View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18682_low_10 (Length: 348)

Name: NF18682_low_10
Description: NF18682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18682_low_10
NF18682_low_10
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (1-333)||(2634-2964)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (1-333)||(12647416-12647746)
chr2 (3-333)||(6266499-6266829)
chr2 (172-333)||(13656062-13656221)
chr2 (3-333)||(4484360-4484698)
chr2 (3-333)||(30833146-30833484)
chr2 (3-333)||(32289373-32289702)
chr2 (79-333)||(45099631-45099892)
chr2 (79-333)||(36205695-36205955)
chr2 (79-333)||(5723286-5723546)
chr2 (79-333)||(4503163-4503424)
chr2 (79-333)||(2334448-2334709)
chr2 (79-333)||(36988106-36988367)
chr2 (193-325)||(29867869-29867999)
chr2 (193-333)||(45726929-45727067)
chr2 (125-331)||(34139802-34140017)
chr2 (213-333)||(33648190-33648310)
chr2 (79-331)||(38312116-38312376)
chr2 (87-331)||(42362236-42362488)
chr2 (212-325)||(24398075-24398188)
chr2 (213-333)||(6595036-6595154)
chr2 (87-331)||(723776-724028)
chr2 (204-329)||(13121779-13121901)
chr2 (87-331)||(14633857-14634110)
chr2 (193-331)||(36773562-36773698)
chr2 (193-333)||(1631762-1631900)
chr2 (3-61)||(3492094-3492152)
chr2 (193-333)||(35446914-35447052)
chr2 (214-325)||(26353204-26353314)
chr2 (1-55)||(9296082-9296137)
chr2 (215-295)||(7597077-7597158)
chr2 (248-325)||(7815311-7815386)
chr2 (285-331)||(17057401-17057446)
chr2 (285-331)||(17085384-17085429)
chr2 (193-325)||(36318047-36318177)
chr2 (79-171)||(39284761-39284853)
chr2 (300-333)||(28672036-28672069)
chr2 (295-331)||(39284936-39284972)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (1-333)||(44203439-44203770)
chr1 (1-333)||(9036224-9036554)
chr1 (3-333)||(40282184-40282515)
chr1 (3-333)||(21053765-21054096)
chr1 (3-333)||(9987010-9987339)
chr1 (1-333)||(20622267-20622599)
chr1 (4-333)||(51765197-51765535)
chr1 (192-333)||(13316382-13316521)
chr1 (79-333)||(3189207-3189468)
chr1 (79-333)||(3198024-3198285)
chr1 (79-333)||(3206863-3207124)
chr1 (79-331)||(28220258-28220518)
chr1 (193-333)||(37168297-37168436)
chr1 (69-325)||(3156730-3156995)
chr1 (79-333)||(20762548-20762810)
chr1 (40-331)||(44454997-44455296)
chr1 (79-331)||(37503589-37503846)
chr1 (87-333)||(8550817-8551071)
chr1 (193-333)||(13547119-13547257)
chr1 (193-333)||(47255370-47255508)
chr1 (193-333)||(7482260-7482399)
chr1 (193-333)||(11348698-11348836)
chr1 (193-333)||(13549030-13549168)
chr1 (193-325)||(49918350-49918480)
chr1 (79-325)||(28223459-28223713)
chr1 (213-331)||(28265586-28265702)
chr1 (79-325)||(31659114-31659368)
chr1 (193-333)||(47115171-47115310)
chr1 (212-333)||(31925737-31925856)
chr1 (79-331)||(1833398-1833658)
chr1 (3-61)||(19365993-19366051)
chr1 (248-329)||(22079371-22079451)
chr1 (193-325)||(23555303-23555433)
chr1 (3-61)||(24202455-24202513)
chr1 (193-333)||(29136247-29136385)
chr1 (193-333)||(42298005-42298143)
chr1 (4-61)||(19358530-19358587)
chr1 (4-61)||(19361119-19361176)
chr1 (87-333)||(834197-834451)
chr1 (248-323)||(6808507-6808581)
chr1 (193-331)||(50167207-50167343)
chr1 (212-325)||(19754514-19754625)
chr1 (193-325)||(4552675-4552805)
chr1 (193-325)||(50169248-50169378)
chr1 (248-333)||(5459961-5460044)
chr1 (285-333)||(28242396-28242442)
chr1 (212-333)||(34603595-34603715)
chr1 (285-333)||(13659366-13659413)
chr1 (193-329)||(37033106-37033241)
chr1 (193-325)||(37559906-37560037)
chr1 (193-331)||(45644386-45644523)
chr1 (213-326)||(37282728-37282841)
chr1 (295-333)||(193711-193749)
chr1 (79-171)||(13316518-13316610)
chr1 (212-270)||(32736952-32737009)
chr1 (295-333)||(37876796-37876834)
chr1 (215-266)||(928071-928123)
chr1 (248-303)||(25652141-25652195)
chr1 (285-333)||(46065009-46065056)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-333)||(6027055-6027385)
chr6 (1-333)||(25421112-25421444)
chr6 (3-333)||(33342135-33342464)
chr6 (3-333)||(34164668-34164996)
chr6 (3-333)||(34166890-34167218)
chr6 (5-333)||(27647673-27647998)
chr6 (3-329)||(16554677-16555003)
chr6 (3-329)||(16631233-16631559)
chr6 (3-333)||(16652920-16653250)
chr6 (3-333)||(16578548-16578878)
chr6 (3-333)||(16616502-16616832)
chr6 (3-333)||(3072789-3073118)
chr6 (166-333)||(13153886-13154053)
chr6 (3-333)||(411911-412240)
chr6 (4-333)||(6097481-6097800)
chr6 (4-333)||(2171562-2171897)
chr6 (79-333)||(31404705-31404966)
chr6 (79-333)||(5406230-5406490)
chr6 (79-333)||(5410555-5410815)
chr6 (81-333)||(5413424-5413682)
chr6 (79-333)||(30834566-30834828)
chr6 (79-333)||(16452359-16452621)
chr6 (1-87)||(6136241-6136326)
chr6 (79-331)||(9183063-9183323)
chr6 (193-333)||(21588931-21589069)
chr6 (193-333)||(21593664-21593802)
chr6 (193-333)||(2972969-2973107)
chr6 (213-333)||(33160382-33160500)
chr6 (193-333)||(3808738-3808877)
chr6 (193-333)||(17762990-17763128)
chr6 (112-331)||(16568953-16569158)
chr6 (196-333)||(17758026-17758161)
chr6 (193-333)||(22424856-22424995)
chr6 (193-333)||(28137438-28137576)
chr6 (285-333)||(5409099-5409146)
chr6 (3-62)||(5674452-5674512)
chr6 (195-329)||(26830157-26830289)
chr6 (3-61)||(22709362-22709420)
chr6 (214-329)||(5043648-5043761)
chr6 (285-333)||(26800679-26800725)
chr6 (193-331)||(3038935-3039071)
chr6 (285-325)||(26954324-26954363)
chr6 (285-333)||(33211215-33211262)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-333)||(3756-4089)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (1-333)||(6592370-6592700)
chr7 (1-333)||(6594588-6594916)
chr7 (1-333)||(18388790-18389123)
chr7 (1-333)||(18392226-18392559)
chr7 (3-333)||(32060352-32060685)
chr7 (5-333)||(20343705-20344035)
chr7 (1-264)||(1562103-1562366)
chr7 (3-333)||(24789649-24789979)
chr7 (1-333)||(39731175-39731507)
chr7 (4-329)||(43504188-43504514)
chr7 (3-333)||(25766990-25767321)
chr7 (4-333)||(48408605-48408942)
chr7 (79-333)||(35853791-35854052)
chr7 (79-333)||(29990931-29991191)
chr7 (193-333)||(34310746-34310884)
chr7 (79-325)||(14069871-14070125)
chr7 (79-325)||(14379899-14380153)
chr7 (79-332)||(4178651-4178910)
chr7 (213-333)||(23555060-23555178)
chr7 (125-333)||(25615785-25615991)
chr7 (79-333)||(30024762-30025024)
chr7 (193-331)||(48491579-48491715)
chr7 (271-333)||(1560696-1560757)
chr7 (193-333)||(22269973-22270111)
chr7 (125-325)||(47673981-47674189)
chr7 (193-333)||(8359346-8359485)
chr7 (193-331)||(41317466-41317602)
chr7 (248-333)||(19502233-19502316)
chr7 (193-333)||(29608737-29608875)
chr7 (193-325)||(4586161-4586291)
chr7 (193-331)||(27347817-27347953)
chr7 (193-333)||(3258995-3259133)
chr7 (3-61)||(21646360-21646418)
chr7 (248-333)||(32358084-32358167)
chr7 (193-332)||(48599365-48599502)
chr7 (213-325)||(41649049-41649158)
chr7 (193-331)||(2361004-2361140)
chr7 (193-331)||(8153342-8153478)
chr7 (193-331)||(18126644-18126780)
chr7 (79-325)||(47676174-47676428)
chr7 (212-333)||(2390301-2390420)
chr7 (213-325)||(4253566-4253678)
chr7 (193-333)||(6431971-6432109)
chr7 (3-61)||(18409116-18409174)
chr7 (213-324)||(23565100-23565210)
chr7 (79-195)||(24514934-24515052)
chr7 (193-265)||(24525992-24526065)
chr7 (212-325)||(31733007-31733118)
chr7 (193-333)||(4508736-4508874)
chr7 (27-61)||(18413992-18414026)
chr7 (193-266)||(23343975-23344048)
chr7 (193-320)||(36574558-36574683)
chr7 (285-325)||(496021-496060)
chr7 (215-325)||(22328428-22328538)
chr7 (285-325)||(24525540-24525579)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-333)||(40379899-40380229)
chr5 (1-333)||(40382110-40382440)
chr5 (1-333)||(25077927-25078259)
chr5 (1-333)||(25135896-25136228)
chr5 (1-333)||(16546437-16546769)
chr5 (1-333)||(16544215-16544547)
chr5 (3-333)||(10593066-10593396)
chr5 (5-333)||(22536320-22536647)
chr5 (3-333)||(29722332-29722662)
chr5 (1-333)||(29751190-29751523)
chr5 (4-333)||(29720173-29720502)
chr5 (1-333)||(9789254-9789586)
chr5 (3-333)||(18441678-18442008)
chr5 (3-333)||(26177691-26178020)
chr5 (33-333)||(16409313-16409613)
chr5 (5-333)||(26170584-26170900)
chr5 (79-333)||(25412638-25412898)
chr5 (79-333)||(13342937-13343198)
chr5 (79-333)||(30182465-30182726)
chr5 (79-329)||(36074077-36074336)
chr5 (79-325)||(13488079-13488333)
chr5 (125-333)||(13239674-13239889)
chr5 (79-331)||(32636700-32636960)
chr5 (213-333)||(37439161-37439279)
chr5 (193-333)||(40147261-40147399)
chr5 (79-325)||(39468587-39468841)
chr5 (193-329)||(213465-213599)
chr5 (193-333)||(28278316-28278454)
chr5 (41-331)||(28750687-28750985)
chr5 (203-329)||(13695724-13695850)
chr5 (79-325)||(42428468-42428722)
chr5 (3-61)||(35388016-35388074)
chr5 (79-331)||(30682954-30683212)
chr5 (295-333)||(16640970-16641008)
chr5 (112-325)||(33831590-33831810)
chr5 (193-325)||(42426273-42426403)
chr5 (4-104)||(16407848-16407947)
chr5 (193-333)||(27637643-27637781)
chr5 (285-333)||(5058136-5058183)
chr5 (298-333)||(4160702-4160737)
chr5 (248-325)||(316817-316893)
chr5 (248-334)||(10054845-10054929)
chr5 (3-61)||(15464876-15464934)
chr5 (295-331)||(19806463-19806499)
chr5 (248-323)||(33906070-33906144)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-333)||(3617255-3617588)
chr3 (1-333)||(4598553-4598885)
chr3 (1-333)||(25637234-25637565)
chr3 (1-333)||(10211200-10211533)
chr3 (1-333)||(4600774-4601106)
chr3 (3-333)||(10056029-10056357)
chr3 (3-333)||(10058251-10058579)
chr3 (3-333)||(10060473-10060801)
chr3 (3-333)||(10062695-10063023)
chr3 (3-333)||(10064917-10065245)
chr3 (3-333)||(10208982-10209313)
chr3 (3-297)||(10067139-10067431)
chr3 (1-333)||(54634931-54635262)
chr3 (1-333)||(45282787-45283124)
chr3 (1-333)||(6716306-6716637)
chr3 (2-228)||(6718491-6718718)
chr3 (79-333)||(800974-801230)
chr3 (3-333)||(23197969-23198305)
chr3 (3-333)||(23200168-23200504)
chr3 (158-333)||(7780034-7780208)
chr3 (71-329)||(9636160-9636429)
chr3 (79-333)||(5258174-5258436)
chr3 (79-333)||(45095041-45095301)
chr3 (79-333)||(37408335-37408596)
chr3 (79-329)||(5260357-5260615)
chr3 (79-333)||(7762142-7762403)
chr3 (87-329)||(19683923-19684173)
chr3 (79-333)||(7764344-7764602)
chr3 (193-325)||(29196424-29196555)
chr3 (193-333)||(34491212-34491350)
chr3 (3-137)||(7782375-7782508)
chr3 (193-333)||(4569952-4570090)
chr3 (193-333)||(41819553-41819691)
chr3 (197-331)||(30236129-30236261)
chr3 (193-331)||(44331545-44331681)
chr3 (87-331)||(39153393-39153645)
chr3 (79-331)||(40735259-40735519)
chr3 (193-325)||(44700516-44700646)
chr3 (193-331)||(49199501-49199638)
chr3 (40-266)||(5236551-5236787)
chr3 (206-333)||(9581295-9581420)
chr3 (195-325)||(31314447-31314575)
chr3 (87-325)||(40734382-40734628)
chr3 (196-325)||(22835040-22835167)
chr3 (87-331)||(760731-760983)
chr3 (193-333)||(6095629-6095767)
chr3 (193-333)||(46860474-46860612)
chr3 (193-333)||(54593704-54593842)
chr3 (212-331)||(51398833-51398950)
chr3 (193-331)||(29810868-29811004)
chr3 (213-331)||(29813083-29813199)
chr3 (193-333)||(43401831-43401970)
chr3 (3-57)||(1306306-1306360)
chr3 (112-325)||(29682269-29682489)
chr3 (193-325)||(53921541-53921671)
chr3 (285-333)||(16499120-16499167)
chr3 (285-333)||(43403774-43403821)
chr3 (213-331)||(46173377-46173493)
chr3 (193-266)||(5433971-5434046)
chr3 (3-54)||(8477729-8477780)
chr3 (3-61)||(32143664-32143722)
chr3 (295-329)||(55302006-55302040)
chr3 (4-61)||(26928287-26928344)
chr3 (296-329)||(27305744-27305777)
chr3 (40-87)||(27986180-27986224)
chr3 (279-324)||(33191916-33191960)
chr3 (285-325)||(47304342-47304381)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (3-333)||(5138099-5138428)
chr4 (1-329)||(7122488-7122817)
chr4 (3-333)||(5135873-5136203)
chr4 (3-333)||(8395414-8395741)
chr4 (3-333)||(8393205-8393532)
chr4 (78-333)||(7124784-7125040)
chr4 (3-333)||(31495346-31495677)
chr4 (3-333)||(13992323-13992654)
chr4 (79-333)||(29999836-30000097)
chr4 (79-333)||(56178667-56178928)
chr4 (79-333)||(52095392-52095654)
chr4 (79-331)||(34570446-34570706)
chr4 (79-331)||(9927490-9927749)
chr4 (79-331)||(37740502-37740761)
chr4 (79-333)||(48142918-48143181)
chr4 (214-325)||(12119559-12119670)
chr4 (193-333)||(46703500-46703639)
chr4 (208-333)||(5370113-5370237)
chr4 (79-331)||(12739582-12739842)
chr4 (197-333)||(2209717-2209852)
chr4 (193-331)||(26364236-26364372)
chr4 (193-327)||(40632445-40632577)
chr4 (193-333)||(41964415-41964554)
chr4 (79-325)||(12747794-12748048)
chr4 (79-331)||(5429555-5429815)
chr4 (193-333)||(8665408-8665546)
chr4 (193-333)||(12073392-12073530)
chr4 (213-325)||(12743963-12744073)
chr4 (213-325)||(12745352-12745462)
chr4 (193-333)||(41639426-41639564)
chr4 (193-329)||(45687216-45687351)
chr4 (220-323)||(26699482-26699585)
chr4 (193-333)||(47038441-47038577)
chr4 (203-333)||(5207872-5208001)
chr4 (213-323)||(12744087-12744195)
chr4 (193-323)||(12745476-12745604)
chr4 (193-331)||(54883020-54883156)
chr4 (212-333)||(6655975-6656094)
chr4 (193-325)||(36994524-36994654)
chr4 (248-333)||(50673877-50673960)
chr4 (79-331)||(54199938-54200198)
chr4 (193-331)||(26175668-26175804)
chr4 (193-331)||(27416997-27417133)
chr4 (193-331)||(36463421-36463557)
chr4 (195-325)||(46147429-46147557)
chr4 (79-266)||(52082752-52082949)
chr4 (212-333)||(379399-379518)
chr4 (193-333)||(8648139-8648277)
chr4 (248-333)||(33989899-33989983)
chr4 (193-325)||(37229759-37229890)
chr4 (281-333)||(33089966-33090017)
chr4 (248-331)||(48893670-48893751)
chr4 (213-330)||(6542212-6542328)
chr4 (3-69)||(31985331-31985398)
chr4 (248-325)||(4588014-4588089)
chr4 (248-333)||(35662496-35662579)
chr4 (215-295)||(48142444-48142525)
chr4 (79-151)||(52093885-52093956)
chr4 (285-325)||(3913539-3913578)
chr4 (285-329)||(13009478-13009521)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (3-333)||(42575354-42575685)
chr8 (3-333)||(15290347-15290662)
chr8 (3-333)||(15470716-15471031)
chr8 (1-333)||(25689762-25690092)
chr8 (1-333)||(3439308-3439641)
chr8 (33-333)||(2627573-2627874)
chr8 (79-333)||(34254361-34254620)
chr8 (79-333)||(17982529-17982791)
chr8 (79-333)||(31218133-31218395)
chr8 (79-333)||(44303730-44303993)
chr8 (87-333)||(34256537-34256788)
chr8 (213-329)||(1746253-1746366)
chr8 (79-331)||(43036299-43036559)
chr8 (79-333)||(42498070-42498332)
chr8 (79-331)||(15212662-15212922)
chr8 (212-333)||(19945389-19945509)
chr8 (79-331)||(33352026-33352286)
chr8 (195-331)||(40321082-40321216)
chr8 (193-333)||(42435021-42435159)
chr8 (196-333)||(40328782-40328918)
chr8 (193-333)||(4283524-4283662)
chr8 (79-331)||(27811154-27811414)
chr8 (199-331)||(30143346-30143476)
chr8 (3-61)||(31043131-31043189)
chr8 (87-265)||(10929685-10929871)
chr8 (212-325)||(12702672-12702783)
chr8 (196-325)||(44353796-44353923)
chr8 (248-333)||(1345401-1345484)
chr8 (79-331)||(4731534-4731794)
chr8 (193-313)||(9765745-9765863)
chr8 (193-329)||(18655400-18655534)
chr8 (3-61)||(26288234-26288292)
chr8 (3-61)||(26301491-26301549)
chr8 (3-61)||(26313485-26313543)
chr8 (193-325)||(30291606-30291737)
chr8 (248-331)||(5689326-5689407)
chr8 (193-331)||(40221745-40221881)
chr8 (193-325)||(18141821-18141950)
chr8 (193-325)||(3303708-3303838)
chr8 (248-325)||(7597669-7597745)
chr8 (248-325)||(41366652-41366727)
chr8 (79-151)||(30143218-30143289)
chr8 (215-325)||(1822313-1822423)
chr8 (215-325)||(1856758-1856868)
chr8 (285-325)||(4743252-4743291)
chr8 (295-331)||(10930231-10930267)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (1-333)||(6081-6411)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (3-333)||(11191-11529)
scaffold0491 (4-333)||(8765-9102)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (79-333)||(434409-434671)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (3-333)||(707-1053)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (193-333)||(11557-11695)
scaffold0286 (4-145)||(22146-22286)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (193-333)||(114602-114740)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (213-330)||(18037-18151)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (193-333)||(7327-7465)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (4-61)||(17638-17695)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (193-331)||(20447-20583)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (285-333)||(149127-149174)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (295-333)||(10589-10627)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (248-325)||(27480-27556)


Alignment Details
Target: scaffold0565 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2964 - 2634
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2964 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag-gagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 2866  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2865 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 2766  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2765 a-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgata 2667  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2666 gtggattggagagtacaatctctcctccagagt 2634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12647746 - 12647416
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647746 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag-gagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 12647648  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647647 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 12647548  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12647547 a-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgata 12647449  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12647448 gtggattggagagtacaatctctcctccagagt 12647416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 6266499 - 6266829
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6266499 aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gagagtgggaagagagagagacttgggaaatcaa 6266595  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggt 197  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6266596 agggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggt 6266695  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcattt 296  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  6266696 gaga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-ttt 6266792  T
Q  297 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6266793 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 6266829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 172 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13656221 - 13656062
Alignment:
Q  172 tagagagaatcattgagtgtcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656221 tagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt-gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttg 13656123  T
Q  272 tatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13656122 tatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 13656062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4484698 - 4484360
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagag--acttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4484698 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaa---agagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaa 4484602  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtg------ 190  Q
    |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| |  ||||||||||||          
T  4484601 agggagtaactctagggtttaggg-tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgt 4484503  T
Q  191 tcttggtgagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaag 287  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||    
T  4484502 tcttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgt-aag 4484405  T
Q  288 aactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4484404 aactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 4484360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 30833146 - 30833484
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  30833146 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gtgagctggaagagaaagaaacttgggaaatcaa 30833242  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttg- 195  Q
    |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| |  |||||||||||||||||     
T  30833243 agggagtaactctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgt 30833341  T
Q  196 -----gtgagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaag 287  Q
         |||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |    
T  30833342 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-g 30833439  T
Q  288 aactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30833440 aactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 30833484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 32289373 - 32289702
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcaga-tttgaagtgagagagttggaagagagag--acttgggaaatca 99  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  32289373 aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagggaga----tggaagagagagaaacttgggaaatca 32289468  T
Q  100 aaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttggg-ttgaaaacatgggaaacaccttg--tagagagaatcattgagtgtcttg 195  Q
    ||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||    
T  32289469 aagggagtaactctagggtttagag-tctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 32289567  T
Q  196 gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactca 293  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  32289568 gtgagatt--ggaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgt-aagaactca 32289663  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     ||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32289664 -ttgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagt 32289702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 45099631 - 45099892
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  45099631 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 45099728  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45099729 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 45099827  T
Q  266 -ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     || ||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099828 tcttttgtatc-tctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 45099892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36205955 - 36205695
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||    
T  36205955 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgag 36205858  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36205857 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaact 36205759  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| | ||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36205758 cttttgtatc-tctttg--aagaactcatt-gacagcggattggagagttcaatctatcctccagagt 36205695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5723546 - 5723286
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  5723546 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5723449  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| | |||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5723448 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-gagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 5723351  T
Q  267 tctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5723350 tttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagt 5723286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4503424 - 4503163
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  4503424 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 4503327  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttggt-------gagatttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  ||||||||||||||| |       |||||| || |||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4503326 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 4503228  T
Q  266 -ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     || ||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503227 tcttttgtatc-tctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 4503163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2334709 - 2334448
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  2334709 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggta-tttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 2334612  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||| |||||     
T  2334611 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaact 2334513  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2334512 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 2334448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36988367 - 36988106
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  36988367 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgag 36988270  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  |||||||||||||||       ||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||  |||||||||||||||     
T  36988269 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaact 36988171  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36988170 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 36988106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29867999
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 29867965  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29867966 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc 29867999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727067
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatc-tctttgtaa-gaac 45727025  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45727026 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 45727067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34140017 - 34139802
Alignment:
Q  125 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggg 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||  | ||| ||    
T  34140017 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgg 34139919  T
Q  214 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctct-tgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 311  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34139918 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 34139822  T
Q  312 agttcaatctctcctccaga 331  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  34139821 agatcaatctctcccccaga 34139802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 333
Target Start/End: Original strand, 33648190 - 33648310
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33648190 ggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatt-tctttgtaaagaactcatt-gatagcggattgga 33648287  T
Q  311 gagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  33648288 gagatcaatctctcctccagagt 33648310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 38312116 - 38312376
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | |||||||||   |    
T  38312116 agagagaaatttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtga 38312213  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||     
T  38312214 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaac 38312312  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||  |||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38312313 ccatttgtat-ctctttgt-aagatctca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 38312376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 331
Target Start/End: Original strand, 42362236 - 42362488
