatc 30211483  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||||| ||  ||||| |  |||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  30211482 aacttaaccttctcagtagtctgttgaataatgtatggtcttagtactacactctcattggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccat 30211383  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | | |||||||||| ||||    
T  30211382 acaacgtttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaat 30211315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 460
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529536
Alignment:
Q  18 atgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtt 117  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||  | || ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  118 ccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 217  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  218 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatctt 317  Q
    |||| |||||| |      |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||    
T  45529300 acacatggtcttc------aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaactt 45529393  T
Q  318 aaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaa 417  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||| || ||||| || || || |  ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||     
T  45529394 aaccttcttagtagtctgttgaacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaac 45529493  T
Q  418 gcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    || ||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  45529494 gcttcgaacggtgccattccaatgctaaaatggtaactgttat 45529536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27365908 - 27365499
Alignment:
Q  49 tgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaa 148  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  27365908 tgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaa 27365809  T
Q  149 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatc 248  Q
    | ||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  27365808 tgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtc 27365709  T
Q  249 ttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctct 348  Q
     || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   || | ||||||||| |  ||| |||||||||| || |||    
T  27365708 cttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtct 27365609  T
Q  349 ggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaat 448  Q
    ||||| || |  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||    
T  27365608 ggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaat 27365509  T
Q  449 gataactatt 458  Q
    | ||||||||    
T  27365508 ggtaactatt 27365499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 31830236 - 31830525
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  31830236 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 31830335  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31830336 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 31830435  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  31830436 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 31830525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358450
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||| | || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11358450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 23276357 - 23276820
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  23276357 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23276456  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| | |||||     
T  23276457 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcag 23276556  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  23276557 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 23276656  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
     | || ||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || || | ||| ||||| ||||||||| |||    
T  23276657 atgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccataca 23276756  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| || | | |||||||||| |||||    
T  23276757 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaa 23276820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 20832563 - 20832852
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20832563 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20832662  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20832663 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20832762  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  20832763 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatctt 20832852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41609218 - 41609047
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  41609218 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactc 41609119  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 175  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609118 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293825
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatctt 23293825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 1063329 - 1063618
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||| ||| ||||    
T  1063329 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgcca 1063428  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  1063429 cagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 1063528  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  1063529 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatctt 1063618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787786
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| || || |  ||| |     
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtc 27787639  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  || ||||| |  || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  27787640 tcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 27787739  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || || |||||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  27787740 ttcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaat 27787786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 332 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41608931 - 41608784
Alignment:
Q  332 tttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgc 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  41608931 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgc 41608832  T
Q  432 cattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  41608831 cattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 41608784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276299
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  ||  |||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccagtcctaa 22276200  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | |||||||| || || ||||||||| ||||    
T  22276201 caaggcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaact 22276299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 480
Target Start/End: Original strand, 12573970 - 12574398
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| ||||  || || || ||||||||||||||||| |    
T  12573970 gacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 12574069  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  || || || || | ||| || || || || ||||||||||||||  | ||    
T  12574070 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 12574169  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggt 351  Q
     || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| | |  ||||| |  || |||    
T  12574170 cctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggt 12574269  T
Q  352 cctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgat 451  Q
    || || || || | ||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  12574270 cccaacacaacactttctcttgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgat 12574369  T
Q  452 aactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || | | | |||||||| ||||||    
T  12574370 aactgttgttgtaggtgaactctatcaat 12574398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 275
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  36 atacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||  |  | || |||    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  136 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 235  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  236 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 275  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 206
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945138
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || |  || |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 206  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 24945138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 419
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128631
Alignment:
Q  175 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || |  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactct 25128486  T
Q  275 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccga 374  Q
    | |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| | | ||| |||| ||| | |||||| |  || | |||||||||    
T  25128487 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttggacaacctccgatcctaacaaaacactttcacccga 25128586  T
Q  375 ctcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagc 419  Q
    |||||||||||| ||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  25128587 ctcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagc 25128631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640342
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 12640441  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | |||||||| || || |||| |||| ||||    
T  12640440 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaact 12640342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831628
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 24831709  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattcc 437  Q
     |   |    || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  24831708 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcc 24831628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833356
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 95  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaa 24833356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  258 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 23817696 - 23817476
Alignment:
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 334  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  ||| | |    
T  23817696 tgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggatcatcttaactttttccgtagtct 23817597  T
Q  335 gttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccat 434  Q
     ||| |||| ||| |||||||| |   | | ||  |  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  23817596 cttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttatcttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 23817497  T
Q  435 tccaatcctagaatgataact 455  Q
     || || ||||||||| ||||    
T  23817496 accgatactagaatgaaaact 23817476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22762274 - 22761992
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||| || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||||||  | | ||| |||||||||||    
T  22762274 acttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataact 22762175  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| |  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | | ||| ||||  || |||||||| |   | | ||| ||     
T  22762174 cttcttcctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcct 22762075  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    || ||||||||||||||||  || || || ||||||||| ||||||| ||  | |||||||| || || ||||||||| ||||    
T  22762074 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaact 22761992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24570223
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    ||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaacctt 24570223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 45676726 - 45676685
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676726 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 23599837 - 23599877
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 41  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599837 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 323
Target Start/End: Original strand, 14708908 - 14708975
Alignment:
Q  256 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14708908 cgcttatcatgataactcttctgtctactccacgatgctttcatcttcttctggatcatcttaacctt 14708975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 19652554 - 19652472
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  19652554 gactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 19652472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23817798 - 23817750
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 221  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  23817798 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacac 23817750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Original strand, 28144701 - 28144749
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 221  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||    
T  28144701 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacac 28144749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17045424 - 17044946
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045424 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 17045325  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17045324 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcac 17045225  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17045224 aggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 17045125  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045124 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 17045025  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17045024 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 17044946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 20249800 - 20250279
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20249800 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaaccca 20249899  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20249900 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcac 20249999  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250000 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 20250099  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250100 ttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctggtcctaagaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgc 20250199  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  20250200 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 20250279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 19106320 - 19106795
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19106320 tcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactc 19106419  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  19106420 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcatagg 19106519  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19106520 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 19106619  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19106620 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatc 19106719  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  19106720 tccgaccatacaaagactcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 19106795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 20136728 - 20137207
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  20136728 tcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaa 20136827  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20136828 cacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 20136927  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20136928 aggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatc 20137027  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20137028 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgc 20137127  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  20137128 atctccgaccatacaaagcttcataaggcgccattcctatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 20137207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 459
Target Start/End: Original strand, 21747485 - 21747942
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21747485 tcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaaccca 21747584  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21747585 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 21747684  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747685 aggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 21747783  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21747784 ttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaaccaacacaacggagttctgc 21747883  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatta 459  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21747884 atctccgagcatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataattatta 21747942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 50620653 - 50620174
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50620653 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaaccca 50620554  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50620553 ctcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 50620454  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50620453 aggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatc 50620354  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620353 ttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctcaggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 50620254  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  50620253 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcaattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 50620174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16079042 - 16078583
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16079042 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16078943  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16078942 ctcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 16078843  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||                   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16078842 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc-------------------ctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 16078762  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16078761 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 16078662  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  16078661 atctccgaccatacaaagccttaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 16078583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16350993 - 16350530
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  16350993 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16350894  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16350893 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16350794  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16350793 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 16350694  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    | ||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16350693 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16350594  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16350593 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 16350530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33391435 - 33390960
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  33391435 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 33391336  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33391335 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 33391236  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33391235 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 33391136  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391135 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 33391036  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  33391035 tccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaa 33390960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 51333899 - 51333424
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51333899 tcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 51333800  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  51333799 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 51333700  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  51333699 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 51333600  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333599 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 51333500  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  51333499 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 51333424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 476
Target Start/End: Original strand, 21830256 - 21830728
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21830256 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 21830355  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21830356 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 21830455  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21830456 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 21830555  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||  ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21830556 tcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatc 21830655  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgat 476  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  21830656 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgat 21830728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 21836903 - 21837378
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  21836903 tcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 21837002  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21837003 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 21837102  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  21837103 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttc 21837202  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21837203 tcttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatc 21837302  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  21837303 tccgaccatacaaagcgtcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 21837378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41354875 - 41354400
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41354875 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 41354776  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41354775 ggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 41354676  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  41354675 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 41354576  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354575 tctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 41354476  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  41354475 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 41354400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19761265 - 19760797
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19761265 ggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgc 19761166  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19761165 caccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgact 19761066  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  19761065 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgga 19760966  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 410  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  19760965 tcaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgacc 19760866  T
Q  411 acacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||| |||||    
T  19760865 atacagagcttcgaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacatgaactctatcaa 19760797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369726
Alignment:
Q  21 agatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttcca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  121 actctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaaca 220  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  221 cgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 320  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttac 16369566  T
Q  321 cttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcc 420  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||||||||||| || ||    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  16369567 cttttcaatagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcc 16369666  T
Q  421 tcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||  || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  16369667 tcaaaaagtgtcattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaat 16369726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50612825 - 50612602
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50612825 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaaccca 50612726  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50612725 ctcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 50612626  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  50612625 aggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664980
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 19664980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940171
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatctt 20940171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 21163230 - 21163381
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21163230 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaaccca 21163329  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 152  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21163330 ctcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 37677041 - 37677331
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||    
T  37677041 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 37677140  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  37677141 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 37677240  T
Q  213 caa-aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| ||| || || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37677241 caagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 37677331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854569
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || ||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctct 19854569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294663
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 20294663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550289
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatctt 31550289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856866
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||  | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 305  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||| |||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctc 20856866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22433510 - 22433206
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  22433510 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 22433411  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    || |||| || || || |||||||||| ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22433410 ttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22433311  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| || || || || |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  22433310 gaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 22433211  T
Q  316 ttaac 320  Q
    |||||    
T  22433210 ttaac 22433206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20836240 - 20835819
Alignment:
Q  61 aacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggag 160  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  20836240 aacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggag 20836141  T
Q  161 tcaact---tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacg 257  Q
    ||||||   |||| ||||| || | |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || || | ||||| |||  | || | |||    
T  20836140 tcaacttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacg 20836041  T
Q  258 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaag 357  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||  ||| | || ||||| |  |||||||| ||     
T  20836040 cttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaa 20835941  T
Q  358 actactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactat 457  Q
    || || |  || || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||| | || ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  20835940 acaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgt 20835841  T
Q  458 tatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | | | |||||||||| |||||    
T  20835840 tgttgtacgtgaactctatcaa 20835819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075167
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     | ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcatctt 20075167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 302
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308076
Alignment:
Q  117 tccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaa 216  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| || |||| |    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  217 aacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 41308076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 133 - 302
Target Start/End: Original strand, 11382676 - 11382845
Alignment:
Q  133 atctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 232  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || || || || |    
T  11382676 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccct 11382775  T
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    | |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11382776 cctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11382845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244437
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || || |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 288  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831479
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 20831479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 450
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914609
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
      |||| |||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || ||| ||||    
T  20914416 atttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggttctaa 20914515  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatga 450  Q
     |   | | ||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| ||||    
T  20914516 catagcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagtatga 20914609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518993
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaacctt 46518993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20395390 - 20395194
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || || | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20395390 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20395291  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |  |||||||||| || || |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  20395290 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202372
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | |||| | |||||||||||||  || || ||  | |||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
    ||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 21202372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22135756 - 22135546
Alignment:
Q  212 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 311  Q
    |||||||||| ||||| ||  | ||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  22135756 tcaaaaacacatggtcaccaacctgaaacttaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaat 22135657  T
Q  312 catcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 411  Q
    ||||||||| || |  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||| |   | | |||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||||    
T  22135656 catcttaacttttttcgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgacca 22135557  T
Q  412 cacaaagcctc 422  Q
     ||||||||||    
T  22135556 tacaaagcctc 22135546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 24476942 - 24477021
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 92  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  24476942 atcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtgg 24477021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaac 219  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 317
