View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18687_low_8 (Length: 354)

Name: NF18687_low_8
Description: NF18687
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18687_low_8
NF18687_low_8
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (11-338)||(39811928-39812255)
chr2 (11-338)||(32246602-32246933)
chr2 (11-335)||(44312563-44312887)
chr2 (23-338)||(19344238-19344556)
chr2 (23-338)||(19349096-19349414)
chr2 (11-333)||(11098877-11099196)
chr2 (15-333)||(14291316-14291631)
chr2 (15-333)||(9296355-9296670)
chr2 (61-268)||(25398386-25398591)
chr2 (61-268)||(25403524-25403729)
chr2 (15-178)||(3491729-3491892)
chr2 (70-156)||(8040059-8040147)
chr2 (73-178)||(40738822-40738926)
chr2 (11-152)||(13569331-13569474)
chr2 (61-156)||(21629943-21630040)
chr2 (31-155)||(28259149-28259274)
chr2 (61-156)||(10445444-10445542)
chr2 (61-156)||(17865202-17865300)
chr2 (61-156)||(20522219-20522317)
chr2 (61-156)||(34682334-34682432)
chr2 (61-154)||(34388859-34388955)
chr2 (31-154)||(10707223-10707348)
chr2 (61-156)||(14699008-14699105)
chr2 (61-125)||(25407653-25407718)
chr2 (44-152)||(8390133-8390244)
chr2 (70-155)||(31056044-31056131)
chr2 (31-155)||(23078442-23078567)
chr2 (61-156)||(33528621-33528719)
chr2 (15-155)||(36757718-36757859)
chr2 (61-156)||(39482930-39483028)
chr2 (70-156)||(16940219-16940307)
chr2 (70-156)||(17010884-17010972)
chr2 (61-155)||(42039670-42039766)
chr2 (71-156)||(33118135-33118222)
chr2 (92-152)||(1345574-1345635)
chr2 (92-152)||(2838063-2838124)
chr2 (92-151)||(35215586-35215646)
chr2 (92-151)||(35217963-35218023)
chr2 (72-134)||(27149306-27149369)
chr2 (72-152)||(2869705-2869787)
chr2 (95-151)||(45332181-45332238)
chr2 (92-151)||(23452237-23452297)
chr2 (92-151)||(36558864-36558924)
chr2 (92-151)||(36561141-36561201)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (11-338)||(31109523-31109849)
chr7 (11-338)||(12406150-12406477)
chr7 (11-338)||(12396730-12397057)
chr7 (11-338)||(24024266-24024594)
chr7 (23-338)||(19992130-19992447)
chr7 (66-338)||(4866548-4866820)
chr7 (11-338)||(21812178-21812506)
chr7 (15-333)||(20357501-20357816)
chr7 (15-333)||(2057786-2058108)
chr7 (23-338)||(24261273-24261592)
chr7 (23-338)||(24266152-24266471)
chr7 (23-338)||(16879889-16880207)
chr7 (23-338)||(16884745-16885063)
chr7 (11-333)||(1533393-1533709)
chr7 (15-268)||(21639701-21639950)
chr7 (15-268)||(21645899-21646148)
chr7 (61-178)||(18408742-18408859)
chr7 (61-178)||(18413619-18413735)
chr7 (15-154)||(21983285-21983427)
chr7 (31-156)||(29159802-29159929)
chr7 (61-156)||(46516310-46516408)
chr7 (61-156)||(49091660-49091758)
chr7 (61-155)||(44848685-44848781)
chr7 (15-156)||(2580389-2580531)
chr7 (61-156)||(2647696-2647794)
chr7 (61-156)||(33332450-33332548)
chr7 (73-156)||(9190021-9190106)
chr7 (73-156)||(20284088-20284173)
chr7 (61-156)||(55947-56044)
chr7 (72-156)||(35960815-35960901)
chr7 (73-156)||(9185178-9185263)
chr7 (31-155)||(2479337-2479461)
chr7 (61-156)||(4796667-4796765)
chr7 (76-155)||(47263678-47263757)
chr7 (92-152)||(28617258-28617319)
chr7 (71-154)||(21988909-21988992)
chr7 (92-151)||(31155911-31155971)
chr7 (72-155)||(5817282-5817366)
chr7 (92-151)||(1049296-1049356)
chr7 (92-151)||(2935497-2935557)
chr7 (92-151)||(3035953-3036013)
chr7 (92-151)||(7351652-7351712)
chr7 (108-155)||(8153466-8153514)
chr7 (92-151)||(9027194-9027254)
chr7 (92-151)||(22108295-22108355)
chr7 (92-151)||(22137306-22137366)
chr7 (92-151)||(40550055-40550115)
chr7 (92-151)||(40552333-40552393)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (23-338)||(39784774-39785091)
chr8 (11-338)||(25328218-25328545)
chr8 (11-333)||(7289865-7290188)
chr8 (11-333)||(6311121-6311443)
chr8 (23-338)||(35745208-35745526)
chr8 (11-333)||(36979205-36979524)
chr8 (15-318)||(33037761-33038063)
chr8 (15-318)||(4760029-4760332)
chr8 (11-333)||(30655469-30655793)
chr8 (15-333)||(10689097-10689412)
chr8 (11-318)||(18853117-18853425)
chr8 (23-338)||(10684214-10684533)
chr8 (11-333)||(18870511-18870828)
chr8 (61-178)||(1261955-1262073)
chr8 (73-178)||(26287879-26287985)
chr8 (73-178)||(26301136-26301242)
chr8 (73-178)||(26313130-26313236)
chr8 (61-178)||(31071230-31071349)
chr8 (70-156)||(26403240-26403328)
chr8 (61-155)||(4456028-4456124)
chr8 (61-152)||(7412344-7412437)
chr8 (61-155)||(19175755-19175851)
chr8 (31-156)||(23799548-23799675)
chr8 (73-156)||(4696609-4696694)
chr8 (61-156)||(5702483-5702581)
chr8 (61-152)||(6127224-6127318)
chr8 (92-153)||(9765852-9765914)
chr8 (73-156)||(19752407-19752492)
chr8 (92-151)||(43079877-43079937)
chr8 (92-151)||(43082248-43082308)
chr8 (89-155)||(6813683-6813750)
chr8 (92-125)||(18810982-18811015)
chr8 (92-151)||(44721118-44721178)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (11-338)||(15044507-15044831)
chr5 (11-333)||(43592102-43592425)
chr5 (11-333)||(43598547-43598870)
chr5 (11-333)||(43604039-43604362)
chr5 (11-333)||(43609531-43609854)
chr5 (11-333)||(27444793-27445116)
chr5 (11-333)||(27449637-27449960)
chr5 (11-333)||(1457101-1457423)
chr5 (11-338)||(28807514-28807842)
chr5 (23-338)||(37561395-37561714)
chr5 (11-333)||(30631231-30631553)
chr5 (23-335)||(37556573-37556889)
chr5 (23-338)||(2785192-2785510)
chr5 (23-338)||(33791133-33791451)
chr5 (23-338)||(33767996-33768314)
chr5 (11-233)||(31180138-31180360)
chr5 (11-338)||(31396930-31397261)
chr5 (38-338)||(31401815-31402118)
chr5 (61-268)||(38192064-38192269)
chr5 (61-268)||(38219289-38219494)
chr5 (11-268)||(24135740-24135994)
chr5 (61-178)||(35387640-35387758)
chr5 (61-155)||(9353333-9353429)
chr5 (61-155)||(36932351-36932447)
chr5 (31-155)||(10281751-10281877)
chr5 (61-155)||(15464532-15464628)
chr5 (61-154)||(11916972-11917068)
chr5 (31-155)||(14520230-14520355)
chr5 (70-156)||(17003970-17004058)
chr5 (61-156)||(3880298-3880396)
chr5 (61-152)||(12084176-12084269)
chr5 (61-155)||(19588746-19588843)
chr5 (73-156)||(28832258-28832343)
chr5 (73-156)||(42127423-42127508)
chr5 (92-151)||(4410241-4410301)
chr5 (76-156)||(31300612-31300694)
chr5 (92-151)||(15552464-15552524)
chr5 (92-151)||(31179371-31179431)
chr5 (92-151)||(31542953-31543013)
chr5 (92-151)||(31545299-31545359)
chr5 (98-151)||(27910675-27910729)
chr5 (73-156)||(24553520-24553604)
chr5 (92-151)||(3373137-3373197)
chr5 (92-151)||(10749919-10749979)
chr5 (92-151)||(15354575-15354635)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (11-338)||(45357236-45357563)
chr4 (11-338)||(9224346-9224673)
chr4 (11-338)||(45347756-45348084)
chr4 (11-338)||(9229133-9229460)
chr4 (11-333)||(51520280-51520603)
chr4 (23-338)||(18855544-18855860)
chr4 (11-338)||(5732481-5732809)
chr4 (11-338)||(3813841-3814168)
chr4 (25-334)||(56146664-56146974)
chr4 (11-333)||(24741769-24742087)
chr4 (61-333)||(29760470-29760737)
chr4 (73-178)||(28468542-28468647)
chr4 (61-178)||(31985635-31985752)
chr4 (61-156)||(10047378-10047476)
chr4 (61-156)||(39245993-39246091)
chr4 (61-156)||(36315230-36315327)
chr4 (61-156)||(36329439-36329536)
chr4 (70-156)||(38152449-38152537)
chr4 (31-155)||(5396643-5396768)
chr4 (61-156)||(16623293-16623391)
chr4 (73-158)||(5269204-5269291)
chr4 (44-155)||(3796502-3796616)
chr4 (71-154)||(5143260-5143345)
chr4 (31-154)||(5147678-5147803)
chr4 (70-156)||(24333808-24333896)
chr4 (61-154)||(3777550-3777645)
chr4 (70-150)||(6743425-6743507)
chr4 (61-156)||(16630680-16630778)
chr4 (73-156)||(25862035-25862120)
chr4 (92-151)||(16931789-16931849)
chr4 (92-151)||(16934143-16934203)
chr4 (92-151)||(22780373-22780433)
chr4 (92-151)||(44599838-44599898)
chr4 (61-134)||(39774305-39774380)
chr4 (71-156)||(54867183-54867269)
chr4 (92-151)||(6765117-6765177)
chr4 (92-151)||(7941596-7941656)
chr4 (92-151)||(18709164-18709224)
chr4 (92-151)||(22782738-22782798)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (11-338)||(14737516-14737843)
chr6 (11-338)||(28184320-28184650)
chr6 (11-338)||(14742376-14742702)
chr6 (11-335)||(22010636-22010960)
chr6 (11-338)||(11856790-11857120)
chr6 (23-338)||(6438319-6438634)
chr6 (11-338)||(28155510-28155837)
chr6 (23-338)||(6005234-6005552)
chr6 (11-338)||(16838561-16838890)
chr6 (11-338)||(33330384-33330715)
chr6 (11-338)||(33335881-33336212)
chr6 (11-333)||(5674719-5675036)
chr6 (110-338)||(5343297-5343527)
chr6 (44-155)||(5757462-5757575)
chr6 (211-333)||(30125944-30126063)
chr6 (61-155)||(21356036-21356132)
chr6 (71-156)||(10077176-10077263)
chr6 (61-156)||(5572241-5572339)
chr6 (72-156)||(31086485-31086571)
chr6 (71-155)||(4629954-4630040)
chr6 (61-156)||(31979512-31979610)
chr6 (73-178)||(22708996-22709102)
chr6 (61-156)||(22963699-22963796)
chr6 (61-156)||(23824597-23824694)
chr6 (61-143)||(21801344-21801429)
chr6 (73-156)||(31936586-31936671)
chr6 (61-134)||(18232867-18232942)
chr6 (73-156)||(5017482-5017567)
chr6 (92-151)||(12195515-12195575)
chr6 (92-151)||(4816231-4816291)
chr6 (92-151)||(5273216-5273276)
chr6 (92-151)||(19704567-19704627)
chr6 (92-151)||(20915356-20915416)
chr6 (92-151)||(26932562-26932622)
chr6 (92-151)||(29754709-29754769)
chr6 (92-151)||(33309110-33309170)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (11-335)||(22173134-22173458)
chr3 (11-338)||(18656251-18656579)
chr3 (11-333)||(7167072-7167391)
chr3 (11-333)||(28503814-28504124)
chr3 (11-338)||(2677026-2677356)
chr3 (11-338)||(2672870-2673200)
chr3 (15-333)||(2671540-2671855)
chr3 (23-338)||(8512032-8512352)
chr3 (23-338)||(8516912-8517232)
chr3 (11-307)||(24967957-24968253)
chr3 (15-333)||(8739017-8739333)
chr3 (15-333)||(9091255-9091571)
chr3 (23-338)||(32475301-32475618)
chr3 (23-338)||(32480158-32480476)
chr3 (15-176)||(40372750-40372911)
chr3 (107-338)||(10207750-10207983)
chr3 (11-333)||(8477193-8477510)
chr3 (11-112)||(28501647-28501750)
chr3 (15-178)||(26928545-26928709)
chr3 (61-178)||(1305927-1306044)
chr3 (15-178)||(32143299-32143463)
chr3 (61-155)||(8370477-8370573)
chr3 (61-155)||(27974943-27975039)
chr3 (61-156)||(18552873-18552971)
chr3 (44-155)||(16264350-16264463)
chr3 (61-156)||(21711222-21711319)
chr3 (61-155)||(27452958-27453054)
chr3 (73-155)||(27986449-27986533)
chr3 (61-154)||(36029094-36029190)
chr3 (61-152)||(1736295-1736389)
chr3 (61-155)||(30709780-30709877)
chr3 (30-156)||(40592742-40592870)
chr3 (73-155)||(33386669-33386753)
chr3 (61-156)||(3715992-3716090)
chr3 (61-156)||(48438213-48438311)
chr3 (61-156)||(6794704-6794801)
chr3 (61-156)||(26298987-26299085)
chr3 (61-155)||(25795781-25795878)
chr3 (61-156)||(47923896-47923994)
chr3 (92-156)||(1417513-1417578)
chr3 (73-156)||(37466290-37466375)
chr3 (73-155)||(39039995-39040079)
chr3 (61-156)||(40844651-40844748)
chr3 (73-156)||(3328359-3328444)
chr3 (89-155)||(4386947-4387014)
chr3 (61-156)||(24695154-24695252)
chr3 (92-151)||(38210569-38210629)
chr3 (92-151)||(50494198-50494258)
chr3 (88-151)||(53894055-53894119)
chr3 (73-134)||(3323693-3323755)
chr3 (245-333)||(40372980-40373064)
chr3 (131-178)||(1309832-1309878)
chr3 (92-151)||(458483-458543)
chr3 (92-151)||(6063444-6063504)
chr3 (92-151)||(10621528-10621588)
chr3 (108-155)||(39153357-39153405)
chr3 (108-159)||(44331669-44331721)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (11-338)||(35001-35328)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (11-338)||(9583-9907)
scaffold0355 (213-338)||(28-148)
scaffold0355 (11-69)||(3788-3845)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (23-338)||(25445040-25445357)
chr1 (23-338)||(39445317-39445633)
chr1 (11-338)||(41398055-41398381)
chr1 (23-338)||(44023825-44024140)
chr1 (23-338)||(1054963-1055279)
chr1 (11-257)||(41390485-41390726)
chr1 (11-318)||(24787314-24787624)
chr1 (11-338)||(43988401-43988734)
chr1 (15-268)||(24202724-24202973)
chr1 (61-192)||(19361433-19361564)
chr1 (61-192)||(19380073-19380204)
chr1 (15-192)||(19358798-19358975)
chr1 (259-338)||(41386566-41386646)
chr1 (31-155)||(26644869-26644994)
chr1 (70-156)||(47703946-47704034)
chr1 (61-155)||(19072928-19073025)
chr1 (61-155)||(19120818-19120915)
chr1 (31-155)||(3281708-3281833)
chr1 (61-156)||(16124516-16124614)
chr1 (61-156)||(27104372-27104470)
chr1 (70-156)||(9476260-9476348)
chr1 (70-156)||(13598397-13598485)
chr1 (70-156)||(29651810-29651898)
chr1 (63-155)||(37069770-37069864)
chr1 (70-156)||(775671-775759)
chr1 (31-155)||(21536541-21536666)
chr1 (73-156)||(47098837-47098922)
chr1 (61-155)||(13604624-13604720)
chr1 (73-156)||(32889438-32889523)
chr1 (92-152)||(47102874-47102935)
chr1 (92-151)||(9459419-9459479)
chr1 (92-151)||(9463246-9463306)
chr1 (92-151)||(16226386-16226446)
chr1 (92-151)||(23786058-23786118)
chr1 (23-51)||(25439847-25439875)
chr1 (92-151)||(51752582-51752642)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (23-338)||(180-496)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (11-338)||(19104-19433)
scaffold0197 (23-338)||(14259-14578)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (11-338)||(148895-149224)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (11-338)||(2190-2519)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (83-338)||(181976-182233)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (61-268)||(17953-18157)
scaffold0188 (61-178)||(24046-24164)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (259-338)||(34136-34216)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (123-333)||(300-506)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (61-155)||(8420-8516)
scaffold0140 (92-151)||(22343-22403)
scaffold0140 (92-151)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (61-154)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (44-155)||(43945-44058)
scaffold0087 (31-155)||(36804-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (70-156)||(5682-5770)
scaffold0006 (70-156)||(2491-2579)
scaffold0006 (61-155)||(133281-133377)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (272-338)||(13166-13233)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (61-156)||(10728-10826)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (73-155)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (61-152)||(17266-17360)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (92-151)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (92-125)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (92-151)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 39811928 - 39812255
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39811928 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 39812027  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39812028 ctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttctc-ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc 39812126  T
Q  211 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812127 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacat 39812226  T
Q  311 catt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  39812227 ctttggtttatttcattggtgtgaaggtt 39812255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32246933 - 32246602
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32246933 caaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 32246834  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttcc---ttttaccgcttatcttgtttatgctttggaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  32246833 ctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaat 32246734  T
Q  208 ctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32246733 ctcttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccaca 32246634  T
Q  308 catcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32246633 catcattggtttatttcattggtgtgaaggtt 32246602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312887
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 44312662  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44312663 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 44312760  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44312761 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 44312860  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaag 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44312861 atcattgtttatttcattggtgtgaag 44312887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19344556 - 19344238
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19344556 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctaga 19344457  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  19344456 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 19344360  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-g 315  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |    
T  19344359 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgg 19344261  T
Q  316 tttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19344260 tttatttcattggtgtgaaggtt 19344238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19349414 - 19349096
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19349414 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctaga 19349315  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  19349314 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 19349218  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-g 315  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |    
T  19349217 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgg 19349119  T
Q  316 tttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19349118 tttatttcattggtgtgaaggtt 19349096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 11098877 - 11099196
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11098877 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 11098975  T
Q  108 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||| ||    
T  11098976 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttcctttcttc-cttatcttgttt-tgctttggtat 11099072  T
Q  208 ctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 305  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11099073 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctcca 11099170  T
Q  306 cacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  11099171 cacatctttgtt--tttcattggtgtga 11099196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14291631 - 14291316
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14291631 gggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctc 14291533  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  14291532 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttatctct 14291436  T