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaat 181  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  42362236 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 42362333  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gt 272  Q
    ||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||    
T  42362334 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 42362432  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  42362433 atcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatctatctctcccccaga 42362488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Original strand, 24398075 - 24398188
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24398075 gggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatc-tctttgtaaagaactcatt-gataatggattgg 24398172  T
Q  310 agagttcaatctctcc 325  Q
    |||| |||||||||||    
T  24398173 agagatcaatctctcc 24398188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6595154 - 6595036
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  6595154 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatc-tctttgtaa-gaactcgtt-gatagtggattgga 6595059  T
Q  311 gagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  6595058 gagatcaatctctcctccagagt 6595036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 724028 - 723776
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaat 181  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  724028 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 723931  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gt 272  Q
    ||||||||||||||       |||||||| |  ||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||    
T  723930 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 723832  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  723831 atcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 723776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 329
Target Start/End: Original strand, 13121779 - 13121901
Alignment:
Q  204 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagt 302  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||| ||||||||    
T  13121779 tgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacct-ttgtat-ctctttgtaga-aactca-ttgatagt 13121874  T
Q  303 ggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||    
T  13121875 ggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14634110 - 14633857
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaat 181  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  14634110 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggtt-tttgattagagt-tcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 14634013  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gt 272  Q
    ||||||||||||||       |||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||    
T  14634012 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 14633914  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14633913 atcccttttgtaa-gaactcata-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 14633857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773698
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 36773658  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36773659 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 36773698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631762
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 1631804  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1631803 tcatt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagt 1631762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3492152 - 3492094
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3492152 aaatcgtgacacaattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 3492094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35447052 - 35446914
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  |||  |||||||||||||| |||||| | |||| |||| | || |||||||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||    
T  35447052 ttggtgagattggtaaaattggtagaaattaggg-ttgttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtat-ctctttgt-aagaac 35446956  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35446955 tca-ttgatagtggattggagagatcactctctcctccagagt 35446914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Original strand, 26353204 - 26353314
Alignment:
Q  214 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 311  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  26353204 gtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatc-tttttgtaa-gtactcatt-gatagtggattggag 26353300  T
Q  312 agttcaatctctcc 325  Q
    || ||| |||||||    
T  26353301 agatcactctctcc 26353314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 9296082 - 9296137
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactt-aagtgttcttgtgc 55  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9296082 gaaaatcgtgacacgattgcttcagaggaagactagtatttaaagtgttcttgtgc 9296137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7597158 - 7597077
Alignment:
Q  215 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatt 295  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7597158 tagaaattaggttttgttccttatgaacttgtcgaaactaatttcttgtaagtcttttgtatc-tttttgtaaagaactcatt 7597077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7815386 - 7815311
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  7815386 aagctaatttcttgtaactcttttgtatc-tctttgtaa-gaactcattt-atagtggattggagagattaatctctcc 7815311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17057446 - 17057401
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17057446 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 17057401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17085429 - 17085384
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17085429 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 17085384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36318047
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||| ||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 36318081  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36318080 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 36318047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 171
Target Start/End: Original strand, 39284761 - 39284853
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  39284761 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 39284853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 333
Target Start/End: Original strand, 28672036 - 28672069
Alignment:
Q  300 agtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28672036 agtggattggagagatcaatctctcctccagagt 28672069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39284972
Alignment:
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 39284972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 44203439 - 44203770
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203439 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggtgagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 44203538  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203539 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 44203638  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44203639 a-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgata 44203737  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44203738 gtggattggagagtacaatctctcctccagagt 44203770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 9036224 - 9036554
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaa---gagagagacttgggaaat 97  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  9036224 gaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagag---gagtttgaaagagagagagacttgggaaat 9036319  T
Q  98 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttg 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9036320 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 9036419  T
Q  196 gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatt 295  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  9036420 gtgaga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tt 9036516  T
Q  296 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  9036517 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagt 9036554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 40282184 - 40282515
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40282184 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaa 40282281  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggt 197  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40282282 agggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggt 40282381  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcattt 296  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  40282382 gaga-ttgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-ttt 40282478  T
Q  297 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40282479 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 40282515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 21053765 - 21054096
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21053765 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagag--ttggaagagagagagacttgggaaatcaa 21053862  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagag--agaatcattgagtgtcttggt 197  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21053863 agggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcattgagtgtcttggt 21053962  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcattt 296  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  21053963 gaga-ttgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-ttt 21054059  T
Q  297 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21054060 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 21054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 9987010 - 9987339
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagaga--gacttgggaaatcaa 100  Q
    |||||||||||| |||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9987010 aaatcgtgacacaattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gtgagttggaagagagatagacttgggaaatcaa 9987106  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggt 197  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9987107 agggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggt 9987206  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcattt 296  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||    
T  9987207 gaga-ttgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttg-caagaactca-tt 9987302  T
Q  297 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9987303 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 9987339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20622599 - 20622267
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatca 99  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  20622599 gaaaatcgtgacacaattgcttcagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaaggggg---gttggaagagagagacttgggaaatca 20622503  T
Q  100 aaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaga--gagaatcattgagtgtcttgg 196  Q
    || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  20622502 aatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcattgactgtcttgg 20622403  T
Q  197 tgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcc--tttttgtaaagaactca 293  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  20622402 tgaga-ttgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttgt-aagaactc- 20622307  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20622306 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 20622267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 51765197 - 51765535
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |   || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  51765197 aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttga---agggagttggaagagtgagaaacttgggaaatcaaa 51765293  T
Q  102 ggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttg--- 195  Q
    ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||       
T  51765294 gggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc 51765392  T
Q  196 ---gtgagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtatcctttttgtaaaga 288  Q
       ||  |||| || |||| |||||||||||||||||    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||  |||||||| ||    
T  51765393 ttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaa-ga 51765491  T
Q  289 actcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51765492 actcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 51765535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316382
Alignment:
Q  192 cttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||| |  |||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaa 13316425  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316424 ctcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 13316382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 3189207 - 3189468
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  3189207 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3189304  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  ||| |||||||||||       ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3189305 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3189403  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3189404 cttttgtatc-tttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagt 3189468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 3198024 - 3198285
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  3198024 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3198121  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  ||| |||||||||||       ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3198122 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3198220  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3198221 cttttgtatc-tttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagt 3198285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 3206863 - 3207124
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  3206863 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3206960  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  ||| |||||||||||       ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3206961 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3207059  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3207060 cttttgtatc-tttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagt 3207124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28220518 - 28220258
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||| | ||||||||||    |    
T  28220518 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaagcattgaaaacaccttgggtga 28220421  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtctt-------ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || ||||||||||||||||       ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28220420 gtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 28220322  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28220321 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 28220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168436
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaa 37168393  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37168394 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 37168436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 325
Target Start/End: Original strand, 3156730 - 3156995
Alignment:
Q  69 gagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaa 164  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||    
T  3156730 gagagctggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaa 3156827  T
Q  165 caccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaa 254  Q
    |||| ||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  3156828 caccctggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaa 3156926  T
Q  255 tttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3156927 tttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 3156995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 20762548 - 20762810
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  20762548 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 20762645  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  ||||||||| |||||       ||||||||  | |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20762646 tgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 20762744  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20762745 ccttttgtatc-tcttcgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctacagagt 20762810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 331
Target Start/End: Original strand, 44454997 - 44455296
Alignment:
Q  40 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagtgagagagttgga-agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  44454997 ttaagtgttcttgtgcagattttgaag-gagag-gttgtagagagagaaacttggtaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaga 44455093  T
Q  137 gtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagg 225  Q
    || | ||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || || ||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  44455094 gttt-tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 44455192  T
Q  226 gtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctct 323  Q
    ||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44455193 gtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatc-tttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctct 44455288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37503846 - 37503589
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggggaag-ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| || | ||||||||||    |    
T  37503846 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtgactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctattgggttggaaaatattgtaaacaccttgggtga 37503749  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37503748 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 37503650  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||  |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37503649 ct--tgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 37503589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8551071 - 8550817
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaat 181  Q
    ||||||||||||||||| |  | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||| |||    || || |||    
T  8551071 acttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttaagaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaat 8550974  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgt 272  Q
    ||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||    
T  8550973 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgt 8550875  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8550874 atcc-ctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 8550817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547119
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 13547161  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13547160 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 13547119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255370
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 47255412  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47255411 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 47255370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482260
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaa 7482303  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7482302 ctcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagt 7482260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348836
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||| ||| ||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttctaa-gaac 11348794  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11348795 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 11348836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549030
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || | ||||||| |||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 13549072  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13549071 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 13549030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918480
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 49918446  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49918447 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 49918480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28223713 - 28223459
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | ||||||||    |    
T  28223713 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaagacaccttgggtga 28223616  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||||| |||| | || |  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28223615 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 28223517  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28223516 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 28223459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28265702 - 28265586
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28265702 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactc-tttgatagtggattgga 28265607  T
Q  311 gagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  28265606 gagatcaatctctcccccaga 28265586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Original strand, 31659114 - 31659368
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg---ta 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    |    
T  31659114 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtga 31659211  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | || ||||||||||||||       ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||  ||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||     
T  31659212 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggg-ctgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 31659310  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||  |||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31659311 ccatttgtat-ctctttgt-aagaactta-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 31659368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115310
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| ||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtat-ctctttgtaaa-aa 47115267  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47115268 ccca-ttgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagt 47115310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31925856 - 31925737
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31925856 gggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 31925761  T
Q  310 agagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  31925760 agagatcaatctctcctctagagt 31925737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 1833398 - 1833658
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || || |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||||||||    |    
T  1833398 agagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttaaggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtga 1833495  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||  | ||||||| ||||||||||    
T  1833496 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaac 1833594  T
Q  266 -ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
     |  ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1833595 tcatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccaccaga 1833658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 19365993 - 19366051
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19365993 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 19366051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 329
Target Start/End: Original strand, 22079371 - 22079451
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22079371 aagctaatttcttgtaaccattttgtatc-tctttgtaaagaactcatt-gatattggattggagagatcaatttctcctcca 22079451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555303
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||||||| |||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 23555337  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555336 tca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcc 23555303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 24202455 - 24202513
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24202455 aaatcgtgacacgattgtatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcatattt 24202513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136385
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||  || ||||  | ||||||| ||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatt-tctttgtaa-gaac 29136343  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29136344 tcatt-gatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagt 29136385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42298005
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 42298047  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42298046 tca-ttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagt 42298005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 19358530 - 19358587
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19358530 aatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 19358587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 19361119 - 19361176
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19361119 aatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 19361176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 834451 - 834197
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta---gagagaat 181  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||     | || |||    
T  834451 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgcgtgaaaat 834354  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gt 272  Q
    ||||||||||||||       |||||||| || ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||    
T  834353 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 834255  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  834254 atcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatctatctctcccccagagt 834197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Original strand, 6808507 - 6808581
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctct 323  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6808507 aagctaacttcttgtaactcttttgtatc-tctttgtaaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctct 6808581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167207
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || |||   ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||||| | |||||||| |||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaaa-aac 50167247  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  50167246 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 50167207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Original strand, 19754514 - 19754625
