View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18641_low_7 (Length: 274)

Name: NF18641_low_7
Description: NF18641
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18641_low_7
NF18641_low_7
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (56-218)||(26494548-26494710)
chr1 (56-217)||(42570745-42570906)
chr1 (55-218)||(29437024-29437186)
chr1 (55-218)||(35525150-35525312)
chr1 (55-218)||(41803316-41803479)
chr1 (56-218)||(24363021-24363183)
chr1 (69-218)||(49397736-49397885)
chr1 (55-218)||(18974401-18974564)
chr1 (55-202)||(46142408-46142555)
chr1 (55-218)||(49428429-49428592)
chr1 (55-217)||(36910972-36911133)
chr1 (55-217)||(48227602-48227764)
chr1 (55-217)||(49925402-49925564)
chr1 (55-218)||(13974016-13974179)
chr1 (55-218)||(6436803-6436973)
chr1 (70-218)||(13634387-13634535)
chr1 (69-218)||(27485690-27485838)
chr1 (55-195)||(51270916-51271056)
chr1 (70-195)||(29761148-29761273)
chr1 (57-188)||(35585861-35585992)
chr1 (55-144)||(14172713-14172802)
chr1 (60-188)||(23343637-23343765)
chr1 (55-143)||(26634161-26634249)
chr1 (57-188)||(15355743-15355874)
chr1 (65-188)||(37779266-37779389)
chr1 (55-158)||(44336871-44336974)
chr1 (65-188)||(17685296-17685419)
chr1 (57-188)||(38044163-38044294)
chr1 (57-188)||(39856202-39856333)
chr1 (57-188)||(49260638-49260769)
chr1 (64-182)||(40532343-40532461)
chr1 (60-182)||(12790235-12790354)
chr1 (93-215)||(13284550-13284675)
chr1 (57-188)||(35186121-35186252)
chr1 (60-218)||(16531152-16531313)
chr1 (57-188)||(24269327-24269457)
chr1 (99-188)||(31451454-31451543)
chr1 (89-188)||(14771762-14771861)
chr1 (9-43)||(26494728-26494762)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (13-218)||(34152199-34152403)
chr4 (55-218)||(44559281-44559444)
chr4 (55-218)||(56139983-56140146)
chr4 (55-218)||(956408-956571)
chr4 (55-218)||(6176391-6176554)
chr4 (55-218)||(6281479-6281642)
chr4 (55-218)||(21016253-21016416)
chr4 (55-218)||(49095713-49095876)
chr4 (13-217)||(49422670-49422870)
chr4 (57-218)||(51427157-51427319)
chr4 (55-218)||(37867540-37867703)
chr4 (55-218)||(40352852-40353015)
chr4 (55-218)||(41793878-41794041)
chr4 (55-218)||(49572190-49572353)
chr4 (69-218)||(9490555-9490704)
chr4 (55-218)||(55797711-55797874)
chr4 (55-195)||(34528774-34528914)
chr4 (56-188)||(42887399-42887531)
chr4 (55-195)||(1043836-1043976)
chr4 (55-195)||(39589872-39590012)
chr4 (59-188)||(4784301-4784430)
chr4 (60-218)||(21410938-21411099)
chr4 (57-188)||(36775441-36775572)
chr4 (60-218)||(21412347-21412508)
chr4 (57-188)||(21170599-21170730)
chr4 (70-182)||(49816385-49816497)
chr4 (57-188)||(49790888-49791019)
chr4 (57-188)||(51026747-51026878)
chr4 (60-188)||(2774140-2774267)
chr4 (57-218)||(9718344-9718507)
chr4 (57-218)||(25145619-25145783)
chr4 (89-188)||(4910624-4910723)
chr4 (68-182)||(43888460-43888574)
chr4 (57-218)||(45940628-45940792)
chr4 (57-144)||(17292831-17292918)
chr4 (88-218)||(24076212-24076345)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (13-214)||(48271745-48271946)
chr7 (55-218)||(46861151-46861314)
chr7 (13-218)||(41623171-41623376)
chr7 (69-218)||(42683493-42683642)
chr7 (55-218)||(17840289-17840452)
chr7 (55-218)||(9366193-9366356)
chr7 (55-218)||(34141941-34142104)
chr7 (55-218)||(34157770-34157930)
chr7 (55-195)||(40589850-40589990)
chr7 (55-218)||(21186250-21186413)
chr7 (71-218)||(36392793-36392940)
chr7 (55-218)||(20565729-20565892)
chr7 (55-210)||(28978189-28978344)
chr7 (55-218)||(42504331-42504494)
chr7 (55-217)||(10225161-10225323)
chr7 (55-195)||(48194078-48194218)
chr7 (55-195)||(45362249-45362389)
chr7 (55-218)||(28113362-28113522)
chr7 (57-218)||(4230560-4230724)
chr7 (57-218)||(15900364-15900522)
chr7 (65-188)||(43350358-43350481)
chr7 (60-218)||(1641643-1641804)
chr7 (60-188)||(42736111-42736238)
chr7 (65-188)||(22291966-22292089)
chr7 (82-182)||(20877007-20877107)
chr7 (57-188)||(17184320-17184450)
chr7 (71-141)||(3380031-3380101)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (55-218)||(28167883-28168046)
chr8 (55-218)||(484330-484493)
chr8 (55-218)||(41276155-41276318)
chr8 (55-218)||(41855954-41856117)
chr8 (55-218)||(24862426-24862589)
chr8 (13-218)||(18439213-18439418)
chr8 (58-217)||(42604532-42604691)
chr8 (55-218)||(15031397-15031560)
chr8 (55-218)||(41016926-41017089)
chr8 (56-217)||(40703442-40703603)
chr8 (55-218)||(45065757-45065920)
chr8 (55-195)||(44051535-44051675)
chr8 (88-185)||(22550179-22550276)
chr8 (57-149)||(26487615-26487707)
chr8 (57-188)||(38032863-38032994)
chr8 (65-188)||(42167903-42168026)
chr8 (89-182)||(19241648-19241741)
chr8 (89-182)||(19314832-19314925)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (55-218)||(34682884-34683047)
chr5 (55-218)||(18309349-18309512)
chr5 (13-218)||(3602431-3602635)
chr5 (55-218)||(25499170-25499333)
chr5 (55-218)||(35566360-35566523)
chr5 (55-217)||(35927037-35927197)
chr5 (55-217)||(8538947-8539109)
chr5 (55-218)||(11347770-11347933)
chr5 (70-218)||(11028417-11028565)
chr5 (55-218)||(1399258-1399421)
chr5 (55-218)||(8575218-8575381)
chr5 (55-218)||(19035752-19035915)
chr5 (69-196)||(20199451-20199578)
chr5 (55-218)||(38855124-38855287)
chr5 (55-218)||(6307-6470)
chr5 (55-218)||(27660454-27660617)
chr5 (57-188)||(7484451-7484582)
chr5 (55-218)||(30710569-30710732)
chr5 (57-175)||(1972510-1972628)
chr5 (57-188)||(6792405-6792536)
chr5 (57-182)||(1695934-1696059)
chr5 (60-182)||(36349265-36349386)
chr5 (65-144)||(4723057-4723136)
chr5 (89-218)||(7400798-7400930)
chr5 (89-173)||(31239140-31239224)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (69-218)||(19470591-19470740)
chr2 (55-217)||(23408807-23408969)
chr2 (55-218)||(2918320-2918483)
chr2 (55-218)||(35492618-35492780)
chr2 (55-218)||(16582895-16583058)
chr2 (55-218)||(41498074-41498237)
chr2 (55-218)||(43492545-43492708)
chr2 (55-218)||(43983697-43983860)
chr2 (55-217)||(3936377-3936539)
chr2 (55-218)||(22002797-22002960)
chr2 (57-218)||(40676376-40676537)
chr2 (55-218)||(28476477-28476640)
chr2 (55-218)||(17425761-17425924)
chr2 (65-218)||(33404838-33404994)
chr2 (55-218)||(39798941-39799104)
chr2 (57-188)||(6977952-6978083)
chr2 (55-183)||(3942507-3942635)
chr2 (57-188)||(34520674-34520805)
chr2 (60-175)||(37311602-37311717)
chr2 (57-188)||(15890930-15891060)
chr2 (70-188)||(16413245-16413362)
chr2 (57-209)||(5421234-5421389)
chr2 (60-188)||(17537870-17537998)
chr2 (68-188)||(24107738-24107858)
chr2 (55-118)||(23786743-23786806)
chr2 (13-43)||(40676328-40676358)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (13-218)||(45099383-45099588)
chr3 (55-218)||(43570965-43571128)
chr3 (55-217)||(2429568-2429730)
chr3 (19-218)||(13894825-13895023)
chr3 (55-217)||(52568395-52568557)
chr3 (55-218)||(41579008-41579171)
chr3 (55-218)||(4003228-4003391)
chr3 (55-218)||(54391424-54391587)
chr3 (55-218)||(55268035-55268198)
chr3 (55-216)||(34692258-34692419)
chr3 (55-218)||(7247141-7247305)
chr3 (55-218)||(2267559-2267722)
chr3 (55-218)||(34050709-34050872)
chr3 (55-214)||(36136001-36136159)
chr3 (59-218)||(46345565-46345724)
chr3 (55-218)||(46405987-46406150)
chr3 (55-218)||(49139128-49139291)
chr3 (55-218)||(51694510-51694673)
chr3 (71-217)||(55205913-55206058)
chr3 (55-218)||(2645950-2646113)
chr3 (56-218)||(49217704-49217867)
chr3 (13-188)||(34646135-34646310)
chr3 (70-194)||(43478134-43478258)
chr3 (55-218)||(3494098-3494261)
chr3 (69-183)||(49611272-49611386)
chr3 (60-218)||(20374938-20375098)
chr3 (57-188)||(11377939-11378070)
chr3 (57-188)||(49274547-49274678)
chr3 (57-188)||(34471019-34471150)
chr3 (57-218)||(51012244-51012408)
chr3 (68-218)||(27188168-27188321)
chr3 (65-188)||(50458216-50458339)
chr3 (57-175)||(14632608-14632726)
chr3 (60-188)||(44928588-44928716)
chr3 (69-217)||(27096660-27096812)
chr3 (57-188)||(10052315-10052445)
chr3 (57-188)||(51016416-51016547)
chr3 (55-149)||(3497792-3497886)
chr3 (160-214)||(24701353-24701407)
chr3 (57-116)||(46413246-46413305)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (55-218)||(32026579-32026742)
chr6 (55-218)||(32036638-32036801)
chr6 (55-218)||(13403900-13404063)
chr6 (69-218)||(13616869-13617018)
chr6 (55-214)||(34802139-34802298)
chr6 (55-218)||(6206456-6206619)
chr6 (55-218)||(11693423-11693586)
chr6 (55-218)||(27641146-27641309)
chr6 (70-218)||(32691680-32691828)
chr6 (57-218)||(14123794-14123958)
chr6 (92-218)||(35020248-35020373)
chr6 (69-195)||(29067587-29067713)
chr6 (69-195)||(29109176-29109302)
chr6 (57-188)||(12397916-12398046)
chr6 (57-217)||(20241309-20241472)
chr6 (57-217)||(22135293-22135456)
chr6 (57-217)||(22142646-22142809)
chr6 (60-217)||(32133629-32133789)
chr6 (89-218)||(30763971-30764103)
chr6 (89-149)||(17464487-17464547)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (55-218)||(2866-3029)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (59-218)||(4519-4678)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (55-218)||(5798-5961)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (60-188)||(1456-1584)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (70-188)||(5420-5538)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (57-149)||(1571-1663)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (91-218)||(9577-9707)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26494710 - 26494548
Alignment:
Q  56 gttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagc 155  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  26494710 gttcgaaggtgcaggtgtacaatcagtcgaagttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagaaggtgctccagggactgtagc 26494611  T
Q  156 gggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26494610 gggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 26494548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 42570745 - 42570906
Alignment:
Q  56 gttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagc 155  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||     
T  42570745 gttcgaaggtgccggcgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgcctcagggactgtaga 42570844  T
Q  156 gggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42570845 gggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaatt 42570906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29437186 - 29437024
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  29437186 ggttcgaaggtgctggtgtacaatcactcgaagttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccc-agggactgtag 29437088  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29437087 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaagaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 29437024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 35525150 - 35525312
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||    
T  35525150 ggtttgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggaatgtag 35525249  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35525250 cgggcaa-ccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 35525312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41803479 - 41803316
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||| ||||    
T  41803479 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaaccaaaacaaggtgtcccaaggactgtag 41803380  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41803379 cgggcaacccgattgacttgtgtgacaaggaagaatgaatgtaatggcttttaaggcctaattg 41803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Original strand, 24363021 - 24363183
Alignment:
Q  56 gttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagc 155  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  24363021 gttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcggggttgaggaggagtgggaggatatgctattttggtcctcaaccaaaagaaggtgctccagggactgtagt 24363120  T
Q  156 gggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24363121 gggcaacctgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttctaatgcctaattg 24363183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49397885 - 49397736
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49397885 ggtgtacaatcagtcgaggttgaggatgagcgggaggacatactattttggtcatcgaccaaaacacggtgccccaaggactgtagcgggcaacccgatt 49397786  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49397785 gacttgtgtgacgatgaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 49397736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18974564 - 18974401
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  18974564 ggttcgaaagtgccggtgtacaaacagtcctggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 18974465  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18974464 cggacaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgggttttaatgcctaattg 18974401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 202
Target Start/End: Original strand, 46142408 - 46142555
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  46142408 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagttcaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgcccctgggactgtag 46142507  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggc 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  46142508 cgggcaacccgattgacttgtgtgatgaggaagaatgaatgtaatggc 46142555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49428592 - 49428429
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  49428592 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 49428493  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
     |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49428492 tgggcaacccggttgatttgtgtgacgaggaagaatgaatataatggcttttaatgcctaattg 49428429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36911133 - 36910972
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  36911133 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgagaaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 36911034  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    | ||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  36911033 c-ggcaacccggttgacttgtgcgacgaggaagaatgaatataaagacttttaatgcctaatt 36910972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 48227764 - 48227602
