View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18686_low_14 (Length: 352)

Name: NF18686_low_14
Description: NF18686
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18686_low_14
NF18686_low_14
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (152-345)||(6330942-6331136)
chr6 (152-345)||(23986347-23986541)
chr6 (152-336)||(3652408-3652593)
chr6 (156-336)||(20126221-20126402)
chr6 (152-346)||(20896717-20896912)
chr6 (228-345)||(16519967-16520084)
chr6 (228-340)||(14771754-14771866)
chr6 (152-345)||(2681246-2681440)
chr6 (227-329)||(17731159-17731261)
chr6 (152-336)||(21311893-21312078)
chr6 (208-345)||(23776420-23776557)
chr6 (152-329)||(2720610-2720788)
chr6 (224-345)||(7911873-7911994)
chr6 (224-345)||(7912305-7912426)
chr6 (224-345)||(13492784-13492905)
chr6 (224-329)||(17027577-17027682)
chr6 (228-336)||(31821731-31821839)
chr6 (152-345)||(20850243-20850437)
chr6 (224-345)||(13191543-13191664)
chr6 (229-345)||(9352062-9352178)
chr6 (155-345)||(15929507-15929698)
chr6 (224-318)||(9440485-9440579)
chr6 (218-336)||(11062275-11062392)
chr6 (228-345)||(9440339-9440456)
chr6 (204-336)||(17851349-17851481)
chr6 (230-345)||(20735696-20735811)
chr6 (218-329)||(27334150-27334261)
chr6 (218-329)||(27394890-27395001)
chr6 (154-298)||(3652903-3653048)
chr6 (228-329)||(21311514-21311615)
chr6 (249-345)||(15929219-15929315)
chr6 (231-329)||(32292887-32292985)
chr6 (231-336)||(28065877-28065982)
chr6 (208-336)||(17850897-17851025)
chr6 (265-345)||(20732614-20732694)
chr6 (265-326)||(10964340-10964401)
chr6 (294-345)||(13492397-13492448)
chr6 (228-326)||(2890888-2890985)
chr6 (278-336)||(28583012-28583070)
chr6 (274-346)||(9440886-9440958)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (152-336)||(33174880-33175065)
chr2 (152-336)||(1706964-1707148)
chr2 (208-345)||(33174484-33174619)
chr2 (208-345)||(11388168-11388303)
chr2 (152-336)||(18447957-18448142)
chr2 (224-345)||(30966229-30966350)
chr2 (208-336)||(18098917-18099045)
chr2 (214-336)||(1912510-1912632)
chr2 (228-336)||(1953154-1953262)
chr2 (154-336)||(38898951-38899134)
chr2 (155-345)||(41754214-41754405)
chr2 (152-345)||(29804604-29804798)
chr2 (224-345)||(30966685-30966806)
chr2 (152-345)||(25338027-25338221)
chr2 (152-336)||(25434095-25434280)
chr2 (237-345)||(8256534-8256642)
chr2 (224-336)||(24818321-24818433)
chr2 (225-345)||(29259650-29259770)
chr2 (221-336)||(16379385-16379500)
chr2 (230-336)||(16378938-16379044)
chr2 (227-345)||(5399847-5399965)
chr2 (240-329)||(8181397-8181486)
chr2 (249-345)||(11394555-11394650)
chr2 (218-329)||(15619887-15619998)
chr2 (228-339)||(30961919-30962038)
chr2 (238-336)||(30963759-30963857)
chr2 (152-345)||(33770932-33771117)
chr2 (228-329)||(16541984-16542085)
chr2 (265-336)||(8073928-8073999)
chr2 (224-329)||(83012-83117)
chr2 (231-336)||(30963302-30963407)
chr2 (228-336)||(27882965-27883073)
chr2 (239-290)||(9909102-9909153)
chr2 (265-336)||(13191010-13191081)
chr2 (279-334)||(20502073-20502128)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (152-345)||(50398562-50398756)
chr4 (224-345)||(44471349-44471470)
chr4 (152-345)||(50399017-50399210)
chr4 (154-345)||(4127461-4127654)
chr4 (209-329)||(29628707-29628827)
chr4 (208-318)||(53854858-53854968)
chr4 (152-336)||(1645782-1645967)
chr4 (228-345)||(4127913-4128030)
chr4 (209-336)||(3169186-3169313)
chr4 (152-345)||(12692023-12692217)
chr4 (155-336)||(23942822-23943001)
chr4 (204-345)||(1464122-1464263)
chr4 (227-336)||(14572183-14572292)
chr4 (224-345)||(23350307-23350428)
chr4 (224-336)||(35871623-35871735)
chr4 (224-336)||(44470907-44471019)
chr4 (218-336)||(21220364-21220482)
chr4 (152-329)||(51331321-51331499)
chr4 (224-345)||(49998631-49998752)
chr4 (156-336)||(9423891-9424072)
chr4 (210-329)||(53996155-53996274)
chr4 (232-345)||(8467824-8467937)
chr4 (209-345)||(24629457-24629593)
chr4 (208-336)||(21067261-21067389)
chr4 (223-346)||(24629000-24629126)
chr4 (224-346)||(14571744-14571866)
chr4 (224-346)||(41869913-41870035)
chr4 (159-329)||(21067666-21067834)
chr4 (152-336)||(27026426-27026610)
chr4 (231-339)||(24271580-24271690)
chr4 (224-334)||(17028869-17028979)
chr4 (228-326)||(27578952-27579050)
chr4 (264-345)||(7678646-7678727)
chr4 (208-336)||(14351774-14351902)
chr4 (240-336)||(43928996-43929092)
chr4 (209-336)||(13613930-13614057)
chr4 (233-336)||(42838628-42838730)
chr4 (152-345)||(31817422-31817616)
chr4 (231-344)||(52048691-52048804)
chr4 (269-345)||(27029317-27029393)
chr4 (224-339)||(17029325-17029440)
chr4 (232-339)||(53391890-53391997)
chr4 (279-345)||(17628561-17628627)
chr4 (279-345)||(31817876-31817942)
chr4 (279-336)||(23943275-23943332)
chr4 (231-340)||(26200314-26200425)
chr4 (207-247)||(44830977-44831017)
chr4 (227-262)||(35477801-35477836)
chr4 (214-252)||(10165939-10165977)
chr4 (167-252)||(33987188-33987274)
chr4 (227-336)||(13266084-13266193)
chr4 (283-336)||(23976252-23976305)
chr4 (267-336)||(33764898-33764967)
chr4 (236-316)||(2499647-2499727)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (208-336)||(18173-18301)
scaffold0047 (208-328)||(17645-17765)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (208-336)||(2044037-2044165)
chr8 (152-336)||(8080381-8080566)
chr8 (152-336)||(22840568-22840753)
chr8 (152-336)||(27022377-27022562)
chr8 (152-336)||(28453261-28453445)
chr8 (224-345)||(34308509-34308630)
chr8 (234-329)||(17103086-17103181)
chr8 (215-326)||(29971450-29971561)
chr8 (224-323)||(34308991-34309090)
chr8 (152-345)||(10844805-10844999)
chr8 (152-345)||(22549025-22549219)
chr8 (152-345)||(41659135-41659328)
chr8 (224-345)||(25147531-25147652)
chr8 (152-345)||(22026301-22026495)
chr8 (228-336)||(6464949-6465057)
chr8 (209-345)||(27925879-27926015)
chr8 (218-345)||(12827284-12827411)
chr8 (238-336)||(22705181-22705279)
chr8 (223-329)||(33852304-33852410)
chr8 (224-345)||(12100687-12100807)
chr8 (152-345)||(27021909-27022107)
chr8 (208-345)||(28375084-28375221)
chr8 (152-345)||(22548579-22548773)
chr8 (228-346)||(27819275-27819393)
chr8 (224-345)||(25147962-25148083)
chr8 (264-335)||(3744673-3744744)
chr8 (218-329)||(32292386-32292497)
chr8 (232-345)||(10844645-10844758)
chr8 (227-336)||(21316148-21316257)
chr8 (224-345)||(25144767-25144888)
chr8 (229-342)||(17429501-17429613)
chr8 (152-292)||(25307687-25307828)
chr8 (228-329)||(30334954-30335055)
chr8 (265-329)||(1297043-1297107)
chr8 (241-336)||(15568044-15568139)
chr8 (267-337)||(36968433-36968503)
chr8 (224-329)||(15567602-15567707)
chr8 (273-336)||(3745145-3745208)
chr8 (265-334)||(41913006-41913075)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (1-130)||(5968981-5969100)
chr7 (152-336)||(6747637-6747822)
chr7 (208-345)||(42515523-42515660)
chr7 (152-336)||(2611691-2611876)
chr7 (224-345)||(9124954-9125075)
chr7 (227-336)||(42515090-42515199)
chr7 (156-329)||(26957603-26957777)
chr7 (152-345)||(34405621-34405815)
chr7 (224-345)||(2941787-2941908)
chr7 (224-336)||(11517428-11517539)
chr7 (210-345)||(28495835-28495970)
chr7 (223-345)||(6719104-6719226)
chr7 (208-340)||(679796-679927)
chr7 (231-329)||(25182363-25182461)
chr7 (218-336)||(43233402-43233520)
chr7 (228-336)||(29039059-29039167)
chr7 (228-336)||(35474160-35474268)
chr7 (209-336)||(2193236-2193363)
chr7 (224-345)||(13125166-13125287)
chr7 (228-345)||(36422251-36422368)
chr7 (228-345)||(46425740-46425857)
chr7 (224-336)||(5406627-5406739)
chr7 (228-336)||(28495647-28495755)
chr7 (152-310)||(3305377-3305536)
chr7 (224-345)||(18833281-18833402)
chr7 (278-339)||(26421341-26421402)
chr7 (155-345)||(2189069-2189260)
chr7 (218-346)||(22529264-22529392)
chr7 (264-329)||(2465959-2466024)
chr7 (208-345)||(29357486-29357622)
chr7 (228-345)||(31406614-31406731)
chr7 (209-329)||(33316707-33316828)
chr7 (273-345)||(2465777-2465849)
chr7 (218-346)||(35527150-35527278)
chr7 (209-336)||(9623188-9623315)
chr7 (224-319)||(13124757-13124852)
chr7 (218-334)||(36015452-36015568)
chr7 (233-339)||(20966055-20966161)
chr7 (264-328)||(11372486-11372550)
chr7 (258-309)||(16811912-16811963)
chr7 (283-329)||(6585662-6585708)
chr7 (224-345)||(31743854-31743975)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (152-345)||(43057553-43057747)
chr1 (152-336)||(30872989-30873175)
chr1 (152-345)||(43057095-43057288)
chr1 (228-345)||(50002737-50002854)
chr1 (152-345)||(16451963-16452157)
chr1 (152-345)||(16461116-16461310)
chr1 (152-345)||(20054110-20054304)
chr1 (152-345)||(20054566-20054760)
chr1 (152-345)||(20055022-20055216)
chr1 (152-345)||(20055478-20055672)
chr1 (152-345)||(20055934-20056128)
chr1 (152-345)||(20056390-20056584)
chr1 (152-345)||(20057293-20057487)
chr1 (227-336)||(35760953-35761062)
chr1 (218-345)||(50002315-50002442)
chr1 (152-345)||(20845691-20845885)
chr1 (227-345)||(35759638-35759756)
chr1 (152-345)||(52250128-52250322)
chr1 (229-345)||(31822693-31822809)
chr1 (209-345)||(38340886-38341022)
chr1 (152-336)||(12883446-12883631)
chr1 (224-345)||(20061221-20061342)
chr1 (224-336)||(2328310-2328422)
chr1 (224-340)||(7548086-7548202)
chr1 (218-345)||(20057749-20057876)
chr1 (154-336)||(51372913-51373096)
chr1 (208-326)||(10820571-10820689)
chr1 (227-345)||(46693765-46693884)
chr1 (223-346)||(50003104-50003227)
chr1 (152-345)||(20056846-20057031)
chr1 (227-329)||(23180728-23180830)
chr1 (228-345)||(2634923-2635040)
chr1 (264-345)||(12728026-12728108)
chr1 (265-346)||(16907270-16907351)
chr1 (284-345)||(20060370-20060431)
chr1 (261-329)||(2739554-2739622)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (152-336)||(30529609-30529794)
chr3 (208-336)||(39640916-39641044)
chr3 (154-345)||(28561670-28561862)
chr3 (208-336)||(20885156-20885283)
chr3 (153-336)||(32227260-32227444)
chr3 (208-336)||(25230744-25230872)
chr3 (208-336)||(25238331-25238459)
chr3 (225-345)||(41472297-41472416)
chr3 (152-345)||(16811303-16811497)
chr3 (152-345)||(39653086-39653280)
chr3 (224-345)||(31284306-31284427)
chr3 (229-345)||(7493881-7493997)
chr3 (208-329)||(25230294-25230415)
chr3 (208-329)||(25237881-25238002)
chr3 (152-336)||(50347668-50347853)
chr3 (237-345)||(11180064-11180172)
chr3 (228-336)||(32796974-32797082)
chr3 (207-346)||(13150128-13150267)
chr3 (218-345)||(14813938-14814065)
chr3 (229-329)||(7477191-7477291)
chr3 (228-336)||(25239116-25239224)
chr3 (225-329)||(41473993-41474097)
chr3 (152-345)||(16810847-16811041)
chr3 (208-345)||(32227480-32227616)
chr3 (208-329)||(37045014-37045135)
chr3 (224-336)||(25248106-25248218)
chr3 (218-340)||(2911084-2911206)
chr3 (227-336)||(8067278-8067387)
chr3 (265-346)||(32386763-32386844)
chr3 (269-336)||(25238723-25238790)
chr3 (152-322)||(25803057-25803228)
chr3 (231-345)||(29224326-29224440)
chr3 (272-345)||(13150584-13150657)
chr3 (281-336)||(4067399-4067454)
chr3 (227-325)||(27187380-27187478)
chr3 (209-336)||(14820134-14820261)
chr3 (238-345)||(25802578-25802685)
chr3 (265-336)||(31103999-31104070)
chr3 (224-288)||(12820639-12820703)
chr3 (279-336)||(47518358-47518415)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (152-345)||(2664-2858)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (210-336)||(10927442-10927568)
chr5 (152-345)||(42788676-42788869)
chr5 (152-336)||(20039513-20039698)
chr5 (209-336)||(39146919-39147046)
chr5 (210-336)||(17445494-17445620)
chr5 (224-345)||(3887087-3887208)
chr5 (153-336)||(10926985-10927170)
chr5 (152-345)||(2193738-2193932)
chr5 (224-329)||(189063-189168)
chr5 (224-345)||(2474400-2474521)
chr5 (214-345)||(42429131-42429261)
chr5 (224-345)||(2473954-2474075)
chr5 (224-345)||(22556531-22556652)
chr5 (208-336)||(27646874-27647002)
chr5 (209-345)||(34867770-34867906)
chr5 (227-336)||(1821904-1822013)
chr5 (228-345)||(8391352-8391468)
chr5 (224-345)||(22556964-22557085)
chr5 (228-340)||(2058691-2058803)
chr5 (208-340)||(11160716-11160848)
chr5 (227-345)||(8642064-8642182)
chr5 (152-336)||(4658032-4658216)
chr5 (227-345)||(3886631-3886749)
chr5 (152-345)||(34371534-34371728)
chr5 (152-345)||(34371990-34372184)
chr5 (218-345)||(21886176-21886303)
chr5 (231-329)||(16370754-16370852)
chr5 (211-336)||(5066930-5067055)
chr5 (208-345)||(18304410-18304547)
chr5 (215-336)||(15513051-15513173)
chr5 (224-309)||(22975076-22975161)
chr5 (239-298)||(29680177-29680236)
chr5 (267-336)||(24182284-24182353)
chr5 (224-329)||(5549339-5549445)
chr5 (243-345)||(18750226-18750328)
chr5 (267-336)||(39801501-39801571)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (224-345)||(162708-162829)
scaffold0022 (265-328)||(69862-69925)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (224-345)||(107493-107614)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (224-345)||(2240-2361)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (227-336)||(245084-245193)
scaffold0005 (224-346)||(245510-245632)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (224-345)||(105715-105836)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (224-336)||(142313-142425)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (152-345)||(1142-1336)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (224-329)||(18961-19066)
scaffold0322 (225-292)||(18204-18271)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (224-336)||(10295-10407)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (207-346)||(154735-154874)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (223-345)||(2081-2203)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (218-336)||(23662-23780)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (209-345)||(4541-4677)
scaffold0333 (209-345)||(4996-5137)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (229-342)||(45387-45499)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (227-336)||(4021-4130)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (208-277)||(729-798)
scaffold0557 (274-336)||(2150-2212)
[»] scaffold1138 (1 HSPs)
scaffold1138 (260-298)||(774-812)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6331136 - 6330942
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||  ||    
T  6331136 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagatgga 6331037  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  6331036 tcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaatatgcatcttcttttc 6330942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23986541 - 23986347
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23986541 ggctgacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 23986442  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  23986441 tccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaacaagatgcatcttcttttc 23986347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 3652408 - 3652593
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  3652408 ggctgatgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 3652507  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3652508 tcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaacaagatgcat 3652593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20126402 - 20126221
Alignment:
Q  156 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 254  Q
    ||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||   |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20126402 gacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcctgacaacttctagacaagctgaatcacatcggaatgagagggatcct 20126303  T
Q  255 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
     | || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20126302 aaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatcaacaagatgcat 20126221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20896912 - 20896717
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | |  | || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  20896912 ggctgacgaggacggagagtggtcgccgttgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 20896813  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  20896812 tccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttca 20896717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 16519967 - 16520084
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16519967 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaac 16520066  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  16520067 aagatgcatcttcttttc 16520084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14771866 - 14771754
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14771866 gaatcacgccggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 14771767  T
Q  328 aacatgcatattc 340  Q
    || || |||||||    
T  14771766 aagatccatattc 14771754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2681440 - 2681246
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||  |||||||| | ||   ||||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  2681440 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtacacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagtttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 2681341  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  2681340 tcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaacaagatgcatcttcttttc 2681246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17731261 - 17731159
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17731261 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 17731162  T
Q  327 caa 329  Q
    |||    
T  17731161 caa 17731159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 21311893 - 21312078
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| || |||||| ||||||||| ||||  ||| | ||| || | ||||||||||||| | ||||||||| |     
T  21311893 ggctgacgagggcgggaagtggtcgccagtgcacaaggcacaacaatgagcgactcccgatagcttctaaaggaactgaatcacaccagaatgagagggt 21311992  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || ||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21311993 tcatgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaagatgcat 21312078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 23776420 - 23776557