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19754514 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgg 19754609  T
Q  310 agagttcaatctctcc 325  Q
    |||| |||||||||||    
T  19754610 agagatcaatctctcc 19754625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552675
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||| | | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaa-gaac 4552709  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4552708 tcatt-gataatggattggagagatcaatctctcc 4552675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169248
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||| ||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagtac 50169282  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  50169281 tca-ttgatagtggattgaagagatcaatctctcc 50169248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Original strand, 5459961 - 5460044
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| | || |||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||    
T  5459961 aagctaatttcttgtaacattttatat-ttctttgtaaagaactca-ttgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagt 5460044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Original strand, 28242396 - 28242442
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28242396 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 28242442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 333
Target Start/End: Original strand, 34603595 - 34603715
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | || |||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  34603595 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatggtggattg 34603690  T
Q  309 gagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  34603691 aagagatcaatctctcctccagagt 34603715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13659413 - 13659366
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13659413 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagt 13659366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033106
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa--cctcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||  | | ||| || || ||||| |||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcat-ctctttgt-aagaa 37033145  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  37033144 ctca-ttgatagtggattggagagattaatctcttctcca 37033106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37560037 - 37559906
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt--caagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||| |||||    
T  37560037 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctctttgt-aagaa 37559941  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37559940 ctc-gttgatagtgaattggagagatcaatctctcc 37559906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644386
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 45644426  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  45644425 tca-ttgatagtggattggagagatcaatatctcccccaga 45644386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37282841 - 37282728
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||| | |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37282841 ggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatc-tctttgtaaagaactcattag-tagtggattgga 37282744  T
Q  311 gagttcaatctctcct 326  Q
    ||| | ||||||||||    
T  37282743 gagataaatctctcct 37282728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 333
Target Start/End: Original strand, 193711 - 193749
Alignment:
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  193711 ttgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagt 193749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13316610 - 13316518
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  13316610 agagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 13316518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Original strand, 32736952 - 32737009
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  32736952 gggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctctt 32737009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37876834 - 37876796
Alignment:
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37876834 ttgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagt 37876796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 928071
Alignment:
Q  215 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 266  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 928071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 303
Target Start/End: Original strand, 25652141 - 25652195
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtg 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  25652141 aagctaatttcttgtaactctcttgtat-ctctttgtaaagaactc-tttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Original strand, 46065009 - 46065056
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  46065009 aagaactcattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagt 46065056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 305; Significance: 1e-172; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 6027055 - 6027385
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027055 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttggaagagagagacttgggaaatcaa 6027153  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027154 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 6027253  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6027254 a-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgata 6027352  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6027353 gtggattggagagtacaatctctcctccagagt 6027385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 25421112 - 25421444
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421112 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaaagag-gttggaagagagagacttgggaaatcaa 25421210  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25421211 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 25421310  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25421311 agatt-gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 25421409  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25421410 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 25421444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33342464 - 33342135
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342464 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagaga-atttggaagagagagacttgggaaatcaaag 33342366  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33342365 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 33342267  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  33342266 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactccttttgtaaagaactcatttgatag 33342167  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33342166 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 33342135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 34164668 - 34164996
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34164668 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagggttgaaagagagagacttgggaaatcaaag 34164765  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34164766 gggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 34164864  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34164865 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 34164964  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34164965 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 34164996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 34166890 - 34167218
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34166890 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagggttgaaagagagagacttgggaaatcaaag 34166987  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34166988 gggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 34167086  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  34167087 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaacttatttgatag 34167186  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34167187 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 34167218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Original strand, 27647673 - 27647998
Alignment:
Q  5 atcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27647673 atcgtgacacgattgcaatagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagagttggaagagagagagacttgggaaatcaaag 27647769  T
Q  103 gg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 201  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647770 ggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 27647869  T
Q  202 tttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  27647870 -ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatag 27647966  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27647967 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 27647998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 329
Target Start/End: Original strand, 16554677 - 16555003
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaag--agagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16554677 aaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagaga-agagttggaagtgagagagacttggggaatcaa 16554774  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16554775 aggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 16554874  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16554875 aga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttga 16554972  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16554973 tagtggattggagagtgcaaactctcctcca 16555003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 329
Target Start/End: Original strand, 16631233 - 16631559
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaag--agagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16631233 aaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagaga-agagttggaagtgagagagacttggggaatcaa 16631330  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16631331 aggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 16631430  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16631431 aga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttga 16631528  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16631529 tagtggattggagagtgcaaactctcctcca 16631559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 16652920 - 16653250
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaag--agagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||    
T  16652920 aaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagaga-agagttggaagtgagagagacttggagaatcaa 16653017  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16653018 aggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 16653117  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16653118 aga-ttgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttga 16653215  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16653216 tagtggattggagagtgcaaactctcctccagagt 16653250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16578878 - 16578548
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaag--agagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16578878 aaatcgtgacacgatttcaacagaggaagggtagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagag-gagttggaagtgagagagacttggggaatcaa 16578781  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16578780 aggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 16578681  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16578680 aga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttga 16578583  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16578582 tagtggattggagagtgcaaactctcctccagagt 16578548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 16616502 - 16616832
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaag--agagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16616502 aaatcgtgacacgatttcaacagaggaagggtagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagag-gagttggaagtgagagagacttggggaatcaa 16616599  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16616600 aggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 16616699  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16616700 aga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttga 16616797  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16616798 tagtggattggagagtgcaaactctcctccagagt 16616832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3073118 - 3072789
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3073118 aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgga---agagagttggaagagagaaacttgggaaatcaaag 3073022  T
Q  103 gg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtg 198  Q
    || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3073021 ggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtg 3072923  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaactcatt 295  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | |||||||  |||||||| |||||||||    
T  3072922 agatt-gggaaaatggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt 3072826  T
Q  296 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3072825 -gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagt 3072789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 166 - 333
Target Start/End: Original strand, 13153886 - 13154053
Alignment:
Q  166 accttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13153886 accttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagatt-gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa 13153984  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13153985 cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 13154053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 411911 - 412240
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  411911 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagggag----ttggaagagagagaaacttgagaaatcaa 412006  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggt 197  Q
    |||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  412007 agggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggt 412105  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--cctcttgtatcctttttgtaaagaactcat 294  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  | | |||||||  |||||| |||||||||     
T  412106 gaga-ttgggaaaaaggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgt-aagaactca- 412201  T
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  412202 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagt 412240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6097800 - 6097481
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaa-gtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6097800 aatcgtgacacgattttatcaggggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggtgagagagtag--agagagaaacttgggaaatcaaag 6097703  T
Q  103 gg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg--tagagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||| ||||||    
T  6097702 ggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttggtg 6097603  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttg 297  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||         |||||| ||||||||| |||    
T  6097602 aga-ttggaaaaatggtagaaatta-ggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ctc---------ttttgt-aagaactca-ttg 6097517  T
Q  298 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097516 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 6097481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2171897 - 2171562
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  2171897 aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gtgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaa 2171801  T
Q  102 ggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-- 195  Q
    ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||      
T  2171800 gggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 2171702  T
Q  196 -----gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
         |||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| |||    
T  2171701 cattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatc-tctttgtaa-gaa 2171605  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171604 ctcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 2171562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31404966 - 31404705
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||    
T  31404966 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgag 31404868  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31404867 tgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagatt-gggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 31404770  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31404769 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 31404705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5406490 - 5406230
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  5406490 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5406393  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5406392 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-gggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 5406295  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5406294 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 5406230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5410815 - 5410555
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  5410815 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5410718  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5410717 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-gggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 5410620  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5410619 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 5410555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5413682 - 5413424
Alignment:
Q  81 agagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | |||||| |||  ||| |    
T  5413682 agagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtg 5413585  T
Q  179 aa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-t 267  Q
    ||  |||||||||||||||       |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5413584 aaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-gggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccct 5413487  T
Q  268 cttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5413486 tttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 5413424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30834828 - 30834566
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | | || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||    
T  30834828 agagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgag 30834731  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30834730 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 30834632  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | |||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834631 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 30834566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16452621 - 16452359
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   | | || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||    
T  16452621 agagagaaacttgggaaatcaaagtaagcaactttagagtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgag 16452524  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16452523 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 16452425  T
Q  266 ctcttg-tatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |  ||  ||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452424 cctttcatatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 16452359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 6136326 - 6136241
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtg-agagagttggaagagagaga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  6136326 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtatttaagt-ttcttgtgcagatttgaagagaagag-gttggaagagagaga 6136241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9183323 - 9183063
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  9183323 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcctgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 9183226  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  9183225 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaac 9183127  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9183126 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaga 9183063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589069
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 21589027  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21589028 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 21589069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593802
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 21593760  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21593761 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 21593802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972969
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 2973011  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2973010 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagt 2972969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33160500 - 33160382
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  33160500 ggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatggtggattgga 33160405  T
Q  311 gagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  33160404 gagatcaatctctcctccagagt 33160382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808738
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaa 3808781  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3808780 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 3808738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763128
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |  ||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctttttgg--aagaac 17763086  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17763087 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagt 17763128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 331
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569158
Alignment:
Q  112 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagatttggg 207  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||   |||||  |     
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  208 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggat 306  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||            |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacct------------ttgtaa-gaactcatt-gatagtggat 16569133  T
Q  307 tggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16569134 tggagagatcaatctctcctccaga 16569158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 333
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758161
Alignment:
Q  196 gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactca 293  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| |||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactca 17758122  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  17758123 tt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagt 17758161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424856
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc---tcttgtatcctttttgtaaaga 288  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||   | |||||| || ||||| ||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtat-ctctttgt-aaga 22424899  T
Q  289 actcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22424898 actcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagt 22424856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137438
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  | ||||||| ||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatt-tctttgtaa-gaac 28137480  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28137479 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagt 28137438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5409146 - 5409099
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5409146 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 5409099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 5674452 - 5674512
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactt-aagtgttcttgtgcagatttg 62  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5674452 aaatcgtgacacgattgtatcagaggaaggctagtatttaaagtgttcttgtgcagatttg 5674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830157
Alignment:
Q  195 ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaactc 292  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||| ||||||    
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatc-tctttgtaa-gaactc 26830193  T
Q  293 atttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26830192 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctcca 26830157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22709420 - 22709362
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709420 aaatcgtgacacgattttattagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 22709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 329
Target Start/End: Original strand, 5043648 - 5043761
Alignment:
Q  214 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 311  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5043648 gtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtagattggag 5043743  T
Q  312 agttcaatctctcctcca 329  Q
    || |||||||||||||||    
T  5043744 agatcaatctctcctcca 5043761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Original strand, 26800679 - 26800725
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26800679 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 26800725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038935
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 3038975  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    || ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  3038974 tc-tttaatagtggattggagagattaatctctcccccaga 3038935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26954363 - 26954324
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26954363 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 26954324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33211262 - 33211215
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33211262 aagaactcattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagt 33211215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4089 - 3756
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagag--ttggaagagagagacttgggaaatc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4089 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcctgtgcagatttgaagtgagagagagttggaagagagagacttgggaaatc 3990  T
Q  99 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3989 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 3890  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3889 aga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 3791  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 3756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6592700 - 6592370