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  48227764 ggttcgaaggtgccgatgtacaatcgctcgaggttgaggaggagcgagaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 48227665  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48227664 cgggcaacccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaaagcctaatt 48227602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Original strand, 49925402 - 49925564
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||  |||||| ||||    
T  49925402 ggttcgaatgtgccggtgtacaatcactcgaggttgacgaggagcgggaggacatgttatttcggtcctcaaccaaaacaaggtgccttagggactgtag 49925501  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  49925502 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggtttttaatgcctaatt 49925564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13974179 - 13974016
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| || || ||||||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  13974179 ggtttgaaggtgccggtgtacaatcactccaggttgaggaggagatggaggacatgctattttgttcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 13974080  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13974079 cgggcaacccgattaacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggtttttaatgtctaattg 13974016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6436973 - 6436803
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||  ||||    
T  6436973 ggttcgaatgtgccggtgtacaattagtccaaattgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacatggtgccccagggattgtag 6436874  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgt-------atgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436873 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgactgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 6436803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 13634387 - 13634535
Alignment:
Q  70 gtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattg 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13634387 gtgtacaatcactcgaggttgaggagtagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtagcggacaagccgattg 13634486  T
Q  170 acttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13634487 atttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 13634535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 27485690 - 27485838
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |||| |||||||  |||||||||    
T  27485690 ggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcaggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgca-ggactgtagcggaaaacccgatt 27485788  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27485789 gacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtaatggctttaaatgcctaattg 27485838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51271056 - 51270916
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  51271056 ggttcgaaggtgccggtgtacattcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggactgtag 51270957  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  51270956 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatg 51270916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Original strand, 29761148 - 29761273
Alignment:
Q  70 gtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattg 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||    
T  29761148 gtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggactgtagcgggaatcccgattg 29761247  T
Q  170 acttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
     ||||| ||||||||| || ||||||    
T  29761248 gcttgtgtgacgaggatgaatgaatg 29761273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 35585861 - 35585992
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || | |    
T  35585861 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcgag 35585960  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  35585961 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 35585992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Original strand, 14172713 - 14172802
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgcccca 144  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14172713 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagaaggtgcccca 14172802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23343765 - 23343637
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | || |    
T  23343765 gaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggtgccccagggattgtcgaggac 23343666  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  23343665 aacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 23343637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 26634161 - 26634249
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgcccc 143  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  26634161 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgcccc 26634249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 15355743 - 15355874
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||  | | |    
T  15355743 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtaccccagggactatcgag 15355842  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  15355843 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 15355874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37779389 - 37779266
Alignment:
Q  65 tgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaaccc 164  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||    
T  37779389 tgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagtgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcgaggacaaccc 37779290  T
Q  165 gattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
     |||||||||| ||| ||||||||    
T  37779289 aattgacttgtgtgatgaggaaga 37779266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Original strand, 44336871 - 44336974
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  44336871 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaagagaagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaatcaaggtgccgcagggactgtag 44336970  T
Q  155 cggg 158  Q
    ||||    
T  44336971 cggg 44336974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Original strand, 17685296 - 17685419
Alignment:
Q  65 tgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaaccc 164  Q
    ||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||| || | |  ||||||    
T  17685296 tgctggtgtatgatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccctagggactgtcgagtacaaccc 17685395  T
Q  165 gattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
     |||||||||| ||| ||||||||    
T  17685396 aattgacttgtgtgatgaggaaga 17685419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 38044163 - 38044294
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||| || |      
T  38044163 ttcgaaggtgttggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttttgtcctcaaccaaaagcaggtgcctcagggactgtcgac 38044262  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  38044263 gacaacccaattgacctgtgtgatgaggaaga 38044294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 39856202 - 39856333
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || |      
T  39856202 ttcgaaggtgttggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcaggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcgaa 39856301  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |  ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  39856302 gaaaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 39856333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 49260638 - 49260769
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||| || | |    
T  49260638 ttcgaaggtgctggtgtataatgattcgaggttgaggatgagcggaaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtaccccagggactgtcgag 49260737  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  49260738 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 49260769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 182
Target Start/End: Original strand, 40532343 - 40532461
Alignment:
Q  64 atgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacc 163  Q
    ||||||||||| ||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||| | || ||||     
T  40532343 atgctggtgtataatcatttgaagttgaggaggagcgggaggacatgctatttttgtcctcagccaaaagcaggtgcctcagggaccgtcgaggacaact 40532442  T
Q  164 cgattgacttgtatgacga 182  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  40532443 cgattgacttgtgtgacga 40532461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 182
Target Start/End: Original strand, 12790235 - 12790354
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || | || |    
T  12790235 gaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggagt---gggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcgaggac 12790331  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacga 182  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  12790332 aacccgattgccttgtgtgacga 12790354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13284675 - 13284550
Alignment:
Q  93 gaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gac 189  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| | | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||   ||     
T  13284675 gaggagcgagaggacatgctattttggtcctcaatgaaaagcaagtgcccaagggactgtagcgggcaacccgattgatttgtgtgatgaggaagatgaa 13284576  T
Q  190 tgaatgtaatggcttttaatgcctaa 215  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  13284575 tgaatgtaatggtttctaatgcctaa 13284550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35186252 - 35186121
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | | ||||||||||||| || | |    
T  35186252 ttcgaaggtggtggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggagaacatgctattttggttctcagccaaaagcaagtgccccagggactgtcgag 35186153  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  35186152 gacaacccaattgacttgtgtcatgaggaaga 35186121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Original strand, 16531152 - 16531313
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| ||| |||||||||| | || ||  |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||| || | || |    
T  16531152 gaaggtgccggtgtacaattattctaggctgaggaggagtgggaggacatgctattttgatcctcaaccaaaagcaggtgccccaaggactgtcgaggac 16531251  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaag---actgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||| ||||| ||   |||||||||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16531252 aacccaattgagttcagtgacgaggaagataattgaatgtaacggcttgtaatgcctaattg 16531313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 24269327 - 24269457
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||| || | |    
T  24269327 ttcgaaggtgctggtgtata-tcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcggccaaaagcaggtgccctagggactgtcgag 24269425  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | || | | |||||||||| ||| ||||||||    
T  24269426 gacagctcaattgacttgtgtgatgaggaaga 24269457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 31451454 - 31451543
Alignment:
Q  99 cgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||| || | || |||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  31451454 cgggtggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcaagtgccccggggactgttgaggacaacccaattgacttgtgtgacaaggaaga 31451543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Original strand, 14771762 - 14771861
Alignment:
Q  89 tgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||   | | ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14771762 tgaggaggagcgggaggacatgatattttggttctcaaccaaaagcaggtgccccaaggaatatcgaggataacccaattgacttgtgtgacgaggaaga 14771861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 26494762 - 26494728
Alignment:
Q  9 tattacatgacacgaaattgtttgtgatggttccg 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26494762 tattacatgacacgaaattgtttgtgatgattccg 26494728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 34152199 - 34152403
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34152199 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgaaaaaagaag-ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgct 34152297  T
Q  113 attttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcc 212  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34152298 attttggtcctcaaccaaatcaaggtgccccagggactgtagcgggcaacccggttgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcc 34152397  T
Q  213 taattg 218  Q
    ||||||    
T  34152398 taattg 34152403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 44559281 - 44559444
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  44559281 ggtttgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaatcaaggtgccccagagactgtag 44559380  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44559381 cgggcaacccgtttgacttgtgtgacgaggcagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 44559444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 56140146 - 56139983
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  56140146 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 56140047  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  56140046 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtagtggtttttaatgcctaattg 56139983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 956408 - 956571
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  956408 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 956507  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  956508 caggcaactcgtttggcttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 956571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 6176391 - 6176554
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  6176391 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 6176490  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6176491 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 6176554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 6281479 - 6281642
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||  |||    
