View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18617_low_21 (Length: 236)

Name: NF18617_low_21
Description: NF18617
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18617_low_21
NF18617_low_21
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (1-211)||(34295397-34295606)
chr7 (1-221)||(43368094-43368313)
chr7 (1-200)||(26652759-26652957)
chr7 (1-221)||(26994208-26994428)
chr7 (1-221)||(47953082-47953302)
chr7 (1-221)||(1870026-1870247)
chr7 (1-221)||(21784763-21784983)
chr7 (1-221)||(36769552-36769772)
chr7 (1-221)||(41211183-41211404)
chr7 (1-216)||(18470576-18470791)
chr7 (1-221)||(3922686-3922906)
chr7 (1-221)||(10932540-10932760)
chr7 (1-217)||(11321872-11322088)
chr7 (1-221)||(18386417-18386636)
chr7 (1-221)||(32873752-32873972)
chr7 (1-221)||(38301241-38301454)
chr7 (1-221)||(26371792-26372012)
chr7 (1-221)||(9913418-9913636)
chr7 (1-221)||(9927106-9927324)
chr7 (35-221)||(40753081-40753267)
chr7 (1-211)||(46633589-46633799)
chr7 (24-221)||(43158669-43158866)
chr7 (1-221)||(30849229-30849449)
chr7 (1-217)||(329363-329578)
chr7 (43-221)||(29661257-29661435)
chr7 (15-221)||(43213908-43214113)
chr7 (1-221)||(3892009-3892229)
chr7 (1-221)||(30598991-30599211)
chr7 (1-220)||(43189226-43189446)
chr7 (22-221)||(23349274-23349472)
chr7 (1-175)||(47947652-47947826)
chr7 (54-221)||(44748640-44748807)
chr7 (22-221)||(48894631-48894829)
chr7 (73-221)||(47316681-47316828)
chr7 (48-221)||(11250561-11250729)
chr7 (1-215)||(41665564-41665777)
chr7 (9-198)||(22724537-22724725)
chr7 (55-204)||(34117399-34117547)
chr7 (1-220)||(46408788-46408999)
chr7 (7-221)||(1363536-1363748)
chr7 (17-221)||(21133279-21133484)
chr7 (4-221)||(48445417-48445633)
chr7 (22-221)||(20127199-20127401)
chr7 (37-221)||(46448627-46448810)
chr7 (18-220)||(22724016-22724217)
chr7 (37-221)||(37966903-37967086)
chr7 (1-221)||(11822124-11822335)
chr7 (66-221)||(17237034-17237188)
chr7 (128-221)||(34519527-34519620)
chr7 (55-194)||(15035263-15035401)
chr7 (48-221)||(26910393-26910562)
chr7 (42-221)||(22631671-22631850)
chr7 (73-198)||(46627135-46627259)
chr7 (50-211)||(48699340-48699500)
chr7 (145-221)||(16963174-16963250)
chr7 (1-105)||(12982195-12982300)
chr7 (67-219)||(29372764-29372915)
chr7 (57-150)||(16963055-16963149)
chr7 (122-187)||(42332072-42332137)
chr7 (128-192)||(35645466-35645530)
chr7 (36-173)||(29455880-29456013)
chr7 (118-175)||(7958635-7958692)
chr7 (119-179)||(8453285-8453344)
chr7 (128-198)||(2048970-2049040)
chr7 (136-182)||(8360580-8360625)
chr7 (128-173)||(8054407-8054452)
chr7 (78-167)||(38360041-38360129)
chr7 (37-105)||(47442765-47442834)
chr7 (83-195)||(21408635-21408745)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (1-211)||(31644336-31644544)
chr5 (1-217)||(3735246-3735461)
chr5 (1-221)||(7523059-7523280)
chr5 (9-222)||(32528611-32528824)
chr5 (1-221)||(4818128-4818348)
chr5 (1-221)||(2351568-2351788)
chr5 (9-221)||(39918403-39918615)
chr5 (22-221)||(31770579-31770778)
chr5 (1-221)||(35701165-35701385)
chr5 (1-221)||(11963229-11963449)
chr5 (1-221)||(7770267-7770486)
chr5 (35-221)||(24181612-24181798)
chr5 (1-221)||(34794775-34794995)
chr5 (1-221)||(4689686-4689905)
chr5 (1-221)||(21739149-21739364)
chr5 (9-221)||(24036129-24036338)
chr5 (1-200)||(40182352-40182551)
chr5 (63-221)||(553346-553505)
chr5 (35-221)||(29241300-29241486)
chr5 (35-221)||(31880064-31880250)
chr5 (1-215)||(41790456-41790670)
chr5 (1-217)||(22493411-22493626)
chr5 (48-221)||(5571632-5571803)
chr5 (1-218)||(6284289-6284507)
chr5 (35-221)||(7208218-7208404)
chr5 (1-221)||(8136727-8136945)
chr5 (35-221)||(18470416-18470601)
chr5 (1-221)||(7725797-7726016)
chr5 (55-217)||(39788134-39788297)
chr5 (35-221)||(41459511-41459696)
chr5 (30-221)||(28090508-28090699)
chr5 (9-213)||(32092978-32093180)
chr5 (73-221)||(40489298-40489445)
chr5 (51-217)||(8560974-8561138)
chr5 (5-222)||(700588-700805)
chr5 (1-221)||(5673032-5673247)
chr5 (25-221)||(22432297-22432489)
chr5 (35-221)||(23091292-23091478)
chr5 (1-151)||(37148632-37148781)
chr5 (115-221)||(5598482-5598588)
chr5 (118-198)||(27839084-27839164)
chr5 (87-217)||(17031132-17031261)
chr5 (1-113)||(20119659-20119774)
chr5 (131-190)||(11090887-11090946)
chr5 (167-221)||(37148577-37148631)
chr5 (123-179)||(29788489-29788544)
[»] chr4 (94 HSPs)
chr4 (1-221)||(52949613-52949831)
chr4 (1-221)||(50178467-50178687)
chr4 (1-200)||(47642487-47642685)
chr4 (1-221)||(20802506-20802726)
chr4 (1-221)||(24002229-24002450)
chr4 (1-221)||(44649139-44649356)
chr4 (1-216)||(43640990-43641205)
chr4 (1-216)||(37695521-37695735)
chr4 (43-221)||(32181197-32181374)
chr4 (1-221)||(23521771-23521991)
chr4 (1-221)||(56154512-56154732)
chr4 (1-221)||(55065308-55065527)
chr4 (9-222)||(29785511-29785724)
chr4 (9-221)||(21202639-21202850)
chr4 (22-221)||(6776490-6776689)
chr4 (9-217)||(9807056-9807262)
chr4 (22-221)||(33177007-33177206)
chr4 (35-221)||(33552817-33553003)
chr4 (1-221)||(49152075-49152294)
chr4 (1-221)||(52319217-52319434)
chr4 (48-221)||(2725108-2725280)
chr4 (1-220)||(12600777-12600996)
chr4 (1-215)||(9512321-9512535)
chr4 (19-221)||(20517997-20518199)
chr4 (37-212)||(44324326-44324500)
chr4 (1-221)||(16320413-16320630)
chr4 (1-221)||(21579917-21580137)
chr4 (1-221)||(37865644-37865864)
chr4 (38-221)||(46680485-46680668)
chr4 (55-221)||(50727888-50728054)
chr4 (55-221)||(50735902-50736068)
chr4 (35-221)||(3649562-3649747)
chr4 (25-221)||(54542905-54543100)
chr4 (22-221)||(55593797-55593996)
chr4 (18-221)||(34929823-34930026)
chr4 (73-221)||(38812484-38812631)
chr4 (43-217)||(20694304-20694478)
chr4 (43-221)||(24210251-24210430)
chr4 (48-221)||(38486232-38486405)
chr4 (68-221)||(41711806-41711958)
chr4 (50-221)||(36743663-36743834)
chr4 (62-221)||(36885883-36886043)
chr4 (1-210)||(37931812-37932020)
chr4 (38-221)||(29592824-29593006)
chr4 (1-221)||(2786856-2787075)
chr4 (50-221)||(4325731-4325902)
chr4 (37-215)||(23327844-23328024)
chr4 (65-221)||(50186484-50186639)
chr4 (35-221)||(1231236-1231422)
chr4 (35-221)||(26083264-26083450)
chr4 (35-221)||(29616095-29616276)
chr4 (35-221)||(47361389-47361570)
chr4 (37-222)||(36497144-36497329)
chr4 (24-221)||(53200618-53200815)
chr4 (1-198)||(22318382-22318578)
chr4 (22-221)||(7554932-7555130)
chr4 (73-221)||(42869937-42870082)
chr4 (115-221)||(28115257-28115363)
chr4 (48-198)||(39078600-39078749)
chr4 (48-221)||(11055981-11056153)
chr4 (9-167)||(14296496-14296654)
chr4 (9-167)||(14314744-14314902)
chr4 (18-198)||(7001763-7001940)
chr4 (117-221)||(50729517-50729621)
chr4 (20-217)||(13110239-13110434)
chr4 (1-198)||(30942680-30942876)
chr4 (129-217)||(2629930-2630018)
chr4 (50-219)||(43739402-43739570)
chr4 (57-170)||(42772706-42772818)
chr4 (56-182)||(45577706-45577829)
chr4 (129-195)||(38520518-38520584)
chr4 (154-221)||(42772832-42772899)
chr4 (73-167)||(56487281-56487374)
chr4 (75-187)||(3579089-3579201)
chr4 (143-215)||(25978592-25978664)
chr4 (74-221)||(9947894-9948040)
chr4 (1-64)||(52949536-52949599)
chr4 (22-182)||(7381193-7381349)
chr4 (163-216)||(6973893-6973946)
chr4 (122-194)||(21098546-21098618)
chr4 (30-170)||(41720764-41720903)
chr4 (129-221)||(52673830-52673922)
chr4 (35-94)||(50729627-50729686)
chr4 (35-197)||(43189762-43189922)
chr4 (35-112)||(53343560-53343638)
chr4 (118-179)||(40792425-40792486)
chr4 (37-109)||(10184875-10184947)
chr4 (55-198)||(44355852-44355995)
chr4 (188-221)||(14296645-14296678)
chr4 (188-221)||(14314893-14314926)
chr4 (128-217)||(41897337-41897426)
chr4 (60-136)||(10586995-10587069)
chr4 (131-175)||(52347157-52347200)
chr4 (122-194)||(52755532-52755604)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-221)||(10485047-10485265)
chr6 (1-221)||(17443151-17443370)
chr6 (9-220)||(14925478-14925688)
chr6 (22-220)||(18057429-18057626)
chr6 (1-221)||(2614784-2615004)
chr6 (1-221)||(24242552-24242772)
chr6 (1-221)||(10324132-10324352)
chr6 (1-221)||(24203251-24203470)
chr6 (1-221)||(17867723-17867943)
chr6 (1-221)||(17877506-17877726)
chr6 (25-221)||(32132401-32132597)
chr6 (22-222)||(32409872-32410072)
chr6 (1-221)||(10959889-10960108)
chr6 (1-221)||(31870121-31870340)
chr6 (35-221)||(166944-167130)
chr6 (20-221)||(3932828-3933029)
chr6 (1-221)||(15276958-15277178)
chr6 (62-222)||(11613811-11613971)
chr6 (1-221)||(15277301-15277521)
chr6 (1-221)||(3259566-3259791)
chr6 (16-221)||(14808022-14808225)
chr6 (1-220)||(11212145-11212364)
chr6 (55-221)||(34176772-34176938)
chr6 (75-221)||(3290635-3290778)
chr6 (37-220)||(9902680-9902863)
chr6 (74-218)||(11279090-11279233)
chr6 (88-221)||(11382040-11382170)
chr6 (1-221)||(34684006-34684226)
chr6 (110-221)||(4494135-4494247)
chr6 (9-221)||(29054255-29054464)
chr6 (22-198)||(32859961-32860136)
chr6 (22-221)||(8177903-8178102)
chr6 (1-221)||(18597179-18597398)
chr6 (1-221)||(3379600-3379818)
chr6 (1-217)||(11675399-11675615)
chr6 (22-213)||(23636133-23636323)
chr6 (1-135)||(29814753-29814887)
chr6 (42-222)||(35004148-35004327)
chr6 (67-194)||(27824698-27824824)
chr6 (1-135)||(28502347-28502482)
chr6 (118-194)||(7396173-7396249)
chr6 (67-179)||(29202990-29203100)
chr6 (1-77)||(32805366-32805442)
chr6 (122-178)||(27756314-27756370)
chr6 (84-197)||(9613946-9614058)
chr6 (118-196)||(29424613-29424691)
chr6 (28-196)||(8342639-8342807)
chr6 (1-80)||(4494259-4494339)
chr6 (139-191)||(9200439-9200491)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (1-221)||(31882998-31883217)
chr3 (1-221)||(33364754-33364973)
chr3 (1-221)||(50386432-50386651)
chr3 (1-221)||(51259756-51259976)
chr3 (1-221)||(47958408-47958628)
chr3 (35-221)||(20609624-20609810)
chr3 (1-221)||(12349147-12349367)
chr3 (9-221)||(28675687-28675899)
chr3 (1-217)||(3864655-3864870)
chr3 (1-221)||(4851434-4851652)
chr3 (1-221)||(1344683-1344903)
chr3 (1-158)||(10747107-10747264)
chr3 (4-221)||(21221336-21221553)
chr3 (42-221)||(3964219-3964397)
chr3 (1-221)||(25927303-25927523)
chr3 (22-217)||(51925188-51925382)
chr3 (1-221)||(29584764-29584984)
chr3 (1-212)||(26282372-26282583)
chr3 (35-221)||(34026590-34026776)
chr3 (35-221)||(44116862-44117048)
chr3 (1-221)||(2134959-2135179)
chr3 (25-221)||(42636379-42636575)
chr3 (22-221)||(25860397-25860596)
chr3 (22-221)||(40094413-40094612)
chr3 (22-217)||(39052818-39053014)
chr3 (1-221)||(38213243-38213463)
chr3 (37-217)||(53557775-53557955)
chr3 (66-221)||(54622772-54622926)
chr3 (50-221)||(24571219-24571390)
chr3 (22-221)||(29645976-29646175)
chr3 (62-221)||(21373882-21374039)
chr3 (1-197)||(5442180-5442376)
chr3 (73-221)||(20255007-20255153)
chr3 (74-217)||(51296544-51296686)
chr3 (48-198)||(3867648-3867797)
chr3 (79-217)||(49748891-49749028)
chr3 (55-173)||(41694925-41695042)
chr3 (116-221)||(19906766-19906871)
chr3 (1-198)||(22484742-22484938)
chr3 (22-217)||(45690886-45691074)
chr3 (1-176)||(53046667-53046837)
chr3 (123-215)||(50678809-50678901)
chr3 (63-188)||(3695301-3695426)
chr3 (67-216)||(25954407-25954554)
chr3 (97-217)||(24721470-24721590)
chr3 (60-194)||(44267691-44267824)
chr3 (117-220)||(52300442-52300544)
chr3 (55-220)||(6179376-6179534)
chr3 (43-194)||(34351371-34351521)
chr3 (67-197)||(44000217-44000346)
chr3 (119-220)||(39215446-39215547)
chr3 (1-113)||(43175458-43175571)
chr3 (18-167)||(32621776-32621924)
chr3 (67-151)||(25395570-25395653)
chr3 (101-198)||(8067056-8067152)
chr3 (55-167)||(26847269-26847381)
chr3 (1-45)||(41695032-41695075)
chr3 (129-216)||(8648538-8648625)
chr3 (129-196)||(14155461-14155528)
chr3 (55-198)||(28624919-28625060)
chr3 (123-176)||(53046559-53046607)
chr3 (128-166)||(17264703-17264741)
chr3 (129-187)||(23322158-23322216)
chr3 (37-95)||(42547464-42547522)
chr3 (119-169)||(51813399-51813449)
chr3 (122-182)||(8253684-8253744)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (1-218)||(31004030-31004246)
chr1 (1-199)||(38663030-38663227)
chr1 (1-211)||(50304549-50304758)
chr1 (1-221)||(844781-845001)
chr1 (1-222)||(42510422-42510643)
chr1 (1-221)||(16386751-16386971)
chr1 (8-221)||(42512827-42513039)
chr1 (1-221)||(6711103-6711323)
chr1 (22-221)||(12890156-12890355)
chr1 (1-220)||(35387369-35387588)
chr1 (1-221)||(32270255-32270470)
chr1 (1-221)||(24339695-24339914)
chr1 (35-217)||(26118276-26118458)
chr1 (1-221)||(41972809-41973028)
chr1 (1-221)||(16451024-16451244)
chr1 (1-221)||(17887844-17888065)
chr1 (1-221)||(45490932-45491152)
chr1 (1-221)||(16476212-16476431)
chr1 (1-221)||(39281792-39282011)
chr1 (1-221)||(1351492-1351711)
chr1 (1-221)||(28340360-28340580)
chr1 (5-221)||(51264396-51264612)
chr1 (35-221)||(30105737-30105923)
chr1 (35-221)||(6029358-6029543)
chr1 (1-221)||(50540241-50540461)
chr1 (22-221)||(32289401-32289600)
chr1 (9-221)||(13994132-13994343)
chr1 (1-221)||(7183815-7184035)
chr1 (9-217)||(25539761-25539968)
chr1 (58-217)||(16437317-16437475)
chr1 (1-221)||(44738099-44738318)
chr1 (37-222)||(45658755-45658939)
chr1 (9-217)||(11772693-11772900)
chr1 (22-221)||(17327706-17327905)
chr1 (1-221)||(41967906-41968126)
chr1 (9-217)||(38087057-38087264)
chr1 (1-219)||(46154797-46155022)
chr1 (1-198)||(1601065-1601267)
chr1 (1-221)||(51703221-51703439)
chr1 (2-221)||(15539947-15540165)
chr1 (1-217)||(10384265-10384480)
chr1 (1-217)||(26764856-26765066)
chr1 (22-221)||(6144043-6144241)
chr1 (46-222)||(49303410-49303585)
chr1 (73-219)||(3414912-3415058)
chr1 (73-204)||(42705312-42705442)
chr1 (72-217)||(50382464-50382608)
chr1 (1-221)||(16704623-16704843)
chr1 (67-221)||(5109694-5109845)
chr1 (35-163)||(20495006-20495134)
chr1 (55-201)||(25343286-25343431)
chr1 (35-189)||(34663858-34664012)
chr1 (18-198)||(570301-570482)
chr1 (73-189)||(32467910-32468025)
chr1 (101-222)||(6771365-6771486)
chr1 (118-191)||(46815816-46815889)
chr1 (145-211)||(23799604-23799670)
chr1 (1-71)||(23799670-23799740)
chr1 (120-221)||(504448-504549)
chr1 (83-191)||(2761643-2761749)
chr1 (120-197)||(7837149-7837226)
chr1 (115-188)||(16643272-16643345)
chr1 (128-217)||(26733579-26733668)
chr1 (35-152)||(51374439-51374556)
chr1 (121-191)||(40610739-40610809)
chr1 (40-105)||(21071661-21071726)
chr1 (123-194)||(39792826-39792897)
chr1 (118-173)||(46447678-46447733)
chr1 (18-172)||(47242621-47242773)
chr1 (47-153)||(52030330-52030435)
chr1 (137-221)||(17291612-17291695)
chr1 (181-221)||(20494965-20495005)
chr1 (122-178)||(33316435-33316491)
chr1 (37-182)||(34283912-34284058)
chr1 (120-154)||(30105007-30105041)
chr1 (129-194)||(21763187-21763252)
chr1 (118-182)||(20986333-20986397)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (1-221)||(8673052-8673272)
chr8 (1-221)||(22999146-22999366)
chr8 (1-215)||(32303588-32303802)
chr8 (23-221)||(7591444-7591641)
chr8 (23-221)||(41548529-41548726)
chr8 (1-221)||(45446343-45446563)
chr8 (27-221)||(10466979-10467172)
chr8 (1-221)||(27103847-27104067)
chr8 (1-221)||(29563223-29563443)
chr8 (1-221)||(34063016-34063236)
chr8 (1-221)||(31513580-31513800)
chr8 (1-213)||(32020006-32020218)
chr8 (35-221)||(4052404-4052588)
chr8 (1-216)||(41709665-41709880)
chr8 (1-213)||(6386464-6386676)
chr8 (1-221)||(45113944-45114163)
chr8 (35-217)||(30543023-30543205)
chr8 (35-221)||(37664280-37664466)
chr8 (1-221)||(29672320-29672540)
chr8 (22-221)||(5968861-5969060)
chr8 (16-221)||(39642787-39642991)
chr8 (1-216)||(15001355-15001569)
chr8 (9-217)||(37618393-37618600)
chr8 (1-221)||(13406932-13407152)
chr8 (1-221)||(31731952-31732172)
chr8 (9-221)||(34101404-34101616)
chr8 (25-221)||(30501058-30501253)
chr8 (1-221)||(17805578-17805799)
chr8 (1-222)||(25478136-25478352)
chr8 (35-221)||(14005041-14005227)
chr8 (1-221)||(3251653-3251873)
chr8 (37-221)||(29611052-29611235)
chr8 (25-217)||(40388953-40389144)
chr8 (1-221)||(35225551-35225770)
chr8 (22-216)||(12753327-12753521)
chr8 (118-216)||(21272689-21272787)
chr8 (1-155)||(37474608-37474761)
chr8 (30-221)||(7394811-7395002)
chr8 (22-198)||(16485829-16486004)
chr8 (25-200)||(27109559-27109735)
chr8 (1-195)||(6460152-6460344)
chr8 (120-221)||(37861866-37861967)
chr8 (25-216)||(10656688-10656878)
chr8 (13-221)||(17520502-17520702)
chr8 (70-191)||(10320304-10320424)
chr8 (22-221)||(16595146-16595344)
chr8 (68-182)||(36426283-36426398)
chr8 (118-196)||(10932741-10932819)
chr8 (58-223)||(54117-54280)
chr8 (55-182)||(14958902-14959027)
chr8 (70-178)||(15351694-15351800)
chr8 (19-167)||(28746230-28746377)
chr8 (69-153)||(32918842-32918925)
chr8 (118-172)||(5859518-5859572)
chr8 (128-182)||(11944890-11944944)
chr8 (128-198)||(22756431-22756501)
chr8 (1-76)||(21272601-21272676)
chr8 (174-221)||(37474761-37474808)
chr8 (118-172)||(3361789-3361843)
chr8 (128-170)||(11926878-11926920)
chr8 (128-197)||(3800964-3801033)
chr8 (132-173)||(5892087-5892128)
chr8 (35-95)||(37861803-37861864)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (1-221)||(2326-2546)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-217)||(101837-102053)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (1-221)||(34338698-34338918)
chr2 (1-221)||(9732912-9733132)
chr2 (1-221)||(16104162-16104382)
chr2 (1-217)||(19513675-19513891)
chr2 (1-221)||(35114673-35114893)
chr2 (1-221)||(5278816-5279036)
chr2 (1-221)||(33366498-33366718)
chr2 (1-221)||(17540602-17540823)
chr2 (1-217)||(18685724-18685940)
chr2 (1-221)||(32497803-32498023)
chr2 (26-221)||(32766486-32766681)
chr2 (8-221)||(7258791-7259005)
chr2 (1-221)||(37308544-37308763)
chr2 (22-213)||(2645076-2645267)
chr2 (73-221)||(7761555-7761702)
chr2 (35-221)||(33889165-33889351)
chr2 (1-210)||(37003861-37004071)
chr2 (1-218)||(30326317-30326533)
chr2 (22-221)||(42706267-42706467)
chr2 (1-221)||(44284525-44284737)
chr2 (22-215)||(3913448-3913640)
chr2 (22-222)||(40692214-40692406)
chr2 (1-210)||(2085960-2086169)
chr2 (26-221)||(12939282-12939478)
chr2 (18-220)||(13829344-13829545)
chr2 (22-219)||(26418832-26419029)
chr2 (25-221)||(40832451-40832648)
chr2 (35-221)||(6896091-6896276)
chr2 (1-221)||(28824539-28824758)
chr2 (30-221)||(42365494-42365685)
chr2 (1-202)||(4641404-4641605)
chr2 (70-215)||(9717182-9717326)
chr2 (26-221)||(11114786-11114980)
chr2 (1-221)||(30798470-30798689)
chr2 (22-216)||(1247065-1247250)
chr2 (1-217)||(16177869-16178082)
chr2 (1-222)||(27462783-27463001)
chr2 (59-215)||(10399858-10400013)
chr2 (81-221)||(12672456-12672595)
chr2 (1-197)||(39461202-39461401)
chr2 (57-221)||(30712802-30712968)
chr2 (9-221)||(38993053-38993261)
chr2 (1-216)||(41934470-41934684)
chr2 (62-210)||(8112247-8112397)
chr2 (1-188)||(20907483-20907664)
chr2 (71-213)||(41366100-41366239)
chr2 (55-201)||(45463112-45463256)
chr2 (131-216)||(26981696-26981781)
chr2 (71-211)||(38623296-38623431)
chr2 (9-167)||(18793297-18793455)
chr2 (9-113)||(26981778-26981884)
chr2 (132-198)||(26796247-26796313)
chr2 (73-219)||(130255-130404)
chr2 (43-167)||(35473036-35473159)
chr2 (57-216)||(37088218-37088376)
chr2 (118-182)||(13249421-13249485)
chr2 (118-182)||(18127009-18127073)
chr2 (18-95)||(16062183-16062260)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (1-221)||(18042-18262)
scaffold0169 (1-218)||(12527-12744)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (1-221)||(51327-51546)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-221)||(5427-5647)
[»] scaffold0729 (1 HSPs)
scaffold0729 (22-221)||(4567-4766)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (1-221)||(23465-23683)
scaffold0054 (128-220)||(19922-20014)
[»] scaffold0650 (1 HSPs)
scaffold0650 (37-221)||(1631-1814)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (35-211)||(15379-15551)
scaffold0360 (118-173)||(13615-13670)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (37-221)||(19079-19262)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (9-220)||(2485-2695)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-221)||(13675-13894)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-221)||(15060-15280)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (73-222)||(372951-373099)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (35-221)||(42938-43122)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (118-194)||(33559-33635)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (48-154)||(3683-3788)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (83-167)||(7503-7587)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (55-113)||(111167-111225)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (160-217)||(19148-19205)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34295606 - 34295397
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34295606 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 34295507  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34295506 ttatatgattttt-gggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggacaaaaatat 34295408  T
Q  201 gagtatttgtc 211  Q
     ||| ||||||    
T  34295407 cagtttttgtc 34295397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 43368094 - 43368313
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43368094 aaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacatgacaaatttttatcacattgaataattttttgtt 43368193  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43368194 ttatacga-ttttggagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggcacaaaaatat 43368292  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| ||||||| ||| ||||    
T  43368293 cagtttttgtcccgtctcttg 43368313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 26652759 - 26652957
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26652759 aaaacatcaagtacagtacataacagtataagaaaaaacagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 26652858  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26652859 ttatacgattttt-ggcggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggacaaaaatat 26652957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26994428 - 26994208
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  26994428 aaaacagaaagtactggacagaacaggacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 26994329  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994328 tttatacgattttt-tagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 26994230  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  26994229 tgagattttgtcctgtcccttg 26994208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 47953082 - 47953302
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  47953082 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 47953181  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47953182 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 47953280  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  47953281 tgagtttttgtcatgtcccttg 47953302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1870026 - 1870247
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  1870026 aaaacagcatgtactgtacataacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgataaattttttatgacattgagtaattttttgt 1870125  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1870126 tttatacgatttttttagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 1870225  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  1870226 tgagtttttgtcctgtcccttg 1870247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21784763 - 21784983
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  21784763 aaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaatcttttatggcattgagtaattttatgt 21784862  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21784863 tttatacgatttttg-gaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 21784961  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  21784962 tgagtttttgtcctgtctcttg 21784983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36769772 - 36769552
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  36769772 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 36769673  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769672 tttatacgatttttgagag-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 36769574  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  36769573 tgagtttttgtcctgtcccttg 36769552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41211404 - 41211183
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  41211404 aaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 41211305  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41211304 tttatacgattttttagggataaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 41211205  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  41211204 tgagtttttgtcctgtcccttg 41211183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 18470576 - 18470791
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  18470576 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 18470675  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18470676 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagagacaaaaata 18470774  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18470775 tgagtttttgtcctgtc 18470791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3922906 - 3922686
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| |||    
T  3922906 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaccagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtatttttttgt 3922807  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3922806 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaacaaaaata 3922708  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  3922707 tgagtttttgtcttgtcccttg 3922686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10932760 - 10932540
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  10932760 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacacggcagaacagcataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 10932661  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10932660 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaata 10932562  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  10932561 tgagtttttgtcctgtcccttg 10932540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11322088 - 11321872
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  11322088 aaaacagtaagtatcggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 11321989  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11321988 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 11321890  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  11321889 tgagtttttgtcctgtcc 11321872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 18386417 - 18386636
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||||| | ||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  18386417 aaaacagcaagtattggacaaaacggtacaaaatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgt 18386516  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18386517 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 18386615  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  18386616 tgagt-tttgtcctgtcccttg 18386636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32873972 - 32873752
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  32873972 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 32873873  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32873872 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaata 32873774  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  32873773 tgagtttttgtcctgtcccttg 32873752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 38301241 - 38301454
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38301241 aaaacaacaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacag-----atttttatgacattgaataattttttgtt 38301335  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    | ||| |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38301336 taatacgattttt-gggggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgt-cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatat 38301433  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| ||||||||||| ||||    
T  38301434 cagtttttgtcctgtctcttg 38301454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26372012 - 26371792
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||   |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  26372012 aaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacataaaacagaacatcacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgt 26371913  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26371912 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaata 26371814  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  26371813 tgagtttttgtcctgtcccttg 26371792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 9913418 - 9913636
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||    
T  9913418 aaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatggaattgaataatttttagtt 9913517  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  9913518 ttatacgattttt-gggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagcgac-aaaatat 9913615  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     | | ||||||||||||||||    
T  9913616 caatttttgtcctgtcccttg 9913636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 9927106 - 9927324
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||    
T  9927106 aaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatggaattgaataatttttagtt 9927205  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  9927206 ttatacgattttt-gggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagcgac-aaaatat 9927303  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     | | ||||||||||||||||    
T  9927304 caatttttgtcctgtcccttg 9927324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 40753081 - 40753267
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  40753081 agaacagtacaacacaaagcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 40753179  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40753180 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 40753267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 46633589 - 46633799
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||  | ||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  46633589 aaaacagcaagtattggacataatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 46633688  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46633689 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 46633787  T
Q  200 tgagtatttgtc 211  Q
    ||||| ||||||    
T  46633788 tgagtttttgtc 46633799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43158866 - 43158669
Alignment:
Q  24 cagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggaca 122  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||    
T  43158866 cagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-aca 43158768  T
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43158767 aaatgctattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 43158669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30849449 - 30849229
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| ||||||   ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  30849449 aaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaacacaggacaatttttttatggcattgagtaattttttgt 30849350  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30849349 tttatacgatttttg-ggggacaaaatgttattttggtattttatacaacttgtatatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 30849251  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  30849250 tgagtttttgtcctgtcccttg 30849229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 329363 - 329578
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||    
T  329363 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacagtacatgacaaatttttatggtattgaataatttcttgtt 329462  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  329463 ttatatgatttttg-ggggacaaaatgctattttggtgttttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaattt 329561  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcc 217  Q
     ||| |||||| |||||    
T  329562 cagtttttgtcttgtcc 329578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Original strand, 29661257 - 29661435
Alignment:
Q  43 acaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattt 141  Q
    |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29661257 acaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgtggg-acaaaatgctattttggtattt 29661355  T
Q  142 tagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29661356 tagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 29661435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43214113 - 43213908
Alignment:
Q  15 agtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgattttta 114  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||     
T  43214113 agtacataacagtgcaagacaaaacagcacaacacaaggtagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaatcattttttgttttataggatttttg 43214014  T
Q  115 tggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctg 214  Q
     ||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || ||    
T  43214013 aggc-acgaaatgctattttggtatttttgacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagcttttatcttg 43213915  T
Q  215 tcccttg 221  Q
    |||||||    
T  43213914 tcccttg 43213908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3892229 - 3892009
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  3892229 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcatatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 3892130  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||| | |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3892129 tttacacgatttttgagga-acaaaatgctattttggtattctagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaata 3892031  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  3892030 tgagtttttgtcctgtcccttg 3892009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30599211 - 30598991
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||    
T  30599211 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgaaattgagtaatttgttgt 30599112  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30599111 tttatacgattttta-ggggacaaaatgttattttggtattttagataatttgtacttgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaata 30599013  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  30599012 tgagcttttgtcctgtcccttg 30598991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43189446 - 43189226
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||| ||  || ||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||    
T  43189446 aaaacagtaagtactggacataacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtgcatgacaaattttttatggcattgagtaatttgttgt 43189347  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    || ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43189346 ttcatacgatttttggggggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 43189247  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  43189246 tgagtttttgtcatgtccctt 43189226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23349472 - 23349274
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||  ||||||    
T  23349472 aacagtacaagatagaacaaaacaacataaggtagaacagcacatgacaaatttttataacattgaataattttttgttttctacgattgttg-ggggac 23349374  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  23349373 gaaatgtcattttagtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgttctgtcccttg 23349274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 47947652 - 47947826