Q  212 t-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttt-gttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
    | ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14291435 ttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 14291337  T
Q  310 tcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
     | ||||   ||||||||||||||    
T  14291336 cctttgt---tttcattggtgtga 14291316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Original strand, 9296355 - 9296670
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9296355 gggtagaatctagggcttgttcttgtataa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctc 9296453  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    |||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  9296454 tcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttttcttgttt-tgctttgttatctct 9296550  T
Q  212 t-gtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  9296551 ttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacaca 9296649  T
Q  310 tcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    || ||||   ||||||||||||||    
T  9296650 tctttgt---tttcattggtgtga 9296670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25398591 - 25398386
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25398591 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 25398493  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgtt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  25398492 ggtgtgtttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt--gctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 25398396  T
Q  258 ggcttggagac 268  Q
     ||||||||||    
T  25398395 -gcttggagac 25398386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25403729 - 25403524
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25403729 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctt-ttt 25403631  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgtt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  25403630 ggtgtgtttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt--gctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 25403534  T
Q  258 ggcttggagac 268  Q
     ||||||||||    
T  25403533 -gcttggagac 25403524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3491892 - 3491729
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagcta-gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct 112  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3491892 gggtagaatctaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct 3491794  T
Q  113 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  3491793 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--tttggtgtgtttgttcttccttt 3491729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040059
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 8040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738822
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgtt 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatct--tttggtgtgtttgtt 40738830  T
Q  171 cttccttt 178  Q
    ||||||||    
T  40738829 cttccttt 40738822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13569474 - 13569331
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| |||  ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13569474 caaagggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaaa-cttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgct 13569376  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13569375 ctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21630040 - 21629943
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21630040 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 21629943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 28259149 - 28259274
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28259149 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcat 28259247  T
Q  130 attgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259248 attggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 10445444 - 10445542
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttcaca-tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  10445444 tcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 10445542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17865300 - 17865202
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17865300 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttg 17865202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20522317 - 20522219
Alignment:
Q  61 tcttgtaacc-ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20522317 tcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 34682334 - 34682432
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34682334 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 34682432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34388955 - 34388859
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388955 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 10707223 - 10707348
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||    
T  10707223 ttgttcttgtgtaa-gcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtca 10707321  T
Q  129 tattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707322 tattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 14699008 - 14699105
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14699008 tcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 14699105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25407718 - 25407653
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattagg 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407718 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Original strand, 8390133 - 8390244
Alignment:
Q  44 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaac 140  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||    
T  8390133 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaac 8390232  T
Q  141 tgggtcaacaat 152  Q
    ||||||||||||    
T  8390233 tgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056044
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 23078442 - 23078567
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||    
T  23078442 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcat 23078540  T
Q  130 attggct-gaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23078541 attggatcgaactgggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 33528621 - 33528719
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33528621 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 33528719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 36757718 - 36757859
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctc 113  Q
    ||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||    |||| ||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |    
T  36757718 gggtagaaattaggttttgttcttgtgtaa-gcttgaaagcttttttcttataactctttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatccc 36757816  T
Q  114 ccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36757817 ccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39483028 - 39482930
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  39483028 tcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 39482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940307
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 16940307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010972
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 17010972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 42039670 - 42039766
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039670 tcttgtaactcttcgtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33118222 - 33118135
Alignment:
Q  71 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  33118222 ttttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatcttg 33118135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Original strand, 1345574 - 1345635
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1345574 tggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1345635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Original strand, 2838063 - 2838124
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  2838063 tggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 27149306 - 27149369
Alignment:
Q  72 tttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 134  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  27149306 tttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgg 27149369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Original strand, 2869705 - 2869787
Alignment:
Q  72 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  2869705 tttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 2869787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 45332238 - 45332181
Alignment:
Q  95 attggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  45332238 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 45332181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23452297 - 23452237
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  23452297 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36558924 - 36558864
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36558924 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36558864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36561201 - 36561141
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36561201 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36561141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 31109523 - 31109849
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31109523 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 31109622  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31109623 ctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttccttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctc 31109722  T
Q  211 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31109723 ttgtgtggttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctgcacacat 31109821  T
Q  311 cattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109822 cattgtttatttcattggtgtgaaggtt 31109849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12406477 - 12406150
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  12406477 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctattc 12406378  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12406377 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 12406280  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12406279 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 12406180  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406179 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 12406150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12397057 - 12396730
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12397057 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgttc 12396958  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12396957 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccctttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 12396860  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12396859 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 12396760  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396759 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 12396730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 24024266 - 24024594
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24024266 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaacattttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 24024365  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtg-ttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||  | ||    
T  24024366 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagct 24024464  T
Q  210 c-ttgtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 307  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24024465 ctttgtgtggttttgctatatactagtcata-ggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 24024563  T
Q  308 catcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024564 catcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 24024594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19992447 - 19992130
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992447 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 19992348  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||    
T  19992347 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 19992249  T
Q  220 tttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  19992248 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacctgctccacacatctttggttt 19992150  T
Q  319 atttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19992149 atttcattggtgtgaaggtt 19992130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 66 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4866820 - 4866548
Alignment:
Q  66 taaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgtt 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  4866820 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgtt 4866722  T
Q  166 ttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggtttt-gctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  4866721 ttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttg 4866623  T
Q  264 gagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866622 gagaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 4866548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 21812178 - 21812506
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagctt-ga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21812178 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagagtcttggaaccttttgtaagactt-cacatattggattggaaagctgct 21812275  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctt-tggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |  |     
T  21812276 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcttttaccgtttatcttgtttatgcttgttaac 21812375  T
Q  207 tctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccac 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  21812376 tct-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccac 21812473  T
Q  307 acatcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21812474 acatctttggtttatttcattggtgtgaaggtt 21812506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Original strand, 20357501 - 20357816
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct 112  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20357501 gggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 20357600  T
Q  113 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-t 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||  ||||| |    
T  20357601 cccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtattttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctt 20357697  T
Q  212 tgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacat 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20357698 tgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacat 20357796  T
Q  311 cattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    | ||||   ||||||||||||||    
T  20357797 ctttgt---tttcattggtgtga 20357816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2058108 - 2057786
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2058108 gggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctc 2058010  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttg----tttatgctttggaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    ||| |||||||| ||    
T  2058009 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtat 2057911  T
Q  208 ctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 305  Q
    ||| ||||||||||||||| || || ||  |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  2057910 ctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgttgtttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctcca 2057812  T
Q  306 cacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  2057811 cacatctttgtt--tttcattggtgtga 2057786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 24261273 - 24261592
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261273 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 24261372  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  24261373 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 24261469  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 315  Q
    | |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  24261470 gatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttg 24261567  T
Q  316 -tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  24261568 atttattctcattggtgtgaaggtt 24261592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 24266152 - 24266471
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266152 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 24266251  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  24266252 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 24266348  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 315  Q
    | |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  24266349 gatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttg 24266446  T
Q  316 -tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  24266447 atttattctcattggtgtgaaggtt 24266471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16880207 - 16879889
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880207 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 16880108  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  16880107 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 16880011  T
Q  219 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg- 315  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||     
T  16880010 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttga 16879913  T