T  6281479 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcaggaggacatgctattttgatcctcaatcaaaacaaggtgccccagggactttag 6281578  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6281579 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatataatggtttttaatgcctaattg 6281642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 21016253 - 21016416
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  21016253 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 21016352  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21016353 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 21016416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49095876 - 49095713
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  49095876 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 49095777  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49095776 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 49095713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 49422670 - 49422870
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgct 112  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  49422670 acatgacacataattgtttgtgatggttccgaaaaaaagaagggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagtgggaggacatgct 49422769  T
Q  113 attttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcc 212  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49422770 attttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccaaggactttagcgggcaaccc----gacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcc 49422865  T
Q  213 taatt 217  Q
    |||||    
T  49422866 taatt 49422870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Original strand, 51427157 - 51427319
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctatttt-ggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagc 155  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||    
T  51427157 ttcgaaggtgccagtgtacaattagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttttggtcctcaaccaaaacaaggcgccccagggactatagc 51427256  T
Q  156 gggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51427257 gggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaattcctaattg 51427319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37867703 - 37867540
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  37867703 ggttcgaaggtgccggtgtataatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaacaaaaacaaggtgccccagggactgtag 37867604  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37867603 cgggcgacccaattgacttgtgtgacgaggaataatgaatgtaatggcttttaatgcttaattg 37867540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 40352852 - 40353015
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||| ||| ||||    
T  40352852 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagcgactgtag 40352951  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40352952 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 40353015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 41793878 - 41794041
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  41793878 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 41793977  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793978 cggacaagccaatcgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 41794041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49572353 - 49572190
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||  ||||    
T  49572353 ggttcgagggtgccggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggatgacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccatagggattgtag 49572254  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49572253 tgtgcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 49572190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9490704 - 9490555
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9490704 ggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagctggaggacatgctattttggtcctcagccaaaacaaggtgccccagggactatagcgggcaacccgatt 9490605  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9490604 gacttgtctgatgaggatgaatggatgtagtggcttttaatgcctaattg 9490555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55797874 - 55797711
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || || |||| ||||    
T  55797874 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcatggactgtag 55797775  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55797774 cggacaagccaattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 55797711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 34528774 - 34528914
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||    
T  34528774 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggattgtag 34528873  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  34528874 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatg 34528914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42887531 - 42887399
Alignment:
Q  56 gttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagc 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  42887531 gttcgaaggtgctggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaaccaaaagaaggtgccccaatgactgtagc 42887432  T
Q  156 gggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||| ||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  42887431 gggaaacccgattaacctgtgtgacgaggaaga 42887399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1043976 - 1043836
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  1043976 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgagagaacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggactgtag 1043877  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  1043876 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatg 1043836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39590012 - 39589872
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||| ||||    
T  39590012 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcacttgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgtagggactgtag 39589913  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  39589912 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatg 39589872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 188
Target Start/End: Original strand, 4784301 - 4784430
Alignment:
Q  59 cgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcggg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4784301 cgaagttgccggtgtacaatcattcgaggttgaggaggagcggggggacatgctattttggtcctcaaccaaaagaatgtgccccagggactgtagcggg 4784400  T
Q  159 caacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  4784401 caacctgattaacctgtgtgacgaggaaga 4784430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Original strand, 21410938 - 21411099
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |  | || |    
T  21410938 gaaggtgccggtgtacaatcagtcaaggttgaggagaagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggtgccacagggactggcgaggac 21411037  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21411038 aacccaattgacttgtgtgacgaggaagatgattgaatgtaatggcttgtgatgcctaattg 21411099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 36775441 - 36775572
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| | |    
T  36775441 ttcgaaggtgctggtgtataattattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggaccgtcgag 36775540  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  36775541 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 36775572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21412508 - 21412347
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||| |  | || |    
T  21412508 gaaggtgccggtgtacaatcagtcaaggttgaggagaagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggtgcctctgggactggcgaggac 21412409  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21412408 aacccaattgacttgtgtgacgaggaagatgattgaatgtaatggcttgtgatgcctaattg 21412347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21170730 - 21170599
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| || | |    
T  21170730 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcggaaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgcccccgggactgtcgag 21170631  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  21170630 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 21170599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Original strand, 49816385 - 49816497
Alignment:
Q  70 gtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattg 169  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||| || | || |||||||||||    
T  49816385 gtgtataatcagtcgaggttgaggaggagctggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccctagggactgtcgaggacaacccgattg 49816484  T
Q  170 acttgtatgacga 182  Q
    |||||| ||||||    
T  49816485 acttgtgtgacga 49816497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 49790888 - 49791019
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || | |    
T  49790888 ttcgaaggtgctgatgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgatattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcgag 49790987  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
      |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  49790988 aacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 49791019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 51026747 - 51026878
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||   |    
T  51026747 ttcgaaggtgctgatgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggatgacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcaag 51026846  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  51026847 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 51026878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2774267 - 2774140
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || | || |    
T  2774267 gaaggtgcttgtgtataattattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcttcaaccaaaagcaggtgcccc-gggactgtcgaggac 2774169  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  2774168 aacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 2774140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9718507 - 9718344
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| || | |    
T  9718507 ttcgaaggtgccggtgtacaaccagtccaggctgaggaggagtgggaggacatgctattttggtcctcagccaaa-gcaggtgctccagggactgtcgag 9718409  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgag---gaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||   || || |||||||||||| || | |||||||||||    
T  9718408 gacaacccaattgacttgtgtgacgagaaagatgattgaatgtaatggtttgtcatgcctaattg 9718344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25145783 - 25145619
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||  |||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | |    
T  25145783 ttcgaaggtgccggtgtacaaccagcccaggctgaggaggagcggaaggacatgttatttcggtcctcaaccaaaagcaggtgcgccagggactgtcgag 25145684  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||||| |||||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25145683 gacaacccaattgacttatgtgacgaggaagatgattgaatgtaatggcttgtaatgtctaattg 25145619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Original strand, 4910624 - 4910723
Alignment:
Q  89 tgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||| || | || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4910624 tgaggaagagcgggaggacatgctattttggtcctcatccaaaagcaggtgccctagggactgtcgaggacaacccaattgacttgtgtgacgaggaaga 4910723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 182
Target Start/End: Original strand, 43888460 - 43888574
Alignment:
Q  68 tggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgat 167  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| ||   || ||| |||||    
T  43888460 tggtgtataatcatttgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggccctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcaaggacaatccgat 43888559  T
Q  168 tgacttgtatgacga 182  Q
    |||||||| ||||||    
T  43888560 tgacttgtgtgacga 43888574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45940792 - 45940628
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||| || ||| || | |    
T  45940792 ttcgaaggtgctgatgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttgggtcctcagccaaaagcaggtgccctagagactgtcgag 45940693  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgt---atgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||| | ||||||||||   ||||||| || || |||||||||||| || ||||  |||||||    
T  45940692 gacaactcaattgacttgtgtgatgacgaagatgattgaatgtaatgggttgtaatatctaattg 45940628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17292918 - 17292831
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgcccca 144  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || || ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  17292918 ttcgaaggtgccggtgtacaaccattcaaggctgaggaggagcaggaggacatgctattttggtcctcaacaaaaagcaggtgcccca 17292831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24076345 - 24076212
Alignment:
Q  88 ttgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa- 186  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||  | | || |||||| |||| ||||| ||||||||||     
T  24076345 ttgaggaggagcggaaggacttgttatttcggtcctcaaccaaaagcaggtgccccaggcactctcgaggacaacccaattgtcttgtgtgacgaggaag 24076246  T
Q  187 --gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
      || ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  24076245 atgattgaatgtaatgacttgtaatgtctaattg 24076212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48271946 - 48271745
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgct 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  48271946 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgtaaaaaagaagggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggatgacatgct 48271847  T
Q  113 attttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcc 212  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48271846 attttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtagcgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcc 48271747  T