Target Start/End: Original strand, 20184364 - 20184448
Alignment:
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatctt 317  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||| || | |||||| ||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  20184364 cttgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatctt 20184448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 5989 - 6468
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5989 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 6088  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6089 ctcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 6188  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6189 aggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatc 6288  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgc 6388  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  6389 atctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 6468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1410
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||  ||| || || ||| |  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||||   || |     
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtc 1532  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || || |||||  |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  1531 tgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 1432  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataact 455  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  1431 ttccaatactcgaatggtaact 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 157 - 421
Target Start/End: Original strand, 22816 - 23080
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || ||||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 23015  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcct 421  Q
     |   | | |||||| |||||||||||||||||||| || |  || |||| |||| |||||||||    
T  23016 caaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtccaacacctcctaccatacaaagcct 23080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16252522 - 16252044
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16252522 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatccca 16252423  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252422 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 16252323  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16252322 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttatt 16252223  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16252222 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 16252123  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16252122 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaataatagaatgataactattattgtacgtgaactcgatcaa 16252044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Original strand, 12523614 - 12524090
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12523614 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactc 12523713  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  12523714 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 12523813  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12523814 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 12523913  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12523914 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 12524013  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  12524014 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaat 12524090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 14680505 - 14680980
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680505 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 14680604  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  14680605 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 14680704  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  14680705 agtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttc 14680804  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680805 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 14680904  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  14680905 tccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaa 14680980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16355522 - 16355044
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355522 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16355423  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355422 ctcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 16355323  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  16355322 aggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcatt 16355223  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  16355222 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattctcc 16355123  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  16355122 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcaaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaa 16355044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 7090368 - 7090846
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7090368 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 7090467  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7090468 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcac 7090566  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7090567 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatc 7090666  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  7090667 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgc 7090766  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  7090767 atctccgaccatataaagcctcataaggttccattctaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 7090846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18227523 - 18227045
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18227523 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatccca 18227424  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18227423 ctcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 18227324  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18227323 aggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 18227224  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18227223 ttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgc 18227124  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18227123 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 18227045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297618
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 18297448  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297449 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 18297548  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  18297549 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 18297618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19778867 - 19778392
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19778867 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 19778768  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19778767 gataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 19778668  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19778667 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 19778568  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778567 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 19778468  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  19778467 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaa 19778392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12477013
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 12476843  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| | || |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476844 atcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 12476943  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  12476944 catacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 12477013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14266973 - 14266498
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14266973 tcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 14266874  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  14266873 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcatagg 14266774  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14266773 ggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 14266674  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    |||   ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14266673 tctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 14266574  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  14266573 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaa 14266498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14304051 - 14303577
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14304051 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 14303952  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  14303951 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcatagg 14303853  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  14303852 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttc 14303753  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14303752 tcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 14303653  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  14303652 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagcatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 14303577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 27711286 - 27711749
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  27711286 acatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27711385  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27711386 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaa 27711485  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27711486 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 27711585  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    | ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27711586 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 27711685  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  27711686 aagtctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 27711749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Original strand, 14652255 - 14652721
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14652255 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgcca 14652354  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14652355 ccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 14652454  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14652455 caaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 14652554  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| || | ||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  14652555 atcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccat 14652654  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||    
T  14652655 acagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaa 14652721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386825
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8386655  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386656 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 8386755  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  8386756 catacaaagcttcgaacggcgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 8386825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23956160
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgg 23955990  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955991 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 23956090  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  23956091 catacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaa 23956160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039003
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29039173  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039172 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 29039073  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  29039072 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 29039003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Original strand, 14159427 - 14159899
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14159427 tcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 14159526  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14159527 ctcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcat 14159626  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
     ||||| |||||||  ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14159627 gggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatc 14159726  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||| || || ||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14159727 ttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctccggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 14159826  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14159827 atctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactc 14159899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 40472978 - 40473453
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40472978 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 40473077  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40473078 ggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 40473177  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  40473178 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttc 40473277  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40473278 tcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatc 40473377  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  40473378 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcaatcaa 40473453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14851429 - 14850965
Alignment:
Q  15 cacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14851429 cacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacc 14851330  T
Q  115 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 214  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  14851329 gttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaa 14851230  T
Q  215 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 314  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14851229 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcat 14851130  T
Q  315 cttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacac 414  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |  ||| ||    
T  14851129 cttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgagccaacacaacggagttctgcaccttcttccatac 14851030  T
Q  415 aaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | | |||||||| |||||    
T  14851029 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaa 14850965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8053697 - 8053222
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  8053697 tcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacac 8053598  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8053597 ggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 8053498  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8053497 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 8053398  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8053397 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatc 8053298  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  8053297 tccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 8053222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149759
Alignment:
Q  31 ggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccg 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  131 atatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  231 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttct 15149759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003223
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15003387  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || || || | ||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||| |||    
T  15003386 ttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctccacttccgaccataca 15003287  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  15003286 aagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 15003223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070826
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    || |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 15070659  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    ||||| |||||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||     
T  15070660 atcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccat 15070759  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  15070760 acaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 15070826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 210 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640023
Alignment:
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1640193 atcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatcttcgac 1640094  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||||    
T  1640093 catacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaat 1640023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14927336 - 14927151
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14927336 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 14927237  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 186  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927236 ctcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15414885
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 265  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  266 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactcc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||  || ||||| |  ||| | |||||||| || |||||||| || | ||| |     
T  15415098 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcccttatcaatttgaccttttccgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacact 15414999  T
Q  366 ttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | ||    
T  15414998 ttcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtac 15414899  T
Q  466 gtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||||    
T  15414898 gtgaactctatcaa 15414885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3265119 - 3264830
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  3265119 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 3265020  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  3265019 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 3264920  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3264919 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 3264830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11207556 - 11207267
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  11207556 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 11207457  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11207456 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 11207357  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11207356 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11207267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Original strand, 15245874 - 15246307
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || | |||||  || ||||| |    
T  15245874 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactg 15245973  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||     
T  15245974 ttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcag 15246073  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || ||||| || ||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  15246074 aaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15246173  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || || || | ||| || ||||||||| |  | || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  15246174 tttaccttcttcgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaactagaataaaggagttctgcacctccgaccataca 15246273  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatg 449  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || |||||    
T  15246274 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatg 15246307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29453862 - 29453573
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  29453862 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 29453763  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  29453762 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 29453663  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29453662 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 29453573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146148
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 16146148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 201 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676417
Alignment:
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactc 364  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 16676417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661902
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 44661902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649313
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 1649313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891218
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||  | ||| ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaa-cccatcctatatgcca 20891028  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | |||||||| || || || |||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 20891218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223154
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 33223154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606039
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| |     
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 51606186  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  || ||||| |  || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  51606185 tcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 51606086  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || || |||||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  51606085 ttcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaat 51606039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15359313 - 15358988
Alignment:
Q  115 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 214  Q
    |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||     
T  15359313 gttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcg 15359214  T
Q  215 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 314  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  15359213 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcat 15359114  T
Q  315 cttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacac 414  Q
    ||| |||||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||    
T  15359113 ctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatac 15359014  T
Q  415 aaagcctcgtaaggtgccattccaat 440  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  15359013 aaagcttcgaacggtgccataccaat 15358988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375247
Alignment:
Q  159 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 258  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  259 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaaga 358  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||| |    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgtacaacttctggtcctaaca 55375338  T
Q  359 ctactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatg 449  Q
       | | |||||| || ||||||||||||||| | || || || |||| |||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||    
T  55375337 aagcactttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatg 55375247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 339 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15147623 - 15147483
Alignment:
Q  339 aacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattcca 438  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  15147623 aacaatatctggtcctaagaacactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcca 15147524  T
Q  439 atcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  15147523 atactagaatgataactattattatacgtgaactcaatcaa 15147483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13248034
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  ||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 13247935  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | | ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||  | || ||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  13247936 caaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccatcctaatactagaatgaaaact 13248034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293040
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| |||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 15293139  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | | ||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  15293138 caaagcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 15293040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 256 - 479
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15078048
Alignment:
Q  256 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtccta 355  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  ||| | || ||||| |  |||||||| |    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15077924  T
Q  356 agactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    | ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  15077925 acactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15078024  T
Q  456 attatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     || | | |||||||||| |||||    
T  15078025 gttgttgtacgtgaactctatcaa 15078048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291224
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||| | ||||||||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 9291125  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | | ||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||||||||  | |||||||| || || ||||||||| ||||    
T  9291126 caaagcactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaact 9291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 455
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900775
Alignment:
Q  139 tacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaa 238  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||  |||| |||||| || |||| ||| || || || || || ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  239 actcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttg 338  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||  ||| | |  ||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatg 27900658  T
Q  339 aacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattcca 438  Q
    ||| |  || ||||| || || || | ||| |||||||||||||| || || | ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||    
T  27900659 aaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacca 27900758  T
Q  439 atcctagaatgataact 455  Q
    || || ||||| |||||    
T  27900759 atactcgaatggtaact 27900775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997705
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  |  ||||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaa 14997606  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || |  |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  14997607 caaagcactctctctggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaact 14997705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 479
Target Start/End: Original strand, 8706078 - 8706331
Alignment:
Q  226 tctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||   || | |||||| || |    
T  8706078 tctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaacttttt 8706177  T
Q  326 aagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgta 425  Q
       || | || |||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |    
T  8706178 ctatagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaa 8706277  T
Q  426 aggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     |||| |||||  || |||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  8706278 tggtgtcattcatatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 8706331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18607904 - 18607823
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagat 85  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18607904 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132293
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| || | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  ||||| ||||| |  || | ||||||     
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttctggacctaacaaaacactttcacct 12132375  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||| || ||||||||||  | |||| ||| || || ||||||||| ||||    
T  12132374 gactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagaatgaaaact 12132293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445227
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || |||||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 16445227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 302
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752829
Alignment:
Q  138 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttga 237  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  238 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 16752829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703082
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 42703070  T
Q  234 ttgaaactcaag 245  Q
    ||||||||||||    
T  42703071 ttgaaactcaag 42703082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9849683 - 9849491
Alignment:
Q  133 atctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 232  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |    |||||||||||||  || |||||      
T  9849683 atctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccga 9849584  T
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
    ||||||| |||| ||| || ||  | ||||||||| ||||||| |  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9849583 cttgaaattcaatatccttcctctgtttatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttct 9849491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  53 acacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 152  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  153 tctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacca 195  Q
      | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12343028 - 12342751
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||||||   ||||| ||||| || || || ||  | |||||||||| ||  || || | |||||||||||||||    
T  12343028 acttcaaagcacgtctaacatcggttacaggatacactctaaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcaatattcttcctcctcttatcatgataact 12342929  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| || | |||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||| |||| ||| |||||||  |   | | ||||||     
T  12342928 cttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacctccggtcctagtaaagcactttcacct 12342829  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatga 450  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||    
T  12342828 gactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgccatcccaatactagaatga 12342751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415209
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatac 108  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactctatac 15415209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 16685361 - 16685513
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||| || | |||||||||||| | || || ||  ||||||| | || ||| ||  | | ||||||||||||| |    
T  16685361 acttcaaagcacacccaacaccggttacatgattcactctcaaaaacccatgatcaccaacttgaaattaaatatccttcatcctcttatcatgataaat 16685460  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
     || || | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16685461 tttctgcctactctgagacgctctcatcttctcctgaatcatcttaactttct 16685513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 15319533 - 15319648
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||  |||||| |||||| | |||||||| |||| ||| |||||||| | ||| || |||||||  || ||||| |    
T  15319533 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaacccactctgtatgccactg 15319632  T
Q  116 ttccaactctttccga 131  Q
    |||||||||| |||||    
T  15319633 ttccaactctctccga 15319648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1649242 - 1649160
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||| ||| ||||| || ||||| |||||    
T  1649242 gactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacataccaatactcgaatggtaact 1649160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18550234 - 18550180