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23776420 cgacagcttctagaggaactgaatcacgccggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgt 23776519  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
     || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  23776520 ctggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 23776557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2720788 - 2720610
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||| ||  |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||  ||||| | ||||||||||| ||    
T  2720788 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaagtcacgacaatgagcgacttcggacagcttctagacgaaccaaatcataccggaatgagaggga 2720689  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||  | | |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2720688 tcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaa 2720610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 7911873 - 7911994
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7911873 aactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtataggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatat 7911972  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  7911973 caacaagatgcatcttcttttc 7911994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 7912305 - 7912426
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  7912305 aactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatat 7912404  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  7912405 caacaagatgcattttcttttc 7912426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 13492784 - 13492905
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  13492784 aactgaatcatatcggaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatat 13492883  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  13492884 caacaagatgcatcttcttttc 13492905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17027682 - 17027577
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17027682 aactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 17027583  T
Q  324 caacaa 329  Q
    ||||||    
T  17027582 caacaa 17027577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31821839 - 31821731
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  31821839 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactatatcaac 31821740  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
    || ||||||    
T  31821739 aagatgcat 31821731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 20850243 - 20850437
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20850243 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20850342  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20850343 tcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20850437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13191664 - 13191543
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |  | |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13191664 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 13191565  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  13191564 caacaagatgcatcttcttttc 13191543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 345
Target Start/End: Original strand, 9352062 - 9352178
Alignment:
Q  229 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  9352062 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaaca 9352161  T
Q  329 acatgcatattcatttc 345  Q
    | |||||| ||| ||||    
T  9352162 agatgcatcttcttttc 9352178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 15929507 - 15929698
Alignment:
Q  155 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 253  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||  || |||||||||| |||||||| | ||   |||||||| |||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  15929507 tgacgagggccgggtgtggtcgttggtgcataaggcatgacaatgagcggctccggacaacttctagatgaatcgaatcacatcagaataagagagatcc 15929606  T
Q  254 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    | | ||| | || ||||  ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  15929607 taatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaaaatgcatcttcttttc 15929698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9440579 - 9440485
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  9440579 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacc 9440485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 336
Target Start/End: Original strand, 11062275 - 11062392
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||    
T  11062275 tagaggaaccgaatcacatcgacatgagag-gatcctgaggctgtgtaggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactac 11062373  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  11062374 ctatatcaacaagatgcat 11062392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9440456 - 9440339
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||  |||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9440456 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattgttcggtactacttatatcaac 9440357  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  9440356 aagatgcattttcttttc 9440339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 336
Target Start/End: Original strand, 17851349 - 17851481
Alignment:
Q  204 ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaa 303  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||  |||||| || |||| ||||| |||     
T  17851349 ctttagacaacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagat 17851448  T
Q  304 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
     |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17851449 atgtttggtactacctttatcaacaagatgcat 17851481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 345
Target Start/End: Original strand, 20735696 - 20735811
Alignment:
Q  230 atcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||  | || |||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20735696 atcacatcataatgagagggatcttgagactgtgtaggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaa 20735795  T
Q  330 catgcatattcatttc 345  Q
     |||||| ||| ||||    
T  20735796 gatgcatcttcttttc 20735811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 329
Target Start/End: Original strand, 27334150 - 27334261
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| | |||  |||||||  |||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27334150 tagaggaactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactac 27334249  T
Q  318 ctatatcaacaa 329  Q
    ||||||||||||    
T  27334250 ctatatcaacaa 27334261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 329
Target Start/End: Original strand, 27394890 - 27395001
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| | |||  |||||||  |||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27394890 tagaggaactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactac 27394989  T
Q  318 ctatatcaacaa 329  Q
    ||||||||||||    
T  27394990 ctatatcaacaa 27395001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 298
Target Start/End: Original strand, 3652903 - 3653048
Alignment:
Q  154 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 252  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  3652903 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagatgaaccgactcacatcggaatgagagggatc 3653002  T
Q  253 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 298  Q
    |||| || || |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  3653003 ctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttat 3653048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 21311514 - 21311615
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| || |||    
T  21311514 gaatcacatcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaac 21311613  T
Q  328 aa 329  Q
    ||    
T  21311614 aa 21311615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 345
Target Start/End: Original strand, 15929219 - 15929315
Alignment:
Q  249 gatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  15929219 gatcctgaggccgtttaggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattcttttc 15929315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 329
Target Start/End: Original strand, 32292887 - 32292985
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |   |||  ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32292887 tcacattggaatgagagaaatccttagatcgtgcaggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaa 32292985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28065982 - 28065877
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||  |||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  28065982 tcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaag 28065883  T
Q  331 atgcat 336  Q
    ||||||    
T  28065882 atgcat 28065877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Original strand, 17850897 - 17851025
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| ||||  |||||| || |||  || || |||  |||    
T  17850897 cgacaacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgt 17850996  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17850997 ttggtactacctttatcaacaagatgcat 17851025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 20732614 - 20732694
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  20732614 aggtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattcttttc 20732694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 326
Target Start/End: Original strand, 10964340 - 10964401
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10964340 aggtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaa 10964401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 345
Target Start/End: Original strand, 13492397 - 13492448
Alignment:
Q  294 cttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  13492397 cttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 13492448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2890985 - 2890888
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  2890985 gaatcacattagaatgagag-gatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaa 2890888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 336
Target Start/End: Original strand, 28583012 - 28583070
Alignment:
Q  278 tatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28583012 tatggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaacaagatgcat 28583070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9440958 - 9440886
Alignment:
Q  274 actatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  9440958 actacatggttgaaggaatgcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttca 9440886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 33174880 - 33175065
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  33174880 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagtggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 33174979  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33174980 tcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 33175065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 1706964 - 1707148
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1706964 ggctaacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaatttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagag-ga 1707062  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||  | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1707063 tcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 1707148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 33174484 - 33174619
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33174484 cgacagcttctagacgaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgt 33174581  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  33174582 ttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 33174619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 11388168 - 11388303
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||    
T  11388168 cgacaacttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagag-gatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgctta-aaaaattgt 11388265  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11388266 ttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 11388303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18448142 - 18447957
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttc-gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | || || ||||||  ||||||||   || | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  18448142 ggctggcgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggttcccgacagcttttagaggaaccgaatcacatcggaatgataggga 18448043  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||    
T  18448042 tcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaacaagatgcat 18447957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 30966229 - 30966350
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30966229 aactgaatcgcatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 30966328  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  30966329 caacaagatgcatcttcttttc 30966350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18099045 - 18098917
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18099045 cgacagcttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgt 18098946  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18098945 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 18098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 336
Target Start/End: Original strand, 1912510 - 1912632
Alignment:
Q  214 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgata 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   | |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||    
T  1912510 cttttagaggaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggta 1912609  T
Q  314 ctacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  1912610 ctacctatatcaacaagatgcat 1912632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Original strand, 1953154 - 1953262
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1953154 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacctatatcaac 1953253  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
     | ||||||    
T  1953254 tagatgcat 1953262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38899134 - 38898951
Alignment:
Q  154 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||| | |||||| | ||  ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  38899134 ctgacgagggcggggagtggtcgttggtgcataagacatgaaaatgagtggctcccgacaacttctagacaagccaaatcacatcggaaggagagtgatc 38899035  T
Q  253 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
     ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38899034 ttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 38898951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 41754214 - 41754405
Alignment:
Q  155 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||     
T  41754214 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggttct 41754313  T
Q  254 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  41754314 tgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttc 41754405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 29804604 - 29804798
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  | |||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  29804604 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgataatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 29804703  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29804704 tcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 29804798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 30966685 - 30966806
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30966685 aactgaatcgcatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatat 30966784  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  30966785 caacaagatgcatcttcttttc 30966806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25338221 - 25338027
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  25338221 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 25338122  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  25338121 tcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 25338027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25434280 - 25434095
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  25434280 ggctgacgagggcggggagtggccgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctaaacgaaccgaatcacaccggaatgagaggga 25434181  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| |||||   |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25434180 tcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaacaagatgcat 25434095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 345
Target Start/End: Original strand, 8256534 - 8256642
Alignment:
Q  237 cggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  8256534 cggaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 8256633  T
Q  337 attcatttc 345  Q
     ||| ||||    
T  8256634 cttcttttc 8256642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Original strand, 24818321 - 24818433
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  24818321 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatat 24818420  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||||    
T  24818421 caacaagatgcat 24818433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29259770 - 29259650
Alignment:
Q  225 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  29259770 actgaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatc 29259671  T
Q  325 aacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||| |||||| ||| ||||    
T  29259670 aacaagatgcatcttcttttc 29259650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 336
