View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18648_low_3 (Length: 613)

Name: NF18648_low_3
Description: NF18648
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18648_low_3
NF18648_low_3
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (110-597)||(2041-2528)
scaffold0234 (110-597)||(10932-11419)
scaffold0234 (16-44)||(2594-2622)
scaffold0234 (16-44)||(11485-11513)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (110-597)||(18252030-18252517)
chr1 (110-597)||(18532234-18532721)
chr1 (110-597)||(27131130-27131616)
chr1 (112-597)||(27310297-27310782)
chr1 (112-597)||(16358755-16359240)
chr1 (116-597)||(36816354-36816834)
chr1 (110-597)||(3855639-3856126)
chr1 (112-469)||(21171081-21171438)
chr1 (116-597)||(27277278-27277756)
chr1 (110-430)||(22657108-22657429)
chr1 (316-597)||(22641594-22641871)
chr1 (144-519)||(12014084-12014457)
chr1 (122-399)||(9917837-9918106)
chr1 (249-597)||(23507039-23507385)
chr1 (281-597)||(19706439-19706750)
chr1 (281-597)||(43802365-43802676)
chr1 (281-597)||(28134723-28135034)
chr1 (281-597)||(9456107-9456418)
chr1 (281-597)||(20391239-20391550)
chr1 (281-597)||(20779645-20779956)
chr1 (281-597)||(22670257-22670568)
chr1 (281-597)||(42816989-42817300)
chr1 (404-597)||(9916497-9916689)
chr1 (144-395)||(12006461-12006712)
chr1 (281-597)||(22612483-22612794)
chr1 (290-577)||(633934-634216)
chr1 (281-597)||(8727658-8727969)
chr1 (281-597)||(47667485-47667785)
chr1 (281-422)||(35930573-35930713)
chr1 (358-581)||(29096789-29097008)
chr1 (484-597)||(28145723-28145835)
chr1 (365-497)||(21881475-21881604)
chr1 (345-510)||(24301691-24301855)
chr1 (298-424)||(26923553-26923678)
chr1 (365-418)||(51997353-51997406)
chr1 (140-217)||(3403248-3403325)
chr1 (140-217)||(3443494-3443571)
chr1 (450-530)||(12006332-12006413)
chr1 (116-185)||(30720625-30720694)
chr1 (436-495)||(10852402-10852461)
chr1 (379-458)||(31236402-31236478)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (110-597)||(29327784-29328271)
chr7 (112-593)||(15152445-15152926)
chr7 (110-597)||(11535782-11536269)
chr7 (110-597)||(11542700-11543187)
chr7 (112-597)||(12750828-12751313)
chr7 (116-597)||(12738542-12739023)
chr7 (112-597)||(18561009-18561485)
chr7 (112-603)||(18257559-18258047)
chr7 (116-597)||(13392157-13392637)
chr7 (112-331)||(15148144-15148363)
chr7 (281-597)||(2204543-2204854)
chr7 (281-597)||(18400095-18400406)
chr7 (281-597)||(18407079-18407390)
chr7 (281-597)||(48808496-48808807)
chr7 (290-597)||(8464999-8465301)
chr7 (281-597)||(15729742-15730053)
chr7 (281-597)||(18139338-18139649)
chr7 (281-597)||(19230879-19231190)
chr7 (281-585)||(30254129-30254428)
chr7 (357-597)||(2365169-2365407)
chr7 (116-586)||(39111819-39112275)
chr7 (358-597)||(41680968-41681203)
chr7 (132-328)||(2364917-2365112)
chr7 (281-597)||(10668901-10669213)
chr7 (281-585)||(47166871-47167170)
chr7 (143-368)||(7396221-7396450)
chr7 (291-575)||(24443349-24443628)
chr7 (365-597)||(34128647-34128875)
chr7 (282-512)||(19388544-19388774)
chr7 (281-597)||(28130552-28130863)
chr7 (184-423)||(3132748-3132986)
chr7 (309-399)||(10235361-10235451)
chr7 (288-575)||(25845498-25845780)
chr7 (288-575)||(25845917-25846199)
chr7 (281-559)||(19393462-19393735)
chr7 (249-413)||(7662569-7662732)
chr7 (358-597)||(18259124-18259359)
chr7 (291-399)||(47833875-47833983)
chr7 (290-390)||(19859122-19859221)
chr7 (365-597)||(14591924-14592153)
chr7 (365-597)||(16011515-16011744)
chr7 (372-511)||(31190524-31190660)
chr7 (365-497)||(22969024-22969153)
chr7 (448-523)||(22948499-22948574)
chr7 (409-597)||(15169290-15169474)
chr7 (355-413)||(7396469-7396527)
chr7 (160-225)||(10234179-10234244)
chr7 (110-142)||(2653207-2653239)
chr7 (324-379)||(29983179-29983234)
chr7 (16-44)||(11543253-11543281)
chr7 (443-507)||(29984308-29984372)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (110-597)||(27380972-27381459)
chr6 (110-597)||(27471355-27471842)
chr6 (112-597)||(17684189-17684674)
chr6 (110-597)||(17691160-17691647)
chr6 (110-597)||(29308890-29309377)
chr6 (110-597)||(29315850-29316336)
chr6 (112-597)||(11651725-11652210)
chr6 (112-597)||(188697-189182)
chr6 (112-380)||(16566257-16566525)
chr6 (358-597)||(27296877-27297116)
chr6 (324-597)||(16394165-16394438)
chr6 (356-593)||(25536915-25537152)
chr6 (112-580)||(13359010-13359474)
chr6 (375-596)||(16559193-16559414)
chr6 (112-328)||(25537148-25537364)
chr6 (133-419)||(27925772-27926062)
chr6 (148-494)||(17850321-17850663)
chr6 (281-597)||(16789062-16789373)
chr6 (149-414)||(20553492-20553755)
chr6 (281-597)||(22859888-22860199)
chr6 (281-597)||(27508347-27508658)
chr6 (293-587)||(2669476-2669768)
chr6 (281-597)||(1586108-1586419)
chr6 (281-583)||(27527947-27528244)
chr6 (281-597)||(14074471-14074782)
chr6 (281-553)||(18019885-18020152)
chr6 (129-528)||(8509941-8510338)
chr6 (281-575)||(10359073-10359360)
chr6 (148-512)||(20736413-20736773)
chr6 (281-597)||(8612906-8613221)
chr6 (244-413)||(28172690-28172859)
chr6 (242-469)||(22560311-22560534)
chr6 (484-597)||(33317055-33317167)
chr6 (281-385)||(13995151-13995254)
chr6 (358-597)||(17120505-17120740)
chr6 (358-500)||(21994655-21994794)
chr6 (288-500)||(19218427-19218630)
chr6 (304-425)||(19347092-19347212)
chr6 (456-519)||(28172899-28172963)
chr6 (441-580)||(28756145-28756283)
chr6 (117-172)||(31258065-31258120)
chr6 (365-512)||(5758565-5758709)
chr6 (288-500)||(4073574-4073781)
chr6 (15-44)||(29308795-29308824)
chr6 (16-44)||(17684742-17684770)
chr6 (16-44)||(27381525-27381553)
chr6 (16-44)||(27471908-27471936)
chr6 (16-44)||(29315756-29315784)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (110-597)||(55612683-55613170)
chr4 (110-597)||(19926480-19926967)
chr4 (110-597)||(26970463-26970950)
chr4 (110-597)||(26963640-26964127)
chr4 (112-597)||(18262214-18262699)
chr4 (110-597)||(5707320-5707807)
chr4 (110-597)||(868597-869084)
chr4 (110-597)||(5713948-5714435)
chr4 (110-597)||(10621053-10621540)
chr4 (110-597)||(10628132-10628619)
chr4 (112-597)||(18269070-18269560)
chr4 (112-597)||(28392854-28393339)
chr4 (122-597)||(8858179-8858654)
chr4 (122-597)||(8845215-8845690)
chr4 (112-597)||(4426336-4426808)
chr4 (116-597)||(5667849-5668327)
chr4 (116-597)||(35223576-35224047)
chr4 (118-601)||(20311299-20311781)
chr4 (365-597)||(10677303-10677534)
chr4 (365-597)||(10890943-10891174)
chr4 (110-225)||(12357136-12357251)
chr4 (281-597)||(15461488-15461799)
chr4 (281-597)||(34975542-34975853)
chr4 (112-581)||(5616215-5616681)
chr4 (136-496)||(21453961-21454319)
chr4 (148-422)||(56516094-56516368)
chr4 (281-597)||(2677004-2677315)
chr4 (281-597)||(15815012-15815323)
chr4 (281-597)||(18111043-18111354)
chr4 (281-597)||(3369023-3369334)
chr4 (281-597)||(17299959-17300270)
chr4 (281-597)||(18163153-18163464)
chr4 (281-597)||(20243928-20244239)
chr4 (281-597)||(26531604-26531915)
chr4 (116-334)||(10677538-10677753)
chr4 (116-334)||(10891178-10891393)
chr4 (281-597)||(4675983-4676294)
chr4 (291-597)||(5870419-5870720)
chr4 (281-597)||(1941715-1942026)
chr4 (290-581)||(19365519-19365806)
chr4 (272-597)||(32646523-32646846)
chr4 (358-580)||(19362477-19362695)
chr4 (365-597)||(9487625-9487853)
chr4 (281-495)||(32636475-32636685)
chr4 (281-581)||(5528495-5528790)
chr4 (294-372)||(24700213-24700291)
chr4 (377-597)||(30040489-30040705)
chr4 (365-581)||(9538033-9538244)
chr4 (281-512)||(4546071-4546298)
chr4 (380-597)||(11421096-11421309)
chr4 (469-519)||(24701361-24701411)
chr4 (257-327)||(39074190-39074260)
chr4 (346-500)||(33888594-33888743)
chr4 (148-326)||(30040740-30040919)
chr4 (337-464)||(34777850-34777975)
chr4 (159-226)||(39074278-39074346)
chr4 (266-348)||(9937933-9938015)
chr4 (488-569)||(9937745-9937826)
chr4 (160-219)||(11161913-11161972)
chr4 (14-44)||(26963544-26963574)
chr4 (281-326)||(11421007-11421052)
chr4 (16-44)||(5713854-5713882)
chr4 (367-458)||(9937830-9937923)
chr4 (16-44)||(10621606-10621634)
chr4 (16-44)||(26970369-26970397)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (110-597)||(6110064-6110551)
chr3 (112-597)||(16482203-16482688)
chr3 (110-597)||(10572312-10572799)
chr3 (110-597)||(15600604-15601091)
chr3 (110-597)||(15607149-15607636)
chr3 (116-597)||(10579075-10579556)
chr3 (116-597)||(17780838-17781319)
chr3 (112-593)||(18522665-18523146)
chr3 (110-597)||(8490488-8490982)
chr3 (110-597)||(15357306-15357793)
chr3 (113-597)||(13211305-13211789)
chr3 (110-597)||(13248607-13249094)
chr3 (112-597)||(18519980-18520462)
chr3 (129-597)||(15341939-15342407)
chr3 (116-597)||(32056619-32057101)
chr3 (112-601)||(17199900-17200389)
chr3 (112-597)||(13516813-13517294)
chr3 (116-597)||(1647241-1647726)
chr3 (110-597)||(29924971-29925458)
chr3 (110-597)||(29974124-29974611)
chr3 (216-597)||(17136465-17136840)
chr3 (112-597)||(16200434-16200917)
chr3 (116-328)||(19089734-19089946)
chr3 (117-579)||(24253130-24253589)
chr3 (110-271)||(18640792-18640953)
chr3 (112-349)||(16200128-16200363)
chr3 (281-597)||(21034229-21034540)
chr3 (281-597)||(15846536-15846847)
chr3 (281-597)||(20147554-20147865)
chr3 (290-597)||(21398792-21399094)
chr3 (281-597)||(55427012-55427323)
chr3 (290-597)||(14890391-14890693)
chr3 (281-597)||(12299902-12300212)
chr3 (242-597)||(25978728-25979078)
chr3 (281-499)||(14147012-14147226)
chr3 (365-563)||(15526827-15527021)
chr3 (112-173)||(18534758-18534819)
chr3 (439-597)||(28088251-28088408)
chr3 (281-597)||(11787578-11787889)
chr3 (293-597)||(15317176-15317472)
chr3 (329-458)||(28953965-28954093)
chr3 (273-375)||(9504446-9504548)
chr3 (112-157)||(18510924-18510969)
chr3 (331-523)||(32280313-32280507)
chr3 (286-401)||(8251933-8252048)
chr3 (197-336)||(19345656-19345795)
chr3 (444-559)||(30464147-30464261)
chr3 (436-500)||(36138033-36138097)
chr3 (15-44)||(15357859-15357888)
chr3 (369-421)||(4189223-4189275)
chr3 (16-44)||(13248513-13248541)
chr3 (16-44)||(15351267-15351295)
chr3 (16-44)||(15601158-15601186)
chr3 (436-500)||(36142816-36142880)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (110-596)||(21940665-21941151)
chr8 (112-597)||(22171491-22171974)
chr8 (116-597)||(6094129-6094610)
chr8 (116-597)||(24642655-24643135)
chr8 (334-597)||(15326422-15326685)
chr8 (334-597)||(15506791-15507054)
chr8 (112-311)||(28554885-28555084)
chr8 (206-530)||(14983710-14984030)
chr8 (456-597)||(28548393-28548534)
chr8 (122-581)||(38232115-38232570)
chr8 (116-243)||(24636860-24636987)
chr8 (281-597)||(8371253-8371564)
chr8 (281-597)||(21969324-21969635)
chr8 (281-597)||(12562114-12562425)
chr8 (285-482)||(24797224-24797419)
chr8 (281-597)||(27007517-27007828)
chr8 (281-597)||(27014660-27014971)
chr8 (281-597)||(27880487-27880798)
chr8 (281-597)||(28020668-28020979)
chr8 (281-597)||(22130609-22130920)
chr8 (281-597)||(25611186-25611497)
chr8 (291-597)||(22659494-22659795)
chr8 (281-597)||(21916667-21916978)
chr8 (281-597)||(45534273-45534584)
chr8 (140-417)||(32872741-32873019)
chr8 (281-597)||(26240475-26240786)
chr8 (281-500)||(18835341-18835556)
chr8 (131-399)||(2375027-2375300)
chr8 (358-597)||(6430953-6431188)
chr8 (366-512)||(8781959-8782102)
chr8 (490-587)||(24796731-24796826)
chr8 (281-597)||(2962932-2963247)
chr8 (435-581)||(20535226-20535371)
chr8 (293-387)||(29645537-29645631)
chr8 (484-602)||(36970439-36970556)
chr8 (484-601)||(2375411-2375528)
chr8 (148-211)||(10920234-10920297)
chr8 (257-364)||(24535462-24535569)
chr8 (290-397)||(36970265-36970371)
chr8 (448-570)||(29645675-29645797)
chr8 (337-389)||(10920427-10920479)
chr8 (536-597)||(8968015-8968076)
chr8 (16-44)||(22171394-22171422)
chr8 (537-585)||(41368106-41368154)
chr8 (537-585)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0390 (3 HSPs)
scaffold0390 (110-597)||(6654-7141)
scaffold0390 (110-597)||(13670-14157)
scaffold0390 (16-44)||(7207-7235)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (110-597)||(24695186-24695673)
chr5 (112-597)||(19714218-19714703)
chr5 (110-597)||(18569581-18570070)
chr5 (116-597)||(19706939-19707419)
chr5 (223-475)||(39538701-39538953)
chr5 (114-597)||(17285470-17285935)
chr5 (176-510)||(18806843-18807175)
chr5 (116-421)||(22546912-22547217)
chr5 (114-597)||(17298621-17299088)
chr5 (115-370)||(27347425-27347679)
chr5 (435-601)||(27347252-27347417)
chr5 (490-597)||(24701950-24702057)
chr5 (281-597)||(20941018-20941329)
chr5 (281-597)||(25805385-25805696)
chr5 (281-597)||(31890-32201)
chr5 (281-597)||(12789663-12789974)
chr5 (281-597)||(22941241-22941552)
chr5 (281-597)||(23545913-23546224)
chr5 (281-597)||(24933306-24933617)
chr5 (292-585)||(20100255-20100543)
chr5 (281-597)||(31096807-31097118)
chr5 (281-597)||(12764990-12765305)
chr5 (281-597)||(5097642-5097953)
chr5 (110-219)||(39537962-39538071)
chr5 (281-597)||(7865430-7865745)
chr5 (281-597)||(9811733-9812048)
chr5 (281-597)||(12703874-12704189)
chr5 (372-510)||(18806483-18806619)
chr5 (372-510)||(18806663-18806799)
chr5 (281-597)||(26245093-26245404)
chr5 (512-601)||(28719471-28719558)
chr5 (348-597)||(18829281-18829530)
chr5 (116-219)||(31886537-31886640)
chr5 (358-601)||(26129689-26129928)
chr5 (516-597)||(39538954-39539035)
chr5 (136-422)||(33477193-33477479)
chr5 (160-228)||(11479420-11479489)
chr5 (16-44)||(24695739-24695767)
chr5 (270-326)||(31267928-31267984)
chr5 (291-335)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (110-597)||(7107-7594)
scaffold0433 (16-44)||(7013-7041)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (110-597)||(18288-18774)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (110-597)||(21329968-21330455)
chr2 (110-597)||(18796506-18796993)
chr2 (112-603)||(18619807-18620296)
chr2 (144-597)||(36270199-36270650)
chr2 (144-585)||(18822115-18822556)
chr2 (175-597)||(20977957-20978360)
chr2 (249-597)||(22183206-22183551)
chr2 (285-583)||(6991847-6992146)
chr2 (281-597)||(30174368-30174679)
chr2 (281-597)||(24250032-24250343)
chr2 (267-422)||(19279445-19279600)
chr2 (230-399)||(18851977-18852146)
chr2 (281-597)||(24229215-24229526)
chr2 (116-255)||(19692598-19692737)
chr2 (358-585)||(15342014-15342237)
chr2 (291-599)||(29800468-29800775)
chr2 (434-597)||(17241034-17241196)
chr2 (296-399)||(36801899-36802003)
chr2 (290-512)||(19616435-19616653)
chr2 (450-530)||(36799745-36799826)
chr2 (365-499)||(40301034-40301164)
chr2 (292-399)||(28741220-28741326)
chr2 (530-597)||(41661694-41661761)
chr2 (152-302)||(24471643-24471792)
chr2 (367-572)||(41316305-41316506)
chr2 (365-500)||(21626824-21626955)
chr2 (436-512)||(28740910-28740986)
chr2 (361-424)||(28718943-28719006)
chr2 (281-399)||(24763751-24763868)
chr2 (281-326)||(12098609-12098654)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (110-601)||(25706-26197)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (110-578)||(993-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (112-601)||(5531-6013)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (341-597)||(230111-230367)
scaffold0008 (112-293)||(230365-230545)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (281-597)||(174-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (281-597)||(3675-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (281-597)||(119721-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (242-585)||(12961-13299)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (281-559)||(130262-130535)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (281-597)||(67374-67685)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (281-500)||(8296-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (290-597)||(39988-40290)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (358-597)||(26609-26844)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (267-399)||(90033-90166)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (110-173)||(8447-8510)
scaffold0176 (14-44)||(8576-8606)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (281-569)||(8722-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (407-597)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (365-597)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (365-500)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (291-597)||(53766-54066)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (139-375)||(92194-92432)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (129-160)||(10127-10158)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (110-143)||(16615-16648)
scaffold0326 (16-44)||(16521-16549)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (329-420)||(45956-46051)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (281-326)||(15089-15134)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (16-44)||(71-99)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (16-44)||(23799-23827)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 2528 - 2041
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2528 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 2429  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 2329  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2328 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 2229  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2228 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 2129  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2128 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 11419 - 10932
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 11320  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11220  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11219 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11120  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11119 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11020  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11019 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 2622 - 2594
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2622 attgttggaataagccctaatagccaatc 2594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11513 - 11485
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11513 attgttggaataagccctaatagccaatc 11485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 18252030 - 18252517
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252030 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18252129  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252130 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18252229  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18252230 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18252329  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252330 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18252429  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252430 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18532721 - 18532234
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532721 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18532622  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18532621 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagataga 18532522  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18532521 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18532422  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532421 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18532322  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532321 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27131616 - 27131130
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131616 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27131517  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27131516 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 27131417  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131416 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27131317  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27131316 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta-cctaga 27131218  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131217 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27310782 - 27310297
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310782 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 27310683  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    | | || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27310682 cacgttgaacataaggaaactattcttaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 27310583  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310582 gatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 27310483  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310482 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 27310383  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310382 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16359240 - 16358755
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16359240 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagaataacttaattgtgagac 16359141  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16359140 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtaaccctagtcaagctttattgagaaatggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 16359041  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359040 gatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16358941  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16358940 atactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatg 16358841  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358840 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 36816834 - 36816354
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  36816834 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaatagttcgtctgtttaatggaacattaagtataaattaattgtgagactccg 36816735  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36816734 ttaaacataaggacattattcttaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggataccattaaagcatagagactattatgtggatagactgatg 36816635  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  36816634 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 36816535  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816534 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttgg 36816436  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  36816435 agtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 3856126 - 3855639
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3856126 acaaggcatttctttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagcccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 3856027  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||   ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3856026 accccattaaacataaggacattattcttaaaatatttgtagtcaaactttattgtgaagtgggatattattaaagcatggagactattacgtgggtaga 3855927  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  3855926 ctgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatga 3855827  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3855826 gaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctaga 3855727  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3855726 tgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 112 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21171438 - 21171081
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21171438 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttcatggaacattaaatataacttaattgtgagac 21171339  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21171338 cccgttgaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 21171239  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21171238 gatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 21171139  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 469  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171138 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27277756 - 27277278
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||| || | ||||||| | ||||||       
T  27277756 catttctttgttgtttttgttttgtttcaaaataataacgtccctagaataattagtccatttaacggagcatta-gtgtgacttaatcgcgagacctt- 27277659  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||| |  || || | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27277658 ttaaccgaaatgacattattcttaaagtatccgtagtcaggctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattatgtgggtagaccgatg 27277559  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||| ||||||     
T  27277558 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatat 27277459  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    | |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27277458 tgcatagtaaaagtcat-gaaagtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttgg 27277360  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27277359 agtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 110 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22657429 - 22657108
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgatttt-gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtga 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22657429 acaagacatttctttattgatttttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtctgtttaatggaacattaaatataacttaattgtga 22657330  T
Q  209 gaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtag 308  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  22657329 gacccctttaaacataaggacacaattcttaaagtgtctctagtcaagctttattctgaaatgagatatcattaaagcatagagactatcatgtggatag 22657230  T
Q  309 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatg 408  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  22657229 actgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatg 22657130  T
Q  409 agaatactacatagtaaaagtt 430  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  22657129 tgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 316 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 12014457 - 12014084
Alignment:
Q  144 aaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagt 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||   |||||| |||      
T  12014457 aaaataataaagtcactagaatacatagtccgtttaatggaatattaagtgtaaattaatcgttagatcccattaaacataatgatgttattcttaaaac 12014358  T
Q  244 atccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 343  Q
    |||| |||| |||||||| || |||| ||||||  |||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  12014357 atccgtagttaagctttagtgtgaagagggatacgattaaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataagga 12014258  T
Q  344 gttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | ||||||   |||    
T  12014257 gttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tca 12014161  T
Q  444 taagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 519  Q
     |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014160 caagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9918106 - 9917837
Alignment:
Q  122 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||  ||||||||     
T  9918106 tttattgattttgttttgttacaaaataataaagtcactt------ttagtttgtttaatcgaacattaagtataacttgatcacgaga-tccattaaat 9918014  T
Q  222 ataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 321  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||    
T  9918013 ataaggacattattcttaaaatatctatagttaagctttattgttaagtgggatagcattgaagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcaca 9917914  T
Q  322 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 399  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917913 tctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 249 - 597
Target Start/End: Original strand, 23507039 - 23507385
Alignment:
Q  249 tagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 348  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23507039 tagtcatgatttagtgtgaagtgggatagcattaaagtatatagaatataaggtggatagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttat 23507138  T
Q  349 caagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataaga 448  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||| ||||| || |     | |||||||   ||||||     