Q  316 tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  16879912 tttattctcattggtgtgaaggtt 16879889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16885063 - 16884745
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16885063 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 16884964  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  16884963 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 16884867  T
Q  219 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg- 315  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||     
T  16884866 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttga 16884769  T
Q  316 tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  16884768 tttattctcattggtgtgaaggtt 16884745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 1533393 - 1533709
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttg-ttcatgtgtaaagcttgaaagcta--gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctg 106  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1533393 caaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgt-aagcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatg 1533491  T
Q  107 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttgga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||   |||||| |||||  ||||||| |    
T  1533492 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-attggtgtgtttgttctttc-tttcttgcttatattgtt--tgctttgta 1533587  T
Q  206 atctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     |||||| |||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  1533588 ttctctt-tgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttgtt-gcttggaaac--ttttttctcattgattaccactatattttgctcc 1533683  T
Q  305 acacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  1533684 acacatctttgt---tttcattggtgtga 1533709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21639950 - 21639701
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctct 112  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  21639950 gggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctct 21639852  T
Q  113 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| | |||||    
T  21639851 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt--gctttgtattctct 21639756  T
Q  212 tgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 268  Q
    ||||  || ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21639755 tgtg--gtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 21639701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21646148 - 21645899
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagcta-gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct 112  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21646148 gggtagaatctaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct 21646050  T
Q  113 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct 211  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||  || |||| | |||||    
T  21646049 tccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtt--tgttttgtattctct 21645954  T
Q  212 tgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 268  Q
      |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21645953 --tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 21645899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18408859 - 18408742
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18408859 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 18408762  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  18408761 ggtgtgtttgttctttcttt 18408742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18413735 - 18413619
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18413735 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 18413639  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  18413638 ggtgtgtttgttctttcttt 18413619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21983427 - 21983285
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaacc--ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21983427 gggtagaaactaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc 21983329  T
Q  112 tcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983328 tcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29159929 - 29159802
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  29159929 ttgttcttgtgtaa-gcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtca 29159831  T
Q  129 tattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29159830 tattggaccgaactgggtcaacaatcttg 29159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 46516310 - 46516408
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46516310 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 46516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49091758 - 49091660
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49091758 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttg 49091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 44848685 - 44848781
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848685 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2580531 - 2580389
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctc 113  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||   |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  2580531 gggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctc 2580433  T
Q  114 ccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  2580432 ccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 2580389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 2647696 - 2647794
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2647696 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttg 2647794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 33332450 - 33332548
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  33332450 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 33332548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190106
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9190106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284088
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20284088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 56044 - 55947
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  56044 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 55947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960815
Alignment:
Q  72 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatcttg 35960815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185263
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2479461 - 2479337
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  2479461 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttataactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcat 2479364  T
Q  130 attgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479363 attgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 4796667 - 4796765
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4796667 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttg 4796765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  76 taacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgc--tctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617319
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 28617319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  71 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctc--ctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 5817282 - 5817366
Alignment:
Q  72 tttgtaacactttcacat-attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  5817282 tttgtatcactttcatattagtggattggagagctgctctct-ccccagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 5817366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1049356 - 1049296
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  1049356 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1049296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 2935497 - 2935557
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2935497 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 2935557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 3035953 - 3036013
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  3035953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3036013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7351712 - 7351652
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7351712 tggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153514
Alignment:
Q  108 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 8153514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9027254 - 9027194
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9027254 tggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9027194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 22108295 - 22108355
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22108295 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 22137306 - 22137366
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22137306 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22137366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 40550055 - 40550115
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40550055 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40550115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 40552333 - 40552393
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40552333 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40552393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 39784774 - 39785091
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784774 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 39784872  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttctt-ccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggtt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39784873 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggtt 39784972  T
Q  221 ttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttta 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39784973 ttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatctttggttta 39785072  T
Q  320 tttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39785073 tttcattggtgtgaaggtt 39785091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 25328218 - 25328545
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25328218 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 25328317  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  25328318 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttttcctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatct 25328416  T
Q  210 cttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25328417 cttgtgtggttttgctatacactag-ttagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccgcaca 25328515  T
Q  310 tcattg-tttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25328516 tcattgatttatttcattgttgtgaaggtt 25328545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 7289865 - 7290188
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7289865 caaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 7289964  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  7289965 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatggtttgttatct 7290063  T
Q  210 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7290064 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 7290163  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  7290164 atcaatgtttatttcattggtgtga 7290188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6311443 - 6311121
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6311443 caaagggtagaatctagggtttgt-cttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 6311345  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  |||    
T  6311344 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatc 6311247  T
Q  209 tctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6311246 tcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 6311147  T
Q  308 catcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6311146 catcattgtttatttcattggtgtga 6311121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35745526 - 35745208
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745526 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 35745427  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  35745426 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 35745331  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-g 315  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  35745330 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgg 35745232  T
Q  316 tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  35745231 tttattctcattggtgtgaaggtt 35745208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36979524 - 36979205
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36979524 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 36979426  T
Q  108 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| ||    
T  36979425 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtat 36979329  T
Q  208 ctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttt-gttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 305  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36979328 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttg-cttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctcca 36979231  T
Q  306 cacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  36979230 cacatctttgtt--tttcattggtgtga 36979205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 318
Target Start/End: Original strand, 33037761 - 33038063
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33037761 gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 33037859  T
Q  113 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-t 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  33037860 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttctt-cttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctt 33037956  T
Q  212 tgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtt--ttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33037957 tgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttgtt-gcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacaca 33038054  T
Q  310 tcattgttt 318  Q
    || ||||||    
T  33038055 tctttgttt 33038063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 318
Target Start/End: Original strand, 4760029 - 4760332
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4760029 gggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctc 4760127  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4760128 tcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-gatgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctct 4760225  T
Q  212 t-gtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  4760226 ttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt-tgctcattgattaccactatctctagctccacaca 4760323  T
Q  310 tcattgttt 318  Q
    || ||||||    
T  4760324 tctttgttt 4760332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30655793 - 30655469
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30655793 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgc 30655695  T
Q  108 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtg----ttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  30655694 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttg 30655597  T
Q  204 gaatctct-tgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttg 300  Q
      |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||    
T  30655596 ttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttg 30655499  T
Q  301 ctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  30655498 ctccacacatctttgt---tttcattggtgtga 30655469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Original strand, 10689097 - 10689412
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10689097 gggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctc 10689195  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttcctt--ttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||| |||||||| ||||    
T  10689196 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttcctttctta---cttatcttgttt-tgctttggtatct 10689290  T
Q  210 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 307  Q
    | ||||||||||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  10689291 ctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccattag-actcatagattaccactatctcttgctccaca 10689388  T
Q  308 catcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||    
T  10689389 catctttgtt--tttcattggtgtga 10689412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Original strand, 18853117 - 18853425
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaacc-ttttgtaacactttcac-atattggattggagagctg 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18853117 caaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctg 18853215  T
Q  107 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| |    
T  18853216 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggta 18853312  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggc-tgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||  |||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  18853313 tctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgcttggaaaccatttga-ctcatagattaccactatctcttgctcc 18853411  T
Q  305 acacatcattgttt 318  Q
    ||||||| ||||||    
T  18853412 acacatctttgttt 18853425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 10684214 - 10684533
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684214 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 10684313  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  10684314 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 10684410  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 315  Q
    | |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  10684411 gatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttg 10684508  T
Q  316 -tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  10684509 atttattctcattggtgtgaaggtt 10684533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 18870511 - 18870828