Target Start/End: Original strand, 16379385 - 16379500
Alignment:
Q  221 acgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactaccta 320  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16379385 acgaaccgaatcaaattggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactaccta 16379484  T
Q  321 tatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16379485 tatcaacaagatgcat 16379500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 336
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379044
Alignment:
Q  230 atcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || |||||  | ||||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  330 catgcat 336  Q
     ||||||    
T  16379038 gatgcat 16379044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5399965 - 5399847
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  | ||||| || | ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5399965 tgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgtatggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 5399866  T
Q  327 caacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||| ||| ||||    
T  5399865 caagatgcatcttcttttc 5399847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8181486 - 8181397
Alignment:
Q  240 aatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||||||| ||||| ||  || |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8181486 aatgagagggatcccgagaccttataggtatgggactttgtggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaa 8181397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 345
Target Start/End: Original strand, 11394555 - 11394650
Alignment:
Q  249 gatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11394555 gatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgctta-aaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 11394650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 329
Target Start/End: Original strand, 15619887 - 15619998
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||  || |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15619887 tagacgaaccgaattacatcagaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactac 15619986  T
Q  318 ctatatcaacaa 329  Q
    ||||||||||||    
T  15619987 ctatatcaacaa 15619998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30962038 - 30961919
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttga--------aggaagacttatgagaattgtttgatactacct 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||        |||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  30962038 gaatcacatcagaatgagagagatcctgaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaaggatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacct 30961939  T
Q  320 atatcaacaacatgcatatt 339  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  30961938 atatcaacaagatgcatatt 30961919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30963857 - 30963759
Alignment:
Q  238 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||    
T  30963857 ggaatgagagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcat 30963759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 33770932 - 33771117
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  33770932 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 33771031  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||         |||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  33771032 tcctga---------ggtatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 33771117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 16541984 - 16542085
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||| |||||| || |||||   ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16541984 gaatcacatcagaatgatagggatcccagagctgtgtaggtatgactctacatggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaac 16542083  T
Q  328 aa 329  Q
    ||    
T  16542084 aa 16542085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 336
Target Start/End: Original strand, 8073928 - 8073999
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  8073928 aggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcat 8073999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 329
Target Start/End: Original strand, 83012 - 83117
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    ||  ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  83012 aactgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagattgtgcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctatac 83111  T
Q  324 caacaa 329  Q
    ||||||    
T  83112 caacaa 83117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30963407 - 30963302
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 330  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||  || |  ||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  30963407 tcacatcagaatgagagggatcatgaagccgcacatgtatatgaatgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaag 30963308  T
Q  331 atgcat 336  Q
    ||||||    
T  30963307 atgcat 30963302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27883073 - 27882965
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||     
T  27883073 gaatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaat 27882974  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
    || ||||||    
T  27882973 aagatgcat 27882965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 290
Target Start/End: Original strand, 9909102 - 9909153
Alignment:
Q  239 gaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaagga 290  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9909102 gaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaagga 9909153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 336
Target Start/End: Original strand, 13191010 - 13191081
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  13191010 aggtataagactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcat 13191081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Original strand, 20502073 - 20502128
Alignment:
Q  279 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgc 334  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  20502073 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaacaagatgc 20502128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50398756 - 50398562
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  50398756 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 50398657  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  50398656 tcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 50398562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44471470 - 44471349
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44471470 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 44471371  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  44471370 caacaagatgcatcttcttttc 44471349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50399210 - 50399017
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||| |||||||| | |||  |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  50399210 ggctgacgagggcggg-agtggtcgccagtgcacaaggcatgacaatgagcggcttctgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 50399112  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  50399111 tcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacacgatgcatcttcttttc 50399017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4127654 - 4127461
Alignment:
Q  154 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaactttta-gacgaactgaatcacatcggaatgagagagat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4127654 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctaagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggat 4127555  T
Q  252 cctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4127554 cctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 4127461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29628827 - 29628707
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29628827 gacagcttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtt 29628728  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaa 329  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  29628727 tggtactacctatatcaacaa 29628707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 53854968 - 53854858
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53854968 cgacagcttatagacgaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgt 53854869  T
Q  308 ttgatactacc 318  Q
    ||| |||||||    
T  53854868 ttggtactacc 53854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1645967 - 1645782
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  1645967 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaa 1645868  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  1645867 tcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcat 1645782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4128030 - 4127913
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4128030 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127931  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  4127930 aagatgcatcttcttttc 4127913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 336
Target Start/End: Original strand, 3169186 - 3169313
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3169186 gacagcttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtt 3169285  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  3169286 tggtactacctatatcaacaagatgcat 3169313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12692217 - 12692023
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  12692217 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 12692118  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12692117 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 12692023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23943001 - 23942822
Alignment:
Q  155 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 254  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  ||||||||  | |  |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23943001 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagctcct--gacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcct 23942904  T
Q  255 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |  ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23942903 ggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 23942822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 345
Target Start/End: Original strand, 1464122 - 1464263
Alignment:
Q  204 ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaa 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||| || || |||||| ||| |||||| ||||    
T  1464122 ctttcgacaccttttagacgaaccgaatcacatcagaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaa 1464221  T
Q  304 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  1464222 ttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 1464263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14572292 - 14572183
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14572292 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 14572193  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
    ||| ||||||    
T  14572192 caagatgcat 14572183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23350428 - 23350307
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23350428 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatat 23350329  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  23350328 caacaagatgcatcttcttttc 23350307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Original strand, 35871623 - 35871735
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  35871623 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatat 35871722  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||||    
T  35871723 caacaagatgcat 35871735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44471019 - 44470907
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44471019 aactgaatcacatcggaatgagagagatcatgacgctgtacaagtatgtgactgtatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 44470920  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||||    
T  44470919 caacaagatgcat 44470907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 218 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21220482 - 21220364
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21220482 tagaggaaccgaatcacatcagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactac 21220383  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  21220382 ctatatcaacaagatgcat 21220364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51331499 - 51331321
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcg-acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||   || |  | ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||  |    
T  51331499 ggctgatgagggcggggagtggttgtcggtgcacaaggcatgataatgagcggttccctataacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggaa 51331400  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51331399 tcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaa 51331321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 49998631 - 49998752
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  49998631 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 49998730  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  49998731 caacaagatgcatcttcttttc 49998752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9424072 - 9423891
Alignment:
Q  156 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||| ||| | ||  |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9424072 gacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaaagagtggctcccgacgacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcct 9423973  T
Q  255 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || | |||  | ||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9423972 gaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 9423891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 53996274 - 53996155
Alignment:
Q  210 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 309  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||  | ||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||    
T  53996274 acaacttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgttt 53996175  T
Q  310 gatactacctatatcaacaa 329  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  53996174 ggtactacctatatcaacaa 53996155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8467937 - 8467824
Alignment:
Q  232 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 331  Q
    |||||| |||||| || ||||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  8467937 cacatcagaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaaga 8467838  T
Q  332 tgcatattcatttc 345  Q
    ||||| ||| ||||    
T  8467837 tgcatcttcttttc 8467824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24629593 - 24629457
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||  |||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  24629593 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtt 24629494  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  24629493 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 24629457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Original strand, 21067261 - 21067389
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| || | |||  | ||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||| |    
T  21067261 cgacaacttatagacgaatcgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattat 21067360  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  21067361 ttggtactacatatatcaacaagatgcat 21067389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24629126 - 24629000
Alignment:
Q  223 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaa---gacttatgagaattgtttgatactacct 319  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24629126 gaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacct 24629027  T
Q  320 atatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  24629026 atatcaacaagatgcatcttcttttca 24629000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14571866 - 14571744
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| |||  |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14571866 aactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatat 14571767  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||||| |||||| ||| |||||    
T  14571766 caacaagatgcatcttcttttca 14571744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 346
Target Start/End: Original strand, 41869913 - 41870035
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |  |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41869913 aactaaatcacatcggagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatat 41870012  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||||| | |||| ||| |||||    
T  41870013 caacaagacgcatcttcttttca 41870035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 329
Target Start/End: Original strand, 21067666 - 21067834
Alignment:
Q  159 gagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaa 257  Q
    |||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  |||||| || ||||||||| |||||||| | |||||   || |||| ||     
T  21067666 gagggcggggagtggtcgccggtgcagaaggcacgacaatgagcggctcccgacaaattatagacgaaccgaatcacaccagaatg---gaaatcccgag 21067762  T
Q  258 gccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21067763 gccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaa 21067834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 27026426 - 27026610
