View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18614_low_5 (Length: 287)

Name: NF18614_low_5
Description: NF18614
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18614_low_5
NF18614_low_5
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (1-275)||(55163960-55164234)
chr3 (1-214)||(1687673-1687885)
chr3 (1-213)||(1017066-1017277)
chr3 (1-214)||(35346378-35346590)
chr3 (1-221)||(21564518-21564737)
chr3 (1-214)||(22852018-22852229)
chr3 (1-214)||(53925886-53926098)
chr3 (1-208)||(20759984-20760190)
chr3 (1-184)||(20813378-20813560)
chr3 (1-214)||(21656540-21656752)
chr3 (1-214)||(21890192-21890404)
chr3 (1-185)||(38446498-38446681)
chr3 (1-228)||(51562184-51562410)
chr3 (1-215)||(29677498-29677711)
chr3 (1-155)||(33151718-33151872)
chr3 (1-214)||(31122684-31122896)
chr3 (1-214)||(41250908-41251120)
chr3 (1-154)||(42016895-42017048)
chr3 (8-211)||(27070649-27070851)
chr3 (1-215)||(19268543-19268761)
chr3 (1-185)||(42107035-42107218)
chr3 (8-215)||(37247985-37248191)
chr3 (4-155)||(47329140-47329291)
chr3 (1-192)||(50287588-50287778)
chr3 (1-155)||(20086279-20086433)
chr3 (1-155)||(52821014-52821168)
chr3 (1-213)||(53196036-53196246)
chr3 (1-214)||(1448642-1448851)
chr3 (1-216)||(10618386-10618599)
chr3 (1-195)||(35608057-35608250)
chr3 (1-214)||(26455604-26455815)
chr3 (1-214)||(32650727-32650939)
chr3 (1-192)||(40922094-40922284)
chr3 (1-125)||(36314967-36315091)
chr3 (1-116)||(19664563-19664678)
chr3 (1-154)||(48651270-48651423)
chr3 (1-185)||(20913690-20913873)
chr3 (1-185)||(20921808-20921991)
chr3 (1-201)||(44798290-44798488)
chr3 (1-112)||(12748413-12748524)
chr3 (1-131)||(3697168-3697298)
chr3 (1-99)||(51475267-51475365)
chr3 (1-192)||(45380189-45380379)
chr3 (1-155)||(38923963-38924117)
chr3 (1-99)||(50364908-50365006)
chr3 (8-131)||(39069755-39069878)
chr3 (1-99)||(50977886-50977984)
chr3 (1-99)||(51081018-51081116)
chr3 (5-141)||(33473218-33473354)
chr3 (1-79)||(28699707-28699785)
chr3 (1-99)||(34019482-34019580)
chr3 (10-85)||(42641213-42641288)
chr3 (108-226)||(1016879-1016996)
chr3 (1-48)||(44152722-44152769)
chr3 (134-214)||(50287384-50287463)
chr3 (102-214)||(51475431-51475541)
chr3 (102-221)||(1687491-1687609)
chr3 (108-214)||(28699532-28699637)
chr3 (160-214)||(33151905-33151959)
chr3 (1-43)||(47473252-47473294)
chr3 (81-214)||(44152775-44152907)
chr3 (102-214)||(21564343-21564454)
chr3 (100-192)||(47473099-47473190)
chr3 (108-155)||(3697051-3697098)
chr3 (160-219)||(28193243-28193302)
chr3 (167-214)||(50364814-50364861)
chr3 (100-213)||(39069574-39069687)
chr3 (102-155)||(33473422-33473475)
chr3 (129-214)||(36315211-36315295)
[»] chr1 (76 HSPs)
chr1 (1-216)||(7651684-7651898)
chr1 (1-215)||(25988177-25988390)
chr1 (1-210)||(50689965-50690173)
chr1 (1-214)||(19315662-19315874)
chr1 (1-219)||(28425265-28425482)
chr1 (1-213)||(12143094-12143303)
chr1 (1-216)||(23767320-23767533)
chr1 (1-214)||(46825553-46825765)
chr1 (5-214)||(7552923-7553131)
chr1 (1-214)||(19274581-19274792)
chr1 (1-214)||(24204378-24204590)
chr1 (1-214)||(43396697-43396909)
chr1 (1-214)||(46051472-46051684)
chr1 (1-185)||(49094647-49094830)
chr1 (1-185)||(49814322-49814505)
chr1 (1-214)||(26549410-26549622)
chr1 (1-214)||(48802238-48802450)
chr1 (1-192)||(45350646-45350834)
chr1 (1-192)||(38473555-38473745)
chr1 (1-214)||(36157584-36157796)
chr1 (1-214)||(9878691-9878903)
chr1 (1-214)||(26069914-26070126)
chr1 (1-214)||(33674039-33674251)
chr1 (5-214)||(37216922-37217130)
chr1 (1-213)||(5400892-5401103)
chr1 (1-192)||(16705892-16706082)
chr1 (1-195)||(23228119-23228313)
chr1 (6-192)||(46095004-46095189)
chr1 (1-214)||(33325749-33325961)
chr1 (1-214)||(36781079-36781291)
chr1 (1-220)||(7608668-7608885)
chr1 (1-141)||(50533405-50533545)
chr1 (1-216)||(21965087-21965301)
chr1 (1-131)||(41106038-41106168)
chr1 (1-214)||(9962773-9962985)
chr1 (1-141)||(48669375-48669515)
chr1 (1-216)||(18781994-18782208)
chr1 (4-155)||(18892354-18892505)
chr1 (1-214)||(45670393-45670605)
chr1 (6-192)||(6711467-6711652)
chr1 (1-214)||(18917546-18917758)
chr1 (1-210)||(52147015-52147223)
chr1 (1-155)||(8141452-8141605)
chr1 (1-115)||(41982240-41982354)
chr1 (1-99)||(48319067-48319165)
chr1 (1-192)||(40721364-40721555)
chr1 (1-100)||(9974864-9974963)
chr1 (1-215)||(12964668-12964867)
chr1 (1-99)||(33194672-33194770)
chr1 (1-154)||(17983864-17984017)
chr1 (5-213)||(21929545-21929758)
chr1 (1-214)||(25800666-25800875)
chr1 (19-212)||(44978677-44978868)
chr1 (1-156)||(33714325-33714478)
chr1 (4-154)||(52067617-52067767)
chr1 (1-131)||(52349913-52350043)
chr1 (1-125)||(34971102-34971226)
chr1 (1-99)||(16506809-16506907)
chr1 (1-99)||(30281653-30281751)
chr1 (108-215)||(22351031-22351137)
chr1 (108-215)||(52146839-52146945)
chr1 (134-216)||(19274375-19274456)
chr1 (160-210)||(52349864-52349914)
chr1 (163-216)||(25800459-25800512)
chr1 (134-215)||(41105833-41105913)
chr1 (102-155)||(49814205-49814258)
chr1 (108-220)||(16505138-16505249)
chr1 (107-210)||(12142916-12143018)
chr1 (1-36)||(50099242-50099277)
chr1 (108-214)||(16508118-16508222)
chr1 (102-155)||(9974747-9974800)
chr1 (102-215)||(46825346-46825458)
chr1 (167-216)||(50533199-50533248)
chr1 (103-155)||(12964551-12964603)
chr1 (167-215)||(18782365-18782413)
chr1 (133-217)||(37216711-37216794)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (1-214)||(47219167-47219379)
chr7 (1-214)||(44544431-44544643)
chr7 (1-216)||(1469398-1469612)
chr7 (1-214)||(47294198-47294410)
chr7 (2-213)||(221298-221508)
chr7 (1-214)||(47272003-47272215)
chr7 (1-214)||(2960547-2960759)
chr7 (1-214)||(11476463-11476675)
chr7 (1-212)||(7336082-7336291)
chr7 (1-155)||(8162677-8162831)
chr7 (1-214)||(48628827-48629039)
chr7 (1-201)||(38427483-38427682)
chr7 (1-215)||(30798275-30798487)
chr7 (1-214)||(31684041-31684253)
chr7 (1-155)||(23842327-23842481)
chr7 (1-214)||(37393904-37394117)
chr7 (1-214)||(30876281-30876493)
chr7 (1-214)||(35600029-35600241)
chr7 (1-141)||(47281103-47281243)
chr7 (5-214)||(41113403-41113612)
chr7 (1-214)||(42979245-42979457)
chr7 (1-214)||(45723398-45723610)
chr7 (1-125)||(33884341-33884465)
chr7 (2-213)||(40851297-40851507)
chr7 (2-200)||(43752697-43752894)
chr7 (1-194)||(11050188-11050380)
chr7 (1-214)||(41139315-41139531)
chr7 (1-141)||(44800389-44800529)
chr7 (1-214)||(47120013-47120227)
chr7 (4-192)||(47579016-47579203)
chr7 (4-131)||(27364328-27364455)
chr7 (1-99)||(3797544-3797642)
chr7 (1-115)||(4923238-4923352)
chr7 (1-154)||(30971908-30972060)
chr7 (1-141)||(43968238-43968378)
chr7 (1-114)||(29248364-29248477)
chr7 (5-141)||(18353170-18353306)
chr7 (1-99)||(37354284-37354382)
chr7 (67-196)||(42888937-42889065)
chr7 (1-99)||(27774130-27774228)
chr7 (5-72)||(40520944-40521011)
chr7 (102-215)||(23842151-23842263)
chr7 (102-221)||(42888715-42888833)
chr7 (102-215)||(47294474-47294586)
chr7 (64-214)||(5106127-5106275)
chr7 (102-215)||(40851129-40851241)
chr7 (102-214)||(31684317-31684428)
chr7 (126-214)||(39033879-39033966)
chr7 (102-214)||(47119838-47119949)
chr7 (163-214)||(47271800-47271851)
chr7 (160-214)||(1469762-1469816)
chr7 (121-215)||(25801472-25801565)
chr7 (108-214)||(27772983-27773088)
chr7 (134-212)||(29739521-29739598)
chr7 (100-214)||(30972122-30972234)
chr7 (1-39)||(39034084-39034122)
chr7 (160-214)||(43968528-43968582)
chr7 (160-210)||(45233468-45233518)
chr7 (160-216)||(34378512-34378569)
chr7 (102-215)||(45233641-45233753)
chr7 (160-193)||(48628644-48628677)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (1-201)||(3875930-3876129)
chr8 (1-215)||(37933664-37933877)
chr8 (1-212)||(9056247-9056457)
chr8 (5-221)||(22683888-22684103)
chr8 (1-216)||(35884335-35884549)
chr8 (1-214)||(2533294-2533508)
chr8 (1-214)||(38107121-38107333)
chr8 (1-214)||(36399976-36400189)
chr8 (1-214)||(260000-260211)
chr8 (1-214)||(655710-655921)
chr8 (1-214)||(841445-841656)
chr8 (1-214)||(15847134-15847346)
chr8 (1-214)||(35443333-35443545)
chr8 (3-214)||(513332-513541)
chr8 (1-214)||(43806440-43806652)
chr8 (1-214)||(41536434-41536646)
chr8 (5-213)||(440866-441073)
chr8 (1-212)||(12010571-12010784)
chr8 (5-214)||(23972201-23972410)
chr8 (1-132)||(39513327-39513458)
chr8 (4-214)||(13797114-13797322)
chr8 (5-214)||(33651867-33652075)
chr8 (12-141)||(38208786-38208914)
chr8 (1-141)||(1293508-1293648)
chr8 (1-214)||(28496262-28496473)
chr8 (1-131)||(28707435-28707565)
chr8 (1-154)||(36218747-36218899)
chr8 (1-213)||(42988135-42988345)
chr8 (1-214)||(24430478-24430690)
chr8 (3-99)||(7434910-7435006)
chr8 (1-99)||(23935255-23935353)
chr8 (1-155)||(38633675-38633829)
chr8 (1-124)||(40301889-40302012)
chr8 (1-210)||(4649172-4649380)
chr8 (1-99)||(6016227-6016325)
chr8 (1-99)||(29485309-29485406)
chr8 (55-141)||(24193109-24193195)
chr8 (102-215)||(22684171-22684283)
chr8 (1-57)||(24193356-24193411)
chr8 (1-44)||(8137196-8137239)
chr8 (103-214)||(6016052-6016162)
chr8 (129-222)||(43806772-43806867)
chr8 (102-175)||(2533158-2533230)
chr8 (134-215)||(35443128-35443207)
chr8 (134-214)||(15846956-15847035)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (1-213)||(55517094-55517304)
chr4 (1-214)||(49118633-49118845)
chr4 (1-214)||(28264665-28264877)
chr4 (1-216)||(24458536-24458750)
chr4 (3-214)||(31591100-31591309)
chr4 (1-211)||(23134916-23135125)
chr4 (1-214)||(33807688-33807899)
chr4 (1-214)||(4544893-4545104)
chr4 (1-217)||(31973613-31973828)
chr4 (1-201)||(44490341-44490540)
chr4 (1-215)||(19496008-19496221)
chr4 (1-214)||(25730262-25730475)
chr4 (1-210)||(12196491-12196699)
chr4 (1-214)||(26017445-26017657)
chr4 (1-214)||(42273824-42274036)
chr4 (1-220)||(40988655-40988869)
chr4 (1-214)||(15985032-15985243)
chr4 (1-214)||(33173927-33174139)
chr4 (1-214)||(48551671-48551883)
chr4 (1-215)||(28812193-28812405)
chr4 (1-214)||(5227412-5227624)
chr4 (1-222)||(23553087-23553306)
chr4 (15-215)||(50276044-50276243)
chr4 (1-215)||(11795059-11795273)
chr4 (1-192)||(48707662-48707852)
chr4 (1-155)||(2055300-2055454)
chr4 (1-220)||(8881912-8882132)
chr4 (1-214)||(9339031-9339245)
chr4 (8-214)||(17847004-17847208)
chr4 (1-210)||(48149521-48149729)
chr4 (1-213)||(10588602-10588813)
chr4 (7-214)||(22298546-22298752)
chr4 (1-212)||(28159862-28160072)
chr4 (1-192)||(35930061-35930251)
chr4 (1-215)||(39995072-39995286)
chr4 (11-192)||(31208776-31208956)
chr4 (1-140)||(32317975-32318114)
chr4 (1-215)||(50542259-50542473)
chr4 (1-155)||(30141073-30141227)
chr4 (1-155)||(32118736-32118890)
chr4 (1-213)||(30466910-30467122)
chr4 (5-154)||(33693299-33693448)
chr4 (5-155)||(37381872-37382022)
chr4 (1-131)||(39700067-39700197)
chr4 (1-114)||(25734229-25734342)
chr4 (5-131)||(51371036-51371162)
chr4 (1-130)||(14564818-14564947)
chr4 (1-131)||(17993006-17993136)
chr4 (1-99)||(24623170-24623268)
chr4 (1-99)||(42549643-42549741)
chr4 (1-99)||(19168816-19168914)
chr4 (39-155)||(20534225-20534341)
chr4 (1-60)||(56555200-56555259)
chr4 (102-219)||(28264485-28264601)
chr4 (102-214)||(26017270-26017381)
chr4 (160-210)||(17992957-17993007)
chr4 (136-214)||(31590896-31590972)
chr4 (134-215)||(31208565-31208645)
chr4 (102-214)||(23135189-23135300)
chr4 (160-214)||(12196296-12196350)
chr4 (102-155)||(48149404-48149457)
chr4 (108-213)||(49118459-49118563)
chr4 (143-215)||(9339379-9339450)
chr4 (134-214)||(17847368-17847447)
chr4 (163-215)||(25734495-25734547)
chr4 (108-192)||(48707922-48708005)
chr4 (103-155)||(51371262-51371314)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (1-215)||(41282364-41282577)
chr5 (1-214)||(14717627-14717840)
chr5 (1-214)||(19659408-19659620)
chr5 (1-192)||(8689594-8689783)
chr5 (1-216)||(35342202-35342416)
chr5 (4-214)||(16095867-16096075)
chr5 (1-214)||(6251994-6252206)
chr5 (1-214)||(38964021-38964232)
chr5 (1-214)||(43166177-43166388)
chr5 (1-185)||(6739891-6740074)
chr5 (3-214)||(11000635-11000845)
chr5 (1-155)||(39001990-39002144)
chr5 (1-214)||(6600043-6600255)
chr5 (1-212)||(11935468-11935677)
chr5 (1-192)||(31710304-31710494)
chr5 (1-216)||(39824578-39824791)
chr5 (1-155)||(27457162-27457316)
chr5 (1-155)||(30863275-30863428)
chr5 (1-214)||(1052555-1052767)
chr5 (1-210)||(20079170-20079377)
chr5 (1-125)||(40074972-40075096)
chr5 (1-155)||(23128877-23129032)
chr5 (4-214)||(8215925-8216134)
chr5 (16-214)||(28078312-28078509)
chr5 (1-155)||(42993540-42993694)
chr5 (1-154)||(14952346-14952499)
chr5 (1-214)||(20408555-20408767)
chr5 (1-213)||(3351910-3352121)
chr5 (1-185)||(4015810-4015993)
chr5 (1-137)||(11692130-11692266)
chr5 (1-193)||(26593208-26593399)
chr5 (5-201)||(33760390-33760585)
chr5 (1-172)||(30297697-30297868)
chr5 (1-192)||(30208331-30208521)
chr5 (1-214)||(27116006-27116218)
chr5 (4-201)||(19398113-19398309)
chr5 (1-99)||(16752138-16752236)
chr5 (1-79)||(6331399-6331477)
chr5 (2-99)||(26035367-26035464)
chr5 (1-154)||(8694888-8695041)
chr5 (3-99)||(444978-445074)
chr5 (134-215)||(43166504-43166584)
chr5 (123-214)||(8215718-8215808)
chr5 (76-214)||(6332873-6333010)
chr5 (108-214)||(38964302-38964406)
chr5 (103-220)||(30863094-30863210)
chr5 (54-131)||(27510046-27510123)
chr5 (160-214)||(33760739-33760793)
chr5 (134-214)||(30297993-30298072)
chr5 (102-155)||(20517063-20517116)
chr5 (102-155)||(40074855-40074908)
chr5 (134-219)||(41282155-41282239)
chr5 (134-214)||(4016117-4016196)
chr5 (134-214)||(19661875-19661954)
chr5 (134-214)||(27116338-27116417)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (1-214)||(37838319-37838531)
chr2 (1-220)||(771877-772094)
chr2 (1-214)||(2456032-2456244)
chr2 (1-221)||(33106869-33107088)
chr2 (1-218)||(41500405-41500621)
chr2 (1-216)||(8899704-8899917)
chr2 (1-216)||(9276596-9276810)
chr2 (1-155)||(25087761-25087915)
chr2 (1-214)||(36211068-36211281)
chr2 (1-215)||(36444134-36444347)
chr2 (1-213)||(7378985-7379195)
chr2 (1-214)||(27328606-27328818)
chr2 (1-216)||(40854631-40854845)
chr2 (1-223)||(2056948-2057168)
chr2 (1-215)||(12759656-12759868)
chr2 (1-155)||(16246158-16246312)
chr2 (1-214)||(2094318-2094529)
chr2 (1-214)||(2314882-2315094)
chr2 (5-214)||(28650333-28650541)
chr2 (1-201)||(19180444-19180642)
chr2 (1-214)||(11949333-11949545)
chr2 (1-214)||(42629984-42630196)
chr2 (1-141)||(33865246-33865386)
chr2 (6-214)||(37732100-37732307)
chr2 (1-192)||(921044-921234)
chr2 (1-154)||(1106525-1106678)
chr2 (1-219)||(3430527-3430743)
chr2 (4-155)||(17134254-17134404)
chr2 (1-212)||(43249321-43249531)
chr2 (1-214)||(17484457-17484669)
chr2 (1-155)||(34253164-34253318)
chr2 (28-213)||(14630663-14630846)
chr2 (1-155)||(7297199-7297353)
chr2 (1-131)||(29737770-29737900)
chr2 (1-155)||(38751070-38751224)
chr2 (30-214)||(23671719-23671901)
chr2 (1-95)||(37654130-37654224)
chr2 (1-99)||(8396572-8396670)
chr2 (1-192)||(41177964-41178138)
chr2 (1-185)||(45124141-45124324)
chr2 (3-99)||(19916008-19916104)
chr2 (1-192)||(9331778-9331968)
chr2 (81-192)||(28216893-28217003)
chr2 (134-214)||(23673117-23673196)
chr2 (134-225)||(7297476-7297566)
chr2 (1-35)||(23672958-23672992)
chr2 (160-213)||(9276393-9276446)
chr2 (160-213)||(9331584-9331637)
chr2 (133-214)||(28650671-28650751)
chr2 (143-214)||(33107222-33107292)
chr2 (160-214)||(920840-920894)
chr2 (160-214)||(31214086-31214140)
chr2 (118-155)||(3358157-3358194)
chr2 (102-155)||(3430807-3430860)
chr2 (102-155)||(11949612-11949665)
chr2 (160-213)||(33865536-33865589)
chr2 (129-214)||(41500732-41500816)
chr2 (102-214)||(772158-772268)
chr2 (163-215)||(2315246-2315298)
chr2 (134-210)||(8899504-8899579)
chr2 (134-214)||(12759993-12760072)
chr2 (135-215)||(41178264-41178343)
chr2 (102-214)||(42629803-42629914)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (1-214)||(1915251-1915462)
chr6 (1-215)||(2707481-2707694)
chr6 (1-214)||(6503740-6503952)
chr6 (1-214)||(30379039-30379251)
chr6 (1-215)||(29050294-29050508)
chr6 (1-154)||(17428238-17428391)
chr6 (1-216)||(9382541-9382755)
chr6 (1-215)||(17943058-17943271)
chr6 (1-214)||(8178156-8178368)
chr6 (1-215)||(3408211-3408425)
chr6 (1-214)||(2598007-2598218)
chr6 (1-214)||(12626658-12626870)
chr6 (1-214)||(16193332-16193544)
chr6 (1-214)||(26392916-26393128)
chr6 (1-221)||(1077259-1077478)
chr6 (1-192)||(10256259-10256449)
chr6 (1-155)||(2390287-2390441)
chr6 (1-214)||(3258714-3258926)
chr6 (5-177)||(11133899-11134072)
chr6 (1-214)||(26230840-26231051)
chr6 (5-214)||(6785008-6785213)
chr6 (13-218)||(25820452-25820656)
chr6 (1-100)||(35223919-35224018)
chr6 (1-155)||(26196286-26196440)
chr6 (1-99)||(26936629-26936727)
chr6 (1-185)||(10931084-10931266)
chr6 (33-214)||(31375971-31376153)
chr6 (62-154)||(12612937-12613029)
chr6 (41-155)||(12612813-12612927)
chr6 (160-214)||(35224160-35224214)
chr6 (134-215)||(1915587-1915667)
chr6 (102-215)||(2707305-2707417)
chr6 (160-214)||(26393278-26393332)
chr6 (134-214)||(1077052-1077131)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-212)||(218907-219118)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (5-215)||(4934-5142)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (1-222)||(5208-5427)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (1-131)||(136-266)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-155)||(47984-48138)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-131)||(11380-11510)
scaffold0122 (160-214)||(11183-11237)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-141)||(13117-13257)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-141)||(59587-59727)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-130)||(252428-252557)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (1-99)||(1994-2092)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (39-213)||(3280-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (39-156)||(1877-1994)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (39-131)||(599-691)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (39-131)||(1902-1994)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (108-215)||(5729-5835)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (134-215)||(101245-101325)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-29)||(19803-19831)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 55164234 - 55163960
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  55164234 atgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattagcaactatgctatctacaata 55164135  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  55164134 tgacttatttgaaacaattcaaaaattaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacggctttgggaaaaatgaaaaacttaaaaggacatt 55164036  T
Q  200 tacatacatttgaccattaattaattagtatttgtttgtagatcatatattaattatgttatatatgttttatttt 275  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55164035 tagatgcatttgaccattaattaattagtatttgtttgtagatcatatattaattatgttatatatgttttatttt 55163960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1687673 - 1687885
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1687673 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 1687772  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||    
T  1687773 ggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgaaacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 1687871  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  1687872 agatgcatttgacc 1687885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 1017066 - 1017277
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1017066 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 1017165  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1017166 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtatgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaagaccttt 1017264  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | || ||||||||    
T  1017265 agatgcatttgac 1017277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35346590 - 35346378
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35346590 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 35346491  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  35346490 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 35346392  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || | |||||||    
T  35346391 agatgcgtttgacc 35346378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21564518 - 21564737
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21564518 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 21564617  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||    
T  21564618 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggatcttt 21564716  T
Q  201 acatacatttgaccattaatt 221  Q
    | || ||||||||| ||||||    
T  21564717 agatgcatttgacctttaatt 21564737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22852018 - 22852229
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22852018 atgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 22852117  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  22852118 ggacttatttgaaagatttcaaaaactaaaaggacttgtttagaactgttgaaactta-aaggacgactttaagaaaaatgaaaaactt-aaagaccttt 22852215  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  22852216 agatgcatttgacc 22852229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 53926098 - 53925886
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  53926098 atgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatactatctacaata 53925999  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  53925998 tgacttatttgaaatgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaacttttgaaactta-aataaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaatgaccttt 53925900  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  53925899 agatacatttgacc 53925886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20760190 - 20759984
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20760190 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 20760091  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  20760090 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttcaaggaccttt 20759992  T
Q  201 acatacat 208  Q
    | ||||||    
T  20759991 atatacat 20759984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20813560 - 20813378
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  20813560 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacatta 20813461  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaa 184  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  20813460 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaatgaaa 20813378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21656540 - 21656752
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  21656540 atgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatatacaata 21656639  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  21656640 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 21656738  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  21656739 agatgcatttgacc 21656752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21890192 - 21890404
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21890192 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaatatgttatctataata 21890291  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||| | ||||  ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  21890292 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccattttgaaaaaaacgaaaaacttaaaggactttt 21890390  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  21890391 agatgcatttgacc 21890404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 38446498 - 38446681
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38446498 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 38446597  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  38446598 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagcacttctttggaacttttaaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaa 38446681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 51562184 - 51562410
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  51562184 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgttatctacatta 51562283  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
      |||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||   ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  51562284 gaacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgcttgagacttttgaaactca-aaggaccactttaggaaaaacgaaaaacttaaagaactttt 51562382  T
Q  201 acatacatttgaccattaattaattagt 228  Q
    | || ||||||||| |||| | ||||||    
T  51562383 agatgcatttgacctttaagttattagt 51562410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 29677498 - 29677711
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  29677498 atgcctaaaaagatgattaattttaaatgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacaaactatgatatctacgata 29677597  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||| | |||||||| ||| ||||| ||||   |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  29677598 ggacctgtttgaaacgattgaaaaactaaacggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 29677696  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  29677697 agatgcatttgacca 29677711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 33151718 - 33151872
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33151718 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 33151817  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  33151818 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 33151872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 31122684 - 31122896
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31122684 atgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 31122783  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||    
T  31122784 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaaacgaaaaagttaaaggaccttt 31122882  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  31122883 agatgcatttgacc 31122896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 41250908 - 41251120
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  41250908 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaata 41251007  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| | || ||||||||  | |||||| ||||||| | |||| |||| |||||| |||||||    
T  41251008 agacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttatttgggacctttgaaactta-aaggaccactttggaagaaataaaaaacttaaaggactttt 41251106  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  41251107 agatgcatttgacc 41251120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 42016895 - 42017048
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42016895 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaata 42016994  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  || |||||  |||||||||||    
T  42016995 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacctgtttgaaacttttgaaa 42017048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27070851 - 27070649
Alignment:
Q  8 aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgactta 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  27070851 aaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataagacttg 27070752  T
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||| || ||    
T  27070751 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaatttaaaggacctttatatgca 27070653  T
Q  208 tttg 211  Q
    ||||    
T  27070652 tttg 27070649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 19268543 - 19268761
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaacta------tgttatct 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||      ||||||||    
T  19268543 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttattgttatct 19268642  T
Q  95 acaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaag 194  Q