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592700 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttggaagagagagacttgggaaatcaa 6592602  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592601 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 6592502  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6592501 a-ttgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgata 6592403  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6592402 gtggattggagagtacaaactctcctccagagt 6592370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6594916 - 6594588
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594916 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag---gttggaagagagagacttgggaaatcaa 6594820  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594819 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 6594720  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6594719 a-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgata 6594621  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6594620 gtggattggagagtacaaactctcctccagagt 6594588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18389123 - 18388790
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgaga--gagttggaagagagagacttgggaaatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389123 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagagtaaaggagttggaagagagagacttgggaaatc 18389024  T
Q  99 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389023 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 18388924  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18388923 aga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 18388825  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18388824 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 18388790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18392559 - 18392226
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgaga--gagttggaagagagagacttgggaaatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392559 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagagtaaaggagttggaagagagagacttgggaaatc 18392460  T
Q  99 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392459 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 18392360  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18392359 aga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 18392261  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18392260 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 18392226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32060685 - 32060352
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagag-ttggaagagagagacttgggaaatcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060685 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggga-agaggttggaagagagagacttgggaaatcaaa 32060587  T
Q  102 ggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtga 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32060586 gggtaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtga 32060487  T
Q  200 gatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtat--cctttttgtaaagaactcatttg 297  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32060486 ga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttg 32060388  T
Q  298 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32060387 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 32060352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Original strand, 20343705 - 20344035
Alignment:
Q  5 atcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20343705 atcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttttggaagagagagagacttggggaatcaaag 20343803  T
Q  103 gg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtga 199  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20343804 ggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtga 20343903  T
Q  200 gatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgat 299  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20343904 ga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgat 20344001  T
Q  300 agtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20344002 agtggattggagagtacaatctctcctccagagt 20344035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1562366 - 1562103
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  1562366 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtatttatgtgttcttgtgcagatttgaag-gagagagttggaagagagagagacttggggaatc 1562268  T
Q  99 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562267 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 1562168  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 264  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562167 aga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 24789649 - 24789979
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789649 aaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaag-gagag-gttggaagagagagacttgggaaatcaaa 24789746  T
Q  102 ggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  24789747 gggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggta 24789846  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttg 297  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  24789847 aga-ttgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttgtaaa-aactc-tttg 24789943  T
Q  298 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24789944 atagtggattggagagtactatctctcctccagagt 24789979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 39731175 - 39731507
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatc 98  Q
    ||||||||||||||||||  | ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39731175 gaaaatcgtgacacgattttatcaatggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttgggaaatc 39731271  T
Q  99 aaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 194  Q
    |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  39731272 aaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 39731370  T
Q  195 ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactc 292  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||    
T  39731371 ggtgagatt-ggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactc 39731467  T
Q  293 atttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39731468 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 39731507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43504514 - 43504188
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||    || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43504514 aatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcctgtgcagatttgaaga---agggttggaagagagagaaacttgggaaatcaaa 43504418  T
Q  102 ggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt 197  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  43504417 gggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcgagtgtcttggt 43504319  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaactcat 294  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | |||||||  |||||||| ||||||||    
T  43504318 gagatt-gggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcat 43504222  T
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43504221 t-gatagtgaattggagagttcaatctctcctcca 43504188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25767321 - 25766990
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagtgagagagttgga-agagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||    
T  25767321 aaatcgtgacacgattttatcaatggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag---gagagctgaagagagagaaacttgagaaatcaa 25767225  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt 197  Q
    |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| |    
T  25767224 agggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctctttggg---aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 25767129  T
Q  198 ----gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
        |||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||  |||||  ||||||    
T  25767128 cattgagattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg--aagaac 25767032  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767031 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 25766990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 48408605 - 48408942
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48408605 aatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttga---agagagc-ggaagagagagaaacttgggaaatcaaa 48408700  T
Q  102 ggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-- 195  Q
    ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||      
T  48408701 gggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 48408799  T
Q  196 -----gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtatcctttttgtaaag 287  Q
         |||||||| || ||| ||||||||||||  ||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||  ||||| |||     
T  48408800 cattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aaat 48408897  T
Q  288 aactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48408898 aactcatt-gatagtggattggagagtttaatctctcctccagagt 48408942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 35853791 - 35854052
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | || ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  35853791 agagagaaacttaggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 35853888  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35853889 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 35853987  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853988 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 35854052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 29990931 - 29991191
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg--tag 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||    
T  29990931 agagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 29991028  T
Q  175 agagaatcattgagtgtc-------ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-c 265  Q
     || ||||||||||||||       ||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29991029 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga-ttgggaaaaggatagaaattaggg-ttgttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 29991126  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || |||||| || ||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29991127 cttttgtat-ctctttct-aataactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 29991191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310746
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatc-tttttgtaa-gaac 34310788  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34310787 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 34310746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14070125 - 14069871
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaa-aacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||    |    
T  14070125 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtga 14070028  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14070027 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 14069929  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14069928 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 14069871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14380153 - 14379899
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaa-aacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||    |    
T  14380153 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtga 14380056  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14380055 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 14379957  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14379956 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 14379899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 4178651 - 4178910
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  4178651 agagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 4178748  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  4178749 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacc 4178847  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagag 332  Q
     | ||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4178848 cttttgtatc-tctttg--aagaactcatt-gatagtggattgaacagttcaatctctcctccagag 4178910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 333
Target Start/End: Original strand, 23555060 - 23555178
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23555060 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgta-cctctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 23555155  T
Q  311 gagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  23555156 gagatcaatctctcctccagagt 23555178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 333
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25615991
Alignment:
Q  125 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagatttgggaaaggggtagaaa 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||   ||||| || ||| |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  221 ttagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaa 318  Q
    ||||| |||||||   |||  |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcatttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaa 25615976  T
Q  319 tctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||    
T  25615977 tctctcctccagagt 25615991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30025024 - 30024762
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | | | ||||||||||    |    
T  30025024 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttgaaaaacgttgtaaacaccttgggtga 30024927  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  30024926 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 30024828  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |  || ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  30024827 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactc-tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagt 30024762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491715
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctctttg-aaagaac 48491675  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48491676 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 48491715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560696
Alignment:
Q  271 gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 1560696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270111
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 22270069  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22270070 tgatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 22270111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673981
Alignment:
Q  125 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggg 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||  | ||| ||    
T  47674189 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgg 47674091  T
Q  214 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 311  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47674090 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 47673995  T
Q  312 agttcaatctctcc 325  Q
    || |||||||||||    
T  47673994 agatcaatctctcc 47673981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359346
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaa 8359389  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8359388 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 8359346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317466
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||| ||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaa-gaac 41317506  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41317505 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 41317466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Original strand, 19502233 - 19502316
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19502233 aagctaatttcttgtaactcttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 19502316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608875
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 29608833  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29608834 tca-ttgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagt 29608875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586291
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaact 291  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||  || |   || ||||| |||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgt-aagaact 4586258  T
Q  292 catttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4586259 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 4586291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27347953
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 27347913  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  27347914 tcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccaga 27347953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259133
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| |  ||||||| | |||||||| |||    
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatc-tctttgtaaa-aac 3259091  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3259092 ccatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 3259133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21646418 - 21646360
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21646418 aaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 21646360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358084
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 32358084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599365
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||||  ||| |  |||| |    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg--aagagc 48599406  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagag 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48599405 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagag 48599365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41649158 - 41649049
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 311  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41649158 ggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 41649063  T
Q  312 agttcaatctctcc 325  Q
    || |||||||||||    
T  41649062 agatcaatctctcc 41649049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2361004
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 2361044  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  2361043 tca-ttgatagtggatttgagatatcaatctctcccccaga 2361004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153478
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||  |||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatc-tctttgtaat-aac 8153438  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8153439 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 8153478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126780
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctctttgt-aagaac 18126740  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||| |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  18126741 tca-ttgatagtggattggaggaatcaatctctcccccaga 18126780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47676428 - 47676174
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg---ta 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    |    
T  47676428 agagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 47676331  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | || ||||| ||||||||       |||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||     
T  47676330 gtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaac 47676232  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||  |||||| || ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47676231 ccatttgtat-ctctttgt-aagaactca-atgatagtggaatggagagatcaatctctcc 47676174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 333
Target Start/End: Original strand, 2390301 - 2390420
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  2390301 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaat-aactcatat-atagtggattgg 2390396  T
Q  310 agagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  2390397 agagatcaatctctcctccagagt 2390420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4253678 - 4253566
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtat-cctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||| ||    
T  4253678 ggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacc-cttttatatctctttggaaagaactca-ttgataatggattaga 4253581  T
Q  311 gagttcaatctctcc 325  Q
    ||| |||||||||||    
T  4253580 gagatcaatctctcc 4253566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432109
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||| ||||| || ||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 6432067  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6432068 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctccttcagagt 6432109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18409174 - 18409116
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18409174 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttctcgtgcagattt 18409116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565100
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 23565114  T
Q  311 gagttcaatctctc 324  Q
    ||| ||||||||||    
T  23565113 gagatcaatctctc 23565100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24515052 - 24514934
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg--tag 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||    
T  24515052 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 24514955  T
Q  175 agagaatcattgagtgtcttg 195  Q
     || |||||||||||||||||    
T  24514954 tgaaaatcattgagtgtcttg 24514934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31733118 - 31733007
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  31733118 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatactggattgg 31733023  T
Q  310 agagttcaatctctcc 325  Q
    |||| |||||||||||    
T  31733022 agagatcaatctctcc 31733007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508736
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 4508778  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  4508777 tcatt-gagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagt 4508736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18414026 - 18413992
Alignment:
Q  27 ggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18414026 ggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 18413992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344048
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 266  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaaggg-tagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 23344048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36574683 - 36574558
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtat-cctttttgtaaagaac 290  Q
    |||| |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||| | ||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||    
T  36574683 ttggagagattggggaaagg--tagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacc-cttttatatctctttgtaaagaac 36574587  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatc 320  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  36574586 tca-ttgatagtggtttggagagatcaatc 36574558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 496060 - 496021
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  496060 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 496021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22328538 - 22328428
Alignment:
Q  215 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 312  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||| | |||| || ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  22328538 tagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatc-tctttgcaaggaagtcatta-atagtggatttgaga 22328441  T
Q  313 gttcaatctctcc 325  Q
    | |||||||||||    
T  22328440 gatcaatctctcc 22328428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24525579 - 24525540
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24525579 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 24525540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 40379899 - 40380229
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379899 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttggaagagagagacttgggaaatcaa 40379997  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379998 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 40380097  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40380098 a-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgata 40380196  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40380197 gtggattggagagttcaaactctcctccagagt 40380229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 40382110 - 40382440
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382110 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttggaagagagagacttgggaaatcaa 40382208  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382209 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 40382308  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40382309 a-ttgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgata 40382407  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40382408 gtggattggagagttcaaactctcctccagagt 40382440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 25077927 - 25078259
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25077927 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggagag-gttggaagagagagacttgggaaatcaa 25078025  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25078026 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 25078125  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25078126 agatt-gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 25078224  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25078225 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 25078259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 25135896 - 25136228
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135896 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggagag-gttggaagagagagacttgggaaatcaa 25135994  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25135995 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 25136094  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25136095 agatt-gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 25136193  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25136194 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 25136228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 16546437 - 16546769
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagag-ttggaagagagagacttgggaaatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16546437 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggca-agaggttggaagagagagacttgggaaatca 16546535  T