T  23507139 caagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagagaacgttgtgtaaaaag---cataagt 23507235  T
Q  449 tattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 547  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||    
T  23507236 tattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgt 23507335  T
Q  548 ccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507336 ctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19706750 - 19706439
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19706750 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19706652  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  19706651 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 19706555  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  19706554 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 19706456  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  19706455 gtacttgatgaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 43802676 - 43802365
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43802676 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 43802578  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  43802577 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 43802481  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  43802480 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 43802382  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  43802381 gtacttgatgaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 28135034 - 28134723
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28135034 taaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28134936  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  28134935 aatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 28134839  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  28134838 ttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 28134740  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  28134739 gtacttgatgaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 9456107 - 9456418
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9456107 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 9456205  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  9456206 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 9456302  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  9456303 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 9456401  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  9456402 gcacttgatgaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20391550 - 20391239
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  20391550 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagt 20391452  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | |    
T  20391451 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctc 20391355  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20391354 ttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20391256  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20391255 gtacttgatgaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20779956 - 20779645
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20779956 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20779858  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20779857 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20779761  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20779760 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20779662  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  20779661 gcacttgatgaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22670568 - 22670257
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22670568 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22670470  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22670469 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22670373  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22670372 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 22670274  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22670273 gcacttgatgaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 42817300 - 42816989
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42817300 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 42817202  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  42817201 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 42817105  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  42817104 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 42817006  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  42817005 gcacttgatgaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 404 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916497
Alignment:
Q  404 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgt 501  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgt 9916593  T
Q  502 accctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916592 accctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12006712 - 12006461
Alignment:
Q  144 aaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||      
T  12006712 aaaataataaagtccctagaatagttagtctatttaatggaatattaagtgtgccttaatcgtgagaccccatgaaacataaggacattattattaaaac 12006613  T
Q  244 atccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 343  Q
    || | ||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||| | |||||| | ||||||   |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||    
T  12006612 attcgtagtcaagccttagtgtgaagagggataacattaaaacttagagattgttatgtgcatagactgatgatcacaacttacgaatcattgataagga 12006513  T
Q  344 gttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 395  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006512 gttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 22612483 - 22612794
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22612483 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagt 22612581  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22612582 aatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22612678  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  22612679 ttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatgg 22612777  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
     ||||  ||||||||||    
T  22612778 ctacttgatgaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 290 - 577
Target Start/End: Original strand, 633934 - 634216
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  633934 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 634032  T
Q  390 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 489  Q
    | |||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  634033 actggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 634129  T
Q  490 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 577  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634130 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 8727658 - 8727969
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| |||    
T  8727658 taaagcgtcgagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagt 8727756  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| |    
T  8727757 aatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactc 8727853  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||| | ||||    
T  8727854 ttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgg 8727952  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  8727953 gtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 47667785 - 47667485
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  47667785 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagt 47667687  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||           |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  47667686 aatatttatattggattgacccaccgtga-----------agt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 47667601  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  47667600 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 47667502  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  47667501 gtacttgatgaatcatg 47667485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 422
Target Start/End: Original strand, 35930573 - 35930713
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  35930573 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 35930671  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 422  Q
    ||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930672 aatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 581
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  558 atgactataaagttggttgatggg 581  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  484 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 583  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  584 ctccatgaatcatg 597  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 497  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  345 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 443  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  444 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 510  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  298 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 397  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  398 gatccgtcatgagaatactacatagta 424  Q
    || ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 418
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactac 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Original strand, 3403248 - 3403325
Alignment:
Q  140 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3403248 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3403325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3443571 - 3443494
Alignment:
Q  140 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 217  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3443571 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3443494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  450 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 530  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30720694 - 30720625
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaa 185  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  30720694 catttttttattggttttattttgttttaaaataataaagttcctggaataattagttcgtttaatggaa 30720625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  436 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 495  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 379 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  379 gtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 458  Q
    |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttat-gaaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 29327784 - 29328271
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327784 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29327883  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327884 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29327983  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29327984 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29328083  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328084 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29328183  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29328184 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 593
Target Start/End: Original strand, 15152445 - 15152926
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152445 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 15152544  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152545 cccgttaaacatacggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15152644  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152645 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 15152744  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152745 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 15152844  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152845 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 11536269 - 11535782
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11536269 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtacaacttaattgtgag 11536170  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536169 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11536070  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11536069 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11535970  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535969 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11535870  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535869 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 11543187 - 11542700
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11543187 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtcag 11543088  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543087 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11542988  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11542987 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11542888  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542887 gaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 11542788  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542787 tgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 12750828 - 12751313
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750828 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgagac 12750927  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    | | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12750928 ctcgttaaacataaagaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagttggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagact 12751027  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12751028 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 12751127  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12751128 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatg 12751227  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12751228 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Original strand, 12738542 - 12739023
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       
T  12738542 catttctttattgattttattttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtttgtttaatgaaacattaattataacttaattgtgagaccttg 12738641  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12738642 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaag 12738741  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12738742 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatac 12738841  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12738842 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgt 12738941  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738942 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 18561009 - 18561485
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561009 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgagac 18561108  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561109 cccgttaaacattaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaggtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 18561208  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  18561209 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgaga 18561308  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18561309 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatg 18561399  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  18561400 ttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 112 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 18258047 - 18257559
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18258047 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgacttaattgtgagac 18257948  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||  |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||| |    
T  18257947 cccattaaacacaaggacattattcttaaagtatccgtagtcaagtttttttgttaagtaggataacaataatgcataaagactattatgtggatagatt 18257848  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||    
T  18257847 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcaga 18257748  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||| ||||||||  | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  18257747 atattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 18257650  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 603  Q
     |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  18257649 -tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Original strand, 13392157 - 13392637
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  13392157 catttctttgttgactttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaacaattagtctgcttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc-a 13392255  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||   ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||  ||||    
T  13392256 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatcaatagtcaaactttattgtgaaaagggataacattaaaacatagagactattgtattggtagatcgatg 13392355  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||     
T  13392356 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatat 13392455  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13392456 tacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttgg 13392555  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392556 agtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 112 - 331
Target Start/End: Original strand, 15148144 - 15148363
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148144 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttgattgaacattaagtataacttaattgtgagac 15148243  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148244 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15148343  T
Q  312 gatgatcacatctcacagat 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15148344 gatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 2204543 - 2204854
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2204543 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2204641  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  2204642 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 2204738  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  2204739 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 2204837  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  2204838 gcacttgatgaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 18400095 - 18400406
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18400095 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18400193  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18400194 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18400290  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18400291 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18400389  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18400390 gcacttgatgaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 18407079 - 18407390
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18407079 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18407177  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18407178 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18407274  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18407275 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18407373  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18407374 gcacttgatgaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 48808807 - 48808496
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48808807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 48808709  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  48808708 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 48808612  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  48808611 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 48808513  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  48808512 gcacttgatgaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 290 - 597
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465301
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  390 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 489  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  490 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 589  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  590 gaatcatg 597  Q
    ||||||||    
T  8465294 gaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 15729742 - 15730053
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  15729742 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 15729840  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  15729841 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 15729937  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  15729938 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 15730036  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15730037 gtacttgatgaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18139649 - 18139338
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18139649 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagt 18139551  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18139550 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18139454  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  18139453 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgg 18139355  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  18139354 gtacttgatgaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 19230879 - 19231190
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19230879 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19230977  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  19230978 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 19231074  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  19231075 ttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 19231173  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  19231174 gtacttgatgaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 585
Target Start/End: Original strand, 30254129 - 30254428
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30254129 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30254227  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || |    
T  30254228 aatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactc 30254324  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  30254325 ttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 30254423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 357 - 597
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  357 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 456  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||   |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  457 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 555  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  556 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 586
Target Start/End: Original strand, 39111819 - 39112275
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||  |||||||    ||||  |     
T  39111819 catttctttattaattttgttttatttcaaaa-aataaagtccctagaatagcgagtccgtttaatgaaacattaagtacgacttaatcacaagacatct 39111917  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||| ||| || |||| |||||||||| |||  |  ||| |||||||  ||||||||||||||   |||||||| |||    
T  39111918 ttaaacataaggacactatttcaaaaatattcacagtccagctttattgtgaaacgaaataacattaaaatatagagactattataagggtagactaatg 39112017  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
     | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||  | |     || ||||||||| ||    
T  39112018 gtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatttataccgaac----ccatcatgagaaaac 39112113  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    |||||||  |  |||||| ||   || ||    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  39112114 tacatag--agtgttatacaa---gtgat----tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtagg 39112204  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 586  Q
    | || |||  |||||   | ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112205 aatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtctgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 358 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 328
Target Start/End: Original strand, 2364917 - 2365112
Alignment:
Q  132 ttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaac 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||  || || |     
T  2364917 ttgttatgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctttctaatggaacattaagtgtggcttaatcgtgagaacccattaaactaaatgacat 2365016  T
Q  232 tattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 328  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365017 tattcttaaaatattcgtagtcaa-ccttattgtgaaatgagataacattaaaacatagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10669213 - 10668901
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  10669213 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 10669115  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacc 479  Q
    |||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | |     
T  10669114 aatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgct 10669018  T
Q  480 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 579  Q
    ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||    
T  10669017 cttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatg 10668919  T
Q  580 ggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  10668918 ggtacttgatgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 47167170 - 47166871
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  47167170 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagt 47167072  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  47167071 aatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 47166975  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  47166974 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 47166876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 368
Target Start/End: Original strand, 7396221 - 7396450
Alignment:
Q  143 caaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaa 241  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  7396221 caaaataaaaatgtcgctagaatagttagttcatttaaatggaacattaagtatgacttaatcttgagaccctattaaacataagaaaattattcttaaa 7396320  T
Q  242 gtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgt---aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat 338  Q
      ||   ||||||||| ||| || ||| |  |||   ||||||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7396321 acatatgtagtcaagccttagtgtgaaatacgatgatattaaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaat 7396420  T
Q  339 aaagagttatcaagtcttcacatagatata 368  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396421 aaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  291 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  391 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 490  Q
     | |||| | ||  | ||||| ||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  491 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 575  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 365 - 597
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||   ||||| | |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 564  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  565 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 512
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388774
Alignment:
Q  282 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 381  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  382 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 479  Q
    ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||     
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttat-gaaagtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccact 19388741  T
Q  480 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388742 cttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 28130552 - 28130863
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  28130552 taaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagt 28130650  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| |||||||| ||    |||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  |    
T  28130651 aatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattc 28130747  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || ||||||||| |||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  28130748 ttagacctgaaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 28130846  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  28130847 gtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 423
Target Start/End: Original strand, 3132748 - 3132986
Alignment:
Q  184 aacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaa 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||||   || || || |||| |  ||| ||| | |  | |||    
T  3132748 aacattaagtgtaacttaattgtgagaccccattaaacataaggtcattattatgaaagtatttgtaatctagttttacttggaattggaaaaatagtaa 3132847  T
Q  284 agcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaat 383  Q
     ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  3132848 tgcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taat 3132946  T
Q  384 atttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 423  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132947 atttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 309 - 399
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235451
Alignment:
Q  309 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattga 10235451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  288 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 387  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  388 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 487  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  488 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 575  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  288 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 387  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  388 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 487  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  488 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 575  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 19393735 - 19393462
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19393735 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 19393637  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| | |||||| |   | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| |    
T  19393636 aatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactc 19393540  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 559  Q
    || |||||||| ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393539 ttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7662732 - 7662569
Alignment:
Q  249 tagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 348  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| | |  || |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | ||||    
T  7662732 tagtcaagatttagtgtgaagtaggatagcattaaagtacattgattattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttat 7662633  T
Q  349 caagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 413  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  7662632 caagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  291 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 390  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  391 ttggattga 399  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 390
Target Start/End: Original strand, 19859122 - 19859221
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859122 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19859220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 597
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592153
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 564  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 14592120  T
Q  565 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  14592121 taacgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 597
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011744
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 564  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 16011711  T
Q  565 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  16011712 taatgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  372 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 471  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||   ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  472 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 497
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 497  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  448 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 523  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  409 agaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 508  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  509 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 413
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  355 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 413  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Original strand, 10234179 - 10234244
Alignment:
Q  160 tagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa 225  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  10234179 tagaatagttagtccgtttaatgaaccattaaatataacttaatcatgagattccattaaacataa 10234244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2653239 - 2653207
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653239 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 2653207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  324 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11543281 - 11543253
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543281 attgttggaataagccctaatagccaatc 11543253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 443 - 507
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  443 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 507  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27381459 - 27380972
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381459 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27381360  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381359 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27381260  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381259 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27381160  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381159 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27381060  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381059 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27471842 - 27471355
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471842 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27471743  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471742 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27471643  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471642 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27471543  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471542 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 27471443  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471442 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17684674 - 17684189
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684674 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 17684575  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684574 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 17684475  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17684474 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 17684375  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684374 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 17684275  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684274 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17691647 - 17691160
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691647 acaaggcatttctttattgattttgttttctttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 17691548  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17691547 accccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttagtgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 17691448  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17691447 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 17691348  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691347 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 17691248  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691247 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 29308890 - 29309377
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308890 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29308989  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308990 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29309089  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29309090 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29309189  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309190 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29309289  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309290 tgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 29315850 - 29316336
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315850 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29315949  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315950 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29316049  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29316050 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29316149  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316150 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 29316249  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316250 tgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 11651725 - 11652210
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651725 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 11651824  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11651825 cccattaaaaataaggaaactattctaaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 11651924  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651925 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 11652024  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652025 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 11652124  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652125 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 189182 - 188697
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189182 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 189083  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  189082 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 188983  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  188982 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 188883  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188882 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 188783  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  188782 ttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 112 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16566525 - 16566257
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566525 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16566426  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566425 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16566326  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566325 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 358 - 597
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 324 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  324 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 423  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  424 aaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  524 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 356 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  356 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc 455  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  456 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  556 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 593  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 112 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13359474 - 13359010
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13359474 aaggcatttatttatttattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgcttaatggagcattaagtataacttaatcgtgaaac 13359375  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
     |||||||||||||  | | |||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||    
T  13359374 tccattaaacataaaaacattatttttaaagtatccgtagtcaacctttattgtgaaatgggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagact 13359275  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||   |  |||  ||    
T  13359274 gatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccat--ga 13359177  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 510  Q
    |||||||||  | ||| ||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13359176 atactacat--tgaaaattatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagat 13359080  T
Q  511 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || ||||||||||  |||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13359079 gtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 375 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  375 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  475 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 574  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  575 tgatgggtactccatgaatcat 596  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 112 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25537364 - 25537148
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537364 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtccgtttaatggaacattaagtataactttattgtgagac 25537265  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25537264 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagact 25537165  T
Q  312 gatgatcacatctcaca 328  Q
    |||||||||||||||||    
T  25537164 gatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 133 - 419
Target Start/End: Original strand, 27925772 - 27926062
Alignment:
Q  133 tgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacat---taagtata--acttaattgtgagaccccattaaacataagg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| |||||||   ||||| |   ||||||| ||||||| |||||||||  |||     
T  27925772 tgttttgtttcaaaataataaagtccttagaataactagtatgtttaacggaacataattaagtgtgtgacttaatcgtgagactccattaaactaaaga 27925871  T
Q  228 aaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 327  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||  ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  27925872 aaattattcttaaagtatctctagtcaaactttatttggaagtggtatagcattgaagcacaaagactattatgtggataaactgatgatctcatctcac 27925971  T
Q  328 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca 419  Q
     ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  27925972 ggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 17850663 - 17850321
Alignment:
Q  148 taataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatcc 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||| |||  |||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||| ||| |||||    
T  17850663 taataaagtccctataatagctagtttgtttgttggaacattatgtaagacttaattgtgatatccaattaaaaacaaggacactattcttaaattatcc 17850564  T
Q  248 atagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 347  Q
    ||||||||||||| ||| |||||   ||| |||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||    
T  17850563 atagtcaagcttt-ttgtgaagtcaaataacattcaagtatatagactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagtta 17850465  T
Q  348 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata-aaaagtgtcataa 446  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |     ||| ||   |||| ||||||    
T  17850464 tcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacattg----ggttttatgtaagtatcataa 17850369  T
Q  447 gatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 494  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17850368 gttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 16789062 - 16789373
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16789062 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 16789160  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  16789161 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 16789257  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  16789258 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 16789356  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  16789357 gcacttgatgaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 149 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20553755 - 20553492
Alignment:
Q  149 aataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatcca 248  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||| | | |||||| |||| ||||     
T  20553755 aataaagtctctaggatagctagtccgtttaatgaaatattaagtacgacttaatcgtgagatcccattaaatataagaatattattcttaaagcatccg 20553656  T
Q  249 tagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 348  Q
    |||| ||  ||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  20553655 tagtgaatttttattgtgaagtgagataaaattaaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatat 20553556  T
Q  349 caagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaata 414  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20553555 caaacattcacatagatat-aatattaagaataatatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22860199 - 22859888
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22860199 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22860101  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22860100 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22860004  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22860003 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 22859905  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22859904 gcacttgatgaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27508658 - 27508347
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27508658 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27508560  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27508559 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27508463  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  27508462 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgg 27508364  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  27508363 gtacttgatgaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 293 - 587
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  293 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 392  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  393 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 491  Q
     ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  492 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 587  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 1586419 - 1586108
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  1586419 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 1586321  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  1586320 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 1586224  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  1586223 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 1586125  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  1586124 gtacttgatgaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27528244 - 27527947
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27528244 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27528146  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27528145 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27528049  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  27528048 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgg 27527950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 14074471 - 14074782
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  14074471 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagt 14074569  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | |    
T  14074570 aatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctc 14074666  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  14074667 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 14074765  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  14074766 gtacttgatgaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 18020152 - 18019885
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18020152 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18020054  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18020053 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18019957  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 553  Q
    || ||||||||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019956 ttagacctgaaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 528
Target Start/End: Original strand, 8509941 - 8510338
Alignment:
Q  129 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-ccccattaaacataagg 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  8509941 attttattttgttttaaaataataaagtctatagaataattagtctatttgatggaacattatgtacgacttaattatgagacccccattaaatatgagg 8510040  T
Q  228 aaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg-atcacatctca 326  Q
    |   |||| | |||||||   |||| ||||||||||  ||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |  |||| || |||||  |    
T  8510041 atgatattattaaagtatatgtagttaagctttattatgaaatgagatagcattaaaacataaagactattatgtgcgtaaa--gatgtataacatcgta 8510138  T
Q  327 cagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagat-ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 425  Q
    || |||| || |||  ||||||||  |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  |    
T  8510139 catatcacgggtaagtagttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--a 8510236  T
Q  426 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc 525  Q
    | |||||   ||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  8510237 atgttat-gtaagtgtcattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtac 8510335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 281 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10359360 - 10359073
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||    
T  10359360 taaagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggt 10359263  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | ||| ||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |    
T  10359262 aatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactc 10359167  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 575  Q
    || ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359166 ttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20736773 - 20736413
Alignment:
Q  148 taataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaa-gtat 245  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  || |||||| | ||||||| | |||||||  |||||   |||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||||    
T  20736773 taataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaa-cataaagaacattattcttaaatgtat 20736675  T
Q  246 ccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagt 345  Q
    |  ||||||||||||| | |||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    | || ||||  |||     
T  20736674 ctgtagtcaagctttaataagaactgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgtgttatagatat-gaga 20736576  T
Q  346 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 445  Q
    ||| |||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | ||| |||| |||||||    
T  20736575 tattaagtttata-ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcata 20736480  T
Q  446 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736479 agatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 8612906 - 8613221
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8612906 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 8613004  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 477  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  8613005 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcg 8613102  T
Q  478 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 577  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  8613103 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttga 8613201  T
Q  578 tgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  8613202 tgggtacttgatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 413
Target Start/End: Original strand, 28172690 - 28172859
Alignment:
Q  244 atccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 343  Q
    ||||||| ||||| |||| || ||||||||||| || | ||| ||||| | ||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |    
T  28172690 atccataatcaagttttagtgtgaagtgggataacactgaagaatagaaattattatgtgaatggactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaa 28172789  T
Q  344 gttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  28172790 gttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22560534 - 22560311
Alignment:
Q  242 gtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |   || |||||||  | ||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||      
T  22560534 gtatccatagtcaagctttaatataaattgggataataataaagcgcagagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat- 22560436  T
Q  342 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 441  Q
    ||| ||| |||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| |||    
T  22560435 gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgt 22560339  T
Q  442 cataagatattctcatagtgatagtggt 469  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560338 cataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 597
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  484 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 583  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  584 ctccatgaatcatg 597  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13995254 - 13995151
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13995254 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 13995156  T
Q  381 aatat 385  Q
    |||||    
T  13995155 aatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||| ||| ||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 500
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 500  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 500
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  288 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 387  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  388 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 487  Q
