View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18605_low_4 (Length: 521)

Name: NF18605_low_4
Description: NF18605
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18605_low_4
NF18605_low_4
[»] chr6 (88 HSPs)
chr6 (13-432)||(15720938-15721360)
chr6 (13-434)||(8709836-8710260)
chr6 (13-434)||(5974182-5974604)
chr6 (13-436)||(30660778-30661201)
chr6 (13-435)||(10915301-10915728)
chr6 (13-436)||(26356528-26356954)
chr6 (13-432)||(5087068-5087485)
chr6 (20-435)||(17697262-17697674)
chr6 (14-430)||(29691790-29692205)
chr6 (13-434)||(844106-844531)
chr6 (13-435)||(861230-861655)
chr6 (13-392)||(22731913-22732293)
chr6 (13-435)||(1820983-1821399)
chr6 (76-435)||(30492773-30493131)
chr6 (13-372)||(5079442-5079802)
chr6 (14-433)||(938845-939256)
chr6 (20-432)||(33744537-33744951)
chr6 (20-398)||(33518277-33518644)
chr6 (76-434)||(20510542-20510887)
chr6 (118-434)||(20977467-20977785)
chr6 (13-238)||(2087438-2087661)
chr6 (270-434)||(16736526-16736691)
chr6 (13-339)||(12481765-12482081)
chr6 (13-348)||(14256111-14256440)
chr6 (150-362)||(17245717-17245929)
chr6 (13-328)||(18502972-18503274)
chr6 (174-432)||(20897688-20897947)
chr6 (13-247)||(28476253-28476486)
chr6 (118-333)||(20977101-20977317)
chr6 (20-432)||(3375297-3375708)
chr6 (169-336)||(34046542-34046710)
chr6 (274-434)||(24958759-24958918)
chr6 (214-432)||(30353000-30353220)
chr6 (13-205)||(11400171-11400364)
chr6 (20-205)||(289461-289647)
chr6 (20-203)||(21108172-21108355)
chr6 (274-427)||(2937237-2937392)
chr6 (13-182)||(20898115-20898275)
chr6 (20-194)||(289005-289178)
chr6 (349-436)||(22732327-22732413)
chr6 (342-436)||(12482110-12482204)
chr6 (342-435)||(20510372-20510465)
chr6 (329-401)||(2087660-2087732)
chr6 (342-426)||(3913148-3913232)
chr6 (364-436)||(30492601-30492673)
chr6 (342-435)||(2087319-2087412)
chr6 (364-432)||(1820868-1820935)
chr6 (342-426)||(5086743-5086827)
chr6 (366-434)||(26356409-26356477)
chr6 (364-434)||(861704-861774)
chr6 (20-205)||(3914525-3914709)
chr6 (356-434)||(15721401-15721479)
chr6 (354-435)||(16465258-16465339)
chr6 (13-82)||(17246307-17246376)
chr6 (357-430)||(18804125-18804198)
chr6 (343-431)||(3335490-3335578)
chr6 (342-434)||(11400391-11400483)
chr6 (364-436)||(14256489-14256561)
chr6 (13-97)||(17244540-17244624)
chr6 (356-428)||(28476099-28476171)
chr6 (342-436)||(938723-938817)
chr6 (343-433)||(5079830-5079920)
chr6 (343-433)||(18503302-18503392)
chr6 (343-433)||(22971778-22971868)
chr6 (343-433)||(23816530-23816620)
chr6 (342-426)||(288888-288971)
chr6 (366-426)||(3914766-3914826)
chr6 (364-436)||(33518701-33518773)
chr6 (343-430)||(17246404-17246491)
chr6 (344-426)||(289683-289765)
chr6 (375-433)||(5974694-5974752)
chr6 (375-433)||(8709689-8709747)
chr6 (343-432)||(8231087-8231176)
chr6 (488-521)||(15328641-15328674)
chr6 (488-521)||(15364811-15364844)
chr6 (365-430)||(30660664-30660729)
chr6 (358-398)||(2958644-2958684)
chr6 (365-433)||(20898325-20898393)
chr6 (342-434)||(33744985-33745077)
chr6 (364-435)||(843983-844054)
chr6 (142-205)||(15053930-15053993)
chr6 (15-69)||(5079000-5079054)
chr6 (407-436)||(10685887-10685916)
chr6 (405-434)||(22734544-22734573)
chr6 (405-434)||(28580354-28580383)
chr6 (370-431)||(30394764-30394825)
chr6 (20-84)||(3913266-3913329)
chr6 (76-108)||(30916905-30916937)
[»] chr3 (131 HSPs)
chr3 (13-430)||(38173902-38174319)
chr3 (13-435)||(45419658-45420078)
chr3 (13-434)||(53517658-53518079)
chr3 (13-433)||(29348275-29348692)
chr3 (13-436)||(44808711-44809135)
chr3 (13-433)||(40762476-40762895)
chr3 (13-434)||(27492313-27492735)
chr3 (23-433)||(11045412-11045823)
chr3 (20-320)||(23883378-23883678)
chr3 (13-433)||(23917328-23917739)
chr3 (13-372)||(37178941-37179300)
chr3 (13-299)||(25250016-25250299)
chr3 (36-434)||(45406698-45407081)
chr3 (13-429)||(11293800-11294208)
chr3 (20-433)||(46295058-46295474)
chr3 (13-251)||(21749566-21749803)
chr3 (13-289)||(32146996-32147271)
chr3 (13-372)||(45235278-45235641)
chr3 (13-301)||(19669699-19669987)
chr3 (20-392)||(39562461-39562838)
chr3 (13-372)||(32943000-32943348)
chr3 (13-339)||(50615053-50615366)
chr3 (13-430)||(19601549-19601968)
chr3 (46-434)||(34995564-34995951)
chr3 (13-251)||(53397095-53397334)
chr3 (13-350)||(117405-117729)
chr3 (15-436)||(54268726-54269138)
chr3 (116-347)||(44557540-44557771)
chr3 (10-199)||(28685303-28685487)
chr3 (13-372)||(53439324-53439652)
chr3 (118-430)||(9018125-9018438)
chr3 (161-431)||(23920953-23921220)
chr3 (177-434)||(53377430-53377687)
chr3 (53-251)||(25232695-25232894)
chr3 (15-194)||(44555919-44556098)
chr3 (20-251)||(52701168-52701398)
chr3 (50-167)||(45387449-45387566)
chr3 (276-435)||(15771776-15771936)
chr3 (15-170)||(15772002-15772157)
chr3 (15-194)||(33475471-33475650)
chr3 (20-251)||(33476247-33476477)
chr3 (15-110)||(3173707-3173802)
chr3 (352-435)||(53518116-53518199)
chr3 (51-195)||(26268683-26268826)
chr3 (364-434)||(38173783-38173853)
chr3 (336-433)||(14525111-14525208)
chr3 (365-434)||(29348157-29348226)
chr3 (20-194)||(41927953-41928126)
chr3 (342-434)||(34995420-34995512)
chr3 (20-125)||(53377329-53377436)
chr3 (364-435)||(11045282-11045353)
chr3 (342-433)||(44809159-44809250)
chr3 (342-432)||(23917212-23917302)
chr3 (13-110)||(37481253-37481351)
chr3 (142-434)||(44287643-44287933)
chr3 (342-426)||(41928160-41928244)
chr3 (367-434)||(3173824-3173891)
chr3 (20-205)||(31991074-31991259)
chr3 (364-430)||(33226763-33226829)
chr3 (20-236)||(8575974-8576191)
chr3 (357-430)||(33225673-33225746)
chr3 (364-433)||(45420127-45420195)
chr3 (342-435)||(46294931-46295024)
chr3 (13-69)||(116924-116980)
chr3 (342-426)||(8576225-8576309)
chr3 (342-434)||(39562872-39562964)
chr3 (13-69)||(44555364-44555420)
chr3 (13-69)||(50614546-50614602)
chr3 (342-426)||(52701050-52701134)
chr3 (342-426)||(52701982-52702066)
chr3 (366-433)||(25250368-25250435)
chr3 (343-430)||(53439209-53439296)
chr3 (343-433)||(116806-116896)
chr3 (343-433)||(117757-117847)
chr3 (356-430)||(28260544-28260618)
chr3 (364-426)||(31990956-31991018)
chr3 (116-205)||(41927360-41927450)
chr3 (343-433)||(44557892-44557982)
chr3 (343-433)||(45234599-45234689)
chr3 (343-433)||(50615394-50615484)
chr3 (343-433)||(54185639-54185729)
chr3 (343-432)||(45235669-45235758)
chr3 (342-426)||(8575193-8575277)
chr3 (342-426)||(25353279-25353363)
chr3 (366-426)||(31991994-31992054)
chr3 (343-395)||(32147923-32147975)
chr3 (342-426)||(33475359-33475443)
chr3 (367-434)||(21749446-21749513)
chr3 (366-433)||(25249897-25249964)
chr3 (307-375)||(32147270-32147340)
chr3 (343-433)||(44555245-44555336)
chr3 (371-426)||(44556953-44557008)
chr3 (343-430)||(53396980-53397067)
chr3 (342-432)||(19601432-19601522)
chr3 (270-434)||(20078100-20078266)
chr3 (344-426)||(44555806-44555888)
chr3 (343-432)||(1430226-1430315)
chr3 (488-521)||(40478173-40478206)
chr3 (296-372)||(53397363-53397440)
chr3 (370-430)||(23883683-23883743)
chr3 (350-426)||(25233191-25233267)
chr3 (343-431)||(37481379-37481467)
chr3 (489-521)||(41877840-41877872)
chr3 (365-436)||(8311373-8311443)
chr3 (364-435)||(27492194-27492265)
chr3 (405-436)||(34661469-34661500)
chr3 (344-395)||(41786404-41786455)
chr3 (405-436)||(43081132-43081163)
chr3 (43-102)||(44287969-44288028)
chr3 (359-434)||(44288612-44288687)
chr3 (490-521)||(45295627-45295658)
chr3 (20-71)||(52701897-52701947)
chr3 (142-205)||(55006177-55006240)
chr3 (369-434)||(3173645-3173710)
chr3 (344-430)||(27867960-27868046)
chr3 (405-435)||(31184988-31185018)
chr3 (343-433)||(32942870-32942960)
chr3 (343-433)||(45387321-45387411)
chr3 (343-433)||(50614428-50614518)
chr3 (93-194)||(53520018-53520120)
chr3 (405-435)||(54239851-54239881)
chr3 (364-433)||(32146884-32146953)
chr3 (141-198)||(53658029-53658086)
chr3 (369-432)||(13813956-13814020)
chr3 (343-431)||(32943933-32944021)
chr3 (343-395)||(37179891-37179943)
chr3 (365-409)||(40762945-40762989)
chr3 (52-100)||(44557774-44557822)
chr3 (489-521)||(52453979-52454011)
chr3 (405-433)||(54239378-54239406)
chr3 (364-432)||(54269189-54269256)
[»] scaffold0445 (2 HSPs)
scaffold0445 (20-436)||(5789-6205)
scaffold0445 (366-434)||(6265-6332)
[»] chr5 (136 HSPs)
chr5 (13-431)||(10463737-10464154)
chr5 (13-433)||(8313209-8313628)
chr5 (13-432)||(37103032-37103450)
chr5 (13-435)||(8404267-8404690)
chr5 (13-435)||(8336843-8337264)
chr5 (13-436)||(34785122-34785544)
chr5 (43-434)||(17742355-17742748)
chr5 (13-427)||(40158265-40158678)
chr5 (15-431)||(1683042-1683458)
chr5 (20-435)||(621500-621914)
chr5 (13-434)||(4462756-4463180)
chr5 (13-391)||(27307819-27308197)
chr5 (13-430)||(27335630-27336045)
chr5 (13-430)||(4426022-4426439)
chr5 (13-434)||(2003952-2004371)
chr5 (13-436)||(42877487-42877905)
chr5 (13-433)||(24636815-24637234)
chr5 (13-434)||(41192845-41193272)
chr5 (13-375)||(41139025-41139387)
chr5 (86-434)||(34009995-34010343)
chr5 (13-432)||(31211187-31211609)
chr5 (13-372)||(8217947-8218293)
chr5 (132-432)||(9687407-9687708)
chr5 (13-434)||(4461837-4462245)
chr5 (20-435)||(30394087-30394504)
chr5 (104-372)||(38693402-38693670)
chr5 (13-328)||(13920063-13920378)
chr5 (20-426)||(2005030-2005438)
chr5 (132-434)||(28456628-28456927)
chr5 (213-430)||(22022975-22023193)
chr5 (13-336)||(34527030-34527341)
chr5 (117-434)||(42852827-42853141)
chr5 (8-184)||(22023191-22023367)
chr5 (13-337)||(43440844-43441155)
chr5 (172-434)||(21837098-21837360)
chr5 (22-435)||(22166745-22167161)
chr5 (40-434)||(37446432-37446822)
chr5 (20-434)||(10674648-10675062)
chr5 (173-425)||(9924401-9924645)
chr5 (13-432)||(18261055-18261471)
chr5 (164-432)||(14049632-14049899)
chr5 (32-435)||(36875874-36876275)
chr5 (20-433)||(30698556-30698969)
chr5 (13-362)||(26865653-26865975)
chr5 (13-156)||(16965878-16966021)
chr5 (20-194)||(2262907-2263081)
chr5 (13-96)||(9687715-9687798)
chr5 (342-433)||(17742216-17742307)
chr5 (41-147)||(9924287-9924393)
chr5 (219-372)||(18950805-18950959)
chr5 (276-432)||(6365174-6365330)
chr5 (271-434)||(32510406-32510570)
chr5 (15-194)||(40272459-40272638)
chr5 (274-412)||(27280413-27280552)
chr5 (20-251)||(43210684-43210914)
chr5 (357-434)||(8404735-8404812)
chr5 (356-433)||(42877945-42878022)
chr5 (20-203)||(19332468-19332651)
chr5 (342-429)||(22023389-22023476)
chr5 (353-436)||(27335509-27335592)
chr5 (364-435)||(40158145-40158216)
chr5 (349-435)||(621955-622041)
chr5 (367-433)||(4462456-4462522)
chr5 (356-433)||(2003834-2003911)
chr5 (364-433)||(28237302-28237371)
chr5 (342-434)||(2004904-2004996)
chr5 (342-426)||(3407211-3407295)
chr5 (13-109)||(6365413-6365508)
chr5 (364-432)||(9687848-9687916)
chr5 (342-426)||(19332351-19332435)
chr5 (366-434)||(27307701-27307769)
chr5 (343-434)||(1683486-1683577)
chr5 (366-433)||(4425903-4425970)
chr5 (342-433)||(10674524-10674615)
chr5 (352-434)||(4462282-4462364)
chr5 (15-376)||(3548280-3548638)
chr5 (366-435)||(8336722-8336791)
chr5 (355-432)||(21837026-21837103)
chr5 (356-433)||(30403454-30403531)
chr5 (13-69)||(26865232-26865288)
chr5 (269-431)||(28615906-28616065)
chr5 (343-426)||(2263114-2263197)
chr5 (366-433)||(10463621-10463688)
chr5 (343-410)||(42645214-42645281)
chr5 (343-433)||(13919945-13920035)
chr5 (41-139)||(14049903-14050000)
chr5 (364-434)||(28456468-28456538)
chr5 (368-426)||(37812172-37812230)
chr5 (343-433)||(38693759-38693849)
chr5 (364-426)||(43210972-43211034)
chr5 (366-435)||(8313090-8313159)
chr5 (343-432)||(18950977-18951066)
chr5 (343-432)||(38691864-38691953)
chr5 (20-205)||(43209900-43210084)
chr5 (364-425)||(43538478-43538539)
chr5 (13-65)||(8217510-8217562)
chr5 (352-436)||(30699013-30699097)
chr5 (20-99)||(32537608-32537687)
chr5 (342-426)||(40272346-40272430)
chr5 (365-428)||(30733836-30733899)
chr5 (486-521)||(31006197-31006232)
chr5 (364-431)||(37102918-37102984)
chr5 (343-433)||(13920973-13921063)
chr5 (364-426)||(19333302-19333364)
chr5 (343-433)||(26865114-26865204)
chr5 (488-521)||(7077225-7077258)
chr5 (342-431)||(8218321-8218410)
chr5 (342-431)||(24637261-24637350)
chr5 (342-435)||(30393960-30394053)
chr5 (343-432)||(34526913-34527002)
chr5 (20-113)||(42645089-42645181)
chr5 (20-100)||(37812678-37812757)
chr5 (13-69)||(38693675-38693731)
chr5 (342-434)||(41193299-41193391)
chr5 (146-205)||(5597755-5597814)
chr5 (146-205)||(24334041-24334100)
chr5 (337-436)||(27280060-27280159)
chr5 (52-99)||(42852775-42852822)
chr5 (405-435)||(19104366-19104396)
chr5 (342-431)||(22167197-22167287)
chr5 (118-260)||(30733973-30734113)
chr5 (342-432)||(36875743-36875833)
chr5 (405-434)||(1056360-1056389)
chr5 (270-434)||(3548594-3548758)
chr5 (370-435)||(6365557-6365622)
chr5 (142-195)||(23425337-23425389)
chr5 (13-54)||(28456585-28456626)
chr5 (405-434)||(33894706-33894735)
chr5 (405-434)||(40360777-40360806)
chr5 (141-205)||(2567432-2567496)
chr5 (489-521)||(9599655-9599687)
chr5 (488-520)||(26685844-26685876)
chr5 (488-520)||(26955575-26955607)
chr5 (343-395)||(34527428-34527480)
chr5 (343-431)||(41138909-41138997)
chr5 (490-518)||(41192730-41192758)
[»] chr4 (136 HSPs)
chr4 (13-434)||(33177295-33177716)
chr4 (13-436)||(53323774-53324198)
chr4 (13-435)||(47309434-47309856)
chr4 (13-434)||(22068097-22068519)
chr4 (13-394)||(30331192-30331573)
chr4 (15-430)||(28448268-28448677)
chr4 (13-432)||(51395489-51395907)
chr4 (20-436)||(55938075-55938492)
chr4 (47-434)||(1870140-1870526)
chr4 (20-362)||(31316547-31316889)
chr4 (13-432)||(10085485-10085902)
chr4 (13-436)||(4850094-4850518)
chr4 (13-436)||(19522712-19523136)
chr4 (8-301)||(43937996-43938290)
chr4 (13-372)||(10321695-10322055)
chr4 (13-371)||(33689232-33689588)
chr4 (13-346)||(53423525-53423859)
chr4 (8-251)||(20177934-20178175)
chr4 (52-432)||(7490732-7491110)
chr4 (13-301)||(51876007-51876297)
chr4 (13-338)||(25422067-25422391)
chr4 (13-205)||(13718078-13718271)
chr4 (13-433)||(47379053-47379471)
chr4 (85-429)||(47463436-47463780)
chr4 (13-248)||(38114273-38114507)
chr4 (20-436)||(48082450-48082868)
chr4 (86-318)||(3873142-3873374)
chr4 (20-429)||(23473360-23473766)
chr4 (213-433)||(7617293-7617514)
chr4 (269-420)||(38114125-38114277)
chr4 (20-435)||(44289684-44290089)
chr4 (117-375)||(11670210-11670469)
chr4 (13-362)||(53571491-53571824)
chr4 (213-431)||(3862366-3862585)
chr4 (213-431)||(3871123-3871342)
chr4 (15-435)||(52947635-52948054)
chr4 (268-436)||(13717866-13718035)
chr4 (58-312)||(42972730-42972983)
chr4 (14-433)||(48219764-48220180)
chr4 (13-260)||(35060875-35061120)
chr4 (13-333)||(44209470-44209777)
chr4 (13-202)||(37329487-37329678)
chr4 (325-434)||(3872919-3873028)
chr4 (53-430)||(38499327-38499705)
chr4 (15-436)||(13603785-13604206)
chr4 (268-432)||(45557893-45558058)
chr4 (270-433)||(20177721-20177885)
chr4 (20-251)||(35821131-35821349)
chr4 (20-436)||(55283115-55283531)
chr4 (146-412)||(20650400-20650666)
chr4 (20-203)||(34513123-34513305)
chr4 (13-89)||(7617535-7617611)
chr4 (20-251)||(44452093-44452322)
chr4 (13-84)||(3873397-3873468)
chr4 (342-433)||(53569036-53569127)
chr4 (368-434)||(3873519-3873585)
chr4 (270-392)||(35351551-35351672)
chr4 (356-433)||(52948097-52948174)
chr4 (356-436)||(7499085-7499165)
chr4 (342-426)||(13508756-13508840)
chr4 (356-435)||(47379512-47379591)
chr4 (366-432)||(38114558-38114624)
chr4 (356-430)||(30331614-30331690)
chr4 (343-432)||(33689616-33689705)
chr4 (366-435)||(43938286-43938355)
chr4 (342-434)||(4849974-4850066)
chr4 (356-436)||(10085365-10085445)
chr4 (13-69)||(11670873-11670929)
chr4 (356-432)||(14579065-14579141)
chr4 (342-434)||(44289558-44289650)
chr4 (342-426)||(48738397-48738481)
chr4 (364-435)||(7490576-7490647)
chr4 (20-251)||(28163783-28164010)
chr4 (344-434)||(6589096-6589186)
chr4 (352-434)||(7617648-7617730)
chr4 (151-238)||(35351735-35351822)
chr4 (343-433)||(53570890-53570980)
chr4 (343-433)||(53571852-53571942)
chr4 (343-436)||(22067977-22068070)
chr4 (342-435)||(23473803-23473895)
chr4 (367-432)||(28448734-28448799)
chr4 (342-426)||(28164045-28164128)
chr4 (20-136)||(47939750-47939865)
chr4 (13-100)||(11670119-11670206)
chr4 (366-433)||(19522593-19522660)
chr4 (356-435)||(20650730-20650809)
chr4 (343-430)||(31470847-31470934)
chr4 (365-432)||(51395958-51396025)
chr4 (364-435)||(53423904-53423975)
chr4 (343-433)||(11670001-11670091)
chr4 (356-410)||(35821030-35821084)
chr4 (333-435)||(42916228-42916330)
chr4 (344-426)||(44451975-44452057)
chr4 (58-194)||(44452920-44453056)
chr4 (343-431)||(25243925-25244013)
chr4 (356-432)||(33177756-33177832)
chr4 (342-434)||(48082324-48082416)
chr4 (485-521)||(51224721-51224757)
chr4 (343-433)||(11670957-11671047)
chr4 (142-205)||(16618865-16618928)
chr4 (405-436)||(23454819-23454850)
chr4 (490-521)||(31049028-31049059)
chr4 (490-521)||(43434480-43434511)
chr4 (490-521)||(45923518-45923549)
chr4 (405-436)||(51863680-51863711)
chr4 (368-431)||(51875879-51875942)
chr4 (490-521)||(54165059-54165090)
chr4 (405-435)||(4415472-4415502)
chr4 (20-114)||(6817994-6818087)
chr4 (405-435)||(16078701-16078731)
chr4 (367-433)||(25421949-25422015)
chr4 (343-433)||(31316423-31316512)
chr4 (343-433)||(37329718-37329808)
chr4 (405-435)||(49459991-49460021)
chr4 (14-84)||(50824411-50824481)
chr4 (405-434)||(1828896-1828925)
chr4 (358-431)||(6818136-6818209)
chr4 (488-521)||(24235472-24235505)
chr4 (342-407)||(28163139-28163204)
chr4 (405-434)||(32800796-32800825)
chr4 (385-430)||(42972666-42972711)
chr4 (343-432)||(44208758-44208847)
chr4 (352-433)||(53323656-53323737)
chr4 (13-69)||(53569155-53569212)
chr4 (13-69)||(53571008-53571065)
chr4 (489-521)||(4550486-4550518)
chr4 (118-205)||(8949622-8949710)
chr4 (343-431)||(10321579-10321667)
chr4 (405-433)||(16071412-16071440)
chr4 (343-431)||(25423007-25423095)
chr4 (405-433)||(26903060-26903088)
chr4 (342-426)||(34513339-34513423)
chr4 (271-331)||(40532187-40532247)
chr4 (366-430)||(47309319-47309383)
chr4 (342-434)||(47463297-47463389)
chr4 (118-205)||(52788873-52788960)
[»] chr7 (124 HSPs)
chr7 (13-434)||(43597358-43597779)
chr7 (13-436)||(22378330-22378753)
chr7 (13-434)||(7238450-7238871)
chr7 (13-435)||(47791838-47792268)
chr7 (13-432)||(38158948-38159371)
chr7 (13-396)||(4926372-4926758)
chr7 (13-432)||(1961897-1962317)
chr7 (13-417)||(18059006-18059406)
chr7 (44-436)||(10620392-10620785)
chr7 (20-435)||(14990421-14990834)
chr7 (20-435)||(15420032-15420445)
chr7 (96-432)||(6330978-6331315)
chr7 (13-346)||(6588687-6589020)
chr7 (53-435)||(27727098-27727485)
chr7 (20-375)||(46044225-46044580)
chr7 (13-434)||(4899739-4900158)
chr7 (14-435)||(11396832-11397252)
chr7 (13-312)||(35482055-35482351)
chr7 (13-433)||(43574239-43574657)
chr7 (13-372)||(44167730-44168074)
chr7 (15-435)||(15652674-15653085)
chr7 (13-284)||(46330799-46331069)
chr7 (13-347)||(38199062-38199382)
chr7 (20-432)||(38598974-38599389)
chr7 (13-205)||(21109449-21109642)
chr7 (12-362)||(3495655-3495992)
chr7 (78-433)||(37539849-37540206)
chr7 (13-436)||(1544347-1544769)
chr7 (13-372)||(43083788-43084137)
chr7 (13-432)||(44080958-44081366)
chr7 (13-371)||(29155900-29156260)
chr7 (86-260)||(36019811-36019985)
chr7 (13-146)||(4883775-4883908)
chr7 (13-372)||(33624788-33625144)
chr7 (15-436)||(9633040-9633461)
chr7 (220-372)||(45958663-45958815)
chr7 (220-434)||(28924698-28924914)
chr7 (13-155)||(45958811-45958953)
chr7 (105-436)||(10463168-10463497)
chr7 (19-157)||(16080918-16081056)
chr7 (20-194)||(1066517-1066691)
chr7 (162-372)||(15130859-15131061)
chr7 (364-435)||(7238921-7238992)
chr7 (364-434)||(6588568-6588638)
chr7 (342-435)||(6589279-6589371)
chr7 (13-98)||(36020005-36020090)
chr7 (20-251)||(8832715-8832946)
chr7 (364-436)||(14990890-14990962)
chr7 (364-436)||(15420501-15420573)
chr7 (20-251)||(12621631-12621861)
chr7 (342-436)||(22378781-22378874)
chr7 (364-434)||(27728102-27728172)
chr7 (366-431)||(4883960-4884025)
chr7 (15-68)||(27727998-27728051)
chr7 (342-426)||(8832597-8832681)
chr7 (342-426)||(18798829-18798913)
chr7 (366-434)||(38158830-38158898)
chr7 (342-426)||(38595316-38595400)
chr7 (350-426)||(40304521-40304597)
chr7 (364-426)||(8081698-8081760)
chr7 (364-434)||(11397295-11397365)
chr7 (356-430)||(12908565-12908639)
chr7 (364-430)||(15654429-15654495)
chr7 (344-426)||(37107568-37107650)
chr7 (343-433)||(38198944-38199034)
chr7 (20-113)||(8081814-8081906)
chr7 (12-69)||(38199807-38199864)
chr7 (364-436)||(21109692-21109764)
chr7 (325-381)||(36019720-36019776)
chr7 (215-331)||(47139713-47139830)
chr7 (92-251)||(1065769-1065928)
chr7 (342-432)||(1260023-1260113)
chr7 (344-426)||(12621897-12621979)
chr7 (274-433)||(16080653-16080814)
chr7 (364-434)||(18058887-18058957)
chr7 (20-251)||(37107686-37107916)
chr7 (20-98)||(38593281-38593358)
chr7 (342-435)||(47791717-47791808)
chr7 (364-433)||(1961779-1961848)
chr7 (359-436)||(10620847-10620924)
chr7 (342-430)||(12932878-12932967)
chr7 (352-433)||(35482388-35482469)
chr7 (22-251)||(42974165-42974394)
chr7 (343-431)||(33624672-33624760)
chr7 (20-169)||(37108538-37108686)
chr7 (342-426)||(38593164-38593247)
chr7 (342-434)||(38598848-38598940)
chr7 (342-426)||(42974605-42974689)
chr7 (13-68)||(3496423-3496478)
chr7 (356-435)||(35481964-35482043)
chr7 (343-430)||(43083212-43083299)
chr7 (344-426)||(1065580-1065662)
chr7 (343-433)||(3496506-3496596)
chr7 (342-432)||(37537369-37537459)
chr7 (343-433)||(38199891-38199981)
chr7 (364-434)||(43574120-43574190)
chr7 (343-433)||(46330681-46330771)
chr7 (93-251)||(38594592-38594750)
chr7 (343-432)||(44167024-44167113)
chr7 (343-432)||(45957988-45958077)
chr7 (343-431)||(15131652-15131740)
chr7 (15-71)||(37537487-37537542)
chr7 (356-431)||(4900199-4900274)
chr7 (20-71)||(8082536-8082586)
chr7 (13-64)||(15130711-15130762)
chr7 (385-432)||(15492893-15492940)
chr7 (344-431)||(33625730-33625817)
chr7 (356-435)||(44080838-44080917)
chr7 (366-436)||(43597829-43597899)
chr7 (343-433)||(45958981-45959071)
chr7 (364-430)||(46044636-46044702)
chr7 (488-521)||(17157285-17157318)
chr7 (405-434)||(21973517-21973546)
chr7 (405-434)||(23594922-23594951)
chr7 (488-521)||(33050335-33050368)
chr7 (342-395)||(40304019-40304072)
chr7 (13-69)||(43083327-43083384)
chr7 (489-521)||(116783-116815)
chr7 (13-49)||(15131588-15131624)
chr7 (343-395)||(25270533-25270585)
chr7 (489-521)||(26041462-26041494)
chr7 (488-520)||(33881591-33881623)
chr7 (20-84)||(40304416-40304479)
chr7 (343-431)||(46331690-46331778)
[»] chr1 (134 HSPs)
chr1 (13-432)||(30719479-30719899)
chr1 (13-432)||(26805367-26805786)
chr1 (8-435)||(35530781-35531209)
chr1 (13-435)||(19791239-19791661)
chr1 (13-433)||(52493528-52493949)
chr1 (15-433)||(26020275-26020692)
chr1 (13-433)||(43504775-43505187)
chr1 (20-372)||(11999725-12000077)
chr1 (13-372)||(36367825-36368185)
chr1 (13-301)||(13501206-13501491)
chr1 (13-251)||(28700954-28701192)
chr1 (13-375)||(30982314-30982677)
chr1 (13-299)||(51561357-51561642)
chr1 (13-372)||(33708880-33709240)
chr1 (92-432)||(46517047-46517388)
chr1 (13-434)||(31400219-31400639)
chr1 (41-251)||(47008705-47008913)
chr1 (13-375)||(46596708-46597070)
chr1 (20-430)||(10041119-10041528)
chr1 (15-434)||(33707243-33707663)
chr1 (13-347)||(36248333-36248658)
chr1 (20-340)||(12368211-12368518)
chr1 (213-434)||(21794533-21794754)
chr1 (151-427)||(2059484-2059760)
chr1 (13-377)||(21091051-21091412)
chr1 (302-431)||(47008553-47008682)
chr1 (13-347)||(15053640-15053953)
chr1 (91-436)||(35188250-35188589)
chr1 (103-321)||(39681883-39682103)
chr1 (213-434)||(42972167-42972385)
chr1 (127-430)||(48410258-48410561)
chr1 (269-436)||(5430436-5430604)
chr1 (20-113)||(21794417-21794510)
chr1 (183-362)||(37986691-37986869)
chr1 (20-238)||(49767693-49767910)
chr1 (300-434)||(28701202-28701337)
chr1 (53-315)||(7565172-7565435)
chr1 (20-238)||(12251439-12251656)
chr1 (271-431)||(20357192-20357352)
chr1 (271-431)||(20562603-20562763)
chr1 (20-432)||(31023932-31024344)
chr1 (20-194)||(27550800-27550974)
chr1 (20-238)||(25351963-25352178)
chr1 (20-203)||(11397039-11397222)
chr1 (15-82)||(2059078-2059145)
chr1 (364-436)||(19791118-19791190)
chr1 (13-109)||(37986893-37986989)
chr1 (342-434)||(35530668-35530760)
chr1 (349-433)||(43504657-43504741)
chr1 (358-434)||(46517412-46517488)
chr1 (342-426)||(48218172-48218256)
chr1 (342-426)||(52010675-52010759)
chr1 (366-433)||(13501087-13501154)
chr1 (20-194)||(49768522-49768696)
chr1 (343-426)||(52882620-52882703)
chr1 (344-426)||(49767575-49767657)
chr1 (358-435)||(30742667-30742744)
chr1 (364-433)||(41331948-41332017)
chr1 (20-113)||(48218046-48218138)
chr1 (61-251)||(52882366-52882556)
chr1 (342-426)||(25352768-25352852)
chr1 (342-434)||(28700834-28700926)
chr1 (275-334)||(29231368-29231428)
chr1 (366-434)||(48410002-48410070)
chr1 (366-434)||(51561220-51561288)
chr1 (364-424)||(52881487-52881547)
chr1 (13-68)||(29231884-29231939)
chr1 (343-433)||(12367585-12367675)
chr1 (343-433)||(12368553-12368643)
chr1 (344-426)||(27551819-27551901)
chr1 (343-433)||(36368213-36368303)
chr1 (344-426)||(51338351-51338433)
chr1 (364-433)||(2058959-2059028)
chr1 (365-430)||(21090938-21091003)
chr1 (33-98)||(26207482-26207547)
chr1 (343-432)||(29231208-29231297)
chr1 (20-69)||(36249098-36249147)
chr1 (342-426)||(11396921-11397005)
chr1 (13-69)||(12367703-12367759)
chr1 (342-426)||(12897412-12897496)
chr1 (13-69)||(15054431-15054487)
chr1 (368-436)||(21091667-21091735)
chr1 (352-432)||(21794293-21794373)
chr1 (364-432)||(26805836-26805904)
chr1 (342-434)||(31400100-31400192)
chr1 (13-69)||(37986209-37986265)
chr1 (342-426)||(51339919-51340003)
chr1 (352-435)||(13501544-13501627)
chr1 (364-426)||(25351845-25351907)
chr1 (343-433)||(36249182-36249272)
chr1 (343-433)||(37986091-37986181)
chr1 (364-430)||(47008974-47009040)
chr1 (364-433)||(15053528-15053597)
chr1 (134-251)||(27551567-27551684)
chr1 (343-432)||(37987017-37987106)
chr1 (133-205)||(52881707-52881780)
chr1 (115-159)||(2059152-2059196)
chr1 (343-431)||(11999601-11999689)
chr1 (350-394)||(12896866-12896910)
chr1 (342-426)||(27550683-27550767)
chr1 (342-433)||(31024377-31024468)
chr1 (343-431)||(33708203-33708291)
chr1 (15-99)||(42971953-42972036)
chr1 (371-426)||(12251714-12251769)
chr1 (64-195)||(18996922-18997052)
chr1 (142-205)||(26507632-26507695)
chr1 (405-436)||(28334985-28335016)
chr1 (356-399)||(28480018-28480061)
chr1 (405-436)||(30440547-30440578)
chr1 (490-520)||(10385567-10385597)
chr1 (405-435)||(11745502-11745532)
chr1 (364-426)||(51840106-51840168)
chr1 (364-426)||(51841347-51841409)
chr1 (268-301)||(6216383-6216416)
chr1 (405-434)||(14292672-14292701)
chr1 (405-434)||(21248887-21248916)
chr1 (343-432)||(30981631-30981720)
chr1 (385-426)||(49768769-49768810)
chr1 (342-427)||(52493416-52493501)
chr1 (343-395)||(533936-533988)
chr1 (490-518)||(5383914-5383942)
chr1 (352-432)||(7565511-7565590)
chr1 (15-99)||(13083446-13083529)
chr1 (490-518)||(24749630-24749658)
chr1 (364-432)||(26020745-26020812)
chr1 (118-205)||(26451181-26451269)
chr1 (493-521)||(27563624-27563652)
chr1 (118-205)||(31861634-31861722)
chr1 (41-113)||(43396432-43396504)
chr1 (405-433)||(43485914-43485942)
chr1 (118-205)||(47632664-47632752)
chr1 (20-95)||(48410127-48410202)
chr1 (493-521)||(49189102-49189130)
chr1 (366-434)||(51561694-51561762)
[»] chr8 (138 HSPs)
chr8 (13-436)||(25101832-25102255)
chr8 (10-433)||(38706316-38706739)
chr8 (13-435)||(44265446-44265868)
chr8 (13-433)||(5250263-5250684)
chr8 (13-435)||(6590263-6590686)
chr8 (13-434)||(41590212-41590631)
chr8 (10-388)||(36470743-36471121)
chr8 (13-436)||(33322531-33322954)
chr8 (13-435)||(37967533-37967956)
chr8 (13-433)||(5695793-5696205)
chr8 (8-427)||(27875327-27875745)
chr8 (8-427)||(28015506-28015926)
chr8 (13-431)||(43622667-43623087)
chr8 (13-433)||(8784576-8784996)
chr8 (13-392)||(6018037-6018414)
chr8 (13-373)||(21135321-21135681)
chr8 (13-372)||(35863039-35863397)
chr8 (13-372)||(24451482-24451841)
chr8 (13-431)||(17842463-17842881)
chr8 (13-434)||(42499252-42499673)
chr8 (13-372)||(35369188-35369546)
chr8 (13-362)||(18839862-18840211)
chr8 (13-260)||(17498541-17498787)
chr8 (13-372)||(41281235-41281593)
chr8 (20-328)||(37706702-37707009)
chr8 (10-246)||(21159841-21160077)
chr8 (20-372)||(16472997-16473341)
chr8 (20-372)||(16477568-16477912)
chr8 (23-421)||(30968670-30969069)
chr8 (141-432)||(43936391-43936681)
chr8 (13-193)||(6413383-6413563)
chr8 (20-412)||(5765610-5766005)
chr8 (78-355)||(18304617-18304896)
chr8 (20-429)||(28755051-28755462)
chr8 (13-205)||(30658540-30658731)
chr8 (13-333)||(36063409-36063718)
chr8 (13-205)||(9252645-9252836)
chr8 (13-205)||(13323652-13323845)
chr8 (20-428)||(36018116-36018528)
chr8 (13-347)||(39336991-39337312)
chr8 (31-247)||(17062425-17062639)
chr8 (31-247)||(17585719-17585933)
chr8 (92-318)||(23483421-23483647)
chr8 (217-434)||(36126455-36126677)
chr8 (34-398)||(32513952-32514318)
chr8 (271-436)||(31185724-31185892)
chr8 (271-436)||(30658321-30658491)
chr8 (13-251)||(43988211-43988446)
chr8 (268-433)||(17062151-17062313)
chr8 (300-433)||(17586074-17586207)
chr8 (271-434)||(2827065-2827229)
chr8 (279-432)||(30806214-30806368)
chr8 (271-430)||(12469454-12469615)
chr8 (13-113)||(14121938-14122038)
chr8 (356-433)||(547343-547420)
chr8 (314-430)||(21159724-21159841)
chr8 (15-194)||(32244511-32244690)
chr8 (366-434)||(14121810-14121878)
chr8 (364-436)||(41590680-41590752)
chr8 (20-205)||(3865698-3865883)
chr8 (364-434)||(6590145-6590215)
chr8 (53-328)||(42024231-42024504)
chr8 (356-435)||(43988488-43988567)
chr8 (53-163)||(2826919-2827029)
chr8 (364-434)||(10409477-10409547)
chr8 (366-435)||(14122090-14122159)
chr8 (20-145)||(44894574-44894698)
chr8 (356-436)||(33322410-33322490)
chr8 (342-426)||(44893744-44893828)
chr8 (342-433)||(36471145-36471236)
chr8 (364-434)||(1680848-1680918)
chr8 (53-194)||(3866505-3866647)
chr8 (342-432)||(6413591-6413681)
chr8 (343-433)||(24451364-24451454)
chr8 (356-434)||(37967414-37967492)
chr8 (268-392)||(10410101-10410226)
chr8 (356-432)||(12469306-12469382)
chr8 (342-426)||(30133849-30133933)
chr8 (13-69)||(39337757-39337813)
chr8 (342-426)||(44894732-44894816)
chr8 (342-429)||(38706763-38706850)
chr8 (20-205)||(6243479-6243663)
chr8 (364-434)||(21160124-21160194)
chr8 (356-426)||(30658771-30658841)
chr8 (343-433)||(41281621-41281711)
chr8 (342-435)||(28755496-28755589)
chr8 (117-169)||(1663854-1663906)
chr8 (366-434)||(5250735-5250803)
chr8 (13-69)||(35369928-35369984)
chr8 (364-432)||(42950226-42950294)
chr8 (364-435)||(8784456-8784527)
chr8 (342-409)||(18304937-18305003)
chr8 (343-433)||(1737439-1737529)
chr8 (364-426)||(6244393-6244455)
chr8 (343-433)||(13323873-13323963)
chr8 (342-436)||(17498813-17498907)
chr8 (343-433)||(21135204-21135294)
chr8 (20-205)||(32243684-32243869)
chr8 (343-433)||(35862921-35863011)
chr8 (343-433)||(39337841-39337931)
chr8 (343-432)||(13323066-13323155)
chr8 (343-432)||(21136266-21136355)
chr8 (357-430)||(44803401-44803474)
chr8 (342-426)||(3866714-3866798)
chr8 (23-111)||(10409789-10409876)
chr8 (342-426)||(32244719-32244803)
chr8 (343-431)||(36063746-36063834)
chr8 (365-433)||(39336873-39336941)
chr8 (489-521)||(43602310-43602342)
chr8 (371-426)||(3865578-3865633)
chr8 (142-205)||(6244275-6244338)
chr8 (405-436)||(8525757-8525788)
chr8 (490-521)||(11089729-11089760)
chr8 (405-436)||(17950448-17950479)
chr8 (118-205)||(34050598-34050685)
chr8 (368-431)||(44265330-44265393)
chr8 (342-436)||(17842342-17842436)
chr8 (33-95)||(28701866-28701928)
chr8 (365-431)||(28701997-28702063)
chr8 (344-426)||(32243566-32243648)
chr8 (403-433)||(32985789-32985819)
chr8 (487-521)||(34972217-34972251)
chr8 (343-433)||(35370012-35370102)
chr8 (488-518)||(38504325-38504355)
chr8 (13-67)||(41255335-41255389)
chr8 (325-430)||(17498435-17498538)
chr8 (343-432)||(24452424-24452513)
chr8 (365-430)||(40304870-40304935)
chr8 (358-426)||(2821319-2821386)
chr8 (405-433)||(9376197-9376225)
chr8 (13-49)||(16478432-16478468)
chr8 (489-521)||(20895893-20895925)
chr8 (342-430)||(27000663-27000751)
chr8 (33-69)||(28694963-28694999)
chr8 (489-521)||(30927818-30927850)
chr8 (343-395)||(35369108-35369160)
chr8 (146-194)||(36333227-36333275)
chr8 (342-430)||(36910697-36910784)
[»] chr2 (111 HSPs)
chr2 (13-432)||(7439220-7439639)
chr2 (13-436)||(33831996-33832418)
chr2 (20-433)||(10357322-10357736)
chr2 (13-435)||(31771316-31771739)
chr2 (13-434)||(42274173-42274596)
chr2 (13-434)||(41120738-41121160)
chr2 (13-432)||(25100585-25101001)
chr2 (20-432)||(31436045-31436456)
chr2 (13-435)||(40364759-40365179)
chr2 (136-433)||(13371870-13372167)
chr2 (13-434)||(30784185-30784594)
chr2 (13-431)||(44286563-44286978)
chr2 (13-346)||(3043323-3043656)
chr2 (20-433)||(8737703-8738100)
chr2 (13-284)||(6457266-6457537)
chr2 (13-315)||(43932727-43933029)
chr2 (13-435)||(37592760-37593171)
chr2 (13-331)||(44492883-44493202)
chr2 (13-337)||(42487639-42487963)
chr2 (13-362)||(20721175-20721511)
chr2 (24-432)||(44879594-44879995)
chr2 (13-251)||(25666038-25666275)
chr2 (21-251)||(36512033-36512263)
chr2 (13-362)||(21439778-21440114)
chr2 (15-434)||(14200838-14201260)
chr2 (13-193)||(35498588-35498768)
chr2 (268-432)||(29809130-29809295)
chr2 (135-372)||(18672317-18672550)
chr2 (268-432)||(35498806-35498970)
chr2 (13-260)||(34073621-34073865)
chr2 (20-435)||(8392207-8392615)
chr2 (13-346)||(20719949-20720274)
chr2 (20-251)||(33000920-33001147)
chr2 (300-434)||(25666290-25666424)
chr2 (281-433)||(6458408-6458561)
chr2 (76-238)||(29809401-29809562)
chr2 (127-309)||(33031165-33031346)
chr2 (302-432)||(30749427-30749555)
chr2 (20-251)||(32319001-32319232)
chr2 (13-95)||(7654925-7655007)
chr2 (13-111)||(20719228-20719326)
chr2 (341-434)||(33031343-33031436)
chr2 (364-432)||(3043705-3043773)
chr2 (343-435)||(41120622-41120714)
chr2 (20-205)||(3117981-3118166)
chr2 (342-426)||(3118828-3118912)
chr2 (20-194)||(32318223-32318398)
chr2 (364-436)||(35498449-35498521)
chr2 (356-434)||(19176643-19176721)
chr2 (15-93)||(33031087-33031165)
chr2 (342-435)||(25100465-25100558)
chr2 (216-377)||(36881222-36881383)
chr2 (356-432)||(4327940-4328016)
chr2 (342-426)||(30982510-30982594)
chr2 (342-426)||(32318105-32318189)
chr2 (364-431)||(6457152-6457219)
chr2 (343-433)||(3104875-3104965)
chr2 (218-301)||(13027450-13027533)
chr2 (364-434)||(31771197-31771267)
chr2 (344-426)||(32319268-32319350)
chr2 (364-430)||(44287026-44287092)
chr2 (342-426)||(9111458-9111542)
chr2 (342-430)||(13027767-13027855)
chr2 (13-69)||(23787782-23787838)
chr2 (365-436)||(1026367-1026438)
chr2 (364-426)||(3117864-3117926)
chr2 (358-432)||(8738619-8738693)
chr2 (343-433)||(20719354-20719444)
chr2 (364-434)||(31435919-31435989)
chr2 (343-433)||(42487991-42488081)
chr2 (365-426)||(7655058-7655118)
chr2 (366-431)||(8392673-8392738)
chr2 (119-338)||(18917309-18917523)
chr2 (356-433)||(33030903-33030980)
chr2 (364-433)||(40365226-40365295)
chr2 (13-69)||(20701256-20701312)
chr2 (343-431)||(20719833-20719921)
chr2 (13-69)||(21439296-21439352)
chr2 (342-426)||(30982713-30982796)
chr2 (448-487)||(16069100-16069139)
chr2 (336-419)||(23497332-23497415)
chr2 (344-426)||(9111999-9112081)
chr2 (20-102)||(13027654-13027735)
chr2 (343-433)||(20701138-20701228)
chr2 (343-433)||(20721540-20721630)
chr2 (343-433)||(21440142-21440232)
chr2 (20-205)||(32319624-32319809)
chr2 (364-434)||(34073909-34073979)
chr2 (343-433)||(43933057-43933147)
chr2 (343-433)||(44492765-44492855)
chr2 (357-431)||(44610645-44610719)
chr2 (13-66)||(18672259-18672312)
chr2 (488-521)||(30413618-30413651)
chr2 (343-431)||(1373521-1373609)
chr2 (343-434)||(10287452-10287543)
chr2 (343-395)||(18672179-18672231)
chr2 (366-426)||(25665929-25665989)
chr2 (490-521)||(6851559-6851590)
chr2 (353-424)||(13372254-13372324)
chr2 (356-431)||(14201303-14201378)
chr2 (342-433)||(33001183-33001274)
chr2 (342-433)||(36512297-36512387)
chr2 (15-65)||(4327848-4327898)
chr2 (405-435)||(6532507-6532537)
chr2 (343-433)||(21439178-21439268)
chr2 (490-520)||(27540156-27540186)
chr2 (343-432)||(42486936-42487025)
chr2 (484-521)||(36582408-36582445)
chr2 (402-435)||(44613174-44613207)
chr2 (405-433)||(22083511-22083539)
chr2 (118-205)||(45301279-45301367)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (15-430)||(17255-17669)
scaffold0036 (342-434)||(17699-17791)
[»] scaffold0651 (2 HSPs)
scaffold0651 (20-362)||(6809-7151)
scaffold0651 (343-433)||(7186-7275)
[»] scaffold1191 (1 HSPs)
scaffold1191 (13-433)||(669-1087)
[»] scaffold0514 (2 HSPs)
scaffold0514 (13-435)||(6054-6470)
scaffold0514 (364-432)||(6519-6587)
[»] scaffold1190 (2 HSPs)
scaffold1190 (13-435)||(75-486)
scaffold1190 (364-432)||(535-603)
[»] scaffold1160 (2 HSPs)
scaffold1160 (15-368)||(1159-1514)
scaffold1160 (358-434)||(1532-1608)
[»] scaffold0707 (2 HSPs)
scaffold0707 (20-398)||(6821-7188)
scaffold0707 (364-436)||(7245-7317)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (112-434)||(157903-158223)
[»] scaffold0148 (3 HSPs)
scaffold0148 (13-328)||(35273-35588)
scaffold0148 (13-69)||(38618-38674)
scaffold0148 (343-430)||(35160-35247)
[»] scaffold0640 (2 HSPs)
scaffold0640 (20-434)||(3765-4181)
scaffold0640 (342-434)||(4215-4307)
[»] scaffold0627 (2 HSPs)
scaffold0627 (13-396)||(6931-7314)
scaffold0627 (365-432)||(6816-6883)
[»] scaffold0097 (6 HSPs)
scaffold0097 (13-362)||(25003-25339)
scaffold0097 (13-346)||(23787-24112)
scaffold0097 (13-111)||(23066-23164)
scaffold0097 (343-433)||(23192-23282)
scaffold0097 (343-431)||(23671-23759)
scaffold0097 (343-433)||(25368-25458)
[»] scaffold0562 (4 HSPs)
scaffold0562 (86-318)||(3961-4193)
scaffold0562 (325-434)||(3738-3847)
scaffold0562 (13-84)||(4216-4287)
scaffold0562 (368-434)||(4338-4404)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (13-372)||(239947-240294)
scaffold0003 (13-69)||(239492-239548)
scaffold0003 (343-430)||(240322-240409)
scaffold0003 (343-395)||(239412-239464)
[»] scaffold0571 (2 HSPs)
scaffold0571 (171-430)||(8610-8868)
scaffold0571 (13-159)||(8430-8575)
[»] scaffold0385 (4 HSPs)
scaffold0385 (13-362)||(9906-10245)
scaffold0385 (343-433)||(10273-10363)
scaffold0385 (13-69)||(9424-9479)
scaffold0385 (371-433)||(9309-9371)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (172-347)||(21711-21886)
scaffold0125 (355-434)||(21881-21960)
scaffold0125 (394-434)||(21632-21672)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (118-435)||(47724-48041)
scaffold0024 (270-425)||(32846-33002)
[»] scaffold0199 (3 HSPs)
scaffold0199 (13-110)||(6204-6301)
scaffold0199 (364-434)||(6085-6155)
scaffold0199 (127-169)||(6305-6347)
[»] scaffold0734 (3 HSPs)
scaffold0734 (219-432)||(2727-2941)
scaffold0734 (20-194)||(3260-3436)
scaffold0734 (342-434)||(3470-3562)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (282-434)||(631-786)
[»] scaffold0093 (3 HSPs)
scaffold0093 (13-99)||(48967-49053)
scaffold0093 (354-430)||(19972-20048)
scaffold0093 (343-395)||(49080-49132)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (20-156)||(282940-283076)
scaffold0005 (20-238)||(283308-283525)
scaffold0005 (356-432)||(238234-238310)
scaffold0005 (342-426)||(282823-282906)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (342-435)||(123460-123554)
scaffold0014 (142-296)||(123198-123351)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (271-431)||(158745-158906)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (355-434)||(5927-6005)
[»] scaffold0287 (1 HSPs)
scaffold0287 (343-433)||(47-137)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (354-432)||(27063-27141)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (488-521)||(9582-9615)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (405-436)||(7314-7345)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (490-521)||(17127-17158)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (405-435)||(16585-16615)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (176-251)||(52512-52586)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (493-521)||(29935-29963)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (344-436)||(134202-134294)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 88)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15721360 - 15720938
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15721360 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaaaaactttactaaaagttcctatgcaaaaaat 15721261  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  15721260 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 15721161  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc--nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15721160 ttctaaaatttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 15721061  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    ||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15721060 gttgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggacttaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttat 15720961  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  15720960 agggaccaaaaacatatttaacc 15720938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 8709836 - 8710260
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8709836 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttt-gaacaattttttgcagacgtgttaagaatattactaaaagttcctctacaaaaaat 8709934  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8709935 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8710033  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8710034 ttctaaattttagttaatgaacctttcatagtattctaaacttgtcttaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 8710133  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattctttt----ttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttt 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8710134 tgtaacagggactaaaattagaagtaattttttttttgttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagttcccaatttt 8710233  T
Q  408 ataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8710234 atagggaccaaaaacatatttagccct 8710260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5974604 - 5974182
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5974604 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 5974505  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  5974504 tgtcgcaaaatttgatttctacatccaaattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 5974405  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5974404 tt-taaattttagttaatgaacctttcatagtattctaaacttgtctgaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 5974306  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  5974305 tgtaacagggactaaaattagaagtaattttttttttgtacggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagttctcaattttata 5974206  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  5974205 gggaccaaaaacatatttaaccct 5974182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Original strand, 30660778 - 30661201
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30660778 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacatgttaagaatattactaaaagttcatctgcaaaaaat 30660877  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt-aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||          
T  30660878 tgtcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttaattttatcattaacttttgtcgttttaaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaa 30660976  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  30660977 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagtataattaaacaaaatttg 30661076  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||    
T  30661077 ttgtaacagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgcaggaactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcgtaattttata 30661175  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |  || |  |||||||||||||||||    
T  30661176 gagactatgaacatatttaacccttt 30661201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 10915301 - 10915728
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt--gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||    
T  10915301 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttttgcagacgtgttaagaacattactaaaaggtcctttacaaaaa 10915400  T
Q  111 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
    ||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  10915401 attgtcgcataatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaacatttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaa 10915500  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaacttt 309  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10915501 a-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgatcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 10915599  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt---gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattt 406  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||    
T  10915600 gttgtaacagggactaaaattcgaagtattttttttttttagtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttgccaattt 10915699  T
Q  407 tataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10915700 tatagggaccaaaaacatatttaaccctt 10915728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Original strand, 26356528 - 26356954
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg---caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    ||  | ||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  26356528 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttttttacacgcgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaa 26356627  T
Q  110 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 209  Q
    ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||        
T  26356628 aattgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaa 26356727  T
Q  210 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactt 308  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26356728 aattt-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 26356826  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatt-aaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttt 407  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  26356827 tgctgtaacagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagagactaaaaaacttattaaaaattaagtaaggattaaacttaaaa-tatcctatttt 26356925  T
Q  408 ataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26356926 atagggatcaaaaacatatttaacccttt 26356954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5087485 - 5087068
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5087485 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactcttgactttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 5087386  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  5087385 tgtcgcaaaaattaatttttacattcagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 5087287  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||         |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5087286 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctaaaaacaaccgttcaaaaagttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 5087187  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||  |||| ||||||||| || ||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  5087186 tgtagtagggactaaaattaaaaataat--ttttttttaggtagtaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatag 5087089  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5087088 gaaccaaaaacatatttaacc 5087068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17697674 - 17697262
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||| | |    
T  17697674 aaatttgtttaatttatgcttaaactcgtgagtttttgaacaattttttgaagacgtgttaagaacattacaaaaagctccttttcataaaattgtcgta 17697575  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||    
T  17697574 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatctt-aataaattctaaa 17697476  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||        |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  17697475 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttttctaaaaaaaatcgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaata 17697376  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaa 418  Q
      | ||||||||||||||||    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  17697375 aagactaaaattagaagtaa---atttttttagggactaaaaaacctattaaaattaagcaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggaccaa 17697279  T
Q  419 aaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||    
T  17697278 aaacatatttaaccctt 17697262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 29692205 - 29691790
Alignment:
Q  14 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29692205 caattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttcaacaattttttgtagacgtgttaaacatattacaaaaagttcctctgcaaaaaatt 29692106  T
Q  114 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
     |  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||       |    
T  29692105 ctcacaaaatttgatttcaacgtccatattttgttacttatatctttaacttttgtcgttttgaaaaattcatatttaattcttttcatgtt-aataaat 29692007  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29692006 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaagtttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgtt 29691907  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
     ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | |||||||||     
T  29691906 gtagtagggactaaaattagaagtaatt-ttttttggagggcctaaaaaacctattaaaattatgtaaggactaaacttataagttctcaattttataga 29691808  T
Q  413 aaccaaaaacatatttaa 430  Q
     |||||||||||||||||    
T  29691807 gaccaaaaacatatttaa 29691790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 844106 - 844531
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  844106 tcaattcaaacttgcttaatttatgtttaaactcttaagtttttgaacaactttttgcagacatatttagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 844205  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatttt-atctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||          
T  844206 tatcgcaaaatttgatttctacattcagattttgttactttttatctttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaa 844305  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  844306 -ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttg 844404  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagt--aagaattaaacttaaaagttccctatttt 407  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  844405 ttttagcagggactaaaattatgagtaattttttttttgtagggactaaaaatgctattaaaattaaataaaaggactaaacttagaagttccctatttt 844504  T
Q  408 ataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  844505 atagggatcaaaaacatatttaaccct 844531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 861655 - 861230
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgcta-aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  861655 tcaattcaaatatgcttaatttatgctttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacatatttagaacattactaaaagttcctcggcaaaaaa 861556  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
    || | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||         
T  861555 ttatcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttactttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaa 861457  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||       ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||    
T  861456 aattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcaaaacttttctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaagtttt 861357  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttta 408  Q
    |||||| ||||| |||||||||  ||||| || |||||| ||  || ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  861356 gttttagcagggactaaaattatgagtaattttttttttatagagactaaaaatgctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttccctatttta 861257  T
Q  409 taggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||||    
T  861256 tagggattaaaaacatatttaaacctt 861230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22732293 - 22731913
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22732293 tcaattcaaatttgtttaaactatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttta-catacgtattaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 22732195  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22732194 tgtcgcaaaatttgatttctacggccagactttgttaattttatctttaacatttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 22732095  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaa-atttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||| |||||||||| | | | |||||||||| | |||||        ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22732094 atctaaattttggtaaatgaacatattacagtgttctaaacttgtcttaaaaaattcgttcaaaatttttaagagtttaagaataattaaacaaactttg 22731995  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactta 392  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22731994 ttgtaacagggactaaaattagaagtaatatttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaactta 22731913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 1820983 - 1821399
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1820983 tcaattcaaatttgttt--tttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtattaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaagt 1821080  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||           
T  1821081 tgtcacaaaatttgatttctacgtccaaattttgt--attttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaactcatttaatgtt-aaaaaa 1821177  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1821178 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttataaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 1821277  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| |||  |||| ||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | || ||||| |||||||||    
T  1821278 tgtaataggaactaacattagaaatactt-ttttttgta-ggactaaaaaacctattaaaattaaataaggactaaactcagaatttcccaattttatag 1821375  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  1821376 ggaccaaaaacatatttaaccctt 1821399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 76 - 435
Target Start/End: Original strand, 30492773 - 30493131
Alignment:
Q  76 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||    
T  30492773 tgttaagaacattactaaaagttcctctgctaaaaattgtcgcaaaattt-atttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttttcatttt 30492871  T
Q  176 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaa 275  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||        ||||||||    
T  30492872 aaaaaaattatatttaactcgtttcatgttaaaaaa-ttataaattttagtaaatgaacccttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaa 30492970  T
Q  276 aaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  || | |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30492971 aaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttagttgtagtagagactaaaattagagataatttttttttgtatggagtaaaaaacctattaaaatt 30493070  T
Q  375 aagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30493071 aagtaaagaataaacttaaaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaatcctt 30493131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5079802 - 5079442
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5079802 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaagt 5079703  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||           
T  5079702 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 5079603  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc-nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataa-ttaacaaactttg 310  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||        ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5079602 at-taaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaaatcgtttaaaaatttaagactttaaggataatttaacaaactttg 5079504  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||| |||||    
T  5079503 ttttagcaggaactaaaattagaagtaatttttttttgtaggaactaaaaaatctactaaaa 5079442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 433
Target Start/End: Original strand, 938845 - 939256
Alignment:
Q  14 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  938845 caattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaataaatt 938944  T
Q  114 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
     | |||||| |||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||       |    
T  938945 atcgcaaaatttgaattctacgtccagactttgttgcttttatctttaacttttgtcttttaaaaaaaatcatatttaattcatttcatgttaaaaaaat 939044  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||       |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  939045 t-taaattttagtaaatgaacctttcaaagtgttctaaacatgtctcaaaaaaatcgttcgaaaatttaggagtttgaggataattaaacaaactttgtt 939143  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    | | ||| | ||||| ||| ||||||           |   |  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |    
T  939144 tcagcagagactaaacttataagtaa--------aaaaaaaaaaaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatatg 939235  T
Q  413 aaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  939236 gaccaaaaacatatttaaccc 939256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33744951 - 33744537
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||  | |||    
T  33744951 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatgttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccgaaaaaaata-tcgca 33744853  T
Q  120 aaaatt-gatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||  ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  33744852 aaaatttgatttctacgtccatatttttattacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttata 33744754  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||     
T  33744753 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 33744654  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaattctttttt-gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| ||    
T  33744653 cagggactaaaattataagtaattttttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcgcaattttatagggac 33744554  T
Q  416 caaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||    
T  33744553 caaaaacatatttaacc 33744537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33518644 - 33518277
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  33518644 aaatttgtttaatgtatgcttatactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatctgcaaaaaattgtcaca 33518545  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||       |||||||    
T  33518544 aaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcattttaggtt--aaaaattctaaa 33518447  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||       ||||||||||||| || ||||  |||| |||||    
T  33518446 ttttagttaataaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaatcaaatcgttcaaaaat-------tttaaggataattaaataaac--tgttgtaaca 33518356  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagtt 398  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  33518355 aggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactataaaacctattaaaatcaagtaaggactaaatttaaaagtt 33518277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 434
Target Start/End: Original strand, 20510542 - 20510887
Alignment:
Q  76 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20510542 tgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaattgtcgtaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttt 20510641  T
Q  176 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||             ||    
T  20510642 aaaaaattcatatttaattcgattcatgtt-aaaaaattctaaattttagttaatgaacctttcatagtgttctaaatttgtctcaa-----------aa 20510729  T
Q  276 aaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatt 374  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20510730 aaatttaaggttttaaagataattaaacaaactttattgtaacagggactaaaactagaagtaatt-ttttttgtagggact-aaaaacctattaaaatt 20510827  T
Q  375 aagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||| | |||  ||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20510828 aagtaaggactaagattagaagtttccaattttatagggaacaaaaacatatttaaccct 20510887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Original strand, 20977467 - 20977785
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat-ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||       || |    
T  20977467 caaaatttgatttctacgtccagattttgttatttttattctttaatttttgtcgttttaaaaaattcacatttaattcttttcatgttaaatttttt-t 20977565  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtttta 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  20977566 aaatattagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaatatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactttgcttta 20977665  T
Q  316 acagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagt-aagaattaaacttaaaagttccctattttataggaa 414  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| | || ||||| | |    
T  20977666 gcagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattataattaagtaaagactaaaacttaaaagttctcaatattataagga 20977765  T
Q  415 ccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20977766 ccaaaaacatatttaaccct 20977785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 2087438 - 2087661
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2087438 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctt-agtttttgaacaaatttttacagacatgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 2087536  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||           
T  2087537 tgtcataaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttatcgttttaaaaaattcatatttaattcggctcatgtt-aaaaaa 2087635  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaaccttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2087636 ttctaaattttagtaaatgaaccttt 2087661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 270 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16736691 - 16736526
Alignment:
Q  270 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16736691 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaacctatt 16736592  T
Q  369 aaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16736591 aaaattaagtaaggattaaacataaaaggtccctattttataggattcaaaaacatatttaaccct 16736526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Original strand, 12481765 - 12482081
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||| || ||||||| | | |||||||| |||| || ||||||||    
T  12481765 tcaattcaaatttgtttaatttatactaaaactctt-----------caattttttgcagacgtgttaagcacaatactaaaaattccgctacaaaaaat 12481853  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||           
T  12481854 tgtcgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatctttaacttctttcgttttaaaatatttatatttaatttattttatgttaaaaaaa 12481953  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12481954 ttctaaattttagcaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttgt 12482053  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaat 339  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  12482054 tgtaatagggactaaaattagaagtaat 12482081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14256440 - 14256111
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttg-aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14256440 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttgagtttttttaacaatttttggtagacatgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaa 14256341  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |      |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||          
T  14256340 ttgtcgcaaaatttgatttcaacgtccaaattttgttact------tttaacttttgtcgttttgaaaaattcatatttaattcttttcatgtt-aataa 14256248  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   |||| |       | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  14256247 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgtttcgagtttgtcacaaaaaatt-gttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactttt 14256149  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttg 348  Q
    || |   | || |||||||||||||||||| |||||||    
T  14256148 ttgttttatggactaaaattagaagtaatttttttttg 14256111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Original strand, 17245717 - 17245929
Alignment:
Q  150 attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttct 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17245717 attttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttatttcgtttcatgttaaaaaa-ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttct 17245815  T
Q  250 aaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttg 348  Q
    || | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17245816 aaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggattaaaattagaagtaatttttttttg 17245915  T
Q  349 tatggattaaaaaa 362  Q
    |||||| |||||||    
T  17245916 tatggactaaaaaa 17245929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18503274 - 18502972
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  18503274 tcaattcaaatttctttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 18503177  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||           
T  18503176 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatgtaattcgtttcaggttaaaaaaa 18503088  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18503087 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 18502989  T
Q  312 tttaacagggcctaaaa 328  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  18502988 tttagtagggactaaaa 18502972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20897947 - 20897688
Alignment:
Q  174 ttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnn-tcgtt 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||         |||||    
T  20897947 ttaaaaaattcatgtttaattcgtttcatgttaaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagcgtcttaaacttgtctaaaaaataatcgtt 20897848  T
Q  273 caaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt-gtatggattaaaaaacctattaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  20897847 caaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattaaaagtaattttttttttgta-ggactaaaaaaactattaa 20897749  T
Q  371 aattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  20897748 aattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttataggaa-caagaatatatttaacc 20897688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28476486 - 28476253
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||  | |  | ||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  28476486 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaacttttgagtttttcaacaattttttggtagatgtattaaacatattactaaatgtttctctg-aaaaaa 28476388  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||          
T  28476387 ttgtcacaaaatttgatttcaacgtccatattttgttacttatatctttaacttttgtcgttttgaaaaatttatatttaattcttttcatgtt-aataa 28476289  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgtt 247  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28476288 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgtt 28476253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 333
Target Start/End: Original strand, 20977101 - 20977317
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat-ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||       || |    
T  20977101 caaaatttgatttctacgtctagattttgttatttttattctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttacttcttttcatgttaattgtttt-t 20977199  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtttta 315  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||        ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20977200 aaatattagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaacaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactttgcttta 20977299  T
Q  316 acagggcctaaaattaga 333  Q
     ||||| |||||||||||    
T  20977300 gcagggactaaaattaga 20977317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 432
Target Start/End: Original strand, 3375297 - 3375708
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||| | || || |||||||  |||||||| |||  ||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||| |  ||    
T  3375297 aaatttgtttaatt-atacttaaaattttaagattttgaaggattttttgtaaaagtgttaagaacattacttaaatttcacctgcaaaaaattatctca 3375395  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||| ||    
T  3375396 aaattttatttctacgttcagatttttgataattttatcttgaacttttgtcgtttaaaaatattcatatttaattcattttatgttaaaaaa-ttccaa 3375494  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaac 317  Q
    ||||||||| | || | |||  || |||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |      
T  3375495 attttagtatacgagcattttgtaatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactttgtttcagt 3375594  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
    |||| |||||| || | ||||    |||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  3375595 agggactaaaactacatgtaaagtatttttgtaggaactaaaaaagctattaaaattaaataatgactaaacttaaaagtttcaaattttatagg-acca 3375693  T
Q  418 aaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||| ||||    
T  3375694 aaaacatattcaacc 3375708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 336
Target Start/End: Original strand, 34046542 - 34046710
Alignment:
Q  169 ttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnnt 268  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |    
T  34046542 ttgtttttaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaatt 34046641  T
Q  269 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagt 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  34046642 cgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattagaagt 34046710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24958918 - 24958759
Alignment:
Q  274 aaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||  || | |||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  24958918 aaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaaatttgttttagcagggattatgataataagtaatt-ttttttgtaaggactaaaaaac-tattaaaa 24958821  T
Q  373 ttaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| || |||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  24958820 ttaagtaaggactaaacttaaaagttaccgattttacaaggaccataaacatatttaaccct 24958759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30353220 - 30353000
Alignment:
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtt 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||        ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |    
T  30353220 tctaaattttagtaagtgaacctttcataatgttctaaacttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagtgtttaaagataattaaataaactttgat 30353122  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggatt--aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
     ||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| || ||  | | ||||||||| || ||||||||    
T  30353121 gtaatagggactaaaattataagtaaattttttttgtaaggactaaaaaaaacctattaaaattaagcaataaccagatttaaaagtttccaattttata 30353022  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
     | | || ||||||||||||||    
T  30353021 aggatcagaaacatatttaacc 30353000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11400364 - 11400171
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaa-ttttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc-ctctgcaaaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    |||||| || || || |||||| |||||||||| ||  || || |||||    
T  11400364 tcaattcaaatttgtttaatttatgattaaactcttgagttttttaaatggttttttacatacgtgctaagaacattactaaaaattatctttg-aaaaa 11400266  T
Q  111 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||| | |||  || ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11400265 attgtcgtaaacttttatttaaatgtccagattttgttaattttatatgtaacttttggcgttttaaaaaatttatatttaattagtttcatgtt 11400171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 289647 - 289461
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |   |    
T  289647 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctta 289549  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga--ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||| ||||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  289548 aaattttatttctacgtccagattttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 289461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21108355 - 21108172