Q  100 aaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546536 aaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtga 16546635  T
Q  200 gatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16546636 ga-ttaggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 16546734  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16546735 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 16546769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 16544215 - 16544547
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagag-ttggaagagagagacttgggaaatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16544215 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggca-agaggttggaagagagagacttgggaaatca 16544313  T
Q  100 aaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544314 aaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtga 16544413  T
Q  200 gatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16544414 ga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 16544512  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16544513 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 16544547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 10593066 - 10593396
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagag--agagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10593066 aaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtatgtaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagagttggaagagagagagacttgggaaatcaa 10593163  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10593164 agggggaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 10593263  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10593264 aga-ttgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttga 10593361  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10593362 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 10593396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22536647 - 22536320
Alignment:
Q  5 atcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga----cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  22536647 atcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagagttggaagagagagagagacttgggaaatcaa 22536551  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtga 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22536550 agggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgcagagagaatcattgagtgtcttggtga 22536451  T
Q  200 gatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgat 299  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  22536450 ga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgat 22536354  T
Q  300 agtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22536353 agtggattggggagtacaatctctcctccagagt 22536320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 29722332 - 29722662
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  29722332 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gagagttggaaaagagagaaacttgggaaatcaa 29722428  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggt 197  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29722429 agggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggt 29722528  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcattt 296  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  29722529 gaga-ttgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-ttt 29722625  T
Q  297 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29722626 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 29722662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29751523 - 29751190
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaat 97  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29751523 gaaaatcgtgacacgattgctttagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaag---gagagttggaagagagagagacttgggaaat 29751427  T
Q  98 caaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtctt 194  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29751426 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt 29751327  T
Q  195 ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactca 293  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||     
T  29751326 ggtgaga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc- 29751230  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29751229 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 29751190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 29720173 - 29720502
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29720173 aatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcaaatttgaag---gagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaa 29720269  T
Q  102 ggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29720270 gggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtg 29720369  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttg 297  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  29720370 aga-ttgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttg 29720466  T
Q  298 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29720467 atagtggattggagagtacaatctctcctctagagt 29720502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9789586 - 9789254
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatc 98  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9789586 gaaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gagagttggaagagagagaaacttgggaaatc 9789490  T
Q  99 aaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 194  Q
    |||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  9789489 aaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 9789391  T
Q  195 ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactc 292  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||    
T  9789390 ggtgagatt-ggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactc 9789294  T
Q  293 atttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9789293 att-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 9789254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18442008 - 18441678
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18442008 aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaa 18441912  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttgg 196  Q
    |||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||    
T  18441911 agggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgg 18441813  T
Q  197 tgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcat 294  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||    
T  18441812 tgagatt-ggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcat 18441716  T
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18441715 t-gatagtggattggagagttcaatctctcctctagagt 18441678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 26177691 - 26178020
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26177691 aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgcgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaa 26177787  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttgg 196  Q
    |||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||    
T  26177788 agggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgg 26177886  T
Q  197 tgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcat 294  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||    
T  26177887 tgagatt--ggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcat 26177982  T
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26177983 t-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 26178020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 16409313 - 16409613
Alignment:
Q  33 ctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttcttt 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||    
T  16409313 ctagtatttaagtgttcttgtgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-cttt 16409408  T
Q  130 gattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattaggg 226  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  16409409 gattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagatt-ggaaaaagggtagaaattaggg 16409507  T
Q  227 tttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctc 324  Q
    || |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16409508 tt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctc 16409604  T
Q  325 ctccagagt 333  Q
    |||||||||    
T  16409605 ctccagagt 16409613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Original strand, 26170584 - 26170900
Alignment:
Q  5 atcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26170584 atcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaag 26170680  T
Q  103 gg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtg 198  Q
    || | | ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  26170681 ggagtaactctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtg 26170779  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttg 297  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||         |||||| ||||||||| |||    
T  26170780 agatt--ggaaaagggtagaaatta-ggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ctc---------ttttgt-aagaactca-ttg 26170864  T
Q  298 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170865 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 26170900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 25412638 - 25412898
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  25412638 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaacattagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 25412735  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25412736 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 25412833  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25412834 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 25412898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 13342937 - 13343198
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  13342937 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 13343034  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa- 264  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13343035 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaat 13343133  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| ||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13343134 ccttttgtatc-tctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 13343198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 30182465 - 30182726
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  30182465 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgag 30182562  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30182563 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 30182661  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | || ||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182662 cttttctatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 30182726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 36074336 - 36074077
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  36074336 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 36074239  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag---gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgta 263  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||    ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36074238 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgta 36074140  T
Q  264 ac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    || || ||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074139 actcttttgtatc-tctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcca 36074077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Original strand, 13488079 - 13488333
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    |    
T  13488079 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtga 13488176  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || ||| |||||||||||||       || ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13488177 gtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 13488275  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13488276 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 13488333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 333
Target Start/End: Original strand, 13239674 - 13239889
Alignment:
Q  125 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaagggg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||||||| |  |||  ||    
T  13239674 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg 13239772  T
Q  215 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 312  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13239773 tagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggaga 13239868  T
Q  313 gttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13239869 gatcaatctctcctccagagt 13239889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 32636700 - 32636960
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||    |    
T  32636700 agagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtagtgaaacattgtaaacaccttgggtga 32636797  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtctt-------ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
    | || ||||||||||||||||       ||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32636798 gtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 32636896  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |  || ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32636897 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 32636960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 333
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439279
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 37439256  T
Q  311 gagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  37439257 gagatcaatctctcctccagagt 37439279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147399
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 40147357  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40147358 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 40147399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39468841 - 39468587
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  39468841 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttcattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtga 39468744  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39468743 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 39468645  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39468644 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcc 39468587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213599
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 213561  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  213562 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcca 213599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278454
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||| |||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaaa-aac 28278412  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28278413 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 28278454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28750985 - 28750687
Alignment:
Q  41 taagtgttcttgtgcaga-tttgaagtgagagagttggaagagagag--acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattaga 136  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||   |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28750985 taagtgttcttatgcagattttgaa---agagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattaga 28750890  T
Q  137 gtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg---tagagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagg 225  Q
    || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28750889 gt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 28750791  T
Q  226 gtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctct 323  Q
    | |||||| |  |||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28750790 g-ttgttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtat-ctttttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctct 28750695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13695850 - 13695724
Alignment:
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| || |||    
T  13695850 ttgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctctttgtaaagaactca-ttaata 13695753  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  13695752 gtggattagagagattattctctcctcca 13695724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42428722 - 42428468
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||    |    
T  42428722 agagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtga 42428625  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42428624 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 42428526  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42428525 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 42428468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 35388074 - 35388016
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35388074 aaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 35388016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30683212 - 30682954
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || |  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  30683212 agagagaaacttgggaaatcagaggaggtaattttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgag 30683115  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||    ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30683114 tgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttcttt----gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 30683019  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaaga-actcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
     | ||||||  | |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30683018 cttttgtatt-tctttgtaagaatactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 30682954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16641008 - 16640970
Alignment:
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16641008 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 16640970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 325
Target Start/End: Original strand, 33831590 - 33831810
Alignment:
Q  112 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||||        |||||    
T  33831590 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgag 33831687  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |  ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||    
T  33831688 attggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-ga 33831783  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||    
T  33831784 tagtggattgaagagatcaatctctcc 33831810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42426403 - 42426273
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| || ||  |||||| || ||||| ||||||    
T  42426403 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtat-ctctttgt-aagaac 42426307  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42426306 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 42426273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Original strand, 16407848 - 16407947
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagag--acttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  16407848 aatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtattcttgtgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttggaaaatcaaa 16407944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637643
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaa 27637685  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27637684 ctcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagt 27637643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Original strand, 5058136 - 5058183
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5058136 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagt 5058183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 333
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160737
Alignment:
Q  298 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 4160737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 316817 - 316893
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  316817 aagctaatttcttgtaatccttttgtat-ctctttgtaaagaactca-ttgataatggatcggagggatcaatctctcc 316893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10054929 - 10054845
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtg 334  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||| ||||    
T  10054929 aagctaatttcttataaccttttgtat-ctctttgtaatgaactca-ttgatagtgtattggagatatcaatatctcccccaaagtg 10054845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15464934 - 15464876
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    |||||||| |||||||  | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15464934 aaatcgtggcacgattttatcagtagaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 15464876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806499
Alignment:
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 19806499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33906144 - 33906070
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctct 323  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  33906144 aagctaacttcttgtaatccttttgtatc-tctttgtaaagaactca-ttgatagtagattggaaagatcaatctct 33906070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 3617255 - 3617588
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtg-agagagttggaagagagagacttgggaaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3617255 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagtagag-gttggaagagagagacttgggaaatca 3617353  T
Q  100 aaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3617354 aaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt 3617453  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttg 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3617454 gagatt-gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 3617552  T
Q  298 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3617553 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 3617588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4598885 - 4598553
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598885 gaaaatcgtgacacgattgaaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaaggagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 4598786  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598785 agggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 4598686  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgat 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4598685 a-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 4598587  T
Q  300 agtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4598586 agtggattggagagtacaaactctcctccagagt 4598553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 25637234 - 25637565
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttgga--agagagagacttgggaaatc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25637234 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gag-gttggaagagagagagacttgggaaatc 25637331  T
Q  99 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637332 aaaggggtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 25637431  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25637432 aga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 25637530  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25637531 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 25637565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 10211200 - 10211533
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagag-ttggaagagagagacttgggaaatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10211200 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtaaaagaggttggaagagagagacttgggaaatca 10211299  T
Q  100 aaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtga 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211300 aagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtga 10211399  T
Q  200 gatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10211400 ga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 10211498  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10211499 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 10211533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4601106 - 4600774
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4601106 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaaggaaagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 4601007  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4601006 agggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgag 4600907  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgat 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4600906 a-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 4600808  T
Q  300 agtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  4600807 agtggattggagagtacaaactctcctctagagt 4600774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 10056029 - 10056357
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10056029 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagggttgaaagagagagacttgggaaatcaaag 10056126  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10056127 gggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 10056225  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10056226 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 10056325  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10056326 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 10056357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 10058251 - 10058579
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10058251 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagggttgaaagagagagacttgggaaatcaaag 10058348  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10058349 gggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 10058447  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10058448 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 10058547  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10058548 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 10058579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 10060473 - 10060801
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10060473 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagggttgaaagagagagacttgggaaatcaaag 10060570  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10060571 gggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 10060669  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10060670 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 10060769  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10060770 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 10060801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 10062695 - 10063023