    ||     ||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 at-----attgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tttcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  488 tgaaaccactatg 500  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  304 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 403  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  404 tcatgagaatactacatagtaa 425  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 519
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  456 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  441 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 540  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  541 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31258120 - 31258065
Alignment:
Q  117 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagt 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  31258120 atttctttattgcttttgttttgtttcaaaataataaagtctctaaaataattagt 31258065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||  | |||||  | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 500
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073781
Alignment:
Q  288 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 387  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  388 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 487  Q
    ||||| |||||| |   | |||||||||||||||  | | ||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacc 4073768  T
Q  488 tgaaaccactatg 500  Q
    | |||||||||||    
T  4073769 taaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 44
Target Start/End: Original strand, 29308795 - 29308824
Alignment:
Q  15 tattgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308795 tattgttggaataagccctaatagccaatc 29308824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 17684770 - 17684742
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684770 attgttggaataagccctaatagccaatc 17684742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 27381553 - 27381525
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381553 attgttggaataagccctaatagccaatc 27381525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 27471936 - 27471908
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471936 attgttggaataagccctaatagccaatc 27471908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 29315756 - 29315784
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315756 attgttggaataagccctaatagccaatc 29315784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 55612683 - 55613170
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612683 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 55612782  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612783 accccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 55612882  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55612883 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 55612982  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612983 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 55613082  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613083 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19926967 - 19926480
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926967 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 19926868  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926867 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 19926768  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19926767 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 19926668  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926667 gaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 19926568  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926567 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 26970463 - 26970950
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970463 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 26970562  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970563 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26970662  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26970663 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26970762  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970763 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 26970862  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970863 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 26963640 - 26964127
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963640 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26963739  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963740 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26963839  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26963840 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26963939  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963940 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 26964039  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964040 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 18262214 - 18262699
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262214 aaggcatttctttattgattttgtttcgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18262313  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262314 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18262413  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18262414 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 18262513  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262514 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 18262613  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262614 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 5707320 - 5707807
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707320 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5707419  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707420 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5707519  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5707520 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5707619  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707620 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 5707719  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707720 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 868597 - 869084
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868597 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 868696  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868697 accccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 868796  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  868797 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 868896  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 868996  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868997 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 5713948 - 5714435
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713948 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagcccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5714047  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714048 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5714147  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5714148 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5714247  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714248 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 5714347  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714348 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10621540 - 10621053
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621540 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10621441  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621440 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10621341  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10621340 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10621241  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621240 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10621141  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621140 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10628619 - 10628132
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628619 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10628520  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628519 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatattattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10628420  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10628419 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10628320  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628319 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 10628220  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628219 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 18269070 - 18269560
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgatttt-----gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269070 aaggcatttctttattgattttgttttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 18269169  T
Q  207 gagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269170 gagaccccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 18269269  T
Q  307 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtca 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18269270 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcca 18269369  T
Q  407 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269370 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 18269469  T
Q  507 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269470 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 28393339 - 28392854
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393339 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28393240  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28393239 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 28393140  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393139 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 28393040  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28393039 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatg 28392940  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28392939 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 597
Target Start/End: Original strand, 8858179 - 8858654
Alignment:
Q  122 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8858179 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8858278  T
Q  222 ataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858279 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8858378  T
Q  322 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8858379 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 8858478  T
Q  422 gtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 521  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858479 gtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 8858578  T
Q  522 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858579 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 122 - 597
Target Start/End: Original strand, 8845215 - 8845690
Alignment:
Q  122 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8845215 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8845314  T
Q  222 ataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845315 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8845414  T
Q  322 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8845415 tctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 8845514  T
Q  422 gtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 521  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845515 gtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcga 8845614  T
Q  522 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845615 gtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 4426808 - 4426336
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426808 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 4426709  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4426708 cccgttaaacataaggaa-ctattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 4426610  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4426609 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 4426510  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426509 atactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 4426422  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426421 ttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 5668327 - 5667849
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| |    
T  5668327 catttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctatttaatggagcattaagtgtgatttaatcgtgagaccc-a 5668229  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccat--agtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 313  Q
    |||||   ||||| | |||||| |||||||   |  ||||||||||||||| |||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  5668228 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatatttgtagtcaagctttattgtgaaaagagataacattaaatcatagagactattatgtggatagaccga 5668129  T
Q  314 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 413  Q
    ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  5668128 tgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaat 5668031  T
Q  414 actacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgtt 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5668030 actacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgtt 5667931  T
Q  514 ggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5667930 g--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Original strand, 35223576 - 35224047
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| || |           
T  35223576 catttctttgttgattttgttttgttttaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtaa------- 35223668  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
       |||  ||||| | |||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||   ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  35223669 ---aacgaaaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgtaaaaaaggataacattaaagcatatagactattatgtgggtagacggatg 35223765  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  35223766 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatac 35223865  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35223866 tatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttgg 35223965  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35223966 agtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 118 - 601
Target Start/End: Original strand, 20311299 - 20311781
Alignment:
Q  118 tttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20311299 tttctttattgattttgttttgttttaaaataataaagtacttataatagttaatatgttcaatggagcattaaggtataacttaattgtgagaccccat 20311398  T
Q  217 taaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatga 316  Q
    |||||||||||| ||| || | |||||||   | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  20311399 taaacataaggacactgtttttaaagtatttgttgtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatga 20311498  T
Q  317 tcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatact 416  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20311499 tcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatact 20311598  T
Q  417 acatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    ||||||  | ||||||   || | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20311599 acatag--acagttat-gtaactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtagg 20311695  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 601  Q
    | |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311696 attcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 365 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 564  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  565 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 365 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 564  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  565 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Original strand, 12357136 - 12357251
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357136 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 12357235  T
Q  210 accccattaaacataa 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357236 accccattaaacataa 12357251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 15461488 - 15461799
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15461488 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15461586  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15461587 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15461683  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  15461684 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 15461782  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15461783 gtacttgatgaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 34975542 - 34975853
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34975542 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 34975640  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  34975641 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 34975737  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  34975738 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 34975836  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  34975837 gtacttgatgaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 581
Target Start/End: Original strand, 5616215 - 5616681
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||| | ||| |||  |||||     
T  5616215 aaggcatttctttattcattttgttttgtttcaaaataataaagttcctaaaataattagtctatttcttggaacattaagtctgactaaatcatgagat 5616314  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaa--gctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||| ||||||   |||| | |||||| ||||||||| | |||||  | ||||||  ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5616315 cccgttaaactagaggacattattcttaaagtatccgttgtcaaaggttttattatgaattgggatattaataaagcattgagactattatgtatgtaga 5616414  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
     |||||| |||||||||  | ||||  || | ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   | |||    
T  5616415 ttgatgaccacatctcatgggtcataaat-atgagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtga 5616513  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    |||||||||| |||  |  ||||  |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  5616514 gaatactacagagttta--ttat-gaaagtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctaga 5616610  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 581  Q
    || |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616611 tg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21454319 - 21453961
Alignment:
Q  136 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactat 234  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||  |||| || | |||    
T  21454319 tttgtttcaaagtaataaagttcttagaatagttagtttgattaatggaacattaaaatgtgacttaatattgagaccccattaattataatgacattat 21454220  T
Q  235 tctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 334  Q
    | | ||| |||| |||||||| |||||||| ||| || |||| || ||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||  ||||   ||| ||    
T  21454219 ttttaaaatatctatagtcaaactttattgtgaaatgagataacaataatgcataaagattattatgtgagtagattgatgatcatctctcgg-gataat 21454121  T
Q  335 ggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataa 434  Q
    |||    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||      
T  21454120 ggactt-gagatatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgt 21454023  T
Q  435 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 496  Q
    ||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454022 aaaatatcataagatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 422
Target Start/End: Original strand, 56516094 - 56516368
Alignment:
Q  148 taataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaagtatc 246  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||  |  ||||| |||||||| | | |||||||||||||||  |||||| ||||  ||| | ||||||  |||||||    
T  56516094 taataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaa-catatagaacattattcttgaagtatc 56516192  T
Q  247 catagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 346  Q
     ||||||||||||||||| |||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  56516193 tatagtcaagctttattgtgaataacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagtt 56516292  T
Q  347 atcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 422  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516293 atcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 2677004 - 2677315
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2677004 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2677102  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  2677103 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 2677199  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  2677200 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 2677298  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  2677299 gcacttgatgaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 15815012 - 15815323
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15815012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15815110  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15815111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15815207  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  15815208 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 15815306  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  15815307 gcacttgatgaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18111354 - 18111043
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18111354 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18111256  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  18111255 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 18111159  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18111158 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18111060  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  18111059 gcacttgatgaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 3369334 - 3369023
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3369334 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3369236  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  3369235 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 3369139  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  3369138 ttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 3369040  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  3369039 gtacttgatgaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17300270 - 17299959
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17300270 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 17300172  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  17300171 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 17300075  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||     
T  17300074 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatga 17299976  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  17299975 gcacttgatgaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 18163153 - 18163464
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  18163153 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 18163251  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||| | ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  18163252 aatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 18163348  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18163349 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 18163447  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  18163448 gtacttgatgaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 20243928 - 20244239
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  20243928 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 20244026  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  20244027 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 20244123  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20244124 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20244222  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20244223 gtacttgatgaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 26531604 - 26531915
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  26531604 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagt 26531702  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  26531703 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 26531799  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  26531800 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 26531898  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  26531899 gcacttgatgaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10677753 - 10677538
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10677753 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10677655  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    ||||||  || || | |||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10677654 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagcttta--gtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10677557  T
Q  316 atcacatctcacagatcat 334  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10677556 atcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10891393 - 10891178
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10891393 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10891295  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    ||||||  || || | |||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10891294 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagcttta--gtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10891197  T
Q  316 atcacatctcacagatcat 334  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10891196 atcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 4676294 - 4675983
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  4676294 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 4676196  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  4676195 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 4676099  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  4676098 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 4676000  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  4675999 gtacttgatgaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 291 - 597
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870720
Alignment:
Q  291 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  391 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 490  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  491 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 590  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T
Q  591 aatcatg 597  Q
    |||||||    
T  5870714 aatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 1941715 - 1942026
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1941715 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 1941813  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  1941814 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 1941910  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  1941911 ttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 1942009  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  1942010 gtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 290 - 581
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365806