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||| | |  ||    
T  21108355 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcatctccaaaaaaatatctca 21108257  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 203  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  21108256 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 21108172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 427
Target Start/End: Original strand, 2937237 - 2937392
Alignment:
Q  274 aaaaatttaagagttta--aggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaa 370  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||| | ||  ||||||||||| ||||||    
T  2937237 aaaaaattaagagtttataatgataattaaacaaactttgttgtaacaaggattaaacttagaagtaatctttttgtttagagattaaaaaacttattaa 2937336  T
Q  371 aattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatt 427  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  2937337 aattaagtaagaactaaatttagaagttcccaattttataag-accaaaaacatatt 2937392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20898275 - 20898115
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | || | ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||     
T  20898275 tcaattcaaatttttttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaatttttttaagacttcttaagaacattactaaaacttcctccgaaaaaaaa 20898176  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaat 182  Q
      |  ||||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20898175 aatcacaaaatttgatttctacgtcca---------aattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaat 20898115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 289005 - 289178
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |  ||    
T  289005 aaatttgtttaatt-atgcttaaacatttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaacttcatctgcaaaaaattatctca 289103  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  289104 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttg-tctattaaaaaatccatatttaatt 289178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 436
Target Start/End: Original strand, 22732327 - 22732413
Alignment:
Q  349 tatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  22732327 tatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttgtaggga-caaaaacatatttaacccttt 22732413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Original strand, 12482110 - 12482204
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12482110 ttttttgtagagactaaaagacctattaaaattaagtaaggaataaacttaaaagttttctactttatagggactaaaaacatatttaacccttt 12482204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20510465 - 20510372
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20510465 ttttttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggagtaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaacacatatttaaccctt 20510372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Original strand, 2087660 - 2087732
Alignment:
Q  329 ttagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccc 401  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  2087660 ttagaagtaattcttttttatagggactaaaaaacctattaaaattaagcaaggattaaacttagaagttccc 2087732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 3913232 - 3913148
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3913232 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 3913148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 30492673 - 30492601
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30492673 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 30492601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2087412 - 2087319
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2087412 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtcccaattttatagggaccaaaaatatatttaaccctt 2087319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1820935 - 1820868
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1820935 ctattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatagg-accaaaaatatatttaacc 1820868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 5086743 - 5086827
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5086743 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 5086827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26356477 - 26356409
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26356477 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctaatttatagggaccaaaaacatatttaaccct 26356409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 861704 - 861774
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  861704 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcacaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 861774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3914709 - 3914525
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |  ||    
T  3914709 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaataattttt-gcacaagtgttaagaacattacaaaatgttcatctgcaaaaaattatctca 3914612  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattt-tgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  3914611 aaattttatttctacgtctagatttctgttagttttattttgaacttttgtcttttaaaaaatttcatatctaatttatttcatgtt 3914525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 434
Target Start/End: Original strand, 15721401 - 15721479
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15721401 taaaaaaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggaccaaaaacatattttaccct 15721479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16465339 - 16465258
Alignment:
Q  354 attaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  16465339 attaaaaaagctattaaaattaagtaagtactaaatttaaaagttttcaattttatagagaccaaaaaaatatttaaccctt 16465258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17246376 - 17246307
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaag 82  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  17246376 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtaaatgtgttaag 17246307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 430
Target Start/End: Original strand, 18804125 - 18804198
Alignment:
Q  357 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18804125 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatatctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 18804198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 3335490 - 3335578
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  3335490 tttttgtgaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcgattttatagggactaaaaacatatttaac 3335578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Original strand, 11400391 - 11400483
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11400391 ttttttatagggactaaaataactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagatccaaattttataggaataaaaaacatatttaaccct 11400483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Original strand, 14256489 - 14256561
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14256489 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagctttcaattttatagggaccaaaaacataattaacccttt 14256561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 17244540 - 17244624
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagt 97  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||    
T  17244540 tcaattcaaatatgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattactaaaagt 17244624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28476171 - 28476099
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatattt 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  28476171 taaaaaacctattaaaattatgtaaggactaaacttataagttcttaattttatagggaccaaaaacatattt 28476099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 938817 - 938723
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||| | |||||||||| | |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  938817 ttttttgtagggactaaaagaactattaaaattaaaaaagcactaaacttaaagggtcccaattttatagggatcaaaatcatatttaacccttt 938723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 5079830 - 5079920
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  5079830 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaaccc 5079920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 18503302 - 18503392
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18503302 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 18503392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22971868 - 22971778
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22971868 tttttgtaagaactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 22971778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 23816530 - 23816620
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23816530 tttttgtaagaactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 23816620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 288971 - 288888
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||    
T  288971 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaag-acacaattttatagggaccaaaaacatat 288888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 426
Target Start/End: Original strand, 3914766 - 3914826
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3914766 attaaaattaagtaaggactaaacttaaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatat 3914826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Original strand, 33518701 - 33518773
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  33518701 ctattaaaattaagtaatgactaaacttaaaagatcccaattttatagagactaaaaacatatttaactcttt 33518773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Original strand, 17246404 - 17246491
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  17246404 tttttgtaaggactaaagcaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 17246491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 289683 - 289765
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||    
T  289683 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaaaactaaacttaaaaggtcccaattttataaggacaaaaaacatat 289765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 433
Target Start/End: Original strand, 5974694 - 5974752
Alignment:
Q  375 aagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5974694 aagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatatttaaccc 5974752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8709747 - 8709689
Alignment:
Q  375 aagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8709747 aagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatatttaaccc 8709689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8231176 - 8231087
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8231176 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaataaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 8231087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15328674 - 15328641
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15328674 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 15328641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15364844 - 15364811
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15364844 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 15364811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 365 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 30660729 - 30660664
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30660729 tattaaaattaagcaaggactaaacttaaaaagtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 30660664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2958684 - 2958644
Alignment:
Q  358 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagtt 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2958684 aaaaaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaagtt 2958644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 433
Target Start/End: Original strand, 20898325 - 20898393
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20898325 tattaaaattaaggaaagactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 20898393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Original strand, 33744985 - 33745077
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||| ||| || | ||||| |||| ||  |||||||| ||||||||    
T  33744985 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaagactaaacttacaaggtcgcaattttgtagggacggaaaacataattaaccct 33745077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 844054 - 843983
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |  ||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  844054 ctattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtcgcacttttatatggactaaaaacatatttaaccctt 843983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Original strand, 15053930 - 15053993
Alignment:
Q  142 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  15053930 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 15053993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 5079000 - 5079054
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  5079000 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctttaagtttttaacaattttttg 5079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10685916 - 10685887
Alignment:
Q  407 tataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685916 tataggaaccaaaaacatatttaacccttt 10685887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 22734544 - 22734573
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22734544 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 22734573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28580383 - 28580354
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28580383 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 28580354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 431
Target Start/End: Original strand, 30394764 - 30394825
Alignment:
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30394764 aaattaagtatggactaaacttagaagttctcaattttattgggaccaaaaacatatttaac 30394825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 3913266 - 3913329
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 84  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3913266 aaatttgtttaatt-atgcttaaatttttaagattttgaacaattttttgcacaaatgttaagaa 3913329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30916937 - 30916905
Alignment:
Q  76 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30916937 tgttaagaatattactaaaagttactctgcaaa 30916905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 131)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Original strand, 38173902 - 38174319
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  38173902 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcgtgttaagaacattactaaaagttcctatacaaaaaat 38174001  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38174002 tgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaactttttctgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 38174101  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||       |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  38174102 tt-taaattttagtatatgaacctttcatagtgttctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaataatttaagagtttaaagataattaaataaactttgt 38174200  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38174201 tataacagggactaaaattagaagtaatttttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttatag 38174300  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38174301 gaaccaaaaacatatttaa 38174319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45420078 - 45419658
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45420078 tcaattcaaatttgttt--tttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 45419981  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||           
T  45419980 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatatttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaactcatttaatgtt-aaaaaa 45419882  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45419881 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 45419782  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||    
T  45419781 tgtaacagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaactcagaagttcccaattttatag 45419682  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  45419681 ggaccaaaaacatatttaaccctt 45419658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 53518079 - 53517658
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53518079 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 53517980  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  53517979 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagaatttgttaaatttatctttaacttttgtctttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaat 53517881  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||         |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53517880 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttatcataaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgt 53517781  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
      ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  53517780 cgtaacaaggactaaaattagaagtattttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaaataaggattaaacttaaaagttctcaattttatag 53517681  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  53517680 ggaccaaaaacataattaaccct 53517658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 29348275 - 29348692
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348275 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaact--tgagtttttgaacaattttttgcagaagtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 29348372  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||           
T  29348373 tgtcgcaaaatttgatttttacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttagttcgttttatgtt-aaaaaa 29348471  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29348472 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaatttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaatataattaaacaaactttgt 29348570  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||||||    
T  29348571 tgtaacagggactaaaattagaagtaattttcttttgcagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcgtaattttatag 29348670  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    | || || ||||||||||||||    
T  29348671 ggactaagaacatatttaaccc 29348692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 44809135 - 44808711
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  44809135 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactctggagtttttaaacaattttttgcacacgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaagt 44809036  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||           
T  44809035 tgtcgcaaaatttgatttttacgtcaaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttttaaaaattcatatttaattcattttatgtt-aaaaaa 44808937  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44808936 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacctgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattgaacaaactttg 44808837  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||||||    
T  44808836 ttgtaacatgaactaaaattagaagtaattttcttttgcatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcgtaattttata 44808737  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    || |  ||||||||||||||||||||    
T  44808736 gggattaaaaacatatttaacccttt 44808711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 40762895 - 40762476
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  40762895 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttgatagacgtgttaagaacattactaaaagctcctctacaaaatat 40762796  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||           
T  40762795 tatcgtaaaatttgatttctacgtcaagattttgttaatttcatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaa 40762697  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |        |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40762696 ttctagattttagtaattgaatctttcatagtgttctaaacttgtttaaaaaaaatcgttcaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 40762597  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  40762596 tgtaacagggattaaaattagaagtaatt-ttttttctagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattcccaattttataa 40762498  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    | || ||||| |||||||||||    
T  40762497 ggactaaaaatatatttaaccc 40762476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 27492313 - 27492735
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27492313 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattcttaggtttttgaacaattttttgcatacatgtttaaaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 27492412  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  27492413 tatcgcaaaatttgatttctacatccaaattttgttactttttatctttaacttttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-agaaa 27492511  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27492512 attctaaattttaataaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaatatcgttcaaaaatttgggagtttaaggataattaaacaaactttg 27492611  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | || | |||||||| |||||| | ||||||||    
T  27492612 ttttagcatggactaaaattataagtaaattttttttgtagggaataaaaaagctattaaaattaattgaggactaaacttagaagttctcaattttata 27492711  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    || | |||||||||||||||||||    
T  27492712 gggatcaaaaacatatttaaccct 27492735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 433
Target Start/End: Original strand, 11045412 - 11045823
Alignment:
Q  23 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatg---ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11045412 tttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaaca-ttctttgcacacgtcgtattaagaaaattgctaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgca 11045510  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       |||||||    
T  11045511 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatcttgaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatggt-aaaaaattctaaa 11045609  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgttttaacag 319  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||| | ||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||    
T  11045610 ttttagtaaatgaacctttctcactattctaaacttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaacttgattgtaatag 11045709  T
Q  320 ggcctaaaattagaagta-attcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaa 418  Q
    || |||||||||||||||  || ||||||||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | |||    
T  11045710 ggactaaaattagaagtatttttttttttgtagggacttaaaaacttattaaaa-taagtaagaactaaacttagaagttcccaattttatagggatcaa 11045808  T
Q  419 aaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||    
T  11045809 aaacatatttaaccc 11045823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23883678 - 23883378
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23883678 aaatttgtttaatttatgcttaaactctggagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttaca 23883579  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||    
T  23883578 aaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaagttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattgtaaa 23883480  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||        | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  23883479 tattagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaattgttctaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgttataaca 23883380  T
Q  319 gg 320  Q
    ||    
T  23883379 gg 23883378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 23917328 - 23917739
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23917328 tcaattcaagtttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaat 23917427  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||||||           
T  23917428 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattgtgttaattttatttttaacttttgtcgttttaagaaattcctat---attcgtttcatgttaaaaa-- 23917522  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
        |||   |||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23917523 ----aaaaaatagttaatgaacctttcatagtattctaaatttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 23917618  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatgga-ttaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  || ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  23917619 tgtaacagggactaaaattagatgt--tttttttttgtggggactaaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattctcaattttata 23917716  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  23917717 gggaccaaaaaaatatttaaccc 23917739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 37178941 - 37179300
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  37178941 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaaattttttaacaattttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 37179040  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  37179041 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacatttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttgatgttaaaaaaa 37179140  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37179141 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaattttaagaatttaaggataattaaacaaactttgt 37179240  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| |||   |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  37179241 tttagcagtaactaaaactagaattaatt-ttttttgtagggactgaaaaacctactaaaa 37179300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Original strand, 25250016 - 25250299
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  25250016 tcaattcaaatttgtttaatttatatttaaactcttgagtttttgaataattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaat 25250115  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  25250116 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgt--attttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 25250212  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25250213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataatt 25250299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 434
Target Start/End: Original strand, 45406698 - 45407081
Alignment:
Q  36 tgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacg 135  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||              ||||||| |||     
T  45406698 tgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagtttctccgcaaaat-------------ttgatttttaca 45406784  T
Q  136 tccagattttgttaatttta-tctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaac 234  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  45406785 tccagattttgttacttttaatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgattcatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaac 45406883  T
Q  235 ctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaa 334  Q
    ||||||||||||||||| | | |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || || ||||||||| ||    
T  45406884 ctttcatagtgttctaaacttttcttataaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaatttgttttagcatggactaaaattataa 45406983  T
Q  335 gtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  45406984 gtaatt-ttttttgtagggagtaaaaaagctattaaaattacgtaaggactaaacttagaagtttcc-aatttatagggacaaaaaacatatttaaccct 45407081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Original strand, 11293800 - 11294208
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaaca---tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||| |||          |||||||    
T  11293800 tcaattcaaatctgtttaatctatgcttaaactcttgaatttttgaacaattttttgcagacgacgtgttaagaacattccta----------tgcaaaa 11293889  T
Q  110 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatcttt-aacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnn 208  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  11293890 aattgttgcaaaattttatttctaagtccagattttgtttattttatcttttaacttttaccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatcttaaa 11293989  T
Q  209 nnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaact 307  Q
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11293990 aaa-ttctaaattttagtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtgtaaaagaagtcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 11294088  T
Q  308 ttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttt 407  Q
    ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||    
T  11294089 ttgttgtactagggactaaaattagaaataattttttttt--agggagtaaaaaacctattaaaattaagtaaagattaaacttagaagttctcaatttt 11294186  T
Q  408 ataggaaccaaaaacatattta 429  Q
    ||||  |||||||||| |||||    
T  11294187 atagagaccaaaaacaaattta 11294208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 433
Target Start/End: Original strand, 46295058 - 46295474
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||  | |||    
T  46295058 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaaatttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccgaaaaaaata-tcgca 46295156  T
Q  120 aaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaactttt-gttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||       || |    
T  46295157 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaactttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttaatgttaaaaaa-ttat 46295255  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtttta 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  46295256 agattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttatttta 46295355  T
Q  316 acagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaa 414  Q
      |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||| |    
T  46295356 ggagggactaaaattataagtaaatttttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggattaaacttagaaggtcacaattttataggga 46295455  T
Q  415 ccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  46295456 ccaaaaatatatttaaccc 46295474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 21749566 - 21749803
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  21749566 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttacgaacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaat 21749665  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||   |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           
T  21749666 tgtcttaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatttttaattcgtttcatatt-aaaaaa 21749764  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21749765 ttctaaattttagtaaatgaacctttcacagtattctaa 21749803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Original strand, 32146996 - 32147271
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32146996 tcaattcaaatttgtctaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 32147095  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  32147096 tatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactcttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 32147194  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagttt 289  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  32147195 ttctaaattttagtaattgaacatttcatagtgttctaaacttgtctccaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttt 32147271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45235641 - 45235278
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa- 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||     
T  45235641 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttatagacgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 45235542  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatcttt-aacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
    || | |||||| || ||||||| ||||||||||  ||| || ||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  45235541 ttatcgcaaaattttatttatatgtccagatttaattacttgtatctttaaaattttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaa 45235443  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||        |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45235442 tattctaaattttagtaattgaacctttcaaagtgttctaaacttgtctcaataaaaccgttaaaaaatttaagagtttatggataattaaacaaacttt 45235343  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  45235342 gttttagcatggactaaatttagaagtaatttttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 45235278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Original strand, 19669699 - 19669987
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttga-gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  19669699 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactctttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaatgttcctccgcaaaaag 19669798  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||          
T  19669799 ttattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcgtatttaattcgtttcatgttaaaaaa 19669898  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 301  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||        ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19669899 attctaaattttagtaattgaacctttgatagtgttctaaacttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttcaagaataattaa 19669987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39562838 - 39562461
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  39562838 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 39562740  T
Q  120 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  39562739 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttagttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 39562641  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||     
T  39562640 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaattgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 39562541  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaa----ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactta 392  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39562540 cagggactaaaattataagtaaattttttttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaactta 39562461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 32943000 - 32943348
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32943000 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 32943099  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| |||  |||||| |||             |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||           
T  32943100 tatcgcaaaatttgatttatatgtcttgattttatta-------------cttttgttgtttcaaaaa-ttcatatttaattcttttaatattaaaaaa- 32943184  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32943185 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttcaaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 32943284  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32943285 tttagtagggactaaaattagaagtaatattttttttttgtatggactaaaaaacctactaaaa 32943348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 50615366 - 50615053
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||       
T  50615366 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttccgccgcaaaat-- 50615269  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  50615268 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 50615181  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50615180 ttctaaatttttttaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggaaaattaaacaaactttgt 50615081  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaat 339  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||    
T  50615080 tttagtagggactaaaattataagtaat 50615053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Original strand, 19601549 - 19601968
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19601549 tcaattcaaatttgtttaatt-atgtttaaactcttatgttttttaacattcttttgcaaacatgttaagaacattactaaaagttcctccacaaaaaat 19601647  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| || |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||          
T  19601648 tatcgcaaaatttaatttctacatccagatttttgttacttttatcttgaacttttgtcattttaaaacattcatatttaattaatttcgtgtt-aaaaa 19601746  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttc--atagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataa-ttaacaaactt 308  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||        ||| | |||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19601747 attctaaattttagcaaatgaacctttcatatagtgttctaaacgtgcctaaaaaagatcgatgaaaattttaagagtttaagtataatttaagaaactt 19601846  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttta 408  Q
    ||||| | ||| | ||||||||| |||||| | ||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||| || || || ||||||    
T  19601847 tgtttcagcagtgactaaaattataagtaaatttttgttgtagggactaaaaaagctattaaatttaagtgaagattaaacttagaaatttccaatttta 19601946  T
Q  409 taggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  19601947 tatggaccaaaaacatatttaa 19601968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 434
Target Start/End: Original strand, 34995564 - 34995951
Alignment:
Q  46 cttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || |||| | || ||||||||||||| |||  | |||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  34995564 cttgagtttttgaacaattttttatagacgtgttcaaaacattactaaaagttgctccacgaaaaattagttcaaaaattgatttctacgtcca-agctt 34995662  T
Q  146 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtg 245  Q
    || | ||||||||| || ||||||  ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34995663 gtgacttttatcttgaaattttgtcatttaaaaaaaatcatatttaattcatctcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttataatg 34995761  T
Q  246 ttctaaccgtgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattctt 343  Q
    ||||||  |||| ||        |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||    
T  34995762 ttctaaaagtgtttccaaaaaaatcgttctaaaatttaatagtttaaggataattaaacaaatttagttttagcagggactaaaattatatgtaatt-tt 34995860  T
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34995861 ttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagatgttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 34995951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 53397095 - 53397334
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  53397095 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtcgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaatt 53397194  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg-ttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||          
T  53397195 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttctatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttttaaaaa 53397294  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53397295 attctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaa 53397334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 117729 - 117405
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  117729 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttttagatgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 117632  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||           
T  117631 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatttttaattcgtttcatgttaaaaaaa 117543  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  117542 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 117444  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgta 350  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  117443 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttgta 117405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 54269138 - 54268726
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  54269138 aattcaaatttggttaatt-atgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatgcgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaatta 54269040  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
    |  ||||| ||||||| || |||||  |||| |||  ||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||       |    
T  54269039 tctcaaaatttgatttctaagtccaattttttgttgcttttatcttgattttttgtcgtttaaaaaaatttatatttaatttatttcatgttaaaaaa-t 54268941  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtt 312  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | | |||||||| | |            |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54268940 tctaaattttaggaaatgatcttttgaaa-tgttctaaacat--------aaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgtt 54268850  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    ||| ||||| ||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||    
T  54268849 ttagcagggactaaaattacatgtaaatattttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaaaactaaacttataaattttcaattttatagg 54268750  T
Q  413 aaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  54268749 gaccaaaaacatatttaaaccttt 54268726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44557771 - 44557540
Alignment:
Q  116 tgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttc 215  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||        |     
T  44557771 tgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaat- 44557673  T
Q  216 taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtttt 314  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44557672 taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagattaaggataattaaacaaactttgtttt 44557573  T
Q  315 aacagggcctaaaattagaagtaattctttttt 347  Q
    |  |||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  44557572 agtagggacgaaaattataagtaattttttttt 44557540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Original strand, 28685303 - 28685487
Alignment:
Q  10 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  28685303 tcatcaatttaaatgtgattaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattatttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgtaaaa 28685402  T
Q  110 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 199  Q
    |||     ||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28685403 aat-----caaaatttaatttatatgtccaaattttattaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 28685487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 53439324 - 53439652
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  53439324 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttacgttttttaacaattttttttcgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaattt 53439423  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |             ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  53439424 t-------------atttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 53439509  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgtt 312  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||       ||||||||||||                |||||||||||||||||    
T  53439510 ttctaaattt-agtaattgaacctttcatagtgttctaaacttttctcaaaaaaatcgttcaaaaat----------------aattaacaaactttgtt 53439592  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  53439593 ttaacagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 53439652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 430
Target Start/End: Original strand, 9018125 - 9018438
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||       |||||    
T  9018125 caaaatttgatttttacttccatatttttgttattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatattgaatttatttcatgttaaaaaa-ttcta 9018223  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtttta 315  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |  || |         |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  9018224 aatttttgtaaatgaacctttcacagtgttataaactcgtgtaaaaaaaaatcgcacaaaaatttaagagtttaagtataattaaacaaatattgtttta 9018323  T
Q  316 acagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  | |||||||| | ||    
T  9018324 gcagagactaaaattataagtattttttttttgtaaggactaaaaaatgtattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattatccattttataaggac 9018423  T
Q  416 caaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||||    
T  9018424 caaaaacatatttaa 9018438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23921220 - 23920953
Alignment:
Q  161 aacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | | |||     
T  23921220 aacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattc-tttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagaaaatgagcctttcatagtgttataaacttatct- 23921124  T
Q  261 nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaa 359  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||    
T  23921123 aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgctataacagagactaaaattaaaaataatt-ttttttgtagggactaaa 23921025  T
Q  360 aaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||  ||||| |||||||||| || |||||||| || ||    |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23921024 aaatttattagaattaagtaataactaaacttagaaattttgaattttatatgaatcaaaaacatatttaac 23920953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 434
Target Start/End: Original strand, 53377430 - 53377687
Alignment:
Q  177 aaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnn-tcgttcaa 275  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||         |||||||     
T  53377430 aaaaattcatatttaattcgttccatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcagagtgttctaaatttgtctaaaaaaaaatcgttcat 53377528  T
Q  276 aaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatt 374  Q
    ||||  || ||||||| |||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  53377529 aaatccaaaagtttaatgataataaaacaaacttt-ttttagcaaggattaaaattataagtaattattttttatagggactaaaaaaactattaaaatt 53377627  T
Q  375 aagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  53377628 aagtaaggactaaacttagaagttcctaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 53377687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 251
Target Start/End: Original strand, 25232695 - 25232894
Alignment:
Q  53 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaat 151  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||| |  ||||| || |||||| |||||||| |||||||| |    
T  25232695 ttttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcatctacaaaaaattatctcaaaattttatttatgcgtccagatttttgttact 25232794  T
Q  152 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  25232795 tttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaatttctaaattttagtaaacgaaccttttctaatgttctaa 25232894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Original strand, 44555919 - 44556098
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  44555919 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaatta 44556017  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    |  ||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  44556018 tctcaaaattttatttctgcgtccagaattttgttaattttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 44556098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 52701168 - 52701398
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  52701168 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttacacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 52701266  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| || |||||| |||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||    
T  52701267 aaattttatttatgcgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcctttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgct-aaataattctaa 52701365  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  52701366 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaa 52701398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 167
Target Start/End: Original strand, 45387449 - 45387566
Alignment:
Q  50 agtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta 149  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  45387449 agttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctacgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttatta 45387548  T
Q  150 attttatctttaactttt 167  Q
     |||||||||| ||||||    
T  45387549 cttttatcttttactttt 45387566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15771936 - 15771776
Alignment:
Q  276 aaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatt 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| | |||| | ||||||||| ||  ||||| | |||||||||||    
T  15771936 aaatataagagtttaaggataattaaacaaactttattttagcagggactagaattacatgtaaatattttttgtagggtctaaaatagctattaaaatt 15771837  T
Q  375 aagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || ||||||| |   |||| ||||||||||||||||    
T  15771836 aagtaaggactaaacttaaaagtttccaattttatggaggccaataacatatttaaccctt 15771776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15772157 - 15772002
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15772157 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaaatcttaagtttttaaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaatta 15772059  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgtt 170  Q
    |  ||||| ||||||| |||||| | | |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15772058 tctcaaaatttgatttctacgtcgaaatttttgtttcttttatcttgaacttttgtt 15772002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Original strand, 33475471 - 33475650
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  33475471 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 33475569  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    |  ||||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  33475570 tcacaaaattttatttctacgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 33475650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33476477 - 33476247
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  33476477 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaggtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 33476379  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| || ||| || |||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  33476378 aaattttattcatgcgtccagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaatttatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 33476280  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  33476279 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaa 33476247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3173802 - 3173707
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 110  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  3173802 aattcaaatttgtttaatttatgattaaattcttgaatttttgaacaattttttgcagacgcgttaagaacattactataagtttctctgcaaaaa 3173707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 435
Target Start/End: Original strand, 53518116 - 53518199
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  53518116 ggattaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 53518199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26268826 - 26268683
Alignment:
Q  51 gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgtta 149  Q
    ||||| ||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||| |||| ||| | |||| |||    
T  26268826 gttttcgaacaattttttgtagacgtattaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaattagctcaaaatttgatttctacgcccatatttttatta 26268727  T
Q  150 attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 195  Q
     ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26268726 cttttatcttgaacttttgtcg--ttaaaaaattcatatttaattc 26268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38173853 - 38173783
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38173853 ctattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagtttcctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 38173783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 433
Target Start/End: Original strand, 14525111 - 14525208
Alignment:
Q  336 taattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  14525111 taatttttttatgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattcccaaatttatagggacgaaaaacatatttaaccc 14525208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29348226 - 29348157
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348226 tattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 29348157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41928126 - 41927953
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt-aagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  |    
T  41928126 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaagaacattacgaaaagttcatatgcaaaaaattatatc 41928028  T
Q  119 aaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    |||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41928027 aaaattttatttctgcgtccaaatttttgttacttttattttgaacttttgt--ctttaaaaaattcatatttaatt 41927953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34995512 - 34995420
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34995512 ttttttatagggactagaaaacctattaaaattaagtaaggactaatcttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 34995420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 125
Target Start/End: Original strand, 53377329 - 53377436
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt--aagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttg 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| |||| |||||||||||  || ||||||| | |    
T  53377329 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattgtttgcagacgtgttaaaagaacattaataaaagttccttcgcgaaaaattatcg 53377428  T
Q  118 caaaaatt 125  Q
    ||||||||    
T  53377429 caaaaatt 53377436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11045353 - 11045282
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11045353 ctattcaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtcccaattttatagggacctaaaacatatttaaccctt 11045282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Original strand, 44809159 - 44809250
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44809159 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 44809250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23917302 - 23917212
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23917302 ttttttgtaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagagaccaaaaacatatttaacc 23917212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 37481351 - 37481253
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttga-gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37481351 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaatgttttttaacaattttttatagatgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 37481253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44287933 - 44287643
Alignment:
Q  142 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcat 241  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  44287933 ttttgttacttttatcttaaaccttcgtcgtttaaaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagcaaatgaaccttccgt 44287835  T
Q  242 agtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaatt 340  Q
      | ||||||   || |||       ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||||   ||||  | |||| | | ||||||    
T  44287834 gatattctaaaattgactcaaaaaaatcgttcaaaaatt-atgaatttaaggataattaaacaaacttt-ttttgttagggattgaaatcacatgtaatt 44287737  T
Q  341 cttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
     ||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||| || || |||||| || |||  |||||||||||||||||    
T  44287736 tttttttgtagggacttataaagcaattaaaattaagtaaggattgaacttaaaaatttccaattttagagaaactcaaaacatatttaaccct 44287643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 41928160 - 41928244
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41928160 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 41928244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 434
Target Start/End: Original strand, 3173824 - 3173891
Alignment:
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3173824 ttaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtcccaattgtatagggaccaaagacatatttaaccct 3173891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 31991074 - 31991259
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||||  | |||||||| || |  ||    
T  31991074 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaaaacattacgaaaagtttatttgcaaaaacttatctca 31991172  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  31991173 aaattttatttctgcgtccaaatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcttatttaatttatttcatgtt 31991259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 430
Target Start/End: Original strand, 33226763 - 33226829
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33226763 ctattaaaattaagtaagaactaaacttagaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 33226829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8576191 - 8575974
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatatt-actaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 118  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |  |||||||| | ||||||||||| |  |    
T  8576191 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatttaggaaaagttcatatgcaaaaaattatctc 8576093  T
Q  119 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    |||| || |||| |  ||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||       ||||    
T  8576092 aaaattttatttctgtgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattct 8575994  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacct 236  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  8575993 aaattttagtaaacgaacct 8575974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 33225746 - 33225673
Alignment:
Q  357 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33225746 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagatctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 33225673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Original strand, 45420127 - 45420195
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45420127 ctattaaaattaagtaagaac-aaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatattgaaccc 45420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 46295024 - 46294931
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| || | ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||    
T  46295024 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaagatcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaaccctt 46294931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 116924 - 116980
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  116924 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 116980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 8576225 - 8576309
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||    
T  8576225 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggagcaaaaacatat 8576309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Original strand, 39562872 - 39562964
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || | ||||| | || ||| |||||||| ||||||||    
T  39562872 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggattaaacttacaaggtcacaattttgttgggaccgaaaacataattaaccct 39562964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 44555364 - 44555420
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44555364 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 44555420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 50614546 - 50614602
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50614546 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 50614602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 52701134 - 52701050
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  52701134 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 52701050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 52701982 - 52702066
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52701982 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaactaaaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatat 52702066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 433
Target Start/End: Original strand, 25250368 - 25250435
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||| ||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25250368 attaaagttaagtaaggactaaagttgaaagatccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 25250435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 53439296 - 53439209
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53439296 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagtactaaacttataatgtctcaattttataggaactaaaaacatatttaa 53439209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 116896 - 116806
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  116896 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctccattttatagggactaaaaacatatttaaccc 116806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 117757 - 117847
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  117757 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcactaaacttaaaatgcctcaattttatagaaactaaaaacatatttaaccc 117847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 356 - 430
Target Start/End: Original strand, 28260544 - 28260618
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||  |||||||| | |||||||||||||||||    
T  28260544 taaaaaaactattaaaattaagtaagaattatatttaaaatatccaaattttataaggaccaaaaacatatttaa 28260618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31991018 - 31990956
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  31991018 ctattaaaattaagtaaagattaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 31990956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 205
Target Start/End: Original strand, 41927360 - 41927450
Alignment:
Q  116 tgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41927360 tgcaaaaatttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 41927450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 44557892 - 44557982
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44557892 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 44557982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 45234689 - 45234599
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45234689 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 45234599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 50615394 - 50615484
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50615394 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 50615484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 54185639 - 54185729
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54185639 tttttgtaatgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 54185729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 45235669 - 45235758
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45235669 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 45235758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8575277 - 8575193
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||||| || ||||||||||    
T  8575277 ttttttatttggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagattccaattttatagggacaaaaaacatat 8575193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 25353279 - 25353363
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||| || ||||||||||    
T  25353279 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaagaactatacttaaaaggttccaattttatagggactaaaaacatat 25353363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 426
Target Start/End: Original strand, 31991994 - 31992054
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31991994 attaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttataggaataaaaaacatat 31992054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 32147923 - 32147975
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32147923 tttttgtaaggaataaaacaactattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 32147975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33475443 - 33475359
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||||| || ||||||||||    
T  33475443 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggacaaaaaacatat 33475359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21749513 - 21749446
Alignment:
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  21749513 ttaaaattaagtaaggactgaacttaaaaggtcccaattttatagggaccataaacatatttgaccct 21749446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 25249964 - 25249897
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25249964 attaaaattaattaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggacaaaaaacatatttaaccc 25249897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 375
Target Start/End: Original strand, 32147270 - 32147340
Alignment:
Q  307 tttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatta 375  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  32147270 tttgttttagcagggactaaaattagaagtaatttttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaatta 32147340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44555336 - 44555245
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttcc-ctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| | || | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44555336 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 44555245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 426
Target Start/End: Original strand, 44556953 - 44557008
Alignment:
Q  371 aattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44556953 aattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 44557008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 53397067 - 53396980
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||  || | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  53397067 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttataatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 53396980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19601522 - 19601432
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || | |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  19601522 ttttttataaggactaaaatatctattaaaattaagtaatgattaaacttagaaggtctcaattttatagggatcagaaacatatttaacc 19601432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 434
Target Start/End: Original strand, 20078100 - 20078266
Alignment:
Q  270 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttt-tgtatggattaaaaaacctat 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| |  || ||||||||  | |||||| | ||| |||| ||| || || | ||||    
T  20078100 gttcaaaaattgaagagtttaagaataattaaacaaagttacttttagcttggactaaaattgcatgtaattttctttctgtagggactacaatagctat 20078199  T
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    || |  |||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20078200 tacatataagtaaggattaaacttagaaattctcaattttataggaaacaaaaatatatttaaccct 20078266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44555888 - 44555806
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  44555888 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttgaaagatcccaattttatagagaccaaaaacatat 44555806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 1430226 - 1430315
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  1430226 tttttgaaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 1430315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Original strand, 40478173 - 40478206
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40478173 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 40478206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 372
Target Start/End: Original strand, 53397363 - 53397440
Alignment:
Q  296 aattaacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  53397363 aattaacaaactctgttttagaagggactaaaattagaagtaattttttttttgcagggactaaaaaacctactaaaa 53397440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 430
Target Start/End: Original strand, 23883683 - 23883743
Alignment:
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23883683 aaattaagtaaggactaaacttgaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaa 23883743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Original strand, 25233191 - 25233267
Alignment:
Q  350 atggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  | |||||||||  |||||||||||||    
T  25233191 atggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttacaattttatagagaccaaaaacatat 25233267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 37481379 - 37481467
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| | | ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  37481379 tttttgtaagcactaaaacaactattaaaattaaataaggattaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 37481467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 41877872 - 41877840
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41877872 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 41877840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 436
Target Start/End: Original strand, 8311373 - 8311443
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8311373 tattaaaattaagtaagtattaat-ttagaagttttcaattttataaaaaccaaaaacatatttaacccttt 8311443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27492265 - 27492194
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||   |  |||||||||||||||||||    
T  27492265 ctattaaaattaaataaaaactaaacttaaaagatcccaattttatatagattaaaaacatatttaaccctt 27492194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 34661500 - 34661469
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34661500 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 34661469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 395
Target Start/End: Original strand, 41786404 - 41786455
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41786404 ttttgtaaggattaaaacaactattaaaattaagtaaagattaaacttaaaa 41786455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 43081163 - 43081132
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081163 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 43081132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 44288028 - 44287969
Alignment:
Q  43 actcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc 102  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44288028 actcttaagtttttgaacaacttttgacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctc 44287969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 434
Target Start/End: Original strand, 44288612 - 44288687
Alignment:
Q  359 aaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |   |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44288612 aaaaactattaaaattaaataagaactaaacgtatacagtcccaaatttataggaaccaaaaccatatttaaccct 44288687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 521
Target Start/End: Original strand, 45295627 - 45295658
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45295627 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 45295658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 52701947 - 52701897
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 71  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52701947 aaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagattttgaacaattttttgca 52701897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Original strand, 55006177 - 55006240
Alignment:
Q  142 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  55006177 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 55006240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3173710 - 3173645
Alignment:
Q  369 aaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttt-ataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  3173710 aaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttaatagg-atcaaaaacatatttaaccct 3173645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27868046 - 27867960