    ||| || ||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19268643 acattaggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaataacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaactt-aaag 19268740  T
Q  195 acttttacatacatttgacca 215  Q
    || |||| || ||||||||||    
T  19268741 acctttagatgcatttgacca 19268761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 42107218 - 42107035
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  42107218 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatactatctacaata 42107119  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  42107118 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgtgacttttgaaactta-aaggacggctttggaaaaaatgaaaa 42107035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 37247985 - 37248191
Alignment:
Q  8 aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgactta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  37247985 aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttg 37248084  T
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| ||  |    
T  37248085 tttgaaacgattcaaaaactaaaagtacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaaacgaaaaacttaaaagacatttagatgta 37248183  T
Q  208 tttgacca 215  Q
    ||||||||    
T  37248184 tttgacca 37248191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47329291 - 47329140
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  47329291 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacgatatga 47329192  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||| || ||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||    
T  47329191 cttgttggaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 47329140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 50287588 - 50287778
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  50287588 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaattaccaactatgctatctacaata 50287687  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  50287688 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtatgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaatgaaaaacttaaa 50287778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20086433 - 20086279
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  20086433 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaagtatgctatctataata 20086334  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||    
T  20086333 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 20086279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52821168 - 52821014
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  52821168 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgttatctacaaca 52821069  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  52821068 ggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttggaacttttgaaac 52821014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 53196036 - 53196246
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53196036 atgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataattaccaactatgttatctacaata 53196135  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| | || |||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  53196136 agacttctttgaaacga-ttcaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttcggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 53196233  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | || ||||||||    
T  53196234 agatgcatttgac 53196246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1448851 - 1448642
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||    
T  1448851 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatggta---acaata 1448755  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||  | |||||  |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  1448754 ggacttctttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttggtacttttgaaactta-aaggatcactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 1448656  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  1448655 agatgcatttgacc 1448642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10618599 - 10618386
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  10618599 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaattatgtcatctacaata 10618500  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| | || ||  |||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||    
T  10618499 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaacata-aaagatcactttggg-aaaacgaaaaacttaaaggaccttt 10618402  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  10618401 agatgcatttgaccat 10618386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35608250 - 35608057
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  35608250 atgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattaccaattatgctatctacaata 35608151  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaaga 195  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   | |||||||||  | || ||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  35608150 ggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgacatttttgaaactta-aatgacgactttaggcaaaatgaaaaacttaaaaga 35608057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26455604 - 26455815
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  26455604 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaaca 26455703  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||| ||   |||||||||||  | |||||| ||||| |||||||  |||| ||||||| || |||    
T  26455704 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttggttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaaccaaaaacttaaaa-accttt 26455801  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  26455802 agatgcatttgacc 26455815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32650939 - 32650727
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  32650939 atgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataata 32650840  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
      |||| |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||  ||||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  32650839 gaacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaagaattgtttgaaacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaaacgaaaaacttaaatgacattt 32650741  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  32650740 agatccatttgacc 32650727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40922284 - 40922094
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40922284 atgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgctatctacaata 40922185  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40922184 cgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaagaccactttaggaaaaatgaaaaacttaaa 40922094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 36315091 - 36314967
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36315091 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 36314992  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaa 125  Q
     ||||| |||||||||||| |||||    
T  36314991 ggacttgtttgaaacaattcaaaaa 36314967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 19664563 - 19664678
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19664563 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatgagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 19664662  T
Q  101 tgacttatttgaaaca 116  Q
     ||||| |||||||||    
T  19664663 ggacttgtttgaaaca 19664678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 48651270 - 48651423
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  48651270 atgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatctacatta 48651369  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  48651370 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaa 48651423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20913873 - 20913690
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20913873 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctacaata 20913774  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  20913773 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagatttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaacgaaaa 20913690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20921991 - 20921808
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20921991 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctacaata 20921892  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | || ||| ||||||||||||| |||||    
T  20921891 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagatttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaacgaaaa 20921808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 44798290 - 44798488
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44798290 atgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgctatctacaata 44798388  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||| |   | |||||||||  | ||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  44798389 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtatgagaattttgaaactta-aagcaccactttgggaaaaataaaaaacttaaaggaccttt 44798487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 12748413 - 12748524
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12748413 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 12748512  T
Q  101 tgacttatttga 112  Q
     ||||| |||||    
T  12748513 ggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 3697168 - 3697298
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  3697168 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattaccaactatactatctacaata 3697267  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     ||||| |||||||  ||| ||||| |||||    
T  3697268 ggacttgtttgaaaggattcaaaaactaaaa 3697298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 51475365 - 51475267
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  51475365 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 51475267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45380379 - 45380189
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa-ctatgttatctacaat 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  45380379 atgcataaaaagatgactaattttaagtgg-tgttatgagccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaattatcaaactatgctatctacaat 45380281  T
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    |  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45380280 agaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaaacgaaaaacttaaa 45380189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38924117 - 38923963
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  38924117 atgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagataagttcaacgaagcaattaccaactattttatctacgata 38924018  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38924017 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 38923963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 50365006 - 50364908
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50365006 atgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaat 50364908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 39069755 - 39069878
Alignment:
Q  8 aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgactta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||||     
T  39069755 aaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaattatcaactatgctattaacaatatgacttg 39069854  T
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||    
T  39069855 tttgaaacgattcaaaaactaaaa 39069878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 50977886 - 50977984
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  50977886 atgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaactatgctatctacaat 50977984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 51081018 - 51081116
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  51081018 atgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaactatgctatctacaat 51081116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33473354 - 33473218
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  33473354 ctaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaattaccaactatgttatctacaataaaac 33473255  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  33473254 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 33473218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 28699707 - 28699785
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 79  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28699707 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaatta 28699785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 34019482 - 34019580
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||   |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34019482 atgcctaaaaatatggctgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattatcaactatgctatctacaat 34019580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42641288 - 42641213
Alignment:
Q  10 aagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaact 85  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42641288 aagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaact 42641213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1016996 - 1016879
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||    
T  1016996 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgca 1016898  T
Q  208 tttgaccattaattaatta 226  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  1016897 tttgacctttatttaatta 1016879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 44152722 - 44152769
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattt 48  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44152722 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagattt 44152769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50287463 - 50287384
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  50287463 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 50287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 51475431 - 51475541
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  51475431 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaactt-aaagaccttta 51475528  T
Q  202 catacatttgacc 214  Q
     || |||||||||    
T  51475529 gatgcatttgacc 51475541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1687609 - 1687491
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| | |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  1687609 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgggacttttgaaactta-aatgacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 1687511  T
Q  202 catacatttgaccattaatt 221  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  1687510 gatgcatttgacccttaatt 1687491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28699637 - 28699532
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||| |    
T  28699637 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaatgacctttagatata 28699539  T
Q  208 tttgacc 214  Q
    |||||||    
T  28699538 tttgacc 28699532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 33151905 - 33151959
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  33151905 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 33151959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 47473252 - 47473294
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 43  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47473252 atgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Original strand, 44152775 - 44152907
Alignment:
Q  81 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | ||||||||   | ||| ||  |||||| ||||||    
T  44152775 caactatgttatctataatatgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagatttttgaaattta-aagaacagctttggaaaaaat 44152873  T
Q  181 gaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  44152874 gaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 44152907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21564454 - 21564343
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||| || |||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  21564454 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgggacttttgaaactta-aagaaccacttcgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 21564356  T
Q  202 catacatttgacc 214  Q
     || |||||||||    
T  21564355 gatgcatttgacc 21564343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47473190 - 47473099
Alignment:
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  47473190 atgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaactta-aaggaccacttagggaaaaacgaaaaacttaaa 47473099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3697098 - 3697051
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3697098 tttgaaacaattcaaaaactaaaagaacttgtttggaacttttgaaac 3697051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28193302 - 28193243
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaa 219  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  28193302 aaggactattttgagaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatacatttgaccattaa 28193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50364861 - 50364814
Alignment:
Q  167 actttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  50364861 actttgggaaaaatgaaaaacttaaaagacctttagattcatttgacc 50364814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39069687 - 39069574
Alignment:
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg-aaaagcttaaaagactt 198  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |    
T  39069687 atgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaaacttaaaagacct 39069589  T
Q  199 ttacatacatttgac 213  Q
    ||| || ||||||||    
T  39069588 ttagatgcatttgac 39069574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 33473422 - 33473475
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  33473422 gacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 33473475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 214
Target Start/End: Original strand, 36315211 - 36315295
Alignment:
Q  129 aaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  36315211 aaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 36315295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 76)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7651684 - 7651898
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7651684 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattatcaactatgctatctacaata 7651783  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  7651784 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 7651882  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  7651883 agatgcatttgaccat 7651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25988390 - 25988177
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  25988390 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattaccaactatgctatctacaata 25988291  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25988290 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgattttggaaaaaatgaaaaacttaaaagaccttt 25988192  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    |||||||||||||||    
T  25988191 acatacatttgacca 25988177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 50689965 - 50690173
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50689965 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaata 50690064  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50690065 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaagaccttt 50690163  T
Q  201 acatacattt 210  Q
    | || |||||    
T  50690164 agatgcattt 50690173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19315662 - 19315874
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19315662 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 19315761  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||    
T  19315762 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaatgaaaaacttaaaggactttt 19315860  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  19315861 agatgcatttgacc 19315874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28425482 - 28425265
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28425482 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctgcaata 28425383  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  28425382 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 28425284  T
Q  201 acatacatttgaccattaa 219  Q
    | || ||||||||| ||||    
T  28425283 agatgcatttgacctttaa 28425265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 12143094 - 12143303
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12143094 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 12143193  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  12143194 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaa--acttaaagacgactttggaaaaaatgaaaaactt-aaagaccttt 12143290  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | || ||||||||    
T  12143291 agatgcatttgac 12143303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23767533 - 23767320
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23767533 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 23767434  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  23767433 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagga-ttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaatgaaaaacttaaaggatcttt 23767336  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  23767335 agatacatttgaccat 23767320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 46825553 - 46825765
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  46825553 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaata 46825652  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  46825653 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgagtttgggaaaaaggaaaaacttaaaggaccttt 46825751  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||  ||||||||    
T  46825752 agatgtatttgacc 46825765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7553131 - 7552923
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7553131 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgac 7553032  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacat 204  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||  | || ||| | ||||| ||||||||||| |||||| | | |||| ||    
T  7553031 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactta-aaagaccattttggaaaaaatgaaaaacttaaaggccctttaaat 7552933  T
Q  205 acatttgacc 214  Q
     |||||||||    
T  7552932 gcatttgacc 7552923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19274581 - 19274792
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19274581 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccagctatgttatctacaata 19274680  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | | |||||||||| | | ||||||||| |||||| ||| |||    
T  19274681 ggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-acggacgacttt-gaagaaatgaaaaacttaaaggaccttt 19274778  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  19274779 agatgcatttgacc 19274792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24204590 - 24204378
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24204590 atgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 24204491  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| | | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  24204490 ggacttgtttgaaacgactcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 24204392  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  24204391 agatgcatttgacc 24204378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 43396697 - 43396909
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  43396697 atgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactctgctatctacagta 43396796  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     || || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  43396797 ggatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaatgaaaaacttaaaggactttt 43396895  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  43396896 agatgcatttgacc 43396909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 46051472 - 46051684
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  46051472 atgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaaca 46051571  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  46051572 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 46051670  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  46051671 agatgcatttgacc 46051684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 49094830 - 49094647
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49094830 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 49094731  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||| |||||||||||||    
T  49094730 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttaggaaaaatgaaaa 49094647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 49814322 - 49814505
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  49814322 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctagaata 49814421  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  || ||||  ||||||||||||| |||||    
T  49814422 tgacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaacttat-aggatcactttgggaaaaacgaaaa 49814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26549410 - 26549622
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26549410 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 26549509  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||  ||||||  || |||    
T  26549510 ggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttaagaaaaatgaaacacttaaagtaccttt 26549608  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||| ||||||||    
T  26549609 agatatatttgacc 26549622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48802450 - 48802238
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48802450 atgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaata 48802351  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||    
T  48802350 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 48802252  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  48802251 agatgcatttgacc 48802238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45350834 - 45350646
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45350834 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 45350735  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     |  || |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  45350734 gg--ttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaa 45350646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38473745 - 38473555
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38473745 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaata 38473646  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38473645 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aagtaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaa 38473555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36157796 - 36157584
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  36157796 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt-ccaattatgctatctacaata 36157698  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttt 199  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||    
T  36157697 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaatttaaaaggacatt 36157599  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || ||||||| ||||    