Q  213 ta 214  Q
    ||    
T  48271746 ta 48271745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 46861151 - 46861314
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  46861151 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgagattgaggaggagtgggaggaaatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 46861250  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46861251 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 46861314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41623376 - 41623171
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgct 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  41623376 acatggcacgaaattgtttgtgatggttccgaaaaaaagaatggttcgaaggtgtcggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcggaaggacatgct 41623277  T
Q  113 attttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcc 212  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41623276 attttggtcctcatccaaaacaaggtgccccagggactgtagcgggcaacccgattgacttgtgtgatgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcc 41623177  T
Q  213 taattg 218  Q
    ||||||    
T  41623176 taattg 41623171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42683642 - 42683493
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42683642 ggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtagcgggcaacccgatt 42683543  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42683542 gacttgtgtgatgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 42683493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17840452 - 17840289
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  17840452 ggttcgaatgtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 17840353  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17840352 cgggcaacccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 17840289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 9366193 - 9366356
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  9366193 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 9366292  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9366293 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 9366356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34142104 - 34141941
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  34142104 ggttcgaaggtgccggagtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggatgacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccacagggactgtag 34142005  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34142004 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggaggaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 34141941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34157930 - 34157770
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  34157930 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggag---cgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccacagggactgtag 34157834  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157833 cgggcaacccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 34157770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40589990 - 40589850
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  40589990 ggttcgaagatgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaacaaggtgccgcagggaccgtag 40589891  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  40589890 caggaaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatg 40589850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 21186250 - 21186413
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  21186250 ggttcgaaggtgccggtatacaatcaatccaggttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccctagggactgtag 21186349  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21186350 cgggcaactcgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacatttaatgcctaattg 21186413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Original strand, 36392793 - 36392940
Alignment:
Q  71 tgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattga 170  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36392793 tgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaaccaaaacaaggtgcctcagggactgtagcgggcaacccgattga 36392892  T
Q  171 cttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36392893 cttgtgtgacgaggaagaattaatgtaatttcttttaatgcctaattg 36392940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20565892 - 20565729
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  20565892 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 20565793  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20565792 cggacaagccaatcgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 20565729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 210
Target Start/End: Original strand, 28978189 - 28978344
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||| ||||||| ||||    
T  28978189 ggttcgaaggtcccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaacaaaaacaaggcgccacagggactgtag 28978288  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  28978289 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaaagacttttaatg 28978344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 42504331 - 42504494
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  42504331 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaagaaggtaccgcagggactgtag 42504430  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42504431 cggacaagccaattgatttgtgtgacgaggaagaatgacagtaatggcttttaatgcctaattg 42504494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10225323 - 10225161
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||| ||  ||||    
T  10225323 ggtttgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcggggggaaatgctattttggttctcaaccaaaacaaggtgcctcagagattgtag 10225224  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10225223 cggccaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatataatggcttttaatgtctaatt 10225161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48194218 - 48194078
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||  |||    
T  48194218 ggttcgaaggtgctggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggactatag 48194119  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  48194118 cgggaaacctgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatg 48194078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 45362249 - 45362389
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  45362249 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagaaggtgccgcaaggactgtag 45362348  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  45362349 caggaaatccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatg 45362389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 28113362 - 28113522
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  28113362 ggtttgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccacagggactgtag 28113461  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||| | || | | |||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||    
T  28113462 cgggcaacccgagtaacctttgtgacgaggaaga-tg--tgtagtggcttgtaatgcctaattg 28113522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4230724 - 4230560
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| || | |    
T  4230724 ttcgaaggtgccggtgtacaatcattccaggtggaggaggagcgggaggacatgctattttgatcctcaaccaaaagcaggtgccccagggactgtcgag 4230625  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||   || ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  4230624 gacaacccaattgacttgtgtgacgaggaagatgattgattgtaatggcttgtaatgtctaattg 4230560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Original strand, 15900364 - 15900522
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||| || | |    
T  15900364 ttcgaaggtgctggtgtacaatcagtcgaggctgaggaggagtgggaggatatgctattttggtcctcagtcaaaagcaggtgccccagggactgtcgag 15900463  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||||||||| || ||| ||||||||||||    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  15900464 gacaacccgattaacctgtgtgacgaggaaga---tatgtagtggcttgtaatgcctaattg 15900522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Original strand, 43350358 - 43350481
Alignment:
Q  65 tgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaaccc 164  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||    
T  43350358 tgctggtgtataatcatttgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcttcaaccaaaagcaggtgccccagggactgtcgaggacaaccc 43350457  T
Q  165 gattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
     |||||||||| ||| ||||||||    
T  43350458 aattgacttgtgtgatgaggaaga 43350481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Original strand, 1641643 - 1641804
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |  | || |    
T  1641643 gaaggtgccggtgtacaatcaaacgaggttgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaaccaaaagaaggtgccccaggaactggcgaggac 1641742  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    || ||  ||||||||| ||||||||||   || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  1641743 aatccagttgacttgtgtgacgaggaagatgattgaatgtaatggattgtaatgcctaattg 1641804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42736238 - 42736111
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| || | || |    
T  42736238 gaagatgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggagaacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtg-cccagggactgtcgaggac 42736140  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  42736139 aacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 42736111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22292089 - 22291966
Alignment:
Q  65 tgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaaccc 164  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||| || | || |||||     
T  22292089 tgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctgagccaaaagcaggtgccccagggactgtcgaggacaacct 22291990  T
Q  165 gattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
     |||||||||| ||| ||||||||    
T  22291989 aattgacttgtgtgatgaggaaga 22291966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Original strand, 20877007 - 20877107
Alignment:
Q  82 tcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacg 181  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||||| |||| |||||    
T  20877007 tcgaggtttaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggtgccccagggactgtcgaggacaacccgattgaattgtgtgacg 20877106  T
Q  182 a 182  Q
    |    
T  20877107 a 20877107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17184450 - 17184320
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | | ||||| | |||||||||| |||  || | |    
T  17184450 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatatt-gtccttagccaaaagcaggtgccccatggattgtcgag 17184352  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  17184351 gacaacccaattgacttgtgtgatgcggaaga 17184320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Original strand, 3380031 - 3380101
Alignment:
Q  71 tgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgcc 141  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  3380031 tgtataattagtccagactgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggtgcc 3380101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28168046 - 28167883
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  28168046 ggttcgaaggtgtcggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 28167947  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28167946 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 28167883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 484330 - 484493
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  484330 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 484429  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  484430 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 484493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41276318 - 41276155
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  41276318 ggttcgaaggtgccggtgtataatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggactgtag 41276219  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41276218 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtagtggcttttaatgcctaattg 41276155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 41855954 - 41856117
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  41855954 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggttcttaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 41856053  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41856054 cgggcaacccgattgatttgtgtgacaaggaagaatgaatgtaatggtttttaatgcctaattg 41856117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24862589 - 24862426
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||| ||||    
T  24862589 ggttcgaaggtgctggtatacaatcactcgaggttgaggaggagtgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgtagggactgtag 24862490  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24862489 cgggaaacccgtttgacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 24862426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 18439213 - 18439418
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgct 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||           |||| |||| ||| | |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||    
T  18439213 acatgacacgtaattgtttgtgatggttccgaaaaaaagaagggtttgaaggtgccgatgtacaatcaatccaggttgaggaggagcgggaggacatgct 18439312  T
Q  113 attttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcc 212  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18439313 attttggtcctcaaccaaaacaaggtgccctagggacagttgtgggaaacccgattgacttttgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcc 18439412  T
Q  213 taattg 218  Q
    ||||||    
T  18439413 taattg 18439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42604691 - 42604532
Alignment:
Q  58 tcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgg 157  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||   || ||    
T  42604691 tcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcgatcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactccagtgg 42604592  T
Q  158 gcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42604591 gcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggtttttaatgcctaatt 42604532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 15031397 - 15031560
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  15031397 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggatatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 15031496  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15031497 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 15031560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 41016926 - 41017089
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  41016926 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcacacgaggttgaggatgagcaggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccacagggactgtag 41017025  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41017026 cgggcaacccgattgatttgtgtgacgaagaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 41017089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40703603 - 40703442
Alignment:
Q  56 gttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagc 155  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| | ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||| ||||     
T  40703603 gttcgaaggtgtcggtgtacaatcactagaggttgaggaggagcaagaggacatgctatttcgatcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtagt 40703504  T
Q  156 gggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  40703503 gtgcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaattaatgtaatggtttttaatgcctaatt 40703442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45065920 - 45065757
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || || |||| ||||    
T  45065920 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttggggaggagcggaaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcatggactgtag 45065821  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45065820 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 45065757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44051675 - 44051535
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||  |||||| ||||    
T  44051675 ggttcgaaagtgccggtgtacaatcactcgaggttgagaaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaatcaaaagagggtgccgtagggactgtag 44051576  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  44051575 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatg 44051535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22550276 - 22550179
Alignment:
Q  88 ttgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgagga 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22550276 ttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggacagtagcgggaaacccgattgacttgtgtgacgagga 22550179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26487707 - 26487615
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggac 149  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  26487707 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggac 26487615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 38032863 - 38032994
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||| || | |    
T  38032863 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttaaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgtcccggggactgtcgag 38032962  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  38032963 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 38032994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Original strand, 42167903 - 42168026
Alignment:
Q  65 tgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaaccc 164  Q
    |||||||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| || | || ||||||    
T  42167903 tgctggtgtataatcgttcaaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccggggactgtcgaggacaaccc 42168002  T
Q  165 gattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
     |||||||||| ||| ||||||||    
T  42168003 aattgacttgtgtgatgaggaaga 42168026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 182
Target Start/End: Original strand, 19241648 - 19241741
Alignment:
Q  89 tgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacga 182  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| | || |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||| ||||||    
T  19241648 tgaggaggagcgggaggacatactatttttgtcctcacccaaaagcagttgccccagggactgtcaaggacaacccgattgacttgtgtgacga 19241741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 182
Target Start/End: Original strand, 19314832 - 19314925
Alignment:
Q  89 tgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacga 182  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| | || |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||| ||||||    
T  19314832 tgaggaggagcgggaggacatactatttttgtcctcacccaaaagcagttgccccagggactgtcaaggacaacccgattgacttgtgtgacga 19314925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 34682884 - 34683047
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  34682884 ggttcgaaggtgacggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggttccccagggactgtag 34682983  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34682984 cgggcaactcgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 34683047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18309512 - 18309349
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  18309512 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgcccaagggactgtag 18309413  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18309412 cgggcaacccgattgcattgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 18309349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3602635 - 3602431
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgct 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  3602635 acatggcacgaaattgtttgtgatggttccgaaaaaaagaagggttcgaaggtggcggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggaggacatgct 3602536  T
Q  113 attttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcc 212  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3602535 attttggtcctcaaccaaaacaaggtgccc-agggactgtagcggacaatccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcc 3602437  T
Q  213 taattg 218  Q
    ||||||    
T  3602436 taattg 3602431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25499333 - 25499170
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  25499333 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtccaggtggaggaggagcgggaggacatactattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccaaggactgtag 25499234  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25499233 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 25499170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35566523 - 35566360
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  35566523 ggttcgaaggtgccagtgtacaaccagtcgaggttgaggcggagcgtgaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgcctcagggactgtag 35566424  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35566423 cggccaacccgattgacttgtgtgacgaggaagattgaatgtaatggctcttaatgcctaattg 35566360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Original strand, 35927037 - 35927197
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  35927037 ggttcgaaggtgccgatgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagaaggtgccccagggac--tag 35927134  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  35927135 cgggaaacccgattggcttgtgtgaccaggaagaatgaatgtaatggcttccaatgcctaatt 35927197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8539109 - 8538947
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||  |||||| ||||    
T  8539109 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcaggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgtagggactgtag 8539010  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8539009 cgggcaacccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 8538947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11347933 - 11347770
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  11347933 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 11347834  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11347833 cgggcaacccgattgatttgtgttacgaggaagaatgaatgcaatgacttttaatgcctaattg 11347770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11028565 - 11028417
Alignment:
Q  70 gtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattg 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  11028565 gtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtagcggacaagccgattg 11028466  T
Q  170 acttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11028465 atttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 11028417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 1399258 - 1399421
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||  ||||    
T  1399258 ggttcaaaggtgccggtgtacaattagtctaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttgatcctcaatcaaaacaaggtgccccagggattgtag 1399357  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1399358 cgaacaacccggttgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 1399421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 8575218 - 8575381
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || |||||||  |||    
T  8575218 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactatag 8575317  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8575318 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 8575381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 19035752 - 19035915
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  19035752 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 19035851  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19035852 cggacaagccaatcgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 19035915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20199578 - 20199451
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20199578 ggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaagtgccccagggactgtagcgggcaacccgatt 20199479  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatgt 196  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20199478 gacttgtgtgacgaggaagaatgaatgt 20199451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38855287 - 38855124
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  38855287 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgttatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 38855188  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855187 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 38855124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 6307 - 6470
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  6307 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 6406  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||  || || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6407 cggttaagcctattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggctttttatgcctaattg 6470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 27660454 - 27660617
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| |||     
T  27660454 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtat 27660553  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27660554 cggacaagccgattgatttgtgtgacgagaaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 27660617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 7484451 - 7484582
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || | |    
T  7484451 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcgag 7484550  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |  ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  7484551 gataacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 7484582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30710732 - 30710569
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||  ||||| |  ||||||| ||||    
T  30710732 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgagaggacatgttatttcggtcctcgaccaaaacaaggtactgcagggactgtag 30710633  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30710632 cggacaagccaattgatttgtgtgacgaggaagaataaatgtaatgacttttaatgcctaattg 30710569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1972628 - 1972510
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| || | |    
T  1972628 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaagcaaaagcaggtgccccagggactgtcgag 1972529  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgt 175  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  1972528 gacaaaccaattgacttgt 1972510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 6792405 - 6792536
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||| |||||| || | |    
T  6792405 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcagatgccctagggactgtcgag 6792504  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||| ||||    
T  6792505 gacaacccaattgacttgtgtgatgagcaaga 6792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1696059 - 1695934
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| || ||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||| |||| || | |    
T  1696059 ttcgaaggtgttggtgtataatgattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggccctcagccaaaagcaggtgccccaaggactgtcgag 1695960  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacga 182  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||    
T  1695959 gacaacccgattgacttgtgtgacga 1695934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 182
Target Start/End: Original strand, 36349265 - 36349386
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| || | || |    