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||  || | |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  27868046 ttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaatgtctcaattttacagggactaaaaacatatttaa 27867960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Original strand, 31184988 - 31185018
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31184988 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 31185018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32942960 - 32942870
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||||   | | ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  32942960 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactcaaaatgcctcaattatatagggacaaaaaacatatttaaccc 32942870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 45387411 - 45387321
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  45387411 tttttgtaaagactaaaacatctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatattcaaccc 45387321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 50614518 - 50614428
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||||   | | |||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  50614518 tttttgtaaggattaaaacaactattaaaattaaataaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagagactaaaaatatatttaaccc 50614428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Original strand, 53520018 - 53520120
Alignment:
Q  93 aaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 191  Q
    |||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||    
T  53520018 aaagtttctttgcaaaaaattatgtcaaaaattgatttttaggtccaaagttttattattttaatctttaattttttgtgtttagaaaaattcatattta 53520117  T
Q  192 att 194  Q
    |||    
T  53520118 att 53520120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Original strand, 54239851 - 54239881
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54239851 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 54239881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32146953 - 32146884
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32146953 ctattaaaattaagtaatgactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 32146884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53658086 - 53658029
Alignment:
Q  141 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtt 198  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  53658086 attttgttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcgtt 53658029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13814020 - 13813956
Alignment:
Q  369 aaaattaagtaagaattaaacttaaaag-ttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||    
T  13814020 aaaattaagtaagaattaaacttagaagcctccatattgtatatggaccaaaaacacatttaacc 13813956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 32943933 - 32944021
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  32943933 tttttataaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 32944021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 37179891 - 37179943
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37179891 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa 37179943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 409
Target Start/End: Original strand, 40762945 - 40762989
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  40762945 tattaaaatttagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttat 40762989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 44557822 - 44557774
Alignment:
Q  52 tttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcc 100  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  44557822 ttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcc 44557774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Original strand, 52453979 - 52454011
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52453979 tgagcaatgatatttgtacatccatttcatgac 52454011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 54239406 - 54239378
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54239406 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 54239378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Original strand, 54269189 - 54269256
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||   | | |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  54269189 ctattaaaattaagtaagaactaa-cttaaaaaaactcaattttatagggatcaaaaacatatttaacc 54269256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6205 - 5789
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  6205 aaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttactatgcaaaaaattgtcgca 6106  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||    
T  6105 aaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgttaaaaaa-ttctaaa 6007  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||       ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  6006 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttccaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaaatcaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaata 5907  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaa 418  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  5906 gggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaa 5807  T
Q  419 aaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5806 aaacatatttaacccttt 5789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Original strand, 6265 - 6332
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  6265 attaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggcccctattttgtagg-gccaaaaacatatttaaccct 6332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 136)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 10463737 - 10464154
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10463737 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 10463836  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  10463837 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 10463935  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  10463936 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttat 10464035  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  10464036 tgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgta-agactaaaatttttattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatgg 10464134  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  10464135 ggaccaaaaacatatttaac 10464154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 8313209 - 8313628
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  8313209 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacatacgtgttaagaacattattaaaagttcttatgcaaaaaat 8313308  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8313309 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatttttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt--aaaaa 8313406  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8313407 ttctgaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttct 8313506  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8313507 tataatagggactaaaattagaagtaattcttatttgtagggattaaaaaatcaattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatag 8313606  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  8313607 ggaccaaaaacatatttaaccc 8313628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 37103032 - 37103450
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37103032 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgaatttttgaataattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 37103131  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | |  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||           
T  37103132 tatctcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatttttaattcgtttcatgtt-agaaaa 37103230  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37103231 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactttgt 37103330  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  37103331 tgtaacaaggactaaaattagaagtagtt-ttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagtttccaattttatag 37103429  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  37103430 gaatcaaaaacatatttaacc 37103450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8404690 - 8404267
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  8404690 tcaattcaagtttgtttaatttatgcttaaactcttgaatttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaaattcatctgcaaaaagt 8404591  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8404590 tgtcgcaaaatttgatttttaagttcaaattttattaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 8404491  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8404490 atctaaattttggtaaatgaaccttttttagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 8404391  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||    
T  8404390 tgtaacagggactaaaattagaagtaatttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcctaattttatag 8404291  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  8404290 ggatcaaaaacatatttaaccctt 8404267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 8336843 - 8337264
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8336843 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttactgacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 8336942  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8336943 tgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaacttttgcagttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8337041  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8337042 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 8337140  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  8337141 tgtaatagggactaaaattaaaagtaattcttttttgtaaggactaaacaatttattaaaattaaataaagattaaacttaaaaagtccctatcttatag 8337240  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    | || |||||| ||||||| ||||    
T  8337241 ggactaaaaacctatttaatcctt 8337264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 34785544 - 34785122
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34785544 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgtacaatttttt-cagacgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 34785446  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||           
T  34785445 tgtcgcaaaatttgatttttacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaatttatatttaattcgttttatgttaaaaaaa 34785346  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||        ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34785345 tt-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtctaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactttgt 34785247  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||   |||||||||    
T  34785246 tgtaacagggactaaaattagaagtaattttcttttgcaggaactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagtagttcgtaattttatag 34785147  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    | || || |||||||||||||||||    
T  34785146 ggactaagaacatatttaacccttt 34785122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 434
Target Start/End: Original strand, 17742355 - 17742748
Alignment:
Q  43 actcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagat 142  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  17742355 actcttgagtttttaaacgattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaatattgtcgcaaaatttgatttctacgtccagat 17742454  T
Q  143 tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  17742455 tttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaat-ctaagttttggtaaatgaacctttcat 17742553  T
Q  242 agtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaatt 340  Q
    |||||||||| | | |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17742554 agtgttctaaacttatcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacggggactaaaattagaagtaatt 17742653  T
Q  341 ctttttt-gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
     |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17742654 ttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaagactaaacttagaagttcccaattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 17742748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 427
Target Start/End: Original strand, 40158265 - 40158678
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||     
T  40158265 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcatacgtgttaagaacattacaaaaagttcctctacaaaaaaa 40158364  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  40158365 tttcgcaaaatttgatatctacgtccataatttgttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 40158463  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  40158464 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatag-gttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttct 40158562  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
      ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  40158563 cgtaacaaggactaaaataagaagtaatttttttttgtagggagtaaaaaacctattaaaattaactaaggactaaacttagaagttcccaattttatag 40158662  T
Q  412 gaaccaaaaacatatt 427  Q
    | ||||||||||||||    
T  40158663 ggaccaaaaacatatt 40158678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1683458 - 1683042
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1683458 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttggataattttttgcagacatgttaacaacattactaaaagctcctatgcaaaaaattg 1683359  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 214  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  1683358 tcacaaaatttgatttatacgtccatattttattacttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaatt 1683260  T
Q  215 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttt 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||        ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  1683259 ctaaattttagtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtcttaaagaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaactttattt 1683160  T
Q  314 taacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag- 411  Q
    ||  |||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||     
T  1683159 tagtagggactaaaattagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaactaaataaggactaaacttagtagttcccaattttataga 1683060  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  1683059 gaa--aaaaacatatttaac 1683042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 621914 - 621500
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  621914 aaatttctttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttggcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgca 621815  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||    
T  621814 aaatgtgatttctacatccagattttgttaattttatctttaagttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattgtaaa 621716  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  621715 ttctagtaaatgaaccttttatagtgttctaaatctgtctcataaaaatcgttctaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaata 621616  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaa 418  Q
    | | |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||| | |||||||  |||||||| |||||||||| |  ||    
T  621615 gagactaaaattagaagtaact-ttttttgtagggactaaaaaatttattaaaattaattaaggactaaacttggaagttcccaattttatagggataaa 621517  T
Q  419 aaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||    
T  621516 aaacatatttaaccctt 621500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 4462756 - 4463180
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  4462756 tcaattcaaatttgtttcatttatgctttaactcttgagtttttgaacaattatttgcagacgtgttaagaacattattaatagtccctctacaaaaaat 4462855  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  4462856 tgttgcaaaatttgatttctacatcctgattttgttaattttatctttaacttttgccgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aacaaa 4462954  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| | ||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4462955 ttctaaattttagtcaatgaatctttcatagtactctaaacttgtctcgaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 4463054  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgt---atggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttta 408  Q
    | ||  |||| |||||||||||||| ||| |||||| |   | ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  4463055 tgtacgagggactaaaattagaagtgatttttttttttgtaagggactgaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaatttta 4463154  T
Q  409 taggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||| || ||||||||||||||||||    
T  4463155 tagggactaaaaacatatttaaccct 4463180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 391
Target Start/End: Original strand, 27307819 - 27308197
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||| |||||| || ||||||||||    
T  27307819 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaaaaacattactgaaagtttctatgcaaaaaat 27307918  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  27307919 tgtcgcaaaatttgatttctacgtcaagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 27308017  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27308018 ttctaaattgtggtaaatgaatctttcatagttttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 27308117  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactt 391  Q
    | ||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27308118 tgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttataggaactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaactt 27308197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Original strand, 27335630 - 27336045
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27335630 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttttgcatatgtgttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaat 27335729  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  27335730 tgtcgcaaaatttgatttttacgcccatattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 27335829  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||        | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27335830 -tataaattttggtaaatgaacctttcataatgttttaaacttgtcttaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactttgt 27335928  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| | | ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||||     
T  27335929 tgtaacaggaactaaaattaaaagtaat--ttttttgtaagaactaaaatacctgttaaaattaaataaggattaaacttagaagttctcaattttataa 27336026  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    | |  ||||||||||||||    
T  27336027 gcataaaaaacatatttaa 27336045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Original strand, 4426022 - 4426439
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  4426022 tcaattcaattttgtttaatttatgtttaaacttctgagtttttgaataattttttacatacgtcttaagaacattactaaaagttcctatgcgcaaaat 4426121  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  4426122 tgttgcaaaatttaatttttacgtctagatttagttaaatttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 4426220  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4426221 ttctaaattttagtaaatgaatatttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 4426320  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  4426321 tgtaataaggactaaaattaaaagtatttcttttttgtagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagatctctattttgtag 4426420  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  4426421 gaatcaaaaacatatttaa 4426439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 2003952 - 2004371
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2003952 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaactttttgcgtacgtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 2004051  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  2004052 tgtcgcaaaatttgatttttatgtccagattttgttaactttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-taacaa 2004150  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||       |||        | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2004151 ttctaaattgtagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcaaataaatcg--------tataagagtttaaggataattaaacaaactttgt 2004242  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttt---tgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaa---agttccctatt 405  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||| |||||   |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||| |||    
T  2004243 tgtagcagggactaaaattagacgtaattttttttttgtgtagggactaaaacacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaattagttcccaatt 2004342  T
Q  406 ttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2004343 ttatagggaccaaaaacatatttatccct 2004371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 42877905 - 42877487
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42877905 tcaattcaaatttgtttaattcatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttt-gtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 42877807  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           
T  42877806 tgtcgcaaaattttatttctacgtccagattttgttaattttatctttatcttttgtcgtttt-aaaaattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaaa 42877708  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| | |||||        || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42877707 at-taaattttggtaaatgaacctttcatggcattctaaacttgtcttaaaaatatccttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 42877609  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||  || || || ||||||| |    
T  42877608 tgtaacagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactaaaaaatctattaaaattaagtaatgactaaactt--aattttccaattttattg 42877512  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  42877511 ggaccaaaaacatatttaacccttt 42877487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24637234 - 24636815
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24637234 tcaattcaaatttgattaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 24637135  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  24637134 tatcgcaaaatttgatttctacttccagattttattacttttatctttaagttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 24637036  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24637035 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 24636936  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||||| |  ||||||||  ||    |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||    
T  24636935 ttttaggagggactaatattagaagtaaatgatttttgtaacgacggcaaaa-ctattaaaattaagtaaggatcaaacttagaagtttccaattttata 24636837  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
     | ||| |||||||| |||||||    
T  24636836 aggacc-aaaacataattaaccc 24636815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41193272 - 41192845
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaa-ttttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41193272 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgattttttgaacaacttttttacagccgtgttaagaatgttgctaaaagttcctctgcaaaaaa 41193173  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    || | |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          
T  41193172 ttatcgcaaaatttgaattctacgtccagatttagttaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatattcaattcgttttatgtt-aaaaa 41193074  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||        | |||||||| |||||||| ||||||||| || || |||  |||    
T  41193073 attctaaatttttgtaaatgaacctttgatagtgttctaaacttgtctaacaaaaatagttcaaaagtttaagagcttaaggatagttaaaaaaaaattg 41192974  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattt---- 406  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||        
T  41192973 ttgtaacagggattaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaattatattcagaagttcccaattttata 41192874  T
Q  407 -tataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41192873 gtatagaaaccaaaaacatatttaaccct 41192845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 41139025 - 41139387
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41139025 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaatctcttaagttttttaacaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 41139124  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |           
T  41139125 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcatgataaaaaaa 41139224  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  41139225 ttctaaattttagtaattgaacctttcacaatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaatttttt 41139324  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatta 375  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  41139325 tttagcatagactaaaattagaagtaatt-tttgttgtagggactaaaaaacctactaaaatta 41139387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 434
Target Start/End: Original strand, 34009995 - 34010343
Alignment:
Q  86 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  34009995 attactaaaagttcctctccaaaaaattgacgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatcttaaacttttgccgttttaaaaaattca 34010094  T
Q  186 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 285  Q
    ||||||||| |||| ||| |       |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||||       | || |||||||||||||    
T  34010095 tatttaatttgttttatggtaaaaaa-ttctaaattttagttaatgaacctttcttagtattctaaacttgtctcaaaaaaatagtacaaaaatttaaga 34010193  T
Q  286 gtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaat 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||| ||| |     
T  34010194 gtttaaggataattaaacaaactttgttgtaatagggactaaaattaaaagtaatttttttttgtagggacttaaaaccatattaaaattaagcaaggac 34010293  T
Q  385 taaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34010294 taaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 34010343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 31211187 - 31211609
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| | | |   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31211187 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaattcttaagtttttgaacaatttttttgtagattagttaagaacattactaaaagttcctctgcataaaa 31211286  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||          
T  31211287 ttattgcaaaatttgatttctacgtcccgattttattacttatatctttaacttttgctgttttaaaaaactcctattgaattcgtttcatattaaaaaa 31211386  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31211387 a-tctaaatttttgtaaataaacctttcatattgttctaaacttgtttaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 31211485  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttt-tttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttta 408  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| | ||||||    
T  31211486 gttttaagagggactaaaattagaagtaattttttatttgtagtgactaaaaaaactattaaaattaagttagaaccaaatttaaaagttctcaatttta 31211585  T
Q  409 taggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||   |||||||||||||||||||    
T  31211586 taatgaccaaaaacatatttaacc 31211609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8218293 - 8217947
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8218293 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 8218194  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8218193 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 8218108  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  8218107 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactttat 8218008  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  8218007 tttagcagagactaaaattagaagtattttttttttgtagggactaaaaaatctactaaaa 8217947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9687708 - 9687407
Alignment:
Q  132 tacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtt-gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 230  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||     
T  9687708 tacgtcaaaattttattaattttatctttaactttttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaac 9687610  T
Q  231 gaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaat 329  Q
    |||||||| |||||||||||| | | | ||       ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9687609 gaaccttttatagtgttctaaacttatatcaaaaaaatcgattaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacagggactaaaat 9687510  T
Q  330 tagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatattta 429  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9687509 tcaaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttgccaattttatagggaccaaaaacatattta 9687410  T
Q  430 acc 432  Q
    |||    
T  9687409 acc 9687407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4462245 - 4461837
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaaca--tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 110  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4462245 tcaattcaaatgtgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatatacgtgtttagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 4462146  T
Q  111 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
     || | | |||| | ||||| ||| |||||||||||||  |||              || |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  4462145 cttatcgtaaaattagatttctacatccagattttgttgcttt--------------gtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttagaaa 4462060  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttc-atagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactt 308  Q
      ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4462059 g-ttctaaattttagtaaatgaacctttttatagtgtattaaacttgtctcaaaaaa-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactt 4461962  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttta 408  Q
     |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||    
T  4461961 cgttttagcagggactaaaattataagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaagctattaatattaagtaaggactaaacatagaagttcccaatttta 4461863  T
Q  409 taggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  4461862 tagggaccaaaaacatatttaaccct 4461837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 435
Target Start/End: Original strand, 30394087 - 30394504
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  30394087 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 30394185  T
Q  120 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  30394186 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 30394284  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |        ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||     
T  30394285 gattttagcaaatgaacc-ttcatagtgttataaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaagttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 30394383  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaattcttttt--tgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaa 414  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||  || | |||||||||  |    
T  30394384 cagggactaaaattataagtaatttttttttgtgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaatgtcgcaattttatagaga 30394483  T
Q  415 ccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30394484 ccaaaaacatatttaaccctt 30394504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38693670 - 38693402
Alignment:
Q  104 gcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 203  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38693670 gcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatg 38693571  T
Q  204 ttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-c 302  Q
    ||       || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38693570 ttaaaaaa-ttataaattttagtaattgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaac 38693472  T
Q  303 aaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  38693471 aaactttgttttagcagggactaatattagaagtaattgttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 38693402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 328
Target Start/End: Original strand, 13920063 - 13920378
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  13920063 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattaataaaagttcctccgcaaaaaat 13920162  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||           
T  13920163 tatcgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaatattcatatttaattaatttcatgtt-aaaaaa 13920261  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13920262 ttctaaattttaataattgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaattgaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 13920361  T
Q  312 tttaacagggcctaaaa 328  Q
    |||| ||| | ||||||    
T  13920362 tttagcagagactaaaa 13920378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 426
Target Start/End: Original strand, 2005030 - 2005438
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| | |||| ||||| | |||||| | | |||    
T  2005030 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttatttaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 2005128  T
Q  120 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  2005129 aaaatttgatttctacgtccatatttttcttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 2005227  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |        || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||     
T  2005228 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttataatcttgtataaaaagaatctttaaaaaatttaagagtttaaagataattaagcaaaaattattttag 2005327  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
    ||||| ||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || | |||||||||| ||    
T  2005328 cagggactaaaattataagtaattttttttttttagggattaaaaaagctattaaaattaagtaacgactaaacttagaaggtcacaattttatagggac 2005427  T
Q  416 caaaaacatat 426  Q
    |||||||||||    
T  2005428 caaaaacatat 2005438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 434
Target Start/End: Original strand, 28456628 - 28456927
Alignment:
Q  132 tacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||| ||||    
T  28456628 tacgtccagattttgttaattttatctttaacttttttcgttt-aaaaaattcatatttaattagtttcatgttaaaaaaaag-taaattttagttaatg 28456725  T
Q  232 aacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaatt 330  Q
    ||| ||||||||| |||||| | ||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  28456726 aacttttcatagtattctaaacttgtctcacaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacattgactaaaatt 28456825  T
Q  331 agaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||    
T  28456826 agaagtaatgtttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggaataaatttagaaattcccaattttatag--attaaaaacatatttaa 28456923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22023193 - 22022975
Alignment:
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22023193 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatggtgttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 22023094  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  22023093 tgtaacagggactaaaattagaaataatttttttttgtagtgactaaaaagcctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatag 22022994  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  22022993 gaacgaaaaatatatttaa 22022975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Original strand, 34527030 - 34527341
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||       
T  34527030 tcaattcaaatttgtttaatttattcttatactcttaagttgtttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaatgttccgccgcaaaat-- 34527127  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||           
T  34527128 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgtttttaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 34527216  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34527217 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaactttgt 34527316  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagt 336  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||    
T  34527317 tttagtagggactaaaattagaagt 34527341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 434
Target Start/End: Original strand, 42852827 - 42853141
Alignment:
Q  117 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||       || |    
T  42852827 gcaaaatttgatttctacgtccagattttgttacttttatttttaactttagtcgttttaaaaaattcattttaaattcgtttcacgttgaaaaattt-t 42852925  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtttta 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||        |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  42852926 aaattttagtaaatgaatctttcatattgttctaaacttatctcataaaaaacgttcaaaaattcaagaatttaagaataattaaacaaactttctttta 42853025  T
Q  316 acagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
     || || ||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| || | |||||| ||| |     
T  42853026 gcaaggactaaaattataagtaatt--tttttgta-ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacctaaaagatctcaattttacagggat 42853122  T
Q  416 caaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42853123 caaaaacatatttaaccct 42853141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22023367 - 22023191
Alignment:
Q  8 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 107  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  22023367 catcctcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaatttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctcggtaa 22023268  T
Q  108 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 184  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22023267 aaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtccgaattttgttaattttagctttaacttttttcgttttaaaaaattc 22023191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43441155 - 43440844
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  43441155 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 43441056  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||             ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||           
T  43441055 tatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatc-------------gttttcaaaaattcatattgaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43440970  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataat-taacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  43440969 ttataaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagaatttaaggataatcaaacaaactttgt 43440870  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagta 337  Q
    |||| || || |||||||||||||||    
T  43440869 tttagcatggactaaaattagaagta 43440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 434
Target Start/End: Original strand, 21837098 - 21837360
Alignment:
Q  172 ttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgt 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||       || |    
T  21837098 ttttaagaaattcatatttaattcgtttcatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtatcgaaaaaatcat 21837196  T
Q  272 tcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaac-ctatta 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||| || ||||| ||||||||| ||  |||||||  ||||||    
T  21837197 tcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaaatttgttttagcatggactaaaattataaataatt-ttttttgtaggggctaaaaaaagctatta 21837295  T
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||| | |||| ||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21837296 aaattaagtaaggactaaatttagaagttctatattctatagggaccaaaaacatatttaaccct 21837360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22167161 - 22166745
Alignment:
Q  22 atttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 121  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| | || | ||||||| |||||||||||||| || | |||||||| || ||||    
T  22167161 atttgtttaatt-atgtttaaactcttatgcttttgaacaattttttgtagacgtattaagaacattactaaaagttcatccgtaaaaaattatttcaaa 22167063  T
Q  122 aattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |  ||| |||||| |||||||| || || |||| ||||       |||||||    
T  22167062 atttgatttctatgtccatatttttgttaattttatcttgaaattttttcatttaaaaaaaattcatattaaactcatttcttgttaaaaaa-ttctaaa 22166964  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaat-ttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaac 317  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||       ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||| |    
T  22166963 ttttactaaatgaacctttcgtagtgttctaaatttgtctcataaaaatcgttaaaaaaagttaagtgtttgaagataattatacaaaatttgttttagc 22166864  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacc 416  Q
     ||| ||| ||||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||  |||||||||| |||    
T  22166863 ggggactataattataagtaactttttttttgtagggattaataaaactattaaaatttagtaaggactaaacttaaagcttccggattttatagggacc 22166764  T
Q  417 aaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22166763 aaaaacatatttacccctt 22166745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Original strand, 37446432 - 37446822
Alignment:
Q  40 aaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtcca 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||   || |||||||| ||||||| | | | ||    
T  37446432 aaaactcttaagtttttgaacaattttttacagacatgttaagaacgttactaaaagttccttcgcaaagttttattgcaaaatttgatttctgcataca 37446531  T
Q  140 gattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttc 239  Q
    ||     ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| |||||| ||     
T  37446532 ga-----ttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaatttatatttaattcgtttcacattaaaaaaattctaaattttagtaagtgaaccattt 37446626  T
Q  240 atagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa 338  Q
    |||  ||||||| | ||| |        || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||    
T  37446627 atatggttctaaacttgt-tttaaaaaatctttcaacaatttaagagttcaaggataattaaacaaactttgctttaatagggactaaaattataattaa 37446725  T
Q  339 ttcttttttgtatgga-ttaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
     | | ||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| | |   |||||||||||||||||||    
T  37446726 atttcttttaaaaagactaaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcacaattttaaaagggtcaaaaacatatttaaccct 37446822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 434
Target Start/End: Original strand, 10674648 - 10675062
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||| | | ||||||||  |  ||    
T  10674648 aaatttgtataatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttacaaaagtgttaaaaacattactaaaagttcatatacaaaaaatcatctca 10674746  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| ||  ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||||||    
T  10674747 aaattttgtttctacgtccatatttttgttacttttatcttgaactttggtattttaaaaatattcatatttaattcattttatgttaataaa-ttctaa 10674845  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaac 317  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||| | ||||||       ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||      
T  10674846 attttagtaaacgaaccttttgtggtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaagatttaaaagtttaaggataattagagaaactttgttttagt 10674945  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
    |||| |||||| || | | || |  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |  |||||||||| || |    
T  10674946 agggactaaaactacatgcaaattatttttatagggattaaaaaagctattaaaattaagtaagaactaaatttagaagtttcaaattttatagggacaa 10675045  T
Q  418 aaaacatatttaaccct 434  Q
      |||||||||||||||    
T  10675046 gcaacatatttaaccct 10675062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 173 - 425
Target Start/End: Original strand, 9924401 - 9924645
Alignment:
Q  173 tttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgtt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||        |||||    
T  9924401 tttaaaaatttcatatttaatttgtttcat-tttaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtct-aaaaaaatcgtt 9924498  T
Q  273 caaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaa-aacctattaa 370  Q
     |||||||||||        ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  9924499 taaaaatttaag--------gataattaaacaaattttgttgtaacagggactaaaattataagtaattcttttttttagggattaaaaaaacctattaa 9924590  T
Q  371 aattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacata 425  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  9924591 aattaagtaaggattaaacttagaagttcctaattttatagggaccaaaaacata 9924645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18261471 - 18261055
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa--aaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  18261471 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaattcttaagttttcaaacattcttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaaa 18261373  T
Q  111 attgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 209  Q
    ||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||    | | ||| ||| |||||||||        
T  18261372 attatcgcaaaatttgatttctacgtccagatttttgttagttttatcttgaacttttgtcgtttaaaaaa----aaaattagttcatttcatgtt-aaa 18261278  T
Q  210 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataa-ttaacaaactt 308  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |        | | | |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  18261277 aaattctaaattttagtaaatggacctttcatagtgttataaacttgtttacattaaattgctaaaaaatttaaaagtgtaagtataatttaacaaactt 18261178  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaatt-aaacttaaaagttccctatttt 407  Q
    || |||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||| || | | ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||| | |||||    
T  18261177 tgctttagcagggactaaaattataagtaat--ttttttttaggaactaaaaaagctattaaatttaagtaaggattaaaacttcgaaattctcaatttt 18261080  T
Q  408 ataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||  || |||||||| |||||||    
T  18261079 atagtgactaaaaacatgtttaacc 18261055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14049899 - 14049632
Alignment:
Q  164 ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnn 263  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||       || ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |        
T  14049899 ttttgtcgtttaaaaaaatttatatttaattcatttgatgttaaaaaattt-taaatattagtaaatgaacttttcgtaatgttctaaacgtgtattaag 14049801  T
Q  264 nnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||||| | | |||||||    
T  14049800 aaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggatgattaaacaaactttattttagcagggactaaaattatatgtaatt--tttttgtaggaactaaaaaa 14049703  T
Q  363 c-ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14049702 aactattaaaattaagtaagaattaaacttaaaaattttcaattttataggatccaaaaacatatttaacc 14049632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 435
Target Start/End: Original strand, 36875874 - 36876275
Alignment:
Q  32 tttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 130  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||  |  ||||| |||||||    
T  36875874 tttatggttaaactcttaagtttttgaacaatttttttgcagatgtgttaagaacactactaaaagttccaccacaaaaaatcatctcaaaatttgattt 36875973  T
Q  131 atacgtccagat-tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaa 229  Q
     ||| |||| || ||||||| ||||| ||| || |||| |||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||       |||| ||||||||||||    
T  36875974 -tacatccaaatatttgttacttttaacttaaattttt-ttgtttaaaaagatt-atatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttctgaattttagtaaa 36876069  T
Q  230 tgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcctaaaa 328  Q
    | ||||||| ||| ||||| || | |||||        || || |||||||||||||||| |||||||| | ||||| || || ||| ||||| ||||||    
T  36876070 taaacctttaataatgttccaaacttgtct-aaaaaaatcattaaaaaatttaagagtttgaggataataacacaaatttggtcttagcagggactaaaa 36876168  T
Q  329 ttagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatattt 428  Q
    ||| | |||| | ||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  36876169 ttacatgtaaatattttttgtagggactcaaaatgctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagtttccaattttatagggaccaaaaacatattt 36876268  T
Q  429 aaccctt 435  Q
    |||||||    
T  36876269 aaccctt 36876275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 30698969 - 30698556
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||| | || | ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| |||    ||    
T  30698969 aaatttgtttaatt-atgcttaaattcttgaatttttaaacaatcttttgtacacctattaagaacattacggaaagtccctctacaaaatattaactca 30698871  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgt-taattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||   || | || |||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||       || ||     
T  30698870 aaatttgatttctacgttcagatttttactactcttttcttgaatttttgtcgttt-aaaaaattcatatttaattcttctcctgttaaaaaa-ttatat 30698773  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaac 317  Q
     ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| || ||||| |     
T  30698772 tttttagtaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctccaaaaaatcgttcaaaaatttaagaattcaagaataattaaacaaatttagtttttag 30698673  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattct-tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacc 416  Q
    | || ||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||| |||    
T  30698672 aaggactaaaattacatgtaattttatttttgtagggactaaaaatgttattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatagggacc 30698573  T
Q  417 aaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||    
T  30698572 aaaaacatatttaaccc 30698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26865975 - 26865653
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||                
T  26865975 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcc------------ 26865888  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
     |  |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  26865887 -gccgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactttta-------------ttgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 26865802  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |||||        || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26865801 tt-taaattttattaattggacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaattcattcaaaaatttaagagcttaaggataattaaacaaactttgt 26865703  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  26865702 tttagtagggactaaaattataagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaa 26865653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16966021 - 16965878
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16966021 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaagtcttacgttttttaacaatattttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 16965922  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttat 156  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  16965921 tatcgcaaaatttgatttttatgtccagattttattacttttat 16965878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2263081 - 2262907
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  2263081 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaaattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacaaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 2262983  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    ||| || |||||| ||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  2262982 aaattttatttatgcgtacagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaatttatatttaatt 2262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9687798 - 9687715
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaag 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  9687798 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaag 9687715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17742307 - 17742216
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17742307 ttttttttaaggaataaaaaaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 17742216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 147
Target Start/End: Original strand, 9924287 - 9924393
Alignment:
Q  41 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| || |||||| ||    
T  9924287 aaactcttgagtttttgaacaattttttacagacttgttaagaacattacttaaagttcctctgcaaaatattgtcacaaaatttgaattctacgtctag 9924386  T
Q  141 attttgt 147  Q
    |||||||    
T  9924387 attttgt 9924393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18950959 - 18950805
Alignment:
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaac 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18950959 attttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttatc 18950860  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    | |  ||||| |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18950859 a-gaactaaatttagaagtaattttttttttgtaaggactaaaaaacctactaaaa 18950805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6365330 - 6365174
Alignment:
Q  276 aaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatt 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||  |||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||    
T  6365330 aaattcaagagtttaaggataattatacaaactttgtttcagtaaggattaaaattataagtaatttttttttgtaggaactaaaaaaactattaaaatt 6365231  T
Q  375 aagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| || | |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6365230 aagtaaggactaaacttagaagtttcc-agtttatagggaccaaggacatatttaacc 6365174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 434
Target Start/End: Original strand, 32510406 - 32510570
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  |||  || ||| || | ||||    ||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  32510406 ttcaaaaatttaagagtttaagattaattagagaaactttgttttattaggaactcaaactacatgtaaactatttttataaggactaaaaaaactatta 32510505  T
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32510506 aaattaagtaaggattaaacatagaagttccaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 32510570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Original strand, 40272459 - 40272638
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  40272459 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 40272557  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    |  ||||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  40272558 tctcaaaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttaaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 40272638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 412
Target Start/End: Original strand, 27280413 - 27280552
Alignment:
Q  274 aaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||| | || | | ||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  27280413 aaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaaatttgttttagcaggtactaaaattacatgtcaatattttttgtagggactaaaaatgctattaaaa 27280512  T
Q  373 ttaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    |||| |||| | |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  27280513 ttaaataaggactaaacttagaagtttccaattttatagg 27280552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43210914 - 43210684
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  43210914 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgtacaagtgttaagaacattaagaaaagttcttatgcaaaaaattatctca 43210816  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||   ||  ||||||||||||||||||  |||||||||       || |||    
T  43210815 aaattttatttcttcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtctcttagaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaattt-taa 43210717  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  43210716 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaa 43210684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Original strand, 8404735 - 8404812
Alignment:
Q  357 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8404735 aaaaaaactattaaaattaagtaaagattaaacttaaaaggtctcaattttataggaatcaaaaacatatttaaccct 8404812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Original strand, 42877945 - 42878022
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42877945 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 42878022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 19332468 - 19332651
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||| ||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| |  ||    
T  19332468 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaataattttttgtacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctcgaaaaaattatctca 19332566  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 203  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  19332567 aaattttatttctgcgtccagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 19332651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 429
Target Start/End: Original strand, 22023389 - 22023476
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatattta 429  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22023389 ttttttctagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatattta 22023476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 353 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27335592 - 27335509
Alignment:
Q  353 gattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27335592 gattaaaaaaactaataaaattaaggaagaactaaacttaaaaggtccgaaatttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 27335509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40158216 - 40158145
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40158216 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 40158145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Original strand, 621955 - 622041
Alignment:
Q  349 tatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  621955 tatggactaaaagaactattaaaattaagtaagtattaaacttgaaaggtcccaattttatagagaccagaaacatatttaaccctt 622041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4462522 - 4462456
Alignment:
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4462522 ttaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 4462456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2003911 - 2003834
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2003911 taaaaaaactattaaaattaaataagatctaaacttaaaaggtcccaattttataggaaccaaaaaaataattaaccc 2003834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Original strand, 28237302 - 28237371
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  28237302 ctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagatccctattttattgagaccaaaaacatatttaaccc 28237371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2004996 - 2004904
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  2004996 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataagaactaaacttacaagatcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaaccct 2004904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 3407211 - 3407295
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3407211 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 3407295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 6365508 - 6365413
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||| |   |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6365508 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagtttttgaac-atttttcgcagatgcgttaagaacattagtaaaagttcctctgcaaaa 6365413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Original strand, 9687848 - 9687916
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9687848 ctattaaaattaagtaagtattaaacttaaaaggttccaattttatagggaccaaaatcatatttaacc 9687916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19332435 - 19332351
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19332435 ttttttatatggactaaaaacattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 19332351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27307769 - 27307701
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27307769 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggcccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 27307701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 434
Target Start/End: Original strand, 1683486 - 1683577
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||| || ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  1683486 tttttttagggactaaaagaactattgaaattaagtaagaattaaacttaaaagatctcaattttataaggatcaaaaacatatttaaccct 1683577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 366 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4425970 - 4425903
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4425970 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaagatccctattttatagggacgaaaaacatatttaaccc 4425903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10674615 - 10674524
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10674615 ttttttataaggactaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaacttataaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 10674524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 434
Target Start/End: Original strand, 4462282 - 4462364
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4462282 ggattaaaagaactattaaaattaattaaggactaaacttaaatggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 4462364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3548638 - 3548280
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||| |||| | |  ||| ||||| |||| ||||| ||||||  ||| |||||     
T  3548638 aattaaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaactttttgaacaattatttgtagaagtgtcaagaacattattaaaaattcctcgacaagaaatta 3548540  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
    |  ||||| || |||| || |  || | |||| ||| ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||       |    
T  3548539 tctcaaaatttaatttctatgcacaaaatttggttacttttatcttgaacttttggcattt-aaaaaattcatatttaattcatttcacattaaataatt 3548441  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgttt 313  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||        |||||||||  |||||| ||||||||||||||||  || ||| |||    
T  3548440 t--aaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaatttgtctaaaataaatcgttcaaatgtttaagtgtttaaggataattaaacaaattttttt 3548343  T
Q  314 taacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaa 376  Q
    ||| ||||  |||||||| | |||| || |||||||   || |||||||  ||||||||||||    
T  3548342 taatagggattaaaattacatgtaaatcatttttgtggagactaaaaaagttattaaaattaa 3548280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8336791 - 8336722
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8336791 attaaaattaaataaggactaaacttaaaaggcccctattttataaggaccaaaaacatatttaaccctt 8336722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21837103 - 21837026
Alignment:
Q  355 ttaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21837103 ttaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 21837026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Original strand, 30403454 - 30403531
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30403454 taaaaaaactattataattaagtaagaactaaactgaaaaggtcgcaattttacagggaccaaaaacatatttaaccc 30403531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 26865232 - 26865288
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26865232 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 26865288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28616065 - 28615906
Alignment:
Q  269 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataat-taacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctat 367  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || |  || |||||| | |||||  |||||||||  || ||||||| ||||    
T  28616065 cgttcaaagatttaagagtttaaggataataaaacaaactttgttttggcatgaact-aaattacatgtaat--ttttttgtagagactaaaaaaactat 28615969  T
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || ||| | |||||||||  |||||||| |||||||||    
T  28615968 taaaattaagtaag-acaaaacttagaaattctcaattttatagagaccaaaaatatatttaac 28615906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 426
Target Start/End: Original strand, 2263114 - 2263197
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2263114 tttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaagactaaacttaagagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 2263197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10463688 - 10463621
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10463688 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaaaacccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 10463621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Original strand, 42645214 - 42645281
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||    
T  42645214 tttttatatggattaaaaacactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagatccaaattttata 42645281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13920035 - 13919945
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13920035 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 13919945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14050000 - 14049903
Alignment:
Q  41 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtcca 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||    
T  14050000 aaactcttaagtttttgaacaatttttggaacacatgttaagaacattactaaaagtttctccac-aaaaattatctcaaaatttgatttctacgtcca 14049903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28456538 - 28456468
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28456538 ctattaaaattaagtattgactaaacttaaaaggtcctaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 28456468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37812230 - 37812172
Alignment:
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37812230 taaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 37812172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 38693759 - 38693849
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38693759 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 38693849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Original strand, 43210972 - 43211034
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  43210972 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatat 43211034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8313159 - 8313090
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8313159 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacctctattttatagggatcaaaaacatatttaaccctt 8313090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 18950977 - 18951066
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  18950977 tttttgtaaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 18951066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38691953 - 38691864
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38691953 tttttataaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttacaggaactaaaaacatatttaacc 38691864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 43209900 - 43210084
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  43209900 aaatctgtttaatt-atgcttgaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacattaccaaaagttcttatgcaaaaaattatctca 43209998  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||  | | ||| | |  |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  43209999 aaattttatttcttcgtccagatttttcttactttttttcgaacttttgtcttttaaaaaaaatcatatttaatttatttcatgtt 43210084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43538539 - 43538478
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacata 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||    
T  43538539 ctattaaaattaagtaataattaaacttaaaatgttccaattttatagggaccaaaaacata 43538478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 8217510 - 8217562
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattt 65  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  8217510 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattt 8217562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 436
Target Start/End: Original strand, 30699013 - 30699097
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||   || |||||||| | |   |||||||||||||||||||    
T  30699013 ggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggattaaatttaaaaggctccaattttataaggatataaaacatatttaacccttt 30699097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32537687 - 32537608
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgtt-aagaatattactaaaagttc 99  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  32537687 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttgagattttgaacaatgttttgcaaaagtgttaaagaacattactaaaagttc 32537608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 40272430 - 40272346
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  40272430 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaatttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatat 40272346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30733899 - 30733836
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatattt 428  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  30733899 tattaaaattaagtaacgactaaacttagaagtttccaattttatagggaccaaaaacatattt 30733836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 486 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 31006232 - 31006197
Alignment:
Q  486 acatgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31006232 acatgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 31006197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37102984 - 37102918
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37102984 ctataaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtcccaattttata-gaatcaaaaacatatttaac 37102918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 13920973 - 13921063
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  13920973 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaaccc 13921063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Original strand, 19333302 - 19333364
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  19333302 ctataaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatat 19333364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26865204 - 26865114
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | |  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26865204 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgactcacttttatagggactaaaaacatatttaaccc 26865114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Original strand, 7077225 - 7077258
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7077225 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 7077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Original strand, 8218321 - 8218410
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  8218321 ttttttgtaaggactaaaaccactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 8218410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Original strand, 24637261 - 24637350
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||||| | || |||| ||||||||||    
T  24637261 ttttttgtagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggattaaaattaaaaggtctccattttataaggactaaaatcatatttaac 24637350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30394053 - 30393960
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| || | ||||| |||  ||| |||| ||| |||||||||    
T  30394053 ttttttgtaaggattaaaaaaactattaaaattaaataaggactaaacttacaaggtcgcaattttgtagagaccgaaaatataattaaccctt 30393960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34527002 - 34526913
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  34527002 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatggctcaattttataaggactaaaaacatatttaacc 34526913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 42645181 - 42645089
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  42645181 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaaatattaagaacattaaaaaaatttcatatgcaaaaaatt 42645089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 37812678 - 37812757
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37812678 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaatttcc 37812757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38693731 - 38693675