T  36157598 tagatacattcgacc 36157584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9878903 - 9878691
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9878903 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactattttatctacaata 9878804  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||    
T  9878803 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttatttgggacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacagtt 9878705  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  9878704 agatgcatttgacc 9878691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26069914 - 26070126
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  26069914 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaattaccaactatgatatctacaata 26070013  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | || |||   |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  26070014 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttctttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaatgaaaaatttaaaggaccttt 26070112  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  26070113 aaatacatttgacc 26070126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 33674039 - 33674251
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  33674039 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaattaccagctatgctatctacaata 33674138  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| ||||| || ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||| || |||||  ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  33674139 ggacttgtttgacacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aagaaccactttaagaaaaatgaaaaatttaaaagaccttt 33674237  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  33674238 aaatacatttgacc 33674251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 37216922 - 37217130
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  37216922 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaataggac 37217021  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacat 204  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  37217022 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgacctaggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagat 37217120  T
Q  205 acatttgacc 214  Q
     |||||||||    
T  37217121 gcatttgacc 37217130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 5400892 - 5401103
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5400892 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 5400991  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5400992 ggacttgtttgaaaagattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggactttt 5401090  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | || ||||||||    
T  5401091 agatgcatttgac 5401103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16705892 - 16706082
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16705892 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctaaaata 16705991  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||  || |||||||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  16705992 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgaaatttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaacgaaaaacttaaa 16706082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23228313 - 23228119
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23228313 atgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 23228214  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaaga 195  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||  | |||||||||||  | |||||  |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23228213 gtacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttagggacttttgaaacttaaaaggatcactttgagaaaaatgaaaaacttaaaaga 23228119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46095189 - 46095004
Alignment:
Q  6 taaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgact 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  46095189 taaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaataggact 46095090  T
Q  106 tatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    | |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  46095089 tgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaatttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaa 46095004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 33325749 - 33325961
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33325749 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 33325848  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  33325849 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 33325947  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||| ||||    
T  33325948 agatgcattcgacc 33325961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36781291 - 36781079
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36781291 atgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaata 36781192  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||   ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  36781191 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttcaaaaaaacgaaaaacttaaaagaccttt 36781093  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  36781092 agatgcatttgacc 36781079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7608885 - 7608668
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  7608885 atgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctataata 7608786  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | | |||||||  |  ||| ||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7608785 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggatttttgaa--atttaaagaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaaagactttt 7608688  T
Q  201 acatacatttgaccattaat 220  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  7608687 agatacatttgacctttaat 7608668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 50533405 - 50533545
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50533405 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctataata 50533504  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  50533505 ggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgttt 50533545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21965087 - 21965301
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  21965087 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaattaccaattatgtcatctacaata 21965186  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  21965187 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 21965285  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | ||  ||||||||||    
T  21965286 agatgtatttgaccat 21965301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41106038 - 41106168
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41106038 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 41106137  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  41106138 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 41106168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 9962773 - 9962985
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  9962773 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaaca 9962872  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  9962873 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttctttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 9962971  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  9962972 aaatgcatttgacc 9962985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 48669515 - 48669375
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  48669515 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatcaccaactatgctatctacaata 48669416  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  48669415 ggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgttt 48669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18782208 - 18781994
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  18782208 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatgaaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatcaactatgctatctagaata 18782109  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||  ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  18782108 tgacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaacata-aagaaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 18782010  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  18782009 agatgcatttgaccat 18781994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 18892354 - 18892505
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  18892354 cctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaatagga 18892453  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  18892454 cttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttttttggaacttttgaaac 18892505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45670605 - 45670393
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaa-ctatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45670605 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaactatgttatctacaat 45670507  T
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||  ||    
T  45670506 aggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggatctt 45670408  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || || |||||||||    
T  45670407 tagatgcatttgacc 45670393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 6711467 - 6711652
Alignment:
Q  6 taaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgact 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  6711467 taaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactataatgtctacaatatgact 6711566  T
Q  106 tatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    | |||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| | ||||  ||||||||||| ||||||    
T  6711567 tgtttgaaacgattcaaaaataaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccattttgaaaaaaatgaaaaacttaaa 6711652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18917546 - 18917758
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  18917546 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattattaaatatgctatctacaata 18917645  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    ||| || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||    
T  18917646 tgatttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgtttgagacttatgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaagaaccttt 18917744  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  18917745 aaatgcatttgacc 18917758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 52147015 - 52147223
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| |    
T  52147015 atgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacaaactatgctatatacaaca 52147114  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   | ||||||||   | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  52147115 tgacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagatttttgaaattta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 52147213  T
Q  201 acatacattt 210  Q
    | || |||||    
T  52147214 agatgcattt 52147223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8141605 - 8141452
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  8141605 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttggtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaaattatgctatctacaata 8141506  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8141505 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa-aacttgtttggaacttttgaaac 8141452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41982354 - 41982240
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41982354 atgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatcaactatgttatctacaata 41982255  T
Q  101 tgacttatttgaaac 115  Q
    |||||| ||||||||    
T  41982254 tgacttgtttgaaac 41982240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 48319165 - 48319067
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  48319165 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatatacaat 48319067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 40721364 - 40721555
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagt-gggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40721364 atgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaattatcaactatgctatctacaat 40721463  T
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    | ||||| || ||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40721464 aggacttgttggaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaaacgaaaaacttaaa 40721555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 9974864 - 9974963
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9974864 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 9974963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 12964668 - 12964867
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||              ||||    
T  12964668 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca--------------aata 12964753  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||  | || | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12964754 ggacttgtttgaatcgattcaaaaactaaaagaacttgtttgggacttttgaaactta-aatggccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggactttt 12964852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33194770 - 33194672
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  33194770 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaactatgctatctacaat 33194672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17984017 - 17983864
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  17984017 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacaaactatgttatttacatta 17983918  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
     |||||  ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   ||||||||||    
T  17983917 ggacttggttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttaagacttttgaaa 17983864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 21929545 - 21929758
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaag-------atgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctaca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21929545 ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctaca 21929644  T
Q  98 atatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagact 197  Q
    |||  |||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| ||| ||||||     
T  21929645 atagaacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaaacgaaaaactt-aaagacc 21929742  T
Q  198 tttacatacatttgac 213  Q
    |||| || ||||||||    
T  21929743 tttagatgcatttgac 21929758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25800666 - 25800875
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa----gatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctac 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||| ||||    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25800666 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agatttggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaattaccaac-atgttatctac 25800758  T
Q  97 aatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagac 196  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  25800759 aataagacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgacttcggaaaaaaagaaaaacttaaaggac 25800857  T
Q  197 ttttacatacatttgacc 214  Q
     |||| || |||||||||    
T  25800858 ctttagatgcatttgacc 25800875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978677
Alignment:
Q  19 aattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaat 118  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  44978868 aattttaagtgg-tattaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacgat 44978770  T
Q  119 ttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 212  Q
    | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||    
T  44978769 tcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttga 44978677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33714478 - 33714325
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33714478 atgcctaaaaagatgactaatgt-aagtgg-tgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaattatcaactatgttatctacaata 33714381  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaaca 156  Q
     || || |||||||| ||| ||||| || ||  |||||||| | || |||||||||    
T  33714380 ggatttgtttgaaacgattcaaaaactagaaagacttgtttgggacatttgaaaca 33714325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52067767 - 52067617
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||    
T  52067767 cctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaattacaaattatgccatctacaacatga 52067668  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  52067667 cttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaa 52067617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 52350043 - 52349913
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  52350043 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatttacaata 52349944  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  52349943 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 52349913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 34971102 - 34971226
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34971102 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattaccaactatgttatctacatta 34971201  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaa 125  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||    
T  34971202 ggacttgtttgaaacgattcaaaaa 34971226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16506907 - 16506809
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16506907 atgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 16506809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 30281653 - 30281751
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30281653 atgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 30281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22351137 - 22351031
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||    
T  22351137 tttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaactaaaaacttaaaggacctttagatgca 22351039  T
Q  208 tttgacca 215  Q
    ||||||||    
T  22351038 tttgacca 22351031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52146945 - 52146839
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||    
T  52146945 tttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacatttagatgca 52146847  T
Q  208 tttgacca 215  Q
    ||||||||    
T  52146846 tttgacca 52146839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19274456 - 19274375
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 216  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  19274456 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgaccat 19274375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52349914 - 52349864
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  52349914 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaagacctttagatatattt 52349864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25800512 - 25800459
Alignment:
Q  163 gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  25800512 gacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatacatttgaccat 25800459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41105913 - 41105833
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  41105913 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 41105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 49814258 - 49814205
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49814258 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaataacttgtttggaacttttgaaac 49814205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16505249 - 16505138
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  || |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||  |||| || ||    
T  16505249 tttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaacttat-aggacgacttcgggaaaaactaaaaacttaaaggatctttagatgca 16505151  T
Q  208 tttgaccattaat 220  Q
    |||||||| ||||    
T  16505150 tttgaccaataat 16505138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12143018 - 12142916
Alignment:
Q  107 atttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatac 206  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |    
T  12143018 atttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgc 12142920  T
Q  207 attt 210  Q
    ||||    
T  12142919 attt 12142916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 50099242 - 50099277
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50099242 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgtta 50099277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Original strand, 16508118 - 16508222
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||||||| |||| | ||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||    
T  16508118 tttgaaacaattcaaaact-aaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaactaaaaacttaaaggacctttagatgca 16508215  T
Q  208 tttgacc 214  Q
    |||||||    
T  16508216 tttgacc 16508222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9974800 - 9974747
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9974800 gacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 9974747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46825458 - 46825346
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    ||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  46825458 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagtcttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 46825360  T
Q  202 catacatttgacca 215  Q
     || ||||| ||||    
T  46825359 gatgcatttaacca 46825346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50533248 - 50533199
Alignment:
Q  167 actttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccat 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  50533248 actttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttaaatacatttgaccat 50533199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12964603 - 12964551
Alignment:
Q  103 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12964603 acttgtttgaaacaattcaaaaattaaaagaacttgtttgagacttttgaaac 12964551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 215
Target Start/End: Original strand, 18782365 - 18782413
Alignment:
Q  167 actttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18782365 actttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacca 18782413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37216794 - 37216711
Alignment:
Q  133 aacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccatt 217  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||  |||| || ||||||||||||    
T  37216794 aacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggaactttagatgcatttgaccatt 37216711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 47219167 - 47219379
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47219167 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 47219266  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  47219267 ggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 47219365  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  47219366 aaatgcatttgacc 47219379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 44544431 - 44544643
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44544431 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 44544530  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  44544531 ggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgggactttagaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggatcttt 44544629  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  44544630 agatacatttgacc 44544643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1469612 - 1469398
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1469612 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 1469513  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   || ||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1469512 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacctttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaatgaaaaacttaaaagaccttt 1469414  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  1469413 agatacatttgaccat 1469398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47294410 - 47294198
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  47294410 atgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacgatgctatctacaata 47294311  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  47294310 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 47294212  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  47294211 agatgcatttgacc 47294198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 221298 - 221508
Alignment:
Q  2 tgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||     
T  221298 tgcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaatag 221397  T
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  221398 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttcgaaaaaatgaaaaacttaaaagactttta 221496  T
Q  202 catacatttgac 213  Q
     || ||||||||    
T  221497 gatgcatttgac 221508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 47272003 - 47272215
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47272003 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 47272102  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||||  | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  47272103 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgttttagaattttgaaactta-aatgacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacattt 47272201  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  47272202 agatgcatttgacc 47272215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2960759 - 2960547
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  2960759 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaata 2960660  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||| | |||||| ||| |||    
T  2960659 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacgaacaacttaaaggaccttt 2960561  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  2960560 agatgcatttgacc 2960547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11476675 - 11476463
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11476675 atgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 11476576  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||| |||    
T  11476575 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacaaaaaacttaaaggaccttt 11476477  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  11476476 agatgcatttgacc 11476463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 7336082 - 7336291
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7336082 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaata 7336181  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||  | |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  7336182 -gaactgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttggaatttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 7336279  T
Q  201 acatacatttga 212  Q
    | || |||||||    
T  7336280 agatgcatttga 7336291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8162831 - 8162677