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||| ||||   |  | ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  27026426 ggctgacgagaacggggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgacaatgagcgactcctggtagcttttaggcaaaccgaatcacatcagaatgagaggga 27026525  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |  || | | ||  ||||||| ||||| | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27026526 tattgga-cggtgcaggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcat 27026610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24271690 - 24271580
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtat--aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||| |  ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  24271690 tcacatcggaatgagagggttcctgaggtcgtgtgcaggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaaca 24271591  T
Q  329 acatgcatatt 339  Q
    | |||||||||    
T  24271590 agatgcatatt 24271580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 334
Target Start/End: Original strand, 17028869 - 17028979
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||||  || ||||||||| || || | ||||||||| | | ||||||||||    
T  17028869 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaagaattgttaggtgctacctatat 17028968  T
Q  324 caacaacatgc 334  Q
    |||||| ||||    
T  17028969 caacaagatgc 17028979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27579050 - 27578952
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||| ||||||||| ||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27579050 gaatcacatcggaataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaa 27578952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7678727 - 7678646
Alignment:
Q  264 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7678727 taggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 7678646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Original strand, 14351774 - 14351902
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| | |||  | ||||||| ||  |||||||||||||| ||| | ||| || |    
T  14351774 cgacaacttctagacaaaccgaatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagtttt 14351873  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  14351874 ttggtactatctatatcaacaagatgcat 14351902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 43929092 - 43928996
Alignment:
Q  240 aatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||  ||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  43929092 aatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcat 43928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13614057 - 13613930
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |  ||  | | ||||||||  ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  13614057 gacaacttttagataaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtt 13613958  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13613957 tgataccacctatatcaacaagatgcat 13613930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 42838628 - 42838730
Alignment:
Q  233 acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacat 332  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  | || || ||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  42838628 acatcagaatgagag-gatcctgagactgtgtaagtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaat 42838726  T
Q  333 gcat 336  Q
    ||||    
T  42838727 gcat 42838730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31817616 - 31817422
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttc-gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||| || ||||||| ||||||||   || | ||||| |||||||| |   ||||||||||| ||| |||| ||    
T  31817616 ggctgacgaggccggggagtggtcaccagtgcacaaggcatgacaatgagcggttcccgacaatttttagacaaggagaatcacatcgaaataagaggga 31817517  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || ||| | |||  | ||||||||||  |||||||||||||   |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  31817516 tcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaacaaaatgcatcttcttttc 31817422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 52048804 - 52048691
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 330  Q
    |||| |||||||||||| | |||| | |||||| |||||||| |||  || | |||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  52048804 tcacgtcggaatgagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtatactaacaag 52048705  T
Q  331 atgcatattcattt 344  Q
    |||||| |||||||    
T  52048704 atgcatcttcattt 52048691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Original strand, 27029317 - 27029393
Alignment:
Q  269 atgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  27029317 atgagactacacgattgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttc 27029393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 339
Target Start/End: Original strand, 17029325 - 17029440
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  || | |||  | ||||| ||||  || |||||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  17029325 aactgaattacatcggaatgagagggatctagaggtcgtgcaagtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctatat 17029424  T
Q  324 caacaacatgcatatt 339  Q
    |||||| |||||||||    
T  17029425 caacaagatgcatatt 17029440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 339
Target Start/End: Original strand, 53391890 - 53391997
Alignment:
Q  232 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 331  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||   ||||||||||  |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  53391890 cacatcagaatgagagagatcttgaagttgtaagagtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaaga 53391989  T
Q  332 tgcatatt 339  Q
    | ||||||    
T  53391990 tacatatt 53391997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Original strand, 17628561 - 17628627
Alignment:
Q  279 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  17628561 atggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttc 17628627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31817942 - 31817876
Alignment:
Q  279 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  31817942 atggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttc 31817876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23943332 - 23943275
Alignment:
Q  279 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23943332 atggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcat 23943275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26200425 - 26200314
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaaga--cttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    || |||||||| |||   |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  26200425 tcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtttgatactaactatacaaaca 26200326  T
Q  329 acatgcatattc 340  Q
    | ||||||||||    
T  26200325 agatgcatattc 26200314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 247
Target Start/End: Original strand, 44830977 - 44831017
Alignment:
Q  207 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagag 247  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44830977 tcgacaacttttagatgaaccgaatcacatcggaatgagag 44831017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 35477801 - 35477836
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35477801 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgt 35477836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 252
Target Start/End: Original strand, 10165939 - 10165977
Alignment:
Q  214 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10165939 cttttagacgaaccgaatcacatcggaatgagaaagatc 10165977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33987274 - 33987188
Alignment:
Q  167 ggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 252  Q
    |||||||| |||||| || ||||||| |||||||| |||| | | || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33987274 ggagtggtcgtcagtgcacaaggcatgacaatgagcgactcttggcagcttctaggcaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 33987188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Original strand, 13266084 - 13266193
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||  ||||||| || |  |||||||||||||| ||||| | |||| |||  |||| ||||||||||    
T  13266084 tgaatcacattagaatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaa 13266183  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
     || ||||||    
T  13266184 taagatgcat 13266193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23976305 - 23976252
Alignment:
Q  283 ttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  23976305 ttgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcat 23976252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 336
Target Start/End: Original strand, 33764898 - 33764967
Alignment:
Q  267 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  33764898 gtataagactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatgcat 33764967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2499727 - 2499647
Alignment:
Q  236 tcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatacta 316  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||  ||||||||||||  |||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||    
T  2499727 tcggaatgagagggattctaaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaagcaacacttataaaaattgtttggtacta 2499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18301 - 18173
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18301 cgacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgt 18202  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18201 ttgatactacctatatcaacaagatgcat 18173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17645
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||||||| | || |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  17765 cgacaacttcttgaggaaccgaatgacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgt 17666  T
Q  308 ttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  17665 ttggtactacctatatcaaca 17645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Original strand, 2044037 - 2044165
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2044037 cgacaacttctagaggaacagaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 2044136  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2044137 ttgatactacctatatcaacaagatgcat 2044165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8080566 - 8080381
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | || |  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8080566 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcttaacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagaggga 8080467  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8080466 tcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 8080381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22840753 - 22840568
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | || |||||| ||  | |||||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22840753 ggctgacaagggcggggagtggtcgccggtgcataagacacgataatgagcggctcccgataacttctagagtaactgaatcacatcggaatgagagaga 22840654  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22840653 tcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcat 22840568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27022562 - 27022377
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||    
T  27022562 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggagccgaatcacatcggaatgagaggga 27022463  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27022462 tcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaacatgcat 27022377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 28453261 - 28453445
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||  |||||||| | ||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||    
T  28453261 ggctgacgagggcggggagtggttgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttttagatga-ctgaatcacaccggaatgagaggga 28453359  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| || | |||  ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28453360 tcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatattaacaagatgcat 28453445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34308630 - 34308509
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  34308630 aactgaatcacatcggaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatat 34308531  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  34308530 caacaagatgcatcttcttttc 34308509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 329
Target Start/End: Original strand, 17103086 - 17103181
Alignment:
Q  234 catcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17103086 catcggaatgagagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaa 17103181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29971561 - 29971450
Alignment:
Q  215 ttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29971561 ttttagacgaactgaatcacatcagaattggaaggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatac 29971462  T
Q  315 tacctatatcaa 326  Q
    || |||||||||    
T  29971461 tatctatatcaa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34309090 - 34308991
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  34309090 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatat 34308991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 10844805 - 10844999
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  10844805 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 10844904  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10844905 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 10844999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22549219 - 22549025
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||       
T  22549219 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggct 22549120  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  22549119 tcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 22549025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41659328 - 41659135
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||| ||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  41659328 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaag-cacgacaatgagtggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 41659230  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  41659229 tcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 41659135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 25147531 - 25147652
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  25147531 aactaaatcacatcggaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatat 25147630  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  25147631 caacaagatgcatcttcttttc 25147652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 22026301 - 22026495
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  22026301 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 22026400  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || ||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  22026401 tcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 22026495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6465057 - 6464949
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6465057 gaatcacattggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6464958  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
    || ||||||    
T  6464957 aagatgcat 6464949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 345
Target Start/End: Original strand, 27925879 - 27926015
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  27925879 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtt 27925978  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  27925979 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 27926015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12827411 - 12827284
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  12827411 tagaagaaccgaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactac 12827312  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12827311 ctatatcaacaagatgcatcttcttttc 12827284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 336
Target Start/End: Original strand, 22705181 - 22705279
Alignment:
Q  238 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22705181 ggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 22705279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33852410 - 33852304
Alignment:
Q  223 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 322  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33852410 gaactgaatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctata 33852311  T
Q  323 tcaacaa 329  Q
    | |||||    
T  33852310 ttaacaa 33852304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 12100687 - 12100807
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  12100687 aactgaatcacatcgaaatgaga-agatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatat 12100785  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| || |||||| ||| ||||    
T  12100786 caataagatgcatcttcttttc 12100807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27022107 - 27021909
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatga----ga 246  Q
    |||||||||||| |||||||||| |   || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||    ||    
T  27022107 ggctgacgagggtggggagtggtcgcgggtgcacaaggcacgacaatgagtggctcccgacaacttctagaggagccgaatcacatcggaatgaatgaga 27022008  T
Q  247 gagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    | |||||||| ||| | ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  27022007 gggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttc 27021909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28375221 - 28375084
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  28375221 cgacagcttctagacgaaacgaatcacaccataatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgt 28375122  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||    
