View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18636_high_4 (Length: 538)

Name: NF18636_high_4
Description: NF18636
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18636_high_4
NF18636_high_4
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (13-521)||(39179041-39179549)
chr7 (217-386)||(39191797-39191966)
chr7 (256-521)||(39196122-39196385)
chr7 (258-500)||(39240349-39240591)
chr7 (256-521)||(39224830-39225093)
chr7 (217-333)||(39220741-39220857)
chr7 (20-157)||(39218222-39218359)
chr7 (20-157)||(39225320-39225457)
chr7 (263-496)||(39257929-39258162)
chr7 (256-521)||(39217732-39217995)
chr7 (28-164)||(39196643-39196779)
chr7 (57-163)||(39240965-39241071)
chr7 (62-159)||(39258399-39258496)
chr7 (56-155)||(39247903-39248002)
chr7 (56-155)||(39300212-39300311)
chr7 (369-433)||(39191713-39191776)
chr7 (273-482)||(39261759-39261968)
chr7 (450-506)||(39185151-39185207)
chr7 (129-173)||(39220963-39221007)
chr7 (13-59)||(39221002-39221048)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (273-320)||(32468555-32468602)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 497; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 39179549 - 39179041
Alignment:
Q  13 catcatgatggaaatggttgaagaaaaagggtcagcaaacgggaaagaagattacactcaagatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39179549 catcatgatggaaatggttgaagaaaaaggctcagcaaacgggaaagaagattacactcaggatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaaga 39179450  T
Q  113 tcaaagactggaagatggaaagcttgctcctttatagtaggtaaaatgaagccctttgctgccataataacactttgaagcttgttacgttattctagtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39179449 tcaaagactggaagatggaaagcttgctcctttatagtaggtaaaatgaagccctttgctgccataataacactttgaagcttgttacgttattctagtt 39179350  T
Q  213 tcagtataatgcattaataacacttacgaatatggtgtatacatttgtgtaatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39179349 tcagtataatgcattaataacacttacgaatatggtgtatacatttgtgtaatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagca 39179250  T
Q  313 tcaaacttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggtactgtggagtcatcaaacaacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccac 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39179249 tcaaacttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggtactgtggagtcatcaaacaacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccac 39179150  T
Q  413 ttgcaggagcttacatagctgatgcctatcttggaagatatttgacctttgtgattgcatcatgcatttatttcatggtatgaaatgttaaatttattgt 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39179149 ttgcaggagcctacatagctgatgcctatcttggaagatatttgacctttgtgattgcatcatgcatttatttcatggtatgaaatgttaaatttattgt 39179050  T
Q  513 catcatttg 521  Q
    |||||||||    
T  39179049 catcatttg 39179041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 217 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39191966 - 39191797
Alignment:
Q  217 tataatgcattaataacacttacgaatatggtgtatacatttgtgtaatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaa 316  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39191966 tataatgcatcaataacacttatgaatatggcgtaagcatttgtgtaatttataatgtatgaagtgttggaaaggatggctttctacggaatatcatcaa 39191867  T
Q  317 acttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggtactgtggagtcatcaaacaacataagcaactt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39191866 acttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggtactgtggagtcatcaaacaacataagcaactt 39191797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 39196385 - 39196122
Alignment:
Q  256 tttgtgtaatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaaacttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggta 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || || ||||| |    
T  39196385 tttgtgtaatttatagggtatgaagtgtttgagaggatggcttactacgggatagcatcaaacttagtgatctatctaacaaataagctccatgagggaa 39196286  T
Q  356 ctgtggagtcatcaaacaacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccacttgcaggagcttacatagctgatgcctatcttggaagatattt 455  Q
    ||||||| ||  |||||||| | ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||  | ||||     
T  39196285 ctgtggaatctgcaaacaacgttagcaactgggcgggttcggtgtggatgatgccacttgtaggagcttacatagccgatgcttattttggccgctattg 39196186  T
Q  456 gacctttgtgattgcatcatgcatttatttcatggtatgaaatgttaaatttattgtcatcatttg 521  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||    
T  39196185 gaccttcgtaattgcatcatgcatttatctcttggtatgtaatg--atatttattttcatcatttg 39196122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 258 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39240591 - 39240349
Alignment:
Q  258 tgtgtaatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaaacttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggtact 357  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||  ||||||||    
T  39240591 tgtgtaatttataggttatgaattgtttgagaggatggcttactatggaatatcatcaaacttagtggtgtatctaacaaaaaagctccatcagggtact 39240492  T
Q  358 gtggagtcatcaaacaacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccacttgcaggagcttacatagctgatgcctatcttggaagatatttga 457  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| | ||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||| ||    
T  39240491 gtggaatcttcaaacaatattagcaattggggaggatcagtttggttgatgccacttgcaggagcttatgtagctgatgcttatcttggccgatattgga 39240392  T
Q  458 cctttgtgattgcatcatgcatttatttcatggtatgaaatgt 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  39240391 cctttgtaattgcatcatgcatttacctcatggtatgatatgt 39240349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 39225093 - 39224830
Alignment:
Q  256 tttgtgtaatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaaacttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggta 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||  ||||||    
T  39225093 tttgtgtaatttatagggtatgaagtgtttgagaggatggcttactacgggatagcatcaaacttagtgatttatctaacaaacaagcttcatcagggta 39224994  T
Q  356 ctgtggagtcatcaaacaacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccacttgcaggagcttacatagctgatgcctatcttggaagatattt 455  Q
    |||||||  | ||||||||| | ||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||  | ||||     
T  39224993 ctgtggaagcttcaaacaacgttagcaactgggcaggttcggtgtggatgatgccacttgtaggagcttacattgccgatgcttattttggccgctattg 39224894  T
Q  456 gacctttgtgattgcatcatgcatttatttcatggtatgaaatgttaaatttattgtcatcatttg 521  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||    
T  39224893 gacctttgtagttgcatcatgcatttatctcttggtatgtaatg--atatttattttcatcatttg 39224830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39220857 - 39220741
Alignment:
Q  217 tataatgcattaataacacttacgaatatggtgtatacatttgtgtaatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39220857 tataatgcattaataacacttatgaatatggcgtatgcatttgtgtaatttatagtgtacgaagtgtttgaaaggatagctttctatggaatagcatcaa 39220758  T
Q  317 acttagtggtgtatcta 333  Q
    |||||||||||||||||    
T  39220757 acttagtggtgtatcta 39220741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39218359 - 39218222
Alignment:
Q  20 atggaaatggttgaagaaaaagggtcagcaaacgggaaagaagattacactcaagatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaagatcaaaga 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  39218359 atggaagtggttgaagaaaaaggccctgcaaatgggaaagaagattacactcaagatggtacagtagacctaaaaggtagacctgttttaagatcgaaga 39218260  T
Q  120 ctggaagatggaaagcttgctcctttatagtaggtaaa 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39218259 ctggacgatggaaagcttgctccttcatagtaggtaaa 39218222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39225457 - 39225320
Alignment:
Q  20 atggaaatggttgaagaaaaagggtcagcaaacgggaaagaagattacactcaagatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaagatcaaaga 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  39225457 atggaagtggttgaagaaaaaggccctgcaaatgggaaagaagattacactcaagatggtacagtagacctaaaaggtagacctgttttaagatcgaaga 39225358  T
Q  120 ctggaagatggaaagcttgctcctttatagtaggtaaa 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39225357 ctggacgatggaaagcttgctccttcatagtaggtaaa 39225320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 263 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 39258162 - 39257929
Alignment:
Q  263 aatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaaacttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggtactgtgga 362  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  39258162 aatttatagggtatgaaatgtttgagaggatggcttactttgggatagcttcaaacttagtggtgtatttgacaaatcagcatcatgagggtactgtgga 39258063  T
Q  363 gtcatcaaacaacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccacttgcaggagcttacatagctgatgcctatcttggaagatatttgaccttt 462  Q
     || ||||||||| | ||||| | || |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| | |||||||    
T  39258062 atcttcaaacaacgttagcaattgggcgggttcagtttggatgatgccacttgtaggagcttacgtagctgatgcatatcttggtcgatactggaccttt 39257963  T
Q  463 gtgattgcatcatgcatttatttcatggtatgaa 496  Q
    ||  ||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  39257962 gtagttgcatcgtgcatttatctcttggtatgaa 39257929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 39217995 - 39217732
Alignment:
Q  256 tttgtgtaatttatagtgtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaaacttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggta 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||   || || || ||||| |    
T  39217995 tttgtgtaatttatagggtatgaagtgtttgagaggatggcttactacgggatagcatcaaacttagtgatctatctaacagacaagctccatgagggaa 39217896  T
Q  356 ctgtggagtcatcaaacaacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccacttgcaggagcttacatagctgatgcctatcttggaagatattt 455  Q
    ||||||| ||  |||||||| | ||||||| |  |||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||  | ||||     
T  39217895 ctgtggaatctgcaaacaacgttagcaactggaaggggttggtgtggatgatgccacttgtaggagcttacatagccgatgcttatttcggtcgctattg 39217796  T