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8162831 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 8162732  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
T  8162731 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaataacttgtttgagacttttgaaac 8162677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 48628827 - 48629039
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48628827 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 48628926  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  48628927 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 48629025  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  48629026 agatgcatttgacc 48629039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38427682 - 38427483
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  38427682 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataata 38427583  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||    
T  38427582 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgactttgagaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 38427484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30798487 - 30798275
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30798487 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 30798388  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     || || |||||||| ||| || || |||||  |||||||| | |||||||||  || ||| ||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||    
T  30798387 ggatttgtttgaaacgattcaacaactaaaaggacttgtttgggacttttgaa--acttaaagaccactttaggaaaaacgaaaaactcaaaagaccttt 30798290  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  30798289 atatgcatttgacca 30798275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31684253 - 31684041
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  31684253 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactattctatctacaata 31684154  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| ||| |||    
T  31684153 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggggaaacgaaaaacttaaaggaccttt 31684055  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  31684054 agatgcatttgacc 31684041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 23842327 - 23842481
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23842327 atgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 23842426  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  23842427 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 23842481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37394117 - 37393904
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  37394117 atgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactaccaactatgctatctacaata 37394018  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg-aaaagcttaaaagacttt 199  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  37394017 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaaacttaaaggacttt 37393919  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || || |||||||||    
T  37393918 tagatgcatttgacc 37393904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 30876281 - 30876493
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30876281 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaata 30876380  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  30876381 gcacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 30876479  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  30876480 aaatgcatttgacc 30876493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35600241 - 35600029
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35600241 atgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 35600142  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  35600141 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 35600043  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||  ||||||||    
T  35600042 aaatgtatttgacc 35600029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 47281243 - 47281103
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47281243 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatggtatctacaata 47281144  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  47281143 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 47281103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 41113403 - 41113612
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  41113403 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggac 41113502  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg-aaaagcttaaaagacttttaca 203  Q
    || |||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||||  |||||| |||| ||||||  || |||| |    
T  41113503 ttgtttgaaatgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttggagaaaatgaaaaaacttaaataacctttaga 41113601  T
Q  204 tacatttgacc 214  Q
    |||||||||||    
T  41113602 tacatttgacc 41113612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42979457 - 42979245
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42979457 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaattaccaactatgttatctacagta 42979358  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| | ||| |||||  |||||||| ||| |||||||||  | |||||  ||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  42979357 ggacttgtttgaaacgattcacaaactaaaaggacttgtttagaa-ttttgaaacttaaaaggaacacttttgaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 42979259  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  42979258 agatgcatttgacc 42979245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45723610 - 45723398
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||  || |||| |||||||||||    
T  45723610 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattactaattatgctatctacaata 45723511  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    ||| || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  45723510 tgatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaactta-aagaacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 45723412  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  45723411 agatgcatttgacc 45723398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 33884341 - 33884465
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33884341 atgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 33884440  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaa 125  Q
    |||||| |||||||| |||||||||    
T  33884441 tgacttgtttgaaacgatttaaaaa 33884465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 40851297 - 40851507
Alignment:
Q  2 tgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||     
T  40851297 tgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaattaccaactattctacctacaatag 40851396  T
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||  || |||||||||  | ||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  40851397 gacttgtttgaaacgattcaaaagctaaaaggacttgtttgaaatttttgaaactta-aaggacgactttaaaaaaaatgaaaaacttaaaggacattta 40851495  T
Q  202 catacatttgac 213  Q
     || ||||||||    
T  40851496 gatgcatttgac 40851507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43752894 - 43752697
Alignment:
Q  2 tgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||     
T  43752894 tgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaatag 43752795  T
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| | |||   ||||||||||| |||||| |||||||    
T  43752794 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccattttaaaaaaaatgaaaaacttaaaggactttt 43752697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11050380 - 11050188
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  11050380 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattaccaaatatgctatctacaata 11050281  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaag 194  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| | |||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  11050280 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactgaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaactcaaaag 11050188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41139531 - 41139315
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaac----tatgttatctac 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||| ||| |||    
T  41139531 atgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatatatgctatttac 41139432  T
Q  97 aatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-ga 195  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||  |||||||| | |||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  41139431 aataggacttgtttgaaacgattcaaaaact-aaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagtacaactttggaaaaaatgaaaaacttaaaagga 41139334  T
Q  196 cttttacatacatttgacc 214  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  41139333 cctttagatacatttgacc 41139315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44800529 - 44800389
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  44800529 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattaccaactatgttatctacaaca 44800430  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  44800429 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaagaacttgttt 44800389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 47120013 - 47120227
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaac--tatgttatctacaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||  |||| | |||||||    
T  47120013 atgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaattaccaactatatgctctctacaa 47120112  T
Q  99 tatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactt 198  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  47120113 taggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggatcactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacat 47120211  T
Q  199 ttacatacatttgacc 214  Q
    ||| || |||||||||    
T  47120212 ttagatgcatttgacc 47120227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47579203 - 47579016
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagc-aattaacaactatgttatctacaatatg 102  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||| |    
T  47579203 cctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaaattaccaattatgctatctataatagg 47579104  T
Q  103 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    |||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  47579103 acttgtctgaaacaattcaaaaactaaaatgacttg-tttggacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaatgaaaaacttaaa 47579016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27364455 - 27364328
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27364455 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgttatctacaatagga 27364356  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
      | |||||||| ||| ||||| |||||    
T  27364355 tctgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 27364328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3797642 - 3797544
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3797642 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaat 3797544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 4923238 - 4923352
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4923238 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattaccaactatgctatccacaata 4923337  T
Q  101 tgacttatttgaaac 115  Q
     ||||| ||||||||    
T  4923338 ggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30972060 - 30971908
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  30972060 atgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaattaccaactatgccatctacaata 30971961  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  30971960 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaacgacttg-tttgaaattttgaaa 30971908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43968378 - 43968238
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  43968378 atgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactacgctatctacaata 43968279  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  43968278 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 43968238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 29248364 - 29248477
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  29248364 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaactatgctatctacaata 29248463  T
Q  101 tgacttatttgaaa 114  Q
     ||||| |||||||    
T  29248464 agacttgtttgaaa 29248477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 18353170 - 18353306
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  || |||    
T  18353170 ctaaaaagatgactaattttaattaggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattaccaactatgctatctaccttaggac 18353269  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  18353270 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 18353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37354382 - 37354284
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37354382 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaat 37354284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 196
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42889065
Alignment:
Q  67 aaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacg 166  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||  | |||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttatttgaaacttttgaaactta-aaggacg 42889035  T
Q  167 actttgggaaaaatgaaaagcttaaaagac 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42889036 actttgggaaaaatgaaaaacttaaaagac 42889065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 27774130 - 27774228
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27774130 atgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 27774228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 40520944 - 40521011
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaa 72  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40520944 ctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23842263 - 23842151
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  23842263 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgttttgaacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggactttta 23842165  T
Q  202 catacatttgacca 215  Q
     || ||||||||||    
T  23842164 gatgcatttgacca 23842151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42888833 - 42888715
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  42888833 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaatgaccttta 42888735  T
Q  202 catacatttgaccattaatt 221  Q
     || ||||||||||| ||||    
T  42888734 gatgcatttgaccataaatt 42888715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Original strand, 47294474 - 47294586
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  47294474 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttta 47294572  T
Q  202 catacatttgacca 215  Q
     || ||||||||||    
T  47294573 gatgcatttgacca 47294586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106275
Alignment:
Q  64 ttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataagg 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | ||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataaga-atgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaactta-aagg 5106224  T
Q  164 acgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||| || |||||||||    
T  5106225 acgattttggaaaaaatgaaaaacttaaataacctttagatgcatttgacc 5106275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40851241 - 40851129
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  40851241 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 40851143  T
Q  202 catacatttgacca 215  Q
     || ||||||||||    
T  40851142 gatgcatttgacca 40851129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 31684317 - 31684428
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  31684317 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaatgcaaaacttaaaggaccttta 31684415  T
Q  202 catacatttgacc 214  Q
     || |||||||||    
T  31684416 gatgcatttgacc 31684428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39033966 - 39033879
Alignment:
Q  126 ttaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  39033966 ttaaaagaacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 39033879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47119949 - 47119838
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  47119949 gacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 47119851  T
Q  202 catacatttgacc 214  Q
     || |||||||||    
T  47119850 gatgcatttgacc 47119838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47271851 - 47271800
Alignment:
Q  163 gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  47271851 gacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 47271800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 1469762 - 1469816
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  1469762 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 1469816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25801565 - 25801472
Alignment:
Q  121 aaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  25801565 aaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 25801472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27773088 - 27772983
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||    
T  27773088 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggactagtttggaacttttgaaattta-aaggacgactttgggaaaaactaaaaacttaaaggacctttagatgca 27772990  T
Q  208 tttgacc 214  Q
    |||||||    
T  27772989 tttgacc 27772983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29739598 - 29739521
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 212  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||    
T  29739598 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggactactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttga 29739521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 30972122 - 30972234
Alignment:
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||    
T  30972122 atgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgtttgggacttttgaaactta-aaagacgactttgggaaaatcgaaaaactt-aaagacctt 30972219  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || || |||||||||    
T  30972220 tagatgcatttgacc 30972234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 39034084 - 39034122
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 39  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39034084 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttagga 39034122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 43968528 - 43968582
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  43968528 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 43968582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45233518 - 45233468
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  45233518 aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatacattt 45233468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34378569 - 34378512
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgaccat 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  34378569 aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaaggacctttaaatgcatttgaccat 34378512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Original strand, 45233641 - 45233753
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  45233641 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaatttaaaggaccttta 45233739  T
Q  202 catacatttgacca 215  Q
     || ||||||||||    
T  45233740 gatgcatttgacca 45233753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48628677 - 48628644
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48628677 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaa 48628644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3875930 - 3876129
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3875930 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 3876029  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  3876030 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 3876128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 37933664 - 37933877
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  37933664 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacgata 37933763  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37933764 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggactttt 37933862  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  37933863 agatgcatttgacca 37933877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9056457 - 9056247
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9056457 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgttatctacaata 9056358  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataag-gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||  ||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||    
T  9056357 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgatttgtttgaaacttttgaa--acttaagagacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctt 9056260  T
Q  200 tacatacatttga 212  Q
    || ||||||||||    
T  9056259 tagatacatttga 9056247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22684103 - 22683888
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22684103 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgatatctacaatatgac 22684004  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacat 204  Q
    || |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||    
T  22684003 ttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggagctttagat 22683905  T
Q  205 acatttgaccattaatt 221  Q
     ||||||||| ||||||    
T  22683904 gcatttgacctttaatt 22683888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35884549 - 35884335
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35884549 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 35884450  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || |||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  35884449 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactc-taaggaccactctaggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 35884351  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  35884350 agatgcatttgaccat 35884335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2533294 - 2533508
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2533294 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaata 2533393  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac-acataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||   | ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| || |||    
T  2533394 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaacttaaaaaggatgacttttgaaaaaatgaaaaacttaaatgagttt 2533493  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || || |||||||||    
T  2533494 tagatgcatttgacc 2533508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 38107121 - 38107333
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38107121 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 38107220  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  38107221 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttttttgggacttttgaaactta-aaggacgacttcgggaaaaatgaaaaacttaaaggacattt 38107319  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  38107320 agatgcatttgacc 38107333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36400189 - 36399976
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36400189 atgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 36400090  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttt 199  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  36400089 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaaggacctt 36399991  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || || |||||||||    
T  36399990 tagatgcatttgacc 36399976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 260000 - 260211
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  260000 atgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 260098  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  260099 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagaattttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacattt 260197  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  260198 agatgcatttgacc 260211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 655921 - 655710
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  655921 atgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 655823  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  655822 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagaattttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacattt 655724  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  655723 agatgcatttgacc 655710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 841656 - 841445
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  841656 atgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 841558  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  841557 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagaattttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacattt 841459  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  841458 agatgcatttgacc 841445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15847134 - 15847346
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15847134 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 15847233  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| || ||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||     
T  15847234 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttggagcttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaatgaaaaacttaaaaaacctta 15847332  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  15847333 agatgcatttgacc 15847346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 35443333 - 35443545
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35443333 atgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 35443432  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
      |||| |||||||| ||| |||||  ||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  35443433 gaacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaatgaaaatcttaaaggaccttt 35443531  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  35443532 agatgcatttgacc 35443545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 513332 - 513541
Alignment:
Q  3 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatg 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  513332 gcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagg 513430  T
Q  103 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttac 202  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||     
T  513431 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggactagtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacttttag 513529  T
Q  203 atacatttgacc 214  Q
    || |||||||||    
T  513530 atgcatttgacc 513541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43806652 - 43806440
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43806652 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 43806553  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||  |||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  43806552 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgcgacttttgaaactta-aaggaccactttaagaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 43806454  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