T  36349265 gaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaagagcgggaggacatgct-ttttggtcctcagccaaaagcaggtgctccagggactgtcgaggac 36349363  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacga 182  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  36349364 aacccgattgacttatgtgacga 36349386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 144
Target Start/End: Original strand, 4723057 - 4723136
Alignment:
Q  65 tgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgcccca 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||    
T  4723057 tgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggcgcccca 4723136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7400930 - 7400798
Alignment:
Q  89 tgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa-- 186  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||   ||||||| || |||| || | || |||||| |||||||||| ||||||||||      
T  7400930 tgaggaggagcggaaggacatgttatttcggtcctcaaccaaaatcaggtgcctcaaggactgtcgaggacaacccaattgacttgtgtgacgaggaaga 7400831  T
Q  187 -gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
     || ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  7400830 tgattgaatataatggcttgtaatgtctaattg 7400798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31239224 - 31239140
Alignment:
Q  89 tgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgactt 173  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||| || | || |||||| ||||||||    
T  31239224 tgaggaggagtggaaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcacgtgccctagggactgtggaggacaacccaattgactt 31239140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 19470591 - 19470740
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19470591 ggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccctagggactgtagcgggcaacccgatt 19470690  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19470691 gacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 19470740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23408969 - 23408807
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||  ||||    
T  23408969 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgagtttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaatcaaggtaccccagggattgtag 23408870  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23408869 cgggcaacccgattgacttgtgtgatgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaatt 23408807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 2918320 - 2918483
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  2918320 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcaggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccatggactgtag 2918419  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2918420 tgggcaacccggttgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 2918483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35492780 - 35492618
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  35492780 ggttcgaaggtgccggtgtacaattactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 35492681  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35492680 tgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgg-ttttaatgcctaattg 35492618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16583058 - 16582895
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||| ||||    
T  16583058 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaacaaaaacaaggtgccctagggactgtag 16582959  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16582958 agggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcataattg 16582895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 41498074 - 41498237
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  41498074 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 41498173  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41498174 cggccaacccgattgacttgtgtgacaagtaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 41498237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43492708 - 43492545
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||     
T  43492708 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtccaggttgacgaggagtgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagtgactgtaa 43492609  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43492608 cggacaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 43492545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43983860 - 43983697
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  43983860 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 43983761  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43983760 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 43983697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Original strand, 3936377 - 3936539
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  3936377 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 3936476  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3936477 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 3936539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22002960 - 22002797
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  22002960 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 22002861  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002860 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 22002797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Original strand, 40676376 - 40676537
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||  ||||||||||| |||| |||||     
T  40676376 ttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcaaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttcgtccttaatcaaaacaaggtgccccatggactgtagca 40676475  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40676476 ggcaacccgattcacttgtgtgactaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 40676537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28476640 - 28476477
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  28476640 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 28476541  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28476540 cggacaagccaattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 28476477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17425924 - 17425761
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  17425924 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcagtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 17425825  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17425824 cggacaagccaatcgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 17425761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33404994 - 33404838
Alignment:
Q  65 tgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaaccc 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  33404994 tgctggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcggtaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagtaggtgccccagggactgtcgagggcaaccc 33404895  T
Q  165 gattgacttgtatgacgaggaaga---ctgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33404894 gattgacttgtgtgaggaggaagatgcttgaatgtagtggcttgtaatacctaattg 33404838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 39798941 - 39799104
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || |||| || ||||    
T  39798941 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgcggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcaggaactgtag 39799040  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39799041 cggacaagcagattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 39799104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6978083 - 6977952
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| || | |    
T  6978083 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggtgcccaagggactgtcgag 6977984  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  6977983 gacaacccaattgatttgtgtgatgaggaaga 6977952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3942635 - 3942507
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||  || |||| ||||    
T  3942635 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcacttgaggttgaggaggagcgggaggatatgctattttggtcctcaactaaaacaaggtgcggcatggactgtag 3942536  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgag 183  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3942535 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgag 3942507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 34520674 - 34520805
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||||| | |    
T  34520674 ttcgaaggtgttggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcttcagccaaaagcaggtgcccgagggaccgtcgag 34520773  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | || ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  34520774 gacatcccaattgacttgtgtgatgaggaaga 34520805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 37311602 - 37311717
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||| || | || |    
T  37311602 gaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgatgaggagcgggaggacatgctattttgatcctcagccaaaagtaggtgccccagggactgtcgaggac 37311701  T
Q  160 aacccgattgacttgt 175  Q
    ||||||||||||||||    
T  37311702 aacccgattgacttgt 37311717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 15890930 - 15891060
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |  || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |      
T  15890930 ttcgaaggtgttggtgtacaatcattttaggttgaggaggagcggaaggacatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggtgccccagggactgtcg-a 15891028  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  15891029 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 15891060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Original strand, 16413245 - 16413362
Alignment:
Q  70 gtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattg 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||| |  | || |||||||||||    
T  16413245 gtgtacaatcattcgaggttgaggaggagcgggaagacatgttattttggtc-tcaaccaaaagcaggtgctgcagggactggcgaggacaacccgattg 16413343  T
Q  170 acttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16413344 acttgtgtgacgaggaaga 16413362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5421389 - 5421234
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| | ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||  | | |    
T  5421389 ttcgaaggtgctggtgcataatcatttgaggttgaggaggagcggcagaacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactctcgag 5421290  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaat 209  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||   || |||||||||||| |||||||    
T  5421289 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaagatgattgaatgtaatgggttttaat 5421234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Original strand, 17537870 - 17537998
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||| ||||  ||| || | || |    
T  17537870 gaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaaacaggtgtcccatagactgtcgaggac 17537969  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  17537970 aacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 17537998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 188
Target Start/End: Original strand, 24107738 - 24107858
Alignment:
Q  68 tggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgat 167  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||| || | |||| || | || |||||| ||    
T  24107738 tggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgagaggaaatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgtcctatggactgttgaggacaacccaat 24107837  T
Q  168 tgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |||||||| |||  |||||||    
T  24107838 tgacttgtgtgagaaggaaga 24107858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 23786743 - 23786806
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttg 118  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23786743 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggatgacatgctattttg 23786806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 43
Target Start/End: Original strand, 40676328 - 40676358
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccg 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40676328 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccg 40676358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 45099383 - 45099588
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgct 112  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |    
T  45099383 acatgacacataattgtttgtgatggttccgaaaaaaagaagggttcgaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggatgagcgggaggacatgtt 45099482  T
Q  113 attttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcc 212  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45099483 attttggtcctcaaccaaaacaaggtgcaccagggactgtagcgggcaacccgattgacttttgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcc 45099582  T
Q  213 taattg 218  Q
    ||||||    
T  45099583 taattg 45099588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43571128 - 43570965
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  43571128 ggttcgaaggtgccgatgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcgaccaaatcaaggtgcctcagggactgtag 43571029  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43571028 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtgatggcttttaatgcctaattg 43570965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2429730 - 2429568
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  2429730 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgagcaggagcgggaagacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactatag 2429631  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2429630 cgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 2429568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 13894825 - 13895023
Alignment:
Q  19 cacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13894825 cacgaaattgtttgtgatggttccgaaaaaaagaagggttcgaaggtgccggtgtacaatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttg 13894924  T