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaaca 220  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18550234 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaaca 18550180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 15351963 - 15351934
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatcc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351963 tcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359327
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatc 68  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatc 15359327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 25765771 - 25765313
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25765771 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccca 25765672  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765671 ctcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 25765572  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  25765571 a-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatt 25765473  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25765472 ttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgc 25765373  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25765372 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattat 25765313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 12497825 - 12498303
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497825 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 12497924  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12497925 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcac 12498024  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12498025 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 12498124  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12498125 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 12498224  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  12498225 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 12498303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12511076 - 12510598
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511076 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 12510977  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12510976 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcac 12510877  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12510876 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 12510777  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12510776 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 12510677  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  12510676 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 12510598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22762937 - 22762441
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22762937 tcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 22762838  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22762837 cttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 22762738  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  22762737 aggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatc 22762638  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22762637 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 22762538  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaattgatgatgtccatctca 497  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||| | ||||||    
T  22762537 atctccgaccacacaaagtctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctca 22762441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 19864486 - 19864964
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864486 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 19864585  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19864586 ctcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcac 19864685  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864686 aggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 19864785  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864786 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 19864885  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  19864886 atctccgaccatataaagccgcaaaaggtgccattccaataccaaaatgataactattattatacgtgaactcaatcaa 19864964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25610343 - 25609872
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25610343 tcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaa 25610244  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25610243 cacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcac 25610144  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25610143 aggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatc 25610044  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25610043 ttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgc 25609944  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaact 472  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25609943 atctccgaccatacaaagcatcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaact 25609872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16963849 - 16963377
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16963849 tcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 16963750  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963749 cacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 16963650  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963649 aggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 16963550  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16963549 ttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttctgc 16963450  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  16963449 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgatagctattgttagacgtgaactc 16963377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22079170 - 22078701
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22079170 tcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 22079071  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22079070 ctcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcac 22078971  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22078970 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatc 22078871  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078870 ttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctctagtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 22078771  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaact 472  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  22078770 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa--ataactattattgtacgtgaact 22078701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 12505154 - 12505632
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12505154 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccca 12505253  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12505254 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcac 12505353  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12505354 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcata 12505453  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12505454 ttctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctcgggtcctaagaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 12505553  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  12505554 atctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 12505632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18408425 - 18407945
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18408425 tcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccca 18408326  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18408325 cccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 18408226  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18408225 acgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatc 18408126  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408125 ttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaataccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 18408026  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatta-tgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | |||||||||| ||||||    
T  18408025 atctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactagtatttgtacgtgaactctatcaat 18407945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27331915 - 27331456
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27331915 tcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 27331816  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27331815 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 27331716  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27331715 aggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatc 27331616  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331615 ttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 27331516  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27331515 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattat 27331456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27392655 - 27392196
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27392655 tcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 27392556  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27392555 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 27392456  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27392455 aggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatc 27392356  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392355 ttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 27392256  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27392255 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattat 27392196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543088
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttc 1543264  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1543263 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatc 1543164  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  1543163 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaa 1543088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16928122 - 16927665
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16928122 tcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 16928023  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16928022 gacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcac 16927923  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16927922 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatc 16927823  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||| || |||   ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927822 ttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 16927723  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16927722 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatt 16927665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24313647 - 24313172
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24313647 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 24313548  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24313547 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 24313448  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24313447 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 24313348  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313347 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 24313248  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  24313247 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 24313172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28263676 - 28263201
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28263676 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 28263577  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28263576 ggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 28263477  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28263476 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 28263377  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28263376 tctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcata 28263277  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  28263276 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 28263201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28342425 - 28341950
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28342425 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 28342326  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28342325 ggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 28342226  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28342225 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 28342126  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28342125 tctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcata 28342026  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  28342025 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 28341950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29591924
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29592094  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592093 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 29591994  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  29591993 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 29591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Original strand, 23078268 - 23078740
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23078268 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 23078367  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23078368 ctcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcac 23078467  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23078468 aggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatc 23078567  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23078568 ttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgc 23078667  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  23078668 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactc 23078740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16627196 - 16626721
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  16627196 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 16627097  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16627096 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 16626997  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16626996 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 16626897  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626896 tcttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 16626797  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16626796 tccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaa 16626721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 2875282 - 2874807
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2875282 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 2875183  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2875182 ggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 2875083  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  2875082 agtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttc 2874983  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2874982 tcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccagcacaacggggttctgcatc 2874883  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  2874882 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 2874807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 25112354 - 25112829
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25112354 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 25112453  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25112454 ggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 25112553  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  25112554 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttc 25112653  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  25112654 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataacggaattctgcatc 25112753  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  25112754 tccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 25112829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28292851 - 28292375
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28292851 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 28292752  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28292751 ggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 28292652  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28292651 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 28292552  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292551 tctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 28292452  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  28292451 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaat 28292375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 27187238 - 27187713
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  27187238 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactc 27187337  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27187338 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27187437  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27187438 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 27187537  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27187538 tctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatc 27187637  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  27187638 tccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 27187713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27262002 - 27261527
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  27262002 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactc 27261903  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27261902 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27261803  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27261802 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 27261703  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27261702 tctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatc 27261603  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  27261602 tccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 27261527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 5839701 - 5839223
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  5839701 tcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaa 5839602  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  5839601 ctcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcat 5839502  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5839501 aggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatt 5839402  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||| |||||| |    
T  5839401 ttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttctac 5839302  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  5839301 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactattattatacgtgaactctatcaa 5839223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21833463 - 21833172
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833463 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 21833364  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21833363 ctcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcac 21833264  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833263 aggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197608
Alignment:
Q  24 tggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaact 123  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  124 ctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgt 223  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  224 ggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    | | ||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttacctt 18197707  T
Q  324 ctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    || |||| | |||| ||||||| |||||||||| || ||    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18197706 ctcagtagtctgttaaacaatcgctggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctc 18197608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 17032364 - 17032582
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17032364 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 17032463  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  17032464 ggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcatagg 17032563  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacg 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17032564 agtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471878
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||     
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatt 21471711  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||| |||||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || ||| | | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||     
T  21471712 aacttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactgcactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgtccat 21471811  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  21471812 acaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 21471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768468
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||| ||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||| |||||||  ||| ||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtagtt 25768322  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  25768323 tgatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgcca 25768422  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| || ||||| ||||  || | | |||||||||| |||||    
T  25768423 taccaatactcgaatggtaacagttgttgtacgtgaactctatcaa 25768468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 260 - 479
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434146
Alignment:
Q  260 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 22434026  T
Q  360 tactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatta 459  Q
     |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22434027 cactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgtta 22434126  T
Q  460 tgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | | | |||||||| |||||    
T  22434127 ttgtaagtgaactctatcaa 22434146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 293
Target Start/End: Original strand, 25750623 - 25750900
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  25750623 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 25750722  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||     
T  25750723 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcag 25750822  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 293  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750823 aaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645611
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggt 351  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   |||| ||||||||| |  ||| |||||||||| || ||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 34645718  T
Q  352 cctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgat 451  Q
    || || |  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| |    
T  34645717 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggt 34645618  T
Q  452 aactatt 458  Q
    |||||||    
T  34645617 aactatt 34645611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 460
Target Start/End: Original strand, 15459204 - 15459594
Alignment:
Q  70 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||     
T  15459204 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 15459303  T
Q  170 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 269  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15459304 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggta 15459403  T
Q  270 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttca 369  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||  ||| | |  ||||| |  || ||||| || || || | |||     
T  15459404 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactttct 15459503  T
Q  370 cccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| || || ||||||||| | ||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  15459504 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttat 15459594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14131613 - 14131361
Alignment:
Q  49 tgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaa 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14131613 tgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatacggaccaa 14131514  T
Q  149 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatc 248  Q
    ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| || ||    
T  14131513 taaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtc 14131414  T
Q  249 ttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 301  Q
     || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131413 cttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 14131361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796636
Alignment:
Q  35 catacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 234  Q
     |||||| ||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||    
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 334  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||  ||| | |    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtct 22796781  T
Q  335 gttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccat 434  Q
    | ||||| |  || ||||  || ||||| |  || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | | | ||||||||    
T  22796780 gatgaaccaaatccggtcgcaacactacactctctcctgactcaaatcaacataaaggagtcctgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccat 22796681  T
Q  435 tccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  22796680 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 22796636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879554
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | || |||||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||   || | |    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctcttattaac 19879411  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    |||||||| |  ||| |||||||||| || ||||| || || |  || | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||    
T  19879412 ttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggccccaacatcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccataca 19879511  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    | || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  19879512 atgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 19879554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 11280936 - 11280530
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  11280936 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11280837  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  11280836 actttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11280737  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggt 351  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   || | ||||||||| |  ||| |||||||||| || ||||||    
T  11280736 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 11280637  T
Q  352 cctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgat 451  Q
    || || |  || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| |    
T  11280636 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgatcatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggt 11280537  T
Q  452 aactatt 458  Q
    |||||||    
T  11280536 aactatt 11280530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 22433796 - 22433930
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433796 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 22433895  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433896 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 22433930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11288029 - 11287680
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  11288029 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11287930  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  11287929 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11287830  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggt 351  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   || | ||||||||| |  ||| |||||||||| || ||||||    
T  11287829 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 11287730  T
Q  352 cctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgca 401  Q
    || || |  || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11287729 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgca 11287680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794946
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |  | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||| |    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 18794803  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    |||||||| |  ||| | ||||| || || ||||| || || |  || | ||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||  |||    
T  18794804 ttaaccttttctgtagtctgttgcactatgtctggccccaacatcacactttctcctaactcaaaccaacacaaaggagttatgcaccttcgaccgtaca 18794903  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    | || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  18794904 aggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 18794946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10469030
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 10469030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564157
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| || || || ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 324  Q
     ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||   |||| |||||||||     
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttt 21564291  T
Q  325 taagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgt 424  Q
    |   || | || ||||| || |||||||| || |  || | ||| || |||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||  ||||||| |||     
T  21564290 tttttagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtccggcacctccgaccgtacaaagcttcga 21564191  T
Q  425 aaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    | ||  |||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  21564190 acggaaccataccaatactcgaatggtaactatt 21564157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364512
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 24364512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 480
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1641050
Alignment:
Q  145 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 244  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  245 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaat 344  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||  || ||||| |  ||| | || ||||| ||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttctgtagtctgatgaactat 1640914  T
Q  345 ctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatccta 444  Q
     |||||||| || | ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| | |||||||| ||||| ||     
T  1640915 atctggtcccaacattacactttcacccgacttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatactc 1641014  T
Q  445 gaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  1641015 gaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaat 1641050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 302
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415586
Alignment:
Q  81 aagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaa 180  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  181 gcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  281 gactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatctt 17415586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27561048 - 27560645
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| |    
T  27561048 gacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatga 27560949  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | ||    
T  27560948 acttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 27560849  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggt 351  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| || || |  ||| | |  ||||| |  || |||    
T  27560848 tctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatccggt 27560749  T
Q  352 cctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgat 451  Q
    || || || || | ||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  27560748 cccaacacaacactttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgat 27560649  T
Q  452 aact 455  Q
    ||||    
T  27560648 aact 27560645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766329
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||| || ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatctt 8766329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  208 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  308 g 308  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743116