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38693731 tcaattcatatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttttaacaattttttg 38693675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Original strand, 41193299 - 41193391
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| || ||| ||||| | ||||||||||||| |||  | ||||||| |||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41193299 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaaataacgaataaacttgaaatatcccaattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 41193391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5597814 - 5597755
Alignment:
Q  146 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  5597814 gttaattttatcttgaacttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 5597755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 205
Target Start/End: Original strand, 24334041 - 24334100
Alignment:
Q  146 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24334041 gttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaattcatatttaattcattacatgtt 24334100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27280159 - 27280060
Alignment:
Q  337 aattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||||| |||  ||   |||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  27280159 aatttttttttatagggactaaaaaacctattaaaattaagggaggactaaactttaaatatcttaattttatagagaccaaaaaaatatttaacccttt 27280060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 99
Target Start/End: Original strand, 42852775 - 42852822
Alignment:
Q  52 tttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 99  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  42852775 tttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaacgttactaaaagttc 42852822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Original strand, 19104366 - 19104396
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19104366 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 19104396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Original strand, 22167197 - 22167287
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaac-ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||  ||| |||  |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  22167197 ttttttgtagggattaaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaaatttgaaggtcctaattttatatggaccaaaaatatatttaac 22167287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30734113 - 30733973
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||       ||||    
T  30734113 caaaatttgatttctacgtccagatttttgttactcttttcttgaacttttgacgttt--aaaaattcatatttaattcttgtcatgtt-aaaaaattct 30734017  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc 260  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||    
T  30734016 attttttagtaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctc 30733973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36875833 - 36875743
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||   |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36875833 ttttttataaggactaaaaagcctattaaaattaagtgaggattaaccttagaaagtcataatttaatagggaccaaaaacatatttaacc 36875743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 1056360 - 1056389
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1056360 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 1056389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 434
Target Start/End: Original strand, 3548594 - 3548758
Alignment:
Q  270 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatt 368  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| |||  ||||| || | ||||||||  | | |||| |||||| || ||| ||||| | |||||    
T  3548594 gttcaaaaagttaaaagtttaagcataattaaacaaattttaatttaatagagactaaaattgaatgcaatt-ttttttataaggactaaaagaactatt 3548692  T
Q  369 aaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| |||   |||||||| | | || | || ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3548693 aaaattaagcaagggctaaacttagagggtctcaatattatagggaccaaaaaaatatttaaccct 3548758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 435
Target Start/End: Original strand, 6365557 - 6365622
Alignment:
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | | || |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  6365557 aaattaagtaaggactaaacttaaagggttccaattttatagggactaaaaagatatttaaccctt 6365622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23425389 - 23425337
Alignment:
Q  142 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  23425389 ttttgttaattttatcttgaacttttgcaatttt-aaaaattcatatttaattc 23425337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Original strand, 28456585 - 28456626
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagttt 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28456585 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttt 28456626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 33894706 - 33894735
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33894706 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 33894735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 40360777 - 40360806
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40360777 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 40360806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2567496 - 2567432
Alignment:
Q  141 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  2567496 atttcgttagttttatcttaaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 2567432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Original strand, 9599655 - 9599687
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9599655 tgagcaatgatatttgtacatccattttatgac 9599687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26685876 - 26685844
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatga 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26685876 atgagcaatgatatttgtacatctatttaatga 26685844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26955607 - 26955575
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatga 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26955607 atgagcaatgatatttgtacatctatttaatga 26955575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 34527428 - 34527480
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34527428 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcagtaaacttaaaa 34527480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41138997 - 41138909
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  41138997 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 41138909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41192758 - 41192730
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaat 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41192758 gagcaatgatatttgtacatccatttaat 41192730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 136)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33177716 - 33177295
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33177716 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagctcctatgcaaaaaat 33177617  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  33177616 tgtctcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacgtttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 33177518  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33177517 ttctaaattttagtaaatgaacttttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 33177418  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33177417 tgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtatggattaaacttgaaaggtccctattttatag 33177318  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  33177317 ggatcaaaaacatatttaaccct 33177295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Original strand, 53323774 - 53324198
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg-caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  53323774 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttttacatacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaa 53323873  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||          
T  53323874 ttgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaa 53323972  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53323973 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 53324072  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  53324073 ttgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtaaggactaaaatttttattaaaattaagtaaagattaaacttgaaagatccctattttata 53324172  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  53324173 gggaccaaaaacatattttacccttt 53324198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 47309434 - 47309856
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47309434 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattatttacagacatgttaagaacattaataaaagttcctatgcaaaaaat 47309533  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  47309534 tgtagcaaaatttgatttatacgtcaagattttgttaattttatctttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 47309632  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47309633 ttctaaattttagtaaatgaacctttcacagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 47309732  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    |  || | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47309733 tgcaataaggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatatattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatag 47309832  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  47309833 ggaccaaaaatatatttaaccctt 47309856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 22068097 - 22068519
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22068097 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaatagttttctgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 22068196  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22068197 tgtcgcaaaatttgacttttacgtcccaattttgttaatttaatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 22068296  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22068297 -tctaaattttagaaaatgaacctttcatagtgttctaaacatatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 22068395  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  22068396 tttaaaagggactaaaatttgaagtaattttttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttata 22068495  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  22068496 gggaccagaaacatatttaaccct 22068519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30331573 - 30331192
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30331573 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 30331474  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||           
T  30331473 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 30331375  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||       ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30331374 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 30331275  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaa 394  Q
    | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  30331274 tgtaacagggactaattttagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaaactattaaagttaaataaagattaaacttaaa 30331192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28448677 - 28448268
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28448677 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-cgtgttgagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaattg 28448579  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 214  Q
    | |||||| ||||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||       ||    
T  28448578 tcgcaaaatttgatttctacgt------tttgttaattttatctttaagttttgtcgttttgaaaaattcatattcaatttgtttcatgttaaaaaa-tt 28448486  T
Q  215 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttt 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28448485 gtaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttg 28448386  T
Q  314 taacagggcctaaaattagaagtaattcttttttg-tatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28448385 taagagggactaaaattagaagtaatttttttttggtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagg 28448286  T
Q  413 aaccaaaaacatatttaa 430  Q
      ||||||||||||||||    
T  28448285 gtccaaaaacatatttaa 28448268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 51395907 - 51395489
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||    
T  51395907 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcatgagtttttgaataatttcttgcagacgtgttaaacacattactaaaagttcctgtacaaaatat 51395808  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| || |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||           
T  51395807 tgtcgcaaaatttaattactacatcctgattttgttaattttatctttaacttttttcgttttgaaatattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaa 51395708  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51395707 ttctaaattttagtaaatgaatcactcatagtgtt-taaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 51395609  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51395608 tgtaacagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaacttattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttccctattttatag 51395510  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  51395509 gaaccaaaaacatatttaacc 51395489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 55938075 - 55938492
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  55938075 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaatattactaaaagtacctctgtgaaaaattgtcgca 55938174  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||       |||||||    
T  55938175 aaatttgatttctacgtgcagattttgttaattttatctttaacatttgttgttttaaaaaattcagatttaattcgttttatgtt-aaaaaattctaaa 55938273  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    || ||||||| | ||||||| ||||||||||| | | | ||       ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  55938274 ttctagtaaacg-acctttcgtagtgttctaaacttatttcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaata 55938372  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacc 416  Q
    ||| ||||||||| ||||||  || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||||||  ||     
T  55938373 gggactaaaattataagtaatttttttttttgtaaggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcgtaattttatagagact 55938472  T
Q  417 aaaaacatatttaacccttt 436  Q
    || || ||||||||||||||    
T  55938473 aagaatatatttaacccttt 55938492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 434
Target Start/End: Original strand, 1870140 - 1870526
Alignment:
Q  47 ttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg 146  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1870140 ttgagtttttcgacaattttttgtagacatgttaaaaacattactaaaagtttctcggcaaaaaattgtcacaaaatttgatttatacgtccatattttg 1870239  T
Q  147 ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1870240 ttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacattttatagtgt 1870338  T
Q  247 tctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattctttt 345  Q
    ||||| | |||||        |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  1870339 tctaaacttgtct-taaaaaatcgttcaaaaatttaatagtttaaggatagttaaacaaactttattttagcagggactaaaattagaaataattttttt 1870437  T
Q  346 ttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||||||||||    
T  1870438 ttgtaggtactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacataaaagttcccaattttatagggatcaatcaaatatttaaccct 1870526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Original strand, 31316547 - 31316889
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31316547 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgca 31316646  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||    
T  31316647 aaatttgatttatatgtccaaattttattatttttatctttaatttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaa 31316746  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31316747 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 31316846  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  31316847 -ggactaaaattagaagtaatttttttttgtaaggactaaaaaa 31316889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 10085485 - 10085902
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10085485 tcaattcaaatttgtttaatttatgctaaaactcttaagtttgtgaataattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 10085584  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||          
T  10085585 tatcgcaaaatttgatttctatatcctgattttgttactttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattta-atttaatttgtttcatgtt--aaaa 10085681  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||    
T  10085682 attctaaattttagtaaatgaagatttcatagtgttctaaatttgtcacaaaaaaaccgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaaaaaaaattg 10085781  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10085782 ttttagcagggactaaaattataagt-atttttttttgtagggactaaaaaagctattaaaattatgtaaggactaaactttaaagttcccaattttata 10085880  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  10085881 aggaccaaaaacatatttaacc 10085902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Original strand, 4850094 - 4850518
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  4850094 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaagaatgttactaaaaatttctccgcaaaaaat 4850193  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  4850194 tatcgcaaaatttgatttctacgtctaagttttgttatttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatattaaattcgtttcatgtt-gaaaaa 4850292  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||       ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4850293 ttctaaatattactaaatgaatctttcatattgttctaaatgtgtctcaataaaatcgttcaaaaattcaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 4850392  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatgga-ttaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    |||| || |  ||||||||| ||||||||  |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||  |||||| |    
T  4850393 tttagcaagaactaaaattataagtaatttatttttgtaaggactaaaaaaaactattaaaattaagtaaggacgaaacttagaagtacctaattttaga 4850492  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    || | ||||||||||| |||||||||    
T  4850493 gggatcaaaaacatatataacccttt 4850518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Original strand, 19522712 - 19523136
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19522712 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaaagtcctatgcaaaaaat 19522811  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  19522812 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 19522910  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||       
T  19522911 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaatttgaa 19523010  T
Q  312 tttaacagggcctaa-aattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || |  |||| |||| | | ||     ||| || ||| || ||| ||||| | | |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||    
T  19523011 ttgaggaggggctaatagtgagtgcagatttttatttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctattttata 19523110  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  19523111 gggaccaaaaacatatttaacccttt 19523136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 301
Target Start/End: Original strand, 43937996 - 43938290
Alignment:
Q  8 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgc-a 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43937996 catcctcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagttcctctgcaa 43938095  T
Q  107 aaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttn 206  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  43938096 aaaaattgtcgcaaaattttatttatacgttcagattttgttaattttttcttgaactattttcgttttaaaattttcatatttaattcgtttcatgtta 43938195  T
Q  207 nnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 301  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43938196 aaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaagcttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagttaaaggataattaa 43938290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 10321695 - 10322055
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  10321695 tcaattaaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtccctccgcaaaaaat 10321794  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |           
T  10321795 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcttttcatgat-aaaata 10321893  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||       | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  10321894 ttctaaattttagtaattgaacctttcacagtgttctaaacttgtgtcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttttt 10321993  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10321994 tttagcagggactaaaattagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 10322055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33689588 - 33689232
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  33689588 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaagaacattactaaaaattcctccgcaaaaaat 33689489  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  33689488 tatcgcaaaatttggtttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 33689390  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||       ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  33689389 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgctctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagaatttaagaataattaaacaaactttgt 33689290  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaa 371  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  33689289 tttagcagggattaaaattagaagta--ttttttttgtagggactaaaaaacctactaaa 33689232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 53423859 - 53423525
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53423859 tcaattcaaatttgtttaatttatactaaa-ctcttgagtttttggacaattttttgcagacatgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 53423761  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnn 211  Q
    ||| |||||| ||| || | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||           
T  53423760 tgtcgcaaaatttgtttcacacgtccatattttgttacttttatctataacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaaa 53423661  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||        | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  53423660 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaagaattgttaaaaaatttaagagtttaaggatagttaaacaaacttta 53423561  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttt 346  Q
    ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  53423560 ttttagcagagactaaaattagaaataattcttttt 53423525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20178175 - 20177934
Alignment:
Q  8 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 107  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20178175 catcctcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcttgggttattgaacaattttttacatacatgttaagaacattactaaaagttcctctacaa 20178076  T
Q  108 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  20178075 aaaattgtcgcaaaatttgatttatacgtccagattttgttacttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcttgttaa 20177976  T
Q  208 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
         |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20177975 aaaatt--taaattttagtaaatgaaccttccatattgttctaa 20177934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 432
Target Start/End: Original strand, 7490732 - 7491110
Alignment:
Q  52 tttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaat 151  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7490732 tttttgaacaatttttcacagacgtgttaagcacattactaaaa-ttcctctgcaaaaaattgacgcatattttgatttctacgtccaaattttgttaat 7490830  T
Q  152 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||        |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7490831 tttatctttaacttttgccgttttaaaatattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaaa-tctaaactttagtaattgaaccttttatagtgttctaa 7490929  T
Q  252 ccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaa-tttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgt 349  Q
     | |||||        | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  7490930 acttgtctaaaaaaagttgttcaaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacagggactaaaattaaaagtaat--ttttttgt 7491027  T
Q  350 atggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||  || |||   |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7491028 aaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaagaataaactttgaaattcttaattttatagggactaaaaacatatttaacc 7491110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Original strand, 51876007 - 51876297
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51876007 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttagagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 51876106  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatc-tttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  51876107 tatcacaaaatttgatttatacgtccagattttgttaattttatcttttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaac 51876206  T
Q  212 nt-tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 301  Q
     | ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||| | |||||        |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  51876207 ttgtctaaattttaataaatgaacatttcacattgttataaacttgtctaaaaaaattcgttcaaaagtttaagagtttaagaataattaa 51876297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Original strand, 25422067 - 25422391
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  25422067 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacatttttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagatcatccgcaaaaaat 25422166  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  25422167 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacatttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 25422264  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25422265 ttctaaattttagtaattgaacctttgatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 25422364  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa 338  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||    
T  25422365 tttagcagggactaaaaataaaagtaa 25422391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13718271 - 13718078
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13718271 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaatttttttccagacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 13718172  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13718171 ttgtcgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatcttgatcttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatgcgtttcatgtt 13718078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 47379471 - 47379053
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||| |   ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  47379471 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttatactcttaagttttcgaaaatgcttttgcagacgtgttaagaacaatactaaaagttcctccgcaaaaaat 47379373  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||          
T  47379372 tatcgcaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttttatcttgacgttttgtcattttaaaaaatacatatttaattcatttcat-ttttaaaa 47379274  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttg 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||       ||| |||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  47379273 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaatattcgctcaaaattt--agagtttaagtataattaaacaaacttcg 47379176  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    | ||| || || ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||    
T  47379175 tattagcatggactaaaattataagtaattttttttggtagggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccagttttata 47379076  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    || |||| |||||||||||||||    
T  47379075 gggaccagaaacatatttaaccc 47379053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 429
Target Start/End: Original strand, 47463436 - 47463780
Alignment:
Q  85 tattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  47463436 tattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcacaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaatttttactgttttaaaaaattc 47463535  T
Q  185 atatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatag---tgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattt 281  Q
    |||||||||| |||| |||||        | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||       ||||| ||||||||    
T  47463536 atatttaatttgtttaatgttaaaaaaaat-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttaaaaaattt 47463633  T
Q  282 aagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaa 380  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47463634 aagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaacaaaaactaaaattagaagtaat--tttttttaagggattaaaaaacctattaaaattaagtaa 47463731  T
Q  381 gaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatattta 429  Q
    | | ||||||   |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  47463732 ggactaaactcggaagttcccaattttataaggaccaaaaacatattta 47463780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38114507 - 38114273
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38114507 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttttttaacaaatttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 38114408  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38114407 tgtcacaaaatttgatttatatgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 38114308  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttc 248  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  38114307 tt-taaattttagtaaatgaacatttcctagcgttc 38114273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 48082450 - 48082868
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| || || | |||||||  | |||    
T  48082450 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcatccgaaaaaaata-tcgca 48082548  T
Q  120 aaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  48082549 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttatttatatcttaaacttttgtcgttttataaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttata 48082647  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||     
T  48082648 gatttttgtaaatgaaccgttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 48082747  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaattctttt-ttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
    ||| | ||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||||| ||| || | |||||||||| ||    
T  48082748 cagagactaaaattataagtaaattttttcttgtagggattaaaagagctattaaaattaagtaaggacttaacttagaaggtcgcaattttatagggac 48082847  T
Q  416 caaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  48082848 caaaaacataattaacccttt 48082868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3873374 - 3873142
Alignment:
Q  86 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  3873374 attactaaaagttcctatgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtacaggttttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattca 3873275  T
Q  186 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 285  Q
    ||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||| |||||    
T  3873274 tatttaatttgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatgtaaga 3873176  T
Q  286 gtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  3873175 gtttaaggataattaaacaaattttgttgtaaca 3873142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23473766 - 23473360
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| | | || ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  23473766 aaatttgtttaatttatgcttaaagtcttaagtttttgaataatttttttgtagacgtgtcaagaacgttaccaaaagttcctctgcaaaaaattatcgc 23473667  T
Q  119 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    |||| ||||||  || ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||  || || ||||| |||||||||||| ||||||||||       || |||    
T  23473666 aaaatttgattcttatgtccagattttattacttatatctttaatttttgacgtatttaaaaactcatatttaatttgtttcatgttaaaaaattt-taa 23473568  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaac 317  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||       |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23473567 attttagt-aatgaacctttcacagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaccgataattaaacaaactttgttttagc 23473469  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| |  |   | |||||||  |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||||   || |    
T  23473468 agggactaaaattaaaagtaatttttttataaa---actaaaaaaattattaaaattaaataaatactaaacttaaaagttcccaattttataaagacta 23473372  T
Q  418 aaaacatattta 429  Q
    ||||||||||||    
T  23473371 aaaacatattta 23473360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7617514 - 7617293
Alignment:
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7617514 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttttaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 7617415  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||     
T  7617414 tgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaatatctctattttatat 7617315  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  7617314 ggatcaaaaacatatttaaccc 7617293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 38114277 - 38114125
Alignment:
Q  269 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctat 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38114277 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacagggactaaaattagaagtaattcttttttgtatgaactaaaaaacctat 38114178  T
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaa 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38114177 taaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaaaa 38114125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 435
Target Start/End: Original strand, 44289684 - 44290089
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| || || | |||||| | | |||    
T  44289684 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcatccg-aaaaaaatatcgca 44289782  T
Q  120 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  44289783 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 44289881  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||      
T  44289882 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttatttt-- 44289979  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactta-aaagttccctattttataggaac 415  Q
              | ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || | || | |||||||||| ||    
T  44289980 ----------agttataagtaaattttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagggtcgcaattttatagggac 44290069  T
Q  416 caaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44290070 caaaaacatatttaaccctt 44290089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 117 - 375
Target Start/End: Original strand, 11670210 - 11670469
Alignment:
Q  117 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  11670210 gcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttct 11670308  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtttta 315  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11670309 aaattttattaattgaacctttcgtagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaactttgtttta 11670408  T
Q  316 acagggcctaaaattagaagtaattct-tttttgtatggattaaaaaacctattaaaatta 375  Q
      |||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  11670409 gtagggactaaaattagaagtaattttgtctttgtagggactaaaaaaactactaaaatta 11670469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 53571824 - 53571491
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||       
T  53571824 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat-- 53571727  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               |||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  53571726 -----------ttgatttatatgtacatattttattacttttatctttaacttttattattttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 53571639  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53571638 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggatgattaaacaaactttgt 53571539  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    ||||  |||| |||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||    
T  53571538 tttagtagggactaaaattagaag---tttttttttgtagggattaaaaaa 53571491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3862585 - 3862366
Alignment:
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3862585 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatcgcattctaaacttgtctcaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttg 3862486  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  3862485 ttgtaacagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaac-tattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctctattttata 3862387  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
     | || |||||||||||||||    
T  3862386 aggacaaaaaacatatttaac 3862366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3871342 - 3871123
Alignment:
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3871342 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatcgcattctaaacttgtctcaaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttg 3871243  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  3871242 ttgtaacagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaac-tattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctctattttata 3871144  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
     | || |||||||||||||||    
T  3871143 aggacaaaaaacatatttaac 3871123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 52948054 - 52947635
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||  | |  |||| | || ||||||||||||| |||  | |||||||     
T  52948054 aattcaaatttgtttaatt-atgtttaaactcttgaatttttgaacaattttttatatatgtgttcaaaacattactaaaagttgctccccgaaaaatta 52947956  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
     | ||||||||||||| |||| ||| | |||||| | ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||||||       |    
T  52947955 gttcaaaaattgatttctacgaccaaacttttgtgacttttatcttgaaattttgtcattt-aaaaaattcatatttaatttatctcatgttaaaaaaat 52947857  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnn-tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttg-t 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||        |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || |||  |    
T  52947856 tctaaattttagtaaatgaactttttataatgttctaaaagtgtctccaaaaaaatcgttctaaaatttaacagtttaaggataattaaataaatttaat 52947757  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||| || |||||||||    
T  52947756 tttagcagggactaaaattatatgtaatt--tttttatagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagatgtttccaattttatag 52947659  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  52947658 ggaccaaaaacatatttaaccctt 52947635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13718035 - 13717866
Alignment:
Q  268 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaaccta 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  13718035 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttttttgtaacatggactaaaattagaagtaaatcttttttgtagggattaaataacgta 13717936  T
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  13717935 ttaaaattaagtaaggattaaatttagaagttcccaattttataagaacaaaaaatatatttaacccttt 13717866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42972983 - 42972730
Alignment:
Q  58 aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatc 157  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42972983 aacaattttttgcagacgtgttaagaacattgctaaa-gttccactgcaaaaaattgtcgtaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatc 42972885  T
Q  158 tttaacttttgttgttttaa-aaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtg 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       || |   ||||  ||||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  42972884 tttaacttttgttgttttaacaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaatttt--tttttgataaatgaacctttcatagtattctaaactcg 42972787  T
Q  257 tctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtt 312  Q
    |||        |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42972786 tcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgtt 42972730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 48220180 - 48219764
Alignment:
Q  14 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48220180 caattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttatgttttttaacattcttttgcagatatgttaagaacattactaaaaattcctccgcaaaaaatt 48220082  T
Q  114 gttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || || ||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||           
T  48220081 attgtaaaatttaatttctacatccaaatttttgttacttttatattgaa-ttttgtcattttaaaacattcatatttaattaatttcttgtt-aaaaaa 48219984  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataa-ttaacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||  |        ||||| |||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  48219983 ttctaaattttaacaaatgaacctttcataatgttctaaacgtgcttaaaaaagatcgttgaaaattttaagagttt-agtataatttaagaaactttgt 48219885  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    |||| ||||| ||||||||| || ||| | ||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48219884 tttagcagggactaaaattataaataaatttttgttgtaaggactaaaaaagctattaaatttaagtgaggactaaacttaaaaattcccaattttatag 48219785  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||| | |||||||| |||||||    
T  48219784 gaatc-aaaacatacttaaccc 48219764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35061120 - 35060875
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  35061120 tcaattcaaatttgtttaatttattctaaaactcttaagatttt-aacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttcctccgcaaaaaat 35061022  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||           
T  35061021 tatcgcaaaatttgatttatatatccagattttattacttttatttttaacttttatcgttttcaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35060923  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc 260  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||| | ||||||    
T  35060922 ttctaaattttagtaattgaatatttcaaagtgctctaaacttgtctc 35060875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44209777 - 44209470
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  44209777 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcgtacgcaaaaaat 44209678  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||              |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||           
T  44209677 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------cttttcaaaaatacatatttaattcttttcgtgtt-aaaaga 44209592  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44209591 ttctaaattttagtaattgaatctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 44209492  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattaga 333  Q
    |||  || || |||||||||||    
T  44209491 tttcgcaaggactaaaattaga 44209470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 37329487 - 37329678
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  37329487 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaaattttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 37329586  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatt--tatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcat 202  Q
    | |||||||| || |||  ||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37329587 tattgcaaaatttaatttatatatatccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcat 37329678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 325 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3873028 - 3872919
Alignment:
Q  325 aaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacat 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3873028 aaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttatagggaccaaaaacat 3872929  T
Q  425 atttaaccct 434  Q
    ||||||||||    
T  3872928 atttaaccct 3872919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 430
Target Start/End: Original strand, 38499327 - 38499705
Alignment:
Q  53 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatt 152  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||    
T  38499327 ttttgaacaattttttgcagaagtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaataatctcaaaattttatttctatgtccagatttttttactt 38499426  T
Q  153 ttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaac 252  Q
    ||||||| ||||  |||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||| ||||||||  || | || |||     
T  38499427 ttatcttgaactcatgtcttttaaaaatattcatatttaattcatttcatgttaaaaaaaatttaaattttagtaaacgaaccttttgtaatattataaa 38499526  T
Q  253 cgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtat 351  Q
    | ||| |        |||||  || |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  | | |||| |  ||||| ||     
T  38499527 cttgtttaaaaaaaatcgttttaagatttaatagtttaaggataattagagaaactttgttttaatagggactaaaacaacatgtaaattatttttatag 38499626  T
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  38499627 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttccaaattttatagggaccacaaatatatttaa 38499705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Original strand, 13603785 - 13604206
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  13603785 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttt-gaacaattttttgcagatattttatgaacattactaaaagttcctccgcaaaaattta 13603882  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
    |  |||||  |||||| ||  |||| ||||| |||| ||||| ||||||    | | |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||       |    
T  13603883 tctcaaaatgtgatttttatatccaaatttttgttacttttaactttaaaaaatttcgtttaaaagaattcatatttaatttatttcaagttaaaaa--t 13603980  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaa-tttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||        || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13603981 tatgaattttagtaaatgaaccttttataatgttataaacttgtctaaaaaatatcattaaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 13604080  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt-gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    |||| |||||  |||||||| | |||| | |||||| ||| ||| ||||||   ||||||||||||||||  | ||||||||  ||||    ||||||||    
T  13604081 tttagcagggattaaaattacatgtaaatatttttttgtagggactaaaaatgttattaaaattaagtaaagactaaacttattagtttttaattttata 13604180  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  13604181 ggaaacaaaaacatatttaacccttt 13604206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 45557893 - 45558058
Alignment:
Q  268 tcgttcaaaaattt-aagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacct 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||  ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45557893 tcgttcaaaaattttaagagtttaaggataattaaacaaatgctgtagtaacaagcactaaaattagtagtaattcttttttgtatggactaaaa-acct 45557991  T
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45557992 attaaaattaagtagggtttaaacttaaaaactcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 45558058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 270 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20177885 - 20177721
Alignment:
Q  270 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttt-tttgtatggattaaaaaacctat 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  20177885 gttcaaaaatttaagagattaagaataattaaacaaattttgttgtaacagtgactaaaattagaagtaattttttgtttgtagggactaaaaaacctat 20177786  T
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||||  || | |||| ||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  20177785 taaaattaagtaagggtt-atcttagaagtttccaattttataaggactaaaaacatatttaaccc 20177721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 35821131 - 35821349
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||           |    
T  35821131 aaatttgtttaatttatacttaaactcttaaatttt-gaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaa-----------a 35821218  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    |||||| ||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||       || ||||    
T  35821219 aaaatt-atcgctacgtccagattttattaattttatttttaagttttgtcgttttataaaattcatattcaataagtttcatgttaaaaaaattgtaaa 35821317  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    || ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  35821318 ttctagtatatgaacctttcatgatgttctaa 35821349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 55283115 - 55283531
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||| | || | ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||    ||    
T  55283115 aaatttgtttaatt-atgcttaaattcttgaatttttaaacaatcttttgtacacctattaagaacattacgaaaagtccctctacaaaatattaactca 55283213  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||| |||| | || |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || | || | ||       | |||     
T  55283214 aaatttgatttctacgttcagatttttgttactcttttcttgaacttttgtcgtttaaaaaaat-catatttaaatcttctcctattaaaaaaat-ctat 55283311  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaac 317  Q
     |||||| |||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| || ||||| |     
T  55283312 tttttagcaaatgaacattttataatgttctaaacatgtctcctaaaaatcgttcaaaaatttaagaattcaagaataattaaacaaatttagtttttag 55283411  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattct-tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacc 416  Q
    | || ||||||||| | || ||| | |||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||| | |||    
T  55283412 aaggactaaaattacatgttattttatttttgtagggactaaaaatattattaaaattaagtaaagactaaacttagaagtttccaattttatacggacc 55283511  T
Q  417 aaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  55283512 aaaaacatatttaatccttt 55283531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20650666 - 20650400
Alignment:
Q  146 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtg 245  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   || ||| |||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||    
T  20650666 gttacttttatcttgaacttttgtctattaaaataattcatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaatctttcgtgatg 20650568  T
Q  246 ttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttt 344  Q
    ||| || | |||| |       ||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||  ||    
T  20650567 ttccaaacttgtcccaagaaaatcgctaaaacttttaagattttaaagataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattacatgtaatttgtt 20650468  T
Q  345 tttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20650467 tttgtagggactaaaaaagctattaaaataaagtgaggactaaacttaaaagttccaaattttatagg 20650400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34513305 - 34513123
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  34513305 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgtcaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 34513207  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 203  Q
    ||| || |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  34513206 aaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttat-ttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 34513123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 7617611 - 7617535
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatatta 89  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  7617611 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacatgttaagaacatta 7617535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 44452093 - 44452322
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  |||||||||| || |  ||    
T  44452093 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaa-ttatctca 44452190  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  44452191 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 44452289  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  44452290 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaa 44452322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 3873468 - 3873397
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 84  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  3873468 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcatgttaagaa 3873397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 53569127 - 53569036
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53569127 ttttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 53569036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 434
Target Start/End: Original strand, 3873519 - 3873585
Alignment:
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3873519 taaaattaagtaaaaactaaacttaaaaggtccatattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 3873585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35351672 - 35351551
Alignment:
Q  270 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatta 369  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||    
T  35351672 gttcaaaaatttaagactttaagaataaaaaa-aaactttgttttaacaagggctaaaattacatgtaatttttttttgtaaggactaaaaaaaatgtta 35351574  T
Q  370 aaattaagtaagaattaaactta 392  Q
    |||||||| ||| | ||||||||    
T  35351573 aaattaagcaaggactaaactta 35351551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Original strand, 52948097 - 52948174
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52948097 taaaaaacctattaaaattaagtaaggactaatcttaaaagatcttaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 52948174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 436
Target Start/End: Original strand, 7499085 - 7499165
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  7499085 taaaaaacctattaaaattaagtaaagaataaacttagaagttctcaattttataaggaccaaaaacatatttcacccttt 7499165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13508840 - 13508756
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13508840 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 13508756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 435
Target Start/End: Original strand, 47379512 - 47379591
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47379512 taaaaaaactattaaaattaagtaagggctaaacttagaaggtcccgattttattgggaccaaaaacatatttaaccctt 47379591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 432
Target Start/End: Original strand, 38114558 - 38114624
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38114558 attaaaattaagtaatgattaaacttgaaaggtccttattttatagggaccaaaaacatatttaacc 38114624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 430
Target Start/End: Original strand, 30331614 - 30331690
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttt--ataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30331614 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactgaacttaaaaggtccctattttaaatagggaccaaaaacatatttaa 30331690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 33689616 - 33689705
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  33689616 tttttgtaaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 33689705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 435
Target Start/End: Original strand, 43938286 - 43938355
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43938286 attaaagttaagtaaggactaaacttagaagttctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 43938355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4850066 - 4849974
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4850066 ttttttttagggactaaaagaactatttaaattaagcaaggattaaacttaaaaggtctcaattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 4849974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10085445 - 10085365
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| || |||| ||||| |||||||||    
T  10085445 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaatcatatataacccttt 10085365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11670929 - 11670873
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11670929 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 11670873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Original strand, 14579065 - 14579141
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14579065 taaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtacccaattttatagagatcaaaaacatatttaacc 14579141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44289650 - 44289558
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| || | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  44289650 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaagatcacaattttgtagggaccgaaaacataattaaccct 44289558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 48738481 - 48738397
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  48738481 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggaccaaaaacatat 48738397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7490647 - 7490576
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7490647 ctattaaaattaagtaaggataaaacttaaagaatccaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 7490576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28164010 - 28163783
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |     
T  28164010 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaaattttgaacaattttttgcaca-gtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattat--ct 28163915  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
     || || |||| | | |||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |       ||||||    
T  28163914 caattttatttctgcttccagatttttgttacttttattttcaacttttgtcttttaaaaaaattcatattaaatttatttcatgct-aaataattctaa 28163816  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  28163815 attttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaa 28163783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 434
Target Start/End: Original strand, 6589096 - 6589186
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | | |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  6589096 ttttgtagggactgaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaggatcccaattttgtcgggaccaaaaacatatttaaccct 6589186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 434
Target Start/End: Original strand, 7617648 - 7617730
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7617648 ggattaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggcccatattttatagggatcaaaaatatatttaaccct 7617730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35351822 - 35351735
Alignment:
Q  151 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaaccttt 238  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||       || |||||||||||||||||||||||    
T  35351822 ttttatcttgaacttttgttgatgaaaaaaattcatatttaattcattacatgttacaaaaattttaaattttagtaaatgaaccttt 35351735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 53570980 - 53570890
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  53570980 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 53570890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 53571852 - 53571942
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  53571852 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 53571942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22068070 - 22067977
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22068070 tttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttataaggtatcaattttatagggaccaaaaatatatttaacccttt 22067977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Original strand, 23473803 - 23473895
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||  || | |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23473803 ttttttgtagggactaaagaac-tattaaaattaagtaaggactaaacttcaaaagtctcgattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 23473895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 432
Target Start/End: Original strand, 28448734 - 28448799
Alignment:
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28448734 ttaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatatttaacc 28448799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 28164045 - 28164128
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28164045 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagttaggactaaacttaaaag-tcccaattttatagggaccaaaaacatat 28164128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 47939865 - 47939750
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |  ||    
T  47939865 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttagctttttaagcaattttttgtagacatgttaagaacattactaaaagtttttccgcaaaaaattatctca 47939767  T
Q  120 aaaattgatttatacgt 136  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  47939766 aaatttgatttctacgt 47939750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 11670119 - 11670206
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  11670119 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaacgcttaagttttttaacaattttttgtagatgtgttaggaacattattaaaagttcc 11670206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19522660 - 19522593
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19522660 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaaaacctctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 19522593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 435
Target Start/End: Original strand, 20650730 - 20650809
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  |  | ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20650730 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtttcaattttatagggtacaaaaacatatttaaccctt 20650809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31470934 - 31470847
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||  || | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  31470934 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 31470847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 432
Target Start/End: Original strand, 51395958 - 51396025
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  51395958 tattaaaattaaataaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggattaaaaacatatttaacc 51396025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Original strand, 53423904 - 53423975
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  53423904 ctattaaaattaagtaagaactaaacataaaatatctcaattttatagagaccaaaaacatatttaaacctt 53423975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11670091 - 11670001
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  11670091 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggattaaaaacatatttaaccc 11670001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35821084 - 35821030
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  35821084 taaaaaaactattaaaattaagtatgaattaaacttgaaagatcccaattttata 35821030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42916330 - 42916228
Alignment:
Q  333 aagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||   ||||||||   | |||||| ||||||||||    
T  42916330 aagtaaattttttttgtagggactaaaaaagatattaaaattaagtaaggattaaatttaaaacttctgaattttatacatatcaaaaatatatttaacc 42916231  T
Q  433 ctt 435  Q
    |||    
T  42916230 ctt 42916228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44452057 - 44451975
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  44452057 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttataaggtcacaattttatagggaccaaaaacatat 44451975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44453056 - 44452920
Alignment:
Q  58 aacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttat 156  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||   ||  ||| | ||||||| |||||| || ||||||    
T  44453056 aacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctcaattttttttttctgcgtccagaattttgctacttttat 44452957  T
Q  157 ctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
     || |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  44452956 tttgaacttttg-tctattaaaaaattcatatttaatt 44452920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 25243925 - 25244013
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  25243925 tttttgtaaggacaaaaaaaactaataaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 25244013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Original strand, 33177756 - 33177832
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||| | |||| ||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33177756 taaaaaaaccattaaaattaaataaggactaaatttaaaaaactcctattttatagggaccaaaaacatatttaacc 33177832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48082416 - 48082324
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| || | ||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  48082416 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaagatcacaattttgtagagaccgaaaatataattaaccct 48082324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 521
Target Start/End: Original strand, 51224721 - 51224757
Alignment:
Q  485 aacatgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51224721 aacaagagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 51224757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 11670957 - 11671047
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccct-attttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | |||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  11670957 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa-tgccttaattttatagggactaaaaacaaatttaaccc 11671047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16618928 - 16618865
Alignment:
Q  142 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  16618928 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 16618865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Original strand, 23454819 - 23454850
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23454819 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 23454850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 31049059 - 31049028
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31049059 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 31049028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 43434511 - 43434480
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43434511 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 43434480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 45923549 - 45923518
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45923549 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 45923518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 51863711 - 51863680
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51863711 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 51863680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 51875942 - 51875879
Alignment:
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  51875942 taaaattaagtaagaactaaacttgaaagattccaattttatagggatcaaagacatatttaac 51875879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 521
Target Start/End: Original strand, 54165059 - 54165090
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54165059 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 54165090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4415502 - 4415472
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4415502 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 4415472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6818087 - 6817994
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||   |||||||||||||||||| | || | ||||||| || | | |||||||||| |||||||||||    
T  6818087 aaatttgtttaatt-atgtttaaactcttacatttttgaacaattttttgtatacgttttaagaacataaattaaagttcctccgcaaaaaattg 6817994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Original strand, 16078701 - 16078731
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078701 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 16078731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 25422015 - 25421949
Alignment:
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25422015 ttaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 25421949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 31316512 - 31316423
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31316512 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagg-actaaaaacatatttaaccc 31316423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 37329718 - 37329808
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37329718 tttttgtgaggactaaaacaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgcctcgattttataggtactaaaaacatatttaaccc 37329808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Original strand, 49459991 - 49460021
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49459991 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 49460021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 50824481 - 50824411
Alignment:
Q  14 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 84  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  50824481 caattcaaatttgtttaatttatgcttaatagcttaagtttttgaacaatatttttcagacgtgttaagaa 50824411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1828925 - 1828896
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1828925 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 1828896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 431
Target Start/End: Original strand, 6818136 - 6818209
Alignment:
Q  358 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||  | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  6818136 aaaaaactattaaaattaagtaatgattaaagttaaaaggcctcaattttacaggaatcaaaaacttatttaac 6818209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24235505 - 24235472
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24235505 atgagcaatgatatttgtacatccatttcatgac 24235472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28163204 - 28163139
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttt 407  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  28163204 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagcaaggactaaacttaaaaggtcccaatttt 28163139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32800825 - 32800796
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32800825 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 32800796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 42972711 - 42972666
Alignment:
Q  385 taaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42972711 taaacttaaaagttttcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 42972666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44208847 - 44208758
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  44208847 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaaataagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 44208758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 53323737 - 53323656
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||| | | |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||   ||||| |||||||| |||||||||||    
T  53323737 ggattaaaagaaccattaaatttaagtaaggactaaacttgaaaggtccctataaaatagggaccaaaaatatatttaaccc 53323656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 53569155 - 53569212
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  53569155 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactgttaagtttttttaacaattttttg 53569212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 53571008 - 53571065
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  53571008 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactgttaagtttttttaacaattttttg 53571065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 4550518 - 4550486
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4550518 tgagcaatgatatttatacatccatttaatgac 4550486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Original strand, 8949622 - 8949710