      || |||||||||    
T  43806453 gaatgcatttgacc 43806440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41536646 - 41536434
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41536646 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 41536547  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | || ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  41536546 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaagacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 41536448  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  41536447 agatgcatttgacc 41536434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 440866 - 441073
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  440866 ctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatatacaataggac 440965  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacat 204  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  440966 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacaactttaggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagat 441064  T
Q  205 acatttgac 213  Q
    |||||||||    
T  441065 acatttgac 441073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 12010571 - 12010784
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttat---ctaca 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||   |||||    
T  12010571 atgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaattaccaactatgctatctactaca 12010670  T
Q  98 atatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagact 197  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  12010671 ataggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaca 12010769  T
Q  198 tttacatacatttga 212  Q
    |||| || |||||||    
T  12010770 tttagatgcatttga 12010784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23972410 - 23972201
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23972410 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgac 23972311  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggg-aaaaatgaaaagcttaaaagacttttaca 203  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||  | |||||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||| |||| |    
T  23972310 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaaataaaaaacttaaaggacctttata 23972212  T
Q  204 tacatttgacc 214  Q
    | |||||||||    
T  23972211 tgcatttgacc 23972201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 39513458 - 39513327
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  39513458 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgttatctacatta 39513359  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaat 132  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39513358 ggacttatttgaaacaatttaaaaactaaaat 39513327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 13797114 - 13797322
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  13797114 cctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatatacaatagga 13797212  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttaca 203  Q
     || |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  13797213 tttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaagacctttaga 13797311  T
Q  204 tacatttgacc 214  Q
    | |||||||||    
T  13797312 tgcatttgacc 13797322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 33651867 - 33652075
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| |||    
T  33651867 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaattacaaactatgctatctacgataggac 33651966  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacat 204  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | || ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  33651967 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaagaccactttaggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagat 33652065  T
Q  205 acatttgacc 214  Q
     |||||||||    
T  33652066 gcatttgacc 33652075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Original strand, 38208786 - 38208914
Alignment:
Q  12 gatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38208786 gatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttg 38208885  T
Q  112 aaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  38208886 aaacgattcaaaaactaaaa-aacttgttt 38208914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 1293508 - 1293648
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1293508 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaaca 1293607  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  1293608 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 1293648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28496473 - 28496262
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496473 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattagaa-ctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 28496375  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||  | || ||| |||||   |||||||||||  ||||| |||||||    
T  28496374 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactta-aatgaccactttataaaaaatgaaaaatttaaaggactttt 28496276  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  28496275 agatgcatttgacc 28496262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28707565 - 28707435
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  28707565 atgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgatatctacaata 28707466  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     || || |||||||| ||| ||||| |||||    
T  28707465 ggatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 28707435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36218899 - 36218747
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |    
T  36218899 atgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaag-aagcaattatcaactatattatctacatca 36218801  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36218800 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttagaacttttgaaa 36218747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42988345 - 42988135
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| || |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42988345 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaatataagttaaatgaagcaattatcaactatattatctacaata 42988246  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||| ||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  42988245 ggactt-tttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttaaaactta-aatgacgactttggaaaaaatgaaaaacttgaaagaccttt 42988148  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | |||||||||||    
T  42988147 aaatacatttgac 42988135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24430690 - 24430478
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||  || |||||| |||||||  |||||||||||    
T  24430690 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaattatcaactatactatctacaata 24430591  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||  | || ||| ||||||  ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  24430590 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggatttttgaaactta-aaagaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 24430492  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  24430491 agatgcatttgacc 24430478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 7434910 - 7435006
Alignment:
Q  3 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7434910 gcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaat 7435006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23935255 - 23935353
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23935255 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaat 23935353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38633829 - 38633675
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  38633829 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacatta 38633730  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  || |||||   |||||||||||    
T  38633729 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacctgtttgagacttttgaaac 38633675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40302012 - 40301889
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40302012 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaata 40301913  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaa 124  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||    
T  40301912 tgacttttttgaaacgattcaaaa 40301889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 4649172 - 4649380
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||     
T  4649172 atgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaattaccaattatgctatctacaatt 4649271  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | || |||  |||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  4649272 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccgctttgggaaaaatgaaaaacttgaaggaccttt 4649370  T
Q  201 acatacattt 210  Q
    | || |||||    
T  4649371 agatgcattt 4649380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 6016227 - 6016325
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6016227 atgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaattaccaactatgctatctacaat 6016325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 29485309 - 29485406
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29485309 atgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaat 29485406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193109
Alignment:
Q  55 aaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgttt 24193109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Original strand, 22684171 - 22684283
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  22684171 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 22684269  T
Q  202 catacatttgacca 215  Q
     || ||||||||||    
T  22684270 gatgcatttgacca 22684283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24193411 - 24193356
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24193411 atgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 8137196 - 8137239
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 44  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8137196 atgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6016162 - 6016052
Alignment:
Q  103 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttac 202  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  6016162 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgtgacttttgaaactta-aaggatcacttttggaaaaatgaaaaacttaaaggacttttaa 6016064  T
Q  203 atacatttgacc 214  Q
    || |||||||||    
T  6016063 atgcatttgacc 6016052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 222
Target Start/End: Original strand, 43806772 - 43806867
Alignment:
Q  129 aaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacc-attaatta 222  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  43806772 aaatgacttgtttgggacttttgaaacttaaaaggactactttgggaaaaatggaaaacttaaaaggacatttagatgcatttgacctattaatta 43806867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2533230 - 2533158
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggga 175  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  2533230 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttaggacttttgaaactta-aaggacgactttggga 2533158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35443207 - 35443128
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  35443207 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaactt-aaagacctttagatacatttgacca 35443128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15847035 - 15846956
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  15847035 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaacaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 15846956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55517304 - 55517094
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  55517304 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaata 55517205  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  55517204 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaactt-aaagaccttt 55517107  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | || ||||||||    
T  55517106 agatgcatttgac 55517094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 49118633 - 49118845
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49118633 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaata 49118732  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  49118733 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaacgacattt 49118831  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  49118832 agatacatttgacc 49118845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 28264665 - 28264877
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28264665 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 28264764  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  28264765 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 28264863  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  28264864 agatgcatttgacc 28264877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24458750 - 24458536
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24458750 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 24458651  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || |||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  24458650 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaactc-taaggaccactctaggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 24458552  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  24458551 agatgcatttgaccat 24458536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 31591100 - 31591309
Alignment:
Q  3 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatg 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  31591100 gcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagg 31591198  T
Q  103 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttac 202  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  31591199 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgactcgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacttttag 31591297  T
Q  203 atacatttgacc 214  Q
    || |||||||||    
T  31591298 atgcatttgacc 31591309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23135125 - 23134916
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23135125 atgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 23135026  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||  ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||    
T  23135025 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgaaacttttgaaactta-aaggatgactttgggaaaaatgaaaaacttacaggaccttt 23134927  T
Q  201 acatacatttg 211  Q
    | || ||||||    
T  23134926 agatgcatttg 23134916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33807899 - 33807688
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33807899 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaata 33807800  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  33807799 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaa--acttaaagacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaatgaccttt 33807702  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  33807701 agatgcatttgacc 33807688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4545104 - 4544893
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4545104 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 4545005  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  4545004 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacctttgaaactta-aaggactactttagaaaaaatgaaaaactt-aaagaccttt 4544907  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  4544906 agatgcatttgacc 4544893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 31973613 - 31973828
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31973613 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 31973712  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||    
T  31973713 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaaacgaaaaatttaaaggacattt 31973811  T
Q  201 acatacatttgaccatt 217  Q
    | || ||||||||||||    
T  31973812 agatgcatttgaccatt 31973828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 44490341 - 44490540
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44490341 atgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgatatctacaata 44490440  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  44490441 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacattt 44490539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19496221 - 19496008
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19496221 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatggtatctacaata 19496122  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | || |||||||   | |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  19496121 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacctttgaaattta-aaggatcactttgggaaaaatgaaaaacttaaaagaacttt 19496023  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  19496022 agatgcatttgacca 19496008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25730262 - 25730475
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  25730262 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaactatgctatctacaata 25730361  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttt 199  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  25730362 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaaggacatt 25730460  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || ||||||||||||    
T  25730461 tagatacatttgacc 25730475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12196491 - 12196699
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12196491 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 12196590  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  12196591 ggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaagctta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 12196689  T
Q  201 acatacattt 210  Q
    | || |||||    
T  12196690 agatgcattt 12196699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26017445 - 26017657
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26017445 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 26017544  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||    
T  26017545 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactacaaggacttgtttgtgacttttgaaactta-aaggacaactttggaaaaaatgaaaaactcaaaggaccttt 26017643  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  26017644 agatgcatttgacc 26017657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 42273824 - 42274036
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  42273824 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 42273923  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  42273924 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagatttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 42274022  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
      || |||||||||    
T  42274023 tgatgcatttgacc 42274036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 40988655 - 40988869
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40988655 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaata 40988754  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| |||    ||||||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| |||||||  |||| |||||| |||||||    
T  40988755 ggacttgtttgaaacgatt----aattaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaacaaaaaacttaaaggactttt 40988849  T
Q  201 acatacatttgaccattaat 220  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  40988850 agatacatttgaccaataat 40988869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15985032 - 15985243
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15985032 atgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata 15985131  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  15985132 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaaa-actttt 15985229  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  15985230 agatacatttgacc 15985243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33174139 - 33173927
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  33174139 atgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgaaatctacaata 33174040  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| |||| |||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  33174039 agacttgtttgaaacgatttgaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aatgacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 33173941  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  33173940 agatgcatttgacc 33173927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48551883 - 48551671
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  48551883 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaaccatgctatctacaata 48551784  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  48551783 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaaggacattt 48551685  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  48551684 agatgcatttgacc 48551671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28812405 - 28812193
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28812405 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 28812307  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  28812306 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 28812208  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  28812207 agatgcatttgacca 28812193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5227412 - 5227624
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5227412 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 5227511  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||| || ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  5227512 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aagaaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 5227610  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  5227611 agatgcatttgacc 5227624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23553087 - 23553306
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  23553087 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaattatgctatctacaaca 23553185  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  23553186 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgtgacttttaaaactta-aaggaccactttagaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 23553284  T
Q  201 acatacatttgaccattaatta 222  Q
    | || |||||||||||| ||||    
T  23553285 agatgcatttgaccatttatta 23553306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50276243 - 50276044
Alignment:
Q  15 gactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  50276243 gactaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 50276144  T
Q  115 caatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    | ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  50276143 cgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-caggaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 50276045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11795273 - 11795059
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  11795273 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctagaata 11795174  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg-aaaagcttaaaagacttt 199  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| | |||| |||||| ||| ||    
T  11795173 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaacgaaaaaacttaaaggacctt 11795075  T
Q  200 tacatacatttgacca 215  Q
    || || ||||||||||    
T  11795074 tagatgcatttgacca 11795059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 48707852 - 48707662
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48707852 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 48707753  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||  ||| ||||  ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  48707752 ggacttgtttgaaaagattcaaaatctaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaa 48707662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 2055300 - 2055454
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2055300 atgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattatcaactatgttatctacaata 2055399  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  2055400 tgacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaacgacttgtttggaacttttaaaac 2055454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8882132 - 8881912
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  8882132 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctagaata 8882033  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgg--gaaaaatgaaaagcttaaaagactt 198  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| |   ||||||||||| |||||| ||| |    
T  8882032 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaaaaatgaaaaacttaaaggacct 8881934  T
Q  199 ttacatacatttgaccattaat 220  Q
    ||| || ||||||||| |||||    
T  8881933 ttaaatgcatttgacctttaat 8881912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9339245 - 9339031
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaa---gatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctaca 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9339245 atgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctaca 9339146  T
Q  98 atatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagact 197  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||     
T  9339145 atatgacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggaattgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaactt-aaagacc 9339048  T
Q  198 tttacatacatttgacc 214  Q
    |||| || |||||||||    
T  9339047 tttagatgcatttgacc 9339031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17847208 - 17847004
Alignment:
Q  8 aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgactta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||     
T  17847208 aaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaataggacttg 17847109  T
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||| || ||    
T  17847108 tttgaaacgattcaaaaactataaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttggg-aaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgca 17847011  T
Q  208 tttgacc 214  Q
    |||||||    
T  17847010 tttgacc 17847004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 48149521 - 48149729
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  48149521 atgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacatta 48149620  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| || ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  48149621 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 48149719  T
Q  201 acatacattt 210  Q
    | || |||||    
T  48149720 agatgcattt 48149729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 10588602 - 10588813
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10588602 atgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 10588701  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||  |||||||||||  | |||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| |||||  ||||| ||| |||    
T  10588702 cgacttgtttgaaacgatccaaaaattaaaaggatttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgacaaaaacgaaaaatttaaaggaccttt 10588800  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | || ||||||||    