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtccta- 355  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || |||||||     
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctac 25743214  T
Q  356 agactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    | |  |||  |||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25743213 aaagcact--ttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccaatactagaatgaaaact 25743116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28283244 - 28282816
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| || |  || || || ||||||||||| ||||| |    
T  28283244 gacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatga 28283145  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | ||    
T  28283144 acttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctt 28283045  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggt 351  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| | |  ||||| |  || |||    
T  28283044 tctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggt 28282945  T
Q  352 cctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgat 451  Q
    || |  || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  28282944 cccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgat 28282845  T
Q  452 aactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || | | | |||||||| ||||||    
T  28282844 aactgttgttgtaggtgaactctatcaat 28282816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 419
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098267
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | | ||| ||||  || ||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 16098204  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagc 419  Q
     |   | | ||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  16098205 caaggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 16098267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382401
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 16382500  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | |||||||| || || |||| |||| ||||    
T  16382499 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaact 16382401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14381850 - 14381471
Alignment:
Q  100 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  14381850 actctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 14381751  T
Q  200 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 299  Q
     |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14381750 taggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcat 14381651  T
Q  300 cttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctg 399  Q
    ||| |||   |||||||| || ||||  ||| | || ||||| |  || | ||| || || || |  || |  ||||||||||| || || ||||| ||     
T  14381650 cttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacacgacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagtccta 14381551  T
Q  400 catctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||||| |||||    
T  14381550 cacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaa 14381471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  156 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 255  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  256 cgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648812
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || |||||||| |   |    || ||     
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaataaagcattctctccg 1648895  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  1648894 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 1648812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078392
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||| || || || ||  | |||||||| | ||| |||||      
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || ||||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaa 15078491  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | | ||| || |||||||||||||||||||| ||  | || |||||| || ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15078490 caaggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaact 15078392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996501
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || ||||||||||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 23996402  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||| |||||  |  |||||||||| || |||| |||| ||||    
T  23996403 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgccattccgatactagcatgaaaact 23996501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 419
Target Start/End: Original strand, 18800870 - 18801159
Alignment:
Q  130 gatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctc 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || |    
T  18800870 gatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccc 18800969  T
Q  230 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagt 329  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||  ||    
T  18800970 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgt 18801069  T
Q  330 aatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagc 419  Q
    | | || ||||| |  || ||||| || || || | ||| ||  |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18801070 agtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagc 18801159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18837936
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | || | ||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || ||| ||||    
T  18838134 tcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtgctaa 18838035  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||  || ||||||||| ||||    
T  18838034 catagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcggatactagaatgaaaact 18837936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21412999
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||  || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||   | |||||||| | | | | ||| ||     
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactcccggtcctaacaatgcgctttctccg 21413049  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    || ||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||    
T  21413048 gattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctc 21412999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 455
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571904
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |  ||| ||| ||| | ||  ||||||| ||| |   | | ||||||     
T  18571722 cttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtttcttgcataacttctggtcttaataaagcactttcacct 18571821  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||||||||||||||||| | || || || |||| |||| ||||||||||  | || | |||||| || ||||||||| ||||    
T  18571822 gactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtcattccgatactagaatgaaaact 18571904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 320
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655601
Alignment:
Q  175 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |   || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | ||||| |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  275 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 320  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 25655601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 455
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233462
Alignment:
Q  160 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 259  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  260 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagac 359  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  ||  ||||||| |     
T  16233267 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccagtcctaacaa 16233366  T
Q  360 tactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
      | |  || || |||||||||||||||||||| || || || || |||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  16233367 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 16233462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787809
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgccactg 18787801  T
Q  116 ttccaact 123  Q
    ||||||||    
T  18787802 ttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640710
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccac 113  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 449
Target Start/End: Original strand, 19453591 - 19453667
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatg 449  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || |||||    
T  19453591 gactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatg 19453667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 14326 - 14804
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14326 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 14425  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14426 cccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 14525  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14526 aggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 14625  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14626 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctac 14725  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||    
T  14726 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaa 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 589 - 1064
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  589 tcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactt 688  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  689 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 788  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  789 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 888  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| | || | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  889 tcttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 988  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  989 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactttaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 1064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 642 - 1121
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  642 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaa 741  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  742 cacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 841  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  842 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatc 941  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  942 ttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 1041  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  1042 atctccgaacatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17662 - 17184
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662 tcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 17563  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17562 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 17463  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  17462 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatt 17363  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17362 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttcgggtcctaagaccactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgc 17263  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17262 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 17184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11553445 - 11552970
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11553445 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactc 11553346  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  11553345 gataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 11553246  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  11553245 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttc 11553146  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553145 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 11553046  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  11553045 tccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 11552970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 12687428 - 12687903
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12687428 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactc 12687527  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  12687528 gataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 12687627  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12687628 agtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 12687727  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687728 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttggacaatctctggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 12687827  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  12687828 tccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 12687903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15154998 - 15154524
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15154998 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaaccca 15154899  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15154898 ctcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 15154799  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  15154798 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatc 15154699  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||     ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154698 ttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatc-----tcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 15154604  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  15154603 atctccgaccatacaaagcttcataaggtgccatcccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 15154524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 14954547 - 14955022
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14954547 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactc 14954646  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  14954647 gataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 14954746  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14954747 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 14954846  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954847 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 14954946  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  14954947 tccgaccatacaaagtctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 14955022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 8707532 - 8708007
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8707532 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 8707631  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8707632 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 8707731  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8707732 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 8707831  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707832 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 8707931  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  8707932 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaa 8708007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15161400 - 15160925
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15161400 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 15161301  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15161300 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 15161201  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15161200 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctc 15161101  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15161100 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 15161001  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15161000 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 15160925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 10870922 - 10871397
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10870922 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactc 10871021  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10871022 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 10871121  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10871122 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 10871221  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871222 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 10871321  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  10871322 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 10871397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8199030
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8198860  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198861 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 8198960  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  8198961 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 8199030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11237556 - 11237081
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11237556 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 11237457  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11237456 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 11237357  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  11237356 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctc 11237257  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11237256 tcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatc 11237157  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  11237156 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatggtaactattattgtatgtgaactcgatcaa 11237081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 18177669 - 18178144
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18177669 tcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 18177768  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||    
T  18177769 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttatagg 18177868  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18177869 agtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 18177968  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18177969 tctcgaatcatctaaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 18178068  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  18178069 tccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaa 18178144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 14332321 - 14332799
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14332321 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaaccca 14332420  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14332421 ctcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 14332520  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14332521 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 14332620  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  14332621 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgc 14332720  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  14332721 atctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 14332799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 4 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 18552101 - 18551645
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  18552101 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 18552002  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18552001 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 18551902  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18551901 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 18551802  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551801 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 18551702  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18551701 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattat 18551645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791219
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 44791389  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791388 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 44791289  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  44791288 catacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaa 44791219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 13685990 - 13686466
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaca-catcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccact 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  13685990 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccact 13686089  T
Q  103 cgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacag 202  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13686090 cggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatag 13686189  T
Q  203 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  13686190 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattct 13686289  T
Q  303 ctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcat 402  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13686290 ctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcat 13686389  T
Q  403 ctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  13686390 ctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 13686466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23517112 - 23516637
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23517112 tcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 23517013  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23517012 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 23516913  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  23516912 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttc 23516813  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||| | ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23516812 tctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctcttgtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttctgcatc 23516713  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  23516712 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 23516637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 14037731 - 14038083
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14037731 tcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 14037830  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  14037831 ctcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcat 14037930  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14037931 aggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatc 14038030  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcc 353  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14038031 ttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcc 14038083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 14347761 - 14348113
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14347761 tcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 14347860  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  14347861 ctcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcat 14347960  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14347961 aggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatc 14348060  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcc 353  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14348061 ttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcc 14348113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 479
Target Start/End: Original strand, 15203814 - 15204281
Alignment:
Q  12 gatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  15203814 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactct 15203913  T
Q  112 accgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 211  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||    
T  15203914 accgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactc 15204013  T
Q  212 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 311  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  15204014 taaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggat 15204113  T
Q  312 catcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 411  Q
    || |||||||||||  ||| |||| |||||||  |||||||| || ||||| |  |||||  |||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||    
T  15204114 caacttaaccttctctgtagtttgctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgacca 15204213  T
Q  412 cacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     |||  || ||  | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  15204214 tacagcgcttcaaatggttccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 15204281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 64 - 479
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624954
Alignment:
Q  64 acatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtca 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  164 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 263  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  264 atgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactact 363  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| || | |||     
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaaaattaca 15624838  T
Q  364 ccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatggg 463  Q
    |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||  || ||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |     
T  15624839 ctctcacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgcttcgaatggtgtcattctaatactagaatgataactgttattgt 15624938  T
Q  464 acgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||||| |||||    
T  15624939 acgtgaactctatcaa 15624954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206646
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    || ||||||| || |||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||      
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaat 12206810  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || ||||| |  ||| | || ||||| || || ||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| || |||    
T  12206809 ttgaccttttctgtagtctgctgaactatatccggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagtattgcacctccgatcataca 12206710  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || | ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | | |||||||||| |||||    
T  12206709 aaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtgaactctatcaa 12206646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147614
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || | |||||  || ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 19147450  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  19147451 ttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccataca 19147550  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  19147551 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 19147614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20747013
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || | |||||  || ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20746849  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  20746850 ttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccataca 20746949  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  20746950 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 20747013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14264553 - 14264090
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  14264553 acatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 14264454  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  14264453 ttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcag 14264354  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  14264353 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatcatc 14264254  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  |  ||||| || ||||| | ||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  14264253 ttgacattcttcgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccataca 14264154  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  14264153 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 14264090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 476
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662360
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||    ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||   |||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |  || ||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctc---cttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatc 21662196  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | |||||| || | | || | ||||||||||| |||||||| |  || || |  ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21662197 aacttaacattttcattagtctgttgaacaatgtctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcacaacacaacggagttctgcatctccgaccat 21662296  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgat 476  Q
    |||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  21662297 acaacgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactattattgtaagtgaactcgat 21662360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 181 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964717
Alignment:
Q  181 gcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  281 gactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaa 380  Q
     |||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||| |  || || |||||| |    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcata 35964817  T
Q  381 ccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  35964816 ccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaat 35964717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15102910 - 15102449
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  15102910 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15102811  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15102810 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaa 15102711  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||   ||||||    
T  15102710 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatc 15102611  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||  |  || ||||| || |  ||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  15102610 ttgactttctctgtagtctgatgaatcaaatccggtcccaacaacactc--tctcctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccataca 15102513  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  15102512 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 15102449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388274
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| || |||||| ||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||| |    
T  11388536 gaacacatgatctcct-cttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 11388438  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    |||||||| |  ||| | || ||||| || |||||||| || |  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || |||    
T  11388437 ttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaacataca 11388338  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||||| |||||    
T  11388337 aagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaa 11388274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 256 - 479
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596459
Alignment:
Q  256 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtccta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| | || |||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtccta 9596335  T
Q  356 agactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  9596336 agaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgact 9596435  T
Q  456 attatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||| | | ||||||||||||||    
T  9596436 attattgtatgtgaactcgatcaa 9596459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072140
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 16072304  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||   || | ||  |||| |  |||||||| || ||||| | ||| || |||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||| |||    
T  16072303 ttgaccttctccatagtctgacgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccataca 16072204  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  16072203 aagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 16072140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 11772362 - 11772108
Alignment:
Q  226 tctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11772362 tctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttct 11772263  T
Q  326 aagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgta 425  Q
     |||| ||||||||||||| || |||||||| || || |  ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||   |    
T  11772262 cagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttccacacaaagccttaaa 11772163  T
Q  426 aggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  11772162 tggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaat 11772108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212151