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  8949622 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttaattttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 8949710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10321667 - 10321579
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  10321667 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattgagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 10321579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 433
Target Start/End: Original strand, 16071412 - 16071440
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16071412 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 16071440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 25423007 - 25423095
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  25423007 tttttttaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 25423095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 433
Target Start/End: Original strand, 26903060 - 26903088
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26903060 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 26903088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 34513339 - 34513423
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   || ||||||||||||| | | |||||||||||| | || |||||||||| || ||||||||||    
T  34513339 ttttttatatggactaaaagcacttttaaaattaagtacggactaaacttaaaaggttccaattttatagggacaaaaaacatat 34513423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40532247 - 40532187
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgttttaacagggcctaaaatta 331  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  40532247 ttcaaaaatttaaaagtttaagaataataaacaaattttcatttaatagggactaaaatta 40532187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 47309383 - 47309319
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||  || ||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  47309383 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccttattttatagggacaaaatacatatttaa 47309319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 47463389 - 47463297
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||   |||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  47463389 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaaataaggactaaacttaaaatgtcttaattttatagggatcaaaaacatattaaaccct 47463297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52788960 - 52788873
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  52788960 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttagttttatcttgaacttttgacgttttaaaaaatt-atatttaattcattacatgtt 52788873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 124)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43597779 - 43597358
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43597779 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 43597680  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  43597679 tatcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43597581  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43597580 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaataaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 43597481  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| | || ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43597480 tgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttttagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaagattaaacttgaaaggtccctattttatag 43597381  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  43597380 ggatcaaaaacatatttaaccct 43597358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22378753 - 22378330
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||     
T  22378753 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaactattgagtttttgaacagttttttacagacatgttaagaacgttactaaaagttcctatgcaaaaaaa 22378654  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22378653 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 22378555  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22378554 ttctaaattttagtaaatgtacctttcgtagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 22378455  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||     
T  22378454 tgtaataaggattaaaattagaagtaattcttttttgtaaggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagatccttattttataa 22378355  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  22378354 ggaccaaaaaaatatttaacccttt 22378330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7238871 - 7238450
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  7238871 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaggttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattattaaaaggtcctctacaaaaaat 7238772  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  7238771 tgtcgcataatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaaactttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 7238673  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7238672 ttctaaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgatcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 7238573  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  7238572 tgtaacagggactaaaattcgaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaaataaggattaaacttagaagttgcaaattttatag 7238473  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  7238472 ggaccaaaaacatatttaaccct 7238450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 47791838 - 47792268
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47791838 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 47791937  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  47791938 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 47792037  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47792038 -tctaaattttggtagatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaacattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 47792136  T
Q  312 tt-------taacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttcccta 403  Q
    ||       |||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |    
T  47792137 tttaagttgtaacaggtactaaaattagaagtaattttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaa 47792236  T
Q  404 ttttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47792237 ttttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 47792268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 38158948 - 38159371
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaa----ctcttgagtttttgaacaattttttg-caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||    |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38158948 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattaactcttgagtttttgaacaatttttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaa 38159047  T
Q  108 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 207  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38159048 aaaattgtcgcaaaatttgatttctacctccagattttgttaattt-atctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaa 38159146  T
Q  208 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaac 306  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38159147 aaaa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtgtaaggataattaaacaaac 38159245  T
Q  307 tttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattt 406  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |   ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  38159246 tttgttgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtaaggactaaatattttattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaaatccctattt 38159345  T
Q  407 tataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  38159346 tatagggaccaaaaacatatttaacc 38159371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 396
Target Start/End: Original strand, 4926372 - 4926758
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc---tgcaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||    
T  4926372 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttaaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctactatgcaaaa 4926471  T
Q  110 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 209  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  4926472 aattgtcgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaacttgtgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaa 4926570  T
Q  210 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactt 308  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4926571 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactt 4926670  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaag 396  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4926671 tgttgtaacagagactaaaattagaagtaatttttttttatatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaatttaaaag 4926758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 1961897 - 1962317
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  || || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1961897 tcaattcaaatttgtttcatttatgcttaaatttttgagtttttgaacaatttttcacagacgtgtttagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaat 1961996  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttt-taaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||          
T  1961997 tgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgtttaaaaaaaatacatatttcattcgtttcatgtt-aaaaa 1962095  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1962096 attctaaattttaataaattgacctttcatagtgttctatacttgtctcaaaaatatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacgaactttg 1962195  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1962196 ttgtaataacgactaaaattagaagtaattcttttttgtaggaattaaaaaacctattaaaattaaataataattaaacttaaaagttctcaattttata 1962295  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |  || ||||||||||||||||    
T  1962296 gagacgaaaaacatatttaacc 1962317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Original strand, 18059006 - 18059406
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18059006 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagttttcgaacaaatttttgcagacgtgttaagaaagttactaaaggttcctctgcaaaaaat 18059105  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  18059106 tgtcgcaaaatttgatttttatgtttagattttgttaattttatctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 18059204  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  18059205 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttg--tccaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaatttgtt 18059302  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  18059303 gtaacagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagagactagaaaacctattaaaattaagtatggactaaacttagaagtttccaattttatagg 18059401  T
Q  413 aacca 417  Q
     ||||    
T  18059402 gacca 18059406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 44 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10620785 - 10620392
Alignment:
Q  44 ctcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagat 142  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  10620785 ctcttgagtttttggataatattttgtatacatgttaagaacattactaaaagcttctctgcaaaaaaattgttacaaaatttgatttatacgtccatat 10620686  T
Q  143 tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcata 242  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10620685 tttgttacttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaacttttcata 10620587  T
Q  243 gtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattc 341  Q
    |||||| || | |||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||     
T  10620586 gtgttcaaaacttgtcttaatgaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttattttagcaaggactaaaattagaagtaatta 10620487  T
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10620486 ttttttgtacggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttttcaattttatagggaccaaaaagatatttaacccttt 10620392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14990834 - 14990421
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  14990834 aaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaggaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgta 14990735  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||       || ||||    
T  14990734 aaatttgatttctacattcagattttgttaattttatctttaacttttg-ccttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattataaa 14990637  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||       || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14990636 ttttagt-aatgaacctttcatagtgttctaaacttctctcaaaaaaatcattcaaaaacttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaaca 14990538  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaa 418  Q
     || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  | |||||||| | | |||    
T  14990537 aggactaaaattagaagtaattttattttgtagggactataaaacctattaaaattaaataaggactaaacttaaaaattatcaattttataaggatcaa 14990438  T
Q  419 aaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14990437 aaacatatttaatcctt 14990421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15420445 - 15420032
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  15420445 aaatttgtttaatttattcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaggaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgta 15420346  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||       || ||||    
T  15420345 aaatttgatttctacattcagattttgttaattttatctttaacttttg-ccttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaattataaa 15420248  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||       || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15420247 ttttagt-aatgaacctttcatagtgttctaaacttctctcaaaaaaatcattcaaaaacttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaaca 15420149  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaa 418  Q
     || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  | |||||||| | | |||    
T  15420148 aggactaaaattagaagtaattttattttgtagggactataaaacctattaaaattaaataaggactaaacttaaaaattatcaattttataaggatcaa 15420049  T
Q  419 aaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||| ||||    
T  15420048 aaacatatttaatcctt 15420032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 96 - 432
Target Start/End: Original strand, 6330978 - 6331315
Alignment:
Q  96 gttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6330978 gttcctatgcaaaaaattgtcgtaaaatttgatttctatgtccagatttttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaatt 6331077  T
Q  195 cgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaagga 294  Q
    | |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  6331078 catttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagga 6331176  T
Q  295 taattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaa 393  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6331177 taattaaacaaactttgttgtaataaggactaaaattagaagtaattcttttttgttgggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttga 6331276  T
Q  394 aagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6331277 aaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaacc 6331315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Original strand, 6588687 - 6589020
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6588687 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctccaaaaaat 6588786  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  6588787 tgttgcaaaatttgatttctacgtccagaatttgttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 6588885  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6588886 ttctaaattttagtaaatgaacctttcctagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 6588985  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttt 346  Q
      ||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  6588986 cgtaacaaggactaaaattagaagtaatttttttt 6589020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27727485 - 27727098
Alignment:
Q  53 ttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaa- 150  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  27727485 ttttgaacaatttttttgcacacgtgttaagaacattactaaaaattcctctacaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaaa 27727386  T
Q  151 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn-ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttct 249  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |        |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  27727385 ttttatcttgaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatggtaaaaaaaattctaaatttaagttaatgaacctttcttagtattct 27727286  T
Q  250 aaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt- 347  Q
    || | ||||||       |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  27727285 aaacttgtctcaaaaaaatcgtacaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaatagggactaaaattagaagtaatttttttttt 27727186  T
Q  348 gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27727185 gtagggacttaaaaacctattaaaattaagtaaggagtaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 27727098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46044580 - 46044225
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtt-gc 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||  | ||    
T  46044580 aaatttgtttaattaatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaatgttcatctgtaaaaaatttatcgc 46044481  T
Q  119 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    |||| || ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  46044480 aaaattttatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcatttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttctaa 46044382  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaac 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  46044381 attttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaaaaaactttgttttagc 46044282  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatta 375  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  46044281 agggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaacctactaaaatta 46044225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4900158 - 4899739
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||||||||  || ||||||    
T  4900158 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagttttt-aacaattttttgcagacttgtttagaacattaataaaagttccttcgcgaaaaat 4900060  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||          
T  4900059 tatcgcaaaatttgatttctacatccagattttgttactttttatctttaagttttgcggtttgaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt--agaa 4899962  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4899961 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaataaactttg 4899862  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    ||||||||||  ||||||||   | ||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||    
T  4899861 ttttaacaggtactaaaattgtcactaatt-ttttatatagggattaaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacgtagaagttatcaattttata 4899763  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    || | ||||||| |||||||||||    
T  4899762 gggatcaaaaacctatttaaccct 4899739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11397252 - 11396832
Alignment:
Q  14 caattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| || ||| |||||||||||| || |||||| |    
T  11397252 caattcaaatttgtttaatttatgttcaaactcttaagtttttgaacaatcttttgcatacgtgttaaaaacattgctaaaagttcctttgtaaaaaaat 11397153  T
Q  114 gttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
     | | |||| ||||||| || ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |       |    
T  11397152 atcggaaaatttgatttctatgtttagattt-gttacttttatctttaacttttgacgttttaaaaaattcatatttaatttgtttcacgctaaaaaaat 11397054  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtt 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11397053 tctaaattttagtaaatgatccattcacagtgttataaacctgtcttacacaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttatt 11396954  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||| || || || |||||||| |    
T  11396953 ttagcagggactaaaattataagtaatt-ttttttgtagggattaaaaagactatttaaattaagtaaggactaaacttagaaatttccaattttataag 11396855  T
Q  413 aaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
     | |||||| |||||||||||||    
T  11396854 gatcaaaaatatatttaaccctt 11396832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35482351 - 35482055
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35482351 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactattgagtttttgaacaattttttgcatacatgttaagaaaattattaaaagttcctctgcaaaaaat 35482252  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||| |||             
T  35482251 tgtcctaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttagcg-tttaaaaaattcatatttaattcatttaatg---aaaaaa 35482156  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35482155 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaacagtttaaagataattaaacaaactttgt 35482056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 43574239 - 43574657
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  43574239 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagtttttgaacaattttttgcagacatgtttagaacattactataagttacttcgcaaaaaat 43574338  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| ||||||| ||| || | ||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||          
T  43574339 tatcgcaaaatttgatttctacatctaaattttattactttttatctttaacttttgtcattttaaaaaatttatatttaattcgtttcaagtt-agaaa 43574437  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | |||| |       ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  43574438 attctaaattttaataaatgaacattttatagtgttctaaacttgtcacaaaaaaatcgttcaaacattttagagtttaagaataattaaacaaaatttg 43574537  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |    
T  43574538 ttttagcagggattaaaattataagtaaattttttttgta-ggact-aaaaacatattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttccaaattttaca 43574635  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    || ||| |||| |||||||||||    
T  43574636 gggacc-aaaatatatttaaccc 43574657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44168074 - 44167730
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |  | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44168074 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttgt--agacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 44167977  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | | |||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||           
T  44167976 tatcgtaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gttttaaaaaattcatatttaattcatttcatgtt-aaaaaa 44167891  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44167890 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttataaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 44167791  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  44167790 tttagcagtgactaaaattagaagtaaattttttttgtagggactaaaaaacttactaaaa 44167730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15653085 - 15652674
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||     
T  15653085 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttacaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccacaaaaaatta 15652986  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnnnt 213  Q
    | | |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||             
T  15652985 tcgtaaaatttgatttctacgtccaaattttgttact------tttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaatttgtttcatattaaaaaaaaa 15652892  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtt 312  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15652891 tctaaattttaataaataaacctttcatattgttctaaacgtatctcaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt-tt 15652793  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    ||| ||||   |||| ||| | |||    |||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15652792 ttagcaggaattaaacttatatgta---tttttttgtacagactaaaaaaactattcaaattaagttaggactaaacttaaaagtttacaattttatagg 15652696  T
Q  413 aaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  15652695 -atcaaaaacatatttaaccctt 15652674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Original strand, 46330799 - 46331069
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  46330799 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaactctcaagttttttaacaattttttgtagacgcgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 46330898  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||           
T  46330899 tatcgcaaaatttgatttatatgtcgagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttacatgtt-aaaaaa 46330997  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaag 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||    
T  46330998 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaag 46331069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 38199062 - 38199382
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||       
T  38199062 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattcctaaaagttccgccgcaaaat-- 38199159  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  38199160 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaattttttttgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 38199247  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgtt 312  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38199248 ttctaaattttattgattgaacctttcatagtattctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaactttgtt 38199347  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt 347  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38199348 ttagtagggactaaaattagaagtaattttttttt 38199382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 432
Target Start/End: Original strand, 38598974 - 38599389
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || || |||||||||  ||| |||| | |||||   |||||||  | |||    
T  38598974 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatttttcacagacgtgttaagaacgttattaaatggtcctccaaaaaaaata-tcgca 38599072  T
Q  120 aaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  38599073 aaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaaattttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttata 38599171  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||     
T  38599172 gattttagtaaatgaatctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaagataattaagcaaaatttattttag 38599271  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatgg--attaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaa 414  Q
    ||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||   ||||||||||||    
T  38599272 cagtgactaaaattataagtaatttttttttttgtggggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtcgtaattttataggaa 38599371  T
Q  415 ccaaaaacatatttaacc 432  Q
     |||||||||||||||||    
T  38599372 tcaaaaacatatttaacc 38599389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21109642 - 21109449
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21109642 tcaattcaaatttgtttcatttatgcttaaactcttaaatttttgaacaattttttgcatacgtgtttagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 21109543  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgtta-attttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    | | |||||| ||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21109542 tatagcaaaatttgatttctacatcgagattttgttactttttatctttaatttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 21109449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 362
Target Start/End: Original strand, 3495655 - 3495992
Alignment:
Q  12 atcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||    
T  3495655 atcaattcaaatttgtttaatttattcttaaacgcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaa 3495752  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          
T  3495753 tt-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa 3495841  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| | || |||       || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3495842 att-taaattttattaattgaatctttcatagtgttttaaacttgcctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 3495940  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  3495941 ttttagtagggactaaaattagaagtgatttttttttgtagggactaaaaaa 3495992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 433
Target Start/End: Original strand, 37539849 - 37540206
Alignment:
Q  78 ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgtttta 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||  | ||| |  |||| |||  ||||||||| ||||||||| |||| |    
T  37539849 ttaagaacattactaaaagttcctctgtaaaaaattatctcaaaatttgatttccaagtctaattttttgttgcttttatcttgaacttttgtcgtttaa 37539948  T
Q  177 aaaaa-ttcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaa 275  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   | ||||       ||||||||    
T  37539949 aaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttgaaatgttctaaatatatctcggaaaaatcgttcaa 37540047  T
Q  276 aaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatt 374  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37540048 aaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgttttagcagggactaaaattacatgtaaatattttttgtatggattaaaaagactattaaaatt 37540147  T
Q  375 aagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||| | |||||||| |||||  | |||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  37540148 aagtaaggactaaacttataagttttcaattttatatggaccaaaaatatatttaaccc 37540206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1544769 - 1544347
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||  || || ||||||||| |||| |||||||| ||   |||||  |    
T  1544769 tcaattcaaatttgtttgatttatgcttaaactttaaagttgttgaacaatttttc-catacgtgttaagaacattattaaaagttacttcacaaaagct 1544671  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | | |||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||           
T  1544670 tatcgtaaaatttgatttctacatcccgattttgttactttcatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcaagttaaaaaa- 1544572  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||| |||| |||| ||||||   |||||||||||||||| | || |||       |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1544571 ttcaaaatcttagcaaatgagtttttcatagtgttctaaacttgactcaaaaatatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaaatttgt 1544472  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattctt-ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    |||| || ||  |||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  1544471 tttagcaaggattaaaattctaagtaatttttattttgtatggactaaaaa--ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttctaattttata 1544374  T
Q  411 ggaaccaaaa-acatatttaacccttt 436  Q
     | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1544373 aggaccaaaatacatatttaactcttt 1544347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43084137 - 43083788
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| || | ||||||       
T  43084137 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtaccgccgcaaaat-- 43084040  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               ||||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||           
T  43084039 -----------ttgatttatattttcatattttattacttttatctttatctttaattgttttcaaaaattcatatttaatttttttcatgttaaaaaa- 43083952  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43083951 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 43083852  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatgga-ttaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  43083851 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttttgtagggactaaaaaaacctattaaaa 43083788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 44080958 - 44081366
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||   |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  44080958 tcaattcaaacttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcaaacatgcttttgcaaacgtgttaagaacaatactaaaagttcctccgcaaaaaat 44081056  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
      | |||||| || |||| |||||||| | |||||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||          
T  44081057 gatcgcaaaatttaatttctacgtccatatttttgttacttttatcttgatgtttagtcgttttaaaaaattcatatttaattaatttca-attttaaaa 44081155  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        ||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  44081156 attttaaattttagtaaatgaacctttcatagtattctaaatttgtctaaaaaaattcgctcaaaaatttaagaatttaagtataattaaacaaactttg 44081255  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    | |||||| || ||||||||| ||||||           || || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44081256 tattaacaaggactaaaattataagtaa-----------attgactaaaaaagctattaaaattaaataaaaattaaacttagaagttcccaattttata 44081344  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  44081345 gggaccagaaacatatttaacc 44081366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29156260 - 29155900
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||    
T  29156260 tcaattcaaatttatataatttatgcttaaactcttaagtttttgaacaatttcttgtagacatgttatgaacatta-taaaaggtcctccacaaaaaat 29156162  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||           
T  29156161 tatcgcaaaatttgatttctatgtccagattctattgcttttagctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcaaatt-aaaaaa 29156063  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttc----atagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaact 307  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | |    ||| |||||||| | ||| |        | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29156062 ttctaaatttttgtaaataaaccgtccatatataatgttctaaacttgtttaaaaaaaattgttcataaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 29155963  T
Q  308 ttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaa 371  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||  | |||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  29155962 ttgttctaatagggactaaaattagaagtacat-ttttttttagggactaaaaaaactattaaa 29155900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36019985 - 36019811
Alignment:
Q  86 attactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc 184  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36019985 attactaaaagtttctatgcaaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtctagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattc 36019886  T
Q  185 atatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc 260  Q
    |||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||    
T  36019885 atatctaattcgtttcatgtt-aaaaagttctaaattttagtaaatgaacatttcataatgttataaacttgtctc 36019811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4883908 - 4883775
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4883908 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaataattttttacagacgtgttaagaacattactaaacgttcctatgcaaaaaat 4883809  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg 146  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4883808 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttg 4883775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 33624788 - 33625144
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctg-------- 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | | || ||||||||| |||||||||| ||| | ||            
T  33624788 tcaatttaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttt-gtagacgtgttaagaacattactaaaaattcatatgtccaaatt 33624886  T
Q  105 -----caaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgttt 199  Q
         ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||             ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33624887 atccgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatc-------------gttttcaaaaattcatatttaattcgttt 33624973  T
Q  200 catgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt 299  Q
    ||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |        ||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  33624974 catgttaaaaaa-ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaaaaatc--tctaaaatttaagagtttaaggataatt 33625070  T
Q  300 aa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  33625071 aaacaaactttgttttagcaaggactaaaattagaagtaaattttgtttgtagggactaaaaaacctactaaaa 33625144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 9633461 - 9633040
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  9633461 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttt-gaacaattttttgcagatattttatgaacattactaaaagttcctccgcaaaaattta 9633364  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
    |  |||||  |||||| ||  |||| ||||| |||| ||||| ||||||    | | |||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||       |    
T  9633363 tctcaaaatgtgatttttatatccaaatttttgttacttttaactttaaaaaatttcgtttaaaagaattcatatttaatttatttcaagttaaaaa--t 9633266  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaa-tttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||        || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9633265 tatgaattttagtaaatgaaccttttataatgttataaacttgtctaaaaaatatcattaaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 9633166  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt-gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    |||| |||||  |||||||| | |||| | |||||| ||| ||| ||||||   ||||||||||||||||  | ||||||||  ||||    ||||||||    
T  9633165 tttagcagggattaaaattacatgtaaatatttttttgtagggactaaaaatgttattaaaattaagtaaagactaaacttattagtttttaattttata 9633066  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  9633065 ggaaacaaaaacatatttaacccttt 9633040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45958815 - 45958663
Alignment:
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||    
T  45958815 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaactttgttttagca 45958716  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  45958715 gaaactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactaaaaaacctactaaaa 45958663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 434
Target Start/End: Original strand, 28924698 - 28924914
Alignment:
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| | ||||||       |||||||||| ||||||| || || ||||||||| |||| || ||||  |||    
T  28924698 ttttagtaaatgaacattttataatgttttaaacatgtctccaaaaaatcgttcaaaactttaagaattcaaagataattaaacaaatttagtttataca 28924797  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattct-tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
     || ||||||||| | |||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||    
T  28924798 aggactaaaattacatgtaattttctttttgtagggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttcccaattttatagggatca 28924897  T
Q  418 aaaacatatttaaccct 434  Q
    |||| ||||||||||||    
T  28924898 aaaatatatttaaccct 28924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45958953 - 45958811
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | | || |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45958953 tcaattcaaatttgtttaatttctgcttaaactcttaagttttt-aacaatttttttgtagacgtgttaataacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 45958855  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatttta 155  Q
    || || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  45958854 ttatttcaaaatttgatttatatgtccagattttattactttta 45958811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10463497 - 10463168
Alignment:
Q  105 caaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 203  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  10463497 caaaaaattatttgaaaaatttatttctacgtccagatttttgttacttttatcttaaatttttgtcttttaaaaaaattcatatttaattaatttcat- 10463399  T
Q  204 ttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-ac 302  Q
    ||       |||||||||   ||||| ||||||||  || |||| ||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |     
T  10463398 tttaaaaaattctaaattg--gtaaacgaaccttttgtaatgttttaaacttgtctcaaaaagatcgttcaaaaatttaagagtttaag-ataatcagag 10463302  T
Q  303 aaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccct 402  Q
    |||||||||||||| || | |||||| || | |||| |  ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |      
T  10463301 aaactttgttttaatagtgactaaaactacatgtaaattatttttatagggactgaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttcaa 10463202  T
Q  403 attttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||| ||  || ||||||||||||||||||||    
T  10463201 attttacagagactaaaaacatatttaacccttt 10463168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16081056 - 16080918
Alignment:
Q  19 gaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 118  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  16081056 gaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcgaacaattatttgtatacatgttaaaaatattactaaaagttcctctgcaaaaaagtatctc 16080958  T
Q  119 aaaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatc 157  Q
    |||  ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  16080957 aaattttgatttctacatccagatttttgttacttttatc 16080918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1066691 - 1066517
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  |  ||    
T  1066691 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatatgcaaaaaatgatctca 1066593  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  1066592 aaattttatttctacgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 1066517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 372
Target Start/End: Original strand, 15130859 - 15131061
Alignment:
Q  162 acttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcn 261  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||      
T  15130859 acttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttaatatttaaaaa-ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaa 15130957  T
Q  262 nnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaa 360  Q
           ||||||||| |||||||        |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  15130958 aaaaaaacgttcaaaagtttaaga--------ataattaaacaaactttgttttagcaaggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaa 15131049  T
Q  361 aacctattaaaa 372  Q
    |||||| |||||    
T  15131050 aacctactaaaa 15131061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Original strand, 7238921 - 7238992
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7238921 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagattccaattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 7238992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6588638 - 6588568
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6588638 ctattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 6588568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Original strand, 6589279 - 6589371
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  6589279 ttttttgta-ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaattttatatggaccaaaaacataattaaccctt 6589371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 36020090 - 36020005
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  36020090 tcaatttaaatttgtttaatttatacttaaactcttgagtttttaaacaattttttacaaatgtgtcaagaacattactaaaagtt 36020005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 8832715 - 8832946
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa-tattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| |  ||| ||||| |||||| |||||||| ||| | || |||| |  |    
T  8832715 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagatttttaacaattttttgcacaagtgtcaagaactattacgaaaagttcatctccgaataattatctc 8832813  T
Q  119 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||| || |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |        ||||    
T  8832814 aaaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgctaaatagg-tcta 8832912  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8832913 aattttagtaaatgaaccttttgtaatgttctaa 8832946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Original strand, 14990890 - 14990962
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14990890 ctattaaaattaggtaaggattaaacttagaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 14990962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Original strand, 15420501 - 15420573
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15420501 ctattaaaattaggtaaggattaaacttagaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 15420573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12621861 - 12621631
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  12621861 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttttagcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 12621763  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       || |||    
T  12621762 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaactttcgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaattt-taa 12621664  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  12621663 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaa 12621631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Original strand, 22378781 - 22378874
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22378781 ttttttttagggattaaaagaactattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagacctctattttataggga-caaaaacatatttaacccttt 22378874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 27728102 - 27728172
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27728102 ctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaacgtcccaattttatagggaccaaaaatatatttaaccct 27728172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 431
Target Start/End: Original strand, 4883960 - 4884025
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4883960 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctattttataggaatcaaaaacatatttaac 4884025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 27728051 - 27727998
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 68  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27728051 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttt 27727998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8832681 - 8832597
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8832681 ttttttatatggaccaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 8832597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 18798913 - 18798829
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  18798913 ttttttatatggaataaaaacactattaaaattaagtaaggattaaacttataaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 18798829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38158898 - 38158830
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38158898 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggcccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 38158830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 38595316 - 38595400
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38595316 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattcccaattttatagggaccaaaaacatat 38595400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Original strand, 40304521 - 40304597
Alignment:
Q  350 atggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40304521 atggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 40304597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8081760 - 8081698
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8081760 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttataggtaccaaaaacatat 8081698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 11397295 - 11397365
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11397295 ctatttaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttattggcaccaaaaacatatttaaccct 11397365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12908639 - 12908565
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12908639 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 12908565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 430
Target Start/End: Original strand, 15654429 - 15654495
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15654429 ctattaaaattaagtatggaataaacttaaaaggtccctattttataaggaccaaaaacatatttaa 15654495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37107650 - 37107568
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37107650 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 37107568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38199034 - 38198944
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38199034 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 38198944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 113
Target Start/End: Original strand, 8081814 - 8081906
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  8081814 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaatt 8081906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38199864 - 38199807
Alignment:
Q  12 atcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38199864 atcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 38199807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Original strand, 21109692 - 21109764
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||    
T  21109692 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacaaggactaaaaacatatttaacccttt 21109764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 36019776 - 36019720
Alignment:
Q  325 aaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaag 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  36019776 aaaattagaagtaattattttttgtaggaactaaaaaacctattaaaattaagtaag 36019720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47139830 - 47139713
Alignment:
Q  215 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||       || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47139830 ctaaattttagtaaatgaaccttgcataatgttttaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaaatgtttaaggataattaaacaaaatttgttt 47139731  T
Q  314 taacagggcctaaaatta 331  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  47139730 tattaggggctaaaatta 47139713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 251
Target Start/End: Original strand, 1065769 - 1065928
Alignment:
Q  92 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattt 190  Q
    |||||||  ||||||||||||| |  ||||| || |||  |||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  1065769 aaaagtttatctgcaaaaaattatctcaaaattttattcctacgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatattt 1065868  T
Q  191 aattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  1065869 aatttatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaacgaacctttagtaatgttctaa 1065928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1260113 - 1260023
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1260113 ttttttatagggactaaaaaaacaattaaaattaagcaaggactaaacttaaaatatcccaattttatagggaacaaaaacatatttaacc 1260023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 12621897 - 12621979
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||    
T  12621897 ttttatatggactaaaaatactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaaatttatagggaccaaaaacatat 12621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16080814 - 16080653
Alignment:
Q  274 aaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggattaaaaaacctatta 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | || |||||| | ||||   || |||||| || | | ||||||| ||||||    
T  16080814 aaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagcatagactgaaattacatgtaattttttttttttataggtactaaaaaatctatta 16080715  T
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    || ||||||||| |   || ||| || ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16080714 aatttaagtaagga--caaattataatttcccgattgtataggaattaaaaacatatttaaccc 16080653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18058957 - 18058887
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18058957 ctattaaaattaagtaagcactgaacttaaaagatcttaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 18058887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 37107686 - 37107916
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| ||   |||||||||||| |   |    
T  37107686 aaatttgcttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaattttaactgcaaaaaattatctta 37107784  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||  |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  37107785 aaattttattcctgcgtccagatttttgttgcttttattttgaacttttgtctttttaaaaaatttatatttaatttatttcatgtt-gaaaaattctaa 37107883  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  37107884 attttagtaaacgaacctttagtaatgttctaa 37107916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 38593281 - 38593358
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  38593281 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcaaaagtgttaagaacattacgaaaagtt 38593358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 47791808 - 47791717
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  47791808 ttttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactgaacttaaaaggtcccaattttatagggacc--gaacatatttaaccctt 47791717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1961848 - 1961779
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1961848 ctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaaattccaattttataagaacgaaaaatatatttaaccc 1961779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 436
Target Start/End: Original strand, 10620847 - 10620924
Alignment:
Q  359 aaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||  || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10620847 aaaaactattaaaattaaataaggattaaacttcaaatatcacaattttataaggaccaaaaacatatttaacccttt 10620924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 430
Target Start/End: Original strand, 12932878 - 12932967
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaa-acctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12932878 ttttttatagggattaaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtcttaattttatagggaccaaaaacatatttaa 12932967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 433
Target Start/End: Original strand, 35482388 - 35482469
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  | |||| ||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35482388 ggattaaaagaactattaaaattaagtaatgactaaatttaaaatatcctaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 35482469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42974394 - 42974165
Alignment:
Q  22 atttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 121  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| || |  ||||    
T  42974394 atttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttaaacaattttttgcacaagtgtcaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaacttatctcaaa 42974296  T
Q  122 aattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgt-tgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    | || |||| | |||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||  || ||||||       |||||||    
T  42974295 attttatttctgcgtccagatttttgttacttttatttcaaacttttgtcttttaaaaaaaaatcatatttaatttattccatgtt-aaataattctaaa 42974197  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  42974196 ttttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaa 42974165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33624760 - 33624672
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  33624760 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 33624672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 37108686 - 37108538
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  37108686 aaatttgcttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttt--gcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 37108590  T
Q  120 aaaa-ttgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgt 169  Q
    |||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||    
T  37108589 aaaattttatttttccgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgt 37108538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 38593247 - 38593164
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38593247 ttttttatatggactcaaaacactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 38593164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38598940 - 38598848
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||   ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  38598940 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaaggtcgtaattttgtagggaccgaaaacataattaaccct 38598848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 42974605 - 42974689
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  42974605 ttttttatatgaactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggataaaaaacatat 42974689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3496478 - 3496423
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3496478 tcaatttaaatttgtttaattcatgcttaaactcttaagttttttaacaatttttt 3496423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35482043 - 35481964
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | | |||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35482043 taaaaaagctattaaaattaaataaggactgaactcagaagttcctaattttatagggaccaaaaacatatataaccctt 35481964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 43083299 - 43083212
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  43083299 tttttgtaagggttaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggattaaaaacatatttaa 43083212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1065662 - 1065580
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  | |||| |||||| |||| | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1065662 ttttatatggactaaaaacacaattataattaattaaggactaaacttaaaatgtcccaattttataggaaccaaaaacatat 1065580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 3496506 - 3496596
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3496506 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggacaaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 3496596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37537459 - 37537369
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||  || | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37537459 ttttttttaaggactaaaaatactattaaaattaagtaaggactgaacttaaaaaatctcaattttataaggaccaaaaacatatttaacc 37537369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 38199891 - 38199981
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  38199891 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaatatatttaaccc 38199981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43574190 - 43574120
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || | | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43574190 ctattaaaactaagtaaggattatacttaaaaggtctcaactttatagggactaaaaacatatttaaccct 43574120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 46330771 - 46330681
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46330771 tttttataaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 46330681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 251
Target Start/End: Original strand, 38594592 - 38594750
Alignment:
Q  93 aaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |  ||||| || |||||| |||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  38594592 aaagttcatctccaaaaaattatctcaaaatttaatttatgcgtctagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttg 38594691  T
Q  192 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    |||  ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  38594692 atttatttcatgct-aaataattctaaattttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaa 38594750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44167113 - 44167024
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  44167113 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 44167024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45958077 - 45957988
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  45958077 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 45957988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 15131652 - 15131740
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  15131652 tttttgtaaggactaaaacaacgattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 15131740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Original strand, 37537487 - 37537542
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 71  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37537487 aattcaaatttggttaatt-atgcttaaactcttaagtttttgaacaattttttgca 37537542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 431
Target Start/End: Original strand, 4900199 - 4900274
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| ||| || ||| | |||||||||    
T  4900199 taaaagacctattaaaattaagtatggattaaacttaaaaggtctcaattttacagggactaaatatatatttaac 4900274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 8082586 - 8082536
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgca 71  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8082586 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttgagattttgaacaattttttgca 8082536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 15130711 - 15130762
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatt 64  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  15130711 tcaatttaaatttggttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaatt 15130762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 432
Target Start/End: Original strand, 15492893 - 15492940
Alignment:
Q  385 taaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15492893 taaacttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatatttaacc 15492940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 431
Target Start/End: Original strand, 33625730 - 33625817
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  33625730 ttttgtaaggactaaaacaacgattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 33625817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44080917 - 44080838
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||| || | |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  44080917 taaaaaaattattaaaattaaataaggactaaacttagaaggtctcaattttatagggattaaaaacatatttaaccctt 44080838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 436
Target Start/End: Original strand, 43597829 - 43597899
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||| | || |||| ||||  ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  43597829 attaaaattaagtaaggactagacttgaaaggccccgattttttagggatcaaaaacatatttaacccttt 43597899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 45958981 - 45959071
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  45958981 tttttctaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggaataaacttaaaatgccccaattttatatagactaaaaacatatttaaccc 45959071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 430
Target Start/End: Original strand, 46044636 - 46044702
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  46044636 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 46044702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17157318 - 17157285
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17157318 atgagcaatgatatttgtacatcaatttaatgac 17157285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21973546 - 21973517
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973546 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 21973517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23594951 - 23594922
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23594951 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 23594922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33050368 - 33050335
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33050368 atgagcaatgatatttgtacatccatttcatgac 33050335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40304072 - 40304019
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40304072 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa 40304019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 43083327 - 43083384
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgag-tttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  43083327 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagtttttttaacaattttttg 43083384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 116815 - 116783
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  116815 tgagcaatgatatttgtacatccatttcatgac 116783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 15131624 - 15131588
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttg 49  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15131624 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttg 15131588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25270585 - 25270533
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25270585 tttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa 25270533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26041494 - 26041462
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26041494 tgagcaatgatatttgtacatccattttatgac 26041462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Original strand, 33881591 - 33881623
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatga 520  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33881591 atgagcaatgatatttgtacattcatttaatga 33881623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 40304479 - 40304416
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 84  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  40304479 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaaatattaagaa 40304416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 46331690 - 46331778
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  46331690 tttttgtaaggactaaaataactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 46331778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 134)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 30719479 - 30719899
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  30719479 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaagacgtgttaagaacattactaaaagtttctatgcaaaaaa 30719578  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  30719579 ttgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgattcatgttaaaaaa 30719678  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30719679 -ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 30719777  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  30719778 ttgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaaataaggattgaacttgaaaggtccctattttata 30719877  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  30719878 gggatcaaaatcatatttaacc 30719899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26805786 - 26805367
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26805786 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttgaatttttaaacaattttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaaa 26805688  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
      |  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  26805687 attcacaaaatttgatttttacgttcagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 26805588  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26805587 atataaattttggtaaatgaacatttcttagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatagttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 26805488  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  26805487 tgtaatagggattaaaattagaagtaattcttttttgtaaggattaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatag 26805388  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  26805387 ggaccaaaaacatatttaacc 26805367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 435
Target Start/End: Original strand, 35530781 - 35531209
Alignment:
Q  8 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35530781 catcatcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagcttttaaacaatcttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcccctgcaa 35530880  T
Q  108 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 207  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||      
T  35530881 aaaaatgttgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttatcattttaaaaaaattatatttaattcgtttcttgttaa 35530980  T
Q  208 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaac 306  Q
          |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35530981 aaaaaatctaaattttggtaaatgaacatttcatagtgttctaaatttgtct-taaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaac 35531079  T
Q  307 tttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatt 405  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||    
T  35531080 tttgttgtaacagggactaaaattagaagtaattttttttttctaaggactaaaaaacttattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaatt 35531179  T
Q  406 ttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35531180 ttatagggaccaaaaacatatttaatcctt 35531209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 19791239 - 19791661
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19791239 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 19791338  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  19791339 tgtcgcaaaatttgatttctacctccaaaatttgttaattttatctttaacttttgtcgttataaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 19791437  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |         |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19791438 ttctaaattttagtaaatgaacatttcatagtgttataaacttg-cataaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgt 19791536  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
      ||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||| | |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  19791537 cgtaacaaggactaaacttagaagtaattttttttttgtagggactaaataacctataaaaattaaataaggactaaatttagaagttctcaattttata 19791636  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    || |||||||||||| |||| ||||    
T  19791637 gggaccaaaaacataattaatcctt 19791661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 52493528 - 52493949
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52493528 tcaattcaaatttgattaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 52493627  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  52493628 tatcgcaaaatttgatttctacttccagattttattacttttatctttaagttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 52493726  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52493727 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccttgtctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 52493826  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||||| |  ||||||||  ||    |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||    
T  52493827 ttttaggagggactaatattagaagtaaatgatttttgtaacgacggcaaaaactattaaaattaagtaaggatcaaacttagaagtttccaattttata 52493926  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
     | |||||||||||| |||||||    
T  52493927 aggaccaaaaacataattaaccc 52493949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26020692 - 26020275
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  26020692 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaaatcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagctcctctacataaaattg 26020593  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 214  Q
    | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||       ||    
T  26020592 tcgcaaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaaattttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-aaaaaatt 26020494  T
Q  215 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |       ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  26020493 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcacaaaaaaatcgttcaaaaattcaagagtttaatgataattaaacaaactttgttg 26020394  T