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaacc-ttttgtaacactttcac-atattggattggagagctg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18870511 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctg 18870609  T
Q  107 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| |    
T  18870610 ctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggta 18870706  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 305  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||   ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  18870707 tctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggc-gtttt-ttgttgtttgcttggaaaccatttaa-ctcatagattaccattatctcttgctcca 18870803  T
Q  306 cacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||    
T  18870804 cacatctttgt---tttcattggtgtga 18870828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Original strand, 1261955 - 1262073
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1261955 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctt-ttt 1262053  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  1262054 ggtgtgtttgttcttccttt 1262073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287879
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgtt 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgtt 26287887  T
Q  171 cttccttt 178  Q
    ||||||||    
T  26287886 cttccttt 26287879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301136
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgtt 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgtt 26301144  T
Q  171 cttccttt 178  Q
    ||||||||    
T  26301143 cttccttt 26301136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313130
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgtt 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgtt 26313138  T
Q  171 cttccttt 178  Q
    ||||||||    
T  26313137 cttccttt 26313130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Original strand, 31071230 - 31071349
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgtt 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||    
T  31071230 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctt-tt 31071328  T
Q  159 tggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  31071329 tggtgtgtttgttcttccttt 31071349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403328
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 26403328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4456124 - 4456028
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456124 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7412437 - 7412344
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  7412437 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 7412344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 19175755 - 19175851
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19175755 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Original strand, 23799548 - 23799675
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  23799548 ttgttcttgtgtaa-gcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtca 23799646  T
Q  129 tattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23799647 tattggaccgaactgggtcaacaatcttg 23799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696694
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 4696694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 5702483 - 5702581
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5702483 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6127318 - 6127224
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  6127318 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752492
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 19752492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6813750 - 6813683
Alignment:
Q  89 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  6813750 tattggattggagagctgctctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaatctt 6813683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 125
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811015
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattagg 18811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 44721118 - 44721178
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  44721118 tggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44721178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15044831 - 15044507
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15044831 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 15044732  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044731 ctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc 15044633  T
Q  211 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  15044632 ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctctacacgt 15044533  T
Q  311 cattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||    
T  15044532 cattg--tatttcattggtgtgaaggtt 15044507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43592425 - 43592102
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43592425 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 43592326  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||    
T  43592325 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 43592227  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43592226 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 43592127  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  43592126 atcattgtttatttcattgatgtga 43592102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43598870 - 43598547
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43598870 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 43598771  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||    
T  43598770 tctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 43598672  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43598671 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 43598572  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43598571 atcattgtttatttcattggtgtga 43598547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43604362 - 43604039
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43604362 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 43604263  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||    
T  43604262 tctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 43604164  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43604163 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 43604064  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43604063 atcattgtttatttcattggtgtga 43604039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43609854 - 43609531
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43609854 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 43609755  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||    
T  43609754 tctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 43609656  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43609655 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 43609556  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43609555 atcattgtttatttcattggtgtga 43609531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27445116 - 27444793
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27445116 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 27445017  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||    
T  27445016 tctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 27444918  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27444917 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacac 27444818  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27444817 atcattgtttatttcattggtgtga 27444793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27449960 - 27449637
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27449960 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 27449861  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||    
T  27449860 tctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 27449762  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  27449761 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacat 27449662  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27449661 atcattgtttatttcattggtgtga 27449637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 1457101 - 1457423
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1457101 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 1457200  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  1457201 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcc-tttctttcttatcttgtttatgctttgttatct 1457298  T
Q  210 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1457299 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 1457398  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1457399 atcattgtttatttcattggtgtga 1457423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 28807514 - 28807842
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28807514 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagattcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctct 28807611  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||    
T  28807612 ctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagct 28807710  T
Q  210 c-ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccac 306  Q
    | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807711 ctttgagtggttttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccac 28807809  T
Q  307 acatcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28807810 acatcattggtttatttcattggtgtgaaggtt 28807842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 37561395 - 37561714
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561395 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 37561494  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttctt-ccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggt 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||    
T  37561495 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgctt-gttagctcttagtgtggt 37561593  T
Q  220 tttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtt 317  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  37561594 tttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtt 37561692  T
Q  318 tatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37561693 tattatcattggtgtgaaggtt 37561714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30631553 - 30631231
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30631553 caaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 30631454  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttcctt--ttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||  |    
T  30631453 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttcctttctta---cttatcttgtttatgctttgtta 30631358  T
Q  207 tctct-tgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 305  Q
    ||| | | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  30631357 tctatatatgtgattttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttgaaaaccatttgttctcatagattaccactatctcttgctcca 30631259  T
Q  306 cacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30631258 cacatcattgtttatttcatttgtgtga 30631231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 37556573 - 37556889
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556573 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 37556672  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttctt-ccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggt 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||    
T  37556673 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgctt-gttagctcttagtgtggt 37556771  T
Q  220 tttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtt 317  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  37556772 tttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtt 37556870  T
Q  318 tatt-tcattggtgtgaag 335  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  37556871 tattatcattggtgtgaag 37556889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2785510 - 2785192
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785510 tctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 2785411  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  2785410 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 2785315  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-g 315  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2785314 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgg 2785216  T
Q  316 tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  2785215 tttattctcattggtgtgaaggtt 2785192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33791451 - 33791133
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33791451 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctttcccccaga 33791352  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||| |||  | |||| | ||||    
T  33791351 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctctatatgtg 33791256  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-g 315  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  33791255 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgg 33791157  T
Q  316 tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  33791156 tttattctcattgatgtgaaggtt 33791133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33768314 - 33767996
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33768314 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccaga 33768215  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||| || ||||| ||  ||||| |||  | |||| | ||||    
T  33768214 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctg--tatgc-ttgttagctctatatgtg 33768119  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-g 315  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  33768118 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgg 33768020  T
Q  316 tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  33768019 tttattctcattgatgtgaaggtt 33767996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31180360 - 31180138
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31180360 caaagggtagaatctagggtttgt-cttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 31180262  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||  |||    
T  31180261 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttctttc-tttctttcttatcttgtttatgctttgttatc 31180164  T
Q  209 tc-ttgtgtggttttgctatacacta 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  31180163 tctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 31396930 - 31397261
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgtt--catgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctg 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31396930 caaagggtaga-tctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 31397028  T
Q  107 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttt-tgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttgga 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |  || |||||| || ||||||||  ||||| |||      
T  31397029 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgtt 31397125  T
Q  206 atctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctc 303  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31397126 agctcttagtgtggttttgctttacattaggctta-ggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctc 31397224  T
Q  304 cacacatcattg-tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31397225 cacacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 31397261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 338
Target Start/End: Original strand, 31401815 - 31402118
Alignment:
Q  38 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggc 135  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31401815 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattggc 31401914  T
Q  136 tgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacact 232  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| |||| |    
T  31401915 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctttacatt 31402010  T
Q  233 a-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tcattggt 329  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31402011 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggt 31402109  T
Q  330 gtgaaggtt 338  Q
    |||||||||    
T  31402110 gtgaaggtt 31402118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38192269 - 38192064
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38192269 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 38192171  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgtt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  38192170 ggtgtgtttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt--gctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 38192074  T
Q  258 ggcttggagac 268  Q
     ||||||||||    
T  38192073 -gcttggagac 38192064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38219494 - 38219289
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38219494 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 38219396  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgtt 257  Q
    ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  38219395 ggtgtgtttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt--gctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 38219299  T
Q  258 ggcttggagac 268  Q
     ||||||||||    
T  38219298 -gcttggagac 38219289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24135994 - 24135740
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagcta-gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||| |||||||    
T  24135994 caaagggtagaatctaggacttgttcttgtgt-aagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgct 24135896  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||| | |    
T  24135895 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgtgtttgttcttccttttctagcttatcttgtt--tgctttgtatt 24135799  T