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 8212151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11306575 - 11306286
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  11306575 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11306476  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  11306475 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 11306376  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11306375 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11306286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 440
Target Start/End: Original strand, 49152238 - 49152665
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  49152238 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 49152337  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  49152338 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 49152437  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||    
T  49152438 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 49152537  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | | | || |||| |||| | |  || || |  || ||||| || || || | |||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||     
T  49152538 aacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccat 49152637  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaat 440  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  49152638 acaaagcttcgaacggtgccataccaat 49152665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950316
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| || |||| |||| |     
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtc 16950463  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  ||  |||| || || || |  ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  16950462 tgatgaaccaagtcctgtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 16950363  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  16950362 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaat 16950316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053798
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| || || |  ||| |     
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 18053945  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  18053944 tcctgaaccaaatccggtcccaacacaactctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 18053845  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || ||||||||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  18053844 ttcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaat 18053798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199588
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| | || |||||| |  || || || |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||| ||| || || |  ||| |     
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtc 23199735  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  || || |  || ||||| || || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  23199734 tcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 23199635  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || ||||||||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  23199634 ttcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaat 23199588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505715
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| | || |||||| |  || || || |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||| ||| || || |  ||| |     
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtc 23505862  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  || || |  || ||||| || || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  23505861 tcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgcca 23505762  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || || ||||||||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  23505761 ttcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaat 23505715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 452
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021733
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||| ||||||   || || |||| ||||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    || ||| || || || || ||||||||||| ||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 13021593  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    ||||| ||||||| |||| | |  ||||| |  || |||||||| || || |  |  || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||     
T  13021594 atcttgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccat 13021693  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgata 452  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  13021694 acaaagcctcgaacggtgccataccaatactcgaatgata 13021733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665778
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||     | ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 13665778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 455
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936725
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||| ||| ||||  || |||||||| |   | ||||||||     
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccttagtttattgcacaacttccggtcctaacaaagcaccttcacct 14936642  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    || ||||||||||||||||  || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  14936643 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaact 14936725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 14129813 - 14130277
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||| ||    
T  14129813 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcg 14129912  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || ||  | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||  ||||| ||||| ||    
T  14129913 ttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaa 14130012  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  14130013 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 14130112  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || ||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  14130113 ttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccataca 14130212  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| ||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  14130213 aagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaat 14130277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Original strand, 14433631 - 14434095
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||| ||    
T  14433631 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcg 14433730  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || ||  | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||  ||||| ||||| ||    
T  14433731 ttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaa 14433830  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  14433831 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 14433930  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || ||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  14433931 ttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccataca 14434030  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| ||| | |||||||| || || || ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  14434031 aagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaat 14434095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286221
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||  || |  || |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||| |||  |     
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtc 14286368  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| || || || |  ||    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||| | |||||||    
T  14286367 tgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 14286268  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  14286267 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaat 14286221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455928
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || | || ||| ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | |||| |||||| || || ||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 12455928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 299
Target Start/End: Original strand, 6413469 - 6413734
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || || |    
T  6413469 acatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaa 6413568  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||| || |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || ||    
T  6413569 tctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctc 6413668  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 299  Q
     ||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6413669 ctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcat 6413734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26288312 - 26288060
Alignment:
Q  49 tgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaa 148  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||||    
T  26288312 tgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacgtaccaa 26288213  T
Q  149 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatc 248  Q
    | ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || ||||| || ||  |    
T  26288212 tgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa-tctagggc 26288114  T
Q  249 ttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26288113 ctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatctt 26288060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440174
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 4440174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824146
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 7824146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107798
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 27107798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1277
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||  |||||||| |||||  | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| || ||| ||| ||| ||| || || || || ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||    |||||||| ||||||| |||| |     
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtc 1399  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||| ||||||| | | | |||||||    
T  1398 tgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgaccatacaaagctttgaacggtgcca 1299  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataact 455  Q
    | ||||| || ||||| |||||    
T  1298 taccaatactcgaatggtaact 1277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 367 - 473
Target Start/End: Original strand, 14039986 - 14040092
Alignment:
Q  367 tcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacg 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  14039986 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14040085  T
Q  467 tgaactc 473  Q
    |||||||    
T  14040086 tgaactc 14040092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 367 - 473
Target Start/End: Original strand, 14350016 - 14350122
Alignment:
Q  367 tcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacg 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  14350016 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14350115  T
Q  467 tgaactc 473  Q
    |||||||    
T  14350116 tgaactc 14350122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364186
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 15364186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368600
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12368666 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaacctt 12368600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26118812 - 26118630
Alignment:
Q  118 ccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 217  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  26118812 ccaactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaa 26118713  T
Q  218 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26118712 aaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatc 26118630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674562
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| || || ||  ||||||| ||||  || || || |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatctta 318  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatctta 21674562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 419
Target Start/End: Original strand, 12193654 - 12193898
Alignment:
Q  175 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 274  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||  || || || | |||| ||||||||||||    
T  12193654 ttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaaatcaatgtcattcctcctcttaacatgataactct 12193753  T
Q  275 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccga 374  Q
    | || | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||  |||||||| |   |   |||||| ||    
T  12193754 tctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttcttgcacaaccttcggtcctaacaaagcattttcacctga 12193853  T
Q  375 ctcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagc 419  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  12193854 ctcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagc 12193898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 320
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146798
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||| || || ||  |||||||| |||  || || |||| ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 320  Q
    ||| | |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45146751 cttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 45146798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 12254384 - 12254326
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatg 59  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12254384 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 149
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340569
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || || || |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  134 tctgatacggaccaat 149  Q
    ||||||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Original strand, 13378796 - 13378944
Alignment:
Q  175 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 274  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| | |||| | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  |  ||||| | |||||||| ||||| ||    
T  13378796 ttcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaattttctttctcctcttatcataataacgct 13378895  T
Q  275 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    | |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13378896 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaacctt 13378944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41140
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  266 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcc 353  Q
    |||| ||||| |||| | | || || |||||||| | |||  ||||| | || |||||||  ||  | || |||||||||||||||||    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctggtcc 41140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 323
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20467028
Alignment:
Q  172 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 271  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| |  ||| |  || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  272 tcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    | || || | |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20466977 tattctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatcataacctt 20467028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118817
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 92  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgg 26118817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353397
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||  | || ||   ||| |||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaagatcaccaatttggaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 13353346  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    ||| ||   |||||| || ||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  13353347 cttctgcgtactctgagatgctctcgtcttctcttaaatcatcttaacctt 13353397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15479411 - 15479323
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgata 140  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  15479411 gacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagagatctgata 15479323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17145428 - 17145282
Alignment:
Q  177 caaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 276  Q
    |||| ||||||||||||| || |||  | | ||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||     
T  17145428 caaaacacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttc 17145329  T
Q  277 tgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    || | |||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  17145328 tgcctactctgagaagctttcatattttcttgaatcatcttcacctt 17145282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457005
Alignment:
Q  237 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 12457005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 320
Target Start/End: Original strand, 17923760 - 17923924
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-cacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 255  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| || || ||| | ||||| ||||| ||| || || ||  | ||||||||||  ||  | ||     
T  17923760 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaccaccggttaccggattcactcttaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccatcctc 17923859  T
Q  256 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 320  Q
    | |||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17923860 ctcttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 17923924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 302
Target Start/End: Original strand, 15340590 - 15340657
Alignment:
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15340590 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatctt 15340657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5432710 - 5432524
Alignment:
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaat 332  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| || | ||| || |||||| ||||||||||   |||||| || |||||||| ||| |    
T  5432710 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactttgagacgctctcatcttctc---aatcatattcaccttctatgtagt 5432614  T
Q  333 ttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
     | ||| ||||  ||||||||||| |   | | ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||    
T  5432613 ctattgcacaacttctggtcctaacaaagcactttctcctaactcataccaacacaacggtgttctacacctccttccatacaaagcctc 5432524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4745 - 4266
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4745 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 4646  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4645 ctcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 4546  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4545 aagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 4446  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4445 ttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgc 4346  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  4345 atctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaat 4266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 8562 - 9041
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8562 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 8661  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8662 ctcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 8761  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8762 aagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 8861  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8862 ttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgc 8961  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  8962 atctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaat 9041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33913 - 33434
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33913 tcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccca 33814  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33813 ctcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 33714  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33713 atgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 33614  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33613 ttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgc 33514  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  33513 atctccaaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaat 33434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 279170 - 278711
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  279170 tcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 279071  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  279070 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcac 278971  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  278970 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 278871  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||| |||||| ||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  278870 ttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgc 278771  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  278770 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattat 278711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 165037 - 164571
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  165037 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgcca 164938  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  164937 ccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 164838  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  164837 caaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatc 164738  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| || | ||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  164737 atcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccat 164638  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||    
T  164637 acagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaa 164571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 357
Target Start/End: Original strand, 308628 - 308981
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  308628 tcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 308727  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  308728 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 308827  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  308828 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttc 308927  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaag 357  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||    
T  308928 tcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaag 308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Original strand, 260289 - 260728
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |  |||| ||| |||||||    
T  260289 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccg 260388  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||| ||  || || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  260389 ttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaa 260488  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  260489 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 260588  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || ||||||| |||  | || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||| |||    
T  260589 ttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataacagagtcctgcacctccgaccataca 260688  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| || || || ||||| |||||    
T  260689 aagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 260728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 555
Alignment:
Q  5 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcg 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1029 cactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacg 930  T
Q  105 atacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  929 atacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacga 830  T
Q  205 gtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct 304  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  829 gggactctcaaaa-cacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttct 731  T
Q  305 cttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatct 404  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  730 cttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatct 631  T
Q  405 ccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  630 ccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 480
Target Start/End: Original strand, 6348 - 6817
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  6348 ggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatatac 6447  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6448 caccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 6547  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6548 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaa 6647  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 410  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6648 tcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgacc 6747  T
Q  411 acacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  6748 atacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 6817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 1105 - 1584
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1105 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatcca 1204  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1205 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcac 1304  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1305 aggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatc 1404  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1405 ttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctagtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctac 1504  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  1505 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccatttcaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaat 1584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 5187 - 5666
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5187 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccca 5286  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5287 ctcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 5386  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5387 aggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 5486  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5487 ttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgc 5586  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  5587 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccgatactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 5666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 229009 - 229488
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  229009 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacccta 229108  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |     
T  229109 ttcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaat 229208  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229209 aggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 229308  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  229309 ttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 229408  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  229409 atctccgaccatacaaaacctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 229488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 219757 - 219288
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  219757 tcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatccca 219658  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  219657 cttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcac 219558  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219557 aggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 219458  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| || || |  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  219457 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttctgc 219358  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaa 470  Q
    | || |  |||  |||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  219357 accttcttccattcaaaacctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaa 219288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 32917
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  ||||| ||||     
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctgggccta- 32981  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcct 421  Q
     || |  |  || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||||    
T  32980 -acaaagcactctccggactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcct 32917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 5980 - 6459
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5980 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaa 6079  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6080 ctcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcac 6179  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180 aggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 6279  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  6280 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgc 6379  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | | |||||||| ||||||    
T  6380 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaatgttattgtatgtgaactcaatcaat 6459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Original strand, 14005 - 14464
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||| | | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14005 tcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctca 14104  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 14204  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14205 aggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 14304  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14305 ttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgc 14404  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14405 atctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattat 14464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 253 - 478
Target Start/End: Original strand, 17660 - 17884
Alignment:
Q  253 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtc 352  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctggtc 17759  T
Q  353 ctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgata 452  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17760 ctaagaccactctttcacctgactc-aaccaacacaacgaagttctacatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgata 17858  T
Q  453 actattatgggacgtgaactcgatca 478  Q
    ||||||||   | |||||||||||||    
T  17859 actattattttatgtgaactcgatca 17884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 31391 - 31854
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  31391 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 31490  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| || ||| |||||||     
T  31491 ttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcag 31590  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || | ||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  31591 aaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 31690  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||| ||| |||| ||||| |  || | ||| || || || | ||| ||  |||||||||| || || |||||  |||| ||||||||| |||    
T  31691 ttgactttctatgtagtttgatgaaccaaatccgatcccaacacaacgctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccataca 31790  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | ||||||||  |||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  31791 aagcttcgaacggtgccatatcaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 31854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 64371 - 63893
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  64371 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 64272  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  64271 ctcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccac 64172  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  64171 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 64072  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  64071 ttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttctgc 63972  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| | |||||||||| |||||    
T  63971 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgttaattgttattgtacgtgaactctatcaa 63893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 9309 - 9780