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10062695 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagggttgaaagagagagacttgggaaatcaaag 10062792  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10062793 gggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 10062891  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10062892 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 10062991  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10062992 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 10063023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 10064917 - 10065245
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10064917 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagggttgaaagagagagacttgggaaatcaaag 10065014  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10065015 gggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 10065113  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10065114 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 10065213  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10065214 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 10065245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 10208982 - 10209313
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagag-ttggaagagagagacttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10208982 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtaaaagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaa 10209081  T
Q  102 ggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209082 gggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 10209181  T
Q  202 tttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  10209182 -ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagtccttttgtaaagaactcatttgata 10209280  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10209281 gtggattggagagtacaaactctcctccagagt 10209313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 297
Target Start/End: Original strand, 10067139 - 10067431
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10067139 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagggttgaaagagagagacttgggaaatcaaag 10067236  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10067237 gggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 10067335  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10067336 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 54634931 - 54635262
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatc 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54634931 gaaaatcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaag--agggagttggaagagagagagacttgggaaatc 54635027  T
Q  99 aaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttg 195  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  54635028 aaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 54635127  T
Q  196 gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatt 295  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  54635128 gtgaga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tt 54635224  T
Q  296 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  54635225 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 54635262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 45282787 - 45283124
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga----cttgggaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| ||    
T  45282787 gaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagagttggaagagagagagagacttggggaa 45282883  T
Q  97 tcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtct 193  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  45282884 tcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtct 45282983  T
Q  194 tggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcc---tttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||    
T  45282984 tggtgagatt-gggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttgt-aagaac 45283081  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45283082 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 45283124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 6716306 - 6716637
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatc 98  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  6716306 gaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaag--aaagggttggaagagagagagacttgggaaatc 6716402  T
Q  99 aaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttg 195  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6716403 aaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 6716502  T
Q  196 gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatt 295  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||    
T  6716503 gtgaga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tt 6716599  T
Q  296 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6716600 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 6716637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 6718491 - 6718718
Alignment:
Q  2 aaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatca 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6718491 aaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaag--aaagggttggaagagagagagacttgggaaatca 6718587  T
Q  100 aaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttgg 196  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6718588 aagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttgg 6718687  T
Q  197 tgagatttgggaaaggggtagaaattagggtt 228  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6718688 tgaga-ttgggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 800974 - 801230
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  800974 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagag 801072  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttg 271  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | |||    
T  801073 agaaaatcattgagtgtcttggtgagatt-gggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttg 801170  T
Q  272 tatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  801171 tatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 801230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23198305 - 23197969
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  23198305 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttggaaaatcaa 23198209  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg--tagagagaatcattgagtg------ 190  Q
    |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||          
T  23198208 agggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgt 23198110  T
Q  191 tcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaaga 288  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  23198109 tcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagag-ttgttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgt-aaga 23198013  T
Q  289 actcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198012 actca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagt 23197969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23200504 - 23200168
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23200504 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactggtatttaagtgtttttgtgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaa 23200408  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg--tagagagaatcattgagtg------ 190  Q
    |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||          
T  23200407 agggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgt 23200309  T
Q  191 tcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaaga 288  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  23200308 tcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgt-aaga 23200212  T
Q  289 actcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200211 actca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagt 23200168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7780034
Alignment:
Q  158 tgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaa 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagatt-gggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaa 7780111  T
Q  255 tttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780110 tttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 7780034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9636429 - 9636160
Alignment:
Q  71 gagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaaca 166  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | |||||    
T  9636429 gagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaaca 9636331  T
Q  167 ccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt-------gagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaat 255  Q
    |||||  ||| |||  |||||||||||||||||       |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||    
T  9636330 ccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaat 9636232  T
Q  256 ttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9636231 ttcttgtaacccttttgtatc-tttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcca 9636160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5258436 - 5258174
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  5258436 agagagaaacttgagaaatcaaagggagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5258339  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5258338 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 5258240  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | |||||||  ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5258239 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccagagt 5258174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 45095041 - 45095301
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  45095041 agagagaaacttgggaaatcaaaagaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 45095138  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45095139 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-gggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 45095236  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45095237 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagt 45095301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 37408335 - 37408596
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gt-ag 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || ||    
T  37408335 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgag 37408432  T
Q  175 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 266  Q
     || ||| |||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37408433 tgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 37408531  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37408532 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagt 37408596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5260615 - 5260357
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  5260615 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5260518  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttggt-------gagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||||       |||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5260517 tgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 5260419  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    | | |||||||  ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5260418 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctcca 5260357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 7762142 - 7762403
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |  |||||||||  |||    
T  7762142 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttggtgag 7762239  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtctt-------ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  ||||||||||||||       |||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  7762240 tgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaact 7762338  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7762339 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 7762403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19684173 - 19683923
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaat 181  Q
    ||||||||||||||||| |  | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  19684173 acttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 19684076  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgt 272  Q
    |||||| |||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  19684075 cattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgt 19683977  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19683976 atc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcca 19683923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 7764344 - 7764602
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  |||    
T  7764344 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggt-ctttgattagatt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggtgag 7764441  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  |||||||||||||||       ||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  7764442 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga---gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaact 7764537  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7764538 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatgaatctctcctccagagt 7764602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196424
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| || ||  |||||| || ||||| ||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtat-ctctttgt-aagaac 29196458  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29196457 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 29196424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491350
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 34491308  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34491309 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 34491350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7782508 - 7782375
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagag--acttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7782508 aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gacagttggaagagagagaaacttgggaaatcaa 7782412  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagag 137  Q
    |||| | | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  7782411 agggagtaactctaggttttagag-tctttgattagag 7782375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570090
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaactt-gtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||  | |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 4570048  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4570049 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctactccagagt 4570090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819553
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaa 41819595  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41819594 ctcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagt 41819553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 331
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236261
Alignment:
Q  197 tgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcat 294  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatc-tctttgtaa-gaactcat 30236225  T
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30236226 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 30236261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331681
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtat-ctctttgt-aagaac 44331641  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44331642 tta-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 44331681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39153645 - 39153393
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaat 181  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |  || |||    
T  39153645 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaat 39153548  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgt 272  Q
    ||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||    
T  39153547 cattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgt 39153449  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  39153448 atcccttt--ataagaactca-ttgatagtggattggagagaacaatctctcccccaga 39153393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 40735259 - 40735519
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaga- 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||| | |     
T  40735259 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaa 40735356  T
Q  176 --gagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 265  Q
      || |||||||||||||||||       ||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  40735357 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaac 40735455  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |   |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40735456 cagtttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 40735519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700516
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatc-tctttgtaa-gaac 44700550  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44700549 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc 44700516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199501
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaa 49199542  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  49199541 ctcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccaga 49199501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5236787 - 5236551
Alignment:
Q  40 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattag 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |   | | |||||||||||  ||||||||||| |||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  5236787 ttaagtgttcttgtgcagattttgaagtggg---gcttgaagagagagaaacttgggaaatcgaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattag 5236692  T
Q  136 agtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattag 224  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  5236691 agt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 5236593  T
Q  225 ggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 266  Q
    || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5236592 gg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 5236551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 333
Target Start/End: Original strand, 9581295 - 9581420
Alignment:
Q  206 ggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtg 303  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||  || |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  9581295 ggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtg 9581390  T
Q  304 gattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9581391 gattggagagatcaatctctcctccagagt 9581420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 325
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314575
Alignment:
Q  195 ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactc 292  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||    
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tttttgtaa-gaactc 31314543  T
Q  293 atttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31314544 -tttgatagtggattggagagatcaatatctcc 31314575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 325
Target Start/End: Original strand, 40734382 - 40734628
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaat 181  Q
    |||||| |||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  40734382 acttggaaaatcaaaggagataactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 40734479  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgt 272  Q
    ||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | || ||||||||||||||| |  ||||    
T  40734480 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgt 40734578  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40734579 atcc-ctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 40734628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835040
Alignment:
Q  196 gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactca 293  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||| |||||||    
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 22835071  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22835070 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 22835040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 331
Target Start/End: Original strand, 760731 - 760983
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta---gagagaat 181  Q
    ||||||||||||||||| |  | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||| |   | || |||    
T  760731 acttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaat 760828  T
Q  182 cattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gt 272  Q
    ||||||||||||||       |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||    
T  760829 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 760927  T
Q  273 atcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  760928 atcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 760983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095629
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| | || ||||| |  ||| |||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 6095671  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6095670 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 6095629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860612
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||  |||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaat-aac 46860570  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46860571 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagt 46860612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593842
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 54593800  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54593801 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 54593842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 51398833 - 51398950
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51398833 gggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgg 51398928  T
Q  310 agagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||| |  |||||||| |||||    
T  51398929 agagatttatctctcccccaga 51398950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 29810868 - 29811004
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  29810868 ttggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 29810964  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29810965 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 29811004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 29813083 - 29813199
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || | ||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29813083 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatc-tctttgtaa-gaactcattt-atagtggattgga 29813178  T
Q  311 gagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  29813179 gagatcaatctctcccccaga 29813199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401831
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa--cctcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||  | | || ||| || ||||| |||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttat-ctctttgt-aagaa 43401874  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  43401873 ctca-ttgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagt 43401831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1306360 - 1306306
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 57  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1306360 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcag 1306306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 325
Target Start/End: Original strand, 29682269 - 29682489
Alignment:
Q  112 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  29682269 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgag 29682366  T
Q  201 atttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgt-aacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| || ||| ||||||||||||  |||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||| | ||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  29682367 attgggaaaatgggtagaaatta-tgtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcc-ctttgt-aagaactca-ttga 29682462  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682463 tagtggattggagagatcaatctctcc 29682489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921541
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| || |||||||||||||||| |  |||||| | |||||| ||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtat-cattttgt-aagaac 53921575  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53921574 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 53921541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Original strand, 16499120 - 16499167
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16499120 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagt 16499167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43403821 - 43403774
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43403821 aagaactcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagt 43403774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173493
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  46173377 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaattcatt-gatagtggattgga 46173472  T
Q  311 gagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  46173473 gagatcaatctctcccccaga 46173493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433971
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 266  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 8477780 - 8477729
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtg 54  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8477780 aaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtg 8477729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 32143722 - 32143664
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32143722 aaatcgtgacacgattttatcagttgaagacttgtatttaagtgttcttgtgcagattt 32143664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 55302040 - 55302006
Alignment:
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55302040 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 55302006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 26928287 - 26928344
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    |||||||||||||||  | |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26928287 aatcgtgacacgattttatcagttgaagacttgtatttaagtgttcttgtgcagattt 26928344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305744
Alignment:
Q  296 tgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 27305744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 87
Target Start/End: Original strand, 27986180 - 27986224
Alignment:
Q  40 ttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  27986180 ttaagtgttcttgtgcagatttgga---agagagttggaagagagaga 27986224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 324
Target Start/End: Original strand, 33191916 - 33191960