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  47947652 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 47947751  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgct 175  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47947752 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgct 47947826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 44748640 - 44748807
Alignment:
Q  54 gagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttg 152  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748640 gagaacaacacagaacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttg-ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttg 44748738  T
Q  153 tacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  44748739 tacgtgggacaaaaagttgtattgtggtttggtgagggacaaaaatttgagtttttgttctgtcccttg 44748807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 48894631 - 48894829
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||    
T  48894631 aacagtacaagaccgaacagtacaacacaaggtaaaacagcactggacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttg-ggggac 48894729  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| ||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48894730 aaaatgttattttggatttttagatgatttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 48894829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47316828 - 47316681
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  47316828 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtaatttagacaacttgcatgtgagacaaaaagttgt 47316730  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47316729 gttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 47316681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 11250561 - 11250729
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagac 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11250561 acaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgaggg-acaaaatgctagtttggtattttagac 11250659  T
Q  147 aacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11250660 aact-----atgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttg 11250729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41665777 - 41665564
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| || ||||||||| | || | | || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41665777 aaaacagtaagtacggaacataacaatacaagataggacagcacaacataacgcataatagcacaagacaaatttttatggtattgaataattttctgtt 41665678  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||| ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  41665677 ttatataatttttg-ggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggcgagggacaaaaattg 41665579  T
Q  201 gagtatttgtcctgt 215  Q
     ||| ||||||||||    
T  41665578 cagtttttgtcctgt 41665564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22724725 - 22724537
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| |||| | ||||| | |||| |||||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22724725 aagtactggacagaacagtacaagatagaatatcacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttctggtattgaataattttctgtattatatga 22724626  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22724625 tttttg-ggcgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgcgctgtggtttggtgagggacaaaaat 22724537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Original strand, 34117399 - 34117547
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34117399 agaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgatttttg-ggggacgaaatgctattttggcattttagacaacttgta 34117497  T
Q  155 cgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 204  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34117498 catggaacaaaaaattgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 34117547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 46408788 - 46408999
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||  | | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||       |||||||| |||||| ||||||| | ||    
T  46408788 aaaacagcaagtattggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacat------tttttatggcattgagtaattttttatt 46408881  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  | | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46408882 ttatacgatttttgagag-acaatatgctattttgatattttagacaacttgtatgtcggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 46408980  T
Q  201 gagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  46408981 gagt-tttgtcctgtccctt 46408999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 1363536 - 1363748
Alignment:
Q  7 gcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatat 106  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||| |||||| ||||  | |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1363536 gcaagtactggacataacaatataagatagaacaacacatcagaaggtagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatac 1363635  T
Q  107 gatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtat 206  Q
     ||||||  ||| || |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  1363636 aattttt--gggtacgaaatgctatttttgtatttttgacaacctgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgatgagggacaaaaatatcagctt 1363733  T
Q  207 ttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||||||    
T  1363734 ttgtcatgtcccttg 1363748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 21133279 - 21133484
Alignment:
Q  17 tacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttat-gttttatatgattttta 114  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||     
T  21133279 tacataacaatacaagaaagaacatcacaacacaaggcagaacaacacagtacaaattttttatgacattgagtaatttttttgttttatacgatttttg 21133378  T
Q  115 tggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctg 214  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||| |||||| ||    
T  21133379 -ggagacgaaatgctattttggtattttagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttattgagggaaaataatatcagtttttgtcttg 21133477  T
Q  215 tcccttg 221  Q
    |||||||    
T  21133478 tcccttg 21133484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 48445417 - 48445633
Alignment:
Q  4 acagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtttta 103  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||   | |||| ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  48445417 acagtaagtactggacaaaacagtacaatgcataacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggtattgaataatttcttgtttta 48445516  T
Q  104 tatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgag 203  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | ||    
T  48445517 tatgatttttg-ggggacaaaatgttattttcgtgttttagacaacttgtatgcgagacaaaaagttgtcctgtgatttggtgaaggacaaaaatttcag 48445615  T
Q  204 tatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | |||||| |||||||||    
T  48445616 tttttgtcatgtcccttg 48445633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 20127199 - 20127401
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataatt----ttatgttttatatgatttttatgg 117  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||    || ||||||||| |||||||  ||    
T  20127199 aacagtacaagacaaaacaacacaacacaagatagaacagcacatgacaaatttttgtagcattgaattattatttttttgttttatacgatttttg-gg 20127297  T
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  20127298 ggacgaaatgtcattttggtattttacacaaattgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagcttttgtcctgtcc 20127397  T
Q  218 cttg 221  Q
    ||||    
T  20127398 cttg 20127401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46448810 - 46448627
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    ||||| |||| |||||| | |||| ||  |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  46448810 aacagtacaagacaaggcaaaacaacattggacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagattttta-ggggacgaaatgttattttgg 46448712  T
Q  137 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
      ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  46448711 atttttagataatttatacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgacggacaaaaatatgagtttttatcatgtcccttg 46448627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22724217 - 22724016
Alignment:
Q  18 acaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgg 117  Q
    |||||| |||| |||| || ||| ||||| | |||| |||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||    
T  22724217 acaaaatagtataagataggacaacacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttg-gg 22724119  T
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||| ||   ||| ||||||||||||    
T  22724118 tgacgaaatgctatttttgtattttatacaacttgtacgtgggataaaaagttgcgttgtggtttggcgatggacaaacattgcagtttttgtcctgtcc 22724019  T
Q  218 ctt 220  Q
    |||    
T  22724018 ctt 22724016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Original strand, 37966903 - 37967086
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    |||||||||| |||| | |||| || |||  |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  37966903 aacagcacaacacaaagcagaatagtacataacaaatttttatggtattaaataattttttgttttatacgatttttttggg-acgaaatgctattttgg 37967001  T
Q  137 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
      ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  37967002 atttttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtggtctagtgaaagacaaaaatatgggtttttgtcttgtcccttg 37967086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 11822124 - 11822335
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| || | |||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||    
T  11822124 aaaacagtaagtactgaacataacagtataaaatagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggacaaatttttatggcattgaat--ttttttttt 11822221  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||   ||||| |||||      |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  11822222 ttatacgatttttg-ggggacgaaatgctattttgaatttttaaacaac------gtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggacaaaaatat 11822314  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  11822315 gagtttttgtcatgtcccttg 11822335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 221
Target Start/End: Original strand, 17237034 - 17237188
Alignment:
Q  66 ggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaa 165  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||    
T  17237034 ggacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttg-ggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgagacaaa 17237132  T
Q  166 aagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  17237133 aagttgtgttgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcatgttccttg 17237188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Original strand, 34519527 - 34519620
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  34519527 ctatttttgtattttagacaacttgtacctgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttg 34519620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15035401 - 15035263
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||   ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15035401 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataattttttgttttgtacgatttttggtggg-caaaatgttattttgatattttagacaatttgta 15035303  T
Q  155 cgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
     |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  15035302 tgtggtacaaaaagttgtgttgtggtctggtgaggaacaa 15035263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26910562 - 26910393
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagaca 147  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||  |||||||  || ||| || | ||||||| ||||||| ||||    
T  26910562 acaaggtagaacagcgcaagacaaatttt-atggtattgaataattttctgatttat--gatttttg-ggtgacgaattactatttttgtatttttgaca 26910467  T
Q  148 acttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  26910466 acttgtacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttatcctgtcccttg 26910393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 22631671 - 22631850
Alignment:
Q  42 cacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttat-gttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtatt 140  Q
    ||||| |||||| |||||| |||| |||||||| |||   |||| ||||||||| | |||||||| |||||||  |||||| ||||   |||||||||||    
T  22631671 cacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattattagagcattaaataatttttttgttttatacgatttttg-ggggacgaaatatcattttggtatt 22631769  T
Q  141 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||||    
T  22631770 ttagacaacttgtacgtataacaaaaagttatgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagttattgtcgcgtcccttg 22631850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 198
Target Start/End: Original strand, 46627135 - 46627259
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||  || ||| |||| ||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||    
T  46627135 tttttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttg-ggagacgaaatactatttttgtattttagacaatccgtacgtgagacaaaaaattgt 46627233  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46627234 gctgtggtttgatgagggataaaaat 46627259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 211
Target Start/End: Original strand, 48699340 - 48699500
Alignment:
Q  50 aagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaac 149  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||| | |||  || || || ||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48699340 aaggcagaacagcacaagacaagcttttatggtattgaatgacttttggtcttgtacgattttt-tgtggacataagtctattttggtattttagacaac 48699438  T
Q  150 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtc 211  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  48699439 ttgtacgtggaacaaatagttgtgttgtggtttagtgagggacaagaatttcagtttttgtc 48699500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 221
Target Start/End: Original strand, 16963174 - 16963250
Alignment:
Q  145 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16963174 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtattgtggtttgataagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttg 16963250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 12982195 - 12982300
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggac-aaatttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||| ||||||||| | | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  12982195 aaaagagcaagtactggagagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgt 12982294  T
Q  100 tttata 105  Q
    ||||||    
T  12982295 tttata 12982300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29372915 - 29372764
Alignment:
Q  67 gacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 166  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||  || |||||||||||||  | ||| |||| | || ||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  29372915 gacaaacttttatggtattaaataatttttggtcttatatgatttttg-gtggataaaaggttaatttgaaattttagacaacttgtacatggaacagaa 29372817  T
Q  167 agttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  29372816 agttgtgttgtggtttagtgacggacaaaaattttagtttttgtcgtgtccct 29372764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Original strand, 16963055 - 16963149
Alignment:
Q  57 aacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttat-gttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaact 150  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963055 aacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaatttttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaact 16963149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 187
Target Start/End: Original strand, 42332072 - 42332137
Alignment:
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga 187  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42332072 aaaatgttattttgatatttaagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 42332137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 192
Target Start/End: Original strand, 35645466 - 35645530
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 192  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35645466 ctattttattattttagacaacttgtacgtacgataaaaagttgtgttgtggtttagtgagggac 35645530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29456013 - 29455880
Alignment:
Q  36 gaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttg 135  Q
    ||||| ||||| | |||| | |||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| ||  || ||||||||||||  |||  |||||| |||||||||    
T  29456013 gaacaacacaacataaggcaaaacaacacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggtcttatatgattttggtgg--acaaaacgctattttg 29455916  T
Q  136 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
    |||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29455915 gtatttt--ataactagtatgtgggacaaaaagttgtg 29455880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 175
Target Start/End: Original strand, 7958635 - 7958692
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgct 175  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  7958635 ggacaaaaaactattttggtattttagacaacttgtacttcagacaaaaagttatgct 7958692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 179
Target Start/End: Original strand, 8453285 - 8453344
Alignment:
Q  119 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 179  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  8453285 gacaaaatgttattttgatattttagacaatttgtacg-aggacaaaaagttgtgatgtgg 8453344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 198
Target Start/End: Original strand, 2048970 - 2049040
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||    
T  2048970 ctatttttgtattttttataacttctacgtgggacaaaatgttttgttgtggtttagtgatggacaaaaat 2049040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 8360580 - 8360625
Alignment:
Q  136 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  8360580 gtattttagacaacttgtacg-aggacaaaaagttgtgatgtggttt 8360625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8054452 - 8054407
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8054452 ctattttggtattttaaaaaacttgtacttgagacaaaaagttgtg 8054407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 167
Target Start/End: Original strand, 38360041 - 38360129
Alignment:
Q  78 atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    |||| |||||||||||||  ||| ||||| |||||| |  |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  38360041 atgatattgaataatttttggttctatataatttttgt-tggacaaaatattatttttgtattttaaacaacttgtaggtgagacaaaaa 38360129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 105
Target Start/End: Original strand, 47442765 - 47442834
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgttttata 105  Q
    ||||| |||| | |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  47442765 aacagtacaacataaggcagaacactacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttata 47442834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21408745 - 21408635
Alignment:
Q  83 attgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||| | |||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| || ||||||||    
T  21408745 attgaataattttttatcttatacgattttta-gtggacgaaaa-ctatttttgtattttagataacttgtacatgaaataaaaagttatgttgtggttt 21408648  T
Q  183 ggtgagggacaaa 195  Q
      |||||||||||    
T  21408647 aatgagggacaaa 21408635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 31644336 - 31644544
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644336 aaaacagcatgtacagtgcagaacagtacaagaa-gaatagcacaatacaaggtagaacaacacaagacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 31644434  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644435 ttatatgattttta-ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 31644533  T
Q  201 gagtatttgtc 211  Q
    |||||||||||    
T  31644534 gagtatttgtc 31644544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 3735246 - 3735461
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3735246 aaaacagcaggtactgtacagaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 3735345  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3735346 ttatacgattttt-ggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatggacaaaaatat 3735444  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcc 217  Q
     ||| ||||||||||||    
T  3735445 cagtttttgtcctgtcc 3735461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 7523059 - 7523280
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttat-g 98  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |    
T  7523059 aaaacaggaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaatttttttg 7523158  T
Q  99 ttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7523159 ttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaat 7523257  T
Q  199 atgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  7523258 atgagtttttgtcctgtcccttg 7523280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 32528611 - 32528824
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  32528611 aagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacg 32528710  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32528711 atttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 32528809  T
Q  208 tgtcctgtcccttgt 222  Q
    |||||||||||||||    
T  32528810 tgtcctgtcccttgt 32528824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4818348 - 4818128
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  4818348 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtgcaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 4818249  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4818248 tttatacgattttt-tagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 4818150  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| ||| |||||    
T  4818149 tgagtttttgtcttgttccttg 4818128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2351568 - 2351788
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  2351568 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggataaattttttatggcattgagtaattttttgt 2351667  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||| || |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2351668 tttgtacgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 2351766  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  2351767 tgagtttttgtcctgtcacttg 2351788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 39918403 - 39918615
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||| |    
T  39918403 aagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacaggacaaatattttatagtattgagtaattttatgttttatacg 39918502  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39918503 atttttg-ggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 39918601  T
Q  208 tgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||    
T  39918602 tgtcctgtcccttg 39918615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31770778 - 31770579
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| |    
T  31770778 aacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgaggg-a 31770680  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31770679 caaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 31770580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 35701165 - 35701385
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||    
T  35701165 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaataacacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgt 35701264  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35701265 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttatgttgtggtttggtgagggacaaaaata 35701363  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  35701364 tgagtttttgtcctgtcccttg 35701385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 11963229 - 11963449
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| | |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |    
T  11963229 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaagcagaataacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttgtat 11963328  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963329 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 11963427  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  11963428 tgagtttttgtcatgtcccttg 11963449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7770486 - 7770267
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||| | ||| ||  |||||||| |||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7770486 aaaacagcaagtactggacataatcgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 7770387  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||  | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7770386 ttatacgatttttg-gggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatat 7770288  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | || ||||||||||||||||    
T  7770287 gtgtttttgtcctgtcccttg 7770267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24181798 - 24181612
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  24181798 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatctttg-ggggacaaaatgctattt 24181700  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24181699 tggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 24181612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 34794775 - 34794995
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttta-tgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| || ||||||||  || |||||||||||||| |||    
T  34794775 aaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgataaattttttgtggcattgaataattttttgt 34794874  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34794875 tttatacgaattttg-gggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 34794973  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  34794974 tgagtttttgtcctgtcccttg 34794995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4689905 - 4689686
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4689905 aaaacagcaagtaatggacataacagtacaagacagaacaacacaacataaggcagaacaacacatgacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 4689806  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| || ||||  |||  | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4689805 ttatacgacttttg-gggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatat 4689707  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | || ||||||||||||||||    
T  4689706 gtgtttttgtcctgtcccttg 4689686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21739364 - 21739149
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||     |||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||    
T  21739364 aaaacagcaagtactggacataacaatataagatagaacagtacaacacaag-----acagaacaggacaaattttttatggcattgtgtaattttttgt 21739270  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739269 tttatacaatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 21739171  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  21739170 tgagtttttgtcctgtcccttg 21739149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 24036129 - 24036338
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||  |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24036129 aagtactgtactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaacacatgacaaattttt--gacattgaataattttttgttttatacga 24036226  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24036227 tttttggggtg-caaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagatttt 24036325  T
Q  209 gtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||    
T  24036326 gtcctgtcccttg 24036338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 40182352 - 40182551
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  40182352 aaaacagcaagtactggacagaacaatacaagaaagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 40182451  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40182452 tttatacgatttttgagag-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 40182550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 553346 - 553505
Alignment:
Q  63 acaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggga 161  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  553346 acaggacaaatattttatggcattgaataattttatgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 553445  T
Q  162 caaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  553446 caaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttg 553505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 29241300 - 29241486
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  29241300 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 29241398  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  29241399 tgatattttagccaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaatatgagcttttggcctgtcccttg 29241486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31880250 - 31880064
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  31880250 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgtattatacgattgttg-ggggacaaaatgctattt 31880152  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31880151 tggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttg 31880064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41790670 - 41790456
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| || | ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  41790670 aaaacagtaagtactggacagaacagtataaaatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggcattgagtaattttatgt 41790571  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41790570 tttatacgatttttg-ggggacaaaatgttattttagtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 41790472  T
Q  200 tgagtatttgtcctgt 215  Q
    ||||| ||||||||||    
T  41790471 tgagtttttgtcctgt 41790456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22493626 - 22493411
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||  | ||| |||||| ||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| || ||| ||||||| |||    
T  22493626 aaaacaacaagtattggacagaacagtgcaagacagaataacacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatggcaatgagtaattttttgt 22493527  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22493526 tttatacgattttt--gcggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 22493429  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  22493428 tgagtttttgtcttgtcc 22493411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5571803 - 5571632
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagac 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5571803 acaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-ggggacaa--tgctattttggtattttagac 5571707  T
Q  147 aacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5571706 aacttgtacgttggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcctgtcccttg 5571632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6284507 - 6284289
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  6284507 aaaacagcaagtactggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagtacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 6284408  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt-ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6284407 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctatttttggtattttggacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaaa 6284309  T
Q  199 atgagtatttgtcctgtccc 218  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  6284308 ataagtttttgtcctgtccc 6284289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7208404 - 7208218
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||    
T  7208404 agaacagtacaatacaagacggaacagcacgggacaaatattttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagga-acaaaatgctattt 7208306  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  7208305 tggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttggttctgtctcttg 7208218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 8136727 - 8136945
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| || |||    
T  8136727 aaaacagtaagtactggacagaatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcataacaacacaggacaatttttttatggcattgagtaatgttttgt 8136826  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||  |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8136827 tttatactattttt-tggggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 8136923  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  8136924 tgagtttttgtcctgtctcttg 8136945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18470601 - 18470416
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt 134  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||    
T  18470601 agaacagcacaatacaagacataacagcacagaacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttg-ggggacgaaatgttatttt 18470503  T
Q  135 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  18470502 ggtgttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttg 18470416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7726016 - 7725797
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| ||||||   ||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||| |||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  7726016 aaaacagtaagtactagacataacagtacaagacagtacatcacaacacaaggtagaatagtataggacaaatttttatggaattgaataattttttgtt 7725917  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  7725916 ttatacgatttttg-ggggacgaaatgctattttggatatttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttaatgaaggacaaaaatat 7725818  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  7725817 gagtttttgtcatgtcccttg 7725797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Original strand, 39788134 - 39788297
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaa-tgctattttggtattttagacaacttg 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  39788134 agaacagcacatgacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttg-ggggacaaaaatgttattttagtattttagacaacttg 39788232  T
Q  153 tacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39788233 tacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc 39788297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 41459511 - 41459696
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttta-tgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||    
T  41459511 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaggacaaaaatttaatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattt 41459609  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  41459610 tgatattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctctggtttggtgagggacaaaaatatgagt-tttttcttgtcccttg 41459696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28090699 - 28090508
Alignment:
Q  30 aagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgc 128  Q
    |||| ||||||| ||||  || || ||||||| ||||||||||||||| ||   ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||     
T  28090699 aagatagaacagtacaactcacggcagaacagtacaggacaaattttttatattattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgt 28090601  T
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28090600 tatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 28090508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32093180 - 32092978
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||||||  ||| |||||| || || |||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| |    