Q  208 ctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagac 268  Q
     |||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24135798 atct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagac 24135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35387758 - 35387640
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  35387758 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctt-ttt 35387660  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  35387659 ggtgtgtttgttcttccttt 35387640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 9353333 - 9353429
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353333 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 36932351 - 36932447
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932351 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10281877 - 10281751
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10281877 ttgttcttgtgtaa-gcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtca 10281779  T
Q  129 tattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281778 tattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15464628 - 15464532
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464628 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Original strand, 11916972 - 11917068
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916972 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14520355 - 14520230
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  14520355 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcat 14520257  T
Q  130 attgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520256 attggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004058
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 17004058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3880396 - 3880298
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  3880396 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatcttg 3880298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Original strand, 12084176 - 12084269
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12084176 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19588843 - 19588746
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588843 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832258
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttg 28832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127508
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 42127508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 156
Target Start/End: Original strand, 31300612 - 31300694
Alignment:
Q  76 taacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31300612 taacactttcatcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31300694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Original strand, 27910675 - 27910729
Alignment:
Q  98 ggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  27910675 ggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27910729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 24553520 - 24553604
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24553520 ttgtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 24553604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3373197 - 3373137
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3373197 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 3373137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 10749919 - 10749979
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10749919 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 10749979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15354635 - 15354575
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15354635 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15354575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 45357236 - 45357563
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45357236 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 45357335  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45357336 ctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatct 45357434  T
Q  210 cttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45357435 cttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacaca 45357534  T
Q  310 tcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357535 tcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 45357563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 9224346 - 9224673
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9224346 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 9224445  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9224446 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 9224543  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9224544 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 9224643  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224644 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 9224673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 45347756 - 45348084
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag-tcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45347756 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 45347855  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttctt-ccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatc 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45347856 tctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatc 45347954  T
Q  209 tcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45347955 tcttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacac 45348054  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45348055 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 45348084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 9229133 - 9229460
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9229133 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 9229232  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9229233 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 9229330  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9229331 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 9229430  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229431 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 9229460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 51520603 - 51520280
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51520603 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 51520504  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||    
T  51520503 tctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatct 51520405  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  51520404 ctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 51520305  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  51520304 atcattgtttatttcattggtgtga 51520280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18855860 - 18855544
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855860 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 18855762  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||    
T  18855761 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 18855663  T
Q  220 tttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18855662 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggttt 18855564  T
Q  319 atttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18855563 atttcattggtgtgaaggtt 18855544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5732809 - 5732481
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5732809 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 5732711  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtg----ttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    |||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||  |    
T  5732710 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgtta 5732613  T
Q  207 tctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 305  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5732612 gctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctcca 5732513  T
Q  306 cacatcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5732512 cacatcattgtat-tttcattggtgtgaaggtt 5732481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3814168 - 3813841
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814168 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 3814070  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  | |||    
T  3814069 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgc-ttgttagctc 3813972  T
Q  211 -ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
     |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3813971 tttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgctctcattgattaccactatcacttgctccacac 3813872  T
Q  309 atcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3813871 atcattggtttatttcattggtgtgaaggtt 3813841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 334
Target Start/End: Original strand, 56146664 - 56146974
Alignment:
Q  25 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagatta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146664 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 56146763  T
Q  124 ggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggtttt 222  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  56146764 ggccatattggctgaactggaccaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggtttt 56146862  T
Q  223 gctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttattt 322  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56146863 gctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttattt 56146962  T
Q  323 cattggtgtgaa 334  Q
    ||||||||||||    
T  56146963 cattggtgtgaa 56146974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24742087 - 24741769
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24742087 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 24741989  T
Q  108 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| ||    
T  24741988 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtat 24741892  T
Q  208 ctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttt-gttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 305  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24741891 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttg-cttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctcca 24741794  T
Q  306 cacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||    
T  24741793 cacatctttgt---tttcattggtgtga 24741769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29760737 - 29760470
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29760737 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 29760639  T
Q  160 ggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttg 258  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||     
T  29760638 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgttgtt- 29760542  T
Q  259 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||| ||||||| |  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  29760541 gcttggaaaccattt-tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtga 29760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468647
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgtt 170  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatct--tttggtgtgtttgtt 28468639  T
Q  171 cttccttt 178  Q
    ||||||||    
T  28468640 cttccttt 28468647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Original strand, 31985635 - 31985752
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgtt 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  31985635 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct--tt 31985731  T
Q  159 tggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  31985732 tggtgtgtttgttcttccttt 31985752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10047476 - 10047378
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10047476 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 10047378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39246091 - 39245993
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39246091 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 39245993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 36315230 - 36315327
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36315230 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36315327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 36329439 - 36329536
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36329439 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36329536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152537
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 38152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 5396643 - 5396768
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5396643 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcat 5396741  T
Q  130 attgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396742 attggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 16623293 - 16623391
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  16623293 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 16623391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269291
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgtt 158  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgtt 5269291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Original strand, 3796502 - 3796616
Alignment:
Q  44 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaac 140  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||    
T  3796502 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaac 3796601  T
Q  141 tgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||||    
T  3796602 tgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  71 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5147803 - 5147678
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaacc-ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  5147803 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactattttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtca 5147705  T
Q  129 tattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||    
T  5147704 tattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333808
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatcttg 24333808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3777645 - 3777550
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777645 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 16630680 - 16630778
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  16630680 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaaccttg 16630778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862120
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 25862120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 39774305 - 39774380
Alignment:
Q  61 tcttgtaacct-tttgtaacactttcacat-attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 134  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  39774305 tcttgtaacctatttgtatcactttcattttagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattgg 39774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 54867269 - 54867183
Alignment:
Q  71 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||| ||||| |||| | ||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  54867269 ttttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 54867183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 6765117 - 6765177
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  6765117 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 7941596 - 7941656
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  7941596 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7941656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18709224 - 18709164
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18709224 tggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 18709164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22782798 - 22782738
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  22782798 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaa 22782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 14737516 - 14737843
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14737516 caaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 14737615  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14737616 ctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctc 14737713  T
Q  211 --ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
      ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737714 ttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 14737813  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737814 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 14737843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28184650 - 28184320
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28184650 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtgttgtaaccttttgtaacactttctcatattagattggagagctgctct 28184551  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184550 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 28184452  T
Q  210 cttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagacca--tttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184451 cttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 28184352  T
Q  308 catcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28184351 catcattggtttatttcattggtgtgaaggtt 28184320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 14742376 - 14742702
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14742376 caaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 14742475  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  14742476 ctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatctc 14742573  T
Q  211 -ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742574 tttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 14742673  T