Alignment:
Q  279 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctc 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33191916 tttgtaaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctc 33191960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 325
Target Start/End: Original strand, 47304342 - 47304381
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47304342 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 47304381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 5138099 - 5138428
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5138099 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttggaagagagaaacttgggaaatcaaag 5138197  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5138198 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 5138296  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5138297 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 5138396  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5138397 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 5138428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 7122488 - 7122817
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7122488 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaaggttgaaagagagagacttgggaaatcaa 7122587  T
Q  101 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7122588 aggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 7122687  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7122688 aga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 7122786  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7122787 tagtggattggagagtacaatctctcctcca 7122817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 5135873 - 5136203
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5135873 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagag-gttggaagagagaaacttgggaaatcaaag 5135971  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5135972 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 5136071  T
Q  202 tttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5136072 -ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 5136170  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5136171 gtggattggagagtacaaactctcctccagagt 5136203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 8395414 - 8395741
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395414 aaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagggttggaagagagagacttgggaaatcaaag 8395512  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8395513 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 8395611  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8395612 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagt 8395710  T
Q  303 ggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8395711 ggattggagagtacaatctctcctccagagt 8395741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 8393205 - 8393532
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8393205 aaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagggttggaagagagagacctgggaaatcaaag 8393303  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8393304 gggaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 8393402  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8393403 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagt 8393501  T
Q  303 ggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8393502 ggattggagagtacaatctctcctccagagt 8393532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 78 - 333
Target Start/End: Original strand, 7124784 - 7125040
Alignment:
Q  78 aagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--ga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7124784 aagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 7124883  T
Q  176 gagaatcattgagtgtcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  7124884 gagaatcattgagtgtcttggtgagatt-gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatt 7124982  T
Q  276 ctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7124983 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 7125040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31495677 - 31495346
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31495677 aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctaatatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaa 31495581  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttgg 196  Q
    |||| | | ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  31495580 agggagtaactctagggtttatagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttgg 31495482  T
Q  197 tgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaactca 293  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | |||||||  |||||||| |||||||    
T  31495481 tgagatt-gggaaaagggtagaaattaggatt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactca 31495385  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495384 tt-gatagttgattggagagttcaatctctcctccagagt 31495346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13992654 - 13992323
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttgga-agagagagacttgggaaatcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  13992654 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttggagggagag-cttgaagagagagaaacttgggaaatcaaa 13992556  T
Q  102 gg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg--tagagagaatcattgagtgtcttggt 197  Q
    ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||    
T  13992555 ggtagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggt 13992457  T
Q  198 gagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcat 294  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||  | |||| |||||||||     
T  13992456 gagattgggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatc--tcttgt-aagaactca- 13992362  T
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13992361 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 13992323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30000097 - 29999836
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  |||    
T  30000097 agagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgag 30000000  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac- 265  Q
     |||  || ||||||||||||       |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  29999999 tgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagatt-gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaact 29999902  T
Q  266 ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29999901 cttttgtatcttttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 29999836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 56178928 - 56178667
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  56178928 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 56178831  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  56178830 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 56178732  T
Q  267 -tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56178731 cttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 56178667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52095654 - 52095392
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  52095654 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggga-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 52095557  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  52095556 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 52095458  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||  |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52095457 ccatttgtat-ctctttgt-aagaaatc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 52095392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34570706 - 34570446
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||    |    
T  34570706 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtagctttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtga 34570609  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34570608 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 34570510  T
Q  266 ctc-ttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |   ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34570509 ccaattgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 34570446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9927749 - 9927490
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  9927749 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 9927652  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtctt-------ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  ||| ||||||||||       ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9927651 tgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 9927553  T
Q  267 tctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
      || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9927552 catttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 9927490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 37740502 - 37740761
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  37740502 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaagtttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 37740599  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 266  Q
     |||  ||| |||||||||||       ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37740600 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 37740698  T
Q  267 tctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
      || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37740699 catttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 37740761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 48142918 - 48143181
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  48142918 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 48143015  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa 264  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || |||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48143016 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 48143114  T
Q  265 cc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || | |||||||  | ||   ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48143115 cccttttgtatc--tcttcataagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 48143181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Original strand, 12119559 - 12119670
Alignment:
Q  214 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 311  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12119559 gtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatc-tctttgtaaagaactcattt-atagtggattggag 12119656  T
Q  312 agttcaatctctcc 325  Q
    || |||||||||||    
T  12119657 agatcaatctctcc 12119670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703639
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaa 46703596  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46703597 ctcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 46703639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5370237 - 5370113
Alignment:
Q  208 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtgg 304  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5370237 aaagaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 5370142  T
Q  305 attggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||    
T  5370141 actagagagatcaatctctcctccagagt 5370113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12739842 - 12739582
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt--gt-a 173  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||  || |    
T  12739842 agagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtga 12739745  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | |  |||||||||||||||||       |||||||| || ||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12739744 gtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 12739646  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||  |||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12739645 ccatttgtat-ctatttgt-atgaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 12739582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209852
Alignment:
Q  197 tgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaactca 293  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatc-tctttgtaa-gaactca 2209813  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2209814 tt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagt 2209852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364372
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 26364332  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26364333 tca-ttaatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 26364372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632577
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatc-tctttgtaa-gaac 40632541  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctc 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40632542 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctc 40632577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964554
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaa 289  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  | |||||||| ||| |||| |||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaa-gaa 41964511  T
Q  290 ctcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41964512 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 41964554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12748048 - 12747794
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt--gt-a 173  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||  || |    
T  12748048 agagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtga 12747951  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | |  |||||||||||||||||       |||||||| || ||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12747950 gtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 12747852  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||  |||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12747851 ccatttgtat-ctatttgt-atgaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 5429555 - 5429815
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  5429555 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 5429652  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5429653 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 5429751  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5429752 ccatttgtatc-tatttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 5429815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665546
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 8665504  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8665505 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 8665546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073530
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| | |||| |||| | |||||||||| ||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 12073488  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12073489 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagt 12073530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743963
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 12743978  T
Q  311 gagttcaatctctcc 325  Q
    ||| |||||||||||    
T  12743977 gagatcaatctctcc 12743963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745352
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 12745367  T
Q  311 gagttcaatctctcc 325  Q
    ||| |||||||||||    
T  12745366 gagatcaatctctcc 12745352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639564
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tatttgtaa-gaac 41639522  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41639523 tcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 41639564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687216
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtat-ctatttgt-aagaac 45687254  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45687253 tca-ttgatagtggattggagagatctatctctcctcca 45687216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26699585 - 26699482
Alignment:
Q  220 attagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttca 317  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  26699585 attagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatc-tctttgtaaagaactcattt-ataatggattggagagatca 26699488  T
Q  318 atctct 323  Q
    ||||||    
T  26699487 atctct 26699482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038441
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaact 291  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| || ||    
T  47038577 ttggtgagatt-ggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatc-tgtttgtaagga-ct 47038482  T
Q  292 catttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47038481 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagt 47038441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5208001 - 5207872
Alignment:
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtat-cctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||  || ||||| ||||||||| ||||||    
T  5208001 ttggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgt-aagaactca-ttgata 5207905  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  5207904 gtggattggaaagatcaatctctctcccagagt 5207872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 12744100  T
Q  311 gagttcaatctct 323  Q
    ||| |||||||||    
T  12744099 gagatcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12745604 - 12745476
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  12745604 ttggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 12745508  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctct 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12745507 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883156
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 54883116  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  54883117 tcatt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccaga 54883156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 333
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656094
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgg 6656070  T
Q  310 agagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  6656071 agagatcaatctctcatccagagt 6656094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994654
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||| ||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaac 36994620  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36994621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 36994654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50673960 - 50673877
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50673960 aagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 50673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 54200198 - 54199938
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||    |    
T  54200198 agagagaaacttaggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtga 54200101  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||     
T  54200100 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 54200002  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  54200001 ccatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtgaattagagagatcattctctcccccaga 54199938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175668
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 26175708  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26175707 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 26175668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416997
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||| |||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaaa-aac 27417037  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27417036 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 27416997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463421
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 36463461  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36463460 tc-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccaga 36463421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147429
Alignment:
Q  195 ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactc 292  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||||    
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaactc 46147461  T
Q  293 atttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46147460 -tttgatagtggattggagacatcaatctctcc 46147429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52082949 - 52082752
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  52082949 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 52082852  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || ||||||||| |||||||       |||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52082851 gtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaac 52082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 333
Target Start/End: Original strand, 379399 - 379518
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||  ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  379399 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaa-gaactaatt-gatagtggattgg 379494  T
Q  310 agagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  379495 agagatcaatctctcctccagagt 379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648277
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||| | || ||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 8648235  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8648236 tcatt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagt 8648277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Original strand, 33989899 - 33989983
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33989899 aagctaatttcttgtaatccttttgtatc-tctttgtaaataactcgtta-atagtggattggagagatcaatctctccaccagagt 33989983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229759
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtat-cctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| ||||| ||||||||  || |||  || ||||| ||||||    
T  37229890 ttggtgagatt-gggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgt-aagaac 37229793  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37229792 tcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc 37229759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Original strand, 33089966 - 33090017
Alignment:
Q  281 tgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  33089966 tgtaaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctctagagt 33090017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48893751 - 48893670
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48893751 aagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 48893670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6542328 - 6542212
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  6542328 ggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatc-tctttgtaa-gaactcgtt-gatagtggattgga 6542232  T
Q  311 gagttcaatctctcctccag 330  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  6542231 gagatcaatctctcccccag 6542212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 31985331 - 31985398
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcaga-tttgaagtgag 69  Q
    |||||||| |||||||  | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31985331 aaatcgtggcacgattttatcagttgaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagtgag 31985398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 4588014 - 4588089
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4588014 aagctaatttcttgtaacccttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagaacaatctctcc 4588089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Original strand, 35662496 - 35662579
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  35662496 aagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagt 35662579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48142525 - 48142444
Alignment:
Q  215 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtat-cctttttgtaaagaactcatt 295  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||    
T  48142525 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacc-cttgtatatctctttgtaaagaactcatt 48142444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 52093956 - 52093885
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  52093956 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttg 52093885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 325
Target Start/End: Original strand, 3913539 - 3913578
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3913539 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 3913578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13009521 - 13009478
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13009521 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcctcca 13009478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42575685 - 42575354
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagag-agttggaagagagagacttgggaaatcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575685 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggagttggaagagagagacttgggaaatcaaa 42575586  T
Q  102 ggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575585 gggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga 42575486  T
Q  202 tttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgata 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42575485 -ttgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 42575387  T
Q  301 gtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42575386 gtggattggagagtacaaactctcctccagagt 42575354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 15290347 - 15290662
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||    
T  15290347 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag---------------agagagacttgggaaatcaaag 15290431  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15290432 ggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 15290530  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15290531 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 15290630  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15290631 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 15290662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 15470716 - 15471031
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||    
T  15470716 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag---------------agagagacttgggaaatcaaag 15470800  T
Q  103 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15470801 ggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgaga- 15470899  T
Q  203 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15470900 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 15470999  T
Q  302 tggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15471000 tggattggagagtacaaactctcctccagagt 15471031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 25689762 - 25690092