T  32093180 aagtactggacagaacagtaagagacagaacaacataacacaaggcagaacagcacaacacaaatttttatggtattgaaaatttttatgttttatataa 32093081  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||    
T  32093080 tttttg-ggggacgaaatgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga-ggacaaaaatttcagttttt 32092983  T
Q  209 gtcct 213  Q
    |||||    
T  32092982 gtcct 32092978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 40489298 - 40489445
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40489298 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacaatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgt 40489396  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40489397 gctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcccgtcccttg 40489445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8561138 - 8560974
Alignment:
Q  51 agggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaact 150  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8561138 agggagaacaaaacatgacaaatttttatggcattgattaattttttgttttatacgattttt--ggggacgaaatgttattttggtattttagacaact 8561041  T
Q  151 tgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||    
T  8561040 tgtacctggaacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtcc 8560974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 700805 - 700588
Alignment:
Q  5 cagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgtttta 103  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||| | || |  |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  700805 cagcaaatactggacataacagtacaagacaaaataatacaacacaaggtagaacagcacatgacaaaatttttatggcaatgagtaattttttgtttta 700706  T
Q  104 tatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgag 203  Q
    |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  700705 tatgattttcg-ggggacaaaataatattttggtattttagataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgaa 700607  T
Q  204 tatttgtcctgtcccttgt 222  Q
    | |||||  ||||||||||    
T  700606 tttttgttttgtcccttgt 700588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 5673032 - 5673247
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| ||||||   ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||| || ||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||    
T  5673032 aaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatataacagcacaacacaaggcataacatcaaaggacaaatattttatggcaatgagtaattttttgt 5673131  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5673132 tttatacgatttttg-ggggacaaaatgttattttgatattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 5673225  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||| | |||||||||    
T  5673226 tgagtttttgacttgtcccttg 5673247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22432489 - 22432297
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaa 124  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||   ||||| |  ||||   ||||||| |||||||  |||||| ||    
T  22432489 agtactagacagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttatatgattgatttttttt---ttttatacgatttttg-ggggacgaa 22432394  T
Q  125 atgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22432393 atgctattttggtattttagacaacttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttg 22432297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23091478 - 23091292
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattt-ttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||    
T  23091478 agaacagtacaacacaagatagaacaacacaagacaaatttcttatggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattt 23091380  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23091379 tgatattttagacaatttatacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgacggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttg 23091292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37148781 - 37148632
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| || | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||    
T  37148781 aaaacagtaagtactggacaaaacagtataatacagaacagcacaacacaaggtataacagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttatt 37148682  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaactt 151  Q
    ||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37148681 ttatattcttttt-gggggacgaaatgctattttggtgttttagacaactt 37148632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 5598482 - 5598588
Alignment:
Q  115 tggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctg 214  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||     
T  5598482 tggggacgaaatgttattttgatattttagacaagttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgttgtttgatgaaggacaaaaatatctgtttttgtcctc 5598581  T
Q  215 tcccttg 221  Q
    |||||||    
T  5598582 tcccttg 5598588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27839164 - 27839084
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27839164 ggacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgttttatggtttggtgagggacaaaaat 27839084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Original strand, 17031132 - 17031261
Alignment:
Q  87 aataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtg 186  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  17031132 aataatttttggtcttatatgattttt-tgtggacaaaaagctatttttgtattttaaataacttgtacgtgggacgaaaagttgtgctgtgatttaatg 17031230  T
Q  187 agggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||| ||||||| |  || ||||||||||||    
T  17031231 aggggcaaaaatttatgtttttgtcctgtcc 17031261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 20119659 - 20119774
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa---ttttat 97  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||   || | |    
T  20119659 aaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttaatagcattgaataatatttgttt 20119758  T
Q  98 gttttatatgattttt 113  Q
    ||||||||||||||||    
T  20119759 gttttatatgattttt 20119774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11090946 - 11090887
Alignment:
Q  131 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 190  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  11090946 ttttgatattttagacaacgtgtacgtgagacaaaaagttgtgtcgtggcttagtgaggg 11090887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37148631 - 37148577
Alignment:
Q  167 agttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  37148631 agttgtgccgtggtttggtgaggaacaaaaatttcagtttttgtcccgtcccttg 37148577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29788544 - 29788489
Alignment:
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 179  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  29788544 aaatgttattttaatattttagacaacttgaacgtggg-caaaaagttgtgttgtgg 29788489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 94)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 52949613 - 52949831
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52949613 aaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataatttt-tgtt 52949711  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  52949712 ttatacgattttt-gggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatat 52949810  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| ||||||||||| ||||    
T  52949811 cagtttttgtcctgtctcttg 52949831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50178687 - 50178467
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50178687 aaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacatcacaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 50178588  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  50178587 ttatacgattttt-gggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggcacaaaaata 50178489  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | ||| ||||||||||| ||||    
T  50178488 tcagtttttgtcctgtctcttg 50178467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47642685 - 47642487
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47642685 aaaacaacaagtatagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaggataaatttttatgacattgaataattttttgtt 47642586  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47642585 ttatacgattttt-gggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatat 47642487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20802726 - 20802506
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  20802726 aaaacagcaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 20802627  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20802626 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 20802528  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  20802527 tgagtttttgtcctgtctcttg 20802506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24002229 - 24002450
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttat-gacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||    
T  24002229 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttttggcattgagtaattttttgt 24002328  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24002329 tttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 24002428  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  24002429 tgagtttttgtcctgtcccttg 24002450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44649356 - 44649139
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  44649356 aaaacggcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacaacacatgacaaattttgatgacattgaataatttt--gtt 44649259  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44649258 ttatacgatttttg-ggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatat 44649160  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| ||||||||||| ||||    
T  44649159 cagtttttgtcctgtctcttg 44649139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 43640990 - 43641205
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  43640990 aaaacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggcattgagtaattttttgt 43641089  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43641090 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 43641188  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||| |||||||||||    
T  43641189 tgagtttttgtcctgtc 43641205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37695735 - 37695521
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37695735 aaaacaacaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatggcattgaataattttttgtt 37695636  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37695635 ttatacgattttt-gggggacgaaatgttattttgatattttagacaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatat 37695537  T
Q  201 gagtatttgtcctgtc 216  Q
     ||| |||||| ||||    
T  37695536 cagtttttgtcttgtc 37695521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Original strand, 32181197 - 32181374
Alignment:
Q  43 acaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtatttt 142  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32181197 acaatacaagatagaacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatactatttttg-ggggacgaaatgctattttggtatttt 32181295  T
Q  143 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32181296 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 32181374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23521771 - 23521991
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  23521771 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 23521870  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23521871 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 23521969  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||    
T  23521970 tgagtttttgtcctatcccttg 23521991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 56154512 - 56154732
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  56154512 aaaacaacaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 56154611  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56154612 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 56154710  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  56154711 tgagtttttgttctgtcccttg 56154732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55065527 - 55065308
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| |||| | || || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  55065527 aaaacagcaagtactggacataacagtataagataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgagtaattttttgtt 55065428  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55065427 ttatacgattttt-gaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatat 55065329  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  55065328 gagtttttgtcctgtcccttg 55065308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29785724 - 29785511
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  29785724 aagtactgaacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacg 29785625  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29785624 atttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagctgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 29785526  T
Q  208 tgtcctgtcccttgt 222  Q
    ||| |||||||||||    
T  29785525 tgttctgtcccttgt 29785511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 21202639 - 21202850
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| |    
T  21202639 aagtactggacaaaacagtacaagacagaacagcacaacacaaaacagaacagcacatgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacg 21202738  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21202739 attttt--ggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaattatgagtttt 21202836  T
Q  208 tgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  21202837 tgtcctgtctcttg 21202850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 6776490 - 6776689
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | ||    
T  6776490 aacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-tagaga 6776588  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6776589 caaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 6776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 9807056 - 9807262
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9807056 aagtactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacga 9807155  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  9807156 ttttt-ggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtttggtga-ggacaaaaagttgagttttt 9807253  T
Q  209 gtcctgtcc 217  Q
    |||||||||    
T  9807254 gtcctgtcc 9807262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33177206 - 33177007
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  33177206 aacagtataagatagaacagtacaacacaagacagaacaacaaaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttg-gggga 33177108  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33177107 caaaatgttattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 33177008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33553003 - 33552817
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  33553003 agaacagtacaacacaaggcaaaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 33552905  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33552904 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttg 33552817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49152294 - 49152075
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  49152294 aaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 49152195  T
Q  100 tttatatgattttt-atggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49152194 tttatacgatttttgatgg--acaaaatgttattttggt-ttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaat 49152098  T
Q  199 atgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  49152097 atgagtttttgtcgtgtcccttg 49152075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 52319217 - 52319434
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||   ||    
T  52319217 aaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattt---gt 52319313  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52319314 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattttgacattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 52319412  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  52319413 tgagttttcgtcctgtcccttg 52319434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2725280 - 2725108
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagac 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2725280 acaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagac 2725182  T
Q  147 aacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2725181 aacttgtacgtgg-acaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 2725108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12600777 - 12600996
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| || |||| |||    
T  12600777 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacttgacaaattttttatggcattgagtagttttttgt 12600876  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12600877 tttaaacgattttt-tagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaata 12600975  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  12600976 tgagtttttgtcttgtccctt 12600996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9512535 - 9512321
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||| ||  ||| | |||  |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  9512535 aaaacagcaagtacgtgacagaacagtacaagatagaatagtgcaacaaaagacagaatagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 9512436  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9512435 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaata 9512337  T
Q  200 tgagtatttgtcctgt 215  Q
    ||||| ||||||||||    
T  9512336 tgagtttttgtcctgt 9512321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20518199 - 20517997
Alignment:
Q  19 caaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgg 117  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||    
T  20518199 caaaacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatagaatttttgagg 20518100  T
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  20518099 g-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaagaagttatgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgactttttgtcctgtct 20518001  T
Q  218 cttg 221  Q
    ||||    
T  20518000 cttg 20517997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44324500 - 44324326
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  44324500 aacagcacaacataaggcagaacagcacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttg-ggggacgaaatgctattttgg 44324402  T
Q  137 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcc 212  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44324401 tatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcc 44324326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16320413 - 16320630
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  16320413 aaaacagcaagtactgtataaagcaatacaagaaagaacaacacaatagaagggagaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttt--gtt 16320510  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| || ||||  |||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16320511 ttatacgagttttg-ggggatgaaattctatttttgtattttaggcaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatat 16320609  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| ||| ||||||||||||    
T  16320610 cagtttttatcctgtcccttg 16320630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21579917 - 21580137
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||  ||    
T  21579917 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggtattgagtaatttttagt 21580016  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21580017 tttatacgatttttgaggg-acaacatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 21580115  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  21580116 tgagtttttgtcctgtcccttg 21580137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 37865644 - 37865864
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  37865644 aaaacagtaagtacgggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaatttttttatggcattgaataattttttgt 37865743  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37865744 tttatacgatttctgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtgatttggtgagggacaaaaata 37865842  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||| ||||    
T  37865843 tgagtttttgtcatgtctcttg 37865864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46680668 - 46680485
Alignment:
Q  38 acagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  46680668 acagaacagtacaagatagaacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgattttt-tagggacaaaatgctattatgg 46680570  T
Q  137 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46680569 tattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 46680485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50728054 - 50727888
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 153  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50728054 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgt 50727956  T
Q  154 acgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50727955 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 50727888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50736068 - 50735902
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 153  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50736068 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgt 50735970  T
Q  154 acgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50735969 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 50735902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 3649562 - 3649747
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt 134  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||    
T  3649562 agaacagcacaacacaaggcataacagcacatcacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgttttttg-ggggacgaaatgttatttt 3649660  T
Q  135 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  3649661 ggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaattttagtttttgtcctgtcccttg 3649747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Original strand, 54542905 - 54543100
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaa 123  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||    
T  54542905 agtacaggatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaagacaaattttttatgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaa 54543003  T
Q  124 aatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54543004 aatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa-gttgtgctatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 54543100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 55593797 - 55593996
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||   ||  |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |    
T  55593797 aacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaatgcaaaacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-a 55593895  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55593896 caaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggactaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 55593995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 34929823 - 34930026
Alignment:
Q  18 acaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatg 116  Q
    |||||||||||||| | | || || |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| | ||| ||| ||||||||| |||||||  |    
T  34929823 acaaaacagtacaaaataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggcattcagtaaatttttgttttatacgatttttg-g 34929921  T
Q  117 gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34929922 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtatatggggcaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 34930021  T
Q  217 ccttg 221  Q
    |||||    
T  34930022 ccttg 34930026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 38812484 - 38812631
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812484 tttttatgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgcgga-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 38812582  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38812583 gttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 38812631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 20694304 - 20694478
Alignment:
Q  43 acaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattt 141  Q
    |||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20694304 acaacacaaggcagaatagcacatgacaaattttgtatggcaatgagtaattttttgttttatataatttttg-ggggacaaaatgctattttggtattt 20694402  T
Q  142 tagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20694403 tagacaacttgtacgttggacaaaaagttgcgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc 20694478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Original strand, 24210251 - 24210430
Alignment:
Q  43 acaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattt 141  Q
    |||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||    
T  24210251 acaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtattt 24210350  T
Q  142 tagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24210351 tagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaataatatgagtttttgtcctgtcccttg 24210430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38486405 - 38486232
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagac 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38486405 acaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcgttgagtaattttttgttttatactatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagac 38486307  T
Q  147 aacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38486306 aacttgtacgttagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 38486232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 41711806 - 41711958
Alignment:
Q  68 acaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41711806 acaaatttttatgctattgaataattttttgttttatacgatatttg-ggggacgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgagacaaaaa 41711904  T
Q  168 gttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41711905 gttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtctttgtcctgtcccttg 41711958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36743834 - 36743663
Alignment:
Q  50 aagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaa 148  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36743834 aaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaa 36743736  T
Q  149 cttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  36743735 cttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcatgtcccttg 36743663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 36885883 - 36886043
Alignment:
Q  62 cacaggacaaattttt-atgacattgaat-aattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgg 159  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36885883 cacaggacaaattttttatggcattgagttaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctatttaggtattttagacaatttgtacgtgg 36885981  T
Q  160 gacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36885982 gataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 36886043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 37931812 - 37932020
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| | || | || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||    
T  37931812 aaaacagtaagtactggacataacagtacaagacataataacataatacaaggcagaacagcacaagacaactttttatggcattgaataatttttcgtt 37931911  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||  ||||||  |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931912 ttatacaatttttg-ggggacgaaatgctattttgacattttaaacaacttgtatgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatat 37932010  T
Q  201 gagtatttgt 210  Q
    |||| |||||    
T  37932011 gagtttttgt 37932020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 29592824 - 29593006
Alignment:
Q  38 acagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggt 137  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||     
T  29592824 acagaacaacacaaggcagaacagaacaagacaaatttttttggcattgaataattttttgttttatatgatttttg-ggggacgaaatgccattttgga 29592922  T
Q  138 attttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29592923 tttttagacaacttttatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaagtacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 29593006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2786856 - 2787075
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||||| ||||| | |||| | ||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2786856 aaaacagtaagtactggacataacagtacaagaccgaacaacacaacataaggcaaaacagcactagacaattttttattgcattgaataattttttgtt 2786955  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  2786956 ttataagatttttg-ggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgggacaaaaatttgtgatgtggtttagtgaaggacaaaaatat 2787054  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  2787055 gagtttttgtcctgtcccttg 2787075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Original strand, 4325731 - 4325902
Alignment:
Q  50 aagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaa 148  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4325731 aaggcagaacaacacacgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatgcgatttttg-ggggacaaaatgctattttggtattttagacaa 4325829  T
Q  149 cttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4325830 cttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgcggttttgtgagagacaaaaatatgagtttttctcctgtcccttg 4325902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Original strand, 23327844 - 23328024
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttg 135  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  23327844 aacaacacaacacaaagtagaacattacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttggggggataaaatgttattttg 23327943  T
Q  136 gtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23327944 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 23328024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Original strand, 50186484 - 50186639
Alignment:
Q  65 aggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  || | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  50186484 aggacaaatttttatgacattgaataattttttattttatacgatttttggggtg-cgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtatgtgggataa 50186582  T
Q  165 aaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  50186583 aaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcccgtcccttg 50186639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 1231236 - 1231422
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||   |||| || ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||    
T  1231236 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaagataaattttttatggcattatgtaatattttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattt 1231334  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  1231335 tgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttttgtgagggacaaaaatatgagtttttgtccagtctcttg 1231422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 26083264 - 26083450
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt 134  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||    
T  26083264 agaacaacacaacacaaggcataacagtacacgacaaatttttatggtattgaataatttcatgttttatatgctttttg-ggggacgaaatgttatttt 26083362  T
Q  135 gg-tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  26083363 gggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgtcccttg 26083450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 29616095 - 29616276
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||    
T  29616095 agaacagtacaacacaagacagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttaaggg-acaaaatgttattt 29616193  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29616194 tggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtc-----agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 29616276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47361570 - 47361389
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  47361570 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgatattgagtaattttttgttttatacgaatttt-tagggacaaaatgctattt 47361472  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  47361471 tggtattttagacaacttgtt----ggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaat-tttgtcttgtcccttg 47361389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 222
Target Start/End: Original strand, 36497144 - 36497329
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatt-tttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttg 135  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||   |||||  |||||| ||||||| | ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  36497144 aacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaaaaatttatagcattgagtaattttttattttatacgatttttgaggg-acagaatgctattttg 36497242  T
Q  136 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36497243 atattttagacaacttgtatgttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgt 36497329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53200815 - 53200618
Alignment:
Q  24 cagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaa 123  Q
    |||||||| | |||||| ||||| | |||| | |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| || |    
T  53200815 cagtacaaaacagaacatcacaacataaggcataacaacacagaacaaatttttatggtattgaataattttttgttttgtatgatttttgaggg-acga 53200717  T
Q  124 aatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa-gttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||    
T  53200716 aatactattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgttccttg 53200618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22318578 - 22318382
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| || |||||||   |||||||||||| |||||  | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  22318578 aaaacagtaagtactggacagaagagtacaatgcagaacagcacaacacaagacataacaacacatgacaaatttttatgatattgaataatttcttgtt 22318479  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22318478 ttatatgatttttg-gatgacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtaagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaat 22318382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7555130 - 7554932
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || |    
T  7555130 aacagtacaagacaaaacaacacaacacaagacagaacatcacacgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttg-gaggcc 7555032  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||| ||| || |||| ||||    
T  7555031 gaaatgctattttggatttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttagtgaaggacaaaaatacgagtttttatcatgtctcttg 7554932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 42869937 - 42870082
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||   ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  42869937 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaa---gttgt 42870033  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42870034 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 42870082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 28115257 - 28115363
Alignment:
Q  115 tggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||    
T  28115257 tggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcaatttttctcctg 28115356  T
Q  215 tcccttg 221  Q
    |||||||    
T  28115357 tcccttg 28115363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 198
Target Start/End: Original strand, 39078600 - 39078749
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagaca 147  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39078600 acaaggcataacaacacaggataaatttttatggtattgaataatttcttattttatatgatttttg-ggggacaaaatgttattttggtgttttagaca 39078698  T
Q  148 acttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39078699 actcgtacgtaggacaaaaatttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaat 39078749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 11055981 - 11056153
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagaca 147  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||  || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  11055981 acaaggtagaacagtacgggacaaatctttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggc-acgaaatgttattttggtatttttgaca 11056079  T
Q  148 acttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  11056080 atctgtacatgggacataaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcccttg 11056153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 14296496 - 14296654
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||| ||||| |||| | ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  14296496 aagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacg 14296595  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14296596 atttttg-ggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 14296654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 14314744 - 14314902
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||| ||||| |||| | ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  14314744 aagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacg 14314843  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14314844 atttttg-ggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 14314902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 7001763 - 7001940
Alignment:
Q  18 acaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgg 117  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||  |     
T  7001763 acaaaatagtacaagacagaacatcacaacacaagacagaacaatacaggacaaatttttatggcattgaataatttttggtcttatacgattttt-ggt 7001861  T
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7001862 ggac-aaatgttattttggta-tttagacaacttatacatagaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaat 7001940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50729621 - 50729517
Alignment:
Q  117 gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  50729621 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatagacaaaaatttcagtttttgtcatgtc 50729522  T
Q  217 ccttg 221  Q
    |||||    
T  50729521 ccttg 50729517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Original strand, 13110239 - 13110434
Alignment:
Q  20 aaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggg 119  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |  |||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  13110239 aaaacaatacaagatagaacaacatagcacaaggtagaacaacgcagaacaaatttttatggcattgcataatttt-tgttttgtatgatttttg-gggg 13110336  T
Q  120 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg-tttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13110337 acgaaatgctattttggatttttagacaaattttacgtgggacaaacagttgtgttgtggttttagtgaaggacaaaaatatgagt-tttgtcatgtcc 13110434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 30942680 - 30942876
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| | || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  30942680 aaaacagtaagtattggacaaaacagtacaattaagaacattacaatacaaggtataatagcatatgacaaatttttatagcattgaataatttcttgtt 30942779  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  30942780 ttatatgattttt-gggggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttatatgtgaggcaaaatgttgtgttgtggtttggtgagagacagaaat 30942876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2630018 - 2629930
Alignment:
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2630018 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatttggtctggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcc 2629930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Original strand, 43739402 - 43739570
Alignment:
Q  50 aagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaac 149  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||| ||  ||| |||||||||  || |||||  |||||| || ||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  43739402 aaggcagaacaacacatgataaatttttttggtattaaataatttttggtcttatacaattttt-tgtggataaaatgttattttaatattttagacaac 43739500  T
Q  150 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||    
T  43739501 ttgtatgtgggacaaaatgttgtgttgtggtttggtgagggacaataatttcagtttttgtcatgtccct 43739570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 42772706 - 42772818
Alignment:
Q  57 aacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacg 156  Q
    ||||||| |||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42772706 aacagcagaggataattatttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttg-gaggaaaaaatgttattttggtattttagataacttatacg 42772804  T
Q  157 tgggacaaaaagtt 170  Q
    ||||||||||||||    
T  42772805 tgggacaaaaagtt 42772818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45577829 - 45577706
Alignment:
Q  56 gaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtac 155  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||  || ||| || | |||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  45577829 gaacaacacatgacaaagttttatggtattgaataatttt--gtctta-atcaattttttgtggacaaaatgtcattttggtattttagacaacttgcac 45577733  T
Q  156 gtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  45577732 gtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 45577706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Original strand, 38520518 - 38520584
Alignment:
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaa 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38520518 tattttggtattttatacaacttgtgcgtgggacaaaaaattatgctgtggtttggtgagggacaaa 38520584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 42772832 - 42772899
Alignment:
Q  154 acgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  42772832 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttg 42772899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 56487374 - 56487281
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  56487374 tttttatgtcattgattgattttttgttttatatgatttttg-gaggacaaaatgttattttggtattttaaacaacttgtacgcgtgacaaaaa 56487281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Original strand, 3579089 - 3579201
Alignment:
Q  75 tttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgc 174  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||| | ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||     
T  3579089 tttatgatattgaataatttttgtttttataaggtttttttgcgaacaaaagactattttggtattttagacaacttgaatgttggacaaaaagttgtga 3579188  T
Q  175 tgtggtttggtga 187  Q
    | |||||| ||||    
T  3579189 tatggtttagtga 3579201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25978664 - 25978592
Alignment:
Q  143 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  25978664 agacaacttgtaagtgagacaaaaagttgtgatatggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgt 25978592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 9947894 - 9948040
Alignment:
Q  74 ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
    |||||||| ||| ||||| |||  |||||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||     
T  9947894 ttttatgatattaaataaattttggttttatatggttttt-tgtggacaaaggactattttggtattttgaataacttgtacgtgagacaaaaagttgta 9947992  T
Q  174 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     |||||||| |||||||| || ||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  9947993 atgtggtttagtgagggataagaattttagtttttgtcatgtctcttg 9948040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 52949536 - 52949599
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcac 64  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52949536 aaaacagcaagtacaatacagaatggtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaatagcac 52949599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Original strand, 7381193 - 7381349
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||| ||||||| | |||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | | ||||||||||||   | ||||    
T  7381193 aacattacaagacataacaacataatacaagacagaacatcacaggacaaatttgtatggtattgaataattt--tttcttatatgatttt--ggtggac 7381288  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| || ||||||| | || ||||||||||| | ||||||    
T  7381289 aaaaaactatttttgtattttagataatttgtacgcgtgaaaaaaagttgtgttatggttt 7381349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6973946 - 6973893
Alignment:
Q  163 aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6973946 aaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtc 6973893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 194
Target Start/End: Original strand, 21098546 - 21098618
Alignment:
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  21098546 aaaatgttattttagtattttagacaaattttacgtgcgacaaaaagttatgttgtggtttagtgagagacaa 21098618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Original strand, 41720764 - 41720903
Alignment:
Q  30 aagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgct 129  Q
    |||| |||||| || || |||| | |||||| |||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||  || |||||  |||||| || ||||||||   |    
T  41720764 aagacagaacaacataacacaaagtagaacaacacatgacaaactttaatgatattgtataatttttagtcttatactattttt-tgtggacaaaaaatt 41720862  T
Q  130 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 170  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41720863 atttttgtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagtt 41720903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Original strand, 52673830 - 52673922
Alignment:
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||    
T  52673830 tatttttgtattttagataactcatacgtgagacaaaaaattgtgttgaggtttagtgagggacaaaaatttctgtttttgtcatgtcccttg 52673922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 50729686 - 50729627
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattt 94  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  50729686 agaacagcacaacacaaggcataacagcacagaacaaatttttatgatattaaataattt 50729627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43189922 - 43189762
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt 134  Q
    |||||| |||||||||||| ||| || |||| || ||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| | |||||| | | ||||||    
T  43189922 agaacaacacaatacaaggaagagcaacacatgataaacttttatggtattgaataattttttgtcttatacgatattta-gtggacaataagttatttt 43189824  T
Q  135 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaa 197  Q
     ||| |||||| |||||| |  ||||||||||| |||||  ||||||| |||||  |||||||    
T  43189823 tgta-tttagataacttgcatttgggacaaaaacttgtgtcgtggtttagtgagacacaaaaa 43189762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 53343638 - 53343560
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttt 112  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  53343638 agaacagtacaacacaatgcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttt 53343560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 179
Target Start/End: Original strand, 40792425 - 40792486
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 179  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  40792425 ggacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtacatgaaacaaaaagttgtgatgtgg 40792486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10184947 - 10184875
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgat 109  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10184947 aacaacacaatacaaggtggaacagcacatgacaaacttttatggtattgaacaattttttgtcttatatgat 10184875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44355995 - 44355852
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgattttt-atggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 153  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||| |||  || || || ||||||| ||||  ||||||  |||||||||||| | | |||||||||    
T  44355995 agaacaacacaggccaaacttttatgctattgaataacttttggtcttgtacgatttttgatgg--acaaaagactattttggtatatcatacaacttgt 44355898  T
Q  154 acgtgggac-aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||||  ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  44355897 acgtaagacaaaaaaattgtgttgtggtttaatgagggacaaaaat 44355852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 221
Target Start/End: Original strand, 14296645 - 14296678
Alignment:
Q  188 gggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14296645 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 14296678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 221
Target Start/End: Original strand, 14314893 - 14314926
Alignment:
Q  188 gggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14314893 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 14314926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41897426 - 41897337
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| |  || ||||||||||||    
T  41897426 ctatttttgtattttatataacttttacgtaggataaaaagttgtgctgttgtttatcgagggacacaaatttttgtttttgtcctgtcc 41897337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 136
Target Start/End: Original strand, 10586995 - 10587069
Alignment:
Q  60 agcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  10586995 agcacaggataaacttttatggtat-gaataattttttgttttatatgattttt-tgtggataaaatgttattttgg 10587069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 52347200 - 52347157
Alignment:
Q  131 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgct 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  52347200 ttttggtattttagacaactt-tacttggaacaaaaagttgtgct 52347157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 194
Target Start/End: Original strand, 52755532 - 52755604
Alignment:
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  52755532 aaaatgttattttgctaatttacacagcttgtgcttggaacaaaaagttgttttgtgctttggtgagggacaa 52755604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 10485047 - 10485265
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10485047 aaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaaggga-aacaacacaggacaaatatttatgacattgaataattttttgtt 10485145  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10485146 ttatacgatttttg-ggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggacaaaaatat 10485244  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| ||||||||||| ||||    
T  10485245 cagtttttgtcctgtctcttg 10485265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17443151 - 17443370
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||| ||  | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17443151 aaaacagcaaatattggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgtt 17443250  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17443251 ttatacgatttttg-gaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggataaaaatat 17443349  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  17443350 gagtttttgtcctgtcccttg 17443370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14925688 - 14925478
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14925688 aagtacgggacataacagtaaaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatacga 14925589  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14925588 ttttta-ggggacggaatgctattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt 14925490  T
Q  209 gtcctgtccctt 220  Q
    ||||||||||||    
T  14925489 gtcctgtccctt 14925478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 18057429 - 18057626
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  18057429 aacagtaaaagatagaacagcacaacacaaggcataatagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatacgattttta-gaggac 18057527  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18057528 gaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccctt 18057626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2614784 - 2615004
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |    
T  2614784 aaaacaacaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttat 2614883  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614884 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 2614982  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  2614983 tgagtttttgtcctgtcccttg 2615004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24242552 - 24242772
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| | || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  24242552 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaagagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgt 24242651  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24242652 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 24242750  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||  |||||||||    
T  24242751 tgagtttttgttgtgtcccttg 24242772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10324352 - 10324132
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||| |||    
T  10324352 aaaacagtaagtaccggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatgggattgagtaattttttgt 10324253  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10324252 tttatacgattttt-tggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 10324154  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  10324153 tgagtttttgtcctgtcccttg 10324132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24203251 - 24203470
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  24203251 aaaacagcaagtattggacagaacagtacatgatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 24203350  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24203351 tttatacaattttga--gggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 24203448  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  24203449 tgagtttttgtcctgtctcttg 24203470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17867723 - 17867943
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  17867723 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 17867822  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17867823 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagggacaaaaata 17867921  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||| || |||||||||    
T  17867922 tgagtttttatcttgtcccttg 17867943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17877506 - 17877726
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  17877506 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 17877605  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17877606 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagggacaaaaata 17877704  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||| || |||||||||    
T  17877705 tgagtttttatcttgtcccttg 17877726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32132597 - 32132401
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaa 123  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  32132597 agtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttg-ggggacaa 32132499  T
Q  124 aatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32132498 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 32132401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32410072 - 32409872
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |    
T  32410072 aacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgaggg-a 32409974  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32409973 caaaatactattttggtattttagacaacttgtgagtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 32409874  T
Q  221 gt 222  Q
    ||    
T  32409873 gt 32409872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 10959889 - 10960108
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | | | |||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  10959889 aaaacagtaagtactggatagaacagtacaagacagaacatcacagcacaaggcagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaatgatattttgtt 10959988  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10959989 ttatacgatttttg-ggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgttgagggacaaaaatat 10960087  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  10960088 gagtttttgtcctgtcccttg 10960108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31870340 - 31870121
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31870340 aaaacatcaagtattgtacataacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgtt 31870241  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| || ||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31870240 ttatacgagttttg-ggggacgaaatgctatttttgtattttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatat 31870142  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| |||||  |||||||||    
T  31870141 cagtttttgttttgtcccttg 31870121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 167130 - 166944
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  167130 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatatgatttttaaggg-acgaaatgctattt 167032  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  167031 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgtcccttg 166944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3933029 - 3932828
Alignment:
Q  20 aaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggg 118  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||    
T  3933029 aaaacagtataagatagaacagtacaacacaagacaaaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggg 3932930  T
Q  119 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccc 218  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3932929 -acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgcccc 3932831  T
Q  219 ttg 221  Q
    |||    
T  3932830 ttg 3932828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15277178 - 15276958
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||| |||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  15277178 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgacaaaaattttatggcattgagtaattttttgt 15277079  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15277078 tttataagatttttgaggg-acaaaatgctattttgttcttttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 15276980  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  15276979 tgagtttttgtcctgtcccttg 15276958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11613971 - 11613811
Alignment:
Q  62 cacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggg 160  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11613971 cacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttatacaacttgtacgtggg 11613873  T
Q  161 acaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11613872 acaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgt 11613811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15277521 - 15277301
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| | |||| ||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||  |||    
T  15277521 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggtaaaacaacacagaacaaattttttatagcattgagtaatttgttgt 15277422  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15277421 tttatacgatttttg-gaagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 15277323  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  15277322 tgagtttttgtcctgtcccttg 15277301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3259566 - 3259791
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggac------aaatttttatgacattgaataattt 94  Q
    ||||||||||| |  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||      || |||||||| |||||| ||||||    
T  3259566 aaaacagcaaggattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacatgacaaattttttatggcattgagtaattt 3259665  T
Q  95 tatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    | ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3259666 tttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 3259764  T
Q  195 aaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3259765 aaatatgagtttttgtcctgtctcttg 3259791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14808225 - 14808022
Alignment:
Q  16 gtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttat 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||      
T  14808225 gtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatggaattgaataatttttagttttatacgattttt-g 14808127  T
Q  116 ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
    |||||  ||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |    
T  14808126 ggggatgaaatgttattttggta-cttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcaatttttatcctat 14808028  T
Q  216 cccttg 221  Q
    ||||||    
T  14808027 cccttg 14808022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 11212145 - 11212364
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||    
T  11212145 aaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatgttttatggccttgagtaattttttgt 11212244  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||  |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  11212245 tttattcgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgcacgtgagacaaaaggttatgttgtggtttggtgagggacaaaagta 11212343  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  11212344 tgagtttttgtcatgtccctt 11212364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 221
Target Start/End: Original strand, 34176772 - 34176938
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34176772 agaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagactacttgt 34176870  T
Q  154 acgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34176871 acgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcatgtcacttg 34176938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Original strand, 3290635 - 3290778
Alignment:
Q  75 tttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgc 174  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||     
T  3290635 tttatgacattgaataattgtttgttttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtggga--aaaagttgtgt 3290731  T
Q  175 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3290732 tgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 3290778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9902863 - 9902680
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataat-tttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttg 135  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||| |||  |||| ||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  9902863 aacaacacaacacaaggcagatcagtacataacaattttttataacattgaataaaatttttggtttatatgatttttg-ggggacgaaatgttattttg 9902765  T
Q  136 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9902764 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttaatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtccctt 9902680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Original strand, 11279090 - 11279233
Alignment:
Q  74 ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||||||||  |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11279090 ttttatggccttgagtaattttttgttttattcgatttttgaggg-ataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtg 11279188  T
Q  174 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccc 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11279189 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccc 11279233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 221
Target Start/End: Original strand, 11382040 - 11382170
Alignment:
Q  88 ataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga 187  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11382040 ataattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 11382138  T
Q  188 gggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11382139 --gacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 11382170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34684226 - 34684006
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatt--tttatgacattgaataattttatg 98  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||| || ||| ||||| | |||| | |||| ||||||| |||    ||||||||| ||| ||||||| ||    
T  34684226 aaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagacaggacaacacaacataaggcataacaacacaggataaaaaagtttatgacaatgagtaattttttg 34684127  T
Q  99 ttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtatttt-agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaa 197  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  34684126 ttttatacgatttttg-gaggacaaaatgctattttggtatttttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa- 34684029  T
Q  198 tatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     |||||| |||||| |||||||||    
T  34684028 -atgagtttttgtcgtgtcccttg 34684006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4494247 - 4494135
Alignment:
Q  110 ttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgag-tattt 208  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4494247 ttttttggggacaaaatgttatttcggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttt 4494148  T
Q  209 gtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||| ||||    
T  4494147 gtcctgtcacttg 4494135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 29054255 - 29054464
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| || ||| ||||| | |||  ||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29054255 aagtactggacataacagtacaagataggacaacacaacataagacagaacagcacaagataaatttt-atggtattgaataattttctgtattatatga 29054353  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||    
T  29054354 tttttg-ggtgacgaaatgttattttg-tattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaattgtagttttt 29054451  T
Q  209 gtcctgtcccttg 221  Q
    ||| |||||||||    
T  29054452 gtcatgtcccttg 29054464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 32859961 - 32860136
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||  || |||    
T  32859961 aacagtacaagataggacaacacaatataaggcagaacagcacaatacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatttgatttttg-ggtgac 32860059  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32860060 gaaatgttatttttgtattttagaaaacttgtacgtgagacaaaaggttgtgctgtggtttggcgatggacaaaaat 32860136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8178102 - 8177903
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttat--gttttatatgatttttatgggg 119  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| |||| ||  ||||||| | |||| |  ||||||||||||||||  ||||    
T  8178102 aacaatacaagatagaatagcacaacacaagacagaacagtacatgacaagttttaatagcattgaacatttttttttgttttatatgatttttg-gggg 8178004  T
Q  120 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  8178003 acgaaatgttattttggtattttagacaacttgaacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatca-tttttatcctgtccct 8177905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18597398 - 18597179
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||  | ||| ||||||||||   |||||| ||||| || ||| |||||| ||||  | |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  18597398 aaaacagtaagtattggacagaacagtacaaagcagaacaacacaacactaggtagaacaacacataataaatttttatggtattgaataattttttgtt 18597299  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||||||||||  ||| || || | ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  18597298 ttatatgatttttgaggg-acgaagtactattttagcgttttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaattt 18597200  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||  |||||| |||||||||    
T  18597199 cagattttgtcatgtcccttg 18597179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3379600 - 3379818
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttat-gt 99  Q
    ||||| |||||||  | ||| |||| ||||||| |||| | ||||| |||| | ||||||| ||| | |||||||| |   ||||||| |||||| | ||    
T  3379600 aaaaccgcaagtatcggacagaacaatacaagacagaataacacaacacaatgcagaacagtacatgtcaaattttaag--cattgaacaatttttttgt 3379697  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3379698 tttatatgatttttg-gaggacgaaatgctattttggtatttaagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctatggtttggtgagcgacaaaaata 3379796  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | ||| |||||| |||| ||||    
T  3379797 tcagtttttgtcttgtctcttg 3379818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11675615 - 11675399
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttat-gt 99  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||| ||||||| |||||| ||||| | |||| | || |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| | ||    
T  11675615 aaaacagtaagtattggacataacaatacaagacagaacaacacaacaaaaggtaaaatagcacatgacaaatttctatagcattgaataatttttttgt 11675516  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||||| | |||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  11675515 tttatacgatttttg-ggggacgagatgccatttaggtattttacaaagcttgtacgtgggataaaaagttgtgttatggtttggtgagagacaaaaata 11675417  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  11675416 tcagtttttgtcctgtcc 11675399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 23636133 - 23636323
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| | ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||  ||||||    
T  23636133 aacagtacaagacagaacaacacaacagaaggcagaactgtacatgacagttttttatggcattgaataattttttgttttata-caattttggggggac 23636231  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcct 213  Q
     ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||| ||| ||||    
T  23636232 gaaatgctattttggatttttaaataacttgtacgtgagacaaaaatttgtgttgtggtttaatgaataacaaaaatatgagtttttatcct 23636323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 29814753 - 29814887
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaa-atttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||| || |||    
T  29814753 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttatggcattgagtaatgttttgt 29814852  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttg 135  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  29814853 tttatacgattttt-gggggacaaaatgttattttg 29814887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35004327 - 35004148
Alignment:
Q  42 cacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattt 141  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||  || |||||  |||||| |   |||||||  |||||||| |||||    
T  35004327 cacaatacaaggcagaacaacacataacaaacttttatgatattgaatagtttttggtattatacaattttt-tattgacaaaaatctattttgatattt 35004229  T
Q  142 tagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||| ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||    
T  35004228 tagaaaacttgtacgtgggacaaagagttgtgttgtggttatatgagagacaaaaaatttagtttttgtcttgtctcttgt 35004148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27824824 - 27824698
Alignment:
Q  67 gacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 166  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||   | ||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  27824824 gacaaacttttatggtattgaataatttttgatcttatatgatttttgttgg-acaaaaagctatttttgtattttggataactcgtacgtgggacaaaa 27824726  T
Q  167 agttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  27824725 agttgtgatgtggtataatgagggacaa 27824698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 28502347 - 28502482
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt--atgacattgaataattttatg 98  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||   || |||||| |||| || ||    
T  28502347 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttattggcattgagtaatgttttg 28502446  T
Q  99 ttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttg 135  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  28502447 ttttatacgattttt-gggggacaaaatgttattttg 28502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7396249 - 7396173
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  7396249 ggacaaaacactatttttgtattttagataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgtagtggtttagtgagggacaa 7396173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29203100 - 29202990
Alignment:
Q  67 gacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 166  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| | ||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  29203100 gacaaatttttatgatattgaacaattatttgtcttatatgaatttt-tgtggacaaaatgctcttt-ggtattttaaacaacttgtacttgagagaaaa 29203003  T
Q  167 agttgtgctgtgg 179  Q
    ||||||| |||||    
T  29203002 agttgtgttgtgg 29202990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 32805366 - 32805442
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt 77  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32805366 aaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttt 32805442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 178
Target Start/End: Original strand, 27756314 - 27756370
Alignment:
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtg 178  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  27756314 aaaatgttattttgatattttagacaacttatacgggggacaaaaagttgtgttgtg 27756370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Original strand, 9613946 - 9614058
Alignment:
Q  84 ttgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 183  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| || || ||||| ||   |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||||     
T  9613946 ttgaataatttttggtgttatatgattatt-tgtggacagaagattattttagtattttagacaacttatacgtggaacaaaaaattgtgttgcggttta 9614044  T
Q  184 gtgagggacaaaaa 197  Q
    |||||  |||||||    
T  9614045 gtgagtaacaaaaa 9614058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29424691 - 29424613
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaa 196  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  29424691 ggacaaaaaactatttttgtattttagataacttgtacgtaggtctaaaaattgtgttgtcgtttagtgatggacaaaa 29424613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8342807 - 8342639
Alignment:
Q  28 acaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatg 127  Q
    |||||||| |||| ||||||||||   |||||| | || || ||| |||||||  ||||||||| ||   || |||||||||||||| | ||||||||      
T  8342807 acaagaaaaaacaacacaatacaaaacagaacaacgcaagataaacttttatggtattgaataaattgcggtcttatatgattttta-gtggacaaaaaa 8342709  T
Q  128 ctattttggtatttt-agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaa 196  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  8342708 ctatttttgtatttttaaataacttctatgcaggacaaaaagttgtgttgtggtttattgagtgacaaaa 8342639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4494339 - 4494259
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatg 80  Q
    ||||||| ||||||   ||| ||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  4494339 aaaacagtaagtactagacagaacagtacaggatagaacagcacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatg 4494259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9200491 - 9200439
Alignment:
Q  139 ttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 191  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  9200491 ttttaaacaatttgtatgtgggacaaaaagttgttatatggtttggtgaggga 9200439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31883217 - 31882998
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31883217 aaaatagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacaacacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 31883118  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31883117 ttatacgattttt-gggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggcacaaaaatat 31883019  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| |||||| |||| ||||    
T  31883018 cagtttttgtcgtgtctcttg 31882998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33364973 - 33364754
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33364973 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagagagaacaacccaggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 33364874  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  33364873 ttatacgattttt-gggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgctgaggggcaaaaatat 33364775  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| ||||||||||| ||||    
T  33364774 cagtttttgtcctgtctcttg 33364754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50386651 - 50386432
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50386651 aaaacagcaagtacagtacagaacagtacaaaaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataattttttgtt 50386552  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50386551 ttatacaattttt-ggggaacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgttgaggcacaaaaatat 50386453  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     | | |||||| |||| ||||    
T  50386452 caatttttgtcatgtctcttg 50386432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51259976 - 51259756
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  51259976 aaaacagtaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaaatttttatggcattgagtaattttttgt 51259877  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51259876 tttatatgatttttaaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggtttggtgagggacaaaaata 51259778  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  51259777 tgagtttttgtcctgtcccttg 51259756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47958628 - 47958408
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  47958628 aaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacactacaatacaaggcagaacagcatagaacaaattttttatgtcattgagtaattttttgt 47958529  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47958528 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggtgagggacaaaaata 47958430  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  47958429 tgagtttttgtcctgtcccttg 47958408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20609810 - 20609624
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  20609810 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttatatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 20609712  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20609711 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 20609624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12349367 - 12349147
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||| ||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  12349367 aaaagagcaagtattggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 12349268  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12349267 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgtgctgtggtttggtgagagacaaaaata 12349169  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  12349168 tgagtttttgtcctgtcccttg 12349147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 28675687 - 28675899
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  28675687 aagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacg 28675786  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28675787 atttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 28675885  T
Q  208 tgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| |||||||    
T  28675886 tgtcctatcccttg 28675899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3864870 - 3864655
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||| | || | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  3864870 aaaacagtaagtactgcacagaacagtacaagatagaacattacaacataacgcataacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 3864771  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3864770 tttatatgattttt--ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaata 3864673  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  3864672 tgagtttttgtcctgtcc 3864655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4851652 - 4851434
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  4851652 aaaacagcaagtaccggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaagacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 4851553  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
T  4851552 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgggttggtgagggacaaaa--a 4851456  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  4851455 tgagtttttgtcctgtcccttg 4851434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1344903 - 1344683
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  1344903 aaaatagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacatcacatgacaatttttttatggcattgagtaattttttgt 1344804  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344803 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 1344705  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  1344704 tgagtttctgtcctgtcccttg 1344683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 10747107 - 10747264
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10747107 aaaacagcaagtacagtataaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 10747206  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtg 158  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10747207 ttatacgatttttggggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 10747264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21221553 - 21221336
Alignment:
Q  4 acagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgtttt 102  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  21221553 acagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgtttt 21221454  T
Q  103 atatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatga 202  Q
    |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21221453 atacaatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatga 21221355  T
Q  203 gtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21221354 gtttttgtcctgtcccttg 21221336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Original strand, 3964219 - 3964397
Alignment:
Q  42 cacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtatt 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3964219 cacaatacaaggcagaacagcacaagacaaattttgtatgatattgaataattttatgttttatatgattttt--ggggacgaaatgctattttggtatt 3964316  T
Q  141 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||    
T  3964317 ttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttg 3964397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25927523 - 25927303
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||    
T  25927523 aaaacaacaagtaccggacaaaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtgattttttgt 25927424  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  25927423 tttatacgatttttgagga-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgttttggtaagggacaaaaata 25927325  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  25927324 tgagtttttgtcctgtcccttg 25927303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51925382 - 51925188
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||    
T  51925382 aacagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttg-ggggac 51925284  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
     ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  51925283 gaaatgttattttggtattaaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcc 51925188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 29584764 - 29584984
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||| |||| ||||| |||||||  |||||| ||||||| | |    
T  29584764 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagtacagaacaaattttttattgcattgagtaattttttat 29584863  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29584864 tttatacgattttt-gaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 29584962  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  29584963 tgagtttttgtcctgtcacttg 29584984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26282583 - 26282372
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  26282583 aaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgt 26282484  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26282483 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagagacaaaaata 26282385  T
Q  200 tgagtatttgtcc 212  Q
    | ||| |||||||    
T  26282384 taagtttttgtcc 26282372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 34026590 - 34026776
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  34026590 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 34026688  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34026689 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 34026776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 44116862 - 44117048
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  44116862 agaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 44116960  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44116961 ttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 44117048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2134959 - 2135179
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||||||||||   ||| |||  ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  2134959 aaaacagcaagtactagacagaacgttacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 2135058  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135059 tttatacgatttttgaggg-acaaagtgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 2135157  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  2135158 tgagtttttgttctgtcccttg 2135179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42636575 - 42636379
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaa 123  Q
    ||||| ||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||| | |||||||  ||| ||||    
T  42636575 agtactagacagaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttaaacgatttttgaggg-acaa 42636477  T
Q  124 aatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42636476 aatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttg 42636379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25860596 - 25860397
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||  | | |    
T  25860596 aacagtacaagatagaacagcacaacaaaaggcataacaacacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttg-gagaa 25860498  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25860497 caaaatgctatttcggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccctt 25860398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 40094413 - 40094612
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||  ||| |    
T  40094413 aacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatgcgatttttgaggg-a 40094511  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40094512 caaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 40094611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39053014 - 39052818
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt--atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggg 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||  ||  |||||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||||    
T  39053014 aacagtacaagatagaacagtacaacacaagatagaacaacacatgacaaatttttttatagcattgagtaatttgttgttttatacgatttttg-gggg 39052916  T
Q  120 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39052915 acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc 39052818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 38213243 - 38213463
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||| | |||| || || |  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||    
T  38213243 aaaacagtaagtattgtacagaacagtacaagacaaaacaacataacattaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgt 38213342  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  38213343 tttatacgatttttg-ggggacaaaatggtattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttcgtgagtgacaaaaata 38213441  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  38213442 tgagtttttgtcctgtctcttg 38213463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53557955 - 53557775
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttg 135  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||    
T  53557955 aacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-gaaggacaaaatgctattttg 53557857  T
Q  136 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53557856 gtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaactatgagtttttgtcctgtcc 53557775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 54622926 - 54622772
Alignment:
Q  66 ggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaa 165  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54622926 ggacaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttg-ggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaa 54622828  T
Q  166 aagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54622827 aagttgtgttgtggtttcgtgagcgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 54622772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 221
Target Start/End: Original strand, 24571219 - 24571390
Alignment:
Q  50 aagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaa 148  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24571219 aaggcagaacagtacatgacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttattcgatttttg-ggggacaaaatcctatttttgtattttagacaa 24571317  T
Q  149 cttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24571318 cttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 24571390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 29645976 - 29646175
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttat-gttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||| | |||| | |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||  |||||    
T  29645976 aacaatacaagacaaaacaacacaacataaggtataacatcacaagacaaatttttatggcattaaataatttttttgttttatacgatttttg-gggga 29646074  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  29646075 caaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatatgtttttgtcctatccctt 29646174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 21373882 - 21374039
Alignment:
Q  62 cacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggga 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||  |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21373882 cacaggacaaatttttatggcattgaataatttt-tattttatacgatttttg-gccgaagaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggga 21373979  T
Q  162 caaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21373980 caaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttg 21374039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 5442180 - 5442376
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  5442180 aaaatagcaagtactggacagaacagtacaatttagaacagtacaatacaaggtataacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgt 5442279  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaa 197  Q
    |||||| |||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5442280 tttatacgatttttgaggg-ataaaatgctattttgatattttagacagcttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaa 5442376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 20255007 - 20255153
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20255007 tttttatggcattgagtaattttttgttttataagatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgta-gtgggacaagaagttgt 20255104  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20255105 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttg 20255153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Original strand, 51296544 - 51296686
Alignment:
Q  74 ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  51296544 ttttatggtattgagtaattttttgttttatacgattttt-tggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttaggacaaaaaattgtg 51296642  T
Q  174 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51296643 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc 51296686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3867797 - 3867648
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagaca 147  Q
    |||||| | |||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3867797 acaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataatttcttgttttatatgatttttg-ggggacaaaatgctattttggtgttttagaaa 3867699  T
Q  148 acttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3867698 acttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 3867648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49749028 - 49748891
Alignment:
Q  79 tgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtg 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49749028 tgacattgaataattttttgttttatacgatttttg-ggggacgaaatgttattttggtatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 49748930  T
Q  179 gtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  49748929 gtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcc 49748891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41695042 - 41694925
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41695042 agaacagcacagaacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgattttt-gggggacaaaatgctatttcagtattttagacaacttgta 41694944  T
Q  155 cgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
     ||||||||||||||||||    
T  41694943 tgtgggacaaaaagttgtg 41694925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 19906766 - 19906871
Alignment:
Q  116 ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  19906766 ggggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgt 19906865  T
Q  216 cccttg 221  Q
    ||||||    
T  19906866 cccttg 19906871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22484938 - 22484742
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  22484938 aaaacagtaagtactggacataacagtataagataggacaacacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttttatggtattgaataattttctgta 22484839  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||| ||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||    
T  22484838 ttatataatttttg-ggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggcaaggaacaaaaat 22484742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45691074 - 45690886
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||| | |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||    
T  45691074 aacagtacaagacagaacaacacaatataagatagaataacacatgacaaatttttatagcattgaataatttt-tgttttatacgatttttg-gaggac 45690977  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||     |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  45690976 gaaatgcgattttggtattttagacaacttatgcgtgagacaaaaagttgtgctg-----tggtgagggagaaaaatatcagtttttgtcctgtcc 45690886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53046837 - 53046667
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  53046837 aaaacaacaagtactgaacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 53046738  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctg 176  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  53046737 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgctg 53046667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 215
Target Start/End: Original strand, 50678809 - 50678901
Alignment:
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50678809 aaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatcagtttttgtcctgt 50678901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3695426 - 3695301
Alignment:
Q  63 acaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggga 161  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3695426 acaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttg-ggggataaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtggga 3695328  T
Q  162 caaaaagttgtgctgtggtttggtgag 188  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3695327 caaaaggttgtgatgtggtttggtgag 3695301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 25954407 - 25954554
Alignment:
Q  67 gacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | |||||  |||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  25954407 gacaaatttttatgatattgaataattttttattttatacgcttttt--ggggacgaaatgttatattagtattttaaacaacttatatgtgagacaaaa 25954504  T
Q  167 agttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25954505 agttgtgctgtaatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcgtgtc 25954554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 217
Target Start/End: Original strand, 24721470 - 24721590
Alignment:
Q  97 tgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaa 196  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||    
T  24721470 tgttttatatgctttttggggggatgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttgttgaggtaccaaa 24721569  T
Q  197 atatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    || | ||| ||||||||||||    
T  24721570 attttagtttttgtcctgtcc 24721590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 194
Target Start/End: Original strand, 44267691 - 44267824
Alignment:
Q  60 agcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgg 159  Q
    |||||| |||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  44267691 agcacaagacaaatttttatcgtattcaataattttttgttttatatgatttttg-gatgacgaaatgctatttttgtattttagacaatttgtatgtgg 44267789  T
Q  160 gacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    || |||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  44267790 gataaaaagttatgttgtggtttggcgagggacaa 44267824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Original strand, 52300442 - 52300544
Alignment:
Q  117 gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  52300442 gggacgaaatgatattttggtgttttagacaacttgtac-tgggacaaaaaattgcgttgtggtttggtgatggacaaaaatttcagtttttgtcctgtc 52300540  T
Q  217 cctt 220  Q
    ||||    
T  52300541 cctt 52300544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 220
Target Start/End: Original strand, 6179376 - 6179534
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||       |    
T  6179376 agaacaacacaagacgaatttttatggtattgaataattttctttattatatgattttt-tggtgacgaaatgttatttttgtattttagac-------a 6179467  T
Q  155 cgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga-gggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  6179468 cgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttggcgaggggacaaaaattacagtttttgtcctgtccctt 6179534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34351521 - 34351371
Alignment:
Q  43 acaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtatttt 142  Q
    |||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||   ||||||||||||   || || || ||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  34351521 acaatataaggcagaacaacatatgacgaatttttatagtattgaataatttatggtcttgtacgattttt-tgtggataaaatgttattttgatatttt 34351423  T
Q  143 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34351422 agacaacttgtatgtgcgacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaa 34351371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 44000217 - 44000346
Alignment:
Q  67 gacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 166  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||  || ||||| |||||||  | ||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44000217 gacaaacttttatggtattgaataatttttggtcttatacgatttttg-gtggacaaaaaactatttttgtatttcagataacttgtacgtgggacaaaa 44000315  T
Q  167 agttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaa 197  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  44000316 aattgtgatgtggtttagtgagggaaaaaaa 44000346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39215547 - 39215446
Alignment:
Q  119 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccc 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||||  |||||| | ||| |||||| ||||||    
T  39215547 gacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattatgatttggttcggtaaggggtaaaaatttcagtttttgtcttgtccc 39215448  T
Q  219 tt 220  Q
    ||    
T  39215447 tt 39215446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 43175458 - 43175571
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||||| |||    
T  43175458 aaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtataatacaagacagaacagcacacgataaattttttatggtattgagtaattttttgt 43175557  T
Q  100 tttatatgattttt 113  Q
    |||||| |||||||    
T  43175558 tttatacgattttt 43175571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 32621776 - 32621924
Alignment:
Q  18 acaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgattttt-atg 116  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||    
T  32621776 acaaaacagtacaagacagaatagcacaatataagacaaaacaacattggataaattgttatgctattgaataattttttgttgtatacaatttttgatg 32621875  T
Q  117 gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    |  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32621876 g--acaacatattattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaa 32621924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 151
Target Start/End: Original strand, 25395570 - 25395653
Alignment:
Q  67 gacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaactt 151  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25395570 gacaaacttttatgacattgcattattttttgttttatacgattttta-gtgaacaaaatgttattttggtattttagacaactt 25395653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8067152 - 8067056
Alignment:
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| || || ||| |||| ||||| ||||    
T  8067152 ttatatgatttcta-gtggacaaaaagctattttgatattttatataacttgtacgtgtgacaaaaagttgtactatgattttgtgaaggacacaaat 8067056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Original strand, 26847269 - 26847381
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  || |||||| || ||| || |||||||   |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  26847269 agaacaacacaagacaaatttttatggtattgaataattgttggtgttatataatgtttttgtggacaaatgtccttttgggtattttagacaacttgta 26847368  T
Q  155 cgtgggacaaaaa 167  Q
     ||||||||||||    
T  26847369 tgtgggacaaaaa 26847381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 41695075 - 41695032
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcaca 45  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41695075 aaaacagcaagtacag-acaaaacagtacaagaaagaacagcaca 41695032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8648625 - 8648538
Alignment:
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| |||| || ||| |||| ||| | ||| |||||| ||||    
T  8648625 tattttggtattttagacaatttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtagtttagttaggaacaagaatttcagtttttgtcatgtc 8648538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14155528 - 14155461
Alignment:
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaa 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||    
T  14155528 tattttgatattttagacaacttgtacttgagacaaaaagttgtgttatgatttagtgagggataaaa 14155461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28625060 - 28624919
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac-aaaatgctattttggtattttagacaacttgt 153  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |  ||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||| |    
T  28625060 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataattttttgtcttataagatttttg-gtagactaaaatg--atttttgtattttagataacttat 28624964  T
Q  154 acgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||| ||||||||| || || |||| |||  ||||||||||||||    
T  28624963 acgtaggacaaaaatttatgttgtgctttaatgagggacaaaaat 28624919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53046607 - 53046559
Alignment:
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  53046607 aaatgctattttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgctg 53046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17264741 - 17264703
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 166  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17264741 ctatttttgtattttacacaacttgtacgtgggacaaaa 17264703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 187
Target Start/End: Original strand, 23322158 - 23322216
Alignment:
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga 187  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  23322158 tattttgatatattagacaacttgtacgagagataaaaagttgtgttgtggtttagtga 23322216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 42547522 - 42547464
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataatttt 95  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42547522 aacaacacgatacaaggtagaacaacacatgacaaacttttatgatattgaataatttt 42547464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 169
Target Start/End: Original strand, 51813399 - 51813449
Alignment:
Q  119 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagt 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  51813399 gacaaaatgttattttggtattttatacaacttgtatttggaacaaaaagt 51813449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 182
Target Start/End: Original strand, 8253684 - 8253744
Alignment:
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||  |||||||    
T  8253684 aaaatgttattttggtattttagacaacttttaattggggcaaagagttgtgtcgtggttt 8253744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31004030 - 31004246
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31004030 aaaacagcaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacagcgcaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatggcattgaataattttttgtt 31004129  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31004130 ttataggattttt-gggggacgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaacat 31004228  T
Q  201 gagtatttgtcctgtccc 218  Q
     ||| |||||||||||||    
T  31004229 cagtttttgtcctgtccc 31004246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 38663030 - 38663227
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38663030 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 38663129  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38663130 ttatacgattttt-gagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggacaaaaata 38663227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 50304549 - 50304758
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50304549 aaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 50304648  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50304649 ttatacgattttt-ggaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttaaacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttgcagagggacaaaaatat 50304747  T
Q  201 gagtatttgtc 211  Q
     ||| ||||||    
T  50304748 cagtttttgtc 50304758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 845001 - 844781
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  845001 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 844902  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844901 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 844803  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  844802 tgagtttttgtcctgtcccttg 844781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 42510422 - 42510643
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  42510422 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgt 42510521  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42510522 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagagacaaaaata 42510620  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  42510621 tgagtttttgtcctgtcccttgt 42510643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16386751 - 16386971
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  16386751 aaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaatacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 16386850  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16386851 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 16386949  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  16386950 tgagtttttgtcctgtcccttg 16386971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42513039 - 42512827
Alignment:
Q  8 caagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  42513039 caagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataattttttgttttatacg 42512940  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  42512939 attttt-gggggacaaaattctattttgatattttagacaatttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttt 42512841  T
Q  208 tgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  42512840 tgtcctgtctcttg 42512827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6711323 - 6711103
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  6711323 aaaacatcaagtactggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 6711224  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6711223 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 6711125  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  6711124 tgagtttttgtcctgtcccttg 6711103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 12890156 - 12890355
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |    
T  12890156 aacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-a 12890254  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12890255 caaaatgctattttggtatcttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 12890354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35387588 - 35387369
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| || | ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  35387588 aaaacagcaagtactggacataataatacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 35387489  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387488 tttatacgatttttgaggg-ataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 35387390  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  35387389 tgagtttttgtcctgtccctt 35387369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 32270255 - 32270470
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||     |||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  32270255 aaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaag-----acagaataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 32270349  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270350 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 32270448  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  32270449 tgagtttttgtcctgtcccttg 32270470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24339914 - 24339695
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  24339914 aaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgt 24339815  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg-tttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24339814 tttatacgatgtttg-ggggacaa--tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgttgtggttttggtgagggacaaaaat 24339718  T
Q  199 atgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  24339717 atgagtttttgtcctgtcccttg 24339695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26118458 - 26118276
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  26118458 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 26118360  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26118359 tggtattttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc 26118276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 41972809 - 41973028
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||    
T  41972809 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattaagtaattttttgt 41972908  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41972909 tttatacgattttga--gggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtagtgtggtttggtgagggacaaaaata 41973006  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  41973007 tgagtttttgtcatgtcccttg 41973028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16451024 - 16451244
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| || |||| ||| || |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  16451024 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacatggcagaatagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 16451123  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16451124 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaata 16451222  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  16451223 tgagtttttgtcctgtcccttg 16451244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17887844 - 17888065
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| || ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||    
T  17887844 aaaacagtaagtacgggacagaatagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaatttgttgt 17887943  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17887944 tttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaata 17888043  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  17888044 tgagtttttgtcctgtcccttg 17888065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45491152 - 45490932
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  45491152 aaaacagcaattactggacagaacaatataagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttgtatggcattgagtaattttttgt 45491053  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45491052 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 45490954  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  45490953 tgagtttttgtcatgtcccttg 45490932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16476431 - 16476212
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||| || |||| |||||| ||| | | |||| | |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16476431 aaaacagtaagtactggacataacaatataagatagaacaacacgacataaggcataacaccacatgacaaatttgtatggcattgaataattttatgtt 16476332  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16476331 ttatacaatttttg-ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggtttggtgagggacaaaaatat 16476233  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  16476232 gagtttttatcctgtcccttg 16476212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 39281792 - 39282011
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| || |||| |||| |||||||||||| |||| | | |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39281792 aaaacagtaagtactggacagaatagtataagatagaacagcacaacacaatgcataacaacacatgacaactttgtatgacattgaataattttatgtt 39281891  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39281892 ttatacgatttttg-gaggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatat 39281990  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  39281991 gagtttttgtcctgtcccttg 39282011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1351711 - 1351492
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| ||||||   ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || |||| |||    
T  1351711 aaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtattttt-tgt 1351613  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1351612 tttatatgatttttgagag-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 1351514  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||    
T  1351513 tgagtttttgtcctgttccttg 1351492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28340580 - 28340360
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  28340580 aaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaatttttttatggcattgagtaattttttgt 28340481  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28340480 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagggacaaaaata 28340382  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  28340381 tgagtttttgtcttgtcccttg 28340360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 51264396 - 51264612
Alignment:
Q  5 cagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgtttta 103  Q
    |||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  51264396 cagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgtttta 51264495  T
Q  104 tatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgag 203  Q
    || ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51264496 tacgatttttaaagg-acaaaatgctattttagtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgag 51264594  T
Q  204 tatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | |||||| |||||||||    
T  51264595 tttttgtcttgtcccttg 51264612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30105923 - 30105737
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  30105923 agaacagtacaacacaaggcagaacaacactggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 30105825  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30105824 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 30105737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6029543 - 6029358
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt 134  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||    
T  6029543 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttg-ggggacgaaatgttatttt 6029445  T
Q  135 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  6029444 ggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttg 6029358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 50540241 - 50540461
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| ||||||   ||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||  |||    
T  50540241 aaaacagtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacacgtcagaacagcacagggcaaattttttatggcattgagtaatttgttgt 50540340  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  50540341 tttatatgatttttg-ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgaaggacaaaaata 50540439  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  50540440 tgagtttatgtcctgtcccttg 50540461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32289600 - 32289401
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| |||| || | || | |||  |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |    
T  32289600 aacagtacaagatagaagagtataacataagccagaacaacataggataaatattttatgacattgaataattttatgttttatataatttttgaggg-a 32289502  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32289501 caaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtccctt 32289402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13994343 - 13994132
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||||| ||||||||  | |||| |  ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13994343 aagtacagaacaaaacaacataagacaacacaacacaatacaaggcagaacaacacaagacaaattttgtatgatattgaataattttatgttttatatg 13994244  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  13994243 attttt--ggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttt 13994146  T
Q  208 tgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| || |||||    
T  13994145 tgtccagttccttg 13994132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 7183815 - 7184035
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  7183815 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaatacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 7183914  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7183915 tttatacgatttttgagag-acaaaatactatattggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaata 7184013  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  7184014 tgagtttttgtcctgtcccttg 7184035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 25539761 - 25539968
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| | ||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||    
T  25539761 aagtactggacataacagtacaagacataacaatacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggctttgaataattttttgttttatacga 25539860  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25539861 tttttg-ggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagttttt 25539959  T
Q  209 gtcctgtcc 217  Q
    ||| |||||    
T  25539960 gtcttgtcc 25539968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 217
Target Start/End: Original strand, 16437317 - 16437475
Alignment:
Q  58 acagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16437317 acagtacaggacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-gaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 16437415  T
Q  158 gggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16437416 gggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc 16437475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44738318 - 44738099
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||| |||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  44738318 aaaacagcaagtactagacagaacagtagaagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 44738219  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  | |||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44738218 tttatacgattttt--gaggaataaaaactattttgctattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 44738121  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  44738120 tgagttttggtcctgtcccttg 44738099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 222
Target Start/End: Original strand, 45658755 - 45658939
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    |||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  45658755 aacagcacaacacaagacagaatagcacatgacaaatttttatggctttgaataattttttgttttatatgatttttg-ggggacgaaatgctattttgg 45658853  T
Q  137 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||    
T  45658854 tatttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagcgacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgt 45658939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11772900 - 11772693
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  11772900 aagtactggacataacagtacaagacataacaacacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggttttgaattattttttgttttatacga 11772801  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  |||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11772800 tttttg-ggggacgaaatactattttggtatttaaaacaatttgtaggtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagttttt 11772702  T
Q  209 gtcctgtcc 217  Q
    ||| |||||    
T  11772701 gtcttgtcc 11772693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17327905 - 17327706
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| | |||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||||    
T  17327905 aacagtataagatagaacagtacaatacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcgttgagtaatttgttgttttatacgatttttg-gggga 17327807  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17327806 caaaatattattttggtattttagataatttgtacatgagacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 17327707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41968126 - 41967906
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||| | | ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||    
T  41968126 aaaacagtaagtgctggacagaacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcggaacaatacatgacaaattttttatgacaatgagtaattttttgt 41968027  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||  ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41968026 tttatacaatttttg-ggagacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaata 41967928  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||| ||||    
T  41967927 tgagtttttgtcttgtctcttg 41967906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38087264 - 38087057
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||   |    
T  38087264 aagtactggacataacagtacaagacagaacagtacaacataaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgaataatattttgctttatgcaa 38087165  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  38087164 tttttg-gggaacgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacttgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtgaaggacaaaaatatgagttttt 38087066  T
Q  209 gtcctgtcc 217  Q
    ||| |||||    
T  38087065 gtcatgtcc 38087057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 46154797 - 46155022
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||||| | || |||||  | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  46154797 aaaacagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtataacacaagacataacggcacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgt 46154896  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgc-------tgtggtttggtgagggac 192  Q
    |||||| |||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||    
T  46154897 tttataagattttt-gaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtgctgtagtttgtagtttggtgagggac 46154995  T
Q  193 aaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  46154996 aaaaatatgagtttttgtcctgtccct 46155022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1601065 - 1601267
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaa-----gggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattt 94  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     || |||||| |||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  1601065 aaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagaaagaacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcaatgagtaattt 1601164  T
Q  95 tatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    | |||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1601165 tttgttttgtacgatttttg-gtggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 1601263  T
Q  195 aaat 198  Q
    ||||    
T  1601264 aaat 1601267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51703439 - 51703221
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  51703439 aaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatataacagaacaacacaaggcaaaacaatacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 51703340  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||  ||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  51703339 tttataccattttga--gggacaaaatgttatttttgtattttagacaacatgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtgg-ttggtgaggaacaaaaata 51703243  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  51703242 tgagtttttgttctgtcccttg 51703221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15540165 - 15539947
Alignment:
Q  2 aaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttt 101  Q
    |||||| |||||| | ||| ||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  15540165 aaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataattttttgttt 15540066  T
Q  102 tatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatg 201  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |     
T  15540065 tatatgatttttg-ggggacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtatgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaagacaaaagtttc 15539967  T
Q  202 agtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||  ||||||||||| ||||    
T  15539966 aggttttgtcctgtctcttg 15539947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 10384265 - 10384480
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| |  || ||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  10384265 aaaacagtaagtactgggcataacagtacaagaccgaacagcacaacacagggcaaaacaacactggacaattttttattgcattgaataattttttgtt 10384364  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10384365 ttataagatttttg-ggggacgaaatgttattttgaatttttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaaggacaaaaatat 10384463  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||| |||||| |||||    
T  10384464 gagtttttgtcttgtcc 10384480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26765066 - 26764856
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||  ||||||||  ||||||       
T  26765066 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcagaacaatataggacaaatttttatagcattgaatttttttat--- 26764970  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
      ||| |||||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26764969 --atacgatttttgaggg-acgaaatattattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttcggtgagggacaaaaatat 26764873  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcc 217  Q
     ||| ||||||||||||    
T  26764872 aagtttttgtcctgtcc 26764856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6144241 - 6144043
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||||||||||| ||  || ||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||    
T  6144241 aacagtacaagatagggcaacacaacataaggcagaacatcacaagacaaatttttatggtattgaataattttctgttttatatgatttttg-ggtgac 6144143  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  6144142 aaaatgttatttttgtgttttagacaacttctacgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttgccgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttg 6144043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49303585 - 49303410
Alignment:
Q  46 atacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttag 144  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  49303585 atacaaggcagaacatcacatgacaactattttacgtcattgagtaattttttgttttatacgattttt--ggggacaaaatgttattttagtattttag 49303488  T
Q  145 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  49303487 acaacttgtacgtaggataaaaaattgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttctcttgtcccttgt 49303410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3415058 - 3414912
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttat-gttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttg 171  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||     
T  3415058 tttttatggcattgagtaatttttttgttttatatgatttttg-ggggacaaaatgctattttggtattttaaacaactagtacgtgggataaaaaatta 3414960  T
Q  172 tgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3414959 tgatgtagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccct 3414912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42705442 - 42705312
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42705442 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatttttg-ggggacaaaatgctattttgacatttcagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgt 42705344  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42705343 gttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 42705312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50382608 - 50382464
Alignment:
Q  72 atttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttg 171  Q
    |||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50382608 atttttatggtattgaataatattttgttttatatgatttttgaggg-acaaaatgttatttttgtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttg 50382510  T
Q  172 tgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  50382509 tgttgtggtttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcc 50382464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16704623 - 16704843
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa-ttttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||  |||||| |||||| || || | || | |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||    
T  16704623 aaaacagaaagtactggacataacaacacaagacagaacaacaaaacataaagcagaatagtacaagacaaatttttatggcattaaataaattttttgt 16704722  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16704723 tttatacgatttttg-gaggacaaaaagctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaagagttgtgatgtggtttggtaagggacaaaaata 16704821  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |  || |||||| |||||||||    
T  16704822 tatgtttttgtcgtgtcccttg 16704843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Original strand, 5109694 - 5109845
Alignment:
Q  67 gacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 166  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||| | |||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5109694 gacaaatttttacgacattgatttttttttt-ttttatacaatttttg-ggggacaaaatgttattttgc-attttagacaacttgtactttggacaaaa 5109790  T
Q  167 agttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5109791 agttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaacatgagtttttgtcctgtcccttg 5109845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20495134 - 20495006
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  20495134 agaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatactatttttgaggg-acaaaatgctattt 20495036  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20495035 tggtattttagacaacttgtacgtgggaca 20495006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25343431 - 25343286
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||  ||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  25343431 agaacaacacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgctttatgcgatttttgaggg-acgaaatactattttggatttttggacaacttgta 25343333  T
Q  155 cgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatg 201  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||    
T  25343332 cgtgcgacaaaaagttgtactatggtttagtgaaggacaaaaatatg 25343286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 34663858 - 34664012
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| | |||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||| |||||    
T  34663858 agaacagtacaacataaggtagaagagcacatgacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatatgatttttgagtg-acaaaatgttattt 34663956  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 189  Q
    || |||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34663957 tgatattttagacaatttataagtgggtcaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 34664012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 570301 - 570482
Alignment:
Q  18 acaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgg 117  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| | || | |||||| |||| || |||||||||||  | |||||| |||| | | |||||  ||||||  |     
T  570301 acaaaatagtacaagatagaacaacacaacataaagcagaacaacacaagataaatttttatggtactgaatacttttttatcttatacaatttttg-gt 570399  T
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgc--tgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  570400 ggaaaaaatgttattttgatattttagacaacttatacgcgagacaaaaagttgtgcattgtggtttggtgagggacaaaaat 570482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32468025 - 32467910
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32468025 tttttatggtattgactaattttttgtcttatatgattttt-tgtgaacaaaaaactattttgatattgtagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgt 32467927  T
Q  173 gctgtggtttggtgagg 189  Q
    ||  |||||| ||||||    
T  32467926 gcgttggtttagtgagg 32467910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Original strand, 6771365 - 6771486
Alignment:
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||| |    
T  6771365 ttatacgatttttttatggacaaaatattattttgatattttagtcaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtgatttagtgagtgacaagaattt 6771464  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
     ||| |||||| ||||||||||    
T  6771465 tagtttttgtcttgtcccttgt 6771486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46815889 - 46815816
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 191  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  46815889 ggacaaaatgttattttggtattttagacaactagtacgtgggaaaaaaggttgtgatatggtttagtgaggga 46815816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799604
Alignment:
Q  145 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtc 211  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23799670 acaacttaaacgtgcgataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtc 23799604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23799740 - 23799670
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaa 71  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23799740 aaaacagtaagtactgtatagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacatgacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 504549 - 504448
Alignment:
Q  120 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||| | | ||| |||||  |||||||    
T  504549 acaaaaagctactttggtattttagacaacttctatgtgggacaaaaaattgtgttatggtttagtgagagacaaaattttcagtttttgtgttgtccct 504450  T
Q  220 tg 221  Q
    ||    
T  504449 tg 504448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2761749 - 2761643
Alignment:
Q  83 attgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||  ||||||| |||||||||| || |||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  2761749 attgaataatttttggttttatatgatttt--tgttgacaaaaatctatttttgtattttagataatttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggttt 2761652  T
Q  183 ggtgaggga 191  Q
     ||||||||    
T  2761651 agtgaggga 2761643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Original strand, 7837149 - 7837226
Alignment:
Q  120 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaa 197  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  7837149 acaaaatactattttgatattttagacaacttgtctgtgagacaaaaagttgtgatgtgatttggtaatggacaaaaa 7837226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16643345 - 16643272
Alignment:
Q  115 tggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgag 188  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  16643345 tggggacgaaatggtatttttgtattttagacaacctgtatgtgggacaaaaagttgtgtcgtgatttggtgag 16643272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 26733579 - 26733668
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||| | ||| |||||| |||||    
T  26733579 ctattttggtattttagacaacttgtacatgaggcaaaaagttgtgttatggtttagtgggggacaagaatttcagtttttgtcatgtcc 26733668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 51374556 - 51374439
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt 134  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||   ||||||  |||||||    
T  51374556 agaacagcacaacacaagttagaacagcagatggcaaaattttatgatattgaataattttttattttataagatttttttgtatacaaaaaactatttt 51374457  T
Q  135 ggtattttagacaacttg 152  Q
      ||||||||||||||||    
T  51374456 tatattttagacaacttg 51374439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 40610739 - 40610809
Alignment:
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40610739 caaaatgttattttggtattttagacaacttatatatgtgataaaaagttgtgttgtggtttgatgaggga 40610809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Original strand, 21071661 - 21071726
Alignment:
Q  40 agcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttata 105  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21071661 agcacaacacaaggcagaacaatacatgacaaatttttattacattgaataattttttgttttata 21071726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 194
Target Start/End: Original strand, 39792826 - 39792897
Alignment:
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39792826 aaatgttattttattattttagacaatttgtacgtgaaacaacaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaa 39792897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 173
Target Start/End: Original strand, 46447678 - 46447733
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46447678 ggacaaaagactattttgatattttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtg 46447733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47242773 - 47242621
Alignment:
Q  18 acaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgg 117  Q
    ||||||||  |||||| ||| || |||| ||||||| |||||  |||| ||||||  |||| || |||||||||||||   | |||||  |||||||||     
T  47242773 acaaaacaacacaagagagaccaacacattacaaggcagaacgacacatgacaaacatttacgatattgaataatttttgatcttatacaatttttatgt 47242674  T
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
      ||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  47242673 --acaaaagactattttggtattttagacaactaacacgtgagacaaaaagttgt 47242621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 52030435 - 52030330
Alignment:
Q  47 tacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagac 146  Q
    ||||||| | ||||||||| | |||| ||||| |  ||||||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  52030435 tacaaggcataacagcacatggcaaacttttacggtattgaatcattttttgttatatatgattttt-tgtggacaaaaaactatttttgtattttagat 52030337  T
Q  147 aacttgt 153  Q
    |||||||    
T  52030336 aacttgt 52030330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 221
Target Start/End: Original strand, 17291612 - 17291695
Alignment:
Q  137 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||    
T  17291612 tattttatataacttgtacgagggacaaaaagttttgttgtggtttagtg-gggacaaaaatttatgtttttgtcctgtctcttg 17291695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20495005 - 20494965
Alignment:
Q  181 ttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20495005 ttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 20494965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 178
Target Start/End: Original strand, 33316435 - 33316491
Alignment:
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtg 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  33316435 aaaatgctatttttgtaatttagacaacttgtacgtgtaagaaaaagttgtgttgtg 33316491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34284058 - 34283912
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||| ||| ||  || || ||||||| |  ||||||||  ||||||||     
T  34284058 aacatcacaatatatgggagaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataagtttttgccttgtacgattttt-tatggacaaaagactattttga 34283960  T
Q  137 tattttagaca--acttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    ||||||| | |  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  34283959 tattttatatataacttgtacgtgagataaaaagttgtgttgtggttt 34283912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 154
Target Start/End: Original strand, 30105007 - 30105041
Alignment:
Q  120 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30105007 acaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 30105041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21763252 - 21763187
Alignment:
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  | ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21763252 tattttggtattttagacaattcgtattttggctaaaaagttgtgatgtagtttggtgagggacaa 21763187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20986397 - 20986333