Q  310 tcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742674 tcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 14742702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 22010636 - 22010960
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22010636 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 22010735  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22010736 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 22010833  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22010834 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 22010933  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaag 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22010934 atcattgtttatttcattggtgtgaag 22010960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11857120 - 11856790
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11857120 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 11857021  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtt--tggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaat 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  11857020 tctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtttttttgttcttccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggtat 11856922  T
Q  208 ctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccac 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11856921 ctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccac 11856822  T
Q  307 acatcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856821 acatcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 11856790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6438634 - 6438319
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438634 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 6438536  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||    
T  6438535 taggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 6438437  T
Q  220 tttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgttta 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438436 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccattggttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgttta 6438338  T
Q  320 tttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6438337 tttcattggtgtgaaggtt 6438319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 28155510 - 28155837
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28155510 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaattcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 28155608  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttctt-ccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |  | ||    
T  28155609 ctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgctt-gttagct 28155707  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155708 cttagtgtggttttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccaca 28155806  T
Q  308 catcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28155807 catcattgtttattgcattggtgtgaaggtt 28155837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6005552 - 6005234
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005552 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 6005453  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  6005452 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 6005357  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-g 315  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6005356 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgg 6005258  T
Q  316 tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  6005257 tttattctcattggtgtgaaggtt 6005234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16838890 - 16838561
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16838890 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 16838792  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  |    
T  16838791 ctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgtta 16838696  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16838695 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttgaaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 16838597  T
Q  305 acacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16838596 acatatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 16838561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 33330384 - 33330715
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33330384 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 33330482  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||| |  | |||||||| |||||| |||  |    
T  33330483 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgtta 33330579  T
Q  207 tctctt-gtgtgg-ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctc 303  Q
     ||||| |||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33330580 gctcttagtgtggtttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctc 33330678  T
Q  304 cacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  33330679 cacacatcattggtttattctaattggtgtgaaggtt 33330715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 33335881 - 33336212
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33335881 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 33335979  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||| |  | |||||||| |||||| |||  |    
T  33335980 ctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgtta 33336076  T
Q  207 tctctt-gtgtgg-ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctc 303  Q
     ||||| |||||| |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33336077 gctcttagtgtggtttttactatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagtttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctc 33336175  T
Q  304 cacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33336176 cacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 33336212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 5674719 - 5675036
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttg-ttcatgtgtaaagcttgaaagcta--gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctg 106  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5674719 caaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgt-aagcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctg 5674817  T
Q  107 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttgga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||   |||||| |||||  ||||||| |    
T  5674818 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc-tctttggtgtgtttgttctttc-tttcttgcttatattgtt--tgctttgta 5674913  T
Q  206 atctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     |||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  | ||| ||  ||| | ||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  5674914 ttctctt-tgtggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgttgttgcttgggaaac--tttttactctttgattaccactatcttttgctcc 5675010  T
Q  305 acacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  5675011 acacatctttgt---tttcattggtgtga 5675036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343297
Alignment:
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaat 207  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  || | |||| || |||||||||  |||||| |  |     
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcctttatcgtttatcttgt--atgctt-gttag 5343432  T
Q  208 ctctt-gtgtggtttt-gctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5343431 ctcttagtgtggtttttgctatactttaggcttagg-ctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 5343333  T
Q  305 acacatcattg-tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  5343332 acacatcattgacttattctcattggtgtgaaggtt 5343297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Original strand, 5757462 - 5757575
Alignment:
Q  44 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaact 141  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  5757462 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 5757561  T
Q  142 gggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||||||||    
T  5757562 gggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 333
Target Start/End: Original strand, 30125944 - 30126063
Alignment:
Q  211 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  30125944 ttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttg-gctcatagattatcactacctcttgctccacaca 30126042  T
Q  310 tcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    || ||||   ||||||||||||||    
T  30126043 tctttgt---tttcattggtgtga 30126063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21356132 - 21356036
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356132 tcttgtaactcttagtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077263
Alignment:
Q  71 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 10077263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 5572241 - 5572339
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5572241 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 5572339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086571
Alignment:
Q  72 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 31086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  71 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31979610 - 31979512
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31979610 tcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31979512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22708996
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgt 169  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||| |||||||||  || |||||||| |||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaa--ttttttggtgtgtttgt 22709005  T
Q  170 tcttccttt 178  Q
    |||||||||    
T  22709004 tcttccttt 22708996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22963796 - 22963699
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22963796 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 22963699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 23824597 - 23824694
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23824597 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 23824694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 143
Target Start/End: Original strand, 21801344 - 21801429
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgg 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801344 tcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31936671 - 31936586
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttcacat-attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  31936671 ttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 31936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18232942 - 18232867
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232942 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017567
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata-ttggctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttg 5017567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4816291 - 4816231
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  4816291 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5273276 - 5273216
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  5273276 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5273216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19704627 - 19704567
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  19704627 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19704567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20915416 - 20915356
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  20915416 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20915356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26932622 - 26932562
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26932622 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 29754769 - 29754709
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29754769 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 29754709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 33309110 - 33309170
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33309110 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 33309170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 22173134 - 22173458
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22173134 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 22173233  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22173234 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttattt-tgctttggtatct 22173331  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22173332 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 22173431  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaag 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173432 atcattgtttatttcattggtgtgaag 22173458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18656579 - 18656251
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18656579 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 18656481  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtg----ttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    |||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||  |    
T  18656480 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgtta 18656383  T
Q  207 tctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 305  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18656382 gctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctcca 18656283  T
Q  306 cacatcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18656282 cacatcattgtat-tttcattggtgtgaaggtt 18656251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7167391 - 7167072
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7167391 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 7167293  T
Q  108 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  ||    
T  7167292 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttat 7167195  T
Q  208 ctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccac 306  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  7167194 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactatctcttgctccac 7167097  T
Q  307 acatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  7167096 acatctttgtt--tttcattggtgtga 7167072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 28503814 - 28504124
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28503814 caaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 28503913  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatc 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||          ||||||||||||||||  |||    
T  28503914 ctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctt----------tcttgtttatgctttgttatc 28504002  T
Q  209 tc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  28504003 tctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt-ttctcatagattatcactaccttttgctccaca 28504100  T
Q  308 catcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||||||   |||||||||||||    
T  28504101 catcattgtt--attcattggtgtga 28504124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 2677026 - 2677356
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2677026 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 2677124  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||| |  | |||||||| |||||| |||  |    
T  2677125 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgtta 2677221  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2677222 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatctctatcacttgctcc 2677320  T
Q  305 acacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2677321 acacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 2677356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 2672870 - 2673200
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2672870 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 2672968  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||| |  | |||||||| |||||| |||  |    
T  2672969 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgtta 2673065  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2673066 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttactctcatagattatctctatcacttgctcc 2673164  T
Q  305 acacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2673165 acacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 2673200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Original strand, 2671540 - 2671855
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| || |||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2671540 gggtagaatctagggcttggtcttgtgtaa-gcttgcaatctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctc 2671638  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  2671639 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttatctct 2671735  T
Q  212 t-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttt-gttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 309  Q
    | |||||||||| || ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2671736 ttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacaca 2671834  T
Q  310 tcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    || ||||   ||||||||||||||    
T  2671835 tctttgt---tttcattggtgtga 2671855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8512352 - 8512032
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512352 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 8512253  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccg-cttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || | |||| ||  ||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||    
T  8512252 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgc-ttgttaactcttagtgt 8512156  T
Q  217 ggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 315  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8512155 ggttgtgctacacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 8512057  T
Q  316 -tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  8512056 atttattctcattggtgtgaaggtt 8512032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8517232 - 8516912