T  10588801 agatgcatttgac 10588813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 22298546 - 22298752
Alignment:
Q  7 aaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgactt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| | |||    
T  22298546 aaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaattaccaattatgctatctacaatagggctt 22298645  T
Q  107 atttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatac 206  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |    
T  22298646 gtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacatttagatgc 22298744  T
Q  207 atttgacc 214  Q
    ||||||||    
T  22298745 atttgacc 22298752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28160072 - 28159862
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28160072 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatggtatctacaata 28159973  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||   | |||||||||  | |||||| |||||  |||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  28159972 agacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagatttttgaaactta-aaggaccactttaagaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 28159874  T
Q  201 acatacatttga 212  Q
    | || |||||||    
T  28159873 agatgcatttga 28159862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 35930061 - 35930251
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35930061 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaattaccaactatgctatctacaata 35930160  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  35930161 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttggaacctttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaatgaaaaacttaaa 35930251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39995286 - 39995072
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39995286 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaata 39995187  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg-aaaagcttaaaagacttt 199  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||| ||||  | |||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||    
T  39995186 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttaaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaaacttaaaggacctt 39995088  T
Q  200 tacatacatttgacca 215  Q
    || || ||||||||||    
T  39995087 tagatgcatttgacca 39995072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 31208776 - 31208956
Alignment:
Q  11 agatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttattt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  31208776 agatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgttt 31208875  T
Q  111 gaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    ||||| ||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  31208876 gaaacgattcaaaaactaaaaggagttgttttggacttttgaaactta-aatgacgaatttaggaaaaatgaaaaacttaaa 31208956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 32317975 - 32318114
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32317975 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaata 32318074  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgtt 140  Q
     ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||    
T  32318075 ggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtt 32318114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50542473 - 50542259
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  50542473 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaata 50542374  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttt 199  Q
     || || ||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  50542373 agatttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaaaggacctt 50542275  T
Q  200 tacatacatttgacca 215  Q
    || |||||||||||||    
T  50542274 tagatacatttgacca 50542259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30141227 - 30141073
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  30141227 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatcaacaata 30141128  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  30141127 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttagaatttttgaaac 30141073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 32118736 - 32118890
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32118736 atgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaata 32118835  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
      |||| |||||||| ||||||||| |||||  | |||||| | |||||||||||    
T  32118836 gaacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggatttgtttgggacttttgaaac 32118890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30467122 - 30466910
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  30467122 atgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattaccaactatgctatctacaata 30467023  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgacttt-gggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  30467022 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttagaaaaaaacgaaaaacttaaaagacctt 30466924  T
Q  200 tacatacatttgac 213  Q
    || || ||||||||    
T  30466923 tagatgcatttgac 30466910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33693448 - 33693299
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||    
T  33693448 ctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaacaggac 33693349  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  33693348 ttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttatttggaacttttgaaa 33693299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Original strand, 37381872 - 37382022
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37381872 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatatgac 37381971  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    || |||||||  |||||||||  ||||  ||||||||   |||||||||||    
T  37381972 ttgtttgaaatgatttaaaaacaaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 37382022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39700067 - 39700197
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  39700067 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaattatgttatctataata 39700166  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     ||||| |||||||| ||| || ||||||||    
T  39700167 agacttgtttgaaacgattcaataattaaaa 39700197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25734342 - 25734229
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25734342 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacgaaagatgagttcaattaagcaattaccaactatgttatctacaata 25734243  T
Q  101 tgacttatttgaaa 114  Q
     ||||| |||||||    
T  25734242 ggacttgtttgaaa 25734229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51371162 - 51371036
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||    
T  51371162 ctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagaac 51371063  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||    
T  51371062 ttgtttgaaacgattcaaaaattaaaa 51371036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 14564818 - 14564947
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  14564818 atgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatatacaata 14564917  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaa 130  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  14564918 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaa 14564947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17993136 - 17993006
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  17993136 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaattaccaactatgctatttacaata 17993037  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  17993036 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 17993006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 24623170 - 24623268
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24623170 atgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 24623268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 42549741 - 42549643
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42549741 atgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaat 42549643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19168914 - 19168816
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19168914 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 19168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534341
Alignment:
Q  39 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 138  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttg 20534324  T
Q  139 ttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||   |||||||||||    
T  20534325 tttgagacttttgaaac 20534341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 56555259 - 56555200
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagat 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  56555259 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28264601 - 28264485
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  28264601 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 28264503  T
Q  202 catacatttgaccattaa 219  Q
     || ||||||||| ||||    
T  28264502 gatgcatttgacctttaa 28264485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26017381 - 26017270
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  26017381 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 26017283  T
Q  202 catacatttgacc 214  Q
     || |||||||||    
T  26017282 gatgcatttgacc 26017270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17993007 - 17992957
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  17993007 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaagacctttagatatattt 17992957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31590972 - 31590896
Alignment:
Q  136 ttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  31590972 ttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaa-acctttaaatacatttgacc 31590896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31208645 - 31208565
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  31208645 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 31208565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 23135189 - 23135300
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||    
T  23135189 gacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagactttttaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggccattta 23135287  T
Q  202 catacatttgacc 214  Q
     || |||||||||    
T  23135288 gatgcatttgacc 23135300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12196350 - 12196296
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  12196350 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 12196296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48149457 - 48149404
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  48149457 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaagaacttgtttgggacttttgaaac 48149404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49118563 - 49118459
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||    
T  49118563 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgca 49118465  T
Q  208 tttgac 213  Q
    ||||||    
T  49118464 tttgac 49118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 215
Target Start/End: Original strand, 9339379 - 9339450
Alignment:
Q  143 gaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  9339379 gaacttttgaaactta-aaggacgattttggaaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 9339450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 17847368 - 17847447
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  17847368 acttgtttgggacttttgaaaccta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 17847447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 25734495 - 25734547
Alignment:
Q  163 gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  25734495 gacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 25734547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Original strand, 48707922 - 48708005
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  48707922 tttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaa 48708005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 51371262 - 51371314
Alignment:
Q  103 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  51371262 acttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttggaacttttgaaac 51371314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 41282364 - 41282577
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41282364 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 41282463  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  41282464 ggacttgtttgaaatgatttaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 41282562  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  41282563 agatgcatttgacca 41282577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14717627 - 14717840
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14717627 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 14717726  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaac-ttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  14717727 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaactttttgaaac-ttgaaggaccactttgaaaaaaatgaaaaacttaaaggacttt 14717825  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || || |||||||||    
T  14717826 tagatgcatttgacc 14717840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19659620 - 19659408
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19659620 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagcaattaccaactatgctatctacaata 19659521  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  19659520 ggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaataaaaaacttaaaggaccttt 19659422  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  19659421 agatgcatttgacc 19659408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 8689594 - 8689783
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8689594 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaattaccaactatgttatctacatta 8689693  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||  || ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8689694 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaa--acttaaagaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaa 8689783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 35342202 - 35342416
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  35342202 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaatg 35342301  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  35342302 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttgaaacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 35342400  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  35342401 agatgcatttgaccat 35342416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16096075 - 16095867
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  16096075 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaa-gatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagga 16095977  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttaca 203  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||    |||||| | |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  16095976 cttgtttgaaacgattcaaaaattaaaagggtttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgacttttggaaaaatgaaaaacttaaaggacttttaga 16095878  T
Q  204 tacatttgacc 214  Q
    | |||||||||    
T  16095877 tgcatttgacc 16095867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6251994 - 6252206
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6251994 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 6252093  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  6252094 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 6252192  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  6252193 agatgcatttgacc 6252206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38964232 - 38964021
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38964232 atgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 38964134  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||| |||||  ||| ||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  38964133 tgacttgtttgaaacgattcagaaactaaaaagactcgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 38964035  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  38964034 agatgcatttgacc 38964021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43166388 - 43166177
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43166388 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgctatctacaata 43166289  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  43166288 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgactttgggaaaaatgaaaaactt-aaagaccttt 43166191  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  43166190 agatacatttgacc 43166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6740074 - 6739891
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6740074 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 6739975  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  6739974 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaa 6739891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11000845 - 11000635
Alignment:
Q  3 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  11000845 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagg 11000746  T
Q  103 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttac 202  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| || |     
T  11000745 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttaag 11000647  T
Q  203 atacatttgacc 214  Q
    || |||||||||    
T  11000646 atgcatttgacc 11000635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39002144 - 39001990
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39002144 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 39002045  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||  | || ||| |||||||||||||    
T  39002044 tgacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggatttatttggaacttttgaaac 39001990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6600255 - 6600043
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6600255 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 6600156  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||  || |||    
T  6600155 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttcggaaaaacgaaaaacttaaagaacgttt 6600057  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  6600056 agatgcatttgacc 6600043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11935468 - 11935677
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11935468 atgcctaaaaagatggctaattttaagtgagtgttaggagccacatttggt-tcaaagatgagatcaaggaaacaattaccaactatgttatctacaata 11935566  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  11935567 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 11935665  T
Q  201 acatacatttga 212  Q
    | ||||||||||    
T  11935666 agatacatttga 11935677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 31710304 - 31710494
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31710304 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacatta 31710403  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||||||||||  |||| ||||||    
T  31710404 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaactaaaaacttaaa 31710494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 39824578 - 39824791
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39824578 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaccaactatgtcatctacaata 39824677  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  39824678 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaacgaaaaactt-aaagacattt 39824775  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  39824776 agatgcatttgaccat 39824791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27457316 - 27457162
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27457316 atgcctaaaaagatgactaatttaaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 27457217  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  27457216 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 27457162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 30863275 - 30863428
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  30863275 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacatta 30863374  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  30863375 tgacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaatgacttg-tttggacttttgaaac 30863428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1052555 - 1052767
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1052555 atgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 1052654  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||| |||||| |||||||||||| |||| | ||| |||    
T  1052655 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttgagaaaaatgaaaaacttagaggaccttt 1052753  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  1052754 aaatacatttgacc 1052767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20079377 - 20079170
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20079377 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacatta 20079278  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||   ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20079277 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaaaaaaaatgaaaaactt-aaagactttt 20079180  T
Q  201 acatacattt 210  Q
    | ||||||||    
T  20079179 aaatacattt 20079170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 40074972 - 40075096
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40074972 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaactatgttatctacaata 40075071  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaa 125  Q
     ||||| |||||||||||| |||||    
T  40075072 ggacttgtttgaaacaattcaaaaa 40075096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23129032 - 23128877
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  23129032 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacgata 23128933  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttga-acttttgaaac 155  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23128932 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgttttgagacttttgaaac 23128877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 8215925 - 8216134
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  8215925 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagga 8216024  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttaca 203  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||| | | |||||| ||||  | |||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||| |||| |    
T  8216025 cttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtatgggacttttaaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaatttaaaggacctttaaa 8216123  T
Q  204 tacatttgacc 214  Q
    | |||||||||    
T  8216124 tgcatttgacc 8216134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28078509 - 28078312
Alignment:
Q  16 actaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  28078509 actaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacattaggacttgtttgaaac 28078410  T
Q  116 aatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
     ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  28078409 gattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacaaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgacc 28078312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 42993540 - 42993694
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  42993540 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 42993639  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     || || |||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  42993640 ggaattgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttctttggaacttttgaaac 42993694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 14952346 - 14952499
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  14952346 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaaca 14952445  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||    
T  14952446 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaa 14952499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20408555 - 20408767
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20408555 atgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacaata 20408654  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  20408655 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccattttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 20408753  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  20408754 agatgcatttgacc 20408767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3352121 - 3351910
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3352121 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 3352022  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||  ||||  |||||||    |||||||||||  | || ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||    
T  3352021 ggacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaaggacttgttcgagacttttgaaactta-aatgaccactttgagaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 3351923  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | || ||||||||    
T  3351922 agatgcatttgac 3351910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4015993 - 4015810
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4015993 atgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 4015894  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
     |||||  ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||  | || ||||||||||  |||||||||||    
T  4015893 ggacttgcttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgactttgaaaaaaatgaaaa 4015810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11692266 - 11692130
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11692266 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctgcaata 11692167  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataactt 137  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  11692166 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaactt 11692130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26593399 - 26593208
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26593399 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaata 26593300  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa 193  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  26593299 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aagaacgacgttggaaaaaatgaaaaacttaaaa 26593208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33760585 - 33760390
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  33760585 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattaccaactatgctatctacaataggac 33760486  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    || |||||||| ||| ||||| ||| |  |||||||| | |||||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  33760485 ttgtttgaaacgattcaaaaactaagaggacttgtttgggacttttgaaactta-aatgacgattttaggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttta 33760390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30297868 - 30297697