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    ||||||||| |||||||  |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20986397 ggacaaaatactatttttctattgtaaacaacttattcgtgggacaaaaagttgtgttatggttt 20986333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8673272 - 8673052
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  8673272 aaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaaatttttatggcattgagtaattttttgt 8673173  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8673172 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 8673074  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  8673073 tgagtttttgtcctgtcccttg 8673052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22999146 - 22999366
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22999146 aaaacagcaagtacaatacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacagaacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 22999245  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22999246 ttatacgattttt-ggaggacaaaatgctattttgatattttagacaagttgtacgtgggacaaaaaagttttgctatggtttgctgagggacaaaaata 22999344  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | ||| ||||||||||| ||||    
T  22999345 tcagtttttgtcctgtctcttg 22999366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32303802 - 32303588
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  32303802 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 32303703  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32303702 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 32303604  T
Q  200 tgagtatttgtcctgt 215  Q
    ||||| ||||||||||    
T  32303603 tgagtttttgtcctgt 32303588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7591641 - 7591444
Alignment:
Q  23 acagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggaca 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  7591641 acagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgattttt-gggggaca 7591543  T
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7591542 aaatgctattttgatattttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttg 7591444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 41548529 - 41548726
Alignment:
Q  23 acagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggaca 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  41548529 acagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgattttt-gggggaca 41548627  T
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41548628 aaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtctgctgaggtacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttg 41548726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 45446343 - 45446563
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  45446343 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 45446442  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45446443 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaacaaaaata 45446541  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  45446542 tgagtttttatcctgtcccttg 45446563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 10466979 - 10467172
Alignment:
Q  27 tacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaat 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  10466979 tacaggaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacatagaataattttttgttttatacgatttttg-ggggacaaaat 10467077  T
Q  127 gctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  10467078 gctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttg 10467172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 27103847 - 27104067
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  27103847 aaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 27103946  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27103947 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaata 27104045  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  27104046 tgagtttttgtcatgtcccttg 27104067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29563443 - 29563223
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  29563443 aaaacagcaagtattgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 29563344  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29563343 tttatacgatttttgaggg-acaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 29563245  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  29563244 tgagtttttgtcctgtcccttg 29563223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 34063016 - 34063236
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  34063016 aaaaccgcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagcacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgt 34063115  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34063116 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaata 34063214  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  34063215 tgagtttttgtcctgtcccttg 34063236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31513800 - 31513580
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  31513800 aaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 31513701  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31513700 tttatacgattttt-gaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctaggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 31513602  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  31513601 tgagtttttgtcctgtcccttg 31513580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32020218 - 32020006
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  32020218 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 32020119  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32020118 tttatacgatttttgaggg-acaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 32020020  T
Q  200 tgagtatttgtcct 213  Q
    ||||| ||||||||    
T  32020019 tgagtttttgtcct 32020006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 4052404 - 4052588
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  4052404 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttt--gttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattt 4052500  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4052501 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 4052588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 41709665 - 41709880
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  41709665 aaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaatttttttatggcattgagtaattttttgt 41709764  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709765 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgttggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 41709863  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||| |||||||||||    
T  41709864 tgagtttttgtcctgtc 41709880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 6386464 - 6386676
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  6386464 aaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaaaacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 6386563  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6386564 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 6386662  T
Q  200 tgagtatttgtcct 213  Q
    ||||| ||||||||    
T  6386663 tgagtttttgtcct 6386676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 45113944 - 45114163
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| | |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45113944 aaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagagcagcacaacacaaggcataacaacacatgataaatttgtatgacattgaataattttatgtt 45114043  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45114044 ttatacgatttttg-gaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctatgacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatat 45114142  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| |||||||| |||||||    
T  45114143 gagtttttgtcctctcccttg 45114163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30543205 - 30543023
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||    
T  30543205 agaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttg-ggggacaaaatgttattt 30543107  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30543106 tggtattttagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc 30543023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37664466 - 37664280
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||    
T  37664466 agaacagtacaacacaatgcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagcg-acaaaatgctattt 37664368  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37664367 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 37664280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29672540 - 29672320
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| ||| || | ||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  29672540 aaaacagtaagaactggacagaacaatacaagatagaacagtgcaacacaagacagaacaacacaggacaaatttttcatggcattgagtaattttttgt 29672441  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29672440 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 29672342  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  29672341 tgagtttttgtcctgtcccttg 29672320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5969060 - 5968861
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |    
T  5969060 aacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-a 5968962  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5968961 caaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 5968862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 39642787 - 39642991
Alignment:
Q  16 gtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttat 115  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||      
T  39642787 gtacagaatagtacaagaaagaacaacacaatgtaagagagaacatcacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacaatttttg- 39642885  T
Q  116 ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||    
T  39642886 ggggatgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgggacagaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttatcttgt 39642985  T
Q  216 cccttg 221  Q
    ||||||    
T  39642986 cccttg 39642991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15001355 - 15001569
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  15001355 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggtattgaataattttctgt 15001454  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15001455 tttatatgatttttg-ggggacaaa-tgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatt 15001552  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtc 216  Q
    | ||| ||||| |||||    
T  15001553 tcagtttttgttctgtc 15001569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37618600 - 37618393
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |    
T  37618600 aagtactggacataacagtacaaaacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatgtttatggcattgaataattttttgttttatacaa 37618501  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37618500 tttttg-ggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagttttt 37618402  T
Q  209 gtcctgtcc 217  Q
    |||||||||    
T  37618401 gtcctgtcc 37618393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13407152 - 13406932
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  13407152 aaaacagtaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatagcattgagtaattttttgt 13407053  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13407052 tttatacgatttttg-gggcacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaaattatgctgtggtttggtgagggacaaaaata 13406954  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||| |||| |||||    
T  13406953 tgagtttttgttctgttccttg 13406932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 31731952 - 31732172
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| || |||| |||| ||||||| |||| |||||  |||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  31731952 aaaacagtaagtactggacagaaaagtataagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgt 31732051  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31732052 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaata 31732150  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  31732151 tgagtttttgtcatgtcccttg 31732172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 34101404 - 34101616
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||| |    
T  34101404 aagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacaggacaaattttttatggcgttgagtaattttttgttttatacg 34101503  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34101504 atttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaaaaaaaagttatgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 34101602  T
Q  208 tgtcctgtcccttg 221  Q
    |||  |||||||||    
T  34101603 tgtgttgtcccttg 34101616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Original strand, 30501058 - 30501253
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaa 124  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||  | ||    
T  30501058 agtacaagacagaacaacacaacataagacaaaacaccataggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttg-gggctcgaa 30501156  T
Q  125 atgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30501157 atgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttg 30501253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17805578 - 17805799
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||  || ||||||| |||    
T  17805578 aaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaagacagaataacacaacacaaggtagaacaacacaggacaaattttttagggcaacgagtaattttttgt 17805677  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17805678 tttatacgatttttgggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaagagttgtgctttggtttggtgaggaacaaaaata 17805777  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  17805778 tgagtttttgtcttgtcccttg 17805799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 25478136 - 25478352
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||| ||||||| |||    || |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  25478136 aaaacagtaagtacttgacaaaacagtataagatagaacaatacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggcattgagtaattttttgtt 25478231  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25478232 ttatacgattttt-tagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttgatgagggacaaaaatat 25478330  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  25478331 gagtttttttcctgtcccttgt 25478352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14005227 - 14005041
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||| |||||    
T  14005227 agaacagtacaacacaagacagaacaacataggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacaattttt-tatggacaaaatgttattt 14005129  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14005128 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttg 14005041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3251873 - 3251653
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||  | ||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  3251873 aaaacagtaagtatcggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 3251774  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3251773 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 3251675  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||    
T  3251674 taagtttttgttctgtcgcttg 3251653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29611235 - 29611052
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    |||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  29611235 aacaacacaacacaaggcataacaacacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttg-ggggacgaaatgctattttgg 29611137  T
Q  137 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  29611136 tgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttg 29611052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 217
Target Start/End: Original strand, 40388953 - 40389144
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaa 124  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||| ||    
T  40388953 agtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacaacacaggaaaaaattttatggcattgaataattttttattttatacgatttttg-ggggacgaa 40389051  T
Q  125 atgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  40389052 atgctattttggcatttaaaacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagagataaaaatatcagtttttgtcctgtcc 40389144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 35225551 - 35225770
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| || ||||||||| || ||| ||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||    
T  35225551 aaaacagtaagtactggacagaatagtacaagacaggacaacacaacacaagacagaacaacacaagacaaatttttatggtattgaataatttcctgtt 35225650  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  35225651 ttatatgatttttg-ggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtggtttggcgagggacaaaaattg 35225749  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  35225750 cagtttttgtcctgtcccttg 35225770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12753521 - 12753327
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||| |||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||||    
T  12753521 aacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacaacacatgacaaaaattttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttg-gggga 12753423  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  12753422 caaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtc 12753327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 216
Target Start/End: Original strand, 21272689 - 21272787
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21272689 ggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 21272787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 37474608 - 37474761
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37474608 aaaacagcaagtacagcatatagcagtacaagaaagaacagcacaatacaagggataacagcacatgacaaatttttatgacattgaataattttttatt 37474707  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtac 155  Q
    ||||| |||||||  ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37474708 ttatacgattttt-ggggaaaaaaacgctagtttggtattttagacaacttgtac 37474761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7395002 - 7394811
Alignment:
Q  30 aagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgc 128  Q
    |||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||  |||||||   || ||||||||     
T  7395002 aagatagaacagtacaacacaagacagaacagcataggacaagttttttatggcactgagtaattttttgttttatgcgatttttgaagg-acaaaatgt 7394904  T
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  7394903 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 7394811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16486004 - 16485829
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||    
T  16486004 aacaatacaagataggacaacacaatataaggcagaacagcacaaaacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttg-ggtgac 16485906  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16485905 gaaatgctatttttgtattttagaaaacttatacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaat 16485829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27109735 - 27109559
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttat--gttttatatgatttttatggggaca 122  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||     
T  27109735 agtacaagatagaacaacacaatacaatgcagaacggtacaggacaaattttaatagcattgaataattttttttgttttatatgatttttg-ggggacg 27109637  T
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27109636 aaatgttattttggtattttaaacaatttgtacgcgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaaggaacaaaaatat 27109559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 6460152 - 6460344
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||||| || | |||||||||  ||| || |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||     
T  6460152 aaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaggacaaaacagcacagcacagggcagagtagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttt--gtc 6460249  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaa 195  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6460250 ttatacgattttt-tatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaa 6460344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Original strand, 37861866 - 37861967
Alignment:
Q  120 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  37861866 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttatgatgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcact 37861965  T
Q  220 tg 221  Q
    ||    
T  37861966 tg 37861967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10656878 - 10656688
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaa 124  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||  | |||| |  | ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||||    
T  10656878 agtacaagagagaacaacacaacacaagacataacaacgtatgacaaatttttatgttattgaataattttttcttttatacgattttt-tgtggacaaa 10656780  T
Q  125 atgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
     || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  10656779 ttgttattttgatattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggttttgtgaaggacaaaaaattcagtttttgtcctgtc 10656688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 17520502 - 17520702
Alignment:
Q  13 acagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttat--gttttatatgatt 110  Q
    |||| ||| ||||| | |||| |||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||  | ||| || ||||| |  |||||||| ||||    
T  17520502 acagaacagaacagaagaagacagaataacacaacacaagacagaacagtacaggacaaatttttatagcgttggattattttttttgttttatacgatt 17520601  T
Q  111 tttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgt 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||     
T  17520602 tttg-ggggacaaaatgctattttgg--------acaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac-aaaatataagtttttgc 17520691  T
Q  211 cctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||    
T  17520692 cctgtcccttg 17520702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10320424 - 10320304
Alignment:
Q  70 aaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagt 169  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||| || |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  10320424 aaatttttatggtattgaataatttttggttttatacgattgttgt-tagacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgtggtaaaaagt 10320326  T
Q  170 tgtgctgtggtttggtgaggga 191  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10320325 tgtgttgtggtttggtgaggga 10320304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16595344 - 16595146
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    ||||||| |||| |||||| || || |||||| |||| || | | | |||| |||| ||  |||||||||||||  || ||||| |||||||  | | ||    
T  16595344 aacagtataagacagaacaacaaaacacaaggcagaaaagtaaatggcaaacttttttggtattgaataatttttggtcttatacgatttttg-gtgaac 16595246  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |    || ||||||||||||||||    
T  16595245 aaaaagctatttttgtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattagcgagggacaaaacttcatgtttttgtcctgtcccttg 16595146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36426398 - 36426283
Alignment:
Q  68 acaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgg-ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 166  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36426398 acaaaattttatgatattgaataatcttcggttttatatggttttttttgtggacaaaagactattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaa 36426299  T
Q  167 agttgtgctgtggttt 182  Q
    || |||| ||||||||    
T  36426298 agatgtgttgtggttt 36426283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 196
Target Start/End: Original strand, 10932741 - 10932819
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaa 196  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10932741 ggacaaaagactattttggtattttagacaaattgtacgtggaactaaaagttgtgatgtggtttagtgagggacaaaa 10932819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Original strand, 54117 - 54280
Alignment:
Q  58 acagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgt 157  Q
    |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||| | ||||||| || ||| |||||  ||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  54117 acagcacaagataaacttttatggtattgaataattttttgtcttaaacgattttt-tgtggataaaatattattttg-tattttcgataacttgtatgt 54214  T
Q  158 gggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttgtg 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||| |  || |||||| |||||||||||    
T  54215 gggacaaaaagttgtgatgtggtttagcaaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtcccttgtg 54280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 182
Target Start/End: Original strand, 14958902 - 14959027
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||| ||| ||| |||||   | ||||| ||||||| || || ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14958902 agaacatcacaaggcaaacttttatgatattaaatcatttttgatcttatacgattttt-tgtgggcaaaaagttattttgatattttagaca-cttgta 14958999  T
Q  155 cgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14959000 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 14959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 178
Target Start/End: Original strand, 15351694 - 15351800
Alignment:
Q  70 aaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagt 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||  |  || |||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  15351694 aaatttttatgatattgaataattttga-ttttatacgatttttg-gttgataaaatgttattttggtattttagacaatttgtaactgagacaaaaagt 15351791  T
Q  170 tgtgctgtg 178  Q
    |||| ||||    
T  15351792 tgtgttgtg 15351800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 28746230 - 28746377
Alignment:
Q  19 caaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggg 118  Q
    ||||||||||| ||| | |||| ||||| | |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   | || || |||||||  | |    
T  28746230 caaaacagtacgagataaaacaacacaacataagataaaacagcacatgataaatttttatgacattgaataatttttgatcttgtacgattttt-ggtg 28746328  T
Q  119 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
     |||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  28746329 aacaaaattttattttggtattttaaatagcttgtacgtaggacaaaaa 28746377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 153
Target Start/End: Original strand, 32918842 - 32918925
Alignment:
Q  69 caaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  32918842 caaatttttatgacattaaataattttttgttttata-caattttggggggacgaaatgctattttggtattaaaaacaacttgt 32918925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5859572 - 5859518
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  5859572 ggacaaaatactattttagtattttagataacttgtacgtatgacaaaaagttgt 5859518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 182
Target Start/End: Original strand, 11944890 - 11944944
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  11944890 ctattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagttgtagtgtggttt 11944944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22756501 - 22756431
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||    
T  22756501 ctatttttgtattttagataacttgtacgtgatacaaaaagttgtgttgtggtataatgagggataaaaat 22756431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 21272601 - 21272676
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt 76  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21272601 aaaacagcaagtattggacagaacaatacaagatagatcagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaatttt 21272676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Original strand, 37474761 - 37474808
Alignment:
Q  174 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37474761 ctgtggtttgctgagggacaaaaatataagtttttgtcctgtctcttg 37474808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3361843 - 3361789
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  3361843 ggacaaaatgttattttggtagattagacaacttgtacttgagagaaaaagttgt 3361789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11926920 - 11926878
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  11926920 ctattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagtt 11926878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3801033 - 3800964
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaa 197  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  3801033 ctatttttgtattttagataactagtatgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttaatgaggaacaaaaa 3800964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 173
Target Start/End: Original strand, 5892087 - 5892128
Alignment:
Q  132 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5892087 tttggtaatttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtg 5892128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Original strand, 37861803 - 37861864
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataatttt 95  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  37861803 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaatttt 37861864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2546 - 2326
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2546 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgt 2447  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2446 tttataggatttttatggg-acaaaaaactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 2348  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  2347 tgagtttttgtcctgtcccttg 2326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 101837 - 102053
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  101837 aaaacagcaagtaccggacagaacagtataagatagaacagtacaatataaggtagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 101936  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  101937 tttatacgattttt-tagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 102035  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  102036 tgagtttttgtcatgtcc 102053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 34338698 - 34338918
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  34338698 aaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggcattgagtaattttttgt 34338797  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34338798 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggtcaaaaata 34338896  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  34338897 tgagtttttgtcctgtcccttg 34338918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9733132 - 9732912
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  9733132 aaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgt 9733033  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9733032 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 9732934  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  9732933 tgagtttttgtcttgtcccttg 9732912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16104162 - 16104382
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  16104162 aaaacaacaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagggcaaattttttatggcattgagtaattttttgt 16104261  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16104262 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 16104360  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  16104361 tgagtttttgtcctgtcccttg 16104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19513891 - 19513675
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||    
T  19513891 aaaacagtaagtactggataaaacagtacaagatagaacagtacaatagaagacagaacagcacgggacaaattttttatggtattgagtaattttttgt 19513792  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19513791 tttatatgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 19513693  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  19513692 tgagtttttgtcctgtcc 19513675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 35114673 - 35114893
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||    
T  35114673 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgt 35114772  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35114773 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 35114871  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  35114872 tgagtttttgtcctgtcccttg 35114893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5279036 - 5278816
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| ||||||   ||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  5279036 aaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 5278937  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5278936 tttatacgattttt-gaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 5278838  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  5278837 tgagtttttgtcctgtcccttg 5278816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 33366498 - 33366718
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  33366498 aaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgt 33366597  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33366598 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaata 33366696  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  33366697 tgagtttttgtcctgtcccttg 33366718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17540602 - 17540823
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  17540602 aaaacagcaagtactggatagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacatattttttatggcattgagtaattttttgt 17540701  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt-ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540702 tttatacgatttttgaggg-acaaaatactatttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 17540800  T
Q  199 atgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  17540801 atgagtttttgtcctgtcccttg 17540823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 18685724 - 18685940
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  18685724 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 18685823  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18685824 tttataggatttttgaggg-acaaaatgttattttaatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagagacaaaaata 18685922  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  18685923 tgagtttttgtcttgtcc 18685940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 32497803 - 32498023
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  32497803 aaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 32497902  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32497903 tttatacgattttt-gaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggtacaaaaata 32498001  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  32498002 tgagtttttgtcctgtcccttg 32498023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32766681 - 32766486
Alignment:
Q  26 gtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaa 125  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||| |||    
T  32766681 gtacaagaaagaacaacacaatgcaagggagaacaacacaggacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgattttt-ggaggacgaaa 32766583  T