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517232 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 8517133  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccg-cttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || | |||| ||  ||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||    
T  8517132 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgc-ttgttaactcttagtgt 8517036  T
Q  217 ggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 315  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8517035 ggttgtgctacacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 8516937  T
Q  316 -tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  8516936 atttattctcattggtgtgaaggtt 8516912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24968253 - 24967957
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24968253 caaagggtaga-tctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctact 24968155  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  |    
T  24968154 ctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgtta 24968059  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24968058 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 24967960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Original strand, 8739017 - 8739333
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8739017 gggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctc 8739115  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| |||||     
T  8739116 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctct 8739212  T
Q  211 ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    |||||||| ||||| | || || ||  |||||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  8739213 ttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacac 8739311  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||    
T  8739312 atctttgt---tttcattggtgtga 8739333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 333
Target Start/End: Original strand, 9091255 - 9091571
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9091255 gggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctc 9091353  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| |||||     
T  9091354 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctct 9091450  T
Q  211 ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    |||||||| ||||| | || || ||  |||||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  9091451 ttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacac 9091549  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||    
T  9091550 atctttgt---tttcattggtgtga 9091571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32475618 - 32475301
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475618 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 32475520  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  32475519 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 32475423  T
Q  219 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg- 315  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||     
T  32475422 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttga 32475325  T
Q  316 tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  32475324 tttattctcattggtgtgaaggtt 32475301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32480476 - 32480158
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480476 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 32480378  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  32480377 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 32480281  T
Q  219 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg- 315  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||     
T  32480280 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgg 32480183  T
Q  316 -tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  32480182 atttattctcattggtgtgaaggtt 32480158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Original strand, 40372750 - 40372911
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagcta-gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct 112  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40372750 gggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctct 40372848  T
Q  113 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttcct 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40372849 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttcct 40372911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207750
Alignment:
Q  107 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttctt--ccttttaccgcttatcttgtttatgctttgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||| |  | |||||||||| |||||| |     
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtt-atgctt-gt 10207887  T
Q  205 aatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgct 302  Q
     | ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10207886 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttagg-ctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 10207788  T
Q  303 ccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10207787 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 10207750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8477510 - 8477193
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttca-tgtgtaaagcttgaaagcta--gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctg 106  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8477510 caaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgt-aagcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctg 8477412  T
Q  107 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttgga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||   ||||||||||||  ||||||| |    
T  8477411 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgtgtttgttctttc-tttcttgcttatcttgtt--tgctttgta 8477316  T
Q  206 atctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     | |||| |||||| ||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  | ||| ||  ||| | ||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  8477315 ttatctt-tgtggtgttgttctacactagtctagggctggttttgttgttgttgcttgggaaac--tttttactctttgattaccactatcttttgctcc 8477219  T
Q  305 acacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  8477218 acacatctttgt---tttcattggtgtga 8477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Original strand, 28501647 - 28501750
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28501647 caaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 28501746  T
Q  109 ctct 112  Q
    ||||    
T  28501747 ctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 26928545 - 26928709
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc 111  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||   |  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  26928545 gggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctc 26928643  T
Q  112 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  26928644 tcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatct--tttggtgtgtttgttctttcttt 26928709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1306044 - 1305927
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1306044 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 1305947  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  1305946 ggtgtgtttgttcttccttt 1305927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32143463 - 32143299
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagcta-gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct 112  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32143463 gggtagaatctaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct 32143365  T
Q  113 cccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  32143364 cccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct--tttggtgtgtttgttcttccttt 32143299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 8370477 - 8370573
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370477 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 27974943 - 27975039
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974943 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 18552873 - 18552971
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18552873 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 18552971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16264463 - 16264350
Alignment:
Q  44 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaact 141  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  16264463 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 16264364  T
Q  142 gggtcaacaatctt 155  Q
     |||||||||||||    
T  16264363 aggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21711319 - 21711222
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21711319 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 21711222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27453054 - 27452958
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  27453054 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 27452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986533
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27986533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36029190 - 36029094
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36029190 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Original strand, 1736295 - 1736389
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1736295 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 30709780 - 30709877
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709780 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Original strand, 40592742 - 40592870
Alignment:
Q  30 tttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggcc 127  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  40592742 tttgttcttgtgtaa-gcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtc 40592840  T
Q  128 atattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40592841 atattggaccgaactgggtcaacaatcttg 40592870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 3715992 - 3716090
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3715992 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 3716090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48438311 - 48438213
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  48438311 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatcttg 48438213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 6794704 - 6794801
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  6794704 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatcttg 6794801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26299085 - 26298987
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  26299085 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 26298987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25795878 - 25795781
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795878 tcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 47923896 - 47923994
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47923896 tcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 156
Target Start/End: Original strand, 1417513 - 1417578
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1417513 tggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 1417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466290
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 37466290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40844748 - 40844651
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  40844748 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatcttg 40844651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328444
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttg 3328444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4387014
Alignment:
Q  89 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  || |||||||| |||||||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatactgaactaaactgggtaaacaatctt 4387014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 24695154 - 24695252
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24695154 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 24695252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894055
Alignment:
Q  88 atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 134
Target Start/End: Original strand, 3323693 - 3323755
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 134  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3323693 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 333
Target Start/End: Original strand, 40372980 - 40373064
Alignment:
Q  245 ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 333  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||    
T  40372980 ttttgatgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgt---tttcattggtgtga 40373064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1309878 - 1309832
Alignment:
Q  131 ttggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  1309878 ttggctgaactgggtcaacaatct--tttggtgtgtttgttcttccttt 1309832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 458483 - 458543
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  458483 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaa 458543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6063504 - 6063444
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| ||||    
T  6063504 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaa 6063444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10621588 - 10621528
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10621588 tggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaa 10621528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153357
Alignment:
Q  108 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 39153357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331721
Alignment:
Q  108 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatcttgttt 44331721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 35001 - 35328
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35001 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 35100  T
Q  110 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35101 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctc-ggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatct 35198  T
Q  210 ctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35199 ctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacac 35298  T
Q  309 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35299 atcattgtttatttcattggtgtgaaggtt 35328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 9583 - 9907
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9583 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 9681  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |  | |||    
T  9682 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc-ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctc 9778  T
Q  211 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacat 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9779 ttgtgtggttttgctatatactagcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacat 9878  T
Q  311 catt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9879 cattggtttatttcattggtgtgaaggtt 9907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Original strand, 28 - 148
Alignment:
Q  213 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  28 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcattgat------tatcacttgctccacacatca 121  T
Q  313 tt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    || |||||||| |||||||||||||||    
T  122 ttggtttatttaattggtgtgaaggtt 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 3788 - 3845
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3788 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaac 3845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 25445040 - 25445357
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445040 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 25445139  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||  | ||| |||||||||    
T  25445140 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttacgc-ttgttagctctttgtgtggt 25445238  T
Q  220 tttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25445239 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcgcttgctccacacatcattggttt 25445337  T
Q  319 atttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25445338 atttcattggtgtgaaggtt 25445357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39445633 - 39445317
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445633 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 39445535  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||    
T  39445534 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 39445436  T
Q  220 tttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39445435 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacacatcattggttt 39445337  T
Q  319 atttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39445336 atttcattggtgtgaaggtt 39445317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41398381 - 41398055
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41398381 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 41398282  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41398281 ctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctt------cttatcttgtttatgctttggtatctc 41398189  T
Q  211 -ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttg---gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398188 tttgtgtggttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccatatgttctcattgattatcactatcacttgctcc 41398090  T
Q  305 acacatcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41398089 acacataattggtttatttcattggtgtgaaggtt 41398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 44023825 - 44024140
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023825 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 44023923  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggtt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||    