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9309 tcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 9408  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9409 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 9508  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9509 aggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatc 9608  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9609 ttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtttgttaaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgc 9708  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaact 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  9709 atctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgcccttccaatactagaatgataactatcattgtacgtgaact 9780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 127539 - 127060
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  127539 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 127440  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  127439 ctcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 127340  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  127339 atgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatc 127240  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  127239 ttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgc 127140  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||    
T  127139 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgcgaactctatcaat 127060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109673
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttc 109849  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  109848 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 109749  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  109748 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccgttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 109673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112979
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||||      
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaag 112839  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || ||||| || ||| |||||||||| || |||||||| || |  || | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||    
T  112840 tttaccttttatgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccataca 112939  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    | || ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  112940 atgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 112979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 96291 - 96038
Alignment:
Q  52 gacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  96291 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatga 96192  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  96191 actttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtcttt 96092  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 305  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96091 cctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 96038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 95973 - 95888
Alignment:
Q  370 cccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  95973 cccgactcaaaccaacatagaggagttctacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaact 95888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43598
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttc 43422  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43423 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatc 43522  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  43523 tccgaacatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaa 43598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 8454 - 8929
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8454 tcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactc 8553  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  8554 ggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcatagg 8653  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8654 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 8753  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8754 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatc 8853  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  8854 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 8929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50397
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc--ttctcttgaatcatcttaacct 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaacct 50533  T
Q  323 tctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    | |  ||| |||||||||| || |||||||| || |  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||    
T  50532 tttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttc 50433  T
Q  423 gtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
      | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  50432 aaacggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 50397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 330
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13961
Alignment:
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagta 330  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagta 13961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 337 - 479
Target Start/End: Original strand, 15249 - 15391
Alignment:
Q  337 tgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattc 436  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15249 tgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattc 15348  T
Q  437 caatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15349 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 15391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106591
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  106657 tcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaacctt 106591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 7346 - 7821
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7346 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactc 7445  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7446 gctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 7545  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7546 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 7645  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7646 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatc 7745  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  7746 tccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 7821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33092 - 32613
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33092 tcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 32993  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32992 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcac 32893  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  32892 aagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatc 32793  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32792 ttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctggccctaaaaccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttc 32693  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  32692 atctccgatcatacaaagcctcaaaagatgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaat 32613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1162 - 691
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |    
T  1162 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaa 1063  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||  ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1062 ctcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 963  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  962 aggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatc 864  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  863 ttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgc 764  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  763 atctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactggaatgataattgttattgtacgtgaactc 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 5 - 479
Target Start/End: Original strand, 180187 - 180661
Alignment:
Q  5 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  180187 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcg 180286  T
Q  105 atacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagga 204  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  180287 atacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccgga 180386  T
Q  205 gtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct 304  Q
    || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180387 gtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct 180486  T
Q  305 cttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatct 404  Q
    |||||||||||||||| |||| | || | || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  180487 cttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatct 180586  T
Q  405 ccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  180587 ccgaccatataaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 180661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 479
Target Start/End: Original strand, 383 - 858
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  383 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactc 482  T
Q  104 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 203  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  483 ggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 582  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  583 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttc 682  T
Q  304 tcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatc 403  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  683 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatc 782  T
Q  404 tccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  783 tccgaccatacaaagcctcgaacggtgtcattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaa 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 4 - 476
Target Start/End: Original strand, 6906 - 7380
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaaga-tgcggtggtaatcccact 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6906 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccact 7005  T
Q  103 cgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacag 202  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7006 cggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatag 7105  T
Q  203 gagtgactctcaaaaa-cacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7106 gagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattt 7205  T
Q  302 tctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgca 401  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7206 tctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctaca 7305  T
Q  402 tctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgat 476  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  7306 tctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgat 7380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 16953 - 17431
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16953 tcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 17052  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  17053 cttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcac 17152  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17153 atgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatc 17252  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  || |||||||| || |||||    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17253 ttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagtttgttgaatgatttctggtcccaaaactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctac 17352  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||    
T  17353 acctccgaccatacagagcctcaaaaggtgccattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaa 17431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 99 - 479
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8234
Alignment:
Q  99 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  199 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 298  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  299 tcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttct 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttct 8153  T
Q  399 gcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  8154 gcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 8234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 48 - 480
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49938
Alignment:
Q  48 ttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacca 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  148 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  248 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctc 347  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T
Q  348 tggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaa 447  Q
      ||||||| || || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  49806 gagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 49905  T
Q  448 tgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  49906 tgataactattattgtacgtgaacactatcaat 49938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 14843 - 15322
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14843 tcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagccca 14942  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14943 ctcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcac 15042  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  15043 aggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatc 15142  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15143 ttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgc 15242  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |  ||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  15243 acttcctaccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactggaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaat 15322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 448025 - 448503
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  448025 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 448124  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||    
T  448125 cttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttac 448224  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  448225 aggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatc 448324  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  || || || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  448325 ttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgc 448424  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | || |  ||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  448425 accttcttccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 448503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 162079 - 162396
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  162079 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 162178  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  162179 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcat 162278  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca-t 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  162279 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcact 162378  T
Q  300 cttctcttgaatcatctta 318  Q
    ||| |||| ||||||||||    
T  162379 ctt-tcttaaatcatctta 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90795
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||| ||| |||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||  ||| |     
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 90940  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  |||||||| ||  |||| | ||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  90939 tgatgaactaaatctggtcccaacgctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 90840  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatca 478  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| ||||    
T  90839 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatca 90795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78647
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||| || || ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatcataacctt 78647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  124 ctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 100 - 479
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22311
Alignment:
Q  100 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  200 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  300 cttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctg 399  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | || | || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctg 22231  T
Q  400 catctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  22232 catctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactcgatcaa 22311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16805 - 16375
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16805 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 16706  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16705 ctcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcac 16606  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16605 aggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatc 16506  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16505 ttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 16406  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgc 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  16405 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgc 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 14941
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15409 ggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 15310  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15309 caccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 15210  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    |||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15209 ctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttgga 15110  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 410  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15109 tcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttctgcacctccgacc 15010  T
Q  411 acacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  15009 atacagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaa 14941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26395
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 26565  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||| || || |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  26564 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttattgtcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttc 26465  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  26464 catacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 26395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 196027 - 195604
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  196027 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 195928  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||  | || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  195927 ttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 195828  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  195827 aaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatc 195729  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| | |    
T  195728 ttgactttctctgtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatata 195629  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaat 440  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||    
T  195628 aagcttcgaacggtgccataccaat 195604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148837
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| || || || || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatctt 148837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 68765 - 68575
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  68765 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 68666  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 206  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  68665 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 121869
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||| ||| ||||  || | ||||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaaccttttccgtaatttcttgcacaacttccgttcctaa 121935  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
     |  || | ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  121934 caaaacactttccccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctc 121869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 455
Target Start/End: Original strand, 180147 - 180344
Alignment:
Q  258 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaag 357  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  |  ||||||||     
T  180147 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttgcggtcctaac 180246  T
Q  358 actactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |  || | ||| || ||||||||||||||||| || || || || |||| |||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  180247 aaaacactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaact 180344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 971 - 1444
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  971 tcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 1070  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1071 ctcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 1170  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||      
T  1171 aggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcact 1270  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||     ||||||||||||| || ||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1271 ttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagtttgttg-----tctctggtcctaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgc 1364  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||    
T  1365 atctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaatgttatagtacgtgaactctatcaat 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 473
Target Start/End: Original strand, 3998 - 4469
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3998 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaaccca 4097  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4098 cttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcac 4197  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4198 aggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 4297  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||| || || ||||||||||||| ||||||||    
T  4298 ttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacgatttctggtcctaaaactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttctgc 4397  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    | || |  ||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  4398 a-cttcttccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactc 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 10 - 473
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3578
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 109  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  110 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 209  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 309  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgg 3414  T
Q  310 atcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 409  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| || || ||||| || ||   ||| |  ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3415 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgcacgatttctggccccaaatttacactctcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggc 3514  T
Q  410 cacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactc 473  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||    
T  3515 catacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatggtaactgttattgtacatgaactc 3578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 479
Target Start/End: Original strand, 111997 - 112465
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  111997 ggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 112096  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112097 caccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 112196  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |    
T  112197 ctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttgga 112296  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 410  Q
    ||| ||||||||||| | || |||||||||| || |||||||| || ||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  112297 tcaacttaaccttctcaatagtttgttgaacgatatctggtcccaaaactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttctgcacctccgacc 112396  T
Q  411 acacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||| ||| ||  | |||| |||| |||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||    
T  112397 atacagagcttcaaatggtgtcatttcaatactagaatgataactgttattgcatgtgaactctatcaa 112465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 203796 - 203331
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||    
T  203796 atcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 203697  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  203696 ctgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactct 203597  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
     | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||     
T  203596 tagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatt 203497  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||||||||| || ||| | || |||||||| |  ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||     
T  203496 agcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatattcggtcccaacactacactctcacccgactcaaaccaacataacagagttctgcacctccgaccat 203397  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatca 478  Q
    ||||||| | | | ||||||||||| || |||||||| ||||| || | | |||||||||| ||||    
T  203396 acaaagctttgaatggtgccattcctatactagaatggtaacttttgttgtacgtgaactctatca 203331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386263
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || | ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |||  ||||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    || ||| |  || ||||| ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 386096  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    |||||||||||||  ||| | |  ||||| |  |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  386097 atcttaaccttctccgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccat 386196  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| | | |  ||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  386197 acaaagcttagaacagtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 386263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 117549 - 118012
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  117549 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 117648  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||||     
T  117649 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcag 117748  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||    
T  117749 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatc 117848  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || || || |  || || |||||||||||||| || |||||  | || ||||||||| |||    
T  117849 ttgactttctccgtagtatgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacataaaggagtcttacacctccgaccataca 117948  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||||| |||||    
T  117949 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaa 118012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 322703 - 322975
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||  |||||||| || || ||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
     |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 322975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Original strand, 1 - 446
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |  || ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |     
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtc 300  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||    
T  301 tgctgaacaatatctagtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcaaaaggtgcca 400  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||| | | |||||||| |||||    
T  401 ttccaatactagaattataattgttattgtatgtgaactctatcaa 446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Original strand, 886 - 1352
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatc 1185  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
      ||||| ||||| |||| |||| ||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  1186 cacttaatcttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaaccat 1285  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  1286 acaaagcttcgaatggtgccattccaatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 1352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 15459 - 15813
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  15459 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaaccta 15557  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15558 ctcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 15657  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658 aagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 15757  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  15758 ttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgagtcctaa 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 480
Target Start/End: Original strand, 15832 - 16100
Alignment:
Q  212 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  312 catcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 411  Q
    ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| || || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16031  T
Q  412 cacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
     | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||    
T  16032 aaaaaagcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaat 16100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25581
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
     ||||| || |||| |||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatt 25748  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||     
T  25747 aacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacttctgaccat 25648  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  25647 acaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 25581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16756 - 16287
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  16756 tcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaaccta 16657  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16656 catgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcac 16557  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
     |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16556 tggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatc 16457  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||| || || |  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  16456 ttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctgttcttaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttttgc 16357  T
Q  401 atctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaa 470  Q
    | |||   ||| ||||||||||  | |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16356 acctcgttccatacaaagcctcaaatggtgtcattgcaatactagaatgataactattattgtacgtgaa 16287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 27933 - 28231
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27933 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaa 28032  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28033 ctcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcac 28132  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 299  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28133 cggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 322 - 26
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  322 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactca 223  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  222 ctcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 123  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 297  Q
    | |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  122 atgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116767
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatc 116934  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||||||||||| |||| |||| ||||| || | |||||| || ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||     
T  116933 aacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccat 116834  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| | | ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||    
T  116833 acagaacttcaaatggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacgtcaactctatcaa 116767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 422