Q  119 gtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||||| |||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894925 gtcctcaacaaaaacaaggtgccccagggattgtag-gggcaacccgattgacttgtgtgacaaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 13895023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Original strand, 52568395 - 52568557
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  52568395 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggagcacatgctattttgatcatcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 52568494  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52568495 tgggcaacacgattgacttgtgtgacaaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 52568557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41579171 - 41579008
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||  |||    
T  41579171 ggtttgaaggtgccggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgggaagacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagtgactatag 41579072  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41579071 cgggcaacctgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 41579008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 4003228 - 4003391
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  4003228 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcggaaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 4003327  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4003328 cgggcaacccgattgatttgtctgacgacgaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 4003391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 54391587 - 54391424
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  54391587 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 54391488  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54391487 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 54391424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 55268035 - 55268198
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  55268035 ggttcaaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctgaaccaaaacaaggtgccccagggactctag 55268134  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55268135 tgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggtttttaatgcctaattg 55268198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 34692258 - 34692419
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||| ||||    
T  34692258 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctactttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcggggactgtag 34692357  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaat 216  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34692358 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtaatgacttttaatgcctaat 34692419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7247305 - 7247141
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccg-ta 153  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    ||    
T  7247305 ggttcgaaggtgtcggtgtacaatcagtccaggttgaggaggagcgagaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggaaatata 7247206  T
Q  154 gcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7247205 gcgggcaacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcatttaatgcctaattg 7247141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 2267559 - 2267722
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  2267559 ggttcgaaggtgtcggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 2267658  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||| || |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2267659 cgggtaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 2267722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34050872 - 34050709
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  34050872 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgttatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccacagggactgtag 34050773  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34050772 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 34050709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36136159 - 36136001
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||  |||||| ||||    
T  36136159 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgaagggac-gtag 36136061  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgccta 214  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36136060 cgggcaacccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgccta 36136001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 218
Target Start/End: Original strand, 46345565 - 46345724
Alignment:
Q  59 cgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcggg 158  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  46345565 cgaaggtgccggtgtacaatcagtccaggttgaggagcagcgggaggacatgctatttcggtcctcaacaaaaacaaggtgccccatggactgtagcggg 46345664  T
Q  159 caacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46345665 caactcgattgacttgtgtgacgaggaataatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 46345724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46406150 - 46405987
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  46406150 ggttcgaaggtgccgatgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 46406051  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46406050 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 46405987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 49139128 - 49139291
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  49139128 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 49139227  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49139228 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 49139291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 51694510 - 51694673
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  51694510 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttgttcctaaaccaaaacaaggtgtcgcagggactgtag 51694609  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51694610 cgggaaacccaattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 51694673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 55205913 - 55206058
Alignment:
Q  71 tgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattga 170  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  55205913 tgtacaatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtagtgggcaacctgattga 55206012  T
Q  171 cttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  55206013 cttgtgtgacgaggaaga-tgaatgtaatggtttttaatgcctaatt 55206058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 2645950 - 2646113
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  2645950 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcaaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 2646049  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2646050 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 2646113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Original strand, 49217704 - 49217867
Alignment:
Q  56 gttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagc 155  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  49217704 gttcgaaggtgcgggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaagacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggactgtagc 49217803  T
Q  156 gggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggc-ttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49217804 gggaaacccgattaacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtagtggcattttaatgcctaattg 49217867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 34646135 - 34646310
Alignment:
Q  13 acatgacacgaaattgtttgtgatggttccgnnnnnnnnnnnggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgct 112  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||           ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  34646135 acatggcacaaaattgtttgtgatggttccgaaaaaaagaagggttcgaaggtgccggtgtacaatcaatcgaggttgaggaggagtgggaggacatgct 34646234  T
Q  113 attttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  34646235 attttggtcctcaaccaaaagaaggtgccctagggactgtagcgggcaacccgattaacctttgtgacgaggaaga 34646310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43478258 - 43478134
Alignment:
Q  70 gtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattg 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43478258 gtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacagggtgccgcagggactgtagcgggaaacccgattg 43478159  T
Q  170 acttgtatgacgaggaagactgaat 194  Q
    |||||| ||||||||| || |||||    
T  43478158 acttgtgtgacgaggatgaatgaat 43478134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 3494098 - 3494261
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || |||||||  |||    
T  3494098 ggttcgaaggtgccggtttacaatcactggaggttcaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactatag 3494197  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3494198 cggacaagccaattgatttatgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 3494261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 49611386 - 49611272
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  49611386 ggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcagggactgtagcgggaaacctgatt 49611287  T
Q  169 gacttgtatgacgag 183  Q
    ||||||| |||||||    
T  49611286 gacttgtgtgacgag 49611272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Original strand, 20374938 - 20375098
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||| |  ||||||    
T  20374938 gaaggtgccggtgtacaatcattccaagttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaagcaagtg-cccaaggactgccgcgggc 20375036  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20375037 aacccgattgacttatgtgacgaggaagatgattgaatgtaatggcttctaatgcctaattg 20375098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 11377939 - 11378070
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||| || | |    
T  11377939 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccctagggactgtcgag 11378038  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11378039 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 11378070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 49274678 - 49274547
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| || | |    
T  49274678 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgtcccagggactgtcgag 49274579  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  49274578 gacaacccaattgacttgtgttacgaggaaga 49274547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 34471019 - 34471150
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||| || | |    
T  34471019 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccctagggactgtcgag 34471118  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |  ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  34471119 gaaaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 34471150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Original strand, 51012244 - 51012408
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| || ||   |    
T  51012244 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccaggaactgtcaag 51012343  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||   || |||||||||||| || ||||  |||||||    
T  51012344 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaatatgattgaatgtaatgggttgtaatatctaattg 51012408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27188321 - 27188168
Alignment:
Q  68 tggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgat 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||| | |  || ||||||||| || || |||| ||||||    
T  27188321 tggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttgctcctcaattaaaagcaaatgtcccagggactgtcgcaggcatcccgat 27188222  T
Q  168 tgacttgtatgacgaggaaga---ctgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||| ||| ||||||||    |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27188221 tgacttgtgtgatgaggaagatgcttgaatgtagtggcttgtaatacctaattg 27188168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Original strand, 50458216 - 50458339
Alignment:
Q  65 tgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaaccc 164  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||    
T  50458216 tgctggtgtataatcattcgaggttgaggaagagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccagggactgtcgaggacaaccc 50458315  T
Q  165 gattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
     |||||||||| ||  ||||||||    
T  50458316 aattgacttgtgtggtgaggaaga 50458339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14632726 - 14632608
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||| || | |    
T  14632726 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccctagggactgtcgag 14632627  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgt 175  Q
    | | |||| ||||||||||    
T  14632626 gacgacccaattgacttgt 14632608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44928716 - 44928588
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||| || | || |    
T  44928716 gaaggtgctagtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggttccccagggactgtcgaggac 44928617  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  44928616 aacccaattgaattgtgtgatgaggaaga 44928588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Original strand, 27096660 - 27096812
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||  || || | || |||||| |||    
T  27096660 ggtgtacaatcattctaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggctctcaaccaaaagcaggtgccccagaaactgtcgaggacaacccaatt 27096759  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaa----gactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||     | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  27096760 gacttgtgtgacgaggaaaatgaattgaatgtaatggtttctaatgcctaatt 27096812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 10052315 - 10052445
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | | ||||| | |||||||||| |||  || | |    