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  390 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 488  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacct 19365714  T
Q  489 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 581  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365715 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 272 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 32646846 - 32646523
Alignment:
Q  272 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 371  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  32646846 ggataacattaaagaatgaagactattatgtggatatgttgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaat 32646747  T
Q  372 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 470  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||||| |||||||  ||| |||||  | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||    
T  32646746 attaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtg 32646650  T
Q  471 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 570  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  32646649 tattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagt 32646550  T
Q  571 tggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
     |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646549 cggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 358 - 580
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgg 580  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 365 - 597
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 564  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  565 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 495
Target Start/End: Original strand, 32636475 - 32636685
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| ||||    
T  32636475 taaagcgtggagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagt 32636573  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |    
T  32636574 aatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactc 32636670  T
Q  481 ttcgacctgaaacca 495  Q
    | |||| ||||||||    
T  32636671 tccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 5528790 - 5528495
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| || ||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||| | ||||| |||  ||| ||| | || |  |||||| ||||||||||||||||    
T  5528790 taaagcgtatagactattatgtttgtagaattatgaccacatctcacgggtcatgaatac-gagatattatgtatatacataggtataaatattaggagt 5528692  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
     |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |    
T  5528691 gatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcataatgataatggtgtataacactc 5528595  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    ||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  5528594 ttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacaggataaccataatgttggttaatgg 5528496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 372
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  294 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 372  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 377 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  377 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 476  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  477 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 576  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  577 atgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 581
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttat-gaaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 564  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  565 taaagttggttgatggg 581  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 512
Target Start/End: Original strand, 4546071 - 4546298
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4546071 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 4546169  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| ||||  || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  4546170 aatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 4546266  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
    || ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4546267 tttgacctaaaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 597
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  380 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 479  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  480 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 579  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  580 ggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 469 - 519
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  469 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 519  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39074260 - 39074190
Alignment:
Q  257 ctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 327  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||    
T  39074260 ctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggagactattacgtgggttgattgttgatcacatctcac 39074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 500
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  346 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 445  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| ||  ||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  446 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 500  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30040919 - 30040740
Alignment:
Q  148 taataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaa-gtat 245  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  || |||| | | ||||||| | |||||||  |||||   |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  30040919 taataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaa-cataaagaacactattcttaaatgtat 30040821  T
Q  246 ccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 326  Q
    | |||||||||| ||| |  ||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30040820 ctatagtcaagcgttaatatgaattgggataataataaagcatcgagactattatgtatatagactgatgaccacatctca 30040740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  337 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 436  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |   | ||||  ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  437 agtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39074346 - 39074278
Alignment:
Q  159 ctagaatagttagtcggtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataag 226  Q
    |||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39074346 ctagaataattagtccgtttaaattgaacattaagtatgacttaatcatgagaccccattaaacataag 39074278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9938015 - 9937933
Alignment:
Q  266 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 348  Q
    |||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938015 gaagtgagatagcatcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 488 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  488 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 569  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11161972 - 11161913
Alignment:
Q  160 tagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaa 219  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  11161972 tagaatagttaatcagtttaatggaacacaaagtgtgacttaattgtgagactccattaa 11161913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 44
Target Start/End: Original strand, 26963544 - 26963574
Alignment:
Q  14 atattgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963544 atattgttggaataagccctaatagccaatc 26963574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 326
Target Start/End: Original strand, 11421007 - 11421052
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 326  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421007 taaagcttcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 5713854 - 5713882
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713854 attgttggaataagccctaatagccaatc 5713882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 367 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  367 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca---tagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 458  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    |||||  | |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 10621634 - 10621606
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621634 attgttggaataagccctaatagccaatc 10621606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 26970369 - 26970397
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970369 attgttggaataagccctaatagccaatc 26970397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 6110064 - 6110551
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110064 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 6110163  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110164 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6110263  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6110264 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6110363  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110364 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 6110463  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110464 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 16482688 - 16482203
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482688 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16482589  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482588 cccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16482489  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16482488 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16482389  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482388 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 16482289  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482288 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10572799 - 10572312
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572799 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10572700  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572699 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10572600  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10572599 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10572500  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10572499 gaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtaga 10572400  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572399 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15601091 - 15600604
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601091 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15600992  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600991 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15600892  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15600891 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15600792  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600791 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15600692  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15600691 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15607636 - 15607149
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607636 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15607537  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607536 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15607437  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15607436 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15607337  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607336 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15607237  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15607236 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10579556 - 10579075
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579556 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttaaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 10579457  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579456 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 10579357  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10579356 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 10579257  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579256 tacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 10579157  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579156 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17781319 - 17780838
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781319 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 17781220  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781219 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 17781120  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17781119 atcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 17781020  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781019 tacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 17780920  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780919 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 593
Target Start/End: Original strand, 18522665 - 18523146
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522665 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18522764  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522765 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcatttaagcatagagactattatgtaggtagact 18522864  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18522865 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaa 18522964  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522965 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 18523064  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523065 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 8490488 - 8490982
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490488 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 8490587  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagacta-------ttatgt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  8490588 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactacagacgattatgt 8490687  T
Q  303 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490688 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 8490787  T
Q  403 gtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 502  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490788 gccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 8490887  T
Q  503 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490888 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15357793 - 15357306
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357793 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15357694  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15357693 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtaga 15357594  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15357593 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatga 15357494  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357493 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 15357394  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357393 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 597
Target Start/End: Original strand, 13211305 - 13211789
Alignment:
Q  113 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211305 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 13211404  T
Q  213 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211405 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 13211504  T
Q  313 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaa 412  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13211505 atgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 13211604  T
Q  413 tactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13211605 tattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgt 13211704  T
Q  513 tggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211705 tggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 13248607 - 13249094
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248607 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 13248706  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248707 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtattcgtagtcaagctttgttgagaagtgggataacattaaagcatagagactattatgtaggtaga 13248806  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13248807 ctgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatga 13248906  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13248907 gaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctaga 13249006  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249007 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 18519980 - 18520462
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18519980 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18520079  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520080 cccgttaaacataaggaaactattcttaaa---tccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18520176  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18520177 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgaga 18520276  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18520277 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatg 18520376  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520377 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 129 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15342407 - 15341939
Alignment:
Q  129 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342407 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagtttgttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 15342308  T
Q  229 aactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 328  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342307 acctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 15342208  T
Q  329 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 428  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15342207 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaa 15342108  T
Q  429 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 528  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342107 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 15342008  T
Q  529 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342007 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 32057101 - 32056619
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  32057101 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacatcaagtataactttattgtaagaccccg 32057002  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  32057001 ttaaacataaagaaactattcttaaagtgtccgtagtcaaactttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatg 32056902  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaata 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32056901 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 32056802  T
Q  415 ctacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttg 514  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056801 ctacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttg 32056702  T
Q  515 gagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32056701 gagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 17200389 - 17199900
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17200389 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgatac 17200290  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17200289 ccctttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagttaagctttattgagatgtgtgatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 17200190  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  17200189 gatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgaga 17200090  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17200089 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatg 17199990  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199989 ttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 13516813 - 13517294
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516813 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttcatggaacattaagtataacttaattgtgagac 13516912  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13516913 cccgttaaacataaggaaacgattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcacagagactattatgtgggtagact 13517012  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13517013 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgaga 13517112  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517113 atactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 13517208  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13517209 ttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 1647726 - 1647241
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataa----cttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  1647726 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataattaacttaattgtgagac 1647627  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1647626 cccgttaaacataaggaaactatttttaaagtatccgtaatcaagctttattgagaaaagggatataattaaagcatagagactattatgtggatagact 1647527  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||    
T  1647526 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgaga 1647427  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1647426 atactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaaccactatataccctagatg 1647327  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1647326 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 29924971 - 29925458
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29924971 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29925070  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  29925071 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29925170  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||    
T  29925171 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29925270  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  29925271 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctaga 29925370  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29925371 cgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 29974124 - 29974611
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29974124 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29974223  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  29974224 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29974323  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||    
T  29974324 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29974423  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  29974424 gaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctaga 29974523  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29974524 cgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 216 - 597
Target Start/End: Original strand, 17136465 - 17136840
Alignment:
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17136465 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatg 17136564  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17136565 atcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 17136658  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136659 tacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttgg 17136758  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17136759 agtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 16200434 - 16200917
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200434 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200532  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
     ||| |||||||||||| | |||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||    
T  16200533 tccaataaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatgtcattaaagcatgaagactatt-tgtggagagact 16200631  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||    
T  16200632 gatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgaga 16200731  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    |||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200732 atactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatg 16200831  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200832 ttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19089946 - 19089734
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19089946 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccct 19089847  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089846 ttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatg 19089747  T
Q  316 atcacatctcaca 328  Q
    |||||||||||||    
T  19089746 atcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 117 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 24253589 - 24253130
Alignment:
Q  117 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-cccca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  24253589 atttctttattgattttgttttacttcaaaataataaagtccttagaatagctcgttcgtttgatggaacattaagtatgacttaatcgtgagatcccca 24253490  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||   | |||||  |||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24253489 tcaaacataaggacactattcttaaagtatatgtggtcaaaatttattgtaaagtgaggtaacattaaagcatagagactattatgtcggtagactaatg 24253390  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||     
T  24253389 atcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataa 24253290  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |    
T  24253289 tgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cattcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatg 24253194  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 579  Q
    | |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253193 actcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 110 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18640953 - 18640792
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640953 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18640854  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18640853 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtg 18640792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 112 - 349
Target Start/End: Original strand, 16200128 - 16200363
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200128 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagttcgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200226  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||    
T  16200227 cccattaaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatatcattaaagcatggagactatt-tgtggagagact 16200325  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 349  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200326 gatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 21034229 - 21034540
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21034229 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21034327  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21034328 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21034424  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  21034425 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 21034523  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  21034524 gtacttgatgaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15846847 - 15846536