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98402
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || ||||||||||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  |||||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctggtcctaa 98336  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
     |  || |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||| ||||    
T  98337 caaaacactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctc 98402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23553
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttct 254  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| |||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacatgaaactcaatatcctttct 23553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 206
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgga 291  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagt 395  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||| || ||| | |  ||||| || || |||||||||||| ||||    
T  290 tcatcttaaccttctcagtagtttgctgtacaatttctggtcccaaaactgcactctcacctgattcgaaccaacacaacagagt 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13307 - 12858
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 110  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13307 ggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgc 13208  T
Q  111 caccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 210  Q
     ||| |||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13207 taccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 13108  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaa 310  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13107 ctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgga 13008  T
Q  311 tcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 410  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||| |||| ||| |||||||| || ||| | |  | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  13007 tcatctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttctggtcccaaaactgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgacc 12908  T
Q  411 acacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    | ||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12907 atacagagcttcgaatggtgccattccaatactagaatggtaactgttat 12858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 136 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 642
Alignment:
Q  136 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 235  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  236 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttg 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  336 ttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccatt 435  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  785 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccatt 686  T
Q  436 ccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  685 ccaatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaa 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 160 - 479
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7841
Alignment:
Q  160 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  260 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagac 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagac 7721  T
Q  360 tactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatta 459  Q
     |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7722 cactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 7821  T
Q  460 tgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | | | ||||||||||||||    
T  7822 ttgtatgtgaactcgatcaa 7841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5452
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | || ||||||||||  || || ||||||| |||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 5620  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | |||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||||||  || ||    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5619 aacttaaccttctctgttgtttgttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcataccaacacaacggagttctgcatctccgaccaa 5520  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || ||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  5519 acaacgcttcgaacggtgtcattccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaat 5452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 24933
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
     | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatt 25100  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||||||||| |  ||| | || |||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  25099 agcttaaccttttctgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacagaacggagttctgcacctccgaccat 25000  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
     |||||| ||| | |||| ||| | ||| |||||||||||||| || | | |||||||||| |||||    
T  24999 gcaaagcttcgaatggtgtcatccaaatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaa 24933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16372 - 16211
Alignment:
Q  140 acggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaa 239  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||    
T  16372 acggtccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatccccaacttgaaa 16273  T
Q  240 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 301  Q
     || | ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  16272 gtctatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatct 16211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 112 - 480
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9415
Alignment:
Q  112 accgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 211  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  212 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 311  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  312 catcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 411  Q
     ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||| |||| || |  |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaaaaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctacca 9346  T
Q  412 cacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||    
T  9347 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactctatcaat 9415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 6943 - 7052
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  6943 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaaccca 7042  T
Q  101 ctcgatacgc 110  Q
    ||||||||||    
T  7043 ctcgatacgc 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 354
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 320  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10626
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||      
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatca-a 10766  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    ||  ||||||  ||| | |||||||| || |||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10765 ttggccttctctgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacgtaacggagttctgcacctccgaccacaca 10666  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  10665 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 10626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86365
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    |||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 312  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||   |||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatc 86533  T
Q  313 atcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccac 412  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||| |  || ||    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  86532 aacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtctggtcccagtaccacagtctcaccggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccat 86433  T
Q  413 acaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| || ||| | ||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  86432 acaacgcttcgaacggtaccattgcaatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaat 86365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 338 - 479
Target Start/End: Original strand, 46531 - 46672
Alignment:
Q  338 gaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattcc 437  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  46531 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattcc 46630  T
Q  438 aatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  46631 aatactagaatgataactattattgtaagtgaactcgatcaa 46672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16923 - 17142
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16923 tcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaa 17022  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17023 ctcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 17122  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaaca 220  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  17123 atgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 479
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26586
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 324  Q
     ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttc 26431  T
Q  325 taagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgt 424  Q
    |  ||| | || ||||| |  || | ||| || |||||   ||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||     
T  26432 tccgtagtctgatgaaccaaatccgctcccaacactacattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcga 26531  T
Q  425 aaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  26532 acggtgccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 26586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 479
Target Start/End: Original strand, 26859 - 26968
Alignment:
Q  370 cccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtga 469  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | ||||||    
T  26859 cccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtga 26958  T
Q  470 actcgatcaa 479  Q
    |||| |||||    
T  26959 actctatcaa 26968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4319
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||| ||| |||||| || ||||| ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  ||| |     
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtc 4173  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| ||| | |||||||    
T  4174 tgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgcca 4273  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| ||  |||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  4274 taccaatactcaaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 4319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5776
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||  |||| ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||| ||||| |  ||| ||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagtt 5922  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    ||  |||| |  |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  5921 tgacgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 5822  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  5821 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47568
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||| || |||| |||||| || ||||| ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||  ||| |     
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 47422  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| || || || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||| ||    
T  47423 tgatgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtca 47522  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  47523 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 47568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 9779 - 10237
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  9779 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 9878  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || |||||| |||||||     
T  9879 ttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcag 9978  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| |     | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  9979 aaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 10073  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || || || | ||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  10074 ttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccataca 10173  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  10174 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 10237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51725
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||| |||||||  ||| ||    
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtt 51871  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | ||||||| ||| | |||| ||    
T  51870 tgatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcatgcacctccgactatacaaagcttcgaacggtgtca 51771  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  51770 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 51725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19272
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    | |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||| |    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaac 19129  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    |||| ||| |  ||| | |||||||| || | ||| || || |  || | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  19130 ttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccataca 19229  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    | || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  19230 atgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 19272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 458
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23434
Alignment:
Q  118 ccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 217  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  218 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatctt 317  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaactt 23293  T
Q  318 aaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaa 417  Q
    || ||| |  ||| | |||||||| || | ||| || || |  || | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||     
T  23294 aatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaat 23393  T
Q  418 gcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  23394 gcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 23434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28630
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| | |||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct-cttgaatcatcttaaccttctaagtaat 332  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||  || ||||| |   || |    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttttctatagt 28777  T
Q  333 ttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcc 432  Q
     || ||||| || | |||||| || ||| | |  |||||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  28776 ctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 28677  T
Q  433 attccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  28676 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 28630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40621
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| | |||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttct-cttgaatcatcttaaccttctaagtaat 332  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||   ||||  || ||||| |   || |    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttttctatagt 40768  T
Q  333 ttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcc 432  Q
     || ||||| || | |||||| || ||| | |  |||||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  40767 ctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 40668  T
Q  433 attccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  40667 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 40621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 6961
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 324  Q
     ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||| ||| |||||     
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcaacttgaccttt 7053  T
Q  325 taagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaa 416  Q
    |  ||| |||| ||||| |  |||||||| || || || | |||   ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  7052 tctgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctgtcgactcaaaccaacacaattgagttctgcacctccgaccatacaa 6961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18862 - 18399
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  18862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactg 18763  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  18762 ttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 18663  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||    
T  18662 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatc 18563  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  |||||||| ||  |||| | ||| || |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| |||    
T  18562 ttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaactctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttttgcacctccgaccataca 18463  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  18462 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 18399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33560
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||  |  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc--ttctcttgaatcatcttaacct 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaacct 33696  T
Q  323 tctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    | |  ||| |||||||||| || |||||||| || |  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| || ||    
T  33695 tttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttc 33596  T
Q  423 gtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
      | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  33595 aaacggtgccataccaatactcgaatggtaactatt 33560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40546
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 40546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 479
Target Start/End: Original strand, 4758 - 5194
Alignment:
Q  43 caaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||||| |||||    
T  4758 caaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacg 4857  T
Q  143 gaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactc 242  Q
    ||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||| |||||||||||    
T  4858 gaccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactc 4957  T
Q  243 aagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaaca 342  Q
    |||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |||| |||| | || |||||     
T  4958 aagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaacc 5057  T
Q  343 atctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcc 442  Q
    |  |||||||| || || || | ||| || |||||||||||  | || ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| |    
T  5058 aaatctggtcccaacaccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatac 5157  T
Q  443 tagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  5158 tcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 5194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27939
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 27799  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || |||||    |||||||| || || || | ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  27800 ttgactttctctgtagtctgatgaaccgaatctggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 27899  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    || | ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  27900 aaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 27939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1473 - 1011
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||   || || |||   || ||||| |    
T  1473 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactg 1374  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||| ||| |||||     
T  1373 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcag 1275  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  1274 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 1175  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || || ||   ||| |  |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  1174 ttgactttcttcgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccataca 1075  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | | || ||||||| |||||    
T  1074 aagcttcgaacggttccataccaatactcgaatggtaactattgttgtacatgaactctatcaa 1011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14226 - 13787
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  14226 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactg 14127  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  14126 ttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaa 14027  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  14026 aaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 13927  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || |||| |||| | || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||    
T  13926 ttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcatctccgaccataca 13827  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    | || ||| | |||||||| | ||| || ||||| |||||    
T  13826 aggcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaact 13787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4988
Alignment:
Q  70 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 169  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  170 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 269  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  270 actcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 4988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21533
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttc 324  Q
    ||  || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || |||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttc 21688  T
Q  325 taagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgt 424  Q
    | |||| | || ||||| |  || ||||| || || || ||  | || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||     
T  21687 tcagtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacacaacacccactcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcga 21588  T
Q  425 aaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  21587 acggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 21533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 455
Target Start/End: Original strand, 26004 - 26226
Alignment:
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaat 332  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |    
T  26004 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 26103  T
Q  333 ttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcc 432  Q
    || ||| ||||  || ||||| || |   | | ||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  26104 ttcttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 26203  T
Q  433 attccaatcctagaatgataact 455  Q
    || || || |||| |||| ||||    
T  26204 ataccgatactagcatgaaaact 26226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 9969
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatc 10109  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | |  ||||| |  || ||||| || || || | ||| |||||| ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  10108 ttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 10009  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  10008 aagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaact 9969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 5)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58445
Alignment:
Q  79 gaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  179 aagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttg 278  Q
      ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  279 tcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| |||||||||||||||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcatctt 58445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19387
Alignment:
Q  35 catacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 234  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatctt 19387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74190
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||| || ||  |  | |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttct 325  Q
    ||| || | |||||| || ||| || ||||||   ||||||||||||||||||    
T  74138 cttatgcctactctgagatgctctcgtcttcttgagaatcatcttaaccttct 74190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59045
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatc 68  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatc 59045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 455
Target Start/End: Original strand, 19458 - 19540
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19458 gactcaaaccagaataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataact 19540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 49358 - 48895
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||| | |    
T  49358 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctg 49259  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| || |||||||     
T  49258 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcag 49159  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || | ||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||    
T  49158 aaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatc 49059  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || |||||||  ||| | || ||||| |  ||  |||| || || || | |||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  49058 ttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtcccaataccacactttcacgtgactcgaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccataca 48959  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  48958 aagcttcgtacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 48895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 58141 - 57678
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||    
T  58141 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccg 58042  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || || || ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  58041 ttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaa 57942  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||||||    
T  57941 aaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 57843  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || ||| ||| |||  | || ||||| |  || ||||| || || || |  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  57842 ttgaccctctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccataca 57743  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  57742 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaat 57678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4307
Alignment:
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagttt 4461  T
Q  335 gttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccat 434  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||| |||| ||||||||||  | ||||||||    
T  4460 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaaatggtgccat 4361  T
Q  435 tccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaattgatgatg 488  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||  |||||| |||||||    
T  4360 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatg 4307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4722 - 4567
Alignment:
Q  44 aaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgg 143  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4722 aaagatgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacgg 4623  T
Q  144 accaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4622 accaataaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37086 - 36974
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  37086 tcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatccaa 36987  T
Q  101 ctcgatacgccac 113  Q
    || ||||||||||    
T  36986 ctagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 253 - 480
Target Start/End: Original strand, 58972 - 59199
Alignment:
Q  253 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtc 352  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||  ||| ||| ||  ||||| || ||||    
T  58972 ctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctcccaaatcaacttaaccttctgtgtagttttttcgacaatttccggtc 59071  T
Q  353 ctaagactac-tccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgat 451  Q
    |||  || || | ||| ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||| ||||| |||||||| |    
T  59072 ctagtaccacattctt-accggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaatgcttcgaatggtgccatcccaatgctagaatggt 59170  T
Q  452 aactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||| |||| | || ||||||||||||||    
T  59171 aactgttattgtacatgaactcgatcaat 59199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatg 86  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 480
Target Start/End: Original strand, 130538 - 130593
Alignment:
Q  425 aaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  130538 aaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaat 130593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 480
Target Start/End: Original strand, 134632 - 134687
Alignment:
Q  425 aaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  134632 aaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaat 134687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Original strand, 509 - 972
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |   |||| |    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatctgttttcttatcaac 808  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    |||||||| |  ||| | || ||||| || |||||||| || |  || | ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  809 ttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 908  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| | | |||||||| |||||    
T  909 aagcttcgaaaggagccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaa 972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 302
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20250
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatctt 20250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13686 - 13396
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  13686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13587  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  13586 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 13487  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13486 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17456 - 17166
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  17456 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 17357  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  17356 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaag 17257  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17256 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 17166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 286 - 479
Target Start/End: Original strand, 12738 - 12931
Alignment:
Q  286 tgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaac 385  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaac 12837  T
Q  386 acaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  12838 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaa 12931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 4924
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||  |||||||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  ||  |     
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtc 5010  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagc 419  Q
    || ||||| |  | |||| | || || || | ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5009 tgatgaactaaatatggttccaacaccacactttctccccactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagc 4924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37646
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| | |||||| || ||||   |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
    |||||||||||   | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||  ||| |     
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtc 37500  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| || || ||   ||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |    
T  37501 tgatgaaccaaatccggtcccaacacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcga 37600  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| || ||||| ||| | || | | |||||||||| |||||    
T  37601 taccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactccatcaa 37646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38198
Alignment:
Q  115 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 214  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  38400 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 38301  T
