View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18641_low_4 (Length: 346)

Name: NF18641_low_4
Description: NF18641
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18641_low_4
NF18641_low_4
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (13-346)||(10217779-10218112)
chr5 (17-287)||(10748052-10748322)
chr5 (17-216)||(10610683-10610882)
chr5 (17-287)||(10717935-10718205)
chr5 (90-287)||(10741809-10742006)
chr5 (26-216)||(10764178-10764368)
chr5 (90-217)||(10563999-10564126)
chr5 (17-145)||(7192049-7192177)
chr5 (242-312)||(9837590-9837660)
chr5 (254-346)||(7191848-7191940)
chr5 (36-133)||(19606921-19607018)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (16-282)||(12931186-12931452)
chr6 (16-346)||(12906033-12906363)
chr6 (16-283)||(12898476-12898743)
chr6 (20-275)||(12956995-12957250)
chr6 (49-282)||(12947551-12947784)
chr6 (233-287)||(24352895-24352949)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (16-216)||(17924439-17924639)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (99-134)||(31468281-31468316)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Original strand, 10217779 - 10218112
Alignment:
Q  13 aaaattgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttccta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10217779 aaaattgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagctagatttagatattgtagatgttggcagtttccta 10217878  T
Q  113 tgcttggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaactt 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10217879 tgcttggaggaatacttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctaacaactt 10217978  T
Q  213 gtttctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaagtggttttgttccattcccaatagagttaag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10217979 gtttctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagcagctgggataattccttcaaagtggttttgttccattcccaatagagttaag 10218078  T
Q  313 cccattaaattgcctaattcggcaggaatttttc 346  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10218079 ccaattaaattgcctaattctgcaggaatttttc 10218112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 10748052 - 10748322
Alignment:
Q  17 ttgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgct 116  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| | ||| || ||| |||||||    
T  10748052 ttgataaagaaaaaatatgaaaaatctctgaaggtatggttccactaagcttattatgagaaagatctaggtattgtaacttttgacaattttctatgct 10748151  T
Q  117 tggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgttt 216  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    | ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10748152 tggaggaatatttccttggaacatattacgatataaatccaatttaaacaattgactgagattgcctatgaagggtggtatatatcctgacaacttgttt 10748251  T
Q  217 ctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaagtggtt 287  Q
    | | |||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  10748252 ccactcaaagctaaatattgcatcttttggaacttcccaaaagaagttggaattattccttcaaagtggtt 10748322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10610882 - 10610683
Alignment:
Q  17 ttgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgct 116  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||| | ||| || |||||||||||    
T  10610882 ttgataaataaaaaagattaaaaatctctaaaggtatggatccactaagtttattatgagaaagatctaggtattgtaacttttgacaatttcctatgct 10610783  T
Q  117 tggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgttt 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||   |||| | ||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10610782 tggaggaatatttccttgaaacatgttactgtgtacagccaacctaaacaattgactgagattgcctatgaagggtggtatatatcctgacaacttgttt 10610683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 10717935 - 10718205
Alignment:
Q  17 ttgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgct 116  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  10717935 ttgataaataaaaaagattaaaaacctctacaggtatggttccactaaacctattatgagaaagatctagatattgtaaattttgacagtttcctatact 10718034  T
Q  117 tggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgttt 216  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| | | |||    |    | ||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10718035 tggaggaatattcccttgaaacatattaagttctaatcgtaaatcaaacaattgactgagatttcctataaagggtggcatatctcctgacaacttgttt 10718134  T
Q  217 ctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaagtggtt 287  Q
    | |  |||   ||| |  |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10718135 ccacccaaaagtaatttctgcatcttttggaagttcccaaaagtagttggaataattccttcaaagtggtt 10718205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 287
Target Start/End: Original strand, 10741809 - 10742006
Alignment:
Q  90 ttgtaaatgttggcagtttcctatgcttggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaag 189  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||    | ||||||| || | ||| |||||||||    
T  10741809 ttgtaaattttgacaatttcctatggtaggaggaatattcccttgaaacatattaaaatttaattccaaatcaaacaattgactaagatttcctataaag 10741908  T
Q  190 tgtggtatatctcctgacaacttgtttctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaagtggtt 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  10741909 ggtggtatatctcctgacaacttgtttccactcaaaattaacacctgcatcttttggaacttcccaaaagtagttggaataattccttcaaaatggtt 10742006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Original strand, 10764178 - 10764368
Alignment:
Q  26 aaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgcttggaggaat 125  Q
    |||||| || ||||| |||||  |||||| |||| |||||||| || | || |||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10764178 aaaaaatatgaaaaacctctacaggtatggttccgctaagcttgttatcagaaagatcgagatattgtaacttttgacagtttcctatgctaggaggaat 10764277  T
Q  126 atttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgttt 216  Q
    |||||| | ||||||||||  |  |||| |||    | ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10764278 atttccgtgaaacatattaccagttaaagccaatgtaaacaattgactgagattgcctatgaagggtggtatatatcctgacaacttgttt 10764368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10564126 - 10563999
Alignment:
Q  90 ttgtaaatgttggcagtttcctatgcttggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaag 189  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |    |||||| || |||| ||| ||||||||     
T  10564126 ttgtaaattttgacaatttcctatgctaggaggaatatttccttcaaacatattatgagctaattctaaatcatacaactgactgagattacctataaaa 10564027  T
Q  190 tgtggtatatctcctgacaacttgtttc 217  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10564026 ggtggcatatcacctgacaacttgtttc 10563999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7192177 - 7192049
Alignment:
Q  17 ttgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgct 116  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |  || |||||||| | || |||||||||||| ||    
T  7192177 ttgataacgaagaaagactgaaaacttctaagggtatggttcctctaagattgttttgtgcaaggtccaggtattgtaactttttgcagtttcctatact 7192078  T
Q  117 tggaggaatatttccttcaaacatattat 145  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  7192077 tgacggaatatttccttctaacatattat 7192049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 312
Target Start/End: Original strand, 9837590 - 9837660