Q  456 gacctttgtgattgcatcatgcatttatttcatggtatgaaatgttaaatttattgtcatcatttg 521  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||    
T  39217795 gacctttgtaattgcatcatgcatttatctcttggtatgtaatg--atatttattttcatcatttg 39217732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39196779 - 39196643
Alignment:
Q  28 ggttgaagaaaaagggtcagcaaacgggaaagaagattacactcaagatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaagatcaaagactggaaga 127  Q
    |||||||||||||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  39196779 ggttgaagaaaaaggccatgcaagtgggaaagaagattacactcaagatggtacagtagacctaaaaggtagacctgttttaagatcaaaaactggacga 39196680  T
Q  128 tggaaagcttgctcctttatagtaggtaaaatgaagc 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  39196679 tggaaagcttgctccttcatagtaggtaaagtgaagc 39196643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39241071 - 39240965
Alignment:
Q  57 aagaagattacactcaagatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaagatcaaagactggaagatggaaagcttgctcctttatagtaggtaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  39241071 aagaagattacactcaagatggaacagtagatttacaaggcagaccagttttaagatcaaagactggaacatggaaagcttgttccttccttgtaggtaa 39240972  T
Q  157 aatgaag 163  Q
    | |||||    
T  39240971 attgaag 39240965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39258496 - 39258399
Alignment:
Q  62 gattacactcaagatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaagatcaaagactggaagatggaaagcttgctcctttatagtaggtaaaat 159  Q
    |||||||| |||||||| ||||||   ||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39258496 gattacacgcaagatggcacagtaagtctacaaggtaaaccggttttaagatcaaagaccggaagatggaaagcttgctcttttatagtaggtaaaat 39258399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39248002 - 39247903
Alignment:
Q  56 aaagaagattacactcaagatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaagatcaaagactggaagatggaaagcttgctcctttatagtaggta 155  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  39248002 aaagaagattatactgaagatgggacagtggaccttaaaggtagaccagttttaagatcaaatacaggaagatggagagcttgttccttcatagtaggta 39247903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39300311 - 39300212
Alignment:
Q  56 aaagaagattacactcaagatggaacagtagacctaaaaggtagacccattttaagatcaaagactggaagatggaaagcttgctcctttatagtaggta 155  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  39300311 aaagaagattatactgaagatgggacagtggaccttaaaggtagaccagttttaagatcaaatacaggaagatggagagcttgttccttcatagtaggta 39300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 39191776 - 39191713
Alignment:
Q  369 aaacaacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccacttgcaggagcttacatagctg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39191776 aaacaacataagcaacttgggggtt-cagtgtcgatgatgccacttgcaagagcttacatagctg 39191713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 39261968 - 39261759
Alignment:
Q  273 gtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaaacttagtggtgtatctaacaagtaaacttcacgagggtactgtggagtcatcaaac 372  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||  || || || |||||||||||  | || ||||||    
T  39261968 gtatgaaatgattgaaaggatggcatactatgggatagcatcaaatctagtgttgtatctaacaaagaagctccatgagggtactgtcaaatcttcaaac 39261869  T
Q  373 aacataagcaacttggggggtgcagtgtggatgatgccacttgcaggagcttacatagctgatgcctatcttggaagatatttgacctttgtgattgcat 472  Q
     |  | | ||| | ||  ||| |||| ||||| ||||||  |   |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||| ||  |||    
T  39261868 catgtcaccaattgggtcggtacagtttggatcatgccagctattggagcttacatagctgatgcttatctcggtcgatattggacctttgttatatcat 39261769  T
Q  473 catgcattta 482  Q
    || |||||||    
T  39261768 caggcattta 39261759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 39185207 - 39185151
Alignment:
Q  450 atatttgacctttgtgattgcatcatgcatttatttcatggtatgaaatgttaaatt 506  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  39185207 atattggacctttgtgattgcatcatgcatttacttcttggtctgaaatgtgaaatt 39185151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 39221007 - 39220963
Alignment:
Q  129 ggaaagcttgctcctttatagtaggtaaaatgaagccctttgctg 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39221007 ggaaagcttgcttctttatagtaggtaaaatgaagccttttgctg 39220963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 39221048 - 39221002
Alignment:
Q  13 catcatgatggaaatggttgaagaaaaagggtcagcaaacgggaaag 59  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39221048 catcatgatggcaatggtagaagaaaaaggctcagcaaaagggaaag 39221002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 320
Target Start/End: Original strand, 32468555 - 32468602
Alignment:
Q  273 gtatgaagtgtttgaaaggatggctttctatggaatagcatcaaactt 320  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32468555 gtatgaagcatttgaaaggatggctttctatggagttgcatcaaactt 32468602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University