T  44023924 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttaccatttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggtt 44024022  T
Q  221 ttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttta 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44024023 ttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcagttgctccacacatcattggttta 44024121  T
Q  320 tttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44024122 tttcattggtgtgaaggtt 44024140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 1054963 - 1055279
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1054963 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagat 1055061  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||    
T  1055062 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 1055160  T
Q  220 tttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1055161 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagacatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacacatcattggttt 1055259  T
Q  319 atttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1055260 atttcattggtgtgaaggtt 1055279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41390726 - 41390485
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41390726 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 41390627  T
Q  111 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||  |||||    
T  41390626 ctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatctt-ctcgatgttttgttcttcctt------cttatcttgtttatgctttgatatctc 41390534  T
Q  211 -ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtt 257  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41390533 tttgtgtggttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgtt 41390485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Original strand, 24787314 - 24787624
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24787314 caaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 24787413  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatc 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||  |||    
T  24787414 ctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatc 24787510  T
Q  209 tc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgttg--gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctc 303  Q
    || ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  24787511 tctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgttgttgcttggaaaccattt-tgctcatttattaccactatctcttgctc 24787609  T
Q  304 cacacatcattgttt 318  Q
    |||||||| ||||||    
T  24787610 cacacatctttgttt 24787624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 43988401 - 43988734
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgtt--catgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctg 106  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43988401 caaagggtaga-tctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 43988499  T
Q  107 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttgga 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||   | || | |  | ||||| |||      
T  43988500 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatgc-ttgtt 43988598  T
Q  206 atctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctc 303  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43988599 agctcttagtgtggttgtgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctc 43988697  T
Q  304 cacacatcattg-tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  43988698 cacacatcattgatttattctcattggcgtgaaggtt 43988734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 24202724 - 24202973
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct 112  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||   | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24202724 gggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct 24202822  T
Q  113 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| | |||||    
T  24202823 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt--gctttgtattctct 24202918  T
Q  212 tgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagac 268  Q
    ||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24202919 tgtg--gtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgtttgcttggagac 24202973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 19361433 - 19361564
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  19361433 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatct--ttt 19361530  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttg 192  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  19361531 ggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19361564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 19380073 - 19380204
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  19380073 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatct--ttt 19380170  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttg 192  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  19380171 ggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19380204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 19358798 - 19358975
Alignment:
Q  15 gggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagcta-gagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct 112  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19358798 gggtagaatctaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct 19358896  T
Q  113 cccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttg 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  19358897 cccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatct--tttgatgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19358975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41386646 - 41386566
Alignment:
Q  259 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41386646 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtgaaggtt 41386566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 26644869 - 26644994
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26644869 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcat 26644967  T
Q  130 attgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644968 attggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704034
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19073025 - 19072928
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073025 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19120915 - 19120818
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120915 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3281833 - 3281708
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3281833 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcat 3281735  T
Q  130 attgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281734 attggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 16124516 - 16124614
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16124516 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 16124614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 27104372 - 27104470
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  27104372 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 27104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476260
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9476260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598397
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 13598397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651810
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttg 29651810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37069864 - 37069770
Alignment:
Q  63 ttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069864 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775671
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 21536541 - 21536666
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca- 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21536541 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcat 21536639  T
Q  129 tattggctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||    
T  21536640 tttttaccgaactgggtcaacaatctt 21536666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098922
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47098922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 13604624 - 13604720
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604624 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32889523 - 32889438
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  32889523 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttg 32889438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Original strand, 47102874 - 47102935
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 152  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  47102874 tggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 47102935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 23786058 - 23786118
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  23786058 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 51
Target Start/End: Original strand, 25439847 - 25439875
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25439847 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga 25439875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 51752582 - 51752642
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  51752582 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 180
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  496 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagat 398  T
Q  122 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc-ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||    
T  397 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 299  T
Q  220 tttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  298 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcaccatcacttgctccacacatctttggttt 200  T
Q  319 atttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  199 atttcattggtgtgaaggtt 180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 19104 - 19433
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  19104 caaagggtaga-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagctgct 19202  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  |    
T  19203 ctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgtta 19298  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19299 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 19397  T
Q  305 acacatcattg-tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19398 acacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 19433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 14259 - 14578
Alignment:
Q  23 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 120  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14259 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 14358  T
Q  121 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  14359 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 14455  T
Q  218 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 315  Q
    | |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  14456 gatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttg 14553  T
Q  316 -tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  14554 atttattctcattggtgtgaaggtt 14578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 148895 - 149224
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  148895 caaagggtaga-tctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctact 148993  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || | |||| || ||||||||  ||||| |||  |    
T  148994 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgtta 149089  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  149090 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 149188  T
Q  305 acacatcattg-tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  149189 acacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 149224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 2190 - 2519
Alignment:
Q  11 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 108  Q
    ||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2190 caaagggtaga-tctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctact 2288  T
Q  109 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || | |||| || ||||||||  ||||| |||  |    
T  2289 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgtta 2384  T
Q  207 tctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 304  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  2385 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctcc 2483  T
Q  305 acacatcattg-tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2484 acacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 2519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 338
Target Start/End: Original strand, 181976 - 182233
Alignment:
Q  83 ttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttc--ttcctttta 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  181976 ttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctttta 182075  T
Q  181 ccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttc 277  Q
     || ||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |    
T  182076 tcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcac 182170  T
Q  278 tcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  182171 tcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 182233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 268
Target Start/End: Original strand, 17953 - 18157
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17953 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 18051  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgt 256  Q
    ||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  18052 ggtgtgtttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgt 18146  T
Q  257 tggcttggagac 268  Q
    | ||||||||||    
T  18147 t-gcttggagac 18157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Original strand, 24046 - 24164
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24046 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 24144  T
Q  160 ggtgt-tttgttcttccttt 178  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24145 ggtgtgtttgttcttccttt 24164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 338
Target Start/End: Original strand, 34136 - 34216
Alignment:
Q  259 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34136 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtgaaggtt 34216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 333
Target Start/End: Original strand, 300 - 506
Alignment:
Q  123 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgtttggtgttttgttcttccttt-taccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggtt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttctttcta--gcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggtt 395  T
Q  221 ttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttg--gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgttt 318  Q
    |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||      
T  396 ttgctcctcactagtttagggctgtttt-ttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt-- 492  T
Q  319 atttcattggtgtga 333  Q
     ||||||||||||||    
T  493 -tttcattggtgtga 506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 8420 - 8516
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8420 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22403
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22343 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 24618 - 24678
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24618 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 24678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 85779 - 85684
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 154  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85779 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Original strand, 43945 - 44058
Alignment:
Q  44 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaact 141  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||    
T  43945 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaact 44044  T
Q  142 gggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||||||||||    
T  44045 gggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 36804 - 36929
Alignment:
Q  31 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  36804 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcat 36902  T
Q  130 attgg-ctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  36903 attggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5682
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2491
Alignment:
Q  70 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttg 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 133281 - 133377
Alignment:
Q  61 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133281 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13166
Alignment:
Q  272 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtgaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacatatctttggtttatttcattggtgtgaaggtt 13166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10826 - 10728
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10826 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45253
Alignment:
Q  73 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 155  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17360 - 17266
Alignment:
Q  61 tcttgtaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaat 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  17360 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11500
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccagactagg 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 69352 - 69292
Alignment:
Q  92 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  69352 tggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 69292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University