Q  314 taacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagga 413  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||       || || ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||  |    
T  26020393 taacagagactaaaattagaa-aaaaaaaaaattatagggactacaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttataaaa 26020295  T
Q  414 accaaaaacatatttaaccc 433  Q
    || |||||||||||||||||    
T  26020294 actaaaaacatatttaaccc 26020275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 43504775 - 43505187
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |    
T  43504775 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaatttttaacagaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaagt 43504874  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  43504875 tgttgtaaat-ttgatttttacgtccagattttgttaattt-------aacttttgtcgttctaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 43504965  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43504966 ttccaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaacagttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttgt 43505065  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || ||||||||     
T  43505066 tgtaagaaggactaaaatttgaagtaattcttttttgtagagactaaaaaacctattaaaattaagtaaggatcaaacttaaaaatttccaattttataa 43505165  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    | |||| |||||||||||||||    
T  43505166 ggaccagaaacatatttaaccc 43505187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Original strand, 11999725 - 12000077
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || ||    
T  11999725 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaaatatttca 11999824  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  11999825 aaatttgatttatatgtccagattttagtacttttatctttaatttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaa 11999923  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11999924 ttttagtaattgaacatttcatagtgttctaaacatgtctcaaaataatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactttgttttagca 12000023  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  12000024 gggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaatctactaaaa 12000077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36368185 - 36367825
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36368185 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 36368086  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  36368085 tatcgcaaaatttaatttatatgtccagattttattacttttatctttaaattttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 36367987  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  36367986 ttctaaattttagtaattaaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttatgagtttaaaaataattaaacaaactttgt 36367887  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  36367886 tttagcagggactaaaattagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 36367825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Original strand, 13501206 - 13501491
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13501206 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaataacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 13501305  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  13501306 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 13501404  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13501405 ttctaaattttagtaaatgaacctttc--agtgttctaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 13501491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 28700954 - 28701192
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttt-ttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28700954 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttttgcaaatgtgttaagaatattactaaaagttcctctgcgaaaaa 28701053  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||          
T  28701054 ttgtagcaaaatttgatttccacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaa 28701152  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28701153 gttctaaattttagtaaatgaacctctcatagtgttctaa 28701192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30982677 - 30982314
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  30982677 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaactttactaaaagttcctccgctaaaaat 30982578  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | |  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||           
T  30982577 tatcacaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgcttcatgtt-aaaaaa 30982479  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  30982478 ttctaaattttagtaattgaacctttcatattgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaagattttaaggatatttaaacaaactttgt 30982379  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatta 375  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  30982378 tttagcagggactaatatttgaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaatta 30982314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51561642 - 51561357
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51561642 tcaattcaaatttgtttactttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 51561543  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  51561542 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcaaattttgtttattttatttttaacttttgccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 51561444  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51561443 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt 51561357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33709240 - 33708880
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33709240 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagatttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattcctaaaagttcctccgcaaaaaat 33709141  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||           
T  33709140 tatcgcaaaatttgatttatatgtctaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcttttcatatt-aaaaaa 33709042  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33709041 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 33708942  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattc-ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  33708941 tttagaagggactaaaattagaagtaatactttttttttagggactaaaaaacctactaaaa 33708880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46517388 - 46517047
Alignment:
Q  92 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 191  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46517388 aaaaggtcctctacaaaaaattgtcacataatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttttcgttttaaaaaattcatattta 46517289  T
Q  192 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaa 291  Q
    ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |       ||| |||||| |||||||||||||    
T  46517288 attcgtttcatgttaaaaaag-tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcccaaaaaaatcgatcaaaattttaagagtttaa 46517190  T
Q  292 ggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaac 389  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  46517189 ggataattaaacaaactttgttgtaagatggactaaaattcgaagtaattttttttttgtagggactaaaatatctattaaaattaagtaaggattaaac 46517090  T
Q  390 ttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||| ||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46517089 ttagaagttgctaatcttatagggaccaaaaacatatttaacc 46517047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 31400219 - 31400639
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||    
T  31400219 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccgaaaaaaat 31400318  T
Q  113 tgttgcaaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
      | ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |         
T  31400319 a-tcgcaaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgataaaaa 31400417  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaacttt 309  Q
      || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  31400418 a-ttatagattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaatatttaagagtttaaggataattaagcaaaattt 31400516  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
     ||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | |||||||    
T  31400517 attttagcagggactaaaattataagtattt-ttttttgtagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagatcgcaattttat 31400615  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  31400616 aggaacc-aaaacatatttaaccct 31400639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47008913 - 47008705
Alignment:
Q  41 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  47008913 aaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaatttaatttctacgtccac 47008814  T
Q  141 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47008813 attttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgttttatgtt--aaaaattctaaattttagtaaataaacctttca 47008716  T
Q  241 tagtgttctaa 251  Q
    |||||||||||    
T  47008715 tagtgttctaa 47008705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46597070 - 46596708
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  46597070 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcatccgcaaaaaat 46596971  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||  || ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  46596970 tatcgcaaaatttagttgatatgtccaga-tttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgttttatgttaaaaaaa 46596872  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||         |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46596871 -tctaaattttaataattgaacctttcacagtgttctaaacttgtctaaaaaaaaccgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 46596773  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaatta 375  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  46596772 tttagcatagactaaaattagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaatctactaaaatta 46596708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10041528 - 10041119
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||  |    ||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  10041528 aaatttgtttaatttatgtttaaattcttgagtttttaaacaattttttataggtgtgttaaacacattactaaaagttcctcttcgaaaaattgtcgca 10041429  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||       || ||||    
T  10041428 aaatttaatttctacgttcagattttattaattttatctttaacttttgccgttttagaaaatttatatttaattcgtataatgttaaaaaaatt-taaa 10041330  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||        ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||    
T  10041329 ttttggtaaatgaacctttcatggtgttctaaacttttcttaaaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttaatgtaaca 10041230  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatgga-ttaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
    ||| ||||||||||| |||||  |||  |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | | |||||| | ||||    
T  10041229 gggactaaaattagatgtaat--tttcatgtaaggactaaaaaaacatattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaactttataaggacca 10041132  T
Q  418 aaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||    
T  10041131 aaaacatatttaa 10041119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33707663 - 33707243
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  33707663 aatttaaatttgtttaatt-attcttaaactcttaattttttgaacaatcttttgcagacgtgttgagaacattactaaaagttccttcgcaaaaaatta 33707565  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnt 213  Q
    |  ||||| ||||||| ||||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||       |    
T  33707564 tctcaaaatttgatttctacgttcaaatttttgttgcttttatcttgaacttttatcgtttgaaaaaatttatatttaatacatttcatattaaaaaaat 33707465  T
Q  214 tctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattta-agagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| | ||||||        | |||||   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33707464 t-taaattttagtaaatgaaacttttgtaatgttttaaacttgtctcagaaaatactttcaattttttttagagtttaaggataattaaacaaactttgt 33707366  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||| | |||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  33707365 tttaacatggactaaaattacatgtaaatattttttctaaggactgaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagttttcaattttatag 33707266  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33707265 gaaccaaaaacatatttaaccct 33707243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 36248333 - 36248658
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||                
T  36248333 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaatttcttgtagacatgttaagaatattactaaaagttcc------------ 36248420  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattt----tatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnn 208  Q
     || |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       
T  36248421 -gtcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattactttaatttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaa 36248519  T
Q  209 nnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaact 307  Q
        || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36248520 aaattt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaact 36248618  T
Q  308 ttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt 347  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36248619 ttgttttagtagggactaaaattagaagtaattttttttt 36248658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12368518 - 12368211
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||              
T  12368518 aaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat--------- 12368428  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
        |||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||       |||||||    
T  12368427 ----ttgatttatatgttcatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattaatatttaatacgtttcatgttaaaaaa-ttctaaa 12368333  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  12368332 ttttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagta 12368233  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaatt 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12368232 gggactaaaattagaagtaatt 12368211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 434
Target Start/End: Original strand, 21794533 - 21794754
Alignment:
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21794533 ttctaaattttagttaatgaacctttcttaatattctaaacttgtctcaaaaaattcgtacaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaactttgt 21794632  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  21794633 tgtaatagggactaatattagaagtaatt-ttttttgtaaggacttaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttataagttcccaattttatag 21794731  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  21794732 ggaccaaaaacatatttaaccct 21794754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 427
Target Start/End: Original strand, 2059484 - 2059760
Alignment:
Q  151 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcta 250  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2059484 ttttatctttaactttt-tcgttttaaaatattcatatttaatttgtttcatgttaacaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttataatgttcta 2059581  T
Q  251 accgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattctt--tttt 347  Q
    | | | |||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  2059582 aacttatct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaattttgttttaacaggatctaaaattagaaataatttttgttttt 2059680  T
Q  348 gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatt 427  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| | || |||| ||||||    
T  2059681 gtagggactaaaaatcctattaaaattaagtaaagattaaacttagaagttctctattttataaggactaaaatcatatt 2059760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 21091051 - 21091412
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||| | || ||||| ||| |||||  ||||||| ||  ||| ||||    
T  21091051 tcaattcaaatttgtttagtttatgtttaaactcttaagtttta-aacaattttttgtagacgtgttacgaacattacataaagttcatccacaataaat 21091149  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | |  ||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||           
T  21091150 tatctcaaaatttgatttatatgttcagattttattactttaatctttaacttttgatgtttt-aaaaattcatatttaattcatttcgcgtt-aaaaaa 21091247  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataat-taacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  21091248 ttataaattttaataaatgaacctttcacagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttgaggataatcaaacaaacattgt 21091347  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaag 377  Q
     ||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||| || ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  21091348 cttagcagggactaaaattataagtaatt-tattttttagggactaaaaagactattaaaattaag 21091412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 302 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 47008682 - 47008553
Alignment:
Q  302 caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccc 401  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  47008682 caaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattgaacttagaagttccc 47008583  T
Q  402 tattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47008582 aattttatagggaccaaaaacatatttaac 47008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 15053640 - 15053953
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  15053640 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 15053737  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  15053738 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaca 15053825  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| | ||||||       | |||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15053826 ttctaaattttattgattgagcctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaatttgttcaaaaa--------tttaaggataattaaacaaactttgt 15053917  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt 347  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15053918 tttagtagggactaaaattagaagtaattttttttt 15053953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 436
Target Start/End: Original strand, 35188250 - 35188589
Alignment:
Q  91 taaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatat 188  Q
    |||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  35188250 taaaagttcctcagcaaaaaaatatcgcaaaaatttgatttctacatttatatttttgttacttttatcttaaacttttgttgtttaaaaaaaat-atat 35188348  T
Q  189 ttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtt 288  Q
    ||||||  |||||||||       ||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||| ||| | ||||||       ||||| |||||||||     |    
T  35188349 ttaatttatttcatgttaaaaaa-ttctatattttagtatatgaatctttcagagagttttaaacttgtctcaaaaaaatcgttaaaaaattta-----t 35188442  T
Q  289 taaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaa 387  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  35188443 taaggacagttaaacaaactttgttttagcagggactaaaattataagtaattttttttt--agggattaaaaaagctactaaaattaagtaaggattaa 35188540  T
Q  388 acttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35188541 acttataagttctcgattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 35188589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 321
Target Start/End: Original strand, 39681883 - 39682103
Alignment:
Q  103 tgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcg-tttca 201  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  39681883 tgcaaaaaattatcgcaaaatttgatttctacatccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttaaaaaaatcctatttaatccgttttca 39681982  T
Q  202 tgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-a 300  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||        | ||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  39681983 tgttaaaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtcttaaaaaaattgttcataaacttaagagtttaaggataattaa 39682082  T
Q  301 acaaactttgttttaacaggg 321  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  39682083 acaaattttgttttagcaggg 39682103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 434
Target Start/End: Original strand, 42972167 - 42972385
Alignment:
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaacaaactttgtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  42972167 ttctaaattttagtaaatgaaccttttataatcttctaaaagtgtctccgaaaaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaaaaaata-gtt 42972265  T
Q  313 ttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    ||| ||  | ||||||||  | |||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42972266 ttagcaaagactaaaattgcatgtaatt-ttttttgta-ggaataaaaaatatattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagg 42972363  T
Q  413 aaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  42972364 gaccaaaaacataattaaccct 42972385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 430
Target Start/End: Original strand, 48410258 - 48410561
Alignment:
Q  127 atttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttag 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||       |||||||||||||    
T  48410258 atttatacgtccagatttttgttacttttatcttgaacttttgtcttttaaaaaaatt-atatttaatccatttcatgttaaaaaa-ttctaaattttag 48410355  T
Q  226 taaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcct 324  Q
    | |  ||||||||  || | || ||| | ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |  | ||    
T  48410356 tgaccgaaccttttgtaattttttaaacttgtctcaaaaagactgttcaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactttgttttaataatgact 48410455  T
Q  325 aaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacat 424  Q
    |||| || | |||| |  ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  48410456 aaaactacatgtaaattatttttatagggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagtttcaaattttatagggaccaaaaacat 48410555  T
Q  425 atttaa 430  Q
    ||||||    
T  48410556 atttaa 48410561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 269 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 5430604 - 5430436
Alignment:
Q  269 cgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctat 367  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||| | ||||||| | ||| |||||||  |||    
T  5430604 cgttcaaaaatttacaagtttaaggataattaaacaaaatttgttttagcaggggctaaaattacgtgtaaatattttttgcaaggactaaaaaaattat 5430505  T
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  5430504 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagtctccaattttatagagactaaaaatatatttaacccttt 5430436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 113
Target Start/End: Original strand, 21794417 - 21794510
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21794417 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcacacgtgttaagaacattaataaaagttcctctacaaaaaatt 21794510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37986869 - 37986691
Alignment:
Q  183 tcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaattta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||    
T  37986869 tcatatttaattcgtttcatgttaaacaa-ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaattta 37986771  T
Q  283 agagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| | || || ||||||||| ||| |||||||    
T  37986770 agagtttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattag-actattttttttttgtagggactaaaaaa 37986691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 238
Target Start/End: Original strand, 49767693 - 49767910
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  49767693 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 49767791  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  49767792 aaaatttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttaaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 49767890  T
Q  219 attttagtaaatgaaccttt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  49767891 attttagtaaacgaaccttt 49767910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 300 - 434
Target Start/End: Original strand, 28701202 - 28701337
Alignment:
Q  300 aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattc-ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagtt 398  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28701202 aacaaactttgttgtaacagggactaaaattagaagtaatttattttttgcagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagtt 28701301  T
Q  399 ccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |   |||||||||   | || |||||||||||||||    
T  28701302 cgtaattttatagagtctaagaacatatttaaccct 28701337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7565435 - 7565172
Alignment:
Q  53 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaat 151  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||| || |||| ||||| ||| || | |||||||| |  ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  7565435 ttttgaacaatttcttgtagacgtgttaaaaacattaataaaaattcatccgtaaaaaattatctcaaaatttgatttctatgtccatatttttgttaat 7565336  T
Q  152 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  7565335 tttatcttgaacttttctcgtttaaaaaaattcatattaaattcatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgtacctttcgtaatgttctaa 7565237  T
Q  252 ccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgtttta 315  Q
     | ||||||       ||||| ||||| |||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||    
T  7565236 acttgtctcataaaaatcgttaaaaaagttaagagtttgaagataattgtacaaaatttgtttta 7565172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12251656 - 12251439
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  12251656 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 12251558  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||  |||||| ||       ||||||    
T  12251557 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatttatttcatatt-aaaaaattctaa 12251459  T
Q  219 attttagtaaatgaaccttt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12251458 attttagtaaacgaaccttt 12251439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 431
Target Start/End: Original strand, 20357192 - 20357352
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatta 369  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||| || | || |||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  20357192 ttcaaaaatttaagattttgaagataattaaacagatttagttttagcagggactaaaattacatgtaatt-ttttttatagggactaaaaaaactatta 20357290  T
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20357291 aaattaagtaagaaataaacatagaagttctcaattttataggaactaaaaccatatttaac 20357352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20562763 - 20562603
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatta 369  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||| || | || |||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  20562763 ttcaaaaatttaagattttgaagataattaaacagatttagttttagcagggactaaaattacatgtaatt-ttttttatagggactaaaaaaactatta 20562665  T
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20562664 aaattaagtaagaaataaacatagaagttctcaattttataggaactaaaaccatatttaac 20562603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31024344 - 31023932
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||| |||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||| || | || ||||| |   |    
T  31024344 aaatttgttcaatt-atgtttaaactcttatgtttttgaacaatttcttgtagacgtgttaagaccattactaaaagttcatccgtaacaaattatctta 31024246  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| ||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||       | |||     
T  31024245 aaatttgatttctatgttcatatttttgttaattttatcttgaacttttttcgtttaaaaaaattcatattaaatacatttcatgttaaaaaaatcctag 31024146  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaac 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |       ||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||  |    
T  31024145 attttagtaaatgaacctttcgtagtgttctaaacttatcccataaaaatcgttaaaaaagttaagagcttgaggataattatacaaaatttg-tttggc 31024047  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
    |||| ||| ||||  |||||| | |||||| || | | ||||||| |||   ||||| |||||| | |||||||||||||| |    ||| || | ||||    
T  31024046 agggactataattctaagtaaattttttttttaggaactaaaaaagctaccgaaatttagtaaggaataaacttaaaagtttctgggtttttaaggacca 31023947  T
Q  418 aaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||    
T  31023946 aaaacatatttaacc 31023932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 27550800 - 27550974
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  27550800 aaatttgtttaatt-atacttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 27550898  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  27550899 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 27550974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 238
Target Start/End: Original strand, 25351963 - 25352178
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |     
T  25351963 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaaaaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattat--ct 25352059  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
     || || |||||| |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||    
T  25352060 caattttatttatgcgtccagatttttgttacttttattttcaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgct-aaataattctaa 25352158  T
Q  219 attttagtaaatgaaccttt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  25352159 attttagtaaacgaaccttt 25352178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 11397039 - 11397222
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  11397039 aaatttgtttaatt-atgcttaaacatttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 11397137  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatg 203  Q
    ||| || |||| | |||||| | |||||||| |||||| ||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  11397138 aaattttatttctgcgtccatatttttgttacttttattttgcacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg 11397222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Original strand, 2059078 - 2059145
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaag 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2059078 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcatacgtgttaag 2059145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19791190 - 19791118
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19791190 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttataggaaataaaaacatatttaacccttt 19791118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 37986989 - 37986893
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  37986989 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaaattttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaa 37986893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 35530760 - 35530668
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  35530760 ttttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaaggtcccaatttcgtaggaacctaaaacatatttaaccct 35530668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 43504741 - 43504657
Alignment:
Q  349 tatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43504741 tatggactaaaaaaacttataaaattaagtaaggattaaacttaaaagattctaattttataagaaccaaaaacatatttaaccc 43504657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Original strand, 46517412 - 46517488
Alignment:
Q  358 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  46517412 aaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtcccaattttatagggacgaaaaacatatttaaccct 46517488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 48218172 - 48218256
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  48218172 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttttagggaccaaaaacatat 48218256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 52010675 - 52010759
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52010675 ttttttatatggactaaaaacactattgaaattaagtaaggaataaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 52010759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 366 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13501154 - 13501087
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13501154 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 13501087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 49768696 - 49768522
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||   ||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  49768696 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaaattttttttggacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatttgcaaaaaattatctca 49768598  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  49768597 aaattttatttctacgtccagaattttattacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaattcatatttaatt 49768522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 426
Target Start/End: Original strand, 52882620 - 52882703
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  52882620 tttttatatggactaaatacactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagatcccaattttatagggacaaaaaacatat 52882703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 49767657 - 49767575
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49767657 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 49767575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 435
Target Start/End: Original strand, 30742667 - 30742744
Alignment:
Q  358 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||  || | |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30742667 aaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttagaaactctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 30742744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Original strand, 41331948 - 41332017
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41331948 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttataggaactaaaaatatatttaaccc 41332017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 48218138 - 48218046
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48218138 aaatttgtttaatt-atgcttaaactttaaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacaaaaagttcatctgcaaaaaatt 48218046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52882556 - 52882366
Alignment:
Q  61 aattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctt 159  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| |  ||||| || |||| | | |||||||||| |||| |||||| ||    
T  52882556 aattttttgcacaagtgttaagaatattaagaaaagttcatctccaacaaattatctcaaaattttatttctgcctccagatttttgttacttttatttt 52882457  T
Q  160 taacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
     || ||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  52882456 gaaattttgtcttttaaaaaaattcatatttaattaatttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaacgaaccttttgtaatgttctaa 52882366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 25352768 - 25352852
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  25352768 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagctcacaattttatagggaccaaaaacatat 25352852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28700926 - 28700834
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| ||||||  |||| | ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  28700926 ttttttttatggaccaaaagaactattaaaatttagtaaggactaaaattaaaagttcccaatttaatagggatcaaaaacatatttaaccct 28700834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Original strand, 29231368 - 29231428
Alignment:
Q  275 aaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  29231368 aaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagtagggactaaaattagaa 29231428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48410070 - 48410002
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48410070 attaaaattaagtaaggacaaaacttaaaatgtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 48410002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 51561288 - 51561220
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||| ||| | |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51561288 attaaaattaagcaaggactaaagttgaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 51561220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 52881547 - 52881487
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacat 424  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  52881547 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacat 52881487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 29231939 - 29231884
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29231939 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaatttttt 29231884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12367675 - 12367585
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12367675 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 12367585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 12368553 - 12368643
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12368553 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 12368643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 27551819 - 27551901
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  27551819 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 27551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 36368213 - 36368303
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36368213 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 36368303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 51338433 - 51338351
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||    
T  51338433 ttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatattccaattttatagggaccaaaaacatat 51338351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2059028 - 2058959
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  2059028 ctattaaaattaaataaggactaaacttaaaaggtcccaatttcatagggactaaaaacatatttaaccc 2058959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21091003 - 21090938
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  21091003 tattaaaattaagtaaggactaaacttaaaattttccaattttataaggaccaaaaacatatttaa 21090938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Original strand, 26207482 - 26207547
Alignment:
Q  33 ttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagtt 98  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26207482 ttatgcttagactcttaagttttagaacaattttttcgaaacatgttaagaacattactaaaagtt 26207547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29231297 - 29231208
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29231297 tttttataaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 29231208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 36249147 - 36249098
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36249147 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 36249098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11397005 - 11396921
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||| |||||| |||||||||||||    
T  11397005 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattgtatagggaccaaaaacatat 11396921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 12367703 - 12367759
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12367703 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacaattttttg 12367759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 12897412 - 12897496
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||||||    
T  12897412 ttttttatatggactaaaattactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggaccgaaaacatat 12897496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15054487 - 15054431
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15054487 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 15054431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 436
Target Start/End: Original strand, 21091667 - 21091735
Alignment:
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  21091667 taaaattaagtaagaactaaacttagaagttccaaatttcatatggaccaaaaacatgtttaacccttt 21091735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21794373 - 21794293
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  21794373 ggattaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggccccaattttatcgggaccaaaaatatatctaacc 21794293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Original strand, 26805836 - 26805904
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  26805836 ctattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtctgaattttatagggataaaaaacatatttaacc 26805904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31400192 - 31400100
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| || | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  31400192 ttttttgtaagaattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaaggtcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaaccct 31400100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 37986209 - 37986265
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  37986209 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaaattttttaacaattttttg 37986265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 51339919 - 51340003
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  | |||||||| | |||||||||||||    
T  51339919 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatttcaattttataaggaccaaaaacatat 51340003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 435
Target Start/End: Original strand, 13501544 - 13501627
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| |||| | | ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  13501544 ggactaaaaaaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtacttattttatatggaccaaaaaaatatttaaccctt 13501627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25351907 - 25351845
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||    
T  25351907 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggatcaaaaacatat 25351845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 36249182 - 36249272
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36249182 tttttgtaaggactacaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 36249272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 37986181 - 37986091
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  37986181 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactgaaaacatatttaaccc 37986091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 430
Target Start/End: Original strand, 47008974 - 47009040
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47008974 ctattaaaagtaagtaaggacaaaacttaaaaggtcctaattttatagggaccaaaaacatatttaa 47009040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15053597 - 15053528
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15053597 ctattaaaattaagtaagaactaaactgaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 15053528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27551684 - 27551567
Alignment:
Q  134 cgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatga 232  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||||||||||||| ||    
T  27551684 cgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatg-taaaaaaattctaaattttagtaaacga 27551586  T
Q  233 acctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||  || ||||||||    
T  27551585 acctttagtaatgttctaa 27551567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 37987017 - 37987106
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  37987017 tttttgcaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 37987106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 205
Target Start/End: Original strand, 52881707 - 52881780
Alignment:
Q  133 acgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52881707 acgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 52881780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 159
Target Start/End: Original strand, 2059152 - 2059196
Alignment:
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctt 159  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2059152 ttgcaaaatttgatttctacgtcctgattttgttaattttatctt 2059196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11999689 - 11999601
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  11999689 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattacgtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 11999601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12896910 - 12896866
Alignment:
Q  350 atggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaa 394  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12896910 atggactaaaaacactattaaaattaagtaagaattaaacttaaa 12896866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27550767 - 27550683
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||  ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  27550767 ttttttatatgggctaaaaatactattataattaagtaaggactaaacttaaaaaatcctaattttatagggaccaaaaacatat 27550683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Original strand, 31024377 - 31024468
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaac-ttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||| |||| |||| ||| | | ||||||||||||||||||    
T  31024377 ttttttttagggattaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacattgaaag-tcccaatttgataaggatcaaaaacatatttaaccc 31024468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33708291 - 33708203
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  33708291 tttttgtaaagactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 33708203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Original strand, 42971953 - 42972036
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 99  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  42971953 aattcaaatctgtttaatt-atgtttaaactcttaagttttagaaaaatcttttgtagacgtgttaagaatattactaaaagttc 42972036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 426
Target Start/End: Original strand, 12251714 - 12251769
Alignment:
Q  371 aattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  12251714 aattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagagaccaaaaacatat 12251769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 18996922 - 18997052
Alignment:
Q  64 tttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaac 163  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||  || |||||||||   |  |||| || |||| || ||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  18996922 tttttgcatacatgtttagaatattataaaaagtttatccgcaaaaaataagtttaaaattttatttttaggtccaaattttgttacatttatcttgaac 18997021  T
Q  164 ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattc 195  Q
    |||||   || |||||||||||||||||||||    
T  18997022 ttttggc-ttctaaaaaattcatatttaattc 18997052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Original strand, 26507632 - 26507695
Alignment:
Q  142 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  26507632 ttttgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 26507695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Original strand, 28334985 - 28335016
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28334985 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 28335016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 399
Target Start/End: Original strand, 28480018 - 28480061
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28480018 taaaaaagctattaaaattaaataagaattaaacttagaagttc 28480061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Original strand, 30440547 - 30440578
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30440547 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 30440578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 490 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10385597 - 10385567
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatga 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10385597 gagcaatgatatttgtacatccatttaatga 10385567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Original strand, 11745502 - 11745532
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11745502 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 11745532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 51840168 - 51840106
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |  | |||||||||| |||||||||||||    
T  51840168 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtttcaattttatagggaccaaaaacatat 51840106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Original strand, 51841347 - 51841409
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||| | | |||||||||||    
T  51841347 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttataaggatcaaaaacatat 51841409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6216416 - 6216383
Alignment:
Q  268 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6216416 tcgttcaaaaatttaatagtttaaggataattaa 6216383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Original strand, 14292672 - 14292701
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14292672 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 14292701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21248916 - 21248887
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21248916 tttataggaaccaaaaacatatttaaccct 21248887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30981720 - 30981631
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  30981720 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 30981631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 426
Target Start/End: Original strand, 49768769 - 49768810
Alignment:
Q  385 taaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49768769 taaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 49768810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 52493501 - 52493416
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatt 427  Q
    ||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||||| | || |||| ||||||    
T  52493501 ttttttgtagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggattaaaattaaaaggtctccattttataaggactaaaatcatatt 52493416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 533936 - 533988
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  533936 tttttgtaaggactaaaataactattaaaattaagtaagggttaaacttaaaa 533988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 5383942 - 5383914
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaat 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5383942 gagcaatgatatttgtacatccatttaat 5383914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Original strand, 7565511 - 7565590
Alignment:
Q  352 ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| | |||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7565511 ggattaaaaaaactattaaaattaagcaaagaataaacattaaaaatctcaattttatagg-accaaaaacatatttaacc 7565590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Original strand, 13083446 - 13083529
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 99  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  13083446 aattcaaacttgtttaatt-atgcttatactctcaagtttttgaacaacttttttcagatgtgttaagaacattactaaaagttc 13083529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 518
Target Start/End: Original strand, 24749630 - 24749658
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaat 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24749630 gagcaatgatatttgtacatccatttaat 24749658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Original strand, 26020745 - 26020812
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  26020745 ctattcaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtcctaattttgtagg-atcaaaaatatatttaacc 26020812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Original strand, 26451181 - 26451269
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  26451181 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttagttttatcttgaatttttggtgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 26451269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 27563652 - 27563624
Alignment:
Q  493 caatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563652 caatgatatttgtacatccatttaatgac 27563624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31861722 - 31861634
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  31861722 caaaattttatttttaggtccatattttcgttaattttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 31861634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43396504 - 43396432
Alignment:
Q  41 aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaatt 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||  || ||||||||| ||| |||| |||||    
T  43396504 aaactcttaagtttttaaacaattttttgtgaccatgttaagaacgttgctaaaagtttctccgcaacaaatt 43396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 43485942 - 43485914
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43485942 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 43485914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47632752 - 47632664
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  47632752 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttaattttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 47632664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Original strand, 48410127 - 48410202
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttga-gtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa 95  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  48410127 aaatttgtttaatt-atgcttaaactttttaagattttgaacaattttttgcagaagtgttaagaacattactaaaa 48410202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 521
Target Start/End: Original strand, 49189102 - 49189130
Alignment:
Q  493 caatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49189102 caatgatatttgtacatccatttaatgac 49189130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Original strand, 51561694 - 51561762
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  51561694 attaaaattaattaaggactaaacttgaaagacccttattttatagggactaaaaacataattaaccct 51561762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 138)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25102255 - 25101832
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25102255 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactctcgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaaaaaat 25102156  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  25102155 tgtcacaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatttttaacttttgccgttttgaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 25102057  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||       | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25102056 ttctaaattttagtaagtgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 25101957  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||     
T  25101956 tgtaatagggactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtctctattttataa 25101857  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  25101856 gaaccaaaaatatatttaacccttt 25101832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38706739 - 38706316
Alignment:
Q  10 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||| | | |||||||    
T  38706739 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacgttactaaaagtgcttgtgcaaaa 38706640  T
Q  110 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 209  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||        
T  38706639 aattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatctaatttgtttcatgtt-aaa 38706541  T
Q  210 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactt 308  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||       ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  38706540 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaattgaagtgtttaagaataattaaacaaactt 38706441  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttta 408  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  38706440 tgttgtaacagggtctaaaattagaagtaatttttttttgtaaaaactaaaaaacctattaaaaataagtaatgattaaacttaaaagatccctatttta 38706341  T
Q  409 taggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  38706340 tagggaccaaaaacatatttaaccc 38706316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 44265446 - 44265868
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44265446 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 44265545  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||           
T  44265546 tgttgcaaaatttgatttctaagtccagattttgttgattttatctttaatttttggcgttttaaaaaactcatatttaattcttttcatgtt-aaaaaa 44265644  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44265645 ttctaaattttagcaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 44265744  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||| || ||||||||     
T  44265745 tgtaacagggagtaaaattagaagtaattttcttttgtaaggactaaaaaacttattaaaattaagtaaagactaaacttagaagtttccaattttataa 44265844  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  44265845 ggacaaaaaacatatttaaccctt 44265868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5250684 - 5250263
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5250684 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttactgacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgccaaaaat 5250585  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaac-ttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  5250584 tgtcgcaaaatttgatttctacgtttagattttgttaattttatctttaactttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaa 5250486  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |   ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5250485 attctaaattttagtaaatgaacctttcgcagcgttctgaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 5250386  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5250385 ttgtaagagggactaaaattagaagtaatttttttttatagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttata 5250286  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  5250285 aggaccaaaaacatatttaaccc 5250263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 6590263 - 6590686
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6590263 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 6590362  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||           
T  6590363 tgtcgcaaaatttgatttctaggctcagattttgttaattttatattttatttttctcgttttaaaaaaatcatatttaatttttttcatgttaaaaaaa 6590462  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6590463 atctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatggttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 6590562  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  6590563 tgtaacaaggactaaaattagaagtaattttcttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatag 6590662  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    | || ||||| ||||||| |||||    
T  6590663 ggacaaaaaatatatttacccctt 6590686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41590631 - 41590212
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41590631 tcaattcaaatttgtttaatttgtgcttaaactcttgagcttttgaacaatttttcgcatacgtgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 41590532  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  41590531 tgtcgcaaaatttgatttctacttccagaatttgttaaatttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 41590433  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||         | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41590432 ttctaaattttagt-aatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaattgttcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgt 41590334  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
      ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  41590333 cgtaacaaggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatag 41590235  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  41590234 ggaccaaaaacataattaaccct 41590212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36471121 - 36470743
Alignment:
Q  10 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||  |||| |||||||||| || ||||    
T  36471121 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagatgtattaagaacgttaccaaaagttcctatgtaaaa 36471022  T
Q  110 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 209  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        
T  36471021 aattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaactttcgctgttttaaaaaattcatatctaattcgtttcatgtt-aaa 36470923  T
Q  210 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactt 308  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||        ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36470922 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttatcttaaaaaaatcgttcaaaaattgaagagtttaaggataattaaacaaactt 36470823  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaa 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36470822 tgttgtaacagggcctaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaa 36470743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Original strand, 33322531 - 33322954
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  33322531 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcatgagttttcaaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 33322630  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  33322631 tgtcgcaaaatttgatttttacgtctagattttgttaattttatctttaacttttttcgttttaaaaaatttatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 33322730  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||      
T  33322731 -tctaaattttggtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtattgaaaaaatcgttcaaaattttaagagtttaaagataattaaacaaactttac 33322829  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  33322830 tataacaggaactaaaattaaaagtaatttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaaataaggactaaacttagaagtttccaattttatag 33322929  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
      ||||||||||||||| |||||||    
T  33322930 agaccaaaaacatattttacccttt 33322954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 37967533 - 37967956
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  37967533 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgagcttttaaacaatttttcgcagacgtgtaaagaacattactaaaacttcctccgcaaaaaat 37967632  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt-tgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  37967633 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaacttttttccattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaat 37967732  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtc-tcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |        |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37967733 a-tctaaattttggtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaaatcgttcaaaactttaagagtttaaggatgattaaacaaacttt 37967831  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||    
T  37967832 gttgtaacagggactaaaattagaagtaa-tattttttgtaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcctaattttat 37967930  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37967931 agggaccaaaaacatatttaaccctt 37967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5696205 - 5695793
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  5696205 tcaattcaaatttgtttaatttatgattaaactcttcagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagatcattattgaaagttcctctgcaaaaaat 5696106  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||  ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||           
T  5696105 tgtcacaaaatttgattttta-gttcagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcatctcatatt-aaaaaa 5696008  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5696007 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttttaaacttgtctcgaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 5695908  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||    
T  5695907 tgtaacagagactaaaattagaagtaattttcttttttaaggactaaaaaccctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaag-------ttttatag 5695815  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  5695814 ggaccaaaaacatatttaaccc 5695793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27875745 - 27875327
Alignment:
Q  8 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 107  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27875745 catcctcaattcaaatttgtttattttatgcttaaactcttgagcttttgaacaattttttacaaacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaa 27875646  T
Q  108 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 207  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  27875645 aaaattgtcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgtgttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-a 27875547  T
Q  208 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaac 306  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||        |||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  27875546 aaaaattctaaattttagtaaatgaacctttaatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtccaaaaatttaagagtttataaataattaaacaaac 27875447  T
Q  307 tttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatt 405  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |      
T  27875446 tttgttgtaagagggactaaaattagaagtaattttttttttgtggggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattacacttagaagttcccaa-- 27875349  T
Q  406 ttataggaaccaaaaacatatt 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27875348 ttatatgaaccaaaaacatatt 27875327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28015926 - 28015506
Alignment:
Q  8 catcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa 107  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28015926 catcctcaattcaaatttgtttattttatgcttaaactcttgagcttttgaacaattttttacaaacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaa 28015827  T
Q  108 aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnn 207  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  28015826 aaaattgtcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgtgttaaaaaattcatatttaattcatttaatgtt-a 28015728  T
Q  208 nnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaac 306  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||        |||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  28015727 aaaaattctaaattttagtaaatgaacctttaatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtccaaaaatttaagagtttataaataattaaacaaac 28015628  T
Q  307 tttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctat 404  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |     
T  28015627 tttgttgtaagagggactaaaattagaagtaatttttttttttgtggggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattacacttagaagttccc-aa 28015529  T
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatt 427  Q
     ||||| ||||||||||||||||    
T  28015528 attatatgaaccaaaaacatatt 28015506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43623087 - 43622667
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43623087 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctcttcaaaaaat 43622988  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  43622987 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccataatttgtttaattttatctttaacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa 43622888  T
Q  212 nttctaaatttt-agtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||         ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43622887 attctaaattttaagtaaatgcacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaacttt 43622788  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    ||  ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||  | |||||||    
T  43622787 gtcgtaacaagaactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactaaaaaacctactaaaattaagtaagaactcaacttagaagttatcaattttat 43622689  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||| |||||||| ||| |||||    
T  43622688 agggaccaaaaatataattaac 43622667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 8784576 - 8784996
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8784576 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttaaacaagtttttgctgacgtgttaagaacattactaaaagtttctctgcaaaaaat 8784675  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||           
T  8784676 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcagattttattaattttatctttaacttcagccgttttaaaaaattcatatttaattctttttatgttaaaaaat 8784775  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||       | |||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8784776 tt-taaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttatgtcaaaaaaattgttcgaaaatttgagagtttacggataattaaacaaactttgt 8784874  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  |||||| ||    
T  8784875 tgtaacaagaactaaaattagaagtaacttttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattcctaattttagag 8784974  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  8784975 ggaccaaaaacatatttaaccc 8784996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 392
Target Start/End: Original strand, 6018037 - 6018414
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6018037 tcaattcaaatttgtttaatttatgcataaactcttgagtttttgaacagttttttgcagacatgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 6018136  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||           
T  6018137 tgtcgcaaaatttaatttttacgttcagattttgttagttttatctttatcttttgttgttttaataaattcatatttaatttgtttcatgtt-aaaaaa 6018235  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||       | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6018236 ttataaattttagtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtctcataaaaattgttcaaaaatttaaaagtttaagaataattaaacaaactttgt 6018335  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaactta 392  Q
    | ||| | || |||||||||||||| | | |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6018336 tgtaata-ggactaaaattagaagtga-tattttttttagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaactta 6018414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 21135321 - 21135681
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21135321 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 21135420  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||           
T  21135421 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcat-tttaaaaaa 21135519  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21135520 ttctaaattttagtaattgaacctttcataatgttctaaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 21135619  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaat 373  Q
    |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  21135620 tttggcagggactaaaattagaattaatttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaat 21135681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 35863039 - 35863397
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35863039 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagattctccgcaaaaaat 35863138  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  35863139 tgttgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatagttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaat 35863238  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35863239 tt-taaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaatattgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 35863337  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  35863338 tttagcagggactaatattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 35863397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 24451482 - 24451841