Alignment:
Q  242 tttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaagtggttttgttccattcccaatagagttaag 312  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||    
T  9837590 tttggaactttccaaaattagccgggataattccttcaaagtggttatgtcccatgctcaagagagttaag 9837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7191940 - 7191848
Alignment:
Q  254 caaaagtagctgggataattccttcaaagtggttttgttccattcccaatagagttaagcccattaaattgcctaattcggcaggaatttttc 346  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  7191940 caaaagtagtaggaataattccttcaaagttgttaagttccatgctcaacagagttaagccaattagatttcctaattcttcaggaatttttc 7191848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 133
Target Start/End: Original strand, 19606921 - 19607018
Alignment:
Q  36 aaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgcttggaggaatatttcctt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||   ||   ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19606921 aaaaacctctaagggtatggttccactaagattattttgaaaaaggactatggattgtaacttttgacagtttcctatgcttgaaggaatatttcctt 19607018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12931452 - 12931186
Alignment:
Q  16 attgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgc 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12931452 attgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgagaaagatcaagagattgtaaattttgacagtttcctatgc 12931353  T
Q  116 ttggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgtt 215  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |   |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  12931352 ttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattctaaataatacaattgactgagattgcctatgaagggtggaatacctcctgacaacttgtt 12931253  T
Q  216 tctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaag 282  Q
    |    |||| | |||  | |||||||||||||||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  12931252 ttccctcaaagataatacctgcatcttttggaacttcccaaaatttgttggaataattccttcaaag 12931186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12906363 - 12906033
Alignment:
Q  16 attgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgc 115  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  12906363 attgataaagaaaacagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagc 12906264  T
Q  116 ttggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgtt 215  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  | |    | ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  12906263 ttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaatactaatttaaacaattgactgagattgcctatgaagggtggaatacctccagacaatttgtt 12906164  T
Q  216 tctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaagtggttttgttccattcccaatagagttaagccc 315  Q
    || || ||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||  ||| |  |||||   ||| ||| |||||||     
T  12906163 tccatccaaagataaaagctgcatcttttggaactttccaaaagtagttggaataattccctcaaagaagttatactccatggtcaagagaattaagcca 12906064  T
Q  316 attaaattgcctaattcggcaggaatttttc 346  Q
    | || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12906063 actagatttcctaattcgtcaggaatttttc 12906033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12898743 - 12898476
Alignment:
Q  16 attgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgc 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  12898743 attgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaagcttattatgagaaagatctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgc 12898644  T
Q  116 ttggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgtt 215  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |  |    | |||| || |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12898643 ttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaacaactgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgtt 12898544  T
Q  216 tctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaagt 283  Q
    | |  ||||   |||    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12898543 tttcctcaaacgtaatagctgcatcttttggaacttcccaaaagtagttggaataattccttcaaagt 12898476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12957250 - 12956995
Alignment:
Q  20 ataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgcttgg 119  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12957250 ataatgaaaaaatatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgataaagatttagatattgtaaattttgacagtttcctatgcttgg 12957151  T
Q  120 aggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgtttcta 219  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| || |    | ||||||| |||| ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  12957150 aggaatacttccttgaaacatgttatgatctaattctaatttaaacaattgactgagattccctatgaacggtggaatatctcctgacaacttgtttttc 12957051  T
Q  220 ttcaatgttaaatcttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattcc 275  Q
      |||   |||  | |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  12957050 cacaaatataatacctgcatcttttggaacttcccaaaagtagttggaataattcc 12956995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12947784 - 12947551
Alignment:
Q  49 ggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgcttggaggaatatttccttcaaacatattatgat 148  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12947784 ggtatggttcctctaagcttattatgagaaagataaagagattgtaaattttgacagtttcctatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgat 12947685  T
Q  149 gtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgtttctattcaatgttaaatcttgcatcttttggaa 248  Q
     ||| || |    | ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    |||| | |||  | ||||||||||||||    
T  12947684 ttaattctaaatcaaacaattgactgagattgcctatgaagggtggaatacctcctgacaacttgttttccctcaaagataatacctgcatcttttggaa 12947585  T
Q  249 cttttcaaaagtagctgggataattccttcaaag 282  Q
    |||  ||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  12947584 cttcccaaaatttgttggaataattccttcaaag 12947551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24352949 - 24352895
Alignment:
Q  233 cttgcatcttttggaacttttcaaaagtagctgggataattccttcaaagtggtt 287  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  24352949 cttgcatgttttggaactttacaaaagtatccggaataattccttcaaagtggtt 24352895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 17924439 - 17924639
Alignment:
Q  16 attgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagcaagatttagatattgtaaatgttggcagtttcctatgc 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  17924439 attgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagc 17924538  T
Q  116 ttggaggaatatttccttcaaacatattatgatgtaaatccagccaatacaattggctgaaattgcctataaagtgtggtatatctcctgacaacttgtt 215  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17924539 ttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgtt 17924638  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  17924639 t 17924639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 134
Target Start/End: Original strand, 31468281 - 31468316
Alignment:
Q  99 ttggcagtttcctatgcttggaggaatatttccttc 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31468281 ttggcagtttcctatgcttagaggaatatttccttc 31468316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University