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30297868 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctaggagccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 30297769  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttg 172  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||    
T  30297768 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaacttaaaaggaccactttg 30297697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30208521 - 30208331
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30208521 atgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 30208422  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
      |||| |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  30208421 gaacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgatttttgaaaaaatgaaaaacttaaa 30208331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27116218 - 27116006
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27116218 atgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 27116119  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| ||| |||  ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||  || |||    
T  27116118 ggacttgtttaaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaagaccactttagaaaaaacgaaaaacttaaagaaccttt 27116020  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  27116019 agatacatttgacc 27116006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19398309 - 19398113
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |    
T  19398309 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaattaccaactatgctatctacaatagaa 19398210  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||| |||||||  ||| ||||| ||||| || ||||||   |||||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19398209 cttgtttgaaatgattcaaaaactaaaagaatttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttggaaaaaatgaaaaacttaaaagaccttta 19398113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 16752138 - 16752236
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16752138 atgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaat 16752236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 6331399 - 6331477
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6331399 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 6331477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26035464 - 26035367
Alignment:
Q  2 tgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26035464 tgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatggtatctacaat 26035367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 8694888 - 8695041
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  8694888 atgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatgagccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataattatcaattatgctatctacaata 8694987  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   ||||||||||    
T  8694988 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaa 8695041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 444978 - 445074
Alignment:
Q  3 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  444978 gcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgctatctacaat 445074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 43166504 - 43166584
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43166504 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacctttagatacatttgacca 43166584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8215808 - 8215718
Alignment:
Q  123 aaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    ||||| ||| || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  8215808 aaatttaaagaaattgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 8215718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 214
Target Start/End: Original strand, 6332873 - 6333010
Alignment:
Q  76 attaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttggga 175  Q
    |||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||||  | |||||||||||||  |    
T  6332873 attaccaactattctatctacaatagaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttaaaactta-aaggacgactttgaaa 6332971  T
Q  176 aaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  6332972 aaaatgaaaaacttaaaggacatttagatgcatttgacc 6333010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Original strand, 38964302 - 38964406
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  38964302 tttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaa-acctttaaataca 38964399  T
Q  208 tttgacc 214  Q
    |||||||    
T  38964400 tttgacc 38964406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30863210 - 30863094
Alignment:
Q  103 acttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttac 202  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||     
T  30863210 acttgtttgaaacgattcaaaaactaaaacgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacctttag 30863112  T
Q  203 atacatttgaccattaat 220  Q
    || |||||||||| ||||    
T  30863111 atgcatttgaccaataat 30863094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 131
Target Start/End: Original strand, 27510046 - 27510123
Alignment:
Q  54 caaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatg-ttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  27510046 caaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgcttat-tacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 27510123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 33760739 - 33760793
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  33760739 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 33760793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 30297993 - 30298072
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  30297993 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaatgacttttagatgcatttgacc 30298072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20517116 - 20517063
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  20517116 gacttatttgaaacaattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaac 20517063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40074908 - 40074855
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  40074908 gacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaagaacttgtttgggacttttgaaac 40074855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41282239 - 41282155
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaa 219  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||||||||| ||||    
T  41282239 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacaaaaaacttaaaggacgtttagatgcatttgacctttaa 41282155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 4016117 - 4016196
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  4016117 acttgtttggtacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaataacttaaaggacctttagatgcatttgacc 4016196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 19661875 - 19661954
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  19661875 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacaactttgggaaaaacgaaaaacttaaacgacctttagatgcatttgacc 19661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 27116338 - 27116417
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  27116338 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacaaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 27116417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 37838319 - 37838531
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37838319 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaata 37838418  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  37838419 ggacttgtttgaaacgattcaaaaattaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttaggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 37838517  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  37838518 agatgcatttgacc 37838531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 772094 - 771877
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  772094 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 771995  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  771994 ggacttgtttgaaa-gattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 771897  T
Q  201 acatacatttgaccattaat 220  Q
    | || |||||||||| ||||    
T  771896 agatgcatttgaccaataat 771877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2456032 - 2456244
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2456032 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 2456131  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2456132 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgacattgggaaaaatgaaaaacttaaaggactttt 2456230  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  2456231 agatgcatttgacc 2456244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33107088 - 33106869
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33107088 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaata 33106989  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||  |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  33106988 ggactcgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggagtttt 33106890  T
Q  201 acatacatttgaccattaatt 221  Q
    | || ||||||| | ||||||    
T  33106889 agatgcatttgatctttaatt 33106869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41500621 - 41500405
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  41500621 atgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatgtacaata 41500522  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| || ||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  41500521 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactagaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 41500423  T
Q  201 acatacatttgaccatta 218  Q
    | || |||||||||||||    
T  41500422 agatgcatttgaccatta 41500405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 8899704 - 8899917
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8899704 atgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaattaccaactatgctatctacaata 8899803  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    ||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  8899804 tgactt-gttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 8899901  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  8899902 agatgcatttgaccat 8899917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9276596 - 9276810
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9276596 atgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 9276695  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  9276696 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttaggaaaaatgaaaaacttaaatgaccttt 9276794  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  9276795 agatgcatttgaccat 9276810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25087915 - 25087761
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25087915 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgttatatacaata 25087816  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  25087815 agacttgtttgaaacaattcaaaaacaaaaatgacttgtttgggacttttgaaac 25087761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36211068 - 36211281
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  36211068 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacaaactatgttatctagaata 36211167  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt-tgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||    
T  36211168 ggacttgtttgaaacaatttaaaaattaaaaggacttgtttgagaccttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggacctt 36211266  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || || |||||||||    
T  36211267 tagatgcatttgacc 36211281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36444347 - 36444134
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  36444347 atgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctactata 36444248  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||    
T  36444247 ggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaagatcttt 36444149  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  36444148 agatgcatttgacca 36444134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 7378985 - 7379195
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  7378985 atgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactattctatctacatta 7379084  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||  || ||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||    
T  7379085 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgggacttttgaa--acttaaagacaactttggaaaaaacgaaaaacttaaaagatcttt 7379182  T
Q  201 acatacatttgac 213  Q
    | || ||||||||    
T  7379183 agatgcatttgac 7379195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27328606 - 27328818
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27328606 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 27328705  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  27328706 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 27328804  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  27328805 agatgcatttgacc 27328818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 40854631 - 40854845
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40854631 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 40854730  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||  ||||  ||| |||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  40854731 ggacttgtttgaaacgattcaaaaacaaaaaggactagtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 40854829  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || ||| |||||||    
T  40854830 agatgcatctgaccat 40854845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2056948 - 2057168
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2056948 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 2057047  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||| | | |||||||||||  | || ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||    
T  2057048 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtctgggacttttgaaactta-aaagaccactttggg-aaaatgaaaaacttaaaggaccttt 2057145  T
Q  201 acatacatttgaccattaattaa 223  Q
    | || |||||||||  |||||||    
T  2057146 agatgcatttgacctataattaa 2057168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12759868 - 12759656
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12759868 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-aggcaaatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 12759770  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  12759769 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 12759671  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  12759670 agatgcatttgacca 12759656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16246312 - 16246158
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16246312 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 16246213  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  16246212 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 16246158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2094529 - 2094318
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2094529 atgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 2094430  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  2094429 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacga-tttggaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 2094332  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  2094331 agatgcatttgacc 2094318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2315094 - 2314882
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  2315094 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaata 2314995  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| | || ||||||||  | |||||| ||||||| | |||| |||| |||||| |||||||    
T  2314994 agacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttatttgggacctttgaaactta-aaggaccactttggaagaaataaaaaacttaaaggactttt 2314896  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  2314895 agatgcatttgacc 2314882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28650541 - 28650333
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  28650541 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattaccaactatgctatctacaataggac 28650442  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacat 204  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  28650441 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttagggaaaatgaaaaacttaaaggacctttagat 28650343  T
Q  205 acatttgacc 214  Q
     |||||||||    
T  28650342 gcatttgacc 28650333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19180444 - 19180642
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  19180444 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattactaactatactatctacaata 19180542  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||   |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||    
T  19180543 agacttgtttgaaacgattcaaaaactaaatggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 19180641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11949545 - 11949333
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11949545 atgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaata 11949446  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   || ||||||||  | || ||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  11949445 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacatttgaaactta-aatgaccactttggaaaaaatgaaaaacttaaaggactttt 11949347  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  11949346 agatgcatttgacc 11949333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 42629984 - 42630196
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||  |||    
T  42629984 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaattatcaattatgctatctatgata 42630083  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  42630084 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagaccttt 42630182  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  42630183 agatgcatttgacc 42630196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33865386 - 33865246
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33865386 atgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 33865287  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  33865286 agacttgtttgaaacgattcaaaaactagaatgacttgttt 33865246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37732307 - 37732100
Alignment:
Q  6 taaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgact 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  37732307 taaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaattaccaactatgttatttacaataagact 37732208  T
Q  106 tatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacata 205  Q
    | |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||     
T  37732207 tgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaagacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacctttagatg 37732109  T
Q  206 catttgacc 214  Q
    |||||||||    
T  37732108 catttgacc 37732100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 921044 - 921234
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  921044 atgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaata 921143  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||   |||||||||||  | || ||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  921144 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttaagacttttgaaactta-aaagacgactttgaaaaaaatgaaaaacttaaa 921234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1106678 - 1106525
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  1106678 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaattatgctatctacaata 1106579  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
     |||||||||||||  ||| ||||| |||||  ||||||||  |||||||||||    
T  1106578 ggacttatttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtttgcaacttttgaaa 1106525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3430743 - 3430527
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3430743 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 3430644  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| ||||||   ||| ||||| ||  |  |||||||| | |||||||||  || ||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||  || |||    
T  3430643 ggacttgtttgaacttattcaaaaactagtaggacttgtttgggacttttgaa--acttaaagaccactttaggaaaaacgaaaaacttaaagaaccttt 3430546  T
Q  201 acatacatttgaccattaa 219  Q
    | || ||||||||| ||||    
T  3430545 agatgcatttgacctttaa 3430527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 17134254 - 17134404
Alignment:
Q  4 cctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  17134254 cctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaatagga 17134353  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||| |||||||| |||| |||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  17134354 cttgtttgaaacgattt-aaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaac 17134404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43249531 - 43249321
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||    
T  43249531 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaattaccaactatgctatcatcaata 43249432  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| || ||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | ||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  43249431 ggacttgttcgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aattaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 43249333  T
Q  201 acatacatttga 212  Q
    | || |||||||    
T  43249332 agatgcatttga 43249321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17484669 - 17484457
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17484669 atgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatctacaata 17484570  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||  || |||    
T  17484569 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacgaaaaacttaaagaaccttt 17484471  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  17484470 agatgcatttgacc 17484457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 34253164 - 34253318
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34253164 atgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgctatctacaata 34253263  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||    
T  34253264 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttaggacctttgaaac 34253318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630846
Alignment:
Q  28 tgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaatt 127  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattcaaaaact 14630762  T
Q  128 aaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 213  Q
    ||||  |||||||| | || ||| ||||  | |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14630763 aaaaggacttgtttgggacctttaaaactta-aaggatcacttt-ggaaaaatgaaaaacttaaaggacttttacatgcatttgac 14630846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7297353 - 7297199
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  7297353 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaagaagacaattaccaactatgctatctacaata 7297254  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||   |||||||||||    
T  7297253 tgacttgtttgaaacgattcaaaatctaaaaggacttgtttgagacttttgaaac 7297199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29737770 - 29737900
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  29737770 atgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatcgacaata 29737869  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  29737870 ggacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaa 29737900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 38751070 - 38751224
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  38751070 atgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatactatctacatta 38751169  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  38751170 ggacttgtttgaaacgattaaaaaactaaaaggacttgtttaggacttttgaaac 38751224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23671901 - 23671719
Alignment:
Q  30 ggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||    
T  23671901 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacgattcaaaatctaa 23671802  T
Q  130 aataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    ||| | |||||  | |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  23671801 aatgatttgttgag-acttttgaaactta-aatgacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 23671719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 37654130 - 37654224
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatcta 95  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37654130 atgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatcta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8396670 - 8396572
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8396670 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattatcaactatgctatctacaat 8396572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41178138 - 41177964
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||                |||||||    
T  41178138 atgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat----------------tacaata 41178055  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41178054 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaa 41177964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 45124141 - 45124324
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  45124141 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaattaccaactatgctatctacaata 45124240  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
     || || |||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||  |||||||||||    
T  45124241 agatttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaatttgtttgagacttttgaaactta-aaggactactttgaaaaaaatgaaaa 45124324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19916104 - 19916008
Alignment:
Q  3 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19916104 gcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattaccaactatgctatctacaat 19916008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 9331778 - 9331968
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |  ||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  9331778 atgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaattaccaacaatactatctacaata 9331877  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9331878 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttaggaaaaatgaaaaacttaaa 9331968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28217003 - 28216893
Alignment:
Q  81 caactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaat 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||| || |||||||||||||     
T  28217003 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacaattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aagaaccactttgggaaaaac 28216905  T
Q  181 gaaaagcttaaa 192  Q
    ||||| ||||||    
T  28216904 gaaaaacttaaa 28216893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 23673117 - 23673196
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  23673117 acttgtttggaatttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 23673196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 225
Target Start/End: Original strand, 7297476 - 7297566