T  28375121 ttggtactacctacatcaacaagatgcatcttcttttc 28375084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22548773 - 22548579
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||| |     
T  22548773 ggctgatgagggtggggagtggtcgccagtgcacaaggcactacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaacctaatcacaccggaatgagagggt 22548674  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  22548673 tcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 22548579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27819393 - 27819275
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27819393 gaatcacatcagaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatcaac 27819294  T
Q  328 aacatgcatattcatttca 346  Q
    || |||||| ||| |||||    
T  27819293 aaaatgcatcttcttttca 27819275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 25147962 - 25148083
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| || | ||| |||||||| |||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  25147962 aactgaatcacataagaatgagagggatcccgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatat 25148061  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  25148062 caacaagatgcatattcttttc 25148083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 335
Target Start/End: Original strand, 3744673 - 3744744
Alignment:
Q  264 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgca 335  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  3744673 taggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgca 3744744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 329
Target Start/End: Original strand, 32292386 - 32292497
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||     
T  32292386 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactat 32292485  T
Q  318 ctatatcaacaa 329  Q
    ||||||||||||    
T  32292486 ctatatcaacaa 32292497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844645
Alignment:
Q  232 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 331  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  332 tgcatattcatttc 345  Q
    ||||| ||| ||||    
T  10844658 tgcatcttcttttc 10844645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21316257 - 21316148
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||||| ||||||| || ||   ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21316257 tgaatcacatcgcgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaa 21316158  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
    ||| ||||||    
T  21316157 caagatgcat 21316148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 25144767 - 25144888
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||  ||||||| || |  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25144767 aactgaatcacatcagaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatat 25144866  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || ||| |||||| ||| ||||    
T  25144867 cagcaagatgcatcttcttttc 25144888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 342
Target Start/End: Original strand, 17429501 - 17429613
Alignment:
Q  229 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||  |  |||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  17429501 aatcacatcggaatgagag-gatcttgagaccgtgcatatatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaaca 17429599  T
Q  329 acatgcatattcat 342  Q
    | ||| || |||||    
T  17429600 agatgtatcttcat 17429613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 292
Target Start/End: Original strand, 25307687 - 25307828
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||| ||  |||||||| |  |||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||    
T  25307687 ggctgacgagggccgggagtggtagtcggtgtacaagacacgacaatgagcggttttcgacagctttgagacaaactgaatcacactggaatgagagcga 25307786  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaag 292  Q
    | |  | |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25307787 ttccaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaag 25307828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30335055 - 30334954
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||  | ||  ||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30335055 gaatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaac 30334956  T
Q  328 aa 329  Q
    ||    
T  30334955 aa 30334954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 1297043 - 1297107
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1297043 aggtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaa 1297107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15568139 - 15568044
Alignment:
Q  241 atgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  15568139 atgagagagatcctgagaccgtacaaatatgtgacttcttggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcat 15568044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36968503 - 36968433
Alignment:
Q  267 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcata 337  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  36968503 gtatgaaactgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagatgcata 36968433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15567707 - 15567602
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | |||| ||||   ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||     
T  15567707 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgacatcgcgcaagtattagacatcatggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatatac 15567608  T
Q  324 caacaa 329  Q
    ||||||    
T  15567607 caacaa 15567602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 336
Target Start/End: Original strand, 3745145 - 3745208
Alignment:
Q  273 gactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  3745145 gactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaatatgcat 3745208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 41913006 - 41913075
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgc 334  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  41913006 aggtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgc 41913075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5969100 - 5968981
Alignment:
Q  1 tcgtgtgccaatgactacattctaacaatgtcatttttcattgcgaagaagaaaataatttctgacaatgtcatttttcattttgaagaaaataattgcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5969100 tcgtgtgccaatgactacattctgacaatttcatttt----------gaagaaaataatttctgacaatgtcatttttcattttgaagaaaataattgcg 5969011  T
Q  101 gccaaatgtagccatgtaatctcaaaagta 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5969010 gccaaatgtatccatgtaatctcaaaagta 5968981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6747822 - 6747637
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||    
T  6747822 ggctgacgagggcagggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagctgaatcacattggaatgagaggga 6747723  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6747722 tcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 6747637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 42515523 - 42515660
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  42515523 cgacagcttctagacgaaccgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgt 42515622  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  42515623 ttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 42515660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2611876 - 2611691
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  2611876 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagagggg 2611777  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| | | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2611776 tcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataacaacaagatgcat 2611691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 9124954 - 9125075
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9124954 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 9125053  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  9125054 caacaagatgcatcttcttttc 9125075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Original strand, 42515090 - 42515199
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42515090 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 42515189  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
    ||| ||||||    
T  42515190 caagatgcat 42515199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26957777 - 26957603
Alignment:
Q  156 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 254  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  26957777 gacgagggcgggaagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatctt 26957678  T
Q  255 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    || || || ||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26957677 gaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34405815 - 34405621
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  34405815 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggga 34405716  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  34405715 tcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaggatgcatcttcttttc 34405621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2941908 - 2941787
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  2941908 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatat 2941809  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  2941808 caacaagatgcatcttcttttc 2941787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11517539 - 11517428
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11517539 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggt-gaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 11517441  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||||    
T  11517440 caacaagatgcat 11517428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 345
Target Start/End: Original strand, 28495835 - 28495970
Alignment:
Q  210 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 309  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||     
T  28495835 acaacttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttg 28495934  T
Q  310 gatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  28495935 ggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 28495970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6719226 - 6719104
Alignment:
Q  223 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 322  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6719226 gaaccgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctata 6719127  T
Q  323 tcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||    
T  6719126 tcaacaagatgcatcttcttttc 6719104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Original strand, 679796 - 679927
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  679796 cgacagcttctagaggaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattg- 679894  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattc 340  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  679895 ttggtactacctatatcaacaagatgcatattc 679927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 329
Target Start/End: Original strand, 25182363 - 25182461
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25182363 tcacatcggaatgagagagatcctgagactgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 25182461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 336
Target Start/End: Original strand, 43233402 - 43233520
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  43233402 tagaggaaccgaatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactat 43233501  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  43233502 ctatatcaacaagatgcat 43233520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29039167 - 29039059
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29039167 gaatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctatatcaac 29039068  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
    |||||||||    
T  29039067 aacatgcat 29039059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35474268 - 35474160
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  35474268 gaatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaac 35474169  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
    || ||||||    
T  35474168 aagatgcat 35474160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 336
Target Start/End: Original strand, 2193236 - 2193363
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2193236 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 2193335  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  2193336 tggtactacctatatcaacaagatgcat 2193363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13125287 - 13125166
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13125287 aactgaatcatatcggaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 13125188  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
     ||||| |||||| ||| ||||    
T  13125187 taacaagatgcatcttcttttc 13125166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 36422251 - 36422368
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36422251 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 36422350  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  36422351 aagatgcatcttcttttc 36422368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 46425740 - 46425857
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  46425740 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaac 46425839  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  46425840 aagatgcatcttcttttc 46425857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5406739 - 5406627
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||   |||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5406739 aactgaatcacatcggaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatat 5406640  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||||    
T  5406639 caacaagatgcat 5406627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28495755 - 28495647
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||||    
T  28495755 gaatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaac 28495656  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
    || ||||||    
T  28495655 aagatgcat 28495647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3305536 - 3305377
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | ||  ||||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  3305536 ggctgacgagggcggagagtggtcgccggtggataaggcacgacaatgagcagctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgaggggga 3305437  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttg 310  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3305436 tcctgaggccgtgtaagtatgggactacatggttgaatgaaggcttatgagaattgtttg 3305377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 18833281 - 18833402
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||  |||  |||||||| ||||  |||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  18833281 aactgaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatat 18833380  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  18833381 caacaagatgcatcttcttttc 18833402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26421402 - 26421341
Alignment:
Q  278 tatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatatt 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26421402 tatggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaagatgcatatt 26421341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 2189069 - 2189260
Alignment:
Q  155 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  2189069 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcc 2189168  T
Q  254 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| || ||  |||| || ||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  2189169 tgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 2189260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22529392 - 22529264
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | | | || ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||     
T  22529392 tagacgaaccgaatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactat 22529293  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  22529292 ctatataaacaagatgcatcttcttttca 22529264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 329
Target Start/End: Original strand, 2465959 - 2466024
Alignment:
Q  264 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2465959 taggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaa 2466024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29357622 - 29357486
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| || | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||   |||| ||||||||    
T  29357622 cgacaacttctagatgaactgaatcacaccg-aatgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgt 29357524  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29357523 ttggtactaactatatcaacaagatgcatcttcttttc 29357486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31406731 - 31406614
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  || | || ||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  31406731 gaatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcagatctgggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaac 31406632  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  31406631 aagatgcatcttcttttc 31406614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 329
Target Start/End: Original strand, 33316707 - 33316828
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatc-acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  33316707 gacagcttctagacaaactgaatccacatcggaatgagataaattttgatgtcgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgt 33316806  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||| | ||| |||||||||||    