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24451482 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttgtgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 24451581  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  24451582 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 24451680  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  24451681 ttctaaattttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaattttaagagtttaagaataattaaacaaactttat 24451780  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  24451781 tttagcagggactaaaattagaagtattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 24451841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 17842463 - 17842881
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||    
T  17842463 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactcttaagtttttcaacaattttttgtatacatgttaaaaacattactagaagtacatcagcaaaaaat 17842562  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
      | |||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  17842563 a-tcgcaaattttgatttctacgtccagattttattacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 17842660  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| |       |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17842661 ttctaaattttagtaaatgaactttttatagtgttctaaacatgtc-ccaaaaaatcgtttggaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 17842759  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    ||||  |||| |||||| ||||| |||  || ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||    
T  17842760 tttagtagggactaaaaatagaaataatttttttttttgtaaggactaaaaatactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttttcaattttat 17842859  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  17842860 agggaccaaaaacatatttaac 17842881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42499673 - 42499252
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||    
T  42499673 tcaattcaattttgtttaatttatgcataaactattaagtttttgaacaattttttgcagacgtattaagaacattactaaaagcttatatgcaaaaaat 42499574  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  42499573 tgtcgcaaaatttaatttttacgtccatattgttttaattgtatctttaacttttgtcgtttttaaaaattcatatttaattcgttttatgtt-aaaaaa 42499475  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  42499474 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttat 42499376  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    | ||||| |  |||||| | ||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||     
T  42499375 tgtaacaagaactaaaacttgaagtaattttttttttgtaaggtctaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttttcaattttatg 42499276  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||    
T  42499275 ggaacgagaaatatatttaaccct 42499252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 35369188 - 35369546
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35369188 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttcaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaacaacattactaaaagttactccgcaaaaaat 35369287  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  35369288 tattgcaaaatttgatttatatgtccaaattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35369386  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35369387 ttctaaattttagcaattgaacctttcatagtgttctaaacttatctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactttgt 35369486  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  35369487 tttagcagggactaaaattagaag-attttttttttgtagggactaaaaaatctactaaaa 35369546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18840211 - 18839862
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18840211 tcaattcaaatttgtttaatttatacttaaactctcaagtttttgaacaattttttgtacatgtgttaagaacattactagaagttcctctgcaaaaaat 18840112  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  18840111 tatcgcaaaatttgatttctatgtccagattttattacttttatctttaactcttttcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 18840013  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||         |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18840012 ttctaagttttagtagatgaacctttcatagtgttctaaacatatccaaaaaaaatcgttcgaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 18839913  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||    
T  18839912 tttaacatggactaaaattagaagtaaattttttttgtagggactaaaaaa 18839862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17498787 - 17498541
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17498787 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttttgcagacatataaagaaaattactaaaagttcctctgcaaaaaat 17498688  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  17498687 tgtcgcaaaatttgatttctacgttcaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatatt-aaaaaa 17498589  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  17498588 ttctaaattttagtaaatgaatcttttatagtgttctaaacttgtctc 17498541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41281593 - 41281235
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||| | | || | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41281593 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaactcttaatttttt-aacaattttt-gtagacgtcttaagaacattactaaaagttcctcagcaaaaaat 41281496  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  41281495 tatcgcaaaatttgatttatatatccagatttcattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 41281397  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41281396 ttctaaactttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 41281297  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    |||| || || ||||| |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  41281296 tttagcaaggactaaatttagaagtaattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 41281235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37707009 - 37706702
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| | || | || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  37707009 aaatttgtgtaatttatgcttaaactcttatgttttttaacaattttttgtagacgtattgagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaattatcgca 37706910  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| |||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  37706909 aaatttgatttatatgttcagattttatcacttttatctttaacttttatcgtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-agaaaattctaaa 37706811  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37706810 ttttaataattgaacctttcatagtgttctaatcttgtct-aaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 37706712  T
Q  319 gggcctaaaa 328  Q
    ||| ||||||    
T  37706711 gggactaaaa 37706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21160077 - 21159841
Alignment:
Q  10 tcatcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  21160077 tcatcaattcaaatttgtttaatttatgcttatacttttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaacatcactaaaagttcatccgcaaaa 21159978  T
Q  110 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 209  Q
    | |||| ||| || ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||        
T  21159977 agttgtcgcacaatttgatttctacatctagattttgttaactttatctttaacttttgccattttaaaaaatttatatttaatccgtttcatattaaaa 21159878  T
Q  210 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 246  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21159877 aaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgt 21159841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Original strand, 16472997 - 16473341
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||      |||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  16472997 aaatttgtttaatttatgcttaaac------gttttttaaccattttttgtagacgtgttaagattatta---aaagttcctctgcaaaaaattatcgca 16473087  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  16473088 aaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaaaataaa 16473186  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16473187 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 16473286  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||| |||| |||| || ||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  16473287 gggactaatattataaataattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 16473341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Original strand, 16477568 - 16477912
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||      |||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  16477568 aaatttgtttaatttatgcttaaac------gttttttaaccattttttgtagacgtgttaagattatta---aaagttcctctgcaaaaaattatcgca 16477658  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  16477659 aaatttgatttatatgtccagatttt-ttacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaaaaataaa 16477757  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16477758 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 16477857  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||| |||| |||| || ||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  16477858 gggactaatattataaataattttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 16477912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 421
Target Start/End: Original strand, 30968670 - 30969069
Alignment:
Q  23 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatt-ttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaa 121  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||    
T  30968670 tttgtttaatttatgcataaactcttaagtttttaaacaattattttgcatacgtgtttataacattactaaaagtttctctacaaaaaattatcgcaaa 30968769  T
Q  122 aattgatttatacgtccagattttgttaatttt-atctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaat 220  Q
    |  |||||| ||| | |||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||       ||||||||    
T  30968770 atatgatttctacattcagattttgttgctttttatcattaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttattacatatt-aaaaaattctaaat 30968868  T
Q  221 tttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacag 319  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||         |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30968869 tttagtaaacgaacatttcatattgttctaaacttgtctaaaaaaaaccgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttaagag 30968968  T
Q  320 ggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaa 419  Q
    || ||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||  | |||||||||| || |||    
T  30968969 ggactaaaattataagtaaat-ttttttgtagggactaaaaaaactattaaaattaagtaagtactgaacttagaagttttcaattttatagggacaaaa 30969067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 141 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43936681 - 43936391
Alignment:
Q  141 attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||        | |||||||| |||||| || ||||||    
T  43936681 attttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaatttatttttaattcgtttcatgttaaaaaaaat-taaattttggtaaataaatctttca 43936583  T
Q  241 tagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaat 339  Q
    ||| |||| || | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  43936582 tagcgttcaaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttttttgtaac-gggactaaaattagaagtaat 43936484  T
Q  340 tcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43936483 ttttttttgtaaggactaaaagacctattaaaattaagcaaggattaaacttagaagttcccaattttattggaaccaaaaatatatttaacc 43936391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6413563 - 6413383
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  6413563 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacatcactaaaagttcctcttcaaaaaat 6413464  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaat 193  Q
    ||| |||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6413463 tgtcgcaaaatttgattcctacatccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaat 6413383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5766005 - 5765610
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg--caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttg 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||   || || |||||||||  ||| |||||| ||||  | |||||||  | |    
T  5766005 aaatttgtttaatttatgcttaaactctgaagtttttcaacaattttttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtccttcgaaaaaaata-tcg 5765907  T
Q  118 caaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttc 215  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       ||     
T  5765906 caaaaatttgatttctacgtccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaa-tta 5765808  T
Q  216 taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtttt 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  5765807 tagattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaaatttatttt 5765708  T
Q  315 aacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    | ||||| ||||||||| |||| | | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | ||||||||||    
T  5765707 agcagggactaaaattataagttaattttttttatagggattaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtcgcaattttatagg 5765610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18304896 - 18304617
Alignment:
Q  78 ttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaa 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18304896 ttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttgattttatctttaaattttgtcgttttaa 18304797  T
Q  178 aaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtct--cnnnnnnntcgttcaa 275  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||        |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||          || |||||    
T  18304796 aaaattcatatttaattcgtttgaagttacaaaaa-tctaaattttggaaaatgaacctttcatagtgttctaaacatgtcttaaaaaaaaatcattcaa 18304698  T
Q  276 aaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggat 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| || || ||||||||| ||||    
T  18304697 aaatttaagagtttaaggataattaatcaaactttgttgtaagagggactaatattagaaatagtttttttttgtaaggat 18304617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28755462 - 28755051
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||| | | |||    
T  28755462 aaatttgtttaatttatgcttaaattcttaagtttttcaacaattttttacagacgtgttaagaacgttattaaaaggtcctccg-aaaaaaatatcgca 28755364  T
Q  120 aaaa-ttgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||| ||||||| ||||| || | |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  28755363 aaaatttgatttctacgttcatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattata 28755265  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||     
T  28755264 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaacaataattaagcaaaatttattttag 28755165  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
    ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||  | |||||||| ||| || | |||||||||| ||    
T  28755164 cagggactaaaattataagtaattttttttttgtagggatcaaaaagactattaaaattaagcaaagactaaacttagaagatcgcaattttatagggac 28755065  T
Q  416 caaaaacatattta 429  Q
    |||||| |||||||    
T  28755064 caaaaatatattta 28755051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30658731 - 30658540
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  30658731 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaa-ctcttgagtttttaaacaattttttgcagacgtattaagaacattactaaaagttcctcttcaaaaaaa 30658634  T
Q  113 -tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30658633 atgttgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcataattaatttgtttcatgtt 30658540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36063718 - 36063409
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt--gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||  | | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36063718 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaattcttaagttttttaacaattttttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaa 36063619  T
Q  111 attgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
    ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  36063618 attatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatc-------------gtttttaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaa 36063533  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36063532 aattctaaattttagtaattgaacctttcataatgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 36063433  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattaga 333  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  36063432 gttttagcaggaactaaaattaga 36063409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 9252645 - 9252836
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9252645 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctttgcaaaaaat 9252744  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9252745 tgccgcaaaatttgatttctacttccagattttgttaattttatctttaacttttaccgtttt-caaaatttatatttaatttgttttatgtt 9252836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13323845 - 13323652
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa-gttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  13323845 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaaagttcctccacaaaaaa 13323746  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    || | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13323745 ttatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcattttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 13323652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Original strand, 36018116 - 36018528
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa-attgttgc 118  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  | || |||||||||   || |||||||| ||| ||||||| ||| | ||    
T  36018116 aaatttgtttcatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttt-agacgtgttaagaacgctattaaaagtttctccgcaaaaacattatcgc 36018214  T
Q  119 aaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    ||||||| ||||| ||| | || ||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||       | ||    
T  36018215 aaaaatttgatttctacattcatatttttgttacttttatcttaaacttttttggtttaaaaaaatacatattttatttatttcatgttaaaaaaat-ct 36018313  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtttta 315  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||       | ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36018314 agattttaataaatgaaccttttatagtgttcaaaacttgtctcaaaaaaattgttaagaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgtttta 36018413  T
Q  316 acagggcctaaaattagaagtaattc--ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagga 413  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||   ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  36018414 gcagggactaaaattacaagtgattgatttttttgtagggattaaaaatgctattaaaattaattaaggattaaacttaaaaattccaaattttataggg 36018513  T
Q  414 accaaaaacatattt 428  Q
    |||||||| ||||||    
T  36018514 accaaaaaaatattt 36018528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 39336991 - 39337312
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  39336991 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 39337088  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||           
T  39337089 -----------ttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttctattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttaatgttaaaaaaa 39337177  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39337178 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaagattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 39337276  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt 347  Q
     |||  | || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  39337277 cttagtatggactaaaattagaagtgattttttttt 39337312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17062639 - 17062425
Alignment:
Q  31 atttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 130  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17062639 atttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttgtatagacgtgttaagaacattattaaaagttcttctgcaaaaa-ttgtcgcaaaatttgattt 17062541  T
Q  131 atacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 230  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  17062540 ctatgtccagattttgttaatttcgtctttaacttttctcattttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaat 17062442  T
Q  231 gaacctttcatagtgtt 247  Q
    |||| ||||||||||||    
T  17062441 gaacatttcatagtgtt 17062425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 17585719 - 17585933
Alignment:
Q  31 atttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgattt 130  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  | || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17585719 atttatgcttaaacttttgagtttttgaacaattttgtatagacgtgttaagaacattattaaaagttcttctgcaaaaa-ttgtcgcaaaatttgattt 17585817  T
Q  131 atacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaat 230  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||    
T  17585818 ctatgtccagattttgttaatttcgtctttaacttttctcattttaaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaat 17585916  T
Q  231 gaacctttcatagtgtt 247  Q
    |||| ||||||||||||    
T  17585917 gaacatttcatagtgtt 17585933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 318
Target Start/End: Original strand, 23483421 - 23483647
Alignment:
Q  92 aaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatattta 191  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23483421 aaaagttcttctacaaaaaattatcgtaaaatttgatttctacgtccacatttggttaatttgatctttaacttttgcaattttaaaaaattcatattta 23483520  T
Q  192 attcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaa 291  Q
    ||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||       | ||||||||||||||||||||||    
T  23483521 attcgtttcatgttaaaaaac-tctaaattttaataaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaa 23483619  T
Q  292 ggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23483620 ggataattaaacaaactttgttgtaaca 23483647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 217 - 434
Target Start/End: Original strand, 36126455 - 36126677
Alignment:
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaa-tttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||        ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  36126455 aaattttagtaaatgaaccttttatagtgttttaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaaatttaatagtttaaggatagttaaacaaactttatttt 36126554  T
Q  315 aacagggcctaaaattagaagtaattctttttt---gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  36126555 agcagggactaaaattagaagtaattttttttttttgtaggtattaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatag 36126654  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  36126655 ggaccaaacacatatttaaccct 36126677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 32514318 - 32513952
Alignment:
Q  34 tatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttata 133  Q
    |||||| ||||| || || |||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |   |||| || || | ||    
T  32514318 tatgcttaaacttttaagattttaaacaattttttacagaagtgttaagaacattactaatagttcatctgcaaaaaattatctgaaaattttatatcta 32514219  T
Q  134 cgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatga 232  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||    
T  32514218 cgtccagaattttgttacttttatctttaacttttttcctttacaaaaatttatatttaattcatttcatgttaaaaaaaatctaaattttagtaaacga 32514119  T
Q  233 acctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcctaaaatta 331  Q
    ||||||  ||  ||||||| | ||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||| ||    
T  32514118 accttttgtaacgttctaaacttgtctcaaaataatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattagagaaactttgttttagtagggactaaaacta 32514019  T
Q  332 gaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagtt 398  Q
     | |||| |  ||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32514018 catgtaaattatttttataaggactaaaaagactattaaaattaagtaaggattaaacttagaagtt 32513952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 271 - 436
Target Start/End: Original strand, 31185724 - 31185892
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggattaaaaaacctat 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||  || ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  31185724 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttagcagggactaaaattataagtaaattttttttttgtaggaattaaaaaaactat 31185823  T
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||| || | |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31185824 taaaattaagtaaggactaaacttataaggtcgcaattttatagggatcaaaaacatatttaacccttt 31185892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 271 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 30658491 - 30658321
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagta-attcttttttgtatggatt---aaaaaacct 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||  || |   |||||| ||    
T  30658491 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacagggactaaaattagaagtatttttttttttgtaaagactaaaaaaaaatct 30658392  T
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30658391 attaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcacaattttatagggaccaaaaacatatttgacccttt 30658321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43988446 - 43988211
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||    |||| ||||  ||||||| || |||||  ||||| ||    
T  43988446 tcaattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagttttcgaacattattttgcatg--tgtttagaacgttactaatagctcctccacaaaatat 43988350  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||          
T  43988349 tatcgcaaaatttgatttttacatccagatttttgttacttttatctttaacttttgctgttttaaaaaattcatatttaactcattttatgtt-aaaaa 43988251  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43988250 attctaaattttagtatataaacctttcatagtgttctaa 43988211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 268 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17062313 - 17062151
Alignment:
Q  268 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaaccta 366  Q
    |||||||||||||||| ||||    |||| || ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  17062313 tcgttcaaaaatttaaaagtt----gatagttaaacaaactttgttgtaacgggaactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaagaccta 17062218  T
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
     |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  17062217 ctaaaattaagtacggattaaacttagaagttcccaattttatagcgaccaaaaatatatttaaccc 17062151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 300 - 433
Target Start/End: Original strand, 17586074 - 17586207
Alignment:
Q  300 aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttc 399  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17586074 aacaaactttgttgtaacgggaactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaagacctactaaaattaagtacggattaaacttagaagttc 17586173  T
Q  400 cctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    || |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  17586174 ccaattttatagcgaccaaaaatatatttaaccc 17586207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 271 - 434
Target Start/End: Original strand, 2827065 - 2827229
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatta 369  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||  ||||||    
T  2827065 ttcaaaaaattaagagtttgaggataattaaacaaacattgtcttagcagagactaaaattataagtaacttttttttgtagggactaaaaagactatta 2827164  T
Q  370 aaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2827165 aaattaagtaaggactaaacttaaaagcttcaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 2827229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 279 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30806368 - 30806214
Alignment:
Q  279 tttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaag 377  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||  ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30806368 tttaagagtttaaggacaattaaacaaactttgttttagtaaggactggaattacatgtaaatattttttgtagggattaaaaaaactattaaaattaag 30806269  T
Q  378 taagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30806268 taaatactaaacttaaaagtttccaattttataggaaccaaaaatatatttaacc 30806214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 430
Target Start/End: Original strand, 12469454 - 12469615
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaac-ctatt 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || | | |||||||  |||||    
T  12469454 ttcaaaaatttaggagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaatagggactaaaattaaaagtaattttttttt-taagaactaaaaaaatctatt 12469552  T
Q  369 aaaattaagtaaga-attaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||| | | |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12469553 aaaattaagtaaaagactaaacttagaagttcctaattttatagggaccaaaaacatatttaa 12469615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14122038 - 14121938
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14122038 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctatgcaacaaat 14121939  T
Q  113 t 113  Q
    |    
T  14121938 t 14121938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Original strand, 547343 - 547420
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  547343 taaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagagaccaaaaacatatttaaccc 547420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21159841 - 21159724
Alignment:
Q  314 taacagggcctaaaattagaagtaattctttttt-gtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagg 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  21159841 taacagggactaaaattagaagtatttatttttttgttgggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaattttatagg 21159742  T
Q  413 aaccaaaaacatatttaa 430  Q
     |||||||| ||||||||    
T  21159741 gaccaaaaatatatttaa 21159724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32244690 - 32244511
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  32244690 aatttaaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctacaaaaaatta 32244592  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    |  ||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||    | ||||||| |||||||||||    
T  32244591 tctcaaaattttatttatgcgtccagaattttgttacttttattttgaacttttgtctactaaaaaaatccatatttaatt 32244511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14121878 - 14121810
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14121878 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 14121810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Original strand, 41590680 - 41590752
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41590680 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttataggaactaaaaacatatttaacccttt 41590752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 3865698 - 3865883
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||| ||||||||| |  ||    
T  3865698 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctccaaaaaattatctca 3865796  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3865797 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 3865883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6590215 - 6590145
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6590215 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 6590145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42024504 - 42024231
Alignment:
Q  53 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaa-aaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaa 150  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| | |  ||||| || |||| |||||| ||||||| ||||     
T  42024504 ttttaaacaattttttgcagaagtgttaagaacattactaaaatttcatctgcaagaaaaatct--caaaattttatttctacgtcgagatttttgttac 42024407  T
Q  151 ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttcta 250  Q
    ||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||  | ||||||| |       |||||||||||||||||  ||| |||  || |||||||    
T  42024406 ttttatcttgaacttttgtctttcaaaaaaattcatatttaacccatttcatggtataaaa-ttctaaattttagtaaacaaacttttggtaatgttcta 42024308  T
Q  251 accgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcctaaaa 328  Q
    | | |||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42024307 aacttgtct--aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattagagaaactttgttttagcagggactaaaa 42024231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 356 - 435
Target Start/End: Original strand, 43988488 - 43988567
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43988488 taaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagacctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 43988567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Original strand, 2826919 - 2827029
Alignment:
Q  53 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatt 152  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||  | |||||| ||||||| ||  | |||||||||||| ||    
T  2826919 ttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatccacaaaaaatcatcgcaaaatttgatttctatattcagattttgttactt 2827018  T
Q  153 ttatctttaac 163  Q
    |||||||||||    
T  2827019 ttatctttaac 2827029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10409547 - 10409477
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10409547 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatatttaaccct 10409477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 435
Target Start/End: Original strand, 14122090 - 14122159
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14122090 attaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 14122159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44894698 - 44894574
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  44894698 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctccaaaaaattatctca 44894600  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt 145  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||    
T  44894599 aaattttatttctgcgtccagatttt 44894574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33322490 - 33322410
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  33322490 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagaaatcaaaaagatatttaacccttt 33322410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44893828 - 44893744
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44893828 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaatttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 44893744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Original strand, 36471145 - 36471236
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36471145 ttttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagatctctattttatagggaccaaaatcatatttaaccc 36471236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1680918 - 1680848
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1680918 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaagaggtcccaattttttagggaccaaaaacatatttaaccct 1680848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3866647 - 3866505
Alignment:
Q  53 ttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccag-attttgttaat 151  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||||| || |||| |  || ||| ||||||||| |    
T  3866647 ttttgaacaattttttgcacaagtgttaagaatattacgaaaagttcatatgcaaaaaattatctcaaaattttatttctgtgttcagaattttgttact 3866548  T
Q  152 tttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    ||||| || |||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  3866547 tttattttgaacttttgtctattaaaaaaatccatatttaatt 3866505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 432
Target Start/End: Original strand, 6413591 - 6413681
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  6413591 ttttttttagggattaaaaaaactattaaaattaagtaagaaataaacttaaaaggtcctaactttataaggaccataaatatatttaacc 6413681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24451454 - 24451364
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24451454 tttttgtaagaactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 24451364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37967492 - 37967414
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37967492 taaaaaaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaagatctcaattttatagggacgaaaaacatatttaaccct 37967414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 392
Target Start/End: Original strand, 10410101 - 10410226
Alignment:
Q  268 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaaccta 366  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |  | |||| || ||||| || | |||||||||  ||    
T  10410101 tcgttcaaaaatttaagactctaaggataattagagaaactttgttttaatagagactaaaacttcatgtaaatcatttttataggaattaaaaaagtta 10410200  T
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaactta 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  10410201 ttaaaattaagtaaggactaaactta 10410226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12469382 - 12469306
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || | |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  12469382 taaaaaaactattaaaatcaagtaagaattaaacttaaaaaatctcaattttatagagatcaaaaacatatttaacc 12469306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 30133849 - 30133933
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||    
T  30133849 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaaatctcaattttatagggaccaaaaacatat 30133933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 39337813 - 39337757
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39337813 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 39337757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 44894732 - 44894816
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44894732 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaagggctaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 44894816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 429
Target Start/End: Original strand, 38706763 - 38706850
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatattta 429  Q
    |||||| || ||| ||||| | ||||||||||||| |||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38706763 ttttttttagggactaaaataactattaaaattaaataaagactaaacttgaaagatccctattttatagggaccaaaaacatattta 38706850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 6243479 - 6243663
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || | |||| |||||| |||||||| |  |||||  || ||||| |||||||| || |||||||||| |  ||    
T  6243479 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaaatttt-gaacaaatttttgcacaagtgttagtaacattacgaaaagttcatccgcaaaaaattatctca 6243576  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||| | | |||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6243577 aaatttaatttctgcatccatatttttgttacttttattttgaacttttatcttttaaaaaaattcatatttaatttgtttcatgtt 6243663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 21160124 - 21160194
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21160124 ctattaaaactaaataaggattaaacttaaaatgtcccaattttatagggacaaaaaacatatttaaccct 21160194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Original strand, 30658771 - 30658841
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||| ||||    
T  30658771 taaaaaaactattaaaattaagtaagaattaaatttaaaaggtcccaattttgtagggaccagaaatatat 30658841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 41281621 - 41281711
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41281621 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 41281711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Original strand, 28755496 - 28755589
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| || | ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||    
T  28755496 ttttttgtaaagattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaaggtcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaaccctt 28755589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Original strand, 1663854 - 1663906
Alignment:
Q  117 gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt 169  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1663854 gcaaaaatttatttctatgtccagattttgttacttttatctttaacttttgt 1663906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Original strand, 5250735 - 5250803
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5250735 attaaaattaaataaggactaaacttgaaaggtctttattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 5250803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 35369984 - 35369928
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35369984 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttg 35369928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Original strand, 42950226 - 42950294
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |  | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42950226 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaagtaacaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 42950294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8784527 - 8784456
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8784527 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatatctgaattttatagggatcaaaaacatatttaaccctt 8784456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 409
Target Start/End: Original strand, 18304937 - 18305003
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  18304937 ttttttttaaggattaaaaaac-tattaaatttaagtaaggattaaacttaaaagatcccaattttat 18305003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1737529 - 1737439
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||  || | |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1737529 tttttgtaagaactaaaacaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgtctcaatttgataggaactaaaaacatatttaaccc 1737439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Original strand, 6244393 - 6244455
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  6244393 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaatatat 6244455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 13323873 - 13323963
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  13323873 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataaggactaaaaacatatttaaccc 13323963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Original strand, 17498813 - 17498907
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17498813 ttttttttagggactaaaaatactattagaattaagtaaggactaaacttaaaaagtcacaattttatagagaacaaaaacatatttaacccttt 17498907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21135294 - 21135204
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||| ||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21135294 tttttgtaaggactaaaacaattatgaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 21135204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 32243684 - 32243869
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32243684 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32243782  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||  | |||| ||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  32243783 aaattttattcctgcgtctagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaaattatatttaaattatttcatgtt 32243869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 35863011 - 35862921
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  35863011 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacgtatttaaccc 35862921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 39337841 - 39337931
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39337841 tttttgtaacgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 39337931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13323155 - 13323066
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  13323155 tttttgttaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 13323066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 21136266 - 21136355
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  21136266 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 21136355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 430
Target Start/End: Original strand, 44803401 - 44803474
Alignment:
Q  357 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  44803401 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtctcaattttacagggactaaaaacatatttaa 44803474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 3866714 - 3866798
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||| | ||||||  |||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  3866714 ttttttatatgaactaaaaacactattataattaagtaaggacaaaacttaaaagatcctaattttatagggaccaaaaacatat 3866798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 10409789 - 10409876
Alignment:
Q  23 tttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||  |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10409789 tttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaatttcttgcggaagtgttaagaacattactaaaagttcatctgcaaaaaa 10409876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 32244719 - 32244803
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  32244719 ttttttatatggactaaaaacactattataattaaataaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggtcaaaaaacatat 32244803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 36063746 - 36063834
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  36063746 tttttgtaaggacaaaaacagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 36063834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 39336941 - 39336873
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39336941 tattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 39336873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Original strand, 43602310 - 43602342
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43602310 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 43602342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 3865633 - 3865578
Alignment:
Q  371 aattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3865633 aattaattaaggaataaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 3865578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6244338 - 6244275
Alignment:
Q  142 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6244338 ttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 6244275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Original strand, 8525757 - 8525788
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8525757 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 8525788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 11089760 - 11089729
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11089760 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 11089729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17950479 - 17950448
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950479 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 17950448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34050685 - 34050598
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  34050685 caaaattttatttttaggtccaaattttgttagttttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcattacatgtt 34050598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44265393 - 44265330
Alignment:
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||  | |||| ||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44265393 taaaattaagtaaagactaaatttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatatttaac 44265330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17842436 - 17842342
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||  ||| || | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  17842436 ttttttgtagagactaaaagaactattaaaattatgtaaggactaaactttgaaggtctcaattttatagggactaaaaatatatttaacccttt 17842342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28701928 - 28701866
Alignment:
Q  33 ttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa 95  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  28701928 ttatgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgtagaagtgttaagaatattactaaaa 28701866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 431
Target Start/End: Original strand, 28701997 - 28702063
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||    
T  28701997 tattaaaattaagtaaggactaaacataaaagatctcaattttatagggatcaaaaatatatttaac 28702063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 32243648 - 32243566
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| ||| |||||||||    
T  32243648 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggacctaaaacatat 32243566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32985819 - 32985789
Alignment:
Q  403 attttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32985819 attttataggaaccaaaaacatatttaaccc 32985789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 487 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34972251 - 34972217
Alignment:
Q  487 catgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34972251 catgagcaatgatatttgtacatctatttaatgac 34972217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 35370012 - 35370102
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||  |  | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35370012 tttttgtgaggactaaaacaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgtttcgattttatagggactaaaaacatatttaaccc 35370102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 38504355 - 38504325
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaat 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38504355 atgagcaatgatatttgtacatccatttaat 38504325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 41255335 - 41255389
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttt 67  Q
    |||||| ||||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41255335 tcaattcaaatttgtttaattagtgtttaatctcttgagtttttgaacaattttt 41255389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17498538 - 17498435
Alignment:
Q  325 aaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacat 424  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||| | |||||||| || || || |||||||||| | ||| |||||    
T  17498538 aaaattagaagaactt-ttttttgtatgaactaaaaatc-tattaagattaagtaaggactaaacttataaatttccaattttatagggatcaataacat 17498441  T
Q  425 atttaa 430  Q
    ||||||    
T  17498440 atttaa 17498435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Original strand, 24452424 - 24452513
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  24452424 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 24452513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 40304935 - 40304870
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | | |||||| | |||||||||||||||||    
T  40304935 tattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtctcaagtttataaggaccaaaaacatatttaa 40304870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Original strand, 2821319 - 2821386
Alignment:
Q  358 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||  || ||||||||||    
T  2821319 aaaaaactattaaaattaagtatgaactaaacttaaaaggttcc-attttatagtgacaaaaaacatat 2821386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 433
Target Start/End: Original strand, 9376197 - 9376225
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9376197 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 9376225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16478468 - 16478432
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttg 49  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16478468 tcaattgaaatttgttcaatttatgcttaaactcttg 16478432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Original strand, 20895893 - 20895925
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20895893 tgagcaatgatatttgtacatccatttcatgac 20895925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27000751 - 27000663
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| |  || |||||||| ||||||||    
T  27000751 ttttttatagggactaaaaaagatattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttccgatttaacggggaccaaaaatatatttaa 27000663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 28694963 - 28694999
Alignment:
Q  33 ttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28694963 ttatgcttaaactctagagtttttgaacaattttttg 28694999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 521
Target Start/End: Original strand, 30927818 - 30927850
Alignment:
Q  489 tgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30927818 tgagcaatgatatttgtacatccatttcatgac 30927850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35369160 - 35369108
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35369160 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa 35369108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36333275 - 36333227
Alignment:
Q  146 gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||    
T  36333275 gttaattttatctttaacttttatcattttaaaatatttatatttaatt 36333227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 430
Target Start/End: Original strand, 36910697 - 36910784
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||||| || ||||||   |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  36910697 ttttttgtaggggttaaaattgctatcaaagttaagtaagaattaaatttaaaagttttcaattttataggga-taaaaacatatttaa 36910784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 111)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 7439220 - 7439639
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7439220 tcaattcaattttttttaatttatgcttaaactcttgtgtttttgaacaattttttactgacgtgtcaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 7439319  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  7439320 tgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 7439418  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7439419 ttctaaattttactaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaactttgt 7439518  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  7439519 tgtaacagagactaaaattagaagtaattattttttgtagggattaaaaaacctatttaaattaagtaaggattaaacttataagtttccaattttatag 7439618  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  7439619 ggaccaaaaacaaatttaacc 7439639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33832418 - 33831996
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33832418 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctacaaaaaat 33832319  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||           
T  33832318 tgtcgcaaaatttgatttgtacgtccagaatttgttaattttatcttatacttttgtcattttaaaaaattcatatttaattcgtttca--tttaaaaaa 33832221  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33832220 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgtttaaaaatttaagagtttaaggataattaaacagactttgt 33832121  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
      ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  33832120 cgtaacaaggactaaaattagaagtaatttttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatag 33832021  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
      |||||||||||| ||||||||||    
T  33832020 agaccaaaaacataattaacccttt 33831996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 433
Target Start/End: Original strand, 10357322 - 10357736
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10357322 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattgtcgaa 10357421  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||       |||||||    
T  10357422 aaatttgatttctacgcccagattttgttaattttatctttaacttttaccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttaaggtt-aaaaaattctaaa 10357520  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  10357521 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaagataattaaacaaactttgttgtaata 10357620  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
    |||  ||||||||||||||| || |||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||| || |    
T  10357621 gggattaaaattagaagtaattttttttttataaggactaaaaaatctattaaaatcaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatagggacaa 10357720  T
Q  418 aaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||||||    
T  10357721 aaaacatatttaaccc 10357736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 31771316 - 31771739
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31771316 tcaattcaaatttgtttaattgatgcataaactcttaagtttttgaacaattttttgtaaacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 31771415  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | |||||||| || |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||           
T  31771416 tattgcaaaatttaatttctacatccagattttattacttttatctttaacttttgtcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcatgttaaaaaat 31771515  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31771516 tt-taaattttagtaaatgaaactttcatagtgttctaaacttgtgtcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 31771614  T
Q  312 tttaaca-gggcctaaaattagaagt-aattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||   ||||||    
T  31771615 tttaacaggggactaaaattagaagtaaatttttttttgtatggactaaaaaaactattaaaattaa-taaggactaaacttagaagttcctcgttttat 31771713  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31771714 agggaccgaaaacatatttaaccctt 31771739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42274596 - 42274173
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42274596 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcatgagttttcaaacaaatttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 42274497  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  42274496 tgtcgcaaaatttgatttctatgtctagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatattaaaaaaa 42274397  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42274396 -tctaaattttggtaaatgaacctttcataatgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaattttgt 42274298  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttta 408  Q
    | |||| ||| |||||| |||||||||   || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||    
T  42274297 tgtaactgggactaaaactagaagtaattttttttttttgtaaggactaaaaaacctatt-aaattaagtaaggactaaacttagaagttcctaatttta 42274199  T
Q  409 taggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  42274198 tagggaccaaaaacatatttaaccct 42274173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 41120738 - 41121160
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41120738 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 41120837  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||           
T  41120838 tgtcgtgaaatttgatttctacgtccatattttgttaattttatctttaatttttgccg-tttaaaaaattcttatttaattcgtttcatgttaaaaaag 41120936  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaca-aactttgt 311  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||| | || || | ||||||||    
T  41120937 -tctaaattttggtaaatgaacttttcatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagggttatgaaaacaactttgt 41121035  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaa--ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    | ||| |||| |||||| |||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||    
T  41121036 tgtaatagggactaaaactagaagtaatttttttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaactttat 41121135  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  41121136 agggaccaaaaacatatttaaccct 41121160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 25100585 - 25101001
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25100585 tcaattcaaatttgtttaatttattgtaat-ctcttaagtttttgaacaatattttacagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 25100683  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |           
T  25100684 tgtcgctaaatttgatttttacgttcagattttgttaattttagctttaacttttgccgttttaaaagattcatatttatttcgtttcatgctaaaaaaa 25100783  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25100784 aattaaattttagtaagtgaacctttcatagtgttctaaacttgtctc-aaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 25100882  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||    
T  25100883 tgtaacagggactgaaattagaagtaattcttgtttgtaaggactaaaaaacct-taaaaattaagtaagaattaaacttaaaaatttcaaatttta-ag 25100980  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  25100981 ggaccaaaaacatatttaacc 25101001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 432
Target Start/End: Original strand, 31436045 - 31436456
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31436045 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaatttttcgcagacgtactaagaacaatactaaaagttcatctacaaaaaattgttgca 31436144  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  31436145 aaatttgatttctacgttcagaatttgttaattttatctttaacttttg-tcatttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaattctaaa 31436242  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  31436243 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttataaacttgtcataaaaaaatcgttcaaaaatttaagtgtttaaggataattaaacaaactttgtcataaca 31436342  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
     || |||||||||||||||| || |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||  | ||||    
T  31436343 aggactaaaattagaagtaattttttttttatagggaccaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaactt-agagttcccaattttatttggacca 31436441  T
Q  418 aaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||||||    
T  31436442 aaaacataattaacc 31436456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40365179 - 40364759
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgct-aaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  40365179 tcaatttaaatttgtttaatttatgtttaaaacccttgagttttgga-caattttttgcttatatgttaagaacattactaaaagttcatcggcaaaaaa 40365081  T
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  40365080 ttgtcacaaaatttgatttatacgtccatattttgttacttttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaa 40364982  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||     
T  40364981 attctaaattttagtaaatgaaccttcaatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttgaggatagttaaacaaacttta 40364882  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    ||||| || ||  ||||||||||||||||  ||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||    
T  40364881 ttttagcatggattaaaattagaagtaat--tttttttcaagtactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacctaaaagtttccaattttata 40364784  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    || ||||||| ||||||||||||||    
T  40364783 gggaccaaaagcatatttaaccctt 40364759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13372167 - 13371870
Alignment:
Q  136 tccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacc 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  13372167 tccagattttgtttattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaat-ttctaaattttagtaaatgaacc 13372069  T
Q  236 tttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaa 334  Q
    |||||||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | |||||| ||||||||||||    
T  13372068 tttcatagtgttctaaacttgtctaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttagtgttacagggactaaaattagaa 13371969  T
Q  335 gtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13371968 gtaattcttttttgtatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagtttccaattttatagggaccaaaaacatatataaccc 13371870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 434
Target Start/End: Original strand, 30784185 - 30784594
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  30784185 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttagaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaaaagctcatctgcaaataat 30784284  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  30784285 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccata-tttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 30784382  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||| | ||||||       | |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30784383 ttctaaattttagtaaatgaac--------gtgttctaaacttgtctcaaaaatattgttc-aaaatttaagaattttaggataattaaacaaactttgt 30784473  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatag 411  Q
    | ||||| || ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| | | |||||||    
T  30784474 tgtaacatggactaaaattagaag-attttttttttgtagggattaaaaaacctattaaaattaagtaaagactgaacttaaaagttctc-aatttatag 30784571  T
Q  412 gaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  30784572 ggaccaaaaacatatttaaccct 30784594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44286978 - 44286563
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgcta---aaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||| | |  ||||    
T  44286978 tcaattcaaatttgtttaatttataatacttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcggacgtgttaagcacattactaaaagttcatttaaaaaa 44286879  T
Q  110 aattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnn 209  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||        
T  44286878 aattgtcgctaaatttgatttctacgttcagattttgttaattttatctttaagttttggcgttttaaaaaattcata----attcgtttcatgttaaaa 44286783  T
Q  210 nnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactt 308  Q
       || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44286782 aa-ttgtaaattttagtaaatgaatctttcatagtgttctaaatttgtctcaaaaaaatcgttcaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaactt 44286684  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctatttta 408  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  44286683 tgttgtaatagggactaaaattataagtaatt--tttttgtagggattaaaaaacctattaaaattaattaagaactaaacttaaaagttcctaatttta 44286586  T
Q  409 taggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    || | | ||||||||||||||||    
T  44286585 taaggatcaaaaacatatttaac 44286563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3043656 - 3043323
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  3043656 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgaattattgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagctactctgcaaaaaat 3043557  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||           
T  3043556 tgtggcaaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaattagttttatgtt-aaaata 3043458  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||       ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3043457 ttctgaattttagtaaatgaacctttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttaaaaaatttatgagtttaaggataattaaacaaactttgt 3043358  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttt 346  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  3043357 tgtaacaggaactaaaattagaagtaatttttttt 3043323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8738100 - 8737703
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa-ttgttgc 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || || |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  8738100 aaatttgtttaatttatgcttaaattcttgagtttttgaacaattttatacagacgtgttaaaaacattacgaaaagtttctctgcaaaaaaattgtcgc 8738001  T
Q  119 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||    
T  8738000 aaaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgctgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaatt-taa 8737902  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaac 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||         ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  8737901 attttagtaaacgaacctttcatagtgttctaaacttttctaaaaaaaaccgttcaaaaatttaagattttaaggataattaaataaactttgttgtaac 8737802  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacca 417  Q
    |  | |||||||||                ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  8737801 aatgactaaaatta----------------gtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttcccaattttatagg-acca 8737719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Original strand, 6457266 - 6457537
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||     
T  6457266 tcaattcaaatttgtttaatttatggttaaactcttgagtttttgaacaattttttgaagacgtgttgagaacattaataaaagctcctctgcaaaaaaa 6457365  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
      | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  6457366 attcgtaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 6457465  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaag 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||       |||||||||||||||||    
T  6457466 ttctaagttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaaggtgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaag 6457537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43933029 - 43932727
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43933029 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaataattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaat 43932930  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  43932929 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttcacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 43932831  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | | ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43932830 ttctaaattttaataattgaacctttcatattgttctaaacttctctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 43932731  T
Q  312 ttta 315  Q
    ||||    
T  43932730 ttta 43932727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37593171 - 37592760
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37593171 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcctgagtttttgaacaattttttgcagctgtgttaagaatattactaaaagttcctttgcaaaaaat 37593072  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||  |||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||||||           
T  37593071 tgccgcaaaatttgacttttacgttcaaattttgttaattttatctttaacttttgtcatttt---aaattcatatttaatccgtttcatgtt-aaaaaa 37592976  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaa---ctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||             | |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  37592975 ttctaaattttagtaaatgaacttttcatggtgttctaaatttgtc-------------taaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacgtctt 37592889  T
Q  309 tgttttaacagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgta-tggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattt 406  Q
    || | ||||  || |||||||||||||||| || ||||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||    
T  37592888 tgatgtaactaggactaaaattagaagtaattttttttttgcaggggctaaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttttcaattt 37592789  T
Q  407 tataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  37592788 tatagagaccagaaacatatttaaccctt 37592760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 331
Target Start/End: Original strand, 44492883 - 44493202
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  44492883 tcaattcaaatttgtttaagttatgttgaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagtttccctgcaaaaaat 44492982  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgtt-gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||          
T  44492983 tatcgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaactttttttcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttgatgtt-aaaat 44493081  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  44493082 attataaattttagtaattgaacctttcatagagttctaaacttatctcaataaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttta 44493181  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaatta 331  Q
    ||||  ||||| |||||||||    
T  44493182 tttttgcagggactaaaatta 44493202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 42487963 - 42487639
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| | |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42487963 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaatttttt-aacaattttttgtagatgtgttaagaacattattaaaagttcctctgcaaaaaat 42487865  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
      | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||           