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgaccattaattaatt 225  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  7297476 acttgtttgggacttttgaaacttaaaag-acgactttggaaaaaacgaaaaacttataagacttttagataaatttgacctttaattaatt 7297566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 23672992 - 23672958
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23672992 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 23672958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9276446 - 9276393
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  9276446 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacatttatatgcatttgac 9276393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9331637 - 9331584
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  9331637 aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggacatttatatgcatttgac 9331584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 28650671 - 28650751
Alignment:
Q  133 aacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  28650671 aacttgtttggaacttttgaaactta-aaggacaactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 28650751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 214
Target Start/End: Original strand, 33107222 - 33107292
Alignment:
Q  143 gaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  33107222 gaacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttaaatgcatttgacc 33107292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 920894 - 920840
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  920894 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 920840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 31214086 - 31214140
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  31214086 aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgacc 31214140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 155
Target Start/End: Original strand, 3358157 - 3358194
Alignment:
Q  118 tttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3358157 tttaaaaattaaaatgacttgtttggaacttttgaaac 3358194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 3430807 - 3430860
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3430807 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttggaacttttgaaac 3430860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 11949612 - 11949665
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11949612 gacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaac 11949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Original strand, 33865536 - 33865589
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 213  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  33865536 aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacctttagatgcatttgac 33865589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 214
Target Start/End: Original strand, 41500732 - 41500816
Alignment:
Q  129 aaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  41500732 aaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaatgacctttagatgcatttgacc 41500816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Original strand, 772158 - 772268
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  772158 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaactt-aaagacattta 772255  T
Q  202 catacatttgacc 214  Q
     || |||||||||    
T  772256 gatgcatttgacc 772268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 2315246 - 2315298
Alignment:
Q  163 gacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2315246 gacgactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatacatttgacca 2315298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8899579 - 8899504
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacattt 210  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||    
T  8899579 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgattttgggaaaaatgaaaaacttaaagaacctttagatacattt 8899504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 12759993 - 12760072
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  12759993 acttgtttgggacttttgaaacttaaaag-acgactttggaaaaaacgaaaaacttaaatgacctttagatacatttgacc 12760072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 41178264 - 41178343
Alignment:
Q  135 cttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    ||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  41178264 cttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacca 41178343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42629914 - 42629803
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||  ||||    
T  42629914 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgagaaaaacgaaaaacttaaaggatcttta 42629816  T
Q  202 catacatttgacc 214  Q
     || |||||||||    
T  42629815 gatgcatttgacc 42629803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1915462 - 1915251
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1915462 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 1915363  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  1915362 ggacttgtttgaaactattcaaaaactaaaaggacttgtttgggactttggaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 1915264  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  1915263 a-atgcatttgacc 1915251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 2707481 - 2707694
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2707481 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaata 2707580  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  2707581 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 2707679  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  2707680 agatgcatttgacca 2707694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6503740 - 6503952
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6503740 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaattaccaactatgatatctacaata 6503839  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||    
T  6503840 ggacttgtttgaaacgatttaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaatgaaaaacttgaaggaccttt 6503938  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  6503939 aaatgcatttgacc 6503952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 30379039 - 30379251
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30379039 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 30379138  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | || ||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  30379139 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aatgaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 30379237  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  30379238 agatacatttgacc 30379251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 29050294 - 29050508
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29050294 atgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 29050393  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttt 199  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  29050394 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaaggacctt 29050492  T
Q  200 tacatacatttgacca 215  Q
    || || ||||||||||    
T  29050493 tagatgcatttgacca 29050508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17428391 - 17428238
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17428391 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 17428292  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  17428291 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaa 17428238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 9382541 - 9382755
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  9382541 atgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacatca 9382640  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||| |||    
T  9382641 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacaaaaaacttaaaggaccttt 9382739  T
Q  201 acatacatttgaccat 216  Q
    | || |||||||||||    
T  9382740 agatgcatttgaccat 9382755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17943058 - 17943271
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  17943058 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattaccaattatgctatctacatta 17943157  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||| |||    
T  17943158 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggaaaaacaaaaaacttaaaggaccttt 17943256  T
Q  201 acatacatttgacca 215  Q
    | || ||||||||||    
T  17943257 agatgcatttgacca 17943271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8178368 - 8178156
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8178368 atgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 8178269  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||| | |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||    
T  8178268 ggacatgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttaaaactta-aaggacgactttgagaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 8178170  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
      || |||||||||    
T  8178169 ggatgcatttgacc 8178156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 3408211 - 3408425
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  3408211 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattaccaactatactatctacaata 3408310  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaa-gacttt 199  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||  | |||||| |||| | ||||||  |||| ||||||| ||| ||    
T  3408311 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaagaacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccacttcgagaaaaacaaaaaacttaaaaggacctt 3408409  T
Q  200 tacatacatttgacca 215  Q
    || || ||||||||||    
T  3408410 taaatgcatttgacca 3408425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2598218 - 2598007
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2598218 atgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatgatatctacaata 2598119  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   || |||  || || ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  2598118 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagaccttt--aaaacttaaagaccactttgggaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 2598021  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  2598020 agatgcatttgacc 2598007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12626658 - 12626870
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  12626658 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaccaactattctatctacaata 12626757  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| ||| |||    
T  12626758 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgggggaaacgaaaaacttaaaggaccttt 12626856  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  12626857 agatgcatttgacc 12626870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16193332 - 16193544
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  16193332 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactattttatctgcatta 16193431  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
      |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| | |||||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  16193432 gaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccattttgggaaaaacaaaaaacttaaaggactttt 16193530  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||  ||||||||    
T  16193531 agatgtatttgacc 16193544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26393128 - 26392916
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26393128 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 26393029  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
      | || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   || ||||||||  |  ||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||    
T  26393028 gaagttttttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacctttgaaactta-gaggaccactttgtgaaaaatgaaaaacttaaaggaccttt 26392930  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | ||||||||||||    
T  26392929 agatacatttgacc 26392916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1077259 - 1077478
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  1077259 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaaca 1077358  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||  | || ||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  1077359 tgacttatttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgagacttttgaaactta-aatgaccactttaggaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 1077457  T
Q  201 acatacatttgaccattaatt 221  Q
    | |  ||||||||| ||||||    
T  1077458 agacgcatttgacctttaatt 1077478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 10256259 - 10256449
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10256259 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 10256358  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaa 192  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||   |||||||||||  | |||||| |||||  |||||| ||||| ||||||    
T  10256359 ggacttgtttgaaacgattcaaaaacgaaaatgacttgtttgagacttttgaaactta-aaggaccactttaagaaaaacgaaaaacttaaa 10256449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 2390287 - 2390441
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2390287 atgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaata 2390386  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| | |||||||||||    
T  2390387 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgggacttttgaaac 2390441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3258926 - 3258714
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac-aactatgttatctacaat 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  3258926 atgcataaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaactatggtatctacaat 3258828  T
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
    |  |||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||    
T  3258827 agaacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggacctt 3258729  T
Q  200 tacatacatttgacc 214  Q
    || || |||||||||    
T  3258728 tatatgcatttgacc 3258714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 11133899 - 11134072
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttc-aaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||    
T  11133899 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaattaccatctatgctatctacgatagga 11133998  T
Q  104 cttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaa 177  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  11133999 cttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttatttaggacttttgaaacttaaaaggaccactttgggaaa 11134072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26231051 - 26230840
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||    
T  26231051 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaactaccaactatgttatttacatta 26230952  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||   ||||||  || || ||| ||| | ||||  ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  26230951 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaatgatttgtttgagactttt--aaaacttaaagaccattttgaaaaaaacgaaaaacttaaacgactttt 26230854  T
Q  201 acatacatttgacc 214  Q
    | || |||||||||    
T  26230853 agatgcatttgacc 26230840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6785213 - 6785008
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| || |||    
T  6785213 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca---accaattatgttatctacattaggac 6785117  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacat 204  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||||||| | |||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||  || |||| ||    
T  6785116 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgagacttttgaaacata-aaggaccactttgaaaaaaacgaaaaacttaaagaacctttagat 6785018  T
Q  205 acatttgacc 214  Q
     |||||||||    
T  6785017 gcatttgacc 6785008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25820656 - 25820452
Alignment:
Q  13 atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttga 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||    
T  25820656 atgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttggtaccaaacatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatctacgataggaattgtttga 25820557  T
Q  113 aacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttga 212  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||  |||| || |||||||    
T  25820556 aacgattaaaaaattaaaatgacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgagtttaggaaaaatgataaacttaaacgatctttagatgcatttga 25820458  T
Q  213 ccatta 218  Q
    ||||||    
T  25820457 ccatta 25820452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35224018 - 35223919
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35224018 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 35223919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26196440 - 26196286
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaac-aactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26196440 atgcctaaaaagatgattaattttaagtgt-tgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaattaccaaactatgttatctacaat 26196342  T
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
    | |||||  ||||| | ||| ||||| |||||| | ||||||   |||||||||||    
T  26196341 aggacttggttgaaccgattcaaaaactaaaatgatttgtttgagacttttgaaac 26196286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 26936629 - 26936727
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  26936629 atgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattatcaactatgctatctacaat 26936727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10931266 - 10931084
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  10931266 atgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt-acaactatgctatccacatta 10931168  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaa 185  Q
     ||||| ||||| || ||| ||||| |||||  | |||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  10931167 ggacttgtttgatacgattcaaaaactaaaagtatttgtttggaacttttgaaactta-aaggaccactttaggaaaaacgaaaa 10931084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 214
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376153
Alignment:
Q  33 gttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaat 132  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||     
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaag 31376070  T
Q  133 aacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatg-aaaagcttaaaa-gacttttacatacatttgacc 214  Q
     ||||||||   |||||||||||  | |||||  |||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||| || |||||||||    
T  31376071 gacttgtttgagacttttgaaactta-aaggatcactttgagaaaaacgaaaaaacttaaaaggacttttagatgcatttgacc 31376153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612937
Alignment:
Q  62 agttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaagacttgtttgggacttttgaaa 12612937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12612927 - 12612813
Alignment:
Q  41 ccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgtt 140  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||    
T  12612927 ccagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaatgattcaaaaactaaaaggacttgtt 12612828  T
Q  141 ttgaacttttgaaac 155  Q
    |   |||||||||||    
T  12612827 tgagacttttgaaac 12612813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 35224160 - 35224214
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  35224160 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacttttagatgcatttgacc 35224214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 1915587 - 1915667
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  1915587 acttgtttggaacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaatttaaaggacttttagatgcatttgacca 1915667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2707417 - 2707305
Alignment:
Q  102 gacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttta 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  2707417 gacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttggaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttta 2707319  T
Q  202 catacatttgacca 215  Q
     || ||||||||||    
T  2707318 tatgcatttgacca 2707305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 26393278 - 26393332
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  26393278 aaggacgactttgggaaaaacgaaaaacttaaaggacctttagatgcatttgacc 26393332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1077131 - 1077052
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1077131 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggaccactttgaaaaaaatgaaaaatttaaaagacatttagatacatttgacc 1077052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 218907 - 219118
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggg-tgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  218907 atgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 219006  T
Q  100 atgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttt 199  Q
    | ||||| |||||||| |||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||  | || ||| |||||  |||||||||||| |||||| ||| ||    
T  219007 aggacttgtttgaaacgattcgaaaattaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaagaccactttaagaaaaatgaaaaacttaaaggacctt 219105  T
Q  200 tacatacatttga 212  Q
    || || |||||||    
T  219106 tagatgcatttga 219118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5142 - 4934
Alignment:
Q  5 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5142 ctaaaaagatgactaattttaagagggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattaccaactatgctatctacaatatgac 5043  T
Q  105 ttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacat 204  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| || |||| ||||| |||||| |||||||| ||    
T  5042 ttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaactta-aaggaccacttt-ggtaaaacgaaaaacttaaaggacttttagat 4945  T
Q  205 acatttgacca 215  Q
     ||||||||||    
T  4944 gcatttgacca 4934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 5208 - 5427
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  5208 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaattatgctatctacaaca 5306  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagactttt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||   |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  5307 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggatttgtttgtgacttttaaaactta-aaggaccactttagaaaaaacgaaaaacttaaaggaccttt 5405  T
Q  201 acatacatttgaccattaatta 222  Q
    | || |||||||||||| ||||    
T  5406 agatgcatttgaccatttatta 5427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 136 - 266
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  136 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccgactatgctatctacatta 235  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  236 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 47984 - 48138
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||     
T  47984 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaactatgtgatatacaatc 48083  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaac 155  Q
     ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  48084 ggacttgtttaaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttttggacttttgaaac 48138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 11380 - 11510
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11380 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattaccaactatgctacctacaata 11479  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
     | ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  11480 ggtcttatttaaaacgatttaaaaactaaaa 11510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11237 - 11183
Alignment:
Q  160 aaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacc 214  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  11237 aaggaccactttgggaaaaacgaaaaacttaaaagacttttagatgcatttgacc 11183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 13117 - 13257
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  13117 atgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatcaattatgctatctacaata 13216  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  13217 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 13257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 59727 - 59587
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  59727 atgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatcaattatgctatctacaata 59628  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttt 141  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  59627 tgacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaaggacttgttt 59587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 252557 - 252428
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  252557 atgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaattaccaactatgctatatacaata 252458  T
Q  101 tgacttatttgaaacaatttaaaaattaaa 130  Q
     ||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  252457 ggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaa 252428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2092 - 1994
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaat 99  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2092 atgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3280
Alignment:
Q  39 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 138  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacgattcaaaaactaaaatgacttg 3353  T
Q  139 ttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgac 213  Q
     |||| | |||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  || |||| || ||||||||    
T  3352 -tttggatttttgaaactta-aaggatcactttggaaaaaatgaaaaacttaaagcacctttagatgcatttgac 3280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 156
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1994
Alignment:
Q  39 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaataacttg 138  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||  |||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaacgacttg 1976  T
Q  139 ttttgaacttttgaaaca 156  Q
    |||   ||||||||||||    
T  1977 tttgagacttttgaaaca 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 599 - 691
Alignment:
Q  39 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1902
Alignment:
Q  39 agccagatttagtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaacaactatgttatctacaatatgacttatttgaaacaatttaaaaattaaaa 131  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactaaaa 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 5729 - 5835
Alignment:
Q  108 tttgaaacaatttaaaaattaaaataacttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacataca 207  Q
    |||||||||| | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| || ||    
T  5729 tttgaaacaaatcaaaaactaaaaggacttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttgggaaaaactaaaaacttaaaggacctttagatgca 5827  T
Q  208 tttgacca 215  Q
    ||||||||    
T  5828 tttgacca 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 101245 - 101325
Alignment:
Q  134 acttgttttgaacttttgaaacacataaggacgactttgggaaaaatgaaaagcttaaaagacttttacatacatttgacca 215  Q
    |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  101245 acttgtttgggacttttgaaactta-aaggacgactttggaaaaaacgaaaaacttaaatgacctttagatgcatttgacca 101325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 19803 - 19831
Alignment:
Q  1 atgcctaaaaagatgactaattttaagtg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19803 atgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University