T  33316807 ttgacaatacttatatcaacaa 33316828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 345
Target Start/End: Original strand, 2465777 - 2465849
Alignment:
Q  273 gactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  2465777 gactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 2465849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35527278 - 35527150
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || | |||  |  |||| ||||   |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  35527278 tagacgaaccgaatcacaccgaaatgagagggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctac 35527179  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35527178 ctatatcaacaagatgcatattcttttca 35527150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 336
Target Start/End: Original strand, 9623188 - 9623315
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |  ||  | | ||||||||  ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  9623188 gacaacttttagataaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtt 9623287  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9623288 tgataccacctatatcaacaagatgcat 9623315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13124852 - 13124757
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacct 319  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  13124852 aactgaatcatattggaatgagagggatcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactacct 13124757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36015568 - 36015452
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||  | || ||  | ||||||||||  |||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||    
T  36015568 tagacgaaccaaatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactac 36015469  T
Q  318 ctatatcaacaacatgc 334  Q
     ||||||||||| ||||    
T  36015468 atatatcaacaagatgc 36015452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Original strand, 20966055 - 20966161
Alignment:
Q  233 acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacat 332  Q
    ||||||||||||||| | || ||| ||| | |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| |||||| |||  || |||||||| |||||| ||    
T  20966055 acatcggaatgagagtggtcttgaggccatctaggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagat 20966154  T
Q  333 gcatatt 339  Q
    | |||||    
T  20966155 gtatatt 20966161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 328
Target Start/End: Original strand, 11372486 - 11372550
Alignment:
Q  264 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11372486 taggtatgaaattgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaaca 11372550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16811963 - 16811912
Alignment:
Q  258 gccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 309  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  16811963 gccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttt 16811912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 329
Target Start/End: Original strand, 6585662 - 6585708
Alignment:
Q  283 ttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6585662 ttgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaa 6585708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31743975 - 31743854
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||  |||  | | ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  31743975 aactgaatcatatcgaaatgagatggatcttgaaatcgtgcaagcatgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgctatctatat 31743876  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  31743875 caacaagatgcatcttcttttc 31743854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43057747 - 43057553
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | | || || |||||||  ||||||| | ||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  43057747 ggctgaagagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcatgccaatgagcggctcccgacagcttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 43057648  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  43057647 tcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttc 43057553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30873175 - 30872989
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggg--gagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagag 249  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||| || || ||||||  ||||||||    |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  30873175 ggctgacgagggcgcgtggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggcttcgacaatttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagaggg 30873076  T
Q  250 atcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30873075 attctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcat 30872989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43057288 - 43057095
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||| |||||||| ||||  |||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| | ||    
T  43057288 ggctgacgaggacggggagtggttgccggtgcacaaggcatgacaatgagcgactcccgacaatttctagaggaaccgaatcacatcagaatgaggg-ga 43057190  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  43057189 tcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 43057095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50002854 - 50002737
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50002854 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50002755  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  50002754 aagatgcatcttcttttc 50002737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16452157 - 16451963
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16452157 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16452058  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16452057 tcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 16451963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16461310 - 16461116
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16461310 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16461211  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16461210 tcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 16461116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20054304 - 20054110
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20054304 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20054205  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20054204 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20054110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20054760 - 20054566
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20054760 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20054661  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20054660 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20054566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20055216 - 20055022
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20055216 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20055117  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20055116 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20055022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20055672 - 20055478
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20055672 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20055573  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20055572 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20055478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20056128 - 20055934
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20056128 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056029  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20056028 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20055934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20056584 - 20056390
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20056584 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056485  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20056484 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20056390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20057487 - 20057293
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20057487 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20057388  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20057387 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20057293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35761062 - 35760953
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35761062 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 35760963  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
    ||| ||||||    
T  35760962 caagatgcat 35760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50002442 - 50002315
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  50002442 tagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 50002343  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  50002342 ctttatcaacaagatgcatcttcttttc 50002315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20845885 - 20845691
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  |     
T  20845885 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagacggt 20845786  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20845785 tcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20845691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35759756 - 35759638
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35759756 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 35759657  T
Q  327 caacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||| ||| ||||    
T  35759656 caagatgcatcttcttttc 35759638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 52250128 - 52250322
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  52250128 ggctgacgagggcggggagcggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggga 52250227  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  52250228 tcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 52250322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31822809 - 31822693
Alignment:
Q  229 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  31822809 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaaca 31822710  T
Q  329 acatgcatattcatttc 345  Q
    | |||||| ||| ||||    
T  31822709 atatgcatcttcttttc 31822693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 345
Target Start/End: Original strand, 38340886 - 38341022
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  38340886 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 38340985  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38340986 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcatttc 38341022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 12883446 - 12883631
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | || |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  12883446 ggctaacgagggtggtgagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctctcgacagcttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagatgga 12883545  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| || || ||  ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12883546 tcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 12883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20061342 - 20061221
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20061342 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 20061243  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  20061242 caacaagatgcatcttcttttc 20061221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Original strand, 2328310 - 2328422
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2328310 aactgaatcacattggaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 2328409  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
     ||||| ||||||    
T  2328410 taacaagatgcat 2328422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 340
Target Start/End: Original strand, 7548086 - 7548202
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||    
T  7548086 aactgaatcacattgcaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactatat 7548185  T
Q  324 caacaacatgcatattc 340  Q
    |||||| ||||||||||    
T  7548186 caacaagatgcatattc 7548202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20057876 - 20057749
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20057876 tagaggaactgaatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactac 20057777  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20057776 ctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20057749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51373096 - 51372913
Alignment:
Q  154 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 252  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||   ||||||||| ||||    
T  51373096 ctgacgaggacgaagagtggttgccagtgcataaggcacgacaatgagcgactcccgacatcttctagacgtaccaaatcacactagaatgagagggatc 51372997  T
Q  253 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    | || ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  51372996 ccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcat 51372913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 326
Target Start/End: Original strand, 10820571 - 10820689
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  ||| || || || ||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10820571 cgacaacttctagatgaaccgaatcacatcggagtgagagggattatgaggcggtgtatgtattggactacatggttgaaggaagatttataagaattgt 10820670  T
Q  308 ttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  10820671 ttggtactacctatatcaa 10820689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46693884 - 46693765
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactat-atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||  | ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  46693884 tgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgcatgtatgggactgtgatggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatca 46693785  T
Q  326 acaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||| |||||| ||| ||||    
T  46693784 acaagatgcatcttcttttc 46693765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 50003227 - 50003104
Alignment:
Q  223 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 322  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||  ||||  |||||| |||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  50003227 gaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctata 50003128  T
Q  323 tcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||    
T  50003127 tcaacaagatgcatcttcttttca 50003104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20057031 - 20056846
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20057031 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056932  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||         |||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20056931 tcctga---------ggtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20056846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 23180728 - 23180830
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23180728 tgaatcacattggaatgagagggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaa 23180827  T
Q  327 caa 329  Q
    |||    
T  23180828 caa 23180830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 2634923 - 2635040
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||  ||||||| ||||  ||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2634923 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggtactacctataccaac 2635022  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  2635023 aagatgcatcttcttttc 2635040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Original strand, 12728026 - 12728108
Alignment:
Q  264 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt-gatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12728026 taggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaacaagatgcatcttcttttc 12728108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 16907270 - 16907351
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  16907270 aggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttca 16907351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060370
Alignment:
Q  284 tgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 20060370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Original strand, 2739554 - 2739622
Alignment:
Q  261 gtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  2739554 gtataggtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaa 2739622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 30529609 - 30529794
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||  ||||| || | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30529609 ggctgacgagggcgatgagtggtcgtcagtgcacaaggcacgacaataagcagctcccgacaacttctagaggaactgaatcacatcggaatgagaggga 30529708  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30529709 tcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatatcaacaagatgcat 30529794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Original strand, 39640916 - 39641044
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39640916 cgacagcttttagaagaatcgaatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgt 39641015  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  39641016 ttggtactacctatatcaataagatgcat 39641044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 28561670 - 28561862
Alignment:
Q  154 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 252  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  28561670 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctactgacaacttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggttc 28561769  T