T  10052315 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatatt-gtccttagccaaaagcaggtgccccatggattgtcgag 10052413  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  10052414 gacaacccaattgacttgtgtgatgcggaaga 10052445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 51016547 - 51016416
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||   | | ||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||| || |      
T  51016547 ttcgaaggtgatggtgtataatcattcgaggttgaggagaaacagaaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggtgccccatggactgtcgaa 51016448  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  51016447 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 51016416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 149
Target Start/End: Original strand, 3497792 - 3497886
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggac 149  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || |||||||    
T  3497792 ggttcgaaggtgccggtttacaatcactggaggttcaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggac 3497886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 24701353 - 24701407
Alignment:
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgccta 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  24701353 aacccgattgacttgtgtgacgaggatgaatgaatgtaatgacttttaatgccta 24701407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 116
Target Start/End: Original strand, 46413246 - 46413305
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattt 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  46413246 ttcgaaggtgctggtgtataatcattcgaggttgcggaggagcgggaggacatgatattt 46413305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 32026579 - 32026742
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  32026579 ggttcgaaggtgccggtgtacaattagtcgaggttgaggaggagcgggtggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 32026678  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32026679 cgggcaacccgattgacttgtgtgatgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 32026742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 32036638 - 32036801
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  32036638 ggttcgaaggtgccggtgtacaattagtcgaggttgaggaggagcgggtggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 32036737  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32036738 cgggcaacccgattgacttgtgtgatgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 32036801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13404063 - 13403900
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  13404063 ggttcgaaggtgccgatgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgagaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaaaaaggtgccccagggactgtag 13403964  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403963 cgggcaacccgatagacttgtgtgaagaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 13403900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 13616869 - 13617018
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13616869 ggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtagcgagcaacccgatt 13616968  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13616969 gacttgtgtgacaaggaagaatgaatgtaatggctttcaatgcctaattg 13617018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 34802139 - 34802298
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  34802139 ggttcaaaggtgccggtgtacaatcagtcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttttgtcctcaaccaaaacaaggtgccccagggactgtag 34802238  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgccta 214  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34802239 caggcaacccggttgacttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatgacttttaatgccta 34802298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6206619 - 6206456
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  6206619 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 6206520  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6206519 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 6206456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11693586 - 11693423
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  11693586 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 11693487  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11693486 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 11693423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27641309 - 27641146
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  27641309 ggttcgaaggtgccggtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtag 27641210  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27641209 cggacaagccaattgatttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 27641146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 32691680 - 32691828
Alignment:
Q  70 gtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattg 169  Q
    ||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  32691680 gtgtacaattacttgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttcggtcctcaaccaaaacaaggtaccgcagggactgtagcggacaagccgattg 32691779  T
Q  170 acttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32691780 atttgtgtgacgaggaagaatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 32691828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14123958 - 14123794
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||| | || |||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  14123958 ttcgaaggtgctgatgtacaatcagtcgaggttaaggaggagtgggaggacatgctactttggtccttaatcaaaagtaggtgccgcagggactgtagcg 14123859  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||   || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14123858 ggcaacccgattgacttgtgtgacgatgaagatgaatgaatgtaatgacttgtaatgcctaattg 14123794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Original strand, 35020248 - 35020373
Alignment:
Q  92 ggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactg 191  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  35020248 ggaggagcgggaggacatgttatttcggtcctcaaccaaaacaaggtgccctagggactgtagtgg-caacccgattgacttgtgtgacgaggaagaatg 35020346  T
Q  192 aatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35020347 aatgtaatggtttttaatgcctaattg 35020373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29067713 - 29067587
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | |||||||  |||||||||    
T  29067713 ggtgtacaatcactcgaggttgaggatgagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcaggggctgtagcggaaaacccgatt 29067614  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    ||||||| |||| |||| || ||||||    
T  29067613 gacttgtgtgacaaggatgaatgaatg 29067587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29109302 - 29109176
Alignment:
Q  69 ggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgatt 168  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | |||||||  |||||||||    
T  29109302 ggtgtacaatcactcgaggttgaggatgagcgggaggacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccgcaggggctgtagcggaaaacccgatt 29109203  T
Q  169 gacttgtatgacgaggaagactgaatg 195  Q
    ||||||| |||| |||| || ||||||    
T  29109202 gacttgtgtgacaaggatgaatgaatg 29109176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12398046 - 12397916
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| || | |    
T  12398046 ttcgaaggtgttggtgtataatcattcgaggttgaggaggagcgggaggacatgatattttggtcctcagccaaaagcaggtg-cccagggactgtcgag 12397948  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  12397947 gacaacccaattgacttgtgtgatgaggaaga 12397916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 217
Target Start/End: Original strand, 20241309 - 20241472
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||  || || ||||||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || | |    
T  20241309 ttcgaaggtgccggtgtataatcgttccagtttgaggaggagcaggaggttatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggttcccaagggactgttgag 20241408  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20241409 gacaacccaattgacttgtgtgacgaggaagatgattgaatgtaatggcttgtaatgtctaatt 20241472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 217
Target Start/End: Original strand, 22135293 - 22135456
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||  || || ||||||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || | |    
T  22135293 ttcgaaggtgccggtgtataatcgttccagtttgaggaggagcaggaggttatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggttcccaagggactgttgag 22135392  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22135393 gacaacccaattgacttgtgtgacgaggaagatgattgaatgtaatggcttgtaatgtctaatt 22135456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 217
Target Start/End: Original strand, 22142646 - 22142809
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcg 156  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||  || || ||||||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| || | |    
T  22142646 ttcgaaggtgccggtgtataatcgttccagtttgaggaggagcaggaggttatgctattttggtcctcaaccaaaagcaggttcccaagggactgttgag 22142745  T
Q  157 ggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22142746 gacaacccaattgacttgtgtgacgaggaagatgattgaatgtaatggcttgtaatgtctaatt 22142809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 217
Target Start/End: Original strand, 32133629 - 32133789
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||| || |  | |    
T  32133629 gaaggtgctggtgtgcaatcagtcgaggctgaagaggagtgagaggacatgctattttggtcctcagccaaaagcaggttccccagggactgtcgatgac 32133728  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaa---gactgaatgtaatggcttttaatgcctaatt 217  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  32133729 aacctgattgacctgtgtgacgaggaagatgaatgaatgtaatgacttctaatgcgtaatt 32133789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 218
Target Start/End: Original strand, 30763971 - 30764103
Alignment:
Q  89 tgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaa-- 186  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||| |||| ||||||||| |   |||||||| |||| || | || |||||| |||||||||| ||||||||||      
T  30763971 tgaggaggagcggaatgacatgttatttcggtcctcaaccaaaagcgagtgccccatggactgtcgaggacaacccaattgacttgtgtgacgaggaaaa 30764070  T
Q  187 -gactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
     || ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30764071 tgattgaatgtaatggcttgtaatgtctaattg 30764103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Original strand, 17464487 - 17464547
Alignment:
Q  89 tgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggac 149  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  17464487 tgaggaggagcgggaggacatgttattttggtcctcaaccaaaagcaggtgtcccagggac 17464547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3029 - 2866
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  3029 ggttcgaaggtgccggagtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggatgacatgctattttggtcctcaaccaaaacaaggtgccacagggactgtag 2930  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2929 cgggaaacccgattgacttgtgtgacgaggaggaatgaatgtaatgacttttaatgcctaattg 2866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 218
Target Start/End: Original strand, 4519 - 4678
Alignment:
Q  59 cgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcggg 158  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  4519 cgaaggtgccggtgtacaatcagtccaggttgaggagcagcgggaggacatgctatttcggtcctcaacaaaaacaaggtgccccatggactgtagcggg 4618  T
Q  159 caacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4619 caactcgattgacttgtgtgacgaggaataatgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 4678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 5798 - 5961
Alignment:
Q  55 ggttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtag 154  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  5798 ggttcgaaggtgccagtgtacaatcactcgaggttgaggaggagcgggaggacatgctatttaggtcctcaaccaaaagaaggtaccgcagggactgtag 5897  T
Q  155 cgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagactgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5898 cggacaagccgattgatttgtgtgacgaggaagaatgacagtaatggcttttaatgcctaattg 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1584 - 1456
Alignment:
Q  60 gaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggc 159  Q
    |||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||   || ||||||||| ||||||||| ||||||| || | || |    
T  1584 gaaggtgccggtgtataatcaatcgaggttgaggaggagcgggtgaacatgctatttctatcctcaaccaaaagaaggtgcctcagggactgtcgaggac 1485  T
Q  160 aacccgattgacttgtatgacgaggaaga 188  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1484 aacccaattgacttgtgtgacgaggaaga 1456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5538 - 5420
Alignment:
Q  70 gtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattg 169  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||| || | || |||||| ||||    
T  5538 gtgtataatcattcgaggttaaggaggagtgggaggacatgctattttggtcctcagccaaaaccaggtgccccagggactgtcgaggacaacccaattg 5439  T
Q  170 acttgtatgacgaggaaga 188  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  5438 acttgtgtgatgaggaaga 5420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 1571 - 1663
Alignment:
Q  57 ttcgaagatgctggtgtacaatcagtcgagattgaggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggac 149  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  1571 ttcgaaggtgccgatgtacaatcagtccagactgaggaggagcggaaggacttgttattttagtcctcaactaaaagcaggtggcccagggac 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9707 - 9577
Alignment:
Q  91 aggaggtgcgggaggacatgctattttggtcatcaaccaaaggaaggtgccccagggaccgtagcgggcaacccgattgacttgtatgacgaggaagac- 189  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||   | |||||| ||||||  | | || |||||| |||||||| | ||| ||||||||      
T  9707 aggaggagcggaaggacatgttattttggtcctcaaccaaaatcatgtgccctagggactatcgaggacaacccaattgacttatgtgaagaggaagatg 9608  T
Q  190 --tgaatgtaatggcttttaatgcctaattg 218  Q
      | ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9607 attaaatgtaatggcttgtaatgtctaattg 9577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University