T  42487864 aatcgcaaaatttgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttatcgttttaaaaaattcatattgaattcatttcatgttaaaaaaa 42487765  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataat-taacaaactttgt 311  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  42487764 atttaaattttagtaattgaacctttcatagcgttttaaacttgtctcaaaaaaatcattcaaaaatttaagagtttaaagataatcaaacaaactttgt 42487665  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagta 337  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  42487664 tttagcagggactaaaattagaagta 42487639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20721511 - 20721175
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  20721511 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 20721414  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  20721413 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 20721326  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20721325 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaactttgt 20721226  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  20721225 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttgcagggactaaaaaa 20721175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44879995 - 44879594
Alignment:
Q  24 ttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaa 123  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||     
T  44879995 ttgtttaatttatgcttaaacttttgagtttttaaacaattttttgcagatgtgttaagatcattactaaaagtttatgtgcaaaaatttgtcgcaaaat 44879896  T
Q  124 ttgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaatttt 223  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||    
T  44879895 ttgattt-tatgtccagattttcttaactttatctctaacttttga------aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaat-ctaaatttt 44879804  T
Q  224 agtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggc 322  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||   |||||        |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||| ||     
T  44879803 gttaaatgaacttttcatagtgttctaaatttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttagagatagttaaacaaactttgttgtaacatgga 44879704  T
Q  323 ctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaac 422  Q
     |||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||    
T  44879703 ttaaaattataagtaaattttttttgtaaggactaaaaaacatactaaaattaagtatggattaaacttaacagttttcaattttatacggaccaaaaac 44879604  T
Q  423 atatttaacc 432  Q
    ||||||||||    
T  44879603 atatttaacc 44879594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 25666038 - 25666275
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25666038 tcaattcaaatttatttaatttatatttaaactcttgagtttttgaacaattttttacagacgtattaagaacattactaaaagttcctatgcgaaaaat 25666137  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  25666138 tgtcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttacttttaatttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 25666237  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25666238 at-taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 25666275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36512263 - 36512033
Alignment:
Q  21 aatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  36512263 aatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaggacgtgttaagaatattactaaaagtttctctgtaaaaaattgtcgca 36512164  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       |||||||    
T  36512163 aaatttgatttttacatccagattttattaattttatctttaacatttgtcgttttaaaaaatccatatttaatttgttttatgtt-acaaaattctaaa 36512065  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  36512064 ttttagaaaataaacatttcatagtgttctaa 36512033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21440114 - 21439778
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  21440114 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagtttttaaacaattttttgtaatcgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cataaaat 21440017  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||           
T  21440016 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgtttttaaaaatttatatttaattcgtttcaagttaaaaaaa 21439928  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21439927 tt-taaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcattcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgt 21439829  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  21439828 tttagtagggactaaaattagaagtgatttttttttgtagggactaaaaaa 21439778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14201260 - 14200838
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa--t 112  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||  |    
T  14201260 aattcaaatttgtttaatt-atgcttaaactcttaagtttgtgaataattttttgtagccgtgttaagaacattactaaaagttcatccgtaaaaaaaat 14201162  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaa-ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattc-atatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
    | |  ||||| ||||||| ||||||||  |||| ||   ||||||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||         
T  14201161 tatctcaaaatttgatttctacgtccaatttttttttgcttttatcttgaacttttgtcatttaaaaaaaatccatatttaattcatttcatgttaaaaa 14201062  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaacttt 309  Q
      |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| | ||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14201061 a-ttctaaattttattaaatgaaccttttgtaatgttctaagcttgtctcagaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaacttt 14200963  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    |||||| ||| | |||||||||   |||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  | |||||||    
T  14200962 gttttagcagagactaaaattacctgtaaatattttttgtagggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatgtcaattttat 14200863  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  14200862 agggaccaaatacatatttaaccct 14200838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 35498588 - 35498768
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35498588 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttgttgaacaatttttcgcagacgtgttaagaacattactaaaagtttctctacaaaaaat 35498687  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaat 193  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  35498688 tgtcgcgaaatttgatttctacgtccagaatttgttaattttatctttaacttttgtcatttttaaaaattcatatttaat 35498768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29809295 - 29809130
Alignment:
Q  268 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaaccta 366  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29809295 tcgttccaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtaattcttttctgtatggactaaaaaaccta 29809196  T
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29809195 ttaaaattaagtaaggattaaacttagtcattcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 29809130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 372
Target Start/End: Original strand, 18672317 - 18672550
Alignment:
Q  135 gtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaac 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||| |||||    
T  18672317 gtccagattttattacttttatcttt----tttatcgtcttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa-ttataaattttagtaattgaac 18672411  T
Q  235 ctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattaga 333  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  18672412 ctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagcagtgactaaaattaga 18672511  T
Q  334 agtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18672512 agtaatttttttttgtagggactaaaaaacctactaaaa 18672550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 268 - 432
Target Start/End: Original strand, 35498806 - 35498970
Alignment:
Q  268 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaaccta 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  35498806 tcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgtcgtaacaaggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaaccta 35498904  T
Q  367 ttaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35498905 ttaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggatcaaaaacataattaacc 35498970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34073865 - 34073621
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||    
T  34073865 tcaatttaaatttgttta-tttatgcctaaactcttg--tttttcaacaattttttgcagacatgtttagaacattactaaaagttcctccataaaaaat 34073769  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaatttt-atctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| || |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||          
T  34073768 tatcgcaaaatttaatttctacatccatattttgttactttttatctttaacttttgtagttttaaaaaattcatatttaattcgtttcttgtt-agaaa 34073670  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc 260  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  34073669 attctaaattttattaaatgaatctttcttagtgttctaaacttgtctc 34073621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8392615 - 8392207
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||   |||| | | |   |    
T  8392615 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacaaacgtgttaagaatgttattaaaagtttctccataaaagaatatcata 8392516  T
Q  120 aaaa-ttgatttatacgtccagattttg-ttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||| ||||||| || ||  | |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||       |||||    
T  8392515 aaaaattgatttctatgtgtacattttggttacttttatctgaaacttttgtcgtttacaaaaattcatatttaatttatttcacgttaaaaaa-ttcta 8392417  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaac-cgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgtttta 315  Q
     |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||          ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8392416 gattttattaaatgaaccttttatattgttctaaaacttgtct----------gttgaaaagtttaagagtttaaggataattaaacaaattttgtttta 8392327  T
Q  316 acagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
     ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| | || ||||||| |     
T  8392326 gcagggactaaaattataagtaaattttttttgtagggattaaaaaaactattaaaattaagtaatgattatacttagaagttctcaatcttatagggat 8392227  T
Q  416 caaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  8392226 caaaaagatatttaatcctt 8392207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Original strand, 20719949 - 20720274
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20719949 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacta---agttttttaacaatttttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 20720045  T
Q  112 ttgtt-gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
     |  | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||         
T  20720046 ataatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcaaatt-aaaa 20720144  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
      |||||||||||||||| ||||||       ||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  20720145 aattctaaattttagtaattgaacc-------gtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaacttt 20720237  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttt 346  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  20720238 gttttagaagggactaaaattagaagtattttttttt 20720274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33001147 - 33000920
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  33001147 aaatttctttaatttatac--aaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttactccgcaaaaaattatcgca 33001050  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| |||| ||||| ||||||| |||  || |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  33001049 aaatttga-ttatatgtccaga-tttaatacttttctctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaattctaaa 33000952  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  33000951 ttttagtaattgaacatttcatattgttctaa 33000920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 300 - 434
Target Start/End: Original strand, 25666290 - 25666424
Alignment:
Q  300 aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttc 399  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  25666290 aacaaactttgttgtaatagagactaaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaatctattaaaattaaataaggattaaacttaaaaggtc 25666389  T
Q  400 cctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25666390 cctattttacagggaccaaaaacatatttaaccct 25666424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 433
Target Start/End: Original strand, 6458408 - 6458561
Alignment:
Q  281 taagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagta 379  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6458408 taagtgtttaaggataattaaacaaactttgttgtaacatggactaaaattagaagtatttttttcttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagta 6458507  T
Q  380 agaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||    
T  6458508 agaattaaacttagaagttcccaaatttataaggatcaaaaacatatttaaccc 6458561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29809562 - 29809401
Alignment:
Q  76 tgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgtttt 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29809562 tgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaattatcgcaaaatctgatttctacatccaaattttgttaattttatcattaacttttgtcgtttt 29809463  T
Q  176 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaaccttt 238  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  29809462 aaaaaaatcatatttaattcctttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaaccttt 29809401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 309
Target Start/End: Original strand, 33031165 - 33031346
Alignment:
Q  127 atttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||| ||    
T  33031165 atttttacgtccagattttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattcata-ttaattcgtttcatgttaaaaaaa-tctaaattttggt 33031262  T
Q  227 aaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33031263 aaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtcttaaaaaaatcgttcaaaaatttaagaatttaaggataattaaacaaacttt 33031346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 302 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30749555 - 30749427
Alignment:
Q  302 caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccc 401  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||    
T  30749555 caaactttgttgtaacagggcttaaaattagaagcaattctttt--gtaggaattaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggttcc 30749458  T
Q  402 tattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  30749457 tattttataaggactaaaaacatatttaacc 30749427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32319232 - 32319001
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32319232 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32319134  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    |||||| |||  | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  32319133 aaaatttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaaattctaa 32319034  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    | ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  32319033 aatttagtaaatgaacctttagtaatgttctaa 32319001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7655007 - 7654925
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaa 95  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7655007 tcaatttaaatttgtttaatttatggttaaactcttgagtttttgaatagttttttgcaaacatattaagaacattactaaaa 7654925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20719326 - 20719228
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20719326 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttctaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 20719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 434
Target Start/End: Original strand, 33031343 - 33031436
Alignment:
Q  341 cttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33031343 cttttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaatgactaaacttagaagttcctaattttataggtatcaaaaacatatttaaccct 33031436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Original strand, 3043705 - 3043773
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3043705 ctattaaaattaaataagaattaaacttaaaagatcccaattttataggaaccaaaaatatatttaacc 3043773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41120714 - 41120622
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41120714 tttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatatttaaccctt 41120622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 3117981 - 3118166
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |  ||    
T  3117981 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttaagattttgaacaaattattgcacaaatgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaataatctca 3118079  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||| | |||| ||| |||| ||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3118080 aaattttatttctgcgtctagattttttttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt 3118166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 3118828 - 3118912
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  3118828 ttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaagatat 3118912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 32318223 - 32318398
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttttt-gcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| |  |    
T  32318223 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaatttttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaatgattatctc 32318321  T
Q  119 aaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    |||| || |||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  32318322 aaaattttatttctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtctattaaaaaaattcatatttaatt 32318398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 35498521 - 35498449
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35498521 ctattaaaattaagtaaagactaaacttaaaaggtcccaattttataggaactaaaaacatatttaacccttt 35498449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19176721 - 19176643
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  19176721 taaaaaacctattaaaattaagtaataactaaacttaagaattcccaattctatagggactaaaaacatatttaaccct 19176643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Original strand, 33031087 - 33031165
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaa 93  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  33031087 aattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgaatttttaaacaattttttgcagacgtgttaagaacattactaa 33031165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25100558 - 25100465
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | || |||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25100558 ttttttttagggactaaaatagctattaaaattaagtaaggactagacttgaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 25100465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 377
Target Start/End: Original strand, 36881222 - 36881383
Alignment:
Q  216 taaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaac-aaactttgtttt 314  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | ||||         || ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  36881222 taaattttagttattgaacctttcatagcgttctaaacttgtcaaaaaaaaatcattcaaaatttttagagtttaaggataattaaataaattttgttgt 36881321  T
Q  315 aacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaag 377  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  36881322 aacagagactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagaagctaaaaaacctattaaaattaag 36881383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Original strand, 4327940 - 4328016
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  4327940 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggactaaaaacatatttaacc 4328016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 30982594 - 30982510
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  30982594 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 30982510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 32318189 - 32318105
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32318189 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 32318105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6457219 - 6457152
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6457219 ctattaaaattaagtaagaactaaacttaaaaggtccaaattttataggggccaaaaacatatttaac 6457152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3104965 - 3104875
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3104965 tttttgtaaggactaaaataactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 3104875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13027533 - 13027450
Alignment:
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 301  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13027533 aattttagtaaacgaaccttttataatgttctaaacgtgtctccgaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa 13027450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31771267 - 31771197
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31771267 ctattaaaattaagtaaggactaagcttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 31771197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 32319268 - 32319350
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  32319268 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatat 32319350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 430
Target Start/End: Original strand, 44287026 - 44287092
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44287026 ctattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagtccccaattttatagggaccaaaaacatatttaa 44287092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9111542 - 9111458
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  9111542 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatat 9111458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 430
Target Start/End: Original strand, 13027767 - 13027855
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||| || ||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13027767 ttttttatagggactaaaaaaacaattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 13027855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23787838 - 23787782
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23787838 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 23787782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1026438 - 1026367
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1026438 tattaaaattaagtaagtattaaatttagaagttttcaattttataaaaaccaaaaacatatttaacccttt 1026367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 3117926 - 3117864
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  3117926 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggaccaaaaacatat 3117864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 358 - 432
Target Start/End: Original strand, 8738619 - 8738693
Alignment:
Q  358 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||    
T  8738619 aaaaaactattaaaattaagtaaagattaaacttgaaaggtcccaattttatagggaccaaaaatatttttaacc 8738693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 20719354 - 20719444
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20719354 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 20719444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31435989 - 31435919
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31435989 ctattaaaattaagtaaagactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 31435919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 42487991 - 42488081
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  42487991 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 42488081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 426
Target Start/End: Original strand, 7655058 - 7655118
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  7655058 tattaaaattaagtaagaactaaacttaaaag-tcccaattttatagggacaaaaaacatat 7655118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 431
Target Start/End: Original strand, 8392673 - 8392738
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8392673 attaaaattaagtaaggactaaatttagaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaac 8392738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 338
Target Start/End: Original strand, 18917309 - 18917523
Alignment:
Q  119 aaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  | | | |||||| |||| |  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||           ||    
T  18917309 aaaaattgatttttacgttcagattttgtttctataacctttaaattttctcatttaaaaaaaatcatatttaatttgtttcatgttaaaaa------aa 18917402  T
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaac 317  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||       || ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  18917403 aaattagcaaatgaacctttcatagtgttctaaatatgtctcaaaaaaatcattcgaaaatttaagaatttaaagataattaaacaaactttgttttagc 18917502  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaa 338  Q
    || | ||||| ||| ||||||    
T  18917503 agagactaaacttacaagtaa 18917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33030980 - 33030903
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  33030980 taaaaaaactattaaaattaaataaagactaaacttaaaagatcccaattttatagagatcaaaaacatatttaaccc 33030903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 433
Target Start/End: Original strand, 40365226 - 40365295
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  40365226 ctattaaaattaagtaaggagtaaacttaaaagatccaaattttatagggatcaaaaatatatttaaccc 40365295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 20701256 - 20701312
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  20701256 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacttttaagttttttaacaattttttg 20701312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20719921 - 20719833
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  20719921 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaac 20719833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 21439296 - 21439352
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21439296 tcaattcaaatttatttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 21439352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 30982713 - 30982796
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30982713 ttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 30982796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16069139 - 16069100
Alignment:
Q  448 aaatgacatagataagcatgaaaatagtgttgtaaataac 487  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069139 aaatgacaaagataagcatgaaaatagtgttgtaaataac 16069100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 419
Target Start/End: Original strand, 23497332 - 23497415
Alignment:
Q  336 taattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaa 419  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  23497332 taatttttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaagtaagggataaaattataagtttcagattttctaggaaccaaa 23497415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 9111999 - 9112081
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||    
T  9111999 ttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggacctaaaacatat 9112081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13027735 - 13027654
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctc 102  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  | |  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13027735 aaatttgtttaatt-atgcttaaacacttaagtttttgaacaattttttatacatttgttaagaacattactataagttcctc 13027654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20701228 - 20701138
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  20701228 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaatcatatttaaccc 20701138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 20721540 - 20721630
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  20721540 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggggctaaaaacatatttaaccc 20721630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 21440142 - 21440232
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  21440142 tttttgtaagaactaaaataactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgtcacaattttataaagactaaaaacatatttaaccc 21440232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32319809 - 32319624
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||| |  ||    
T  32319809 aaatttgtttaatt-atgtttaaacttttatgattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacatcatgaaaagtttatctgcaaaaaattatctca 32319711  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccaga-ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||| || |||  | |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  32319710 aaattttattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttcacttttaaaaaaaatcatatttaatttatttcatgtt 32319624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Original strand, 34073909 - 34073979
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||| | || |||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  34073909 ctattaaaattaagtaaggactaaatttaaaaggttccaattttatagggactaaaaatatatttaaccct 34073979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 43933057 - 43933147
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  43933057 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaatatatttaaccc 43933147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44492855 - 44492765
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  44492855 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaccatatttaaccc 44492765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44610719 - 44610645
Alignment:
Q  357 aaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  44610719 aaaaaaactattaaaattaagttaggaataaacttagaaggtcccaattttttagggaccagaaacatatttaac 44610645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Original strand, 18672259 - 18672312
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaatttt 66  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18672259 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttgaactcttaagttttttaacaatttt 18672312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Original strand, 30413618 - 30413651
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30413618 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 30413651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Original strand, 1373521 - 1373609
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  1373521 tttttttaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 1373609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 434
Target Start/End: Original strand, 10287452 - 10287543
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagt-aagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||    |||||||||||| ||||||    
T  10287452 tttttgtagggactaaaaaac-tattaaaattaagtaaaaaattaaacttaaaacttccgaattttatagtggtcaaaaacatattcaaccct 10287543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18672231 - 18672179
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18672231 tttttgtaaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa 18672179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25665989 - 25665929
Alignment:
Q  366 attaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  25665989 attaaaattaagtaaggattaaacttgaaagacctctattttacagggaccaaaaacatat 25665929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 521
Target Start/End: Original strand, 6851559 - 6851590
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6851559 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 6851590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 424
Target Start/End: Original strand, 13372254 - 13372324
Alignment:
Q  353 gattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacat 424  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  13372254 gattaaaagaactattaaaattaagtaag-actaaacttgaaaggtccaaattttatagggaccaaaaacat 13372324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 431
Target Start/End: Original strand, 14201303 - 14201378
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||  |||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  14201303 taaaaaacctattaaaattaagcaaggactaaaattagaaagtcctgattttatagggactaaaaacatatttaac 14201378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Original strand, 33001183 - 33001274
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||||   | | |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  33001183 ttttttgtaaggactaaaataactattaaaattaagtaaggaatgaacttaaaaagcctcaattttatagggactaaaaacatagttaaccc 33001274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Original strand, 36512297 - 36512387
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||| || ||| ||||| | || |||||||||| |||  | |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36512297 ttttttttagggactaaaagaactgttaaaattaaataaagactaaacttaaaaggtcca-attttatagggaccaaaaacatatttaaccc 36512387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 4327898 - 4327848
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattt 65  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  4327898 aattcaaatttgtttaatttatgcttaaactattaagcttttgaacaattt 4327848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Original strand, 6532507 - 6532537
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6532507 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 6532537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21439268 - 21439178
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21439268 tttttgtaagtactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttacaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 21439178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 490 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 27540186 - 27540156
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatga 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27540186 gagcaatgatatttgtacatccatttaatga 27540156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42487025 - 42486936
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccct-attttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  42487025 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa-tgccttaattttacagggactaaaaacatatttaacc 42486936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 36582445 - 36582408
Alignment:
Q  484 taacatgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36582445 taacaagagcaatgatatttgtacatccatttgatgac 36582408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 435
Target Start/End: Original strand, 44613174 - 44613207
Alignment:
Q  402 tattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44613174 tattttataggaatcaaaaacatatttaaccctt 44613207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 433
Target Start/End: Original strand, 22083511 - 22083539
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083511 tttataggaaccaaaaacatatttaaccc 22083539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45301367 - 45301279
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt 205  Q
    ||||| || |||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  45301367 caaaattttatttttaggtccaaattttcgttaatcttatcttgaatttttggcgttttaaaaaaattatatttaattcatttcatgtt 45301279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17669 - 17255
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||     
T  17669 aattcaaatttgtttaatttatagttaaactcttaagtttttgaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgtaaaaaatta 17570  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnntt 214  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||    
T  17569 ttgcaaaatttgatttttaagtccagattttattacttttatctttaacttttgttgttttaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt--aaaaatt 17472  T
Q  215 ctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttt 313  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17471 ctaaattttagtaaatgaatctatcatggtgttctaaacttgtctcaaaaaaatctttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttattt 17372  T
Q  314 taacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttatagga 413  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||     
T  17371 tagtagggactaaaattaaaagtaatttatttttgtagggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttagaaattctcaattttataggg 17272  T
Q  414 accaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||||||||||||    
T  17271 accaaaaacatatttaa 17255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Original strand, 17699 - 17791
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||| || | |||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  17699 ttttttgtagggattaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaagctctcaattttataaggactaaaaacatatttaaccct 17791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7151 - 6809
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7151 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagttttttaacaattttttgtagacgtgttaaaaacattactaaaagttcctctgcaaaaaattatcgca 7052  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||    
T  7051 aaatttgatttatatgtccaaattttattatttttatctttaatttttatcgttttcaaaaattcatatttaatttgtttcatgttaaaaaaattctaaa 6952  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6951 ttttagtaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcagaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttgttttagca 6852  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  6851 -ggactaaaattagaagtaatttttttttgtaaggactaaaaaa 6809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 7186 - 7275
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7186 tttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagg-actaaaaacatatttaaccc 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1191
Description:

Target: scaffold1191; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 669 - 1087
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||    
T  669 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgataagaacattactaaaagttcatctgc-acaaat 767  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    ||| |||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  768 tgtcgcaaaatttgatttttgagtccagaatttgttaattttatctttaacttttttcattttaaaaaattcatatttaattcgtttcatctt-aaaaaa 866  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtct-cnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataat-taacaaactttg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||         ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||     
T  867 ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttatctaaaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataatcaaacaaactttt 966  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||    
T  967 ttgtaagagggactaaaattagaagtaact-ttttttgtagggactaaaaaa-ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaatttccaattttata 1064  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    || |||| ||||||| |||||||    
T  1065 gggaccagaaacatagttaaccc 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6470 - 6054
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6470 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttgagtttttcaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcatctacaaaaaat 6371  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaa--ttcgtttcatgttnnnnn 210  Q
    ||| |||||| ||||||| || | ||| | |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||         
T  6370 tgtcgcaaaatttgatttctaggcccaaactttgttaa-tttatctttaatttttctggttttaaaaaaatcatatttaatttttttttcatgtt-aaaa 6273  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||       ||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||    
T  6272 aattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaaga-------gataattaaacaaacttt 6180  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttat 409  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  6179 gttgtaacaaggactaaaattagaagtaattttcttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttat 6080  T
Q  410 aggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||| || || || |||||||| ||||    
T  6079 agggacaaagaatatatttaagcctt 6054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Original strand, 6519 - 6587
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6519 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 6587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold1190
Description:

Target: scaffold1190; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 75
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  486 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacacatgagtttttgaacaattttttggagacgtgttaagaacattactaaaagttcctctgcaaaaaat 387  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgttt-catgttnnnnnn 211  Q
    |||  ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||            ||| ||||| ||||| | ||||||||||  ||| ||| ||          
T  386 tgtcacaaaatttgatttctaggcccagattttgttaatttt------------tgtcgttttcaaaaaattatatttaattttttttcat-tttaaaaa 300  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  299 attctaaattttagtaaatgaacctttcgtagtgttctgaacttgtctcgaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 200  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  199 ttgtaacaaggactaaaattagaagtaattttcttttgtaaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttata 100  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |  || ||||| |||||||| ||||    
T  99 gtgacaaaaaatatatttaagcctt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 432
Target Start/End: Original strand, 535 - 603
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  535 ctattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgtctaaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1514
Alignment:
Q  15 aattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattg 114  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  1159 aattcaaatttgttttatttatgcttaaactcatgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaagaacattacttaaagtttctttgcaaaaaattg 1258  T
Q  115 ttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttt---taaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||    |||||| |||||||||||||||||||||||          
T  1259 tcgcaaaatttgatttctacgtccagattttgttaattttatctttagcttttaccatttaaaaaaaaaaatcatatttaattcgtttcatgtt-aaaaa 1357  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1358 attctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgcctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaaacaaactttg 1457  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatt 368  Q
    || ||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  1458 ttgtaatagggactaaaa-tagaagtaattttcttttgtaaggacttaaaaacttatt 1514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Original strand, 1532 - 1608
Alignment:
Q  358 aaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1532 aaaaaactattaaaattaagtaagaactaaatttagaagttcccaattttatagggaccaaaaatatatttaaccct 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7188 - 6821
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  7188 aaatttgtttaatgtatgcttatactcttgagtttttgaacaattttttgcagacgtgttaaaaacattactaaaagttcatctgcaaaaaattgtcaca 7089  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaa 219  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||       |||||||    
T  7088 aaatttgatttctacgtccaaattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcattttaggtt--aaaaattctaaa 6991  T
Q  220 ttttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||       ||||||||||||| || ||||  |||| |||||    
T  6990 ttttagttaataaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaatcaaatcgttcaaaaat-------tttaaggataattaaataaac--tgttgtaaca 6900  T
Q  319 gggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagtt 398  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  6899 aggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtaaggactataaaacctattaaaatcaagtaaggactaaatttaaaagtt 6821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 436
Target Start/End: Original strand, 7245 - 7317
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  7245 ctattaaaattaagtaatgactaaacttaaaagatcccaattttatagagactaaaaacatatttaactcttt 7317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 112 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 158223 - 157903
Alignment:
Q  112 ttgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  158223 ttgtcgcaaaatttaatttctacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgccgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatggtaaaaaa 158124  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  158123 -ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaa-tcgttcaaaaattgaagagtttaaggagaattaaacaaactttg 158026  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttata 410  Q
    || |||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| | ||||||||    
T  158025 ttgtaacaggtagtaaaattagaagcaattattttttgtatggactaaaagacctattaaaattaagtgaggactaaacttagaagttctcaattttata 157926  T
Q  411 ggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    || |  ||||||||||||||||||    
T  157925 gg-attaaaaacatatttaaccct 157903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 328
Target Start/End: Original strand, 35273 - 35588
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  35273 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattagtaaaagttcctccgcaaaaaat 35372  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||           
T  35373 tattgcaaaatttgatttatatgtccagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaatttatatttaattcgtttcatgtt-aaaaaa 35471  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| | ||| ||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35472 ttctaaattttagtaattgaacctttcataataatctaaacttgtttcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagactttaaggataattaaacaaactttgt 35571  T
Q  312 tttaacagggcctaaaa 328  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  35572 tttagcagggactaaaa 35588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38674 - 38618
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38674 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttgaactcttaagttttttaacaattttttg 38618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 35247 - 35160
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  35247 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggattaaaaacatatttaa 35160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4181 - 3765
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||  |||||   |||||||  |  ||    
T  4181 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaattttttacagacatgttaagaacgttattaaaacgtcctccaaaaaaaata-tcaca 4083  T
Q  120 aaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttcta 217  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||       || ||    
T  4082 aaaatttgatttctacgttcatatttttgttacttatatcttaaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatttatttcatgttaaaaaa-ttata 3984  T
Q  218 aattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaa 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||     
T  3983 gattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaaggataattaagcaaaatttattttag 3884  T
Q  317 cagggcctaaaattagaagtaa-ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | ||||||| || ||    
T  3883 cagggactataattataagtaagtttttttttgtagggattaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtcgcaattttattgggac 3784  T
Q  416 caaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3783 caaaaacatatttaaccct 3765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Original strand, 4215 - 4307
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || | ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  4215 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataagaactaaacttacaaggtcgcaattttgtatggaccgaaaacataattaaccct 4307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 396
Target Start/End: Original strand, 6931 - 7314
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| || | ||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6931 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaattcttaaattttttaatagttttttgctggcatgtttagaacattactaaaagtttctccgcaaaaaat 7030  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaa-ttttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnn 211  Q
    | | |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||          
T  7031 tatagcaaaatttgatttctacatccaaattttgttaatttttatatttaacttttatctttttaaaaaattcatatttaatttgtttcgtgtt-agaaa 7129  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttg 310  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||       || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7130 attctaaattttagtaaatgaacttttcatattgttctaaacttgtctcaaaaaaatcattaaaaaatttaagagtttaatgataattaaacaaactttg 7229  T
Q  311 ttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaag 396  Q
    ||||| ||| | ||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  7230 ttttagcagagactaaaattataagtaaat-ttttttgtagggactaaaaaagctattaaagttaaataaggattaaacttaaaag 7314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6883 - 6816
Alignment:
Q  365 tattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6883 tatttaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaatatatttaacc 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 6)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25339 - 25003
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||    
T  25339 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttccgc--cacaaaat 25242  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
    |           ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  25241 t-----------tgatttatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 25154  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25153 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaattcgttcaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaactttgt 25054  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  25053 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttgcagggactaaaaaa 25003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Original strand, 23787 - 24112
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaa-acatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||||||||   | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23787 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaacta---agttttttaacaatttttttatagacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 23883  T
Q  112 ttgtt-gcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnn 210  Q
     |  | |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||         
T  23884 ataatcgcaaaatttgatttatatgttcagattttattacttttatctttaacttttatcgttttcaaaaattcatatttaattcatttcaaatt-aaaa 23982  T
Q  211 nnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
      |||||||||||||||| ||||||       ||||||||| | ||||||       ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23983 aattctaaattttagtaattgaacc-------gtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaaaataattaaacaaacttt 24075  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttt 346  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  24076 gttttagaagggactaaaattagaagtattttttttt 24112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 23164 - 23066
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23164 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttctaacaattttttgttgacgtgttaagaacattactaaaagttcctccgcaaaaaa 23066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 23192 - 23282
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23192 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 23282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23759 - 23671
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   | | |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  23759 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaac 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 25368 - 25458
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||   | | ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  25368 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggggctaaaaacatatttaaccc 25458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4193 - 3961
Alignment:
Q  86 attactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattca 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4193 attactaaaagttcctatgcaaaaaattgtcgcaaaatttgatttctacgtacaggttttgttaattttatctttaactttttccgttttaaaaaattca 4094  T
Q  186 tatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaaga 285  Q
    ||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||| |||||    
T  4093 tatttaatttgtttcatgtt-aaaaaattctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaatcgttcaaaaatgtaaga 3995  T
Q  286 gtttaaggataatt-aacaaactttgttttaaca 318  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  3994 gtttaaggataattaaacaaattttgttgtaaca 3961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 325 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3847 - 3738
Alignment:
Q  325 aaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacat 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3847 aaaattagaagtaattcttttttgtagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttatagggaccaaaaacat 3748  T
Q  425 atttaaccct 434  Q
    ||||||||||    
T  3747 atttaaccct 3738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4287 - 4216
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaa 84  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4287 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttacaggcatgttaagaa 4216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 434
Target Start/End: Original strand, 4338 - 4404
Alignment:
Q  368 taaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4338 taaaattaagtaaaaactaaacttaaaaggtccatattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 4404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 240294 - 239947
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||       
T  240294 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttttagatgtgttaagaacattactaaaagttccgccgcaaaat-- 240197  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnn 212  Q
               ||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||           
T  240196 -----------ttgatctatatgtccatattttattacttttatctttaacttttattgttttcaaatattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaa- 240109  T
Q  213 ttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgt 311  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  240108 ttctaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaagtcgttcaaaaatttaacagttgaaggataattaaacaaactttgt 240009  T
Q  312 tttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatgga-ttaaaaaacctattaaaa 372  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  240008 tttagtagggactaaaattagaagtaatttttttttgtagggactaaaaaaacctattaaaa 239947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 239492 - 239548
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  239492 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagttttttaacaattttttg 239548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Original strand, 240322 - 240409
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  240322 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 240409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 239464 - 239412
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  239464 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa 239412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0571
Description:

Target: scaffold0571; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 430
Target Start/End: Original strand, 8610 - 8868
Alignment:
Q  171 gttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaaccttt-catagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntc 269  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||        ||    
T  8610 gttttaagaaattcatatttaattcgtttcatcttaaaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttcatagtgttctaaccttatctaaaaaaaatc 8708  T
Q  270 gttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatt 368  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  8709 gttcaaaaatttaagaatttaagaataatcaaacaaactttgttgtaagagggactaaaattagaagtaatt-ttttttgtagggactaaaaaac-tatt 8806  T
Q  369 aaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8807 aaaattaagtaaggattaaacttaaaagttttcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 8430 - 8575
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  8430 tcaattcaaatttgtttaatttatgtttaaactcttgagtttttgaacaattttttgtagacatggtaacaacattgctaaaagttcatctgc-acaaat 8528  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctt 159  Q
    ||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  8529 tgtcgcaaaatttgatttttgcgtccaaattttgttaattttatctt 8575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10245 - 9906
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaat 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||       
T  10245 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagtttttttacaattttttgtagacgtgttaagaacattattaaaagttccgccgcaaaat-- 10148  T
Q  113 tgttgcaaaaattgatttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgtt-nnnnnn 211  Q
               |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  10147 -----------ttgatttatatgtccatattttattgtttttatctttaacttttattgttttcaaaaattcatatttaattcgtttcatgttaaaaaaa 10059  T
Q  212 nttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctc-nnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaacttt 309  Q
        ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||        || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10058 aaattaaattttattaattgaacctttcatagtgttctaaacttgtctcaaaaaaattcattaaaaaatttaagagtttaagaataattaaacaaacttt 9959  T
Q  310 gttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaa 362  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  9958 gttttagtagggactaaaattagaagtgatttttttttgtagggactaaaaaa 9906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 10273 - 10363
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10273 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgactcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 10363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 9424 - 9479
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg 69  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  9424 tcaattcaaatttgtttaatttatgcttaaact-ttaagttttttaacaattttttg 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9371 - 9309
Alignment:
Q  371 aattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9371 aattaagtaaggattaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 9309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21886 - 21711
Alignment:
Q  172 ttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgt 271  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||       ||||    
T  21886 ttttaagaaattcaaatttaattcgtttcatgttagaaaa-ttctaaattttagtaaatgaaccttttatagtgttctaaacttgtctcgaaaaaatcgt 21788  T
Q  272 tcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattctttttt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21787 tcaaaaatttaaaagtttaaggataattaaacaaactttgttttagcatggactaaaattataagtaattttttttt 21711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 21881 - 21960
Alignment:
Q  355 ttaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21881 ttaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 21960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21672 - 21632
Alignment:
Q  394 aagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21672 aagttctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 21632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 48041 - 47724
Alignment:
Q  118 caaaaattgatttatacgtccagat-tttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttct 216  Q
    ||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||       ||||    
T  48041 caaaattttatttctacgtccggatatttgttacttttatcttgaacttttgtcgttt-aaaaaatttatatttaattcatttcatgttaaaaaa-ttct 47944  T
Q  217 aaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgtttta 315  Q
    ||||||||| ||| |||||| |  || |||||||| | ||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||     
T  47943 aaattttagaaaacgaacctcttgtaatgttctaaacttgtctcaagaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataattagaaaaagtttgttttc 47844  T
Q  316 acagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaac 415  Q
      |||| |||||| || | |||| |  ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |  | |||||||| |     
T  47843 gtagggactaaaactacatgtaaattatttttatagggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttataagtttcaaaatttatagggat 47744  T
Q  416 caaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47743 caaaaacatatttaaccctt 47724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33002 - 32846
Alignment:
Q  270 gttcaaaaatttaagagtttaaggataatta-acaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatt 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||    ||||| || ||| |||||||  ||||    
T  33002 gttcaaaaatttaagagttcaaggataattagaaaaactttgttttagtagggactaaaatcacatgtaaactgtttttatagggactaaaaaagttatt 32903  T
Q  369 aaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacata 425  Q
    |||||||| |||  | |||||||| ||||| |  | |||||||  ||||||||||||    
T  32902 aaaattaaataaagactaaacttagaagtttcaaaatttatagagaccaaaaacata 32846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6301
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaa 110  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  6204 tcaattcaaatatgtttaatttatgcttaaacttttaagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaacgttactaaaagttcctcagcaaaaa 6301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6155 - 6085
Alignment:
Q  364 ctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6155 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaagaggtcccaattttttagggaccaaaaacatatttaaccct 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 6305 - 6347
Alignment:
Q  127 atttatacgtccagattttgttaattttatctttaacttttgt 169  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6305 atttctatgtccagattttgttacttttatctttaacttttgt 6347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2941 - 2727
Alignment:
Q  219 attttagtaaatgaacctttcatagtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaac 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |    
T  2941 attttagtaaatgaacctttcatagtgtgctaaacttgtataaaaagaatcgttaaaaaatttaagagtttaacgataattaaacaaaatttattttagc 2842  T
Q  318 agggcctaaaattagaagtaattct-tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaacc 416  Q
    ||| | |||||||| |||||| | | |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  | |||||||||| |||    
T  2841 aggac-taaaattataagtaaatttatttttgtagggatcaaaaaggctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggttgcaattttatagggacc 2743  T
Q  417 aaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||| ||||||||||    
T  2742 aaaaatatatttaacc 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3436 - 3260
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttg-caaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||  | ||    
T  3436 aaatttgtttaatttatgcttaaactcttaagtttttcaacaatttttttacagacgtgttaagaacgttattaaaagatcctccgaaaaaaata-tcgc 3338  T
Q  119 aaaaatt-gatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaatt 194  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3337 aaaaatttgatttctacatccatatttttgttacttatatcttaaacttttgtcgttttaaaaaattcatatttaatt 3260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 434
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3562
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| || | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3470 ttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttataaggtcacaattttgtagggaccgaaaacataattaaccct 3562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 786 - 631
Alignment:
Q  282 aagagtttaaggataattaa-caaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaa---ttcttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaag 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || | || |  ||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  786 aagagtttaaggataattaaacaaactttggttgagcatgaactaaaattagaagtaactttttttttttgtagggaataaaaaac-tactaaaattaag 688  T
Q  378 taagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||  | |||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  687 taaagactaaacttagaagtttacaattttatagggaccaaaaacatatttgaccct 631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 49053 - 48967
Alignment:
Q  13 tcaattgaaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttc 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  49053 tcaattcaaatttgtttaatttattcttaaactcttaagttttttaacaattttttgtagacgtgttaagaacattactaaaagttc 48967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 430
Target Start/End: Original strand, 19972 - 20048
Alignment:
Q  354 attaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 430  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19972 attaaaaaaactattaaaattaaataagtattaaatttaaaaggtccgaattttatagagaccaaaaatatatttaa 20048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 49080 - 49132
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa 395  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  49080 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa 49132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Original strand, 282940 - 283076
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||    
T  282940 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtgttaagaacattacgaaaagttcatctgcaaaaaattatctca 283038  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccag-attttgttaattttat 156  Q
    ||| || |||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  283039 aaattttatttctgcgtccagaattttgttacttttat 283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 283525 - 283308
Alignment:
Q  20 aaatttgtttaatttatgctaaaactcttgagtttttgaacaattttttgcaaacatgttaagaatattactaaaagttcctctgcaaaaaattgttgca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||| || || |||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  283525 aaatttgtttaatt-atgcttaaacttttaagattttgaacaattttttgcacaagtattaagaacatcacgaaaattttatctgcaaaaaattatctca 283427  T
Q  120 aaaattgatttatacgtccagatttt-gttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaa 218  Q
    ||| |  |||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||       ||||||    
T  283426 aaattgtattcctgcgtccagatttttgttacttttattttgaacttttgtcttttaaaaaaattcatatttaatttatttcatgtt-aaaaaattctaa 283328  T
Q  219 attttagtaaatgaaccttt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  283327 attttagtaaacgaaccttt 283308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 238310 - 238234
Alignment:
Q  356 taaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  238310 taaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtacccaattttatagagatcaaaaacatatttaacc 238234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 282906 - 282823
Alignment:
Q  342 ttttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatat 426  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  282906 ttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaatatccc-aatttatagggaccaataacatat 282823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Original strand, 123460 - 123554
Alignment:
Q  342 ttttttgtat--ggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  123460 ttttttgtataaggactaaaaaacctattaaaat-aagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 123554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 123351 - 123198
Alignment:
Q  142 ttttgttaattttatctttaacttttgttgttttaaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcat 241  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||       || |||||||||||||||| | |||| ||    
T  123351 ttttgttacttttatcttaaacatttgctgtttgaaaaaatttatatttaattcatctcaagttaaaaaattt-taaattttagtaaatgcagcttttat 123253  T
Q  242 agtgttctaaccgtgtctcnnnnnnntcgttcaaaaatttaagagtttaaggata 296  Q
    | |||| |||  |||||||       ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  123252 attgttttaaatgtgtctcggaaaaatcgttaaaaattttaagagtttaaggata 123198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 431
Target Start/End: Original strand, 158745 - 158906
Alignment:
Q  271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataatt-aacaaactttgttttaacagggcctaaaattagaagtaattcttttttgtatggattaaaaaacctatta 369  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | || |||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  158745 ttcaaaaatttaagagtttgaagataattaaacagatttagttttagcagggactaaaattacatgtaatt-ttttttatagggactaaaaaaactatta 158843  T
Q  370 aaattaagt-aagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaac 431  Q
    ||||||||| || || ||||| || |||||| | |||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  158844 aaattaagtaaaaaaataaacatagaagttctcaattttatagggattaaaaccatatttaac 158906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 5927 - 6005
Alignment:
Q  355 ttaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 434  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5927 ttaaaaaacc-attaaaattaattaagaactaaacttacaagttctcaattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 6005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 47 - 137
Alignment:
Q  343 tttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccc 433  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||   | | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  47 tttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggacaaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27141 - 27063
Alignment:
Q  354 attaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||  |||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  27141 attaaaaaaactattaaaattaaataagtactaaacttaaaaggtccgaattttatagagactaaaaacataattaacc 27063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9615 - 9582
Alignment:
Q  488 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9615 atgagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 9582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 436
Target Start/End: Original strand, 7314 - 7345
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7314 tttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17158 - 17127
Alignment:
Q  490 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17158 gagcaatgatatttgtacatccatttaatgac 17127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16615 - 16585
Alignment:
Q  405 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16615 tttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 16585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 52512 - 52586
Alignment:
Q  176 aaaaaattcatatttaattcgtttcatgttnnnnnnnttctaaattttagtaaatgaacctttcatagtgttctaa 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||       | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  52512 aaaaaattcatatttaattcatttcaagttaaaaaaat-ctaaattttagtaaatgaaccttttataatgttctaa 52586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 29963 - 29935
Alignment:
Q  493 caatgatatttgtacatccatttaatgac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29963 caatgatatttgtacatccatttaatgac 29935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 134294 - 134202
Alignment:
Q  344 ttttgtatggattaaaaaacctattaaaattaagtaagaattaaacttaaaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacccttt 436  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||  | ||| ||||||  |||| || |||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  134294 ttttgtagggactaaaaaagctattgaaattaagtaaagactaatcttaaagcttccataatttatagggatcaaaaccatatttaactcttt 134202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University