Q  253 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  28561770 ctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 28561862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20885283 - 20885156
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20885283 cgacaacttctagaggaacc-aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgt 20885185  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20885184 ttgatactacctatatcaacaagatgcat 20885156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32227444 - 32227260
Alignment:
Q  153 gctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagat 251  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||| | ||  | ||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||    
T  32227444 gctgacgagggcggggagtggtcgccagtgcacaaggcacaacaatgagcggctcccaacaacttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggat 32227345  T
Q  252 cctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  32227344 cctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcat 32227260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25230872 - 25230744
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25230872 cgacagcttatagaggaaccaaatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgt 25230773  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25230772 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 25230744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25238459 - 25238331
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25238459 cgacagcttatagaggaaccaaatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgt 25238360  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25238359 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 25238331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 345
Target Start/End: Original strand, 41472297 - 41472416
Alignment:
Q  225 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  41472297 actgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaag-cttataagaattgtttggtactacatatatc 41472395  T
Q  325 aacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||| |||||| ||| ||||    
T  41472396 aacaagatgcatcttcttttc 41472416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 16811303 - 16811497
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16811303 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16811402  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  16811403 tcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaacaagatgcatcttcttttc 16811497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 39653086 - 39653280
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  39653086 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 39653185  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  39653186 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 39653280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31284427 - 31284306
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31284427 aactgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 31284328  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  31284327 caacaagatgcatcttcttttc 31284306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 345
Target Start/End: Original strand, 7493881 - 7493997
Alignment:
Q  229 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  7493881 aatcacatcggaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 7493980  T
Q  329 acatgcatattcatttc 345  Q
    | |||||| ||| ||||    
T  7493981 agatgcatcttcttttc 7493997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25230415 - 25230294
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  25230415 cgacatcttatagaggaaccaaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattat 25230316  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  25230315 ttggtactacctatatcaacaa 25230294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25238002 - 25237881
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  25238002 cgacatcttatagaggaaccaaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattat 25237903  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  25237902 ttggtactacctatatcaacaa 25237881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 50347668 - 50347853
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | || || |||| |  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  50347668 ggctgacgagggcggggagtgatcgccggtgcacaaggaacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagaggga 50347767  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  50347768 tcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 50347853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11180172 - 11180064
Alignment:
Q  237 cggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  11180172 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 11180073  T
Q  337 attcatttc 345  Q
     ||| ||||    
T  11180072 cttcttttc 11180064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32797082 - 32796974
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||  || | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32797082 gaatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 32796983  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
    || ||||||    
T  32796982 aagatgcat 32796974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13150267 - 13150128
Alignment:
Q  207 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattg 306  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13150267 tcgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattg 13150168  T
Q  307 tttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  13150167 ttgggtactacctgtatcaacaagatgcatcttcttttca 13150128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 345
Target Start/End: Original strand, 14813938 - 14814065
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  14813938 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactac 14814037  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  14814038 ctatatcaataagatgcatcttcttttc 14814065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 329
Target Start/End: Original strand, 7477191 - 7477291
Alignment:
Q  229 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  7477191 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 7477290  T
Q  329 a 329  Q
    |    
T  7477291 a 7477291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25239224 - 25239116
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25239224 gaatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaac 25239125  T
Q  328 aacatgcat 336  Q
    || ||||||    
T  25239124 aagatgcat 25239116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 41473993 - 41474097
Alignment:
Q  225 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 324  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||  ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41473993 actgaatcacatcgaaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatc 41474092  T
Q  325 aacaa 329  Q
    |||||    
T  41474093 aacaa 41474097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 16810847 - 16811041
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16810847 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16810946  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || ||| ||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  16810947 tcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctacaagatgcatcttcttttc 16811041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 32227480 - 32227616
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32227480 cgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggatc-tgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 32227578  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    | | |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  32227579 tgggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttc 32227616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Original strand, 37045014 - 37045135
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||    
T  37045014 cgacagcttctagaggaaccgaatcacatctgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgt 37045113  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  37045114 ttggtaatacctatatcaacaa 37045135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Original strand, 25248106 - 25248218
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||||||| ||||  |||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25248106 aactgaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatat 25248205  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||||    
T  25248206 caacaagatgcat 25248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 340
Target Start/End: Original strand, 2911084 - 2911206
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||    
T  2911084 tagacgaaccgaatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattac 2911183  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcatattc 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  2911184 ctatatcaacaagatgcatattc 2911206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Original strand, 8067278 - 8067387
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| || |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8067278 tgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgcaggtatgggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaa 8067377  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
    ||| ||||||    
T  8067378 caagatgcat 8067387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32386844 - 32386763
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  32386844 aggtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttca 32386763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25238790 - 25238723
Alignment:
Q  269 atgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  25238790 atgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcat 25238723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25803228 - 25803057
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |   || || |||||||||||||||| | ||| | ||| ||| |||| |||| |||||| |||||||| |||| |     
T  25803228 ggctgactaggacggggagtggtcgctggtgcacaaggcataacaatgagcggcttccaacagcttctagatgaaccgaatcatatcggaataagagggt 25803129  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 322  Q
    |||| | | ||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  25803128 tcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctata 25803057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 345
Target Start/End: Original strand, 29224326 - 29224440
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 330  Q
    ||||||| |||||| || | || ||| ||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||     
T  29224326 tcacatcagaatgaaagggttcatgaggccatgtagatatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaag 29224425  T
Q  331 atgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||| ||||    
T  29224426 atgcatcttcttttc 29224440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13150657 - 13150584
Alignment:
Q  272 agactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  13150657 agactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 13150584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067399
Alignment:
Q  281 ggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 4067399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27187478 - 27187380
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatca 325  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||  | ||||| ||||  |||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27187478 tgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgcatgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 27187380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 336
Target Start/End: Original strand, 14820134 - 14820261
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| || |||||||| | ||||||  |||| |||||||| | ||  | || | ||||||| ||||| |||||||||    
T  14820134 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtt 14820233  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  14820234 tggtactacttatatcaacaagatgcat 14820261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25802685 - 25802578
Alignment:
Q  238 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcata 337  Q
    |||||||||| |||| ||  ||| | |||||||||||||  |||||| | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  25802685 ggaatgagagggatcatgtggccatgtaggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 25802586  T
Q  338 ttcatttc 345  Q
    ||| ||||    
T  25802585 ttcttttc 25802578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31104070 - 31103999
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||    
T  31104070 aggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcat 31103999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Original strand, 12820639 - 12820703
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaag 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  12820639 aactgaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaag 12820703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47518415 - 47518358
Alignment:
Q  279 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || || |||||| ||||||    
T  47518415 atggttgaaggaaaacttataagaattgtttgaaactatctctaccaacaagatgcat 47518358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 2664 - 2858
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |  || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  2664 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggagcacaaggcacgacaatgagtggctcccgacaacttctagaggaatcgaatcacatcgaaatgagaggga 2763  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2764 tcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatattcttttc 2858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10927568 - 10927442
Alignment:
Q  210 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 309  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10927568 acaacttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 10927469  T
Q  310 gatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  10927468 ggtactacctatatcaacaagatgcat 10927442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42788869 - 42788676
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||| |||| | || |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  42788869 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacaaca-tgagcggctctcgacaacttctagaggaaccgaatcacaacggaatgagaggga 42788771  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  42788770 tcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 42788676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20039698 - 20039513
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20039698 ggctgacgagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcagctcccgacagcttctagacaaaccgaatcacatcggaatgagaggga 20039599  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || ||| ||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20039598 tcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20039513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 336
Target Start/End: Original strand, 39146919 - 39147046
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39146919 gacaacttctagaggaactgaatcacatcgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtt 39147018  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  39147019 tgatactacttatattaacaagatgcat 39147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17445620 - 17445494
Alignment:
Q  210 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 309  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17445620 acaacttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 17445521  T
Q  310 gatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  17445520 ggtactacctatatcaacaagatgcat 17445494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3887208 - 3887087
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  3887208 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatat 3887109  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  3887108 caacaagatgcatcttcttttc 3887087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10927170 - 10926985
Alignment:
Q  153 gctgacgagggc-ggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  10927170 gctgacgagggcaggggagtgatcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagtagctcccgacagcttatagaggaaccgaatcacatcagaatgagaggga 10927071  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10927070 tcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 10926985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 2193738 - 2193932
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  2193738 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagaggga 2193837  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  2193838 tcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 2193932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 329
Target Start/End: Original strand, 189063 - 189168
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  189063 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 189162  T
Q  324 caacaa 329  Q
    ||||||    
T  189163 caacaa 189168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 2474400 - 2474521
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  2474400 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatat 2474499  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  2474500 caacaagatgcatcttcttttc 2474521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 345
Target Start/End: Original strand, 42429131 - 42429261
Alignment:
Q  214 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgata 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  42429131 cttttagacgaaccgaatcacatcggaataagag-gatcctgagaccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggta 42429229  T