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15846847 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15846749  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  15846748 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 15846652  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  15846651 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 15846553  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15846552 gtacttgatgaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20147865 - 20147554
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20147865 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20147767  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20147766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20147670  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  20147669 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 20147571  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  20147570 gcacttgatgaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 290 - 597
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399094
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  390 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 489  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  490 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 589  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  590 gaatcatg 597  Q
    ||||||||    
T  21399087 gaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 55427012 - 55427323
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  55427012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 55427110  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  55427111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 55427207  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  55427208 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 55427306  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  55427307 gtacttgatgaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 290 - 597
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890693
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  390 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 489  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  490 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 589  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  590 gaatcatg 597  Q
    ||||||||    
T  14890686 gaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 12299902 - 12300212
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  12299902 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagt 12299999  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  12300000 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 12300096  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  12300097 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 12300195  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12300196 gtacttgatgaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 25979078 - 25978728
Alignment:
Q  242 gtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa 341  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||| | |||||  | |||||| | |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||  | | || ||||      
T  25979078 gtatccgtagtcaagctttaatatgaattaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataaccgcatctcatgggttatagatat- 25978980  T
Q  342 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 441  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||    
T  25978979 gagatattaagtctatacataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgt 25978883  T
Q  442 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaa 541  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||    
T  25978882 cataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaa 25978784  T
Q  542 cgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978783 cgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 499
Target Start/End: Original strand, 14147012 - 14147226
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||     
T  14147012 taaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagg 14147110  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| |    
T  14147111 aatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactc 14147207  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactat 499  Q
    || ||||||||||||||||    
T  14147208 ttagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 365 - 563
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 563  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Original strand, 18534758 - 18534819
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18534758 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccatagaatagttagtc 18534819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 439 - 597
Target Start/End: Original strand, 28088251 - 28088408
Alignment:
Q  439 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 538  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||  ||||||    
T  28088251 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagggctttgttgccattc 28088349  T
Q  539 aaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
     ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088350 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 11787578 - 11787889
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||| | | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11787578 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataaccgcatctcattggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 11787676  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | | |||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  11787677 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gatattttcataagatattctcacaatgataatattgtatatcgctc 11787773  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  |||| || |||| ||||||||||||    
T  11787774 ttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatggataaccataacgttggttgatgg 11787872  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  11787873 gtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317176
Alignment:
Q  293 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 392  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  393 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 492  Q
     ||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaa 15317277  T
Q  493 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 592  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  15317276 ccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaa 15317181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 458
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  329 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 427  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  428 gttataaaaagtgtcataagatattctcata 458  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 375
Target Start/End: Original strand, 9504446 - 9504548
Alignment:
Q  273 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 372  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  9504446 gatatctttaaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaata 9504545  T
Q  373 tta 375  Q
    |||    
T  9504546 tta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 157
Target Start/End: Original strand, 18510924 - 18510969
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510924 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 18510969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 523
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  331 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 430  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  431 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 523  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  286 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 385  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  386 ttatattggattgatc 401  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 336
Target Start/End: Original strand, 19345656 - 19345795
Alignment:
Q  197 acttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagacta 296  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||  | | ||| || |||| ||||||| ||| ||||||||| || |||  |    
T  19345656 acttaatcgtgagactccattaattataagaacactattcttaaagaatcctcaattaaggttcattgtgaagtggtataacattaaagcgtaaagatca 19345755  T
Q  297 ttatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 336  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19345756 ttatgtgggtatactgatgatcacgtctcatagatcatgg 19345795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 559
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  444 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 543  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  544 ttgtccgtaacaggat 559  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  436 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 500  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15357888 - 15357859
Alignment:
Q  15 tattgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357888 tattgttggaataagccctaatagccaatc 15357859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 421
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189275
Alignment:
Q  369 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 421  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata 4189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 13248513 - 13248541
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248513 attgttggaataagccctaatagccaatc 13248541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15351295 - 15351267
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351295 attgttggaataagccctaatagccaatc 15351267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15601186 - 15601158
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601186 attgttggaataagccctaatagccaatc 15601158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 500
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  436 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 500  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 463; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 596
Target Start/End: Original strand, 21940665 - 21941151
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940665 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21940764  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940765 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 21940864  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21940865 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 21940964  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940965 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 21941064  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941065 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Original strand, 22171491 - 22171974
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171491 aaggcatttccttattgattttgttttatttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 22171590  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171591 cccattaaacata--gaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 22171688  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22171689 gatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 22171788  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171789 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 22171888  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171889 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Original strand, 6094129 - 6094610
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6094129 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 6094228  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  6094229 ttaaacataaggaaactatttttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatg 6094328  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6094329 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 6094428  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6094429 tatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttgg 6094528  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094529 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Original strand, 24642655 - 24643135
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24642655 catttctttattgattttgttttgtttcaaaatcataaagtccctagaattgttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24642754  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642755 ttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatg 24642854  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24642855 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatac 24642954  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642955 tacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttgg 24643053  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 agtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 334 - 597
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  334 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 433  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  434 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  534 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 334 - 597
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  334 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 433  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  434 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  534 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 112 - 311
Target Start/End: Original strand, 28554885 - 28555084
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554885 aaggcatttctttattgattttgtttagtttcaaaataataaaatacctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28554984  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554985 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 206 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 14984030 - 14983710
Alignment:
Q  206 tgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagg 305  Q
    |||||||| |||||||   |||| | |||||| |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  14984030 tgagacccaattaaactataggacattattcttaaagtatctataatcaaaatttattgtgaagtgggataacattaa-gaatagggactattatgtggg 14983932  T
Q  306 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 405  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |    
T  14983931 tagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgcc 14983833  T
Q  406 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 504  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  14983832 atgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaatcactatgtacc 14983736  T
Q  505 ctagatgttggagtcgagtgctttgt 530  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983735 ctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 456 - 597
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  456 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  556 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 38232570 - 38232115
Alignment:
Q  122 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  |   ||| ||||||||||||  ||| || |||||||||    
T  38232570 tttattgattttgttttatttcaaaataataaa-tctctagaatagttagtctgtttaataaatttttaggtataacttaatcatgacactccattaaac 38232472  T
Q  222 ataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 321  Q
     |||  | | |||||| |||||||   ||||||| ||||||||  ||||| ||||   |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  38232471 gtaaa-atagtattcttaaagtatttgtagtcaaactttattgtaaagtgagatagtcttaaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcaca 38232373  T
Q  322 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  38232372 tctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacata 38232273  T
Q  422 gtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcg 520  Q
    |  ||||||||  ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||    
T  38232272 g--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcg 38232176  T
Q  521 agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 581  Q
    ||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232175 agtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 116 - 243
Target Start/End: Original strand, 24636860 - 24636987
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24636860 catttctttcttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccttttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24636959  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagt 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24636960 ttaaacataaggaaactattcttaaagt 24636987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 8371564 - 8371253
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  8371564 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagt 8371466  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  8371465 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 8371369  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  8371368 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgg 8371270  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  8371269 gtacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 21969324 - 21969635
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21969324 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21969422  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21969423 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21969519  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  21969520 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 21969618  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  21969619 gtacttgatgaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 12562114 - 12562425
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12562114 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 12562212  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  12562213 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 12562309  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  12562310 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 12562408  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12562409 gtacttgatgaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 285 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  285 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 384  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  385 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 482  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27007828 - 27007517
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27007828 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27007730  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27007729 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27007633  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27007632 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27007534  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27007533 gcacttgatgaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27014971 - 27014660
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27014971 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27014873  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27014872 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27014776  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27014775 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27014677  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27014676 gcacttgatgaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27880798 - 27880487
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27880798 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27880700  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  27880699 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 27880603  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27880602 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 27880504  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  27880503 gcacttgatgaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 28020979 - 28020668
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28020979 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28020881  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  28020880 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 28020784  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  28020783 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 28020685  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  28020684 gcacttgatgaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22130920 - 22130609
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22130920 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22130822  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22130821 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22130725  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  22130724 ttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgg 22130626  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  22130625 gcacttgatgaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 25611186 - 25611497
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25611186 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25611284  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| |    
T  25611285 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactc 25611381  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||    
T  25611382 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgg 25611480  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  25611481 gcacttgatgaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 291 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659494
Alignment:
Q  291 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  391 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 490  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  491 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 590  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T
Q  591 aatcatg 597  Q
    |||||||    
T  22659500 aatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 21916667 - 21916978
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21916667 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagt 21916765  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  21916766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 21916862  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||    
T  21916863 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgg 21916961  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  21916962 gcacttgatgaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 45534584 - 45534273
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  45534584 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 45534486  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  45534485 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 45534389  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  45534388 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgg 45534290  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  45534289 gtacttgatgaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32873019 - 32872741
Alignment:
Q  140 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggttta-atggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctc 238  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||  |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || | |  || | || | |     
T  32873019 tttcaaaataataaagtccttataatagttcatccatttatatagaacattaagtatgacttaattgtgagatctcattgaaaagagtgacaatactatt 32872920  T
Q  239 aaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat 338  Q
    ||| |||   |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| ||    
T  32872919 aaaatatttgtagttaagatttattgtgaagtgggataacatcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaat 32872820  T
Q  339 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatacta 417  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32872819 aaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 26240475 - 26240786
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  26240475 taaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagt 26240573  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | |    
T  26240574 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctc 26240670  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  26240671 ttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 26240769  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  26240770 gtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 500
Target Start/End: Original strand, 18835341 - 18835556
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  18835341 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagt 18835439  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |    
T  18835440 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaa-tgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactc 18835536  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatg 500  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  18835537 ttagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 399
Target Start/End: Original strand, 2375027 - 2375300
Alignment:
Q  131 tttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |  || |||||||  ||| |||| |||||||||| | | |    
T  2375027 tttgttttgtttcaaaataataaactccctataataattagtcaatttaatggaacatttatgatgacttaatcatgaaaccc-attaaacatacgaata 2375125  T
Q  231 ctattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgat-------gatcacatc 323  Q
     |||| | |||||||   |||||| | ||||||| || ||| |||| |||||||| |||   ||||||| || |||||| ||||       |||||||||    
T  2375126 ttatttttaaagtatatgtagtcacgatttattgcga-gtgagataacattaaagtatatgaactattaagtgggtagattgatcactcatgatcacatc 2375224  T
Q  324 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 399  Q
     |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2375225 acacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattga 2375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 597
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 366 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  366 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 465  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  466 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 490 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  490 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 587  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 2963247 - 2962932
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | | ||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  2963247 taaagcgtagagactattatgtatgtagactaatgaccgtatctcatgggttataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 2963149  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 477  Q
    |||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  |||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | | ||||  |     
T  2963148 aatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagcgtatatcc 2963051  T
Q  478 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 577  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | || ||||| || |||| |||||||||    
T  2963050 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaaaggataaccataacgttggttga 2962952  T
Q  578 tgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||| ||||  ||||||||||    
T  2962951 tggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  435 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 534  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  535 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 581  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 387