Q  215 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 314  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||    
T  38300 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcat 38201  T
Q  315 ctt 317  Q
    |||    
T  38200 ctt 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27376
Alignment:
Q  115 gttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 214  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  27563 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 27464  T
Q  215 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27463 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatctt 27376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 79 - 365
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatctt 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 14067 - 14352
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  14067 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 14166  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||     
T  14167 ttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcag 14265  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14266 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 14352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3018
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || | ||| ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatctt 3018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1208
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || | |   || ||||| |||||||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatctt 1208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 458
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6607
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||  | |||||||||||| || || || ||||||||||||||| | | ||| || || | || ||| ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  216 -aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcat 314  Q
     ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcat 6463  T
Q  315 cttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacac 414  Q
    ||| || |||| |||| | |  ||||| |  || ||||| || || || | ||| ||| |||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||| ||    
T  6464 cttgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccaactcaaacaagcataaaggagtcctgcacctccgaccatac 6563  T
Q  415 aaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactatt 458  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  6564 aaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactatt 6607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27645
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || |||||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || | ||| |||||||| |||||  | || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||   ||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatc 27505  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  |||||||| || || ||   ||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  27506 ttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacattttctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 27605  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  27606 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 27645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 172 - 462
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||  | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| | ||| |||| |||||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 10869 - 11159
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  10869 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 10968  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  10969 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaag 11068  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 11159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 434
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| || ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  225 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
     || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7696
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  | | ||| ||| ||||  |||||||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgcagtttcttgcacaacttctggtcctaa 7795  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   |    || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  7794 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 7696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 39720 - 40006
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  39720 acatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 39819  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  39820 ttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 39919  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39920 aaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 40006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14275
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 14277  T
Q  316 tt 317  Q
    ||    
T  14276 tt 14275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 179  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4158
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || ||  | |||   || ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatctt 4158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25904
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatctt 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16943
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || | ||| ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    |  ||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 16943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49246
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 49246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16752
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatctt 16752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39227 - 38926
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || || |    
T  39227 tcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaa 39128  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||| ||| ||||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||     
T  39127 ctctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaa 39028  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||||||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  39027 aggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcatc 38928  T
Q  301 tt 302  Q
    ||    
T  38927 tt 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 61538 - 61099
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  61538 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 61439  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| || ||||     
T  61438 ttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcag 61339  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||    
T  61338 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatc 61239  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | |  ||||| |  |||| ||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  61238 ttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 61139  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| || || || ||||| |||||    
T  61138 aagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 61099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67487
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||  ||| |     
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtc 67609  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    |  ||||| |  |||| ||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  67608 tcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 67509  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataact 455  Q
    | || || || ||||| |||||    
T  67508 tacctatactcgaatggtaact 67487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 52504 - 52065
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  52504 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 52405  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| || ||||     
T  52404 ttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcag 52305  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||    
T  52304 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatc 52205  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | |  ||||| |  |||| ||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  52204 ttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 52105  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| || || || ||||| |||||    
T  52104 aagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 52065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 42658 - 42219
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  42658 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 42559  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  42558 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcag 42459  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||    
T  42458 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatc 42359  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  |  ||||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| |||    
T  42358 ttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccataca 42259  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  42258 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 42219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 47724 - 47285
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  47724 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 47625  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  47624 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcag 47525  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||    
T  47524 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatc 47425  T
Q  316 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 415  Q
    || || ||||  ||| | || ||||| |  |  ||||| || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| |||    
T  47424 ttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctccgaccataca 47325  T
Q  416 aagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  47324 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 47285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 215
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  137 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 95
Target Start/End: Original strand, 2210 - 2243
Alignment:
Q  62 acacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2210 acacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 2243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | |  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  225 gtctccttcttgaaactca 243  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 26261 - 26198
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaca 64  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  26261 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatgaaaca 26198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 332 - 480
Target Start/End: Original strand, 1562 - 1710
Alignment:
Q  332 tttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  1562 tttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgc 1661  T
Q  432 cattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  1662 cattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaat 1710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 317 - 480
Target Start/End: Original strand, 6331 - 6494
Alignment:
Q  317 taaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaa 416  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6331 taaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaa 6430  T
Q  417 agcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  6431 agcctcatagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaat 6494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 6239 - 6333
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 95  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6239 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 317
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20404
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 315  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatc 20402  T
Q  316 tt 317  Q
    ||    
T  20403 tt 20404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43790
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 43770  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaac 320  Q
    || |||   |||||||||||    
T  43771 ttttctctgatcatcttaac 43790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44802
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 100  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  101 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  201 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatc 300  Q
    |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 44782  T
Q  301 ttctcttgaatcatcttaac 320  Q
    || |||   |||||||||||    
T  44783 ttttctctgatcatcttaac 44802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12642
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || |||||||||||||  || || || |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    ||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||| |||  |     
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtc 12789  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  ||||||||||| || || |  || || ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  12788 tgatgaaccaaatctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 12689  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    | || || || ||||| ||||| || | | | |||||||| ||||||    
T  12688 tacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaat 12642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26528
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 112  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||| ||| ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  113 ccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 212  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  213 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 26528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46574
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 46475  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | |  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  46476 caaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 46574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 302
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248880
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  |||||||| | || || |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| || || || || ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
     |||||||| ||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 248880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 159 - 450
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23809
Alignment:
Q  159 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 258  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || |||||||||||||| || |   |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  259 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaaga 358  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| |||| ||| |||||||| |    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacctccggtcctaaca 23717  T
Q  359 ctactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatga 450  Q
       | |  || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||| ||||    
T  23718 aagcactctctccagactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 23809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2214
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||   |||||||| ||| |||  ||| | ||  |||  |  |||||||| ||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctcttatcatcttgaccctctccgtagtctgaagaatcaaatctggtcccaa 2115  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     || || | ||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  2116 caccacactttctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 2214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3696
Alignment:
Q  250 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||| ||||| |||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctg 3711  T
Q  350 gtcctaagactactc 364  Q
    |||||||||| ||||    
T  3710 gtcctaagaccactc 3696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 277
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | | ||  ||||  || ||||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaa 371  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatga 450  Q
     |   | | |||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || | |||||||    
T  370 caaagcactttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgccattccgatacaagaatga 277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4464 - 4235
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  4464 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 4365  T
Q  116 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || |  || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  4364 ttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaa 4265  T
Q  216 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaag 245  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||    
T  4264 aaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 349 - 480
Target Start/End: Original strand, 10 - 141
Alignment:
Q  349 ggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaat 448  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  10 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaat 109  T
Q  449 gataactattatgggacgtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  110 gataactattattgtacgtgaactctatcaat 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7100
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||   ||| || |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaacc--ttctgaaa 7446  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 233  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||| || ||| || |||| ||| || || || || ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatt 333  Q
     ||||||| |||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||  |||       
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagac 7246  T
Q  334 tgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcca 433  Q
    || ||||| |  || ||||| || || || || || || ||| ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||| | || ||||    
T  7245 tgatgaaccaaatccggtcccaacacaacaccctctcctgacacaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgcca 7146  T
Q  434 ttccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || | | |||||||||| |||||    
T  7145 taccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaa 7100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 302
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43050
Alignment:
Q  36 atacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||  | || || |||    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  136 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 235  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||| || || || || || |    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  236 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatctt 43050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 419
Target Start/End: Original strand, 1 - 254
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 265  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  266 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactcc 365  Q
    | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  ||| | || ||||| |  || ||||| || ||||| |     
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 200  T
Q  366 ttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagc 419  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  201 ttctcctgactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagc 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 8308 - 8189
Alignment:
Q  361 actccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8308 actctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactgttat 8209  T
Q  461 gggacgtgaactcgatcaat 480  Q
       |||||||||| ||||||    
T  8208 tatacgtgaactctatcaat 8189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || |||||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 184  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3447
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||| |  || ||||| |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14623
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  |||||| || | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaa 356  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 14722  T
Q  357 gactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
     |   | | ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||  | || |||||||| ||  |||||||| ||||    
T  14721 caaagcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatagtagaatgaaaact 14623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  34 acatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || | ||| |||||||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  134 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 214  Q
    ||||||||  |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 959
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || || || ||  |  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcaccc 372  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || |||||||| |   | | ||||||     
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacct 1023  T
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattc 436  Q
     |||||||||||||||  || || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1022 aactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattc 959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28467 - 28284
Alignment:
Q  140 acggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaa 239  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || || ||| |||| ||    
T  28467 acggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaa 28368  T
Q  240 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 28284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 366 - 480
Target Start/End: Original strand, 2 - 116
Alignment:
Q  366 ttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggac 465  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||    
T  2 ttcacctgattcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattatac 101  T
Q  466 gtgaactcgatcaat 480  Q
    |||||||| ||||||    
T  102 gtgaactctatcaat 116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3893
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 3893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13196
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaacctt 13196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 302
Target Start/End: Original strand, 5311 - 5480
Alignment:
Q  133 atctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 232  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || |    
T  5311 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccct 5410  T
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    | |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5411 cctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Original strand, 136109 - 136278
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  136109 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactc 136208  T
Q  125 tttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 194  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  136209 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 940
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaat 311  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 306
Target Start/End: Original strand, 107 - 160
Alignment:
Q  253 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 306  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  107 ctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctct 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8383
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaacctt 8383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 319
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14807
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 319  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaa 14807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14945
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaacctt 14945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43826
Alignment:
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 43826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24168
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaacctt 24168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 455
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71639
Alignment:
Q  258 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaag 357  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| | | ||| ||||  || ||||||||     
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaac 71541  T
Q  358 actactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataact 455  Q
    || || | ||| || || ||||||||||||||| | || || || ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  71542 acaacactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaact 71639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 323
Target Start/End: Original strand, 13397 - 13539
Alignment:
Q  181 gcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||| | ||    
T  13397 gcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatc 13496  T
Q  281 gactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13497 tactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaacctt 13539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1115
Alignment:
Q  190 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 289  Q
    ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  290 acgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaa 389  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| || ||||  ||| | |  ||||| |  || || || || || || | ||| |||| ||| ||||| || ||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgtctcgaaccagcataa 1186  T
Q  390 cggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattat 460  Q
     ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  1185 aggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttat 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 305  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 305  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9059 - 8909
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| || | || ||||||||||  || || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  9059 acttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 8960  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8959 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 8909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9275
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || || || || ||  | |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 9275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3962
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    ||| |||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4012 cttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 3962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3912 - 3863
Alignment:
Q  373 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctc 422  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||    
T  3912 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctc 3863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 293 - 450
Target Start/End: Original strand, 7426 - 7583
Alignment:
Q  293 ctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | || |  ||| ||| ||| ||||  || |||||||| |   | | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7426 ctttcatcttctcttgaatcatcttctctttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacgg 7525  T
Q  393 agttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatga 450  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  7526 agttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaatactagaatga 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  273 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 305  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1532 - 1310
Alignment:
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaat 332  Q
    |||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |    
T  1532 cttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 1433  T
Q  333 ttgttgaacaatctctggtcctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgcc 432  Q
     | ||| ||||  || |||||||| |   | | |||||| ||||||||| |||||||||| || || || ||| | ||| ||||||||||  | |||| |    
T  1432 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtgtc 1333  T
Q  433 attccaatcctagaatgataact 455  Q
    ||||| || ||||||||| ||||    
T  1332 attccgatactagaatgaaaact 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10493 - 10431
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaac 219  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  10493 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaac 10431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26175
Alignment:
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaacctt 26175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 3241
Alignment:
Q  253 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtc 352  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||| | || ||||| |  || | ||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttc 3344  T
Q  353 ctaagactactccttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgata 452  Q
    | || || || |  || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  3343 ccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggta 3244  T
Q  453 act 455  Q
    |||    
T  3243 act 3241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3487
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  3593 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactg 3494  T
Q  116 ttccaac 122  Q
    |||||||    
T  3493 ttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 7556 - 7498
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatg 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7556 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5491
Alignment:
Q  250 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45932
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaac 122  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaac 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Original strand, 10781 - 10941
Alignment:
Q  160 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 259  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| || |||  | | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | ||    
T  10781 gtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggttacaaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 10880  T
Q  260 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 320  Q
    ||||||| |||||||| || | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10881 tatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaac 10941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 302
Target Start/End: Original strand, 10867 - 11036
Alignment:
Q  133 atctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 232  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||| || ||| || || | |||||| || || || |    
T  10867 atctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcaccct 10966  T
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 302  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  10967 cctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatctt 11036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 323
Target Start/End: Original strand, 18332 - 18397
Alignment:
Q  258 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacctt 323  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18332 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctt 18397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 9200 - 9287
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 103  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  9200 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaatcccactc 9287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 886
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 92  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgg 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19119 - 19067
Alignment:
Q  427 ggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  19119 ggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaa 19067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 197404 - 197340
Alignment:
Q  415 aaagcctcgtaaggtgccattccaatcctagaatgataactattatgggacgtgaactcgatcaa 479  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | | |||||||| |||||    
T  197404 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaa 197340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University