Q  314 ctacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  42429230 ctacctttatcaacaatatgcatattcttttc 42429261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 2473954 - 2474075
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  2473954 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 2474053  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  2474054 caacaagatgcatcttcttttc 2474075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 22556531 - 22556652
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  22556531 aactgaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatat 22556630  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  22556631 caacaagatgcatcttcttttc 22556652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27647002 - 27646874
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27647002 cgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 27646903  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27646902 ttggtactacctataacaacaagatgcat 27646874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 345
Target Start/End: Original strand, 34867770 - 34867906
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34867770 gacagcttctagaagaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 34867869  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  34867870 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 34867906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Original strand, 1821904 - 1822013
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | | |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1821904 tgaattacatcggaatgagagagatcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 1822003  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
    ||| ||||||    
T  1822004 caagatgcat 1822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8391468 - 8391352
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  8391468 gaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtact-cctgtatcaac 8391370  T
Q  328 aacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  8391369 aagatgcatcttcttttc 8391352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 22556964 - 22557085
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  22556964 aactgaatcacatcggaatgagagagttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatat 22557063  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  22557064 caacaagatgcatcttcttttc 22557085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2058803 - 2058691
Alignment:
Q  228 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  || |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2058803 gaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagctatgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttggtactacctatatcaac 2058704  T
Q  328 aacatgcatattc 340  Q
    || ||||| ||||    
T  2058703 aagatgcaaattc 2058691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11160848 - 11160716
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11160848 cgacaatttttagatgaaccgaattgcatcggaatgagagggatcatgaagtcgtgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgt 11160749  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattc 340  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  11160748 ttggtactatctatgtcaacaagatgcatattc 11160716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8642182 - 8642064
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  8642182 tgaatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaa 8642083  T
Q  327 caacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||| ||| ||||    
T  8642082 caagatgcatcttcttttc 8642064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4658216 - 4658032
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||  ||||   |||| | | ||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  4658216 ggctgacaaggacggggagtggtcgccagtgcataatgcatgacaatgaccgactcctgacagcctctaggcaaactgaatcacatcgaaataagaggga 4658117  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    || |||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4658116 tcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaaga-ttataagacttgtttgatactacctataacaacaacatgcat 4658032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3886749 - 3886631
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||| ||||  ||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3886749 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaa 3886650  T
Q  327 caacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||| ||| ||||    
T  3886649 caagatgcatcttcttttc 3886631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 34371534 - 34371728
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  34371534 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 34371633  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||  | |||||| |||| || ||||  |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  34371634 tcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 34371728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 34371990 - 34372184
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| |     
T  34371990 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcaggacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccagaatgagagggt 34372089  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||  | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  34372090 tcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 34372184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21886303 - 21886176
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |  ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21886303 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 21886204  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
     ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  21886203 atatatcaacaagatgcatcttcttttc 21886176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16370852 - 16370754
Alignment:
Q  231 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 329  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16370852 tcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaa 16370754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5067055 - 5066930
Alignment:
Q  211 caacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttg 310  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||| || |||||  | |||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||    
T  5067055 caacttctagacaaatcgaatcacaccagaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttg 5066956  T
Q  311 atactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
     || || |||||||||||| ||||||    
T  5066955 gtattatctatatcaacaagatgcat 5066930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 18304410 - 18304547
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 307  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| ||| | ||  |||||   ||||||    
T  18304410 cgacagcttctagacgaaccaaatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgt 18304509  T
Q  308 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18304510 ttggtactacctatatcaacaagatgcatattcttttc 18304547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15513173 - 15513051
Alignment:
Q  215 ttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaaga--cttatgagaattgtttgat 312  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||| |    
T  15513173 ttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattg-ttggt 15513075  T
Q  313 actacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||| |||||||||| ||||||    
T  15513074 actaccaatatcaacaagatgcat 15513051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22975161 - 22975076
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  22975161 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaattgttt 22975076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29680236 - 29680177
Alignment:
Q  239 gaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 298  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  29680236 gaatgagagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttat 29680177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24182353 - 24182284
Alignment:
Q  267 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  24182353 gtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaacaagatgcat 24182284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 329
Target Start/End: Original strand, 5549339 - 5549445
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat-gagaattgtttgatactacctata 322  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || |||| || | ||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||| ||||    
T  5549339 aactgaatcacatcggaatgagatggttcatgaaaccatgtaggtatgagattgtataattgaaggaaaacttataaaaaattgtttggtactacgtata 5549438  T
Q  323 tcaacaa 329  Q
     ||||||    
T  5549439 ccaacaa 5549445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18750328 - 18750226
Alignment:
Q  243 gagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcat 342  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||  |||  ||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||| |    
T  18750328 gagagagatcctgaagtcgtgcaggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttctt 18750229  T
Q  343 ttc 345  Q
    |||    
T  18750228 ttc 18750226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39801571 - 39801501
Alignment:
Q  267 gtatgagactatatggttgaaggaagactta-tgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  | | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39801571 gtatgagactatatggttaaaagaagactttctaaaaatcgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 39801501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 162829 - 162708
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  162829 aactgaattacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 162730  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
     ||||| |||||| ||| ||||    
T  162729 taacaagatgcatcttcttttc 162708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 69925 - 69862
Alignment:
Q  265 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  69925 aggtatgagactgcatcgttgaaggaatgcttataataattgtttggtactacctatatcaaca 69862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 107614 - 107493
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  107614 aactgaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatat 107515  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  107514 caacaagatgcatcttcttttc 107493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2361 - 2240
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2361 aactgaatcacatcggaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 2262  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  2261 caacaagatgcatcttcttttc 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Original strand, 245084 - 245193
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  245084 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 245183  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
    ||| ||||||    
T  245184 caagatgcat 245193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 346
Target Start/End: Original strand, 245510 - 245632
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| |||  |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  245510 aactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatat 245609  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttca 346  Q
    |||||| |||||| ||| |||||    
T  245610 caacaagatgcatcttcttttca 245632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 105715 - 105836
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  105715 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 105814  T
Q  324 caacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  105815 caacaaaatgcatcttcttttc 105836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 142425 - 142313
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  142425 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatat 142326  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||||    
T  142325 caacaagatgcat 142313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 345
Target Start/End: Original strand, 1142 - 1336
Alignment:
Q  152 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  |     
T  1142 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacaacttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagacggt 1241  T
Q  251 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    |||||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  1242 tcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaacaagatgcatcttcttttc 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 329
Target Start/End: Original strand, 18961 - 19066
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18961 aactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 19060  T
Q  324 caacaa 329  Q
    ||||||    
T  19061 caacaa 19066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18271 - 18204
Alignment:
Q  225 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaag 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  18271 actgaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaag 18204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 336
Target Start/End: Original strand, 10295 - 10407
Alignment:
Q  224 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  10295 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatat 10394  T
Q  324 caacaacatgcat 336  Q
    |||||| ||||||    
T  10395 caacaagatgcat 10407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 346
Target Start/End: Original strand, 154735 - 154874
Alignment:
Q  207 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattg 306  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  154735 tcgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattg 154834  T
Q  307 tttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttca 346  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  154835 ttgggtactacctgtatcaacaagatgcatcttcttttca 154874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2203 - 2081
Alignment:
Q  223 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 322  Q
    |||| |||||||| | |||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2203 gaaccgaatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 2104  T
Q  323 tcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||    
T  2103 tcaacaagatgcatcttcttttc 2081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 336
Target Start/End: Original strand, 23662 - 23780
Alignment:
Q  218 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 317  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| | || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  23662 tagaggaaccgaatcacaccgaaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 23761  T
Q  318 ctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  23762 ctatatcaacaagatgcat 23780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 345
Target Start/End: Original strand, 4541 - 4677
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 308  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||  |||||||||    
T  4541 gacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtt 4640  T
Q  309 tgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4641 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 4677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 345
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5137
Alignment:
Q  209 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagactt-----atgagaa 303  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||  ||     |  ||||    
T  4996 gacaacttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaa 5095  T
Q  304 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcatttc 345  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  5096 ttgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttc 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 342
Target Start/End: Original strand, 45387 - 45499
Alignment:
Q  229 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||  |  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45387 aatcacatcggaatgagag-gatcttgagaccgtgcatatatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaaca 45485  T
Q  329 acatgcatattcat 342  Q
    | ||| || |||||    
T  45486 agatgtatcttcat 45499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4130 - 4021
Alignment:
Q  227 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 326  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4130 tgaatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaa 4031  T
Q  327 caacatgcat 336  Q
    ||| ||||||    
T  4030 caagatgcat 4021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 277
Target Start/End: Original strand, 729 - 798
Alignment:
Q  208 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagacta 277  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  729 cgacaacttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggacta 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 336
Target Start/End: Original strand, 2150 - 2212
Alignment:
Q  274 actatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 336  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  2150 actacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcat 2212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1138
Description:

Target: scaffold1138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 812 - 774
Alignment:
Q  260 cgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  812 cgtataggtatgagattatatggttgaaggaggacttat 774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University