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  293 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 387  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 602
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  484 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 583  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  584 ctccatgaatcatgatgat 602  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 484 - 601
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  484 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 583  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  584 ctccatgaatcatgatga 601  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Original strand, 10920234 - 10920297
Alignment:
Q  148 taataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  10920234 taataaaattcctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgagttaatcgtgagac 10920297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 364
Target Start/End: Original strand, 24535462 - 24535569
Alignment:
Q  257 ctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctt 356  Q
    ||||| || |||||| |||| |||| || ||| |||| |||| |||  ||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  24535462 ctttagtgtgaagtgagataacattgaaacatcgagattattttgtgagtacactgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagtttt 24535561  T
Q  357 cacataga 364  Q
    ||||||||    
T  24535562 cacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 397
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  390 attggatt 397  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 570
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  448 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 547  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  548 ccgtaacaggatgactataaagt 570  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 389
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  337 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  536 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 22171394 - 22171422
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171394 attgttggaataagccctaatagccaatc 22171422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  537 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 585  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 537 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  537 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 585  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 7141 - 6654
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7141 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 7042  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041 accctattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6942  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6941 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6842  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6841 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 6742  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 14157 - 13670
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14157 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctacaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 14058  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14057 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 13958  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13957 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 13858  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13857 gaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 13758  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13757 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 7235 - 7207
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7235 attgttggaataagccctaatagccaatc 7207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24695673 - 24695186
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695673 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 24695574  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695573 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcaataaagcatagagactattatgtaggtaga 24695474  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24695473 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 24695374  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695373 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 24695274  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695273 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19714703 - 19714218
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714703 aaggcatttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 19714604  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714603 cccgttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 19714504  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714503 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 19714404  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714403 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 19714304  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19714303 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18570070 - 18569581
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18570070 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18569971  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18569970 accccgttaaacataaggaaactactcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcataaagactattatgttggtaga 18569871  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcat 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18569870 ctgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccat 18569771  T
Q  408 gagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569770 gagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 18569671  T
Q  508 gatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569670 catgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19707419 - 19706939
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19707419 catttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 19707320  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19707319 ttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatg 19707220  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19707219 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 19707120  T
Q  416 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 515  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  19707119 tacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattgg 19707021  T
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707020 agtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 223 - 475
Target Start/End: Original strand, 39538701 - 39538953
Alignment:
Q  223 taaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacat 322  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  39538701 taaggacactattcttaaaatatccatagttaagctttattgtgaagtgggatatcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatat 39538800  T
Q  323 ctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 422  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  39538801 ttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatag 39538900  T
Q  423 taaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 475  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538901 taaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17285935 - 17285470
Alignment:
Q  114 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  17285935 ggcatttatttattgattttgttatgtttcaaaataataatctccagagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgaaaccc 17285836  T
Q  214 cattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 313  Q
     | |||||  || || | |||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||  |||||||||||                ||||||||    
T  17285835 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgtgaattgggatagtattaaagcata----------------tagactga 17285752  T
Q  314 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 413  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  17285751 tgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaat 17285652  T
Q  414 actacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
    |||||||||  ||||||||  | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  17285651 actacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggttt 17285555  T
Q  513 tggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
     ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285554 aggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18807175 - 18806843
Alignment:
Q  176 tttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa-ggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtggga 274  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||    
T  18807175 tttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgagacaccattaaa-ataatggacattattcttaaagtatctatagtcaagcgttattgtgaagtaaga 18807077  T
Q  275 tatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 374  Q
    || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807076 taacaataaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 18806977  T
Q  375 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtat 473  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  18806976 agaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagtt-ttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtat 18806880  T
Q  474 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 510  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806879 tccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 116 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22547217 - 22546912
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22547217 catttatttattcattttgttttattttaaaataataaaaccgctataatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaatcgtgagatctca 22547118  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 315  Q
    ||||| ||| ||| | |||| | ||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22547117 ttaaatatatggacattatttttaaagtattcgcagtcaaactttattgtgaagtgagataacattaaaatatagagactattatgtggatagaccgatg 22547018  T
Q  316 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  22547017 atcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatac 22546918  T
Q  416 tacata 421  Q
    ||||||    
T  22546917 tacata 22546912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 17299088 - 17298621
Alignment:
Q  114 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||    
T  17299088 ggcatttatttattgattttgttatgtttataaataataatatccagagaatagttagtccgattaatggaacattaagtgcgacttaatcgtgaaaccc 17298989  T
Q  214 cattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 313  Q
     | |||||  || || | |||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||  |||||||||||                ||||||||    
T  17298988 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgttaagtgggatagtattaaagcata----------------tagactga 17298905  T
Q  314 tgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    ||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  17298904 tgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgaga 17298805  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 510  Q
    ||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  17298804 atactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggt 17298708  T
Q  511 gttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
     | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298707 ttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 115 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27347679 - 27347425
Alignment:
Q  115 gcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccc 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||     
T  27347679 gcatttctttgttgattttgttttgattcaaaataataaagtccttagaataattaatctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc- 27347581  T
Q  215 attaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgat 314  Q
    |||||||  ||||| | |||||| |||||||   |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||    
T  27347580 attaaacgaaaggacattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattttgtggataggccgat 27347481  T
Q  315 gatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347480 gatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 435 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 27347417 - 27347252
Alignment:
Q  435 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347417 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgttttgtcacc 27347318  T
Q  535 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 601  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347317 attcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 490 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  490 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  590 gaatcatg 597  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 20941018 - 20941329
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20941018 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20941116  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  20941117 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 20941213  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  20941214 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 20941312  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20941313 gtacttgatgaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 25805696 - 25805385
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25805696 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25805598  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  25805597 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 25805501  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  25805500 ttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 25805402  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  25805401 gtacttgatgaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 31890 - 32201
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31890 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 31988  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  31989 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 32085  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  32086 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 32184  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  32185 gcacttgatgaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 12789974 - 12789663
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  12789974 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagt 12789876  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | |    
T  12789875 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctc 12789779  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  12789778 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 12789680  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12789679 gtacttgatgaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 22941241 - 22941552
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22941241 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagt 22941339  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  22941340 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 22941436  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  22941437 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 22941535  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  22941536 gtacttgatgaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 23545913 - 23546224
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23545913 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 23546011  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  23546012 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 23546108  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  23546109 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 23546207  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  23546208 gcacttgatgaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24933617 - 24933306
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  24933617 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 24933519  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | |    
T  24933518 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctc 24933422  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  24933421 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 24933323  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  24933322 gtacttgatgaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 292 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  292 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  392 tggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 491  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  492 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 585  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 31096807 - 31097118
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  31096807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagt 31096905  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  31096906 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 31097002  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  31097003 ttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 31097101  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  31097102 gtacttgatgaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 12765305 - 12764990
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12765305 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12765207  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 477  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||   |  || |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  12765206 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcg 12765109  T
Q  478 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 577  Q
    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  12765108 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 12765010  T
Q  578 tgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12765009 tgggtacttgatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 5097642 - 5097953
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  5097642 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagt 5097740  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  5097741 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 5097837  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||    
T  5097838 ttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgg 5097936  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||   ||||||||||    
T  5097937 gtacatgatgaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 219
Target Start/End: Original strand, 39537962 - 39538071
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39537962 acaagccatttctttaatgattttgttttgtttcaaaatggttaagtccttagaatagttggttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 39538061  T
Q  210 accccattaa 219  Q
    ||| ||||||    
T  39538062 acctcattaa 39538071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 7865745 - 7865430
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7865745 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 7865647  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 477  Q
    |||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  7865646 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcg 7865549  T
Q  478 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 577  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  7865548 ctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttga 7865450  T
Q  578 tgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  7865449 tgggtacttgatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 9812048 - 9811733
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  9812048 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 9811950  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 477  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  |     
T  9811949 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcg 9811852  T
Q  478 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 577  Q
    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  9811851 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 9811753  T
Q  578 tgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  9811752 tgggtacttgatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 12704189 - 12703874
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12704189 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12704091  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 477  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  |     
T  12704090 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcg 12703993  T
Q  478 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 577  Q
    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||    
T  12703992 ctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttga 12703894  T
Q  578 tgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12703893 tgggtacttgatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 372 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  372 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 470  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  471 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 510  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 372 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  372 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 470  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  471 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 510  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 26245093 - 26245404
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  26245093 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagt 26245191  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| | |||||||||    | |||||||| ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | |    
T  26245192 aatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctc 26245288  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||    
T  26245289 ttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgg 26245387  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  26245388 gtacttgatgaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 512 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 601  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  348 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataag 447  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  ||||||||   ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttat-gtaagttccataag 18829434  T
Q  448 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 546  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  547 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 31886537 - 31886640
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||   |||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||    
T  31886537 catttctttagtgattttgttttgtttcaaattaataaagtccttagaataattagttcatttaattgaacatcaagtacgacttaatcgtgagactcca 31886636  T
Q  216 ttaa 219  Q
    ||||    
T  31886637 ttaa 31886640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 601  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 597
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  516 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33477479 - 33477193
Alignment:
Q  136 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaac-tat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||||| | |  |||| |||||||| |||||| |||||| |  | | |    
T  33477479 tttgtttcaaaataataaagtccttacaatagttaggctgattaatggatcattaagtgtgatctaatcgtgagacctcattaatcataagcacgcttgt 33477380  T
Q  235 tctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 334  Q
    ||| ||| |||   || ||||| ||||    ||||||| ||| || ||| || || | ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || ||||    
T  33477379 tcttaaactatatgtattcaagttttacgatgaagtggaataacaataatgcgtaaaaactattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcat 33477280  T
Q  335 ggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 422  Q
    |||| | ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  33477279 ggat-atgaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttatacataattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 11479420 - 11479489
Alignment:
Q  160 tagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc-cattaaacataagga 228  Q
    ||||||| |||||  |||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11479420 tagaataattagtgtgtttaatgaaatattaagtgtgacttgattgtgagaccctcattaaacataagga 11479489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 24695767 - 24695739
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695767 attgttggaataagccctaatagccaatc 24695739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31267984 - 31267928
Alignment:
Q  270 tgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 326  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  31267984 tgggataacaataaagcgtggagactattatgtatgtagacggatgaccacatctca 31267928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 291 - 335
Target Start/End: Original strand, 39535465 - 39535509
Alignment:
Q  291 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatg 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39535465 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcataggtcatg 39535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7594
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7107 acaaggtatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatagaacattaagtataacttaattgtgag 7206  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7207 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 7306  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7307 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 7406  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7407 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctaga 7506  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 7013 - 7041
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7013 attgttggaataagccctaatagccaatc 7041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 18288 - 18774
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18288 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18387  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18487  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18488 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18587  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18588 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 18687  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18688 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 21330455 - 21329968
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330455 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21330356  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21330355 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtgga 21330256  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330255 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 21330156  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330155 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 21330056  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21330055 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 597
Target Start/End: Original strand, 18796506 - 18796993