Q  126 tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32766582 tgttattttggtattttagacaacctgtacgtaggacaaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttg 32766486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 7258791 - 7259005
Alignment:
Q  8 caagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatat 106  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  7258791 caagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatac 7258890  T
Q  107 gatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtat 206  Q
     ||||||  |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7258891 aatttttgagggacaaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttt 7258990  T
Q  207 ttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||    
T  7258991 ttgtcctgtcccttg 7259005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 37308544 - 37308763
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |      
T  37308544 aaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaatttttttg 37308643  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    ||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37308644 ttt-tacgattttt-tagggacaaaatactattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 37308741  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  37308742 tgagtttttgtcctgtcccttg 37308763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2645267 - 2645076
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||  |    
T  2645267 aacagtataagatagaacagtacaacataaggcagaacagcactggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagga-a 2645169  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2645168 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcct 2645076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7761702 - 7761555
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7761702 tttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgt 7761604  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7761603 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 7761555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 33889165 - 33889351
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  33889165 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacataacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgaggg-acaaaatgttattt 33889263  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33889264 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggaaaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 33889351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37004071 - 37003861
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcaca-ggacaaattttt-atgacattgaataattttatg 98  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  37004071 aaaacagcaagtactagacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtaaaacagcacaaggacaaattttttatggcattgaataatttttta 37003972  T
Q  99 ttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37003971 ttttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaat 37003873  T
Q  199 atgagtatttgt 210  Q
    |||||| |||||    
T  37003872 atgagtttttgt 37003861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30326533 - 30326317
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||    
T  30326533 aaaagagcaagtactggacagaacagtacaagatagaaccgtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggaattgagtaattttttgt 30326434  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  30326433 tttatacgatttttgaggg-acaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagagac-aaaata 30326336  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtccc 218  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  30326335 tgagtttttgtcctgtccc 30326317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 42706267 - 42706467
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttat-gttttatatgatttttatgggg 119  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||  |||     
T  42706267 aacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttttttgttttatacgatttttgaggg- 42706365  T
Q  120 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  42706366 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttatccct 42706465  T
Q  220 tg 221  Q
    ||    
T  42706466 tg 42706467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 44284525 - 44284737
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||        ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  44284525 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaaca--------caaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 44284616  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44284617 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgttattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttagtgagggacaaaaata 44284715  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  44284716 tgagtttttgtcttgtcccttg 44284737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3913640 - 3913448
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga- 120  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||||     
T  3913640 aacagtataagacagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggataaatttttatggcattgaataatattttgttttatacgattttt--ggggag 3913543  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  3913542 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaacatgtgagtttttgtcctgt 3913448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 222
Target Start/End: Original strand, 40692214 - 40692406
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |    
T  40692214 aacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggg-a 40692312  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  40692313 caaaatgctatt--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgttctgtggtttggtgagggacaaaaatacgagtttttgtcctgtccctt 40692404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 2085960 - 2086169
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  2085960 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgccattgagtaattttttgt 2086059  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  2086060 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgttattttggtatttcagacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtactgtggtttgggtagggacaaaaata 2086158  T
Q  200 tgagtatttgt 210  Q
    ||||| |||||    
T  2086159 tgagtttttgt 2086169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12939478 - 12939282
Alignment:
Q  26 gtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataat--tttatgttttatatgatttttatggggacaa 123  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||| || |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12939478 gtacaagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttaataacattgaatattgttttttgttttatatgatttttg-ggggacaa 12939380  T
Q  124 aatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  12939379 aatgttattttggtatcttagacaacttgtacgtgagataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcccttg 12939282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 13829344 - 13829545
Alignment:
Q  18 acaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgg 117  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  13829344 acaaaacagtacaaagcagaacagcacaacacaaggcagaacatcacagaacaaatttttatgatattgaataattttttgttttatatgattttt-gag 13829442  T
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  13829443 ggacgaaatgatattttggtgttttagataacttgtacctgggacaaaaagttgtgatgtggtctagtgatggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcc 13829542  T
Q  218 ctt 220  Q
    |||    
T  13829543 ctt 13829545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 26418832 - 26419029
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaat-ttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||    
T  26418832 aacagtgcaagacagaacagcacaacgcaaggcagaacaacacatgacaaaaattttatggcaatgagtaattttttgttttatacaatttttg-gggga 26418930  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26418931 taaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcatgtccct 26419029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40832648 - 40832451
Alignment:
Q  25 agtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataatt--ttatgttttatatgatttttatggggaca 122  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||   ||||||| |||  || ||||||||| |||||||  ||||||     
T  40832648 agtacaagatagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttatattattgaattattatttttgttttatacgatttttg-ggggacg 40832550  T
Q  123 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  40832549 aaatactattttggtattttagactacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatccgtttttgtcctgtcccttg 40832451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Original strand, 6896091 - 6896276
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt 134  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||    
T  6896091 agaacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgccttttg-ggggacgaaatgctatttt 6896189  T
Q  135 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  6896190 ggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgttgtttggtgagggacaaaaatttcagtttttatcctgtcccttg 6896276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28824758 - 28824539
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||  |||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  28824758 aaaacagtaagtactggactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaatacatgacaaatttttatgacatggaataaatttttgtt 28824659  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||  ||||||  || | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28824658 ttatacaatttttggggtg-cgaaatgctattttagtattttagacaacttgcacgtgagataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatat 28824560  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  28824559 gagtttttgtcctgacccttg 28824539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Original strand, 42365494 - 42365685
Alignment:
Q  30 aagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgc 128  Q
    |||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||| || |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  42365494 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgattttta-ggggacaaaatgt 42365592  T
Q  129 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42365593 tattttggtattttagacaacttgtccgtgatataaaaagttgtgttgtggtttgatgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttg 42365685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4641404 - 4641605
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| || | ||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  4641404 aaaacagcaagtactggacagaacagtaaaatatagaacagtacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttataccattgagtaattttttgt 4641503  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4641504 tttatacgatttttgagga-acaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagagacaaaaata 4641602  T
Q  200 tga 202  Q
    |||    
T  4641603 tga 4641605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Original strand, 9717182 - 9717326
Alignment:
Q  70 aaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagt 169  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717182 aaatttttatggcattgggtaattttttgtttgatacgatttttgaggg-acaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagt 9717280  T
Q  170 tgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9717281 tgtgctgtggtttggtgagggacaaaaacatgagtttttgtcctgt 9717326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 11114786 - 11114980
Alignment:
Q  26 gtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaa 125  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||  | | || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||| | |||| |||    
T  11114786 gtacaagacagaacaacacaacacaagacagaacaatataagaaaaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgattgtta-gcggacgaaa 11114884  T
Q  126 tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11114885 tactattttggaattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttg 11114980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30798689 - 30798470
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |  |||  ||  ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| | ||||||| |||    
T  30798689 aaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtaacata--agacagaacagcacatgacaaattttgtatggtatttagtaattttttgt 30798592  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30798591 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 30798493  T
Q  200 tgag-tatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||| | ||| ||||||||||||    
T  30798492 tgagttttttttcctgtcccttg 30798470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Original strand, 1247065 - 1247250
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggac 121  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||| | || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||| ||    
T  1247065 aacagtacaagacagaacaacacaacacaaagcagtacagtacaagacaaatttttatggcattgaataattttttattttatacgatttttg-gggaac 1247163  T
Q  122 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
     ||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1247164 gaaatgctatt--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtc 1247250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16178082 - 16177869
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| | | || ||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  16178082 aaaacagtaagtactggacagaacagtgcaagacatatcaacacaacacaagatagaacaacacacgacaaatttttatagcattgaataatttt--gtt 16177985  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16177984 ttatacgatttttg-ggggacgaaattccattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagcgacaaaaatat 16177886  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcc 217  Q
     ||| | ||||||||||    
T  16177885 cagtttatgtcctgtcc 16177869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27463001 - 27462783
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||  | | |||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27463001 aaaacagcaagtattggataaaacagtgcaaaacagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttatatgacattgaataattttttgtt 27462902  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    || || |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27462901 tt-tacgattttta-gggcacgaaatgctattttggtatttttgacaatatgtatg-gtgataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaataa 27462805  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
     ||  |||||| ||||||||||    
T  27462804 cagcttttgtcttgtcccttgt 27462783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10400013 - 10399858
Alignment:
Q  59 cagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtg 158  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  10400013 cagcacatgataaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgacttttg-ggggacaaaatgctattttggatttttagacaacttatacatg 10399915  T
Q  159 ggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgt 215  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10399914 agacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 10399858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12672595 - 12672456
Alignment:
Q  81 acattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 180  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12672595 acattgagtaattttttgttttatacgatttttg-gaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacttgggataaaaacttgtgttgtggt 12672497  T
Q  181 ttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  12672496 ttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcccgtcccttg 12672456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 39461202 - 39461401
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |    
T  39461202 aaaacagtaagtactggacataacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttat 39461301  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttg---tgctgtggtttggtgagggacaaaa 196  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||   || |||| |||||||||||||||||    
T  39461302 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacagcttgtacgtgagataaaaagttgtgttgttgtgatttggtgagggacaaaa 39461400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Original strand, 30712802 - 30712968
Alignment:
Q  57 aacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacg 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30712802 aacagcaaaggacaaatttttatggtattgaataattttttgttttatatgatttt--tggggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttctacg 30712899  T
Q  157 tgggacaaaaagttgtgctgtgg----tttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  30712900 tgggataaaaagttgtgttgtggttaatttggtgagggacaaaaatttcagtttgtgtcctgtcccttg 30712968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38993261 - 38993053
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga 108  Q
    |||||| | ||| |||| || |||| || ||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||   |||  ||||||||||||| ||| |||||| |    
T  38993261 aagtactggacagaacaatataagataggacagcacaacataaggcagaacaacacaagacaaatt---atggtattgaataattttctgtattatatta 38993165  T
Q  109 tttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtattt 208  Q
    |||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||   ||| |||    
T  38993164 tttttg-ggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgacgaggaacaaaaattgtagttttt 38993066  T
Q  209 gtcctgtcccttg 221  Q
    |||||||||||||    
T  38993065 gtcctgtcccttg 38993053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 41934470 - 41934684
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||  | || | | ||  ||||||||||| |  ||||||| |||||||||     
T  41934470 aaaacagtaagtaccgtataacacagtacaagatagaacaacacaacacaagataaaataacgcataacaaatttttacggtattgaatgattttatgtc 41934569  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||| |    
T  41934570 ttatatgatttttg-gtggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaagtacaagaattt 41934668  T
Q  201 gagtatttgtcctgtc 216  Q
     ||| |||||| ||||    
T  41934669 cagtttttgtcttgtc 41934684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Original strand, 8112247 - 8112397
Alignment:
Q  62 cacaggacaaatttt-tatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtatttt-agacaacttgtacgtgg 159  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||| | |||||  |||    
T  8112247 cacatgacaaattttgtatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttaagggaaaaaaatgttattttggtatttttagactatttgtatctgg 8112346  T
Q  160 gacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgt 210  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8112347 aacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgt 8112397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 20907483 - 20907664
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||     ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20907483 aaaatagcaggtaccgtatagaacagtacaagaaagaacaacacaa-----gggagaacaacatatgacaaatttttatgtcattgaataattttttgtt 20907577  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgag 188  Q
    || || |||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20907578 ttgtacgattttt-gggggataaaatgttattttagtattttatacaatttgtacataggacaaaaaattgttctgtggtttggtgag 20907664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41366239 - 41366100
Alignment:
Q  71 aatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  41366239 aatttttatgatattgaataatttt--gtcttatataattttt-tgtggatacaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaaatt 41366143  T
Q  171 gtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcct 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  41366142 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcct 41366100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45463256 - 45463112
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 154  Q
    |||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||    
T  45463256 agaacaacacatgacaaatttttattgcattaaataattttttgttttatacgatttct--ggggacgaaatgttattttgatattttagacaatctgta 45463159  T
Q  155 cgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatg 201  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45463158 cgtatgacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagtgacaaaaatatg 45463112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26981781 - 26981696
Alignment:
Q  131 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26981781 ttttggtattttagacaacttgtacgtagaacaaaaagttttgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtc 26981696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38623431 - 38623296
Alignment:
Q  71 aatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggg-gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagt 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||  ||||| ||    ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38623431 aatttttatgatattgaataattttttgttttatatgattt--atgggagatgaaatgtta----ggcgttctagacaacttgtatgtgggacaaaaagt 38623338  T
Q  170 tgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  38623337 tgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtc 38623296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18793455 - 18793297
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||||||||||| || | ||||||| |||| | |||| |||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||      
T  18793455 aagtactggacaaaacagtataaaatagaacagtacaacataaggtagaacatcacaagacaaattttttatgggattgagtaattttttgttttataca 18793356  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18793355 atttttg-gaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagactaaaa 18793297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 26981884 - 26981778
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa--tttttatgacattgaataattttatgttttatat 106  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  26981884 aagtactggacagaacagtacaagacaaaacagcacaacacaaggcagaacagcacaggataaatttttttatgacaatgagtaattttttgttttatac 26981785  T
Q  107 gattttt 113  Q
    |||||||    
T  26981784 gattttt 26981778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Original strand, 26796247 - 26796313
Alignment:
Q  132 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||    
T  26796247 tttggtattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgcgttgtgctttagtgagggacacaaat 26796313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 130255 - 130404
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa-----a 167  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||     |    
T  130255 tttttattatattgaataattttatgtattatataatttttgt-aggatgaaatgatattttggtattttagataatttgtacgtaagataaaaatatta 130353  T
Q  168 gttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccct 219  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  130354 attgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttaagt-tttgttctgtccct 130404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35473159 - 35473036
Alignment:
Q  43 acaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatga-tttttatggggacaaaatgctattttggtattt 141  Q
    ||||||||||  |||||| || | |||||||||| |||  ||| |||||||||  || |||||  | |||||||||  |||||| | |||| ||||||||    
T  35473159 acaatacaagttagaacaacatatgacaaattttgatggtattaaataatttttggtcttatacaaatttttatgg--acaaaaggatattatggtattt 35473062  T
Q  142 tagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35473061 tagacaacttgtacgtgggacaaaaa 35473036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Original strand, 37088218 - 37088376
Alignment:
Q  57 aacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgattttt-atggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtac 155  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||| ||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||     
T  37088218 aacagcacaagacaaatttgtatggtattgaacaattttgtgtcttatccgatgtttgatgg--acaaaatgctattttggtattttaaacatcatgtat 37088315  T
Q  156 gtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtc 216  Q
     | |||  ||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||    
T  37088316 ttaggatgaaaagatgtgttgtggcttagtgagggacaagaatttcagtttttgtcttgtc 37088376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13249485 - 13249421
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  13249485 ggacaaaagtctattttgatattttaaacaacttgtactttggacaaaaaattgtgttgtggttt 13249421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18127073 - 18127009
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 182  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  18127073 ggacaaaacgttattttgctattttacataacttgtacttgagacaaaaagttgtgttgtggttt 18127009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16062260 - 16062183
Alignment:
Q  18 acaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataatttt 95  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| | |||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  16062260 acaaaacagtacaagacataacaacacaacataagacagaacaacacagaacaaatttttatggtattgaatattttt 16062183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18262 - 18042
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  18262 aaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgt 18163  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18162 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 18064  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  18063 tgagtttttgtcctgtcccttg 18042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12744 - 12527
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  12744 aaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgt 12645  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12644 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 12546  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtccc 218  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  12545 tgagtttttgtcctgtccc 12527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 51327 - 51546
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  51327 aaaacagcaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtataatacaagacagaacagcacaagacaaattttttatgacattgagtaattttttgt 51426  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51427 tttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt-gtgagggacaaaaata 51524  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  51525 tgagtttttgtcttgtcccttg 51546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5647 - 5427
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5647 aaaacagcaagtactggacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgtt 5548  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||| |||||||  |||  | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5547 ttatacgattttt-ggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatat 5449  T
Q  201 gag-tatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  5448 gtgttttttgtcctgtcccttg 5427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0729 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0729
Description:

Target: scaffold0729; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4766 - 4567
Alignment:
Q  22 aacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatgggga 120  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | ||    
T  4766 aacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-tagaga 4668  T
Q  121 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4667 caaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23465 - 23683
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgt 99  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  23465 aaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcactggacaaattttttatggcattgagtaattttttgt 23564  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  |||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23565 tttatacgatttttgaggg---acaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaata 23661  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  23662 tgagtttttgtcatgtcccttg 23683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Original strand, 19922 - 20014
Alignment:
Q  128 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtccctt 220  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| | ||| |||||| | ||||||    
T  19922 ctattttggtatttcaaacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtacagtggtttagtgagtgacaagaatttcagtttttgtcatatccctt 20014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0650 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0650
Description:

Target: scaffold0650; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1631
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttgg 136  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||    
T  1814 aacagcacaacacaagagagaacaacacagaacaaatttttatggtattgaataattttttgttttatatgacttttgaggg-acgaaatgctattttgg 1716  T
Q  137 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  1715 ttttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttg 1631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15551 - 15379
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattt 133  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||     |||||||||||    
T  15551 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg-----aaatgctattt 15457  T
Q  134 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtc 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15456 tggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 15379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13670 - 13615
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13670 ggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacatgtgacaaaaagttgtg 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19262 - 19079
Alignment:
Q  37 aacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttg 135  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||    |||||||||| |||||||    
T  19262 aacagtacaacacaaggtagaacagcacatggcaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-gaaggacaaaatgttattttg 19164  T
Q  136 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19163 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagt-tttgtcctgtctcttg 19079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0957 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2695 - 2485
Alignment:
Q  9 aagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaattttt-atgacattgaataattttatgttttatatg 107  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  2695 aagtactggacataacagtataagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgagattgggtaattttttgttttatacg 2596  T
Q  108 atttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatt 207  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  2595 atttttg-ggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagac-aatagttgtgttgtggtttggttagggacaaagatatgagtttt 2498  T
Q  208 tgtcctgtccctt 220  Q
    |||||||||||||    
T  2497 tgtcctgtccctt 2485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13894 - 13675
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgtt 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||    
T  13894 aaaacagtaagtactggacagaacagtataatgcagaacaacaaaatacaaggcataattgcacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgtt 13795  T
Q  101 ttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatat 200  Q
    ||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  13794 ttatatgctttttg-ggggacggaatgctattttggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaattt 13696  T
Q  201 gagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
     ||| |||||||| |||||||    
T  13695 cagtttttgtcctatcccttg 13675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15060 - 15280
Alignment:
Q  1 aaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatt-tttatgacattgaataattttatgt 99  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||| | ||||||| |||| | |||| |||||| |||| || |||   |||||| |||||| ||||||  |||    
T  15060 aaaacagtaagtaccggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgaaaaaaaatttatggcattgagtaatttgttgt 15159  T
Q  100 tttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaata 199  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15160 tttataagatttttg-ggggacaaaatactattttagtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgggggacaaaaata 15258  T
Q  200 tgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  15259 tgagtttttgtcttgtcccttg 15280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 373099 - 372951
Alignment:
Q  73 tttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  373099 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 373001  T
Q  173 gctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttgt 222  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  373000 gttatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatatcccttgt 372951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43122 - 42938
Alignment:
Q  35 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctatttt 134  Q
    ||||||||||||||||||| | || |  ||||  ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  43122 agaacagcacaatacaaggcataataatacagatcaaatttttgtggtattgaataatttcttgttttatatgattgtt-tggggacaacatgctatttt 43024  T
Q  135 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcccttg 221  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  43023 ggtgttttagacaa-ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacacaaatttcagtttttgttctgtcccttg 42938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33635 - 33559
Alignment:
Q  118 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaa 194  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33635 ggacaaaagcctattttggtattttatacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaa 33559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3788 - 3683
Alignment:
Q  48 acaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttatggggacaaaatgctattttggtattttagaca 147  Q
    |||||| |||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||  | ||| ||||  ||||||| |||||||||| |    
T  3788 acaaggtagaatagtacatgacaaacttttatgatattgaataattttttatcttatatgattttt-ggtggataaaaaactatttttgtattttagata 3690  T
Q  148 acttgta 154  Q
    |||||||    
T  3689 acttgta 3683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7587 - 7503
Alignment:
Q  83 attgaataattttatgttttatatgattttta-tggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 167  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7587 attgaataatttttggtcttatataatttttaatggacaaaaaat-ctattttggtattttagacaactcgtacgtgagacaaaaa 7503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 111225 - 111167
Alignment:
Q  55 agaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgattttt 113  Q
    |||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  111225 agaacatcacacgataaacttttatgatattgaataattttatgtcttatacgattttt 111167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19205 - 19148
Alignment:
Q  160 gacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcctgtcc 217  Q
    |||||||||||||| || | |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  19205 gacaaaaagttgtgttgagctttgatgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcc 19148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University