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagagacttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689762 gaaaatcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcatctttgaaga-agag-gttggaagagagagacttgggaaatcaa 25689859  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggt 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25689860 agggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt 25689959  T
Q  198 gagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttg 297  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  25689960 gaga-ttgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttg 25690056  T
Q  298 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25690057 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 25690092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 3439308 - 3439641
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga----cttgggaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||| ||||    
T  3439308 gaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaag--agagagttggaagagagagagagacttgagaaa 3439404  T
Q  97 tcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtct 193  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  3439405 tcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcattgagtgtct 3439504  T
Q  194 tggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactca 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||     
T  3439505 tggtgaga-ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc- 3439601  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3439602 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagt 3439641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 2627573 - 2627874
Alignment:
Q  33 ctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagag--acttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttcttt 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | |||||    
T  2627573 ctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagag-tcttt 2627668  T
Q  130 gattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtcttggtgagatttgggaaaggggtagaaattaggg 226  Q
    ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2627669 gattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgaga-ttgggaaaagggtagaaattaggg 2627767  T
Q  227 tttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctct 323  Q
     |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | | |||||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2627768 -ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctct 2627864  T
Q  324 cctccagagt 333  Q
    ||||||||||    
T  2627865 cctccagagt 2627874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34254620 - 34254361
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagaga 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||  |||     
T  34254620 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagt 34254523  T
Q  178 gaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc- 266  Q
    |||  |||||||||||||||       |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  34254522 gaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt-gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaaccc 34254425  T
Q  267 tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | ||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34254424 ttttgtatc-tctttgtaa-gaacttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagt 34254361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 17982529 - 17982791
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  17982529 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 17982626  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17982627 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaac 17982725  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | |||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982726 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 17982791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 31218133 - 31218395
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  31218133 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 31218230  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31218231 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 31218329  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | |||||||  ||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31218330 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagt 31218395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 44303730 - 44303993
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||    
T  44303730 agagagaaacttgagaaatcaaaggaaacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 44303827  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa 264  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||   |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44303828 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa 44303926  T
Q  265 -cctcttgtatc-ctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
     ||| ||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44303927 tccttttgtatctcttttt---aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 44303993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34256788 - 34256537
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tca 183  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||  | | |||  |||    
T  34256788 acttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatca 34256691  T
Q  184 ttgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtat 274  Q
    ||||||||||||       |||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||    
T  34256690 ttgagtgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtat 34256593  T
Q  275 cctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34256592 c-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagt 34256537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1746366 - 1746253
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1746366 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc-tctttg--aagaactcatt-gatagtggattgga 1746272  T
Q  311 gagttcaatctctcctcca 329  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1746271 gagttcaatctctcctcca 1746253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 43036299 - 43036559
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg---ta 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    |    
T  43036299 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 43036396  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | || ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||     
T  43036397 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaat 43036495  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
     |  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43036496 tcatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtggatttgagagatcaatctctcctccaga 43036559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 42498070 - 42498332
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| | | ||||||||||  |||    
T  42498070 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacgttgtaaacaccttggtgag 42498167  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| || |||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42498168 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 42498266  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | ||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42498267 ccttttgtatt-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 42498332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 15212662 - 15212922
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  15212662 agagagaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 15212759  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
    | || ||||||||| |||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15212760 gtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 15212858  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15212859 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccaga 15212922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19945509 - 19945389
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 308  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||  ||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  19945509 gggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattg 19945414  T
Q  309 gagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  19945413 gagagttcaatctctcctcgagagt 19945389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 33352026 - 33352286
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  33352026 agagagaaacttgggaaatcaaagaaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 33352123  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 265  Q
      || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  33352124 ttgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaac 33352222  T
Q  266 ctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33352223 ccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 33352286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 331
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321216
Alignment:
Q  195 ggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactc 292  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||| | |||||||| |||||    
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatc-tctttgtaaa-aactc 40321178  T
Q  293 atttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40321179 -tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 40321216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42435021
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 42435063  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42435062 tcatt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagt 42435021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 333
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328918
Alignment:
Q  196 gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtatcctttttgtaaagaactc 292  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||||||   | ||||||| | ||||||| ||||||    
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatc-tctttgtaa-gaactc 40328878  T
Q  293 atttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40328879 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 40328918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283662
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 4283620  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  4283621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagt 4283662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 27811154 - 27811414
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    |    
T  27811154 agagagaaaattgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttgggtga 27811251  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||     
T  27811252 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 27811350  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||  |||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  27811351 ccatttgtat-ctctttgt-aagaaccca-ttgatagtggattgaagagatcaatctctcccccaga 27811414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 331
Target Start/End: Original strand, 30143346 - 30143476
Alignment:
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcattt 296  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| |||||||||     
T  30143346 agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt- 30143441  T
Q  297 gatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30143442 gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 30143476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 31043131 - 31043189
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31043131 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 31043189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 265
Target Start/End: Original strand, 10929685 - 10929871
Alignment:
Q  87 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg---tagagagaatc 182  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||   ||| || ||||    
T  10929685 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtt--ggggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaacattgtaaacaccttggattagtgaaaatc 10929781  T
Q  183 attgagtgtc-------ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 265  Q
    ||||||||||       |||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  10929782 attgagtgtcttgttctttggtgagatatggaaaatgggtagaaatta-tgtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 10929871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12702783 - 12702672
Alignment:
Q  212 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  12702783 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtc-tctttgtaa-gaactcatt-gatattggattgg 12702688  T
Q  310 agagttcaatctctcc 325  Q
    |||| |||||||||||    
T  12702687 agagatcaatctctcc 12702672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 325
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353923
Alignment:
Q  196 gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactca 293  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| |||||||||    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtat-ctctttgt-aagaactca 44353892  T
Q  294 tttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
     |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  44353893 -ttgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1345484 - 1345401
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaacctct-tgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1345484 aagctaatttcttgtaacccatatgtatc-tctttg-aaagaactcatt-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagt 1345401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 4731534 - 4731794
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---a 173  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  4731534 agagagaaacttgaaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 4731631  T
Q  174 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa- 264  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||| || ||| ||||||||||||||||| | || | |||| |||||  || ||||||||||||||     
T  4731632 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaac 4731730  T
Q  265 cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  4731731 ccatttgtat-ctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcgatctctcccccaga 4731794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 313
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765863
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctctttgt-aagaac 9765841  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagag 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  9765842 tca-ttgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655534
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 18655496  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctcca 329  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18655497 tcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctcca 18655534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26288292 - 26288234
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26288292 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26288234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26301549 - 26301491
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26301549 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26301491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26313543 - 26313485
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26313543 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26313485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291737
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| |  |||||| |  ||||| |||||     
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-cactttgt-aagaat 30291703  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30291704 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc 30291737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 331
Target Start/End: Original strand, 5689326 - 5689407
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5689326 aagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 5689407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221881
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 40221841  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40221842 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 40221881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141950
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||  ||| |||| ||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaa-gaac 18141916  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18141917 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc 18141950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303708
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||| | |||| |||| | || ||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-agtttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 3303742  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3303741 tca-ttgatagtggattgaagagatcaatctctcc 3303708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 7597669 - 7597745
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7597669 aagctaatttcttataatccttttgtatc-tctttgtaaagaatgcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 7597745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41366727 - 41366652
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41366727 aagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaa-gaactcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc 41366652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 151
Target Start/End: Original strand, 30143218 - 30143289
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30143218 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttg 30143289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 325
Target Start/End: Original strand, 1822313 - 1822423
Alignment:
Q  215 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatc-ctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 312  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||| |  |||||| ||||||||    
T  1822313 tagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc-cttttatatctatttgtaaataactcacta-atagtgaattggaga 1822410  T
Q  313 gttcaatctctcc 325  Q
    | |||||||||||    
T  1822411 gatcaatctctcc 1822423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 325
Target Start/End: Original strand, 1856758 - 1856868
Alignment:
Q  215 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtatc-ctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 312  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||| |  |||||| ||||||||    
T  1856758 tagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc-cttttatatctatttgtaaataactcacta-atagtgaattggaga 1856855  T
Q  313 gttcaatctctcc 325  Q
    | |||||||||||    
T  1856856 gatcaatctctcc 1856868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4743291 - 4743252
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4743291 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 4743252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10930267 - 10930231
Alignment:
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10930267 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaga 10930231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 6081 - 6411
Alignment:
Q  1 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagag--agagacttgggaaatc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6081 gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag---gttggaagagagagagacttgggaaatc 6177  T
Q  99 aaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 198  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178 aaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtg 6277  T
Q  199 agatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttga 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6278 aga-ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 6376  T
Q  299 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6377 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagt 6411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11529 - 11191
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11529 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaa 11433  T
Q  101 aggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtg------ 190  Q
    |||| | | |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| |  ||||||||||||          
T  11432 agggagtaactctagggtttatgg-tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgt 11334  T
Q  191 tcttggtgagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaag 287  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||    
T  11333 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgt-aag 11236  T
Q  288 aactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235 aactc-gttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 11191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9102 - 8765
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagaga--cttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9102 aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttga---agagagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaa 9006  T
Q  102 ggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtg------t 191  Q
    ||| | | ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | ||| ||||||  ||| |  || |||||||||      |    
T  9005 gggagtaactctaggctttaggg-tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaagaccttggtgagtgtaaaccattgagtgtcttgtt 8907  T
Q  192 cttggtgagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcctttttgtaaaga 288  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  || |||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||    
T  8906 cttggtgagattgggagaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgt-aaga 8809  T
Q  289 actcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8808 actc-gttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 8765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 434409 - 434671
Alignment:
Q  79 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagag 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||    
T  434409 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgag 434506  T
Q  177 agaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagatttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 265  Q
     |||  |||||||||||||||       |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  434507 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 434605  T
Q  266 c-tcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    | | ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434606 ccttttgtatc-tctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 434671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 707 - 1053
Alignment:
Q  3 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt--gaagtgag------agagttggaagagagag--acttgg 92  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | |||       ||| | ||||||||||  ||||||    
T  707 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttggatgagctagaagagagagaaacttgg 806  T
Q  93 gaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg--tagagagaatcattgag 188  Q
    |||||||||||  | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||    
T  807 gaaatcaaaggcagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgag 904  T
Q  189 tg------tcttggtgagatttgg-gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatccttt 279  Q
    ||      ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |    
T  905 tgtcttgttcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctct 1002  T
Q  280 ttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1003 ttg--aacaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11695
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgt-aagaac 11653  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11654 tca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 11695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 22146 - 22286
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagagttggaagagagag--acttgggaaatcaaa 101  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  22146 aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag---gtgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaa 22242  T
Q  102 ggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctt 145  Q
    ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22243 gggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt 22286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114740
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatc-tctttgtaa-gaac 114698  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  114699 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 114740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18037
Alignment:
Q  213 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 310  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  18151 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat-ctctttgtaa--aactca-ttgatagtggattgga 18057  T
Q  311 gagttcaatctctcctccag 330  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18056 gagatcaatctctcctccag 18037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7465
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 7423  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  7424 tcatt-gatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagt 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 17638 - 17695
Alignment:
Q  4 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 61  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17638 aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 17695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20447
Alignment:
Q  193 ttggtgagatttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcctttttgtaaagaac 290  Q
    ||||||||||| || ||| | | |||||||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaa-gaac 20487  T
Q  291 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccaga 331  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20486 tc-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccaga 20447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 149174 - 149127
Alignment:
Q  285 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  149174 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagt 149127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 333
Target Start/End: Original strand, 10589 - 10627
Alignment:
Q  295 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagt 333  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10589 ttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagt 10627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27556 - 27480
Alignment:
Q  248 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcc 325  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27556 aagctaatttcttgtaactcatttgtatc-tctttgtaaataacttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 27480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University