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796506 acaaggaatttatttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18796605  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    ||| | || |||||||||| | |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18796606 acctcttttaacataaggatattattcttaaattatctgtagtcaagctttattgtgaagtggtatatcattaaagcattgagactattatgtgggtaga 18796705  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  18796706 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatga 18796805  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18796806 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaa 18796905  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18796906 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 112 - 603
Target Start/End: Original strand, 18619807 - 18620296
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18619807 aaggaatttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctataataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaattatgagac 18619906  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    || |||||||| ||||| | |||||| ||||||||  | ||||| |||||||| |||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| |     
T  18619907 cc-attaaacaaaaggatattattcttaaagtatctgtggtcaaactttattgtgaaaagggataatattaaagcatatagactattatgtgggtaggcc 18620005  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||    
T  18620006 gatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgaga 18620105  T
Q  412 atactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 511  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18620106 atactacatagtaaaagttat-gaaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaatg 18620204  T
Q  512 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 603  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18620205 ttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 144 - 597
Target Start/End: Original strand, 36270199 - 36270650
Alignment:
Q  144 aaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaag 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||| || ||  |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||| || || |||||||| |||     
T  36270199 aaaataataaagtccctagaatagttagtttacttaaatgaaatgttaagtgtgacttaatcgtgagacatcattaaacacaatgacactattcttaaaa 36270298  T
Q  243 tatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaag 342  Q
     |||| || |||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||    
T  36270299 catccgtaatcaagctttagtgtgaagagggataacattaaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaag 36270398  T
Q  343 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtc 442  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||  ||| ||||  |||| |||    
T  36270399 agttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtc 36270495  T
Q  443 ataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaa 541  Q
    | |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | ||||    
T  36270496 acaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-cacccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaa 36270594  T
Q  542 cgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
     || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36270595 agtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 585
Target Start/End: Original strand, 18822115 - 18822556
Alignment:
Q  144 aaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaa-tggaaca-ttaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaa 241  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||| ||||| | |||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  18822115 aaaataataaagtctatagaattgttagttcgtttaaatggaaaaattaagtgtggcttaatcgtgagacaccattaaacacaaggacactattcttaaa 18822214  T
Q  242 gtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa 341  Q
      ||   || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||     
T  18822215 acatatgtaatcaagctttagtttgaagtgggatatcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataag 18822314  T
Q  342 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||  ||| |||||  ||||  |    
T  18822315 gagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaag-at 18822411  T
Q  442 cataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 540  Q
    |  |||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||    
T  18822412 ctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataa 18822511  T
Q  541 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 585  Q
    ||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822512 acgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 175 - 597
Target Start/End: Original strand, 20977957 - 20978360
Alignment:
Q  175 gtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtggga 274  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||| || |||||| ||    
T  20977957 gtttaatggaacattaagaataatttaatcatgagatcccattaaaaataaggaaattattcttaaaacatccgtagtcaagctttaatgtgaagtgaga 20978056  T
Q  275 tatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  20978057 tatcactaaagcatagagactattatgtggatag-----------------acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattatt 20978139  T
Q  375 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtat 473  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  ||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20978140 atgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--aaaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtat 20978236  T
Q  474 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 573  Q
    ||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |     
T  20978237 tccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagtactttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcga 20978336  T
Q  574 ttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978337 ttgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 249 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22183551 - 22183206
Alignment:
Q  249 tagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 348  Q
    ||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  22183551 tagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttat 22183452  T
Q  349 caagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataaga 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||   || |||||  |||  |||| | |     
T  22183451 caagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggt 22183356  T
Q  449 tattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 547  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||    
T  22183355 cattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgt 22183256  T
Q  548 ccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
      ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||    
T  22183255 ttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 285 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  285 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 382  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  383 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 481  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattat-gtaagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  482 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 30174368 - 30174679
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30174368 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30174466  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  30174467 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 30174563  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  30174564 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 30174662  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  30174663 gcacttgatgaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24250343 - 24250032
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24250343 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 24250245  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  24250244 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 24250148  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  24250147 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 24250049  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  24250048 gcacttgatgaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Original strand, 19279445 - 19279600
Alignment:
Q  267 aagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagata 366  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19279445 aagtgggataactttaaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagata 19279544  T
Q  367 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 422  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279545 tagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18852146 - 18851977
Alignment:
Q  230 actattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacag 329  Q
    |||||||| |||||||   ||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||   || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |    
T  18852146 actattcttaaagtatatgtagtccaactttattgtgaagtaggataacattaaattgtatagactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacgg 18852047  T
Q  330 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18852046 atcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24229526 - 24229215
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  24229526 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 24229428  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  24229427 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 24229331  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || | | |||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||    
T  24229330 ttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagg 24229232  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  24229231 gtacttgatgaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19692737 - 19692598
Alignment:
Q  116 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||| | ||    
T  19692737 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagcctgacttaatcatgagatctca 19692638  T
Q  216 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaa 255  Q
    ||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  19692637 ttaaactaaaggaaattattcttaaagtatccttagtcaa 19692598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 358 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgggtact 585  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 599
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800775
Alignment:
Q  291 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  388 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 487  Q
    ||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| |||     
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagact 29800664  T
Q  488 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 587  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||      
T  29800665 tgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatgggcacttg 29800763  T
Q  588 atgaatcatgat 599  Q
    | ||||||||||    
T  29800764 acgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 597
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  434 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 533  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  534 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  296 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 394  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  395 attga 399  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 512
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616653
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  390 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 489  Q
      || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctg 19616630  T
Q  490 aaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  19616631 aaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  450 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 530  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa--gtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 499  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  292 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 391  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  392 tggattga 399  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 597
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  530 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24471792 - 24471643
Alignment:
Q  152 aaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatag 251  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||| || | |||||||||||||||  ||||  ||||||| | | ||||||  |||||||||||     
T  24471792 aaagtccctaaaatatttagtcggtttaatagc-cattatgtgtgacttaattgtgagacatcatttgacataagaacattattctttaagtatccatac 24471694  T
Q  252 tcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgt 302  Q
     ||| || ||||   |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  24471693 acaaactctattttaaagtgggataacactaaagcataaagactattatgt 24471643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 367 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  367 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 466  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  467 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 566  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  567 aagttg 572  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 500
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||   ||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 500  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  436 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  361 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24763868 - 24763751
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  24763868 taaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagt 24763770  T
Q  381 aatatttatattggattga 399  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24763769 aatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12098654 - 12098609
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 326  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098654 taaaacatagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 26197 - 25706
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26197 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccatttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26098  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgaaaagtgggatatcattaaagcatagcgactattatgtaggtaga 25998  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25997 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 25898  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 25798  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25797 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 110 - 578
Target Start/End: Original strand, 993 - 1461
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  993 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgag 1092  T
Q  210 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 accccattaaacataaagaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 1192  T
Q  310 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1193 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatga 1292  T
Q  410 gaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293 gaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 1392  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1393 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 601
Target Start/End: Original strand, 5531 - 6013
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5531 aaggcatttctttattgatttatttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 5630  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 311  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5631 cccgttaaacataaggaaattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 5730  T
Q  312 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgaga 411  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5731 gatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtga 5830  T
Q  412 atactacatagtaaaagttat-aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 509  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5831 atactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctaga 5921  T
Q  510 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 601  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5922 tgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 341 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  341 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  441 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  541 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 230545 - 230365
Alignment:
Q  112 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230545 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcttataatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 230446  T
Q  212 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 293  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230445 ccc-ttaaacataaggaaaccattcttaaagtatttgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 230365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 174 - 485
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  174 taaagcgtcgagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 272  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  273 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 369  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||    
T  370 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgg 468  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  469 gtacttgatgaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3675
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3986 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3888  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  3887 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 3791  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  3790 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 3692  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  3691 gcacttgatgaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Original strand, 119721 - 120032
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  119721 taaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 119819  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  119820 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 119916  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  119917 ttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgg 120015  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||  ||||||||||    
T  120016 gcacttgatgaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 13299 - 12961
Alignment:
Q  242 gtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa 341  Q
    |||||||||||||||||||| |   || |||||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||      
T  13299 gtatccatagtcaagctttaatattaattgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat- 13201  T
Q  342 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 441  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  |||    
T  13200 gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgt 13104  T
Q  442 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaa 541  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||    
T  13103 cataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaa 13005  T
Q  542 cgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 585  Q
    ||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13004 cgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 130535 - 130262
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  130535 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 130437  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  130436 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 130340  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 559  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130339 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 67685 - 67374
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  67685 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 67587  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  67586 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 67490  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 580  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  67489 ttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgg 67391  T
Q  581 gtactccatgaatcatg 597  Q
    |||||  ||||||||||    
T  67390 gtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 500
Target Start/End: Original strand, 8296 - 8511
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8296 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 8394  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |    
T  8395 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctc 8491  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatg 500  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8492 ttagacctgaaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 290 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39988
Alignment:
Q  290 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 389  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  390 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 489  Q
    |  ||||||| ||    ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  490 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 589  Q
    |||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  590 gaatcatg 597  Q
    ||||||||    
T  39995 gaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 597
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  358 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  458 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 557  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  558 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 267 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 90166 - 90033
Alignment:
Q  267 aagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat-aaagagttatcaagtcttcacatagat 365  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  90166 aagtgggataatattaaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagat 90067  T
Q  366 ataaatattaggagtaatatttatattggattga 399  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  90066 ataaatattacgtataacatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8510 - 8447
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtc 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtc 8447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 8606 - 8576
Alignment:
Q  14 atattgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8606 atattgttggaataagccctaatagccaatc 8576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 569
Target Start/End: Original strand, 8722 - 9005
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 380  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||| |||  |   ||||  | ||||||||||||||    
T  8722 taaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatgatcacgtctcacatgtcatagatat-gagatattaaggatatgcatatgtgtaaatattaggagt 8820  T
Q  381 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 480  Q
    |||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| |||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  8821 aatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataatggtgtataccactc 8917  T
Q  481 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 569  Q
     | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8918 ctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactataaag 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 597
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  407 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 506  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  507 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 365 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||   |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  462 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 561  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  562 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 597  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  365 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 464  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaag-gtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  465 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 500  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 597
Target Start/End: Original strand, 53766 - 54066
Alignment:
Q  291 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 390  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  391 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 490  Q
     ||| |||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||   || || | || |||    | ||| |||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcaacatgttaatagtttatattgctcttagacctga 53961  T
Q  491 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 590  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  53962 aaccactatgatccctaggtgt-ggactcaagtgctttatg-ccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 54059  T
Q  591 aatcatg 597  Q
    |||||||    
T  54060 aatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 375
Target Start/End: Original strand, 92194 - 92432
Alignment:
Q  139 gtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcggtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattct 237  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||  | |  | ||||||    
T  92194 gttttaaagtaataaagtctctagaatatctagttattttaaatggaacattaagtataacttaatcgtgagacagcaataaacagcaaggcattattct 92293  T
Q  238 caaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggatatcatt-aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 336  Q
     |||  || | ||||||||||||| || | || |||||| | || ||| | |||| |||||||| | | |||||||||||| |||| ||||   ||||||    
T  92294 taaaacattcgtagtcaagctttagtgtggagagggataactttaaaatcttagaaactattatatggctagactgatgattacatgtcacgagtcatgg 92393  T
Q  337 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 375  Q
    |||| || |||||||||| || || | ||||||||||||    
T  92394 ataaggaattatcaagtcatcgcacatatataaatatta 92432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10158 - 10127
Alignment:
Q  129 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10158 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 143
Target Start/End: Original strand, 16615 - 16648
Alignment:
Q  110 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16615 acaaggcatttctttattgattttgttttgnttc 16648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Original strand, 16521 - 16549
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16521 attgttggaataagccctaatagccaatc 16549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 420
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  329 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataa----atattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 420  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15134 - 15089
Alignment:
Q  281 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 326  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15134 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctca 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 99 - 71
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  99 attgttggaataagccctaatagccaatc 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 23827 - 23799
Alignment:
Q  16 attgttggaataagccctaatagccaatc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827 attgttggaataagccctaatagccaatc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University